Sample	A_T_coord_clusters	G_C_coord_clusters	Non_coord_clusters	clusters	mutations	complex	insertions	deletions	indels	substitutions	bases	A_to_T	A_to_G	A_to_C	A	a	T_to_A	T_to_C	T_to_G	T	t	G_to_C	G_to_T	G_to_A	G	g	C_to_G	C_to_A	C_to_T	C	c	tCw_to_G	tCw_to_A	tCw_to_T	tCw	tcw	tCw_per_mut	tCw_per_C	tcw_per_c	enrich_tCw	freq_tCw	wGa_to_C	wGa_to_T	wGa_to_A	wGa	wga	wGa_per_mut	wGa_per_G	wga_per_g	enrich_wGa	freq_wGa	[tCw_to_G+tCw_to_T]_per_mut	tCw_to_G+tCw_to_T	[(C_to_G)+(C_to_T)]-[(tCw_to_G)+(tCw_to_T)]	tcw+wga	c-tcw	Fisher_p-value_tCw	odds_ratio_tCw	95%_confidence_lower_tCw	95%_confidence_upper_tCw	APOBEC_enrich	tCw_to_G_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_G	odds_ratio_tCw_to_G	tCw_to_T_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_T	odds_ratio_tCw_to_T	p-value_GvT_skew	non-APOBEC_mutations	non-APOBEC_substitutions
TCGA-B7-5816-01A-21D-1600-08	0	0	0	0	1425	3	1	0	1	1421	58261	12	178	35	225	13591	14	180	32	226	13686	10	63	403	476	15471	11	91	392	494	15513	0	7	8	15	1990	0.0105263157894737	0.0303643724696356	0.12827950750983	0.236704778955506	0.00753768844221105	1	4	12	17	1897	0.0119298245614035	0.0357142857142857	0.122616508305863	0.291268167783719	0.00896151818661044	0.0147368421052632	21	795	3887	27097	1	0.184149813757442	0.122647572844582	Inf	0.205140816295646	0.379580285934801	0.940078032690073	0.348566974548325	0.200532981248574	1	0.179906768881096	3.57808500464659e-07	1404	1400
TCGA-B7-5818-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	464	1	1	3	4	458	18778	15	54	43	112	4788	12	30	64	106	4826	3	9	99	111	4566	6	14	109	129	4598	1	1	20	22	674	0.0474137931034483	0.170542635658915	0.146585471944324	1.16343477560785	0.0326409495548961	1	2	20	23	701	0.0495689655172414	0.207207207207207	0.153526062198861	1.34965493310714	0.0328102710413695	0.0905172413793103	42	175	1375	7789	0.0505350985321841	1.35948348220754	0.999065798513309	Inf	1.28994721407625	1.4810505050505	0.400955037819496	1.61838637112297	1.28167832167832	0.0597374495086445	1.34869537624374	2.85566834197724e-17	422	416
TCGA-BR-4183-01A-02D-1126-08	0	0	0	0	72	0	0	2	2	70	2870	2	4	2	8	638	0	3	3	6	734	1	4	20	25	718	1	3	27	31	780	0	2	0	2	99	0.0277777777777778	0.0645161290322581	0.126923076923077	0.50830889540567	0.0202020202020202	0	0	1	1	86	0.0138888888888889	0.04	0.119777158774373	0.333953488372093	0.0116279069767442	0.0138888888888889	1	48	185	1313	0.998310062581163	0.14795375362516	0.00742498194772708	Inf	0.165250965250965	0	1	0	0.172282921219091	0.997816398459713	0.154385701265406	1	71	69
TCGA-BR-4184-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	4480	7	4	33	37	4433	181753	29	217	35	281	42274	41	224	20	285	42827	12	130	1765	1907	48085	14	127	1819	1960	48567	1	15	16	32	6088	0.00714285714285714	0.0163265306122449	0.125352605678753	0.130244844324063	0.00525624178712221	2	13	17	32	6033	0.00714285714285714	0.0167802831672784	0.125465321825933	0.133744391861194	0.00530416045085364	0.00803571428571428	36	3574	12121	84531	1	0.070247390738661	0.0520656960209577	Inf	0.0795184109627736	0.920068793511579	0.649879992615341	0.909630009289592	0.0734206682322298	1	0.0648105265612863	1.85735630567316e-09	4444	4397
TCGA-BR-4187-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	42	0	0	2	2	40	1640	0	1	1	2	347	0	2	1	3	424	0	2	19	21	412	0	1	13	14	457	0	1	0	1	71	0.0238095238095238	0.0714285714285714	0.155361050328228	0.459758551307847	0.0140845070422535	0	1	1	2	49	0.0476190476190476	0.0952380952380952	0.118932038834951	0.800777453838678	0.0408163265306122	0.0238095238095238	1	31	120	749	0.990926236678485	0.201549896707593	0.00996177856529434	Inf	0.226302083333333	NaN	1	0	0.226302083333333	0.990926236678485	0.201549896707593	1	41	39
TCGA-BR-4188-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	89	1	0	0	0	88	3608	1	6	1	8	801	0	5	1	6	860	2	5	40	47	931	3	1	23	27	1016	1	0	1	2	124	0.0224719101123595	0.0740740740740741	0.122047244094488	0.606929510155317	0.0161290322580645	1	2	1	4	123	0.0449438202247191	0.0851063829787234	0.132116004296455	0.644179207749524	0.032520325203252	0.0449438202247191	4	64	247	1700	0.977957996617494	0.43029393272298	0.141794528278619	Inf	0.463681829006906	3.15303643724696	0.124829321741042	4.58285459150395	0.250240987083092	0.997859726473567	0.225757143028704	1	85	84
TCGA-BR-4191-01A-02D-1126-08	0	0	0	0	221	0	0	5	5	212	8692	10	11	10	31	2070	7	7	7	21	2180	23	21	50	94	2235	18	15	33	66	2207	6	2	6	14	338	0.0633484162895928	0.212121212121212	0.15314907113729	1.38506365429442	0.0414201183431953	3	1	6	10	309	0.0452488687782805	0.106382978723404	0.138255033557047	0.769469117950837	0.0323624595469256	0.0950226244343891	21	103	647	3795	0.26574718291524	1.19581279839206	0.767390224458786	Inf	1.16271127287231	1.50706827006446	0.134819348065904	1.64945744076709	0.992607214018361	0.559315186637326	0.991359348083963	0.561214940972018	200	191
TCGA-BR-4201-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	1403	2	0	14	14	1387	56867	12	113	7	132	13125	16	107	17	140	13260	8	55	506	569	15105	4	49	493	546	15377	0	7	7	14	1890	0.00997861724875267	0.0256410256410256	0.122910840866229	0.208614841948175	0.00740740740740741	1	1	9	11	1857	0.00784034212401996	0.0193321616871705	0.122939424031778	0.157249489652509	0.00592353257942919	0.0121168923734854	17	994	3747	26735	1	0.122031766492886	0.0774198430115725	Inf	0.136791002204995	0.677920113868873	0.792794358598069	0.648648354895011	0.130290952815639	1	0.116138696212673	1.0592858856819e-05	1386	1370
TCGA-BR-4253-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	101	0	0	2	2	99	4059	1	6	11	18	1043	2	6	7	15	1030	6	1	23	30	981	1	5	30	36	1005	0	0	5	5	152	0.0495049504950495	0.138888888888889	0.151243781094527	0.918311403508772	0.0328947368421053	5	0	1	6	157	0.0594059405940594	0.2	0.160040774719674	1.24968152866242	0.0382165605095541	0.108910891089109	11	49	309	1677	0.331860237721443	1.21819680233351	0.63928072534887	Inf	1.17831715210356	4.59084604715673	0.00150443101323394	13.5388999510022	0.727605788605972	0.851077417747082	0.692944264643807	1	90	88
TCGA-BR-4255-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	70	0	0	0	0	70	2870	3	4	4	11	721	1	8	1	10	706	1	2	21	24	687	2	2	21	25	756	1	1	1	3	112	0.0428571428571429	0.12	0.148148148148148	0.81	0.0267857142857143	0	1	1	2	105	0.0285714285714286	0.0833333333333333	0.152838427947598	0.545238095238095	0.019047619047619	0.0428571428571429	3	42	217	1226	0.972853788197045	0.403733064116696	0.105171818169113	Inf	0.44331797235023	2.21658986175115	0.387748205893032	2.82212434115892	0.316655694535879	0.990557205319601	0.282643418700875	1	67	67
TCGA-BR-4256-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	1083	0	1	2	3	1079	44239	9	107	24	140	10631	17	122	24	163	10472	6	47	330	383	11349	9	64	320	393	11787	1	4	8	13	1522	0.0120036934441367	0.0330788804071247	0.129125307542208	0.256176585649657	0.00854139290407359	1	6	15	22	1591	0.0203139427516159	0.0574412532637076	0.140188562868975	0.409742792765441	0.0138277812696417	0.023084025854109	25	640	3113	20023	1	0.251260895812764	0.173265227543681	Inf	0.279400718307172	0.990941214262769	0.618726216283723	0.989547738747345	0.262980553015889	1	0.235953062620047	1.58396584349755e-07	1058	1054
TCGA-BR-4257-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	1193	0	3	38	41	1152	47232	11	147	21	179	11177	17	123	17	157	11176	5	58	326	389	12351	7	69	351	427	12528	0	9	5	14	1592	0.0117351215423303	0.0327868852459016	0.127075351213282	0.258011368316995	0.00879396984924623	0	5	4	9	1644	0.00754400670578374	0.0231362467866324	0.133106631042021	0.173817386898842	0.00547445255474453	0.00754400670578374	9	680	3236	21643	1	0.0885238913681827	0.0459663342810401	Inf	0.100426353738153	0	1	0	0.102206436817706	1	0.0901141332324584	0.00148348531785854	1184	1143
TCGA-BR-4267-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	104	1	0	1	1	102	4182	5	7	8	20	1076	4	3	4	11	1011	12	8	15	35	1053	14	3	19	36	1042	4	1	1	6	132	0.0576923076923077	0.166666666666667	0.126679462571977	1.31565656565657	0.0454545454545455	3	2	1	6	159	0.0576923076923077	0.171428571428571	0.150997150997151	1.13530997304582	0.0377358490566038	0.0865384615384615	9	51	291	1804	0.460553748915529	1.09397636468883	0.537751395704875	Inf	1.07989690721649	1.93827650013217	0.0613232457116286	2.28279363643739	0.423488983222155	0.959278625679937	0.387578903558839	0.0893794588773726	95	93
TCGA-BR-4279-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	61	0	0	0	0	61	2501	1	8	1	10	565	2	2	2	6	602	4	4	19	27	704	3	1	14	18	630	1	0	0	1	89	0.0163934426229508	0.0555555555555556	0.141269841269841	0.393258426966292	0.0112359550561798	1	2	0	3	80	0.0491803278688525	0.111111111111111	0.113636363636364	0.977777777777778	0.0375	0.0327868852459016	2	38	169	1165	0.968902267861633	0.363000635515797	0.0617806500017522	Inf	0.394674556213018	2.2552831783601	0.221165579566252	2.75445510185122	0	1	0	0.428571428571429	59	59
TCGA-BR-4280-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	839	2	11	88	99	738	30258	6	110	34	150	7122	7	92	34	133	6991	11	41	169	221	7992	5	54	175	234	8153	1	1	3	5	1016	0.00595947556615018	0.0213675213675214	0.124616705507175	0.171465946564372	0.00492125984251968	1	2	4	7	1018	0.00834326579261025	0.0316742081447964	0.127377377377377	0.24866431384402	0.0068762278978389	0.0107270560190703	9	351	2034	14111	0.999999999998177	0.177896172383136	0.0919995507257598	Inf	0.198439036381514	0.992195181907571	0.616718258871066	0.991080596859066	0.16152014589193	0.999999999999752	0.144112145726821	0.0893794588773726	830	729
TCGA-BR-4292-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	1506	2	15	99	114	1390	56990	14	79	23	116	12814	16	85	22	123	12874	9	61	483	553	15583	7	59	532	598	15719	1	2	4	7	1808	0.00464807436918991	0.0117056856187291	0.115020039442713	0.101770836416373	0.0038716814159292	1	7	6	14	1750	0.00929614873837981	0.0253164556962025	0.112301867419624	0.225432188065099	0.008	0.00796812749003984	12	1019	3558	27744	1	0.0918299111795824	0.0527849036887773	Inf	0.102397351578307	1.09970489038786	0.55737259157437	1.11391718295584	0.0866762475182548	1	0.0775909921084415	0.0147893763157335	1494	1378
TCGA-BR-4294-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	35	1	0	0	0	34	1394	1	1	1	3	337	3	1	0	4	369	2	3	10	15	360	2	2	8	12	328	0	0	1	1	49	0.0285714285714286	0.0833333333333333	0.149390243902439	0.557823129251701	0.0204081632653061	0	0	2	2	40	0.0571428571428571	0.133333333333333	0.111111111111111	1.2	0.05	0.0857142857142857	3	19	89	599	0.559330589886853	1.06260692719263	0.262521090042795	Inf	1.05413687436159	0	1	0	1.28838951310861	0.423004172600244	1.34543726562656	0.1	32	31
TCGA-BR-4357-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	291	2	0	1	1	286	11726	11	29	21	61	2964	13	19	23	55	3052	18	18	42	78	2871	19	25	48	92	2839	14	4	11	29	449	0.0996563573883162	0.315217391304348	0.158154279675942	1.99310061005132	0.0645879732739421	10	4	5	19	446	0.0652920962199313	0.243589743589744	0.155346569139673	1.56804070369093	0.0426008968609865	0.13745704467354	40	87	895	4815	8.76608783928744e-06	2.47295404294277	1.75424967939176	Inf	2.0094136277658	4.13830590366903	2.60868464531619e-11	9.92401783637953	1.13420235878336	0.335376094936377	1.16315616522059	0.146894599045387	251	246
TCGA-BR-4361-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	3205	4	14	96	110	3091	126731	57	641	37	735	30186	64	643	33	740	30499	29	87	686	802	33244	16	89	709	814	32802	4	8	32	44	4243	0.0137285491419657	0.0540540540540541	0.129351868788489	0.417883827735348	0.010370021211407	2	5	24	31	4284	0.00967238689547582	0.0386533665835411	0.128865359162556	0.299951568324753	0.00723622782446312	0.0193447737909516	62	1378	8527	57519	1	0.303502231489521	0.241623990631445	Inf	0.333487419047991	1.03273523318088	0.532678517326978	1.03777783533171	0.310931037946931	1	0.282115620614946	1.21467229604863e-17	3143	3029
TCGA-BR-4362-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	1844	2	4	37	41	1800	73800	27	247	49	323	17107	30	279	73	382	17594	13	68	468	549	19517	14	53	479	546	19582	2	3	11	16	2573	0.00867678958785249	0.0293040293040293	0.131396180165458	0.223020404909251	0.00621842207539837	1	7	3	11	2461	0.00596529284164859	0.0200364298724954	0.126095199057232	0.158899228696259	0.00446972775294596	0.00921908893709327	17	957	5034	34065	1	0.120210682720919	0.0762644765277018	Inf	0.135563384590534	0.862998278373725	0.693747592800685	0.845898644543822	0.114823424577708	1	0.101543650665318	0.0027625909802312	1827	1783
TCGA-BR-4363-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	589	0	6	43	49	539	22099	5	45	8	58	5018	7	65	14	86	4923	2	27	166	195	6133	3	19	178	200	6025	0	2	0	2	670	0.0033955857385399	0.01	0.111203319502075	0.0899253731343284	0.00298507462686567	0	1	2	3	713	0.00509337860780985	0.0153846153846154	0.116256318278167	0.132333585068508	0.00420757363253857	0.0033955857385399	2	347	1383	10775	1	0.0448981869219979	0.00795369329653066	Inf	0.0503784182469487	0	1	0	0.0511106626982125	1	0.0455558697888215	0.444444444444444	587	537
TCGA-BR-4366-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	163	2	0	0	0	161	6601	3	13	9	25	1567	2	13	13	28	1579	13	5	39	57	1735	11	9	31	51	1720	2	2	1	5	215	0.0306748466257669	0.0980392156862745	0.125	0.784313725490196	0.0232558139534884	6	1	4	11	203	0.0674846625766871	0.192982456140351	0.11700288184438	1.64938207587935	0.0541871921182266	0.0797546012269939	13	81	418	3037	0.351808796848724	1.16600524607292	0.659080258298001	Inf	1.14310801180902	2.75518341307815	0.00584735757592756	3.63088378130845	0.590396445659604	0.935434054506982	0.55896381978365	0.472547597169157	150	148
TCGA-BR-4368-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	1463	4	1	26	27	1431	58671	17	134	10	161	13198	12	121	14	147	13470	15	49	470	534	15789	10	81	498	589	16214	1	7	14	22	1909	0.0150375939849624	0.0373514431239389	0.117737757493524	0.317242691886613	0.0115243583027763	5	5	6	16	1823	0.0109364319890636	0.0299625468164794	0.115460130470581	0.259505568669991	0.00877674163466813	0.0177717019822283	26	967	3732	28271	1	0.203684512621812	0.141922363582732	Inf	0.224529369034474	2.05807073954984	0.0633922919769579	2.39209625461267	0.177175511324883	1	0.159820924061314	0.00141716780471384	1437	1405
TCGA-BR-4369-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	205	0	0	1	1	203	8323	5	12	13	30	2011	7	11	29	47	1995	6	7	52	65	2138	7	8	46	61	2179	4	4	3	11	293	0.0536585365853659	0.180327868852459	0.134465351078476	1.34107312706317	0.037542662116041	2	1	7	10	289	0.0487804878048781	0.153846153846154	0.135173058933583	1.13814213468193	0.0346020761245675	0.0780487804878049	16	95	582	3735	0.43047819363576	1.08084928918307	0.650315789043194	Inf	1.06919290424445	3.42347343378271	0.00449477698090235	5.49724432295181	0.756890385019987	0.864566924992368	0.729311637434333	0.340791997944932	189	187
TCGA-BR-4370-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	1163	1	0	3	3	1159	47519	10	50	10	70	10336	7	74	9	90	10650	5	42	440	487	13241	8	46	458	512	13292	0	5	8	13	1523	0.0111779879621668	0.025390625	0.114580198615709	0.221596971437951	0.00853578463558766	2	5	9	16	1341	0.0137575236457438	0.0328542094455852	0.101276338645117	0.324401631073075	0.0119313944817301	0.0163370593293207	19	892	2864	23669	1	0.176039535984678	0.114610695998338	Inf	0.193218438207139	1.42527932960894	0.417279210056256	1.50256679900267	0.1753823673962	1	0.159475820686989	4.66438924069604e-05	1144	1140
TCGA-BR-4371-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	185	0	0	0	0	185	7585	2	8	5	15	1732	1	7	4	12	1763	5	8	56	69	2073	2	11	76	89	2017	1	4	3	8	248	0.0432432432432432	0.0898876404494382	0.122954883490332	0.73106197897789	0.032258064516129	1	2	6	9	272	0.0486486486486487	0.130434782608696	0.131210805595755	0.994085677749361	0.0330882352941176	0.0594594594594595	11	128	520	3570	0.971136284977453	0.590056502374848	0.321636344542042	Inf	0.622440509131157	2.24725274725275	0.221038064024969	2.74519781941028	0.536276223776224	0.989236444921286	0.502410974140499	0.0255098257322952	174	174
