# Non-clustered (scattered) mutations all scattered mutation 
"Sample"	"A_T_coord_clusters"	"G_C_coord_clusters"	"Non_coord_clusters"	"clusters"	"mutations"	"complex"	"insertions"	"deletions"	"indels"	"substitutions"	"bases"	"A_to_T"	"A_to_G"	"A_to_C"	"A"	"a"	"T_to_A"	"T_to_C"	"T_to_G"	"T"	"t"	"G_to_C"	"G_to_T"	"G_to_A"	"G"	"g"	"C_to_G"	"C_to_A"	"C_to_T"	"C"	"c"	"tCw_to_G"	"tCw_to_A"	"tCw_to_T"	"tCw"	"tcw"	"tCw_per_mut"	"tCw_per_C"	"tcw_per_c"	"enrich_tCw"	"freq_tCw"	"wGa_to_C"	"wGa_to_T"	"wGa_to_A"	"wGa"	"wga"	"wGa_per_mut"	"wGa_per_G"	"wga_per_g"	"enrich_wGa"	"freq_wGa"	"[tCw_to_G+tCw_to_T]_per_mut"	"tCw_to_G+tCw_to_T"	"[(C_to_G)+(C_to_T)]-[(tCw_to_G)+(tCw_to_T)]"	"tcw+wga"	"c-tcw"	"Fisher_p-value_tCw"	"BH_Fisher_p-value_tCw"	"bonferroni_Fisher_p-value_tCw"	"odds_ratio_tCw"	"95%_confidence_lower_tCw"	"95%_confidence_upper_tCw"	"APOBEC_enrich"	"tCw_to_G_enrich"	"Fisher_p-value_tCw_to_G"	"BH_Fisher_p-value_tCw_to_G"	"bonferroni_Fisher_p-value_tCw_to_G"	"odds_ratio_tCw_to_G"	"tCw_to_T_enrich"	"Fisher_p-value_tCw_to_T"	"BH_Fisher_p-value_tCw_to_T"	"bonferroni_Fisher_p-value_tCw_to_T"	"odds_ratio_tCw_to_T"	"p-value_GvT_skew"	"BH_p-value_GvT_skew"	"bonferroni_p-value_GvT_skew"	"non-APOBEC_mutations"	"non-APOBEC_substitutions"	"APOBEC_MutLoad_MinEstimate"
"TCGA-05-4244-01A-01D-1105-08"	0	0	0	0	472	0	7	11	18	448	18368	19	19	7	45	4643	24	21	7	52	4517	15	100	57	172	4680	28	91	60	179	4528	5	17	11	33	623	0.0699152542372881	0.184357541899441	0.137588339222615	1.33992126760942	0.0529695024077047	4	12	12	28	649	0.0593220338983051	0.162790697674419	0.138675213675214	1.17389902175082	0.0431432973805855	0.0677966101694915	32	128	1272	7936	0.0202875101454629	0.0377710554740732	1	1.5596572903609	1.09124661232181	Inf	1.44779874213836	1.51513821851689	0.131597495452986	0.177269567404316	1	1.65138510932126	1.42305004569156	0.05107392036396	0.12322029040994	1	1.52647713675701	0.0069060106826951	0.0584625737724261	1	440	416	10
"TCGA-05-4249-01A-01D-1105-08"	0	0	0	0	725	0	3	19	22	694	28454	37	35	8	80	6968	37	25	9	71	7231	35	155	72	262	7117	40	164	77	281	7138	15	19	21	55	1011	0.0758620689655172	0.195729537366548	0.141636312692631	1.38191635778677	0.0544015825914936	13	16	5	34	966	0.0468965517241379	0.129770992366412	0.13573134747787	0.956087114567035	0.0351966873706004	0.0744827586206896	54	170	1977	12278	3.40723836181e-05	9.51533640066451e-05	0.0078025758485449	1.97267548674305	1.49568491036668	Inf	1.73822620854108	2.69189006912831	3.96237147106987e-07	1.39597394903846e-06	9.07383066875e-05	3.69943707041309	1.25819406395019	0.128923690581939	0.265992648147565	1	1.31274267791219	0.870590485124634	1	1	671	640	23
"TCGA-05-4250-01A-01D-1105-08"	0	0	0	0	814	5	9	30	39	757	31037	28	46	15	89	7622	34	39	13	86	7864	46	134	107	287	7834	54	158	83	295	7717	18	19	26	63	1101	0.0773955773955774	0.213559322033898	0.14267202280679	1.49685493926939	0.0572207084468665	18	11	27	56	1053	0.0687960687960688	0.195121951219512	0.134414092417667	1.45164802075371	0.0531813865147198	0.109336609336609	89	201	2154	13397	2.57875887646465e-13	1.37333902955908e-12	5.90535782710405e-11	2.75370668783698	2.20261051213054	Inf	2.21566772324144	2.59905292479109	2.78379415235197e-08	1.06248143481434e-07	6.37488860888601e-06	3.49815656253019	2.01388603821532	3.91208583947493e-07	2.18504306643844e-06	8.95867657239759e-05	2.40587096196683	0.0317994236253433	0.147504025764895	1	725	668	49
"TCGA-05-4382-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	3276	13	16	59	75	3123	128043	164	91	31	286	32080	180	90	26	296	32387	182	830	276	1288	31831	189	787	277	1253	31745	63	114	78	255	4497	0.0778388278388278	0.203511572226656	0.141660103953378	1.43661882595846	0.056704469646431	61	106	71	238	4511	0.0726495726495727	0.184782608695652	0.141717193930445	1.30388277929313	0.0527599201950787	0.0833333333333333	273	651	9008	54568	8.33581348494725e-33	8.25133114776658e-32	1.90890128805292e-30	2.54025551072096	2.24548825676939	Inf	2.08523736476667	2.35891666227803	9.78220417782906e-21	8.00044555972448e-20	2.24012475672285e-18	3.04105264290594	1.90162973479069	4.59964883421731e-15	5.01580753826554e-14	1.05331958303576e-12	2.23412700098676	0.0875079990798019	0.286276168418209	1	3003	2850	142
"TCGA-05-4384-01A-01D-1753-08"	0	0	0	0	330	1	3	14	17	306	12546	13	18	8	39	3153	17	18	6	41	3050	14	53	42	109	3155	12	58	47	117	3188	4	8	10	22	412	0.0666666666666667	0.188034188034188	0.129234629861982	1.45498298896357	0.0533980582524272	6	5	10	21	415	0.0636363636363636	0.192660550458716	0.131537242472266	1.4646844257765	0.0506024096385542	0.0909090909090909	30	85	827	5516	0.000153943637372715	0.000383185793025562	0.0352530929583517	2.35365707365838	1.60064930203753	Inf	2.00084117554282	2.94995814342852	0.00105842270533495	0.00247325305634391	0.242378799521704	4.16760583303593	1.72357105009307	0.0104064168824233	0.0294206106922832	1	1.93314611546624	0.0408532599837751	0.173248084005268	1	300	276	15
"TCGA-05-4389-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	573	3	7	12	19	544	22304	15	29	8	52	5628	35	30	9	74	5651	49	54	105	208	5529	50	62	98	210	5496	27	13	30	70	800	0.12216404886562	0.333333333333333	0.145560407569141	2.29	0.0875	28	15	38	81	814	0.141361256544503	0.389423076923077	0.147223729426659	2.6451108013608	0.0995085995085995	0.214659685863874	123	179	1614	9411	2.77968981291705e-27	2.05338376502582e-26	6.36548967158005e-25	4.00610892983173	3.26127329459419	Inf	2.78210320293459	3.79491945477076	6.98658922636715e-21	5.9256627142151e-20	1.59992893283808e-18	7.28673772870345	2.28816818356621	2.35871332070455e-11	1.74240435626239e-10	5.40145350441342e-09	2.93663441097556	0.15977128902874	0.415768468040698	1	450	421	79
"TCGA-05-4390-01A-02D-1753-08"	0	0	0	0	1233	5	11	33	44	1156	47396	58	50	24	132	11862	65	44	15	124	12076	56	277	108	441	11789	55	309	95	459	11669	5	21	9	35	1615	0.0283860502838605	0.0762527233115468	0.138400891250321	0.550955435493771	0.021671826625387	10	32	15	57	1616	0.0462287104622871	0.129251700680272	0.137076936126898	0.942913551559238	0.0352722772277228	0.0316301703163017	39	275	3231	20227	0.778234077833029	0.845316290546513	1	0.887856627843935	0.654051111098643	Inf	0.901755880039506	0.981120396162179	0.573466496239327	0.62535156018479	1	0.978170097863155	0.858359519006911	0.816441538472511	0.925569862921807	1	0.839379228884167	0.148428552240745	0.399883981919184	1	1194	1117	0
"TCGA-05-4395-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	684	1	6	14	20	659	27019	19	22	7	48	6795	29	27	10	66	6798	61	116	111	288	6730	51	95	111	257	6696	38	17	39	94	954	0.137426900584795	0.365758754863813	0.14247311827957	2.56721239262903	0.0985324947589098	39	16	34	89	894	0.130116959064327	0.309027777777778	0.132838038632987	2.32635004971414	0.0995525727069351	0.219298245614035	150	184	1848	11578	8.68369120298066e-42	1.04661330814872e-40	1.98856528548257e-39	5.10660815992761	4.2130034261003	Inf	3.26279259662493	4.99479166666667	1.25957855285089e-39	2.06031063287753e-38	2.88443488602854e-37	13.778705169063	2.38899126399126	6.0089749909112e-13	5.2925202804564e-12	1.37605527291866e-10	3.06914986486101	0.749896047042068	1	1	534	509	104
"TCGA-05-4396-01A-21D-1855-08"	0	0	0	0	17719	131	2	15	17	17504	717664	23	18	11	52	171344	32	25	7	64	189358	172	7754	58	7984	174569	180	9155	69	9404	182393	6	233	14	253	26152	0.0142784581522659	0.0269034453424075	0.143382695607836	0.187633837042587	0.00967421229733864	5	170	11	186	23313	0.0104972063886224	0.0232965931863727	0.133546047694608	0.174446144895633	0.00797838116072578	0.00203171736553982	36	443	49465	307497	0.999994679745703	1	1	0.50517669025433	0.370828959077848	Inf	0.542364131277741	0.225514252501769	0.999999999998403	1	1	0.20053124847059	1.42056222048358	0.0429425733549941	0.109537365446833	1	1.52363344228093	0.025639747149025	0.130477824380594	1	17683	17468	0
"TCGA-05-4397-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	1868	2	11	58	69	1756	71996	81	104	32	217	18521	79	110	26	215	18529	137	306	229	672	17426	165	295	192	652	17520	65	39	42	146	2606	0.0781584582441113	0.223926380368098	0.148744292237443	1.50544519725598	0.0560245587106677	61	57	82	200	2533	0.107066381156317	0.297619047619048	0.145357511764031	2.04749685108943	0.0789577575996842	0.133832976445396	250	473	5139	29807	2.11918987033381e-39	2.31092609669735e-38	4.85294480306442e-37	3.06548861549252	2.67909148683962	Inf	2.35136779817074	2.83715104208951	1.46443318752792e-29	1.59692952354235e-28	3.35355199943894e-27	4.15235662535163	2.00289620752117	1.34885046430715e-14	1.40403071057426e-13	3.08886756326337e-12	2.42152383225711	0.93693492258911	1	1	1618	1506	144
"TCGA-05-4398-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	1864	3	9	42	51	1780	72980	94	96	28	218	18382	85	81	30	196	18687	114	374	175	663	17837	114	373	216	703	18074	39	46	50	135	2661	0.0724248927038627	0.19203413940256	0.147228062410092	1.304331091906	0.0507328072153326	38	53	58	149	2522	0.0799356223175966	0.22473604826546	0.141391489600269	1.58945951344608	0.0590800951625694	0.0992489270386266	185	434	5183	30728	1.84507573593288e-22	1.20720669579608e-21	4.2252234352863e-20	2.52706966705927	2.17196383461504	Inf	2.0707485669099	2.33992624335293	2.43238439620649e-13	1.42824622238791e-12	5.57016026731286e-11	3.02307066657262	1.91378562514773	1.45340154430928e-11	1.10942984548942e-10	3.32828953646825e-09	2.26244440593613	0.00714826229531848	0.0584625737724261	1	1679	1595	96
"TCGA-05-4402-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	334	2	2	8	10	321	13161	2	10	4	16	3367	7	11	4	22	3525	57	17	55	129	3036	58	27	69	154	3233	38	8	34	80	525	0.239520958083832	0.519480519480519	0.162387875038664	3.19901051329623	0.152380952380952	42	4	27	73	508	0.218562874251497	0.565891472868217	0.167325428194993	3.38198132210218	0.143700787401575	0.422155688622754	141	98	1033	5236	2.66812526811602e-47	3.81875428999105e-46	6.11000686398569e-45	7.28940342577089	5.78275217363703	Inf	3.58029786906561	4.22172650364073	1.48558091091429e-35	2.12623767874608e-34	3.40198028599372e-33	11.5746825673654	2.98542453861287	9.74486458439333e-17	1.31269058225063e-15	2.23157398982607e-14	4.90617739114616	0.0388079016694377	0.167679424194363	1	193	180	102
"TCGA-05-4403-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	370	0	6	17	23	342	14022	28	22	5	55	3499	13	23	3	39	3580	18	63	43	124	3487	14	60	50	124	3456	1	6	4	11	499	0.0297297297297297	0.0887096774193548	0.144386574074074	0.614390070463508	0.0220440881763527	5	11	5	21	497	0.0567567567567568	0.169354838709677	0.142529394895325	1.18820990458882	0.0422535211267606	0.0405405405405405	15	110	996	5947	0.806318943983425	0.870976595151907	1	0.81423379138434	0.485394113781689	Inf	0.836506024096386	1.3070406626506	0.307507672134078	0.376573566410181	1	1.37782267474897	0.674601632335795	0.929640612107475	1	1	0.639773517116604	0.55612706705449	0.84339800235416	1	355	327	0
"TCGA-05-4405-01A-21D-1855-08"	0	0	0	0	896	6	8	17	25	846	34686	45	32	16	93	8572	49	41	15	105	8723	43	169	91	303	8579	56	195	94	345	8812	15	23	17	55	1237	0.0613839285714286	0.159420289855072	0.140376758965048	1.13566014082692	0.0444624090541633	21	23	10	54	1199	0.0602678571428571	0.178217821782178	0.13975987877375	1.27517155385263	0.0450375312760634	0.0703125	63	221	2436	14955	0.000148272557382427	0.000373125446599734	0.0339544156405758	1.75000803135314	1.36038471623891	Inf	1.58368746964546	2.59605911330049	2.71506742257542e-08	1.05381430469453e-07	6.21750439769771e-06	3.50776651105663	1.04193183331114	0.441529918658419	0.652324847566309	1	1.04910434478795	0.231832622705178	0.530896705994858	1	833	783	23
"TCGA-05-4410-01A-21D-1855-08"	0	0	0	0	2433	10	10	39	49	2342	96022	106	91	34	231	24291	132	78	20	230	24293	152	585	232	969	23707	139	556	217	912	23731	43	63	62	168	3416	0.0690505548705302	0.184210526315789	0.143946736336438	1.2797131147541	0.0491803278688525	50	61	64	175	3324	0.071927661323469	0.180598555211558	0.140211751803265	1.28804150072215	0.052647412755716	0.0900123304562269	219	521	6740	40698	1.37278927587541e-26	9.8240232554834e-26	3.14368744175469e-24	2.53806781375746	2.21017529364983	Inf	2.0829501162884	2.2493468750956	1.50882201351743e-14	9.33838489447274e-14	3.45520241095491e-12	2.83607537043004	1.97510722806368	2.92576330393839e-14	2.79166581917455e-13	6.69999796601891e-12	2.35529356629185	0.00869561561279785	0.0615899152019947	1	2214	2123	114
"TCGA-05-4415-01A-22D-1855-08"	0	0	0	0	495	4	2	14	16	464	19024	20	22	3	45	4576	24	14	6	44	4646	21	121	51	193	4869	17	115	50	182	4933	3	10	4	17	638	0.0343434343434343	0.0934065934065934	0.1293330630448	0.722217437734679	0.0266457680250784	4	14	8	26	630	0.0525252525252525	0.134715025906736	0.129390018484288	1.04115470022206	0.0412698412698413	0.0383838383838384	19	120	1268	8534	0.437054695380643	0.515904769289522	1	1.0656386856672	0.674820308201142	Inf	1.05665751310623	1.42399966793957	0.21506665359413	0.2751411378383	1	1.51966004439953	0.918449573663991	0.667888528483569	0.839871292138077	1	0.907444599041048	0.29852388171488	0.615873593808176	1	476	445	0
"TCGA-05-4417-01A-22D-1855-08"	0	0	0	0	922	1	6	14	20	889	36449	30	34	7	71	8736	32	30	15	77	8994	31	260	57	348	9164	35	314	44	393	9555	3	21	8	32	1249	0.03470715835141	0.0814249363867685	0.130716902145474	0.622910542174197	0.0256204963971177	5	24	9	38	1173	0.0412147505422994	0.109195402298851	0.128000872981231	0.853083262290424	0.0323955669224211	0.027114967462039	25	142	2422	16297	0.248810819475912	0.335162809764611	1	1.18461386167147	0.79850007154925	Inf	1.15699649421224	0.936816555313665	0.633439257977524	0.684233915456854	1	0.928094821470904	1.30087645428457	0.15521862470686	0.309087522242356	1	1.36173995871519	0.0760792938595346	0.262047254525264	1	897	864	0
"TCGA-05-4418-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	583	4	6	12	18	553	22673	23	35	7	65	5559	21	30	11	62	5667	29	127	66	222	5647	31	112	61	204	5800	6	13	10	29	769	0.0497427101200686	0.142156862745098	0.132586206896552	1.07218440041816	0.0377113133940182	4	19	7	30	740	0.0514579759862779	0.135135135135135	0.131043031698247	1.03122717311907	0.0405405405405405	0.0463121783876501	27	160	1509	9938	0.338689209466352	0.433295133898294	1	1.11130928907106	0.761249226458159	Inf	1.09527859580485	1.26430307046609	0.263219626878115	0.329384123251849	1	1.31712675219871	1.01542451328773	0.513011828016222	0.727553344273811	1	1.017808357432	0.187991322240526	0.467934921663918	1	556	526	0
"TCGA-05-4420-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	768	2	4	18	22	729	29889	29	25	15	69	7602	43	41	19	103	7414	37	148	82	267	7404	34	168	88	290	7469	6	15	12	33	997	0.04296875	0.113793103448276	0.133485071629402	0.852478124027254	0.033099297893681	5	22	9	36	989	0.046875	0.134831460674157	0.133576445164776	1.00939548516831	0.0364004044489383	0.0416666666666667	32	209	1986	12887	0.542616290203013	0.616269162794236	1	0.993519534456938	0.705443710436541	Inf	0.99437974535441	1.16025559196063	0.348051321077432	0.417297133647811	1	1.18960967895788	0.925102185889461	0.682166202347958	0.839871292138077	1	0.914534108033574	0.0684671808136957	0.244984131349005	1	736	697	0
"TCGA-05-4422-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	154	0	4	5	9	143	5863	5	11	2	18	1583	4	5	5	14	1441	12	16	35	63	1454	13	17	18	48	1385	9	3	9	21	209	0.136363636363636	0.4375	0.150902527075812	2.89922248803828	0.100478468899522	5	1	10	16	209	0.103896103896104	0.253968253968254	0.143741403026135	1.76684134578871	0.076555023923445	0.214285714285714	33	45	418	2421	7.33311472343129e-09	2.79880545277628e-08	1.67928327166577e-06	4.24451785477503	2.79623433534361	Inf	2.87348178137652	3.80344497607655	2.3331545596591e-06	7.12389858882579e-06	0.000534292394161934	7.36361980108009	2.43481989708405	0.00013956398945738	0.000591854696032223	0.03196015358574	3.23478097888855	0.349677032717578	0.684410602498507	1	121	110	22
"TCGA-05-4424-01A-22D-1855-08"	0	0	0	0	1688	6	11	33	44	1616	66256	77	67	21	165	16637	61	76	18	155	17292	106	360	159	625	16143	113	368	190	671	16184	53	47	52	152	2432	0.0900473933649289	0.226527570789866	0.150271873455264	1.50745156482861	0.0625	54	44	36	134	2290	0.0793838862559242	0.2144	0.141857151706622	1.51137956331878	0.0585152838427948	0.115521327014218	195	373	4722	27605	3.63684021491859e-31	3.20321695852445e-30	8.32836409216357e-29	3.0560969959988	2.62425530656502	Inf	2.3503129641892	3.34486876739405	8.86712847479083e-33	1.19445436513359e-31	2.0305724207271e-30	5.58464772783506	1.72622207335292	1.71865790009939e-07	9.83931647806901e-07	3.9357265912276e-05	1.97110575345213	0.112227772763079	0.333768311204482	1	1493	1421	112
"TCGA-05-4425-01A-01D-1753-08"	0	0	0	0	101	0	4	3	7	94	3854	0	13	2	15	882	4	5	2	11	969	4	5	29	38	996	2	3	25	30	1007	1	1	2	4	145	0.0396039603960396	0.133333333333333	0.143992055610725	0.925977011494253	0.0275862068965517	0	1	1	2	106	0.0198019801980198	0.0526315789473684	0.106425702811245	0.494538232373386	0.0188679245283019	0.0396039603960396	4	56	251	1752	0.951060208552999	0.981048593507373	1	0.498709565138221	0.163750178526637	Inf	0.532005312084993	1.33001328021248	0.553023222338504	0.611798637273031	1	1.3957496193767	0.443337760070828	0.971482176413773	1	1	0.410720756349516	0.545454545454546	0.84339800235416	1	97	90	0
"TCGA-05-4426-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	145	0	4	9	13	132	5412	9	10	5	24	1360	6	7	2	15	1359	4	19	23	46	1307	1	29	17	47	1386	1	5	2	8	198	0.0551724137931034	0.170212765957447	0.142857142857143	1.19148936170213	0.0404040404040404	2	3	3	8	178	0.0551724137931034	0.173913043478261	0.136189747513389	1.27699071812408	0.0449438202247191	0.0551724137931034	8	37	376	2317	0.290740875531636	0.384853528882917	1	1.33221898009636	0.617353144123703	Inf	1.27328605200946	4.29734042553191	0.0220905978586447	0.038616388623127	1	9.22998394377055	0.895279255319149	0.674119245447808	0.839871292138077	1	0.880381912770702	0.685082190087752	0.958841985019867	1	137	124	0
"TCGA-05-4427-01A-21D-1855-08"	0	0	0	0	2410	5	11	49	60	2314	94874	109	94	48	251	23701	119	104	61	284	24542	115	574	216	905	23262	136	524	214	874	23369	41	72	43	156	3424	0.0647302904564315	0.178489702517162	0.146518892549959	1.21820264548001	0.0455607476635514	25	62	39	126	3273	0.0522821576763485	0.139226519337017	0.140701573381481	0.98951643532468	0.0384967919340055	0.0614107883817427	148	533	6697	39934	1.83828985643694e-07	6.57763089256343e-07	4.20968377124059e-05	1.65573200281863	1.41052088919385	Inf	1.51324425406252	1.83090008191811	5.98656887056533e-07	1.98684677008617e-06	0.000137092427135946	2.12730078262321	1.32782189873286	0.00451697416232125	0.0141696860708434	1	1.40505274240854	0.150960070653846	0.401975071857334	1	2262	2166	50
"TCGA-05-4430-01A-02D-1265-08"	0	0	0	0	668	1	4	15	19	645	26445	35	38	7	80	6811	34	32	6	72	6705	35	156	46	237	6373	36	163	57	256	6556	7	22	8	37	898	0.0553892215568862	0.14453125	0.136973764490543	1.05517469376392	0.0412026726057906	3	21	8	32	930	0.0479041916167665	0.135021097046413	0.145928134316648	0.925257474706229	0.0344086021505376	0.0389221556886228	26	148	1828	11101	0.414045756279672	0.498907836663098	1	1.06684665357287	0.724697553202132	Inf	1.05684876380191	0.996162973464419	0.557159774233221	0.613411482208691	1	0.99553423550642	1.09868071636464	0.384504030917126	0.608151190753274	1	1.11678219918877	0.276271704595325	0.60555089088151	1	642	619	0
"TCGA-05-4432-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	1627	4	10	34	44	1544	63304	77	101	30	208	15693	88	94	20	202	16708	84	298	160	542	15419	78	322	192	592	15484	19	39	34	92	2223	0.0565457897971727	0.155405405405405	0.14356755360372	1.08245492456019	0.0413855150697256	19	36	19	74	2115	0.0454824830977259	0.136531365313653	0.137168428562164	0.995355613130599	0.0349881796690307	0.0559311616472034	91	423	4338	26565	0.012273171504581	0.0238182735131275	1	1.31739666787012	1.07691353373121	Inf	1.26121569767129	1.67101241398152	0.000920285851279355	0.00217263360765951	0.210745459942972	1.87653973928846	1.07261607255124	0.314161454548378	0.528992449202784	1	1.08550953788361	0.0846624438973709	0.28106092649894	1	1536	1453	19
