Correlation between gene mutation status and selected clinical features
Overview
Introduction

This pipeline computes the correlation between significantly recurrent gene mutations and selected clinical features.

Summary

Testing the association between mutation status of 187 genes and 15 clinical features across 146 patients, one significant finding detected with Q value < 0.25.

  • MIPEP mutation correlated to 'Time to Death'.

Results
Overview of the results

Table 1.  Get Full Table Overview of the association between mutation status of 187 genes and 15 clinical features. Shown in the table are P values (Q values). Thresholded by Q value < 0.25, one significant finding detected.

Clinical
Features 		Time
to
Death 		YEARS
TO
BIRTH 		PATHOLOGIC
STAGE 		PATHOLOGY
T
STAGE 		PATHOLOGY
N
STAGE 		PATHOLOGY
M
STAGE 		GENDER RADIATION
THERAPY 		HISTOLOGICAL
TYPE 		NUMBER
PACK
YEARS
SMOKED 		YEAR
OF
TOBACCO
SMOKING
ONSET 		RESIDUAL
TUMOR 		NUMBER
OF
LYMPH
NODES 		RACE ETHNICITY
nMutated (%) nWild-Type logrank test Wilcoxon-test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Wilcoxon-test Wilcoxon-test Fisher's exact test Wilcoxon-test Fisher's exact test Fisher's exact test
MIPEP 3 (2%) 143 3.78e-05
(0.106) 		0.885
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.56
(1.00) 		0.28
(1.00) 		0.622
(1.00) 		0.308
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
TP53 100 (68%) 46 0.204
(1.00) 		0.568
(1.00) 		0.42
(1.00) 		0.748
(1.00) 		0.683
(1.00) 		0.567
(1.00) 		0.724
(1.00) 		0.395
(1.00) 		0.131
(1.00) 		0.354
(1.00) 		0.876
(1.00) 		0.0776
(1.00) 		0.753
(1.00) 		0.388
(1.00) 		0.647
(1.00)
RBM4 62 (42%) 84 0.251
(1.00) 		0.544
(1.00) 		0.922
(1.00) 		0.72
(1.00) 		0.441
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.698
(1.00) 		0.703
(1.00) 		0.984
(1.00) 		0.862
(1.00) 		0.859
(1.00) 		0.416
(1.00) 		0.299
(1.00) 		1
(1.00)
JMY 55 (38%) 91 0.711
(1.00) 		0.199
(1.00) 		0.454
(1.00) 		0.357
(1.00) 		0.845
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.542
(1.00) 		0.789
(1.00) 		0.316
(1.00) 		0.155
(1.00) 		0.712
(1.00) 		0.723
(1.00) 		0.397
(1.00) 		1
(1.00)
RIOK1 55 (38%) 91 0.654
(1.00) 		0.715
(1.00) 		0.965
(1.00) 		0.456
(1.00) 		0.556
(1.00) 		0.637
(1.00) 		0.026
(1.00) 		0.225
(1.00) 		0.222
(1.00) 		0.188
(1.00) 		0.78
(1.00) 		0.975
(1.00) 		0.214
(1.00) 		0.396
(1.00) 		1
(1.00)
LCE2A 46 (32%) 100 0.313
(1.00) 		0.0799
(1.00) 		0.08
(1.00) 		0.355
(1.00) 		0.683
(1.00) 		0.0675
(1.00) 		0.724
(1.00) 		0.216
(1.00) 		0.886
(1.00) 		0.346
(1.00) 		0.308
(1.00) 		0.243
(1.00) 		0.67
(1.00) 		0.419
(1.00) 		0.32
(1.00)
C1QB 35 (24%) 111 0.33
(1.00) 		0.153
(1.00) 		0.45
(1.00) 		0.569
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.444
(1.00) 		0.498
(1.00) 		1
(1.00) 		0.805
(1.00) 		0.2
(1.00) 		0.664
(1.00) 		0.552
(1.00) 		0.197
(1.00) 		1
(1.00)
SMAD4 32 (22%) 114 0.99
(1.00) 		0.943
(1.00) 		0.216
(1.00) 		0.368
(1.00) 		0.818
(1.00) 		0.569
(1.00) 		0.689
(1.00) 		0.623
(1.00) 		0.394
(1.00) 		0.334
(1.00) 		0.0494
(1.00) 		0.395
(1.00) 		0.881
(1.00) 		0.191
(1.00) 		1
(1.00)
CDKN2A 30 (21%) 116 0.341
(1.00) 		0.371
(1.00) 		0.25
(1.00) 		0.612
(1.00) 		0.103
(1.00) 		1
(1.00) 		0.307
(1.00) 		0.463
(1.00) 		1
(1.00) 		0.767
(1.00) 		0.856
(1.00) 		0.832
(1.00) 		0.0265
(1.00) 		0.413
(1.00) 		0.581
(1.00)
MLL2 29 (20%) 117 0.689
(1.00) 		0.8
(1.00) 		0.711
(1.00) 		0.892
(1.00) 		0.813
(1.00) 		0.571
(1.00) 		0.407
(1.00) 		0.805
(1.00) 		0.826
(1.00) 		0.606
(1.00) 		0.0693
(1.00) 		0.563
(1.00) 		0.479
(1.00) 		0.868
(1.00) 		1
(1.00)
AEBP1 26 (18%) 120 0.584
(1.00) 		0.957
(1.00) 		0.764
(1.00) 		0.773
(1.00) 		0.809
(1.00) 		0.569
(1.00) 		0.67
(1.00) 		0.799
(1.00) 		0.323
(1.00) 		0.455
(1.00) 		0.181
(1.00) 		0.959
(1.00) 		0.627
(1.00) 		0.409
(1.00) 		1
(1.00)
RBM47 25 (17%) 121 0.655
(1.00) 		0.86
(1.00) 		0.756
(1.00) 		0.759
(1.00) 		0.315
(1.00) 		0.431
(1.00) 		0.0508
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.419
(1.00) 		0.535
(1.00) 		0.871
(1.00) 		0.771
(1.00) 		0.429
(1.00) 		1
(1.00)
ANKRD36 24 (16%) 122 0.825
(1.00) 		0.236
(1.00) 		0.0257
(1.00) 		0.642
(1.00) 		0.442
(1.00) 		0.114
(1.00) 		0.662
(1.00) 		0.189
(1.00) 		0.622
(1.00) 		0.245
(1.00) 		0.363
(1.00) 		0.722
(1.00) 		0.0775
(1.00) 		0.412
(1.00) 		1
(1.00)
RFX1 24 (16%) 122 0.294
(1.00) 		0.464
(1.00) 		0.52
(1.00) 		0.874
(1.00) 		1
(1.00) 		0.566
(1.00) 		0.382
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.408
(1.00) 		0.609
(1.00) 		0.12
(1.00) 		0.295
(1.00) 		0.847
(1.00) 		1
(1.00)
TYRO3 14 (10%) 132 0.752
(1.00) 		0.0347
(1.00) 		0.312
(1.00) 		0.131
(1.00) 		1
(1.00) 		0.431
(1.00) 		0.575
(1.00) 		0.311
(1.00) 		1
(1.00) 		0.52
(1.00) 		0.115
(1.00) 		0.886
(1.00) 		0.2
(1.00) 		0.764
(1.00) 		0.385
(1.00)
NCOA3 14 (10%) 132 0.955
(1.00) 		0.707
(1.00) 		0.232
(1.00) 		0.581
(1.00) 		0.192
(1.00) 		0.431
(1.00) 		0.784
(1.00) 		0.311
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0921
(1.00) 		0.959
(1.00) 		0.111
(1.00) 		0.215
(1.00) 		0.473
(1.00) 		0.385
(1.00)
GPR6 12 (8%) 134 0.86
(1.00) 		0.549
(1.00) 		0.862
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.145
(1.00) 		1
(1.00) 		0.41
(1.00) 		0.673
(1.00) 		0.513
(1.00) 		0.673
(1.00) 		0.525
(1.00) 		0.724
(1.00) 		0.319
(1.00)
LZTS1 10 (7%) 136 0.274
(1.00) 		0.634
(1.00) 		1
(1.00) 		0.702
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.754
(1.00) 		0.684
(1.00) 		0.653
(1.00) 		0.0931
(1.00) 		0.374
(1.00) 		0.0819
(1.00) 		1
(1.00)
KRAS 123 (84%) 23 0.272
(1.00) 		0.721
(1.00) 		0.536
(1.00) 		0.517
(1.00) 		0.3
(1.00) 		1
(1.00) 		0.649
(1.00) 		0.186
(1.00) 		0.0375
(1.00) 		0.99
(1.00) 		0.672
(1.00) 		0.605
(1.00) 		0.952
(1.00) 		0.0398
(1.00) 		0.581
(1.00)
ZMIZ2 12 (8%) 134 0.566
(1.00) 		0.808
(1.00) 		0.307
(1.00) 		0.219
(1.00) 		0.731
(1.00) 		0.431
(1.00) 		0.385
(1.00) 		1
(1.00) 		0.411
(1.00) 		0.486
(1.00) 		0.0207
(1.00) 		1
(1.00) 		0.601
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
IRS4 16 (11%) 130 0.271
(1.00) 		0.913
(1.00) 		0.943
(1.00) 		0.137
(1.00) 		0.762
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0646
(1.00) 		0.759
(1.00) 		1