TCGA-BR-6452-01A-12D-1800-08	0	0	0	0	8496	29	4	22	26	8435	345835	363	1428	157	1948	83444	368	1444	162	1974	85910	43	434	1827	2304	87549	71	474	1664	2209	88932	8	49	89	146	12418	0.0171845574387947	0.0660932548664554	0.13963477713309	0.473329468657079	0.0117571267514898	11	38	92	141	11913	0.0165960451977401	0.0611979166666667	0.136072370900867	0.449745354339797	0.0118358096197431	0.0235404896421846	200	3405	24331	152150	1	0.36730377551189	0.324381053096737	Inf	0.402404402846525	1.20888989355144	0.220641558307568	1.25066200174614	0.376068296876786	1	0.341950555099116	5.60438552378208e-50	8296	8235
TCGA-BR-6453-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	227	1	0	0	0	226	9266	7	16	31	54	2314	4	22	36	62	2323	2	7	47	56	2302	3	3	48	54	2327	0	0	5	5	327	0.0220264317180617	0.0925925925925926	0.140524280189085	0.658908143617624	0.0152905198776758	0	1	4	5	320	0.0220264317180617	0.0892857142857143	0.139009556907037	0.642299107142857	0.015625	0.039647577092511	9	91	647	3982	0.948915227235361	0.608747933222751	0.307285416317386	Inf	0.643910355486862	0	1	0	0.677800374196697	0.926435235905331	0.644134514822468	0.000119075970469159	218	217
TCGA-BR-6454-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	170	0	1	2	3	167	6847	4	13	11	28	1599	14	7	7	28	1618	9	10	35	54	1789	10	10	37	57	1841	4	2	3	9	219	0.0529411764705882	0.157894736842105	0.118957088538838	1.32732516222062	0.0410958904109589	4	6	4	14	232	0.0823529411764706	0.259259259259259	0.129681386249301	1.99920178799489	0.0603448275862069	0.0882352941176471	15	76	451	3179	0.159222659561827	1.39106454177297	0.815497272211828	Inf	1.32672205842938	3.38896020539153	0.00125632417863255	5.12266307641121	0.782520325203252	0.805184239164383	0.759150903828544	1	155	152
TCGA-BR-6455-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	112	0	1	0	1	111	4551	2	4	1	7	999	0	6	1	7	1030	2	4	53	59	1205	1	8	29	38	1317	0	1	2	3	157	0.0267857142857143	0.0789473684210526	0.11921032649962	0.662252765672142	0.0191082802547771	1	0	2	3	128	0.0267857142857143	0.0508474576271186	0.106224066390041	0.478681144067797	0.0234375	0.0446428571428571	5	80	285	2237	0.968437106194136	0.490674456217244	0.187171520413791	Inf	0.520536635706914	2.94970760233918	0.302872561995162	3.92076469288985	0.431664527171587	0.985909889630364	0.402619189025356	0.242424242424242	107	106
TCGA-BR-6456-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	50	0	0	2	2	47	1927	2	3	1	6	469	0	4	3	7	466	1	7	12	20	511	2	4	8	14	481	1	0	1	2	69	0.04	0.142857142857143	0.143451143451143	0.995859213250518	0.0289855072463768	0	2	1	3	57	0.06	0.15	0.111545988258317	1.34473684210526	0.0526315789473684	0.06	3	20	126	866	0.576092504467887	1.03092562718191	0.257048020533098	Inf	1.02691511387164	2.62433862433862	0.33641279885663	3.42995642760998	0.787301587301587	0.742303823014197	0.763853350106446	1	47	44
TCGA-BR-6457-01A-21D-1800-08	0	0	0	0	145	0	0	0	0	144	5904	7	7	10	24	1393	2	10	15	27	1485	2	8	35	45	1485	3	9	36	48	1541	1	2	4	7	211	0.0482758620689655	0.145833333333333	0.136924075275795	1.06506714060032	0.033175355450237	0	5	1	6	197	0.0413793103448276	0.133333333333333	0.132659932659933	1.00507614213198	0.0304568527918782	0.0413793103448276	6	70	408	2618	0.952232440265872	0.550087453191457	0.230968752463476	Inf	0.585526315789474	1.48333333333333	0.515816472353701	1.60386225220857	0.522300469483568	0.969588579932564	0.486200456954595	0.160248447204969	139	138
TCGA-BR-6458-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	342	1	1	1	2	339	13899	11	24	70	105	3423	10	35	61	106	3536	12	7	49	68	3500	4	9	47	60	3440	2	2	2	6	528	0.0175438596491228	0.1	0.153488372093023	0.651515151515151	0.0113636363636364	5	1	5	11	512	0.0321637426900585	0.161764705882353	0.146285714285714	1.10581341911765	0.021484375	0.0409356725146199	14	98	1040	5900	0.804608428498132	0.810462476121773	0.472787699370306	Inf	0.834134615384615	2.91947115384615	0.00563884366887349	4.41124123757681	0.486578525641026	0.992547614469899	0.446233624515581	1	328	325
TCGA-BR-6563-01A-13D-2053-08	0	0	0	0	92	0	0	0	0	92	3772	2	6	7	15	921	3	6	6	15	918	3	1	26	30	922	0	4	28	32	1011	0	2	1	3	125	0.0326086956521739	0.09375	0.123639960435213	0.75825	0.024	0	0	1	1	123	0.0108695652173913	0.0333333333333333	0.133405639913232	0.249864498644986	0.00813008130081301	0.0217391304347826	2	55	248	1685	0.996004408148604	0.247172748977885	0.0426359102454761	Inf	0.273486134691568	0	1	0	0.288679808841099	0.994302974830077	0.261430358549313	0.428571428571429	90	90
TCGA-BR-6564-01A-12D-1882-08	0	0	0	0	42	0	0	0	0	42	1722	2	4	0	6	404	1	1	1	3	399	3	2	14	19	473	0	2	12	14	446	0	0	1	1	55	0.0238095238095238	0.0714285714285714	0.123318385650224	0.579220779220779	0.0181818181818182	2	1	1	4	54	0.0952380952380952	0.210526315789474	0.114164904862579	1.84405458089669	0.0740740740740741	0.0952380952380952	4	25	109	810	0.461444324202318	1.18874841393184	0.37236644765136	Inf	1.16292312559317	5.62079510703364	0.0397294754941521	14.7785555858932	0.648553281580804	0.830766064802087	0.619530523670405	1	38	38
TCGA-BR-6565-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	167	0	0	0	0	165	6765	4	13	7	24	1631	0	9	6	15	1629	22	8	36	66	1747	11	11	38	60	1758	3	3	0	6	241	0.0359281437125748	0.1	0.137087599544937	0.729460580912863	0.024896265560166	7	1	2	10	232	0.0598802395209581	0.151515151515152	0.132799084144247	1.14093521421108	0.0431034482758621	0.0718562874251497	12	95	473	3032	0.792442099365911	0.809747255295325	0.449826869543256	Inf	0.831044634565608	2.24549939137677	0.0100317083574064	2.78589552061586	0.200274270041712	0.999702699846329	0.178106309612145	0.00914703938353406	155	153
TCGA-BR-6566-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	1049	1	0	13	13	1034	42394	11	100	35	146	9466	7	108	24	139	9872	6	55	316	377	11446	12	68	292	372	11610	1	2	6	9	1327	0.00857959961868446	0.0241935483870968	0.114298018949182	0.211670758684396	0.00678221552373775	0	5	3	8	1339	0.00762631077216397	0.0212201591511936	0.116984099248646	0.181393533715132	0.00597460791635549	0.00953288846520496	10	616	2666	20390	1	0.124163684868489	0.0669830746651319	Inf	0.138149553362782	0.480453446695007	0.890494378503127	0.449902978852401	0.128015556520709	1	0.114918838012362	0.00659992584352986	1039	1024
TCGA-BR-6705-01A-12D-1882-08	0	0	0	0	123	0	0	0	0	122	5002	5	10	5	20	1187	3	7	7	17	1295	8	8	27	43	1224	6	3	33	42	1296	3	1	3	7	190	0.0569105691056911	0.166666666666667	0.146604938271605	1.13684210526316	0.0368421052631579	2	2	3	7	161	0.0569105691056911	0.162790697674419	0.131535947712418	1.2376137512639	0.0434782608695652	0.0894308943089431	11	63	351	2169	0.461095046101135	1.07894615240647	0.573721002843508	Inf	1.06722106722107	2.56410256410256	0.0359895918006595	3.43063145771378	0.717948717948718	0.857535593548637	0.686698533596925	1	112	111
TCGA-BR-6706-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	261	0	0	0	0	260	10660	6	41	41	88	2676	7	37	47	91	2682	3	7	32	42	2668	2	2	35	39	2634	0	0	4	4	400	0.0153256704980843	0.102564102564103	0.151860288534548	0.675384615384615	0.01	1	1	3	5	396	0.0191570881226054	0.119047619047619	0.148425787106447	0.802068302068302	0.0126262626262626	0.0306513409961686	8	64	796	4506	0.864052728660293	0.707642024388596	0.337822561616237	Inf	0.740089335566723	1.3321608040201	0.55690937015412	1.41509364165323	0.695904897622441	0.892270921227104	0.660472767483118	0.0152200740436034	253	252
TCGA-BR-6707-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	82	0	0	1	1	81	3321	0	2	0	2	793	3	8	0	11	825	1	6	24	31	861	2	6	29	37	842	0	0	1	1	109	0.0121951219512195	0.027027027027027	0.129453681710214	0.208777584924374	0.00917431192660551	0	5	4	9	105	0.109756097560976	0.290322580645161	0.121951219512195	2.38064516129032	0.0857142857142857	0.0609756097560976	5	51	214	1489	0.846613106924227	0.682281731642226	0.256082220677205	Inf	0.710530707610147	0	1	0	0.750749426908834	0.810928243415531	0.724904934619343	0.0325077399380805	77	76
TCGA-BR-6801-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	60	0	0	3	3	57	2337	0	4	0	4	546	1	1	0	2	522	3	1	19	23	637	2	3	23	28	632	0	1	3	4	82	0.0666666666666667	0.142857142857143	0.129746835443038	1.10104529616725	0.0487804878048781	3	0	2	5	74	0.0833333333333333	0.217391304347826	0.116169544740973	1.87132784958872	0.0675675675675676	0.133333333333333	8	39	156	1113	0.222626704728511	1.46302402294152	0.673568202680359	Inf	1.38461538461538	4.88076923076923	0.0157710339866087	10.6627275760134	0.968406593406593	0.60278085417907	0.964160301242879	0.637186343068696	52	49
TCGA-BR-6802-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	535	1	1	2	3	531	21771	8	45	11	64	4904	7	41	7	55	5008	3	26	190	219	5832	3	25	165	193	6027	1	5	3	9	721	0.0168224299065421	0.0466321243523316	0.119628339140534	0.389808340459782	0.0124826629680999	1	1	1	3	675	0.00560747663551402	0.0136986301369863	0.115740740740741	0.118356164383562	0.00444444444444444	0.011214953271028	6	355	1396	10463	0.999999999999908	0.126686141609594	0.0547351184226687	Inf	0.141190897618046	2.83166189111748	0.150916947637827	3.74683498222702	0.0957181484321401	0.999999999999998	0.0854202956934916	0.64040536122916	529	525
TCGA-BR-6803-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	22	0	0	1	1	21	861	0	2	1	3	216	0	0	0	0	211	1	4	8	13	202	1	1	3	5	232	0	0	0	0	33	0	0	0.142241379310345	0	0	1	0	0	1	24	0.0454545454545455	0.0769230769230769	0.118811881188119	0.647435897435897	0.0416666666666667	0.0454545454545455	1	12	57	377	0.840111885430627	0.551765897650437	0.0257357555448368	Inf	0.585695006747638	3.80701754385965	0.248623853211009	6.56546117895507	0	1	0	1	21	20
TCGA-BR-6852-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	1220	2	2	8	10	1206	49446	12	99	31	142	10816	15	105	32	152	11276	3	71	370	444	13647	12	71	385	468	13707	2	6	5	13	1567	0.010655737704918	0.0277777777777778	0.114321149777486	0.242980216975112	0.00829610721123165	0	6	5	11	1488	0.00901639344262295	0.0247747747747748	0.109034952736865	0.227218650101715	0.00739247311827957	0.00983606557377049	12	758	3055	24299	1	0.125922833640167	0.072286699931975	Inf	0.13954045954046	1.19384615384615	0.511693504779032	1.22365801074189	0.118593988792664	1	0.106766886302043	0.0173369017336625	1208	1194
TCGA-BR-7196-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	84	0	0	1	1	83	3403	4	2	3	9	813	4	5	4	13	795	4	2	28	34	860	7	7	13	27	935	1	2	2	5	121	0.0595238095238095	0.185185185185185	0.129411764705882	1.43097643097643	0.0413223140495868	2	0	1	3	111	0.0357142857142857	0.0882352941176471	0.12906976744186	0.68362480127186	0.027027027027027	0.0714285714285714	6	46	232	1563	0.679071209816425	0.878831249990676	0.361818819955663	Inf	0.892738726790451	2.11010971786834	0.163012949130498	2.52454992797603	0.566126997476871	0.912564533689972	0.532020880224251	1	78	77
TCGA-BR-7197-01A-11D-2201-08	0	0	0	0	191	1	1	0	1	189	7749	5	9	16	30	1820	8	14	25	47	1973	4	3	54	61	1974	3	10	38	51	1982	2	2	4	8	301	0.0418848167539267	0.156862745098039	0.151866801210898	1.03289687968211	0.026578073089701	2	0	3	5	250	0.0261780104712042	0.0819672131147541	0.126646403242148	0.647213114754098	0.02	0.0575916230366492	11	88	551	3405	0.827973900251658	0.772504711312426	0.417130110165363	Inf	0.797741480137124	4.10267046927664	0.0093783735868962	8.23167308064597	0.546279491833031	0.978004184304567	0.508983226947375	0.428307982231794	180	178
TCGA-BR-7703-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	794	1	6	36	42	751	30791	3	55	10	68	6790	7	61	7	75	7110	5	40	289	334	8364	8	37	229	274	8527	2	8	4	14	1013	0.017632241813602	0.0510948905109489	0.118799108713498	0.430094897716546	0.0138203356367226	2	2	3	7	970	0.00881612090680101	0.0209580838323353	0.115973218555715	0.18071485894191	0.00721649484536083	0.0138539042821159	11	520	1983	14908	1	0.159041230334124	0.0885523274702014	Inf	0.176453717236814	2.62089297490205	0.0570108348676275	3.34070565523196	0.115106786059887	1	0.102991040384939	0.484077886516911	783	740
TCGA-BR-7707-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	1588	1	10	26	36	1550	63550	18	181	34	233	14321	11	161	32	204	14613	7	77	475	559	17180	12	72	470	554	17436	2	2	11	15	2008	0.00944584382871537	0.0270758122743682	0.115164028446891	0.235106505386397	0.00747011952191235	0	6	10	16	2037	0.0100755667506297	0.0286225402504472	0.118568102444703	0.241401689495672	0.0078546882670594	0.0144836272040302	23	941	4045	30571	1	0.184731264907499	0.125537296215412	Inf	0.204178100108222	0.900813219699434	0.668593041410864	0.889130829586213	0.190171679714325	1	0.171770961699386	7.12372401949819e-07	1565	1527
TCGA-BR-7715-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	163	0	0	6	6	157	6437	3	16	10	29	1593	0	12	9	21	1499	5	8	37	50	1705	1	9	47	57	1640	0	1	1	2	218	0.0122699386503067	0.0350877192982456	0.132926829268293	0.26396265894093	0.00917431192660551	2	1	3	6	222	0.0368098159509202	0.12	0.130205278592375	0.921621621621622	0.027027027027027	0.0368098159509202	6	84	440	2905	0.982739076837195	0.471671569689682	0.19913492999106	Inf	0.506818181818182	2.53409090909091	0.181750670244076	3.29943276136431	0.362012987012987	0.996751023971836	0.330184748107614	0.608391608391609	157	151
TCGA-BR-7716-01A-21D-2053-08	0	0	0	0	185	1	0	1	1	182	7462	4	11	5	20	1970	9	8	4	21	1825	24	11	43	78	1852	15	15	33	63	1815	11	6	8	25	277	0.135135135135135	0.396825396825397	0.152617079889807	2.60013752793536	0.0902527075812274	17	7	19	43	321	0.232432432432432	0.551282051282051	0.173326133909287	3.1806054796709	0.133956386292835	0.297297297297297	55	60	598	3069	1.40072572012281e-14	4.7017792075991	3.36518147241265	Inf	2.9327468372837	4.40253837578252	3.64188008535002e-14	13.0491372031825	2.17851170568562	4.72476311950803e-05	2.8266268341127	1	130	127
TCGA-BR-7717-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	163	0	0	1	1	160	6560	6	8	7	21	1536	6	12	9	27	1606	9	6	47	62	1672	9	3	38	50	1746	2	0	3	5	259	0.0306748466257669	0.1	0.148339060710195	0.674131274131274	0.0193050193050193	3	0	4	7	243	0.0429447852760736	0.112903225806452	0.145334928229665	0.776848533120935	0.0288065843621399	0.0736196319018405	12	91	502	2916	0.842076656075629	0.766044862890477	0.425130672696496	Inf	0.79325416779484	1.89132359451085	0.113685435289185	2.23346608289958	0.560721818607921	0.97336341949335	0.52137948064584	0.684272652909078	151	148
TCGA-BR-7722-01A-31D-2201-08	0	0	0	0	60	1	1	2	3	56	2296	1	3	2	6	516	2	5	1	8	573	1	4	15	20	604	3	0	19	22	603	1	0	1	2	85	0.0333333333333333	0.0909090909090909	0.140961857379768	0.644919786096257	0.0235294117647059	0	0	2	2	79	0.0333333333333333	0.1	0.130794701986755	0.764556962025317	0.0253164556962025	0.0666666666666667	4	34	164	1043	0.777086040837063	0.748364989176984	0.239878991203699	Inf	0.774711168164313	1.83993902439024	0.443826831332959	2.11823538067289	0.649390243902439	0.857877476723424	0.615664806377128	0.485714285714286	56	52
TCGA-BR-7723-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	189	0	0	1	1	187	7667	11	20	19	50	1904	8	21	10	39	1903	4	8	38	50	1996	4	10	34	48	1864	0	2	6	8	244	0.0423280423280423	0.166666666666667	0.130901287553648	1.27322404371585	0.0327868852459016	1	2	1	4	300	0.0211640211640212	0.08	0.150300601202405	0.532266666666667	0.0133333333333333	0.0423280423280423	8	72	544	3316	0.890563633596214	0.6773471838251	0.324170785287443	Inf	0.709558823529412	0.886948529411765	0.703629704067385	0.870850775737869	0.68984885620915	0.89567720943985	0.656509803029646	0.0271907389958272	181	179
TCGA-BR-7851-01A-11D-2201-08	0	0	0	0	1651	4	12	68	80	1566	64206	18	127	12	157	14274	17	122	10	149	14434	5	82	565	652	17790	8	77	523	608	17708	1	5	10	16	2005	0.00969109630526953	0.0263157894736842	0.113225660718319	0.232418952618454	0.00798004987531172	0	3	7	10	2054	0.00605693519079346	0.0153374233128834	0.115458122540753	0.13283970824547	0.00486854917234664	0.0109024833434282	18	1083	4059	31439	1	0.128737608059603	0.0828458298884472	Inf	0.142978264065524	0.672731062974965	0.793743778040495	0.645465659964209	0.13664849716679	1	0.122947849277511	3.88079391298207e-06	1633	1548
