Correlation between gene mutation status and selected clinical features
Overview
Introduction
This pipeline computes the correlation between significantly recurrent gene mutations and selected clinical features.
Summary
Testing the association between mutation status of 198 genes and 15 clinical features across 129 patients, 11 significant findings detected with Q value < 0.25.
-
REG1B mutation correlated to 'STOPPEDSMOKINGYEAR'.
-
OR8J3 mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
-
OR4M2 mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
-
CRISPLD1 mutation correlated to 'STOPPEDSMOKINGYEAR'.
-
C20ORF85 mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
-
F9 mutation correlated to 'STOPPEDSMOKINGYEAR'.
-
NOVA1 mutation correlated to 'STOPPEDSMOKINGYEAR'.
-
GBA3 mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
-
GPR101 mutation correlated to 'STOPPEDSMOKINGYEAR'.
-
OR2W5 mutation correlated to 'NUMBERPACKYEARSSMOKED'.
-
OR7G1 mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
Results
Overview of the results
Table 1. Get Full Table Overview of the association between mutation status of 198 genes and 15 clinical features. Shown in the table are P values (Q values). Thresholded by Q value < 0.25, 11 significant findings detected.
|
Clinical Features |
Time to Death |
AGE | GENDER |
KARNOFSKY PERFORMANCE SCORE |
HISTOLOGICAL TYPE |
PATHOLOGY T |
PATHOLOGY N |
PATHOLOGICSPREAD(M) |
TUMOR STAGE |
RADIATIONS RADIATION REGIMENINDICATION |
NEOADJUVANT THERAPY |
NUMBERPACKYEARSSMOKED | STOPPEDSMOKINGYEAR | TOBACCOSMOKINGHISTORYINDICATOR | YEAROFTOBACCOSMOKINGONSET | ||
| nMutated (%) | nWild-Type | logrank test | t-test | Fisher's exact test | t-test | Chi-square test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | t-test | t-test | Fisher's exact test | t-test | |
| REG1B | 6 (5%) | 123 |
0.591 (1.00) |
0.153 (1.00) |
0.7 (1.00) |
0.998 (1.00) |
0.627 (1.00) |
0.316 (1.00) |
0.667 (1.00) |
0.421 (1.00) |
0.0967 (1.00) |
1 (1.00) |
0.454 (1.00) |
1.1e-09 (2.93e-06) |
0.315 (1.00) |
0.312 (1.00) |
|
| OR8J3 | 10 (8%) | 119 |
0.807 (1.00) |
0.978 (1.00) |
0.0183 (1.00) |
6.69e-05 (0.177) |
0.343 (1.00) |
0.68 (1.00) |
0.29 (1.00) |
0.579 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.29 (1.00) |
0.0226 (1.00) |
0.459 (1.00) |
0.55 (1.00) |
|
| OR4M2 | 7 (5%) | 122 |
0.476 (1.00) |
0.337 (1.00) |
0.136 (1.00) |
1.89e-05 (0.0502) |
0.083 (1.00) |
0.293 (1.00) |
0.406 (1.00) |
0.606 (1.00) |
1 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.128 (1.00) |
0.0793 (1.00) |
0.22 (1.00) |
0.0561 (1.00) |
|
| CRISPLD1 | 7 (5%) | 122 |
0.304 (1.00) |
0.0558 (1.00) |
0.136 (1.00) |
0.79 (1.00) |
0.353 (1.00) |
0.883 (1.00) |
0.406 (1.00) |
0.891 (1.00) |
1 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.663 (1.00) |
1.27e-10 (3.38e-07) |
0.00306 (1.00) |
0.0828 (1.00) |
|
| C20ORF85 | 3 (2%) | 126 |
0.536 (1.00) |
0.872 (1.00) |
0.575 (1.00) |
2.5e-15 (6.66e-12) |
0.721 (1.00) |
0.584 (1.00) |
0.424 (1.00) |
0.477 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.367 (1.00) |
0.0018 (1.00) |
0.22 (1.00) |
0.982 (1.00) |
|
| F9 | 7 (5%) | 122 |
0.499 (1.00) |
0.9 (1.00) |
0.237 (1.00) |
0.0112 (1.00) |
0.549 (1.00) |
0.619 (1.00) |
0.34 (1.00) |
0.63 (1.00) |
0.504 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0166 (1.00) |
2.24e-09 (5.97e-06) |
0.207 (1.00) |
0.569 (1.00) |
|
| NOVA1 | 8 (6%) | 121 |
0.476 (1.00) |
0.697 (1.00) |
1 (1.00) |
0.409 (1.00) |
0.154 (1.00) |
0.446 (1.00) |
1 (1.00) |
0.463 (1.00) |
0.553 (1.00) |
0.352 (1.00) |
0.196 (1.00) |
1.26e-08 (3.35e-05) |
0.0174 (1.00) |
0.766 (1.00) |
|
| GBA3 | 7 (5%) | 122 |
0.721 (1.00) |
0.0625 (1.00) |
0.698 (1.00) |
3.11e-06 (0.00827) |
1 (1.00) |
0.0756 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0739 (1.00) |
1 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.0751 (1.00) |
0.000251 (0.665) |
0.359 (1.00) |
0.519 (1.00) |
|
| GPR101 | 8 (6%) | 121 |
0.461 (1.00) |
0.436 (1.00) |
1 (1.00) |
0.896 (1.00) |
0.268 (1.00) |
0.0756 (1.00) |
0.136 (1.00) |
0.324 (1.00) |
0.553 (1.00) |
0.352 (1.00) |
0.278 (1.00) |
2.58e-05 (0.0684) |
0.00669 (1.00) |
0.314 (1.00) |
|
| OR2W5 | 6 (5%) | 123 |
0.499 (1.00) |
0.44 (1.00) |
1 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.318 (1.00) |
0.405 (1.00) |
0.667 (1.00) |
0.891 (1.00) |
0.45 (1.00) |
1 (1.00) |
3.36e-07 (0.000892) |
0.841 (1.00) |
|||
| OR7G1 | 4 (3%) | 125 |
0.568 (1.00) |
0.283 (1.00) |
0.312 (1.00) |
1.37e-07 (0.000364) |
1 (1.00) |
0.409 (1.00) |
0.129 (1.00) |
0.277 (1.00) |
0.327 (1.00) |
1 (1.00) |
|||||
| STK11 | 17 (13%) | 112 |
0.523 (1.00) |
0.723 (1.00) |
0.0653 (1.00) |
0.942 (1.00) |
0.629 (1.00) |
0.728 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.659 (1.00) |
0.304 (1.00) |
0.706 (1.00) |
0.962 (1.00) |
0.853 (1.00) |
0.412 (1.00) |
|
| EGFR | 19 (15%) | 110 |
0.0399 (1.00) |
0.206 (1.00) |
0.326 (1.00) |
0.0989 (1.00) |
0.935 (1.00) |
0.164 (1.00) |
0.712 (1.00) |
0.417 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.852 (1.00) |
0.0112 (1.00) |
0.00871 (1.00) |
0.259 (1.00) |
|
| KRAS | 35 (27%) | 94 |
0.366 (1.00) |
0.861 (1.00) |
0.429 (1.00) |
0.91 (1.00) |
0.692 (1.00) |
0.12 (1.00) |
0.191 (1.00) |
0.678 (1.00) |
0.577 (1.00) |
0.734 (1.00) |
0.186 (1.00) |
0.586 (1.00) |
0.507 (1.00) |
0.128 (1.00) |
0.454 (1.00) |
| TP53 | 58 (45%) | 71 |
0.315 (1.00) |
0.382 (1.00) |
0.284 (1.00) |
0.284 (1.00) |
0.208 (1.00) |
0.266 (1.00) |
0.689 (1.00) |
0.925 (1.00) |
0.894 (1.00) |
1 (1.00) |
0.338 (1.00) |
0.366 (1.00) |
0.996 (1.00) |
0.0219 (1.00) |
0.443 (1.00) |
| KEAP1 | 24 (19%) | 105 |
0.367 (1.00) |
0.888 (1.00) |
1 (1.00) |
0.243 (1.00) |
0.778 (1.00) |
0.908 (1.00) |
0.43 (1.00) |
1 (1.00) |
0.696 (1.00) |
0.763 (1.00) |
0.429 (1.00) |
0.984 (1.00) |
0.617 (1.00) |
0.751 (1.00) |
|
| BRAF | 13 (10%) | 116 |
0.84 (1.00) |
0.274 (1.00) |
0.0726 (1.00) |
0.99 (1.00) |
0.205 (1.00) |
0.925 (1.00) |
0.301 (1.00) |
0.739 (1.00) |
0.346 (1.00) |
0.692 (1.00) |
0.524 (1.00) |
0.349 (1.00) |
0.249 (1.00) |
0.359 (1.00) |
|
| NAV3 | 27 (21%) | 102 |
0.601 (1.00) |
0.957 (1.00) |
1 (1.00) |
0.563 (1.00) |
0.459 (1.00) |
0.698 (1.00) |
0.897 (1.00) |
0.842 (1.00) |
0.458 (1.00) |
0.242 (1.00) |
0.404 (1.00) |
0.168 (1.00) |
0.0284 (1.00) |
0.409 (1.00) |
|
| CD5L | 11 (9%) | 118 |
0.814 (1.00) |
0.889 (1.00) |
0.203 (1.00) |
0.713 (1.00) |
0.173 (1.00) |
0.692 (1.00) |
1 (1.00) |
0.269 (1.00) |
0.272 (1.00) |
0.691 (1.00) |
0.763 (1.00) |
0.877 (1.00) |
0.938 (1.00) |
0.705 (1.00) |
|
| CDKN2A | 7 (5%) | 122 |
0.742 (1.00) |
0.133 (1.00) |
1 (1.00) |
0.999 (1.00) |
1 (1.00) |
0.854 (1.00) |
0.667 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.424 (1.00) |
0.0836 (1.00) |
0.419 (1.00) |
0.238 (1.00) |
|
| REG3A | 10 (8%) | 119 |
0.824 (1.00) |
0.949 (1.00) |
0.323 (1.00) |
0.263 (1.00) |
0.495 (1.00) |
0.518 (1.00) |
0.735 (1.00) |
0.936 (1.00) |
0.597 (1.00) |
0.365 (1.00) |
0.798 (1.00) |
0.00421 (1.00) |
0.187 (1.00) |
0.912 (1.00) |
|
| RIMS2 | 22 (17%) | 107 |
0.397 (1.00) |
0.585 (1.00) |
0.101 (1.00) |
0.901 (1.00) |
0.213 (1.00) |
0.774 (1.00) |
0.878 (1.00) |
0.58 (1.00) |
1 (1.00) |
0.123 (1.00) |
0.787 (1.00) |
0.0186 (1.00) |
0.28 (1.00) |
0.152 (1.00) |
|
| U2AF1 | 4 (3%) | 125 |
0.95 (1.00) |
0.0809 (1.00) |
0.636 (1.00) |
0.989 (1.00) |
0.759 (1.00) |
0.0364 (1.00) |
0.0549 (1.00) |
0.0167 (1.00) |
0.327 (1.00) |