"TCGA-05-4433-01A-22D-1855-08"	0	0	0	0	119	0	4	6	10	109	4469	1	9	1	11	1084	3	3	4	10	1013	5	13	26	44	1199	6	16	22	44	1173	3	3	1	7	117	0.0588235294117647	0.159090909090909	0.0997442455242967	1.59498834498835	0.0598290598290598	1	0	2	3	148	0.0252100840336134	0.0681818181818182	0.123436196830692	0.552364864864865	0.0202702702702703	0.0588235294117647	7	52	265	2107	0.495936670868539	0.571123338366803	1	1.07030999378576	0.476338089772701	Inf	1.06197633514551	3.2548885077187	0.0275490757737395	0.0457154953056982	1	4.53880559075593	0.559433962264151	0.914658137994109	1	1	0.530173073837431	1	1	1	112	102	0
"TCGA-05-4434-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	116	1	2	8	10	104	4264	2	7	3	12	1147	6	6	1	13	1057	6	7	29	42	1073	11	5	21	37	987	9	1	7	17	152	0.146551724137931	0.459459459459459	0.154002026342452	2.98346372688478	0.111842105263158	2	3	3	8	171	0.0689655172413793	0.19047619047619	0.159366262814539	1.19521024784183	0.0467836257309941	0.181034482758621	21	46	323	1737	0.00128327119069982	0.00288106963402214	0.293869102670259	2.45368283930355	1.50242520773885	Inf	1.99898341111779	4.12675286832999	7.92508527815433e-06	2.32672375474018e-05	0.00181484452869734	9.83986356763398	1.27554179566563	0.255519531427103	0.453596687572144	1	1.34421858262202	1	1	1	95	83	10
"TCGA-05-5420-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	188	0	2	7	9	176	7216	9	14	3	26	1826	10	5	7	22	1738	9	22	32	63	1968	7	29	29	65	1684	1	4	4	9	218	0.0478723404255319	0.138461538461538	0.129453681710214	1.06958362738179	0.0412844036697248	2	1	8	11	274	0.0585106382978723	0.174603174603175	0.139227642276423	1.25408411539798	0.0401459854014599	0.0797872340425532	15	62	492	3160	0.0919100253451127	0.144160245233088	1	1.55367609946746	0.903236204535126	Inf	1.44599303135889	1.39176829268293	0.369128051396886	0.435723318401479	1	1.48198837073984	1.46021591363455	0.115274162324313	0.244423918261738	1	1.57269233114868	0.00791169367365138	0.0589893456626878	1	173	161	0
"TCGA-05-5423-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	313	0	4	5	9	302	12382	13	12	4	29	3165	13	16	2	31	3077	20	62	42	124	3050	16	54	48	118	3090	4	4	10	18	410	0.0575079872204473	0.152542372881356	0.132686084142395	1.14964861513022	0.0439024390243902	6	7	12	25	422	0.0798722044728434	0.201612903225806	0.138360655737705	1.45715486928604	0.0592417061611374	0.10223642172524	32	94	832	5308	0.000328712724424284	0.000784116811387094	0.075275213893161	2.17150779298776	1.49823963764651	Inf	1.87423687423687	2.04994658119658	0.0189493123644871	0.0341684451296657	1	2.45328527300114	1.80395299145299	0.00415583223845554	0.0135955083229474	0.951685582606319	2.06377618226926	0.0135255124610445	0.0794190347071587	1	281	270	15
"TCGA-05-5425-01A-02D-1625-08"	0	0	0	0	84	0	7	23	30	54	2214	2	2	1	5	549	3	1	0	4	560	4	14	6	24	562	0	20	1	21	543	0	6	0	6	79	0.0714285714285714	0.285714285714286	0.14548802946593	1.96383363471971	0.0759493670886076	0	1	0	1	61	0.0119047619047619	0.0416666666666667	0.108540925266904	0.383879781420765	0.0163934426229508	0	0	11	140	965	1	1	1	0	0	Inf	0	0	1	1	1	0	0	1	1	1	0	1	1	1	84	54	0
"TCGA-05-5428-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	844	2	4	16	20	809	33169	28	19	5	52	8242	27	17	11	55	8490	62	153	121	336	8131	62	163	141	366	8306	37	22	65	124	1211	0.146919431279621	0.33879781420765	0.14579821815555	2.32374454567196	0.102394715111478	31	16	58	105	1171	0.124407582938389	0.3125	0.14401672610995	2.16988684884714	0.089666951323655	0.226303317535545	191	195	2382	14055	1.90855138702396e-57	3.97325697844079e-56	4.37058267628487e-55	5.7785540778315	4.8419483950778	Inf	3.41449798358152	3.78414723328187	2.58643888235931e-25	2.46789376691784e-24	5.92294504060282e-23	7.16350009807671	3.23954948372334	3.71377164293919e-35	2.12613426558269e-33	8.50453706233075e-33	5.22060050113599	2.6860601688016e-07	1.23021555731113e-05	6.15107778655566e-05	653	618	135
"TCGA-05-5429-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	94	0	6	5	11	83	3403	1	3	3	7	802	0	4	5	9	910	4	6	25	35	878	4	10	18	32	813	0	1	2	3	112	0.0319148936170213	0.09375	0.137761377613776	0.680524553571429	0.0267857142857143	0	1	2	3	101	0.0319148936170213	0.0857142857142857	0.11503416856492	0.745120226308345	0.0297029702970297	0.0425531914893617	4	47	213	1478	0.897109825063649	0.942376834585209	1	0.590699516382139	0.192504758311146	Inf	0.622664089109822	0	1	1	1	0	0.738508570804673	0.806711653956937	0.920670824827525	1	0.711813074243514	0.0606060606060606	0.227821152944769	1	90	79	0
"TCGA-05-5715-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	287	2	6	6	12	273	11193	7	8	0	15	2809	2	11	2	15	2969	47	9	52	108	2691	46	18	71	135	2724	32	5	39	76	444	0.264808362369338	0.562962962962963	0.162995594713656	3.45385385385385	0.171171171171171	41	2	19	62	406	0.21602787456446	0.574074074074074	0.150873281308064	3.80500821018062	0.152709359605911	0.456445993031359	131	85	850	4565	5.29511305617141e-48	8.08387259908835e-47	1.21258088986325e-45	8.27212311807853	6.46676615757579	Inf	3.86364379084967	5.00056925996205	7.48454328805356e-40	1.42830034413689e-38	1.71396041296427e-37	19.5774639862132	3.00401721664275	7.65459084300278e-16	9.22579633182967e-15	1.75290130304764e-13	4.79037156038142	0.0913122177210932	0.294514054339864	1	156	142	97
"TCGA-17-Z000-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	345	1	9	19	28	311	12751	16	17	7	40	3309	11	11	5	27	3306	27	37	43	107	2989	30	57	50	137	3147	15	11	14	40	447	0.115942028985507	0.291970802919708	0.142040038131554	2.05555283397835	0.0894854586129754	11	3	12	26	448	0.0753623188405797	0.242990654205607	0.149882903981265	1.62120327102804	0.0580357142857143	0.150724637681159	52	98	895	5241	1.29707946608569e-09	5.40056723152042e-09	2.97031197733623e-07	3.10641469635649	2.28585693679653	Inf	2.37670018621974	3.12723708713124	2.58835994015576e-08	1.02195590740633e-07	5.92734426295669e-06	4.90957345494666	1.91669369856431	0.000705270863945149	0.00269178379739065	0.161507027843439	2.27203847946404	1	1	1	293	259	30
"TCGA-17-Z001-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	530	3	12	19	31	492	20172	31	27	9	67	5137	29	12	13	54	5256	30	107	55	192	4759	22	96	61	179	5020	2	12	12	26	754	0.0490566037735849	0.145251396648045	0.150199203187251	0.967058370256213	0.0344827586206897	5	13	12	30	719	0.0566037735849057	0.15625	0.151082160117672	1.03420549374131	0.0417246175243394	0.0584905660377358	31	137	1473	8306	0.134964424270289	0.2020055761954	1	1.27590537489056	0.89061045977618	Inf	1.2250226295542	0.893688965481226	0.6849638830783	0.729566182441538	1	0.877179567191136	1.37355151344898	0.0646900437273242	0.148140200135572	1	1.47093094909763	0.000588742622822256	0.0074901144792387	0.134822060626297	499	461	0
"TCGA-17-Z003-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	614	1	3	11	14	581	23821	43	66	13	122	6270	31	57	7	95	6445	38	67	58	163	5511	47	79	75	201	5595	15	9	16	40	877	0.0651465798045603	0.199004975124378	0.15674709562109	1.26959274323933	0.0456100342075257	9	7	8	24	884	0.0390879478827362	0.147239263803681	0.160406459807657	0.917913555228604	0.0271493212669683	0.0781758957654723	48	170	1761	9345	0.0111102817977091	0.0220412958103745	1	1.49828254537967	1.119972925838	Inf	1.38861885188253	1.78069946888466	0.00284952625873745	0.00593219557500797	0.652541513250876	2.08772013621353	1.13804101394884	0.279274962859069	0.484499746172173	1	1.16838836234115	1	1	1	566	533	13
"TCGA-17-Z004-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	69	0	4	3	7	62	2542	4	8	2	14	726	1	13	2	16	645	6	6	5	17	597	3	4	8	15	574	1	0	0	1	76	0.0144927536231884	0.0666666666666667	0.132404181184669	0.503508771929825	0.0131578947368421	1	2	0	3	98	0.0434782608695652	0.176470588235294	0.164154103852596	1.0750300120048	0.0306122448979592	0.0289855072463768	2	20	174	997	0.858968284884071	0.914901103434662	1	0.573211116259164	0.0947670196783615	Inf	0.611807732497388	1.49553001277139	0.397869170594421	0.46724123110832	1	1.63629839188747	0	1	1	1	0	0.428571428571429	0.760797342192692	1	67	60	0
"TCGA-17-Z005-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	302	1	6	5	11	287	11767	13	15	7	35	3003	21	20	4	45	2945	11	55	35	101	2942	14	54	38	106	2877	2	8	5	15	381	0.0496688741721854	0.141509433962264	0.132429614181439	1.06856336354182	0.0393700787401575	4	5	4	13	415	0.043046357615894	0.128712871287129	0.141060503059143	0.912465704401765	0.0313253012048193	0.0496688741721854	15	83	796	5023	0.364201087315551	0.458253016457479	1	1.14036010547613	0.673051439733861	Inf	1.11892370013332	1.75447236180905	0.117525775433275	0.164106113257439	1	1.9924926415032	0.90127004887451	0.682156984607985	0.839871292138077	1	0.887433441114069	0.547152630062323	0.84339800235416	1	287	272	0
"TCGA-17-Z007-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	309	4	5	9	14	290	11890	13	29	18	60	3228	9	21	19	49	3289	11	22	55	88	2638	12	30	51	93	2735	4	8	6	18	442	0.058252427184466	0.193548387096774	0.161608775137112	1.1976353816961	0.0407239819004525	0	8	4	12	376	0.0388349514563107	0.136363636363636	0.142532221379833	0.956721470019342	0.0319148936170213	0.0453074433656958	14	115	818	4555	0.937664222027124	0.973354970108281	1	0.677943227283812	0.396941139841179	Inf	0.712856086882356	1.14234081003508	0.473239051985238	0.541858714523098	1	1.17224614051242	0.619666005443558	0.969345974060662	1	1	0.580098215021565	0.125278403507509	0.349862858575848	1	295	276	0
"TCGA-17-Z008-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	723	3	7	19	26	676	27716	29	38	9	76	6967	38	34	10	82	7105	38	145	76	259	6819	33	133	93	259	6825	10	16	8	34	949	0.0470262793914246	0.131274131274131	0.139047619047619	0.944094779711218	0.035827186512118	8	14	9	31	933	0.0428769017980636	0.11969111969112	0.13682358117026	0.874784292790724	0.0332261521972133	0.0484094052558783	35	205	1882	11762	0.390653529696523	0.481109334565006	1	1.06703931248741	0.767941016430322	Inf	1.05725292242295	1.83796081483588	0.00695549061885642	0.013731097859639	1	2.12241536878197	0.729263216142968	0.94000557677455	1	1	0.699000157128727	1	1	1	688	641	0
"TCGA-17-Z009-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	140	0	11	18	29	108	4428	5	8	3	16	1171	9	6	2	17	1166	6	17	15	38	1024	3	16	18	37	1067	2	4	3	9	186	0.0642857142857143	0.243243243243243	0.174320524835989	1.39537925021796	0.0483870967741935	1	1	2	4	166	0.0285714285714286	0.105263157894737	0.162109375	0.649334178820545	0.0240963855421687	0.0571428571428571	8	34	352	1739	0.41521096067813	0.498907836663098	1	1.16231080628991	0.535396717551194	Inf	1.13149350649351	1.98011363636364	0.183505890434631	0.240130565197317	1	2.46868836614082	0.900051652892562	0.673543227685213	0.839871292138077	1	0.882253934474847	0.672768878718535	0.95632953954556	1	132	100	0
"TCGA-17-Z010-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	693	0	9	14	23	655	26855	37	30	5	72	6836	33	31	9	73	6855	44	174	62	280	6678	30	129	71	230	6486	13	13	20	46	937	0.0663780663780664	0.2	0.144465001541782	1.38441835645678	0.0490928495197439	18	25	16	59	949	0.0851370851370851	0.210714285714286	0.142108415693321	1.48277133825079	0.0621707060063224	0.0966810966810967	67	140	1886	11278	6.3786753671194e-11	2.981054406266e-10	1.46071665907034e-08	2.86147551868372	2.20277261812157	Inf	2.25917900010758	2.92399186036514	8.78457290552892e-09	3.6575767188475e-08	2.01166719536612e-06	4.31063850569902	1.8892831229718	0.000102327417603701	0.000442131672287689	0.0234329786312475	2.21915707122862	0.55389375498222	0.84339800235416	1	626	588	37
"TCGA-17-Z011-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	274	2	13	15	28	240	9840	10	10	2	22	2498	12	12	7	31	2456	18	47	27	92	2452	8	50	37	95	2434	0	7	9	16	363	0.0583941605839416	0.168421052631579	0.149137222678718	1.1293025953313	0.0440771349862259	3	8	4	15	345	0.0547445255474453	0.16304347826087	0.140701468189233	1.15879017013233	0.0434782608695652	0.0583941605839416	16	74	708	4178	0.229026234984558	0.315945830189541	1	1.27585119121113	0.761286095497574	Inf	1.22686754551161	0.796284224250326	0.748359849813027	0.793400025959181	1	0.769750441520863	1.40179201977401	0.130092474203176	0.265992648147565	1	1.50406301963352	0.00775609292507153	0.0589893456626878	1	258	224	0
"TCGA-17-Z012-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	590	1	5	3	8	578	23698	21	31	14	66	5899	11	28	7	46	5835	34	66	129	229	5964	49	56	132	237	6000	23	6	29	58	859	0.0983050847457627	0.244725738396624	0.143166666666667	1.70937651965046	0.0675203725261933	9	10	40	59	893	0.1	0.25764192139738	0.149731723675386	1.720690279075	0.0660694288913774	0.171186440677966	101	243	1752	10212	5.34507860397727e-12	2.66091956589303e-11	1.22402300031079e-09	2.42238610639334	1.96657898406461	Inf	2.00495778910481	2.63277768608681	9.34548723826481e-08	3.34393215244163e-07	2.14011657756264e-05	3.65673418174251	1.8053062509841	7.16755241014772e-07	3.90802262362816e-06	0.000164136950192383	2.09457450938347	1.64839197111137e-06	6.29136268974173e-05	0.000377481761384504	489	477	51
"TCGA-17-Z013-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	202	0	8	16	24	174	7134	15	18	3	36	1875	2	13	4	19	1895	4	24	30	58	1640	5	31	25	61	1724	2	6	2	10	230	0.0495049504950495	0.163934426229508	0.133410672853828	1.2287954383464	0.0434782608695652	1	4	2	7	225	0.0346534653465347	0.120689655172414	0.13719512195122	0.879693486590038	0.0311111111111111	0.0346534653465347	7	57	455	2909	0.778872215307049	0.845316290546513	1	0.785206429203087	0.352069613840284	Inf	0.808653846153846	2.46446886446886	0.111604348330794	0.156793839065962	1	3.19511396662721	0.537702297702298	0.949778654466105	1	1	0.501524116723974	1	1	1	195	167	0
"TCGA-17-Z014-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	967	2	10	35	45	901	36941	62	48	16	126	9668	69	46	11	126	9793	58	159	104	321	8643	43	187	98	328	8837	15	33	26	74	1359	0.0765253360910031	0.225609756097561	0.153785221228924	1.46704445521276	0.0544518027961737	19	19	27	65	1288	0.0672182006204757	0.202492211838006	0.149022330209418	1.35880449294712	0.0504658385093168	0.0899689762150982	87	216	2647	14833	1.94427943653357e-09	7.8112279116875e-09	4.45239990966188e-07	2.25691589246851	1.80722679489412	Inf	1.89611254287499	2.22302849854309	3.19525735991741e-06	9.62781493975114e-06	0.000731713935421087	2.8434377539093	1.73265456504094	3.60265996086736e-05	0.000175533857667793	0.00825009131038625	1.99323432954198	0.0196307803020908	0.109645089979971	1	880	814	41
"TCGA-17-Z015-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	1419	7	26	49	75	1315	53915	59	74	25	158	14063	63	62	20	145	13780	70	277	153	500	13106	79	276	157	512	12966	12	28	18	58	1866	0.0408738548273432	0.11328125	0.143914854234151	0.787140775723473	0.0310825294748124	19	42	11	72	1924	0.0507399577167019	0.144	0.14680299099649	0.980906444906445	0.0374220374220374	0.0422832980972516	60	399	3790	22282	0.82864990783572	0.890895910302253	1	0.884107402876205	0.692622499493977	Inf	0.899236035663166	1.43123373058738	0.0241740112550011	0.0409782562341728	1	1.54448929824992	0.643533917780237	0.997430999634285	1	1	0.606756791887353	0.883076620415214	1	1	1359	1255	0
"TCGA-17-Z016-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	1463	8	7	22	29	1402	57482	98	71	21	190	15345	99	79	22	200	15338	61	332	108	501	13410	71	292	148	511	13389	16	38	22	76	2122	0.051948051948052	0.148727984344423	0.158488311300321	0.938416108570912	0.0358152686145146	14	50	13	77	2015	0.0526315789473684	0.153692614770459	0.150260999254288	1.02283769929124	0.0382133995037221	0.0444292549555707	65	323	4137	22662	0.257777325992116	0.345210571065465	1	1.10238481521909	0.868194134053588	Inf	1.08521227843275	1.47224602808359	0.0176763858901702	0.0321261299114998	1	1.61110157618454	0.885648001269036	0.805253875328695	0.920670824827525	1	0.867546371916205	0.576345717078458	0.868310323756361	1	1398	1337	0
"TCGA-17-Z017-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	555	0	12	23	35	508	20828	29	34	10	73	5424	38	26	9	73	5442	38	99	59	196	4981	30	92	44	166	4981	11	12	5	28	765	0.0504504504504504	0.168674698795181	0.15358361774744	1.09825970548862	0.0366013071895425	9	6	9	24	753	0.0432432432432432	0.122448979591837	0.151174462959245	0.80998455158956	0.0318725099601594	0.0612612612612613	34	137	1518	8444	0.062320291832788	0.101938191640775	1	1.3804438974373	0.977653487445049	Inf	1.30484093413155	1.93017127799736	0.00230627497273575	0.00484529329134392	0.528136968756487	2.31749055533872	0.892001483812374	0.71893218313984	0.866502473363281	1	0.875035233242729	0.2959200715111	0.615873593808176	1	521	474	0
"TCGA-17-Z018-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	623	4	23	34	57	556	22796	33	21	7	61	5842	27	27	9	63	5849	29	141	36	206	5693	23	163	40	226	5412	4	20	9	33	768	0.0529695024077047	0.146017699115044	0.141906873614191	1.02896847345133	0.04296875	4	17	3	24	798	0.0385232744783307	0.116504854368932	0.140172141226067	0.831155558799912	0.0300751879699248	0.0321027287319422	20	108	1566	9539	0.348234535044204	0.443031714028459	1	1.12797505760497	0.720420685004378	Inf	1.10801803959132	1.09097160821299	0.454945076933832	0.523529761898731	1	1.10753688196786	1.11968138737649	0.385073898075217	0.608151190753274	1	1.14207897624365	0.460766778140137	0.789946930088746	1	603	536	0
"TCGA-17-Z020-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	374	2	5	7	12	356	14596	12	21	9	42	3904	12	20	6	38	3795	37	48	51	136	3518	29	54	57	140	3379	13	8	17	38	527	0.101604278074866	0.271428571428571	0.155963302752294	1.74033613445378	0.0721062618595825	16	9	18	43	565	0.114973262032086	0.316176470588235	0.160602615122229	1.9686881832379	0.0761061946902655	0.171122994652406	64	110	1092	5805	3.31033915383486e-11	1.57930763797538e-10	7.58067666228183e-09	3.09223237922123	2.33890946435497	Inf	2.32310218517115	2.77518315018315	7.34070610548063e-08	2.68366239034039e-07	1.68102169815506e-05	4.16536663020383	2.04683048433048	1.82153467408453e-05	9.06807479055125e-05	0.00417131440365357	2.54828282296133	0.421757852986232	0.75468749229676	1	310	292	36
"TCGA-17-Z021-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	537	4	3	7	10	513	21033	36	32	9	77	5531	29	23	5	57	5631	33	105	66	204	5023	27	102	46	175	4848	10	13	10	33	751	0.0614525139664804	0.188571428571429	0.154909240924092	1.21730264409359	0.0439414114513981	11	19	11	41	764	0.0763500931098696	0.200980392156863	0.152100338443161	1.32136715942922	0.0536649214659686	0.0782122905027933	42	130	1515	8356	0.00142049652922999	0.00315819131255988	0.325293705193668	1.7818090922369	1.29743244328055	Inf	1.59099700667741	2.28042904290429	0.000149847441435657	0.000385562517851297	0.0343150640887655	2.96944078790603	1.22165841584158	0.192470751395759	0.361277066144498	1	1.27277617534702	1	1	1	495	471	16
"TCGA-17-Z022-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	4591	17	15	56	71	4432	181712	234	165	57	456	48331	246	174	59	479	47689	341	1021	443	1805	42368	321	937	434	1692	43324	138	147	164	449	6730	0.0978000435634938	0.265366430260047	0.155341150401625	1.70828160840807	0.0667161961367013	137	148	149	434	6662	0.0945327815290786	0.240443213296399	0.157241314199396	1.52913510371387	0.0651456019213449	0.128076671749074	588	951	13392	72300	1.24252582476779e-99	7.1134603467956e-98	2.84538413871824e-97	3.33796440573662	3.05295536554376	Inf	2.44474487692748	2.65808915093829	1.26180755084919e-56	4.81589881907441e-55	2.88953929144464e-54	3.83626538582749	2.2837027909581	2.93195260714582e-47	3.35708573518196e-45	6.71417147036393e-45	2.99606027326921	0.0616808361684528	0.227821152944769	1	4003	3844	347
"TCGA-17-Z023-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	998	2	16	36	52	926	37966	58	59	22	139	9757	56	73	22	151	10183	83	138	92	313	8930	69	139	115	323	9096	23	23	20	66	1419	0.0661322645290581	0.204334365325077	0.156002638522427	1.30981352149183	0.0465116279069767	32	15	19	66	1296	0.0661322645290581	0.210862619808307	0.145128779395297	1.45293456395693	0.0509259259259259	0.094188376753507	94	265	2715	15311	5.02592760002619e-08	1.85635067807419e-07	1.150937420406e-05	2.00036031878016	1.621362708856	Inf	1.73845293607678	2.40241833866434	1.56239117971343e-10	7.30178735008929e-10	3.57787580154375e-08	3.19731789379188	1.25090346171297	0.0818042458497634	0.181875459219377	1	1.3091264034977	0.0535773212258886	0.211538044150491	1	904	832	40