TCGA-BR-7901-01A-11D-2201-08	0	0	0	0	233	0	1	0	1	231	9471	12	21	10	43	2310	15	22	20	57	2387	15	6	42	63	2358	8	11	49	68	2416	4	2	7	13	383	0.055793991416309	0.191176470588235	0.158526490066225	1.20595914606051	0.0339425587467363	3	2	6	11	329	0.0472103004291846	0.174603174603175	0.139525021204411	1.25141120277898	0.033434650455927	0.0858369098712446	20	94	712	4062	0.253971606039372	1.21376924703541	0.76898176378335	Inf	1.17632564557461	2.04066927210552	0.0457313308950777	2.49532685061289	0.957865168539326	0.611898558576983	0.950843368806741	0.142453803288567	213	211
TCGA-BR-7957-01A-11D-2201-08	0	0	0	0	59	1	0	0	0	58	2378	1	1	2	4	545	3	4	0	7	565	2	3	16	21	590	2	4	20	26	678	0	0	1	1	83	0.0169491525423729	0.0384615384615385	0.122418879056047	0.314179796107507	0.0120481927710843	0	0	0	0	89	0	0	0.150847457627119	0	0	0.0169491525423729	1	39	172	1096	0.996872674896308	0.16350771140398	0.00816059883355829	Inf	0.184302325581395	0	1	0	0.204780361757106	0.994480181490943	0.182190908490559	1	58	57
TCGA-BR-8059-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	712	2	1	3	4	704	28864	15	58	26	99	6674	20	51	32	103	6812	37	43	173	253	7660	33	47	169	249	7718	6	5	3	14	983	0.0196629213483146	0.0562248995983936	0.127364602228557	0.441448397864091	0.0142421159715158	7	4	3	14	938	0.0196629213483146	0.0553359683794466	0.122454308093995	0.451890743908914	0.0149253731343284	0.026685393258427	19	393	1921	13457	0.999999979962086	0.338689175807324	0.219222078852222	Inf	0.369172103930497	1.48668104409906	0.092658284427548	1.59761129178045	0.140442203895997	0.999999999999944	0.125100899359476	0.0891234373572265	693	685
TCGA-BR-8077-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	131	0	2	0	2	126	5166	4	5	10	19	1278	3	4	3	10	1202	6	8	33	47	1312	8	7	35	50	1374	3	2	3	8	182	0.0610687022900763	0.16	0.132459970887918	1.20791208791209	0.043956043956044	2	0	1	3	179	0.0229007633587786	0.0638297872340425	0.136432926829268	0.467847379056222	0.0167597765363128	0.0687022900763359	9	73	361	2325	0.787474279980571	0.794088749939701	0.396754897702293	Inf	0.816634011215458	2.65730114760586	0.0313314021403825	3.57560500750448	0.437673130193906	0.985503275858702	0.402622669279313	1	122	117
TCGA-BR-8080-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	169	0	1	1	2	166	6806	6	15	9	30	1609	8	18	13	39	1700	5	8	36	49	1713	4	12	32	48	1784	1	2	1	4	229	0.0236686390532544	0.0833333333333333	0.128363228699552	0.64919941775837	0.0174672489082969	2	3	0	5	221	0.029585798816568	0.102040816326531	0.129013426736719	0.790931757318312	0.0226244343891403	0.0236686390532544	4	73	450	3047	0.991923248780441	0.371090947216539	0.123110662103186	Inf	0.403694083694084	2.59037037037037	0.0992137139123618	3.38386948640181	0.114281045751634	0.999907769868481	0.101090653465176	0.576470588235294	165	162
TCGA-BR-8081-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	923	1	2	10	12	910	37310	10	67	13	90	8294	10	59	11	80	8565	0	52	328	380	10077	4	38	318	360	10374	0	1	5	6	1207	0.00650054171180932	0.0166666666666667	0.116348563716985	0.143247721623861	0.00497100248550124	0	4	5	9	1155	0.00975081256771398	0.0236842105263158	0.114617445668354	0.206637047163363	0.00779220779220779	0.0108342361863489	10	640	2362	18089	1	0.119667259614029	0.0645601036921325	Inf	0.133205236761545	0	1	0	0.134030036989171	1	0.120419878257754	0.000199900049975012	913	900
TCGA-BR-8284-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	346	0	0	1	1	345	14145	2	24	5	31	3107	4	15	4	23	3356	4	19	121	144	3829	1	25	121	147	3853	1	4	1	6	464	0.0173410404624277	0.0408163265306122	0.120425642356605	0.33893384940183	0.0129310344827586	1	1	2	4	434	0.0115606936416185	0.0277777777777778	0.113345521023766	0.245071684587814	0.00921658986175115	0.0144508670520231	5	242	898	6784	0.999999996524331	0.156104931084587	0.0608433594018002	Inf	0.173169346185405	3.42182628062361	0.107655273411961	5.03466851058565	0.106048335143294	0.999999999930422	0.0948396266024996	1	341	340
TCGA-BR-8295-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	56	0	0	3	3	53	2173	4	4	1	9	551	3	4	4	11	513	6	1	11	18	559	6	1	8	15	550	2	0	0	2	76	0.0357142857142857	0.133333333333333	0.138181818181818	0.964912280701754	0.0263157894736842	2	0	0	2	82	0.0357142857142857	0.111111111111111	0.146690518783542	0.757452574525745	0.024390243902439	0.0714285714285714	4	27	158	951	0.663534245934279	0.891810969786738	0.282104912847333	Inf	0.905675786035116	2.33966244725738	0.0814229160843437	3.00533911323442	0	1	0	0.0285714285714286	52	49
TCGA-BR-8296-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	84	0	0	0	0	84	3444	1	1	0	2	792	1	3	0	4	793	5	4	30	39	912	4	5	30	39	947	1	0	3	4	103	0.0476190476190476	0.102564102564103	0.108764519535375	0.942992282798108	0.0388349514563107	1	1	3	5	106	0.0595238095238095	0.128205128205128	0.116228070175439	1.10304789550073	0.0471698113207547	0.0952380952380952	8	61	209	1650	0.522333710006788	1.03536256254145	0.488888168188321	Inf	1.03127383676583	1.9766081871345	0.270199011818619	2.25444565721995	0.889473684210526	0.680290341993517	0.877222647477402	0.153434800493624	76	76
TCGA-BR-8360-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	653	2	8	41	49	602	24682	5	41	13	59	5445	7	39	17	63	5599	6	35	206	247	6824	4	33	196	233	6814	0	4	0	4	780	0.00612557427258806	0.0171673819742489	0.114470208394482	0.149972488169913	0.00512820512820513	3	2	7	12	779	0.0183767228177642	0.048582995951417	0.11415592028136	0.425584549900475	0.0154043645699615	0.0153139356814701	10	402	1559	12079	0.999999999996791	0.192746614899374	0.103638587806483	Inf	0.212328041998543	2.62437459910199	0.0971386324307936	3.31983077811658	0.152326883861641	0.999999999999968	0.137314393251469	0.252412503425707	643	592
TCGA-BR-8361-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	1657	2	24	106	130	1524	62484	17	144	27	188	14051	19	110	20	149	14006	22	67	533	622	17007	12	56	497	565	17420	0	0	13	13	2011	0.00784550392275196	0.0230088495575221	0.115442020665901	0.199310869861778	0.00646444554947787	4	8	5	17	2015	0.0102595051297526	0.0273311897106109	0.118480625624743	0.230680666703901	0.00843672456575682	0.0132770066385033	22	1042	4026	30401	1	0.15943388331649	0.107403688807191	Inf	0.176809852500103	1.00601969550861	0.573926268592151	1.00682241574269	0.149437877099822	1	0.134313016560406	0.000368176733900806	1635	1502
TCGA-BR-8365-01A-21D-2340-08	0	0	0	0	24	0	0	0	0	24	984	1	0	2	3	223	0	1	1	2	265	0	1	11	12	273	1	1	5	7	223	0	0	1	1	37	0.0416666666666667	0.142857142857143	0.165919282511211	0.861003861003861	0.027027027027027	0	0	1	1	28	0.0416666666666667	0.0833333333333333	0.102564102564103	0.8125	0.0357142857142857	0.0833333333333333	2	15	65	431	0.675550951764202	0.884330328606617	0.141429805736025	Inf	0.897737556561086	0	1	0	0.953846153846154	0.642746904942258	0.947342873526498	0.333333333333333	22	22
TCGA-BR-8366-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	187	0	0	0	0	186	7626	5	26	21	52	1882	5	19	26	50	1923	1	8	36	45	1886	0	6	33	39	1935	0	1	1	2	294	0.0106951871657754	0.0512820512820513	0.151937984496124	0.337519623233909	0.00680272108843537	1	3	5	9	276	0.0481283422459893	0.2	0.146341463414634	1.36666666666667	0.0326086956521739	0.0374331550802139	7	63	570	3251	0.912163276687899	0.63378845805756	0.285514818211662	Inf	0.670350877192982	6.70350877192982	0.149398220826792	Inf	0.582913806254767	0.955163744260608	0.543262630762298	0.0634674922600621	180	179
TCGA-BR-8367-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	70	0	0	2	2	68	2788	2	4	1	7	597	1	3	3	7	651	1	5	23	29	765	3	1	21	25	775	0	0	0	0	87	0	0	0.112258064516129	0	0	0	0	2	2	73	0.0285714285714286	0.0689655172413793	0.0954248366013072	0.722720831365139	0.0273972602739726	0.0285714285714286	2	46	160	1380	0.965069494906964	0.37516023884738	0.0642328818130594	Inf	0.401041666666667	0	1	0	0.4375	0.950061724049827	0.410879067478812	0.333333333333333	68	66
TCGA-BR-8368-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	1071	0	23	95	118	952	39032	7	62	14	83	8399	9	65	10	84	8565	11	33	335	379	11127	8	58	340	406	10941	1	5	5	11	1187	0.0102707749766573	0.0270935960591133	0.108490997166621	0.249731284315719	0.0092670598146588	0	2	6	8	1160	0.00746965452847806	0.0211081794195251	0.104250921182709	0.202474752069875	0.00689655172413793	0.0112044817927171	12	682	2347	19721	1	0.147853287212336	0.0848153801865037	Inf	0.162581700349579	0.494875877379858	0.881919086409814	0.466825124204005	0.153228234625763	1	0.13920631709838	0.00109803113140154	1059	940
TCGA-BR-8370-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	119	0	0	0	0	119	4879	1	5	0	6	1130	0	5	4	9	1199	6	10	30	46	1271	0	24	34	58	1279	0	1	2	3	170	0.0252100840336134	0.0517241379310345	0.132916340891321	0.389148073022312	0.0176470588235294	2	3	2	7	167	0.0588235294117647	0.152173913043478	0.131392604248623	1.15816193699557	0.0419161676646707	0.0504201680672269	6	64	337	2213	0.912672851270083	0.615731602527992	0.257529515549936	Inf	0.648579906740144	2.52225519287834	0.183354431577703	3.2811629080043	0.472922848664688	0.975659501586091	0.437885967669631	0.628482972136223	113	113
TCGA-BR-8371-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	23	0	0	1	1	22	902	0	4	1	5	206	1	2	1	4	219	1	0	1	2	219	0	1	10	11	258	0	0	0	0	35	0	0	0.135658914728682	0	0	0	0	1	1	29	0.0434782608695652	0.5	0.132420091324201	3.77586206896552	0.0344827586206897	0.0434782608695652	1	11	64	413	0.823175134514321	0.587178699255513	0.0272549671254313	Inf	0.62109375	0	1	0	0.677556818181818	0.796067549003545	0.645809339839059	1	22	21
TCGA-BR-8372-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	1362	3	23	93	116	1242	50922	23	209	28	260	11585	12	222	16	250	11646	11	65	300	376	13729	5	67	284	356	13962	1	6	2	9	1619	0.0066079295154185	0.0252808988764045	0.115957599197823	0.218018474436294	0.00555898702903027	0	6	3	9	1591	0.0066079295154185	0.023936170212766	0.1158860805594	0.206549139441272	0.00565681961030798	0.00440528634361234	6	594	3210	24481	1	0.0770380159494889	0.0334037337089412	Inf	0.0862647975077882	0.539154984423676	0.860734340176143	0.508441996997641	0.0738568471813255	1	0.0658615511231435	0.17741935483871	1356	1236
TCGA-BR-8373-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	106	0	2	2	4	102	4182	1	7	7	15	968	3	7	4	14	982	2	7	31	40	1097	4	4	25	33	1135	1	2	3	6	149	0.0566037735849057	0.181818181818182	0.131277533039648	1.3849908480781	0.0402684563758389	0	3	2	5	128	0.0471698113207547	0.125	0.116681859617138	1.0712890625	0.0390625	0.0566037735849057	6	56	277	1955	0.79610634258716	0.756272513916959	0.314345206424227	Inf	0.779783393501805	1.34296028880866	0.549222378359081	1.41130071779524	0.719443011861784	0.839023561048262	0.692035561256864	0.148606811145511	100	96
TCGA-BR-8381-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	140	0	0	1	1	139	5699	4	8	3	15	1343	2	6	5	13	1330	3	8	49	60	1538	4	8	39	51	1488	0	3	4	7	165	0.05	0.137254901960784	0.110887096774194	1.23778966131907	0.0424242424242424	1	2	4	7	198	0.05	0.116666666666667	0.128738621586476	0.906228956228956	0.0353535353535354	0.0642857142857143	9	86	363	2663	0.816493217151778	0.767789638997903	0.385651336821639	Inf	0.789734667246629	1.19086973632428	0.591753544432314	1.22259317598054	0.757826195842725	0.840869792995859	0.733674520250905	0.0127536231884058	131	130
TCGA-BR-8382-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	915	1	0	4	4	909	37269	5	79	27	111	8214	11	73	20	104	8249	3	49	307	359	10456	5	42	288	335	10350	0	4	4	8	1166	0.0087431693989071	0.0238805970149254	0.112657004830918	0.211976139883772	0.00686106346483705	0	8	3	11	1179	0.0120218579234973	0.0306406685236769	0.112758224942617	0.271737769366892	0.00932994062765055	0.00765027322404372	7	596	2345	18461	1	0.0924666583842485	0.0431543847106125	Inf	0.102997450558154	0	1	0	0.104382290229525	1	0.0937247010265625	0.00798525798525799	908	902
TCGA-BR-8384-01A-21D-2394-08	0	0	0	0	46	0	0	0	0	46	1886	0	3	5	8	453	3	1	3	7	460	2	2	10	14	464	4	2	11	17	509	1	0	0	1	71	0.0217391304347826	0.0588235294117647	0.139489194499018	0.421706710853355	0.0140845070422535	0	0	1	1	60	0.0217391304347826	0.0714285714285714	0.129310344827586	0.552380952380952	0.0166666666666667	0.0434782608695652	2	25	131	842	0.894201247877788	0.51447066452687	0.085909294456374	Inf	0.550183771557817	1.23791348600509	0.581627534405717	1.28513416759572	0.353689567430025	0.951440213858981	0.32161806082269	1	44	44
TCGA-BR-8484-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	98	0	0	0	0	98	4018	4	8	4	16	965	5	7	5	17	1015	1	1	33	35	1018	4	5	21	30	1020	2	1	3	6	137	0.0612244897959184	0.2	0.134313725490196	1.48905109489051	0.0437956204379562	0	0	3	3	144	0.0306122448979592	0.0857142857142857	0.141453831041257	0.605952380952381	0.0208333333333333	0.0816326530612245	8	51	281	1757	0.57892139136559	0.980818540879418	0.461085570613571	Inf	0.983412751070632	2.90106761565836	0.143847992734551	4.1643317271831	0.805852115460656	0.77180018824436	0.781668660089032	0.153434800493624	90	90
TCGA-BR-8485-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	347	1	0	2	2	344	14104	6	38	59	103	3518	18	49	74	141	3779	10	7	32	49	3383	5	6	40	51	3424	1	2	6	9	555	0.0259365994236311	0.176470588235294	0.162091121495327	1.08871224165342	0.0162162162162162	4	1	3	8	476	0.0230547550432277	0.163265306122449	0.14070351758794	1.16034985422741	0.0168067226890756	0.0403458213256484	14	73	1031	5776	0.449112028149325	1.07442559560962	0.620248658052503	Inf	1.06244355998528	2.2007759456838	0.0643185636410377	2.80070363163378	0.825290979631426	0.780647815708059	0.800357012695321	0.296003611097677	333	330
TCGA-BR-8486-01A-31D-2394-08	0	0	0	0	60	0	1	0	1	59	2419	1	5	2	8	565	1	5	2	8	533	4	4	18	26	646	0	2	15	17	675	0	0	2	2	74	0.0333333333333333	0.117647058823529	0.10962962962963	1.0731319554849	0.027027027027027	2	0	0	2	80	0.0333333333333333	0.0769230769230769	0.123839009287926	0.621153846153846	0.025	0.0666666666666667	4	33	154	1167	0.641393820332543	0.918578346900735	0.293860159835719	Inf	0.927342927342927	4.28896103896104	0.0704214833448531	7.55669652931096	0.519874065328611	0.909462419729635	0.489097545919022	1	56	55
TCGA-BR-8588-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	138	0	0	0	0	137	5617	3	6	4	13	1241	6	15	6	27	1246	0	9	36	45	1568	1	10	41	52	1562	0	2	2	4	171	0.0289855072463768	0.0769230769230769	0.109475032010243	0.702654071075124	0.0233918128654971	0	1	1	2	182	0.0144927536231884	0.0444444444444444	0.116071428571429	0.382905982905983	0.010989010989011	0.0217391304347826	3	75	353	2777	0.994455363651685	0.31474792759225	0.0836001835646266	Inf	0.341032904772282	0	1	0	0.345461903535558	0.993907244836465	0.319000770116913	0.181818181818182	135	134
TCGA-BR-8589-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	1242	2	1	0	1	1238	50758	75	168	317	560	13018	77	177	295	549	13113	5	9	43	57	12218	3	3	66	72	12409	1	3	10	14	1986	0.0112721417069243	0.194444444444444	0.16004512853574	1.21493510126441	0.00704934541792548	1	2	7	10	1966	0.00805152979066022	0.175438596491228	0.160910132591259	1.09028930413521	0.00508646998982706	0.0152979066022544	19	98	3952	20675	0.516487869519442	1.0142761771354	0.639504856822429	Inf	1.01195759368836	1.55788208502024	0.37600035010396	1.74379221778957	0.971889741113546	0.591266424661186	0.966692224701874	1.71198776636332e-05	1223	1219
TCGA-BR-8590-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	142	1	0	1	1	139	5699	6	12	13	31	1433	5	13	21	39	1359	3	4	31	38	1423	5	4	22	31	1484	2	2	3	7	187	0.0492957746478873	0.225806451612903	0.126010781671159	1.79196135932379	0.0374331550802139	1	0	3	4	185	0.028169014084507	0.105263157894737	0.130007027406887	0.809672830725462	0.0216216216216216	0.0633802816901408	9	52	372	2535	0.3814399817201	1.17935037287383	0.581564329999318	Inf	1.15296139608673	2.9304435483871	0.0720825331067369	4.08604060206407	0.884662203286671	0.687379670441179	0.870002742858492	0.386996904024768	133	130
