SampleName	CN_cNMF	Methlyation_cNMF	RPPA_cNMF	RPPA_cHierarchical	mRNAseq_cNMF	mRNAseq_cHierarchical	miRseq_cNMF	miRseq_cHierarchical	miRseq_Mature_cNMF	miRseq_Mature_cHierarchical
TCGA-BL-A0C8-01	1	1	1	1	1	1	1	3	1	4
TCGA-BL-A13I-01	2	2	2	4	1	3	2	1	2	3
TCGA-BL-A13J-01	1	3	3	1	2	1	1	3	1	4
TCGA-BL-A3JM-01	3	1	3	4	1	3	2	1	3	2
TCGA-BL-A5ZZ-01	2	2	NA	NA	1	3	NA	NA	NA	NA
TCGA-BT-A0S7-01	2	2	2	4	1	3	3	1	4	1
TCGA-BT-A0YX-01	2	2	4	1	2	3	1	3	1	4
TCGA-BT-A20J-01	2	2	3	3	1	3	3	1	2	3
TCGA-BT-A20N-01	4	1	3	3	2	1	2	1	2	2
TCGA-BT-A20O-01	2	2	3	3	3	3	3	1	2	3
TCGA-BT-A20P-01	5	3	1	1	4	1	2	1	3	1
TCGA-BT-A20Q-01	2	3	1	1	3	2	3	1	4	1
TCGA-BT-A20R-01	3	2	2	4	3	2	3	2	4	1
TCGA-BT-A20T-01	2	3	3	3	4	1	3	1	4	1
TCGA-BT-A20U-01	2	2	3	3	2	3	3	1	2	1
TCGA-BT-A20V-01	4	2	3	3	2	3	3	1	2	2
TCGA-BT-A20W-01	6	1	2	4	4	1	1	3	1	4
TCGA-BT-A20X-01	2	2	3	3	2	3	3	1	2	3
TCGA-BT-A2LA-01	6	2	3	3	1	1	3	1	2	3
TCGA-BT-A2LB-01	7	1	4	4	3	2	3	1	4	1
TCGA-BT-A2LD-01	6	2	5	4	3	3	1	3	1	4
TCGA-BT-A3PH-01	7	1	1	3	4	1	2	3	3	2
TCGA-BT-A3PJ-01	6	2	3	3	2	3	2	1	2	3
TCGA-BT-A3PK-01	2	2	5	2	2	3	1	3	2	3
TCGA-BT-A42B-01	5	1	2	4	NA	NA	2	1	2	3
TCGA-BT-A42C-01	5	1	1	1	4	1	1	3	1	4
TCGA-BT-A42E-01	5	2	NA	NA	2	3	2	3	2	3
TCGA-BT-A42F-01	2	2	NA	NA	2	3	2	1	2	3
TCGA-C4-A0EZ-01	6	1	5	4	1	1	2	1	3	2
TCGA-C4-A0F0-01	2	2	2	4	2	3	3	1	2	3
TCGA-C4-A0F1-01	NA	2	3	1	2	3	1	3	1	4
TCGA-C4-A0F6-01	5	1	1	1	4	1	2	1	3	2
TCGA-C4-A0F7-01	NA	3	3	4	2	3	2	1	3	1
TCGA-CF-A1HR-01	2	3	1	1	4	2	3	1	4	1
TCGA-CF-A1HS-01	6	2	3	3	2	3	3	1	2	3
TCGA-CF-A27C-01	2	3	1	1	4	1	2	1	3	2
TCGA-CF-A3MF-01	7	3	1	1	4	1	1	3	3	2
TCGA-CF-A3MG-01	5	1	1	1	4	1	1	3	1	4
TCGA-CF-A3MH-01	2	3	1	1	4	1	2	1	3	2
TCGA-CF-A3MI-01	7	1	1	1	4	1	2	1	3	2
TCGA-CF-A47S-01	2	3	NA	NA	4	1	1	3	1	4
TCGA-CF-A47T-01	2	1	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-CF-A47V-01	2	3	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-CF-A47W-01	2	3	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-CF-A47X-01	8	1	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-CF-A47Y-01	2	3	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-CF-A5U8-01	2	3	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-CF-A5UA-01	2	3	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-CU-A0YN-01	6	2	5	2	2	3	2	1	2	2