"TCGA-17-Z025-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	781	0	3	14	17	748	30668	43	38	10	91	7899	37	48	7	92	7908	43	166	81	290	7447	28	176	71	275	7414	9	22	3	34	1057	0.0435339308578745	0.123636363636364	0.142568114378203	0.86720908230842	0.032166508987701	8	26	9	43	1102	0.0550576184379001	0.148275862068966	0.147979051967235	1.00200575755679	0.0390199637023593	0.0371318822023047	29	194	2159	12702	0.766350110988634	0.843721997194217	1	0.879484677906167	0.613391596708423	Inf	0.89513497570915	1.64810912720417	0.0241664051742663	0.0409782562341728	1	1.85202392483327	0.543416786523976	0.995391450761206	1	1	0.504300977794113	0.410029122982153	0.75468749229676	1	752	719	0
"TCGA-17-Z026-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	2468	13	18	36	54	2377	97457	86	38	28	152	25474	86	51	21	158	25932	255	383	385	1023	22961	275	359	410	1044	23090	181	59	242	482	3828	0.195299837925446	0.461685823754789	0.165786054569078	2.78482906752824	0.125914315569488	168	77	198	443	3804	0.179497568881686	0.433040078201369	0.165672226819389	2.61383628695626	0.116456361724501	0.31969205834684	789	536	7632	38419	1.63698101982414e-261	3.74868653539728e-259	3.74868653539728e-259	7.40796959439425	6.73294289242708	Inf	3.59303815118073	3.97328997072901	1.00997597720159e-138	2.31284498779164e-136	2.31284498779164e-136	9.70539531875974	3.33953693814854	4.30318130744823e-133	9.85428519405645e-131	9.85428519405645e-131	6.23890838269073	2.29148702432224e-05	0.000539514113674187	0.00524750528569793	1679	1588	569
"TCGA-17-Z027-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	153	0	13	29	42	111	4551	6	14	5	25	1172	2	9	7	18	1124	6	14	12	32	1166	6	11	19	36	1089	1	0	3	4	152	0.0261437908496732	0.111111111111111	0.139577594123049	0.796052631578947	0.0263157894736842	0	0	3	3	159	0.0196078431372549	0.09375	0.136363636363636	0.6875	0.0188679245283019	0.0457516339869281	7	36	311	1944	0.38450184677212	0.478537624515302	1	1.21531008346212	0.531694522514508	Inf	1.18036341882898	0.604233654876742	0.831609467463903	0.87357141306988	1	0.568371323738687	1.40338139197179	0.252754561456626	0.452193707605995	1	1.49988233534876	0.0291375291375292	0.141967961116898	1	146	104	0
"TCGA-17-Z028-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	1221	4	3	24	27	1164	47724	50	55	14	119	12379	62	54	13	129	12330	69	263	113	445	11557	72	251	148	471	11458	24	38	35	97	1627	0.0794430794430794	0.205944798301486	0.141996858090417	1.45034757156634	0.0596189305470191	31	37	23	91	1681	0.0745290745290745	0.204494382022472	0.145452972224626	1.40591408270893	0.0541344437834622	0.0925470925470925	113	289	3308	19707	1.40706476582089e-12	7.32313253120418e-12	3.22217831372984e-10	2.32924489632621	1.92009142409169	Inf	1.955680334723	2.71387009356214	7.64029866706548e-13	4.37407098689499e-12	1.74962839475799e-10	3.80973050661932	1.54608356845358	0.000465740707159028	0.00189883274163371	0.106654621939417	1.70205645541536	0.822075932199593	1	1	1108	1051	55
"TCGA-17-Z030-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	1384	6	12	35	47	1318	54038	85	39	17	141	13750	85	49	15	149	14103	71	300	121	492	12922	56	358	122	536	13263	8	43	20	71	1915	0.0513005780346821	0.132462686567164	0.144386639523486	0.917416507540626	0.0370757180156658	13	44	24	81	1907	0.0585260115606936	0.164634146341463	0.147577774338338	1.11557547929963	0.0424750917671736	0.0469653179190751	65	305	3822	22363	0.0653754677362248	0.106177178096422	1	1.24693581567288	0.980841739454773	Inf	1.2035760250046	1.13286319979233	0.303799442359758	0.374032646776261	1	1.15915307902768	1.24053293365463	0.0763521945535015	0.171418162281881	1	1.29370106395914	0.00193859303311214	0.0211398954563181	0.44393780458268	1319	1253	0
"TCGA-17-Z031-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	6927	25	109	251	360	6426	263466	387	334	237	958	67215	382	327	239	948	68037	289	1485	508	2282	64234	329	1406	503	2238	63980	84	199	83	366	9328	0.0528367258553486	0.163538873994638	0.145795561112848	1.12169995263475	0.0392367066895369	69	205	74	348	9201	0.0502381983542659	0.152497808939527	0.143241896814771	1.06461735239882	0.0378219758721878	0.0447524180742024	310	1319	18529	109685	2.96924019811414e-07	1.04608616210483e-06	6.79956005368138e-05	1.39126562176369	1.24962353680764	Inf	1.31681291593378	1.71311462954686	1.219445255444e-11	6.34665826128809e-11	2.79252963496676e-09	1.94783710680838	1.07456320375486	0.17693693445275	0.337654649913998	1	1.08829563149671	0.847322091737693	1	1	6617	6116	75
"TCGA-17-Z032-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	919	5	12	18	30	874	35834	30	58	18	106	9613	45	73	15	133	9631	59	158	109	326	8392	42	149	118	309	8198	15	20	23	58	1312	0.0631120783460283	0.187702265372168	0.16003903391071	1.17285302707396	0.0442073170731707	31	28	21	80	1304	0.0870511425462459	0.245398773006135	0.155386081982841	1.57928412811924	0.0613496932515337	0.0979325353645267	90	238	2616	13974	7.77597338124314e-08	2.82650461000743e-07	1.78069790430468e-05	2.01993680056591	1.62649723298573	Inf	1.74011244126203	2.8883186483786	2.1246998531541e-12	1.1584673008864e-11	4.86556266372289e-10	4.46720439168477	1.22923655175201	0.0846770454929575	0.186452340556608	1	1.28433190282273	0.897877795231569	1	1	829	784	38
"TCGA-17-Z033-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	418	2	15	14	29	380	15580	11	11	5	27	3895	17	21	6	44	4032	30	73	63	166	3813	24	59	60	143	3840	15	12	20	47	601	0.11244019138756	0.328671328671329	0.156510416666667	2.09999650931431	0.0782029950083195	15	9	18	42	577	0.100478468899522	0.253012048192771	0.151324416469971	1.67198429767597	0.072790294627383	0.162679425837321	68	109	1178	6475	2.09921479360417e-13	1.14457187556037e-12	4.80720187735355e-11	3.42832137420257	2.607437698314	Inf	2.49587062242813	3.6092246745897	1.56766188238142e-11	7.97765713478545e-11	3.58994571065345e-09	6.86803029458614	2.00708103855232	1.44737476769089e-05	7.52479591402903e-05	0.00331448821801214	2.4569015703796	0.280181014468084	0.60555089088151	1	350	312	41
"TCGA-17-Z035-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	124	2	6	12	18	104	4264	4	6	3	13	1138	4	7	6	17	1101	6	10	24	40	1020	6	5	23	34	1005	1	1	2	4	144	0.032258064516129	0.117647058823529	0.143283582089552	0.821078431372549	0.0277777777777778	4	4	5	13	165	0.104838709677419	0.325	0.161764705882353	2.00909090909091	0.0787878787878788	0.0967741935483871	12	47	309	1716	0.186038136016482	0.273094443254964	1	1.41762105678684	0.761822177996302	Inf	1.33289452032253	2.73058252427184	0.0262990484155067	0.0439597232638762	1	3.96283256510694	0.976038008675893	0.591042352992216	0.786784662554334	1	0.971854546860125	0.720681594686528	0.994193284236235	1	112	92	0
"TCGA-17-Z036-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	220	1	1	3	4	213	8733	14	19	5	38	2242	8	16	5	29	2345	9	31	29	69	2091	12	36	29	77	2055	3	7	10	20	313	0.0909090909090909	0.25974025974026	0.152311435523114	1.70532343056305	0.0638977635782748	3	7	4	14	303	0.0636363636363636	0.202898550724638	0.144906743185079	1.40020088965418	0.0462046204620462	0.0909090909090909	20	59	616	3530	0.0111682493678056	0.0220412958103745	1	1.94226546152675	1.20345466714284	Inf	1.70392898241	1.92300556586271	0.0806456469711485	0.117629637938809	1	2.29161407482699	1.62460815047022	0.0435279613137615	0.109537397152213	1	1.82302904276055	0.0610356763159465	0.227821152944769	1	200	193	8
"TCGA-17-Z037-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	317	1	4	15	19	296	12136	10	20	6	36	3203	16	14	18	48	3116	12	22	62	96	2931	20	17	79	116	2886	8	5	6	19	416	0.0599369085173502	0.163793103448276	0.144144144144144	1.13631465517241	0.0456730769230769	4	3	5	12	444	0.0378548895899054	0.125	0.151484135107472	0.825168918918919	0.027027027027027	0.0725552050473186	23	150	860	4957	0.738669245172511	0.817175155287464	1	0.883835618023343	0.585068592208582	Inf	0.899253931980105	2.53648255813953	0.00140862530061964	0.00316250190041076	0.322575193841898	3.45732680315656	0.527684314695695	0.995592543081639	1	1	0.487767826360188	1	1	1	294	273	0
"TCGA-17-Z038-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	54	1	2	2	4	49	2009	1	3	3	7	526	3	3	3	9	515	3	7	5	15	469	2	12	4	18	499	1	2	0	3	74	0.0555555555555556	0.166666666666667	0.148296593186373	1.12387387387387	0.0405405405405405	2	1	0	3	65	0.0555555555555556	0.2	0.138592750533049	1.44307692307692	0.0461538461538462	0.0555555555555556	3	11	139	829	0.329675797377636	0.424133469659992	1	1.62559954618604	0.383437682140042	Inf	1.49229188078109	4.17841726618705	0.0243364316499891	0.0409782562341728	1	8.91200468396629	0	1	1	1	0	0.181818181818182	0.458144262511275	1	51	46	0
"TCGA-17-Z039-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	57	0	18	39	57	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NA	NA	NA	NA	0	0	0	0	0	0	NA	NA	NA	NA	0	0	0	0	0	1	1	1	0	0	Inf	NA	NA	1	1	1	0	NA	1	1	1	0	1	1	1	57	0	0
"TCGA-17-Z040-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	515	3	79	132	211	300	12300	9	25	13	47	3185	8	12	12	32	3358	29	23	55	107	2790	26	32	56	114	2967	13	10	11	34	438	0.0660194174757282	0.298245614035088	0.147623862487361	2.02030761836097	0.0776255707762557	14	5	18	37	447	0.0718446601941748	0.345794392523364	0.160215053763441	2.15831399360221	0.0827740492170022	0.10873786407767	56	110	885	4872	6.93920200656386e-09	2.73978837845366e-08	1.58907725950312e-06	2.80207080638593	2.08899636884672	Inf	2.1944864202573	3.19340523882897	6.08936347923328e-09	2.58234117915634e-08	1.39446423674442e-06	5.30622905186467	1.69952664528936	0.00265087357617871	0.00906044849171529	0.607050048944925	1.94674092207916	0.863760066168137	1	1	459	244	30
"TCGA-17-Z041-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	580	1	91	120	211	366	15006	15	34	10	59	4093	11	34	9	54	4087	40	53	54	147	3450	19	50	37	106	3376	6	7	10	23	549	0.0396551724137931	0.216981132075472	0.162618483412322	1.33429563185208	0.0418943533697632	12	16	4	32	537	0.0551724137931034	0.217687074829932	0.155652173913043	1.39854824611409	0.0595903165735568	0.0551724137931034	32	118	1086	5740	0.050401299799538	0.0851013909288105	1	1.43325737400325	0.999140645432213	Inf	1.34089625537139	1.91759528045697	0.00390580336823513	0.00791530063120217	0.894428971325845	2.3200768448926	0.96699249185437	0.598751928520971	0.786784662554334	1	0.96099004066426	0.529223317330229	0.84339800235416	1	548	334	0
"TCGA-17-Z042-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	1036	6	7	21	28	984	40344	50	38	12	100	10078	58	49	10	117	10497	47	248	94	389	9646	47	243	88	378	10123	10	33	13	56	1549	0.0540540540540541	0.148148148148148	0.153017880075077	0.968175405877149	0.0361523563589413	11	23	12	46	1391	0.0444015444015444	0.118251928020566	0.144204851752022	0.820027388703361	0.0330697340043134	0.0444015444015444	46	230	2940	16829	0.225059847636217	0.312355788537538	1	1.14478982579812	0.859296038282846	Inf	1.12069160997732	1.50220364741641	0.0348082874833231	0.0553548460672291	1	1.64661807441323	0.923646931299993	0.696976455496885	0.848976639940355	1	0.911468353545394	0.615552294214648	0.915334255682821	1	990	938	0
"TCGA-17-Z043-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	558	2	7	11	18	526	21566	34	34	12	80	5597	35	46	16	97	5783	40	87	51	178	5061	31	81	59	171	5125	14	13	18	45	797	0.0806451612903226	0.263157894736842	0.155512195121951	1.69220101697154	0.0564617314930991	18	15	12	45	785	0.0806451612903226	0.252808988764045	0.155107686228018	1.62989336577686	0.0573248407643312	0.111111111111111	62	119	1582	8604	6.61081712781745e-10	2.85637192881169e-09	1.5138771222702e-07	2.83332265107631	2.14836489653333	Inf	2.2055164802928	2.90194262922669	4.35275478138216e-09	1.88071857535191e-08	9.96780844936515e-07	4.46174020582665	1.75600505689001	0.00123364380648574	0.00455652309169733	0.282504431685234	2.03937851214616	0.875442055316994	1	1	496	464	34
"TCGA-17-Z044-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	407	0	7	17	24	379	15539	20	24	3	47	3895	23	36	4	63	4209	20	59	55	134	3784	25	71	39	135	3651	4	13	6	23	569	0.0565110565110565	0.17037037037037	0.155847712955355	1.09318492481937	0.0404217926186292	7	10	5	22	543	0.0540540540540541	0.164179104477612	0.143498942917548	1.14411368571507	0.0405156537753223	0.0540540540540541	22	117	1112	6323	0.42410097390457	0.503207891316821	1	1.06919703681136	0.697472505824192	Inf	1.05823973914394	1.63439248601119	0.0649018747162251	0.098427346423944	1	1.83944332356189	0.782421934792591	0.848339153281979	0.956993429071789	1	0.753612712824276	1	1	1	385	357	0
"TCGA-17-Z045-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	1489	9	18	35	53	1410	57810	78	75	20	173	14974	83	69	23	175	15201	77	329	108	514	13592	102	339	107	548	14043	19	46	21	86	2114	0.0577568838146407	0.156934306569343	0.150537634408602	1.04249217935349	0.0406811731315043	13	38	18	69	2000	0.0463398253861652	0.134241245136187	0.147145379635079	0.912303501945525	0.0345	0.0476830087306917	71	323	4114	23521	0.0509121858395067	0.0851013909288105	1	1.25673363784659	0.998781965898689	Inf	1.21047913648826	1.20085930858793	0.155140238142051	0.205359043552195	1	1.24455986463857	1.2184882025076	0.109783581615729	0.234957384953289	1	1.26689064541365	0.417507725142734	0.75468749229676	1	1418	1339	0
"TCGA-17-Z046-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	1244	7	11	25	36	1185	48585	66	65	18	149	12669	61	58	15	134	12659	52	294	123	469	11697	45	251	137	433	11560	5	27	24	56	1638	0.045016077170418	0.12933025404157	0.141695501730104	0.912733661001559	0.0341880341880342	11	43	23	77	1697	0.0618971061093248	0.164179104477612	0.145079935026075	1.13164583681475	0.0453741897466117	0.0506430868167203	63	294	3335	19922	0.0482633894794059	0.0831001217352177	1	1.28004432635717	1.00253448019538	Inf	1.23063762236529	1.15028671231395	0.313554827755756	0.379915637862794	1	1.17994542793135	1.26061469265367	0.055958533554246	0.1321082905559	1	1.31810254280079	1.11832849826754e-05	0.000365853180147524	0.00256097226103267	1181	1122	0
"TCGA-17-Z047-01A-01W-0747-08"	0	0	0	0	79	0	12	5	17	62	2542	3	5	4	12	669	2	6	4	12	655	4	2	14	20	609	5	2	11	18	609	2	0	0	2	86	0.0253164556962025	0.111111111111111	0.141215106732348	0.786821705426357	0.0232558139534884	2	1	3	6	89	0.0759493670886076	0.3	0.146141215106732	2.05280898876405	0.0674157303370786	0.0886075949367089	7	27	175	1043	0.214180314295395	0.303813547592344	1	1.54456257100297	0.658778046756523	Inf	1.43294117647059	3.09333333333333	0.0303828720601157	0.0489977302941303	1	4.7587716653562	0.8352	0.718191079577139	0.866502473363281	1	0.812853848830951	1	1	1	72	55	0
"TCGA-17-Z048-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	137	0	17	6	23	114	4674	5	11	4	20	1199	1	9	8	18	1246	8	6	25	39	1161	7	12	18	37	1068	3	2	0	5	138	0.0364963503649635	0.135135135135135	0.129213483146067	1.04582843713278	0.036231884057971	3	0	6	9	163	0.0656934306569343	0.230769230769231	0.140396210163652	1.64369985842378	0.0552147239263804	0.0875912408759124	12	46	301	1928	0.0887657485203554	0.140188664904561	1	1.67050190444982	0.896550477773934	Inf	1.53213426509337	2.96212624584718	0.0105678911215667	0.0198364513675309	1	4.2662619389631	1.0332998532025	0.534319583835766	0.750669844775401	1	1.03868874429424	1	1	1	125	102	0
"TCGA-17-Z049-01A-01W-0746-08"	0	0	0	0	1259	4	8	25	33	1205	49405	60	58	12	130	12469	79	58	17	154	12159	59	310	97	466	12670	72	252	131	455	12107	26	27	24	77	1592	0.0611596505162828	0.169230769230769	0.131494176922442	1.28698299188249	0.0483668341708543	17	39	27	83	1739	0.0659253375694996	0.178111587982833	0.137253354380426	1.29768477270988	0.0477285796434733	0.0746624305003971	94	265	3331	21446	1.5605948996197e-10	7.14752464025823e-10	3.57376232012911e-08	2.28367835758796	1.8521350882704	Inf	1.94763465344962	2.44158162622232	1.24964448963629e-08	5.11015335940554e-08	2.8616858812671e-06	3.14579023461508	1.66383178751442	0.000173201235828648	0.000721146963722916	0.0396630830047604	1.85501080081211	0.390337659842583	0.738738215735136	1	1165	1111	46
"TCGA-17-Z050-01A-01W-0747-08"	0	0	0	0	442	1	7	8	15	422	17302	21	30	12	63	4569	24	30	15	69	4678	28	59	61	148	4007	25	58	59	142	4048	11	8	12	31	636	0.0701357466063348	0.21830985915493	0.157114624505929	1.38949419789175	0.0487421383647799	18	14	12	44	622	0.0995475113122172	0.297297297297297	0.155228350386823	1.91522551490397	0.0707395498392283	0.119909502262443	53	120	1258	6797	7.76582670712008e-07	2.65429002377686e-06	0.00017783743159305	2.38609486164322	1.77906876589685	Inf	1.96161904849426	3.50353961064283	7.87753420486276e-11	3.75824027690327e-10	1.80395533291357e-08	6.52629065454469	1.28060413354531	0.119960269612642	0.252026621479771	1	1.35069870103906	0.494639666845577	0.814909954731202	1	389	369	26
"TCGA-17-Z051-01A-01W-0747-08"	0	0	0	0	425	2	5	8	13	407	16687	20	26	8	54	4369	16	34	8	58	4344	25	70	51	146	4061	29	73	47	149	3913	4	7	12	23	584	0.0541176470588235	0.154362416107383	0.149246102734475	1.0342810517606	0.0393835616438356	8	8	11	27	603	0.0635294117647059	0.184931506849315	0.148485594681113	1.24545082805152	0.0447761194029851	0.0823529411764706	35	117	1187	6787	0.00553887407493675	0.0116367170932157	1	1.71030763030524	1.20866832504503	Inf	1.54685629406287	1.49283909014322	0.0981863024711327	0.140529145411809	1	1.63352614514456	1.57662087581452	0.0169091275959143	0.0460975026126711	1	1.75330169026528	0.0352997806006067	0.155454803029595	1	390	372	12
"TCGA-17-Z052-01A-01W-0747-08"	0	0	0	0	319	1	0	4	4	310	12710	12	19	5	36	3332	12	20	3	35	3090	15	60	34	109	3048	24	79	27	130	3240	4	12	4	20	419	0.0626959247648903	0.153846153846154	0.129320987654321	1.18964567651918	0.0477326968973747	5	5	3	13	456	0.0407523510971787	0.119266055045872	0.149606299212598	0.797199420569773	0.0285087719298246	0.0501567398119122	16	84	875	5413	0.31624897011585	0.413834366608741	1	1.1782880698639	0.707411253452403	Inf	1.14980571428571	1.65837362637363	0.0846514266101816	0.122690991732478	1	1.85562868595394	0.824655737704918	0.76215589137816	0.904319684588594	1	0.801951991520581	0.774649126350741	1	1	303	294	0
"TCGA-17-Z053-01A-01W-0747-08"	0	0	0	0	666	2	5	20	25	633	25953	31	44	11	86	6858	28	50	7	85	6919	49	89	82	220	6009	38	101	103	242	6167	7	15	25	47	933	0.0705705705705706	0.194214876033058	0.151289119507054	1.28373326955613	0.0503751339764201	17	14	17	48	908	0.0720720720720721	0.218181818181818	0.151106673323348	1.44389267120545	0.052863436123348	0.0990990990990991	66	206	1841	10335	6.53991026200216e-05	0.000176192876470411	0.0149763944999849	1.79849105775217	1.40062170862961	Inf	1.60481835319679	1.82449568263125	0.00210071408733615	0.00453193833631397	0.481063525999978	2.13843644809117	1.5015106361114	0.00437598134300032	0.0139180517714871	1	1.64872351426938	0.00933433609213398	0.0615899152019947	1	600	567	25
"TCGA-17-Z054-01A-01W-0747-08"	0	0	0	0	36	0	5	0	5	31	1271	2	4	0	6	300	0	2	0	2	358	1	1	9	11	328	3	3	6	12	285	0	0	2	2	46	0.0555555555555556	0.166666666666667	0.16140350877193	1.03260869565217	0.0434782608695652	1	0	0	1	36	0.0277777777777778	0.0909090909090909	0.109756097560976	0.828282828282828	0.0277777777777778	0.0833333333333333	3	16	82	531	0.482205359295297	0.560533133394025	1	1.21376365171237	0.295230469618075	Inf	1.1803594351733	1.86890243902439	0.439771425444985	0.508624527408594	1	2.15504998787734	0.996747967479675	0.618262999791054	0.79989958730029	1	0.996253567061822	1	1	1	33	28	0
"TCGA-17-Z055-01A-01W-0747-08"	0	0	0	0	1756	4	5	23	28	1695	69495	115	89	24	228	17578	104	93	32	229	18111	99	327	157	583	16777	105	388	162	655	17029	24	43	22	89	2407	0.0506833712984055	0.13587786259542	0.141347113747137	0.961306241020941	0.0369754881595347	28	32	17	77	2384	0.0438496583143508	0.132075471698113	0.142099302616678	0.929458971761428	0.0322986577181208	0.0518223234624146	91	432	4791	29015	0.0231368553804233	0.0427285474364269	1	1.27570523986368	1.04339837964129	Inf	1.22774258458638	1.79862569114475	1.53139175142808e-05	4.38360888846288e-05	0.0035068871107703	2.07181263723223	0.862663732743408	0.85924860485507	0.96003517663643	1	0.843540694476115	0.139586783093289	0.38054015867099	1	1665	1604	17