(1.00) 		0.943
(1.00) 		0.898
(1.00) 		0.0927
(1.00) 		0.122
(1.00) 		0.445
(1.00)
SIK3 13 (9%) 133 0.942
(1.00) 		0.703
(1.00) 		0.846
(1.00) 		1
(1.00) 		0.74
(1.00) 		1
(1.00) 		0.772
(1.00) 		0.509
(1.00) 		0.675
(1.00) 		0.542
(1.00) 		0.542
(1.00) 		0.334
(1.00) 		0.483
(1.00) 		0.00258
(1.00) 		1
(1.00)
PABPC1 9 (6%) 137 0.198
(1.00) 		0.711
(1.00) 		0.222
(1.00) 		0.691
(1.00) 		0.448
(1.00) 		0.307
(1.00) 		1
(1.00) 		0.707
(1.00) 		1
(1.00) 		0.987
(1.00) 		0.14
(1.00) 		0.118
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
RBMX 5 (3%) 141 0.66
(1.00) 		0.309
(1.00) 		0.322
(1.00) 		0.529
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.356
(1.00) 		0.708
(1.00) 		0.775
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ESPN 6 (4%) 140 0.355
(1.00) 		0.436
(1.00) 		0.184
(1.00) 		0.172
(1.00) 		0.174
(1.00) 		1
(1.00) 		0.688
(1.00) 		0.0494
(1.00) 		1
(1.00) 		0.732
(1.00) 		0.96
(1.00) 		0.468
(1.00) 		1
(1.00)
FNDC1 14 (10%) 132 0.351
(1.00) 		0.134
(1.00) 		0.648
(1.00) 		0.776
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.784
(1.00) 		1
(1.00) 		0.481
(1.00) 		0.734
(1.00) 		0.316
(1.00) 		1
(1.00) 		0.797
(1.00) 		0.762
(1.00) 		0.416
(1.00)
ATP2C1 8 (5%) 138 0.14
(1.00) 		0.962
(1.00) 		0.41
(1.00) 		0.678
(1.00) 		0.114
(1.00) 		0.262
(1.00) 		0.727
(1.00) 		0.673
(1.00) 		0.246
(1.00) 		0.379
(1.00) 		0.607
(1.00) 		0.164
(1.00) 		0.667
(1.00) 		0.28
(1.00) 		1
(1.00)
HACL1 5 (3%) 141 0.577
(1.00) 		0.198
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.572
(1.00) 		1
(1.00) 		0.18
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.587
(1.00) 		0.344
(1.00) 		1
(1.00)
UBAC1 5 (3%) 141 0.155
(1.00) 		0.936
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0569
(1.00) 		0.576
(1.00) 		0.153
(1.00) 		1
(1.00)
OGFOD1 5 (3%) 141 0.664
(1.00) 		0.272
(1.00) 		0.0467
(1.00) 		0.0638
(1.00) 		0.602
(1.00) 		1
(1.00) 		0.18
(1.00) 		0.307
(1.00) 		0.426
(1.00) 		0.241
(1.00) 		0.557
(1.00) 		0.0769
(1.00) 		1
(1.00)
CASQ2 8 (5%) 138 0.505
(1.00) 		0.104
(1.00) 		0.884
(1.00) 		0.68
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.47
(1.00) 		0.669
(1.00) 		0.0764
(1.00) 		0.146
(1.00) 		1
(1.00) 		0.806
(1.00) 		0.181
(1.00) 		1
(1.00)
TGFBR2 8 (5%) 138 0.421
(1.00) 		0.414
(1.00) 		0.546
(1.00) 		0.679
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.47
(1.00) 		0.443
(1.00) 		0.593
(1.00) 		0.667
(1.00) 		0.857
(1.00) 		0.122
(1.00) 		0.687
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
RNF43 9 (6%) 137 0.0351
(1.00) 		0.739
(1.00) 		0.473
(1.00) 		1
(1.00) 		0.233
(1.00) 		1
(1.00) 		0.508
(1.00) 		0.669
(1.00) 		0.64
(1.00) 		0.644
(1.00) 		0.972
(1.00) 		0.187
(1.00) 		0.0964
(1.00) 		0.617
(1.00) 		0.285
(1.00)
DCP1B 9 (6%) 137 0.782
(1.00) 		0.666
(1.00) 		0.827
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0804
(1.00) 		0.443
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.409
(1.00) 		0.0634
(1.00) 		0.0417
(1.00)
ZNF678 5 (3%) 141 0.0754
(1.00) 		0.467
(1.00) 		0.796
(1.00) 		1
(1.00) 		0.329
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.321
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.101
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
RPL22 5 (3%) 141 0.184
(1.00) 		0.966
(1.00) 		0.531
(1.00) 		0.141
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.375
(1.00) 		0.575
(1.00) 		0.424
(1.00) 		0.523
(1.00) 		0.531
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
NBPF16 7 (5%) 139 0.551
(1.00) 		0.223
(1.00) 		1
(1.00) 		0.126
(1.00) 		0.678
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.673
(1.00) 		1
(1.00) 		0.294
(1.00) 		0.808
(1.00) 		0.0822
(1.00) 		1
(1.00)
CD86 6 (4%) 140 0.205
(1.00) 		0.291
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.858
(1.00) 		1
(1.00) 		0.52
(1.00) 		0.472
(1.00) 		1
(1.00)
PARP10 5 (3%) 141 0.828
(1.00) 		0.906
(1.00) 		0.232
(1.00) 		0.218
(1.00) 		0.602
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0187
(1.00) 		0.575
(1.00) 		1
(1.00) 		0.731
(1.00) 		0.517
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
VWA3A 5 (3%) 141 0.171
(1.00) 		0.613
(1.00) 		0.0408
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0143
(1.00) 		0.661
(1.00) 		0.56
(1.00) 		1
(1.00) 		0.523
(1.00) 		0.763
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
SHROOM4 11 (8%) 135 0.594
(1.00) 		0.207
(1.00) 		1
(1.00) 		0.703
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.346
(1.00) 		1
(1.00) 		0.659
(1.00) 		1
(1.00) 		0.859
(1.00) 		0.694
(1.00) 		0.385
(1.00)
PRKRA 4 (3%) 142 0.694
(1.00) 		0.787
(1.00) 		0.75
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.333
(1.00) 		0.575
(1.00) 		0.358
(1.00) 		1
(1.00) 		0.189
(1.00) 		0.345
(1.00) 		1
(1.00)
RBM12 5 (3%) 141 0.309
(1.00) 		0.501
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.321
(1.00) 		0.426
(1.00) 		0.524
(1.00) 		0.561
(1.00) 		1
(1.00) 		0.211
(1.00)
ZNF880 4 (3%) 142 0.23
(1.00) 		0.365
(1.00) 		0.202
(1.00) 		1
(1.00) 		0.269
(1.00) 		0.112
(1.00) 		1
(1.00) 		0.56
(1.00) 		0.356
(1.00) 		0.71
(1.00) 		0.437
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CDC27 7 (5%) 139 0.703
(1.00) 		0.262
(1.00) 		0.857
(1.00) 		0.653
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.453
(1.00) 		0.0494
(1.00) 		1
(1.00) 		0.253
(1.00) 		0.981
(1.00) 		0.00087
(0.879) 		1
(1.00)
SUZ12 4 (3%) 142 0.974
(1.00) 		0.857
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.572
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.575
(1.00) 		0.357
(1.00) 		0.321
(1.00) 		0.793
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
SORBS2 6 (4%) 140 0.924
(1.00) 		0.76
(1.00) 		0.703
(1.00) 		1
(1.00) 		0.645
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.321
(1.00) 		0.486
(1.00) 		0.244
(1.00) 		0.337
(1.00) 		0.577
(1.00) 		0.0619
(1.00) 		1
(1.00)
RNF32 5 (3%) 141 0.537
(1.00) 		0.647
(1.00) 		0.531
(1.00) 		0.53
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.375
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.576
(1.00) 		1
(1.00) 		0.211
(1.00)
CBX3 4 (3%) 142 0.267
(1.00) 		0.116
(1.00) 		0.751
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.333
