		Clinical Features	MRNA_CNMF		MRNA_CHIERARCHICAL		CN_CNMF		METHLYATION_CNMF		RPPA_CNMF		RPPA_CHIERARCHICAL		MRNASEQ_CNMF		MRNASEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_CNMF		MIRSEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_MATURE_CNMF		MIRSEQ_MATURE_CHIERARCHICAL	
	nCNV (%)	nWild-Type	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q
1p gain	50 (9%)	489	0.5349	0.643	0.21792	0.295	9.9999e-06	2.95e-05	0.00046	0.00107	0.04534	0.0723	0.26343	0.347	9.9999e-06	2.95e-05	3e-05	8.22e-05	2e-05	5.64e-05	4e-05	0.000108	0.00239	0.00498	0.00294	0.00605
1q gain	188 (35%)	351	0.18221	0.253	0.01017	0.0188	9.9999e-06	2.95e-05	0.18727	0.259	0.093529	0.14	0.01574	0.028	2e-05	5.64e-05	0.00017	0.000429	9.9999e-06	2.95e-05	0.01701	0.03	0.90092	0.995	0.076969	0.118
2p gain	95 (18%)	444	0.85666	0.956	0.37197	0.466	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.056679	0.0881	0.24399	0.325	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	5.9999e-05	0.000158	0.00017	0.000429
2q gain	79 (15%)	460	0.34288	0.437	0.60195	0.71	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.063489	0.0979	0.13228	0.191	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	8.9999e-05	0.000234	3e-04	0.000725
3p gain	49 (9%)	490	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	2.95e-05	0.0092599	0.0172	0.30198	0.391	0.94664	1	4e-05	0.000108	0.0055399	0.0107	0.00111	0.00243	0.00098999	0.00219	0.01489	0.0266	0.03567	0.0595
3q gain	84 (16%)	455	0.61659	0.727	0.25326	0.335	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.10517	0.155	0.15964	0.227	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00028	0.00068	5e-05	0.000133
4p gain	14 (3%)	525	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	2.95e-05	0.84614	0.95	0.37388	0.467	0.03787	0.0625	0.00054999	0.00126	0.04522	0.0722	0.00407	0.00809	0.00054999	0.00126	0.34765	0.441	0.43472	0.533
4q gain	8 (1%)	531	NA	NA	NA	NA	0.00457	0.00901	0.61766	0.727	NA	NA	NA	NA	0.02934	0.0502	0.5473	0.655	0.27147	0.356	0.075699	0.116	0.79564	0.904	0.63542	0.745
5p gain	51 (9%)	488	1	1	0.51381	0.622	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.14723	0.21	0.70541	0.81	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00021	0.00052	9.9999e-06	2.95e-05
5q gain	20 (4%)	519	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	2.95e-05	0.03569	0.0595	0.36836	0.463	0.28979	0.377	0.00025	0.000613	0.0065199	0.0125	0.00251	0.00519	0.00014	0.000355	0.22964	0.308	0.00012	0.000307
6p gain	80 (15%)	459	0.20778	0.284	0.66366	0.771	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.098419	0.146	0.83289	0.94	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00211	0.00445	0.01938	0.0339
6q gain	64 (12%)	475	0.20698	0.283	0.66136	0.771	9.9999e-06	2.95e-05	0.00045	0.00105	0.051459	0.0809	0.75789	0.865	2e-05	5.64e-05	0.00049	0.00113	0.00099999	0.00221	5e-05	0.000133	0.01594	0.0283	0.30278	0.392
7p gain	67 (12%)	472	0.85325	0.954	0.90505	0.996	9.9999e-06	2.95e-05	0.00134	0.0029	0.84631	0.95	0.86387	0.963	0.039	0.0639	0.062359	0.0963	0.01316	0.0238	0.4314	0.53	0.03113	0.0525	0.052799	0.0826
7q gain	66 (12%)	473	0.85393	0.954	0.90317	0.996	9.9999e-06	2.95e-05	0.00151	0.00324	0.85363	0.954	0.53706	0.644	0.17791	0.248	0.0274	0.0471	0.081709	0.124	0.47634	0.582	0.089809	0.136	0.20947	0.285
8p gain	118 (22%)	421	0.35593	0.451	0.40186	0.498	9.9999e-06	2.95e-05	0.88259	0.978	0.02137	0.0373	0.21657	0.294	0.13902	0.199	0.03578	0.0596	0.30709	0.396	0.02915	0.05	0.11573	0.167	0.50763	0.616
