SampleName	CN_cNMF	Methlyation_cNMF	mRNAseq_cNMF	mRNAseq_cHierarchical	miRseq_cNMF	miRseq_cHierarchical	miRseq_Mature_cNMF	miRseq_Mature_cHierarchical
TCGA-2G-AAEW-01	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAEX-01	2	1	1	2	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAF1-01	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAF4-01	2	1	1	2	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAF6-01	2	1	1	2	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAF8-01	1	1	1	2	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAFE-01	2	1	1	1	1	1	1	1
TCGA-2G-AAFG-01	2	1	1	2	2	1	1	2
TCGA-2G-AAFH-01	2	1	1	2	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAFI-01	3	2	2	3	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAFJ-01	3	3	3	4	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAFL-01	1	2	2	5	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAFM-01	1	2	2	5	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAFN-01	3	2	2	6	2	2	2	3
TCGA-2G-AAFO-01	1	2	2	5	2	1	3	1
TCGA-2G-AAFV-01	3	3	3	7	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAFY-01	1	2	2	6	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAFZ-01	3	3	3	7	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAG0-01	1	2	2	6	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAG3-01	1	3	3	4	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAG5-01	1	3	3	4	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAG6-01	3	3	3	4	3	3	4	4
TCGA-2G-AAG7-01	3	2	2	6	2	2	2	3
TCGA-2G-AAG8-01	1	2	2	5	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAG9-01	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAGA-01	2	2	2	5	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAGC-01	3	2	2	3	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAGE-01	3	2	2	6	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAGF-01	3	2	2	6	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAGG-01	3	3	3	4	3	3	4	4
TCGA-2G-AAGI-01	3	3	3	4	3	3	4	5
TCGA-2G-AAGJ-01	1	2	2	6	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAGK-01	3	2	2	3	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAGM-01	3	3	3	7	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAGN-01	3	2	2	6	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAGO-01	2	2	2	6	2	2	2	3
TCGA-2G-AAGP-01	1	2	3	4	3	3	4	4
TCGA-2G-AAGS-01	3	2	3	3	2	2	4	3
TCGA-2G-AAGT-01	3	2	3	7	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAGV-01	3	3	3	4	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAGW-01	3	2	2	6	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAGX-01	2	3	3	4	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAGY-01	2	3	3	4	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAGZ-01	1	2	2	5	1	1	3	1
TCGA-2G-AAH0-01	2	1	1	1	4	1	1	6
TCGA-2G-AAH2-01	3	2	3	4	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAH3-01	2	2	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAH4-01	3	3	3	7	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAH8-01	2	3	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAHA-01	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAHC-01	1	1	1	1	1	1	3	7
TCGA-2G-AAHG-01	3	3	1	2	4	1	1	6
TCGA-2G-AAHL-01	2	3	1	1	1	1	1	1
TCGA-2G-AAHN-01	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAHP-01	2	3	1	2	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAHT-01	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAKD-01	2	2	2	6	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAKG-01	3	2	2	3	2	2	2	3
TCGA-2G-AAKH-01	1	2	2	5	2	1	2	3
TCGA-2G-AAKL-01	3	2	2	6	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAKM-01	3	2	2	6	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAKO-01	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAL5-01	3	3	3	4	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAL7-01	3	2	2	6	2	2	2	3