TCGA-BR-8591-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	1512	1	12	35	47	1462	59942	15	160	22	197	13181	13	164	25	202	13389	6	80	427	513	16715	15	94	441	550	16657	1	8	8	17	1819	0.0112433862433862	0.0309090909090909	0.109203337936003	0.28304163126593	0.00934579439252336	0	4	9	13	1880	0.0085978835978836	0.0253411306042885	0.112473825904876	0.225306913856746	0.00691489361702128	0.0119047619047619	18	871	3699	29673	1	0.165784254188237	0.106565598505296	Inf	0.18267059683233	0.429614181438999	0.915154076220661	0.401102374689163	0.176696155269266	1	0.160253820074523	7.95496460062332e-06	1494	1444
TCGA-BR-8676-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	92	0	1	1	2	90	3690	2	3	6	11	875	3	5	3	11	848	2	5	25	32	993	2	9	25	36	974	1	3	3	7	132	0.0760869565217391	0.194444444444444	0.135523613963039	1.43476430976431	0.053030303030303	0	1	3	4	137	0.0434782608695652	0.125	0.137965760322256	0.906021897810219	0.0291970802919708	0.0760869565217391	7	47	269	1698	0.621291990646264	0.9401417504768	0.416507331864183	Inf	0.947886548258295	1.82806691449814	0.445552232527116	2.10308521434068	0.877472118959108	0.696307498699744	0.860833377068673	0.0634674922600621	85	83
TCGA-BR-8677-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	78	1	1	1	2	75	3075	1	4	3	8	744	0	3	0	3	684	2	2	27	31	802	3	6	24	33	845	1	0	3	4	113	0.0512820512820513	0.121212121212121	0.133727810650888	0.906409224993296	0.0353982300884956	0	0	3	3	108	0.0384615384615385	0.0967741935483871	0.134663341645885	0.718637992831541	0.0277777777777778	0.0897435897435897	7	49	221	1426	0.639686955148255	0.921807745490741	0.408331618889722	Inf	0.931561085972851	1.49049773755656	0.514464432977001	1.61256110120025	0.876763375033271	0.696711862207587	0.860412090022241	0.0291375291375292	71	68
TCGA-BR-8678-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	125	0	0	3	3	122	5002	0	4	3	7	1207	5	8	4	17	1271	6	7	30	43	1236	5	14	36	55	1288	2	3	3	8	186	0.064	0.145454545454545	0.144409937888199	1.00723362658847	0.043010752688172	4	2	4	10	171	0.08	0.232558139534884	0.138349514563107	1.68094655242758	0.0584795321637427	0.104	13	64	357	2167	0.294834232892444	1.23285059531871	0.689298217858405	Inf	1.19364109280076	3.85637891520244	0.00202422555093049	7.27602246673258	0.749851455733809	0.840778962550032	0.720255302434518	1	112	109
TCGA-BR-8679-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	174	0	0	3	3	171	7011	5	8	6	19	1646	6	9	10	25	1647	2	8	53	63	1765	5	4	55	64	1953	2	0	6	8	236	0.0459770114942529	0.125	0.12083973374296	1.03442796610169	0.0338983050847458	0	2	5	7	216	0.0402298850574713	0.111111111111111	0.122379603399433	0.907921810699588	0.0324074074074074	0.0747126436781609	13	102	452	3266	0.652313839062489	0.920922379937804	0.524716196794126	Inf	0.929857637552905	2.35018963337547	0.206138813750583	2.88907845758086	0.837799082268109	0.774653910307678	0.819445074528728	0.0025092716799495	161	158
TCGA-BR-8680-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	6750	15	7	3	10	6720	275520	13	479	555	1047	73515	19	466	535	1020	73965	7	630	1678	2315	64030	8	694	1636	2338	64010	2	593	128	723	10421	0.107111111111111	0.309238665526091	0.162802687080144	1.899469050986	0.0693791382784762	2	531	125	658	10535	0.0974814814814815	0.284233261339093	0.164532250507575	1.72752308718957	0.0624584717607973	0.0380740740740741	257	3072	20956	107084	1	0.427490470229298	0.382699574692092	Inf	0.471689929108643	1.62931857224661	0.221422290984582	1.85812407837755	0.46645020984278	1	0.422349316762451	6.7788730716834e-75	6493	6463
TCGA-BR-8682-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	77	0	0	1	1	76	3116	3	1	3	7	669	0	1	0	1	732	2	3	28	33	810	0	3	32	35	905	0	1	2	3	109	0.038961038961039	0.0857142857142857	0.120441988950276	0.711664482306684	0.0275229357798165	2	1	1	4	91	0.051948051948052	0.121212121212121	0.112345679012346	1.07892107892108	0.043956043956044	0.0649350649350649	5	57	200	1515	0.86119780990156	0.664606335804725	0.250271356006242	Inf	0.691532258064516	8.575	0.0137803373097491	Inf	0.42875	0.975569566054461	0.398831342956403	1	72	71
TCGA-BR-8683-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	168	0	0	2	2	166	6806	2	12	3	17	1553	9	6	3	18	1641	9	17	35	61	1761	6	13	51	70	1851	1	3	3	7	230	0.0416666666666667	0.1	0.124257158292815	0.804782608695652	0.0304347826086957	2	3	3	8	209	0.0476190476190476	0.131147540983607	0.118682566723453	1.1050278453212	0.0382775119617225	0.0535714285714286	9	92	439	3173	0.876394008878955	0.707125272960705	0.356305574237417	Inf	0.733169444507093	1.64555808656036	0.273183583793526	1.80657983978738	0.574031890660592	0.956949509468784	0.54215706731243	0.426986506746627	159	157
TCGA-BR-8687-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	196	1	0	0	0	195	7995	7	29	15	51	1974	1	24	40	65	1892	1	9	29	39	2060	2	4	34	40	2069	2	1	3	6	261	0.0306122448979592	0.15	0.126147897535041	1.18908045977012	0.0229885057471264	0	1	4	5	297	0.0255102040816327	0.128205128205128	0.144174757281553	0.889234222567556	0.0168350168350168	0.0459183673469388	9	57	558	3571	0.543694790982906	1.01046775952093	0.501570948807256	Inf	1.00904203323558	4.93309438470729	0.0500624737716624	12.7852789842195	0.822182397451215	0.764102711729445	0.799994827469327	0.0804953560371517	187	186
TCGA-BR-8690-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	175	1	0	1	1	172	7052	8	12	8	28	1651	8	6	10	24	1715	7	11	27	45	1798	8	20	47	75	1888	3	4	2	9	242	0.0514285714285714	0.12	0.128177966101695	0.936198347107438	0.0371900826446281	4	4	1	9	223	0.0514285714285714	0.2	0.124026696329255	1.61255605381166	0.0403587443946188	0.0571428571428571	10	79	465	3221	0.698961986863273	0.87687720007365	0.45678977938	Inf	0.890660867464057	3.69921146953405	0.00134354278846528	6.05599625995534	0.321360069747167	0.996687381651084	0.292746036593968	0.264232986146223	165	162
TCGA-BR-A4IV-01A-31D-A25D-08	0	0	0	0	27	0	0	0	0	27	1107	2	0	3	5	287	2	0	0	2	238	1	3	8	12	292	1	1	6	8	290	0	0	0	0	28	0	0	0.096551724137931	0	0	0	0	1	1	41	0.037037037037037	0.0833333333333333	0.14041095890411	0.593495934959349	0.024390243902439	0.037037037037037	1	15	69	513	0.8672139285355	0.496103159701833	0.0235668543880741	Inf	0.527173913043478	0	1	0	0.602484472049689	0.82963377526718	0.572343726905525	1	26	26
TCGA-BR-A4IY-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	151	0	0	2	2	146	5986	5	8	5	18	1313	5	9	3	17	1441	13	5	39	57	1611	12	13	29	54	1621	2	2	4	8	224	0.0529801324503311	0.148148148148148	0.138186304750154	1.07208994708995	0.0357142857142857	4	0	2	6	194	0.0397350993377483	0.105263157894737	0.120422098075729	0.874118285404232	0.0309278350515464	0.0794701986754967	12	81	418	2814	0.551257480757445	0.997342615542192	0.550745518155413	Inf	0.997684827905541	1.85569377990431	0.0962248208242269	2.12528433881305	0.682240360258936	0.886856724585047	0.65156281621654	1	139	134
TCGA-BR-A4IZ-01A-32D-A25D-08	0	0	0	0	10	0	0	0	0	10	410	0	0	2	2	88	0	0	0	0	99	0	0	4	4	116	0	0	4	4	107	0	0	0	0	9	0	0	0.0841121495327103	0	0	0	0	0	0	12	0	0	0.103448275862069	0	0	0	0	8	21	202	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	10	10
TCGA-BR-A4J1-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	77	1	0	1	1	75	3075	0	5	6	11	725	2	3	2	7	736	8	5	17	30	831	5	5	17	27	783	0	1	3	4	95	0.051948051948052	0.148148148148148	0.121328224776501	1.22105263157895	0.0421052631578947	2	0	2	4	110	0.051948051948052	0.133333333333333	0.1323706377858	1.00727272727273	0.0363636363636364	0.0909090909090909	7	40	205	1409	0.392911516915174	1.20264959170598	0.527140218974245	Inf	1.17259989621173	1.21125703564728	0.507128543807579	1.24948103199494	1.15781922525108	0.440520885769048	1.18488604701452	0.314685314685315	70	68
TCGA-BR-A4J4-01A-12D-A25D-08	0	0	0	0	89	1	0	0	0	88	3608	0	3	2	5	808	0	4	1	5	858	1	7	29	37	1008	4	8	29	41	934	1	2	2	5	117	0.0561797752808989	0.121951219512195	0.125267665952891	0.973525119866583	0.0427350427350427	0	1	0	1	104	0.0112359550561798	0.027027027027027	0.103174603174603	0.261954261954262	0.00961538461538462	0.0337078651685393	3	60	221	1721	0.978641511070295	0.389495556396695	0.102616720433256	Inf	0.418444300797242	1.75746606334842	0.454457987487056	1.94605770546152	0.303011390232486	0.991935547246535	0.27823023930978	1	86	85
TCGA-BR-A4J6-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	38	0	1	0	1	37	1517	0	4	1	5	355	2	1	2	5	372	2	5	6	13	385	0	4	10	14	405	0	0	2	2	62	0.0526315789473684	0.142857142857143	0.153086419753086	0.933179723502304	0.032258064516129	0	2	0	2	40	0.0526315789473684	0.153846153846154	0.103896103896104	1.48076923076923	0.05	0.0526315789473684	2	16	102	688	0.696836695497657	0.843313259308188	0.136585855184206	Inf	0.860566448801743	0	1	0	0.968137254901961	0.633042399914012	0.963625800138966	0.428571428571429	36	35
TCGA-BR-A4J7-01A-31D-A25D-08	0	0	0	0	58	0	0	0	0	58	2378	0	2	0	2	482	1	5	2	8	566	2	5	20	27	680	0	1	20	21	650	0	0	1	1	74	0.0172413793103448	0.0476190476190476	0.113846153846154	0.418275418275418	0.0135135135135135	0	0	0	0	58	0	0	0.0852941176470588	0	0	0.0172413793103448	1	41	132	1198	0.987110697986065	0.221499180758335	0.0110377032514253	Inf	0.23989898989899	0	1	0	0.251893939393939	0.984193743873495	0.232855799179045	1	57	57
TCGA-BR-A4J8-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	112	0	1	1	2	110	4510	3	6	6	15	1030	5	7	1	13	1069	0	5	30	35	1150	4	5	38	47	1261	0	1	4	5	167	0.0446428571428571	0.106382978723404	0.132434575733545	0.803287042935406	0.029940119760479	0	0	3	3	139	0.0267857142857143	0.0857142857142857	0.120869565217391	0.709146968139774	0.0215827338129496	0.0625	7	65	306	2105	0.822172213293818	0.740905558987983	0.332890228494245	Inf	0.766022149600581	0	1	0	0.811082276047674	0.774594979805716	0.789472761608889	0.0013986013986014	105	103
TCGA-BR-A4QI-01A-12D-A25D-08	0	0	0	0	149	0	1	2	3	146	5986	5	11	4	20	1358	10	6	7	23	1440	5	10	40	55	1564	4	9	35	48	1624	1	1	5	7	204	0.0469798657718121	0.145833333333333	0.125615763546798	1.1609477124183	0.0343137254901961	1	2	4	7	186	0.0469798657718121	0.127272727272727	0.118925831202046	1.07018572825024	0.0376344086021505	0.0738255033557047	11	73	390	2798	0.45636807527447	1.08106593162662	0.578778646069239	Inf	1.07045177045177	1.81652421652422	0.304342625554044	2.04924848004749	0.980923076923077	0.578299177978774	0.978327070749761	0.0183066361556064	138	135
TCGA-BR-A4QL-01A-31D-A25D-08	0	0	0	0	2058	2	61	215	276	1779	72939	22	121	26	169	16095	18	109	18	145	16014	15	67	652	734	20189	10	70	651	731	20641	2	8	7	17	2243	0.00826044703595724	0.0232558139534884	0.108667215735672	0.214009476510902	0.00757913508693714	3	8	10	21	2277	0.0102040816326531	0.0286103542234332	0.112784189410075	0.253673448140928	0.00922266139657444	0.010689990281827	22	1306	4520	36310	1	0.135324791483269	0.091246585319872	Inf	0.149646150975584	1.80663716814159	0.1359080988629	2.00828910570603	0.11785430490563	1	0.106195530518076	0.0047470738656848	2036	1757
TCGA-CD-5798-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	98	0	0	0	0	98	4018	7	4	5	16	949	3	5	7	15	1015	3	2	25	30	1015	0	6	31	37	1039	0	2	2	4	157	0.0408163265306122	0.108108108108108	0.151106833493744	0.715441556205887	0.0254777070063694	0	1	3	4	126	0.0408163265306122	0.133333333333333	0.124137931034483	1.07407407407407	0.0317460317460317	0.0510204081632653	5	54	283	1771	0.921470943217143	0.579565400363863	0.218497215281019	Inf	0.615080553392825	0	1	0	0.648031297324584	0.89871088413183	0.613645915554211	0.0256410256410257	93	93
TCGA-CD-5799-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	57	0	0	1	1	56	2296	2	5	2	9	513	3	4	0	7	528	2	7	17	26	660	2	1	11	14	595	0	0	0	0	69	0	0	0.115966386554622	0	0	1	2	0	3	97	0.0526315789473684	0.115384615384615	0.146969696969697	0.785091197462331	0.0309278350515464	0.0175438596491228	1	31	166	1089	0.988957683504306	0.21176792379409	0.0104914915676008	Inf	0.236257530120482	1.89006024096386	0.434450688061458	2.18497312542173	0	1	0	1	56	55
TCGA-CD-5800-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	180	0	0	0	0	180	7380	2	7	2	11	1688	3	9	5	17	1899	9	6	58	73	1911	7	8	64	79	1882	1	1	13	15	291	0.0833333333333333	0.189873417721519	0.154622741764081	1.22797859846013	0.0515463917525773	2	1	10	13	250	0.0722222222222222	0.178082191780822	0.130821559392988	1.3612602739726	0.052	0.144444444444444	26	112	541	3252	0.0869763260485779	1.39529759753925	0.934013161640559	Inf	1.32093010795896	1.31457948243993	0.405690054917583	1.38703825147869	1.32176297687949	0.10129396734198	1.39638063701323	9.92400503067198e-08	154	154
TCGA-CD-5801-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	605	0	1	0	1	603	24723	27	67	100	194	6194	26	78	102	206	6672	4	16	69	89	5774	3	15	96	114	6083	1	4	17	22	1059	0.0363636363636364	0.192982456140351	0.174091731053756	1.1085101800772	0.0207743153918791	1	1	12	14	913	0.0231404958677686	0.157303370786517	0.158122618635262	0.994818907909472	0.0153340635268346	0.0512396694214876	31	141	1972	9885	0.343782155563966	1.10209475738454	0.770589626476338	Inf	1.08368024435115	1.71790785279629	0.329413454139165	2.00500132799489	1.05677361853832	0.405267577565441	1.0688877298433	4.78822115159594e-11	574	572
TCGA-CD-5802-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	57	0	0	0	0	56	2296	1	4	0	5	547	0	2	0	2	518	3	1	22	26	595	2	4	17	23	636	1	1	6	8	78	0.140350877192982	0.347826086956522	0.122641509433962	2.83612040133779	0.102564102564103	1	0	4	5	86	0.087719298245614	0.192307692307692	0.14453781512605	1.33050089445438	0.0581395348837209	0.210526315789474	12	32	164	1067	0.0124118695308425	2.43752360902518	1.26588204759551	Inf	2.04711751662971	3.00243902439024	0.136303587792935	4.32965599328947	1.92464040025016	0.0317151930844853	2.24163532499625	0.00483241351460493	45	44
TCGA-CD-5803-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	47	0	0	0	0	46	1886	2	3	0	5	442	2	2	1	5	472	3	3	12	18	472	3	4	11	18	500	0	1	1	2	59	0.0425531914893617	0.111111111111111	0.118	0.941619585687382	0.0338983050847458	1	0	2	3	57	0.0638297872340425	0.166666666666667	0.120762711864407	1.38011695906433	0.0526315789473684	0.0851063829787234	4	25	116	856	0.466030833615023	1.18046848299251	0.37015183285242	Inf	1.15576694411415	1.39655172413793	0.535402367959918	1.475177289296	1.09295352323838	0.53221886317312	1.10674323777595	0.523809523809524	43	42
TCGA-CD-5804-01A-12D-2053-08	0	0	0	0	98	0	2	5	7	91	3731	1	7	3	11	882	2	6	0	8	872	3	7	28	38	1012	1	5	28	34	965	1	1	1	3	141	0.0306122448979592	0.0882352941176471	0.146113989637306	0.603879849812265	0.0212765957446809	2	1	3	6	139	0.0612244897959184	0.157894736842105	0.137351778656126	1.14956455887921	0.0431654676258993	0.0714285714285714	7	53	280	1697	0.762846646420248	0.80055326695452	0.356622007762437	Inf	0.82375	5.29553571428571	0.0103290972998228	18.1362458566518	0.504336734693878	0.964736370439331	0.466345441897133	1	91	84
TCGA-CD-5813-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	198	0	2	0	2	196	8036	10	10	7	27	2011	9	22	7	38	2007	10	13	47	70	1961	9	8	44	61	2057	3	1	2	6	297	0.0303030303030303	0.0983606557377049	0.144385026737968	0.681238615664845	0.0202020202020202	5	3	5	13	295	0.0656565656565657	0.185714285714286	0.150433452320245	1.23452784503632	0.0440677966101695	0.0757575757575758	15	95	592	3426	0.667204431362034	0.913754312650776	0.540954688876009	Inf	0.925522113022113	2.85775248933144	0.00376407649990007	4.20683548006762	0.522089397089397	0.985298959826173	0.482332645377813	1	183	181
