Sample	A_T_coord_clusters	G_C_coord_clusters	Non_coord_clusters	clusters	mutations	complex	insertions	deletions	indels	substitutions	bases	A_to_T	A_to_G	A_to_C	A	a	T_to_A	T_to_C	T_to_G	T	t	G_to_C	G_to_T	G_to_A	G	g	C_to_G	C_to_A	C_to_T	C	c	tCw_to_G	tCw_to_A	tCw_to_T	tCw	tcw	tCw_per_mut	tCw_per_C	tcw_per_c	enrich_tCw	freq_tCw	wGa_to_C	wGa_to_T	wGa_to_A	wGa	wga	wGa_per_mut	wGa_per_G	wga_per_g	enrich_wGa	freq_wGa	[tCw_to_G+tCw_to_T]_per_mut	tCw_to_G+tCw_to_T	[(C_to_G)+(C_to_T)]-[(tCw_to_G)+(tCw_to_T)]	tcw+wga	c-tcw	Fisher_p-value_tCw	odds_ratio_tCw	95%_confidence_lower_tCw	95%_confidence_upper_tCw	APOBEC_enrich	tCw_to_G_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_G	odds_ratio_tCw_to_G	tCw_to_T_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_T	odds_ratio_tCw_to_T	p-value_GvT_skew	non-APOBEC_mutations	non-APOBEC_substitutions
TCGA-05-4244-01A-01D-1105-08	0	0	0	0	237	3	3	7	10	224	9184	10	7	1	18	2297	17	10	4	31	2170	9	46	29	84	2385	18	41	32	91	2332	1	5	3	9	321	0.0379746835443038	0.0989010989010989	0.137650085763293	0.718496456814214	0.0280373831775701	2	6	7	15	324	0.0632911392405063	0.178571428571429	0.135849056603774	1.31448412698413	0.0462962962962963	0.0548523206751055	13	75	645	4072	0.42997905460516	1.09429172860585	0.618433907083215	Inf	1.08035588442565	0.812575366063738	0.734297509428584	0.789183727603187	1.19888168763502	0.32201126073349	1.2378098215441	0.0489914130589479	224	211
TCGA-05-4249-01A-01D-1105-08	0	0	1	1	361	4	3	9	12	345	14145	22	21	5	48	3347	18	8	3	29	3449	15	76	41	132	3684	22	69	45	136	3665	11	7	11	29	518	0.0803324099722992	0.213235294117647	0.141336971350614	1.50870145355439	0.055984555984556	5	6	2	13	472	0.03601108033241	0.0984848484848485	0.128121606948969	0.768682588597843	0.0275423728813559	0.0803324099722992	29	94	990	6359	0.00185328734366223	1.98146905244746	1.34741579591469	Inf	1.75019298677835	3.21004641004641	9.65389511046719e-06	4.89236328595601	1.12211651397698	0.374588011706924	1.1438152258663	0.646661949228087	332	316
TCGA-05-4250-01A-01D-1105-08	0	0	0	0	394	9	5	13	18	367	15047	11	23	4	38	3500	14	22	5	41	3669	27	64	51	142	3941	30	74	42	146	3937	7	9	13	29	551	0.0736040609137056	0.198630136986301	0.13995427990856	1.41925018024513	0.0526315789473684	8	6	9	23	510	0.0583756345177665	0.161971830985915	0.129408779497589	1.25162938414803	0.0450980392156863	0.0939086294416244	37	113	1061	6817	0.000193555399399413	2.10354961618613	1.49568542750301	Inf	1.83151743638077	1.95396597053425	0.00748548066592742	2.29435092413918	1.75646833480283	0.00575071225022085	1.99070875348858	0.21887252153302	357	330
TCGA-05-4382-01A-01D-1931-08	0	0	2	2	2075	59	11	40	51	1965	80565	85	47	17	149	19641	107	48	18	173	19424	119	515	184	818	20782	114	507	204	825	20718	36	64	57	157	2842	0.0756626506024096	0.19030303030303	0.137175403031181	1.38729703793743	0.0552427867698804	40	67	52	159	2878	0.0766265060240964	0.194376528117359	0.138485227600808	1.40359034306288	0.0552466990965949	0.0891566265060241	185	436	5720	35780	1.39381300492291e-24	2.65428498390329	2.28174650883212	Inf	2.16138531355923	2.3665176025691	2.37755146849524e-13	3.02790444959972	2.03820020186	1.98373136819838e-13	2.44373241569629	0.00507645557069601	1890	1780