0.124 (1.00) |
0.859 (1.00) |
0.841 (1.00) |
|||
| DCAF4L2 | 10 (8%) | 119 |
0.946 (1.00) |
0.702 (1.00) |
0.323 (1.00) |
0.536 (1.00) |
0.369 (1.00) |
0.327 (1.00) |
0.21 (1.00) |
0.266 (1.00) |
1 (1.00) |
0.666 (1.00) |
0.934 (1.00) |
0.757 (1.00) |
0.382 (1.00) |
0.223 (1.00) |
|
| MAGEC1 | 19 (15%) | 110 |
0.952 (1.00) |
0.178 (1.00) |
0.802 (1.00) |
0.844 (1.00) |
0.585 (1.00) |
0.186 (1.00) |
0.0969 (1.00) |
0.217 (1.00) |
1 (1.00) |
0.309 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.443 (1.00) |
0.0099 (1.00) |
0.778 (1.00) |
|
| IL1RAPL1 | 11 (9%) | 118 |
0.569 (1.00) |
0.409 (1.00) |
0.352 (1.00) |
0.914 (1.00) |
0.883 (1.00) |
0.436 (1.00) |
0.435 (1.00) |
0.226 (1.00) |
0.598 (1.00) |
1 (1.00) |
0.99 (1.00) |
0.212 (1.00) |
0.513 (1.00) |
0.585 (1.00) |
|
| CDH8 | 13 (10%) | 116 |
0.289 (1.00) |
0.11 (1.00) |
0.396 (1.00) |
0.501 (1.00) |
0.537 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.802 (1.00) |
0.828 (1.00) |
0.609 (1.00) |
1 (1.00) |
0.583 (1.00) |
0.633 (1.00) |
0.236 (1.00) |
0.657 (1.00) |
|
| OR2T33 | 9 (7%) | 120 |
0.112 (1.00) |
0.781 (1.00) |
1 (1.00) |
0.996 (1.00) |
0.143 (1.00) |
0.297 (1.00) |
0.712 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.354 (1.00) |
0.979 (1.00) |
0.921 (1.00) |
0.44 (1.00) |
0.496 (1.00) |
|
| TMTC1 | 13 (10%) | 116 |
0.628 (1.00) |
0.247 (1.00) |
0.556 (1.00) |
0.0231 (1.00) |
0.0677 (1.00) |
0.451 (1.00) |
0.492 (1.00) |
0.1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.125 (1.00) |
0.847 (1.00) |
0.00923 (1.00) |
0.0482 (1.00) |
0.697 (1.00) |
|
| HGF | 14 (11%) | 115 |
0.457 (1.00) |
0.358 (1.00) |
0.00783 (1.00) |
0.256 (1.00) |
0.954 (1.00) |
0.0451 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.215 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0419 (1.00) |
0.0573 (1.00) |
0.15 (1.00) |
0.354 (1.00) |
|
| SNTG1 | 14 (11%) | 115 |
0.632 (1.00) |
0.971 (1.00) |
0.776 (1.00) |
0.704 (1.00) |
0.253 (1.00) |
0.234 (1.00) |
0.512 (1.00) |
0.503 (1.00) |
0.36 (1.00) |
0.465 (1.00) |
0.672 (1.00) |
0.635 (1.00) |
0.324 (1.00) |
0.959 (1.00) |
|
| MUC7 | 10 (8%) | 119 |
0.451 (1.00) |
0.501 (1.00) |
0.323 (1.00) |
0.263 (1.00) |
0.397 (1.00) |
0.68 (1.00) |
0.735 (1.00) |
0.936 (1.00) |
1 (1.00) |
0.666 (1.00) |
0.933 (1.00) |
0.0104 (1.00) |
0.0152 (1.00) |
0.708 (1.00) |
|
| OR2T4 | 10 (8%) | 119 |
0.0344 (1.00) |
0.427 (1.00) |
0.323 (1.00) |
0.809 (1.00) |
0.147 (1.00) |
1 (1.00) |
0.735 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.365 (1.00) |
0.386 (1.00) |
0.648 (1.00) |
0.827 (1.00) |
0.0108 (1.00) |
|
| OR2W3 | 10 (8%) | 119 |
0.831 (1.00) |
0.669 (1.00) |
0.0965 (1.00) |
0.64 (1.00) |
0.495 (1.00) |
0.68 (1.00) |
0.145 (1.00) |
0.145 (1.00) |
1 (1.00) |
0.365 (1.00) |
0.0771 (1.00) |
0.928 (1.00) |
0.705 (1.00) |
0.559 (1.00) |
|
| EPHA6 | 15 (12%) | 114 |
0.75 (1.00) |
0.485 (1.00) |
0.172 (1.00) |
0.459 (1.00) |
0.712 (1.00) |
0.043 (1.00) |
0.809 (1.00) |
0.216 (1.00) |
0.813 (1.00) |
0.631 (1.00) |
0.463 (1.00) |
0.442 (1.00) |
0.824 (1.00) |
0.596 (1.00) |
0.784 (1.00) |
| CARM1 | 3 (2%) | 126 |
0.56 (1.00) |
0.575 (1.00) |
0.927 (1.00) |
0.19 (1.00) |
0.247 (1.00) |
1 (1.00) |
0.349 (1.00) |
0.256 (1.00) |
0.416 (1.00) |
0.242 (1.00) |
0.184 (1.00) |
||||
| CDH10 | 24 (19%) | 105 |
0.175 (1.00) |
0.658 (1.00) |
0.82 (1.00) |
0.451 (1.00) |
0.106 (1.00) |
0.135 (1.00) |
0.783 (1.00) |
0.212 (1.00) |
1 (1.00) |
0.122 (1.00) |
0.123 (1.00) |
0.005 (1.00) |
0.0418 (1.00) |
0.716 (1.00) |
|
| RBM10 | 10 (8%) | 119 |
0.812 (1.00) |
0.109 (1.00) |
0.0183 (1.00) |
0.973 (1.00) |
0.0019 (1.00) |
0.255 (1.00) |
1 (1.00) |
0.65 (1.00) |
0.597 (1.00) |
1 (1.00) |
0.689 (1.00) |
0.428 (1.00) |
0.173 (1.00) |
0.224 (1.00) |
|
| OR2L3 | 9 (7%) | 120 |
0.768 (1.00) |
0.685 (1.00) |
0.00471 (1.00) |
0.539 (1.00) |
0.659 (1.00) |
0.0893 (1.00) |
0.18 (1.00) |
0.775 (1.00) |
1 (1.00) |
0.354 (1.00) |
0.178 (1.00) |
0.0723 (1.00) |
0.327 (1.00) |
0.687 (1.00) |
|
| PDE10A | 9 (7%) | 120 |
0.0574 (1.00) |
0.0409 (1.00) |
0.495 (1.00) |
0.413 (1.00) |
0.113 (1.00) |
0.809 (1.00) |
0.524 (1.00) |
0.369 (1.00) |
0.597 (1.00) |
1 (1.00) |
0.873 (1.00) |
0.969 (1.00) |
0.78 (1.00) |
0.164 (1.00) |
|
| SEC14L1 | 4 (3%) | 125 |
0.43 (1.00) |
0.63 (1.00) |
0.312 (1.00) |
0.656 (1.00) |
0.291 (1.00) |
0.0579 (1.00) |
0.522 (1.00) |
0.409 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.475 (1.00) |
0.644 (1.00) |
0.692 (1.00) |
0.472 (1.00) |
|
| CDH18 | 13 (10%) | 116 |
0.561 (1.00) |
0.501 (1.00) |
1 (1.00) |
0.258 (1.00) |
0.166 (1.00) |
0.601 (1.00) |
1 (1.00) |
0.911 (1.00) |
0.346 (1.00) |
0.125 (1.00) |
0.259 (1.00) |
0.00267 (1.00) |
0.151 (1.00) |
0.731 (1.00) |
|
| ITGA8 | 13 (10%) | 116 |
0.902 (1.00) |
0.84 (1.00) |
1 (1.00) |
0.99 (1.00) |
0.139 (1.00) |
0.0137 (1.00) |
0.0511 (1.00) |
0.0443 (1.00) |
0.103 (1.00) |
1 (1.00) |
0.559 (1.00) |
0.285 (1.00) |
0.194 (1.00) |
0.491 (1.00) |
|
| OR4C46 | 9 (7%) | 120 |
0.894 (1.00) |
0.822 (1.00) |
0.495 (1.00) |
0.355 (1.00) |
0.155 (1.00) |
0.24 (1.00) |
0.712 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.639 (1.00) |
0.583 (1.00) |
0.217 (1.00) |
0.535 (1.00) |
0.655 (1.00) |
|
| SETD2 | 13 (10%) | 116 |
0.01 (1.00) |
0.703 (1.00) |
0.556 (1.00) |
0.984 (1.00) |
0.311 (1.00) |
0.855 (1.00) |
0.492 (1.00) |
0.473 (1.00) |
0.346 (1.00) |
1 (1.00) |
0.769 (1.00) |
0.134 (1.00) |
0.568 (1.00) |
0.919 (1.00) |
|
| OR2G3 | 9 (7%) | 120 |
0.768 (1.00) |
0.963 (1.00) |
0.495 (1.00) |
0.355 (1.00) |
0.435 (1.00) |
0.453 (1.00) |
0.712 (1.00) |
0.54 (1.00) |
0.198 (1.00) |
1 (1.00) |
0.97 (1.00) |
0.622 (1.00) |
0.197 (1.00) |
0.351 (1.00) |
|
| FAM47B | 12 (9%) | 117 |
0.944 (1.00) |
0.101 (1.00) |
0.359 (1.00) |
0.565 (1.00) |
0.0338 (1.00) |
0.847 (1.00) |
0.476 (1.00) |
0.328 (1.00) |
0.602 (1.00) |
0.213 (1.00) |
0.12 (1.00) |
0.862 (1.00) |
0.00405 (1.00) |
0.35 (1.00) |
|
| CD1E | 10 (8%) | 119 |
0.764 (1.00) |
0.651 (1.00) |
0.515 (1.00) |
0.973 (1.00) |
0.0281 (1.00) |
0.809 (1.00) |
1 (1.00) |
0.822 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.427 (1.00) |
0.269 (1.00) |
0.327 (1.00) |
0.995 (1.00) |
|
| CPXCR1 | 8 (6%) | 121 |
0.27 (1.00) |
0.398 (1.00) |
0.137 (1.00) |
0.986 (1.00) |
0.496 (1.00) |
0.225 (1.00) |
1 (1.00) |
0.775 (1.00) |
0.553 (1.00) |
0.121 (1.00) |
0.627 (1.00) |
0.94 (1.00) |
0.251 (1.00) |
0.473 (1.00) |
|
| OR4C16 | 7 (5%) | 122 |
0.818 (1.00) |
0.597 (1.00) |
1 (1.00) |
0.74 (1.00) |
0.489 (1.00) |
0.883 (1.00) |
0.676 (1.00) |
0.606 (1.00) |
0.504 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.499 (1.00) |
0.42 (1.00) |
|||
| OR2M7 | 9 (7%) | 120 |
0.345 (1.00) |
0.709 (1.00) |
1 (1.00) |
0.998 (1.00) |
0.194 (1.00) |
0.36 (1.00) |
0.524 (1.00) |
0.137 (1.00) |
0.597 (1.00) |
0.354 (1.00) |
0.161 (1.00) |
0.403 (1.00) |
0.386 (1.00) |
0.924 (1.00) |
|
| DACH1 | 9 (7%) | 120 |
0.318 (1.00) |
0.95 (1.00) |
0.0368 (1.00) |
0.000391 (1.00) |
0.778 (1.00) |
0.453 (1.00) |
1 (1.00) |
0.695 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0531 (1.00) |
0.984 (1.00) |
0.327 (1.00) |
0.482 (1.00) |
|
| FBXL7 | 13 (10%) | 116 |
0.363 (1.00) |
0.61 (1.00) |
0.396 (1.00) |
0.795 (1.00) |
0.181 (1.00) |
0.925 (1.00) |
0.802 (1.00) |
0.911 (1.00) |
1 (1.00) |
0.125 (1.00) |
0.612 (1.00) |
0.583 (1.00) |
|||
| WT1 | 7 (5%) | 122 |
0.101 (1.00) |
0.565 (1.00) |
1 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.549 (1.00) |
