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1 OK 92 2 0.022 0.104 0.118 0.100 0.114 3 2 0 0 0 2 1 0 3 1 1 1 0 1 0 0 3 0 1 1 0 1 1 1 1 0 0 0 0 2 0 0 4 3 0 1 0 0 1 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 2 0 2 0 0 0 0 1 2 0 3 0 0 1 0 3 2 1 3 3 0 0 0 5 1 1 0 1 3 0 0 1 0 2 5 0 1 0 0 3 2 1 2 1 1 1 0 CPTAC3-LSCC-C3L-02891-TP mutations/Mb 1 OK 92 2 0.022 0.104 0.118 0.100 0.114 2.57 1.64 0.00 0.00 0.00 2.05 1.36 0.00 2.67 1.06 1.17 0.98 0.00 1.03 0.00 0.00 2.79 0.00 1.06 0.98 0.00 1.08 0.96 0.90 2.95 0.00 0.00 0.00 0.00 1.25 0.00 0.00 3.43 2.46 0.00 0.93 0.00 0.00 1.36 0.00 0.89 1.06 0.00 0.00 0.00 1.03 0.00 0.00 0.00 1.51 0.00 1.95 0.00 0.00 0.00 0.00 2.95 4.26 0.00 8.05 0.00 0.00 0.91 0.00 2.57 1.64 1.28 2.78 5.95 0.00 0.00 0.00 4.44 1.06 1.17 0.00 1.86 3.08 0.00 0.00 0.93 0.00 2.12 4.88 0.00 1.08 0.00 0.00 8.86 4.26 3.10 5.36 2.21 0.62 0.91 0.00 CPTAC3-LSCC-C3L-02951-TP # 1 OK 378 15 0.040 0.119 0.145 0.116 0.114 4 4 1 2 3 2 0 1 4 1 0 7 1 10 4 0 7 1 3 2 2 4 2 1 2 1 1 5 1 5 4 1 6 15 4 10 0 0 1 1 15 20 9 14 0 2 0 1 14 15 8 12 0 2 0 0 4 15 10 9 0 3 2 2 5 11 2 6 4 1 2 1 4 4 4 1 2 4 3 1 3 7 4 2 3 1 1 3 2 1 4 4 2 4 1 1 CPTAC3-LSCC-C3L-02951-TP mutations/Mb 1 OK 378 15 0.040 0.119 0.145 0.116 0.114 3.43 3.28 1.28 1.85 5.95 2.05 0.00 1.26 3.56 1.06 0.00 6.85 1.86 10.25 5.93 0.00 6.52 0.75 3.18 1.95 4.33 4.30 1.92 0.90 5.91 2.13 3.10 13.41 2.21 3.12 3.63 0.91 5.14 12.31 5.13 9.26 0.00 0.00 1.36 1.26 13.33 21.12 10.51 13.70 0.00 2.05 0.00 1.39 13.04 11.31 8.48 11.71 0.00 2.15 0.00 0.00 11.82 31.94 30.97 24.14 0.00 1.87 1.82 1.83 4.29 9.03 2.57 5.56 7.93 1.02 2.73 1.26 3.56 4.22 4.67 0.98 3.72 4.10 4.44 1.39 2.79 5.28 4.24 1.95 6.50 1.08 0.96 2.70 5.91 2.13 12.39 10.73 4.42 2.50 0.91 0.91 CPTAC3-LSCC-C3L-02963-TP # 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1 OK 249 7 0.028 0.184 0.246 0.182 0.146 6 0 0 2 2 5 0 1 6 1 2 1 0 2 2 0 0 3 1 0 1 2 1 1 2 1 2 0 1 2 3 5 6 8 2 2 1 1 1 0 7 6 4 8 0 0 0 0 7 8 9 4 0 0 0 0 4 7 4 8 0 1 1 0 5 2 0 2 3 1 0 3 4 6 6 5 2 4 0 0 2 5 5 2 1 2 2 0 2 5 4 10 2 6 3 1 CPTAC3-LSCC-C3L-03272-TP mutations/Mb 1 OK 249 7 0.028 0.184 0.246 0.182 0.146 5.14 0.00 0.00 1.85 3.96 5.12 0.00 1.26 5.33 1.06 2.33 0.98 0.00 2.05 2.96 0.00 0.00 2.26 1.06 0.00 2.17 2.15 0.96 0.90 5.91 2.13 6.19 0.00 2.21 1.25 2.72 4.57 5.14 6.57 2.57 1.85 1.98 1.02 