TCGA-05-4384-01A-01D-1753-08	0	0	0	0	162	5	0	5	5	152	6232	7	11	3	21	1413	8	8	1	17	1473	8	21	27	56	1691	6	32	20	58	1655	1	4	3	8	204	0.0493827160493827	0.137931034482759	0.123262839879154	1.11899932386748	0.0392156862745098	3	0	6	9	197	0.0555555555555556	0.160714285714286	0.116499112950917	1.3795322697607	0.0456852791878173	0.0802469135802469	13	48	401	2945	0.0285308913768657	1.98857383980743	1.09714842433782	Inf	1.77825926985814	2.38403990024938	0.0779877459862381	2.9362931040686	1.59781397569905	0.106024320300955	1.73905166351378	0.157056955393271	149	139
TCGA-05-4389-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	312	6	3	7	10	296	12136	5	12	3	20	2937	11	16	7	34	3029	30	25	59	114	3005	32	32	64	128	3165	15	6	20	41	463	0.131410256410256	0.3203125	0.146287519747235	2.1896092062635	0.0885529157667387	17	7	22	46	449	0.147435897435897	0.403508771929825	0.149417637271215	2.70054311725863	0.102449888641425	0.237179487179487	74	111	912	5258	2.64602754298995e-16	3.84246555878622	2.94185500118243	Inf	2.70614035087719	3.49179400113186	1.67590264985514e-11	6.14687197793112	2.31011981172443	1.01440782021846e-07	2.98872252300632	0.16737244905763	238	222
TCGA-05-4390-01A-02D-1753-08	0	0	0	0	633	16	5	25	30	586	24026	28	19	11	58	5725	32	16	7	55	5788	28	144	59	231	6321	31	157	54	242	6192	3	12	6	21	825	0.033175355450237	0.0867768595041322	0.133236434108527	0.65129977460556	0.0254545454545455	4	20	7	31	835	0.0489731437598736	0.134199134199134	0.132099351368454	1.01589548176375	0.037125748502994	0.0315955766192733	20	152	1660	10853	0.767477066027704	0.860285291569097	0.55481819624783	Inf	0.876506024096386	0.894333265264448	0.681745972839385	0.880088552450989	0.867197995521911	0.748947680338408	0.849960020218677	0.212899908589895	613	566
TCGA-05-4395-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	298	4	1	3	4	290	11890	9	10	2	21	2811	11	11	4	26	2962	22	51	53	126	2966	22	42	53	117	3151	18	8	19	45	447	0.151006711409396	0.384615384615385	0.141859727070771	2.71123730855274	0.100671140939597	16	7	19	42	389	0.140939597315436	0.333333333333333	0.131153068105192	2.54155955441302	0.107969151670951	0.241610738255034	72	78	836	5281	3.69635773985951e-23	5.82844760872039	4.36127685540306	Inf	3.51215311004785	5.65403436276642	4.25071865416833e-21	21.4690665955119	2.62307032590051	1.17637527830598e-08	3.52909614167361	0.644391098272556	226	218
TCGA-05-4396-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	560	3	0	10	10	547	22427	12	7	7	26	5148	16	8	3	27	5614	124	68	35	227	5701	152	77	38	267	5964	4	8	8	20	826	0.0357142857142857	0.0749063670411985	0.13849765258216	0.540849362026281	0.0242130750605327	1	1	5	7	772	0.0125	0.0308370044052863	0.135414839501842	0.22772248978567	0.00906735751295337	0.0321428571428571	18	331	1598	10067	0.999999922754349	0.34260450876323	0.218467753601515	Inf	0.376491387873811	0.13224184215777	0.999999999999469	0.116241501481428	1.29995542373172	0.195142176665567	1.36490257978655	0.0418252892405445	542	529