0.883 (1.00) |
0.676 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.261 (1.00) |
0.419 (1.00) |
0.0384 (1.00) |
0.718 (1.00) |
|
| REG3G | 7 (5%) | 122 |
0.659 (1.00) |
0.296 (1.00) |
0.136 (1.00) |
0.102 (1.00) |
0.772 (1.00) |
0.142 (1.00) |
0.173 (1.00) |
0.0609 (1.00) |
1 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.886 (1.00) |
0.0723 (1.00) |
0.379 (1.00) |
0.505 (1.00) |
|
| OR2T3 | 7 (5%) | 122 |
0.0914 (1.00) |
0.0403 (1.00) |
0.136 (1.00) |
0.262 (1.00) |
0.772 (1.00) |
0.142 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0812 (1.00) |
0.504 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.222 (1.00) |
0.127 (1.00) |
0.164 (1.00) |
0.0265 (1.00) |
|
| LIPI | 7 (5%) | 122 |
0.123 (1.00) |
0.897 (1.00) |
1 (1.00) |
0.994 (1.00) |
1 (1.00) |
0.475 (1.00) |
1 (1.00) |
0.445 (1.00) |
0.504 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.354 (1.00) |
0.0459 (1.00) |
0.979 (1.00) |
||
| NRXN1 | 19 (15%) | 110 |
0.309 (1.00) |
0.735 (1.00) |
0.0769 (1.00) |
0.458 (1.00) |
0.419 (1.00) |
0.417 (1.00) |
0.619 (1.00) |
0.478 (1.00) |
0.212 (1.00) |
0.737 (1.00) |
0.342 (1.00) |
0.539 (1.00) |
0.0952 (1.00) |
0.752 (1.00) |
|
| OR4A15 | 10 (8%) | 119 |
0.449 (1.00) |
0.373 (1.00) |
0.0965 (1.00) |
0.656 (1.00) |
0.238 (1.00) |
1 (1.00) |
0.388 (1.00) |
0.475 (1.00) |
0.597 (1.00) |
0.365 (1.00) |
0.188 (1.00) |
0.409 (1.00) |
0.197 (1.00) |
0.92 (1.00) |
|
| ZSWIM2 | 11 (9%) | 118 |
0.184 (1.00) |
0.271 (1.00) |
0.758 (1.00) |
0.967 (1.00) |
0.251 (1.00) |
0.439 (1.00) |
0.759 (1.00) |
0.941 (1.00) |
0.0666 (1.00) |
0.21 (1.00) |
0.334 (1.00) |
0.469 (1.00) |
0.964 (1.00) |
0.165 (1.00) |
|
| ANKRD56 | 9 (7%) | 120 |
0.727 (1.00) |
0.661 (1.00) |
0.495 (1.00) |
0.413 (1.00) |
0.0479 (1.00) |
0.726 (1.00) |
1 (1.00) |
0.609 (1.00) |
1 (1.00) |
0.354 (1.00) |
0.394 (1.00) |
0.415 (1.00) |
0.327 (1.00) |
0.867 (1.00) |
|
| OR51A7 | 6 (5%) | 123 |
0.193 (1.00) |
0.0602 (1.00) |
1 (1.00) |
0.998 (1.00) |
0.558 (1.00) |
1 (1.00) |
0.667 (1.00) |
0.891 (1.00) |
0.0967 (1.00) |
1 (1.00) |
0.408 (1.00) |
||||
| TMEFF1 | 3 (2%) | 126 |
0.195 (1.00) |
0.48 (1.00) |
0.261 (1.00) |
0.927 (1.00) |
0.721 (1.00) |
0.584 (1.00) |
1 (1.00) |
0.638 (1.00) |
1 (1.00) |
0.416 (1.00) |
0.945 (1.00) |
0.772 (1.00) |
|||
| ZIC4 | 9 (7%) | 120 |
0.107 (1.00) |
0.362 (1.00) |
0.0368 (1.00) |
0.996 (1.00) |
0.113 (1.00) |
0.24 (1.00) |
0.342 (1.00) |
0.455 (1.00) |
1 (1.00) |
0.354 (1.00) |
0.675 (1.00) |
0.813 (1.00) |
0.271 (1.00) |
0.0275 (1.00) |
|
| FAM123C | 12 (9%) | 117 |
0.884 (1.00) |
0.507 (1.00) |
0.359 (1.00) |
0.664 (1.00) |
0.171 (1.00) |
0.834 (1.00) |
0.581 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.689 (1.00) |
0.00144 (1.00) |
0.204 (1.00) |
0.047 (1.00) |
0.514 (1.00) |
|
| PRSS1 | 9 (7%) | 120 |
0.429 (1.00) |
0.698 (1.00) |
1 (1.00) |
0.539 (1.00) |
0.167 (1.00) |
0.726 (1.00) |
0.524 (1.00) |
0.313 (1.00) |
0.597 (1.00) |
1 (1.00) |
0.449 (1.00) |
0.778 (1.00) |
0.492 (1.00) |
0.776 (1.00) |
|
| PABPC3 | 6 (5%) | 123 |
0.124 (1.00) |
0.562 (1.00) |
1 (1.00) |
0.956 (1.00) |
0.85 (1.00) |
0.107 (1.00) |
1 (1.00) |
0.146 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.818 (1.00) |
0.0371 (1.00) |
0.441 (1.00) |
0.739 (1.00) |
|
| ADAMTS16 | 14 (11%) | 115 |
0.474 (1.00) |
0.639 (1.00) |
0.0418 (1.00) |
0.99 (1.00) |
0.768 (1.00) |
0.555 (1.00) |
0.083 (1.00) |
0.057 (1.00) |
1 (1.00) |
0.124 (1.00) |
0.0106 (1.00) |
0.397 (1.00) |
1 (1.00) |
0.636 (1.00) |
|
| OR2L8 | 7 (5%) | 122 |
0.164 (1.00) |
0.79 (1.00) |
0.136 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.489 (1.00) |
0.39 (1.00) |
1 (1.00) |
0.823 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.28 (1.00) |
0.157 (1.00) |
0.149 (1.00) |
0.844 (1.00) |
|
| HOXA1 | 7 (5%) | 122 |
0.508 (1.00) |
0.897 (1.00) |
0.698 (1.00) |
0.984 (1.00) |
0.772 (1.00) |
0.293 (1.00) |
0.406 (1.00) |
0.414 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.353 (1.00) |
0.703 (1.00) |
|||
| GABRA5 | 8 (6%) | 121 |
0.904 (1.00) |
0.922 (1.00) |
0.285 (1.00) |
0.986 (1.00) |
0.351 (1.00) |
0.691 (1.00) |
0.296 (1.00) |
0.11 (1.00) |
0.553 (1.00) |
1 (1.00) |
0.442 (1.00) |
0.332 (1.00) |
0.846 (1.00) |
0.568 (1.00) |
|
| RGPD4 | 8 (6%) | 121 |
0.885 (1.00) |
0.517 (1.00) |
1 (1.00) |
0.896 (1.00) |
0.154 (1.00) |
0.0191 (1.00) |
0.47 (1.00) |
0.178 (1.00) |
1 (1.00) |
0.352 (1.00) |
0.724 (1.00) |
0.215 (1.00) |
0.805 (1.00) |
0.743 (1.00) |
|
| FSCB | 12 (9%) | 117 |
0.178 (1.00) |
0.574 (1.00) |
0.761 (1.00) |
0.696 (1.00) |
0.848 (1.00) |
0.755 (1.00) |
1 (1.00) |
0.899 (1.00) |
0.084 (1.00) |
1 (1.00) |
0.216 (1.00) |
0.946 (1.00) |
0.178 (1.00) |
0.232 (1.00) |
|
| SLITRK2 | 15 (12%) | 114 |
0.272 (1.00) |
0.841 (1.00) |
0.786 (1.00) |
0.0246 (1.00) |
0.0218 (1.00) |
0.926 (1.00) |
1 (1.00) |
0.829 (1.00) |
1 (1.00) |
0.129 (1.00) |
0.135 (1.00) |
0.438 (1.00) |
0.0229 (1.00) |
0.0744 (1.00) |
|
| ST6GALNAC3 | 8 (6%) | 121 |
0.377 (1.00) |
0.862 (1.00) |
1 (1.00) |
0.522 (1.00) |
0.22 (1.00) |
0.792 (1.00) |
0.692 (1.00) |
0.918 (1.00) |
1 (1.00) |
0.616 (1.00) |
0.947 (1.00) |
0.983 (1.00) |
0.658 (1.00) |
0.819 (1.00) |
|
| FERD3L | 6 (5%) | 123 |
0.0164 (1.00) |
0.285 (1.00) |
0.7 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.156 (1.00) |
0.824 (1.00) |
1 (1.00) |
0.784 (1.00) |
0.45 (1.00) |
0.588 (1.00) |
0.7 (1.00) |
0.698 (1.00) |
0.375 (1.00) |
0.538 (1.00) |
|
| PDHA2 | 8 (6%) | 121 |
0.298 (1.00) |
0.539 (1.00) |
0.285 (1.00) |
0.993 (1.00) |
0.548 (1.00) |
0.792 (1.00) |
0.296 (1.00) |
0.344 (1.00) |
1 (1.00) |
0.352 (1.00) |
0.386 (1.00) |
0.117 (1.00) |
0.552 (1.00) |
||
| FAM75A6 | 15 (12%) | 114 |
0.437 (1.00) |
0.186 (1.00) |
1 (1.00) |
0.975 (1.00) |
0.101 (1.00) |
0.866 (1.00) |
0.432 (1.00) |
0.318 (1.00) |
0.034 (1.00) |
1 (1.00) |
0.363 (1.00) |
0.0952 (1.00) |
0.0917 (1.00) |
0.72 (1.00) |
|
| KCNJ3 | 9 (7%) | 120 |
0.783 (1.00) |
0.492 (1.00) |
0.732 (1.00) |
0.998 (1.00) |
0.113 (1.00) |
0.726 (1.00) |
0.712 (1.00) |
0.285 (1.00) |
0.198 (1.00) |
1 (1.00) |
0.468 (1.00) |
0.937 (1.00) |
0.271 (1.00) |
||
| KRTAP11-1 | 6 (5%) | 123 |
0.207 (1.00) |
0.124 (1.00) |
0.239 (1.00) |
0.956 (1.00) |
0.137 (1.00) |
0.619 (1.00) |
0.34 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.588 (1.00) |
0.144 (1.00) |
0.42 (1.00) |
|||
| OR10T2 | 7 (5%) | 122 |
0.949 (1.00) |
0.879 (1.00) |
1 (1.00) |
0.984 (1.00) |
0.142 (1.00) |
0.142 (1.00) |
0.676 (1.00) |
0.562 (1.00) |
0.504 (1.00) |
0.319 (1.00) |
0.0651 (1.00) |
0.00547 (1.00) |
0.0174 (1.00) |
0.611 (1.00) |
|
| ABCB5 | 15 (12%) | 114 |
0.176 (1.00) |
0.778 (1.00) |
0.0551 (1.00) |
0.0132 (1.00) |
0.136 (1.00) |
0.66 (1.00) |
0.432 (1.00) |
0.724 (1.00) |
1 (1.00) |
0.463 (1.00) |
0.115 (1.00) |
0.459 (1.00) |
0.14 (1.00) |
0.492 (1.00) |
|
| CALD1 | 6 (5%) | 123 |
0.307 (1.00) |
0.43 (1.00) |
0.401 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.0672 (1.00) |
0.545 (1.00) |
0.667 (1.00) |
0.63 (1.00) |
0.45 (1.00) |
0.588 (1.00) |
0.0225 (1.00) |
0.0397 (1.00) |
|||
| CLEC12B | 3 (2%) | 126 |
0.289 (1.00) |
0.929 (1.00) |
0.261 (1.00) |
0.992 (1.00) |
1 (1.00) |
0.424 (1.00) |
0.638 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.883 (1.00) |
|||||
| DUSP22 | 7 (5%) | 122 |
0.816 (1.00) |
0.762 (1.00) |
0.459 (1.00) |
0.994 (1.00) |
0.183 (1.00) |
0.405 (1.00) |
0.251 (1.00) |
0.331 (1.00) |
0.504 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.000132 (0.35) |
