Hybridization REF p difference q subclass Composite Element REF p difference q subclass STAT5A|STAT5-ALPHA-R-V 2.76570211518283e-07 2.27031327785322 4.83997870156995e-05 1 AKT1 AKT2 AKT3|AKT-R-V 0.000189046627245665 1.58607705839025 0.00413539497099892 1 ERBB3|HER3-R-V 2.71973086012057e-06 1.56610670009684 0.00023797645026055 1 TSC2|TUBERIN-R-C 2.18663841275647e-05 1.32842307970168 0.000956654305580956 1 XRCC5|KU80-R-C 0.000121901038181229 1.0729004990672 0.00332688262532247 1 ATM|ATM-R-C 0.00587417775136522 1.06351438136317 0.0410296640282356 1 PRKAA1|AMPK_PT172-R-V 0.000133075305012899 0.962802837472233 0.00332688262532247 1 GAB2|GAB2-R-V 0.0306695364443621 0.957815766647134 0.103214786110834 1 FRAP1|MTOR-R-V 4.69726477856077e-05 0.933406091540027 0.00164404267249627 1 PRKCA |PKC-ALPHA_PS657-R-V 1.4282628320714e-05 0.928685981105448 0.000833153318708317 1 TP53BP1|53BP1-R-C 0.00308625554947121 0.867467826967935 0.0284260379556559 1 CHEK2|CHK2-M-C 0.00202099038954385 0.755253991760812 0.0221045823856359 1 IGF1R|IGF-1R-BETA-R-C 0.0221024841094065 0.749086389509796 0.082296483386088 1 MSH2|MSH2-M-C 0.0132366989769045 0.72296849811406 0.0609584821304813 1 MAPK1|ERK2-R-C 0.00553894049622485 0.688092847489823 0.0403881077849729 1 RPS6KB1|P70S6K-R-V 0.000236485400229729 0.687098550636799 0.00459832722668917 1 NEK7|NEK7-R-NA 0.0391017157227492 0.61335124852204 0.124414550026929 1 NF2|NF2-R-C 0.000719906194317839 0.577081086783671 0.00964131798480654 1 BECN1|BECLIN-G-V 0.000667193900118736 0.571760998089718 0.00964131798480654 1 EEF2K|EEF2K-R-V 0.0107026820656172 0.512193619173617 0.0530547600657895 1 XIAP|XIAP-R-C 0.00612921042482157 0.496460500745513 0.0410296640282356 1 NCOA3|AIB1-M-V 0.0109141220706767 0.462815612078512 0.0530547600657895 1 PIK3R1|PI3K-P85-R-V 0.0232344737898926 0.447283457553296 0.0829802635353307 1 NOTCH1|NOTCH1-R-V 0.00821259046133016 0.444825018312864 0.0458214468151147 1 PDK1|PDK1_PS241-R-V 0.0176862060792031 0.405029847672399 0.0719787456711754 1 MAPK9|JNK2-R-C 0.0029631201929687 0.393718002223221 0.0284260379556559 1 SMAD4|SMAD4-M-V 0.0151542702305254 0.392510030812537 0.0662999322585486 1 DVL3|DVL3-R-V 0.00437236474199471 0.356755705496798 0.0357242435743309 1 RAF1|C-RAF-R-V 0.0181845670896344 0.343617449078863 0.0723249827428641 1 PIK3CA |PI3K-P110-ALPHA-R-C 0.0063302910214992 0.268882501848858 0.0410296640282356 1 ERBB2|HER2-M-V 0.0216938451773978 0.252481018518327 0.082296483386088 1 CD20|CD20-R-C 0.0346275232933633 -0.153222160370956 0.112218825487751 1 CASP9|CASPASE-9_CLEAVEDD330-R-C 0.0419575100206385 -0.16359376641839 0.12881691673003 1 RAF1|C-RAF_PS338-R-C 0.0012512642095798 -0.181897823680207 0.0145980824450977 1 ERCC1|ERCC1-M-C 0.00782998811655599 -0.204816004935698 0.0457227146465728 1 CCND1|CYCLIN_D1-R-V 0.0194395525882076 -0.22813682036367 0.0755982600652518 1 XRCC1|XRCC1-R-C 0.046171768410018 -0.272086166375192 0.139311370202641 1 MET|C-MET-M-C 0.0232279928772282 -0.289661914344681 0.0829802635353307 1 SETD2|SETD2-R-C 0.0083787788461924 -0.376512639280837 0.0458214468151147 1 KRAS|K-RAS-M-C 0.0078381796536982 -0.377618555945581 0.0457227146465728 1 MAP2K1|MEK1_PS217_S221-R-V 0.0105904846438505 -0.38549342224204 0.0530547600657895 1 CDC2|CDK1-R-V 0.00988203490203905 -0.395359489445062 0.0524047305411162 1 YAP1|YAP-R-V 0.00658645285948005 -0.40032061891555 0.0411653303717503 1 STAT3|STAT3_PY705-R-V 0.0404074431855029 -0.402901622366938 