TCGA-CD-8524-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	166	0	0	1	1	164	6724	1	4	2	7	1564	4	10	7	21	1548	2	8	54	64	1802	8	16	48	72	1810	1	3	1	5	223	0.0301204819277108	0.0694444444444444	0.123204419889503	0.563652217239661	0.0224215246636771	0	2	3	5	220	0.0301204819277108	0.078125	0.122086570477247	0.639914772727273	0.0227272727272727	0.0301204819277108	5	107	443	3169	0.998505851249729	0.334341332817977	0.128663206588177	Inf	0.363995485327314	0.815349887133183	0.730040124778948	0.794885663030457	0.319745053777719	0.998973110696618	0.292041236141127	0.303405572755418	161	159
TCGA-CD-8525-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	86	0	1	0	1	85	3485	0	8	4	12	824	2	6	3	11	869	10	5	16	31	853	6	4	21	31	939	3	0	3	6	114	0.0697674418604651	0.193548387096774	0.121405750798722	1.59422750424448	0.0526315789473684	7	1	2	10	114	0.116279069767442	0.32258064516129	0.133645955451348	2.41369552914544	0.087719298245614	0.174418604651163	15	38	228	1564	0.0023913843472424	2.70574566865081	1.51560591479978	Inf	2.22442899702085	4.91228070175439	5.08468768178561e-06	11.4036724143369	1.06211474632527	0.518066605700668	1.07179850345195	0.155613477924309	71	70
TCGA-CD-8526-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	46	0	0	1	1	45	1845	1	2	0	3	433	0	1	0	1	426	5	3	13	21	504	3	3	14	20	482	2	0	0	2	65	0.0434782608695652	0.1	0.134854771784232	0.741538461538462	0.0307692307692308	0	1	1	2	52	0.0434782608695652	0.0952380952380952	0.103174603174603	0.923076923076923	0.0384615384615385	0.0652173913043478	3	32	117	869	0.801024033384638	0.696531509174856	0.178301788023915	Inf	0.722344322344322	2.10683760683761	0.24690070096661	2.47259745050263	0.312124089901868	0.966306180347182	0.285891080170731	1	43	42
TCGA-CD-8528-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	119	0	0	2	2	117	4797	1	6	3	10	1056	3	7	2	12	1113	3	7	30	40	1347	4	4	47	55	1281	0	0	0	0	152	0	0	0.118657298985168	0	0	1	2	0	3	146	0.0252100840336134	0.075	0.108389012620638	0.691952054794521	0.0205479452054795	0.00840336134453781	1	83	298	2330	0.999953466815679	0.0942383574778676	0.00473190338636232	Inf	0.104985618408437	1.25982742090125	0.570066053195769	1.30298452778353	0	1	0	1	118	116
TCGA-CD-8529-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	437	2	0	2	2	429	17589	18	17	17	52	4209	22	19	13	54	4427	52	34	83	169	4363	53	38	63	154	4590	17	7	9	33	633	0.0755148741418764	0.214285714285714	0.137908496732026	1.55382532159783	0.0521327014218009	18	7	14	39	638	0.0892448512585812	0.230769230769231	0.146229658491863	1.57812876778394	0.061128526645768	0.132723112128146	58	193	1271	7682	0.000134013106865261	1.81619711412722	1.39078021447001	Inf	1.6277110284276	2.34801993181222	7.28087639674729e-07	3.0215121400749	1.10968065270578	0.330871258387099	1.13014001007931	0.0611927096055434	379	371
TCGA-CD-8530-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	94	1	0	0	0	93	3813	4	7	9	20	915	1	7	6	14	949	5	4	15	24	947	5	7	23	35	1002	2	3	3	8	136	0.0851063829787234	0.228571428571429	0.135728542914172	1.68403361344538	0.0588235294117647	0	0	0	0	115	0	0	0.121436114044351	0	0	0.0531914893617021	5	43	251	1698	0.756885403706387	0.786708086475492	0.293691225069752	Inf	0.808847941567065	1.55298804780876	0.377252928620779	1.69068257794389	0.613021597819249	0.882509476448644	0.579983641911939	1	89	88
TCGA-CD-8531-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	255	0	1	8	9	245	10045	11	13	12	36	2340	7	21	9	37	2387	12	10	63	85	2616	7	11	69	87	2702	0	1	5	6	317	0.0235294117647059	0.0689655172413793	0.117320503330866	0.587838572827151	0.0189274447949527	2	1	2	5	324	0.0196078431372549	0.0588235294117647	0.123853211009174	0.474945533769063	0.0154320987654321	0.0352941176470588	9	142	641	4677	0.995476792485028	0.462499110821915	0.235810176047514	Inf	0.494488123895817	0.873306511207817	0.686243159691804	0.858396025865662	0.439961234813029	0.997029848286459	0.40864666587092	0.0804953560371517	246	236
TCGA-CD-8532-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	50	0	1	1	2	48	1968	1	1	0	2	509	3	9	1	13	461	1	1	13	15	503	1	2	15	18	495	0	0	4	4	65	0.08	0.222222222222222	0.131313131313131	1.69230769230769	0.0615384615384615	0	0	1	1	73	0.02	0.0666666666666667	0.145129224652087	0.459360730593607	0.0136986301369863	0.1	5	25	138	860	0.40731726830957	1.2460745949122	0.448034921450015	Inf	1.20531400966184	0	1	0	1.29140786749482	0.349568409125492	1.35431154673075	0.00793650793650794	45	43
TCGA-CD-8534-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	83	0	0	0	0	83	3403	0	6	0	6	805	3	4	4	11	827	3	4	30	37	874	1	2	26	29	897	1	0	3	4	127	0.0481927710843374	0.137931034482759	0.141583054626533	0.974205810480586	0.031496062992126	1	1	8	10	116	0.120481927710843	0.27027027027027	0.132723112128146	2.03634669151911	0.0862068965517241	0.156626506024096	13	47	243	1528	0.0655527324238892	1.73862068502227	0.952938918774804	Inf	1.57908093278464	3.6440329218107	0.0941585731574089	6.27725450100083	1.43158436213992	0.143946108034864	1.5366617347424	0.00183814181660459	70	70
TCGA-CD-8535-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	296	2	3	5	8	286	11726	12	20	30	62	2911	13	24	32	69	2968	8	9	63	80	2968	5	10	60	75	2879	1	3	9	13	404	0.0439189189189189	0.173333333333333	0.140326502257728	1.23521452145215	0.0321782178217822	1	1	8	10	433	0.0337837837837838	0.125	0.14588948787062	0.856812933025404	0.023094688221709	0.0641891891891892	19	117	837	5010	0.5832444898259	0.972032501062025	0.614023891327341	Inf	0.975938224752267	1.07471739729804	0.574676547050609	1.08831245745048	0.965498149605152	0.601417640087183	0.959965777098535	1.26725132514006e-05	277	267
TCGA-CD-A4MI-01A-21D-A25D-08	0	0	0	0	1061	0	0	4	4	1056	43296	8	95	13	116	9600	7	82	11	100	9703	8	80	324	412	11803	5	78	345	428	12190	0	5	3	8	1392	0.00754005655042413	0.0186915887850467	0.114191960623462	0.163685680524224	0.00574712643678161	2	3	4	9	1377	0.00848256361922714	0.0218446601941748	0.116665254596289	0.187242210800178	0.0065359477124183	0.00848256361922714	9	673	2769	21224	1	0.10250610899121	0.0532121294091095	Inf	0.114345672501056	1.33305553240548	0.452636048108509	1.39358401801509	0.0906637170769047	1	0.0810518380793834	0.117538005190953	1052	1047
TCGA-CD-A4MJ-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	705	2	10	61	71	632	25912	6	60	9	75	5618	4	63	14	81	5814	8	36	199	243	7118	4	37	192	233	7362	0	1	3	4	791	0.00567375886524823	0.0171673819742489	0.107443629448519	0.159780361687005	0.00505689001264223	0	1	1	2	785	0.00283687943262411	0.00823045267489712	0.110283787580781	0.0746297606877933	0.00254777070063694	0.00567375886524823	4	399	1576	12904	1	0.0820891431073657	0.0278784178267753	Inf	0.0911942159690645	0	1	0	0.0939930154361458	0.999999999999999	0.0846345244359065	0.0606060606060606	701	628
TCGA-CG-4300-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	163	1	0	1	1	160	6560	2	12	10	24	1608	6	11	10	27	1628	6	13	40	59	1644	2	7	41	50	1680	2	1	2	5	212	0.0306748466257669	0.1	0.126190476190476	0.792452830188679	0.0235849056603774	1	2	2	5	210	0.0306748466257669	0.0847457627118644	0.127737226277372	0.663438256658596	0.0238095238095238	0.0429447852760736	7	82	422	2902	0.94348623277789	0.587118842135988	0.266282831603783	Inf	0.619521806272964	2.95379146919431	0.0705969439941406	4.12371717931336	0.388976654379498	0.993922888321913	0.35730894595676	1	156	153
TCGA-CG-4301-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	59	1	0	0	0	58	2378	1	4	3	8	562	4	3	1	8	570	3	1	18	22	642	6	5	9	20	604	4	2	1	7	74	0.11864406779661	0.35	0.122516556291391	2.85675675675676	0.0945945945945946	1	1	1	3	77	0.0508474576271186	0.136363636363636	0.11993769470405	1.13695395513577	0.038961038961039	0.11864406779661	7	29	151	1095	0.144547154847387	1.74946975281597	0.74871633523638	Inf	1.60448859455482	4.58425312729949	0.00231506934958795	9.03507373883247	0.611233750306598	0.855128217592818	0.580336473221172	0.34984520123839	52	51
TCGA-CG-4304-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	83	0	0	2	2	80	3280	1	2	4	7	758	3	4	4	11	795	6	4	20	30	872	6	2	24	32	855	3	1	1	5	101	0.0602409638554217	0.15625	0.11812865497076	1.3227103960396	0.0495049504950495	2	1	3	6	116	0.072289156626506	0.2	0.13302752293578	1.50344827586207	0.0517241379310345	0.108433734939759	9	47	217	1510	0.272926048484862	1.33224460764317	0.650290082535625	Inf	1.2790487162607	3.31605222734255	0.0120266820866828	4.9629905514364	0.723502304147465	0.81928901355967	0.695978250425495	1	74	71
TCGA-CG-4305-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	1207	1	1	5	6	1200	49200	13	127	23	163	11244	15	94	28	137	11544	8	60	373	441	13225	16	74	369	459	13187	2	7	7	16	1613	0.0132560066280033	0.0348583877995643	0.122317433836354	0.284982988166679	0.00991940483570986	1	4	9	14	1489	0.0115990057995029	0.0317460317460317	0.112589792060491	0.281961900497831	0.0094022834116857	0.0157415078707539	19	747	3102	23310	1	0.191138375147741	0.124367990196868	Inf	0.211195337632758	1.06431334622824	0.547282877518916	1.0735222135055	0.18360122414719	1	0.165614682811847	0.000631025357802889	1188	1181
TCGA-CG-4306-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	1143	1	2	15	17	1124	46084	7	59	11	77	10137	14	87	13	114	10376	6	47	407	460	12856	7	56	410	473	12715	2	3	8	13	1480	0.0113735783027122	0.0274841437632135	0.116397955171058	0.236122221587338	0.00878378378378378	0	5	7	12	1458	0.010498687664042	0.0260869565217391	0.11341008089608	0.230023259974951	0.00823045267489712	0.0148731408573928	17	813	2938	22633	1	0.161088393720741	0.102060280740354	Inf	0.178265273483314	1.33900612661675	0.450229985842417	1.40061716475019	0.15979571278474	1	0.144086456721265	0.000209758131372125	1126	1107
TCGA-CG-4436-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	210	0	0	1	1	208	8528	5	13	18	36	2058	9	15	25	49	2218	8	6	51	65	2067	12	8	38	58	2185	5	0	3	8	323	0.0380952380952381	0.137931034482759	0.147826086956522	0.933062880324544	0.0247678018575851	2	1	0	3	299	0.0142857142857143	0.0461538461538462	0.144654088050314	0.319063545150502	0.0100334448160535	0.0476190476190476	10	99	622	3630	0.965223262074577	0.589558078016332	0.309680763570314	Inf	0.627157143278563	2.39260450160772	0.0196792823607568	3.14127575637012	0.230427399833809	0.999888819869132	0.2036245343473	0.19838056680162	200	198
TCGA-CG-4437-01A-01D-1800-08	0	0	0	0	579	1	0	1	1	574	23534	26	22	27	75	5460	30	39	15	84	5715	67	36	114	217	6141	55	45	98	198	6218	13	7	8	28	839	0.0483592400690846	0.141414141414141	0.134930845931168	1.04804902421112	0.033373063170441	18	3	10	31	811	0.0535405872193437	0.142857142857143	0.1320631818922	1.08173330984675	0.0382244143033292	0.0846286701208981	49	285	1650	10709	0.264575869376545	1.11582895769885	0.846706939190967	Inf	1.0988767918708	1.9032737208147	0.000283646969177388	2.21080077793842	0.635969125214408	0.988744854404814	0.602214484280273	0.0245141327320167	530	525
TCGA-CG-4438-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	158	0	0	1	1	156	6396	4	9	6	19	1518	1	9	9	19	1596	23	6	38	67	1626	10	10	31	51	1656	3	2	5	10	228	0.0632911392405063	0.196078431372549	0.13768115942029	1.42414860681115	0.043859649122807	11	0	5	16	217	0.10126582278481	0.238805970149254	0.133456334563346	1.78939404360685	0.0737327188940092	0.151898734177215	24	78	445	2837	0.00519330288992804	1.96120581109329	1.27329638277617	Inf	1.73536021150033	3.12890704800817	5.14951693268073e-05	4.69432313912013	1.06888128969223	0.464834676100791	1.08055290142933	0.404330407061853	134	132
TCGA-CG-4440-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	134	1	0	2	2	130	5330	3	6	7	16	1251	2	7	11	20	1299	7	9	35	51	1391	6	9	28	43	1389	2	1	5	8	191	0.0597014925373134	0.186046511627907	0.137508999280058	1.35297698770242	0.0418848167539267	3	3	5	11	188	0.082089552238806	0.215686274509804	0.135154565061107	1.59584897788903	0.0585106382978723	0.111940298507463	15	61	379	2401	0.0919389770426574	1.55752460699337	0.902823559134833	Inf	1.44771559505624	2.82118936472498	0.0239257506911781	3.95688037323494	1.16430037274364	0.357821396592959	1.19520370366284	0.183671546964095	119	115
TCGA-CG-4441-01A-01D-1800-08	0	0	0	0	135	0	1	1	2	133	5453	1	8	13	22	1236	3	4	8	15	1366	4	9	38	51	1390	4	5	36	45	1461	2	0	0	2	206	0.0148148148148148	0.0444444444444444	0.140999315537303	0.315210355987055	0.00970873786407767	2	2	1	5	172	0.037037037037037	0.0980392156862745	0.123741007194245	0.792293661650707	0.0290697674418605	0.037037037037037	5	77	378	2473	0.987632837119813	0.424916549081363	0.1622186301352	Inf	0.459898051361466	3.77116402116402	0.0141101807699418	6.53504710145786	0.101923351923352	0.999969841357306	0.0896533717495401	0.265734265734266	130	128
TCGA-CG-4442-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	1742	3	24	160	184	1552	63632	14	246	11	271	14795	19	271	27	317	14942	8	86	416	510	16886	7	69	378	454	17009	1	3	8	12	2073	0.0068886337543054	0.026431718061674	0.121876653536363	0.21687269296238	0.00578871201157742	0	8	10	18	1985	0.0103329506314581	0.0352941176470588	0.117553002487268	0.300240035560824	0.00906801007556675	0.0109070034443169	19	790	4058	29837	1	0.176840248101572	0.115119007323661	Inf	0.196168230618943	0.556842451125349	0.852332980311011	0.525196656362028	0.189354485899048	1	0.170555412285795	2.59137441523792e-06	1723	1533
TCGA-CG-4443-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	113	0	0	4	4	107	4387	4	8	2	14	999	5	8	1	14	1052	10	5	22	37	1154	15	9	18	42	1182	6	1	4	11	151	0.0973451327433628	0.261904761904762	0.127749576988156	2.05014191106906	0.0728476821192053	2	0	3	5	149	0.0442477876106195	0.135135135135135	0.129116117850953	1.04661708688554	0.0335570469798658	0.132743362831858	15	50	300	2036	0.0180052810653485	2.03526546196502	1.16464778731748	Inf	1.79692307692308	2.49173333333333	0.0111081554048805	3.19145545489667	1.36266666666667	0.252295597575197	1.43934056708345	1	98	92
TCGA-CG-4444-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	209	1	0	0	0	205	8405	6	16	26	48	2061	8	12	33	53	2084	9	9	36	54	2158	5	12	33	50	2102	1	1	2	4	291	0.0191387559808612	0.08	0.138439581351094	0.57786941580756	0.013745704467354	4	3	3	10	298	0.0478468899521531	0.185185185185185	0.138090824837813	1.34103902560278	0.0335570469798658	0.0478468899521531	10	73	589	3671	0.726518002502798	0.853816103103329	0.444164056821674	Inf	0.871397303986745	2.58307057967499	0.0346823653965715	3.4611125161487	0.524101277035506	0.969413371803229	0.486985945036323	1	199	195
TCGA-CG-4449-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	116	0	1	2	3	113	4633	1	8	2	11	1013	4	10	4	18	1197	9	4	30	43	1191	9	7	25	41	1232	3	2	5	10	207	0.0862068965517241	0.24390243902439	0.168019480519481	1.45163190762342	0.0483091787439614	5	0	2	7	152	0.0603448275862069	0.162790697674419	0.127623845507976	1.27555079559364	0.0460526315789474	0.129310344827586	15	58	359	2064	0.12006143623458	1.4866172504124	0.858993764541321	Inf	1.38684320982943	2.99969049829774	0.00265312357515457	4.5952823269081	0.859002279057989	0.724417574031309	0.838496585658138	1	101	98
TCGA-CG-4455-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	57	0	0	0	0	57	2337	0	6	2	8	564	3	3	1	7	560	1	3	21	25	584	1	3	13	17	629	0	2	1	3	79	0.0526315789473684	0.176470588235294	0.125596184419714	1.40506329113924	0.0379746835443038	0	0	2	2	84	0.0350877192982456	0.08	0.143835616438356	0.556190476190476	0.0238095238095238	0.0526315789473684	3	33	163	1050	0.87801170715851	0.585820221780982	0.150754537493913	Inf	0.620143149284254	0	1	0	0.65662215806568	0.852479055263018	0.623593472934202	0.166666666666667	54	54
TCGA-CG-4462-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	88	0	0	0	0	88	3608	0	5	4	9	878	1	3	4	8	813	4	4	22	30	966	3	2	36	41	951	0	0	1	1	101	0.0113636363636364	0.024390243902439	0.106203995793901	0.229654672784352	0.0099009900990099	2	2	0	4	136	0.0454545454545455	0.133333333333333	0.140786749482402	0.947058823529412	0.0294117647058824	0.0340909090909091	3	62	237	1680	0.989685273573105	0.343122647565015	0.0905211469395917	Inf	0.37332035053554	2.31103074141049	0.212332006430895	2.83324735896037	0.13945875163684	0.999481634975924	0.124424914896524	1	85	85