0.324 (1.00) |
0.805 (1.00) |
0.777 (1.00) |
|
| CROT | 8 (6%) | 121 |
0.257 (1.00) |
0.71 (1.00) |
0.723 (1.00) |
0.896 (1.00) |
0.602 (1.00) |
0.54 (1.00) |
0.676 (1.00) |
0.609 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.926 (1.00) |
0.466 (1.00) |
0.749 (1.00) |
0.784 (1.00) |
|
| OR2C3 | 9 (7%) | 120 |
0.13 (1.00) |
0.665 (1.00) |
1 (1.00) |
0.956 (1.00) |
0.4 (1.00) |
0.138 (1.00) |
0.712 (1.00) |
0.153 (1.00) |
0.597 (1.00) |
1 (1.00) |
0.819 (1.00) |
0.615 (1.00) |
0.678 (1.00) |
0.509 (1.00) |
|
| LCE1F | 4 (3%) | 125 |
0.743 (1.00) |
0.292 (1.00) |
0.135 (1.00) |
0.557 (1.00) |
0.466 (1.00) |
0.229 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0802 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.407 (1.00) |
0.112 (1.00) |
|||
| TBX22 | 10 (8%) | 119 |
0.776 (1.00) |
0.897 (1.00) |
0.323 (1.00) |
0.135 (1.00) |
0.137 (1.00) |
0.68 (1.00) |
0.538 (1.00) |
0.822 (1.00) |
0.597 (1.00) |
0.365 (1.00) |
0.276 (1.00) |
0.18 (1.00) |
0.803 (1.00) |
0.546 (1.00) |
|
| OR4A5 | 6 (5%) | 123 |
0.263 (1.00) |
0.648 (1.00) |
0.0377 (1.00) |
0.998 (1.00) |
1 (1.00) |
0.475 (1.00) |
1 (1.00) |
0.696 (1.00) |
1 (1.00) |
0.00648 (1.00) |
0.623 (1.00) |
0.23 (1.00) |
0.459 (1.00) |
||
| KRTAP19-6 | 4 (3%) | 125 |
0.153 (1.00) |
0.0451 (1.00) |
0.312 (1.00) |
0.0566 (1.00) |
0.587 (1.00) |
0.655 (1.00) |
1 (1.00) |
0.699 (1.00) |
1 (1.00) |
0.513 (1.00) |
0.0348 (1.00) |
0.0018 (1.00) |
0.281 (1.00) |
0.843 (1.00) |
|
| ADAMTS18 | 15 (12%) | 114 |
0.484 (1.00) |
0.808 (1.00) |
0.172 (1.00) |
0.228 (1.00) |
0.357 (1.00) |
0.66 (1.00) |
0.126 (1.00) |
0.565 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.88 (1.00) |
0.283 (1.00) |
0.918 (1.00) |
0.332 (1.00) |
|
| LPA | 11 (9%) | 118 |
0.716 (1.00) |
0.433 (1.00) |
0.527 (1.00) |
0.984 (1.00) |
0.00952 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.557 (1.00) |
0.101 (1.00) |
0.272 (1.00) |
0.691 (1.00) |
0.948 (1.00) |
0.902 (1.00) |
0.5 (1.00) |
0.931 (1.00) |
|
| AQP9 | 5 (4%) | 124 |
0.0382 (1.00) |
0.775 (1.00) |
0.65 (1.00) |
1 (1.00) |
0.33 (1.00) |
0.11 (1.00) |
1 (1.00) |
0.752 (1.00) |
1 (1.00) |
0.186 (1.00) |
0.729 (1.00) |
0.966 (1.00) |
0.932 (1.00) |
0.647 (1.00) |
|
| C1ORF94 | 6 (5%) | 123 |
0.757 (1.00) |
0.478 (1.00) |
0.7 (1.00) |
0.998 (1.00) |
0.85 (1.00) |
0.405 (1.00) |
1 (1.00) |
0.421 (1.00) |
0.45 (1.00) |
1 (1.00) |
0.767 (1.00) |
||||
| NELL1 | 11 (9%) | 118 |
0.0204 (1.00) |
0.0186 (1.00) |
1 (1.00) |
0.989 (1.00) |
0.451 (1.00) |
0.635 (1.00) |
0.166 (1.00) |
0.304 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.691 (1.00) |
0.849 (1.00) |
0.93 (1.00) |
0.0571 (1.00) |
0.23 (1.00) |
|
| CNGA2 | 9 (7%) | 120 |
0.676 (1.00) |
0.463 (1.00) |
0.0368 (1.00) |
0.148 (1.00) |
0.435 (1.00) |
0.187 (1.00) |
1 (1.00) |
0.695 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.518 (1.00) |
0.41 (1.00) |
0.565 (1.00) |
0.362 (1.00) |
|
| ESYT2 | 6 (5%) | 123 |
0.351 (1.00) |
0.000837 (1.00) |
1 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.0393 (1.00) |
0.405 (1.00) |
0.667 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.142 (1.00) |
0.293 (1.00) |
|||
| NLRP13 | 13 (10%) | 116 |
0.459 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.777 (1.00) |
0.62 (1.00) |
0.369 (1.00) |
0.355 (1.00) |
0.219 (1.00) |
0.201 (1.00) |
0.346 (1.00) |
1 (1.00) |
0.292 (1.00) |
0.103 (1.00) |
0.244 (1.00) |
0.19 (1.00) |
|
| NPFFR2 | 8 (6%) | 121 |
0.204 (1.00) |
0.873 (1.00) |
1 (1.00) |
0.861 (1.00) |
0.819 (1.00) |
0.225 (1.00) |
1 (1.00) |
0.234 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.214 (1.00) |
0.0222 (1.00) |
0.699 (1.00) |
0.655 (1.00) |
|
| NRG3 | 9 (7%) | 120 |
0.673 (1.00) |
0.566 (1.00) |
0.495 (1.00) |
0.69 (1.00) |
0.104 (1.00) |
0.809 (1.00) |
0.524 (1.00) |
1 (1.00) |
0.597 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0485 (1.00) |
0.338 (1.00) |
0.552 (1.00) |
0.0652 (1.00) |
|
| TNN | 16 (12%) | 113 |
0.442 (1.00) |
0.475 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.984 (1.00) |
0.24 (1.00) |
1 (1.00) |
0.825 (1.00) |
1 (1.00) |
0.644 (1.00) |
0.468 (1.00) |
0.515 (1.00) |
0.403 (1.00) |
0.167 (1.00) |
0.702 (1.00) |
|
| GPR174 | 5 (4%) | 124 |
0.429 (1.00) |
0.142 (1.00) |
0.393 (1.00) |
0.156 (1.00) |
0.674 (1.00) |
0.234 (1.00) |
0.605 (1.00) |
0.498 (1.00) |
1 (1.00) |
0.591 (1.00) |
0.204 (1.00) |
0.463 (1.00) |
0.189 (1.00) |
||
| PSG8 | 10 (8%) | 119 |
0.39 (1.00) |
0.842 (1.00) |
0.323 (1.00) |
0.0441 (1.00) |
0.189 (1.00) |
0.175 (1.00) |
0.735 (1.00) |
0.455 (1.00) |
0.597 (1.00) |
1 (1.00) |
0.455 (1.00) |
0.00659 (1.00) |
0.219 (1.00) |
||
| OR10Z1 | 6 (5%) | 123 |
0.37 (1.00) |
0.955 (1.00) |
0.0829 (1.00) |
0.127 (1.00) |
0.273 (1.00) |
0.405 (1.00) |
1 (1.00) |
0.581 (1.00) |
0.45 (1.00) |
0.588 (1.00) |
0.787 (1.00) |
0.203 (1.00) |
0.273 (1.00) |
0.609 (1.00) |
|
| FAM71B | 10 (8%) | 119 |
0.655 (1.00) |
0.872 (1.00) |
1 (1.00) |
0.187 (1.00) |
0.137 (1.00) |
1 (1.00) |
0.735 (1.00) |
0.65 (1.00) |
0.597 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
0.551 (1.00) |
0.827 (1.00) |
0.205 (1.00) |
|
| OR10G9 | 7 (5%) | 122 |
0.608 (1.00) |
0.0998 (1.00) |
0.136 (1.00) |
0.984 (1.00) |
0.0553 (1.00) |
0.657 (1.00) |
0.251 (1.00) |
0.0628 (1.00) |
1 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.379 (1.00) |
0.157 (1.00) |
0.129 (1.00) |
0.611 (1.00) |
|
| SERPINI2 | 5 (4%) | 124 |
0.962 (1.00) |
0.414 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.398 (1.00) |
0.824 (1.00) |
1 (1.00) |
0.581 (1.00) |
0.391 (1.00) |
0.591 (1.00) |
0.773 (1.00) |
0.0653 (1.00) |
|||
| ZNF492 | 6 (5%) | 123 |
0.89 (1.00) |
0.925 (1.00) |
0.7 (1.00) |
0.956 (1.00) |
1 (1.00) |
0.824 (1.00) |
1 (1.00) |
0.513 (1.00) |
0.0967 (1.00) |
0.588 (1.00) |
0.0401 (1.00) |
0.271 (1.00) |
0.273 (1.00) |
||
| PCK1 | 8 (6%) | 121 |
0.159 (1.00) |
0.539 (1.00) |
0.285 (1.00) |
0.993 (1.00) |
0.154 (1.00) |
0.792 (1.00) |
0.0146 (1.00) |
0.0119 (1.00) |
0.553 (1.00) |
0.352 (1.00) |
0.472 (1.00) |
0.676 (1.00) |
0.552 (1.00) |
0.00956 (1.00) |
|
| BLID | 4 (3%) | 125 |
0.00515 (1.00) |
0.781 (1.00) |
0.031 (1.00) |
0.656 (1.00) |
0.0305 (1.00) |
0.229 (1.00) |
1 (1.00) |
0.213 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.445 (1.00) |
0.851 (1.00) |
0.621 (1.00) |
0.528 (1.00) |
|
| DYTN | 8 (6%) | 121 |
0.316 (1.00) |
0.000296 (0.784) |
1 (1.00) |
0.993 (1.00) |
0.9 (1.00) |
0.198 (1.00) |
1 (1.00) |
0.324 (1.00) |
1 (1.00) |
0.352 (1.00) |
0.453 (1.00) |
0.00296 (1.00) |
0.0204 (1.00) |
0.039 (1.00) |
|
| OR14A16 | 7 (5%) | 122 |
0.434 (1.00) |
0.158 (1.00) |
0.136 (1.00) |
0.984 (1.00) |
0.283 (1.00) |
0.176 (1.00) |
0.251 (1.00) |
0.202 (1.00) |
0.504 (1.00) |
0.319 (1.00) |
0.729 (1.00) |
0.239 (1.00) |
0.441 (1.00) |
0.473 (1.00) |
|
| OR5AS1 | 6 (5%) | 123 |
0.416 (1.00) |
0.111 (1.00) |
0.401 (1.00) |
0.956 (1.00) |
0.558 (1.00) |
0.405 (1.00) |
0.667 (1.00) |
0.513 (1.00) |
1 (1.00) |
0.588 (1.00) |
0.634 (1.00) |
0.706 (1.00) |
0.867 (1.00) |
0.135 (1.00) |
|
| PTH | 3 (2%) | 126 |
0.00705 (1.00) |
0.784 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.26 (1.00) |
1 (1.00) |
0.802 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.874 (1.00) |
0.303 (1.00) |
0.22 (1.00) |
0.707 (1.00) |
||
| ADAMTS2 | 11 (9%) | 118 |
0.717 (1.00) |
0.971 (1.00) |
0.527 (1.00) |
0.984 (1.00) |
0.734 (1.00) |
0.139 (1.00) |
0.759 (1.00) |
