"Sample"	"A_T_coord_clusters"	"G_C_coord_clusters"	"Non_coord_clusters"	"clusters"	"mutations"	"complex"	"insertions"	"deletions"	"indels"	"substitutions"	"bases"	"A_to_T"	"A_to_G"	"A_to_C"	"A"	"a"	"T_to_A"	"T_to_C"	"T_to_G"	"T"	"t"	"G_to_C"	"G_to_T"	"G_to_A"	"G"	"g"	"C_to_G"	"C_to_A"	"C_to_T"	"C"	"c"	"tCw_to_G"	"tCw_to_A"	"tCw_to_T"	"tCw"	"tcw"	"tCw_per_mut"	"tCw_per_C"	"tcw_per_c"	"enrich_tCw"	"freq_tCw"	"wGa_to_C"	"wGa_to_T"	"wGa_to_A"	"wGa"	"wga"	"wGa_per_mut"	"wGa_per_G"	"wga_per_g"	"enrich_wGa"	"freq_wGa"	"[tCw_to_G+tCw_to_T]_per_mut"	"tCw_to_G+tCw_to_T"	"[(C_to_G)+(C_to_T)]-[(tCw_to_G)+(tCw_to_T)]"	"tcw+wga"	"c-tcw"	"Fisher_p-value_tCw"	"BH_Fisher_p-value_tCw"	"bonferroni_Fisher_p-value_tCw"	"odds_ratio_tCw"	"95%_confidence_lower_tCw"	"95%_confidence_upper_tCw"	"APOBEC_enrich"	"tCw_to_G_enrich"	"Fisher_p-value_tCw_to_G"	"BH_Fisher_p-value_tCw_to_G"	"bonferroni_Fisher_p-value_tCw_to_G"	"odds_ratio_tCw_to_G"	"tCw_to_T_enrich"	"Fisher_p-value_tCw_to_T"	"BH_Fisher_p-value_tCw_to_T"	"bonferroni_Fisher_p-value_tCw_to_T"	"odds_ratio_tCw_to_T"	"p-value_GvT_skew"	"BH_p-value_GvT_skew"	"bonferroni_p-value_GvT_skew"	"non-APOBEC_mutations"	"non-APOBEC_substitutions"	"APOBEC_MutLoad_MinEstimate"
"TCGA-B7-5816-01A-21D-1600-08"	0	0	0	0	1425	3	1	0	1	1421	58261	12	178	35	225	13591	14	180	32	226	13686	10	63	403	476	15471	11	91	392	494	15513	0	7	8	15	1990	0.0105263157894737	0.0303643724696356	0.12827950750983	0.236704778955506	0.00753768844221105	1	4	12	17	1897	0.0119298245614035	0.0357142857142857	0.122616508305863	0.291268167783719	0.00896151818661044	0.0147368421052632	21	795	3887	27097	1	1	1	0.184149813757442	0.122647572844582	Inf	0.205140816295646	0.379580285934801	0.940078032690073	1	1	0.348566974548325	0.200532981248574	1	1	1	0.179906768881096	3.57808500464659e-07	6.55982250851875e-06	7.8717870102225e-05	1404	1400	0
"TCGA-B7-5818-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	464	1	1	3	4	458	18778	15	54	43	112	4788	12	30	64	106	4826	3	9	99	111	4566	6	14	109	129	4598	1	1	20	22	674	0.0474137931034483	0.170542635658915	0.146585471944324	1.16343477560785	0.0326409495548961	1	2	20	23	701	0.0495689655172414	0.207207207207207	0.153526062198861	1.34965493310714	0.0328102710413695	0.0905172413793103	42	175	1375	7789	0.0505350985321841	0.855209359775423	1	1.35948348220754	0.999065798513309	Inf	1.28994721407625	1.4810505050505	0.400955037819496	0.668258396365827	1	1.61838637112297	1.28167832167832	0.0597374495086445	1	1	1.34869537624374	2.85566834197724e-17	1.57061758808748e-15	6.28247035234993e-15	422	416	0
"TCGA-BR-4183-01A-02D-1126-08"	0	0	0	0	72	0	0	2	2	70	2870	2	4	2	8	638	0	3	3	6	734	1	4	20	25	718	1	3	27	31	780	0	2	0	2	99	0.0277777777777778	0.0645161290322581	0.126923076923077	0.50830889540567	0.0202020202020202	0	0	1	1	86	0.0138888888888889	0.04	0.119777158774373	0.333953488372093	0.0116279069767442	0.0138888888888889	1	48	185	1313	0.998310062581163	1	1	0.14795375362516	0.00742498194772708	Inf	0.165250965250965	0	1	1	1	0	0.172282921219091	0.997816398459713	1	1	0.154385701265406	1	1	1	71	69	0
"TCGA-BR-4184-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	4480	7	4	33	37	4433	181753	29	217	35	281	42274	41	224	20	285	42827	12	130	1765	1907	48085	14	127	1819	1960	48567	1	15	16	32	6088	0.00714285714285714	0.0163265306122449	0.125352605678753	0.130244844324063	0.00525624178712221	2	13	17	32	6033	0.00714285714285714	0.0167802831672784	0.125465321825933	0.133744391861194	0.00530416045085364	0.00803571428571428	36	3574	12121	84531	1	1	1	0.070247390738661	0.0520656960209577	Inf	0.0795184109627736	0.920068793511579	0.649879992615341	0.857055339509616	1	0.909630009289592	0.0734206682322298	1	1	1	0.0648105265612863	1.85735630567316e-09	5.83740553211565e-08	4.08618387248095e-07	4444	4397	0
"TCGA-BR-4187-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	42	0	0	2	2	40	1640	0	1	1	2	347	0	2	1	3	424	0	2	19	21	412	0	1	13	14	457	0	1	0	1	71	0.0238095238095238	0.0714285714285714	0.155361050328228	0.459758551307847	0.0140845070422535	0	1	1	2	49	0.0476190476190476	0.0952380952380952	0.118932038834951	0.800777453838678	0.0408163265306122	0.0238095238095238	1	31	120	749	0.990926236678485	1	1	0.201549896707593	0.00996177856529434	Inf	0.226302083333333	NA	1	1	1	0	0.226302083333333	0.990926236678485	1	1	0.201549896707593	1	1	1	41	39	0
"TCGA-BR-4188-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	89	1	0	0	0	88	3608	1	6	1	8	801	0	5	1	6	860	2	5	40	47	931	3	1	23	27	1016	1	0	1	2	124	0.0224719101123595	0.0740740740740741	0.122047244094488	0.606929510155317	0.0161290322580645	1	2	1	4	123	0.0449438202247191	0.0851063829787234	0.132116004296455	0.644179207749524	0.032520325203252	0.0449438202247191	4	64	247	1700	0.977957996617494	1	1	0.43029393272298	0.141794528278619	Inf	0.463681829006906	3.15303643724696	0.124829321741042	0.34376927316364	1	4.58285459150395	0.250240987083092	0.997859726473567	1	1	0.225757143028704	1	1	1	85	84	0
"TCGA-BR-4191-01A-02D-1126-08"	0	1	0	1	224	0	0	5	5	215	8815	10	11	10	31	2107	7	7	7	21	2224	23	21	50	94	2259	20	15	34	69	2225	8	2	7	17	341	0.0758928571428571	0.246376811594203	0.153258426966292	1.60759063283607	0.0498533724340176	3	1	6	10	313	0.0446428571428571	0.106382978723404	0.138556883576804	0.76779280810278	0.0319488817891374	0.107142857142857	24	103	654	3830	0.112217695569543	1	1	1.36446374530068	0.898818799477274	Inf	1.29567290327241	1.75392930801508	0.0420800494471627	0.174671903365581	1	2.01275730973219	1.06108926751129	0.456736991984309	1	1	1.07227543321495	0.784553146909804	1	1	200	191	0
"TCGA-BR-4201-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	1403	2	0	14	14	1387	56867	12	113	7	132	13125	16	107	17	140	13260	8	55	506	569	15105	4	49	493	546	15377	0	7	7	14	1890	0.00997861724875267	0.0256410256410256	0.122910840866229	0.208614841948175	0.00740740740740741	1	1	9	11	1857	0.00784034212401996	0.0193321616871705	0.122939424031778	0.157249489652509	0.00592353257942919	0.0121168923734854	17	994	3747	26735	1	1	1	0.122031766492886	0.0774198430115725	Inf	0.136791002204995	0.677920113868873	0.792794358598069	0.992179722550619	1	0.648648354895011	0.130290952815639	1	1	1	0.116138696212673	1.0592858856819e-05	0.000116521447425009	0.00233042894850018	1386	1370	0
"TCGA-BR-4253-01A-01D-1126-08"	0	1	0	1	103	0	0	2	2	101	4141	1	6	11	18	1077	2	6	7	15	1051	6	1	25	32	1001	1	5	30	36	1012	0	0	5	5	152	0.0485436893203883	0.138888888888889	0.150197628458498	0.924707602339181	0.0328947368421053	5	0	2	7	161	0.0679611650485437	0.21875	0.160839160839161	1.36005434782609	0.0434782608695652	0.116504854368932	12	50	313	1700	0.255450510537546	1	1	1.3033323185796	0.702828391966004	Inf	1.24476965886839	4.59379278868097	0.00149922530209243	0.0209752492089579	0.329829566460335	13.5495555066818	0.8185303514377	0.770849428005627	1	1	0.792149483805661	0.684272652909078	0.983921461699328	1	91	89	0
"TCGA-BR-4255-01A-01D-1126-08"	0	0	1	1	75	0	0	0	0	75	3075	3	4	4	11	768	1	9	1	11	746	1	3	23	27	779	2	3	21	26	782	1	1	1	3	113	0.04	0.115384615384615	0.144501278772379	0.798502382573179	0.0265486725663717	0	1	1	2	122	0.0266666666666667	0.0740740740740741	0.156611039794608	0.472981177899211	0.0163934426229508	0.04	3	44	235	1326	0.978909084100479	1	1	0.384882219535144	0.100488264941713	Inf	0.423992756903576	2.21418439716312	0.38802206241172	0.654967541379506	1	2.81874963346855	0.301934235976789	0.992927348499854	1	1	0.268832353429342	1	1	1	72	72	0
"TCGA-BR-4256-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	1083	0	1	2	3	1079	44239	9	107	24	140	10631	17	122	24	163	10472	6	47	330	383	11349	9	64	320	393	11787	1	4	8	13	1522	0.0120036934441367	0.0330788804071247	0.129125307542208	0.256176585649657	0.00854139290407359	1	6	15	22	1591	0.0203139427516159	0.0574412532637076	0.140188562868975	0.409742792765441	0.0138277812696417	0.023084025854109	25	640	3113	20023	1	1	1	0.251260895812764	0.173265227543681	Inf	0.279400718307172	0.990941214262769	0.618726216283723	0.830238283979194	1	0.989547738747345	0.262980553015889	1	1	1	0.235953062620047	1.58396584349755e-07	3.87191650632734e-06	3.48472485569461e-05	1058	1054	0
"TCGA-BR-4257-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	1193	0	3	38	41	1152	47232	11	147	21	179	11177	17	123	17	157	11176	5	58	326	389	12351	7	69	351	427	12528	0	9	5	14	1592	0.0117351215423303	0.0327868852459016	0.127075351213282	0.258011368316995	0.00879396984924623	0	5	4	9	1644	0.00754400670578374	0.0231362467866324	0.133106631042021	0.173817386898842	0.00547445255474453	0.00754400670578374	9	680	3236	21643	1	1	1	0.0885238913681827	0.0459663342810401	Inf	0.100426353738153	0	1	1	1	0	0.102206436817706	1	1	1	0.0901141332324584	0.00148348531785854	0.00777063737925902	0.326366769928879	1184	1143	0
"TCGA-BR-4267-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	104	1	0	1	1	102	4182	5	7	8	20	1076	4	3	4	11	1011	12	8	15	35	1053	14	3	19	36	1042	4	1	1	6	132	0.0576923076923077	0.166666666666667	0.126679462571977	1.31565656565657	0.0454545454545455	3	2	1	6	159	0.0576923076923077	0.171428571428571	0.150997150997151	1.13530997304582	0.0377358490566038	0.0865384615384615	9	51	291	1804	0.460553748915529	1	1	1.09397636468883	0.537751395704875	Inf	1.07989690721649	1.93827650013217	0.0613232457116286	0.228662950111157	1	2.28279363643739	0.423488983222155	0.959278625679937	1	1	0.387578903558839	0.0893794588773726	0.231335070035553	1	95	93	0
"TCGA-BR-4279-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	61	0	0	0	0	61	2501	1	8	1	10	565	2	2	2	6	602	4	4	19	27	704	3	1	14	18	630	1	0	0	1	89	0.0163934426229508	0.0555555555555556	0.141269841269841	0.393258426966292	0.0112359550561798	1	2	0	3	80	0.0491803278688525	0.111111111111111	0.113636363636364	0.977777777777778	0.0375	0.0327868852459016	2	38	169	1165	0.968902267861633	1	1	0.363000635515797	0.0617806500017522	Inf	0.394674556213018	2.2552831783601	0.221165579566252	0.483551404418785	1	2.75445510185122	0	1	1	1	0	0.428571428571429	0.719738276990186	1	59	59	0
"TCGA-BR-4280-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	839	2	11	88	99	738	30258	6	110	34	150	7122	7	92	34	133	6991	11	41	169	221	7992	5	54	175	234	8153	1	1	3	5	1016	0.00595947556615018	0.0213675213675214	0.124616705507175	0.171465946564372	0.00492125984251968	1	2	4	7	1018	0.00834326579261025	0.0316742081447964	0.127377377377377	0.24866431384402	0.0068762278978389	0.0107270560190703	9	351	2034	14111	0.999999999998177	1	1	0.177896172383136	0.0919995507257598	Inf	0.198439036381514	0.992195181907571	0.616718258871066	0.830238283979194	1	0.991080596859066	0.16152014589193	0.999999999999752	1	1	0.144112145726821	0.0893794588773726	0.231335070035553	1	830	729	0
"TCGA-BR-4292-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	1506	2	15	99	114	1390	56990	14	79	23	116	12814	16	85	22	123	12874	9	61	483	553	15583	7	59	532	598	15719	1	2	4	7	1808	0.00464807436918991	0.0117056856187291	0.115020039442713	0.101770836416373	0.0038716814159292	1	7	6	14	1750	0.00929614873837981	0.0253164556962025	0.112301867419624	0.225432188065099	0.008	0.00796812749003984	12	1019	3558	27744	1	1	1	0.0918299111795824	0.0527849036887773	Inf	0.102397351578307	1.09970489038786	0.55737259157437	0.791109484815235	1	1.11391718295584	0.0866762475182548	1	1	1	0.0775909921084415	0.0147893763157335	0.0551468269400232	1	1494	1378	0
"TCGA-BR-4294-01A-01D-1126-08"	0	0	0	0	35	1	0	0	0	34	1394	1	1	1	3	337	3	1	0	4	369	2	3	10	15	360	2	2	8	12	328	0	0	1	1	49	0.0285714285714286	0.0833333333333333	0.149390243902439	0.557823129251701	0.0204081632653061	0	0	2	2	40	0.0571428571428571	0.133333333333333	0.111111111111111	1.2	0.05	0.0857142857142857	3	19	89	599	0.559330589886853	1	1	1.06260692719263	0.262521090042795	Inf	1.05413687436159	0	1	1	1	0	1.28838951310861	0.423004172600244	1	1	1.34543726562656	0.1	0.255813953488372	1	32	31	0
"TCGA-BR-4357-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	291	2	0	1	1	286	11726	11	29	21	61	2964	13	19	23	55	3052	18	18	42	78	2871	19	25	48	92	2839	14	4	11	29	449	0.0996563573883162	0.315217391304348	0.158154279675942	1.99310061005132	0.0645879732739421	10	4	5	19	446	0.0652920962199313	0.243589743589744	0.155346569139673	1.56804070369093	0.0426008968609865	0.13745704467354	40	87	895	4815	8.76608783928744e-06	0.000964269662321618	0.00192853932464324	2.47295404294277	1.75424967939176	Inf	2.0094136277658	4.13830590366903	2.60868464531619e-11	2.86955310984781e-09	5.73910621969562e-09	9.92401783637953	1.13420235878336	0.335376094936377	1	1	1.16315616522059	0.146894599045387	0.343795870106225	1	251	246	20
"TCGA-BR-4361-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	3205	4	14	96	110	3091	126731	57	641	37	735	30186	64	643	33	740	30499	29	87	686	802	33244	16	89	709	814	32802	4	8	32	44	4243	0.0137285491419657	0.0540540540540541	0.129351868788489	0.417883827735348	0.010370021211407	2	5	24	31	4284	0.00967238689547582	0.0386533665835411	0.128865359162556	0.299951568324753	0.00723622782446312	0.0193447737909516	62	1378	8527	57519	1	1	1	0.303502231489521	0.241623990631445	Inf	0.333487419047991	1.03273523318088	0.532678517326978	0.780056430140278	1	1.03777783533171	0.310931037946931	1	1	1	0.282115620614946	1.21467229604863e-17	8.90759683768995e-16	2.67227905130699e-15	3143	3029	0
"TCGA-BR-4362-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	1844	2	4	37	41	1800	73800	27	247	49	323	17107	30	279	73	382	17594	13	68	468	549	19517	14	53	479	546	19582	2	3	11	16	2573	0.00867678958785249	0.0293040293040293	0.131396180165458	0.223020404909251	0.00621842207539837	1	7	3	11	2461	0.00596529284164859	0.0200364298724954	0.126095199057232	0.158899228696259	0.00446972775294596	0.00921908893709327	17	957	5034	34065	1	1	1	0.120210682720919	0.0762644765277018	Inf	0.135563384590534	0.862998278373725	0.693747592800685	0.903103375243495	1	0.845898644543822	0.114823424577708	1	1	1	0.101543650665318	0.0027625909802312	0.0129312769287418	0.607770015650864	1827	1783	0
"TCGA-BR-4363-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	589	0	6	43	49	539	22099	5	45	8	58	5018	7	65	14	86	4923	2	27	166	195	6133	3	19	178	200	6025	0	2	0	2	670	0.0033955857385399	0.01	0.111203319502075	0.0899253731343284	0.00298507462686567	0	1	2	3	713	0.00509337860780985	0.0153846153846154	0.116256318278167	0.132333585068508	0.00420757363253857	0.0033955857385399	2	347	1383	10775	1	1	1	0.0448981869219979	0.00795369329653066	Inf	0.0503784182469487	0	1	1	1	0	0.0511106626982125	1	1	1	0.0455558697888215	0.444444444444444	0.74074074074074	1	587	537	0
"TCGA-BR-4366-01A-01D-1158-08"	1	1	0	2	169	2	0	0	0	167	6847	4	15	9	28	1645	2	13	13	28	1648	14	7	39	60	1787	11	9	31	51	1767	2	2	1	5	225	0.029585798816568	0.0980392156862745	0.127334465195246	0.769934640522876	0.0222222222222222	6	2	4	12	212	0.0710059171597633	0.2	0.118634583100168	1.68584905660377	0.0566037735849057	0.0769230769230769	13	82	437	3117	0.388501292005811	1	1	1.13072854406734	0.639634133944461	Inf	1.11289895218596	2.60247139588101	0.00845157586130788	0.0688646922032494	1	3.35473255051251	0.580908793723439	0.941128185464588	1	1	0.548744876044096	0.481265818703551	0.774992792169106	1	156	154	0
"TCGA-BR-4368-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	1463	4	1	26	27	1431	58671	17	134	10	161	13198	12	121	14	147	13470	15	49	470	534	15789	10	81	498	589	16214	1	7	14	22	1909	0.0150375939849624	0.0373514431239389	0.117737757493524	0.317242691886613	0.0115243583027763	5	5	6	16	1823	0.0109364319890636	0.0299625468164794	0.115460130470581	0.259505568669991	0.00877674163466813	0.0177717019822283	26	967	3732	28271	1	1	1	0.203684512621812	0.141922363582732	Inf	0.224529369034474	2.05807073954984	0.0633922919769579	0.22895345263682	1	2.39209625461267	0.177175511324883	1	1	1	0.159820924061314	0.00141716780471384	0.00760431504968402	0.311776917037045	1437	1405	0
"TCGA-BR-4369-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	205	0	0	1	1	203	8323	5	12	13	30	2011	7	11	29	47	1995	6	7	52	65	2138	7	8	46	61	2179	4	4	3	11	293	0.0536585365853659	0.180327868852459	0.134465351078476	1.34107312706317	0.037542662116041	2	1	7	10	289	0.0487804878048781	0.153846153846154	0.135173058933583	1.13814213468193	0.0346020761245675	0.0780487804878049	16	95	582	3735	0.43047819363576	1	1	1.08084928918307	0.650315789043194	Inf	1.06919290424445	3.42347343378271	0.00449477698090235	0.0429935189477616	0.988850935798517	5.49724432295181	0.756890385019987	0.864566924992368	1	1	0.729311637434333	0.340791997944932	0.624785329565709	1	189	187	0
"TCGA-BR-4370-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	1163	1	0	3	3	1159	47519	10	50	10	70	10336	7	74	9	90	10650	5	42	440	487	13241	8	46	458	512	13292	0	5	8	13	1523	0.0111779879621668	0.025390625	0.114580198615709	0.221596971437951	0.00853578463558766	2	5	9	16	1341	0.0137575236457438	0.0328542094455852	0.101276338645117	0.324401631073075	0.0119313944817301	0.0163370593293207	19	892	2864	23669	1	1	1	0.176039535984678	0.114610695998338	Inf	0.193218438207139	1.42527932960894	0.417279210056256	0.685085270241614	1	1.50256679900267	0.1753823673962	1	1	1	0.159475820686989	4.66438924069604e-05	0.000446158970849186	0.0102616563295313	1144	1140	0