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.621
(1.00) 		0.859
(1.00) 		0.026
(1.00) 		1
(1.00)
SDCBP 6 (4%) 140 0.562
(1.00) 		0.21
(1.00) 		0.829
(1.00) 		0.173
(1.00) 		0.338
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.246
(1.00) 		0.286
(1.00) 		0.195
(1.00) 		1
(1.00)
PLIN4 7 (5%) 139 0.37
(1.00) 		0.32
(1.00) 		0.266
(1.00) 		0.0372
(1.00) 		1
(1.00) 		0.164
(1.00) 		0.703
(1.00) 		0.669
(1.00) 		1
(1.00) 		0.967
(1.00) 		0.304
(1.00) 		0.143
(1.00) 		0.422
(1.00) 		0.143
(1.00) 		1
(1.00)
AAK1 4 (3%) 142 0.0455
(1.00) 		0.61
(1.00) 		0.082
(1.00) 		0.0919
(1.00) 		0.269
(1.00) 		1
(1.00) 		0.333
(1.00) 		0.575
(1.00) 		1
(1.00) 		0.316
(1.00) 		0.392
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
TMCC1 7 (5%) 139 0.507
(1.00) 		0.826
(1.00) 		0.609
(1.00) 		0.329
(1.00) 		0.678
(1.00) 		1
(1.00) 		0.703
(1.00) 		1
(1.00) 		0.543
(1.00) 		0.361
(1.00) 		0.208
(1.00) 		0.483
(1.00) 		0.492
(1.00) 		0.238
(1.00) 		1
(1.00)
IYD 6 (4%) 140 0.929
(1.00) 		0.996
(1.00) 		0.315
(1.00) 		0.598
(1.00) 		0.174
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.616
(1.00) 		1
(1.00) 		0.567
(1.00) 		0.0718
(1.00) 		0.237
(1.00) 		1
(1.00)
NLRP2 6 (4%) 140 0.401
(1.00) 		0.164
(1.00) 		0.479
(1.00) 		1
(1.00) 		0.645
(1.00) 		0.262
(1.00) 		0.688
(1.00) 		0.346
(1.00) 		0.487
(1.00) 		0.526
(1.00) 		0.719
(1.00) 		0.764
(1.00) 		0.669
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
SP140 5 (3%) 141 0.2
(1.00) 		0.419
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.575
(1.00) 		1
(1.00) 		0.512
(1.00) 		0.0719
(1.00) 		0.356
(1.00) 		0.442
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
OR2T4 6 (4%) 140 0.639
(1.00) 		0.405
(1.00) 		0.703
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.413
(1.00) 		0.186
(1.00) 		0.0904
(1.00) 		0.356
(1.00) 		0.594
(1.00) 		0.0609
(1.00) 		1
(1.00)
GPR50 5 (3%) 141 0.754
(1.00) 		0.327
(1.00) 		0.144
(1.00) 		1
(1.00) 		0.105
(1.00) 		1
(1.00) 		0.375
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.731
(1.00) 		0.16
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CFTR 7 (5%) 139 0.518
(1.00) 		0.67
(1.00) 		0.316
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0705
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.346
(1.00) 		1
(1.00) 		0.569
(1.00) 		0.207
(1.00) 		0.277
(1.00) 		0.285
(1.00)
GPR98 8 (5%) 138 0.826
(1.00) 		0.673
(1.00) 		0.547
(1.00) 		0.681
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.673
(1.00) 		1
(1.00) 		0.712
(1.00) 		0.644
(1.00) 		0.119
(1.00) 		0.674
(1.00) 		0.0336
(1.00) 		1
(1.00)
DAAM1 6 (4%) 140 0.263
(1.00) 		0.364
(1.00) 		0.376
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.214
(1.00) 		0.413
(1.00) 		0.575
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0416
(1.00) 		0.94
(1.00) 		0.108
(1.00) 		1
(1.00)
MTBP 3 (2%) 143 0.108
(1.00) 		0.243
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0943
(1.00) 		0.56
(1.00) 		1
(1.00) 		0.235
(1.00) 		0.197
(1.00) 		0.443
(1.00) 		1
(1.00)
RREB1 9 (6%) 137 0.77
(1.00) 		0.82
(1.00) 		0.342
(1.00) 		1
(1.00) 		0.233
(1.00) 		1
(1.00) 		0.508
(1.00) 		0.216
(1.00) 		1
(1.00) 		0.323
(1.00) 		0.857
(1.00) 		0.197
(1.00) 		0.0872
(1.00) 		0.0449
(1.00) 		1
(1.00)
TRPC4 6 (4%) 140 0.387
(1.00) 		0.0117
(1.00) 		0.176
(1.00) 		0.598
(1.00) 		0.645
(1.00) 		1
(1.00) 		0.413
(1.00) 		0.56
(1.00) 		0.484
(1.00) 		0.52
(1.00) 		0.619
(1.00) 		1
(1.00) 		0.673
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CD2AP 3 (2%) 143 0.0375
(1.00) 		0.562
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		0.56
(1.00) 		1
(1.00) 		0.625
(1.00) 		0.086
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
GNAS 9 (6%) 137 0.44
(1.00) 		0.76
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.448
(1.00) 		1
(1.00) 		0.508
(1.00) 		1
(1.00) 		0.00094
(0.879) 		0.858
(1.00) 		0.15
(1.00) 		0.427
(1.00) 		0.208
(1.00) 		0.618
(1.00) 		1
(1.00)
FAR1 4 (3%) 142 0.351
(1.00) 		0.247
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.572
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.575
(1.00) 		1
(1.00) 		0.318
(1.00) 		0.385
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
COL28A1 5 (3%) 141 0.75
(1.00) 		0.602
(1.00) 		0.394
(1.00) 		1
(1.00) 		0.329
(1.00) 		1
(1.00) 		0.661
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0586
(1.00) 		0.307
(1.00) 		0.197
(1.00) 		1
(1.00)
SKA3 6 (4%) 140 0.307
(1.00) 		0.749
(1.00) 		0.208
(1.00) 		1
(1.00) 		0.338
(1.00) 		1
(1.00) 		0.413
(1.00) 		0.669
(1.00) 		1
(1.00) 		0.822
(1.00) 		0.504
(1.00) 		0.0574
(1.00) 		0.031
(1.00) 		0.469
(1.00) 		1
(1.00)
JAK2 4 (3%) 142 0.99
(1.00) 		0.737
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.572
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.575
(1.00) 		1
(1.00) 		0.318
(1.00) 		0.463
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ARID1A 7 (5%) 139 0.516
(1.00) 		0.539
(1.00) 		0.227
(1.00) 		0.652
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.453
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.496
(1.00) 		0.898
(1.00) 		1
(1.00) 		0.874
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
KCNA7 5 (3%) 141 0.543
(1.00) 		0.471
(1.00) 		0.795
(1.00) 		1
(1.00) 		0.329
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.822
(1.00) 		0.0507
(1.00) 		0.713
(1.00) 		0.9
(1.00) 		0.409
(1.00) 		1
(1.00)
CHRNA9 4 (3%) 142 0.159
(1.00) 		0.153
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.572
(1.00) 		1
(1.00) 		0.625
(1.00) 		0.575
(1.00) 		1
(1.00) 		0.854
(1.00) 		0.0783
(1.00) 		0.0411
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
KLHL20 3 (2%) 143 0.232
(1.00) 		0.709
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		0.56
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.704
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
NUP210L 5 (3%) 141 0.243
(1.00) 		0.62
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.18
(1.00) 		0.321
(1.00) 		0.0737
(1.00) 		0.712
(1.00) 		0.644
(1.00) 		0.731
(1.00) 		0.856
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
AQP7 6 (4%) 140 0.542
(1.00) 		0.259
(1.00) 		0.262
(1.00) 		0.173
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.413