1.36 0.00 6.22 6.34 4.67 7.83 0.00 0.00 0.00 0.00 6.52 6.03 9.54 3.90 0.00 0.00 0.00 0.00 11.82 14.91 12.39 21.46 0.00 0.62 0.91 0.00 4.29 1.64 0.00 1.85 5.95 1.02 0.00 3.78 3.56 6.34 7.00 4.89 3.72 4.10 0.00 0.00 1.86 3.77 5.30 1.95 2.17 2.15 1.92 0.00 5.91 10.65 12.39 26.82 4.42 3.75 2.72 0.91 CPTAC3-LSCC-C3L-03678-TP # 1 OK 385 14 0.036 0.232 0.259 0.224 0.122 20 4 2 1 2 0 0 0 5 2 2 4 2 3 0 3 8 5 3 1 0 0 1 0 7 3 5 3 1 9 6 2 12 12 4 4 0 0 0 1 10 19 9 5 0 0 1 0 11 17 10 10 1 0 1 0 5 14 6 10 0 1 0 2 12 4 3 4 3 3 0 1 9 6 2 5 0 1 1 0 14 8 1 5 1 5 1 0 4 2 5 3 3 6 2 2 CPTAC3-LSCC-C3L-03678-TP mutations/Mb 1 OK 385 14 0.036 0.232 0.259 0.224 0.122 17.15 3.28 2.57 0.93 3.96 0.00 0.00 0.00 4.44 2.11 2.33 3.91 3.72 3.08 0.00 4.18 7.45 3.77 3.18 0.98 0.00 0.00 0.96 0.00 20.68 6.39 15.48 8.05 2.21 5.62 5.45 1.83 10.29 9.85 5.13 3.70 0.00 0.00 0.00 1.26 8.89 20.07 10.51 4.89 0.00 0.00 1.48 0.00 10.24 12.82 10.60 9.76 2.17 0.00 0.96 0.00 14.77 29.81 18.58 26.82 0.00 0.62 0.00 1.83 10.29 3.28 3.85 3.70 5.95 3.07 0.00 1.26 8.00 6.34 2.33 4.89 0.00 1.03 1.48 0.00 13.04 6.03 1.06 4.88 2.17 5.38 0.96 0.00 11.82 4.26 15.48 8.05 6.62 3.75 1.82 1.83 CPTAC3-LSCC-C3L-03961-TP # 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1 OK 190 2 0.011 0.108 0.179 0.107 0.099 3 5 1 1 0 1 1 0 1 3 4 2 3 3 0 0 2 0 3 0 0 0 2 0 1 3 0 1 0 3 0 0 6 1 3 6 0 0 0 2 5 6 0 4 2 0 0 1 5 7 4 4 1 1 2 1 4 2 5 4 0 2 3 0 2 3 3 1 2 3 1 2 8 3 1 0 3 3 1 3 1 5 1 3 1 2 0 0 3 2 3 0 0 1 3 2 CPTAC3-LSCC-C3L-03963-TP mutations/Mb 1 OK 190 2 0.011 0.108 0.179 0.107 0.099 2.57 4.10 1.28 0.93 0.00 1.02 1.36 0.00 0.89 3.17 4.67 1.96 5.59 3.08 0.00 0.00 1.86 0.00 3.18 0.00 0.00 0.00 1.92 0.00 2.95 6.39 0.00 2.68 0.00 1.87 0.00 0.00 5.14 0.82 3.85 5.56 0.00 0.00 0.00 2.52 4.44 6.34 0.00 3.91 3.72 0.00 0.00 1.39 4.66 5.28 4.24 3.90 2.17 1.08 1.92 0.90 11.82 4.26 15.48 10.73 0.00 1.25 2.72 0.00 1.71 2.46 3.85 0.93 3.96 3.07 1.36 2.52 7.11 3.17 1.17 0.00 5.59 3.08 1.48 4.18 0.93 3.77 1.06 2.93 2.17 2.15 0.00 0.00 8.86 4.26 9.29 0.00 0.00 0.62 2.72 1.83 CPTAC3-LSCC-C3L-03965-TP # 1 OK 407 6 0.015 0.215 0.249 0.204 0.250 12 6 3 4 7 2 1 0 9 6 3 4 6 1 2 0 9 1 3 1 2 0 3 3 2 3 2 2 1 10 5 3 11 7 4 7 1 2 0 1 13 9 12 8 1 2 0 0 6 22 7 9 0 4 2 1 3 6 5 13 1 0 2 0 15 11 5 4 3 4 3 1 12 4 9 1 3 0 0 0 8 8 6 2 1 3 0 1 4 11 3 1 1 6 0 2 CPTAC3-LSCC-C3L-03965-TP