8q gain	159 (29%)	380	0.01037	0.0191	0.03103	0.0524	9.9999e-06	2.95e-05	0.04005	0.065	3e-04	0.000725	0.02192	0.0382	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00019	0.000476	9.9999e-06	2.95e-05	0.00046	0.00107	0.0074499	0.0142
9p gain	22 (4%)	517	NA	NA	NA	NA	6.9999e-05	0.000184	0.00379	0.00761	0.095699	0.142	0.32741	0.42	0.0050099	0.00978	0.01325	0.0239	0.01068	0.0197	0.11104	0.162	0.1052	0.155	0.36882	0.463
9q gain	9 (2%)	530	NA	NA	NA	NA	0.03083	0.0521	0.1671	0.235	NA	NA	NA	NA	0.35994	0.455	0.30524	0.394	0.17144	0.24	0.51135	0.62	0.66264	0.771	0.26312	0.347
10p gain	117 (22%)	422	0.0076999	0.0145	0.089989	0.136	9.9999e-06	2.95e-05	0.87208	0.969	0.19313	0.266	0.81425	0.921	0.093249	0.139	0.16488	0.232	0.57521	0.682	0.01853	0.0325	0.53686	0.644	0.0359	0.0597
10q gain	109 (20%)	430	0.00495	0.0097	0.091449	0.137	4e-05	0.000108	0.72672	0.832	0.12342	0.178	0.66185	0.771	0.13979	0.2	0.37924	0.472	0.3403	0.434	0.00195	0.00416	0.56489	0.671	0.060299	0.0936
11p gain	23 (4%)	516	0.0392	0.0641	0.19657	0.27	9.9999e-06	2.95e-05	0.04439	0.071	0.054959	0.0857	0.11419	0.166	0.00327	0.00672	0.00149	0.00322	0.00223	0.00467	0.0067199	0.0129	0.2285	0.307	0.36189	0.457
11q gain	19 (4%)	520	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	2.95e-05	0.11467	0.166	0.17872	0.249	0.0115	0.0211	0.03333	0.0559	0.10227	0.151	0.20853	0.285	0.091269	0.137	0.88541	0.979	0.65182	0.761
12p gain	71 (13%)	468	0.38667	0.48	0.6881	0.795	9.9999e-06	2.95e-05	3e-05	8.22e-05	0.91531	1	0.97212	1	9.9999e-06	2.95e-05	4e-05	0.000108	0.00055999	0.00128	0.00061999	0.0014	0.00402	0.00802	0.00346	0.00706
12q gain	54 (10%)	485	0.38644	0.48	0.68696	0.794	9.9999e-06	2.95e-05	0.0087999	0.0164	0.96266	1	0.9809	1	0.00439	0.00867	0.04217	0.0678	0.04859	0.0771	0.10732	0.157	0.19977	0.274	0.2754	0.36
13q gain	30 (6%)	509	0.13784	0.197	0.0067999	0.013	9.9999e-06	2.95e-05	5.9999e-05	0.000158	0.25153	0.334	0.01161	0.0213	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.0070699	0.0135	0.02365	0.041
14q gain	37 (7%)	502	1	1	0.84317	0.948	9.9999e-06	2.95e-05	0.00215	0.00452	0.085929	0.13	0.69087	0.796	0.00023	0.000569	0.00061999	0.0014	0.0061999	0.012	0.00049	0.00113	0.092559	0.139	0.31207	0.402
15q gain	11 (2%)	528	NA	NA	NA	NA	0.00056999	0.0013	0.91456	1	NA	NA	NA	NA	0.69076	0.796	0.59144	0.699	0.63763	0.747	0.91338	1	1	1	0.24921	0.332
16p gain	27 (5%)	512	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	2.95e-05	0.00245	0.0051	0.1798	0.25	0.63437	0.745	0.01901	0.0333	0.052319	0.082	0.00337	0.00689	0.23677	0.317	0.14518	0.207	0.35821	0.454
16q gain	10 (2%)	529	NA	NA	NA	NA	0.0121	0.022	0.051069	0.0805	0.94372	1	0.8391	0.945	0.11135	0.162	0.28353	0.37	0.070719	0.109	0.21084	0.287	0.62264	0.732	0.79635	0.904
17p gain	12 (2%)	527	NA	NA	NA	NA	0.0015	0.00323	0.16033	0.227	0.22394	0.302	1	1	0.11424	0.166	0.0413	0.0666	0.077449	0.118	0.13411	0.193	0.34672	0.441	0.66511	0.771
17q gain	30 (6%)	509	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.04117	0.0665	1	1	3e-05	8.22e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00012	0.000307	0.0022	0.00462	0.050009	0.079	0.091509	0.137
18p gain	72 (13%)	467	0.33488	0.429	0.24076	0.321	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.01208	0.022	0.16304	0.231	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05