"TCGA-17-Z056-01A-01W-0747-08"	0	0	0	0	1029	8	6	11	17	995	40795	64	38	14	116	10563	58	37	14	109	10830	88	167	122	377	9641	71	181	141	393	9761	32	25	53	110	1531	0.10689990281827	0.279898218829517	0.156848683536523	1.78451111299472	0.0718484650555193	35	24	41	100	1480	0.0971817298347911	0.26525198938992	0.153511046571932	1.72790164169475	0.0675675675675676	0.156462585034014	161	261	3011	16391	9.37535575471287e-29	7.66770167081874e-28	2.14695646782925e-26	3.35771192092798	2.82155983560914	Inf	2.45838088147566	2.71527251231856	1.38224714020996e-15	8.79262764189113e-15	3.16534595108081e-13	3.9640880054164	2.30307377385581	1.40669906884216e-15	1.61067043382427e-14	3.22134086764855e-13	3.02762559350883	0.00897280920673847	0.0615899152019947	1	868	834	96
"TCGA-17-Z057-01A-01W-0747-08"	0	0	0	0	946	1	17	20	37	898	36818	29	47	11	87	9596	23	43	14	80	9877	120	77	148	345	8538	144	90	152	386	8807	101	21	69	191	1431	0.201902748414376	0.494818652849741	0.162484387419098	3.04533045118635	0.133473095737247	87	16	68	171	1327	0.180761099365751	0.495652173913044	0.155422815647693	3.18905671504866	0.128862094951017	0.343551797040169	325	239	2758	14587	8.69014664268771e-108	9.95021790587743e-106	1.99004358117549e-105	7.19090588480979	6.20344432180337	Inf	3.62396754251976	4.47851429450414	4.90317962170242e-87	5.61414066684927e-85	1.12282813336985e-84	13.0799401380327	2.87196640077351	4.62825580561205e-33	1.7664509658086e-31	1.05987057948516e-30	4.44492039619309	0.000182645085058484	0.00278838163189286	0.0418257244783928	621	573	235
"TCGA-17-Z058-01A-01W-0747-08"	0	0	0	0	302	1	7	14	21	276	11316	15	23	6	44	2990	18	22	4	44	2952	10	47	35	92	2646	12	45	39	96	2728	4	7	8	19	382	0.0629139072847682	0.197916666666667	0.140029325513196	1.41339441535777	0.049738219895288	2	2	6	10	392	0.033112582781457	0.108695652173913	0.148148148148148	0.733695652173913	0.0255102040816327	0.0662251655629139	20	76	774	4600	0.0567974459196728	0.0935727706158638	1	1.56383455935033	0.982741452467404	Inf	1.44649009474591	1.89358703312192	0.0863137987424535	0.124313584352339	1	2.22825484157662	1.31356938333683	0.174306270779919	0.337654649913998	1	1.38663992909854	0.0518267291519976	0.208216157470306	1	282	256	0
"TCGA-17-Z059-01A-01W-0747-08"	0	0	0	0	349	0	4	10	14	329	13489	18	11	5	34	3386	17	15	4	36	3533	32	65	39	136	3279	20	55	48	123	3291	6	10	15	31	480	0.0888252148997135	0.252032520325203	0.145852324521422	1.72799796747967	0.0645833333333333	17	5	13	35	505	0.100286532951289	0.257352941176471	0.154010369014944	1.67101048340128	0.0693069306930693	0.146131805157593	51	88	985	5585	4.74550339993182e-10	2.08984668958536e-09	1.08672027858439e-07	3.28523695226896	2.40028680916537	Inf	2.44728481174451	2.95021475985943	5.15738336975517e-07	1.78945574496051e-06	0.000118104079167393	4.49564061317048	2.14668300367583	5.12136468145472e-05	0.000234561190407286	0.0117279251205313	2.69018751258221	0.474780981820481	0.793612006108687	1	298	278	30
"TCGA-17-Z060-01A-01W-0747-08"	0	0	0	0	523	5	10	11	21	491	20131	29	19	7	55	5101	24	23	15	62	5182	25	112	55	192	4835	21	100	61	182	5013	3	10	11	24	706	0.0458891013384321	0.131868131868132	0.140833832036705	0.936338449086324	0.0339943342776204	3	18	12	33	685	0.0630975143403442	0.171875	0.141675284384695	1.21316149635036	0.0481751824817518	0.0554493307839388	29	133	1391	8457	0.107367511414486	0.162828874926605	1	1.32562752784289	0.914243532085885	Inf	1.26737137329038	0.923452005126121	0.647438883820429	0.692820113994758	1	0.911958168593973	1.40375319170034	0.0576637766607625	0.13474494750321	1	1.50353076182461	0.000447496356773213	0.00616502894063804	0.102476665701066	494	462	0
"TCGA-17-Z061-01A-01W-0747-08"	0	0	0	0	446	0	2	25	27	412	16892	21	43	11	75	4604	29	38	10	77	4485	27	62	48	137	3914	21	50	52	123	3889	4	7	7	18	571	0.0403587443946188	0.146341463414634	0.146824376446387	0.99671094784503	0.031523642732049	10	7	11	28	616	0.062780269058296	0.204379562043796	0.157383750638733	1.29860650298607	0.0454545454545455	0.0717488789237668	32	116	1187	6616	0.0248651656982285	0.0455529835591546	1	1.53747716944594	1.07163783898886	Inf	1.42134383751907	1.91733361415333	0.0105002260069801	0.0198364513675309	1	2.29474501665196	1.18326874473463	0.257981493128529	0.454444322511024	1	1.22344638578463	0.511727811186231	0.83287179059573	1	414	380	9
"TCGA-17-Z062-01A-01W-0747-08"	0	0	0	0	1015	5	2	35	37	955	39155	58	38	14	110	9900	52	50	7	109	10251	43	236	72	351	9468	47	252	86	385	9536	13	28	16	57	1396	0.0561576354679803	0.148051948051948	0.146392617449664	1.01133479700815	0.0408309455587393	11	34	10	55	1376	0.0541871921182266	0.156695156695157	0.145331643430503	1.07819022063208	0.0399709302325581	0.0492610837438424	50	198	2772	16232	0.0108984868342325	0.0220412958103745	1	1.47867385480243	1.11715515256959	Inf	1.38219755155239	1.82818662818663	0.00208309914330495	0.00453193833631397	0.477029703816834	2.12925359146902	1.12815314081137	0.28512019502742	0.490921238054731	1	1.15335891835711	0.872651499446626	1	1	965	905	14
"TCGA-35-3615-01A-01D-1040-01"	0	0	0	0	214	1	3	9	12	200	8200	10	10	1	21	2065	7	8	2	17	2046	12	30	33	75	2081	16	33	38	87	2008	9	5	15	29	267	0.135514018691589	0.333333333333333	0.13296812749004	2.50686641697878	0.108614232209738	7	8	10	25	279	0.116822429906542	0.333333333333333	0.134070158577607	2.48626045400239	0.0896057347670251	0.191588785046729	41	58	546	3543	1.17632477688691e-11	5.7314547639809e-11	2.69378373907102e-09	4.58467703807568	3.17237002231973	Inf	3.1015096015096	4.27943485086342	7.38300133587095e-08	2.68366239034039e-07	1.69070730591445e-05	8.64311628332016	2.63697570035598	3.35712843300634e-06	1.78786607246152e-05	0.000768782411158452	3.52514765891792	0.112175324104726	0.333768311204482	1	173	159	28
"TCGA-35-4122-01A-01D-1105-08"	0	0	0	0	773	2	4	16	20	733	30053	26	78	18	122	7716	28	69	11	108	8028	57	106	74	237	7152	56	120	90	266	7157	21	23	18	62	1062	0.0802069857697283	0.233082706766917	0.14838619533324	1.57078430539626	0.0583804143126177	31	17	15	63	1133	0.0815006468305304	0.265822784810127	0.158417225950783	1.67799166545633	0.0556045895851721	0.109961190168176	85	192	2195	12114	1.70830821528164e-10	7.67063884900972e-10	3.91202581299496e-08	2.44306036538167	1.94394440641791	Inf	2.00038650362244	2.99985082750418	1.70377251781326e-14	1.02674712257694e-13	3.90163906579237e-12	4.70407926120722	1.31173120728929	0.0609045029549891	0.140880112895884	1	1.39022125507692	0.0160037301011006	0.0916213548288009	1	688	648	43
"TCGA-35-4123-01A-01D-1105-08"	0	0	0	0	736	2	5	9	14	705	28905	38	34	14	86	7098	34	29	7	70	7212	43	157	71	271	7321	36	176	66	278	7274	7	29	7	43	1019	0.0584239130434783	0.154676258992806	0.140087984602695	1.10413651414492	0.042198233562316	10	23	7	40	970	0.0543478260869565	0.14760147601476	0.132495560715749	1.11401072773614	0.0412371134020619	0.0421195652173913	31	185	1989	12606	0.408937577402874	0.498120772474777	1	1.06203001115315	0.748115814526809	Inf	1.05311854086364	1.57903278156443	0.0363358675295199	0.0573856114776556	1	1.73771662324809	0.749854124693111	0.904545085451998	1	1	0.721397029028086	0.690868679162786	0.958841985019867	1	705	674	0
"TCGA-35-5375-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	926	0	11	19	30	874	35834	49	41	23	113	9354	53	66	28	147	9451	58	153	103	314	8543	72	128	100	300	8486	23	17	20	60	1254	0.0647948164146868	0.2	0.14777280226255	1.35342902711324	0.0478468899521531	18	22	15	55	1270	0.0593952483801296	0.17515923566879	0.148659721409341	1.17825618135313	0.0433070866141732	0.08207343412527	76	257	2524	14505	8.311171648808e-05	0.000218765322710004	0.0190325830757703	1.69938605602676	1.3509628578211	Inf	1.53981715471414	2.12784651956601	1.31881075035908e-06	4.08118461935445e-06	0.000302007661832229	2.64711866571906	1.16324662549866	0.192000167330869	0.361277066144498	1	1.19722323578877	0.483485386165785	0.802305459651919	1	850	798	27
"TCGA-38-4625-01A-01D-1553-08"	0	0	0	0	1437	2	9	27	36	1373	56293	58	47	15	120	14691	65	39	11	115	14359	119	318	146	583	13605	84	300	171	555	13638	38	39	50	127	1962	0.0883785664578984	0.228828828828829	0.143862736471623	1.59060528418327	0.0647298674821611	68	40	55	163	2014	0.113430758524704	0.27958833619211	0.148033811098861	1.88867890461452	0.0809334657398213	0.146833681280445	211	309	3976	23267	6.23747645092909e-46	8.40224768978095e-45	1.42838210726276e-43	3.99579324075204	3.42477294083064	Inf	2.78027443507197	3.577819131538	9.44063211332686e-36	1.4412698359679e-34	2.16190475395185e-33	6.39413032750197	2.26954391966944	1.66843018169793e-16	2.12261395338237e-15	3.82070511608826e-14	2.89817277213318	1	1	1	1226	1162	135
"TCGA-38-4626-01A-01D-1553-08"	0	0	0	0	693	1	8	13	21	662	27142	27	22	11	60	6968	38	23	11	72	7208	34	184	53	271	6462	29	183	47	259	6504	9	25	10	44	952	0.0634920634920635	0.16988416988417	0.146371463714637	1.16063722786412	0.046218487394958	12	30	6	48	981	0.0692640692640693	0.177121771217712	0.151810584958217	1.1667287315075	0.0489296636085627	0.0533910533910534	37	126	1933	11033	0.00563564835527488	0.011732395212345	1	1.67598997331563	1.19917631785877	Inf	1.52260861561704	2.23590274185204	0.000213103351019601	0.00053044203677705	0.0488006673834886	2.85353723046737	1.07323331608898	0.422323019341144	0.64047663198094	1	1.08719941089507	0.462239688348873	0.789946930088746	1	656	625	13
"TCGA-38-4627-01A-01D-1553-08"	0	0	0	0	103	0	2	5	7	95	3895	3	5	1	9	1002	4	4	2	10	932	1	9	25	35	958	3	24	14	41	1003	2	1	3	6	131	0.058252427184466	0.146341463414634	0.130608175473579	1.12046173896853	0.0458015267175573	1	2	1	4	141	0.0388349514563107	0.114285714285714	0.147181628392484	0.776494427558257	0.0283687943262411	0.0679611650485437	7	36	272	1689	0.390770027201271	0.481109334565006	1	1.20727709045642	0.527569710401045	Inf	1.17364911080711	5.40716911764706	0.00973198486719878	0.018571871121571	1	18.5801971569671	0.739441930618401	0.808099719608439	0.920670824827525	1	0.709772563394126	1	1	1	96	88	0
"TCGA-38-4628-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	319	0	2	12	14	303	12423	10	13	12	35	3109	8	14	13	35	3096	16	40	57	113	3148	21	48	51	120	3070	10	12	12	34	399	0.106583072100313	0.283333333333333	0.129967426710098	2.18003341687552	0.0852130325814536	4	10	12	26	419	0.0815047021943574	0.230088495575221	0.133100381194409	1.72868397152935	0.0620525059665871	0.119122257053292	38	107	818	5400	2.57979101335726e-05	7.38465177573516e-05	0.00590772142058813	2.34403127801086	1.66664117031608	Inf	1.99210859118118	2.87623075398137	0.000152746648073407	0.000388655360097891	0.0349789824088102	4.01733646593432	1.6892148872589	0.00702187537087838	0.0203545501257107	1	1.88581242131691	0.0766688473938544	0.262047254525264	1	281	265	19
"TCGA-38-4629-01A-02D-1265-08"	0	0	0	0	659	1	7	24	31	620	25420	28	20	10	58	6312	41	33	15	89	6479	40	112	84	236	6114	37	105	95	237	6515	10	20	26	56	945	0.0849772382397572	0.236286919831224	0.145049884881044	1.62900453195812	0.0592592592592593	12	24	17	53	883	0.0804248861911988	0.224576271186441	0.144422636571802	1.55499356968731	0.0600226500566251	0.0986342943854325	65	191	1828	10801	4.14364226377545e-06	1.375208809282e-05	0.000948894078404578	2.01070935919691	1.55997290644041	Inf	1.75414771950219	1.97389809315411	0.00109585891206484	0.0025348655642712	0.250951690862848	2.36341582148311	1.6596182291603	0.000533411796360063	0.0020703610401094	0.122151301366454	1.86800545658564	0.00290861236733099	0.0289596622660346	0.666072232118797	594	555	28
"TCGA-38-4630-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	308	1	6	10	16	290	11890	9	7	6	22	3043	7	7	7	21	3087	28	18	54	100	2781	38	34	75	147	2979	25	11	31	67	457	0.217532467532468	0.45578231292517	0.153407183618664	2.97106238556692	0.146608315098468	16	6	20	42	388	0.136363636363636	0.42	0.139518158935635	3.01036082474227	0.108247422680412	0.298701298701299	92	103	845	4915	6.27188125699401e-26	4.35230547833827e-25	1.43626080785163e-23	5.19327784931078	4.02376074914486	Inf	3.21602184797451	4.23453469607316	2.92886311481565e-18	2.16357952675092e-17	6.70709653292784e-16	9.53293650218495	2.69492225127288	1.01231263512985e-11	7.99377908430123e-11	2.31819593444736e-09	3.80195911447703	0.21702702534857	0.512362771183737	1	216	198	63
"TCGA-38-4631-01A-01D-1753-08"	0	0	0	0	1727	9	8	38	46	1642	67322	104	57	24	185	16802	93	57	20	170	16935	101	431	142	674	16597	87	383	143	613	16988	11	43	18	72	2258	0.04169079328315	0.117455138662316	0.132917353425948	0.883670458633938	0.0318866253321523	25	53	23	101	2277	0.0584829183555298	0.149851632047478	0.137193468699162	1.09226505801141	0.0443566095740009	0.0445859872611465	77	396	4535	29050	0.048656198138529	0.0831512639830085	1	1.24554289405462	1.00174132934197	Inf	1.20558447219302	1.41811912078632	0.0191379219578326	0.0342389385026849	1	1.51711999522056	1.06538617768235	0.357419286041156	0.58463583216732	1	1.07639255699358	0.605351355892205	0.906048761433431	1	1650	1565	0
"TCGA-38-4632-01A-01D-1753-08"	0	0	0	0	1122	8	8	24	32	1061	43501	58	73	17	148	10993	82	58	19	159	10977	46	207	137	390	10807	48	235	81	364	10724	14	30	12	56	1490	0.0499108734402852	0.153846153846154	0.138940693770981	1.10727929788332	0.0375838926174497	11	26	17	54	1481	0.0481283422459893	0.138461538461538	0.137040806884427	1.01036721549888	0.0364618501012829	0.0481283422459893	54	258	2971	18560	0.0477735259666709	0.0828798291391488	1	1.30750389072261	1.00352062628141	Inf	1.25429795717578	1.92740820842613	0.000798968188612631	0.00190587203325305	0.182963715192292	2.26331404140108	0.964057757095347	0.613529484996949	0.798285523092621	1	0.958539907359464	0.638617524887616	0.928182453933403	1	1068	1007	0
"TCGA-38-6178-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	155	0	0	4	4	151	6191	6	7	6	19	1512	1	9	7	17	1683	11	20	28	59	1511	12	18	26	56	1485	4	3	5	12	236	0.0774193548387097	0.214285714285714	0.158922558922559	1.34836561743341	0.0508474576271186	1	4	5	10	203	0.0645161290322581	0.169491525423729	0.134348113831899	1.26158470401603	0.0492610837438424	0.0967741935483871	15	62	439	2557	0.154558965202769	0.228348406654414	1	1.40899918442869	0.818330218454381	Inf	1.32946779871609	1.48360899277013	0.242099131807516	0.304619237274292	1	1.61763483001516	1.2638150679153	0.264743663079564	0.462796174390994	1	1.32363779681011	0.202747085914524	0.490027400431726	1	140	136	0
"TCGA-44-2655-01A-01D-1553-08"	0	0	0	0	436	2	4	8	12	414	16974	18	15	8	41	4305	21	12	2	35	4377	20	97	39	156	4100	19	122	41	182	4192	7	14	6	27	569	0.0619266055045872	0.148351648351648	0.135734732824427	1.09295274145889	0.0474516695957821	6	17	10	33	586	0.0756880733944954	0.211538461538462	0.142926829268293	1.48004725649777	0.0563139931740614	0.0665137614678899	29	90	1155	7137	0.00178319675603393	0.00392646208780548	0.40835205713177	1.99093795019985	1.35219897909408	Inf	1.74955800502019	2.39307359307359	0.00177696016263224	0.00391272958887291	0.406923877242783	3.08901597313181	1.43584415584416	0.0857053845140679	0.186919362416396	1	1.54470673182247	0.67022909761254	0.95632953954556	1	407	385	12
"TCGA-44-2656-01A-02D-0969-08"	0	0	0	0	1897	7	17	57	74	1792	73472	95	49	14	158	18120	99	74	10	183	18254	79	427	161	667	18468	98	502	184	784	18630	7	64	31	102	2440	0.0537691091196626	0.130102040816327	0.130971551261406	0.993361073937772	0.0418032786885246	19	49	22	90	2437	0.0474433315761729	0.134932533733133	0.131957981373186	1.02254166310361	0.0369306524415265	0.0416447021613073	79	443	4877	32221	0.103854626918448	0.158551397095497	1	1.1781532973244	0.951711630538112	Inf	1.15120940657414	1.11737209940815	0.303352348045971	0.374032646776261	1	1.13755209284565	1.16856941633756	0.129813169763032	0.265992648147565	1	1.19915006947016	0.00095024265862649	0.0114529246750245	0.217605568825466	1818	1713	0
"TCGA-44-2657-01A-01D-1105-08"	0	0	0	0	996	3	6	20	26	946	38786	47	37	13	97	9611	46	39	6	91	9755	65	217	102	384	9650	50	221	103	374	9770	13	26	22	61	1374	0.0612449799196787	0.163101604278075	0.140634595701126	1.15975449330189	0.0443959243085881	17	34	14	65	1216	0.0652610441767068	0.169270833333333	0.126010362694301	1.34330883360746	0.0534539473684211	0.0662650602409639	66	254	2590	16830	0.000227831969386238	0.000555037457334559	0.0521735209894485	1.6884161328903	1.32370730888554	Inf	1.54647683397683	1.95601812993117	0.000205328353571102	0.000516705417228378	0.0470201929677824	2.29330738268892	1.31673415575855	0.0518942183547252	0.123789333367001	1	1.38417514504504	0.47392388385727	0.793612006108687	1	930	880	23
"TCGA-44-2659-01A-01D-0969-08"	0	0	0	0	902	4	11	39	50	827	33907	44	24	7	75	8658	52	31	3	86	8690	37	224	73	334	8245	46	214	72	332	8314	8	23	17	48	1189	0.0532150776053215	0.144578313253012	0.143011787346644	1.01095382370525	0.0403700588730025	5	35	10	50	1173	0.0554323725055432	0.149700598802395	0.142268041237113	1.05224333940814	0.0426257459505541	0.0443458980044346	40	188	2362	14197	0.0975035606113353	0.151893301904733	1	1.27882623199699	0.937029079620481	Inf	1.22992706151492	1.09804331636453	0.404579006367152	0.472696900296315	1	1.11620671507202	1.30541913632515	0.0881415209276195	0.190418946154952	1	1.37527121821377	0.020465344528566	0.111584854691467	1	862	787	0
"TCGA-44-2661-01A-01D-1105-08"	0	0	0	0	138	1	5	8	13	124	5084	1	6	2	9	1147	3	13	3	19	1243	11	16	24	51	1351	6	18	21	45	1343	1	2	1	4	181	0.0289855072463768	0.0888888888888889	0.134772896500372	0.659545733578883	0.0220994475138122	3	4	4	11	155	0.0797101449275362	0.215686274509804	0.114729829755736	1.87994939911448	0.0709677419354839	0.0652173913043478	9	53	336	2358	0.371033318007778	0.464298523627219	1	1.19161916038419	0.587686009903102	Inf	1.16388248847926	1.88655462184874	0.155010871090869	0.205359043552195	1	2.15854152826081	0.890873015873016	0.676381238218997	0.839871292138077	1	0.877242906366309	1	1	1	129	115	0
"TCGA-44-2662-01A-01D-0969-08"	0	0	0	0	526	0	5	20	25	500	20500	10	15	4	29	5430	11	16	5	32	5379	75	45	105	225	4947	80	30	104	214	4744	58	8	65	131	772	0.249049429657795	0.61214953271028	0.162731871838111	3.76170645489323	0.169689119170984	62	11	63	136	832	0.258555133079848	0.604444444444444	0.168182737012331	3.59397435897436	0.163461538461538	0.47148288973384	248	116	1604	8087	1.48056066881283e-100	1.13016131052713e-98	3.39048393158138e-98	10.7730411545506	8.8621454524554	Inf	4.11637116001206	4.67749979888987	6.15569589212248e-61	3.52413589824012e-59	1.40965435929605e-58	17.2702476124895	3.70022312639454	2.72738290440595e-46	2.08190228369654e-44	6.24570685108963e-44	7.96359019376584	0.543640779138067	0.84339800235416	1	278	252	188
"TCGA-44-2665-01A-01D-1040-01"	0	0	0	0	102	1	3	6	9	92	3772	2	14	5	21	939	2	6	2	10	897	8	3	19	30	902	4	6	21	31	1034	1	3	5	9	130	0.0882352941176471	0.290322580645161	0.125725338491296	2.30918114143921	0.0692307692307692	4	1	8	13	127	0.127450980392157	0.433333333333333	0.14079822616408	3.07769028871391	0.102362204724409	0.176470588235294	18	34	257	1679	0.000101093788488699	0.000260117725437214	0.0231504775639121	3.45560528504339	2.00051614098443	Inf	2.6076025142173	3.13878080415045	0.0150139940352681	0.0275056370726112	1	4.66082911775348	2.44824902723735	0.00166085877053248	0.00585133320695289	0.380336658451938	3.14295400031358	0.0305355360502663	0.145679953239812	1	84	74	11
"TCGA-44-2666-01A-01W-0928-08"	0	0	0	0	88	0	2	0	2	86	3526	4	9	4	17	895	3	9	1	13	901	6	5	19	30	856	4	5	17	26	874	3	1	3	7	112	0.0795454545454545	0.269230769230769	0.128146453089245	2.10096153846154	0.0625	1	1	1	3	109	0.0340909090909091	0.1	0.127336448598131	0.785321100917431	0.0275229357798165	0.0909090909090909	8	38	221	1509	0.233777776627047	0.31905551746631	1	1.43714810865915	0.663847820826954	Inf	1.36140074759001	3.13122171945701	0.0303378694283706	0.0489977302941303	1	4.54593405986159	0.869783810960282	0.692451121456009	0.847974902745594	1	0.853595431074905	1	1	1	80	78	0
"TCGA-44-2668-01A-01W-0928-08"	0	0	0	0	807	3	5	20	25	772	31652	39	29	8	76	8198	51	30	12	93	8178	41	165	89	295	7523	71	151	86	308	7753	25	25	30	80	1173	0.0991325898389095	0.25974025974026	0.15129627241068	1.71676575768647	0.0682011935208866	21	26	32	79	1116	0.0978934324659232	0.267796610169492	0.148345075103017	1.80522750744183	0.0707885304659498	0.133828996282528	108	179	2289	12987	1.55764210855368e-20	9.38684323312612e-20	3.56700042858793e-18	3.42283737035202	2.76700854565402	Inf	2.51134116658523	2.74096611121513	2.918470303077e-11	1.45289065087964e-10	6.68329699404633e-09	3.95393987676966	2.36438120202209	2.72900692755731e-11	1.9529455825332e-10	6.24942586410624e-09	3.11266064019246	0.0754659536468923	0.262047254525264	1	699	664	65