TCGA-CG-4465-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	676	1	5	38	43	632	25912	9	62	17	88	5897	3	59	16	78	5824	9	35	182	226	7054	4	46	190	240	7137	0	2	4	6	800	0.00887573964497041	0.025	0.112091915370604	0.22303125	0.0075	0	1	6	7	804	0.0103550295857988	0.0309734513274336	0.113977884888007	0.271749658785717	0.00870646766169154	0.014792899408284	10	375	1604	12587	0.999999999934215	0.209272812814396	0.112467224938061	Inf	0.229798879424815	0	1	0	0.237829485426219	0.999999999776825	0.216787992727285	0.000107686095032979	666	622
TCGA-CG-4466-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	230	0	1	3	4	226	9266	6	17	23	46	2309	4	18	36	58	2431	7	11	43	61	2374	14	11	36	61	2152	5	1	4	10	357	0.0434782608695652	0.163934426229508	0.16589219330855	0.988198558111769	0.0280112044817927	1	5	2	8	365	0.0347826086956522	0.131147540983607	0.153748946925021	0.852997978890636	0.0219178082191781	0.0521739130434783	12	88	722	3804	0.889882050719068	0.718506480077061	0.399126811964347	Inf	0.752243767313019	1.79105658884052	0.105791173209809	2.10707216286448	0.476103650198114	0.990752906400454	0.433099992624636	1	218	214
TCGA-CG-4469-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	349	2	1	4	5	340	13940	7	26	47	80	3427	11	22	47	80	3513	11	11	65	87	3470	15	19	59	93	3530	3	7	2	12	511	0.0343839541547278	0.129032258064516	0.144759206798867	0.891357868821413	0.0234833659491194	2	0	7	9	511	0.0257879656160458	0.103448275862069	0.147262247838617	0.702476550374519	0.0176125244618395	0.0401146131805158	14	136	1022	5978	0.978369008358869	0.60217318695535	0.354333421374537	Inf	0.639269406392694	1.31717597471022	0.328493423765245	1.39261756927112	0.49712770658418	0.995742964371457	0.457812960147073	0.326423631912115	335	326
TCGA-CG-4474-01A-02D-1158-08	0	0	0	0	110	0	0	0	0	110	4510	0	7	1	8	978	4	5	5	14	1090	4	5	38	47	1222	3	7	31	41	1220	2	1	2	5	158	0.0454545454545455	0.121951219512195	0.129508196721311	0.941648656992899	0.0316455696202532	1	0	2	3	137	0.0272727272727273	0.0638297872340425	0.112111292962357	0.569343065693431	0.0218978102189781	0.0636363636363636	7	69	295	2147	0.824822568786859	0.738424623023692	0.332344444039989	Inf	0.762444246208742	3.54769975786925	0.0429395940783454	5.4520753996745	0.479882092851879	0.972563968010747	0.447980765325374	1	103	103
TCGA-CG-4475-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	55	0	0	1	1	54	2214	2	6	2	10	557	2	1	3	6	538	4	3	17	24	600	2	2	10	14	519	0	0	2	2	66	0.0363636363636364	0.142857142857143	0.127167630057803	1.12337662337662	0.0303030303030303	1	0	0	1	81	0.0181818181818182	0.0416666666666667	0.135	0.308641975308642	0.0123456790123457	0.0545454545454545	3	30	147	972	0.825998584713179	0.66143074803218	0.169265059163115	Inf	0.692022263450835	1.2687074829932	0.571873631524589	1.32208352669742	0.563869992441421	0.885765016238657	0.529215080588169	1	52	51
TCGA-CG-4476-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	147	0	0	0	0	146	5986	8	5	4	17	1476	2	10	1	13	1454	12	14	27	53	1525	8	12	43	63	1531	2	0	11	13	200	0.0884353741496599	0.206349206349206	0.130633572828217	1.57960317460317	0.065	4	3	0	7	205	0.0476190476190476	0.132075471698113	0.134426229508197	0.982512655315232	0.0341463414634146	0.115646258503401	17	73	405	2651	0.0864647730692014	1.52409610077469	0.91852733752278	Inf	1.42529492455418	2.2637037037037	0.0410650427564273	2.80397009281894	1.18574955908289	0.324384570362134	1.22028622158317	0.200287272812301	130	129
TCGA-CG-4477-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	74	1	1	3	4	69	2829	0	4	1	5	656	3	2	4	9	694	5	2	19	26	792	5	6	18	29	687	2	1	1	4	91	0.0540540540540541	0.137931034482759	0.132459970887918	1.04130352406214	0.043956043956044	0	0	1	1	93	0.0135135135135135	0.0384615384615385	0.117424242424242	0.327543424317618	0.010752688172043	0.0540540540540541	4	43	184	1295	0.850960489325658	0.654858860040035	0.212398548539216	Inf	0.6840888066605	1.60760869565217	0.360938819542956	1.75868994716179	0.43448883666275	0.953215988047789	0.402346665386304	1	70	65
TCGA-CG-5717-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	202	0	0	1	1	199	8159	8	25	4	37	2059	7	17	5	29	2079	21	11	36	68	2055	26	10	29	65	1966	12	1	4	17	335	0.0841584158415842	0.261538461538462	0.170396744659207	1.5348794489093	0.0507462686567164	9	2	4	15	326	0.0742574257425743	0.220588235294118	0.158637469586375	1.39051786358715	0.0460122699386503	0.143564356435644	29	83	661	3360	0.00812749295795511	1.77576557046168	1.19777655144928	Inf	1.57511616598228	2.71802877651527	6.16567060799679e-06	4.10364676219356	0.748702432212266	0.857520477503457	0.713487064375829	0.0023068798379325	173	170
TCGA-CG-5718-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	101	1	0	1	1	99	4059	2	5	1	8	943	3	6	2	11	984	0	5	36	41	1067	6	10	23	39	1065	2	0	2	4	153	0.0396039603960396	0.102564102564103	0.143661971830986	0.713926596279537	0.0261437908496732	0	2	7	9	150	0.0891089108910891	0.219512195121951	0.14058106841612	1.56146341463415	0.06	0.108910891089109	11	54	303	1829	0.320018773327842	1.22947553678782	0.648333425745767	Inf	1.19075907590759	2.34543454345435	0.206241930124444	3.0159448027483	1.07333445208928	0.468028173402636	1.08651564498323	0.0154193027325347	90	88
TCGA-CG-5719-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	108	0	0	0	0	108	4428	5	4	1	10	1065	1	5	2	8	1032	6	2	36	44	1163	7	2	37	46	1168	4	1	3	8	150	0.0740740740740741	0.173913043478261	0.128424657534247	1.35420289855072	0.0533333333333333	2	1	5	8	168	0.0740740740740741	0.181818181818182	0.14445399828031	1.25865800865801	0.0476190476190476	0.12962962962963	14	72	318	2013	0.286601037683492	1.23073980491552	0.704807420599138	Inf	1.19328652917946	3.38316400580552	0.00486153377103154	5.41959454947621	0.803308348410442	0.794152008771535	0.779174919459658	0.722393472194293	94	94
TCGA-CG-5720-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	114	0	0	1	1	113	4633	0	8	6	14	1142	5	7	2	14	1129	8	6	25	39	1200	5	9	32	46	1162	3	2	1	6	175	0.0526315789473684	0.130434782608696	0.150602409638554	0.866086956521739	0.0342857142857143	7	0	3	10	155	0.087719298245614	0.256410256410256	0.129166666666667	1.98511166253102	0.0645161290322581	0.12280701754386	14	56	330	2032	0.108266401178972	1.5390750767707	0.871622137504082	Inf	1.43151515151515	5.50582750582751	6.13989457154641e-07	20.4889789335037	0.502286018075492	0.965588843088153	0.46483722957994	0.0731727514850386	100	99
TCGA-CG-5721-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	4648	12	4	25	29	4603	188723	69	1170	49	1288	45533	98	1212	57	1367	46467	22	97	855	974	48367	25	109	840	974	48356	4	5	23	32	6597	0.00688468158347676	0.0328542094455852	0.136425676234593	0.240821305434397	0.00485068970744278	0	3	12	15	6245	0.00322719449225473	0.0154004106776181	0.129116959910683	0.119274886027919	0.00240192153722978	0.00839070567986231	39	1703	12842	83881	1	0.149583967211921	0.112069691275965	Inf	0.168621733258641	0.641001766146322	0.886537310572137	0.607609921144757	0.155523289868835	1	0.137719405940801	4.57665870110448e-11	4609	4564
TCGA-CG-5722-01A-21D-1600-08	0	0	0	0	103	0	0	0	0	103	4223	1	8	2	11	929	2	4	2	8	1104	5	6	33	44	1043	2	6	32	40	1147	2	0	2	4	170	0.0388349514563107	0.1	0.14821272885789	0.674705882352941	0.0235294117647059	1	0	5	6	131	0.058252427184466	0.136363636363636	0.125599232981783	1.08570437196391	0.0458015267175573	0.0970873786407767	10	62	301	1889	0.539552071296095	1.01221257516101	0.520758467937389	Inf	1.01052048726467	3.11817750355956	0.0598530124168108	4.70177909580324	0.783542039355993	0.805648516364597	0.757503263037313	0.178895407997576	93	93
TCGA-CG-5723-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	1757	3	1	29	30	1724	70684	17	144	33	194	15939	18	194	44	256	15935	9	55	589	653	19227	8	77	536	621	19583	1	6	8	15	2242	0.00853727945361412	0.0241545893719807	0.11448705509881	0.210980965063112	0.00669045495093666	3	8	12	23	2127	0.0130904951622083	0.0352220520673813	0.110625682633796	0.318389466431378	0.0108133521391631	0.0136596471257826	24	1118	4369	34441	1	0.169228390501466	0.116134319208492	Inf	0.186683844423716	2.09012696403808	0.116082522784769	2.42542119580427	0.157920703949543	1	0.142682896066559	0.000145320594766212	1733	1700
TCGA-CG-5724-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	135	0	2	1	3	132	5412	5	12	10	27	1264	1	8	10	19	1395	6	2	33	41	1348	1	7	37	45	1405	0	3	2	5	203	0.037037037037037	0.111111111111111	0.144483985765125	0.769020251778872	0.0246305418719212	2	0	2	4	162	0.0296296296296296	0.0975609756097561	0.120178041543027	0.811803673592292	0.0246913580246914	0.0444444444444444	6	71	365	2388	0.95073934477731	0.552979936905841	0.23212200498802	Inf	0.58772460416296	2.15499021526419	0.23615268202096	2.61593100617146	0.430998043052838	0.986925739558753	0.396605327543116	0.619909502262444	129	126
TCGA-CG-5726-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	1549	3	15	139	154	1391	57031	23	119	19	161	12870	28	137	16	181	13340	9	69	447	525	15240	9	76	439	524	15581	0	5	12	17	1894	0.0109748224661072	0.0324427480916031	0.12155830819588	0.266890421338578	0.00897571277719113	1	6	8	15	1810	0.00968366688185926	0.0285714285714286	0.118766404199475	0.240568271507498	0.00828729281767956	0.013557133634603	21	883	3704	27117	1	0.174117300385696	0.116022011164467	Inf	0.193297666717636	0.462278017758579	0.900195693167041	0.430655444631451	0.187833054619739	1	0.169081286074756	3.57808500464659e-07	1528	1370
TCGA-CG-5727-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	181	0	0	0	0	180	7380	3	9	2	14	1785	2	10	5	17	1759	8	13	62	83	1898	8	13	45	66	1938	2	3	3	8	239	0.0441988950276243	0.121212121212121	0.123323013415893	0.98288322556105	0.0334728033472803	4	3	3	10	270	0.0552486187845304	0.120481927710843	0.142255005268704	0.84694332887104	0.037037037037037	0.0662983425414365	12	111	509	3327	0.902155295527552	0.70668782433884	0.394482634387619	Inf	0.735253246442091	2.82612966601179	0.0135795111793555	3.91995782972833	0.42259882856251	0.996698649246668	0.38836316380627	1	169	168
TCGA-CG-5728-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	1430	1	2	3	5	1424	58384	17	125	17	159	13292	14	144	26	184	13439	16	80	445	541	15928	14	51	475	540	15725	2	6	6	14	1923	0.00979020979020979	0.0259259259259259	0.122289348171701	0.212004776487356	0.00728029121164847	3	5	7	15	1917	0.0104895104895105	0.0277264325323475	0.120354093420392	0.230373822313631	0.00782472613458529	0.0125874125874126	18	932	3840	27813	1	0.139889850923564	0.0899695856346842	Inf	0.156182565789474	1.373828125	0.296419446303742	1.44856819161762	0.116476732336957	1	0.103816497755275	0.0453973543509942	1412	1406
TCGA-CG-5730-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	197	0	1	2	3	194	7954	5	5	2	12	1860	7	6	1	14	1927	5	13	58	76	2006	8	5	79	92	2161	2	1	13	16	317	0.0812182741116751	0.173913043478261	0.146691346598797	1.18557125222878	0.0504731861198738	3	4	12	19	259	0.0964467005076142	0.25	0.129112662013958	1.93629343629344	0.0733590733590734	0.152284263959391	30	120	576	3591	0.0254795842453811	1.55840442639092	1.07184022240627	Inf	1.446875	2.78245192307692	0.025098074704039	3.8948131140122	1.32014142335766	0.0923704656199587	1.39147977682609	2.29280737344463e-06	167	164
TCGA-CG-5732-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	82	0	0	1	1	81	3321	1	8	5	14	824	0	3	2	5	850	3	6	23	32	738	7	5	18	30	909	0	0	1	1	127	0.0121951219512195	0.0333333333333333	0.13971397139714	0.238582677165354	0.0078740157480315	2	2	2	6	104	0.0731707317073171	0.1875	0.140921409214092	1.33052884615385	0.0576923076923077	0.0609756097560976	5	46	231	1416	0.858653280999819	0.666430244475603	0.249279583209597	Inf	0.699006875477464	1.42597402597403	0.421061623649628	1.53200490087394	0.521697814380741	0.938720112725571	0.484100558709423	1	77	76
TCGA-CG-5733-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	1222	1	4	42	46	1175	48175	8	124	13	145	10985	9	98	23	130	11234	4	69	394	467	12923	8	54	371	433	13033	0	9	4	13	1543	0.0106382978723404	0.0300230946882217	0.118391774725696	0.25359105189345	0.0084251458198315	0	3	11	14	1523	0.0114566284779051	0.0299785867237687	0.117851891975547	0.254375099298269	0.00919238345370978	0.0122749590834697	15	762	3066	22890	1	0.14696895703427	0.0900874993638695	Inf	0.163431533294547	0	1	0	0.165995165189363	1	0.149320442785988	4.01737967240367e-06	1207	1160
TCGA-CG-5734-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	121	0	0	0	0	120	4920	4	6	8	18	1142	3	10	3	16	1195	3	6	28	37	1318	0	6	43	49	1265	0	0	2	2	173	0.0165289256198347	0.0408163265306122	0.136758893280632	0.298454641972396	0.0115606936416185	1	1	0	2	175	0.0165289256198347	0.0540540540540541	0.132776934749621	0.407104247104247	0.0114285714285714	0.0247933884297521	3	71	348	2235	0.998109874469042	0.271453205238639	0.0719993870264453	Inf	0.300908667287978	2.47413793103448	0.352807116006544	3.20910751953012	0.20908207867897	0.999542969997666	0.186222239437598	1	118	117
TCGA-D7-5577-01A-01D-1600-08	0	0	0	0	136	0	1	0	1	135	5535	6	8	7	21	1391	3	3	7	13	1266	2	13	43	58	1466	3	6	34	43	1412	0	1	2	3	180	0.0220588235294118	0.0697674418604651	0.127478753541076	0.547286821705426	0.0166666666666667	1	3	4	8	212	0.0588235294117647	0.137931034482759	0.144611186903138	0.95380611581002	0.0377358490566038	0.0514705882352941	7	75	392	2486	0.939955372651533	0.591993730378166	0.267670396574762	Inf	0.626742160278746	1.46836734693878	0.519674659257668	1.58515166273067	0.572091174131991	0.958926659440546	0.536022556194163	0.0634674922600621	129	128
TCGA-D7-5578-01A-01D-1600-08	0	0	0	0	289	0	0	1	1	287	11767	9	16	19	44	2869	6	24	20	50	2891	16	14	81	111	3011	9	14	59	82	2996	4	5	7	16	417	0.055363321799308	0.195121951219512	0.139185580774366	1.4018833713517	0.0383693045563549	7	3	8	18	419	0.0622837370242214	0.162162162162162	0.1391564264364	1.1653228407405	0.0429594272076372	0.0899653979238754	26	139	836	5171	0.282083977504121	1.15692598460488	0.782171660825418	Inf	1.13224590401624	3.16157894736842	0.000265541320507856	4.85811825830499	0.769865003417635	0.889680376643255	0.742281983013557	0.454459191072131	263	261
TCGA-D7-5579-01A-01D-1600-08	0	0	0	0	168	1	0	0	0	166	6806	5	15	10	30	1627	6	11	18	35	1761	4	10	31	45	1679	9	9	38	56	1739	4	1	3	8	247	0.0476190476190476	0.142857142857143	0.142035652673951	1.00578368999422	0.0323886639676113	1	2	4	7	246	0.0416666666666667	0.155555555555556	0.146515783204288	1.0616982836495	0.0284552845528455	0.0714285714285714	12	70	493	2925	0.527579656954582	1.01709283267714	0.559242932423912	Inf	1.01459456785237	2.66656264627867	0.0297670282803675	3.70613682716503	0.703354205250316	0.884637087791406	0.669930230676739	0.710381651279623	156	154
TCGA-D7-6518-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	112	1	0	0	0	111	4551	2	5	1	8	1063	3	5	5	13	1144	7	9	35	51	1186	5	6	28	39	1158	2	3	2	7	165	0.0625	0.179487179487179	0.142487046632124	1.25967365967366	0.0424242424242424	3	2	3	8	167	0.0714285714285714	0.156862745098039	0.140809443507589	1.11400727955853	0.0479041916167665	0.0892857142857143	10	65	332	2012	0.632199783549788	0.93235464843988	0.481007675390039	Inf	0.94136546184739	2.94176706827309	0.0194399971669836	4.32492025198827	0.56033658443297	0.953337337384135	0.522549277347729	1	102	101
TCGA-D7-6519-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	64	0	0	4	4	60	2460	1	2	1	4	554	1	2	2	5	553	2	8	18	28	669	1	5	17	23	684	1	2	2	5	79	0.078125	0.217391304347826	0.115497076023392	1.88222344523941	0.0632911392405063	0	0	1	1	86	0.015625	0.0357142857142857	0.128550074738416	0.277823920265781	0.0116279069767442	0.0625	4	34	165	1188	0.697557346851982	0.847168479311557	0.271608255454427	Inf	0.863157894736842	2.73333333333333	0.324340935465668	3.59505853837395	0.702857142857143	0.816487193145671	0.675166387264652	0.545454545454546	60	56
