# Mutations from non-coordinated clusters only with 2 mutations
Sample	A_T_coord_clusters	G_C_coord_clusters	Non_coord_clusters	clusters	mutations	complex	insertions	deletions	indels	substitutions	bases	A_to_T	A_to_G	A_to_C	A	a	T_to_A	T_to_C	T_to_G	T	t	G_to_C	G_to_T	G_to_A	G	g	C_to_G	C_to_A	C_to_T	C	c	tCw_to_G	tCw_to_A	tCw_to_T	tCw	tcw	tCw_per_mut	tCw_per_C	tcw_per_c	enrich_tCw	freq_tCw	wGa_to_C	wGa_to_T	wGa_to_A	wGa	wga	wGa_per_mut	wGa_per_G	wga_per_g	enrich_wGa	freq_wGa	[tCw_to_G+tCw_to_T]_per_mut	tCw_to_G+tCw_to_T	[(C_to_G)+(C_to_T)]-[(tCw_to_G)+(tCw_to_T)]	tcw+wga	c-tcw	Fisher_p-value_tCw	odds_ratio_tCw	95%_confidence_lower_tCw	95%_confidence_upper_tCw	APOBEC_enrich	tCw_to_G_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_G	odds_ratio_tCw_to_G	tCw_to_T_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_T	odds_ratio_tCw_to_T	p-value_GvT_skew	non-APOBEC_mutations	non-APOBEC_substitutions
TCGA-FA-8693-01A-11D-2397-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-FA-A4BB-01A-11D-A31X-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-FA-A4XK-01A-11D-A31X-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-FA-A6HN-01A-11D-A31X-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-FA-A6HO-01A-11D-A31X-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-FA-A7DS-01A-11D-A382-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-FA-A7Q1-01A-11D-A382-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-FA-A82F-01A-11D-A382-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-FA-A86F-01A-11D-A382-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-FF-8041-01A-11D-2210-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-FF-8042-01A-11D-2210-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-FF-8043-01A-11D-2210-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-FF-8046-01A-11D-2210-10	0	0	1	1	2	0	0	0	0	2	82	0	0	0	0	30	1	0	0	1	16	0	0	0	0	15	0	0	1	1	21	0	0	0	0	6	0	0	0.285714285714286	0	0	0	0	0	0	3	0	NaN	0.2	NaN	0	0	0	1	9	27	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	2	2
TCGA-FF-8047-01A-11D-2210-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-FF-8061-01A-11D-2210-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-FF-8062-01A-11D-2210-10	0	0	1	1	2	0	0	0	0	2	82	1	0	0	1	14	0	0	0	0	13	0	0	0	0	25	0	0	1	1	30	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	NaN	0.04	NaN	0	0	0	1	1	54	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	2	2
TCGA-FF-A7CQ-01A-11D-A382-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-FF-A7CR-01A-11D-A382-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-FF-A7CW-01A-11D-A382-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-FF-A7CX-01A-12D-A382-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-FM-8000-01A-11D-2210-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-G8-6324-01A-11D-2210-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-G8-6325-01A-11D-2210-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-G8-6326-01A-11D-2210-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-G8-6906-01A-11D-2210-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-G8-6907-01A-11D-2210-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-G8-6909-01A-11D-2210-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-G8-6914-01A-11D-2210-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-GR-7351-01A-11D-2210-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-GR-7353-01A-11D-2210-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-GR-A4D4-01A-11D-A31X-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-GR-A4D5-01A-11D-A31X-10	0	0	1	1	2	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	2	0
TCGA-GR-A4D6-01A-11D-A31X-10	0	0	1	1	2	0	0	0	0	2	82	0	0	0	0	15	0	0	0	0	21	0	0	1	1	20	0	0	1	1	26	0	0	1	1	4	0.5	1	0.153846153846154	6.5	0.25	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	0.5	1	1	4	42	0.199468085106383	9.50263961239312	0.21882511679606	Inf	5.75	NaN	1	0	5.75	0.199468085106383	9.50263961239312	1	1	1
TCGA-GR-A4D9-01B-11D-A31X-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-GS-A9TQ-01A-11D-A382-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-GS-A9TT-01A-11D-A382-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-GS-A9TU-01A-11D-A382-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-GS-A9TV-01A-11D-A382-10	0	0	1	1	2	0	0	0	0	2	82	0	1	0	1	15	0	0	1	1	16	0	0	0	0	31	0	0	0	0	20	0	0	0	0	1	0	NaN	0.05	NaN	0	0	0	0	0	2	0	NaN	0.0645161290322581	NaN	0	0	0	0	3	48	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	2	2
TCGA-GS-A9TW-01A-11D-A382-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-GS-A9TX-01A-11D-A382-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-GS-A9TY-01A-11D-A38X-10	0	0	1	1	2	0	0	0	0	2	82	0	0	0	0	26	0	1	0	1	17	0	0	1	1	16	0	0	0	0	23	0	0	0	0	2	0	NaN	0.0869565217391304	NaN	0	0	0	0	0	2	0	0	0.125	0	0	0	0	1	4	35	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	2	2
TCGA-GS-A9TZ-01A-11D-A38X-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-GS-A9U3-01A-11D-A38X-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-GS-A9U4-01A-11D-A38X-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-RQ-A68N-01A-11D-A31X-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-RQ-A6JB-01A-11D-A31X-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-RQ-AAAT-01A-11D-A38X-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
TCGA-VB-A8QN-01A-11D-A382-10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	0	0
Totals	0	0	6	6	12	2	0	0	0	10	410	1	1	0	2	100	1	1	1	3	83	0	0	2	2	107	0	0	3	3	120	0	0	1	1	13	0.0833333333333333	0.333333333333333	0.108333333333333	3.07692307692308	0.0769230769230769	0	0	0	0	8	0	0	0.0747663551401869	0	0	0.0833333333333333	1	4	21	206	0.395121216684234	2.43912304400653	0.0966511757643815	Inf	2.16190476190476	NaN	1	0	2.16190476190476	0.395121216684234	2.43912304400653	1	11	9
