SampleName	CN_cNMF	Methlyation_cNMF	RPPA_cNMF	RPPA_cHierarchical	mRNAseq_cNMF	mRNAseq_cHierarchical	miRseq_cNMF	miRseq_cHierarchical
TCGA-BL-A0C8-01	1	1	1	3	1	3	1	1
TCGA-BL-A13I-01	2	2	2	1	2	2	2	2
TCGA-BL-A13J-01	3	3	2	2	1	3	1	3
TCGA-BL-A3JM-01	4	3	NA	NA	2	2	2	2
TCGA-BT-A0S7-01	2	2	1	1	2	2	2	2
TCGA-BT-A0YX-01	2	2	3	3	3	1	1	1
TCGA-BT-A20J-01	3	2	4	2	2	2	3	2
TCGA-BT-A20N-01	3	3	4	2	3	3	2	2
TCGA-BT-A20O-01	2	2	4	2	2	2	3	2
TCGA-BT-A20P-01	4	4	4	3	1	3	2	2
TCGA-BT-A20Q-01	4	4	3	3	1	3	3	2
TCGA-BT-A20R-01	2	1	2	2	2	3	3	3
TCGA-BT-A20T-01	4	4	4	2	1	3	3	3
TCGA-BT-A20U-01	2	2	2	2	3	1	2	2
TCGA-BT-A20V-01	5	2	4	2	3	2	2	2
TCGA-BT-A20W-01	1	1	2	1	1	3	1	1
TCGA-BT-A20X-01	2	2	4	2	3	1	2	2
TCGA-BT-A2LA-01	3	1	4	3	2	2	2	2
TCGA-BT-A2LB-01	6	1	3	3	1	3	3	2
TCGA-BT-A2LD-01	5	1	NA	NA	2	1	1	1
TCGA-BT-A3PH-01	6	3	NA	NA	1	3	2	2
TCGA-BT-A3PJ-01	5	2	NA	NA	3	1	2	2
TCGA-BT-A3PK-01	2	2	NA	NA	3	1	1	1
TCGA-BT-A42B-01	2	3	NA	NA	NA	NA	2	2
TCGA-BT-A42C-01	3	3	NA	NA	NA	NA	1	1
TCGA-BT-A42E-01	3	2	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-BT-A42F-01	2	2	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-C4-A0EZ-01	5	1	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-C4-A0F0-01	2	2	2	1	3	1	2	2
TCGA-C4-A0F1-01	NA	2	3	3	NA	NA	NA	NA
TCGA-C4-A0F6-01	4	1	3	3	1	3	2	2
TCGA-C4-A0F7-01	NA	4	4	3	NA	NA	NA	NA
TCGA-CF-A1HR-01	4	4	3	3	1	3	3	2
TCGA-CF-A1HS-01	3	2	4	2	3	1	2	2
TCGA-CF-A27C-01	4	3	3	3	1	3	2	2
TCGA-CF-A3MF-01	4	3	NA	NA	1	3	1	1
TCGA-CF-A3MG-01	4	3	NA	NA	1	3	1	1
TCGA-CF-A3MH-01	2	3	NA	NA	1	3	2	2
TCGA-CF-A3MI-01	6	3	NA	NA	1	3	2	2
TCGA-CF-A47S-01	2	4	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-CF-A47T-01	2	3	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-CF-A47V-01	2	4	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-CF-A47W-01	2	4	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-CF-A47X-01	4	3	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-CF-A47Y-01	2	4	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-CU-A0YN-01	5	2	1	1	3	1	2	2