(1.00) 		0.346
(1.00) 		1
(1.00) 		0.73
(1.00) 		0.699
(1.00) 		1
(1.00) 		0.249
(1.00)
P2RY1 5 (3%) 141 0.582
(1.00) 		0.532
(1.00) 		0.185
(1.00) 		1
(1.00) 		0.105
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.662
(1.00) 		0.573
(1.00) 		0.73
(1.00) 		0.26
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CCDC33 3 (2%) 143 0.0313
(1.00) 		0.934
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		0.25
(1.00) 		1
(1.00) 		0.282
(1.00) 		0.0785
(1.00) 		0.477
(1.00) 		0.113
(1.00) 		1
(1.00)
WRN 4 (3%) 142 0.182
(1.00) 		0.155
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.572
(1.00) 		1
(1.00) 		0.125
(1.00) 		0.575
(1.00) 		1
(1.00) 		0.434
(1.00) 		0.187
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
C1ORF125 4 (3%) 142 0.992
(1.00) 		0.557
(1.00) 		0.31
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.214
(1.00) 		0.0422
(1.00) 		0.56
(1.00) 		1
(1.00) 		0.712
(1.00) 		0.644
(1.00) 		0.709
(1.00) 		0.788
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
SIGLEC14 4 (3%) 142 0.0173
(1.00) 		0.589
(1.00) 		0.75
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.358
(1.00) 		1
(1.00) 		0.533
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
KRT2 5 (3%) 141 0.517
(1.00) 		0.698
(1.00) 		0.798
(1.00) 		0.531
(1.00) 		0.329
(1.00) 		1
(1.00) 		0.18
(1.00) 		0.616
(1.00) 		1
(1.00) 		0.316
(1.00) 		0.607
(1.00) 		0.353
(1.00) 		0.598
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MSH2 4 (3%) 142 0.54
(1.00) 		0.649
(1.00) 		0.312
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.575
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.893
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MORF4L1 3 (2%) 143 0.982
(1.00) 		0.377
(1.00) 		0.266
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0943
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.768
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
KIAA0586 6 (4%) 140 0.0605
(1.00) 		0.914
(1.00) 		0.535
(1.00) 		0.598
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.413
(1.00) 		0.186
(1.00) 		1
(1.00) 		0.4
(1.00) 		0.939
(1.00) 		0.426
(1.00) 		0.472
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
SYT14 4 (3%) 142 0.00601
(1.00) 		0.995
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.572
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.575
(1.00) 		0.36
(1.00) 		0.709
(1.00) 		0.276
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
TAX1BP1 5 (3%) 141 0.596
(1.00) 		0.897
(1.00) 		0.796
(1.00) 		1
(1.00) 		0.329
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.575
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0434
(1.00) 		0.401
(1.00) 		0.195
(1.00) 		1
(1.00)
HSPE1 4 (3%) 142 0.802
(1.00) 		0.259
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.572
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.355
(1.00) 		1
(1.00) 		0.313
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
GPSM2 3 (2%) 143 0.0678
(1.00) 		0.0341
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		0.185
(1.00) 		1
(1.00) 		0.248
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
HELZ 5 (3%) 141 0.145
(1.00) 		0.605
(1.00) 		0.321
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.164
(1.00) 		0.18
(1.00) 		0.321
(1.00) 		1
(1.00) 		0.379
(1.00) 		0.607
(1.00) 		0.521
(1.00) 		0.856
(1.00) 		0.343
(1.00) 		1
(1.00)
DOCK8 5 (3%) 141 0.657
(1.00) 		0.232
(1.00) 		0.797
(1.00) 		0.527
(1.00) 		0.329
(1.00) 		1
(1.00) 		0.661
(1.00) 		0.321
(1.00) 		0.422
(1.00) 		0.774
(1.00) 		0.441
(1.00) 		1
(1.00) 		0.856
(1.00) 		0.409
(1.00) 		1
(1.00)
COBL 6 (4%) 140 0.737
(1.00) 		0.0651
(1.00) 		0.26
(1.00) 		0.174
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.669
(1.00) 		0.487
(1.00) 		0.413
(1.00) 		0.837
(1.00) 		1
(1.00) 		0.868
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
GSN 4 (3%) 142 0.405
(1.00) 		0.697
(1.00) 		0.752
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0422
(1.00) 		0.307
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.7
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
NAA20 3 (2%) 143 0.789
(1.00) 		0.181
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		0.56
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.443
(1.00) 		1
(1.00)
ZACN 3 (2%) 143 0.827
(1.00) 		0.852
(1.00) 		0.18
(1.00) 		0.36
(1.00) 		0.16
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		0.56
(1.00) 		0.0614
(1.00) 		0.39
(1.00) 		0.109
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
AP3B1 4 (3%) 142 0.797
(1.00) 		0.723
(1.00) 		0.31
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.333
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.712
(1.00) 		0.557
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
C3ORF15 5 (3%) 141 0.969
(1.00) 		0.438
(1.00) 		0.311
(1.00) 		0.451
(1.00) 		1
(1.00) 		0.164
(1.00) 		0.661
(1.00) 		0.616
(1.00) 		0.0731
(1.00) 		0.23
(1.00) 		0.032
(1.00) 		1
(1.00) 		0.576
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
BCLAF1 7 (5%) 139 0.186
(1.00) 		0.364
(1.00) 		0.265
(1.00) 		0.33
(1.00) 		1
(1.00) 		0.262
(1.00) 		0.0481
(1.00) 		0.673
(1.00) 		1
(1.00) 		0.788
(1.00) 		0.227
(1.00) 		0.391
(1.00) 		0.695
(1.00) 		0.467
(1.00) 		1
(1.00)
RBL2 4 (3%) 142 0.833
(1.00) 		0.391
(1.00) 		0.0545
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.164
(1.00) 		1
(1.00) 		0.575
(1.00) 		1
(1.00) 		0.712
(1.00) 		1
(1.00) 		0.746
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
OMA1 3 (2%) 143 0.0171
(1.00) 		0.629
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		0.56
(1.00) 		1
(1.00) 		0.628
(1.00) 		0.184
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
SORT1 5 (3%) 141 0.64
(1.00) 		0.747
(1.00) 		0.144
(1.00) 		1
(1.00) 		0.105
(1.00) 		1
(1.00) 		0.661
(1.00) 		0.616
(1.00) 		1
(1.00) 		0.729
(1.00) 		0.154
(1.00) 		0.195
(1.00) 		1
(1.00)
NBPF9 3 (2%) 143 0.418
(1.00) 		0.159
(1.00) 		0.402
(1.00) 		0.362
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.281
(1.00) 		0.0282
(1.00) 		0.866
(1.00) 		0.271
(1.00) 		0.0455
(1.00)
C5ORF51 3 (2%) 143 0.977
(1.00) 		0.114
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		0.56
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.184