"TCGA-BR-4371-01A-01D-1158-08"	0	0	1	1	187	0	0	0	0	187	7667	2	8	6	16	1757	1	7	4	12	1800	5	8	57	70	2080	2	11	76	89	2030	1	4	3	8	250	0.0427807486631016	0.0898876404494382	0.123152709359606	0.729887640449438	0.032	1	2	7	10	274	0.053475935828877	0.142857142857143	0.131730769230769	1.0844629822732	0.0364963503649635	0.0641711229946524	12	128	524	3586	0.950697513487053	1	1	0.641637683118307	0.359478272276842	Inf	0.672300981461287	2.24100327153762	0.221994053846806	0.483551404418785	1	2.73646053896705	0.589737703036217	0.978893640262624	1	1	0.556447009497616	0.0116425658138673	0.0449362189307159	1	175	175	0
"TCGA-BR-6452-01A-12D-1800-08"	0	0	4	4	8515	30	4	22	26	8453	346573	365	1430	158	1953	83631	369	1446	162	1977	86036	43	434	1832	2309	87742	72	474	1668	2214	89164	8	49	89	146	12434	0.0171462125660599	0.0659439927732611	0.139450899466152	0.472883237223343	0.01174199774811	11	38	92	141	11938	0.0165590135055784	0.0610653962754439	0.136057988192656	0.448818897637795	0.0118110236220472	0.0234879624192601	200	3415	24372	152534	1	1	1	0.366534870860772	0.323698459907043	Inf	0.401580935790317	1.19924289455469	0.231357398890277	0.494161434522922	1	1.23866988185725	0.375372042859487	1	1	1	0.341308850822584	5.60438552378208e-50	6.16482407616029e-48	1.23296481523206e-47	8315	8253	0
"TCGA-BR-6453-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	227	1	0	0	0	226	9266	7	16	31	54	2314	4	22	36	62	2323	2	7	47	56	2302	3	3	48	54	2327	0	0	5	5	327	0.0220264317180617	0.0925925925925926	0.140524280189085	0.658908143617624	0.0152905198776758	0	1	4	5	320	0.0220264317180617	0.0892857142857143	0.139009556907037	0.642299107142857	0.015625	0.039647577092511	9	91	647	3982	0.948915227235361	1	1	0.608747933222751	0.307285416317386	Inf	0.643910355486862	0	1	1	1	0	0.677800374196697	0.926435235905331	1	1	0.644134514822468	0.000119075970469159	0.000970248648267222	0.026196713503215	218	217	0
"TCGA-BR-6454-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	170	0	1	2	3	167	6847	4	13	11	28	1599	14	7	7	28	1618	9	10	35	54	1789	10	10	37	57	1841	4	2	3	9	219	0.0529411764705882	0.157894736842105	0.118957088538838	1.32732516222062	0.0410958904109589	4	6	4	14	232	0.0823529411764706	0.259259259259259	0.129681386249301	1.99920178799489	0.0603448275862069	0.0882352941176471	15	76	451	3179	0.159222659561827	1	1	1.39106454177297	0.815497272211828	Inf	1.32672205842938	3.38896020539153	0.00125632417863255	0.0209752492089579	0.276391319299161	5.12266307641121	0.782520325203252	0.805184239164383	1	1	0.759150903828544	1	1	1	155	152	0
"TCGA-BR-6455-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	112	0	1	0	1	111	4551	2	4	1	7	999	0	6	1	7	1030	2	4	53	59	1205	1	8	29	38	1317	0	1	2	3	157	0.0267857142857143	0.0789473684210526	0.11921032649962	0.662252765672142	0.0191082802547771	1	0	2	3	128	0.0267857142857143	0.0508474576271186	0.106224066390041	0.478681144067797	0.0234375	0.0446428571428571	5	80	285	2237	0.968437106194136	1	1	0.490674456217244	0.187171520413791	Inf	0.520536635706914	2.94970760233918	0.302872561995162	0.572268184802476	1	3.92076469288985	0.431664527171587	0.985909889630364	1	1	0.402619189025356	0.242424242424242	0.493827160493826	1	107	106	0
"TCGA-BR-6456-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	50	0	0	2	2	47	1927	2	3	1	6	469	0	4	3	7	466	1	7	12	20	511	2	4	8	14	481	1	0	1	2	69	0.04	0.142857142857143	0.143451143451143	0.995859213250518	0.0289855072463768	0	2	1	3	57	0.06	0.15	0.111545988258317	1.34473684210526	0.0526315789473684	0.06	3	20	126	866	0.576092504467887	1	1	1.03092562718191	0.257048020533098	Inf	1.02691511387164	2.62433862433862	0.33641279885663	0.605726465637244	1	3.42995642760998	0.787301587301587	0.742303823014197	1	1	0.763853350106446	1	1	1	47	44	0
"TCGA-BR-6457-01A-21D-1800-08"	0	0	0	0	145	0	0	0	0	144	5904	7	7	10	24	1393	2	10	15	27	1485	2	8	35	45	1485	3	9	36	48	1541	1	2	4	7	211	0.0482758620689655	0.145833333333333	0.136924075275795	1.06506714060032	0.033175355450237	0	5	1	6	197	0.0413793103448276	0.133333333333333	0.132659932659933	1.00507614213198	0.0304568527918782	0.0413793103448276	6	70	408	2618	0.952232440265872	1	1	0.550087453191457	0.230968752463476	Inf	0.585526315789474	1.48333333333333	0.515816472353701	0.77197023073343	1	1.60386225220857	0.522300469483568	0.969588579932564	1	1	0.486200456954595	0.160248447204969	0.359741412092788	1	139	138	0
"TCGA-BR-6458-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	342	1	1	1	2	339	13899	11	24	70	105	3423	10	35	61	106	3536	12	7	49	68	3500	4	9	47	60	3440	2	2	2	6	528	0.0175438596491228	0.1	0.153488372093023	0.651515151515151	0.0113636363636364	5	1	5	11	512	0.0321637426900585	0.161764705882353	0.146285714285714	1.10581341911765	0.021484375	0.0409356725146199	14	98	1040	5900	0.804608428498132	1	1	0.810462476121773	0.472787699370306	Inf	0.834134615384615	2.91947115384615	0.00563884366887349	0.0477132925827757	1	4.41124123757681	0.486578525641026	0.992547614469899	1	1	0.446233624515581	1	1	1	328	325	0
"TCGA-BR-6563-01A-13D-2053-08"	0	0	0	0	92	0	0	0	0	92	3772	2	6	7	15	921	3	6	6	15	918	3	1	26	30	922	0	4	28	32	1011	0	2	1	3	125	0.0326086956521739	0.09375	0.123639960435213	0.75825	0.024	0	0	1	1	123	0.0108695652173913	0.0333333333333333	0.133405639913232	0.249864498644986	0.00813008130081301	0.0217391304347826	2	55	248	1685	0.996004408148604	1	1	0.247172748977885	0.0426359102454761	Inf	0.273486134691568	0	1	1	1	0	0.288679808841099	0.994302974830077	1	1	0.261430358549313	0.428571428571429	0.719738276990186	1	90	90	0
"TCGA-BR-6564-01A-12D-1882-08"	0	0	0	0	42	0	0	0	0	42	1722	2	4	0	6	404	1	1	1	3	399	3	2	14	19	473	0	2	12	14	446	0	0	1	1	55	0.0238095238095238	0.0714285714285714	0.123318385650224	0.579220779220779	0.0181818181818182	2	1	1	4	54	0.0952380952380952	0.210526315789474	0.114164904862579	1.84405458089669	0.0740740740740741	0.0952380952380952	4	25	109	810	0.461444324202318	1	1	1.18874841393184	0.37236644765136	Inf	1.16292312559317	5.62079510703364	0.0397294754941521	0.173736719354115	1	14.7785555858932	0.648553281580804	0.830766064802087	1	1	0.619530523670405	1	1	1	38	38	0
"TCGA-BR-6565-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	167	0	0	0	0	165	6765	4	13	7	24	1631	0	9	6	15	1629	22	8	36	66	1747	11	11	38	60	1758	3	3	0	6	241	0.0359281437125748	0.1	0.137087599544937	0.729460580912863	0.024896265560166	7	1	2	10	232	0.0598802395209581	0.151515151515152	0.132799084144247	1.14093521421108	0.0431034482758621	0.0718562874251497	12	95	473	3032	0.792442099365911	1	1	0.809747255295325	0.449826869543256	Inf	0.831044634565608	2.24549939137677	0.0100317083574064	0.0733032711600328	1	2.78589552061586	0.200274270041712	0.999702699846329	1	1	0.178106309612145	0.00914703938353406	0.0372657160069906	1	155	153	0
"TCGA-BR-6566-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	1049	1	0	13	13	1034	42394	11	100	35	146	9466	7	108	24	139	9872	6	55	316	377	11446	12	68	292	372	11610	1	2	6	9	1327	0.00857959961868446	0.0241935483870968	0.114298018949182	0.211670758684396	0.00678221552373775	0	5	3	8	1339	0.00762631077216397	0.0212201591511936	0.116984099248646	0.181393533715132	0.00597460791635549	0.00953288846520496	10	616	2666	20390	1	1	1	0.124163684868489	0.0669830746651319	Inf	0.138149553362782	0.480453446695007	0.890494378503127	1	1	0.449902978852401	0.128015556520709	1	1	1	0.114918838012362	0.00659992584352986	0.0290396737115314	1	1039	1024	0
"TCGA-BR-6705-01A-12D-1882-08"	0	0	0	0	123	0	0	0	0	122	5002	5	10	5	20	1187	3	7	7	17	1295	8	8	27	43	1224	6	3	33	42	1296	3	1	3	7	190	0.0569105691056911	0.166666666666667	0.146604938271605	1.13684210526316	0.0368421052631579	2	2	3	7	161	0.0569105691056911	0.162790697674419	0.131535947712418	1.2376137512639	0.0434782608695652	0.0894308943089431	11	63	351	2169	0.461095046101135	1	1	1.07894615240647	0.573721002843508	Inf	1.06722106722107	2.56410256410256	0.0359895918006595	0.164952295753023	1	3.43063145771378	0.717948717948718	0.857535593548637	1	1	0.686698533596925	1	1	1	112	111	0
"TCGA-BR-6706-01A-11D-1882-08"	0	0	0	0	261	0	0	0	0	260	10660	6	41	41	88	2676	7	37	47	91	2682	3	7	32	42	2668	2	2	35	39	2634	0	0	4	4	400	0.0153256704980843	0.102564102564103	0.151860288534548	0.675384615384615	0.01	1	1	3	5	396	0.0191570881226054	0.119047619047619	0.148425787106447	0.802068302068302	0.0126262626262626	0.0306513409961686	8	64	796	4506	0.864052728660293	1	1	0.707642024388596	0.337822561616237	Inf	0.740089335566723	1.3321608040201	0.55690937015412	0.791109484815235	1	1.41509364165323	0.695904897622441	0.892270921227104	1	1	0.660472767483118	0.0152200740436034	0.0556106000189776	1	253	252	0
"TCGA-BR-6707-01A-11D-1882-08"	0	0	0	0	82	0	0	1	1	81	3321	0	2	0	2	793	3	8	0	11	825	1	6	24	31	861	2	6	29	37	842	0	0	1	1	109	0.0121951219512195	0.027027027027027	0.129453681710214	0.208777584924374	0.00917431192660551	0	5	4	9	105	0.109756097560976	0.290322580645161	0.121951219512195	2.38064516129032	0.0857142857142857	0.0609756097560976	5	51	214	1489	0.846613106924227	1	1	0.682281731642226	0.256082220677205	Inf	0.710530707610147	0	1	1	1	0	0.750749426908834	0.810928243415531	1	1	0.724904934619343	0.0325077399380805	0.0993292053663571	1	77	76	0
"TCGA-BR-6801-01A-11D-1882-08"	0	0	0	0	60	0	0	3	3	57	2337	0	4	0	4	546	1	1	0	2	522	3	1	19	23	637	2	3	23	28	632	0	1	3	4	82	0.0666666666666667	0.142857142857143	0.129746835443038	1.10104529616725	0.0487804878048781	3	0	2	5	74	0.0833333333333333	0.217391304347826	0.116169544740973	1.87132784958872	0.0675675675675676	0.133333333333333	8	39	156	1113	0.222626704728511	1	1	1.46302402294152	0.673568202680359	Inf	1.38461538461538	4.88076923076923	0.0157710339866087	0.0889648071039465	1	10.6627275760134	0.968406593406593	0.60278085417907	1	1	0.964160301242879	0.637186343068696	0.945564962888693	1	52	49	0
"TCGA-BR-6802-01A-11D-1882-08"	0	0	0	0	535	1	1	2	3	531	21771	8	45	11	64	4904	7	41	7	55	5008	3	26	190	219	5832	3	25	165	193	6027	1	5	3	9	721	0.0168224299065421	0.0466321243523316	0.119628339140534	0.389808340459782	0.0124826629680999	1	1	1	3	675	0.00560747663551402	0.0136986301369863	0.115740740740741	0.118356164383562	0.00444444444444444	0.011214953271028	6	355	1396	10463	0.999999999999908	1	1	0.126686141609594	0.0547351184226687	Inf	0.141190897618046	2.83166189111748	0.150916947637827	0.381629062992206	1	3.74683498222702	0.0957181484321401	0.999999999999998	1	1	0.0854202956934916	0.64040536122916	0.945564962888693	1	529	525	0
"TCGA-BR-6803-01A-11D-1882-08"	0	0	0	0	22	0	0	1	1	21	861	0	2	1	3	216	0	0	0	0	211	1	4	8	13	202	1	1	3	5	232	0	0	0	0	33	0	0	0.142241379310345	0	0	1	0	0	1	24	0.0454545454545455	0.0769230769230769	0.118811881188119	0.647435897435897	0.0416666666666667	0.0454545454545455	1	12	57	377	0.840111885430627	1	1	0.551765897650437	0.0257357555448368	Inf	0.585695006747638	3.80701754385965	0.248623853211009	0.506455997281685	1	6.56546117895507	0	1	1	1	0	1	1	1	21	20	0
"TCGA-BR-6852-01A-11D-1882-08"	0	0	1	1	1223	2	2	8	10	1209	49569	12	99	31	142	10839	15	105	32	152	11295	3	71	371	445	13691	12	71	387	470	13744	2	6	5	13	1570	0.0106295993458708	0.0276595744680851	0.114231664726426	0.242135790757555	0.00828025477707006	0	6	5	11	1492	0.00899427636958299	0.0247191011235955	0.108976700021912	0.226829231557068	0.00737265415549598	0.0098119378577269	12	761	3062	24373	1	1	1	0.12552077578165	0.0720597926593205	Inf	0.139091800926603	1.19464402351404	0.511318045015587	0.77197023073343	1	1.22457860774863	0.118203564331864	1	1	1	0.106418670191034	0.0173369017336625	0.0615180384097702	1	1211	1197	0
"TCGA-BR-7196-01A-11D-2053-08"	0	0	0	0	84	0	0	1	1	83	3403	4	2	3	9	813	4	5	4	13	795	4	2	28	34	860	7	7	13	27	935	1	2	2	5	121	0.0595238095238095	0.185185185185185	0.129411764705882	1.43097643097643	0.0413223140495868	2	0	1	3	111	0.0357142857142857	0.0882352941176471	0.12906976744186	0.68362480127186	0.027027027027027	0.0714285714285714	6	46	232	1563	0.679071209816425	1	1	0.878831249990676	0.361818819955663	Inf	0.892738726790451	2.11010971786834	0.163012949130498	0.407532372826245	1	2.52454992797603	0.566126997476871	0.912564533689972	1	1	0.532020880224251	1	1	1	78	77	0
"TCGA-BR-7197-01A-11D-2201-08"	0	0	0	0	191	1	1	0	1	189	7749	5	9	16	30	1820	8	14	25	47	1973	4	3	54	61	1974	3	10	38	51	1982	2	2	4	8	301	0.0418848167539267	0.156862745098039	0.151866801210898	1.03289687968211	0.026578073089701	2	0	3	5	250	0.0261780104712042	0.0819672131147541	0.126646403242148	0.647213114754098	0.02	0.0575916230366492	11	88	551	3405	0.827973900251658	1	1	0.772504711312426	0.417130110165363	Inf	0.797741480137124	4.10267046927664	0.0093783735868962	0.0733032711600328	1	8.23167308064597	0.546279491833031	0.978004184304567	1	1	0.508983226947375	0.428307982231794	0.719738276990186	1	180	178	0
"TCGA-BR-7703-01A-11D-2053-08"	0	1	0	1	799	1	6	36	42	756	30996	3	55	10	68	6826	7	61	7	75	7153	9	40	290	339	8425	8	37	229	274	8592	2	8	4	14	1018	0.0175219023779725	0.0510948905109489	0.118482309124767	0.431244891227969	0.0137524557956778	4	2	3	9	978	0.0112640801001252	0.0265486725663717	0.116083086053412	0.228704055594766	0.00920245398773006	0.016270337922403	13	523	1996	15021	0.999999999999999	1	1	0.187069313313773	0.109793103202113	Inf	0.206776425986301	3.00901803607214	0.0102614431693744	0.0733032711600328	1	4.10474183493498	0.114988165154973	1	1	1	0.102894422766635	1	1	1	786	743	0
"TCGA-BR-7707-01A-11D-2053-08"	0	0	1	1	1591	1	10	26	36	1553	63673	18	182	34	234	14348	11	162	32	205	14657	7	78	475	560	17205	12	72	470	554	17463	2	2	11	15	2013	0.00942803268384664	0.0270758122743682	0.115272289984539	0.234885697837701	0.00745156482861401	0	6	10	16	2040	0.0100565681961031	0.0285714285714286	0.118570183086312	0.240966386554622	0.00784313725490196	0.0144563167818982	23	941	4053	30615	1	1	1	0.184631981365604	0.125469219642691	Inf	0.204081193890495	0.900385679223967	0.668860960780243	0.875889353402699	1	0.888652848070484	0.190081421169504	1	1	1	0.171678643492929	7.12372401949819e-07	1.17514587833608e-05	0.00015672192842896	1568	1530	0
"TCGA-BR-7715-01A-11D-2053-08"	0	0	0	0	163	0	0	6	6	157	6437	3	16	10	29	1593	0	12	9	21	1499	5	8	37	50	1705	1	9	47	57	1640	0	1	1	2	218	0.0122699386503067	0.0350877192982456	0.132926829268293	0.26396265894093	0.00917431192660551	2	1	3	6	222	0.0368098159509202	0.12	0.130205278592375	0.921621621621622	0.027027027027027	0.0368098159509202	6	84	440	2905	0.982739076837195	1	1	0.471671569689682	0.19913492999106	Inf	0.506818181818182	2.53409090909091	0.181750670244076	0.443274449968073	1	3.29943276136431	0.362012987012987	0.996751023971836	1	1	0.330184748107614	0.608391608391609	0.923076923076924	1	157	151	0
"TCGA-BR-7716-01A-21D-2053-08"	0	0	0	0	185	1	0	1	1	182	7462	4	11	5	20	1970	9	8	4	21	1825	24	11	43	78	1852	15	15	33	63	1815	11	6	8	25	277	0.135135135135135	0.396825396825397	0.152617079889807	2.60013752793536	0.0902527075812274	17	7	19	43	321	0.232432432432432	0.551282051282051	0.173326133909287	3.1806054796709	0.133956386292835	0.297297297297297	55	60	598	3069	1.40072572012281e-14	3.08159658427018e-12	3.08159658427018e-12	4.7017792075991	3.36518147241265	Inf	2.9327468372837	4.40253837578252	3.64188008535002e-14	8.01213618777004e-12	8.01213618777004e-12	13.0491372031825	2.17851170568562	4.72476311950803e-05	0.0103944788629177	0.0103944788629177	2.8266268341127	1	1	1	130	127	36
"TCGA-BR-7717-01A-11D-2053-08"	0	0	0	0	163	0	0	1	1	160	6560	6	8	7	21	1536	6	12	9	27	1606	9	6	47	62	1672	9	3	38	50	1746	2	0	3	5	259	0.0306748466257669	0.1	0.148339060710195	0.674131274131274	0.0193050193050193	3	0	4	7	243	0.0429447852760736	0.112903225806452	0.145334928229665	0.776848533120935	0.0288065843621399	0.0736196319018405	12	91	502	2916	0.842076656075629	1	1	0.766044862890477	0.425130672696496	Inf	0.79325416779484	1.89132359451085	0.113685435289185	0.329089417942378	1	2.23346608289958	0.560721818607921	0.97336341949335	1	1	0.52137948064584	0.684272652909078	0.983921461699328	1	151	148	0
"TCGA-BR-7722-01A-31D-2201-08"	0	0	0	0	60	1	1	2	3	56	2296	1	3	2	6	516	2	5	1	8	573	1	4	15	20	604	3	0	19	22	603	1	0	1	2	85	0.0333333333333333	0.0909090909090909	0.140961857379768	0.644919786096257	0.0235294117647059	0	0	2	2	79	0.0333333333333333	0.1	0.130794701986755	0.764556962025317	0.0253164556962025	0.0666666666666667	4	34	164	1043	0.777086040837063	1	1	0.748364989176984	0.239878991203699	Inf	0.774711168164313	1.83993902439024	0.443826831332959	0.707550020965587	1	2.11823538067289	0.649390243902439	0.857877476723424	1	1	0.615664806377128	0.485714285714286	0.774992792169106	1	56	52	0
"TCGA-BR-7723-01A-11D-2053-08"	0	0	0	0	189	0	0	1	1	187	7667	11	20	19	50	1904	8	21	10	39	1903	4	8	38	50	1996	4	10	34	48	1864	0	2	6	8	244	0.0423280423280423	0.166666666666667	0.130901287553648	1.27322404371585	0.0327868852459016	1	2	1	4	300	0.0211640211640212	0.08	0.150300601202405	0.532266666666667	0.0133333333333333	0.0423280423280423	8	72	544	3316	0.890563633596214	1	1	0.6773471838251	0.324170785287443	Inf	0.709558823529412	0.886948529411765	0.703629704067385	0.910579617028381	1	0.870850775737869	0.68984885620915	0.89567720943985	1	1	0.656509803029646	0.0271907389958272	0.0866951098417679	1	181	179	0