TCGA-D7-6520-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	72	0	2	0	2	70	2870	0	10	2	12	720	4	1	2	7	663	2	3	17	22	751	6	4	19	29	736	4	2	2	8	112	0.111111111111111	0.275862068965517	0.152173913043478	1.8128078817734	0.0714285714285714	1	0	2	3	105	0.0416666666666667	0.136363636363636	0.139813581890812	0.975324675324675	0.0285714285714286	0.125	9	35	217	1270	0.189898107982859	1.50447551448261	0.721751518664512	Inf	1.40165479681609	4.28283410138249	0.00264241351773506	9.72922983718668	0.761392729134665	0.790354965783346	0.731702706438603	1	63	61
TCGA-D7-6521-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	97	0	0	0	0	97	3977	0	4	1	5	917	0	2	2	4	938	4	2	30	36	1030	1	8	43	52	1092	0	1	8	9	147	0.0927835051546392	0.173076923076923	0.134615384615385	1.28571428571429	0.0612244897959184	0	0	5	5	110	0.0515463917525773	0.138888888888889	0.106796116504854	1.30050505050505	0.0454545454545455	0.134020618556701	13	65	257	1865	0.151752254918912	1.45107809716455	0.809157462953043	Inf	1.37613488975357	0	1	0	1.47039070412025	0.104533351061742	1.5719213889104	7.47820104395685e-07	84	84
TCGA-D7-6522-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	85	0	0	0	0	85	3485	0	3	4	7	844	2	8	3	13	810	2	10	27	39	911	1	4	21	26	920	1	0	0	1	107	0.0117647058823529	0.0384615384615385	0.116304347826087	0.330697340043134	0.00934579439252336	0	1	2	3	128	0.0352941176470588	0.0769230769230769	0.140504939626784	0.547475961538462	0.0234375	0.0352941176470588	3	48	235	1596	0.966192748943193	0.424609007400332	0.11119884289366	Inf	0.458322903629537	2.59716312056738	0.33865616033355	3.39243633488459	0.324645390070922	0.988483675405685	0.295405493224482	1	82	82
TCGA-D7-6524-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	123	0	0	1	1	121	4961	2	7	1	10	1159	2	4	0	6	1162	3	15	39	57	1303	2	11	35	48	1337	0	2	0	2	151	0.016260162601626	0.0416666666666667	0.112939416604338	0.3689293598234	0.0132450331125828	0	6	2	8	163	0.0650406504065041	0.140350877192982	0.125095932463546	1.12194596921752	0.049079754601227	0.016260162601626	2	77	314	2326	0.99941828272636	0.192470886948835	0.0334421457938287	Inf	0.212851729420302	0	1	0	0.227233603029781	0.998983056096039	0.205835648085739	0.473684210526316	121	119
TCGA-D7-6525-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	189	0	0	5	5	184	7544	3	17	9	29	1885	4	15	14	33	1798	4	15	53	72	1916	6	15	29	50	1945	1	4	3	8	294	0.0423280423280423	0.16	0.151156812339332	1.05850340136054	0.0272108843537415	1	7	8	16	262	0.0846560846560847	0.222222222222222	0.136743215031315	1.62510602205259	0.0610687022900763	0.0687830687830688	13	79	556	3305	0.575360930379822	0.97817048326885	0.553416664164413	Inf	0.981251954957773	1.38884892086331	0.434152609262876	1.48588227508432	0.931545007896122	0.647840027724533	0.920937403210046	0.00784054833607701	176	171
TCGA-D7-6526-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	248	0	1	0	1	246	10086	11	16	22	49	2502	8	23	15	46	2499	10	16	46	72	2473	9	15	55	79	2612	1	2	10	13	378	0.0524193548387097	0.164556962025316	0.144716692189893	1.1370973143125	0.0343915343915344	3	1	8	12	363	0.0483870967741935	0.166666666666667	0.14678528103518	1.13544536271809	0.0330578512396694	0.0887096774193548	22	98	741	4344	0.15363614932475	1.31595989013774	0.851666570687102	Inf	1.2580971659919	1.44470487960793	0.297331459316859	1.56312843808035	1.22299274461859	0.215926988018801	1.27128793272622	0.000146579292150807	226	224
TCGA-D7-6527-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	252	2	0	1	1	249	10209	5	24	38	67	2682	3	23	41	67	2600	14	9	48	71	2529	4	3	37	44	2398	2	2	5	9	371	0.0357142857142857	0.204545454545455	0.154712260216847	1.32210242587601	0.0242587601078167	6	0	5	11	381	0.0436507936507936	0.154929577464789	0.150652431791222	1.02839081734501	0.0288713910761155	0.0714285714285714	18	85	752	4175	0.307682063849725	1.17562056841728	0.72536168593033	Inf	1.14498554017765	2.91193853427896	0.0031238003204815	4.43972316530321	0.770807259073842	0.852691385388175	0.740289339676975	0.751186307456559	234	231
TCGA-D7-6528-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	391	2	2	2	4	384	15744	16	28	45	89	3993	17	29	61	107	3958	24	18	77	119	4026	6	10	53	69	3767	3	2	6	11	534	0.0281329923273657	0.159420289855072	0.141757366604725	1.12459968517614	0.0205992509363296	11	4	12	27	607	0.0690537084398977	0.226890756302521	0.15076999503229	1.5048800409785	0.0444810543657331	0.0818414322250639	32	128	1141	6652	0.0415413717750346	1.45741183822257	1.0191793616788	Inf	1.36599474145486	3.18732106339468	3.08189325963091e-05	5.09969173476056	0.94568866716106	0.638514413252794	0.936954151021041	0.486131842360621	359	352
TCGA-D7-6815-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	163	0	3	2	5	156	6396	2	5	2	9	1442	4	8	3	15	1468	7	9	53	69	1761	1	8	54	63	1725	0	1	1	2	193	0.0122699386503067	0.0317460317460317	0.111884057971014	0.283740439180854	0.0103626943005181	1	3	4	8	201	0.049079754601227	0.115942028985507	0.114139693356048	1.01579061215661	0.0398009950248756	0.0368098159509202	6	109	394	3092	0.991634352847447	0.432057557647596	0.183350239568492	Inf	0.461619951445597	1.10596446700508	0.617399859809853	1.1210397975494	0.413444660562645	0.994604756477303	0.384763362911325	0.140866873065015	157	150
TCGA-D7-6817-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	105	0	1	0	1	103	4223	3	7	4	14	1002	4	6	4	14	1007	12	7	19	38	1172	4	5	28	37	1042	0	0	1	1	134	0.00952380952380952	0.027027027027027	0.128598848368522	0.210165389269867	0.00746268656716418	3	0	0	3	127	0.0285714285714286	0.0789473684210526	0.108361774744027	0.728553667633651	0.0236220472440945	0.0380952380952381	4	59	261	1953	0.947203738844476	0.507424689638806	0.166875699469985	Inf	0.538587848932677	1.59051724137931	0.292237406550846	1.72626918128229	0.18048422597212	0.997126201559955	0.162736598882071	0.485714285714286	101	99
TCGA-D7-6818-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	174	0	0	2	2	172	7052	4	22	24	50	1725	4	19	28	51	1830	3	6	20	29	1739	4	6	32	42	1758	1	1	4	6	259	0.0344827586206897	0.142857142857143	0.147326507394767	0.969663541092113	0.0231660231660232	1	0	0	1	262	0.00574712643678161	0.0344827586206897	0.15066129959747	0.228876020005265	0.00381679389312977	0.0344827586206897	6	53	521	2976	0.889502839279695	0.64672173964216	0.269335082449155	Inf	0.682585640391685	1.9177406087195	0.281300576797039	2.28413558973228	0.516314779270633	0.960860937289772	0.476086809469319	0.592074592074592	168	166
TCGA-D7-6820-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	113	0	0	1	1	112	4592	3	9	4	16	1127	6	7	3	16	1114	9	5	25	39	1179	7	5	29	41	1172	3	1	3	7	161	0.0619469026548673	0.170731707317073	0.137372013651877	1.24284199363733	0.0434782608695652	2	0	4	6	150	0.0530973451327434	0.153846153846154	0.127226463104326	1.20923076923077	0.04	0.106194690265487	12	58	311	2040	0.215334426092136	1.35694268849921	0.73734022511812	Inf	1.29591180523656	2.36233922829582	0.0513650304332513	2.97962131107008	0.979933309515303	0.584658083246781	0.9769524987263	0.695097590523624	101	100
TCGA-D7-6822-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	277	1	1	4	5	271	11111	11	19	33	63	2805	12	30	43	85	2841	12	9	48	69	2733	6	8	40	54	2732	0	3	6	9	390	0.0324909747292419	0.166666666666667	0.142752562225476	1.16752136752137	0.0230769230769231	3	3	8	14	424	0.0505415162454874	0.202898550724638	0.155140870837907	1.30783429040197	0.0330188679245283	0.0613718411552347	17	89	814	4651	0.413202637870132	1.09139934809015	0.665984321739267	Inf	1.0767349682444	1.11895986895987	0.515780589573458	1.14269206316762	1.06809805673442	0.441175057972158	1.08098670064227	0.00180263699192212	260	254
TCGA-D7-8570-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	132	0	0	0	0	132	5412	6	7	1	14	1248	7	1	3	11	1233	18	6	30	54	1458	10	5	38	53	1473	3	0	3	6	179	0.0454545454545455	0.113207547169811	0.121520706042091	0.931590597659956	0.0335195530726257	6	0	1	7	182	0.053030303030303	0.12962962962963	0.12482853223594	1.03846153846154	0.0384615384615385	0.0984848484848485	13	83	361	2570	0.406394161462414	1.11496441604751	0.629974394995551	Inf	1.09946329639889	2.6097150771666	0.00528130652776855	3.36999040370309	0.477594916082777	0.973665346246927	0.445033023922508	0.115238543930158	119	119
TCGA-D7-8572-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	194	1	0	0	0	193	7913	6	9	6	21	2053	8	8	8	24	1946	15	11	39	65	1950	9	22	52	83	1964	3	4	3	10	286	0.0515463917525773	0.120481927710843	0.145621181262729	0.827365405678659	0.034965034965035	4	2	5	11	303	0.0567010309278351	0.169230769230769	0.155384615384615	1.08910891089109	0.0363036303630363	0.077319587628866	15	100	589	3325	0.761784420955687	0.846807605148062	0.502086631884526	Inf	0.866760168302945	1.93817204301075	0.0589939103943519	2.3238290935287	0.584190003544842	0.971614948739566	0.544181805791428	1	179	178
TCGA-D7-8573-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	93	0	0	1	1	91	3731	2	7	5	14	819	2	7	2	11	889	3	1	26	30	989	3	7	26	36	1034	1	2	1	4	127	0.043010752688172	0.111111111111111	0.122823984526112	0.904636920384952	0.031496062992126	1	0	1	2	108	0.021505376344086	0.0666666666666667	0.109201213346815	0.610493827160494	0.0185185185185185	0.043010752688172	4	54	235	1788	0.915324232452649	0.563720127038904	0.18475564770117	Inf	0.593690388848129	2.86950354609929	0.148557212137143	3.80030171015407	0.331096563011457	0.986755690248861	0.304452937942905	1	89	87
TCGA-D7-8574-01A-13D-2340-08	0	0	0	0	34	0	0	0	0	34	1394	0	2	0	2	329	0	1	2	3	355	0	2	14	16	347	0	4	9	13	363	0	0	0	0	63	0	0	0.173553719008264	0	0	0	1	0	1	52	0.0294117647058824	0.0625	0.14985590778098	0.417067307692308	0.0192307692307692	0	0	23	115	595	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	34	34
TCGA-D7-8576-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	65	0	0	3	3	62	2542	0	4	1	5	586	1	3	2	6	566	3	1	22	26	704	3	4	18	25	686	0	0	1	1	82	0.0153846153846154	0.04	0.119533527696793	0.334634146341463	0.0121951219512195	0	0	1	1	92	0.0153846153846154	0.0384615384615385	0.130681818181818	0.294314381270903	0.0108695652173913	0.0307692307692308	2	44	174	1216	0.98311023144986	0.317827152109472	0.0543731247672167	Inf	0.347326336831584	0	1	0	0.399425287356322	0.967138814697128	0.367994748754301	0.333333333333333	63	60
TCGA-D7-A4YT-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	314	2	3	4	7	305	12505	11	15	15	41	2951	12	15	12	39	2894	27	30	55	112	3329	31	25	57	113	3331	9	6	6	21	439	0.0668789808917197	0.185840707964602	0.131792254578205	1.4101034128248	0.0478359908883827	8	2	9	19	463	0.0605095541401274	0.169642857142857	0.139080805046561	1.21974313483493	0.041036717062635	0.101910828025478	32	138	902	5758	0.0350526998583193	1.48015194446157	1.03644749643932	Inf	1.38985261510369	2.16415628106124	0.00142371767219734	2.64650382186187	0.988873930947102	0.560889590321814	0.987154793200265	0.819701372337903	282	273
TCGA-D7-A4YU-01A-21D-A25D-08	0	0	0	0	259	0	0	2	2	256	10496	8	14	16	38	2369	6	19	21	46	2511	6	13	69	88	2746	15	16	53	84	2870	4	0	2	6	375	0.0231660231660232	0.0714285714285714	0.130662020905923	0.546666666666667	0.016	3	3	5	11	323	0.0424710424710425	0.125	0.117625637290605	1.06269349845201	0.0340557275541796	0.0540540540540541	14	129	698	4918	0.860393818427285	0.764698105668537	0.448764599505418	Inf	0.787705131544673	2.68194842406877	0.0111001848638575	3.52143010708743	0.46164685988069	0.995129405855045	0.428923093325394	1	245	242
TCGA-D7-A4YV-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	930	2	2	19	21	906	37146	10	49	14	73	8130	9	44	13	66	8274	8	48	338	394	10301	11	44	318	373	10441	2	3	2	7	1169	0.00752688172043011	0.0187667560321716	0.111962455703477	0.16761650960813	0.00598802395209581	0	6	4	10	1169	0.010752688172043	0.0253807106598985	0.113484127754587	0.22364987211943	0.00855431993156544	0.00860215053763441	8	667	2338	18404	1	0.094417582935023	0.0467512239854233	Inf	0.105145898678833	0.933861600108055	0.648208338426454	0.926076966298278	0.0811434622045108	1	0.0726653247157192	0.224503095470837	922	898
TCGA-D7-A4Z0-01A-22D-A25D-08	0	0	0	0	330	2	0	0	0	327	13407	15	37	68	120	3405	12	34	80	126	3512	4	3	35	42	3254	6	4	29	39	3236	2	1	0	3	507	0.00909090909090909	0.0769230769230769	0.156674907292954	0.490972538309816	0.00591715976331361	1	1	3	5	537	0.0151515151515152	0.119047619047619	0.165027658266749	0.72137979959209	0.00931098696461825	0.0181818181818182	6	68	1044	5446	0.985147379177219	0.460322189126004	0.193821270788828	Inf	0.504038521279901	1.86494252873563	0.209220026419497	2.23528375467423	0.291397270114943	0.998797671526261	0.256580609645611	1	324	321
TCGA-EQ-5647-01A-01D-1600-08	0	0	0	0	92	0	0	0	0	92	3772	3	7	5	15	861	2	8	5	15	965	2	8	25	35	957	2	9	16	27	989	0	1	3	4	138	0.0434782608695652	0.148148148148148	0.13953488372093	1.06172839506173	0.0289855072463768	1	0	0	1	126	0.0108695652173913	0.0285714285714286	0.13166144200627	0.217006802721088	0.00793650793650794	0.0434782608695652	4	41	264	1682	0.875266860367628	0.621708438881952	0.201885301706203	Inf	0.655218855218855	1.84280303030303	0.442749142732316	2.1226905050867	0.539356984478936	0.928942250784707	0.5031282436393	0.523809523809524	88	88
TCGA-F1-6177-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	1462	4	50	135	185	1273	52193	4	90	10	104	11541	5	87	11	103	11409	10	58	475	543	14542	9	55	459	523	14701	0	3	7	10	1536	0.00683994528043776	0.0191204588910134	0.1044826882525	0.183001214945825	0.00651041666666667	0	0	8	8	1610	0.00547195622435021	0.0147329650092081	0.1107137945262	0.133072532399941	0.00496894409937888	0.0102599179206566	15	938	3146	26097	1	0.132658280446196	0.0814128551873461	Inf	0.14630580713763	0	1	0	0.149282049466982	1	0.135400927561633	2.93108577675973e-07	1447	1258
TCGA-F1-6874-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	947	1	11	33	44	902	36982	9	72	11	92	8261	12	60	10	82	8321	7	56	316	379	9991	10	56	283	349	10409	2	7	5	14	1215	0.0147835269271383	0.0401146131805158	0.116725910269959	0.343665027651019	0.011522633744856	2	5	9	16	1143	0.0168954593453009	0.0422163588390501	0.1144029626664	0.369014559195932	0.0139982502187227	0.0190073917634636	18	598	2358	18042	0.999999999999998	0.230318996580024	0.147699444089957	Inf	0.252800634480024	2.03562340966921	0.125007008423142	2.35413896027965	0.202202993114054	1	0.183118392614217	0.0101229709088794	929	884
TCGA-F1-6875-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	111	0	0	0	0	111	4551	3	5	5	13	1074	0	13	3	16	1004	5	5	31	41	1212	3	3	35	41	1261	1	1	6	8	154	0.0720720720720721	0.195121951219512	0.122125297383029	1.59771935381691	0.051948051948052	1	0	1	2	154	0.018018018018018	0.0487804878048781	0.127062706270627	0.383908774152677	0.012987012987013	0.0810810810810811	9	65	308	2165	0.584324072862945	0.973285047286861	0.483676491133019	Inf	0.976526851526851	2.00730519480519	0.263457107269662	2.3419764143375	0.851584022038568	0.729291766763196	0.834036430385163	0.0697785186949274	102	102
TCGA-FP-7735-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	75	0	0	6	6	69	2829	1	2	2	5	686	2	4	1	7	666	4	4	23	31	727	4	2	20	26	750	1	0	3	4	83	0.0533333333333333	0.153846153846154	0.110666666666667	1.39017608897127	0.0481927710843374	2	1	7	10	101	0.133333333333333	0.32258064516129	0.138927097661623	2.32194187160652	0.099009900990099	0.173333333333333	13	38	184	1293	0.00981826955408848	2.40219089409225	1.29387562788099	Inf	2.04614236999147	3.0101902173913	0.0680861470005828	4.21020291074307	1.86678463094034	0.0388957196291996	2.12809027528619	0.0213009078536068	62	56
TCGA-FP-7829-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	280	0	2	2	4	276	11316	4	14	12	30	2602	10	9	7	26	2608	6	33	71	110	3030	2	27	81	110	3076	1	8	2	11	384	0.0392857142857143	0.1	0.124837451235371	0.801041666666667	0.0286458333333333	1	8	8	17	359	0.0607142857142857	0.154545454545455	0.118481848184818	1.30438085591289	0.0473537604456825	0.0428571428571429	12	148	743	5363	0.977975090108063	0.585288264307054	0.329505703580654	Inf	0.616352624495289	2.05450874831763	0.253785172202307	2.40553011154068	0.540660196925692	0.991269398898652	0.508356388305061	0.0200300915227592	268	264