TCGA-2G-AALF-01	1	3	3	7	3	3	4	4
TCGA-2G-AALG-01	3	2	3	4	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AALN-01	3	3	3	3	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AALO-01	3	2	3	4	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AALP-01	3	2	2	3	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AALQ-01	3	3	3	7	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AALR-01	3	3	3	7	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AALS-01	1	1	2	3	2	2	4	5
TCGA-2G-AALT-01	3	3	3	4	3	3	4	5
TCGA-2G-AALW-01	3	3	3	4	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AALX-01	3	3	3	4	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AALY-01	2	2	2	6	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AALZ-01	1	3	3	4	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAM2-01	3	2	2	6	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAM3-01	3	3	3	4	NA	NA	NA	NA
TCGA-2G-AAM4-01	3	3	2	6	3	2	2	3
TCGA-2X-A9D5-01	2	1	1	1	4	1	1	6
TCGA-2X-A9D6-01	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-4K-AA1G-01	2	3	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-4K-AA1H-01	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-4K-AA1I-01	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-4K-AAAL-01	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-S6-A8JW-01	2	3	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-S6-A8JX-01	2	3	1	2	4	1	1	6
TCGA-S6-A8JY-01	2	3	1	2	NA	NA	NA	NA
TCGA-SB-A6J6-01	2	1	1	2	4	1	1	6
TCGA-SB-A76C-01	2	3	1	1	4	1	1	2
TCGA-SN-A6IS-01	2	1	1	2	4	1	1	6
TCGA-SN-A84W-01	3	3	3	4	3	3	4	4
TCGA-SN-A84X-01	3	1	3	4	3	3	4	4
TCGA-SN-A84Y-01	3	2	2	6	2	2	2	3
TCGA-SO-A8JP-01	2	3	1	2	NA	NA	NA	NA
TCGA-VF-A8A8-01	3	2	2	6	NA	NA	NA	NA
TCGA-VF-A8A9-01	2	1	1	2	2	1	3	7
TCGA-VF-A8AA-01	1	1	1	1	1	1	3	1
TCGA-VF-A8AB-01	1	1	1	1	1	1	3	7
TCGA-VF-A8AC-01	1	1	1	1	1	1	3	1
TCGA-VF-A8AD-01	1	2	2	6	2	2	2	3
TCGA-VF-A8AE-01	1	1	1	2	4	1	3	7
TCGA-W4-A7U2-01	2	1	1	2	NA	NA	NA	NA
TCGA-W4-A7U3-01	1	2	3	7	NA	NA	NA	NA
TCGA-W4-A7U4-01	3	2	2	6	2	2	2	3
TCGA-WZ-A7V3-01	2	1	1	2	4	1	1	2
TCGA-WZ-A7V4-01	1	1	1	1	1	1	3	1
TCGA-WZ-A7V5-01	2	1	1	1	4	1	3	7
TCGA-WZ-A8D5-01	2	1	1	1	2	1	3	2
TCGA-X3-A8G4-01	3	2	3	3	2	2	4	3
TCGA-XE-A8H1-01	1	2	2	5	NA	NA	NA	NA
TCGA-XE-A8H4-01	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-XE-A8H5-01	2	3	1	2	4	1	1	6
TCGA-XE-A9SE-01	3	1	1	2	4	1	1	6
TCGA-XE-AANI-01	3	3	3	4	3	3	4	4
TCGA-XE-AANJ-01	2	1	1	2	4	1	1	2
TCGA-XE-AANR-01	2	2	1	1	1	1	3	1
TCGA-XE-AANV-01	2	1	1	1	4	1	3	1
TCGA-XE-AAO3-01	2	1	1	2	NA	NA	NA	NA
TCGA-XE-AAO4-01	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA
TCGA-XE-AAO6-01	2	1	1	2	2	1	2	2
TCGA-XE-AAOB-01	1	1	2	3	3	3	4	5
TCGA-XE-AAOC-01	3	3	3	4	3	3	4	4
TCGA-XE-AAOD-01	1	1	1	1	1	1	3	1
TCGA-XE-AAOF-01	1	1	1	1	4	1	1	6
TCGA-XE-AAOJ-01	3	3	3	7	3	3	4	4
TCGA-XE-AAOL-01	2	3	1	2	NA	NA	NA	NA
TCGA-XY-A89B-01	1	1	1	1	2	1	3	7
TCGA-XY-A8S2-01	3	2	2	6	2	2	2	3
TCGA-XY-A8S3-01	3	2	2	3	2	2	2	3
TCGA-XY-A9T9-01	2	1	1	2	4	1	1	6
TCGA-YU-A90P-01	3	2	2	6	NA	NA	NA	NA
TCGA-YU-A90Q-01	2	3	1	1	4	1	1	6
TCGA-YU-A90S-01	1	1	1	1	1	1	3	7
TCGA-YU-A90W-01	2	3	1	2	4	1	1	6
TCGA-YU-A90Y-01	3	2	2	3	2	2	4	3
TCGA-YU-A912-01	3	3	1	1	4	1	1	6
TCGA-YU-A94D-01	1	3	3	4	3	3	4	4
TCGA-YU-A94I-01	3	3	3	7	3	3	4	4
TCGA-YU-AA4L-01	1	2	3	7	NA	NA	NA	NA
TCGA-YU-AA61-01	1	2	3	7	3	3	4	5
TCGA-ZM-AA05-01	1	1	1	1	4	1	3	7
TCGA-ZM-AA06-01	3	1	1	1	4	1	1	2
TCGA-ZM-AA0B-01	2	1	1	2	4	1	1	2
TCGA-ZM-AA0D-01	1	1	1	1	1	1	3	1
TCGA-ZM-AA0E-01	1	1	1	1	4	1	1	7
TCGA-ZM-AA0F-01	1	1	1	1	4	1	3	7
TCGA-ZM-AA0H-01	1	1	1	1	4	1	3	7
TCGA-ZM-AA0N-01	2	1	1	2	NA	NA	NA	NA