"TCGA-BR-7851-01A-11D-2201-08"	0	0	0	0	1651	4	12	68	80	1566	64206	18	127	12	157	14274	17	122	10	149	14434	5	82	565	652	17790	8	77	523	608	17708	1	5	10	16	2005	0.00969109630526953	0.0263157894736842	0.113225660718319	0.232418952618454	0.00798004987531172	0	3	7	10	2054	0.00605693519079346	0.0153374233128834	0.115458122540753	0.13283970824547	0.00486854917234664	0.0109024833434282	18	1083	4059	31439	1	1	1	0.128737608059603	0.0828458298884472	Inf	0.142978264065524	0.672731062974965	0.793743778040495	0.992179722550619	1	0.645465659964209	0.13664849716679	1	1	1	0.122947849277511	3.88079391298207e-06	4.9101307107156e-05	0.000853774660856055	1633	1548	0
"TCGA-BR-7901-01A-11D-2201-08"	0	2	0	2	241	0	1	0	1	239	9799	12	21	10	43	2395	15	22	20	57	2462	19	6	42	67	2431	10	12	50	72	2511	4	2	7	13	390	0.0539419087136929	0.180555555555556	0.15531660692951	1.1625	0.0333333333333333	7	2	6	15	344	0.0622406639004149	0.223880597014925	0.141505553270259	1.58213293995141	0.0436046511627907	0.0995850622406639	24	97	734	4208	0.0858601898034781	1	1	1.41835438060511	0.932897923599884	Inf	1.3354651293715	2.55388518274922	0.0020692272410982	0.025290555168978	0.455229993041604	3.50222049065802	0.951397938632863	0.621908039557806	1	1	0.943399218523638	0.787491058542852	1	1	217	215	0
"TCGA-BR-7957-01A-11D-2201-08"	0	0	0	0	59	1	0	0	0	58	2378	1	1	2	4	545	3	4	0	7	565	2	3	16	21	590	2	4	20	26	678	0	0	1	1	83	0.0169491525423729	0.0384615384615385	0.122418879056047	0.314179796107507	0.0120481927710843	0	0	0	0	89	0	0	0.150847457627119	0	0	0.0169491525423729	1	39	172	1096	0.996872674896308	1	1	0.16350771140398	0.00816059883355829	Inf	0.184302325581395	0	1	1	1	0	0.204780361757106	0.994480181490943	1	1	0.182190908490559	1	1	1	58	57	0
"TCGA-BR-8059-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	712	2	1	3	4	704	28864	15	58	26	99	6674	20	51	32	103	6812	37	43	173	253	7660	33	47	169	249	7718	6	5	3	14	983	0.0196629213483146	0.0562248995983936	0.127364602228557	0.441448397864091	0.0142421159715158	7	4	3	14	938	0.0196629213483146	0.0553359683794466	0.122454308093995	0.451890743908914	0.0149253731343284	0.026685393258427	19	393	1921	13457	0.999999979962086	1	1	0.338689175807324	0.219222078852222	Inf	0.369172103930497	1.48668104409906	0.092658284427548	0.299776802559714	1	1.59761129178045	0.140442203895997	0.999999999999944	1	1	0.125100899359476	0.0891234373572265	0.231335070035553	1	693	685	0
"TCGA-BR-8077-01A-11D-2340-08"	0	0	1	1	133	0	2	0	2	128	5248	4	5	10	19	1292	3	5	3	11	1215	7	8	33	48	1342	8	7	35	50	1399	3	2	3	8	186	0.0601503759398496	0.16	0.132952108649035	1.20344086021505	0.043010752688172	2	0	1	3	180	0.0225563909774436	0.0625	0.134128166915052	0.465972222222222	0.0166666666666667	0.0676691729323308	9	74	366	2375	0.792768005642584	1	1	0.789272708289329	0.394574519466822	Inf	0.812067943906775	2.49635701275046	0.040837147838818	0.173736719354115	1	3.24253180421672	0.440533590485374	0.984809930881266	1	1	0.405660160438575	1	1	1	124	119	0
"TCGA-BR-8080-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	169	0	1	1	2	166	6806	6	15	9	30	1609	8	18	13	39	1700	5	8	36	49	1713	4	12	32	48	1784	1	2	1	4	229	0.0236686390532544	0.0833333333333333	0.128363228699552	0.64919941775837	0.0174672489082969	2	3	0	5	221	0.029585798816568	0.102040816326531	0.129013426736719	0.790931757318312	0.0226244343891403	0.0236686390532544	4	73	450	3047	0.991923248780441	1	1	0.371090947216539	0.123110662103186	Inf	0.403694083694084	2.59037037037037	0.0992137139123618	0.303153014732217	1	3.38386948640181	0.114281045751634	0.999907769868481	1	1	0.101090653465176	0.576470588235294	0.893123446561723	1	165	162	0
"TCGA-BR-8081-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	923	1	2	10	12	910	37310	10	67	13	90	8294	10	59	11	80	8565	0	52	328	380	10077	4	38	318	360	10374	0	1	5	6	1207	0.00650054171180932	0.0166666666666667	0.116348563716985	0.143247721623861	0.00497100248550124	0	4	5	9	1155	0.00975081256771398	0.0236842105263158	0.114617445668354	0.206637047163363	0.00779220779220779	0.0108342361863489	10	640	2362	18089	1	1	1	0.119667259614029	0.0645601036921325	Inf	0.133205236761545	0	1	1	1	0	0.134030036989171	1	1	1	0.120419878257754	0.000199900049975012	0.00141786691793423	0.0439780109945026	913	900	0
"TCGA-BR-8284-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	346	0	0	1	1	345	14145	2	24	5	31	3107	4	15	4	23	3356	4	19	121	144	3829	1	25	121	147	3853	1	4	1	6	464	0.0173410404624277	0.0408163265306122	0.120425642356605	0.33893384940183	0.0129310344827586	1	1	2	4	434	0.0115606936416185	0.0277777777777778	0.113345521023766	0.245071684587814	0.00921658986175115	0.0144508670520231	5	242	898	6784	0.999999996524331	1	1	0.156104931084587	0.0608433594018002	Inf	0.173169346185405	3.42182628062361	0.107655273411961	0.320056218251776	1	5.03466851058565	0.106048335143294	0.999999999930422	1	1	0.0948396266024996	1	1	1	341	340	0
"TCGA-BR-8295-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	56	0	0	3	3	53	2173	4	4	1	9	551	3	4	4	11	513	6	1	11	18	559	6	1	8	15	550	2	0	0	2	76	0.0357142857142857	0.133333333333333	0.138181818181818	0.964912280701754	0.0263157894736842	2	0	0	2	82	0.0357142857142857	0.111111111111111	0.146690518783542	0.757452574525745	0.024390243902439	0.0714285714285714	4	27	158	951	0.663534245934279	1	1	0.891810969786738	0.282104912847333	Inf	0.905675786035116	2.33966244725738	0.0814229160843437	0.267358828933666	1	3.00533911323442	0	1	1	1	0	0.0285714285714286	0.089795918367347	1	52	49	0
"TCGA-BR-8296-01A-11D-2340-08"	0	0	1	1	88	1	0	0	0	87	3567	1	1	0	2	834	1	3	0	4	817	5	4	30	39	932	6	6	30	42	984	2	0	3	5	109	0.0568181818181818	0.119047619047619	0.110772357723577	1.07470511140236	0.0458715596330275	1	1	3	5	109	0.0568181818181818	0.128205128205128	0.116952789699571	1.09621265584568	0.0458715596330275	0.102272727272727	9	62	218	1698	0.42375455823526	1	1	1.1305589497582	0.558813429149301	Inf	1.11409742860835	2.39699749791493	0.122758287996775	0.34376927316364	1	2.91850602175021	0.878899082568807	0.691613433681804	1	1	0.865531746375842	0.369849964277209	0.661520261308829	1	79	78	0
"TCGA-BR-8360-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	653	2	8	41	49	602	24682	5	41	13	59	5445	7	39	17	63	5599	6	35	206	247	6824	4	33	196	233	6814	0	4	0	4	780	0.00612557427258806	0.0171673819742489	0.114470208394482	0.149972488169913	0.00512820512820513	3	2	7	12	779	0.0183767228177642	0.048582995951417	0.11415592028136	0.425584549900475	0.0154043645699615	0.0153139356814701	10	402	1559	12079	0.999999999996791	1	1	0.192746614899374	0.103638587806483	Inf	0.212328041998543	2.62437459910199	0.0971386324307936	0.300992945560206	1	3.31983077811658	0.152326883861641	0.999999999999968	1	1	0.137314393251469	0.252412503425707	0.50945642893262	1	643	592	0
"TCGA-BR-8361-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	1657	2	24	106	130	1524	62484	17	144	27	188	14051	19	110	20	149	14006	22	67	533	622	17007	12	56	497	565	17420	0	0	13	13	2011	0.00784550392275196	0.0230088495575221	0.115442020665901	0.199310869861778	0.00646444554947787	4	8	5	17	2015	0.0102595051297526	0.0273311897106109	0.118480625624743	0.230680666703901	0.00843672456575682	0.0132770066385033	22	1042	4026	30401	1	1	1	0.15943388331649	0.107403688807191	Inf	0.176809852500103	1.00601969550861	0.573926268592151	0.799137842343501	1	1.00682241574269	0.149437877099822	1	1	1	0.134313016560406	0.000368176733900806	0.00231425375594792	0.0809988814581773	1635	1502	0
"TCGA-BR-8365-01A-21D-2340-08"	0	0	0	0	24	0	0	0	0	24	984	1	0	2	3	223	0	1	1	2	265	0	1	11	12	273	1	1	5	7	223	0	0	1	1	37	0.0416666666666667	0.142857142857143	0.165919282511211	0.861003861003861	0.027027027027027	0	0	1	1	28	0.0416666666666667	0.0833333333333333	0.102564102564103	0.8125	0.0357142857142857	0.0833333333333333	2	15	65	431	0.675550951764202	1	1	0.884330328606617	0.141429805736025	Inf	0.897737556561086	0	1	1	1	0	0.953846153846154	0.642746904942258	1	1	0.947342873526498	0.333333333333333	0.616246498599439	1	22	22	0
"TCGA-BR-8366-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	187	0	0	0	0	186	7626	5	26	21	52	1882	5	19	26	50	1923	1	8	36	45	1886	0	6	33	39	1935	0	1	1	2	294	0.0106951871657754	0.0512820512820513	0.151937984496124	0.337519623233909	0.00680272108843537	1	3	5	9	276	0.0481283422459893	0.2	0.146341463414634	1.36666666666667	0.0326086956521739	0.0374331550802139	7	63	570	3251	0.912163276687899	1	1	0.63378845805756	0.285514818211662	Inf	0.670350877192982	6.70350877192982	0.149398220826792	0.381629062992206	1	Inf	0.582913806254767	0.955163744260608	1	1	0.543262630762298	0.0634674922600621	0.179010875605303	1	180	179	0
"TCGA-BR-8367-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	70	0	0	2	2	68	2788	2	4	1	7	597	1	3	3	7	651	1	5	23	29	765	3	1	21	25	775	0	0	0	0	87	0	0	0.112258064516129	0	0	0	0	2	2	73	0.0285714285714286	0.0689655172413793	0.0954248366013072	0.722720831365139	0.0273972602739726	0.0285714285714286	2	46	160	1380	0.965069494906964	1	1	0.37516023884738	0.0642328818130594	Inf	0.401041666666667	0	1	1	1	0	0.4375	0.950061724049827	1	1	0.410879067478812	0.333333333333333	0.616246498599439	1	68	66	0
"TCGA-BR-8368-01A-11D-2340-08"	0	0	1	1	1079	0	23	95	118	960	39360	7	62	16	85	8492	9	65	10	84	8634	11	33	337	381	11208	8	58	344	410	11026	1	5	5	11	1199	0.010194624652456	0.0268292682926829	0.108742971159079	0.24672186171403	0.00917431192660551	0	2	6	8	1179	0.00741427247451344	0.020997375328084	0.105192719486081	0.199608636706671	0.00678541136556404	0.0111214087117702	12	688	2378	19856	1	1	1	0.145643436858322	0.0835522441205224	Inf	0.160283551603989	0.49209862334558	0.883416278820463	1	1	0.463893483084307	0.151025862377718	1	1	1	0.137093294917551	0.00109803113140154	0.00619402176688048	0.241566848908339	1067	948	0
"TCGA-BR-8370-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	119	0	0	0	0	119	4879	1	5	0	6	1130	0	5	4	9	1199	6	10	30	46	1271	0	24	34	58	1279	0	1	2	3	170	0.0252100840336134	0.0517241379310345	0.132916340891321	0.389148073022312	0.0176470588235294	2	3	2	7	167	0.0588235294117647	0.152173913043478	0.131392604248623	1.15816193699557	0.0419161676646707	0.0504201680672269	6	64	337	2213	0.912672851270083	1	1	0.615731602527992	0.257529515549936	Inf	0.648579906740144	2.52225519287834	0.183354431577703	0.443274449968073	1	3.2811629080043	0.472922848664688	0.975659501586091	1	1	0.437885967669631	0.628482972136223	0.940586761020198	1	113	113	0
"TCGA-BR-8371-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	23	0	0	1	1	22	902	0	4	1	5	206	1	2	1	4	219	1	0	1	2	219	0	1	10	11	258	0	0	0	0	35	0	0	0.135658914728682	0	0	0	0	1	1	29	0.0434782608695652	0.5	0.132420091324201	3.77586206896552	0.0344827586206897	0.0434782608695652	1	11	64	413	0.823175134514321	1	1	0.587178699255513	0.0272549671254313	Inf	0.62109375	0	1	1	1	0	0.677556818181818	0.796067549003545	1	1	0.645809339839059	1	1	1	22	21	0
"TCGA-BR-8372-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	1362	3	23	93	116	1242	50922	23	209	28	260	11585	12	222	16	250	11646	11	65	300	376	13729	5	67	284	356	13962	1	6	2	9	1619	0.0066079295154185	0.0252808988764045	0.115957599197823	0.218018474436294	0.00555898702903027	0	6	3	9	1591	0.0066079295154185	0.023936170212766	0.1158860805594	0.206549139441272	0.00565681961030798	0.00440528634361234	6	594	3210	24481	1	1	1	0.0770380159494889	0.0334037337089412	Inf	0.0862647975077882	0.539154984423676	0.860734340176143	1	1	0.508441996997641	0.0738568471813255	1	1	1	0.0658615511231435	0.17741935483871	0.386401524172421	1	1356	1236	0
"TCGA-BR-8373-01A-11D-2340-08"	0	0	1	1	108	0	2	2	4	104	4264	1	7	7	15	979	3	7	4	14	1008	3	7	31	41	1119	5	4	25	34	1158	1	2	3	6	152	0.0555555555555556	0.176470588235294	0.13126079447323	1.34442724458204	0.0394736842105263	0	3	2	5	128	0.0462962962962963	0.121951219512195	0.114387846291332	1.06612042682927	0.0390625	0.0555555555555556	6	58	280	1997	0.813126590236077	1	1	0.737894265741156	0.307147464468787	Inf	0.762388392857143	1.01651785714286	0.650582916809572	0.857055339509616	1	1.01887115208144	0.726084183673469	0.833024759850703	1	1	0.699324459097499	0.148606811145511	0.344142088968552	1	102	98	0
"TCGA-BR-8381-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	140	0	0	1	1	139	5699	4	8	3	15	1343	2	6	5	13	1330	3	8	49	60	1538	4	8	39	51	1488	0	3	4	7	165	0.05	0.137254901960784	0.110887096774194	1.23778966131907	0.0424242424242424	1	2	4	7	198	0.05	0.116666666666667	0.128738621586476	0.906228956228956	0.0353535353535354	0.0642857142857143	9	86	363	2663	0.816493217151778	1	1	0.767789638997903	0.385651336821639	Inf	0.789734667246629	1.19086973632428	0.591753544432314	0.813661123594432	1	1.22259317598054	0.757826195842725	0.840869792995859	1	1	0.733674520250905	0.0127536231884058	0.048375812093953	1	131	130	0
"TCGA-BR-8382-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	915	1	0	4	4	909	37269	5	79	27	111	8214	11	73	20	104	8249	3	49	307	359	10456	5	42	288	335	10350	0	4	4	8	1166	0.0087431693989071	0.0238805970149254	0.112657004830918	0.211976139883772	0.00686106346483705	0	8	3	11	1179	0.0120218579234973	0.0306406685236769	0.112758224942617	0.271737769366892	0.00932994062765055	0.00765027322404372	7	596	2345	18461	1	1	1	0.0924666583842485	0.0431543847106125	Inf	0.102997450558154	0	1	1	1	0	0.104382290229525	1	1	1	0.0937247010265625	0.00798525798525799	0.0331463539010709	1	908	902	0
"TCGA-BR-8384-01A-21D-2394-08"	0	0	0	0	46	0	0	0	0	46	1886	0	3	5	8	453	3	1	3	7	460	2	2	10	14	464	4	2	11	17	509	1	0	0	1	71	0.0217391304347826	0.0588235294117647	0.139489194499018	0.421706710853355	0.0140845070422535	0	0	1	1	60	0.0217391304347826	0.0714285714285714	0.129310344827586	0.552380952380952	0.0166666666666667	0.0434782608695652	2	25	131	842	0.894201247877788	1	1	0.51447066452687	0.085909294456374	Inf	0.550183771557817	1.23791348600509	0.581627534405717	0.804767657668288	1	1.28513416759572	0.353689567430025	0.951440213858981	1	1	0.32161806082269	1	1	1	44	44	0
"TCGA-BR-8484-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	98	0	0	0	0	98	4018	4	8	4	16	965	5	7	5	17	1015	1	1	33	35	1018	4	5	21	30	1020	2	1	3	6	137	0.0612244897959184	0.2	0.134313725490196	1.48905109489051	0.0437956204379562	0	0	3	3	144	0.0306122448979592	0.0857142857142857	0.141453831041257	0.605952380952381	0.0208333333333333	0.0816326530612245	8	51	281	1757	0.57892139136559	1	1	0.980818540879418	0.461085570613571	Inf	0.983412751070632	2.90106761565836	0.143847992734551	0.376744742876205	1	4.1643317271831	0.805852115460656	0.77180018824436	1	1	0.781668660089032	0.153434800493624	0.351621417797888	1	90	90	0
"TCGA-BR-8485-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	347	1	0	2	2	344	14104	6	38	59	103	3518	18	49	74	141	3779	10	7	32	49	3383	5	6	40	51	3424	1	2	6	9	555	0.0259365994236311	0.176470588235294	0.162091121495327	1.08871224165342	0.0162162162162162	4	1	3	8	476	0.0230547550432277	0.163265306122449	0.14070351758794	1.16034985422741	0.0168067226890756	0.0403458213256484	14	73	1031	5776	0.449112028149325	1	1	1.07442559560962	0.620248658052503	Inf	1.06244355998528	2.2007759456838	0.0643185636410377	0.22895345263682	1	2.80070363163378	0.825290979631426	0.780647815708059	1	1	0.800357012695321	0.296003611097677	0.576290216296362	1	333	330	0
"TCGA-BR-8486-01A-31D-2394-08"	0	0	0	0	60	0	1	0	1	59	2419	1	5	2	8	565	1	5	2	8	533	4	4	18	26	646	0	2	15	17	675	0	0	2	2	74	0.0333333333333333	0.117647058823529	0.10962962962963	1.0731319554849	0.027027027027027	2	0	0	2	80	0.0333333333333333	0.0769230769230769	0.123839009287926	0.621153846153846	0.025	0.0666666666666667	4	33	154	1167	0.641393820332543	1	1	0.918578346900735	0.293860159835719	Inf	0.927342927342927	4.28896103896104	0.0704214833448531	0.24027511035579	1	7.55669652931096	0.519874065328611	0.909462419729635	1	1	0.489097545919022	1	1	1	56	55	0
"TCGA-BR-8588-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	138	0	0	0	0	137	5617	3	6	4	13	1241	6	15	6	27	1246	0	9	36	45	1568	1	10	41	52	1562	0	2	2	4	171	0.0289855072463768	0.0769230769230769	0.109475032010243	0.702654071075124	0.0233918128654971	0	1	1	2	182	0.0144927536231884	0.0444444444444444	0.116071428571429	0.382905982905983	0.010989010989011	0.0217391304347826	3	75	353	2777	0.994455363651685	1	1	0.31474792759225	0.0836001835646266	Inf	0.341032904772282	0	1	1	1	0	0.345461903535558	0.993907244836465	1	1	0.319000770116913	0.181818181818182	0.386401524172421	1	135	134	0
"TCGA-BR-8589-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	1242	2	1	0	1	1238	50758	75	168	317	560	13018	77	177	295	549	13113	5	9	43	57	12218	3	3	66	72	12409	1	3	10	14	1986	0.0112721417069243	0.194444444444444	0.16004512853574	1.21493510126441	0.00704934541792548	1	2	7	10	1966	0.00805152979066022	0.175438596491228	0.160910132591259	1.09028930413521	0.00508646998982706	0.0152979066022544	19	98	3952	20675	0.516487869519442	1	1	1.0142761771354	0.639504856822429	Inf	1.01195759368836	1.55788208502024	0.37600035010396	0.651339189156466	1	1.74379221778957	0.971889741113546	0.591266424661186	1	1	0.966692224701874	1.71198776636332e-05	0.0001793510993333	0.0037663730859993	1223	1219	0