TCGA-FP-7916-01A-11D-2201-08	0	0	0	0	121	0	1	1	2	119	4879	2	7	4	13	1134	4	6	5	15	1104	4	8	36	48	1315	3	7	33	43	1326	1	0	3	4	155	0.0330578512396694	0.0930232558139535	0.116892911010558	0.795798949737434	0.0258064516129032	1	1	1	3	150	0.0247933884297521	0.0625	0.114068441064639	0.547916666666667	0.02	0.0495867768595041	6	70	305	2336	0.883406507826294	0.656574903613827	0.275153148407608	Inf	0.683606557377049	2.47400468384075	0.190325822120809	3.06164238731838	0.501971964837253	0.963918954959375	0.471424133169438	0.592074592074592	115	113
TCGA-FP-7998-01A-11D-2201-08	0	0	0	0	81	0	0	0	0	81	3321	2	3	1	6	729	2	4	2	8	798	5	6	21	32	901	3	5	27	35	893	1	2	1	4	113	0.0493827160493827	0.114285714285714	0.126539753639418	0.903160556257901	0.0353982300884956	2	0	3	5	106	0.0617283950617284	0.15625	0.117647058823529	1.328125	0.0471698113207547	0.0864197530864197	7	49	219	1575	0.53653886248894	1.02738575529841	0.455125644106605	Inf	1.02397260273973	3.07191780821918	0.0645232457431037	4.30978441639667	0.682648401826484	0.851980430313529	0.653928324349287	1	74	74
TCGA-FP-8099-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	151	1	1	1	2	148	6068	2	5	1	8	1370	0	7	4	11	1434	3	11	60	74	1617	3	7	45	55	1647	1	1	1	3	212	0.0198675496688742	0.0545454545454545	0.128718882817243	0.423756432246998	0.0141509433962264	0	2	6	8	202	0.0529801324503311	0.108108108108108	0.124922696351268	0.865400053518866	0.0396039603960396	0.0529801324503311	8	103	414	2850	0.975745238143165	0.534765159181685	0.258104360109831	Inf	0.568220394307351	1.31400966183575	0.55735024321946	1.37665643964904	0.5256038647343	0.983259842193962	0.491800502835922	0.0237358101135191	143	140
TCGA-FP-8209-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	2	0	0	0	0	2	82	0	0	0	0	15	0	0	1	1	23	0	0	1	1	19	0	0	0	0	25	0	0	0	0	3	0	NaN	0.12	NaN	0	0	0	0	0	1	0	0	0.0526315789473684	0	0	0	0	1	4	40	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	2	2
TCGA-HF-7132-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	1310	3	4	16	20	1286	52726	7	109	19	135	11922	6	76	15	97	11825	6	73	450	529	14321	11	76	438	525	14658	0	5	5	10	1649	0.00763358778625954	0.019047619047619	0.112498294446719	0.16931473620376	0.00606428138265616	1	7	9	17	1690	0.0129770992366412	0.0321361058601134	0.118008518958173	0.272320220131766	0.0100591715976331	0.0114503816793893	15	890	3339	25640	1	0.129424714007494	0.0793819550168533	Inf	0.143849930256685	0.510526223067843	0.875204403584715	0.479943708884772	0.136830226452868	1	0.123007813086489	0.000129174207928057	1295	1271
TCGA-HF-7133-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	86	0	0	1	1	85	3485	2	4	1	7	753	1	6	2	9	816	2	3	32	37	932	3	7	22	32	984	3	1	1	5	111	0.0581395348837209	0.15625	0.11280487804878	1.38513513513514	0.045045045045045	2	0	0	2	99	0.0232558139534884	0.0540540540540541	0.106223175965665	0.508872508872509	0.0202020202020202	0.0697674418604651	6	53	210	1706	0.639648002944438	0.919702713838883	0.380555768455214	Inf	0.927845036319613	9.12380952380952	1.68451882578353e-05	Inf	0.168959435626102	0.99798351585153	0.153353675859282	0.102564102564103	80	79
TCGA-HF-7136-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	94	0	2	3	5	87	3567	4	2	2	8	843	4	3	4	11	851	0	5	21	26	928	6	14	22	42	945	3	1	1	5	151	0.0531914893617021	0.119047619047619	0.15978835978836	0.745033112582781	0.033112582781457	0	0	2	2	109	0.0212765957446809	0.0769230769230769	0.117456896551724	0.654904728299224	0.018348623853211	0.0638297872340425	6	43	260	1613	0.691671118745691	0.865724373216411	0.355692760040095	Inf	0.882103610675039	3.60192307692308	0.0391707386911575	6.19392546505362	0.502593917710197	0.948179021496472	0.465432223985367	1	88	81
TCGA-HJ-7597-01A-21D-2201-08	0	0	0	0	867	1	7	44	51	815	33415	10	70	9	89	7273	6	62	7	75	7367	5	33	320	358	9313	3	22	268	293	9462	1	1	3	5	1061	0.00576701268742791	0.0170648464163823	0.112132741492285	0.152184332508774	0.00471253534401508	0	3	2	5	1009	0.00576701268742791	0.0139664804469274	0.108343176205304	0.128909645591907	0.00495540138751239	0.0069204152249135	6	590	2070	16705	1	0.0820727345330235	0.0355739890294948	Inf	0.091309211166229	1.13375603864734	0.607330204288957	1.15284613710836	0.0771262611324723	1	0.0692152036908615	0.140866873065015	861	809
TCGA-HU-8243-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	135	0	2	2	4	131	5371	1	5	0	6	1238	4	8	2	14	1260	8	10	38	56	1480	7	4	44	55	1393	3	0	3	6	168	0.0444444444444444	0.109090909090909	0.120603015075377	0.904545454545455	0.0357142857142857	2	2	0	4	188	0.0296296296296296	0.0714285714285714	0.127027027027027	0.562310030395137	0.0212765957446809	0.0592592592592593	8	89	356	2517	0.922939843265151	0.635609420687907	0.305336031836692	Inf	0.665585543843392	2.69007490636704	0.0306969670411563	3.53244441396236	0.295252123869553	0.998331369269028	0.268563725990578	0.649916646820672	127	123
TCGA-HU-8245-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	69	0	1	1	2	67	2747	2	5	6	13	617	2	5	1	8	621	2	2	18	22	760	2	5	17	24	749	1	1	0	2	83	0.0289855072463768	0.0833333333333333	0.110814419225634	0.752008032128514	0.0240963855421687	0	0	1	1	89	0.0144927536231884	0.0454545454545455	0.117105263157895	0.388151174668029	0.0112359550561798	0.0289855072463768	2	37	172	1337	0.945364907180307	0.420346110437683	0.0715112795367594	Inf	0.449910554561717	2.19331395348837	0.385048641506047	2.58878458219801	0.250664451827243	0.985133916694522	0.228752391706376	1	67	65
TCGA-HU-8604-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	235	0	0	1	1	233	9553	3	12	11	26	2250	3	14	18	35	2367	6	17	60	83	2359	4	19	66	89	2577	1	5	1	7	331	0.0297872340425532	0.0786516853932584	0.128443927046954	0.612342577820021	0.0211480362537764	1	5	3	9	290	0.0382978723404255	0.108433734939759	0.122933446375583	0.882052347320316	0.0310344827586207	0.025531914893617	6	130	621	4315	0.999621594242081	0.320745841694141	0.136834040377485	Inf	0.350667803353225	1.58969404186795	0.364864669393174	1.7368764802037	0.252332387598088	0.99994245183064	0.227857708535412	0.653936472623903	229	227
TCGA-HU-8610-01A-22D-2394-08	0	0	0	0	68	0	0	0	0	68	2788	2	1	3	6	615	1	4	2	7	642	0	4	25	29	752	4	4	18	26	779	1	2	4	7	104	0.102941176470588	0.269230769230769	0.133504492939666	2.01664201183432	0.0673076923076923	0	1	0	1	73	0.0147058823529412	0.0344827586206897	0.0970744680851064	0.355219650448748	0.0136986301369863	0.0735294117647059	5	42	177	1354	0.647265861515793	0.910716700083633	0.338493127827357	Inf	0.920182714268542	2.16242937853107	0.389532093488317	2.54780555149126	0.804624885034818	0.747881277222626	0.78469730417607	0.282051282051282	63	63
TCGA-HU-A4G2-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	55	0	1	1	2	53	2173	0	3	0	3	483	0	6	1	7	519	0	5	16	21	579	0	3	19	22	592	0	2	2	4	80	0.0727272727272727	0.181818181818182	0.135135135135135	1.34545454545455	0.05	0	1	1	2	69	0.0363636363636364	0.0952380952380952	0.119170984455959	0.799171842650104	0.0289855072463768	0.0545454545454545	3	32	149	1022	0.838962209381711	0.643239103213453	0.165151386416171	Inf	0.673633748801534	NaN	1	0	0.673633748801534	0.838962209381711	0.643239103213453	0.181818181818182	52	50
TCGA-HU-A4GD-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	91	0	1	1	2	89	3649	4	7	2	13	850	1	6	4	11	853	8	3	21	32	1008	6	5	22	33	938	0	2	3	5	116	0.0549450549450549	0.151515151515152	0.123667377398721	1.2251828631139	0.0431034482758621	1	0	3	4	129	0.043956043956044	0.125	0.12797619047619	0.976744186046512	0.0310077519379845	0.0769230769230769	7	50	245	1701	0.589364221126947	0.972011492692914	0.431469527599706	Inf	0.975438596491228	0.56734693877551	0.848064885901153	0.53420198643089	1.10830564784053	0.463901901679223	1.12576767408844	0.0497737556561086	84	82
TCGA-HU-A4GN-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	1253	2	2	7	9	1242	50922	10	88	13	111	11233	8	94	19	121	11497	7	61	451	519	14056	9	66	416	491	14136	1	5	6	12	1628	0.00957701516360734	0.0244399185336049	0.115166949632145	0.212212953557149	0.00737100737100737	1	2	8	11	1630	0.00877893056664006	0.0211946050096339	0.115964712578258	0.182767710438904	0.00674846625766871	0.0127693535514765	16	867	3258	24934	1	0.141239534891186	0.0881353409791061	Inf	0.156795677440391	1.08164518109269	0.56687431321034	1.09334094057793	0.139728097211513	1	0.125613040472576	0.000440288054874629	1237	1226
TCGA-HU-A4GP-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	209	0	1	3	4	204	8364	5	10	5	20	1973	13	11	3	27	1966	6	19	47	72	2246	5	17	63	85	2179	2	3	5	10	287	0.0478468899521531	0.117647058823529	0.131711794401101	0.893215822914532	0.0348432055749129	1	4	3	8	291	0.0382775119617225	0.111111111111111	0.129563668744435	0.857579228713249	0.0274914089347079	0.0526315789473684	11	110	578	3847	0.928062890061875	0.665623543560206	0.361738921630875	Inf	0.695973576596414	2.08792072978924	0.165679355228702	2.49515122633783	0.556778861277131	0.980081973699239	0.522077240425217	0.146353090735738	198	193
TCGA-HU-A4GQ-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	1922	1	14	52	66	1853	75973	16	138	11	165	16104	20	128	26	174	16706	8	84	703	795	21303	6	91	622	719	21860	1	7	9	17	2403	0.00884495317377731	0.023643949930459	0.109926806953339	0.215088117136843	0.00707449022055764	0	9	6	15	2323	0.00780437044745057	0.0188679245283019	0.109045674318171	0.173027721147833	0.00645716745587602	0.00832466181061394	16	1323	4726	38437	1	0.0983616728957035	0.0614605164101828	Inf	0.109133305752709	0.652363823227133	0.802802332571056	0.625628487669348	0.10339351160581	1	0.093129184968992	7.65739041610025e-05	1906	1837
TCGA-HU-A4GU-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	1624	2	9	44	53	1569	64329	16	90	46	152	14005	13	93	48	154	14537	6	108	505	619	17723	11	112	521	644	18064	2	10	16	28	2025	0.0172413793103448	0.0434782608695652	0.112101417183348	0.38784755770263	0.0138271604938272	3	14	9	26	2016	0.0160098522167488	0.0420032310177706	0.11375049370874	0.369257571095212	0.0128968253968254	0.0184729064039409	30	1013	4041	31746	1	0.232660061707587	0.166485978610148	Inf	0.254726066447864	2.60469889514826	0.0355294117689745	3.27293506438555	0.215788894822224	1	0.196207942806005	2.70660369922644e-05	1594	1539
TCGA-HU-A4H3-01A-21D-A25D-08	0	0	0	0	981	0	12	90	102	879	36039	14	61	13	88	8107	4	76	20	100	8189	5	54	291	350	9935	7	59	275	341	9808	1	5	2	8	1149	0.00815494393476045	0.0234604105571848	0.117149265905383	0.200260841379346	0.00696257615317668	0	7	7	14	1186	0.0142711518858308	0.04	0.119375943633619	0.335075885328836	0.0118043844856661	0.0101936799184506	10	568	2335	17408	1	0.13126071861046	0.0707718150208434	Inf	0.146284537243541	0.704603854389722	0.779220085965603	0.677761452586245	0.134447378576131	1	0.120467735838225	0.00934194808273082	971	869
TCGA-HU-A4H4-01A-21D-A25D-08	0	0	0	0	763	0	0	1	1	762	31242	11	130	28	169	7370	18	128	37	183	7500	7	48	155	210	8173	6	44	150	200	8199	2	3	6	11	1081	0.0144167758846658	0.055	0.131845346993536	0.417155411655874	0.0101757631822387	1	2	4	7	1019	0.00917431192660551	0.0333333333333333	0.124678820506546	0.26735361465489	0.00686947988223749	0.0170380078636959	13	305	2100	14272	0.999999965854097	0.289687073384216	0.169298602876328	Inf	0.318712189278227	1.79912087912088	0.227760780627919	2.03877860851045	0.255612802498048	0.999999998133695	0.230391120268374	0.0354150113883151	750	749
TCGA-HU-A4H5-01A-21D-A25D-08	0	0	0	0	289	1	0	4	4	284	11644	17	14	13	44	2698	18	14	9	41	2842	35	21	54	110	3008	16	29	44	89	3096	4	3	3	10	409	0.0346020761245675	0.112359550561798	0.132105943152455	0.850526084448229	0.0244498777506112	5	3	6	14	383	0.0484429065743945	0.127272727272727	0.127327127659574	0.999572751008782	0.0365535248041775	0.0622837370242214	18	131	792	5312	0.663052902100058	0.921578038300944	0.576783618016717	Inf	0.931055521659549	1.36007130124777	0.211981582629392	1.43712833593609	0.707792207792208	0.901495860824969	0.678280690595176	1	271	266
TCGA-HU-A4H6-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	107	0	0	0	0	107	4387	1	3	4	8	987	3	3	3	9	1011	2	4	41	47	1203	2	5	36	43	1186	1	0	2	3	142	0.0280373831775701	0.0697674418604651	0.11973018549747	0.582705535538814	0.0211267605633803	0	0	0	0	135	0	0	0.112219451371571	0	0	0.0280373831775701	3	78	277	2112	0.996618486096543	0.293344928897855	0.0778687351586954	Inf	0.319427730980078	2.15613718411552	0.390003399639615	2.54024144897054	0.224014252895119	0.999075341643933	0.203395310979036	1	104	104
TCGA-IN-7806-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	85	0	1	1	2	83	3403	2	5	2	9	794	3	9	1	13	755	0	4	33	37	902	2	7	15	24	952	0	2	5	7	98	0.0823529411764706	0.291666666666667	0.102941176470588	2.83333333333333	0.0714285714285714	0	0	4	4	112	0.0470588235294118	0.108108108108108	0.124168514412417	0.870656370656371	0.0357142857142857	0.105882352941176	9	41	210	1644	0.112035437056603	1.71787047394363	0.832183892466912	Inf	1.58914285714286	0	1	0	1.65535714285714	0.0920675285901505	1.80589859228057	0.000221141088014153	76	74
TCGA-IN-7808-01A-11D-2201-08	0	0	0	0	124	0	1	0	1	123	5043	2	7	2	11	1156	4	7	5	16	1215	3	9	31	43	1332	7	7	39	53	1340	1	3	1	5	166	0.0403225806451613	0.0943396226415094	0.123880597014925	0.761536712889293	0.0301204819277108	0	1	2	3	157	0.0241935483870968	0.0697674418604651	0.117867867867868	0.591912309287513	0.0191082802547771	0.032258064516129	4	76	323	2349	0.989906919916885	0.38285383790656	0.126975863824228	Inf	0.413622291021672	0.827244582043344	0.724674462341439	0.808122040777866	0.35453339230429	0.992813012483464	0.325720039752862	0.569230769230769	120	119
TCGA-IN-8462-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	131	0	1	2	3	128	5248	3	6	1	10	1202	2	6	7	15	1273	3	17	32	52	1321	4	12	35	51	1452	0	2	3	5	192	0.0381679389312977	0.0980392156862745	0.132231404958678	0.741421568627451	0.0260416666666667	2	2	2	6	179	0.0458015267175573	0.115384615384615	0.13550340651022	0.851525569402664	0.0335195530726257	0.0534351145038168	7	67	371	2402	0.879573673149486	0.676511147757759	0.304700806763961	Inf	0.70703722590515	2.13554100885637	0.239448331047922	2.58840237937417	0.557790562014724	0.954041877592714	0.522224972721867	0.361455108359133	124	121
TCGA-IN-8663-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	193	0	2	1	3	190	7790	4	11	15	30	1769	4	20	22	46	1946	6	9	44	59	2033	8	10	37	55	2042	4	1	3	8	269	0.0414507772020725	0.145454545454545	0.131733594515181	1.10415680973302	0.0297397769516729	0	0	2	2	281	0.0103626943005181	0.0338983050847458	0.138219380226267	0.245250015079317	0.00711743772241993	0.0466321243523316	9	86	550	3525	0.906665368124408	0.670775642260274	0.337797441995372	Inf	0.701913875598086	2.11688311688312	0.109948112911789	2.56274418840732	0.457351290684624	0.988435633592089	0.421713781694024	1	184	181
TCGA-IP-7968-01A-11D-2201-08	0	0	0	0	126	0	2	1	3	122	5002	7	6	2	15	1093	2	2	2	6	1163	4	9	36	49	1327	1	3	48	52	1419	0	0	1	1	175	0.00793650793650794	0.0192307692307692	0.123326286116984	0.155934065934066	0.00571428571428571	3	3	3	9	163	0.0714285714285714	0.183673469387755	0.122833458929917	1.49530487041442	0.0552147239263804	0.0555555555555556	7	82	338	2408	0.930547282706135	0.608258962764294	0.275473853926207	Inf	0.638986769496709	4.87455621301775	0.0155831418896023	10.6670717648811	0.386869540715695	0.994032012048049	0.356301869529803	1	119	115
Totals	0	0	0	0	107861	190	506	2416	2922	104627	4289707	1819	10531	3529	15879	1002818	1974	10609	3731	16314	1020717	1585	5247	29661	36493	1127405	1463	5508	28970	35941	1138767	365	1136	1083	2584	145322	0.0239567591622551	0.0718956066887399	0.127613462631074	0.563385752619123	0.0177812031213443	424	1040	1099	2563	142454	0.0237620641381037	0.0702326473570274	0.126355657461161	0.555833025352391	0.017991772782793	0.0275447103216176	2971	58708	287776	1978396	1	0.347907092718889	0.337164611161226	Inf	0.379318151459523	2.03845128943246	1.62381798207644e-85	2.40114635631306	0.293066206165369	1	0.265739913847961	1.95786978197677e-207	104890	101656