18q gain	45 (8%)	494	0.25482	0.337	0.04322	0.0693	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.27944	0.365	0.095269	0.142	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	2e-05	5.64e-05	9.9999e-05	0.000258
19p gain	54 (10%)	485	0.0393	0.0641	0.03018	0.0513	9.9999e-06	2.95e-05	0.00027	0.000659	0.90771	0.997	0.075249	0.115	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	4e-04	0.000946	0.082579	0.125
19q gain	57 (11%)	482	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	2.95e-05	3e-05	8.22e-05	0.48701	0.592	0.04309	0.0692	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00021	0.00052	0.01358	0.0244
20p gain	112 (21%)	427	0.0080299	0.0151	0.04943	0.0783	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.16276	0.23	0.74276	0.849	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00025	0.000613	9.9999e-06	2.95e-05
20q gain	132 (24%)	407	0.00198	0.00421	0.0071099	0.0135	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.03215	0.054	0.67262	0.779	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05
21q gain	39 (7%)	500	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	2.95e-05	0.00046	0.00107	0.42529	0.524	0.45385	0.556	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00034	0.000816	0.23362	0.313
22q gain	31 (6%)	508	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.37244	0.466	0.18672	0.259	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	4e-05	0.000108	2e-05	5.64e-05
xp gain	64 (12%)	475	0.5761	0.682	0.90776	0.997	9.9999e-06	2.95e-05	0.1079	0.158	0.87355	0.969	0.55769	0.665	0.52485	0.634	0.78791	0.897	0.26588	0.349	0.81804	0.924	0.22709	0.306	0.42528	0.524
xq gain	64 (12%)	475	0.70478	0.81	0.92726	1	9.9999e-06	2.95e-05	0.587	0.694	0.87359	0.969	0.33735	0.431	0.63877	0.747	0.88507	0.979	0.55497	0.663	0.98072	1	0.22398	0.302	0.87049	0.969
1p loss	25 (5%)	514	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.78716	0.897	0.36203	0.457	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	7.9999e-05	0.000208	9.9999e-06	2.95e-05	0.28952	0.377	0.00059999	0.00136
1q loss	14 (3%)	525	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	2.95e-05	3e-05	8.22e-05	NA	NA	NA	NA	7.9999e-05	0.000208	0.00108	0.00237	0.00032	0.000772	9.9999e-06	2.95e-05	0.526	0.634	0.0074999	0.0142
2p loss	11 (2%)	528	NA	NA	NA	NA	0.00024	0.000592	0.30089	0.39	NA	NA	NA	NA	0.0053299	0.0103	0.080799	0.123	0.40079	0.497	0.10675	0.157	0.55949	0.667	0.72141	0.826
2q loss	17 (3%)	522	NA	NA	NA	NA	2e-05	5.64e-05	0.11556	0.167	NA	NA	NA	NA	0.00028	0.00068	0.01464	0.0262	0.01846	0.0324	0.03024	0.0513	0.41645	0.515	0.80099	0.908
3p loss	51 (9%)	488	0.03828	0.063	0.00072999	0.00164	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.02247	0.0391	0.12494	0.18	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.01512	0.027	9.9999e-05	0.000258
3q loss	31 (6%)	508	0.03817	0.0629	0.00071999	0.00162	9.9999e-06	2.95e-05	5e-05	0.000133	0.064189	0.0988	0.26277	0.347	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00018	0.000452	0.01244	0.0226	0.096839	0.144
4p loss	105 (19%)	434	0.0037	0.00748	0.00163	0.00349	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00106	0.00233	0.18754	0.259	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05
4q loss	105 (19%)	434	0.15083	0.214	0.0051299	0.01	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.01346	0.0243	0.18954	0.262	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05