"TCGA-44-3396-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	381	2	3	8	11	366	15006	14	14	6	34	3900	9	16	5	30	3947	39	46	60	145	3523	53	34	70	157	3636	32	7	28	67	562	0.175853018372703	0.426751592356688	0.154565456545655	2.76097649432192	0.119217081850534	23	8	27	58	497	0.152230971128609	0.4	0.14107294919103	2.83541247484909	0.116700201207243	0.288713910761155	110	112	1059	6100	8.64768329896934e-33	8.25133114776658e-32	1.98031947546398e-30	5.65528312919208	4.46226120689172	Inf	3.34962441194736	4.04139467093649	1.25120417263463e-22	1.14610302213332e-21	2.8652575553333e-20	8.55810403656976	2.86006392097044	7.47696034542662e-14	6.84889567641078e-13	1.7122239191027e-11	4.22310953055748	1	1	1	271	256	77
"TCGA-44-3398-01A-01D-1105-08"	0	0	0	0	432	2	5	10	15	409	16769	17	11	7	35	4055	26	19	4	49	4320	40	57	55	152	4188	41	70	62	173	4206	23	11	21	55	663	0.127314814814815	0.317919075144509	0.157631954350927	2.01684408756833	0.0829562594268477	21	2	23	46	590	0.106481481481481	0.302631578947368	0.140878701050621	2.14817127564674	0.0779661016949153	0.203703703703704	88	110	1253	7141	1.60336640761932e-22	1.07991443336713e-21	3.67170907344824e-20	4.55830813940266	3.54325496401202	Inf	2.97738760308593	3.63902929266058	3.42721062825527e-16	2.37827646627411e-15	7.84831233870457e-14	6.77488168346791	2.51932797184194	2.20911368307778e-09	1.53299101037822e-08	5.05887033424812e-07	3.43438680385746	1	1	1	344	321	58
"TCGA-44-3918-01A-01D-1105-08"	0	0	0	0	2106	13	10	45	55	1986	81426	107	52	12	171	19989	93	65	15	173	20513	124	515	193	832	20592	130	501	179	810	20332	48	62	36	146	2805	0.0693257359924027	0.180246913580247	0.137959866220736	1.30651702207258	0.0520499108734403	41	72	45	158	2788	0.0750237416904084	0.189903846153846	0.135392385392385	1.40261836441894	0.0566714490674319	0.0807217473884141	170	456	5593	35331	1.15563118749092e-18	6.7856292803954e-18	2.64639541935421e-16	2.35493835635146	2.01686741984363	Inf	1.98704565097061	2.56383189898509	9.82672710780954e-18	7.0322515865262e-17	2.25032050768838e-15	3.40724106021925	1.59321848162738	1.47867168616291e-05	7.52479591402903e-05	0.00338615816131306	1.75830868695763	0.527102044051781	0.84339800235416	1	1936	1816	84
"TCGA-44-3919-01A-02D-1105-08"	0	0	0	0	82	0	3	5	8	74	3034	1	10	3	14	764	1	3	2	6	745	4	8	13	25	822	11	7	11	29	703	3	1	1	5	104	0.0609756097560976	0.172413793103448	0.147937411095306	1.16545092838196	0.0480769230769231	0	1	2	3	108	0.0365853658536585	0.12	0.131386861313869	0.913333333333333	0.0277777777777778	0.0731707317073171	6	33	212	1313	0.46633504129586	0.547644740803856	1	1.12594710672021	0.455257058987086	Inf	1.1066763425254	1.43867924528302	0.350223708447523	0.417714735596264	1	1.54783310913368	0.899174528301887	0.668514725559234	0.839871292138077	1	0.884864039345565	1	1	1	76	68	0
"TCGA-44-4112-01A-01D-1458-08"	0	0	0	0	1006	7	7	33	40	946	38786	68	36	10	114	9810	65	24	13	102	9802	55	227	88	370	9593	51	227	82	360	9581	20	23	13	56	1298	0.0556660039761431	0.155555555555556	0.135476463834673	1.14821092278719	0.0431432973805855	17	28	15	60	1332	0.0596421471172962	0.162162162162162	0.13885124569999	1.16788410031653	0.045045045045045	0.0646123260437376	65	211	2630	16544	9.03221393221983e-06	2.77139951175716e-05	0.00206837699047834	1.93784086022877	1.50955423465998	Inf	1.71696423651292	2.54479517899419	3.46820282477536e-08	1.30199745389108e-07	7.94218446873557e-06	3.37288095260118	1.20078729590696	0.175918086887961	0.337654649913998	1	1.24035687227042	0.242070657059696	0.548853271947231	1	941	881	27
"TCGA-44-5643-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	291	1	3	14	17	271	11111	7	15	6	28	2789	10	16	6	32	2785	19	36	54	109	2743	14	39	49	102	2794	6	4	12	22	376	0.0756013745704467	0.215686274509804	0.134574087329993	1.60273258239466	0.0585106382978723	9	4	11	24	399	0.0824742268041237	0.220183486238532	0.145461173897193	1.51369248810099	0.0601503759398496	0.130584192439863	38	98	775	4762	2.22160164105135e-05	6.4398326050729e-05	0.00508746775800759	2.38208590056269	1.68653848620197	Inf	1.99626185958254	3.2475073313783	1.41749984056344e-05	4.10895523403833e-05	0.00324607463489028	5.118158724727	1.59537738803633	0.0155870574034109	0.0430052547636277	1	1.76633047433621	0.137836762416048	0.38029660955753	1	253	233	19
"TCGA-44-5645-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	95	0	3	4	7	88	3608	4	12	4	20	910	5	6	2	13	900	3	8	25	36	966	2	3	14	19	832	1	0	1	2	109	0.0210526315789474	0.105263157894737	0.131009615384615	0.803476581361661	0.018348623853211	1	1	1	3	125	0.0315789473684211	0.0833333333333333	0.129399585921325	0.644	0.024	0.0421052631578947	4	40	234	1564	0.840573786123901	0.899492509450343	1	0.668503574662706	0.216663497005784	Inf	0.698523698523699	3.07350427350427	0.130499656782775	0.177231893329874	1	4.45025561090743	0.394039009423625	0.969596535095452	1	1	0.361422315875579	1	1	1	91	84	0
"TCGA-44-6144-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	512	3	2	5	7	494	20254	24	28	6	58	5117	19	24	11	54	5189	32	97	62	191	4996	29	110	52	191	4952	6	19	10	35	704	0.068359375	0.183246073298429	0.1421647819063	1.28896953831509	0.0497159090909091	8	11	15	34	727	0.06640625	0.178010471204188	0.145516413130504	1.22330167006345	0.046767537826685	0.076171875	39	136	1431	8517	0.00354495288049763	0.00751661305216627	0.811794209633957	1.70664941078316	1.23224940456542	Inf	1.54925426774483	1.59549094408358	0.0493545374580744	0.0763661424182367	1	1.7727453551527	1.5245135900548	0.0200188387591646	0.0526932652396402	1	1.6717421034199	0.0579274670578625	0.224837117902551	1	473	455	14
"TCGA-44-6145-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	649	3	2	20	22	612	25092	35	34	6	75	6329	30	22	7	59	6399	41	152	49	242	6123	27	159	50	236	6241	4	20	6	30	885	0.0462249614791988	0.127118644067797	0.141804198045185	0.896437805228383	0.0338983050847458	9	14	9	32	883	0.049306625577812	0.132231404958678	0.144210354401437	0.916934193161929	0.0362400906002265	0.0431432973805855	28	139	1768	10596	0.211176378028125	0.302246191052754	1	1.20723055960602	0.829389361836873	Inf	1.17251469910857	1.33693771626298	0.167819787751149	0.220866272385133	1	1.41652932146919	1.05957767722474	0.448052356730915	0.657717882637048	1	1.0702284361685	0.830252223160419	1	1	621	584	0
"TCGA-44-6146-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	98	0	3	8	11	86	3526	4	6	1	11	882	3	7	1	11	866	7	4	23	34	877	0	14	16	30	901	0	5	1	6	122	0.0612244897959184	0.2	0.135405105438402	1.47704918032787	0.0491803278688525	1	2	1	4	102	0.0408163265306122	0.117647058823529	0.11630558722919	1.01153402537486	0.0392156862745098	0.0306122448979592	3	43	224	1554	0.939351303030262	0.973354970108281	1	0.484161123614563	0.126287435625016	Inf	0.517663043478261	1.13392857142857	0.61125412234348	0.663399023775625	1	1.15613432227985	0.407051282051282	0.964581457512693	1	1	0.375141023055903	1	1	1	95	83	0
"TCGA-44-6147-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	424	3	6	11	17	397	16277	28	16	7	51	4096	21	17	12	50	4297	22	73	49	144	3945	24	81	47	152	3939	11	7	9	27	586	0.0636792452830189	0.177631578947368	0.148768723026149	1.19401158613257	0.0460750853242321	9	11	5	25	506	0.0589622641509434	0.173611111111111	0.128263624841572	1.35354907773386	0.0494071146245059	0.080188679245283	34	108	1092	6792	0.000982912943889377	0.00225087064150667	0.225087064150667	1.95795201548464	1.37303957347153	Inf	1.72867977093329	3.13903487816531	1.08432244803377e-06	3.40150466574977e-06	0.000248309840599733	4.78314251074008	1.05288461538462	0.46298531185302	0.675309786078609	1	1.06192030999558	0.2959200715111	0.615873593808176	1	390	363	14
"TCGA-44-6148-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	26	0	1	1	2	24	984	2	2	2	6	262	1	4	0	5	261	1	2	2	5	229	0	4	4	8	232	0	0	0	0	31	0	0	0.133620689655172	0	0	0	0	0	0	36	0	0	0.157205240174672	0	0	0	0	7	67	394	1	1	1	0	0	Inf	0	0	1	1	1	0	0	1	1	1	0	1	1	1	26	24	0
"TCGA-44-6774-01A-21D-1855-08"	0	0	0	0	794	2	5	14	19	758	31078	39	35	10	84	7838	43	32	6	81	7664	41	209	51	301	7699	27	211	54	292	7877	5	22	5	32	1021	0.0403022670025189	0.10958904109589	0.129617874825441	0.845477842029705	0.0313418217433888	10	19	6	35	1095	0.044080604534005	0.116279069767442	0.142226263151059	0.817563980036105	0.0319634703196347	0.0327455919395466	26	147	2116	13460	0.322536404088976	0.417292861787432	1	1.12504359354592	0.764386336104176	Inf	1.10628626375428	1.62376292672078	0.0379080080278878	0.0594584509478514	1	1.80021418459252	0.771158520118823	0.859420136290254	0.96003517663643	1	0.744392234043355	0.512816255344969	0.83287179059573	1	768	732	0
"TCGA-44-6775-01A-11D-1855-08"	0	0	0	0	258	0	6	6	12	246	10086	3	9	3	15	2448	4	16	6	26	2542	4	49	43	96	2522	7	65	37	109	2574	0	2	9	11	362	0.0426356589147287	0.100917431192661	0.140637140637141	0.717573115717979	0.0303867403314917	2	6	13	21	363	0.0813953488372093	0.21875	0.143933386201427	1.51980027548209	0.0578512396694215	0.0930232558139535	24	67	725	4371	0.00188986304987929	0.00412170131830817	0.432778638422357	2.15922712933127	1.39643686786395	Inf	1.85379310344828	1.27799373040752	0.478329561272312	0.544962534981888	1	1.33968292731227	1.93296551724138	0.00159994001323962	0.00572478535987301	0.366386263031873	2.28637346475938	2.62567471592132e-07	1.23021555731113e-05	6.01279509945982e-05	234	222	11
"TCGA-44-6776-01A-11D-1855-08"	0	0	0	0	530	3	5	15	20	501	20541	20	26	4	50	5216	18	28	7	53	4999	21	131	54	206	5290	31	99	62	192	5036	7	9	9	25	697	0.0471698113207547	0.130208333333333	0.138403494837172	0.940787900526064	0.0358680057388809	2	18	5	25	723	0.0471698113207547	0.121359223300971	0.136672967863894	0.887953376572802	0.0345781466113416	0.0433962264150943	23	145	1420	8906	0.543608606482252	0.616269162794236	1	0.994842563175749	0.659417376926235	Inf	0.995548289738431	1.25858613217768	0.282818878118291	0.351986538527656	1	1.31266908217951	0.877634774162215	0.739100611982308	0.881531459083065	1	0.860867192201575	0.342057680012223	0.675269040713785	1	507	478	0
"TCGA-44-6777-01A-11D-1855-08"	0	0	0	0	1045	6	7	20	27	1001	41041	39	46	13	98	10084	53	34	17	104	10516	48	201	107	356	10128	84	244	115	443	10313	43	26	38	107	1493	0.102392344497608	0.241534988713318	0.144768738485407	1.66841951681209	0.0716677829872739	29	21	25	75	1374	0.0717703349282297	0.210674157303371	0.135663507109005	1.55291693243707	0.0545851528384279	0.129186602870813	135	219	2867	17574	1.15490561049507e-28	9.11977188977141e-28	2.64473384803371e-26	3.7783883470024	3.12423453661936	Inf	2.71897335548291	3.8889558296604	1.98690810094671e-27	1.97826937007303e-26	4.55001955116797e-25	7.35360907869451	2.02330810056656	2.61714341131132e-08	1.61979957078457e-07	5.99325841190292e-06	2.42847013765104	0.385391960345845	0.735456324326654	1	910	866	85
"TCGA-44-6778-01A-11D-1855-08"	0	0	0	0	959	2	8	25	33	909	37269	41	42	15	98	9394	59	60	14	133	9304	47	214	89	350	9447	41	203	84	328	9124	4	25	16	45	1226	0.0469238790406674	0.13719512195122	0.134370889960544	1.02101818326503	0.0367047308319739	13	18	10	41	1283	0.0427528675703858	0.117142857142857	0.135810310151371	0.862547600489923	0.0319563522992985	0.0448383733055266	43	218	2509	16062	0.0992403883908472	0.153554384739892	1	1.26270703745378	0.937970439660398	Inf	1.21944600969078	1.42988423493605	0.0805716534123756	0.117629637938809	1	1.5327676274074	1.11240228817874	0.311970274854694	0.528992449202784	1	1.13224530747457	0.158471088850323	0.415768468040698	1	916	866	0
"TCGA-44-6779-01A-11D-1855-08"	0	0	0	0	316	1	18	41	59	253	10373	16	10	9	35	2597	9	15	7	31	2672	7	47	49	103	2501	10	51	23	84	2603	2	4	3	9	352	0.0284810126582278	0.107142857142857	0.135228582404917	0.792309253246753	0.0255681818181818	1	7	8	16	339	0.0506329113924051	0.155339805825243	0.135545781687325	1.14603201878741	0.0471976401179941	0.0443037974683544	14	75	691	4413	0.318611657584483	0.414557213561628	1	1.19206882362997	0.687827853792441	Inf	1.16190507162718	1.30348174001873	0.410722617258491	0.477438981483221	1	1.3684167583198	1.12847724714584	0.384802677286133	0.608151190753274	1	1.15158745319469	0.0254766332173073	0.130477824380594	1	302	239	0
"TCGA-49-4486-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	631	1	1	8	9	616	25256	7	16	5	28	6495	10	16	5	31	6398	101	64	84	249	6096	114	85	109	308	6267	88	5	52	145	978	0.229793977812995	0.470779220779221	0.156055528961225	3.01674169388893	0.148261758691207	78	9	39	126	970	0.199683042789223	0.506024096385542	0.159120734908136	3.18012669233636	0.129896907216495	0.407290015847861	257	151	1948	10415	3.97826641503285e-98	1.82204601808505e-96	9.11023009042523e-96	9.09732713489884	7.61427397610818	Inf	3.99767861456698	4.90009550642281	2.13104064373254e-86	1.62669435804917e-84	4.88008307414752e-84	18.1147644629713	2.99239554850996	4.77720727828917e-24	1.21553385192024e-22	1.09398046672822e-21	4.76921962475431	1.49533957844622e-10	1.71216381732092e-08	3.42432763464184e-08	374	359	193
"TCGA-49-4487-01A-21D-1855-08"	0	0	0	0	894	4	2	17	19	854	35014	29	41	14	84	8548	38	27	17	82	8956	71	181	87	339	8820	68	197	84	349	8690	27	28	23	78	1232	0.087248322147651	0.223495702005731	0.141772151898734	1.57644289807614	0.0633116883116883	32	19	20	71	1231	0.0794183445190157	0.209439528023599	0.139569160997732	1.50061465245178	0.057676685621446	0.114093959731544	102	208	2463	15047	8.18667962979014e-17	4.57256008590718e-16	1.87474963522194e-14	2.99560872545812	2.42539275578364	Inf	2.3391615260697	3.01758106304238	5.37142484819784e-16	3.61781261834502e-15	1.23005629023731e-13	4.5052081340486	1.78769769192232	9.59937817501025e-05	0.000422741846553336	0.0219825760207735	2.05224369850616	0.0667902750539894	0.242777349005771	1	792	752	58
"TCGA-49-4488-01A-01D-1753-08"	0	0	0	0	643	4	5	16	21	612	25092	35	29	10	74	6330	29	17	16	62	6267	36	145	61	242	6248	26	151	57	234	6247	5	23	11	39	853	0.0606531881804044	0.166666666666667	0.136545541860093	1.22059398202423	0.0457209847596717	13	17	17	47	877	0.073094867807154	0.194214876033058	0.140364916773367	1.38364258318648	0.0535917901938426	0.0715396578538103	46	134	1730	10765	2.61459917565462e-05	7.3918914966038e-05	0.00598743211224908	2.13594336152073	1.57581630406695	Inf	1.84576107899807	2.09686742494872	0.00148057227860709	0.00329175778447596	0.339051051801024	2.54528297666695	1.71382384637994	0.00284002267844669	0.00956419402006312	0.650365193364292	1.93587495101569	0.120525509369564	0.349862858575848	1	597	566	21
"TCGA-49-4490-01A-21D-1855-08"	0	0	0	0	205	1	4	6	10	194	7954	1	15	0	16	1962	5	14	6	25	1988	13	28	34	75	1892	9	29	40	78	2112	5	2	7	14	279	0.0682926829268293	0.179487179487179	0.132102272727273	1.35869864902123	0.0501792114695341	8	1	10	19	256	0.0926829268292683	0.253333333333333	0.135306553911205	1.87229166666667	0.07421875	0.146341463414634	30	66	535	3469	6.52080570572758e-06	2.10318944593185e-05	0.00149326450661162	2.94623644775582	1.97115054054222	Inf	2.33878504672897	4.42242990654206	7.38342143395346e-07	2.41410130645547e-06	0.000169080350837534	9.35603697261093	1.71932306137914	0.0177398168141737	0.0476433796561674	1	1.93355919553554	0.458647672059954	0.789946930088746	1	175	164	17
"TCGA-49-4494-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	471	3	2	14	16	446	18286	28	18	1	47	4484	19	14	6	39	4511	22	96	58	176	4590	23	99	62	184	4701	6	11	8	25	626	0.0530785562632696	0.135869565217391	0.133163156775154	1.0203240033338	0.0399361022364217	9	9	9	27	615	0.0573248407643312	0.153409090909091	0.133986928104575	1.144955654102	0.0439024390243902	0.0679405520169851	32	133	1241	8050	0.0198394316299473	0.0372395888791634	1	1.56061971871424	1.09321498216931	Inf	1.45196688887261	2.4955680902498	0.00052032474910189	0.00125425650046666	0.119154367544333	3.24277403282593	1.06061643835616	0.438152381785037	0.651538282005023	1	1.07063220013264	0.831980703389964	1	1	439	414	10
"TCGA-49-4501-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	184	0	5	5	10	174	7134	3	11	3	17	1832	4	15	2	21	1749	9	14	50	73	1756	5	24	34	63	1797	1	2	9	12	256	0.0652173913043478	0.19047619047619	0.142459654980523	1.33705357142857	0.046875	3	0	11	14	254	0.0760869565217391	0.191780821917808	0.144646924829157	1.32585481609319	0.0551181102362205	0.130434782608696	24	74	510	3043	0.0061119838299953	0.012609408081702	1	1.93479363609666	1.25443687454966	Inf	1.70612244897959	1.99047619047619	0.130795589400649	0.177231893329874	1	2.38587140675096	1.65873015873016	0.0154809676980941	0.0430052547636277	1	1.86413073949303	1.69700778754334e-05	0.000485768479184281	0.00388614783347425	160	150	10
"TCGA-49-4505-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	464	2	3	10	13	444	18204	19	21	8	48	4656	22	26	10	58	4761	23	99	45	167	4301	18	104	49	171	4486	5	16	12	33	643	0.0711206896551724	0.192982456140351	0.143334819438252	1.3463752694333	0.0513219284603421	4	16	13	33	613	0.0711206896551724	0.197604790419162	0.142524994187398	1.386457102109	0.0538336052202284	0.0732758620689655	34	101	1256	7531	0.00065415341361533	0.00152858297671337	0.149801131717911	2.01831057026322	1.41231166171635	Inf	1.76196036801132	1.53571151157371	0.122915114359538	0.168548270588828	1	1.68625583604394	1.86064337986177	0.00138491674040313	0.00503406243733836	0.317145933552317	2.17223366566794	0.00251842117439062	0.0262144749516115	0.576718448935452	430	410	15
"TCGA-49-4506-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	314	1	5	5	10	294	12054	14	15	8	37	3047	13	20	4	37	3136	17	59	37	113	2941	12	62	33	107	2930	1	11	5	17	409	0.054140127388535	0.158878504672897	0.139590443686007	1.13817608482051	0.0415647921760391	3	5	5	13	385	0.0414012738853503	0.115044247787611	0.130907854471268	0.878818526606137	0.0337662337662338	0.0445859872611465	14	85	794	5077	0.474090746147262	0.553912147284301	1	1.05316561359218	0.610909455039869	Inf	1.0456453705824	1.01989055849909	0.565057610505962	0.619130109118973	1	1.0230716949915	1.05631522130263	0.479382742699413	0.692126515625161	1	1.06570618257722	0.125278403507509	0.349862858575848	1	300	280	0
"TCGA-49-4507-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	477	0	5	12	17	452	18532	17	25	9	51	4642	25	26	8	59	4759	21	79	64	164	4558	37	67	74	178	4573	17	12	20	49	651	0.10272536687631	0.275280898876405	0.142357314673081	1.93373202851275	0.0752688172043011	11	17	14	42	648	0.0880503144654088	0.25609756097561	0.142167617376042	1.8013775971093	0.0648148148148148	0.129979035639413	62	134	1299	7832	7.67899096634672e-10	3.25646098387666e-09	1.7584889312934e-07	2.78923477312087	2.12395295456008	Inf	2.22353930024666	3.39343261394707	8.13576465926844e-10	3.65311785680877e-09	1.86309010697247e-07	5.62565610835689	1.73184500898127	0.000906504390191369	0.00340310664514465	0.207589505353824	1.97099534760809	0.434333067661959	0.765094403804528	1	415	390	34
"TCGA-49-4510-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	493	1	7	7	14	477	19557	8	13	5	26	4724	4	16	2	22	4845	6	178	22	206	4996	10	198	15	223	4992	3	2	3	8	636	0.0162271805273834	0.0358744394618834	0.127403846153846	0.281580505964972	0.0125786163522013	3	7	3	13	642	0.026369168356998	0.0631067961165049	0.128502802241793	0.491092762302271	0.0202492211838006	0.0243407707910751	12	41	1278	8710	0.0336814846746013	0.0597911627169279	1	1.99461299885897	1.07152251824066	Inf	1.76951014261671	2.93075117370892	0.0112668672690993	0.0209765252408434	1	4.08872594482973	1.26735185890115	0.334691434164831	0.559447725720776	1	1.31905472798597	1	1	1	481	465	0
"TCGA-49-4512-01A-21D-1855-08"	0	0	0	0	164	0	4	6	10	154	6314	1	9	3	13	1555	5	8	3	16	1587	4	19	28	51	1564	10	32	32	74	1608	4	3	7	14	222	0.0853658536585366	0.189189189189189	0.138059701492537	1.37034331628926	0.0630630630630631	1	1	2	4	194	0.024390243902439	0.0784313725490196	0.124040920716113	0.632302405498282	0.0206185567010309	0.0853658536585366	14	60	416	2756	0.103325766668648	0.158551397095497	1	1.54558730451732	0.880304466485305	Inf	1.44256756756757	2.72321428571429	0.0283932824802019	0.0467774222155844	1	3.67795846677226	1.14375	0.390381312270259	0.612310414451297	1	1.16903875010987	0.305266721477971	0.624161421593351	1	150	140	0