TCGA-CU-A0YO-01	2	4	NA	NA	1	3	3	2
TCGA-CU-A0YR-01	1	4	NA	NA	1	3	1	2
TCGA-CU-A3KJ-01	3	2	NA	NA	3	1	2	2
TCGA-CU-A3QU-01	5	1	NA	NA	1	3	1	1
TCGA-CU-A3YL-01	4	3	NA	NA	1	3	3	2
TCGA-DK-A1A3-01	6	1	2	2	2	3	3	3
TCGA-DK-A1A5-01	6	3	3	3	2	3	1	3
TCGA-DK-A1A6-01	1	3	4	3	1	3	2	2
TCGA-DK-A1A7-01	3	1	NA	NA	1	3	2	2
TCGA-DK-A1AA-01	2	3	3	3	1	3	2	2
TCGA-DK-A1AB-01	4	4	3	3	3	1	3	2
TCGA-DK-A1AC-01	1	1	4	2	2	2	1	1
TCGA-DK-A1AD-01	3	1	2	3	1	3	3	2
TCGA-DK-A1AE-01	2	2	4	2	3	1	3	2
TCGA-DK-A1AF-01	2	2	2	1	2	3	3	2
TCGA-DK-A1AG-01	2	3	3	3	1	3	2	2
TCGA-DK-A2HX-01	6	4	2	2	2	3	3	2
TCGA-DK-A2I1-01	6	1	3	3	2	3	1	3
TCGA-DK-A2I2-01	5	2	4	2	3	1	2	2
TCGA-DK-A2I4-01	2	2	NA	NA	2	2	3	2
TCGA-DK-A2I6-01	6	2	NA	NA	3	1	1	1
TCGA-DK-A3IK-01	1	1	NA	NA	1	3	1	3
TCGA-DK-A3IL-01	6	1	NA	NA	1	3	3	3
TCGA-DK-A3IM-01	3	2	NA	NA	3	1	2	2
TCGA-DK-A3IN-01	2	2	NA	NA	2	1	2	2
TCGA-DK-A3IQ-01	4	4	NA	NA	NA	NA	3	3
TCGA-DK-A3IS-01	4	3	NA	NA	1	3	2	2
TCGA-DK-A3IT-01	2	4	NA	NA	2	3	1	3
TCGA-DK-A3IU-01	2	2	NA	NA	2	2	3	3
TCGA-DK-A3IV-01	5	4	NA	NA	1	3	3	2
TCGA-DK-A3WW-01	2	2	NA	NA	NA	NA	2	2
TCGA-DK-A3WX-01	2	2	NA	NA	3	1	2	2
TCGA-DK-A3WY-01	2	2	NA	NA	2	2	3	2
TCGA-DK-A3X1-01	3	1	NA	NA	1	3	2	2
TCGA-DK-A3X2-01	6	3	NA	NA	3	3	2	2
TCGA-E5-A2PC-01	4	2	4	2	3	1	2	2
TCGA-E7-A3X6-01	3	3	NA	NA	3	1	2	2
TCGA-E7-A3Y1-01	2	4	NA	NA	1	3	3	2
TCGA-FD-A3B3-01	2	2	1	1	3	1	3	2
TCGA-FD-A3B4-01	2	2	1	1	3	1	3	2
TCGA-FD-A3B5-01	6	2	NA	NA	3	1	2	2
TCGA-FD-A3B6-01	5	2	NA	NA	3	1	2	2
TCGA-FD-A3B7-01	2	2	NA	NA	2	1	2	2
TCGA-FD-A3B8-01	2	2	NA	NA	2	2	3	2
TCGA-FD-A3N5-01	5	3	NA	NA	3	1	2	2
TCGA-FD-A3N6-01	2	3	NA	NA	3	1	2	2
TCGA-FD-A3NA-01	4	1	NA	NA	1	1	2	2
TCGA-FD-A3SJ-01	3	1	NA	NA	2	3	3	2
TCGA-FD-A3SL-01	6	4	NA	NA	2	3	3	2
TCGA-FD-A3SM-01	2	2	NA	NA	2	3	2	2
TCGA-FD-A3SN-01	3	3	NA	NA	3	1	1	2
TCGA-FD-A3SO-01	2	2	NA	NA	3	1	2	2
TCGA-FD-A3SP-01	2	2	NA	NA	2	2	3	2
TCGA-FD-A3SQ-01	4	4	NA	NA	2	3	3	3
TCGA-FD-A3SR-01	3	1	NA	NA	2	3	3	3
TCGA-FD-A3SS-01	6	3	NA	NA	3	1	1	3