TCGA-CU-A0YO-01	2	3	NA	NA	4	2	3	1	4	1
TCGA-CU-A0YR-01	1	3	NA	NA	4	1	1	3	1	4
TCGA-CU-A3KJ-01	5	2	3	3	2	3	2	1	2	3
TCGA-CU-A3QU-01	3	1	1	1	4	1	1	3	3	4
TCGA-CU-A3YL-01	2	3	1	1	4	1	2	1	3	1
TCGA-CU-A5W6-01	2	3	NA	NA	4	1	1	3	1	4
TCGA-CU-A72E-01	NA	2	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-DK-A1A3-01	7	2	1	1	3	2	3	2	4	1
TCGA-DK-A1A5-01	5	1	3	1	3	2	1	2	1	1
TCGA-DK-A1A6-01	1	1	3	1	4	1	2	1	3	2
TCGA-DK-A1A7-01	4	3	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-DK-A1AA-01	2	3	1	1	4	1	2	1	3	2
TCGA-DK-A1AB-01	5	3	2	4	2	3	3	1	4	1
TCGA-DK-A1AC-01	4	1	1	3	1	1	1	3	1	4
TCGA-DK-A1AD-01	6	1	1	1	4	2	3	1	4	1
TCGA-DK-A1AE-01	2	1	3	3	2	3	3	1	2	1
TCGA-DK-A1AF-01	2	2	2	4	3	2	3	1	4	1
TCGA-DK-A1AG-01	2	3	1	1	4	1	2	1	3	2
TCGA-DK-A2HX-01	7	3	2	4	3	2	3	2	4	1
TCGA-DK-A2I1-01	4	2	1	1	3	2	3	2	4	1
TCGA-DK-A2I2-01	3	2	3	4	2	3	2	1	2	3
TCGA-DK-A2I4-01	3	2	3	4	3	3	3	1	4	1
TCGA-DK-A2I6-01	7	2	NA	NA	2	3	1	3	1	3
TCGA-DK-A3IK-01	1	1	2	4	4	1	1	2	1	1
TCGA-DK-A3IL-01	4	1	1	4	4	2	3	2	4	1
TCGA-DK-A3IM-01	1	2	5	2	2	3	2	1	2	3
TCGA-DK-A3IN-01	7	2	3	4	3	3	3	1	2	2
TCGA-DK-A3IQ-01	2	2	4	4	3	2	3	2	4	1
TCGA-DK-A3IS-01	8	1	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-DK-A3IT-01	2	3	2	4	3	2	1	2	4	1
TCGA-DK-A3IU-01	2	2	3	4	3	3	3	2	4	1
TCGA-DK-A3IV-01	5	3	5	2	4	1	2	1	3	2
TCGA-DK-A3WW-01	2	2	5	2	2	3	2	1	2	3
TCGA-DK-A3WX-01	2	2	5	2	2	3	2	1	2	3
TCGA-DK-A3WY-01	2	2	2	4	3	3	3	1	4	1
TCGA-DK-A3X1-01	4	2	3	1	4	1	2	1	3	2
TCGA-DK-A3X2-01	8	1	1	3	2	3	2	1	2	2
TCGA-DK-A6AV-01	5	1	NA	NA	4	1	1	3	1	4
TCGA-DK-A6AW-01	2	1	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-DK-A6B0-01	2	3	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-DK-A6B1-01	5	1	NA	NA	1	1	1	3	3	4
TCGA-DK-A6B2-01	4	2	NA	NA	3	2	1	3	1	4
TCGA-DK-A6B5-01	4	2	NA	NA	2	3	2	1	2	2
TCGA-DK-A6B6-01	5	1	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-E5-A2PC-01	8	1	3	3	2	3	2	1	2	2
TCGA-E5-A4TZ-01	6	1	NA	NA	2	3	2	1	2	2
TCGA-E5-A4U1-01	5	1	NA	NA	1	1	2	1	3	2
TCGA-E7-A3X6-01	2	2	3	1	2	3	2	1	3	3
TCGA-E7-A3Y1-01	2	3	1	1	4	1	3	1	3	2
TCGA-E7-A4IJ-01	6	1	NA	NA	1	1	2	1	3	2