"TCGA-BR-8590-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	142	1	0	1	1	139	5699	6	12	13	31	1433	5	13	21	39	1359	3	4	31	38	1423	5	4	22	31	1484	2	2	3	7	187	0.0492957746478873	0.225806451612903	0.126010781671159	1.79196135932379	0.0374331550802139	1	0	3	4	185	0.028169014084507	0.105263157894737	0.130007027406887	0.809672830725462	0.0216216216216216	0.0633802816901408	9	52	372	2535	0.3814399817201	1	1	1.17935037287383	0.581564329999318	Inf	1.15296139608673	2.9304435483871	0.0720825331067369	0.24027511035579	1	4.08604060206407	0.884662203286671	0.687379670441179	1	1	0.870002742858492	0.386996904024768	0.686607410366524	1	133	130	0
"TCGA-BR-8591-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	1512	1	12	35	47	1462	59942	15	160	22	197	13181	13	164	25	202	13389	6	80	427	513	16715	15	94	441	550	16657	1	8	8	17	1819	0.0112433862433862	0.0309090909090909	0.109203337936003	0.28304163126593	0.00934579439252336	0	4	9	13	1880	0.0085978835978836	0.0253411306042885	0.112473825904876	0.225306913856746	0.00691489361702128	0.0119047619047619	18	871	3699	29673	1	1	1	0.165784254188237	0.106565598505296	Inf	0.18267059683233	0.429614181438999	0.915154076220661	1	1	0.401102374689163	0.176696155269266	1	1	1	0.160253820074523	7.95496460062332e-06	9.211011642827e-05	0.00175009221213713	1494	1444	0
"TCGA-BR-8676-01A-11D-2394-08"	0	1	0	1	94	0	1	1	2	92	3772	2	3	6	11	891	3	5	3	11	877	3	5	26	34	1008	2	9	25	36	996	1	3	3	7	137	0.074468085106383	0.194444444444444	0.137550200803213	1.41362530413625	0.0510948905109489	0	1	4	5	140	0.0531914893617021	0.147058823529412	0.138888888888889	1.05882352941176	0.0357142857142857	0.0851063829787234	8	48	277	1727	0.520610260210742	1	1	1.03909616214181	0.487046008326367	Inf	1.03352243424446	1.44693140794224	0.52549814275178	0.775903298022762	1	1.55825634717829	0.992992142705458	0.570915789609633	1	1	0.991880953976856	0.0271907389958272	0.0866951098417679	1	86	84	0
"TCGA-BR-8677-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	78	1	1	1	2	75	3075	1	4	3	8	744	0	3	0	3	684	2	2	27	31	802	3	6	24	33	845	1	0	3	4	113	0.0512820512820513	0.121212121212121	0.133727810650888	0.906409224993296	0.0353982300884956	0	0	3	3	108	0.0384615384615385	0.0967741935483871	0.134663341645885	0.718637992831541	0.0277777777777778	0.0897435897435897	7	49	221	1426	0.639686955148255	1	1	0.921807745490741	0.408331618889722	Inf	0.931561085972851	1.49049773755656	0.514464432977001	0.77197023073343	1	1.61256110120025	0.876763375033271	0.696711862207587	1	1	0.860412090022241	0.0291375291375292	0.0902853015529074	1	71	68	0
"TCGA-BR-8678-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	125	0	0	3	3	122	5002	0	4	3	7	1207	5	8	4	17	1271	6	7	30	43	1236	5	14	36	55	1288	2	3	3	8	186	0.064	0.145454545454545	0.144409937888199	1.00723362658847	0.043010752688172	4	2	4	10	171	0.08	0.232558139534884	0.138349514563107	1.68094655242758	0.0584795321637427	0.104	13	64	357	2167	0.294834232892444	1	1	1.23285059531871	0.689298217858405	Inf	1.19364109280076	3.85637891520244	0.00202422555093049	0.025290555168978	0.445329621204708	7.27602246673258	0.749851455733809	0.840778962550032	1	1	0.720255302434518	1	1	1	112	109	0
"TCGA-BR-8679-01A-11D-2394-08"	0	0	1	1	177	0	0	3	3	174	7134	5	9	6	20	1682	6	9	10	25	1673	2	8	54	64	1806	5	4	56	65	1973	2	0	6	8	237	0.0451977401129944	0.123076923076923	0.120121642169285	1.02460240181759	0.0337552742616034	0	2	6	8	221	0.0451977401129944	0.125	0.122369878183832	1.02149321266968	0.0361990950226244	0.0790960451977401	14	103	458	3321	0.563751652043913	1	1	0.985588392216541	0.573492201556411	Inf	0.987310118314485	2.35745477230193	0.205127377944515	0.480399412582345	1	2.89925941185865	0.90011909487892	0.69357384306107	1	1	0.887887671470697	0.000965052278614514	0.00558714477092613	0.212311501295193	163	160	0
"TCGA-BR-8680-01A-11D-2394-08"	0	0	2	2	6768	15	7	4	11	6737	276217	13	480	555	1048	73710	19	466	538	1023	74167	7	632	1680	2319	64178	8	696	1643	2347	64162	2	595	128	725	10449	0.107121749408983	0.308904985087346	0.162853402325364	1.89682856284566	0.0693846301081443	2	531	125	658	10555	0.0972222222222222	0.283742992669254	0.16446445822556	1.7252541718169	0.0623401231643771	0.0379728132387707	257	3081	21004	107336	1	1	1	0.426268424572409	0.381560663797225	Inf	0.47044278935029	1.62940392306227	0.221393485552348	0.483551404418785	1	1.85824035514506	0.465211246465643	1	1	1	0.421137547177401	6.91402981775976e-75	1.52108655990715e-72	1.52108655990715e-72	6511	6480	0
"TCGA-BR-8682-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	77	0	0	1	1	76	3116	3	1	3	7	669	0	1	0	1	732	2	3	28	33	810	0	3	32	35	905	0	1	2	3	109	0.038961038961039	0.0857142857142857	0.120441988950276	0.711664482306684	0.0275229357798165	2	1	1	4	91	0.051948051948052	0.121212121212121	0.112345679012346	1.07892107892108	0.043956043956044	0.0649350649350649	5	57	200	1515	0.86119780990156	1	1	0.664606335804725	0.250271356006242	Inf	0.691532258064516	8.575	0.0137803373097491	0.0838983721455999	1	Inf	0.42875	0.975569566054461	1	1	0.398831342956403	1	1	1	72	71	0
"TCGA-BR-8683-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	168	0	0	2	2	166	6806	2	12	3	17	1553	9	6	3	18	1641	9	17	35	61	1761	6	13	51	70	1851	1	3	3	7	230	0.0416666666666667	0.1	0.124257158292815	0.804782608695652	0.0304347826086957	2	3	3	8	209	0.0476190476190476	0.131147540983607	0.118682566723453	1.1050278453212	0.0382775119617225	0.0535714285714286	9	92	439	3173	0.876394008878955	1	1	0.707125272960705	0.356305574237417	Inf	0.733169444507093	1.64555808656036	0.273183583793526	0.541444940852033	1	1.80657983978738	0.574031890660592	0.956949509468784	1	1	0.54215706731243	0.426986506746627	0.719738276990186	1	159	157	0
"TCGA-BR-8687-01A-11D-2394-08"	1	0	0	1	200	1	0	0	0	199	8159	7	31	17	55	2024	1	24	40	65	1935	1	9	29	39	2101	2	4	34	40	2099	2	1	3	6	267	0.03	0.15	0.127203430204859	1.17921348314607	0.0224719101123595	0	1	4	5	305	0.025	0.128205128205128	0.145168967158496	0.883144178226145	0.0163934426229508	0.045	9	57	572	3628	0.553452441293641	1	1	1.00147187784943	0.497119307277953	Inf	1.00127145581691	4.89510489510489	0.0507978246015534	0.201791190987773	1	12.6717867842417	0.815850815850816	0.77127550407982	1	1	0.792872250225908	0.0804953560371517	0.215963150343578	1	191	190	0
"TCGA-BR-8690-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	175	1	0	1	1	172	7052	8	12	8	28	1651	8	6	10	24	1715	7	11	27	45	1798	8	20	47	75	1888	3	4	2	9	242	0.0514285714285714	0.12	0.128177966101695	0.936198347107438	0.0371900826446281	4	4	1	9	223	0.0514285714285714	0.2	0.124026696329255	1.61255605381166	0.0403587443946188	0.0571428571428571	10	79	465	3221	0.698961986863273	1	1	0.87687720007365	0.45678977938	Inf	0.890660867464057	3.69921146953405	0.00134354278846528	0.0209752492089579	0.295579413462362	6.05599625995534	0.321360069747167	0.996687381651084	1	1	0.292746036593968	0.264232986146223	0.526680526680527	1	165	162	0
"TCGA-BR-A4IV-01A-31D-A25D-08"	0	0	0	0	27	0	0	0	0	27	1107	2	0	3	5	287	2	0	0	2	238	1	3	8	12	292	1	1	6	8	290	0	0	0	0	28	0	0	0.096551724137931	0	0	0	0	1	1	41	0.037037037037037	0.0833333333333333	0.14041095890411	0.593495934959349	0.024390243902439	0.037037037037037	1	15	69	513	0.8672139285355	1	1	0.496103159701833	0.0235668543880741	Inf	0.527173913043478	0	1	1	1	0	0.602484472049689	0.82963377526718	1	1	0.572343726905525	1	1	1	26	26	0
"TCGA-BR-A4IY-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	151	0	0	2	2	146	5986	5	8	5	18	1313	5	9	3	17	1441	13	5	39	57	1611	12	13	29	54	1621	2	2	4	8	224	0.0529801324503311	0.148148148148148	0.138186304750154	1.07208994708995	0.0357142857142857	4	0	2	6	194	0.0397350993377483	0.105263157894737	0.120422098075729	0.874118285404232	0.0309278350515464	0.0794701986754967	12	81	418	2814	0.551257480757445	1	1	0.997342615542192	0.550745518155413	Inf	0.997684827905541	1.85569377990431	0.0962248208242269	0.300992945560206	1	2.12528433881305	0.682240360258936	0.886856724585047	1	1	0.65156281621654	1	1	1	139	134	0
"TCGA-BR-A4IZ-01A-32D-A25D-08"	0	0	0	0	10	0	0	0	0	10	410	0	0	2	2	88	0	0	0	0	99	0	0	4	4	116	0	0	4	4	107	0	0	0	0	9	0	0	0.0841121495327103	0	0	0	0	0	0	12	0	0	0.103448275862069	0	0	0	0	8	21	202	1	1	1	0	0	Inf	0	NA	1	1	1	0	0	1	1	1	0	1	1	1	10	10	0
"TCGA-BR-A4J1-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	77	1	0	1	1	75	3075	0	5	6	11	725	2	3	2	7	736	8	5	17	30	831	5	5	17	27	783	0	1	3	4	95	0.051948051948052	0.148148148148148	0.121328224776501	1.22105263157895	0.0421052631578947	2	0	2	4	110	0.051948051948052	0.133333333333333	0.1323706377858	1.00727272727273	0.0363636363636364	0.0909090909090909	7	40	205	1409	0.392911516915174	1	1	1.20264959170598	0.527140218974245	Inf	1.17259989621173	1.21125703564728	0.507128543807579	0.77197023073343	1	1.24948103199494	1.15781922525108	0.440520885769048	1	1	1.18488604701452	0.314685314685315	0.602006688963211	1	70	68	0
"TCGA-BR-A4J4-01A-12D-A25D-08"	0	0	0	0	89	1	0	0	0	88	3608	0	3	2	5	808	0	4	1	5	858	1	7	29	37	1008	4	8	29	41	934	1	2	2	5	117	0.0561797752808989	0.121951219512195	0.125267665952891	0.973525119866583	0.0427350427350427	0	1	0	1	104	0.0112359550561798	0.027027027027027	0.103174603174603	0.261954261954262	0.00961538461538462	0.0337078651685393	3	60	221	1721	0.978641511070295	1	1	0.389495556396695	0.102616720433256	Inf	0.418444300797242	1.75746606334842	0.454457987487056	0.708959297626541	1	1.94605770546152	0.303011390232486	0.991935547246535	1	1	0.27823023930978	1	1	1	86	85	0
"TCGA-BR-A4J6-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	38	0	1	0	1	37	1517	0	4	1	5	355	2	1	2	5	372	2	5	6	13	385	0	4	10	14	405	0	0	2	2	62	0.0526315789473684	0.142857142857143	0.153086419753086	0.933179723502304	0.032258064516129	0	2	0	2	40	0.0526315789473684	0.153846153846154	0.103896103896104	1.48076923076923	0.05	0.0526315789473684	2	16	102	688	0.696836695497657	1	1	0.843313259308188	0.136585855184206	Inf	0.860566448801743	0	1	1	1	0	0.968137254901961	0.633042399914012	1	1	0.963625800138966	0.428571428571429	0.719738276990186	1	36	35	0
"TCGA-BR-A4J7-01A-31D-A25D-08"	0	0	0	0	58	0	0	0	0	58	2378	0	2	0	2	482	1	5	2	8	566	2	5	20	27	680	0	1	20	21	650	0	0	1	1	74	0.0172413793103448	0.0476190476190476	0.113846153846154	0.418275418275418	0.0135135135135135	0	0	0	0	58	0	0	0.0852941176470588	0	0	0.0172413793103448	1	41	132	1198	0.987110697986065	1	1	0.221499180758335	0.0110377032514253	Inf	0.23989898989899	0	1	1	1	0	0.251893939393939	0.984193743873495	1	1	0.232855799179045	1	1	1	57	57	0
"TCGA-BR-A4J8-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	112	0	1	1	2	110	4510	3	6	6	15	1030	5	7	1	13	1069	0	5	30	35	1150	4	5	38	47	1261	0	1	4	5	167	0.0446428571428571	0.106382978723404	0.132434575733545	0.803287042935406	0.029940119760479	0	0	3	3	139	0.0267857142857143	0.0857142857142857	0.120869565217391	0.709146968139774	0.0215827338129496	0.0625	7	65	306	2105	0.822172213293818	1	1	0.740905558987983	0.332890228494245	Inf	0.766022149600581	0	1	1	1	0	0.811082276047674	0.774594979805716	1	1	0.789472761608889	0.0013986013986014	0.00760431504968402	0.307692307692308	105	103	0
"TCGA-BR-A4QI-01A-12D-A25D-08"	0	0	0	0	149	0	1	2	3	146	5986	5	11	4	20	1358	10	6	7	23	1440	5	10	40	55	1564	4	9	35	48	1624	1	1	5	7	204	0.0469798657718121	0.145833333333333	0.125615763546798	1.1609477124183	0.0343137254901961	1	2	4	7	186	0.0469798657718121	0.127272727272727	0.118925831202046	1.07018572825024	0.0376344086021505	0.0738255033557047	11	73	390	2798	0.45636807527447	1	1	1.08106593162662	0.578778646069239	Inf	1.07045177045177	1.81652421652422	0.304342625554044	0.572268184802476	1	2.04924848004749	0.980923076923077	0.578299177978774	1	1	0.978327070749761	0.0183066361556064	0.0639279357814827	1	138	135	0
"TCGA-BR-A4QL-01A-31D-A25D-08"	0	0	0	0	2058	2	61	215	276	1779	72939	22	121	26	169	16095	18	109	18	145	16014	15	67	652	734	20189	10	70	651	731	20641	2	8	7	17	2243	0.00826044703595724	0.0232558139534884	0.108667215735672	0.214009476510902	0.00757913508693714	3	8	10	21	2277	0.0102040816326531	0.0286103542234332	0.112784189410075	0.253673448140928	0.00922266139657444	0.010689990281827	22	1306	4520	36310	1	1	1	0.135324791483269	0.091246585319872	Inf	0.149646150975584	1.80663716814159	0.1359080988629	0.365692552615191	1	2.00828910570603	0.11785430490563	1	1	1	0.106195530518076	0.0047470738656848	0.0216965504737364	1	2036	1757	0
"TCGA-CD-5798-01A-11D-1600-08"	0	1	0	1	101	0	0	0	0	101	4141	7	4	5	16	977	3	5	7	15	1032	3	2	25	30	1067	2	6	32	40	1065	2	2	3	7	161	0.0693069306930693	0.175	0.151173708920188	1.15760869565217	0.0434782608695652	0	1	3	4	131	0.0396039603960396	0.133333333333333	0.122774133083411	1.08600508905852	0.0305343511450382	0.0792079207920792	8	54	292	1840	0.628463463549505	1	1	0.933550720629089	0.440130264361137	Inf	0.942112240388864	2.92054794520548	0.142183453095305	0.376744742876205	1	4.1969152187111	0.768565248738284	0.80927181342403	1	1	0.741429684302524	0.18266253869969	0.386401524172421	1	93	93	0
"TCGA-CD-5799-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	57	0	0	1	1	56	2296	2	5	2	9	513	3	4	0	7	528	2	7	17	26	660	2	1	11	14	595	0	0	0	0	69	0	0	0.115966386554622	0	0	1	2	0	3	97	0.0526315789473684	0.115384615384615	0.146969696969697	0.785091197462331	0.0309278350515464	0.0175438596491228	1	31	166	1089	0.988957683504306	1	1	0.21176792379409	0.0104914915676008	Inf	0.236257530120482	1.89006024096386	0.434450688061458	0.697658039222779	1	2.18497312542173	0	1	1	1	0	1	1	1	56	55	0
"TCGA-CD-5800-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	180	0	0	0	0	180	7380	2	7	2	11	1688	3	9	5	17	1899	9	6	58	73	1911	7	8	64	79	1882	1	1	13	15	291	0.0833333333333333	0.189873417721519	0.154622741764081	1.22797859846013	0.0515463917525773	2	1	10	13	250	0.0722222222222222	0.178082191780822	0.130821559392988	1.3612602739726	0.052	0.144444444444444	26	112	541	3252	0.0869763260485779	1	1	1.39529759753925	0.934013161640559	Inf	1.32093010795896	1.31457948243993	0.405690054917583	0.671066256254648	1	1.38703825147869	1.32176297687949	0.10129396734198	1	1	1.39638063701323	9.92400503067198e-08	2.72910138343479e-06	2.18328110674784e-05	154	154	0
"TCGA-CD-5801-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	605	0	1	0	1	603	24723	27	67	100	194	6194	26	78	102	206	6672	4	16	69	89	5774	3	15	96	114	6083	1	4	17	22	1059	0.0363636363636364	0.192982456140351	0.174091731053756	1.1085101800772	0.0207743153918791	1	1	12	14	913	0.0231404958677686	0.157303370786517	0.158122618635262	0.994818907909472	0.0153340635268346	0.0512396694214876	31	141	1972	9885	0.343782155563966	1	1	1.10209475738454	0.770589626476338	Inf	1.08368024435115	1.71790785279629	0.329413454139165	0.5989335529803	1	2.00500132799489	1.05677361853832	0.405267577565441	1	1	1.0688877298433	4.78822115159594e-11	1.75568108891851e-09	1.05340865335111e-08	574	572	0
"TCGA-CD-5802-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	57	0	0	0	0	56	2296	1	4	0	5	547	0	2	0	2	518	3	1	22	26	595	2	4	17	23	636	1	1	6	8	78	0.140350877192982	0.347826086956522	0.122641509433962	2.83612040133779	0.102564102564103	1	0	4	5	86	0.087719298245614	0.192307692307692	0.14453781512605	1.33050089445438	0.0581395348837209	0.210526315789474	12	32	164	1067	0.0124118695308425	0.341326412098169	1	2.43752360902518	1.26588204759551	Inf	2.04711751662971	3.00243902439024	0.136303587792935	0.365692552615191	1	4.32965599328947	1.92464040025016	0.0317151930844853	1	1	2.24163532499625	0.00483241351460493	0.0216965504737364	1	45	44	0
"TCGA-CD-5803-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	47	0	0	0	0	46	1886	2	3	0	5	442	2	2	1	5	472	3	3	12	18	472	3	4	11	18	500	0	1	1	2	59	0.0425531914893617	0.111111111111111	0.118	0.941619585687382	0.0338983050847458	1	0	2	3	57	0.0638297872340425	0.166666666666667	0.120762711864407	1.38011695906433	0.0526315789473684	0.0851063829787234	4	25	116	856	0.466030833615023	1	1	1.18046848299251	0.37015183285242	Inf	1.15576694411415	1.39655172413793	0.535402367959918	0.780056430140278	1	1.475177289296	1.09295352323838	0.53221886317312	1	1	1.10674323777595	0.523809523809524	0.829051044878383	1	43	42	0
"TCGA-CD-5804-01A-12D-2053-08"	0	0	0	0	98	0	2	5	7	91	3731	1	7	3	11	882	2	6	0	8	872	3	7	28	38	1012	1	5	28	34	965	1	1	1	3	141	0.0306122448979592	0.0882352941176471	0.146113989637306	0.603879849812265	0.0212765957446809	2	1	3	6	139	0.0612244897959184	0.157894736842105	0.137351778656126	1.14956455887921	0.0431654676258993	0.0714285714285714	7	53	280	1697	0.762846646420248	1	1	0.80055326695452	0.356622007762437	Inf	0.82375	5.29553571428571	0.0103290972998228	0.0733032711600328	1	18.1362458566518	0.504336734693878	0.964736370439331	1	1	0.466345441897133	1	1	1	91	84	0
"TCGA-CD-5813-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	198	0	2	0	2	196	8036	10	10	7	27	2011	9	22	7	38	2007	10	13	47	70	1961	9	8	44	61	2057	3	1	2	6	297	0.0303030303030303	0.0983606557377049	0.144385026737968	0.681238615664845	0.0202020202020202	5	3	5	13	295	0.0656565656565657	0.185714285714286	0.150433452320245	1.23452784503632	0.0440677966101695	0.0757575757575758	15	95	592	3426	0.667204431362034	1	1	0.913754312650776	0.540954688876009	Inf	0.925522113022113	2.85775248933144	0.00376407649990007	0.0376407649990007	0.828096829978015	4.20683548006762	0.522089397089397	0.985298959826173	1	1	0.482332645377813	1	1	1	183	181	0