0.269 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.714 (1.00) |
0.524 (1.00) |
0.695 (1.00) |
0.994 (1.00) |
|
| C1ORF129 | 7 (5%) | 122 |
0.963 (1.00) |
0.782 (1.00) |
0.698 (1.00) |
0.0878 (1.00) |
0.111 (1.00) |
0.223 (1.00) |
0.0968 (1.00) |
0.903 (1.00) |
0.504 (1.00) |
0.319 (1.00) |
0.652 (1.00) |
0.506 (1.00) |
|||
| CMKLR1 | 5 (4%) | 124 |
0.247 (1.00) |
0.256 (1.00) |
0.65 (1.00) |
0.345 (1.00) |
0.0906 (1.00) |
0.316 (1.00) |
0.605 (1.00) |
0.752 (1.00) |
0.391 (1.00) |
0.186 (1.00) |
0.467 (1.00) |
0.798 (1.00) |
0.273 (1.00) |
||
| INHBA | 7 (5%) | 122 |
0.345 (1.00) |
0.0957 (1.00) |
0.698 (1.00) |
0.262 (1.00) |
0.353 (1.00) |
0.0134 (1.00) |
0.676 (1.00) |
0.0509 (1.00) |
0.504 (1.00) |
1 (1.00) |
0.856 (1.00) |
0.00207 (1.00) |
0.00862 (1.00) |
0.211 (1.00) |
|
| OLAH | 5 (4%) | 124 |
0.74 (1.00) |
0.166 (1.00) |
1 (1.00) |
0.871 (1.00) |
0.0564 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.858 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.00233 (1.00) |
0.844 (1.00) |
0.867 (1.00) |
0.859 (1.00) |
|
| CDH11 | 11 (9%) | 118 |
0.229 (1.00) |
0.534 (1.00) |
0.0534 (1.00) |
0.885 (1.00) |
0.173 (1.00) |
0.533 (1.00) |
0.557 (1.00) |
0.941 (1.00) |
0.272 (1.00) |
0.21 (1.00) |
0.596 (1.00) |
0.835 (1.00) |
0.327 (1.00) |
0.368 (1.00) |
|
| KRTAP4-11 | 5 (4%) | 124 |
0.101 (1.00) |
0.883 (1.00) |
0.393 (1.00) |
0.000818 (1.00) |
0.587 (1.00) |
0.409 (1.00) |
1 (1.00) |
0.277 (1.00) |
1 (1.00) |
0.591 (1.00) |
0.751 (1.00) |
0.993 (1.00) |
0.621 (1.00) |
||
| PLAC1L | 3 (2%) | 126 |
0.215 (1.00) |
0.884 (1.00) |
1 (1.00) |
0.992 (1.00) |
0.352 (1.00) |
1 (1.00) |
0.256 (1.00) |
1 (1.00) |
0.897 (1.00) |
0.382 (1.00) |
|||||
| C7ORF58 | 12 (9%) | 117 |
0.742 (1.00) |
0.212 (1.00) |
1 (1.00) |
0.514 (1.00) |
0.266 (1.00) |
0.241 (1.00) |
0.375 (1.00) |
0.11 (1.00) |
0.309 (1.00) |
0.689 (1.00) |
0.131 (1.00) |
0.0029 (1.00) |
0.00112 (1.00) |
0.231 (1.00) |
|
| SEMA3D | 11 (9%) | 118 |
0.285 (1.00) |
0.202 (1.00) |
0.115 (1.00) |
0.731 (1.00) |
0.251 (1.00) |
0.635 (1.00) |
0.759 (1.00) |
0.843 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.691 (1.00) |
0.732 (1.00) |
0.00243 (1.00) |
0.0559 (1.00) |
0.666 (1.00) |
|
| LRRC32 | 7 (5%) | 122 |
0.822 (1.00) |
0.286 (1.00) |
1 (1.00) |
0.374 (1.00) |
0.315 (1.00) |
0.337 (1.00) |
0.406 (1.00) |
0.745 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.622 (1.00) |
0.0997 (1.00) |
0.787 (1.00) |
0.759 (1.00) |
|
| GABRG1 | 6 (5%) | 123 |
0.113 (1.00) |
0.337 (1.00) |
0.7 (1.00) |
0.956 (1.00) |
0.0672 (1.00) |
1 (1.00) |
0.667 (1.00) |
0.63 (1.00) |
0.45 (1.00) |
0.588 (1.00) |
0.238 (1.00) |
0.206 (1.00) |
0.701 (1.00) |
0.658 (1.00) |
|
| G3BP1 | 6 (5%) | 123 |
0.936 (1.00) |
0.0269 (1.00) |
1 (1.00) |
0.832 (1.00) |
0.027 (1.00) |
0.734 (1.00) |
0.667 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.588 (1.00) |
0.914 (1.00) |
1 (1.00) |
|||
| SDK1 | 8 (6%) | 121 |
0.925 (1.00) |
0.858 (1.00) |
0.0719 (1.00) |
0.522 (1.00) |
0.082 (1.00) |
0.792 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.352 (1.00) |
0.902 (1.00) |
0.35 (1.00) |
0.544 (1.00) |
0.795 (1.00) |
|
| COL25A1 | 9 (7%) | 120 |
0.13 (1.00) |
0.613 (1.00) |
1 (1.00) |
0.758 (1.00) |
0.238 (1.00) |
0.518 (1.00) |
0.524 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.422 (1.00) |
0.139 (1.00) |
0.418 (1.00) |
0.795 (1.00) |
|
| EPHB6 | 15 (12%) | 114 |
0.357 (1.00) |
0.18 (1.00) |
1 (1.00) |
0.686 (1.00) |
0.311 (1.00) |
0.749 (1.00) |
0.664 (1.00) |
1 (1.00) |
0.631 (1.00) |
0.463 (1.00) |
0.226 (1.00) |
0.00596 (1.00) |
0.0229 (1.00) |
0.682 (1.00) |
|
| MARCH11 | 5 (4%) | 124 |
0.776 (1.00) |
0.648 (1.00) |
1 (1.00) |
0.293 (1.00) |
0.000512 (1.00) |
0.717 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0544 (1.00) |
1 (1.00) |
0.591 (1.00) |
0.455 (1.00) |
0.362 (1.00) |
0.375 (1.00) |
0.823 (1.00) |
|
| LRRTM4 | 11 (9%) | 118 |
0.16 (1.00) |
0.789 (1.00) |
0.0534 (1.00) |
0.984 (1.00) |
1 (1.00) |
0.533 (1.00) |
0.557 (1.00) |
0.496 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.691 (1.00) |
0.0258 (1.00) |
0.562 (1.00) |
0.106 (1.00) |
0.56 (1.00) |
|
| CYP4V2 | 6 (5%) | 123 |
0.387 (1.00) |
0.973 (1.00) |
0.0829 (1.00) |
0.248 (1.00) |
0.273 (1.00) |
0.223 (1.00) |
0.0376 (1.00) |
0.116 (1.00) |
1 (1.00) |
0.588 (1.00) |
0.844 (1.00) |
0.525 (1.00) |
0.888 (1.00) |
0.337 (1.00) |
|
| CYLC1 | 6 (5%) | 123 |
0.0266 (1.00) |
0.398 (1.00) |
1 (1.00) |
0.248 (1.00) |
0.273 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.339 (1.00) |
0.45 (1.00) |
0.252 (1.00) |
0.584 (1.00) |
0.212 (1.00) |
0.701 (1.00) |
0.149 (1.00) |
|
| HSD3B2 | 7 (5%) | 122 |
0.399 (1.00) |
0.962 (1.00) |
0.136 (1.00) |
0.79 (1.00) |
0.0134 (1.00) |
0.883 (1.00) |
0.676 (1.00) |
0.482 (1.00) |
0.504 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.567 (1.00) |
0.527 (1.00) |
0.42 (1.00) |
0.892 (1.00) |
|
| LOC440563 | 6 (5%) | 123 |
0.784 (1.00) |
0.205 (1.00) |
0.239 (1.00) |
0.798 (1.00) |
0.158 (1.00) |
0.811 (1.00) |
0.13 (1.00) |
0.162 (1.00) |
1 (1.00) |
0.588 (1.00) |
0.242 (1.00) |
0.407 (1.00) |
0.584 (1.00) |
||
| UTS2D | 3 (2%) | 126 |
1 (1.00) |
0.992 (1.00) |
0.721 (1.00) |
0.424 (1.00) |
0.477 (1.00) |
0.256 (1.00) |
1 (1.00) |
0.664 (1.00) |
|||||||
| CHRNA4 | 8 (6%) | 121 |
0.37 (1.00) |
0.113 (1.00) |
0.0719 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.742 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.609 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.749 (1.00) |
0.00268 (1.00) |
0.519 (1.00) |
||
| KDM4DL | 3 (2%) | 126 |
0.447 (1.00) |
0.0751 (1.00) |
0.927 (1.00) |
0.721 (1.00) |
0.584 (1.00) |
1 (1.00) |
0.477 (1.00) |
0.256 (1.00) |
1 (1.00) |
||||||
| ZNF676 | 11 (9%) | 118 |
0.429 (1.00) |
0.174 (1.00) |
0.758 (1.00) |
0.885 (1.00) |
0.351 (1.00) |
0.233 (1.00) |
1 (1.00) |
0.648 (1.00) |
1 (1.00) |
0.21 (1.00) |
0.972 (1.00) |
0.231 (1.00) |
0.0925 (1.00) |
0.943 (1.00) |
|
| C18ORF34 | 11 (9%) | 118 |
0.997 (1.00) |
0.753 (1.00) |
0.203 (1.00) |
0.391 (1.00) |
0.265 (1.00) |
0.0988 (1.00) |
0.166 (1.00) |
0.433 (1.00) |
1 (1.00) |
0.691 (1.00) |
0.283 (1.00) |
0.95 (1.00) |
0.66 (1.00) |
0.672 (1.00) |
|
| KRTAP15-1 | 5 (4%) | 124 |
0.471 (1.00) |
0.411 (1.00) |
0.65 (1.00) |
0.871 (1.00) |
0.0415 (1.00) |
0.507 (1.00) |
1 (1.00) |
0.858 (1.00) |
1 (1.00) |
0.591 (1.00) |
0.634 (1.00) |
0.345 (1.00) |
|||
| SLC5A11 | 9 (7%) | 120 |
0.798 (1.00) |
0.506 (1.00) |
0.495 (1.00) |
0.996 (1.00) |
0.155 (1.00) |
0.518 (1.00) |
1 (1.00) |
0.863 (1.00) |
0.198 (1.00) |
0.354 (1.00) |
0.452 (1.00) |
0.729 (1.00) |
0.787 (1.00) |
||
| SLITRK4 | 11 (9%) | 118 |
0.414 (1.00) |
0.882 (1.00) |
0.758 (1.00) |
0.996 (1.00) |
0.265 (1.00) |
0.4 (1.00) |
1 (1.00) |
0.795 (1.00) |
0.0102 (1.00) |
0.691 (1.00) |
0.0677 (1.00) |
0.252 (1.00) |
0.0949 (1.00) |
0.725 (1.00) |
|
| EIF2C1 | 4 (3%) | 125 |
0.445 (1.00) |
0.547 (1.00) |
1 (1.00) |
0.989 (1.00) |
0.122 (1.00) |
0.788 (1.00) |
1 (1.00) |
0.832 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.343 (1.00) |
0.797 (1.00) |
0.692 (1.00) |
0.881 (1.00) |
|
| FKBP6 | 5 (4%) | 124 |
0.361 (1.00) |
0.0973 (1.00) |
0.163 (1.00) |
0.871 (1.00) |
0.131 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.666 (1.00) |
1 (1.00) |
0.591 (1.00) |
0.467 (1.00) |
0.822 (1.00) |
0.621 (1.00) |
0.107 (1.00) |
|
| HTR1A | 6 (5%) | 123 |
0.848 (1.00) |
0.0907 (1.00) |
0.401 (1.00) |
0.832 (1.00) |
0.00848 (1.00) |