TCGA-E7-A4XJ-01	2	1	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-E7-A519-01	2	3	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-E7-A541-01	5	1	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-E7-A5KE-01	5	1	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-E7-A5KF-01	2	3	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-E7-A677-01	2	1	NA	NA	4	1	1	3	1	4
TCGA-E7-A678-01	2	3	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-E7-A6ME-01	3	1	NA	NA	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-E7-A6MF-01	2	3	NA	NA	4	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-E7-A7DU-01	2	3	NA	NA	4	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-E7-A7DV-01	NA	2	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-FD-A3B3-01	6	2	2	4	2	3	3	1	2	1
TCGA-FD-A3B4-01	2	2	2	4	2	3	3	1	2	3
TCGA-FD-A3B5-01	5	2	3	1	2	3	2	1	2	3
TCGA-FD-A3B6-01	3	2	2	4	2	3	2	1	2	3
TCGA-FD-A3B7-01	3	2	2	3	2	3	1	3	2	3
TCGA-FD-A3B8-01	2	2	2	4	3	3	3	1	4	1
TCGA-FD-A3N5-01	6	1	3	4	2	3	2	1	2	3
TCGA-FD-A3N6-01	2	2	5	3	2	3	2	1	2	3
TCGA-FD-A3NA-01	8	2	1	1	4	3	2	1	3	2
TCGA-FD-A3SJ-01	6	2	2	4	1	2	3	1	4	1
TCGA-FD-A3SL-01	3	3	2	4	3	2	3	1	4	1
TCGA-FD-A3SM-01	2	2	2	1	3	2	3	1	3	2
TCGA-FD-A3SN-01	5	1	3	4	2	3	1	3	4	3
TCGA-FD-A3SO-01	2	2	2	4	2	3	2	3	2	3
TCGA-FD-A3SP-01	2	2	5	2	3	3	3	1	4	1
TCGA-FD-A3SQ-01	2	3	2	4	3	2	3	2	4	1
TCGA-FD-A3SR-01	5	1	2	4	3	2	3	2	4	1
TCGA-FD-A3SS-01	8	1	2	4	2	3	1	3	1	4
TCGA-FD-A43N-01	6	1	NA	NA	4	1	1	3	3	2
TCGA-FD-A43P-01	4	3	NA	NA	1	1	2	1	3	2
TCGA-FD-A43S-01	2	2	NA	NA	3	2	3	1	4	1
TCGA-FD-A43U-01	2	2	NA	NA	3	2	2	1	4	3
TCGA-FD-A43X-01	2	1	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-FD-A43Y-01	5	2	NA	NA	2	3	3	1	2	3
TCGA-FD-A5BR-01	1	3	NA	NA	3	2	3	1	4	1
TCGA-FD-A5BS-01	2	2	NA	NA	3	3	3	1	4	3
TCGA-FD-A5BT-01	3	2	NA	NA	3	3	3	3	4	1
TCGA-FD-A5BU-01	2	2	NA	NA	2	3	3	1	4	1
TCGA-FD-A5BV-01	5	1	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-FD-A5BX-01	2	2	NA	NA	3	3	3	1	4	3
TCGA-FD-A5BY-01	5	3	NA	NA	2	3	3	1	4	1
TCGA-FD-A5BZ-01	5	1	NA	NA	3	2	3	3	4	4
TCGA-FD-A5C0-01	5	3	NA	NA	3	2	1	2	1	1
TCGA-FD-A5C1-01	5	2	NA	NA	2	3	1	3	1	3
TCGA-FD-A62N-01	3	2	NA	NA	3	3	3	1	4	3
TCGA-FD-A62O-01	1	1	NA	NA	4	1	1	3	1	4
TCGA-FD-A62P-01	1	2	NA	NA	3	3	3	1	4	1