"TCGA-CD-8524-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	166	0	0	1	1	164	6724	1	4	2	7	1564	4	10	7	21	1548	2	8	54	64	1802	8	16	48	72	1810	1	3	1	5	223	0.0301204819277108	0.0694444444444444	0.123204419889503	0.563652217239661	0.0224215246636771	0	2	3	5	220	0.0301204819277108	0.078125	0.122086570477247	0.639914772727273	0.0227272727272727	0.0301204819277108	5	107	443	3169	0.998505851249729	1	1	0.334341332817977	0.128663206588177	Inf	0.363995485327314	0.815349887133183	0.730040124778948	0.928374725152419	1	0.794885663030457	0.319745053777719	0.998973110696618	1	1	0.292041236141127	0.303405572755418	0.585519526370105	1	161	159	0
"TCGA-CD-8525-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	86	0	1	0	1	85	3485	0	8	4	12	824	2	6	3	11	869	10	5	16	31	853	6	4	21	31	939	3	0	3	6	114	0.0697674418604651	0.193548387096774	0.121405750798722	1.59422750424448	0.0526315789473684	7	1	2	10	114	0.116279069767442	0.32258064516129	0.133645955451348	2.41369552914544	0.087719298245614	0.174418604651163	15	38	228	1564	0.0023913843472424	0.131526139098332	0.526104556393328	2.70574566865081	1.51560591479978	Inf	2.22442899702085	4.91228070175439	5.08468768178561e-06	0.000223726257998567	0.00111863128999283	11.4036724143369	1.06211474632527	0.518066605700668	1	1	1.07179850345195	0.155613477924309	0.352937784982969	1	71	70	0
"TCGA-CD-8526-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	46	0	0	1	1	45	1845	1	2	0	3	433	0	1	0	1	426	5	3	13	21	504	3	3	14	20	482	2	0	0	2	65	0.0434782608695652	0.1	0.134854771784232	0.741538461538462	0.0307692307692308	0	1	1	2	52	0.0434782608695652	0.0952380952380952	0.103174603174603	0.923076923076923	0.0384615384615385	0.0652173913043478	3	32	117	869	0.801024033384638	1	1	0.696531509174856	0.178301788023915	Inf	0.722344322344322	2.10683760683761	0.24690070096661	0.506455997281685	1	2.47259745050263	0.312124089901868	0.966306180347182	1	1	0.285891080170731	1	1	1	43	42	0
"TCGA-CD-8528-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	119	0	0	2	2	117	4797	1	6	3	10	1056	3	7	2	12	1113	3	7	30	40	1347	4	4	47	55	1281	0	0	0	0	152	0	0	0.118657298985168	0	0	1	2	0	3	146	0.0252100840336134	0.075	0.108389012620638	0.691952054794521	0.0205479452054795	0.00840336134453781	1	83	298	2330	0.999953466815679	1	1	0.0942383574778676	0.00473190338636232	Inf	0.104985618408437	1.25982742090125	0.570066053195769	0.798818673267957	1	1.30298452778353	0	1	1	1	0	1	1	1	118	116	0
"TCGA-CD-8529-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	437	2	0	2	2	429	17589	18	17	17	52	4209	22	19	13	54	4427	52	34	83	169	4363	53	38	63	154	4590	17	7	9	33	633	0.0755148741418764	0.214285714285714	0.137908496732026	1.55382532159783	0.0521327014218009	18	7	14	39	638	0.0892448512585812	0.230769230769231	0.146229658491863	1.57812876778394	0.061128526645768	0.132723112128146	58	193	1271	7682	0.000134013106865261	0.00982762783678581	0.0294828835103574	1.81619711412722	1.39078021447001	Inf	1.6277110284276	2.34801993181222	7.28087639674729e-07	4.00448201821101e-05	0.00016017928072844	3.0215121400749	1.10968065270578	0.330871258387099	1	1	1.13014001007931	0.0611927096055434	0.177136790963415	1	379	371	22
"TCGA-CD-8530-01A-11D-2340-08"	0	2	0	2	99	1	0	0	0	98	4018	4	7	9	20	967	1	7	6	14	999	5	4	18	27	995	7	7	23	37	1057	3	3	3	9	145	0.0909090909090909	0.243243243243243	0.137180700094607	1.77315936626281	0.0620689655172414	0	0	3	3	131	0.0303030303030303	0.111111111111111	0.131658291457286	0.843935538592027	0.0229007633587786	0.0909090909090909	9	44	276	1776	0.283816158142217	1	1	1.31601518995816	0.641798647332129	Inf	1.26251025430681	1.85869565217391	0.213996101968499	0.480399412582345	1	2.14390917779439	1.08801696712619	0.482359708193324	1	1	1.10308521039437	0.400323058285099	0.704568582581774	1	90	89	0
"TCGA-CD-8531-01A-11D-2340-08"	1	0	1	2	261	0	1	9	10	250	10250	12	15	12	39	2386	8	21	9	38	2441	13	10	63	86	2666	7	11	69	87	2757	0	1	5	6	326	0.0229885057471264	0.0689655172413793	0.118244468625317	0.58324518722234	0.0184049079754601	2	1	2	5	335	0.0191570881226054	0.0581395348837209	0.125656414103526	0.462686567164179	0.0149253731343284	0.0344827586206897	9	143	661	4762	0.99634972152319	1	1	0.453460625826099	0.231263531529638	Inf	0.485777131937256	0.820423600605144	0.719609156622564	0.925812950040726	1	0.800509595977594	0.435073121533031	0.997396557517191	1	1	0.403483773138069	0.0804953560371517	0.215963150343578	1	252	241	0
"TCGA-CD-8532-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	50	0	1	1	2	48	1968	1	1	0	2	509	3	9	1	13	461	1	1	13	15	503	1	2	15	18	495	0	0	4	4	65	0.08	0.222222222222222	0.131313131313131	1.69230769230769	0.0615384615384615	0	0	1	1	73	0.02	0.0666666666666667	0.145129224652087	0.459360730593607	0.0136986301369863	0.1	5	25	138	860	0.40731726830957	1	1	1.2460745949122	0.448034921450015	Inf	1.20531400966184	0	1	1	1	0	1.29140786749482	0.349568409125492	1	1	1.35431154673075	0.00793650793650794	0.0331463539010709	1	45	43	0
"TCGA-CD-8534-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	83	0	0	0	0	83	3403	0	6	0	6	805	3	4	4	11	827	3	4	30	37	874	1	2	26	29	897	1	0	3	4	127	0.0481927710843374	0.137931034482759	0.141583054626533	0.974205810480586	0.031496062992126	1	1	8	10	116	0.120481927710843	0.27027027027027	0.132723112128146	2.03634669151911	0.0862068965517241	0.156626506024096	13	47	243	1528	0.0655527324238892	1	1	1.73862068502227	0.952938918774804	Inf	1.57908093278464	3.6440329218107	0.0941585731574089	0.300215740501883	1	6.27725450100083	1.43158436213992	0.143946108034864	1	1	1.5366617347424	0.00183814181660459	0.00919070908302295	0.40439119965301	70	70	0
"TCGA-CD-8535-01A-11D-2340-08"	0	1	0	1	299	2	3	5	8	289	11849	12	20	30	62	2954	13	24	32	69	2997	9	10	64	83	2987	5	10	60	75	2911	1	3	9	13	410	0.0434782608695652	0.173333333333333	0.140845070422535	1.23066666666667	0.0317073170731707	2	1	8	11	437	0.0367892976588629	0.132530120481928	0.146300636089722	0.905875217115602	0.0251716247139588	0.0668896321070234	20	118	847	5051	0.520382923310773	1	1	1.01074453753948	0.645849862490129	Inf	1.00918844001848	1.49215719345589	0.326498653729692	0.5989335529803	1	1.62621652197032	0.954659709791675	0.620667793590394	1	1	0.947455023464571	8.82777082593548e-05	0.000776843832682322	0.0194210958170581	279	269	0
"TCGA-CD-A4MI-01A-21D-A25D-08"	0	0	0	0	1061	0	0	4	4	1056	43296	8	95	13	116	9600	7	82	11	100	9703	8	80	324	412	11803	5	78	345	428	12190	0	5	3	8	1392	0.00754005655042413	0.0186915887850467	0.114191960623462	0.163685680524224	0.00574712643678161	2	3	4	9	1377	0.00848256361922714	0.0218446601941748	0.116665254596289	0.187242210800178	0.0065359477124183	0.00848256361922714	9	673	2769	21224	1	1	1	0.10250610899121	0.0532121294091095	Inf	0.114345672501056	1.33305553240548	0.452636048108509	0.708959297626541	1	1.39358401801509	0.0906637170769047	1	1	1	0.0810518380793834	0.117538005190953	0.287315123800107	1	1052	1047	0
"TCGA-CD-A4MJ-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	705	2	10	61	71	632	25912	6	60	9	75	5618	4	63	14	81	5814	8	36	199	243	7118	4	37	192	233	7362	0	1	3	4	791	0.00567375886524823	0.0171673819742489	0.107443629448519	0.159780361687005	0.00505689001264223	0	1	1	2	785	0.00283687943262411	0.00823045267489712	0.110283787580781	0.0746297606877933	0.00254777070063694	0.00567375886524823	4	399	1576	12904	1	1	1	0.0820891431073657	0.0278784178267753	Inf	0.0911942159690645	0	1	1	1	0	0.0939930154361458	0.999999999999999	1	1	0.0846345244359065	0.0606060606060606	0.177136790963415	1	701	628	0
"TCGA-CG-4300-01A-01D-1158-08"	0	0	1	1	165	1	0	1	1	162	6642	2	13	10	25	1631	6	12	10	28	1643	6	13	40	59	1662	2	7	41	50	1706	2	1	2	5	215	0.0303030303030303	0.1	0.126025791324736	0.793488372093023	0.0232558139534884	1	2	2	5	214	0.0303030303030303	0.0847457627118644	0.128760529482551	0.658165689846349	0.0233644859813084	0.0424242424242424	7	82	429	2939	0.944745796635755	1	1	0.584901826536323	0.265300418206434	Inf	0.617479898378775	2.94405594405594	0.0711686902372347	0.24027511035579	1	4.10820414056347	0.387694609916832	0.994096177130778	1	1	0.355959254394225	1	1	1	158	155	0
"TCGA-CG-4301-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	59	1	0	0	0	58	2378	1	4	3	8	562	4	3	1	8	570	3	1	18	22	642	6	5	9	20	604	4	2	1	7	74	0.11864406779661	0.35	0.122516556291391	2.85675675675676	0.0945945945945946	1	1	1	3	77	0.0508474576271186	0.136363636363636	0.11993769470405	1.13695395513577	0.038961038961039	0.11864406779661	7	29	151	1095	0.144547154847387	1	1	1.74946975281597	0.74871633523638	Inf	1.60448859455482	4.58425312729949	0.00231506934958795	0.0268060661531236	0.509315256909349	9.03507373883247	0.611233750306598	0.855128217592818	1	1	0.580336473221172	0.34984520123839	0.6360821840698	1	52	51	0
"TCGA-CG-4304-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	83	0	0	2	2	80	3280	1	2	4	7	758	3	4	4	11	795	6	4	20	30	872	6	2	24	32	855	3	1	1	5	101	0.0602409638554217	0.15625	0.11812865497076	1.3227103960396	0.0495049504950495	2	1	3	6	116	0.072289156626506	0.2	0.13302752293578	1.50344827586207	0.0517241379310345	0.108433734939759	9	47	217	1510	0.272926048484862	1	1	1.33224460764317	0.650290082535625	Inf	1.2790487162607	3.31605222734255	0.0120266820866828	0.0778197076197122	1	4.9629905514364	0.723502304147465	0.81928901355967	1	1	0.695978250425495	1	1	1	74	71	0
"TCGA-CG-4305-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	1207	1	1	5	6	1200	49200	13	127	23	163	11244	15	94	28	137	11544	8	60	373	441	13225	16	74	369	459	13187	2	7	7	16	1613	0.0132560066280033	0.0348583877995643	0.122317433836354	0.284982988166679	0.00991940483570986	1	4	9	14	1489	0.0115990057995029	0.0317460317460317	0.112589792060491	0.281961900497831	0.0094022834116857	0.0157415078707539	19	747	3102	23310	1	1	1	0.191138375147741	0.124367990196868	Inf	0.211195337632758	1.06431334622824	0.547282877518916	0.791109484815235	1	1.0735222135055	0.18360122414719	1	1	1	0.165614682811847	0.000631025357802889	0.00375204266801718	0.138825578716636	1188	1181	0
"TCGA-CG-4306-01A-01D-1158-08"	0	0	1	1	1146	1	2	15	17	1127	46207	7	59	13	79	10184	14	87	14	115	10413	6	47	407	460	12878	7	56	410	473	12732	2	3	8	13	1485	0.0113438045375218	0.0274841437632135	0.116635249764373	0.235641830567835	0.00875420875420875	0	5	7	12	1464	0.0104712041884817	0.0260869565217391	0.113682248796397	0.229472558802566	0.00819672131147541	0.0148342059336824	17	813	2949	22661	1	1	1	0.160686061267018	0.101805951580363	Inf	0.177871199957511	1.33604611732791	0.451420414106095	0.708959297626541	1	1.39711936223859	0.159442468102168	1	1	1	0.143726587715464	0.000209758131372125	0.00141786691793423	0.0461467889018675	1129	1110	0
"TCGA-CG-4436-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	210	0	0	1	1	208	8528	5	13	18	36	2058	9	15	25	49	2218	8	6	51	65	2067	12	8	38	58	2185	5	0	3	8	323	0.0380952380952381	0.137931034482759	0.147826086956522	0.933062880324544	0.0247678018575851	2	1	0	3	299	0.0142857142857143	0.0461538461538462	0.144654088050314	0.319063545150502	0.0100334448160535	0.0476190476190476	10	99	622	3630	0.965223262074577	1	1	0.589558078016332	0.309680763570314	Inf	0.627157143278563	2.39260450160772	0.0196792823607568	0.105596149252841	1	3.14127575637012	0.230427399833809	0.999888819869132	1	1	0.2036245343473	0.19838056680162	0.41565452091768	1	200	198	0
"TCGA-CG-4437-01A-01D-1800-08"	0	0	0	0	579	1	0	1	1	574	23534	26	22	27	75	5460	30	39	15	84	5715	67	36	114	217	6141	55	45	98	198	6218	13	7	8	28	839	0.0483592400690846	0.141414141414141	0.134930845931168	1.04804902421112	0.033373063170441	18	3	10	31	811	0.0535405872193437	0.142857142857143	0.1320631818922	1.08173330984675	0.0382244143033292	0.0846286701208981	49	285	1650	10709	0.264575869376545	1	1	1.11582895769885	0.846706939190967	Inf	1.0988767918708	1.9032737208147	0.000283646969177388	0.00567293938354776	0.0624023332190254	2.21080077793842	0.635969125214408	0.988744854404814	1	1	0.602214484280273	0.0245141327320167	0.0804941671797563	1	530	525	0
"TCGA-CG-4438-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	158	0	0	1	1	156	6396	4	9	6	19	1518	1	9	9	19	1596	23	6	38	67	1626	10	10	31	51	1656	3	2	5	10	228	0.0632911392405063	0.196078431372549	0.13768115942029	1.42414860681115	0.043859649122807	11	0	5	16	217	0.10126582278481	0.238805970149254	0.133456334563346	1.78939404360685	0.0737327188940092	0.151898734177215	24	78	445	2837	0.00519330288992804	0.228505327156834	1	1.96120581109329	1.27329638277617	Inf	1.73536021150033	3.12890704800817	5.14951693268073e-05	0.0012587708057664	0.0113289372518976	4.69432313912013	1.06888128969223	0.464834676100791	1	1	1.08055290142933	0.404330407061853	0.705973726615934	1	134	132	0
"TCGA-CG-4440-01A-01D-1158-08"	0	1	0	1	138	1	0	2	2	134	5494	3	6	7	16	1284	2	7	11	20	1364	7	9	35	51	1432	6	10	31	47	1414	2	2	6	10	197	0.072463768115942	0.212765957446809	0.139321074964639	1.5271627605573	0.050761421319797	3	3	5	11	196	0.0797101449275362	0.215686274509804	0.136871508379888	1.57583033213285	0.0561224489795918	0.115942028985507	16	63	393	2453	0.0762303165227182	1	1	1.58490323255912	0.935027963845347	Inf	1.46667955035913	2.78528087688393	0.0251594090677233	0.12872255802091	1	3.89852395959259	1.2069550466497	0.303171080040818	1	1	1.24823104419973	0.110898141419859	0.277245353549648	1	122	118	0
"TCGA-CG-4441-01A-01D-1800-08"	0	0	0	0	135	0	1	1	2	133	5453	1	8	13	22	1236	3	4	8	15	1366	4	9	38	51	1390	4	5	36	45	1461	2	0	0	2	206	0.0148148148148148	0.0444444444444444	0.140999315537303	0.315210355987055	0.00970873786407767	2	2	1	5	172	0.037037037037037	0.0980392156862745	0.123741007194245	0.792293661650707	0.0290697674418605	0.037037037037037	5	77	378	2473	0.987632837119813	1	1	0.424916549081363	0.1622186301352	Inf	0.459898051361466	3.77116402116402	0.0141101807699418	0.0838983721455999	1	6.53504710145786	0.101923351923352	0.999969841357306	1	1	0.0896533717495401	0.265734265734266	0.526680526680527	1	130	128	0
"TCGA-CG-4442-01A-01D-1158-08"	0	0	1	1	1745	3	24	162	186	1553	63673	14	247	11	272	14806	19	271	27	317	14956	8	86	416	510	16893	7	69	378	454	17018	1	3	8	12	2075	0.00687679083094556	0.026431718061674	0.121929721471383	0.216778302637864	0.00578313253012048	0	8	10	18	1988	0.0103151862464183	0.0352941176470588	0.117681880068667	0.299911232098473	0.00905432595573441	0.0108882521489971	19	790	4063	29848	1	1	1	0.176687739859201	0.115019637080212	Inf	0.196019308986065	0.556419722700796	0.852561630697242	1	1	0.524743733255888	0.189210736938558	1	1	1	0.170408324090842	2.59137441523792e-06	3.56313982095214e-05	0.000570102371352342	1726	1534	0
"TCGA-CG-4443-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	113	0	0	4	4	107	4387	4	8	2	14	999	5	8	1	14	1052	10	5	22	37	1154	15	9	18	42	1182	6	1	4	11	151	0.0973451327433628	0.261904761904762	0.127749576988156	2.05014191106906	0.0728476821192053	2	0	3	5	149	0.0442477876106195	0.135135135135135	0.129116117850953	1.04661708688554	0.0335570469798658	0.132743362831858	15	50	300	2036	0.0180052810653485	0.440129092708519	1	2.03526546196502	1.16464778731748	Inf	1.79692307692308	2.49173333333333	0.0111081554048805	0.07405436936587	1	3.19145545489667	1.36266666666667	0.252295597575197	1	1	1.43934056708345	1	1	1	98	92	0
"TCGA-CG-4444-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	209	1	0	0	0	205	8405	6	16	26	48	2061	8	12	33	53	2084	9	9	36	54	2158	5	12	33	50	2102	1	1	2	4	291	0.0191387559808612	0.08	0.138439581351094	0.57786941580756	0.013745704467354	4	3	3	10	298	0.0478468899521531	0.185185185185185	0.138090824837813	1.34103902560278	0.0335570469798658	0.0478468899521531	10	73	589	3671	0.726518002502798	1	1	0.853816103103329	0.444164056821674	Inf	0.871397303986745	2.58307057967499	0.0346823653965715	0.164952295753023	1	3.4611125161487	0.524101277035506	0.969413371803229	1	1	0.486985945036323	1	1	1	199	195	0
"TCGA-CG-4449-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	116	0	1	2	3	113	4633	1	8	2	11	1013	4	10	4	18	1197	9	4	30	43	1191	9	7	25	41	1232	3	2	5	10	207	0.0862068965517241	0.24390243902439	0.168019480519481	1.45163190762342	0.0483091787439614	5	0	2	7	152	0.0603448275862069	0.162790697674419	0.127623845507976	1.27555079559364	0.0460526315789474	0.129310344827586	15	58	359	2064	0.12006143623458	1	1	1.4866172504124	0.858993764541321	Inf	1.38684320982943	2.99969049829774	0.00265312357515457	0.0277946279301907	0.583687186534005	4.5952823269081	0.859002279057989	0.724417574031309	1	1	0.838496585658138	1	1	1	101	98	0
"TCGA-CG-4455-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	57	0	0	0	0	57	2337	0	6	2	8	564	3	3	1	7	560	1	3	21	25	584	1	3	13	17	629	0	2	1	3	79	0.0526315789473684	0.176470588235294	0.125596184419714	1.40506329113924	0.0379746835443038	0	0	2	2	84	0.0350877192982456	0.08	0.143835616438356	0.556190476190476	0.0238095238095238	0.0526315789473684	3	33	163	1050	0.87801170715851	1	1	0.585820221780982	0.150754537493913	Inf	0.620143149284254	0	1	1	1	0	0.65662215806568	0.852479055263018	1	1	0.623593472934202	0.166666666666667	0.370370370370371	1	54	54	0