0.126273259954697 1 SNAI2|SNAIL-M-C 0.0163505014693423 -0.426396539874408 0.0697887257837781 1 WWTR1|TAZ_PS89-R-C 0.0325278116813719 -0.443474691990255 0.107403151778115 1 CDKN1A|P21-R-C 0.00455491319844559 -0.448584037664587 0.0357242435743309 1 CHEK1|CHK1-R-C 0.013849586815275 -0.457755373931742 0.0621455818634135 1 MAPT|TAU-M-C 0.000362208335045283 -0.475467113114909 0.00633864586329245 1 CLDN7|CLAUDIN-7-R-V 0.00257811212157245 -0.501918828003233 0.0265393894867752 1 YBX1|YB-1_PS102-R-V 0.0284707785284586 -0.516291539204209 0.0976938478917697 1 RAB11A RAB11B|RAB11-R-V 0.0119878180494748 -0.566404532130348 0.0566991394231916 1 PTGS2|COX-2-R-C 0.0494037532094597 -0.637351432987642 0.144094280194257 1 COL6A1|COLLAGEN_VI-R-V 0.0174238381366697 -0.643525963446621 0.0719787456711754 1 RAB25|RAB25-R-C 0.0238867610134202 -0.653183451387454 0.0836036635469707 1 TGM2|TRANSGLUTAMINASE-M-V 0.0484355418410679 -0.716831333595536 0.14366474274893 1 RPS6|S6_PS240_S244-R-V 0.00469518629834063 -0.86838555534315 0.0357242435743309 1 MAPK14|P38_PT180_Y182-R-V 0.000771305438784523 -1.02127445207819 0.00964131798480654 1 RPS6|S6_PS235_S236-R-V 0.000702985953554172 -1.0937703407242 0.00964131798480654 1 PAI-1|PAL-1-M-C 0.00430658324090268 -1.7596882242987 0.0357242435743309 1 PAI-1|PAL-1-M-C 0.0126323537054881 1.94928770587116 0.0514107418246609 3 TGM2|TRANSGLUTAMINASE-M-V 0.035674874570597 1.24210376495819 0.097983980526015 3 FN1|FIBRONECTIN-R-C 0.00558155591652135 0.951209147555888 0.0351626351906696 3 COL6A1|COLLAGEN_VI-R-V 0.00490635616303202 0.89921497136711 0.0351626351906696 3 RAB11A RAB11B|RAB11-R-V 0.0267367993803424 0.764557883124251 0.0838204514766129 3 CLDN7|CLAUDIN-7-R-V 0.0109142338635615 0.630588372205245 0.0454759744315063 3 NOTCH3|NOTCH3-R-C 0.00781601813012077 0.621818814506377 0.0408566812456991 3 WWTR1|TAZ_PS89-R-C 0.0102844022180172 0.61947992173622 0.044646838679937 3 SNAI2|SNAIL-M-C 0.00823099478935136 0.595330213450032 0.0411549739467568 3 KDR|VEGFR2-R-V 0.0472907150926427 0.580256976880463 0.114942710294618 3 YAP1|YAP-R-V 0.00491829549563831 0.50414391239208 0.0351626351906696 3 ERBB2|HER2_PY1248-R-V 0.0398400775854652 0.502542057076704 0.103398079090066 3 KRAS|K-RAS-M-C 0.0235277157739867 0.464238703834114 0.0791798127009168 3 SETD2|SETD2-R-C 0.0342848156129495 0.413061101483501 0.0967716569720349 3 ESR1|ER-ALPHA_PS118-R-V 0.0291810385692941 0.399306583116042 0.0865539279597706 3 SMAD3|SMAD3-R-V 0.0450136103460404 0.378991995320368 0.112534025865101 3 TP53|P53-R-V 0.00658903878121858 0.307470168394553 0.0383130007803759 3 ERCC1|ERCC1-M-C 0.00944913890108558 0.28985978631937 0.0423999822484609 3 CD20|CD20-R-C 0.00377253409245608 0.26663573574045 0.0314377841038007 3 MRE11A|MRE11-R-C 0.0205944246933077 0.262421334851034 0.0726478523889073 3 AR|AR-R-V 0.0273015184809539 0.260835958324826 0.0838204514766129 3 CASP3|CASPASE-3_ACTIVE-R-C 0.0315476614773466 0.260635222105268 0.0905055862055025 3 FOXO3|FOXO3A-R-C 0.0047920499676066 0.247840254249276 0.0351626351906696 3 BCL2L1|BCL-X-R-C 0.0298898890480439 0.245102360605432 0.0871788430567947 3 ERBB3|HER3_PY1298-R-C 0.00876536592029535 0.22929151832257 0.0415831443543875 3 RAF1|C-RAF_PS338-R-C 0.00136779215997662 0.189454014199804 0.0197629682026781 3 EGFR|EGFR_PY1173-R-C 0.0381418012829512 0.143106868101899 0.101133564007825 3 MET|C-MET_PY1235-R-C 0.0363940499096627 0.10932447954955 0.097983980526015 3 MAPK9|JNK2-R-C 