TCGA-05-4397-01A-01D-1265-08	0	0	1	1	913	18	5	27	32	863	35383	41	49	14	104	8683	33	47	14	94	8656	68	142	114	324	8944	78	162	101	341	9100	34	18	21	73	1307	0.0799561883899233	0.214076246334311	0.143626373626374	1.49050791250362	0.0558530986993114	24	27	44	95	1281	0.104052573932092	0.29320987654321	0.143224508050089	2.04720463372558	0.0741608118657299	0.134720700985761	123	238	2588	15456	1.39931484444083e-20	3.08619952891034	2.54303057424046	Inf	2.37556247243832	2.76976985454468	7.23001162835431e-14	3.93593564487171	2.10786815714748	2.57617888272262e-09	2.58770058959903	0.496910345327083	790	740
TCGA-05-4398-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	906	16	8	29	37	853	34973	47	37	10	94	8461	47	36	14	97	8550	49	177	91	317	8901	64	169	112	345	9061	19	22	29	70	1296	0.0772626931567329	0.202898550724638	0.143030570577199	1.41856772231168	0.0540123456790123	13	30	33	76	1243	0.0838852097130243	0.239747634069401	0.139647230648242	1.71680908354926	0.0611423974255833	0.103752759381898	94	222	2539	15423	1.3049452525931e-12	2.57182084647954	2.07387841420182	Inf	2.10442165509196	2.00338088648935	7.23151993166016e-05	2.39961757464242	2.16066602382149	2.15572963277487e-09	2.67061519907188	0.000259167759315218	812	759
TCGA-05-4402-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	196	1	1	5	6	189	7749	2	7	3	12	1901	3	5	4	12	2027	28	10	38	76	1861	31	12	46	89	1960	23	4	21	48	310	0.244897959183673	0.539325842696629	0.158163265306122	3.40993113446901	0.154838709677419	20	1	20	41	304	0.209183673469388	0.539473684210526	0.163353036002149	3.30250173130194	0.134868421052632	0.428571428571429	84	59	614	3207	1.98994079937799e-29	7.43055088261085	5.49298755799578	Inf	3.65554315391449	4.53549936509689	1.52709301305911e-21	14.0218919972323	3.03747867225066	6.35450073452255e-12	4.97729397957801	0.880708657964567	112	105
TCGA-05-4403-01A-01D-1265-08	0	0	1	1	161	0	2	5	7	154	6314	11	7	2	20	1510	3	10	2	15	1570	11	23	27	61	1645	7	22	29	58	1589	1	4	3	8	230	0.0496894409937888	0.137931034482759	0.144745122718691	0.952923538230885	0.0347826086956522	2	5	4	11	234	0.0683229813664596	0.180327868852459	0.142249240121581	1.26768950539442	0.047008547008547	0.062111801242236	10	64	464	2770	0.631580764511375	0.932789423142547	0.482174495415374	Inf	0.941868592730662	1.16163793103448	0.489494609545313	1.19388017903919	0.871228448275862	0.709831009378254	0.852872623091498	0.269064999877013	151	144
TCGA-05-4405-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	489	12	3	10	13	464	19024	25	18	9	52	4586	25	23	10	58	4516	20	85	67	172	4933	32	96	54	182	4989	8	11	4	23	691	0.0470347648261759	0.126373626373626	0.138504710362798	0.912413924714938	0.0332850940665702	10	9	8	27	672	0.0552147239263804	0.156976744186047	0.136225420636529	1.15233077242525	0.0401785714285714	0.0613496932515337	30	143	1363	8559	0.107619430030543	1.31734271605418	0.915628839135911	Inf	1.26234632038304	2.51983746261076	0.000124530603595904	3.32389424298765	0.721936903888481	0.916210773250281	0.691347500061877	0.275153147190293	459	434