mutations/Mb 1 OK 407 6 0.015 0.215 0.249 0.204 0.250 10.29 4.93 3.85 3.70 13.88 2.05 1.36 0.00 8.00 6.34 3.50 3.91 11.17 1.03 2.96 0.00 8.38 0.75 3.18 0.98 4.33 0.00 2.88 2.70 5.91 6.39 6.19 5.36 2.21 6.25 4.54 2.74 9.43 5.75 5.13 6.48 1.98 2.05 0.00 1.26 11.56 9.50 14.01 7.83 1.86 2.05 0.00 0.00 5.59 16.59 7.42 8.79 0.00 4.30 1.92 0.90 8.86 12.78 15.48 34.87 2.21 0.00 1.82 0.00 12.86 9.03 6.42 3.70 5.95 4.10 4.09 1.26 10.67 4.22 10.51 0.98 5.59 0.00 0.00 0.00 7.45 6.03 6.36 1.95 2.17 3.23 0.00 0.90 11.82 23.42 9.29 2.68 2.21 3.75 0.00 1.83 CPTAC3-LSCC-C3L-04013-TP # 1 OK 154 1 0.006 0.295 0.900 0.272 0.244 5 4 1 2 0 4 1 0 3 0 1 2 1 2 1 1 5 1 4 0 0 0 0 0 2 0 1 1 0 1 1 0 3 1 1 1 1 0 0 1 6 2 3 2 1 0 2 1 4 4 4 2 0 1 0 0 7 1 1 3 0 0 2 1 1 3 1 6 1 2 1 2 2 2 0 3 3 2 0 0 3 3 3 1 0 2 2 0 1 4 0 1 3 1 2 0 CPTAC3-LSCC-C3L-04013-TP mutations/Mb 1 OK 154 1 0.006 0.295 0.900 0.272 0.244 4.29 3.28 1.28 1.85 0.00 4.10 1.36 0.00 2.67 0.00 1.17 1.96 1.86 2.05 1.48 1.39 4.66 0.75 4.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.91 0.00 3.10 2.68 0.00 0.62 0.91 0.00 2.57 0.82 1.28 0.93 1.98 0.00 0.00 1.26 5.33 2.11 3.50 1.96 1.86 0.00 2.96 1.39 3.72 3.02 4.24 1.95 0.00 1.08 0.00 0.00 20.68 2.13 3.10 8.05 0.00 0.00 1.82 0.91 0.86 2.46 1.28 5.56 1.98 2.05 1.36 2.52 1.78 2.11 0.00 2.94 5.59 2.05 0.00 0.00 2.79 2.26 3.18 0.98 0.00 2.15 1.92 0.00 2.95 8.52 0.00 2.68 6.62 0.62 1.82 0.00 CPTAC3-LSCC-C3L-04014-TP # 1 OK 277 6 0.022 0.206 0.221 0.201 0.177 8 2 3 3 1 1 2 1 8 3 2 5 0 2 0 1 5 7 3 4 0 3 1 1 3 1 1 3 1 6 3 4 2 5 5 4 0 1 0 0 10 7 3 1 0 6 1 0 5 10 7 5 1 1 1 1 2 6 3 8 0 0 0 1 4 7 2 0 3 3 2 1 5 5 2 3 1 0 3 1 6 2 0 9 1 0 2 1 2 5 3 5 1 5 3 6 CPTAC3-LSCC-C3L-04014-TP mutations/Mb 1 OK 277 6 0.022 0.206 0.221 0.201 0.177 6.86 1.64 3.85 2.78 1.98 1.02 2.73 1.26 7.11 3.17 2.33 4.89 0.00 2.05 0.00 1.39 4.66 5.28 3.18 3.90 0.00 3.23 0.96 0.90 8.86 2.13 3.10 8.05 2.21 3.75 2.72 3.66 1.71 4.10 6.42 3.70 0.00 1.02 0.00 0.00 8.89 7.39 3.50 0.98 0.00 6.15 1.48 0.00 4.66 7.54 7.42 4.88 2.17 1.08 0.96 0.90 5.91 12.78 9.29 21.46 0.00 0.00 0.00 0.91 3.43 5.75 2.57 0.00 5.95 3.07 2.73 1.26 4.44 5.28 2.33 2.94 1.86 0.00 4.44 1.39 5.59 1.51 0.00 8.79 2.17 0.00 1.92 0.90 5.91 10.65 9.29 13.41 2.21 3.12 2.72 5.49 CPTAC3-LSCC-C3L-04071-TP # 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