0.854 (1.00) |
0.667 (1.00) |
0.566 (1.00) |
0.45 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0294 (1.00) |
0.891 (1.00) |
0.804 (1.00) |
0.193 (1.00) |
|
| SULT1C3 | 4 (3%) | 125 |
0.595 (1.00) |
0.527 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.409 (1.00) |
1 (1.00) |
0.277 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.918 (1.00) |
0.92 (1.00) |
|||
| REG1A | 5 (4%) | 124 |
0.904 (1.00) |
0.512 (1.00) |
1 (1.00) |
0.998 (1.00) |
0.33 (1.00) |
0.655 (1.00) |
0.272 (1.00) |
1 (1.00) |
0.068 (1.00) |
1 (1.00) |
0.512 (1.00) |
0.281 (1.00) |
0.741 (1.00) |
||
| OR8H3 | 9 (7%) | 120 |
0.592 (1.00) |
0.893 (1.00) |
0.169 (1.00) |
0.0165 (1.00) |
0.013 (1.00) |
0.396 (1.00) |
0.524 (1.00) |
0.509 (1.00) |
0.597 (1.00) |
0.354 (1.00) |
0.641 (1.00) |
0.588 (1.00) |
0.678 (1.00) |
0.832 (1.00) |
|
| ASTN2 | 9 (7%) | 120 |
0.297 (1.00) |
0.765 (1.00) |
1 (1.00) |
0.000158 (0.42) |
0.659 (1.00) |
0.453 (1.00) |
0.342 (1.00) |
0.162 (1.00) |
1 (1.00) |
0.354 (1.00) |
0.508 (1.00) |
0.203 (1.00) |
0.114 (1.00) |
0.71 (1.00) |
|
| C1ORF49 | 4 (3%) | 125 |
0.873 (1.00) |
0.553 (1.00) |
0.312 (1.00) |
0.0566 (1.00) |
0.377 (1.00) |
1 (1.00) |
0.522 (1.00) |
0.802 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0851 (1.00) |
0.0018 (1.00) |
0.281 (1.00) |
0.927 (1.00) |
|
| CRB1 | 15 (12%) | 114 |
0.000725 (1.00) |
0.372 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.686 (1.00) |
0.0528 (1.00) |
0.505 (1.00) |
0.815 (1.00) |
0.202 (1.00) |
0.631 (1.00) |
1 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.963 (1.00) |
0.763 (1.00) |
0.804 (1.00) |
|
| CYBB | 7 (5%) | 122 |
0.682 (1.00) |
0.452 (1.00) |
0.02 (1.00) |
0.878 (1.00) |
0.613 (1.00) |
0.503 (1.00) |
0.676 (1.00) |
0.562 (1.00) |
1 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.528 (1.00) |
0.652 (1.00) |
|||
| GPR139 | 8 (6%) | 121 |
0.627 (1.00) |
0.311 (1.00) |
0.465 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.0562 (1.00) |
0.101 (1.00) |
1 (1.00) |
0.285 (1.00) |
1 (1.00) |
0.352 (1.00) |
0.824 (1.00) |
0.379 (1.00) |
0.399 (1.00) |
0.0128 (1.00) |
|
| LRRIQ3 | 7 (5%) | 122 |
0.163 (1.00) |
0.751 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0033 (1.00) |
0.205 (1.00) |
0.883 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.572 (1.00) |
0.549 (1.00) |
1 (1.00) |
||
| ODAM | 4 (3%) | 125 |
0.0733 (1.00) |
0.311 (1.00) |
0.312 (1.00) |
0.989 (1.00) |
0.228 (1.00) |
0.163 (1.00) |
0.129 (1.00) |
1 (1.00) |
0.327 (1.00) |
1 (1.00) |
0.453 (1.00) |
0.164 (1.00) |
0.552 (1.00) |
0.254 (1.00) |
|
| OR5W2 | 6 (5%) | 123 |
0.203 (1.00) |
0.809 (1.00) |
0.7 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.203 (1.00) |
0.475 (1.00) |
0.667 (1.00) |
0.234 (1.00) |
0.45 (1.00) |
0.0542 (1.00) |
0.982 (1.00) |
0.599 (1.00) |
0.888 (1.00) |
0.145 (1.00) |
|
| UPP1 | 5 (4%) | 124 |
0.725 (1.00) |
0.645 (1.00) |
0.65 (1.00) |
0.871 (1.00) |
0.398 (1.00) |
0.185 (1.00) |
1 (1.00) |
0.292 (1.00) |
0.391 (1.00) |
0.591 (1.00) |
0.668 (1.00) |
0.344 (1.00) |
|||
| ZBBX | 10 (8%) | 119 |
0.973 (1.00) |
0.904 (1.00) |
0.323 (1.00) |
0.898 (1.00) |
0.397 (1.00) |
0.809 (1.00) |
0.388 (1.00) |
0.145 (1.00) |
1 (1.00) |
0.666 (1.00) |
0.319 (1.00) |
0.909 (1.00) |
0.263 (1.00) |
0.0208 (1.00) |
|
| SLC32A1 | 8 (6%) | 121 |
0.143 (1.00) |
0.908 (1.00) |
0.285 (1.00) |
0.833 (1.00) |
0.9 (1.00) |
0.883 (1.00) |
0.296 (1.00) |
0.344 (1.00) |
0.553 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0118 (1.00) |
0.433 (1.00) |
0.729 (1.00) |
0.649 (1.00) |
|
| TAX1BP1 | 3 (2%) | 126 |
0.845 (1.00) |
0.842 (1.00) |
0.575 (1.00) |
0.286 (1.00) |
0.0125 (1.00) |
0.415 (1.00) |
1 (1.00) |
0.349 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.555 (1.00) |
0.883 (1.00) |
|||
| RABL3 | 3 (2%) | 126 |
0.0405 (1.00) |
0.967 (1.00) |
0.575 (1.00) |
1 (1.00) |
0.26 (1.00) |
0.163 (1.00) |
1 (1.00) |
0.802 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.949 (1.00) |
0.804 (1.00) |
0.772 (1.00) |
0.953 (1.00) |
|
| TTLL7 | 6 (5%) | 123 |
0.256 (1.00) |
0.997 (1.00) |
1 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.722 (1.00) |
0.545 (1.00) |
0.667 (1.00) |
0.891 (1.00) |
1 (1.00) |
0.252 (1.00) |
0.853 (1.00) |
0.267 (1.00) |
0.934 (1.00) |
0.681 (1.00) |
|
| MS4A14 | 8 (6%) | 121 |
0.645 (1.00) |
0.101 (1.00) |
1 (1.00) |
0.993 (1.00) |
0.0467 (1.00) |
0.691 (1.00) |
0.47 (1.00) |
0.566 (1.00) |
0.553 (1.00) |
1 (1.00) |
0.659 (1.00) |
0.0864 (1.00) |
0.459 (1.00) |
0.905 (1.00) |
|
| DUSP27 | 10 (8%) | 119 |
0.168 (1.00) |
0.143 (1.00) |
0.515 (1.00) |
0.738 (1.00) |
0.102 (1.00) |
0.137 (1.00) |
0.55 (1.00) |
1 (1.00) |
0.936 (1.00) |
1 (1.00) |
0.666 (1.00) |
0.859 (1.00) |
0.906 (1.00) |
0.107 (1.00) |
0.65 (1.00) |
| C14ORF177 | 4 (3%) | 125 |
0.23 (1.00) |
0.819 (1.00) |
1 (1.00) |
0.989 (1.00) |
0.759 (1.00) |
0.317 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0968 (1.00) |
1 (1.00) |
0.124 (1.00) |
0.656 (1.00) |
1 (1.00) |
|||
| TBX5 | 8 (6%) | 121 |
0.954 (1.00) |
0.199 (1.00) |
0.0719 (1.00) |
0.986 (1.00) |
0.119 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.84 (1.00) |
0.553 (1.00) |
0.352 (1.00) |
0.00334 (1.00) |
0.494 (1.00) |
0.034 (1.00) |
0.579 (1.00) |
|
| NHEDC1 | 7 (5%) | 122 |
0.189 (1.00) |
0.115 (1.00) |
0.459 (1.00) |
0.102 (1.00) |
0.283 (1.00) |
0.142 (1.00) |
0.251 (1.00) |
0.26 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.00546 (1.00) |
0.493 (1.00) |
0.552 (1.00) |
0.799 (1.00) |
|
| RBM19 | 12 (9%) | 117 |
0.97 (1.00) |
0.106 (1.00) |
0.359 (1.00) |
0.272 (1.00) |
0.445 (1.00) |
0.151 (1.00) |
0.581 (1.00) |
0.492 (1.00) |
0.309 (1.00) |
0.689 (1.00) |
0.651 (1.00) |
0.441 (1.00) |
0.0686 (1.00) |
0.301 (1.00) |
|
| THEMIS | 8 (6%) | 121 |
0.0298 (1.00) |
0.31 (1.00) |
0.285 (1.00) |
0.993 (1.00) |
0.2 (1.00) |
0.691 (1.00) |
0.692 (1.00) |
0.463 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.873 (1.00) |
0.559 (1.00) |
0.883 (1.00) |
0.489 (1.00) |
|
| OR2T34 | 6 (5%) | 123 |
0.896 (1.00) |
0.147 (1.00) |
0.7 (1.00) |
0.998 (1.00) |
0.491 (1.00) |
0.234 (1.00) |
0.667 (1.00) |
0.379 (1.00) |
0.45 (1.00) |
0.588 (1.00) |
0.217 (1.00) |
0.124 (1.00) |
0.273 (1.00) |
0.57 (1.00) |
|
| NLGN1 | 11 (9%) | 118 |
0.692 (1.00) |
0.453 (1.00) |
0.527 (1.00) |
0.974 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0467 (1.00) |
0.557 (1.00) |
0.0664 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.21 (1.00) |
0.597 (1.00) |
0.187 (1.00) |
0.263 (1.00) |
0.566 (1.00) |
|
| ZNF831 | 23 (18%) | 106 |
0.252 (1.00) |
0.799 (1.00) |
1 (1.00) |
0.573 (1.00) |
0.583 (1.00) |
0.437 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.646 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.0244 (1.00) |
0.412 (1.00) |
0.272 (1.00) |
0.0707 (1.00) |
0.955 (1.00) |
|
| GDI1 | 3 (2%) | 126 |
0.652 (1.00) |
0.201 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.26 (1.00) |
0.163 (1.00) |
1 (1.00) |
0.802 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.325 (1.00) |
||||
| GLYATL1 | 6 (5%) | 123 |
0.923 (1.00) |
0.537 (1.00) |
0.239 (1.00) |
0.00588 (1.00) |
0.0672 (1.00) |
0.734 (1.00) |
0.34 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.588 (1.00) |
0.946 (1.00) |
0.932 (1.00) |
|||
| SPRYD5 | 8 (6%) | 121 |
0.129 (1.00) |
0.564 (1.00) |
0.723 (1.00) |
0.0189 (1.00) |
0.082 (1.00) |
0.171 (1.00) |
1 (1.00) |
0.304 (1.00) |
0.553 (1.00) |
0.616 (1.00) |