TCGA-05-4410-01A-21D-1855-08	0	0	1	1	1299	19	5	22	27	1253	51373	55	49	19	123	12506	72	42	11	125	12669	94	291	153	538	13049	83	247	137	467	13149	25	28	38	91	1864	0.0700538876058507	0.194860813704497	0.14175982964484	1.37458414130924	0.0488197424892704	27	33	38	98	1832	0.0754426481909161	0.182156133828996	0.140393899915702	1.29746473271538	0.0534934497816594	0.0985373364126251	128	339	3696	22502	9.46338189284262e-14	2.29869728232205	1.91967824762639	Inf	1.94280523188446	2.08241005698633	1.38057353892964e-07	2.53254488826308	1.85759814897746	5.53466972326046e-08	2.16209252290876	0.0122786750257895	1171	1125
TCGA-05-4415-01A-22D-1855-08	0	0	0	0	228	5	2	5	7	216	8856	9	9	2	20	2129	11	5	0	16	2098	8	58	25	91	2286	4	55	30	89	2343	0	5	1	6	312	0.0263157894736842	0.0674157303370786	0.133162612035851	0.506266205704408	0.0192307692307692	4	9	1	14	314	0.0614035087719298	0.153846153846154	0.137357830271216	1.12003919647232	0.0445859872611465	0.0263157894736842	6	61	626	4003	0.903789146599903	0.629027578944543	0.263487471563921	Inf	0.662200181202613	2.46485623003195	0.0679830330199447	3.19613190576321	0.268893406912576	0.996660994387523	0.241348181820913	0.661419661419662	222	210
TCGA-05-4417-01A-22D-1855-08	0	0	0	0	329	7	3	7	10	312	12792	16	16	2	34	3001	13	16	9	38	3099	15	67	31	113	3334	24	81	22	127	3358	1	9	3	13	472	0.0395136778115502	0.102362204724409	0.140559857057772	0.728246363272388	0.0275423728813559	3	10	4	17	434	0.0516717325227964	0.150442477876106	0.130173965206959	1.1557032747441	0.0391705069124424	0.033434650455927	11	81	906	5786	0.715614280475097	0.867314609580854	0.468141897374488	Inf	0.883146175256742	0.757570611875248	0.792428740174514	0.729895320937331	0.975550835103503	0.589043998191204	0.971832323767306	0.506177594327247	318	301
TCGA-05-4418-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	304	10	4	6	10	284	11644	13	18	2	33	2692	14	18	7	39	2807	11	64	38	113	3026	14	50	35	99	3119	4	2	7	13	409	0.0427631578947368	0.131313131313131	0.131131773004168	1.00138302338791	0.0317848410757946	0	12	3	15	393	0.0493421052631579	0.132743362831858	0.129874421678784	1.0220901168682	0.0381679389312977	0.0460526315789474	14	84	802	5343	0.403987647876528	1.1102928025446	0.643850344166341	Inf	1.09458496615604	1.22593516209476	0.416093055129737	1.2689162397791	1.04960202234141	0.487592039133003	1.05747955628685	0.121153918421345	290	270
TCGA-05-4420-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	347	4	3	9	12	331	13571	18	13	8	39	3312	13	13	6	32	3194	17	70	41	128	3526	17	75	40	132	3539	3	8	5	16	453	0.0461095100864553	0.121212121212121	0.128002260525572	0.94695297344304	0.0353200883002208	3	11	6	20	441	0.0576368876080692	0.15625	0.125070901871809	1.24929138321995	0.0453514739229025	0.0489913544668588	17	98	894	6171	0.286702792626682	1.19736297360751	0.733522715654397	Inf	1.16822293551211	1.39459139360442	0.256402695974871	1.47904671386323	1.07320407655978	0.451394681650274	1.08472194272413	0.266839618208723	330	314
TCGA-05-4422-01A-01D-1265-08	0	1	0	1	60	0	0	4	4	56	2296	2	3	0	5	559	2	2	1	5	567	6	8	16	30	588	5	2	9	16	582	3	1	6	10	88	0.166666666666667	0.625	0.151202749140893	4.13352272727273	0.113636363636364	1	0	5	6	70	0.1	0.2	0.119047619047619	1.68	0.0857142857142857	0.25	15	21	158	1012	4.4621236118614e-05	4.56639569285189	2.40388566144058	Inf	3.08544303797468	2.692750287687	0.0516666948485723	3.65416464073257	3.25822784810127	0.000244772461886642	5.0219252330758	0.0319523882654032	45	41