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CSTF2T 3 (2%) 143 0.9
(1.00) 		0.377
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.56
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.527
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
SSBP3 3 (2%) 143 0.00231
(1.00) 		0.0624
(1.00) 		0.647
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.545
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
PRSS3 3 (2%) 143 0.109
(1.00) 		0.798
(1.00) 		0.405
(1.00) 		0.36
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.387
(1.00) 		0.545
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
UBXN4 3 (2%) 143 0.232
(1.00) 		0.709
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		0.56
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.704
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
AGAP6 7 (5%) 139 0.602
(1.00) 		0.905
(1.00) 		1
(1.00) 		0.654
(1.00) 		0.678
(1.00) 		1
(1.00) 		0.703
(1.00) 		0.673
(1.00) 		0.539
(1.00) 		0.53
(1.00) 		0.0522
(1.00) 		1
(1.00) 		0.322
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
TGM5 4 (3%) 142 0.395
(1.00) 		0.876
(1.00) 		0.0215
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.333
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.433
(1.00) 		0.501
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
GPRC6A 5 (3%) 141 0.224
(1.00) 		0.191
(1.00) 		0.326
(1.00) 		1
(1.00) 		0.602
(1.00) 		1
(1.00) 		0.661
(1.00) 		0.575
(1.00) 		1
(1.00) 		0.712
(1.00) 		0.644
(1.00) 		1
(1.00) 		0.729
(1.00) 		1
(1.00) 		0.172
(1.00)
OR52D1 4 (3%) 142 0.393
(1.00) 		0.986
(1.00) 		0.227
(1.00) 		0.163
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.625
(1.00) 		0.0643
(1.00) 		0.0527
(1.00) 		1
(1.00) 		0.392
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
KLK13 5 (3%) 141 0.52
(1.00) 		0.354
(1.00) 		0.795
(1.00) 		1
(1.00) 		0.329
(1.00) 		1
(1.00) 		0.18
(1.00) 		0.56
(1.00) 		0.425
(1.00) 		0.23
(1.00) 		0.00883
(1.00) 		0.352
(1.00) 		0.669
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
BRD8 3 (2%) 143 0.511
(1.00) 		0.539
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0493
(1.00) 		0.944
(1.00) 		0.112
(1.00) 		1
(1.00)
ZMYM2 3 (2%) 143 0.0594
(1.00) 		0.809
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.56
(1.00) 		0.279
(1.00) 		1
(1.00) 		0.308
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ZNF780A 5 (3%) 141 0.184
(1.00) 		0.274
(1.00) 		0.167
(1.00) 		0.531
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.661
(1.00) 		1
(1.00) 		0.427
(1.00) 		0.158
(1.00) 		0.625
(1.00) 		1
(1.00) 		0.809
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MLPH 3 (2%) 143 0.875
(1.00) 		0.279
(1.00) 		1
(1.00) 		0.362
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		0.185
(1.00) 		1
(1.00) 		0.449
(1.00) 		0.237
(1.00) 		0.603
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
NLRP6 3 (2%) 143 0.125
(1.00) 		0.614
(1.00) 		0.647
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.545
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
SEPT2 3 (2%) 143 0.346
(1.00) 		0.841
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0785
(1.00) 		0.443
(1.00) 		1
(1.00)
MMP13 3 (2%) 143 0.037
(1.00) 		0.452
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		0.56
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.282
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
OXR1 3 (2%) 143 0.213
(1.00) 		0.72
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.56
(1.00) 		1
(1.00) 		0.62
(1.00) 		0.443
(1.00) 		0.0892
(1.00)
LACTB 3 (2%) 143 0.813
(1.00) 		0.261
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0943
(1.00) 		0.56
(1.00) 		1
(1.00) 		0.712
(1.00) 		0.644
(1.00) 		1
(1.00) 		0.282
(1.00) 		1
(1.00)
SYCP2 5 (3%) 141 0.957
(1.00) 		0.258
(1.00) 		0.796
(1.00) 		0.526
(1.00) 		0.329
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.321
(1.00) 		0.0722
(1.00) 		0.379
(1.00) 		0.208
(1.00) 		1
(1.00) 		0.124
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
WDHD1 3 (2%) 143 0.0543
(1.00) 		0.125
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.625
(1.00) 		0.184
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
RTTN 5 (3%) 141 0.321
(1.00) 		0.467
(1.00) 		0.796
(1.00) 		1
(1.00) 		0.329
(1.00) 		1
(1.00) 		0.661
(1.00) 		0.56
(1.00) 		0.128
(1.00) 		0.733
(1.00) 		0.771
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
TDRD5 4 (3%) 142 0.112
(1.00) 		0.446
(1.00) 		0.311
(1.00) 		1
(1.00) 		0.572
(1.00) 		0.164
(1.00) 		0.333
(1.00) 		0.56
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0785
(1.00) 		0.385
(1.00) 		0.153
(1.00) 		1
(1.00)
SEPHS2 5 (3%) 141 0.96
(1.00) 		0.432
(1.00) 		0.0735
(1.00) 		0.0633
(1.00) 		0.105
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.423
(1.00) 		0.83
(1.00) 		0.341
(1.00) 		0.732
(1.00) 		0.531
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ACTRT2 3 (2%) 143 0.503
(1.00) 		0.167
(1.00) 		0.141
(1.00) 		0.111
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.25
(1.00) 		1
(1.00) 		0.281
(1.00) 		1
(1.00) 		0.709
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
DNAH7 7 (5%) 139 0.489
(1.00) 		0.11
(1.00) 		0.761
(1.00) 		0.126
(1.00) 		0.191
(1.00) 		1
(1.00) 		0.703
(1.00) 		0.669
(1.00) 		0.54
(1.00) 		0.379
(1.00) 		0.28
(1.00) 		0.21
(1.00) 		0.733
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MC3R 4 (3%) 142 0.342
(1.00) 		0.61
(1.00) 		0.103
(1.00) 		0.449
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.389
(1.00) 		0.545
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
FAM8A1 4 (3%) 142 0.31
(1.00) 		0.177
(1.00) 		0.0176
(1.00) 		0.164
(1.00) 		0.269
(1.00) 		0.164
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0643
(1.00) 		1
(1.00) 		0.435
(1.00) 		0.233
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
TGFBR1 8 (5%) 138 0.429
(1.00) 		0.312
(1.00) 		0.729
(1.00) 		0.679
(1.00) 		0.114
(1.00) 		1
(1.00) 		0.47
(1.00) 		0.395
(1.00) 		1
(1.00) 		0.402
(1.00) 		0.474
(1.00) 		0.124
(1.00) 		0.337
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
L1CAM 6 (4%) 140 0.552
(1.00) 		0.259
(1.00) 		0.378
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.164