"TCGA-49-4514-01A-21D-1855-08"	0	0	0	0	762	7	5	15	20	724	29684	25	23	3	51	7429	26	28	2	56	7567	78	113	108	299	7329	64	133	121	318	7359	36	21	53	110	1092	0.144356955380577	0.345911949685535	0.148389726865063	2.33110443016103	0.100732600732601	54	17	41	112	1046	0.146981627296588	0.374581939799331	0.142720698594624	2.62458034109875	0.107074569789675	0.241469816272966	184	187	2138	12550	3.50078005961043e-55	6.16675872039068e-54	8.01678633650788e-53	5.77478161137848	4.81972231308938	Inf	3.40720980133586	4.35420756531707	1.22049247026051e-39	2.06031063287753e-38	2.79492775689657e-37	10.1568193837571	2.81998848043921	5.25291734154474e-22	1.00243172601145e-20	1.20291807121375e-19	4.08687854503235	0.772614963231777	1	1	578	540	130
"TCGA-49-6742-01A-11D-1855-08"	0	0	0	0	689	2	7	11	18	664	27224	14	25	23	62	6857	12	24	21	57	6916	80	56	131	267	6628	62	80	136	278	6823	35	7	62	104	1010	0.150943396226415	0.37410071942446	0.148028726366701	2.52721703825059	0.102970297029703	60	10	62	132	1007	0.191582002902758	0.49438202247191	0.1519312009656	3.25398614195017	0.131082423038729	0.317851959361393	219	190	2017	11434	3.0502947098567e-70	9.97882126510263e-69	6.98517488557184e-68	6.53267582255121	5.49592480915399	Inf	3.57083252015569	4.46153121006655	1.33354809704472e-43	3.3931390469249e-42	3.05382514223241e-41	11.4549001890326	3.0971275989297	2.9761475844202e-33	1.36307559366445e-31	6.81537796832226e-31	4.91489814896499	0.00968225741166729	0.0615899152019947	1	470	445	158
"TCGA-49-6743-01A-11D-1855-08"	0	0	0	0	1729	7	7	34	41	1656	67896	95	94	20	209	17085	79	79	27	185	17495	111	235	232	578	16359	134	298	252	684	16957	68	34	92	194	2468	0.112203585887796	0.283625730994152	0.145544612844253	1.94872022709394	0.0786061588330632	58	25	86	169	2396	0.0977443609022556	0.292387543252595	0.146463720276301	1.99631378133105	0.070534223706177	0.175824175824176	304	425	4864	28452	3.02668279661422e-68	8.66387950530821e-67	6.93110360424656e-66	4.18411996115231	3.67608823913414	Inf	2.85631001371742	3.52260338345865	2.93405115535468e-41	6.71897714576222e-40	6.71897714576222e-39	6.19307197730662	2.51903341126577	7.25489031616189e-33	2.37338554628725e-31	1.66136988240107e-30	3.4024912318944	0.000121368890975605	0.00198524828810097	0.0277934760334135	1425	1352	198
"TCGA-49-6744-01A-11D-1855-08"	0	0	0	0	579	1	1	8	9	561	23001	33	14	5	52	5744	26	24	6	56	5871	36	139	57	232	5786	30	147	44	221	5600	6	16	6	28	785	0.0483592400690846	0.126696832579186	0.140178571428571	0.903824538144508	0.0356687898089172	7	24	10	41	837	0.0708117443868739	0.176724137931034	0.144659522986519	1.22165574918634	0.0489844683393071	0.0500863557858377	29	138	1622	9764	0.151109871589615	0.224702341519622	1	1.26498663680351	0.873841344328044	Inf	1.21899480939477	1.38267384075029	0.139627977904943	0.186987175089076	1	1.47647531832111	1.11203623444959	0.365521224326444	0.593647945891884	1	1.13308038033135	0.676530067276772	0.95632953954556	1	550	532	0
"TCGA-49-6745-01A-11D-1855-08"	0	0	0	0	363	2	2	1	3	357	14637	1	13	3	17	3729	7	12	3	22	3730	39	33	78	150	3525	47	42	79	168	3653	36	7	36	79	545	0.21763085399449	0.470238095238095	0.14919244456611	3.15188947138488	0.144954128440367	27	3	35	65	547	0.179063360881543	0.433333333333333	0.155177304964539	2.79250457038391	0.118829981718464	0.369146005509642	134	109	1092	6086	1.21409048988669e-44	1.54459290102251e-43	2.78026722184052e-42	6.84875996337049	5.45669985735948	Inf	3.62476069883477	4.81529516994633	1.30513669029008e-32	1.6604239004246e-31	2.98876302076428e-30	15.256321161606	2.97262079746156	1.40860693058782e-18	2.15047324736407e-17	3.22570987104611e-16	4.59995812985102	0.408310223115083	0.75468749229676	1	229	223	97
"TCGA-49-6767-01A-11D-1855-08"	0	0	0	0	1090	3	9	21	30	1041	42681	51	38	9	98	10497	55	48	20	123	10822	57	265	106	428	10704	66	239	87	392	10658	17	29	18	64	1483	0.0587155963302752	0.163265306122449	0.139144304747607	1.17335241581461	0.043155765340526	13	24	22	59	1479	0.0541284403669725	0.13785046728972	0.13817264573991	0.997668290648518	0.0398918187964841	0.0642201834862385	70	246	2962	18400	5.02397760565648e-05	0.000138613358035582	0.0115049087169533	1.76758853824638	1.39336880307514	Inf	1.59759912477884	1.75902900149866	0.00130771993632337	0.00299467865418052	0.299467865418052	2.00385231730223	1.49471894427865	0.005944001244024	0.0179206383192064	1	1.62400674238658	0.203286476161633	0.490027400431726	1	1020	971	26
"TCGA-50-5044-01A-21D-1855-08"	0	0	0	0	363	2	0	3	3	356	14596	3	8	2	13	3565	11	9	3	23	3643	52	37	65	154	3632	43	63	60	166	3756	33	6	31	70	543	0.192837465564738	0.421686746987952	0.144568690095847	2.91686081341942	0.128913443830571	40	2	34	76	531	0.209366391184573	0.493506493506494	0.146200440528634	3.37554723995402	0.143126177024482	0.380165289256198	138	82	1074	6314	1.79786698163872e-57	3.97325697844079e-56	4.11711538795267e-55	9.88875266252683	7.74531556683608	Inf	4.31498222447943	5.28593550916397	3.26602023151573e-41	6.79926030015547e-40	7.47918633017102e-39	19.500925006966	3.57705772811918	3.11785146648605e-22	6.49079987113914e-21	7.13987985825305e-20	6.36636659459603	0.41196687047949	0.75468749229676	1	225	218	106
"TCGA-50-5045-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	632	5	4	16	20	595	24395	33	18	4	55	6081	34	18	9	61	6183	28	153	48	229	6043	33	169	48	250	6088	9	22	10	41	881	0.064873417721519	0.164	0.144710906701708	1.13329398410897	0.0465380249716232	6	13	7	26	861	0.0411392405063291	0.11353711790393	0.142478901208009	0.796869690468583	0.0301974448315912	0.0506329113924051	32	125	1742	10389	0.0255144019840432	0.0463714131297293	1	1.52667641026122	1.06843642851189	Inf	1.4193803154731	1.71241836216145	0.0239605396156921	0.0409782562341728	1	1.94469536608956	1.23317905663988	0.212239404003768	0.388822588134903	1	1.28332709827389	0.839686230932621	1	1	600	563	9
"TCGA-50-5049-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	1698	6	11	31	42	1620	66420	97	55	14	166	16393	88	70	11	169	16717	105	411	118	634	16499	108	414	129	651	16811	22	44	18	84	2306	0.049469964664311	0.129032258064516	0.137172089703171	0.940659709593487	0.0364267129228101	15	45	21	81	2276	0.0477031802120141	0.127760252365931	0.137947754409358	0.926149562295909	0.0355887521968366	0.0447585394581861	76	384	4582	28728	0.0530206394638678	0.0879835249074328	1	1.24087034846681	0.99623919291178	Inf	1.20108932875334	1.26282063104657	0.0799955623710344	0.117629637938809	1	1.31805881283411	1.14785545268671	0.200853953227806	0.370931897493287	1	1.17555468575858	0.896044762659435	1	1	1622	1544	0
"TCGA-50-5051-01A-21D-1855-08"	0	0	0	0	437	2	2	9	11	417	17097	13	9	11	33	4112	12	11	5	28	4260	13	98	25	136	4252	24	150	46	220	4473	2	13	6	21	557	0.0480549199084668	0.0954545454545455	0.124524927341829	0.766549698057777	0.0377019748653501	3	9	3	15	583	0.034324942791762	0.110294117647059	0.137111947318909	0.804409242256079	0.0257289879931389	0.0320366132723112	14	94	1140	7585	0.556091224297543	0.627314730857819	1	0.990948922513718	0.577559881189547	Inf	0.992121507472385	1.03425794215268	0.541036959381353	0.601443998535582	1	1.03961350501748	0.970163083765752	0.592058382011387	0.786784662554334	1	0.965832970277651	0.372321981438772	0.722557065673549	1	423	403	0
"TCGA-50-5055-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	45	0	0	0	0	44	1804	0	1	5	6	472	1	5	3	9	484	2	6	11	19	397	2	1	7	10	451	1	0	3	4	66	0.0888888888888889	0.4	0.146341463414634	2.73333333333333	0.0606060606060606	1	2	2	5	68	0.111111111111111	0.263157894736842	0.171284634760705	1.53637770897833	0.0735294117647059	0.155555555555556	7	15	134	714	0.0508866547863952	0.0851013909288105	1	2.48310145222076	0.995478614474616	Inf	2.01356852103121	3.16417910447761	0.12187410795968	0.168548270588828	1	5.31248103745051	1.75787728026534	0.147545269884061	0.299007670826991	1	2.04730379638187	0.334841628959276	0.672620465190125	1	38	37	0
"TCGA-50-5066-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	577	1	2	9	11	557	22837	32	22	6	60	5746	34	29	12	75	5941	37	105	53	195	5439	38	125	64	227	5711	7	18	17	42	848	0.072790294627383	0.185022026431718	0.148485379092978	1.24606225583908	0.0495283018867925	13	11	11	35	790	0.0606585788561525	0.179487179487179	0.145247288104431	1.23573515092502	0.0443037974683544	0.0831889081455806	48	144	1638	9512	0.000142665530160717	0.000363004515631158	0.0326704064068042	1.93565280206186	1.43869120889988	Inf	1.70177045177045	1.81522181522182	0.00513652271435121	0.010318102645495	1	2.11150726524117	1.62904521878881	0.0057706181723905	0.017857723803749	1	1.82682621842187	0.223108814196269	0.521346106642302	1	529	509	20
"TCGA-50-5068-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	206	0	2	7	9	196	8036	6	12	5	23	2060	10	13	7	30	2114	14	27	31	72	1941	4	32	35	71	1921	2	3	9	14	282	0.0679611650485437	0.197183098591549	0.14679854242582	1.34322245529917	0.049645390070922	3	3	6	12	279	0.058252427184466	0.166666666666667	0.143740340030912	1.1594982078853	0.043010752688172	0.0970873786407767	20	64	561	3301	0.0173144837416444	0.0327687336928642	1	1.83841779987406	1.14348035298464	Inf	1.63907987437399	1.91225985343632	0.10951310378431	0.154805560287697	1	2.26250960108816	1.56457624372063	0.0511175877246475	0.12322029040994	1	1.73033548848779	0.00946526301035661	0.0615899152019947	1	186	176	8
"TCGA-50-5072-01A-21D-1855-08"	0	0	0	0	398	0	3	11	14	378	15498	23	19	5	47	3916	26	16	7	49	3933	13	78	47	138	3783	17	63	64	144	3866	5	8	13	26	568	0.0653266331658292	0.180555555555556	0.14692188308329	1.22892214397496	0.0457746478873239	2	8	14	24	514	0.0603015075376884	0.173913043478261	0.135871001850383	1.27998646591101	0.0466926070038911	0.085427135678392	34	107	1082	6567	0.00124373983449791	0.00281996457524774	0.284816422100021	1.92846590941044	1.35173872283244	Inf	1.70465777847695	1.64950708564387	0.122249889820201	0.168548270588828	1	1.84698299921542	1.71956337113454	0.00320783353881036	0.010646288121559	0.734593880387572	1.95072889262449	4.25551385925874e-05	0.000801529021432605	0.00974512673770252	364	344	14
"TCGA-50-5930-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	51	0	17	34	51	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NA	NA	NA	NA	0	0	0	0	0	0	NA	NA	NA	NA	0	0	0	0	0	1	1	1	0	0	Inf	NA	NA	1	1	1	0	NA	1	1	1	0	1	1	1	51	0	0
"TCGA-50-5931-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	719	2	6	16	22	681	27921	36	58	10	104	7139	41	48	11	100	7331	41	133	70	244	6668	32	130	71	233	6783	9	20	6	35	1006	0.0486787204450626	0.150214592274678	0.148311956361492	1.01282860775263	0.0347912524850895	11	19	16	46	976	0.0639777468706537	0.188524590163934	0.146370725854829	1.2879938188659	0.0471311475409836	0.0584144645340751	42	172	1982	11469	0.0320166350145074	0.0577307828214346	1	1.41295890102353	1.03920978097912	Inf	1.33194545300225	1.85933677066199	0.00379518592730977	0.00775979979780301	0.869097577353937	2.18346002621326	1.0588988842848	0.42214439938493	0.64047663198094	1	1.06979923255826	0.857877482438165	1	1	677	639	0
"TCGA-50-5932-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	195	0	8	12	20	170	6970	6	5	1	12	1768	12	8	4	24	1764	6	39	20	65	1723	9	42	18	69	1715	4	3	2	9	213	0.0461538461538462	0.130434782608696	0.124198250728863	1.05021432945499	0.0422535211267606	2	1	3	6	227	0.0307692307692308	0.0923076923076923	0.131746952988973	0.700643849542528	0.026431718061674	0.0564102564102564	11	42	440	2998	0.0720587720969315	0.11620745640984	1	1.78415938107266	0.931152214838132	Inf	1.62169811320755	3.12545454545455	0.00804005933656938	0.0156031660006304	1	4.53948351504997	1.02811004784689	0.546976557209645	0.754564045789209	1	1.03236469968157	1	1	1	184	159	0
"TCGA-50-5933-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	1119	5	8	23	31	1065	43665	52	39	15	106	11030	73	41	16	130	11272	48	241	130	419	10660	57	239	114	410	10703	18	34	24	76	1557	0.0679177837354781	0.185365853658537	0.145473231804167	1.27422654573367	0.0488118175979448	12	35	26	73	1515	0.065236818588025	0.174224343675418	0.142120075046904	1.22589538190096	0.0481848184818482	0.0714924039320822	80	269	3072	18291	1.6067937329182e-05	4.77864629660088e-05	0.00367955764838268	1.77067758093844	1.41665393925171	Inf	1.59406339541547	1.98688616071429	0.00013497718768726	0.000355284781383707	0.0309097759803825	2.38147314882667	1.42502081198771	0.00612065699784388	0.0182029928896915	1	1.53452234897718	0.0127288328642878	0.0767079664716291	1	1039	985	30
"TCGA-50-5935-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	251	0	2	10	12	239	9799	5	13	4	22	2416	5	10	4	19	2710	33	15	55	103	2411	22	18	55	95	2262	19	2	22	43	428	0.171314741035857	0.452631578947368	0.18921308576481	2.3921790457452	0.100467289719626	22	5	20	47	369	0.187250996015936	0.456310679611651	0.153048527581916	2.98147709632436	0.127371273712737	0.330677290836653	83	82	797	3876	1.25919936860749e-21	7.79342311921933e-21	2.88356655411115e-19	4.92031676913597	3.73078756824611	Inf	2.94938595490666	4.37077677654842	2.34029986424719e-20	1.78642889637536e-19	5.35928668912607e-18	14.2305986631897	2.23869054408578	1.67354457901625e-07	9.82671047678772e-07	3.83241708594721e-05	3.00291229017308	1	1	1	168	156	55
"TCGA-50-5936-01A-11D-1625-08"	0	0	0	0	277	2	5	7	12	260	10660	11	12	9	32	2766	8	8	13	29	2703	34	23	56	113	2578	17	31	38	86	2613	11	10	16	37	396	0.133574007220217	0.430232558139535	0.151549942594719	2.8388830162086	0.0934343434343434	27	1	27	55	403	0.1985559566787	0.486725663716814	0.156322730799069	3.11359494060036	0.136476426799007	0.292418772563177	81	64	799	4392	5.06344548997538e-28	3.86509672401454e-27	1.15952901720436e-25	6.95302650172858	5.17265819289029	Inf	3.62928660826033	4.84080590934747	1.49031956824397e-20	1.17683855561334e-19	3.41283181127869e-18	16.0538431509627	2.97197294490454	6.05669396826745e-12	4.95351042404731e-11	1.38698291873325e-09	4.63281157145208	0.55262353013613	0.84339800235416	1	196	179	59
"TCGA-50-5939-01A-11D-1625-08"	0	0	0	0	191	1	2	8	10	178	7298	6	12	3	21	1854	5	7	4	16	1900	12	13	46	71	1749	15	17	38	70	1795	4	0	12	16	257	0.0837696335078534	0.228571428571429	0.143175487465181	1.5964424680378	0.0622568093385214	4	2	14	20	242	0.104712041884817	0.28169014084507	0.138364779874214	2.03585147247119	0.0826446280991736	0.178010471204188	34	77	499	3045	9.07663595553655e-06	2.77139951175716e-05	0.00207854963381787	2.69363465438373	1.84969094235284	Inf	2.17544999909729	2.10435686187189	0.0291920512418294	0.0477498552455638	1	2.56837385006876	2.19830136463403	7.50945548197409e-05	0.00033718927556315	0.0171966530537207	2.73446110368074	4.30695309606814e-05	0.000801529021432605	0.00986292258999604	157	144	18
"TCGA-50-5941-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	901	4	5	24	29	855	35055	46	40	11	97	8966	53	32	17	102	8895	59	191	85	335	8498	53	181	87	321	8696	12	19	17	48	1204	0.0532741398446171	0.149532710280374	0.138454461821527	1.08001366162635	0.0398671096345515	16	20	21	57	1265	0.0632630410654828	0.170149253731343	0.148858554954107	1.14302637012566	0.0450592885375494	0.0732519422863485	66	218	2469	14725	5.16986808299906e-05	0.000140940451310332	0.0118389979100678	1.80552430557984	1.40974819181335	Inf	1.61838344770934	1.74098825435399	0.00212310997622144	0.00453193833631397	0.48619218455471	1.98795431547651	1.53854775966167	0.00431107088933991	0.0139047216008287	0.987235233658839	1.69120432575416	0.180738554809002	0.458144262511275	1	835	789	25
"TCGA-50-5942-01A-21D-1753-08"	0	0	0	0	145	0	2	4	6	136	5576	9	13	7	29	1529	7	9	2	18	1393	7	18	26	51	1330	4	27	7	38	1324	1	4	2	7	193	0.0482758620689655	0.184210526315789	0.145770392749245	1.26370329970003	0.0362694300518135	1	2	2	5	192	0.0344827586206897	0.0980392156862745	0.144360902255639	0.679125816993464	0.0260416666666667	0.0413793103448276	6	38	385	2269	0.630656073508814	0.7044889796757	1	0.930562214394289	0.381109984600329	Inf	0.940023612750886	1.25336481700118	0.489692432787289	0.555146371823214	1	1.30952101515284	0.835576544667454	0.725192777278717	0.869471968569771	1	0.812956070408123	0.64040536122916	0.928182453933403	1	139	130	0
"TCGA-50-5944-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	198	0	4	8	12	184	7544	3	9	2	14	1811	9	9	10	28	1960	11	29	42	82	1898	11	18	31	60	1875	7	2	5	14	271	0.0707070707070707	0.233333333333333	0.144533333333333	1.61439114391144	0.0516605166051661	3	4	5	12	250	0.0606060606060606	0.146341463414634	0.131717597471022	1.1110243902439	0.048	0.101010101010101	20	75	521	3252	0.0364634894205433	0.0637415196740795	1	1.66422677659903	1.04261340656094	Inf	1.5245984442873	3.29174664107486	0.000350895050711218	0.000854840070349669	0.0803549666128689	5.1980138394162	0.992033234296532	0.563154632030515	0.772230004401125	1	0.990770775162122	1	1	1	178	164	0
"TCGA-50-5946-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	42	0	6	36	42	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NA	NA	NA	NA	0	0	0	0	0	0	NA	NA	NA	NA	0	0	0	0	0	1	1	1	0	0	Inf	NA	NA	1	1	1	0	NA	1	1	1	0	1	1	1	42	0	0
"TCGA-50-6590-01A-12D-1855-08"	0	0	0	0	1962	11	8	37	45	1875	76875	103	69	27	199	19494	86	83	18	187	20105	161	374	183	718	18712	167	405	199	771	18564	89	61	71	221	2926	0.112640163098879	0.286640726329442	0.157616892911011	1.81859140245378	0.0755297334244703	75	50	57	182	2759	0.0927624872579001	0.253481894150418	0.147445489525438	1.71915665217203	0.0659659296846684	0.148827726809378	292	418	5685	31591	2.72428086724238e-60	6.93178131776117e-59	6.23860318598505e-58	3.88171293093568	3.404990952175	Inf	2.69664226343107	3.27845206684257	2.11291142990828e-48	6.91223882069994e-47	4.83856717448996e-46	5.55658035955117	2.19707782489973	1.12427639001098e-18	1.83899495223225e-17	2.57459293312514e-16	2.80036016708615	0.0102634370728662	0.063522353775307	1	1670	1583	184
"TCGA-50-6591-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	156	0	6	20	26	127	5207	3	6	6	15	1282	1	6	5	12	1383	7	14	26	47	1257	5	25	23	53	1285	1	5	3	9	198	0.0576923076923077	0.169811320754717	0.15408560311284	1.10205831903945	0.0454545454545455	1	4	4	9	171	0.0576923076923077	0.191489361702128	0.136038186157518	1.40761478163494	0.0526315789473684	0.0576923076923077	9	52	369	2173	0.535830130011091	0.613525498862699	1	1.01922487020734	0.502498507286357	Inf	1.01639344262295	1.14814814814815	0.538320018441413	0.6013428498687	1	1.17767775677067	0.984126984126984	0.581024538602046	0.786784662554334	1	0.981487271024747	0.121205379714835	0.349862858575848	1	147	118	0
"TCGA-50-6592-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	656	1	1	10	11	634	25994	33	39	13	85	6723	37	44	14	95	6881	46	90	84	220	6224	58	84	92	234	6166	23	13	30	66	946	0.100609756097561	0.282051282051282	0.153421991566656	1.83840190816935	0.0697674418604651	23	13	26	62	887	0.0945121951219512	0.281818181818182	0.142512853470437	1.97749308188993	0.0698985343855693	0.155487804878049	102	178	1833	10557	1.19787390881177e-18	6.85782812794738e-18	2.74313125117895e-16	3.29990384066445	2.65403568784503	Inf	2.46235679214403	2.98973939317638	8.49915178162632e-13	4.74708721461568e-12	1.94630575799243e-10	4.56719657618182	2.15072161880673	1.32770877824751e-08	8.68700886339085e-08	3.0404531021868e-06	2.68727640357986	0.250522765657933	0.562448169957516	1	554	532	61
"TCGA-50-6593-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	639	3	4	12	16	613	25133	25	39	10	74	6350	29	31	12	72	6506	41	130	54	225	6070	34	130	78	242	6207	7	13	12	32	897	0.0500782472613459	0.132231404958678	0.144514258095698	0.915005942673927	0.0356744704570792	8	10	7	25	848	0.0391236306729265	0.111111111111111	0.139703459637562	0.795335429769392	0.0294811320754717	0.05320813771518	34	173	1745	10532	0.208728205537762	0.300621126214764	1	1.18613625283465	0.846173517236182	Inf	1.15559431363592	1.40710601719198	0.106377641564571	0.151307328685011	1	1.50881975331236	1.01268993661544	0.514688392019028	0.727553344273811	1	1.01482348231007	0.539468301271801	0.84339800235416	1	605	579	0
"TCGA-50-6594-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	1157	8	12	32	44	1090	44690	55	42	12	109	11294	54	32	10	96	11369	59	276	111	446	11071	82	269	88	439	10956	29	39	18	86	1509	0.0743301642178047	0.195899772209567	0.137732749178532	1.42231802805038	0.0569913850231942	11	32	30	73	1487	0.0630942091616249	0.163677130044843	0.134314876704905	1.21860760371651	0.0490921318090114	0.0760587726879862	88	252	2996	19031	1.92917569478252e-09	7.8112279116875e-09	4.41781234105197e-07	2.2181053718059	1.78642825378758	Inf	1.90290583523129	2.08571239193629	3.71013098671253e-06	1.10340259215217e-05	0.000849619995957169	2.51552247471253	1.77337958148553	5.12142337133813e-05	0.000234561190407286	0.0117280595203643	2.01918731094601	0.380323658418387	0.731883342670678	1	1069	1002	42