"TCGA-CG-4462-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	88	0	0	0	0	88	3608	0	5	4	9	878	1	3	4	8	813	4	4	22	30	966	3	2	36	41	951	0	0	1	1	101	0.0113636363636364	0.024390243902439	0.106203995793901	0.229654672784352	0.0099009900990099	2	2	0	4	136	0.0454545454545455	0.133333333333333	0.140786749482402	0.947058823529412	0.0294117647058824	0.0340909090909091	3	62	237	1680	0.989685273573105	1	1	0.343122647565015	0.0905211469395917	Inf	0.37332035053554	2.31103074141049	0.212332006430895	0.480399412582345	1	2.83324735896037	0.13945875163684	0.999481634975924	1	1	0.124424914896524	1	1	1	85	85	0
"TCGA-CG-4465-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	676	1	5	38	43	632	25912	9	62	17	88	5897	3	59	16	78	5824	9	35	182	226	7054	4	46	190	240	7137	0	2	4	6	800	0.00887573964497041	0.025	0.112091915370604	0.22303125	0.0075	0	1	6	7	804	0.0103550295857988	0.0309734513274336	0.113977884888007	0.271749658785717	0.00870646766169154	0.014792899408284	10	375	1604	12587	0.999999999934215	1	1	0.209272812814396	0.112467224938061	Inf	0.229798879424815	0	1	1	1	0	0.237829485426219	0.999999999776825	1	1	0.216787992727285	0.000107686095032979	0.000911190034894438	0.0236909409072554	666	622	0
"TCGA-CG-4466-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	230	0	1	3	4	226	9266	6	17	23	46	2309	4	18	36	58	2431	7	11	43	61	2374	14	11	36	61	2152	5	1	4	10	357	0.0434782608695652	0.163934426229508	0.16589219330855	0.988198558111769	0.0280112044817927	1	5	2	8	365	0.0347826086956522	0.131147540983607	0.153748946925021	0.852997978890636	0.0219178082191781	0.0521739130434783	12	88	722	3804	0.889882050719068	1	1	0.718506480077061	0.399126811964347	Inf	0.752243767313019	1.79105658884052	0.105791173209809	0.318822713782986	1	2.10707216286448	0.476103650198114	0.990752906400454	1	1	0.433099992624636	1	1	1	218	214	0
"TCGA-CG-4469-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	349	2	1	4	5	340	13940	7	26	47	80	3427	11	22	47	80	3513	11	11	65	87	3470	15	19	59	93	3530	3	7	2	12	511	0.0343839541547278	0.129032258064516	0.144759206798867	0.891357868821413	0.0234833659491194	2	0	7	9	511	0.0257879656160458	0.103448275862069	0.147262247838617	0.702476550374519	0.0176125244618395	0.0401146131805158	14	136	1022	5978	0.978369008358869	1	1	0.60217318695535	0.354333421374537	Inf	0.639269406392694	1.31717597471022	0.328493423765245	0.5989335529803	1	1.39261756927112	0.49712770658418	0.995742964371457	1	1	0.457812960147073	0.326423631912115	0.616246498599439	1	335	326	0
"TCGA-CG-4474-01A-02D-1158-08"	0	0	0	0	110	0	0	0	0	110	4510	0	7	1	8	978	4	5	5	14	1090	4	5	38	47	1222	3	7	31	41	1220	2	1	2	5	158	0.0454545454545455	0.121951219512195	0.129508196721311	0.941648656992899	0.0316455696202532	1	0	2	3	137	0.0272727272727273	0.0638297872340425	0.112111292962357	0.569343065693431	0.0218978102189781	0.0636363636363636	7	69	295	2147	0.824822568786859	1	1	0.738424623023692	0.332344444039989	Inf	0.762444246208742	3.54769975786925	0.0429395940783454	0.174939086985852	1	5.4520753996745	0.479882092851879	0.972563968010747	1	1	0.447980765325374	1	1	1	103	103	0
"TCGA-CG-4475-01A-01D-1158-08"	0	1	1	2	59	0	0	1	1	57	2337	2	6	2	10	586	2	2	3	7	568	5	3	18	26	639	2	2	10	14	544	0	0	2	2	75	0.0338983050847458	0.142857142857143	0.137867647058824	1.03619047619048	0.0266666666666667	2	0	1	3	85	0.0508474576271186	0.115384615384615	0.13302034428795	0.867420814479638	0.0352941176470588	0.0847457627118644	5	30	160	1023	0.52472220634758	1	1	1.06558382942802	0.388571763602714	Inf	1.05625	2.1125	0.244719253416479	0.506455997281685	1	2.55467533184987	0.7921875	0.750096025555311	1	1	0.767403422210365	1	1	1	54	52	0
"TCGA-CG-4476-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	147	0	0	0	0	146	5986	8	5	4	17	1476	2	10	1	13	1454	12	14	27	53	1525	8	12	43	63	1531	2	0	11	13	200	0.0884353741496599	0.206349206349206	0.130633572828217	1.57960317460317	0.065	4	3	0	7	205	0.0476190476190476	0.132075471698113	0.134426229508197	0.982512655315232	0.0341463414634146	0.115646258503401	17	73	405	2651	0.0864647730692014	1	1	1.52409610077469	0.91852733752278	Inf	1.42529492455418	2.2637037037037	0.0410650427564273	0.173736719354115	1	2.80397009281894	1.18574955908289	0.324384570362134	1	1	1.22028622158317	0.200287272812301	0.41569056621421	1	130	129	0
"TCGA-CG-4477-01A-01D-1158-08"	0	0	0	0	74	1	1	3	4	69	2829	0	4	1	5	656	3	2	4	9	694	5	2	19	26	792	5	6	18	29	687	2	1	1	4	91	0.0540540540540541	0.137931034482759	0.132459970887918	1.04130352406214	0.043956043956044	0	0	1	1	93	0.0135135135135135	0.0384615384615385	0.117424242424242	0.327543424317618	0.010752688172043	0.0540540540540541	4	43	184	1295	0.850960489325658	1	1	0.654858860040035	0.212398548539216	Inf	0.6840888066605	1.60760869565217	0.360938819542956	0.635252322395602	1	1.75868994716179	0.43448883666275	0.953215988047789	1	1	0.402346665386304	1	1	1	70	65	0
"TCGA-CG-5717-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	202	0	0	1	1	199	8159	8	25	4	37	2059	7	17	5	29	2079	21	11	36	68	2055	26	10	29	65	1966	12	1	4	17	335	0.0841584158415842	0.261538461538462	0.170396744659207	1.5348794489093	0.0507462686567164	9	2	4	15	326	0.0742574257425743	0.220588235294118	0.158637469586375	1.39051786358715	0.0460122699386503	0.143564356435644	29	83	661	3360	0.00812749295795511	0.298008075125021	1	1.77576557046168	1.19777655144928	Inf	1.57511616598228	2.71802877651527	6.16567060799679e-06	0.000226074588959882	0.00135644753375929	4.10364676219356	0.748702432212266	0.857520477503457	1	1	0.713487064375829	0.0023068798379325	0.01127807920767	0.50751356434515	173	170	0
"TCGA-CG-5718-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	101	1	0	1	1	99	4059	2	5	1	8	943	3	6	2	11	984	0	5	36	41	1067	6	10	23	39	1065	2	0	2	4	153	0.0396039603960396	0.102564102564103	0.143661971830986	0.713926596279537	0.0261437908496732	0	2	7	9	150	0.0891089108910891	0.219512195121951	0.14058106841612	1.56146341463415	0.06	0.108910891089109	11	54	303	1829	0.320018773327842	1	1	1.22947553678782	0.648333425745767	Inf	1.19075907590759	2.34543454345435	0.206241930124444	0.480399412582345	1	3.0159448027483	1.07333445208928	0.468028173402636	1	1	1.08651564498323	0.0154193027325347	0.0556106000189776	1	90	88	0
"TCGA-CG-5719-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	108	0	0	0	0	108	4428	5	4	1	10	1065	1	5	2	8	1032	6	2	36	44	1163	7	2	37	46	1168	4	1	3	8	150	0.0740740740740741	0.173913043478261	0.128424657534247	1.35420289855072	0.0533333333333333	2	1	5	8	168	0.0740740740740741	0.181818181818182	0.14445399828031	1.25865800865801	0.0476190476190476	0.12962962962963	14	72	318	2013	0.286601037683492	1	1	1.23073980491552	0.704807420599138	Inf	1.19328652917946	3.38316400580552	0.00486153377103154	0.0445640595677891	1	5.41959454947621	0.803308348410442	0.794152008771535	1	1	0.779174919459658	0.722393472194293	1	1	94	94	0
"TCGA-CG-5720-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	114	0	0	1	1	113	4633	0	8	6	14	1142	5	7	2	14	1129	8	6	25	39	1200	5	9	32	46	1162	3	2	1	6	175	0.0526315789473684	0.130434782608696	0.150602409638554	0.866086956521739	0.0342857142857143	7	0	3	10	155	0.087719298245614	0.256410256410256	0.129166666666667	1.98511166253102	0.0645161290322581	0.12280701754386	14	56	330	2032	0.108266401178972	1	1	1.5390750767707	0.871622137504082	Inf	1.43151515151515	5.50582750582751	6.13989457154641e-07	4.00448201821101e-05	0.000135077680574021	20.4889789335037	0.502286018075492	0.965588843088153	1	1	0.46483722957994	0.0731727514850386	0.201225066583856	1	100	99	0
"TCGA-CG-5721-01A-11D-1600-08"	0	0	1	1	4651	12	4	25	29	4606	188846	69	1170	49	1288	45557	98	1213	57	1368	46491	22	97	857	976	48412	25	109	840	974	48386	4	5	23	32	6603	0.00688024080842829	0.0328542094455852	0.136465093208779	0.24075174590854	0.00484628199303347	0	3	12	15	6252	0.00322511287895076	0.0153688524590164	0.129141535156573	0.11900781913722	0.00239923224568138	0.00838529348527198	39	1705	12855	83943	1	1	1	0.149367730273626	0.111907214827478	Inf	0.168388500529905	0.640850070756474	0.886652025420875	1	1	0.607444114358631	0.155303236062817	1	1	1	0.137516141736188	4.57665870110448e-11	1.75568108891851e-09	1.00686491424299e-08	4612	4567	0
"TCGA-CG-5722-01A-21D-1600-08"	0	0	0	0	103	0	0	0	0	103	4223	1	8	2	11	929	2	4	2	8	1104	5	6	33	44	1043	2	6	32	40	1147	2	0	2	4	170	0.0388349514563107	0.1	0.14821272885789	0.674705882352941	0.0235294117647059	1	0	5	6	131	0.058252427184466	0.136363636363636	0.125599232981783	1.08570437196391	0.0458015267175573	0.0970873786407767	10	62	301	1889	0.539552071296095	1	1	1.01221257516101	0.520758467937389	Inf	1.01052048726467	3.11817750355956	0.0598530124168108	0.227028667787903	1	4.70177909580324	0.783542039355993	0.805648516364597	1	1	0.757503263037313	0.178895407997576	0.386401524172421	1	93	93	0
"TCGA-CG-5723-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	1757	3	1	29	30	1724	70684	17	144	33	194	15939	18	194	44	256	15935	9	55	589	653	19227	8	77	536	621	19583	1	6	8	15	2242	0.00853727945361412	0.0241545893719807	0.11448705509881	0.210980965063112	0.00669045495093666	3	8	12	23	2127	0.0130904951622083	0.0352220520673813	0.110625682633796	0.318389466431378	0.0108133521391631	0.0136596471257826	24	1118	4369	34441	1	1	1	0.169228390501466	0.116134319208492	Inf	0.186683844423716	2.09012696403808	0.116082522784769	0.331664350813626	1	2.42542119580427	0.157920703949543	1	1	1	0.142682896066559	0.000145320594766212	0.00107491480910592	0.0319705308485666	1733	1700	0
"TCGA-CG-5724-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	135	0	2	1	3	132	5412	5	12	10	27	1264	1	8	10	19	1395	6	2	33	41	1348	1	7	37	45	1405	0	3	2	5	203	0.037037037037037	0.111111111111111	0.144483985765125	0.769020251778872	0.0246305418719212	2	0	2	4	162	0.0296296296296296	0.0975609756097561	0.120178041543027	0.811803673592292	0.0246913580246914	0.0444444444444444	6	71	365	2388	0.95073934477731	1	1	0.552979936905841	0.23212200498802	Inf	0.58772460416296	2.15499021526419	0.23615268202096	0.498096254329719	1	2.61593100617146	0.430998043052838	0.986925739558753	1	1	0.396605327543116	0.619909502262444	0.934110208888614	1	129	126	0
"TCGA-CG-5726-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	1549	3	15	139	154	1391	57031	23	119	19	161	12870	28	137	16	181	13340	9	69	447	525	15240	9	76	439	524	15581	0	5	12	17	1894	0.0109748224661072	0.0324427480916031	0.12155830819588	0.266890421338578	0.00897571277719113	1	6	8	15	1810	0.00968366688185926	0.0285714285714286	0.118766404199475	0.240568271507498	0.00828729281767956	0.013557133634603	21	883	3704	27117	1	1	1	0.174117300385696	0.116022011164467	Inf	0.193297666717636	0.462278017758579	0.900195693167041	1	1	0.430655444631451	0.187833054619739	1	1	1	0.169081286074756	3.57808500464659e-07	6.55982250851875e-06	7.8717870102225e-05	1528	1370	0
"TCGA-CG-5727-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	181	0	0	0	0	180	7380	3	9	2	14	1785	2	10	5	17	1759	8	13	62	83	1898	8	13	45	66	1938	2	3	3	8	239	0.0441988950276243	0.121212121212121	0.123323013415893	0.98288322556105	0.0334728033472803	4	3	3	10	270	0.0552486187845304	0.120481927710843	0.142255005268704	0.84694332887104	0.037037037037037	0.0662983425414365	12	111	509	3327	0.902155295527552	1	1	0.70668782433884	0.394482634387619	Inf	0.735253246442091	2.82612966601179	0.0135795111793555	0.0838983721455999	1	3.91995782972833	0.42259882856251	0.996698649246668	1	1	0.38836316380627	1	1	1	169	168	0
"TCGA-CG-5728-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	1430	1	2	3	5	1424	58384	17	125	17	159	13292	14	144	26	184	13439	16	80	445	541	15928	14	51	475	540	15725	2	6	6	14	1923	0.00979020979020979	0.0259259259259259	0.122289348171701	0.212004776487356	0.00728029121164847	3	5	7	15	1917	0.0104895104895105	0.0277264325323475	0.120354093420392	0.230373822313631	0.00782472613458529	0.0125874125874126	18	932	3840	27813	1	1	1	0.139889850923564	0.0899695856346842	Inf	0.156182565789474	1.373828125	0.296419446303742	0.568808009127904	1	1.44856819161762	0.116476732336957	1	1	1	0.103816497755275	0.0453973543509942	0.134965107529983	1	1412	1406	0
"TCGA-CG-5730-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	197	0	1	2	3	194	7954	5	5	2	12	1860	7	6	1	14	1927	5	13	58	76	2006	8	5	79	92	2161	2	1	13	16	317	0.0812182741116751	0.173913043478261	0.146691346598797	1.18557125222878	0.0504731861198738	3	4	12	19	259	0.0964467005076142	0.25	0.129112662013958	1.93629343629344	0.0733590733590734	0.152284263959391	30	120	576	3591	0.0254795842453811	0.560550853398384	1	1.55840442639092	1.07184022240627	Inf	1.446875	2.78245192307692	0.025098074704039	0.12872255802091	1	3.8948131140122	1.32014142335766	0.0923704656199587	1	1	1.39147977682609	2.29280737344463e-06	3.36278414771879e-05	0.000504417622157819	167	164	0
"TCGA-CG-5732-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	82	0	0	1	1	81	3321	1	8	5	14	824	0	3	2	5	850	3	6	23	32	738	7	5	18	30	909	0	0	1	1	127	0.0121951219512195	0.0333333333333333	0.13971397139714	0.238582677165354	0.0078740157480315	2	2	2	6	104	0.0731707317073171	0.1875	0.140921409214092	1.33052884615385	0.0576923076923077	0.0609756097560976	5	46	231	1416	0.858653280999819	1	1	0.666430244475603	0.249279583209597	Inf	0.699006875477464	1.42597402597403	0.421061623649628	0.686174497799394	1	1.53200490087394	0.521697814380741	0.938720112725571	1	1	0.484100558709423	1	1	1	77	76	0
"TCGA-CG-5733-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	1222	1	4	42	46	1175	48175	8	124	13	145	10985	9	98	23	130	11234	4	69	394	467	12923	8	54	371	433	13033	0	9	4	13	1543	0.0106382978723404	0.0300230946882217	0.118391774725696	0.25359105189345	0.0084251458198315	0	3	11	14	1523	0.0114566284779051	0.0299785867237687	0.117851891975547	0.254375099298269	0.00919238345370978	0.0122749590834697	15	762	3066	22890	1	1	1	0.14696895703427	0.0900874993638695	Inf	0.163431533294547	0	1	1	1	0	0.165995165189363	1	1	1	0.149320442785988	4.01737967240367e-06	4.9101307107156e-05	0.000883823527928807	1207	1160	0
"TCGA-CG-5734-01A-11D-1600-08"	0	0	0	0	121	0	0	0	0	120	4920	4	6	8	18	1142	3	10	3	16	1195	3	6	28	37	1318	0	6	43	49	1265	0	0	2	2	173	0.0165289256198347	0.0408163265306122	0.136758893280632	0.298454641972396	0.0115606936416185	1	1	0	2	175	0.0165289256198347	0.0540540540540541	0.132776934749621	0.407104247104247	0.0114285714285714	0.0247933884297521	3	71	348	2235	0.998109874469042	1	1	0.271453205238639	0.0719993870264453	Inf	0.300908667287978	2.47413793103448	0.352807116006544	0.625948109043868	1	3.20910751953012	0.20908207867897	0.999542969997666	1	1	0.186222239437598	1	1	1	118	117	0
"TCGA-D7-5577-01A-01D-1600-08"	0	0	0	0	136	0	1	0	1	135	5535	6	8	7	21	1391	3	3	7	13	1266	2	13	43	58	1466	3	6	34	43	1412	0	1	2	3	180	0.0220588235294118	0.0697674418604651	0.127478753541076	0.547286821705426	0.0166666666666667	1	3	4	8	212	0.0588235294117647	0.137931034482759	0.144611186903138	0.95380611581002	0.0377358490566038	0.0514705882352941	7	75	392	2486	0.939955372651533	1	1	0.591993730378166	0.267670396574762	Inf	0.626742160278746	1.46836734693878	0.519674659257668	0.772489358355993	1	1.58515166273067	0.572091174131991	0.958926659440546	1	1	0.536022556194163	0.0634674922600621	0.179010875605303	1	129	128	0
"TCGA-D7-5578-01A-01D-1600-08"	0	0	0	0	289	0	0	1	1	287	11767	9	16	19	44	2869	6	24	20	50	2891	16	14	81	111	3011	9	14	59	82	2996	4	5	7	16	417	0.055363321799308	0.195121951219512	0.139185580774366	1.4018833713517	0.0383693045563549	7	3	8	18	419	0.0622837370242214	0.162162162162162	0.1391564264364	1.1653228407405	0.0429594272076372	0.0899653979238754	26	139	836	5171	0.282083977504121	1	1	1.15692598460488	0.782171660825418	Inf	1.13224590401624	3.16157894736842	0.000265541320507856	0.00567293938354776	0.0584190905117283	4.85811825830499	0.769865003417635	0.889680376643255	1	1	0.742281983013557	0.454459191072131	0.751737007788487	1	263	261	0
"TCGA-D7-5579-01A-01D-1600-08"	1	0	0	1	170	1	0	0	0	168	6888	5	15	10	30	1638	6	12	19	37	1800	4	10	31	45	1691	9	9	38	56	1759	4	1	3	8	256	0.0470588235294118	0.142857142857143	0.145537237066515	0.981584821428571	0.03125	1	2	4	7	247	0.0411764705882353	0.155555555555556	0.146067415730337	1.06495726495726	0.0283400809716599	0.0705882352941176	12	70	503	2947	0.543336924815593	1	1	1.00437260375384	0.552303083761254	Inf	1.00373369538864	2.63801804557272	0.0310416408541574	0.15175913306477	1	3.65980826620137	0.695825049701789	0.89127247474463	1	1	0.661551491696312	0.710381651279623	1	1	158	156	0
"TCGA-D7-6518-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	112	1	0	0	0	111	4551	2	5	1	8	1063	3	5	5	13	1144	7	9	35	51	1186	5	6	28	39	1158	2	3	2	7	165	0.0625	0.179487179487179	0.142487046632124	1.25967365967366	0.0424242424242424	3	2	3	8	167	0.0714285714285714	0.156862745098039	0.140809443507589	1.11400727955853	0.0479041916167665	0.0892857142857143	10	65	332	2012	0.632199783549788	1	1	0.93235464843988	0.481007675390039	Inf	0.94136546184739	2.94176706827309	0.0194399971669836	0.105596149252841	1	4.32492025198827	0.56033658443297	0.953337337384135	1	1	0.522549277347729	1	1	1	102	101	0
"TCGA-D7-6519-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	64	0	0	4	4	60	2460	1	2	1	4	554	1	2	2	5	553	2	8	18	28	669	1	5	17	23	684	1	2	2	5	79	0.078125	0.217391304347826	0.115497076023392	1.88222344523941	0.0632911392405063	0	0	1	1	86	0.015625	0.0357142857142857	0.128550074738416	0.277823920265781	0.0116279069767442	0.0625	4	34	165	1188	0.697557346851982	1	1	0.847168479311557	0.271608255454427	Inf	0.863157894736842	2.73333333333333	0.324340935465668	0.5989335529803	1	3.59505853837395	0.702857142857143	0.816487193145671	1	1	0.675166387264652	0.545454545454546	0.857142857142858	1	60	56	0