TCGA-05-4424-01A-22D-1855-08	0	0	0	0	870	10	4	21	25	834	34194	39	36	9	84	8304	37	34	12	83	8490	58	189	87	334	8730	65	168	100	333	8670	26	17	28	71	1248	0.0816091954022989	0.213213213213213	0.143944636678201	1.48121679371679	0.0568910256410256	28	21	23	72	1223	0.0827586206896552	0.215568862275449	0.140091638029782	1.53877037421478	0.0588716271463614	0.120689655172414	105	205	2471	14929	5.90328684128605e-18	3.09424546242079	2.50942764800466	Inf	2.38508635657498	3.09147081758151	2.30672553071466e-15	4.72782011482244	1.92045914425518	2.68628357028667e-06	2.26549482835624	0.806258233710929	765	729
TCGA-05-4425-01A-01D-1753-08	0	0	0	0	48	0	2	3	5	43	1763	0	4	0	4	373	2	1	2	5	398	2	3	13	18	471	2	0	14	16	521	1	0	2	3	57	0.0625	0.1875	0.109404990403071	1.71381578947368	0.0526315789473684	0	1	0	1	49	0.0208333333333333	0.0555555555555556	0.104033970276008	0.534013605442177	0.0204081632653061	0.0625	3	28	106	886	0.659802993659787	0.895627577185535	0.227483970348489	Inf	0.905660377358491	2.33962264150943	0.36575943346083	2.7819902569668	0.693221523410203	0.799930642479091	0.668906752849419	1	45	40
TCGA-05-4426-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	57	0	0	4	4	53	2173	2	6	3	11	534	4	2	0	6	495	4	4	14	22	562	0	4	10	14	582	0	1	1	2	73	0.0350877192982456	0.142857142857143	0.125429553264605	1.13894324853229	0.0273972602739726	2	1	1	4	83	0.0701754385964912	0.181818181818182	0.147686832740214	1.23110624315444	0.0481927710843374	0.0701754385964912	4	24	156	988	0.545288257558485	1.05551789349467	0.331371742377373	Inf	1.04761904761905	3.66666666666667	0.0935583153612427	6.31639474631548	0.611111111111111	0.857500125980297	0.575982690030393	1	53	49
TCGA-05-4427-01A-21D-1855-08	0	0	2	2	1175	15	3	28	31	1129	46289	52	46	20	118	11225	57	55	31	143	11575	66	263	119	448	11770	72	225	123	420	11719	16	29	23	68	1694	0.0578723404255319	0.161904761904762	0.144551582899565	1.12004834991848	0.0401416765053129	13	26	24	63	1626	0.0536170212765957	0.140625	0.138147833474936	1.01793127306273	0.0387453874538745	0.0646808510638298	76	304	3320	20169	0.0011755149489938	1.51871476469773	1.21295142578052	Inf	1.415	1.48677536231884	0.0179155218899451	1.61623804708572	1.37407024793388	0.0147248070204673	1.46419975674197	0.0203187499610188	1099	1053
TCGA-05-4430-01A-02D-1265-08	0	1	0	1	346	2	2	9	11	333	13653	22	12	4	38	3312	17	14	2	33	3412	20	87	29	136	3415	18	75	33	126	3514	3	5	4	12	492	0.0346820809248555	0.0952380952380952	0.140011383039271	0.680216802168022	0.024390243902439	5	11	5	21	475	0.0606936416184971	0.154411764705882	0.13909224011713	1.11013931888545	0.0442105263157895	0.0491329479768786	17	83	967	5962	0.229002237155567	1.26275871554783	0.76919146750801	Inf	1.21812823164426	1.50851793392478	0.152592751953699	1.64397669524706	1.04014744637555	0.505246608686264	1.04696716433148	1	329	316