"TCGA-50-6595-01A-12D-1855-08"	0	0	0	0	245	0	0	5	5	239	9799	6	10	5	21	2291	6	7	1	14	2447	27	36	30	93	2488	22	34	55	111	2573	10	2	14	26	355	0.106122448979592	0.234234234234234	0.137971239797901	1.69770333713996	0.0732394366197183	11	3	10	24	349	0.0979591836734694	0.258064516129032	0.140273311897106	1.83972640724651	0.0687679083094556	0.183673469387755	45	89	704	4357	1.19388181349755e-08	4.48194975886785e-08	2.73398935290939e-06	3.12826614057492	2.25035056271141	Inf	2.41418970488467	3.08096590909091	9.01162085209665e-07	2.86619607656963e-06	0.000206366117513013	4.63973361379645	2.0298128342246	0.000491091806268996	0.00193896592475173	0.1124600236356	2.43451375168873	0.687907002816452	0.958841985019867	1	200	194	26
"TCGA-50-6597-01A-11D-1855-08"	0	0	0	0	194	2	2	8	10	182	7462	3	6	6	15	1844	5	9	3	17	1866	8	27	44	79	1811	10	38	23	71	1941	3	4	6	13	263	0.0670103092783505	0.183098591549296	0.135497166409068	1.3513093771756	0.0494296577946768	6	1	9	16	261	0.0824742268041237	0.20253164556962	0.144119271120928	1.4053057859256	0.0613026819923372	0.123711340206186	24	61	524	3228	0.000544273330381765	0.0012849339449219	0.124638592657424	2.42280927540357	1.55549299927784	Inf	2.02173327346206	3.58015267175573	0.00031199911900935	0.000768255895195066	0.0714477982531412	6.15544584160367	1.6030534351145	0.0430496196079255	0.109537365446833	1	1.77668491824294	0.182057327024131	0.458144262511275	1	170	158	12
"TCGA-55-1592-01A-01D-0969-08"	0	0	0	0	1178	2	7	31	38	1127	46207	72	101	24	197	11989	59	70	19	148	12279	78	167	129	374	10971	72	193	143	408	10968	22	29	29	80	1614	0.067911714770798	0.196078431372549	0.147155361050328	1.33245863401123	0.0495662949194548	19	26	27	72	1620	0.0611205432937182	0.192513368983957	0.14766201804758	1.30374331550802	0.0444444444444444	0.0823429541595925	97	325	3234	18705	5.80743794193385e-06	1.89986184100407e-05	0.00132990328870285	1.72620562594452	1.41040522542094	Inf	1.55932303985791	1.85425479282622	5.1740853262406e-05	0.00014105542139394	0.011848655397091	2.17549002956171	1.39667685255921	0.00594746075222571	0.0179206383192064	1	1.49948356036149	0.0846864800367986	0.28106092649894	1	1081	1030	35
"TCGA-55-1594-01A-01D-1040-01"	0	0	0	0	362	1	4	12	16	343	14063	13	14	8	35	3553	14	15	7	36	3603	46	32	55	133	3391	35	38	66	139	3516	18	6	19	43	498	0.11878453038674	0.309352517985612	0.141638225255973	2.18410331975384	0.0863453815261044	25	7	25	57	511	0.157458563535912	0.428571428571429	0.150693010911236	2.84400335476656	0.111545988258317	0.240331491712707	87	115	1009	5898	1.17736890959722e-21	7.48937445271565e-21	2.69617480297763e-19	4.42102763809052	3.43651370129919	Inf	2.94826266571157	3.63397325306807	1.1269149947517e-15	7.37324382280398e-15	2.58063533798139e-13	6.61164197847216	2.48923326425804	4.07147616091494e-09	2.74225894367506e-08	9.32368040849521e-07	3.33941650074117	1	1	1	275	256	57
"TCGA-55-1595-01A-01D-0969-08"	0	0	0	0	521	2	2	9	11	504	20664	27	26	5	58	5174	29	31	7	67	5331	35	110	50	195	4987	22	114	48	184	5172	6	18	9	33	753	0.0633397312859885	0.179347826086957	0.145591647331787	1.23185518794388	0.0438247011952191	7	12	7	26	716	0.0499040307101727	0.133333333333333	0.143573290555444	0.928677839851024	0.0363128491620112	0.0556621880998081	29	126	1469	8690	0.0876011180677443	0.139310111371621	1	1.36147697521265	0.937503747791168	Inf	1.29388436285382	1.57723955907468	0.061333670111744	0.0936360697039292	1	1.74766884938135	1.12907572831719	0.342077413548942	0.567650200744259	1	1.15421727300296	0.669383531196162	0.95632953954556	1	492	475	0
"TCGA-55-1596-01A-01D-1040-01"	0	0	0	0	384	2	4	7	11	364	14924	18	26	9	53	3866	25	34	9	68	3784	32	59	36	127	3617	17	55	44	116	3657	3	3	6	12	482	0.03125	0.103448275862069	0.131802023516544	0.784876234082129	0.024896265560166	6	8	3	17	509	0.0442708333333333	0.133858267716535	0.140724357202101	0.951208947604536	0.0333988212180747	0.046875	18	111	991	6283	0.496303687052375	0.571123338366803	1	1.02811764548073	0.641072137930551	Inf	1.02419449463779	1.34817438579872	0.218496091064522	0.277975582520975	1	1.42643117023134	0.825756811301715	0.777731530537867	0.904639361492816	1	0.80369200202313	1	1	1	366	346	0
"TCGA-55-5899-01A-11D-1625-08"	0	0	0	0	1002	6	5	25	30	946	38786	42	42	6	90	9831	43	42	8	93	9969	69	190	141	400	9581	75	167	121	363	9405	39	22	44	105	1366	0.104790419161677	0.289256198347107	0.145241892610314	1.99154798349527	0.0768667642752562	30	27	49	106	1360	0.105788423153693	0.265	0.141947604634172	1.86688602941176	0.0779411764705882	0.161676646706587	162	244	2726	16260	2.1562623821957e-35	2.2444731160128e-34	4.93784085522815e-33	3.95998475709766	3.32039054333188	Inf	2.77905157053587	3.33729212521399	1.62943274431432e-21	1.43515422479992e-20	3.73140098447979e-19	5.48689035778395	2.47223233437691	2.50695002518029e-17	3.58807222353929e-16	5.74091555766286e-15	3.28211466677614	0.0211895209712392	0.112846518660786	1	840	784	104
"TCGA-55-6543-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	67	0	1	3	4	63	2583	4	5	2	11	620	6	5	3	14	675	1	5	11	17	649	2	11	8	21	639	1	0	0	1	90	0.0149253731343284	0.0476190476190476	0.140845070422535	0.338095238095238	0.0111111111111111	1	0	1	2	85	0.0298507462686567	0.117647058823529	0.130970724191063	0.898269896193772	0.0235294117647059	0.0447761194029851	3	19	175	1113	0.592473341403	0.665080368535721	1	1.00420739239901	0.250342539350674	Inf	1.00363636363636	4.90666666666667	0.0510375046587471	0.0784401917238462	1	12.675714615682	0.387368421052632	0.937249055320782	1	1	0.353525909644257	1	1	1	64	60	0
"TCGA-55-6642-01A-11D-1855-08"	0	0	0	0	383	1	2	7	9	366	15006	18	18	5	41	3632	8	8	4	20	3612	11	109	22	142	3854	15	122	26	163	3908	3	7	3	13	472	0.0339425587467363	0.0797546012269939	0.120777891504606	0.660341062701466	0.0275423728813559	2	12	4	18	474	0.0469973890339426	0.126760563380282	0.122989102231448	1.03066500267427	0.0379746835443038	0.031331592689295	12	62	946	6816	0.187674004249929	0.273741063523782	1	1.39445931071897	0.765359036346135	Inf	1.33055253985487	1.57789884534071	0.204540941593409	0.263145368679161	1	1.7153439338731	1.19657329105004	0.368845378215758	0.594828109939497	1	1.23009859297439	0.749041072526961	1	1	371	354	0
"TCGA-55-6712-01A-11D-1855-08"	0	0	0	0	522	1	1	14	15	504	20664	9	18	11	38	5023	8	11	4	23	5314	47	83	68	198	5018	68	118	59	245	5309	52	8	28	88	744	0.168582375478927	0.359183673469388	0.14013938594839	2.56304586350669	0.118279569892473	34	6	22	62	712	0.118773946360153	0.313131313131313	0.141889198884018	2.20687209170355	0.0870786516853933	0.260536398467433	136	106	1456	8871	7.0796013736464e-51	1.15802051040359e-49	1.62122871456503e-48	7.81452574734183	6.23265290054929	Inf	3.98599128144583	5.30412087912088	8.16444984504273e-48	2.33707376814348e-46	1.86965901451479e-45	18.0592881680318	2.79240936229125	3.27735132640617e-12	2.77967945832227e-11	7.50513453747013e-10	3.95575855424419	4.55016475049077e-05	0.000801529021432605	0.0104198772786239	386	368	102
"TCGA-64-1676-01A-01W-0928-08"	0	0	0	0	1179	3	10	24	34	1128	46248	56	37	22	115	11684	57	41	10	108	11675	56	276	105	437	11209	64	298	106	468	11680	13	42	19	74	1688	0.0627650551314674	0.158119658119658	0.144520547945205	1.09409810831612	0.0438388625592417	6	28	11	45	1583	0.0381679389312977	0.102974828375286	0.141225800695869	0.729150253479837	0.0284270372710044	0.0415606446140797	49	282	3271	19618	0.419488755482968	0.500327734404165	1	1.04213358852224	0.792066844590396	Inf	1.03589171895103	1.10794609191888	0.352890141429228	0.418714209260587	1	1.12821340672727	0.99491292863756	0.54217270310351	0.754564045789209	1	0.994069910639679	0.108313782261071	0.333768311204482	1	1130	1079	0
"TCGA-64-1677-01A-01W-0928-08"	0	0	0	0	465	2	4	11	15	444	18204	10	18	4	32	4639	26	20	9	55	4770	67	50	75	192	4413	56	42	67	165	4382	33	10	25	68	723	0.146236559139785	0.412121212121212	0.164993153811045	2.49780795506937	0.0940525587828492	43	7	26	76	705	0.163440860215054	0.395833333333333	0.159755268524813	2.47774822695035	0.107801418439716	0.273118279569892	127	138	1428	7367	6.60283528027473e-32	6.04819711673165e-31	1.51204927918291e-29	4.74672092830939	3.82484719029439	Inf	2.9516542466043	3.80553847555282	2.49859039487055e-29	2.60080545647889e-28	5.72177200425356e-27	8.3376875418817	2.21202213279678	1.45994808431077e-08	9.28689198075462e-08	3.34328111307166e-06	2.89096184306517	0.00430923332651964	0.0394725772709199	0.986814431772998	338	317	84
"TCGA-64-1678-01A-01W-0928-08"	0	0	0	0	894	14	5	24	29	841	34481	49	20	9	78	8717	49	30	9	88	9019	39	191	94	324	8367	30	191	130	351	8378	9	29	43	81	1266	0.0906040268456376	0.230769230769231	0.151110050131296	1.52716004374772	0.0639810426540284	8	19	22	49	1215	0.0548098434004474	0.151234567901235	0.145213338114019	1.04146471574455	0.0403292181069959	0.0917225950782998	82	211	2481	14264	7.27763634085126e-09	2.79880545277628e-08	1.66657872205494e-06	2.23419006934869	1.77846346048825	Inf	1.88888109358084	1.66286969373032	0.0219999998555763	0.038616388623127	1	1.87943216747711	1.95850067657051	5.31877644839117e-08	3.20526264916205e-07	1.21799980668158e-05	2.35018606073195	1.40157182725346e-10	1.71216381732092e-08	3.20959948441042e-08	812	759	39
"TCGA-64-1680-01A-02W-0928-08"	0	0	0	0	107	0	1	5	6	101	4141	1	4	4	9	1103	2	7	3	12	1033	8	3	28	39	1043	11	10	20	41	962	6	2	7	15	152	0.14018691588785	0.365853658536585	0.158004158004158	2.31546854942234	0.0986842105263158	5	0	8	13	164	0.121495327102804	0.333333333333333	0.157238734419942	2.11991869918699	0.0792682926829268	0.242990654205607	26	41	316	1689	7.19642344434223e-06	2.25750817637585e-05	0.00164798096875437	3.38670804354593	2.13227602834559	Inf	2.46221424522955	3.67338441039307	3.71458737977957e-05	0.000103736647557259	0.00850640509969522	7.33786707672297	1.98279272151899	0.00625439083482543	0.0183622500150644	1	2.42813015223893	0.42183405682963	0.75468749229676	1	81	75	15
"TCGA-64-5774-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	325	1	4	10	14	305	12505	13	12	7	32	3032	14	21	2	37	3063	12	74	35	121	3148	13	65	37	115	3262	3	5	6	14	412	0.0430769230769231	0.121739130434783	0.126302881667689	0.963866610384128	0.0339805825242718	2	5	4	11	392	0.0338461538461538	0.0909090909090909	0.124523506988564	0.730055658627087	0.0280612244897959	0.0461538461538462	15	82	804	5606	0.23406692984428	0.31905551746631	1	1.27542888468391	0.752491568264445	Inf	1.23288198184336	1.59452736318408	0.198224644010034	0.25646013264575	1	1.74297127876029	1.10731066887783	0.418196399150076	0.64047663198094	1	1.12456826386114	0.216534219430637	0.512362771183737	1	310	290	0
"TCGA-64-5775-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	1054	5	9	44	53	974	39934	54	36	16	106	10097	55	49	11	115	10032	40	224	98	362	10069	47	251	93	391	9736	11	31	12	54	1347	0.0512333965844402	0.138107416879795	0.138352506162695	0.998228515769627	0.0400890868596882	3	29	20	52	1423	0.0493358633776091	0.143646408839779	0.141324858476512	1.01642704891619	0.0365425158116655	0.0436432637571157	46	232	2770	17035	0.129389943641364	0.194936165091265	1	1.21933510692741	0.915317325120583	Inf	1.18306365737735	1.15054566579526	0.329838623476074	0.397542340926426	1	1.17938999264329	1.19787551741735	0.160319309829413	0.316492430611514	1	1.23767580216566	0.00428696498906395	0.0394725772709199	0.981714982495645	1008	928	0
"TCGA-64-5778-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	1081	0	7	33	40	1023	41943	45	44	12	101	10510	54	44	10	108	10704	55	249	107	411	10308	52	240	111	403	10421	9	29	24	62	1433	0.0573543015726179	0.153846153846154	0.137510795509068	1.11879327929572	0.0432658757850663	12	41	29	82	1482	0.0758556891766883	0.199513381995134	0.143771827706636	1.38770846262202	0.0553306342780027	0.0684551341350601	74	251	2915	17814	1.93635589419229e-05	5.68494230474403e-05	0.00443425499770034	1.80162997949892	1.42837862238112	Inf	1.61915397809737	1.39564611019381	0.0699555827975426	0.104704761180636	1	1.49221957805639	1.72885738115096	4.32458465650939e-05	0.000206318726320969	0.0099032988634065	1.96297647041743	2.35595682827156e-05	0.000539514113674187	0.00539514113674187	1007	949	28
"TCGA-64-5779-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	789	3	7	14	21	745	30545	37	33	8	78	7695	35	28	12	75	7706	44	172	75	291	7467	44	192	65	301	7677	8	19	10	37	1043	0.0468948035487959	0.122923588039867	0.13586036212062	0.904778892983758	0.0354745925215724	7	27	17	51	1051	0.064638783269962	0.175257731958763	0.140752644971207	1.2451469881409	0.0485252140818268	0.0532319391634981	42	186	2094	13050	0.0326024844155169	0.0583278822746357	1	1.40720802744183	1.0374123955011	Inf	1.33222741667923	1.23274290179734	0.231188141831874	0.292497704306625	1	1.28054281249952	1.39476054031928	0.0456961377172532	0.113743647144032	1	1.48903450238207	0.0509725809322808	0.208216157470306	1	747	703	0
"TCGA-64-5781-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	2283	9	17	51	68	2184	89544	117	74	19	210	22538	105	70	22	197	22369	149	480	226	855	22169	143	510	269	922	22468	43	66	75	184	3107	0.0805957074025405	0.199566160520607	0.138285561687734	1.44314531528066	0.0592211136144191	41	52	74	167	3162	0.0731493648707841	0.195321637426901	0.142631602688439	1.36941346619765	0.0528146742567995	0.102058694699956	233	554	6269	38368	7.80943511400114e-29	6.62355793002319e-28	1.78836064110626e-26	2.57391077208374	2.25060118920172	Inf	2.10803548571935	2.04829810526684	6.6312719498397e-11	3.23098143938998e-10	1.51856127651329e-08	2.47157690005645	2.14327450610749	6.2034116528456e-20	1.09275482192434e-18	1.42058126850164e-17	2.63537786047733	2.5568719416544e-07	1.23021555731113e-05	5.85523674638858e-05	2050	1951	122
"TCGA-64-5815-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	357	0	5	8	13	338	13858	24	12	2	38	3398	21	13	4	38	3477	12	76	42	130	3470	13	71	48	132	3513	3	13	4	20	477	0.0560224089635854	0.151515151515152	0.135781383432963	1.11587573851725	0.0419287211740042	5	9	6	20	455	0.0560224089635854	0.153846153846154	0.131123919308357	1.17328825021133	0.043956043956044	0.0504201680672269	18	97	932	6051	0.273061013970828	0.363552163949533	1	1.20474604943292	0.747769480010387	Inf	1.17273745101698	2.3975965665236	0.0133960441925228	0.0247394687103848	1	3.05459286123857	0.832498807820696	0.776772130036515	0.904639361492816	1	0.811583614238385	0.789510612340418	1	1	339	320	0
"TCGA-67-3770-01A-01D-0969-08"	0	0	0	0	511	1	8	17	25	477	19557	14	30	6	50	4764	23	38	8	69	5003	30	104	60	194	4924	24	98	42	164	4866	7	19	8	34	688	0.0665362035225049	0.207317073170732	0.141389231401562	1.46628615995462	0.0494186046511628	3	8	5	16	632	0.0313111545988258	0.0824742268041237	0.128350934199838	0.642568184784027	0.0253164556962025	0.0450097847358121	23	133	1320	8470	0.35815219213799	0.453131779003313	1	1.10967374185452	0.733579689932466	Inf	1.09348290598291	1.37345679012346	0.186046335206501	0.242071652058459	1	1.45826467127345	0.945261437908497	0.629967739183753	0.810464113893705	1	0.937262086718553	0.635255856723194	0.928182453933403	1	488	454	0
"TCGA-67-3771-01A-01D-1040-01"	0	0	0	0	1502	5	9	58	67	1411	57851	58	73	20	151	13941	68	66	16	150	14382	135	238	173	546	14579	137	240	187	564	14949	55	23	58	136	2011	0.0905459387483356	0.24113475177305	0.134524048431333	1.79250293597977	0.0676280457483839	61	27	45	133	1893	0.0885486018641811	0.243589743589744	0.129844296590987	1.87601419534859	0.0702588483888009	0.145805592543276	219	413	3904	25624	1.12768650028829e-41	1.29120104283009e-40	2.58240208566018e-39	3.48028288999387	3.01163718373966	Inf	2.6209048817182	3.22562078109932	1.80300092236719e-32	2.1730905853794e-31	4.12887211222087e-30	4.88030187888651	2.16400842440801	2.12092326878186e-14	2.11170186326542e-13	4.85691428551046e-12	2.63055500924302	0.292303263227205	0.615873593808176	1	1283	1192	135
"TCGA-67-3772-01A-01W-0928-08"	0	0	0	0	171	0	8	13	21	150	6150	7	7	7	21	1504	1	12	5	18	1572	10	8	32	50	1533	16	12	33	61	1541	8	1	5	14	230	0.0818713450292398	0.229508196721311	0.149253731343284	1.53770491803279	0.0608695652173913	4	0	5	9	223	0.0526315789473684	0.18	0.145466405740378	1.23739910313901	0.0403587443946188	0.128654970760234	22	69	453	2621	0.0131488147788794	0.0253031813812049	1	1.8442934717612	1.1713389703583	Inf	1.64054047497756	3.13194090677534	0.000146161518938845	0.000380352134511313	0.0334709878369955	4.95550485450518	1.04398030225845	0.496201494412323	0.710188388877637	1	1.05196932905864	0.768310654634237	1	1	149	128	9
"TCGA-67-3773-01A-01W-0928-08"	0	0	0	0	236	0	3	8	11	218	8938	12	14	3	29	2327	11	11	5	27	2296	4	44	44	92	2141	8	40	22	70	2174	1	5	1	7	319	0.0296610169491525	0.1	0.146734130634775	0.681504702194357	0.0219435736677116	1	5	5	11	290	0.0466101694915254	0.119565217391304	0.135450723960766	0.882721139430285	0.0379310344827586	0.0338983050847458	8	70	609	3706	0.87522775890486	0.923627450641534	1	0.695524267629997	0.332736303529341	Inf	0.726706243947623	1.18089764641489	0.52176951095231	0.588597133044724	1	1.21700787760746	0.644125988953575	0.917651175116841	1	1	0.608597863154467	0.228476084538376	0.528495185447355	1	228	210	0
"TCGA-67-3774-01A-01D-1040-01"	0	0	0	0	253	0	3	10	13	237	9717	10	15	5	30	2330	12	18	2	32	2556	19	44	32	95	2436	9	42	29	80	2395	2	7	3	12	342	0.0474308300395257	0.15	0.142797494780793	1.05043859649123	0.0350877192982456	2	7	6	15	305	0.0592885375494071	0.157894736842105	0.125205254515599	1.26108714408973	0.0491803278688525	0.0513833992094862	13	76	647	4184	0.416119636692802	0.498907836663098	1	1.10616938974006	0.625479445191712	Inf	1.0906517548582	1.06668138661956	0.528122275452903	0.59284314254272	1	1.07780073271122	1.1016545468366	0.43422205993085	0.649914063556632	1	1.11918736681974	0.202126062490759	0.490027400431726	1	240	224	0
"TCGA-67-4679-01B-01D-1753-08"	0	0	0	0	654	1	6	19	25	618	25338	38	23	9	70	6118	48	29	12	89	6435	26	129	60	215	6366	37	135	72	244	6419	8	18	9	35	910	0.0535168195718654	0.14344262295082	0.141766630316249	1.01182219419924	0.0384615384615385	8	12	13	33	799	0.0504587155963303	0.153488372093023	0.125510524662268	1.22291236138196	0.0413016270337922	0.0581039755351682	38	157	1709	11076	0.0112186825831801	0.0220412958103745	1	1.56857637785629	1.13443719589039	Inf	1.4578325906588	1.89993219835233	0.00774019142083008	0.0151496054305136	1	2.20611667341307	1.24683050516871	0.163244031182386	0.319511821715952	1	1.29616647021324	0.339405867999411	0.675269040713785	1	616	580	12
"TCGA-67-6215-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	264	0	1	1	2	262	10742	10	28	55	93	2966	4	35	64	103	2993	1	10	25	36	2373	3	8	19	30	2410	0	1	5	6	421	0.0227272727272727	0.2	0.174688796680498	1.14489311163895	0.0142517814726841	0	3	4	7	374	0.0265151515151515	0.194444444444444	0.157606405394016	1.23373440285205	0.018716577540107	0.0340909090909091	9	39	795	3988	0.405157117259856	0.4961549724733	1	1.15754815714168	0.564347084799902	Inf	1.12806603773585	0	1	1	1	0	1.23061749571184	0.305035068234549	0.521291273326207	1	1.28984449550183	0.00045766590389016	0.00616502894063804	0.104805491990847	255	253	0
"TCGA-67-6216-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	105	0	0	6	6	99	4059	1	6	0	7	1096	7	5	0	12	1096	9	6	24	39	932	12	8	21	41	935	7	2	4	13	163	0.123809523809524	0.317073170731707	0.174331550802139	1.81879395481071	0.0797546012269939	7	1	9	17	155	0.161904761904762	0.435897435897436	0.166309012875536	2.62100909842845	0.109677419354839	0.257142857142857	27	39	318	1549	6.66797168449591e-06	2.12078543854106e-05	0.00152696551574956	3.36940287256788	2.12450507624287	Inf	2.40180102915952	3.91404612159329	7.48476824272219e-07	2.41410130645547e-06	0.000171401192758338	9.7241416974526	1.69608665269043	0.0359972356996757	0.0936746247184743	1	1.97809123335704	1	1	1	78	72	16