"TCGA-D7-6520-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	72	0	2	0	2	70	2870	0	10	2	12	720	4	1	2	7	663	2	3	17	22	751	6	4	19	29	736	4	2	2	8	112	0.111111111111111	0.275862068965517	0.152173913043478	1.8128078817734	0.0714285714285714	1	0	2	3	105	0.0416666666666667	0.136363636363636	0.139813581890812	0.975324675324675	0.0285714285714286	0.125	9	35	217	1270	0.189898107982859	1	1	1.50447551448261	0.721751518664512	Inf	1.40165479681609	4.28283410138249	0.00264241351773506	0.0277946279301907	0.581330973901713	9.72922983718668	0.761392729134665	0.790354965783346	1	1	0.731702706438603	1	1	1	63	61	0
"TCGA-D7-6521-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	97	0	0	0	0	97	3977	0	4	1	5	917	0	2	2	4	938	4	2	30	36	1030	1	8	43	52	1092	0	1	8	9	147	0.0927835051546392	0.173076923076923	0.134615384615385	1.28571428571429	0.0612244897959184	0	0	5	5	110	0.0515463917525773	0.138888888888889	0.106796116504854	1.30050505050505	0.0454545454545455	0.134020618556701	13	65	257	1865	0.151752254918912	1	1	1.45107809716455	0.809157462953043	Inf	1.37613488975357	0	1	1	1	0	1.47039070412025	0.104533351061742	1	1	1.5719213889104	7.47820104395685e-07	1.17514587833608e-05	0.000164520422967051	84	84	0
"TCGA-D7-6522-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	85	0	0	0	0	85	3485	0	3	4	7	844	2	8	3	13	810	2	10	27	39	911	1	4	21	26	920	1	0	0	1	107	0.0117647058823529	0.0384615384615385	0.116304347826087	0.330697340043134	0.00934579439252336	0	1	2	3	128	0.0352941176470588	0.0769230769230769	0.140504939626784	0.547475961538462	0.0234375	0.0352941176470588	3	48	235	1596	0.966192748943193	1	1	0.424609007400332	0.11119884289366	Inf	0.458322903629537	2.59716312056738	0.33865616033355	0.605726465637244	1	3.39243633488459	0.324645390070922	0.988483675405685	1	1	0.295405493224482	1	1	1	82	82	0
"TCGA-D7-6524-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	123	0	0	1	1	121	4961	2	7	1	10	1159	2	4	0	6	1162	3	15	39	57	1303	2	11	35	48	1337	0	2	0	2	151	0.016260162601626	0.0416666666666667	0.112939416604338	0.3689293598234	0.0132450331125828	0	6	2	8	163	0.0650406504065041	0.140350877192982	0.125095932463546	1.12194596921752	0.049079754601227	0.016260162601626	2	77	314	2326	0.99941828272636	1	1	0.192470886948835	0.0334421457938287	Inf	0.212851729420302	0	1	1	1	0	0.227233603029781	0.998983056096039	1	1	0.205835648085739	0.473684210526316	0.774992792169106	1	121	119	0
"TCGA-D7-6525-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	189	0	0	5	5	184	7544	3	17	9	29	1885	4	15	14	33	1798	4	15	53	72	1916	6	15	29	50	1945	1	4	3	8	294	0.0423280423280423	0.16	0.151156812339332	1.05850340136054	0.0272108843537415	1	7	8	16	262	0.0846560846560847	0.222222222222222	0.136743215031315	1.62510602205259	0.0610687022900763	0.0687830687830688	13	79	556	3305	0.575360930379822	1	1	0.97817048326885	0.553416664164413	Inf	0.981251954957773	1.38884892086331	0.434152609262876	0.697658039222779	1	1.48588227508432	0.931545007896122	0.647840027724533	1	1	0.920937403210046	0.00784054833607701	0.0331463539010709	1	176	171	0
"TCGA-D7-6526-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	248	0	1	0	1	246	10086	11	16	22	49	2502	8	23	15	46	2499	10	16	46	72	2473	9	15	55	79	2612	1	2	10	13	378	0.0524193548387097	0.164556962025316	0.144716692189893	1.1370973143125	0.0343915343915344	3	1	8	12	363	0.0483870967741935	0.166666666666667	0.14678528103518	1.13544536271809	0.0330578512396694	0.0887096774193548	22	98	741	4344	0.15363614932475	1	1	1.31595989013774	0.851666570687102	Inf	1.2580971659919	1.44470487960793	0.297331459316859	0.568808009127904	1	1.56312843808035	1.22299274461859	0.215926988018801	1	1	1.27128793272622	0.000146579292150807	0.00107491480910592	0.0322474442731775	226	224	0
"TCGA-D7-6527-01A-11D-1800-08"	0	1	0	1	255	2	0	1	1	252	10332	5	24	38	67	2709	3	23	41	67	2629	14	9	48	71	2560	6	3	38	47	2434	3	2	6	11	375	0.0431372549019608	0.234042553191489	0.154067378800329	1.51909219858156	0.0293333333333333	6	0	5	11	385	0.0431372549019608	0.154929577464789	0.150390625	1.03018108651911	0.0285714285714286	0.0784313725490196	20	86	760	4234	0.18315572978006	1	1	1.29552099552833	0.818247933138703	Inf	1.23982125124131	2.95697368421053	0.00152547266974239	0.0209752492089579	0.335603987343326	4.55628241569303	0.840483476132191	0.776296196833312	1	1	0.817118497225957	0.762554397606516	1	1	235	232	0
"TCGA-D7-6528-01A-11D-1800-08"	0	0	0	0	391	2	2	2	4	384	15744	16	28	45	89	3993	17	29	61	107	3958	24	18	77	119	4026	6	10	53	69	3767	3	2	6	11	534	0.0281329923273657	0.159420289855072	0.141757366604725	1.12459968517614	0.0205992509363296	11	4	12	27	607	0.0690537084398977	0.226890756302521	0.15076999503229	1.5048800409785	0.0444810543657331	0.0818414322250639	32	128	1141	6652	0.0415413717750346	0.761591815875634	1	1.45741183822257	1.0191793616788	Inf	1.36599474145486	3.18732106339468	3.08189325963091e-05	0.0008475206463985	0.006780165171188	5.09969173476056	0.94568866716106	0.638514413252794	1	1	0.936954151021041	0.486131842360621	0.774992792169106	1	359	352	0
"TCGA-D7-6815-01A-11D-1882-08"	0	0	1	1	166	0	3	2	5	159	6519	2	6	2	10	1489	4	8	3	15	1487	7	9	54	70	1792	1	8	55	64	1751	0	1	1	2	194	0.0120481927710843	0.03125	0.110793832095945	0.282055412371134	0.0103092783505155	1	3	4	8	208	0.0481927710843374	0.114285714285714	0.116071428571429	0.984615384615385	0.0384615384615385	0.036144578313253	6	111	402	3141	0.99310549366949	1	1	0.422419468564033	0.179338802743345	Inf	0.451970914657482	1.10167910447761	0.618904902602672	0.830238283979194	1	1.11614215659252	0.404285909900041	0.995604940780223	1	1	0.375715555097482	0.140866873065015	0.336855566025036	1	160	153	0
"TCGA-D7-6817-01A-11D-1882-08"	0	0	0	0	105	0	1	0	1	103	4223	3	7	4	14	1002	4	6	4	14	1007	12	7	19	38	1172	4	5	28	37	1042	0	0	1	1	134	0.00952380952380952	0.027027027027027	0.128598848368522	0.210165389269867	0.00746268656716418	3	0	0	3	127	0.0285714285714286	0.0789473684210526	0.108361774744027	0.728553667633651	0.0236220472440945	0.0380952380952381	4	59	261	1953	0.947203738844476	1	1	0.507424689638806	0.166875699469985	Inf	0.538587848932677	1.59051724137931	0.292237406550846	0.568808009127904	1	1.72626918128229	0.18048422597212	0.997126201559955	1	1	0.162736598882071	0.485714285714286	0.774992792169106	1	101	99	0
"TCGA-D7-6818-01A-11D-1882-08"	0	0	0	0	174	0	0	2	2	172	7052	4	22	24	50	1725	4	19	28	51	1830	3	6	20	29	1739	4	6	32	42	1758	1	1	4	6	259	0.0344827586206897	0.142857142857143	0.147326507394767	0.969663541092113	0.0231660231660232	1	0	0	1	262	0.00574712643678161	0.0344827586206897	0.15066129959747	0.228876020005265	0.00381679389312977	0.0344827586206897	6	53	521	2976	0.889502839279695	1	1	0.64672173964216	0.269335082449155	Inf	0.682585640391685	1.9177406087195	0.281300576797039	0.552554704422755	1	2.28413558973228	0.516314779270633	0.960860937289772	1	1	0.476086809469319	0.592074592074592	0.904558404558404	1	168	166	0
"TCGA-D7-6820-01A-11D-1882-08"	0	0	0	0	113	0	0	1	1	112	4592	3	9	4	16	1127	6	7	3	16	1114	9	5	25	39	1179	7	5	29	41	1172	3	1	3	7	161	0.0619469026548673	0.170731707317073	0.137372013651877	1.24284199363733	0.0434782608695652	2	0	4	6	150	0.0530973451327434	0.153846153846154	0.127226463104326	1.20923076923077	0.04	0.106194690265487	12	58	311	2040	0.215334426092136	1	1	1.35694268849921	0.73734022511812	Inf	1.29591180523656	2.36233922829582	0.0513650304332513	0.201791190987773	1	2.97962131107008	0.979933309515303	0.584658083246781	1	1	0.9769524987263	0.695097590523624	0.992996557890891	1	101	100	0
"TCGA-D7-6822-01A-11D-1882-08"	0	0	0	0	277	1	1	4	5	271	11111	11	19	33	63	2805	12	30	43	85	2841	12	9	48	69	2733	6	8	40	54	2732	0	3	6	9	390	0.0324909747292419	0.166666666666667	0.142752562225476	1.16752136752137	0.0230769230769231	3	3	8	14	424	0.0505415162454874	0.202898550724638	0.155140870837907	1.30783429040197	0.0330188679245283	0.0613718411552347	17	89	814	4651	0.413202637870132	1	1	1.09139934809015	0.665984321739267	Inf	1.0767349682444	1.11895986895987	0.515780589573458	0.77197023073343	1	1.14269206316762	1.06809805673442	0.441175057972158	1	1	1.08098670064227	0.00180263699192212	0.00919070908302295	0.396580138222866	260	254	0
"TCGA-D7-8570-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	132	0	0	0	0	132	5412	6	7	1	14	1248	7	1	3	11	1233	18	6	30	54	1458	10	5	38	53	1473	3	0	3	6	179	0.0454545454545455	0.113207547169811	0.121520706042091	0.931590597659956	0.0335195530726257	6	0	1	7	182	0.053030303030303	0.12962962962963	0.12482853223594	1.03846153846154	0.0384615384615385	0.0984848484848485	13	83	361	2570	0.406394161462414	1	1	1.11496441604751	0.629974394995551	Inf	1.09946329639889	2.6097150771666	0.00528130652776855	0.0464754974443632	1	3.36999040370309	0.477594916082777	0.973665346246927	1	1	0.445033023922508	0.115238543930158	0.284859322074548	1	119	119	0
"TCGA-D7-8572-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	194	1	0	0	0	193	7913	6	9	6	21	2053	8	8	8	24	1946	15	11	39	65	1950	9	22	52	83	1964	3	4	3	10	286	0.0515463917525773	0.120481927710843	0.145621181262729	0.827365405678659	0.034965034965035	4	2	5	11	303	0.0567010309278351	0.169230769230769	0.155384615384615	1.08910891089109	0.0363036303630363	0.077319587628866	15	100	589	3325	0.761784420955687	1	1	0.846807605148062	0.502086631884526	Inf	0.866760168302945	1.93817204301075	0.0589939103943519	0.227028667787903	1	2.3238290935287	0.584190003544842	0.971614948739566	1	1	0.544181805791428	1	1	1	179	178	0
"TCGA-D7-8573-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	93	0	0	1	1	91	3731	2	7	5	14	819	2	7	2	11	889	3	1	26	30	989	3	7	26	36	1034	1	2	1	4	127	0.043010752688172	0.111111111111111	0.122823984526112	0.904636920384952	0.031496062992126	1	0	1	2	108	0.021505376344086	0.0666666666666667	0.109201213346815	0.610493827160494	0.0185185185185185	0.043010752688172	4	54	235	1788	0.915324232452649	1	1	0.563720127038904	0.18475564770117	Inf	0.593690388848129	2.86950354609929	0.148557212137143	0.381629062992206	1	3.80030171015407	0.331096563011457	0.986755690248861	1	1	0.304452937942905	1	1	1	89	87	0
"TCGA-D7-8574-01A-13D-2340-08"	0	0	0	0	34	0	0	0	0	34	1394	0	2	0	2	329	0	1	2	3	355	0	2	14	16	347	0	4	9	13	363	0	0	0	0	63	0	0	0.173553719008264	0	0	0	1	0	1	52	0.0294117647058824	0.0625	0.14985590778098	0.417067307692308	0.0192307692307692	0	0	23	115	595	1	1	1	0	0	Inf	0	NA	1	1	1	0	0	1	1	1	0	1	1	1	34	34	0
"TCGA-D7-8576-01A-11D-2340-08"	0	1	0	1	67	0	0	3	3	64	2624	0	4	1	5	617	1	3	2	6	583	3	1	24	28	724	3	4	18	25	700	0	0	1	1	84	0.0149253731343284	0.04	0.12	0.333333333333333	0.0119047619047619	0	0	1	1	92	0.0149253731343284	0.0357142857142857	0.12707182320442	0.281055900621118	0.0108695652173913	0.0298507462686567	2	46	176	1248	0.985499905350016	1	1	0.308461624653011	0.0528190340099145	Inf	0.337121212121212	0	1	1	1	0	0.385281385281385	0.971967537043406	1	1	0.354717289567577	0.333333333333333	0.616246498599439	1	65	62	0
"TCGA-D7-A4YT-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	314	2	3	4	7	305	12505	11	15	15	41	2951	12	15	12	39	2894	27	30	55	112	3329	31	25	57	113	3331	9	6	6	21	439	0.0668789808917197	0.185840707964602	0.131792254578205	1.4101034128248	0.0478359908883827	8	2	9	19	463	0.0605095541401274	0.169642857142857	0.139080805046561	1.21974313483493	0.041036717062635	0.101910828025478	32	138	902	5758	0.0350526998583193	0.701053997166386	1	1.48015194446157	1.03644749643932	Inf	1.38985261510369	2.16415628106124	0.00142371767219734	0.0209752492089579	0.313217887883415	2.64650382186187	0.988873930947102	0.560889590321814	1	1	0.987154793200265	0.819701372337903	1	1	282	273	0
"TCGA-D7-A4YU-01A-21D-A25D-08"	0	0	0	0	259	0	0	2	2	256	10496	8	14	16	38	2369	6	19	21	46	2511	6	13	69	88	2746	15	16	53	84	2870	4	0	2	6	375	0.0231660231660232	0.0714285714285714	0.130662020905923	0.546666666666667	0.016	3	3	5	11	323	0.0424710424710425	0.125	0.117625637290605	1.06269349845201	0.0340557275541796	0.0540540540540541	14	129	698	4918	0.860393818427285	1	1	0.764698105668537	0.448764599505418	Inf	0.787705131544673	2.68194842406877	0.0111001848638575	0.07405436936587	1	3.52143010708743	0.46164685988069	0.995129405855045	1	1	0.428923093325394	1	1	1	245	242	0
"TCGA-D7-A4YV-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	930	2	2	19	21	906	37146	10	49	14	73	8130	9	44	13	66	8274	8	48	338	394	10301	11	44	318	373	10441	2	3	2	7	1169	0.00752688172043011	0.0187667560321716	0.111962455703477	0.16761650960813	0.00598802395209581	0	6	4	10	1169	0.010752688172043	0.0253807106598985	0.113484127754587	0.22364987211943	0.00855431993156544	0.00860215053763441	8	667	2338	18404	1	1	1	0.094417582935023	0.0467512239854233	Inf	0.105145898678833	0.933861600108055	0.648208338426454	0.857055339509616	1	0.926076966298278	0.0811434622045108	1	1	1	0.0726653247157192	0.224503095470837	0.461595149566207	1	922	898	0
"TCGA-D7-A4Z0-01A-22D-A25D-08"	0	0	0	0	330	2	0	0	0	327	13407	15	37	68	120	3405	12	34	80	126	3512	4	3	35	42	3254	6	4	29	39	3236	2	1	0	3	507	0.00909090909090909	0.0769230769230769	0.156674907292954	0.490972538309816	0.00591715976331361	1	1	3	5	537	0.0151515151515152	0.119047619047619	0.165027658266749	0.72137979959209	0.00931098696461825	0.0181818181818182	6	68	1044	5446	0.985147379177219	1	1	0.460322189126004	0.193821270788828	Inf	0.504038521279901	1.86494252873563	0.209220026419497	0.480399412582345	1	2.23528375467423	0.291397270114943	0.998797671526261	1	1	0.256580609645611	1	1	1	324	321	0
"TCGA-EQ-5647-01A-01D-1600-08"	0	0	1	1	103	2	0	0	0	101	4141	3	7	5	15	967	2	8	5	15	1047	2	8	34	44	1043	2	9	16	27	1084	0	1	3	4	157	0.0388349514563107	0.148148148148148	0.144833948339483	1.02288275536683	0.0254777070063694	1	0	8	9	144	0.087378640776699	0.204545454545455	0.138063279002876	1.48153409090909	0.0625	0.116504854368932	12	42	301	1826	0.0756984058622533	1	1	1.73274426271787	0.924822835904802	Inf	1.5703211517165	1.76661129568106	0.457601001195313	0.708959297626541	1	2.02135406472692	1.55461794019934	0.0913902323735742	1	1	1.71054174122897	0.000212680037690134	0.00141786691793423	0.0467896082918295	91	89	0
"TCGA-F1-6177-01A-11D-1800-08"	0	1	0	1	1465	4	50	135	185	1276	52316	4	90	10	104	11569	5	87	11	103	11425	10	58	475	543	14558	11	55	460	526	14764	0	3	7	10	1536	0.0068259385665529	0.0190114068441065	0.104036846383094	0.182737246514575	0.00651041666666667	0	0	8	8	1611	0.00546075085324232	0.0147329650092081	0.11066080505564	0.1331362536338	0.00496585971446307	0.0102389078498294	15	941	3147	26175	1	1	1	0.132588427249974	0.0813718071060221	Inf	0.146194223628002	0	1	1	1	0	0.149477730254941	1	1	1	0.135614884687268	2.93108577675973e-07	6.44838870887141e-06	6.44838870887141e-05	1450	1261	0
"TCGA-F1-6874-01A-11D-1882-08"	0	0	0	0	947	1	11	33	44	902	36982	9	72	11	92	8261	12	60	10	82	8321	7	56	316	379	9991	10	56	283	349	10409	2	7	5	14	1215	0.0147835269271383	0.0401146131805158	0.116725910269959	0.343665027651019	0.011522633744856	2	5	9	16	1143	0.0168954593453009	0.0422163588390501	0.1144029626664	0.369014559195932	0.0139982502187227	0.0190073917634636	18	598	2358	18042	0.999999999999998	1	1	0.230318996580024	0.147699444089957	Inf	0.252800634480024	2.03562340966921	0.125007008423142	0.34376927316364	1	2.35413896027965	0.202202993114054	1	1	1	0.183118392614217	0.0101229709088794	0.0397688142848834	1	929	884	0
"TCGA-F1-6875-01A-11D-2053-08"	0	0	0	0	111	0	0	0	0	111	4551	3	5	5	13	1074	0	13	3	16	1004	5	5	31	41	1212	3	3	35	41	1261	1	1	6	8	154	0.0720720720720721	0.195121951219512	0.122125297383029	1.59771935381691	0.051948051948052	1	0	1	2	154	0.018018018018018	0.0487804878048781	0.127062706270627	0.383908774152677	0.012987012987013	0.0810810810810811	9	65	308	2165	0.584324072862945	1	1	0.973285047286861	0.483676491133019	Inf	0.976526851526851	2.00730519480519	0.263457107269662	0.526914214539324	1	2.3419764143375	0.851584022038568	0.729291766763196	1	1	0.834036430385163	0.0697785186949274	0.194319925479545	1	102	102	0
"TCGA-FP-7735-01A-11D-2053-08"	0	0	0	0	75	0	0	6	6	69	2829	1	2	2	5	686	2	4	1	7	666	4	4	23	31	727	4	2	20	26	750	1	0	3	4	83	0.0533333333333333	0.153846153846154	0.110666666666667	1.39017608897127	0.0481927710843374	2	1	7	10	101	0.133333333333333	0.32258064516129	0.138927097661623	2.32194187160652	0.099009900990099	0.173333333333333	13	38	184	1293	0.00981826955408848	0.308574185985638	1	2.40219089409225	1.29387562788099	Inf	2.04614236999147	3.0101902173913	0.0680861470005828	0.237761148256003	1	4.21020291074307	1.86678463094034	0.0388957196291996	1	1	2.12809027528619	0.0213009078536068	0.0720953804275923	1	62	56	0
"TCGA-FP-7829-01A-11D-2053-08"	0	0	0	0	280	0	2	2	4	276	11316	4	14	12	30	2602	10	9	7	26	2608	6	33	71	110	3030	2	27	81	110	3076	1	8	2	11	384	0.0392857142857143	0.1	0.124837451235371	0.801041666666667	0.0286458333333333	1	8	8	17	359	0.0607142857142857	0.154545454545455	0.118481848184818	1.30438085591289	0.0473537604456825	0.0428571428571429	12	148	743	5363	0.977975090108063	1	1	0.585288264307054	0.329505703580654	Inf	0.616352624495289	2.05450874831763	0.253785172202307	0.512226953068877	1	2.40553011154068	0.540660196925692	0.991269398898652	1	1	0.508356388305061	0.0200300915227592	0.0688534396094848	1	268	264	0