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.166
(1.00) 		1
(1.00) 		0.817
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
LCP2 3 (2%) 143 0.319
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.56
(1.00) 		1
(1.00) 		0.443
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ZNF358 4 (3%) 142 0.309
(1.00) 		0.0682
(1.00) 		0.311
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.333
(1.00) 		1
(1.00) 		0.358
(1.00) 		0.163
(1.00) 		0.392
(1.00) 		0.153
(1.00) 		1
(1.00)
KCNE1 4 (3%) 142 0.974
(1.00) 		0.857
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.572
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.575
(1.00) 		0.354
(1.00) 		0.321
(1.00) 		0.793
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
OR1N2 5 (3%) 141 0.473
(1.00) 		0.613
(1.00) 		0.208
(1.00) 		0.529
(1.00) 		0.105
(1.00) 		1
(1.00) 		0.18
(1.00) 		1
(1.00) 		0.423
(1.00) 		0.712
(1.00) 		0.26
(1.00) 		0.195
(1.00) 		0.0158
(1.00)
FLVCR1 3 (2%) 143 0.425
(1.00) 		0.408
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		1
(1.00) 		0.281
(1.00) 		0.391
(1.00) 		0.827
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
BTN2A1 3 (2%) 143 0.298
(1.00) 		0.788
(1.00) 		0.141
(1.00) 		0.113
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		1
(1.00) 		0.283
(1.00) 		1
(1.00) 		0.545
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
PAPSS2 4 (3%) 142 1
(1.00) 		0.679
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.572
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.358
(1.00) 		0.71
(1.00) 		0.463
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
PBRM1 5 (3%) 141 0.991
(1.00) 		0.471
(1.00) 		0.462
(1.00) 		0.53
(1.00) 		0.602
(1.00) 		1
(1.00) 		0.18
(1.00) 		0.575
(1.00) 		1
(1.00) 		0.951
(1.00) 		0.411
(1.00) 		0.732
(1.00) 		0.934
(1.00) 		0.153
(1.00) 		1
(1.00)
CYTH4 3 (2%) 143 0.0031
(1.00) 		0.355
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0801
(1.00) 		0.704
(1.00) 		0.113
(1.00) 		1
(1.00)
ANKRD49 3 (2%) 143 0.0171
(1.00) 		0.629
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		0.56
(1.00) 		1
(1.00) 		0.624
(1.00) 		0.184
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CMYA5 8 (5%) 138 0.723
(1.00) 		0.0498
(1.00) 		1
(1.00) 		0.681
(1.00) 		0.68
(1.00) 		1
(1.00) 		0.727
(1.00) 		0.189
(1.00) 		0.594
(1.00) 		0.0109
(1.00) 		0.758
(1.00) 		0.388
(1.00) 		0.328
(1.00) 		0.526
(1.00) 		1
(1.00)
PHF15 4 (3%) 142 0.419
(1.00) 		0.852
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.572
(1.00) 		1
(1.00) 		0.333
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.652
(1.00) 		1
(1.00) 		0.452
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
RSPO1 3 (2%) 143 0.437
(1.00) 		0.355
(1.00) 		1
(1.00) 		0.361
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		1
(1.00) 		0.279
(1.00) 		0.387
(1.00) 		0.827
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ASH1L 6 (4%) 140 0.293
(1.00) 		0.851
(1.00) 		0.262
(1.00) 		0.174
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.413
(1.00) 		1
(1.00) 		0.487
(1.00) 		0.379
(1.00) 		0.28
(1.00) 		0.209
(1.00) 		0.837
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
BVES 4 (3%) 142 0.871
(1.00) 		0.191
(1.00) 		0.438
(1.00) 		1
(1.00) 		0.269
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.575
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.612
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
DDX4 5 (3%) 141 0.882
(1.00) 		0.755
(1.00) 		0.796
(1.00) 		1
(1.00) 		0.329
(1.00) 		1
(1.00) 		0.661
(1.00) 		0.56
(1.00) 		0.426
(1.00) 		0.379
(1.00) 		0.28
(1.00) 		0.0438
(1.00) 		0.961
(1.00) 		0.195
(1.00) 		1
(1.00)
TEKT4 6 (4%) 140 0.382
(1.00) 		0.745
(1.00) 		0.315
(1.00) 		1
(1.00) 		0.174
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0941
(1.00) 		0.56
(1.00) 		0.484
(1.00) 		0.115
(1.00) 		0.0422
(1.00) 		0.355
(1.00) 		0.158
(1.00) 		0.239
(1.00) 		0.211
(1.00)
WWP2 5 (3%) 141 0.825
(1.00) 		0.299
(1.00) 		0.799
(1.00) 		0.529
(1.00) 		0.329
(1.00) 		1
(1.00) 		0.661
(1.00) 		1
(1.00) 		0.127
(1.00) 		0.525
(1.00) 		0.996
(1.00) 		1
(1.00) 		0.211
(1.00)
DHX35 4 (3%) 142 0.365
(1.00) 		0.356
(1.00) 		0.519
(1.00) 		0.451
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.575
(1.00) 		0.357
(1.00) 		0.641
(1.00) 		0.143
(1.00) 		1
(1.00) 		0.673
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
WDR36 3 (2%) 143 0.487
(1.00) 		0.44
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.213
(1.00) 		1
(1.00)
DRD1 4 (3%) 142 0.79
(1.00) 		0.472
(1.00) 		0.749
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.595
(1.00) 		0.324
(1.00) 		0.746
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ENTPD2 4 (3%) 142 0.593
(1.00) 		0.257
(1.00) 		0.312
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.333
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.26
(1.00) 		0.0328
(1.00) 		1
(1.00) 		0.7
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
SRFBP1 3 (2%) 143 0.0211
(1.00) 		0.788
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		0.56
(1.00) 		1
(1.00) 		0.886
(1.00) 		0.626
(1.00) 		0.243
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CSRNP3 4 (3%) 142 0.752
(1.00) 		0.371
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.572
(1.00) 		1
(1.00) 		0.333
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.389
(1.00) 		0.941
(1.00) 		1
(1.00) 		0.131
(1.00)
REXO1 3 (2%) 143 0.232
(1.00) 		0.709
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		0.56
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.704
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CEACAM4 4 (3%) 142 0.119
(1.00) 		0.155
(1.00) 		0.44
(1.00) 		1
(1.00) 		0.269
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.575
(1.00) 		1
(1.00) 		0.209
(1.00) 		0.545
(1.00) 		0.345
(1.00) 		1
(1.00)
SARS2 3 (2%) 143 0.0268
(1.00) 		0.232
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0283
(1.00) 		0.384
(1.00) 		0.0336
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
CPNE2 3 (2%) 143 0.196
(1.00) 		0.74
(1.00) 		0.16
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.479
(1.00) 		1
(1.00) 		0.195
(1.00) 		1
(1.00) 		0.131
(1.00)
CYTSA 4 (3%) 142 0.783
(1.00) 		0.61
(1.00) 		0.751