"TCGA-67-6217-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	362	3	6	15	21	329	13489	18	16	6	40	3340	10	15	8	33	3491	13	68	48	129	3187	20	68	39	127	3471	2	12	5	19	484	0.0524861878453039	0.149606299212598	0.139441083261308	1.07289972017961	0.0392561983471074	6	9	7	22	433	0.0607734806629834	0.170542635658915	0.135864449325384	1.2552410619976	0.0508083140877598	0.0552486187845304	20	100	917	5741	0.214924867729082	0.303813547592344	1	1.25207121515568	0.796122576688111	Inf	1.21010541621229	1.76015333267242	0.0757198184927996	0.112596353473059	1	2.00319654755563	1.0014665513481	0.545523223302471	0.754564045789209	1	1.00170096212945	0.441007160272224	0.770920913758315	1	342	309	0
"TCGA-71-6725-01A-11D-1855-08"	0	0	0	0	334	1	1	3	4	329	13489	6	13	5	24	3185	3	12	4	19	3337	6	76	44	126	3468	7	113	40	160	3499	3	4	7	14	489	0.0419161676646707	0.0875	0.13975421549014	0.62609918200409	0.0286298568507157	2	4	4	10	458	0.029940119760479	0.0793650793650794	0.132064590542099	0.600956539821169	0.0218340611353712	0.0479041916167665	16	81	947	6020	0.242799571064138	0.329000602211169	1	1.25563566594371	0.753019006744278	Inf	1.21351201297641	2.82958329948826	0.0233413373605308	0.0404936837542542	1	3.97224598139227	0.963405742444813	0.60125465479043	0.786784662554334	1	0.957892515387157	0.124581370450959	0.349862858575848	1	318	313	0
"TCGA-73-4658-01A-01D-1753-08"	0	0	0	0	605	1	0	11	11	588	24108	11	15	4	30	6147	23	13	2	38	6195	62	94	111	267	5900	63	75	115	253	5866	40	10	54	104	875	0.171900826446281	0.411067193675889	0.149164677804296	2.75579446640316	0.118857142857143	36	13	55	104	915	0.171900826446281	0.389513108614232	0.155084745762712	2.51161458013549	0.113661202185792	0.305785123966942	185	166	1790	9976	2.1705390138493e-57	4.14211195142908e-56	4.9705343417149e-55	6.20964632771289	5.15298979859192	Inf	3.4644988779067	3.99649608938548	1.1704520648041e-30	1.34016761420069e-29	2.68033522840139e-28	8.64153123063777	3.17025263261977	1.11824921809092e-30	3.20098838678526e-29	2.56079070942821e-28	5.19113109517127	0.00156034673881052	0.0178659701593805	0.357319403187609	420	403	132
"TCGA-73-4659-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	532	2	4	19	23	498	20418	29	28	3	60	5147	27	28	5	60	5234	23	103	63	189	5032	23	122	44	189	5005	2	22	7	31	722	0.0582706766917293	0.164021164021164	0.144255744255744	1.13701651790294	0.0429362880886427	6	9	9	24	684	0.0451127819548872	0.126984126984127	0.135930047694754	0.934187320152232	0.0350877192982456	0.0451127819548872	24	129	1406	8631	0.309685788304609	0.407574974262962	1	1.1420367445595	0.760743142514149	Inf	1.11979471731794	1.24151153441771	0.313250396012627	0.379915637862794	1	1.29231866264869	1.0674678613685	0.43156685312077	0.649914063556632	1	1.07934403192486	0.104903275447173	0.329080138046611	1	508	474	0
"TCGA-73-4662-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	525	0	3	19	22	497	20377	26	22	12	60	5089	26	27	11	64	5141	27	114	59	200	5051	22	100	51	173	5096	9	23	9	41	736	0.0780952380952381	0.236994219653179	0.144427001569859	1.6409273686856	0.0557065217391304	10	15	10	35	688	0.0666666666666667	0.175	0.136210651356167	1.28477470930233	0.0508720930232558	0.0723809523809524	38	121	1424	8723	0.000677079380346397	0.0015661735161548	0.155051178099325	1.92372746234146	1.37818606846612	Inf	1.70299802134125	2.76302740197202	1.77235878937691e-05	5.01074275021373e-05	0.00405870162767312	3.87902743268821	1.2308031154239	0.199235736699512	0.370931897493287	1	1.27895818965309	1	1	1	487	459	16
"TCGA-73-4666-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	940	3	2	24	26	893	36613	37	44	13	94	9220	54	42	14	110	9430	46	194	92	332	9028	55	223	79	357	8935	14	30	10	54	1207	0.0574468085106383	0.151260504201681	0.135086737548965	1.11972875314169	0.0447390223695112	15	25	16	56	1291	0.0595744680851064	0.168674698795181	0.142999556933983	1.17954700288373	0.0433772269558482	0.0585106382978723	55	217	2498	15465	0.00284685785216456	0.0061502872466574	0.651930448145684	1.56908513770827	1.20137805643656	Inf	1.45405294824095	2.06472901093152	8.75989753798504e-05	0.000233257736767276	0.0200601653619857	2.4933947796927	1.09336123869856	0.344777060741851	0.568014006545927	1	1.11013182650738	0.755694024726483	1	1	885	838	17
"TCGA-73-4668-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	1206	6	6	18	24	1156	47396	66	61	12	139	12138	72	52	11	135	12228	69	254	109	432	11427	55	287	108	450	11603	8	44	13	65	1696	0.0538971807628524	0.144444444444444	0.146169094199776	0.988200995807128	0.0383254716981132	9	40	15	64	1651	0.0530679933665008	0.148148148148148	0.14448236632537	1.02537182852143	0.0387643852210781	0.0373134328358209	45	296	3347	19683	0.778141588347677	0.845316290546513	1	0.894070080613582	0.672744056454224	Inf	0.908021977925695	0.943333943733917	0.641022013236169	0.689173901554379	1	0.934320997340987	0.887843711749569	0.778226874297313	0.904639361492816	1	0.871248587491682	0.100142484568072	0.318508735640118	1	1161	1111	0
"TCGA-73-4670-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	910	1	10	36	46	851	34891	39	56	17	112	8838	41	60	22	123	9058	46	178	95	319	8544	36	167	94	297	8451	8	23	23	54	1267	0.0593406593406593	0.181818181818182	0.149923086025322	1.21274305804693	0.042620363062352	13	25	17	55	1191	0.0604395604395604	0.172413793103448	0.13939606741573	1.23686267697386	0.0461796809403862	0.067032967032967	61	210	2458	14537	0.00029047078116443	0.000700187461964784	0.0665178088866545	1.71785379948462	1.32910347355651	Inf	1.55632335412044	1.77069896207506	0.00573977258778609	0.0114296341095914	1	2.03596001989572	1.46331383109251	0.00838458762615702	0.0240008820798745	1	1.5876355234842	0.0063514814698464	0.0559418944844164	1	849	790	22
"TCGA-73-4675-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	186	2	2	11	13	170	6970	9	11	6	26	1696	5	16	4	25	1801	10	23	21	54	1740	11	29	25	65	1733	4	2	3	9	255	0.0483870967741935	0.138461538461538	0.147143681477207	0.940995475113122	0.0352941176470588	3	5	2	10	230	0.0537634408602151	0.185185185185185	0.132183908045977	1.40096618357488	0.0434782608695652	0.0645161290322581	12	55	485	2988	0.2230211200819	0.311413637187531	1	1.34405369479844	0.731118062244739	Inf	1.28253577473457	2.38694158075601	0.0205543353191358	0.0364879285897837	1	3.0790015574762	0.778350515463918	0.788045731620006	0.911426628994855	1	0.751375794611472	0.728106304302077	0.99842121967171	1	174	158	0
"TCGA-73-4676-01A-01D-1753-08"	0	0	0	0	220	0	3	10	13	204	8364	16	20	2	38	2153	10	19	7	36	2159	7	21	31	59	2031	10	30	31	71	2021	1	2	5	8	270	0.0363636363636364	0.112676056338028	0.133597229094508	0.8434011476265	0.0296296296296296	0	4	2	6	291	0.0272727272727273	0.101694915254237	0.14327917282127	0.709767604403285	0.0206185567010309	0.0363636363636364	8	71	561	3491	0.870306874686364	0.922686455107303	1	0.701216475473738	0.33550441539683	Inf	0.731424445497416	0.424871552899235	0.92051515410525	0.962547809543846	1	0.388989221080585	0.81547927088724	0.772020826172898	0.904639361492816	1	0.792036519298759	0.0328502415458937	0.147504025764895	1	212	196	0
"TCGA-73-4677-01A-01D-1265-08"	0	0	0	0	591	1	2	16	18	560	22960	33	33	6	72	5739	25	12	5	42	5841	20	140	56	216	5561	25	135	70	230	5819	8	11	7	26	771	0.0439932318104907	0.11304347826087	0.132496992610414	0.853177691309987	0.0337224383916991	3	14	10	27	798	0.0456852791878173	0.125	0.143499370616796	0.871083959899749	0.0338345864661654	0.0473773265651438	28	143	1569	9811	0.192595157606902	0.279141082860636	1	1.22433462304184	0.841530106824152	Inf	1.18763021852485	1.77296225479782	0.0393168860271527	0.0612487544232515	1	2.02292763646199	0.978583062713082	0.577629596994863	0.786784662554334	1	0.975243161439427	0.270554072079331	0.601523131127833	1	563	532	0
"TCGA-75-5122-01A-01D-1753-08"	0	0	0	0	304	1	3	11	14	289	11849	8	17	2	27	2932	8	10	7	25	2981	32	44	48	124	2952	23	47	43	113	2984	12	4	8	24	415	0.0789473684210526	0.212389380530973	0.139075067024129	1.52715641326367	0.0578313253012048	13	6	11	30	418	0.0986842105263158	0.241935483870968	0.14159891598916	1.70859700571076	0.0717703349282297	0.144736842105263	44	102	833	5103	6.42183674817277e-07	2.22818275050237e-06	0.000147060061533156	2.64186318330831	1.91028586451229	Inf	2.14757683895476	3.23911382734912	2.41028737420375e-08	9.68343524022208e-08	5.51955808692659e-06	5.10295994247071	1.48785668113399	0.0490051871049581	0.120668686527262	1	1.61643815744856	0.327534369986378	0.663764342715757	1	260	245	24
"TCGA-75-5125-01A-01D-1753-08"	0	0	0	0	389	0	6	13	19	363	14883	17	16	9	42	3858	24	16	3	43	3766	43	51	63	157	3614	25	39	57	121	3645	13	7	12	32	520	0.0822622107969152	0.264462809917355	0.142661179698217	1.85378258105531	0.0615384615384615	21	8	20	49	540	0.125964010282776	0.312101910828025	0.149418926397344	2.08877093654164	0.0907407407407407	0.169665809768638	66	122	1060	6199	5.06639279807414e-12	2.57823100168662e-11	1.16020395075898e-09	3.16305214114428	2.41046552916769	Inf	2.40412484945805	3.42405660377359	8.60263540136858e-12	4.58140350444978e-11	1.9700035069134e-09	5.84590528975734	1.82616352201258	0.000472635223900094	0.00189883274163371	0.108233466273122	2.12632507799439	0.873034934501061	1	1	323	297	39
"TCGA-75-5126-01A-01D-1753-08"	0	0	0	0	1420	7	8	25	33	1365	55965	54	49	11	114	14180	62	55	11	128	14297	130	271	156	557	13686	128	280	158	566	13802	75	37	54	166	1915	0.116901408450704	0.293286219081272	0.13874800753514	2.11380490640194	0.0866840731070496	76	44	62	182	2024	0.128169014084507	0.326750448833034	0.147888353061523	2.20944004087396	0.0899209486166008	0.188028169014085	267	305	3939	23549	4.26320634645641e-74	1.6271237555642e-72	9.76274253338518e-72	5.23317667678106	4.52868134793378	Inf	3.2574097646451	4.08426960764055	1.04623676795503e-59	4.79176439723404e-58	2.39588219861702e-57	8.43550102086108	2.57801537135585	6.03010909896171e-23	1.38089498366223e-21	1.38089498366223e-20	3.50231022784297	0.00798545727311494	0.0589893456626878	1	1153	1098	185
"TCGA-75-5146-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	437	0	3	11	14	419	17179	26	17	4	47	4313	16	21	7	44	4344	21	100	36	157	4260	23	107	41	171	4262	5	10	6	21	572	0.0480549199084668	0.12280701754386	0.134209291412482	0.915041099251626	0.0367132867132867	5	8	8	21	579	0.0480549199084668	0.133757961783439	0.135915492957746	0.984125936437741	0.0362694300518135	0.0549199084668192	24	97	1151	7371	0.0345472061165541	0.0608562323130068	1	1.5843865236364	1.04448303410505	Inf	1.46856129416749	1.68272648290024	0.0660742181213713	0.099546025985487	1	1.88328640516057	1.3461811863202	0.15228259845863	0.305901009184441	1	1.42304025136348	0.469196705136096	0.793612006108687	1	413	395	0
"TCGA-75-5147-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	115	0	4	8	12	103	4223	3	5	4	12	1087	4	7	3	14	1089	7	12	23	42	1053	8	9	18	35	994	5	2	5	12	151	0.104347826086957	0.342857142857143	0.151911468812877	2.25695364238411	0.0794701986754967	2	3	3	8	148	0.0695652173913043	0.19047619047619	0.140550807217474	1.35521235521236	0.0540540540540541	0.130434782608696	15	41	299	1748	0.0140766578236264	0.0268629553467537	1	2.13786989714243	1.20782439145129	Inf	1.83379120879121	3.1948717948718	0.00326168678690409	0.00672906553334267	0.746926274201037	5.10918211196272	1.33583489681051	0.246878855599692	0.448692523272456	1	1.41698089777963	1	1	1	100	88	7
"TCGA-75-6203-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	47	0	0	3	3	44	1804	4	1	1	6	455	3	0	0	3	444	0	6	16	22	447	0	6	7	13	458	0	1	0	1	66	0.0212765957446809	0.0769230769230769	0.14410480349345	0.533799533799534	0.0151515151515152	0	0	0	0	46	0	0	0.102908277404922	0	0	0	0	23	112	793	1	1	1	0	0	Inf	0	NA	1	1	1	0	0	1	1	1	0	1	1	1	47	44	0
"TCGA-75-6205-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	91	0	0	2	2	89	3649	4	11	5	20	939	4	3	1	8	941	6	10	16	32	921	11	5	13	29	848	2	0	4	6	132	0.0659340659340659	0.206896551724138	0.155660377358491	1.32915360501567	0.0454545454545455	0	3	0	3	138	0.032967032967033	0.09375	0.149837133550489	0.625679347826087	0.0217391304347826	0.0659340659340659	6	40	270	1499	0.722979655332302	0.803700684811151	1	0.832857185625909	0.341065685542047	Inf	0.854589371980676	0.770806100217865	0.757028612878263	0.798891946309319	1	0.740360104403707	0.903703703703704	0.6662528484754	0.839871292138077	1	0.888370214378277	0.619909502262444	0.915866296890966	1	85	83	0
"TCGA-75-6206-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	218	1	1	2	3	210	8610	10	8	4	22	2175	11	12	1	24	2263	21	39	22	82	2076	20	30	32	82	2096	10	2	5	17	286	0.0779816513761468	0.207317073170732	0.136450381679389	1.5193586900904	0.0594405594405594	6	5	2	13	272	0.0596330275229358	0.158536585365854	0.13102119460501	1.21000717360115	0.0477941176470588	0.105504587155963	23	72	558	3614	0.00346430442405909	0.00741425900102366	0.793325713109532	2.06852102875626	1.33005934596576	Inf	1.81014902848519	2.91773756447242	4.34431541367148e-05	0.000119861232497683	0.00994848229730769	4.14330678815386	0.969202177087482	0.596282560291578	0.786784662554334	1	0.964620095501934	0.0325942029399336	0.147504025764895	1	195	187	10
"TCGA-75-6207-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	166	0	3	7	10	154	6314	5	14	3	22	1592	6	8	4	18	1655	11	21	27	59	1509	7	17	31	55	1558	7	3	4	14	197	0.0843373493975904	0.254545454545455	0.126444159178434	2.01310567604984	0.0710659898477157	7	3	5	15	229	0.0903614457831325	0.254237288135593	0.151756129887343	1.67530160609873	0.0655021834061135	0.13855421686747	23	53	426	2641	0.000226547207680397	0.000555037457334559	0.0518793105588109	2.68933025914853	1.69574819183367	Inf	2.17880528786756	5.59963484611372	2.11759410244679e-09	9.32555864346760e-09	4.84929049460315e-07	21.6467208244191	1.11716852841185	0.418169408700094	0.64047663198094	1	1.1386087826461	0.282942992682627	0.60555089088151	1	143	131	12
"TCGA-75-6211-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	768	1	7	18	25	730	29930	39	30	8	77	7629	44	35	8	87	7633	32	179	69	280	7312	42	164	80	286	7356	16	19	14	49	1069	0.0638020833333333	0.171328671328671	0.145323545405111	1.17894640439074	0.0458372310570627	8	32	8	48	1038	0.0625	0.171428571428571	0.141958424507659	1.20759702725021	0.046242774566474	0.0598958333333333	46	177	2107	12561	0.00728857581283125	0.0149025344744496	1	1.54927367662437	1.15417562646137	Inf	1.43601618350959	2.25780217806796	7.02759995368056e-05	0.000189331810516806	0.0160932038939285	2.86126344405271	1.02788085735309	0.480559458447164	0.692126515625161	1	1.03271296917827	0.866094906211194	1	1	722	684	14
"TCGA-75-6212-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	67	0	1	6	7	60	2460	1	3	7	11	629	3	1	1	5	563	2	6	13	21	648	1	9	13	23	620	0	0	0	0	82	0	0	0.132258064516129	0	0	0	1	2	3	88	0.0447761194029851	0.142857142857143	0.135802469135802	1.05194805194805	0.0340909090909091	0.0298507462686567	2	27	170	1098	0.914670483175352	0.956436258662811	1	0.47864203678394	0.0803772869189425	Inf	0.514401622718053	0	1	1	1	0	0.573755656108597	0.880289545994584	0.978574301129902	1	0.538443170577891	0.4	0.750819672131148	1	65	58	0
"TCGA-80-5611-01A-01D-1625-08"	0	0	0	0	471	2	9	18	27	438	17958	27	48	16	91	4626	26	35	16	77	4824	23	45	57	125	4185	28	59	58	145	4323	11	11	10	32	663	0.0679405520169851	0.220689655172414	0.153365718251214	1.43897643938212	0.0482654600301659	5	7	10	22	592	0.0467091295116773	0.176	0.141457586618877	1.24418918918919	0.0371621621621622	0.0764331210191083	36	130	1255	7253	0.0112612734053005	0.0220412958103745	1	1.60030880454921	1.14012588105172	Inf	1.47020592329477	2.12683384110616	0.00213733336385113	0.00453193833631397	0.489449340321909	2.6414597081931	1.17900571626537	0.249151198132684	0.449256884821926	1	1.21664443594915	0.540618245849576	0.84339800235416	1	435	402	12
"TCGA-86-6562-01A-11D-1753-08"	0	0	0	0	154	0	1	1	2	151	6191	4	7	0	11	1602	7	8	8	23	1693	13	16	32	61	1414	14	14	28	56	1482	9	3	4	16	232	0.103896103896104	0.285714285714286	0.156545209176788	1.82512315270936	0.0689655172413793	10	5	5	20	215	0.12987012987013	0.327868852459016	0.152050919377652	2.15630956919558	0.0930232558139535	0.181818181818182	28	59	447	2449	0.000100917372845197	0.000260117725437214	0.0231100783815501	2.59895657734289	1.70578440673206	Inf	2.08511404253131	4.55911840251885	3.2349857357021e-10	1.48162346695156e-09	7.40811733475781e-08	12.9930319795876	0.971812080536913	0.592721771971064	0.786784662554334	1	0.96684395366423	0.0287307726457845	0.141967961116898	1	126	123	15
"TCGA-91-6828-01A-11D-1855-08"	0	0	0	0	804	1	7	27	34	763	31283	27	29	10	66	7658	36	24	19	79	7721	44	186	85	315	7959	43	195	65	303	7945	12	15	13	40	1085	0.0497512437810945	0.132013201320132	0.136563876651982	0.966677312892579	0.0368663594470046	18	17	14	49	1054	0.0609452736318408	0.155555555555556	0.132428697072497	1.17463630613536	0.0464895635673624	0.0708955223880597	57	180	2139	13765	9.21138211152045e-06	2.77553487307656e-05	0.00210940650353818	2.03775010894755	1.55749718922628	Inf	1.78822471165397	2.56387935064726	5.78913190218676e-07	1.94957530235407e-06	0.000132571120560077	3.38663376951714	1.33834502103787	0.070323009816173	0.159445240078254	1	1.41257773521044	0.748154437439176	1	1	747	706	25
"TCGA-91-6829-01A-21D-1855-08"	0	0	0	0	1531	6	10	32	42	1449	59409	90	89	24	203	14769	83	80	23	186	15143	93	280	132	505	14808	98	303	154	555	14689	24	33	25	82	1990	0.0535597648595689	0.147747747747748	0.135475525903737	1.09058626465662	0.0412060301507538	28	34	27	89	2019	0.0581319399085565	0.176237623762376	0.136345218800648	1.29258382004619	0.0440812283308569	0.0679294578706728	104	373	4009	25488	8.35322477486819e-07	2.81307128447767e-06	0.000191288847344482	1.77261111754858	1.46146774994699	Inf	1.6041934996363	2.00314214483381	5.73988872224048e-07	1.94957530235407e-06	0.000131443451739307	2.37831984759912	1.33776276106034	0.0178922735826655	0.0476433796561674	1	1.41279892341691	1	1	1	1427	1345	39
"TCGA-91-6831-01A-11D-1855-08"	0	0	0	0	618	1	5	17	22	591	24231	28	40	7	75	5966	30	40	11	81	6235	39	109	68	216	5933	43	104	72	219	6097	10	14	7	31	876	0.0501618122977346	0.141552511415525	0.143677218304084	0.985211943037051	0.0353881278538813	12	13	6	31	777	0.0501618122977346	0.143518518518519	0.130962413618743	1.0958756375423	0.0398970398970399	0.0566343042071197	35	187	1653	10377	0.218077463722267	0.306378768051529	1	1.17492929003226	0.843424278273797	Inf	1.1473815012835	1.95254747465805	0.00135858481432268	0.00308035566811776	0.311115922479894	2.30160606705758	0.675784288306974	0.95642911667919	1	1	0.642617780268388	0.109757172186384	0.333768311204482	1	583	556	0
"TCGA-91-6835-01A-11D-1855-08"	0	0	0	0	231	0	0	7	7	219	8979	5	21	5	31	2196	10	11	8	29	2452	11	36	33	80	2115	15	36	28	79	2216	5	3	8	16	332	0.0692640692640693	0.20253164556962	0.149819494584838	1.35183773066951	0.0481927710843374	4	5	10	19	293	0.0822510822510823	0.2375	0.138534278959811	1.7143771331058	0.0648464163822526	0.116883116883117	27	60	625	3706	7.68594403672958e-05	0.000204660602838497	0.0176008118441107	2.66734542419078	1.74751805623927	Inf	2.15056551724138	2.39870769230769	0.00850913189165447	0.0163747159931838	1	3.13803121306544	2.0448	0.00205462841891518	0.00712893799896328	0.470509907931576	2.48146993667465	0.0485565290609367	0.202171730090082	1	204	192	14
"TCGA-91-6836-01A-21D-1855-08"	0	0	0	0	1976	2	10	28	38	1922	78802	56	42	13	111	18450	57	41	12	110	19782	55	588	92	735	19604	56	787	123	966	20966	14	36	21	71	2829	0.0359311740890688	0.0734989648033126	0.134932748259086	0.544708128690793	0.0250972074938141	8	49	9	66	2513	0.0334008097165992	0.0897959183673469	0.128188124872475	0.700501067916223	0.0262634301631516	0.0263157894736842	52	274	5342	35228	0.0837082979201704	0.134050351214818	1	1.25150696217616	0.95841165843828	Inf	1.21139804259796	1.50522293165498	0.0319206652349513	0.051117708662964	1	1.63007818179876	1.05970240220107	0.396695911432853	0.617982066109683	1	1.0694014282421	0.280772444031236	0.60555089088151	1	1924	1870	0
"Totals"	0	0	0	0	173657	689	1642	4311	5953	164719	6753479	7171	6958	2426	16555	1699616	7435	6937	2447	16819	1739651	9591	37963	16831	64385	1647608	9650	40160	17150	66960	1666604	3521	4184	4219	11924	240142	0.0686640907075442	0.178076463560335	0.14409061780723	1.23586439055021	0.0496539547434435	3557	4074	3986	11617	233673	0.0668962379863754	0.180430224431156	0.14182560414856	1.2721978200929	0.0497147723528178	0.0880068180378562	15283	37939	473815	2840397	0	NA	NA	2.41482329354087	2.37662947837285	Inf	2.0085789292719	2.573086573916	0	NA	NA	3.48853909877757	1.68893878947033	0	NA	NA	1.90814178268332	1.45601696272826e-28	NA	NA	158374	149436	NA