"TCGA-FP-7916-01A-11D-2201-08"	0	0	0	0	121	0	1	1	2	119	4879	2	7	4	13	1134	4	6	5	15	1104	4	8	36	48	1315	3	7	33	43	1326	1	0	3	4	155	0.0330578512396694	0.0930232558139535	0.116892911010558	0.795798949737434	0.0258064516129032	1	1	1	3	150	0.0247933884297521	0.0625	0.114068441064639	0.547916666666667	0.02	0.0495867768595041	6	70	305	2336	0.883406507826294	1	1	0.656574903613827	0.275153148407608	Inf	0.683606557377049	2.47400468384075	0.190325822120809	0.455126965941065	1	3.06164238731838	0.501971964837253	0.963918954959375	1	1	0.471424133169438	0.592074592074592	0.904558404558404	1	115	113	0
"TCGA-FP-7998-01A-11D-2201-08"	0	0	0	0	81	0	0	0	0	81	3321	2	3	1	6	729	2	4	2	8	798	5	6	21	32	901	3	5	27	35	893	1	2	1	4	113	0.0493827160493827	0.114285714285714	0.126539753639418	0.903160556257901	0.0353982300884956	2	0	3	5	106	0.0617283950617284	0.15625	0.117647058823529	1.328125	0.0471698113207547	0.0864197530864197	7	49	219	1575	0.53653886248894	1	1	1.02738575529841	0.455125644106605	Inf	1.02397260273973	3.07191780821918	0.0645232457431037	0.22895345263682	1	4.30978441639667	0.682648401826484	0.851980430313529	1	1	0.653928324349287	1	1	1	74	74	0
"TCGA-FP-8099-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	151	1	1	1	2	148	6068	2	5	1	8	1370	0	7	4	11	1434	3	11	60	74	1617	3	7	45	55	1647	1	1	1	3	212	0.0198675496688742	0.0545454545454545	0.128718882817243	0.423756432246998	0.0141509433962264	0	2	6	8	202	0.0529801324503311	0.108108108108108	0.124922696351268	0.865400053518866	0.0396039603960396	0.0529801324503311	8	103	414	2850	0.975745238143165	1	1	0.534765159181685	0.258104360109831	Inf	0.568220394307351	1.31400966183575	0.55735024321946	0.791109484815235	1	1.37665643964904	0.5256038647343	0.983259842193962	1	1	0.491800502835922	0.0237358101135191	0.0791193670450637	1	143	140	0
"TCGA-FP-8209-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	2	0	0	0	0	2	82	0	0	0	0	15	0	0	1	1	23	0	0	1	1	19	0	0	0	0	25	0	0	0	0	3	0	NA	0.12	NA	0	0	0	0	0	1	0	0	0.0526315789473684	0	0	0	0	1	4	40	1	1	1	0	0	Inf	0	NA	1	1	1	0	0	1	1	1	0	1	1	1	2	2	0
"TCGA-HF-7132-01A-11D-2053-08"	0	0	1	1	1313	3	4	16	20	1289	52849	7	109	19	135	11938	6	76	15	97	11852	6	73	451	530	14364	11	76	440	527	14695	0	5	5	10	1653	0.00761614623000762	0.0189753320683112	0.112487240558013	0.16868875060123	0.00604960677555959	1	7	9	17	1693	0.0129474485910129	0.0320754716981132	0.11786410470621	0.272139442097872	0.0100413467217956	0.0114242193450114	15	893	3346	25713	1	1	1	0.129086533792766	0.0791769446349217	Inf	0.143469683045836	0.510864596884779	0.875021348352542	1	1	0.480303204014666	0.13645990354498	1	1	1	0.122678854932788	0.000129174207928057	0.00101494020514902	0.0284183257441725	1298	1274	0
"TCGA-HF-7133-01A-11D-2053-08"	0	0	0	0	86	0	0	1	1	85	3485	2	4	1	7	753	1	6	2	9	816	2	3	32	37	932	3	7	22	32	984	3	1	1	5	111	0.0581395348837209	0.15625	0.11280487804878	1.38513513513514	0.045045045045045	2	0	0	2	99	0.0232558139534884	0.0540540540540541	0.106223175965665	0.508872508872509	0.0202020202020202	0.0697674418604651	6	53	210	1706	0.639648002944438	1	1	0.919702713838883	0.380555768455214	Inf	0.927845036319613	9.12380952380952	1.68451882578353e-05	0.000529420202389109	0.00370594141672377	Inf	0.168959435626102	0.99798351585153	1	1	0.153353675859282	0.102564102564103	0.259357500736812	1	80	79	0
"TCGA-HF-7136-01A-11D-2053-08"	0	0	0	0	94	0	2	3	5	87	3567	4	2	2	8	843	4	3	4	11	851	0	5	21	26	928	6	14	22	42	945	3	1	1	5	151	0.0531914893617021	0.119047619047619	0.15978835978836	0.745033112582781	0.033112582781457	0	0	2	2	109	0.0212765957446809	0.0769230769230769	0.117456896551724	0.654904728299224	0.018348623853211	0.0638297872340425	6	43	260	1613	0.691671118745691	1	1	0.865724373216411	0.355692760040095	Inf	0.882103610675039	3.60192307692308	0.0391707386911575	0.173736719354115	1	6.19392546505362	0.502593917710197	0.948179021496472	1	1	0.465432223985367	1	1	1	88	81	0
"TCGA-HJ-7597-01A-21D-2201-08"	0	0	0	0	867	1	7	44	51	815	33415	10	70	9	89	7273	6	62	7	75	7367	5	33	320	358	9313	3	22	268	293	9462	1	1	3	5	1061	0.00576701268742791	0.0170648464163823	0.112132741492285	0.152184332508774	0.00471253534401508	0	3	2	5	1009	0.00576701268742791	0.0139664804469274	0.108343176205304	0.128909645591907	0.00495540138751239	0.0069204152249135	6	590	2070	16705	1	1	1	0.0820727345330235	0.0355739890294948	Inf	0.091309211166229	1.13375603864734	0.607330204288957	0.82989220461845	1	1.15284613710836	0.0771262611324723	1	1	1	0.0692152036908615	0.140866873065015	0.336855566025036	1	861	809	0
"TCGA-HU-8243-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	135	0	2	2	4	131	5371	1	5	0	6	1238	4	8	2	14	1260	8	10	38	56	1480	7	4	44	55	1393	3	0	3	6	168	0.0444444444444444	0.109090909090909	0.120603015075377	0.904545454545455	0.0357142857142857	2	2	0	4	188	0.0296296296296296	0.0714285714285714	0.127027027027027	0.562310030395137	0.0212765957446809	0.0592592592592593	8	89	356	2517	0.922939843265151	1	1	0.635609420687907	0.305336031836692	Inf	0.665585543843392	2.69007490636704	0.0306969670411563	0.15175913306477	1	3.53244441396236	0.295252123869553	0.998331369269028	1	1	0.268563725990578	0.649916646820672	0.95275512567721	1	127	123	0
"TCGA-HU-8245-01A-11D-2340-08"	0	0	0	0	69	0	1	1	2	67	2747	2	5	6	13	617	2	5	1	8	621	2	2	18	22	760	2	5	17	24	749	1	1	0	2	83	0.0289855072463768	0.0833333333333333	0.110814419225634	0.752008032128514	0.0240963855421687	0	0	1	1	89	0.0144927536231884	0.0454545454545455	0.117105263157895	0.388151174668029	0.0112359550561798	0.0289855072463768	2	37	172	1337	0.945364907180307	1	1	0.420346110437683	0.0715112795367594	Inf	0.449910554561717	2.19331395348837	0.385048641506047	0.654967541379506	1	2.58878458219801	0.250664451827243	0.985133916694522	1	1	0.228752391706376	1	1	1	67	65	0
"TCGA-HU-8604-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	235	0	0	1	1	233	9553	3	12	11	26	2250	3	14	18	35	2367	6	17	60	83	2359	4	19	66	89	2577	1	5	1	7	331	0.0297872340425532	0.0786516853932584	0.128443927046954	0.612342577820021	0.0211480362537764	1	5	3	9	290	0.0382978723404255	0.108433734939759	0.122933446375583	0.882052347320316	0.0310344827586207	0.025531914893617	6	130	621	4315	0.999621594242081	1	1	0.320745841694141	0.136834040377485	Inf	0.350667803353225	1.58969404186795	0.364864669393174	0.637065295765859	1	1.7368764802037	0.252332387598088	0.99994245183064	1	1	0.227857708535412	0.653936472623903	0.95275512567721	1	229	227	0
"TCGA-HU-8610-01A-22D-2394-08"	0	0	0	0	68	0	0	0	0	68	2788	2	1	3	6	615	1	4	2	7	642	0	4	25	29	752	4	4	18	26	779	1	2	4	7	104	0.102941176470588	0.269230769230769	0.133504492939666	2.01664201183432	0.0673076923076923	0	1	0	1	73	0.0147058823529412	0.0344827586206897	0.0970744680851064	0.355219650448748	0.0136986301369863	0.0735294117647059	5	42	177	1354	0.647265861515793	1	1	0.910716700083633	0.338493127827357	Inf	0.920182714268542	2.16242937853107	0.389532093488317	0.654967541379506	1	2.54780555149126	0.804624885034818	0.747881277222626	1	1	0.78469730417607	0.282051282051282	0.554029304029304	1	63	63	0
"TCGA-HU-A4G2-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	55	0	1	1	2	53	2173	0	3	0	3	483	0	6	1	7	519	0	5	16	21	579	0	3	19	22	592	0	2	2	4	80	0.0727272727272727	0.181818181818182	0.135135135135135	1.34545454545455	0.05	0	1	1	2	69	0.0363636363636364	0.0952380952380952	0.119170984455959	0.799171842650104	0.0289855072463768	0.0545454545454545	3	32	149	1022	0.838962209381711	1	1	0.643239103213453	0.165151386416171	Inf	0.673633748801534	NA	1	1	1	0	0.673633748801534	0.838962209381711	1	1	0.643239103213453	0.181818181818182	0.386401524172421	1	52	50	0
"TCGA-HU-A4GD-01A-11D-A25D-08"	0	1	0	1	97	0	1	1	2	95	3895	4	7	2	13	904	1	6	4	11	897	9	4	25	38	1077	6	5	22	33	1017	0	2	3	5	122	0.0515463917525773	0.151515151515152	0.119960668633235	1.26304023845007	0.040983606557377	1	0	6	7	136	0.0721649484536082	0.184210526315789	0.12627669452182	1.45878482972136	0.0514705882352941	0.103092783505155	10	52	258	1836	0.234466167020427	1	1	1.3682900506192	0.69747022977385	Inf	1.30907726931733	0.541085271317829	0.860881395241	1	1	0.508432916059836	1.55418109846611	0.121989127297121	1	1	1.68493647868854	0.00275945618522009	0.0129312769287418	0.60708036074842	87	85	0
"TCGA-HU-A4GN-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	1253	2	2	7	9	1242	50922	10	88	13	111	11233	8	94	19	121	11497	7	61	451	519	14056	9	66	416	491	14136	1	5	6	12	1628	0.00957701516360734	0.0244399185336049	0.115166949632145	0.212212953557149	0.00737100737100737	1	2	8	11	1630	0.00877893056664006	0.0211946050096339	0.115964712578258	0.182767710438904	0.00674846625766871	0.0127693535514765	16	867	3258	24934	1	1	1	0.141239534891186	0.0881353409791061	Inf	0.156795677440391	1.08164518109269	0.56687431321034	0.798818673267957	1	1.09334094057793	0.139728097211513	1	1	1	0.125613040472576	0.000440288054874629	0.00269064922423384	0.0968633720724184	1237	1226	0
"TCGA-HU-A4GP-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	209	0	1	3	4	204	8364	5	10	5	20	1973	13	11	3	27	1966	6	19	47	72	2246	5	17	63	85	2179	2	3	5	10	287	0.0478468899521531	0.117647058823529	0.131711794401101	0.893215822914532	0.0348432055749129	1	4	3	8	291	0.0382775119617225	0.111111111111111	0.129563668744435	0.857579228713249	0.0274914089347079	0.0526315789473684	11	110	578	3847	0.928062890061875	1	1	0.665623543560206	0.361738921630875	Inf	0.695973576596414	2.08792072978924	0.165679355228702	0.409544473599039	1	2.49515122633783	0.556778861277131	0.980081973699239	1	1	0.522077240425217	0.146353090735738	0.343795870106225	1	198	193	0
"TCGA-HU-A4GQ-01A-11D-A25D-08"	0	0	1	1	1925	1	14	52	66	1856	76096	16	138	11	165	16122	20	128	26	174	16753	8	84	704	796	21332	6	92	623	721	21889	1	7	9	17	2411	0.00883116883116883	0.0235783633841886	0.110146649001782	0.214063374581711	0.00705101617586064	0	9	6	15	2326	0.00779220779220779	0.0188442211055276	0.109038064879055	0.17282240955422	0.00644883920894239	0.00831168831168831	16	1325	4737	38484	1	1	1	0.0981049493974585	0.0612994749422129	Inf	0.108863584736089	0.651723513978105	0.803135500923356	0.998247515271968	1	0.624938923071144	0.103136351119369	1	1	1	0.0928847268580533	7.65739041610025e-05	0.00070192745480919	0.0168462589154205	1909	1840	0
"TCGA-HU-A4GU-01A-11D-A25D-08"	0	0	1	1	1630	2	9	44	53	1575	64575	17	91	46	154	14090	14	94	48	156	14595	6	108	506	620	17775	11	113	521	645	18115	2	10	16	28	2027	0.0171779141104294	0.0434108527131783	0.111896218603367	0.387956387222114	0.0138135175135668	3	14	9	26	2031	0.0159509202453988	0.0419354838709677	0.114261603375527	0.367012912755515	0.0128015755785327	0.0184049079754601	30	1014	4058	31832	1	1	1	0.232083909915602	0.166075669678949	Inf	0.254145352163741	2.60125242802888	0.0357083733806648	0.164952295753023	1	3.26806283452583	0.215293531044259	1	1	1	0.195719744745389	2.70660369922644e-05	0.000270660369922644	0.00595452813829817	1600	1545	0
"TCGA-HU-A4H3-01A-21D-A25D-08"	0	0	0	0	981	0	12	90	102	879	36039	14	61	13	88	8107	4	76	20	100	8189	5	54	291	350	9935	7	59	275	341	9808	1	5	2	8	1149	0.00815494393476045	0.0234604105571848	0.117149265905383	0.200260841379346	0.00696257615317668	0	7	7	14	1186	0.0142711518858308	0.04	0.119375943633619	0.335075885328836	0.0118043844856661	0.0101936799184506	10	568	2335	17408	1	1	1	0.13126071861046	0.0707718150208434	Inf	0.146284537243541	0.704603854389722	0.779220085965603	0.985220798347314	1	0.677761452586245	0.134447378576131	1	1	1	0.120467735838225	0.00934194808273082	0.0373677923309233	1	971	869	0
"TCGA-HU-A4H4-01A-21D-A25D-08"	0	0	0	0	763	0	0	1	1	762	31242	11	130	28	169	7370	18	128	37	183	7500	7	48	155	210	8173	6	44	150	200	8199	2	3	6	11	1081	0.0144167758846658	0.055	0.131845346993536	0.417155411655874	0.0101757631822387	1	2	4	7	1019	0.00917431192660551	0.0333333333333333	0.124678820506546	0.26735361465489	0.00686947988223749	0.0170380078636959	13	305	2100	14272	0.999999965854097	1	1	0.289687073384216	0.169298602876328	Inf	0.318712189278227	1.79912087912088	0.227760780627919	0.491248742530806	1	2.03877860851045	0.255612802498048	0.999999998133695	1	1	0.230391120268374	0.0354150113883151	0.106730171307251	1	750	749	0
"TCGA-HU-A4H5-01A-21D-A25D-08"	0	0	0	0	289	1	0	4	4	284	11644	17	14	13	44	2698	18	14	9	41	2842	35	21	54	110	3008	16	29	44	89	3096	4	3	3	10	409	0.0346020761245675	0.112359550561798	0.132105943152455	0.850526084448229	0.0244498777506112	5	3	6	14	383	0.0484429065743945	0.127272727272727	0.127327127659574	0.999572751008782	0.0365535248041775	0.0622837370242214	18	131	792	5312	0.663052902100058	1	1	0.921578038300944	0.576783618016717	Inf	0.931055521659549	1.36007130124777	0.211981582629392	0.480399412582345	1	1.43712833593609	0.707792207792208	0.901495860824969	1	1	0.678280690595176	1	1	1	271	266	0
"TCGA-HU-A4H6-01A-11D-A25D-08"	0	0	0	0	107	0	0	0	0	107	4387	1	3	4	8	987	3	3	3	9	1011	2	4	41	47	1203	2	5	36	43	1186	1	0	2	3	142	0.0280373831775701	0.0697674418604651	0.11973018549747	0.582705535538814	0.0211267605633803	0	0	0	0	135	0	0	0.112219451371571	0	0	0.0280373831775701	3	78	277	2112	0.996618486096543	1	1	0.293344928897855	0.0778687351586954	Inf	0.319427730980078	2.15613718411552	0.390003399639615	0.654967541379506	1	2.54024144897054	0.224014252895119	0.999075341643933	1	1	0.203395310979036	1	1	1	104	104	0
"TCGA-IN-7806-01A-11D-2053-08"	0	0	0	0	85	0	1	1	2	83	3403	2	5	2	9	794	3	9	1	13	755	0	4	33	37	902	2	7	15	24	952	0	2	5	7	98	0.0823529411764706	0.291666666666667	0.102941176470588	2.83333333333333	0.0714285714285714	0	0	4	4	112	0.0470588235294118	0.108108108108108	0.124168514412417	0.870656370656371	0.0357142857142857	0.105882352941176	9	41	210	1644	0.112035437056603	1	1	1.71787047394363	0.832183892466912	Inf	1.58914285714286	0	1	1	1	0	1.65535714285714	0.0920675285901505	1	1	1.80589859228057	0.000221141088014153	0.00143091292244452	0.0486510393631137	76	74	0
"TCGA-IN-7808-01A-11D-2201-08"	0	0	0	0	124	0	1	0	1	123	5043	2	7	2	11	1156	4	7	5	16	1215	3	9	31	43	1332	7	7	39	53	1340	1	3	1	5	166	0.0403225806451613	0.0943396226415094	0.123880597014925	0.761536712889293	0.0301204819277108	0	1	2	3	157	0.0241935483870968	0.0697674418604651	0.117867867867868	0.591912309287513	0.0191082802547771	0.032258064516129	4	76	323	2349	0.989906919916885	1	1	0.38285383790656	0.126975863824228	Inf	0.413622291021672	0.827244582043344	0.724674462341439	0.92690919601812	1	0.808122040777866	0.35453339230429	0.992813012483464	1	1	0.325720039752862	0.569230769230769	0.888161483906164	1	120	119	0
"TCGA-IN-8462-01A-11D-2340-08"	1	0	0	1	133	0	1	2	3	130	5330	3	6	1	10	1210	2	7	8	17	1289	3	17	32	52	1359	4	12	35	51	1472	0	2	3	5	195	0.037593984962406	0.0980392156862745	0.132472826086957	0.740070387129211	0.0256410256410256	2	2	2	6	182	0.0451127819548872	0.115384615384615	0.13392200147167	0.861580726965342	0.032967032967033	0.0526315789473684	7	67	377	2454	0.87661155389099	1	1	0.680154185960759	0.306377274299747	Inf	0.710337658613521	2.14550966275104	0.237727757748275	0.498096254329719	1	2.60233100159597	0.56039431489766	0.952729604369775	1	1	0.525036607317617	0.361455108359133	0.651804293762371	1	126	123	0
"TCGA-IN-8663-01A-11D-2394-08"	0	0	0	0	193	0	2	1	3	190	7790	4	11	15	30	1769	4	20	22	46	1946	6	9	44	59	2033	8	10	37	55	2042	4	1	3	8	269	0.0414507772020725	0.145454545454545	0.131733594515181	1.10415680973302	0.0297397769516729	0	0	2	2	281	0.0103626943005181	0.0338983050847458	0.138219380226267	0.245250015079317	0.00711743772241993	0.0466321243523316	9	86	550	3525	0.906665368124408	1	1	0.670775642260274	0.337797441995372	Inf	0.701913875598086	2.11688311688312	0.109948112911789	0.322514464541248	1	2.56274418840732	0.457351290684624	0.988435633592089	1	1	0.421713781694024	1	1	1	184	181	0
"TCGA-IP-7968-01A-11D-2201-08"	0	0	0	0	126	0	2	1	3	122	5002	7	6	2	15	1093	2	2	2	6	1163	4	9	36	49	1327	1	3	48	52	1419	0	0	1	1	175	0.00793650793650794	0.0192307692307692	0.123326286116984	0.155934065934066	0.00571428571428571	3	3	3	9	163	0.0714285714285714	0.183673469387755	0.122833458929917	1.49530487041442	0.0552147239263804	0.0555555555555556	7	82	338	2408	0.930547282706135	1	1	0.608258962764294	0.275473853926207	Inf	0.638986769496709	4.87455621301775	0.0155831418896023	0.0889648071039465	1	10.6670717648811	0.386869540715695	0.994032012048049	1	1	0.356301869529803	1	1	1	119	115	0
"Totals"	5	17	26	48	108040	194	506	2420	2926	104797	4296677	1824	10546	3537	15907	1004621	1977	10620	3737	16334	1022396	1601	5255	29705	36561	1129162	1479	5516	29000	35995	1140498	372	1139	1087	2598	145556	0.0240466493891151	0.0721766912071121	0.12762494980263	0.565537469897008	0.017848800461678	432	1041	1118	2591	142734	0.0239818585708997	0.0708678646645333	0.126407016885088	0.560632363699845	0.0181526475822159	0.0278507960014809	3009	58776	288290	1981370	1	NA	NA	0.35184988265065	0.341040909313374	Inf	0.383416115036373	2.05511702907381	6.52682967292057e-89	NA	NA	2.42782785066287	0.295709125593645	1	NA	NA	0.268222856078912	1.8252019464425e-207	NA	NA	105031	101788	NA