TCGA-FD-A43N-01	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-FD-A43P-01	5	4	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-FD-A43S-01	2	2	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-FD-A43U-01	4	2	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-FD-A43X-01	4	3	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-FJ-A3Z7-01	2	1	NA	NA	NA	NA	1	1
TCGA-FJ-A3ZE-01	2	4	NA	NA	NA	NA	2	2
TCGA-FJ-A3ZF-01	5	1	NA	NA	NA	NA	1	3
TCGA-FT-A3EE-01	6	3	NA	NA	1	1	2	2
TCGA-G2-A2EC-01	NA	4	1	1	1	3	3	2
TCGA-G2-A2EF-01	3	2	1	1	3	1	2	2
TCGA-G2-A2EJ-01	4	2	1	1	3	1	2	2
TCGA-G2-A2EK-01	2	1	1	1	1	3	3	2
TCGA-G2-A2EL-01	2	2	1	3	3	2	2	2
TCGA-G2-A2EO-01	4	3	4	3	1	3	2	2
TCGA-G2-A2ES-01	4	3	4	2	3	1	2	2
TCGA-G2-A3IB-01	2	3	NA	NA	3	1	2	2
TCGA-G2-A3IE-01	1	1	NA	NA	1	3	2	2
TCGA-G2-A3VY-01	3	1	NA	NA	1	3	1	3
TCGA-GC-A3BM-01	4	3	NA	NA	1	3	2	2
TCGA-GC-A3I6-01	4	3	NA	NA	3	1	2	2
TCGA-GC-A3OO-01	2	4	NA	NA	2	3	3	2
TCGA-GC-A3RB-01	1	1	NA	NA	1	3	2	2
TCGA-GC-A3RC-01	2	3	NA	NA	3	1	2	2
TCGA-GC-A3RD-01	6	1	NA	NA	1	3	2	2
TCGA-GC-A3WC-01	2	2	NA	NA	2	1	3	2
TCGA-GC-A3YS-01	3	2	NA	NA	NA	NA	1	3
TCGA-GD-A2C5-01	3	1	3	3	1	3	3	2
TCGA-GD-A3OP-01	2	4	NA	NA	1	3	3	2
TCGA-GD-A3OQ-01	2	3	NA	NA	3	1	2	2
TCGA-GD-A3OS-01	3	2	NA	NA	2	2	3	2
TCGA-GU-A42P-01	6	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-GU-A42Q-01	4	2	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-GU-A42R-01	4	4	NA	NA	NA	NA	2	2
TCGA-GV-A3JV-01	1	3	NA	NA	1	3	1	1
TCGA-GV-A3JW-01	3	4	NA	NA	1	3	2	2
TCGA-GV-A3JX-01	5	3	NA	NA	1	3	2	2
TCGA-GV-A3JZ-01	1	1	NA	NA	2	2	2	2
TCGA-GV-A3QF-01	6	1	NA	NA	1	3	1	1
TCGA-GV-A3QG-01	2	2	NA	NA	2	2	1	1
TCGA-GV-A3QH-01	1	1	NA	NA	1	3	2	2
TCGA-GV-A3QI-01	4	3	NA	NA	1	3	2	2
TCGA-GV-A3QK-01	4	3	NA	NA	NA	NA	2	2
TCGA-GV-A40E-01	1	2	NA	NA	NA	NA	2	2
TCGA-GV-A40G-01	3	3	NA	NA	NA	NA	1	1
TCGA-H4-A2HO-01	2	1	3	3	1	3	1	1
TCGA-H4-A2HQ-01	1	1	1	1	1	3	1	1
TCGA-HQ-A2OE-01	4	1	3	3	1	3	1	1
TCGA-K4-A3WS-01	2	4	NA	NA	2	3	3	3
TCGA-K4-A3WU-01	2	2	NA	NA	NA	NA	1	1
TCGA-K4-A3WV-01	3	2	NA	NA	3	2	2	2