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.56
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0502
(1.00) 		0.385
(1.00) 		0.0483
(1.00) 		1
(1.00)
LUZP1 4 (3%) 142 0.515
(1.00) 		0.602
(1.00) 		0.439
(1.00) 		1
(1.00) 		0.269
(1.00) 		1
(1.00) 		0.625
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.208
(1.00) 		0.966
(1.00) 		0.0262
(1.00) 		1
(1.00)
CCDC87 3 (2%) 143 0.706
(1.00) 		0.334
(1.00) 		0.403
(1.00) 		1
(1.00) 		0.57
(1.00) 		0.594
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0491
(1.00) 		0.325
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ZBTB4 4 (3%) 142 0.811
(1.00) 		0.867
(1.00) 		0.31
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.164
(1.00) 		0.333
(1.00) 		0.56
(1.00) 		0.356
(1.00) 		0.708
(1.00) 		0.553
(1.00) 		0.343
(1.00) 		1
(1.00)
MLL5 4 (3%) 142 0.861
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.572
(1.00) 		1
(1.00) 		0.333
(1.00) 		0.56
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.793
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ADORA3 5 (3%) 141 0.678
(1.00) 		0.151
(1.00) 		0.797
(1.00) 		1
(1.00) 		0.329
(1.00) 		1
(1.00) 		0.661
(1.00) 		0.321
(1.00) 		1
(1.00) 		0.615
(1.00) 		0.557
(1.00) 		1
(1.00) 		0.124
(1.00) 		0.196
(1.00) 		1
(1.00)
ARHGAP9 4 (3%) 142 0.685
(1.00) 		0.272
(1.00) 		0.523
(1.00) 		0.452
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.357
(1.00) 		1
(1.00) 		0.165
(1.00) 		0.71
(1.00) 		0.673
(1.00) 		1
(1.00) 		0.172
(1.00)
ANKRD30A 8 (5%) 138 0.803
(1.00) 		0.911
(1.00) 		0.728
(1.00) 		0.243
(1.00) 		0.114
(1.00) 		1
(1.00) 		0.727
(1.00) 		0.669
(1.00) 		0.591
(1.00) 		0.326
(1.00) 		0.857
(1.00) 		0.666
(1.00) 		0.557
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
KIF4B 5 (3%) 141 0.619
(1.00) 		0.78
(1.00) 		0.796
(1.00) 		0.217
(1.00) 		0.329
(1.00) 		1
(1.00) 		0.661
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.681
(1.00) 		0.731
(1.00) 		0.432
(1.00) 		0.408
(1.00) 		1
(1.00)
ATP2C2 4 (3%) 142 0.99
(1.00) 		0.64
(1.00) 		0.23
(1.00) 		0.0389
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.333
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.317
(1.00) 		0.557
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
POM121 5 (3%) 141 0.399
(1.00) 		0.426
(1.00) 		0.167
(1.00) 		0.53
(1.00) 		0.602
(1.00) 		0.164
(1.00) 		0.18
(1.00) 		1
(1.00) 		0.427
(1.00) 		0.355
(1.00) 		0.517
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
DDB1 5 (3%) 141 0.279
(1.00) 		0.0546
(1.00) 		0.797
(1.00) 		1
(1.00) 		0.329
(1.00) 		1
(1.00) 		0.18
(1.00) 		1
(1.00) 		0.427
(1.00) 		0.984
(1.00) 		0.181
(1.00) 		0.356
(1.00) 		0.507
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
NUP54 3 (2%) 143 0.131
(1.00) 		0.689
(1.00) 		0.112
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.164
(1.00) 		0.594
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.743
(1.00) 		0.425
(1.00) 		1
(1.00) 		0.768
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
C14ORF21 4 (3%) 142 0.869
(1.00) 		0.181
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.572
(1.00) 		1
(1.00) 		0.625
(1.00) 		0.575
(1.00) 		1
(1.00) 		0.526
(1.00) 		1
(1.00) 		0.625
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
LILRB2 4 (3%) 142 0.342
(1.00) 		0.688
(1.00) 		0.364
(1.00) 		0.452
(1.00) 		0.269
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0422
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.471
(1.00) 		0.155
(1.00) 		1
(1.00)
ADAMTSL4 5 (3%) 141 0.124
(1.00) 		0.369
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.18
(1.00) 		0.575
(1.00) 		1
(1.00) 		0.731
(1.00) 		0.546
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ZNF483 4 (3%) 142 0.557
(1.00) 		0.21
(1.00) 		0.749
(1.00) 		0.449
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.333
(1.00) 		1
(1.00) 		0.359
(1.00) 		0.713
(1.00) 		0.471
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ANKRD28 6 (4%) 140 0.363
(1.00) 		0.0825
(1.00) 		0.828
(1.00) 		1
(1.00) 		0.338
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0941
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.143
(1.00) 		0.766
(1.00) 		0.319
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
DIO1 4 (3%) 142 0.137
(1.00) 		0.131
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.572
(1.00) 		1
(1.00) 		0.333
(1.00) 		1
(1.00) 		0.36
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
KLK15 5 (3%) 141 0.571
(1.00) 		0.897
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.616
(1.00) 		1
(1.00) 		0.731
(1.00) 		0.162
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
BOC 4 (3%) 142 0.542
(1.00) 		0.778
(1.00) 		0.522
(1.00) 		0.45
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.333
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.662
(1.00) 		1
(1.00) 		0.459
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
NDUFV2 3 (2%) 143 0.0957
(1.00) 		0.32
(1.00) 		0.645
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		0.185
(1.00) 		1
(1.00) 		0.625
(1.00) 		0.223
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
MAP3K9 5 (3%) 141 0.725
(1.00) 		0.59
(1.00) 		0.62
(1.00) 		1
(1.00) 		0.602
(1.00) 		1
(1.00) 		0.375
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.759
(1.00) 		0.153
(1.00) 		0.374
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
TNRC6C 6 (4%) 140 0.474
(1.00) 		0.175
(1.00) 		0.703
(1.00) 		0.174
(1.00) 		0.645
(1.00) 		1
(1.00) 		0.0941
(1.00) 		0.616
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		0.472
(1.00) 		1
(1.00)
PDXDC1 3 (2%) 143 0.859
(1.00) 		0.385
(1.00) 		1
(1.00) 		0.362
(1.00) 		0.57
(1.00) 		1
(1.00) 		0.594
(1.00) 		0.56
(1.00) 		1
(1.00) 		0.388
(1.00) 		0.603
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
ENPP7 5 (3%) 141 0.448
(1.00) 		0.751
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00) 		0.575
(1.00) 		0.129
(1.00) 		0.711
(1.00) 		0.535
(1.00) 		1
(1.00) 		0.172
(1.00)
FCGBP 12 (8%) 134 0.112
(1.00) 		0.615
(1.00) 		0.937
(1.00) 		1
(1.00) 		0.731
(1.00) 		1
(1.00) 		0.547
(1.00) 		1
(1.00) 		0.665
(1.00) 		0.967
(1.00) 		0.181
(1.00) 		0.155
(1.00) 		0.403
(1.00) 		1
(1.00) 		1
(1.00)
'MIPEP MUTATION STATUS' versus 'Time to Death'

