Chromosome Arm	TCGA-AF-2691-01A-01D-1167-02	TCGA-AF-2692-01A-01D-1167-02	TCGA-AF-3913-01A-02D-1115-02	TCGA-AG-3574-01A-01D-1167-02	TCGA-AG-3727-01A-01D-1167-02	TCGA-AG-3728-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3878-01A-02D-1167-02	TCGA-AG-3881-01A-01D-0957-02	TCGA-AG-3882-01A-01D-0957-02	TCGA-AG-3885-01A-01D-0957-02	TCGA-AG-3887-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3890-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3892-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3893-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3894-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3896-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3898-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3901-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3902-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3909-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3999-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-4001-01A-02D-1115-02	TCGA-AG-4005-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-4007-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-4008-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-4015-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-A002-01A-01D-A077-02	TCGA-AG-A008-01A-01D-A077-02	TCGA-AG-A00Y-01A-02D-A077-02	TCGA-AG-A011-01A-01D-A077-02	TCGA-AG-A01N-01A-01D-A077-02	TCGA-AG-A01W-01A-21D-A079-02	TCGA-AG-A01Y-01A-41D-A079-02	TCGA-AG-A020-01A-21D-A079-02	TCGA-AG-A032-01A-01D-A077-02
1p	0.000	-0.415	0.000	0.000	0.000	-0.348	0.000	-0.395	0.454	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.313	0.000	0.000	-0.302	-0.515	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.395	0.000	0.000	-0.607	0.000	0.000	-0.066	0.000	0.000	-0.515
1q	0.000	0.734	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.130	0.454	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.302	0.465	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.395	0.000	0.000	0.425	0.000	0.791	0.384	0.000	0.000	0.440
2p	0.000	0.000	0.000	0.796	0.000	0.000	0.000	-0.429	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.461	0.878	0.000	0.471	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.396	0.000	0.000	0.000	0.303
2q	0.000	0.000	0.331	0.796	0.000	0.000	0.000	-0.429	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.354	0.342	0.000	0.000	0.000	0.503	0.878	0.000	0.471	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.396	0.436	0.000	0.000	0.303
3p	0.000	0.000	1.028	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.461	0.000	-0.559	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.548	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.541	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
3q	0.000	0.000	1.028	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.461	0.000	0.537	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.548	0.000	0.000	0.000	0.000	0.338	0.000	0.541	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
4p	0.000	-0.395	0.000	0.000	0.000	-0.409	0.000	-0.454	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.769	0.000	0.000	-0.363	0.000	0.067	-0.340	-0.573	0.000	-0.544	0.000	0.000	-0.573	0.000	-0.465	-0.660	0.710	0.000	-0.480	-0.790	0.000	0.000
4q	0.000	-0.395	0.000	0.000	0.000	-0.409	0.000	-0.454	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.550	0.000	0.000	-0.363	0.000	0.511	-0.340	-0.573	0.000	-0.544	0.000	0.000	-0.573	0.000	-0.465	-0.660	0.000	0.000	-0.480	-0.790	0.000	0.000
5p	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.423	-0.449	0.946	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.395	0.000	0.000	0.000	-0.556	0.315	0.000	0.454	0.000	-0.550	0.000	0.000	0.000	0.000	0.385	-0.468	0.000	0.000	0.804
5q	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.429	0.000	-0.423	-0.449	0.946	0.000	-0.338	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.395	0.000	0.000	0.000	-0.556	0.000	0.000	0.454	0.000	-0.550	0.000	0.000	0.000	0.000	0.385	-0.468	-0.756	0.000	0.804
6p	0.000	-0.406	0.531	0.000	0.000	0.732	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.480	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.519	0.482	0.000	0.000	0.000	-0.385	0.000	-0.558	0.386	0.000	0.000	0.000	0.000
6q	0.000	-0.406	0.531	0.000	0.000	0.732	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.480	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.018	0.482	0.000	0.000	0.000	-0.385	0.000	-0.558	0.386	0.000	0.000	0.000	0.000
7p	0.000	0.000	1.140	0.000	0.000	0.455	-0.368	0.000	0.511	1.449	0.000	0.331	0.000	0.488	0.000	0.553	0.560	0.000	0.000	0.738	0.000	1.481	0.000	1.446	0.393	1.348	0.000	-0.338	0.000	0.000	0.766	0.472	0.000	0.000	0.395
7q	0.000	0.000	1.140	0.000	0.000	0.455	-0.368	0.000	0.511	1.449	0.000	0.331	0.000	0.488	0.000	0.553	0.560	0.000	0.000	0.738	0.564	1.481	0.000	0.487	0.000	0.000	0.000	-0.338	0.000	0.000	0.766	0.472	0.000	0.000	0.395
8p	0.083	-0.465	-0.100	0.801	-0.881	-0.327	0.000	0.218	0.000	-1.046	0.803	-0.348	0.000	-0.627	0.000	-0.148	0.316	0.000	0.273	0.000	-0.533	-0.693	0.087	-0.064	-0.362	0.147	0.000	0.000	-0.747	-0.438	-0.832	0.398	0.726	-0.336	0.409
8q	0.490	0.368	0.703	0.801	0.000	0.000	0.000	0.613	0.000	0.000	0.803	0.000	0.000	0.000	0.000	0.550	0.316	0.000	0.815	0.000	1.516	0.000	0.534	0.964	1.066	0.574	0.000	0.000	0.557	1.237	0.894	0.398	1.505	-0.336	0.409
9p	0.000	0.000	1.262	0.000	0.000	0.000	-0.367	2.732	-0.366	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.536	0.000	0.000	0.469	0.000	0.000	1.187	0.000	0.000	0.000	1.139	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.898	0.000	0.902	0.350