5p loss	55 (10%)	484	0.051689	0.0811	0.03941	0.0642	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00378	0.00761	0.104	0.153	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	5e-05	0.000133	0.00085999	0.00191
5q loss	74 (14%)	465	0.01318	0.0238	0.0099899	0.0185	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.0012	0.00261	0.00246	0.00511	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00014	0.000355	3e-05	8.22e-05
6p loss	18 (3%)	521	0.37604	0.47	0.02901	0.0498	9.9999e-06	2.95e-05	0.00127	0.00276	0.36376	0.458	1	1	0.00037	0.000884	2e-04	0.000498	0.0062699	0.0121	0.00397	0.00794	0.069619	0.107	0.02467	0.0427
6q loss	25 (5%)	514	0.3775	0.471	0.03013	0.0513	9.9999e-06	2.95e-05	3e-05	8.22e-05	0.47773	0.583	0.80397	0.91	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00018	0.000452	2e-05	5.64e-05	0.01242	0.0226	0.00358	0.00729
7p loss	44 (8%)	495	0.03986	0.0648	0.19348	0.266	9.9999e-06	2.95e-05	4e-04	0.000946	0.03708	0.0614	0.55274	0.661	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.062049	0.096	0.061889	0.0959
7q loss	42 (8%)	497	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.04621	0.0736	0.01399	0.0251	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00266	0.00549	0.00034	0.000816
8p loss	80 (15%)	459	0.0078199	0.0147	4e-05	0.000108	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.03355	0.0561	0.02514	0.0433	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05
8q loss	25 (5%)	514	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.32706	0.42	0.83723	0.944	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	3e-05	8.22e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00094999	0.00211	0.0086999	0.0163
9p loss	103 (19%)	436	0.00114	0.00249	2e-05	5.64e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00379	0.00761	0.5624	0.669	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.0090999	0.017	0.00061999	0.0014
9q loss	122 (23%)	417	4e-05	0.000108	3e-05	8.22e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00037	0.000884	0.70039	0.806	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00111	0.00243	5e-05	0.000133
10p loss	43 (8%)	496	0.03896	0.0639	0.02949	0.0504	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.055149	0.0859	0.18688	0.259	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.02506	0.0433	0.00406	0.00809
10q loss	40 (7%)	499	0.1359	0.195	0.16717	0.235	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.054579	0.0852	0.1702	0.239	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.03156	0.0531	0.00466	0.00917
11p loss	75 (14%)	464	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.30013	0.39	0.331	0.424	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00046	0.00107	2e-05	5.64e-05
11q loss	72 (13%)	467	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.85246	0.954	0.78856	0.897	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05
12p loss	43 (8%)	496	0.13776	0.197	0.165	0.232	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.04163	0.067	0.03759	0.0622	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00038	0.000905	0.0025	0.00518
12q loss	36 (7%)	503	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.1022	0.151	0.01559	0.0277	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	3e-05	8.22e-05	0.00045	0.00105
13q loss	93 (17%)	446	0.90452	0.996	0.19558	0.269	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.02453	0.0425	0.49997	0.607	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	2e-05	5.64e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.16472	0.232	0.00203	0.0043