TCGA-FD-A62S-01	1	2	NA	NA	2	3	3	1	4	1
TCGA-FD-A6TA-01	NA	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-FD-A6TB-01	NA	2	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-FD-A6TC-01	NA	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-FD-A6TD-01	NA	2	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-FD-A6TE-01	NA	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-FD-A6TF-01	3	2	NA	NA	3	2	NA	NA	NA	NA
TCGA-FD-A6TG-01	4	3	NA	NA	3	2	NA	NA	NA	NA
TCGA-FD-A6TH-01	7	1	NA	NA	3	3	NA	NA	NA	NA
TCGA-FD-A6TI-01	2	1	NA	NA	4	2	NA	NA	NA	NA
TCGA-FD-A6TK-01	NA	2	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-FJ-A3Z7-01	4	1	5	2	1	1	1	3	1	4
TCGA-FJ-A3Z9-01	2	1	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-FJ-A3ZE-01	2	3	1	2	4	1	2	1	3	2
TCGA-FJ-A3ZF-01	6	1	1	1	1	1	1	3	3	4
TCGA-FT-A3EE-01	7	1	NA	NA	4	3	2	1	2	2
TCGA-FT-A61P-01	5	2	NA	NA	3	3	3	1	4	1
TCGA-G2-A2EC-01	NA	3	5	2	4	2	3	2	4	1
TCGA-G2-A2EF-01	6	2	5	2	2	3	2	1	2	3
TCGA-G2-A2EJ-01	2	2	3	2	2	3	2	1	2	3
TCGA-G2-A2EK-01	2	2	4	4	4	2	3	1	4	1
TCGA-G2-A2EL-01	3	2	5	3	1	1	2	1	3	2
TCGA-G2-A2EO-01	1	1	3	1	3	2	2	1	4	3
TCGA-G2-A2ES-01	8	3	3	3	2	3	2	1	2	3
TCGA-G2-A3IB-01	2	1	5	2	2	3	2	1	2	3
TCGA-G2-A3IE-01	1	3	5	1	4	1	2	1	3	2
TCGA-G2-A3VY-01	6	1	1	1	1	1	1	3	3	4
TCGA-GC-A3BM-01	8	1	1	1	4	1	2	1	3	2
TCGA-GC-A3I6-01	8	3	3	4	2	3	2	1	2	3
TCGA-GC-A3OO-01	2	3	NA	NA	3	2	3	1	4	1
TCGA-GC-A3RB-01	6	1	NA	NA	1	1	2	1	2	2
TCGA-GC-A3RC-01	5	1	NA	NA	2	3	2	1	2	3
TCGA-GC-A3RD-01	5	1	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-GC-A3WC-01	2	2	3	3	2	3	3	1	4	1
TCGA-GC-A3YS-01	6	2	3	3	2	3	1	3	2	3
TCGA-GC-A4ZW-01	7	1	NA	NA	1	1	2	1	3	2
TCGA-GC-A6I1-01	3	2	NA	NA	2	3	2	1	2	3
TCGA-GC-A6I3-01	6	2	NA	NA	1	2	3	1	4	1
TCGA-GD-A2C5-01	5	1	1	4	4	2	3	1	4	1
TCGA-GD-A3OP-01	3	3	2	4	4	2	3	2	4	1
TCGA-GD-A3OQ-01	2	1	4	1	2	3	2	1	2	2
TCGA-GD-A3OS-01	5	2	5	2	1	3	3	1	2	3
TCGA-GD-A6C6-01	1	1	NA	NA	1	1	2	1	3	2
TCGA-GD-A76B-01	2	1	NA	NA	4	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-GU-A42P-01	7	1	NA	NA	1	1	1	3	1	4
TCGA-GU-A42Q-01	2	2	NA	NA	2	3	2	1	2	3
TCGA-GU-A42R-01	5	3	1	1	4	1	2	1	3	2