P value = 3.78e-05 (logrank test), Q value = 0.11

Table S1.  Gene #185: 'MIPEP MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #1: 'Time to Death'

nPatients nDeath Duration Range (Median), Month
ALL 144 76 0.0 - 75.1 (14.3)
MIPEP MUTATED 3 3 3.6 - 11.0 (4.0)
MIPEP WILD-TYPE 141 73 0.0 - 75.1 (14.5)

Figure S1.  Get High-res Image Gene #185: 'MIPEP MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #1: 'Time to Death'

Methods & Data
Input

  • Mutation data file = sample_sig_gene_table.txt from Mutsig_2CV pipeline

  • Processed Mutation data file = /xchip/cga/gdac-prod/tcga-gdac/jobResults/GDAC_Correlate_Genomic_Events_Preprocess/PAAD-TP/19861013/transformed.cor.cli.txt

  • Clinical data file = /xchip/cga/gdac-prod/tcga-gdac/jobResults/Append_Data/PAAD-TP/19775410/PAAD-TP.merged_data.txt

  • Number of patients = 146

  • Number of significantly mutated genes = 187

  • Number of selected clinical features = 15

  • Exclude genes that fewer than K tumors have mutations, K = 3

Survival analysis

For survival clinical features, the Kaplan-Meier survival curves of tumors with and without gene mutations were plotted and the statistical significance P values were estimated by logrank test (Bland and Altman 2004) using the 'survdiff' function in R

Fisher's exact test

For binary or multi-class clinical features (nominal or ordinal), two-tailed Fisher's exact tests (Fisher 1922) were used to estimate the P values using the 'fisher.test' function in R

Q value calculation

For multiple hypothesis correction, Q value is the False Discovery Rate (FDR) analogue of the P value (Benjamini and Hochberg 1995), defined as the minimum FDR at which the test may be called significant. We used the 'Benjamini and Hochberg' method of 'p.adjust' function in R to convert P values into Q values.

References
[1] Bland and Altman, Statistics notes: The logrank test, BMJ 328(7447):1073 (2004)
[2] Fisher, R.A., On the interpretation of chi-square from contingency tables, and the calculation of P, Journal of the Royal Statistical Society 85(1):87-94 (1922)
[3] Benjamini and Hochberg, Controlling the false discovery rate: a practical and powerful approach to multiple testing, Journal of the Royal Statistical Society Series B 59:289-300 (1995)
Made with Nozzle