14q loss	61 (11%)	478	0.0021	0.00443	0.00045	0.00105	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.0143	0.0256	0.04995	0.079	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00497	0.00972	2e-05	5.64e-05
15q loss	109 (20%)	430	0.00073999	0.00165	6.9999e-05	0.000184	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00089999	0.002	0.48366	0.589	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	2e-05	5.64e-05	9.9999e-06	2.95e-05
16p loss	97 (18%)	442	0.00232	0.00485	0.0076699	0.0145	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.091969	0.138	0.32051	0.412	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00416	0.00825	9.9999e-06	2.95e-05
16q loss	138 (26%)	401	0.00079999	0.00179	0.00135	0.00292	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.34491	0.439	0.97395	1	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00026	0.000636	9.9999e-06	2.95e-05
17p loss	130 (24%)	409	0.00328	0.00672	0.00014	0.000355	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00361	0.00732	0.36903	0.463	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05
17q loss	93 (17%)	446	0.00199	0.00422	2e-05	5.64e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.10741	0.157	0.91858	1	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00417	0.00826	0.00051999	0.0012
18p loss	52 (10%)	487	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.47743	0.583	0.56742	0.674	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-05	0.000258	7.9999e-05	0.000208	0.01736	0.0306	0.00361	0.00732
18q loss	65 (12%)	474	0.5347	0.643	0.51444	0.622	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.53074	0.639	1	1	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.01147	0.0211	0.00041	0.000967
19p loss	59 (11%)	480	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.097009	0.144	0.26963	0.354	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.0052299	0.0102	9.9999e-06	2.95e-05
19q loss	56 (10%)	483	0.2554	0.337	0.01674	0.0296	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.25037	0.333	0.71736	0.823	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.0117	0.0214	2e-05	5.64e-05
20p loss	19 (4%)	520	NA	NA	NA	NA	9.9999e-06	2.95e-05	0.2101	0.286	0.46498	0.569	0.6654	0.771	0.01617	0.0286	0.01026	0.019	0.0070699	0.0135	0.051289	0.0808	0.42081	0.52	0.43036	0.529
20q loss	9 (2%)	530	NA	NA	NA	NA	5e-04	0.00115	0.086409	0.131	0.6438	0.752	1	1	0.03698	0.0614	0.0307	0.052	0.04049	0.0655	0.047	0.0747	0.17416	0.243	0.25083	0.333
21q loss	54 (10%)	485	0.04007	0.065	0.02991	0.051	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.24	0.321	0.42525	0.524	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00364	0.00737	2e-05	5.64e-05
22q loss	109 (20%)	430	0.00196	0.00417	0.0075899	0.0144	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.03884	0.0638	0.27905	0.365	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00382	0.00766	0.00013	0.000332
xp loss	85 (16%)	454	0.00164	0.00351	4e-04	0.000946	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	2e-05	5.64e-05	0.21855	0.295	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.00065999	0.00149	9.9999e-06	2.95e-05
xq loss	71 (13%)	468	0.0083099	0.0156	0.0047	0.00923	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	2e-04	0.000498	0.21374	0.29	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	9.9999e-06	2.95e-05	0.0057599	0.0111	9.9999e-06	2.95e-05