TCGA-GU-A762-01	NA	2	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-GU-A763-01	2	1	NA	NA	4	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-GU-A766-01	3	2	NA	NA	2	3	NA	NA	NA	NA
TCGA-GU-A767-01	6	3	NA	NA	4	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-GV-A3JV-01	1	1	2	4	4	1	1	3	1	4
TCGA-GV-A3JW-01	5	3	5	2	4	1	2	1	3	2
TCGA-GV-A3JX-01	3	1	NA	NA	1	1	2	3	3	4
TCGA-GV-A3JZ-01	6	1	1	1	1	1	2	1	3	2
TCGA-GV-A3QF-01	7	1	5	2	4	1	1	3	1	4
TCGA-GV-A3QG-01	2	2	2	4	3	3	1	3	1	4
TCGA-GV-A3QH-01	1	1	1	1	1	1	2	1	3	2
TCGA-GV-A3QI-01	4	3	3	3	1	1	2	1	3	2
TCGA-GV-A3QK-01	7	1	1	1	4	1	2	1	3	2
TCGA-GV-A40E-01	1	2	3	2	2	3	2	1	2	3
TCGA-GV-A40G-01	4	1	1	1	4	1	1	3	1	4
TCGA-GV-A6ZA-01	NA	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-H4-A2HO-01	2	1	1	1	4	1	1	3	1	4
TCGA-H4-A2HQ-01	5	1	1	2	1	1	1	3	1	4
TCGA-HQ-A2OE-01	5	1	1	1	4	1	1	3	1	4
TCGA-HQ-A2OF-01	1	1	NA	NA	1	1	2	1	3	2
TCGA-HQ-A5ND-01	5	2	NA	NA	2	3	2	1	2	3
TCGA-HQ-A5NE-01	6	2	NA	NA	2	3	2	1	2	3
TCGA-K4-A3WS-01	2	3	5	4	3	2	3	2	4	1
TCGA-K4-A3WU-01	2	2	2	4	3	2	1	3	1	4
TCGA-K4-A3WV-01	5	2	2	4	1	3	3	1	2	2
TCGA-K4-A4AB-01	2	2	NA	NA	2	3	1	2	1	1
TCGA-K4-A4AC-01	1	2	NA	NA	2	3	3	1	2	3
TCGA-K4-A54R-01	3	3	NA	NA	3	2	2	1	3	2
TCGA-K4-A5RH-01	6	2	NA	NA	3	3	3	1	2	3
TCGA-K4-A5RI-01	5	1	NA	NA	2	3	3	1	4	2
TCGA-K4-A5RJ-01	3	2	NA	NA	1	3	2	1	2	3
TCGA-K4-A6FZ-01	3	2	NA	NA	2	3	2	1	2	3
TCGA-K4-A6MB-01	6	1	NA	NA	4	1	1	3	3	4
TCGA-KQ-A41N-01	NA	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-KQ-A41P-01	NA	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-KQ-A41Q-01	NA	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-KQ-A41S-01	NA	3	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-LC-A66R-01	3	2	NA	NA	2	3	1	3	2	3
TCGA-LT-A5Z6-01	3	1	NA	NA	4	1	2	1	3	2
TCGA-MV-A51V-01	5	1	NA	NA	4	1	1	3	3	4
TCGA-PQ-A6FI-01	8	2	NA	NA	2	3	2	1	2	3
TCGA-PQ-A6FN-01	3	2	NA	NA	2	3	3	1	2	3
TCGA-R3-A69X-01	2	2	NA	NA	3	2	3	1	4	1
TCGA-S5-A6DX-01	2	3	NA	NA	4	2	1	3	1	4
TCGA-UY-A78K-01	NA	2	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-UY-A78L-01	NA	2	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-UY-A78N-01	NA	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
TCGA-UY-A78O-01	NA	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