0.0288302048196819 -0.296933197263811 0.0865539279597706 3 DVL3|DVL3-R-V 0.0401775393035684 -0.319672205196022 0.103398079090066 3 EIF4EBP1|4E-BP1_PS65-R-V 0.0079378694991644 -0.320947868850098 0.0408566812456991 3 PIK3CA |PI3K-P110-ALPHA-R-C 0.00540322923295077 -0.348087495467621 0.0351626351906696 3 BCL2|BCL-2-R-C 0.00898481488434909 -0.35515373011842 0.0415831443543875 3 MAPK14|P38_MAPK-R-C 0.0135147445829523 -0.36679844092838 0.053751825045833 3 EEF2|EEF2-R-V 0.00705689528719606 -0.395972715308157 0.0385923961018535 3 SRC|SRC-M-V 0.0270979501464373 -0.408956946751079 0.0838204514766129 3 PCNA|PCNA-M-V 0.00902948277409556 -0.422501568986675 0.0415831443543875 3 FRAP1|MTOR_PS2448-R-C 0.0146128715808879 -0.461516255295889 0.0555924462316387 3 EIF4EBP1|4E-BP1-R-V 0.0462525363767802 -0.467821560761213 0.114002730506148 3 NCOA3|AIB1-M-V 0.00289810938070612 -0.473609190321416 0.0281189883364646 3 PRKCA |PKC-ALPHA_PS657-R-V 0.0270601990669708 -0.498671431391208 0.0838204514766129 3 GSK3A GSK3B|GSK3-ALPHA-BETA-M-V 0.00290587272840254 -0.518851911825693 0.0281189883364646 3 NF2|NF2-R-C 0.00115368998227964 -0.608895868887363 0.0183541588089943 3 EIF4EBP1|4E-BP1_PT70-R-C 1.05569135877288e-05 -0.627953554438085 0.000933641234139373 3 MSH6|MSH6-R-C 0.0104601164907281 -0.632886300233203 0.044646838679937 3 XIAP|XIAP-R-C 0.0180791106108811 -0.641480795170347 0.0659134241021707 3 PTEN|PTEN-R-V 0.0361347762161743 -0.641972795565347 0.097983980526015 3 CCNB1|CYCLIN_B1-R-V 0.00162333666849832 -0.657676633297033 0.0197897348157377 3 PDK1|PDK1_PS241-R-V 0.0014681062093418 -0.688220965167749 0.0197629682026781 3 RPS6KB1|P70S6K-R-V 0.0067868744239523 -0.714511417658813 0.0383130007803759 3 BECN1|BECLIN-G-V 5.75157366453838e-05 -0.729404248653014 0.00251631347823554 3 ACACA ACACB|ACC_PS79-R-V 0.00520150656820467 -0.740237652701018 0.0351626351906696 3 PIK3R1|PI3K-P85-R-V 0.0030529187336733 -0.743785925033791 0.0281189883364646 3 CHEK2|CHK2-M-C 0.000806149268194723 -0.807418881246345 0.0156247543752579 3 PRKAA1|AMPK_PT172-R-V 0.0207565292539735 -0.821658867723904 0.0726478523889073 3 TP53BP1|53BP1-R-C 0.014493631777314 -0.85721982312293 0.0555924462316387 3 ACACA|ACC1-R-C 0.00370274878509906 -0.88514014665895 0.0314377841038007 3 FRAP1|MTOR-R-V 1.60052782995321e-05 -0.908363023085261 0.000933641234139373 3 GSK3A GSK3B|GSK3-ALPHA-BETA_PS21_S9-R-V 0.00588908226282091 -0.92059662939621 0.0355375653790917 3 NEK7|NEK7-R-NA 0.0215931503850851 -0.930514942765302 0.0740941434782332 3 PREX1|P-REX1-R-NA 0.0159748723176413 -0.939376281733228 0.0594809075656857 3 CTNNB1|BETA-CATENIN-R-V 0.0431205323929664 -0.965474271611224 0.109363669112596 3 AKT1 AKT2 AKT3|AKT_PS473-R-V 0.0253905554472988 -1.01650373556409 0.0838204514766129 3 XRCC5|KU80-R-C 0.00562602163050713 -1.02434175567778 0.0351626351906696 3 MAPK1|ERK2-R-C 0.000892843107157597 -1.04246430022935 0.0156247543752579 3 ERBB3|HER3-R-V 0.00169626298420609 -1.15418357421071 0.0197897348157377 3 MSH2|MSH2-M-C 0.00196923078353714 -1.23628637961638 0.0215384616949375 3 GSK3A GSK3B|GSK3_PS9-R-V 0.000762568935115123 -1.25568684990761 0.0156247543752579 3 TSC2|TUBERIN-R-C 0.000369003318152688 -1.37055097476682 0.0092250829538172 3 ATM|ATM-R-C 0.00027002882426764 -1.53916194682961 0.00787584070780617 3 STAT5A|STAT5-ALPHA-R-V 1.29206629548562e-05 -1.91350133240901 0.000933641234139373 3 AKT1 AKT2 AKT3|AKT-R-V 7.8996968576665e-05 -1.92817479438027 0.00276489390018328 3