0.849 (1.00) |
0.724 (1.00) |
0.16 (1.00) |
0.54 (1.00) |
|
| UGT2B10 | 8 (6%) | 121 |
0.644 (1.00) |
0.15 (1.00) |
0.285 (1.00) |
0.522 (1.00) |
0.0423 (1.00) |
0.54 (1.00) |
1 (1.00) |
0.364 (1.00) |
1 (1.00) |
0.121 (1.00) |
0.34 (1.00) |
0.643 (1.00) |
0.271 (1.00) |
0.261 (1.00) |
|
| PLA2G2A | 3 (2%) | 126 |
0.575 (1.00) |
1 (1.00) |
0.721 (1.00) |
0.584 (1.00) |
1 (1.00) |
0.477 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.22 (1.00) |
||||||
| SERPINB4 | 7 (5%) | 122 |
0.0461 (1.00) |
0.758 (1.00) |
1 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.315 (1.00) |
0.0756 (1.00) |
1 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.504 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.802 (1.00) |
0.571 (1.00) |
0.379 (1.00) |
0.377 (1.00) |
|
| NXF5 | 5 (4%) | 124 |
0.485 (1.00) |
0.549 (1.00) |
0.393 (1.00) |
1 (1.00) |
0.19 (1.00) |
0.316 (1.00) |
0.605 (1.00) |
0.752 (1.00) |
1 (1.00) |
0.591 (1.00) |
0.783 (1.00) |
0.187 (1.00) |
0.804 (1.00) |
0.143 (1.00) |
|
| PGK2 | 9 (7%) | 120 |
0.714 (1.00) |
0.881 (1.00) |
1 (1.00) |
0.758 (1.00) |
0.00285 (1.00) |
1 (1.00) |
0.712 (1.00) |
0.609 (1.00) |
1 (1.00) |
0.354 (1.00) |
0.16 (1.00) |
0.612 (1.00) |
0.678 (1.00) |
||
| NTM | 7 (5%) | 122 |
0.878 (1.00) |
0.518 (1.00) |
0.698 (1.00) |
0.00276 (1.00) |
0.00798 (1.00) |
1 (1.00) |
0.676 (1.00) |
0.67 (1.00) |
0.504 (1.00) |
0.319 (1.00) |
0.286 (1.00) |
0.218 (1.00) |
0.379 (1.00) |
||
| LELP1 | 3 (2%) | 126 |
0.701 (1.00) |
0.0751 (1.00) |
1 (1.00) |
0.26 (1.00) |
0.584 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.293 (1.00) |
0.382 (1.00) |
0.735 (1.00) |
|||
| PSG11 | 5 (4%) | 124 |
0.792 (1.00) |
0.0927 (1.00) |
1 (1.00) |
0.957 (1.00) |
0.806 (1.00) |
0.316 (1.00) |
0.605 (1.00) |
0.43 (1.00) |
0.391 (1.00) |
0.591 (1.00) |
0.772 (1.00) |
||||
| IL31 | 3 (2%) | 126 |
0.741 (1.00) |
0.575 (1.00) |
1 (1.00) |
0.026 (1.00) |
1 (1.00) |
0.424 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.122 (1.00) |
|||||
| GDF5 | 3 (2%) | 126 |
1 (1.00) |
0.275 (1.00) |
0.0746 (1.00) |
0.0846 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0458 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.172 (1.00) |
0.883 (1.00) |
|||||
| SKIV2L2 | 9 (7%) | 120 |
0.0894 (1.00) |
0.88 (1.00) |
0.299 (1.00) |
0.123 (1.00) |
0.0113 (1.00) |
0.609 (1.00) |
0.692 (1.00) |
0.313 (1.00) |
0.597 (1.00) |
1 (1.00) |
0.865 (1.00) |
0.964 (1.00) |
0.648 (1.00) |
||
| ARHGAP36 | 10 (8%) | 119 |
0.806 (1.00) |
0.623 (1.00) |
0.323 (1.00) |
0.456 (1.00) |
0.0908 (1.00) |
0.691 (1.00) |
0.735 (1.00) |
0.73 (1.00) |
0.234 (1.00) |
0.365 (1.00) |
0.263 (1.00) |
0.0107 (1.00) |
0.0464 (1.00) |
0.0682 (1.00) |
|
| VN1R2 | 6 (5%) | 123 |
0.808 (1.00) |
0.325 (1.00) |
0.401 (1.00) |
0.603 (1.00) |
0.12 (1.00) |
0.404 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0967 (1.00) |
0.588 (1.00) |
0.733 (1.00) |
0.293 (1.00) |
0.379 (1.00) |
0.252 (1.00) |
|
| SCG2 | 6 (5%) | 123 |
0.377 (1.00) |
0.58 (1.00) |
0.0829 (1.00) |
0.248 (1.00) |
0.273 (1.00) |
0.0346 (1.00) |
1 (1.00) |
0.339 (1.00) |
0.45 (1.00) |
1 (1.00) |
0.403 (1.00) |
0.153 (1.00) |
0.42 (1.00) |
0.867 (1.00) |
|
| FCGR3A | 5 (4%) | 124 |
0.548 (1.00) |
0.212 (1.00) |
0.65 (1.00) |
1 (1.00) |
0.00872 (1.00) |
0.11 (1.00) |
0.0892 (1.00) |
0.00908 (1.00) |
0.391 (1.00) |
0.186 (1.00) |
0.891 (1.00) |
0.393 (1.00) |
0.315 (1.00) |
||
| NETO1 | 9 (7%) | 120 |
0.648 (1.00) |
0.301 (1.00) |
0.0773 (1.00) |
0.69 (1.00) |
0.167 (1.00) |
0.518 (1.00) |
0.712 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.729 (1.00) |
0.378 (1.00) |
0.529 (1.00) |
0.884 (1.00) |
|
| C7 | 9 (7%) | 120 |
0.283 (1.00) |
0.608 (1.00) |
0.0368 (1.00) |
0.996 (1.00) |
0.0613 (1.00) |
0.518 (1.00) |
0.342 (1.00) |
0.455 (1.00) |
1 (1.00) |
0.354 (1.00) |
0.169 (1.00) |
0.815 (1.00) |
0.781 (1.00) |
0.742 (1.00) |
|
| ADAMTS1 | 9 (7%) | 120 |
0.0973 (1.00) |
0.553 (1.00) |
1 (1.00) |
0.998 (1.00) |
0.843 (1.00) |
0.809 (1.00) |
0.524 (1.00) |
0.648 (1.00) |
0.597 (1.00) |
0.639 (1.00) |
0.167 (1.00) |
0.05 (1.00) |
0.396 (1.00) |
0.27 (1.00) |
|
| OR5K3 | 5 (4%) | 124 |
0.162 (1.00) |
0.521 (1.00) |
0.65 (1.00) |
0.591 (1.00) |
0.232 (1.00) |
0.234 (1.00) |
0.605 (1.00) |
0.258 (1.00) |
0.391 (1.00) |
0.591 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.148 (1.00) |
0.621 (1.00) |
||
| PLD5 | 7 (5%) | 122 |
0.854 (1.00) |
0.565 (1.00) |
0.136 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.183 (1.00) |
0.883 (1.00) |
0.676 (1.00) |
0.903 (1.00) |
0.504 (1.00) |
1 (1.00) |
0.502 (1.00) |
0.958 (1.00) |
0.341 (1.00) |
0.0645 (1.00) |
'REG1B MUTATION STATUS' versus 'STOPPEDSMOKINGYEAR'
P value = 1.1e-09 (t-test), Q value = 2.9e-06
Table S1. Gene #29: 'REG1B MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #13: 'STOPPEDSMOKINGYEAR'
| nPatients | Mean (Std.Dev) | |
|---|---|---|
| ALL | 58 | 1990.8 (15.5) |
| REG1B MUTATED | 3 | 2007.7 (1.5) |
| REG1B WILD-TYPE | 55 | 1989.9 (15.4) |
Figure S1. Get High-res Image Gene #29: 'REG1B MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #13: 'STOPPEDSMOKINGYEAR'
'OR8J3 MUTATION STATUS' versus 'HISTOLOGICAL.TYPE'
P value = 6.69e-05 (Chi-square test), Q value = 0.18
Table S2. Gene #87: 'OR8J3 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #5: 'HISTOLOGICAL.TYPE'
| nPatients | LUNG ACINAR ADENOCARCINOMA | LUNG ADENOCARCINOMA MIXED SUBTYPE | LUNG ADENOCARCINOMA- NOT OTHERWISE SPECIFIED (NOS) | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA MUCINOUS | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA NONMUCINOUS | LUNG MICROPAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG MUCINOUS ADENOCARCINOMA | LUNG PAPILLARY ADENOCARCINOMA | MUCINOUS (COLLOID) ADENOCARCINOMA |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ALL | 1 | 31 | 86 | 1 | 2 | 1 | 1 | 4 | 2 |
| OR8J3 MUTATED | 0 | 4 | 3 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| OR8J3 WILD-TYPE | 1 | 27 | 83 | 1 | 0 | 1 | 1 | 4 | 1 |
Figure S2. Get High-res Image Gene #87: 'OR8J3 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #5: 'HISTOLOGICAL.TYPE'
'OR4M2 MUTATION STATUS' versus 'HISTOLOGICAL.TYPE'
P value = 1.89e-05 (Chi-square test), Q value = 0.05
Table S3. Gene #100: 'OR4M2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #5: 'HISTOLOGICAL.TYPE'
| nPatients | LUNG ACINAR ADENOCARCINOMA | LUNG ADENOCARCINOMA MIXED SUBTYPE | LUNG ADENOCARCINOMA- NOT OTHERWISE SPECIFIED (NOS) | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA MUCINOUS | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA NONMUCINOUS | LUNG MICROPAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG MUCINOUS ADENOCARCINOMA | LUNG PAPILLARY ADENOCARCINOMA | MUCINOUS (COLLOID) ADENOCARCINOMA |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ALL | 1 | 31 | 86 | 1 | 2 | 1 | 1 | 4 | 2 |
| OR4M2 MUTATED | 0 | 1 | 4 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| OR4M2 WILD-TYPE | 1 | 30 | 82 | 1 | 0 | 1 | 1 | 4 | 2 |
Figure S3. Get High-res Image Gene #100: 'OR4M2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #5: 'HISTOLOGICAL.TYPE'
'CRISPLD1 MUTATION STATUS' versus 'STOPPEDSMOKINGYEAR'
P value = 1.27e-10 (t-test), Q value = 3.4e-07
Table S4. Gene #107: 'CRISPLD1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #13: 'STOPPEDSMOKINGYEAR'
| nPatients | Mean (Std.Dev) | |
|---|---|---|
| ALL | 58 | 1990.8 (15.5) |
| CRISPLD1 MUTATED | 7 | 2006.4 (1.9) |