9q	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.367	0.000	-0.366	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.536	0.000	0.000	0.469	0.000	0.000	0.611	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.898	0.000	0.902	0.350
10p	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.327	-0.327	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.063	0.000	-0.343	0.000	-0.433	0.000	0.539	0.000	-0.752	0.000
10q	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.413	0.000	-0.397	0.000	0.000	-0.843	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.344	0.000	-0.327	0.486	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.536	0.000	-0.343	0.000	-0.433	0.000	0.539	0.000	-0.752	0.000
11p	0.000	0.689	0.579	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.416	0.000	-0.560	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.450	0.000	0.481	0.000	0.000	0.000	-0.305	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
11q	0.000	-0.434	0.579	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.416	0.000	-0.560	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.450	0.000	0.481	0.000	0.000	0.000	-0.305	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.767	0.000
12p	0.000	0.000	-0.586	0.840	0.000	-0.388	0.000	0.000	0.000	0.000	0.830	0.000	0.000	0.000	0.000	0.392	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.493	0.000	0.000	0.000	-1.040	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.430	0.000	0.000	0.000
12q	0.000	0.000	0.000	0.840	0.000	-0.388	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.392	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.394	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
13q	0.724	0.947	1.013	0.000	0.868	1.276	0.000	0.000	1.464	2.510	0.752	0.367	0.000	1.605	0.731	2.282	0.000	0.000	0.454	0.706	1.900	0.928	3.421	0.932	0.645	1.109	0.000	0.000	2.614	0.000	0.000	0.000	0.769	0.000	1.882
14q	0.000	-0.434	0.000	0.000	-0.869	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.431	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.596	-0.490	0.000	0.000	-0.522	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.431	0.816	0.000	-0.516
15q	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.444	0.000	-0.405	-0.437	0.000	0.000	-0.382	0.000	-0.604	0.000	0.000	0.000	0.450	0.000	-0.680	-0.476	0.000	-0.481	0.000	-0.470	-0.505	0.000	-0.345	-0.673	-0.544	0.000	0.566	0.000	0.000	-0.495
16p	0.000	0.000	0.480	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.346	0.000	0.477	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.808	0.000	0.000	-0.503	0.313	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.670	0.000	0.000	0.000	0.446
16q	0.000	0.000	0.480	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.346	0.000	0.477	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.808	0.000	0.000	-0.503	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.670	0.307	0.000	0.000	0.446
17p	-0.437	-0.380	0.000	0.000	-0.883	0.000	0.000	-0.302	0.319	-0.509	0.000	-0.347	0.000	-0.583	0.000	0.000	-0.560	0.000	-0.527	-0.625	-0.455	-0.573	-0.509	0.531	-0.549	-0.470	0.000	-0.321	-0.412	-0.462	-0.630	-0.474	-0.043	0.000	0.000
17q	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.319	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.527	0.000	-0.455	0.000	0.000	1.047	0.000	-0.470	0.000	-0.321	0.000	0.000	-0.630	-0.474	0.720	0.000	0.000
18p	0.000	-0.455	-0.791	-0.856	0.000	-0.861	0.000	0.000	-0.523	0.000	-0.853	-0.458	0.000	-0.748	0.000	-0.720	-0.737	0.603	-0.402	-1.074	-1.084	-0.603	0.000	-0.530	-0.599	-0.579	0.000	-0.893	-0.146	-0.622	-0.477	-0.468	-0.051	-0.835	-0.539
18q	0.000	-0.455	-0.791	-0.856	-0.867	-0.861	0.000	-0.986	-0.523	-1.067	-0.853	-0.458	0.000	-0.748	0.000	-0.720	-0.737	0.603	-0.402	-1.074	-1.084	-0.603	-0.550	-0.530	-0.599	-0.579	0.000	-0.893	-0.694	-0.622	-0.477	-0.943	-0.798	-0.835	-0.539
19p	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.426	-0.325	0.595	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.564	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.574	0.000	1.036	0.000	-0.447	0.000	0.000	0.000	-0.588	0.000	0.000	0.000	0.000	0.478
19q	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.426	-0.325	0.595	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.564	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.574	0.000	0.510	0.000	0.101	0.000	0.000	0.000	-0.588	0.000	0.000	0.000	0.000	0.478
20p	0.000	0.000	0.972	-0.851	-0.846	1.543	-0.359	0.000	0.000	0.000	0.865	1.162	0.000	1.686	0.839	1.012	0.488	0.000	0.345	1.593	0.757	2.183	0.528	2.493	1.347	0.000	0.000	-0.304	1.674	0.683	-0.470	0.522	-0.791	-0.459	2.167
20q	1.099	0.000	2.333	1.549	0.817	1.543	-0.359	0.000	2.428	0.440	0.865	1.162	0.000	1.686	0.839	1.012	0.854	0.000	0.872	1.593	0.757	2.183	0.528	2.493	1.347	2.838	0.000	0.828	1.339	0.683	2.506	0.983	-0.059	1.224	2.167
21q	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.399	0.000	-0.471	-0.592	0.476	0.000	-0.797	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.481	0.000	0.000	-0.371	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.338	-0.551	0.000	0.000	0.000	0.458	-0.484	0.000	-0.825	-0.941	0.000
22q	0.000	-0.527	0.000	0.000	0.000	-0.433	0.000	0.000	0.000	-0.566	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.411	0.000	-0.512	0.000	0.000	-0.447	0.000	0.000	-0.389	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.837	0.000
Xq	0.000	0.987	1.225	0.894	-0.841	1.315	-0.590	0.605	0.975	0.000	0.000	0.634	0.000	2.329	0.000	0.000	1.921	0.000	0.995	-0.331	0.000	0.459	0.492	2.419	1.966	0.519	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.801	0.000	0.376