| CRISPLD1 WILD-TYPE | 51 | 1988.7 (15.3) |
Figure S4. Get High-res Image Gene #107: 'CRISPLD1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #13: 'STOPPEDSMOKINGYEAR'
'C20ORF85 MUTATION STATUS' versus 'HISTOLOGICAL.TYPE'
P value = 2.5e-15 (Chi-square test), Q value = 6.7e-12
Table S5. Gene #108: 'C20ORF85 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #5: 'HISTOLOGICAL.TYPE'
| nPatients | LUNG ACINAR ADENOCARCINOMA | LUNG ADENOCARCINOMA MIXED SUBTYPE | LUNG ADENOCARCINOMA- NOT OTHERWISE SPECIFIED (NOS) | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA MUCINOUS | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA NONMUCINOUS | LUNG MICROPAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG MUCINOUS ADENOCARCINOMA | LUNG PAPILLARY ADENOCARCINOMA | MUCINOUS (COLLOID) ADENOCARCINOMA |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ALL | 1 | 31 | 86 | 1 | 2 | 1 | 1 | 4 | 2 |
| C20ORF85 MUTATED | 0 | 1 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| C20ORF85 WILD-TYPE | 1 | 30 | 86 | 1 | 0 | 1 | 1 | 4 | 2 |
Figure S5. Get High-res Image Gene #108: 'C20ORF85 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #5: 'HISTOLOGICAL.TYPE'
'F9 MUTATION STATUS' versus 'STOPPEDSMOKINGYEAR'
P value = 2.24e-09 (t-test), Q value = 6e-06
Table S6. Gene #131: 'F9 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #13: 'STOPPEDSMOKINGYEAR'
| nPatients | Mean (Std.Dev) | |
|---|---|---|
| ALL | 58 | 1990.8 (15.5) |
| F9 MUTATED | 4 | 2006.2 (1.7) |
| F9 WILD-TYPE | 54 | 1989.7 (15.4) |
Figure S6. Get High-res Image Gene #131: 'F9 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #13: 'STOPPEDSMOKINGYEAR'
'NOVA1 MUTATION STATUS' versus 'STOPPEDSMOKINGYEAR'
P value = 1.26e-08 (t-test), Q value = 3.3e-05
Table S7. Gene #133: 'NOVA1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #13: 'STOPPEDSMOKINGYEAR'
| nPatients | Mean (Std.Dev) | |
|---|---|---|
| ALL | 58 | 1990.8 (15.5) |
| NOVA1 MUTATED | 4 | 2005.8 (1.9) |
| NOVA1 WILD-TYPE | 54 | 1989.7 (15.5) |
Figure S7. Get High-res Image Gene #133: 'NOVA1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #13: 'STOPPEDSMOKINGYEAR'
'GBA3 MUTATION STATUS' versus 'HISTOLOGICAL.TYPE'
P value = 3.11e-06 (Chi-square test), Q value = 0.0083
Table S8. Gene #137: 'GBA3 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #5: 'HISTOLOGICAL.TYPE'
| nPatients | LUNG ACINAR ADENOCARCINOMA | LUNG ADENOCARCINOMA MIXED SUBTYPE | LUNG ADENOCARCINOMA- NOT OTHERWISE SPECIFIED (NOS) | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA MUCINOUS | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA NONMUCINOUS | LUNG MICROPAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG MUCINOUS ADENOCARCINOMA | LUNG PAPILLARY ADENOCARCINOMA | MUCINOUS (COLLOID) ADENOCARCINOMA |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ALL | 1 | 31 | 86 | 1 | 2 | 1 | 1 | 4 | 2 |
| GBA3 MUTATED | 0 | 0 | 4 | 0 | 2 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| GBA3 WILD-TYPE | 1 | 31 | 82 | 1 | 0 | 1 | 1 | 3 | 2 |
Figure S8. Get High-res Image Gene #137: 'GBA3 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #5: 'HISTOLOGICAL.TYPE'
'GPR101 MUTATION STATUS' versus 'STOPPEDSMOKINGYEAR'
P value = 2.58e-05 (t-test), Q value = 0.068
Table S9. Gene #153: 'GPR101 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #13: 'STOPPEDSMOKINGYEAR'
| nPatients | Mean (Std.Dev) | |
|---|---|---|
| ALL | 58 | 1990.8 (15.5) |
| GPR101 MUTATED | 7 | 2003.7 (5.0) |
| GPR101 WILD-TYPE | 51 | 1989.0 (15.6) |
Figure S9. Get High-res Image Gene #153: 'GPR101 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #13: 'STOPPEDSMOKINGYEAR'
'OR2W5 MUTATION STATUS' versus 'NUMBERPACKYEARSSMOKED'
P value = 3.36e-07 (t-test), Q value = 0.00089
Table S10. Gene #157: 'OR2W5 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #12: 'NUMBERPACKYEARSSMOKED'
| nPatients | Mean (Std.Dev) | |
|---|---|---|
| ALL | 85 | 39.9 (27.3) |
| OR2W5 MUTATED | 3 | 56.7 (1.2) |
| OR2W5 WILD-TYPE | 82 | 39.3 (27.6) |
Figure S10. Get High-res Image Gene #157: 'OR2W5 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #12: 'NUMBERPACKYEARSSMOKED'
'OR7G1 MUTATION STATUS' versus 'HISTOLOGICAL.TYPE'
P value = 1.37e-07 (Chi-square test), Q value = 0.00036
Table S11. Gene #165: 'OR7G1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #5: 'HISTOLOGICAL.TYPE'
| nPatients | LUNG ACINAR ADENOCARCINOMA | LUNG ADENOCARCINOMA MIXED SUBTYPE | LUNG ADENOCARCINOMA- NOT OTHERWISE SPECIFIED (NOS) | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA MUCINOUS | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA NONMUCINOUS | LUNG MICROPAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG MUCINOUS ADENOCARCINOMA | LUNG PAPILLARY ADENOCARCINOMA | MUCINOUS (COLLOID) ADENOCARCINOMA |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ALL | 1 | 31 | 86 | 1 | 2 | 1 | 1 | 4 | 2 |
| OR7G1 MUTATED | 1 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| OR7G1 WILD-TYPE | 0 | 30 | 85 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4 | 2 |
Figure S11. Get High-res Image Gene #165: 'OR7G1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #5: 'HISTOLOGICAL.TYPE'
Methods & Data
Input
-
Mutation data file = LUAD.mutsig.cluster.txt
-
Clinical data file = LUAD.clin.merged.picked.txt
-
Number of patients = 129
-
Number of significantly mutated genes = 198
-
Number of selected clinical features = 15
-
Exclude genes that fewer than K tumors have mutations, K = 3
Survival analysis
For survival clinical features, the Kaplan-Meier survival curves of tumors with and without gene mutations were plotted and the statistical significance P values were estimated by logrank test (Bland and Altman 2004) using the 'survdiff' function in R
Student's t-test analysis
For continuous numerical clinical features, two-tailed Student's t test with unequal variance (Lehmann and Romano 2005) was applied to compare the clinical values between tumors with and without gene mutations using 't.test' function in R
Fisher's exact test
For binary or multi-class clinical features (nominal or ordinal), two-tailed Fisher's exact tests (Fisher 1922) were used to estimate the P values using the 'fisher.test' function in R
Chi-square test
For multi-class clinical features (nominal or ordinal), Chi-square tests (Greenwood and Nikulin 1996) were used to estimate the P values using the 'chisq.test' function in R
Q value calculation
For multiple hypothesis correction, Q value is the False Discovery Rate (FDR) analogue of the P value (Benjamini and Hochberg 1995), defined as the minimum FDR at which the test may be called significant. We used the 'Benjamini and Hochberg' method of 'p.adjust' function in R to convert P values into Q values.
References
[1] Bland and Altman, Statistics notes: The logrank test, BMJ 328(7447):1073 (2004)
[2] Lehmann and Romano, Testing Statistical Hypotheses (3E ed.), New York: Springer. ISBN 0387988645 (2005)
[3] Fisher, R.A., On the interpretation of chi-square from contingency tables, and the calculation of P, Journal of the Royal Statistical Society 85(1):87-94 (1922)
[4] Greenwood and Nikulin, A guide to chi-squared testing, Wiley, New York. ISBN 047155779X (1996)
[5] Benjamini and Hochberg, Controlling the false discovery rate: a practical and powerful approach to multiple testing, Journal of the Royal Statistical Society Series B 59:289-300 (1995)