TCGA-05-4432-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	782	18	5	19	24	740	30340	38	40	17	95	7033	49	35	7	91	7697	35	142	95	272	7727	45	148	89	282	7883	8	17	19	44	1071	0.0562659846547315	0.156028368794326	0.135861981479132	1.14843289561688	0.0410830999066293	8	21	7	36	997	0.0460358056265985	0.132352941176471	0.129028083344118	1.02576848191634	0.0361083249749248	0.0537084398976982	42	222	2068	13542	0.122024016720852	1.23885257847195	0.917262881381563	Inf	1.20087480218041	1.50967117988395	0.0594137545677253	1.63702026269742	1.0666155075267	0.395070716559602	1.07759479149657	0.105231675523025	740	698
TCGA-05-4433-01A-22D-1855-08	0	0	0	0	51	0	2	1	3	48	1968	1	5	0	6	458	1	1	2	4	422	1	2	17	20	533	3	3	12	18	555	2	1	0	3	52	0.0588235294117647	0.166666666666667	0.0936936936936937	1.77884615384615	0.0576923076923077	0	0	0	0	56	0	0	0.105065666041276	0	0	0.0392156862745098	2	31	108	980	0.852121058005086	0.585652842204	0.0985321457829788	Inf	0.610549943883277	5.03703703703704	0.0527007364770885	9.03715086187826	0	1	0	0.4	49	46
TCGA-05-4434-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	65	0	2	6	8	57	2337	0	5	1	6	609	6	3	0	9	558	3	1	18	22	616	3	3	14	20	554	3	0	3	6	76	0.0923076923076923	0.3	0.137184115523466	2.18684210526316	0.0789473684210526	2	1	1	4	101	0.0615384615384615	0.181818181818182	0.163961038961039	1.10891089108911	0.0396039603960396	0.138461538461538	9	29	177	993	0.116113525419704	1.74013608101852	0.821234572475807	Inf	1.56556645851918	5.50847457627119	0.000444261618538464	27.9229617495487	0.826271186440678	0.734466222817379	0.80159045092711	1	56	48
TCGA-05-5420-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	118	3	0	5	5	110	4510	4	8	1	13	1068	7	3	5	15	1086	5	13	20	38	1213	4	19	21	44	1143	1	2	2	5	144	0.0423728813559322	0.113636363636364	0.125984251968504	0.901988636363636	0.0347222222222222	0	1	3	4	151	0.0338983050847458	0.105263157894737	0.124484748557296	0.845590798187522	0.0264900662251656	0.0508474576271186	6	44	295	2061	0.609301491487904	0.952710006214949	0.392303392394542	Inf	0.958372881355932	0.887382297551789	0.700486844846117	0.873326285594754	0.973956180239768	0.596845839803246	0.970348993501342	0.131221719457014	112	104
TCGA-05-5423-01A-01D-1625-08	0	0	1	1	171	2	1	2	3	166	6806	9	8	1	18	1596	10	5	2	17	1696	12	35	25	72	1740	6	30	23	59	1774	2	2	4	8	234	0.0467836257309941	0.135593220338983	0.131905298759865	1.02795885846733	0.0341880341880342	3	3	5	11	207	0.064327485380117	0.152777777777778	0.118965517241379	1.28421900161031	0.0531400966183575	0.0818713450292398	14	52	441	3073	0.0345835371172901	1.87557991511644	1.06097977686782	Inf	1.69023569023569	2.21340388007055	0.0665284056224127	2.67904947129409	1.49404761904762	0.14375684851016	1.60779636067919	0.313274208580104	157	152
TCGA-05-5425-01A-02D-1625-08	0	0	1	1	695	24	5	14	19	652	26732	36	28	9	73	6384	21	27	10	58	6686	37	155	81	273	6724	40	145	63	248	6938	16	21	9	46	954	0.0661870503597122	0.185483870967742	0.137503603343903	1.34893825657672	0.0482180293501048	13	28	8	49	938	0.0705035971223022	0.179487179487179	0.139500297441999	1.28664370455415	0.0522388059701493	0.0661870503597122	46	175	1892	11770	0.00315104336829253	1.63514104033607	1.21728651760054	Inf	1.50299905293065	2.71957112654787	1.94434633992277e-07	3.7580853820201	0.852470930232558	0.793611572443746	0.832733484558375	0.0617692084552485	649	606
TCGA-05-5428-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	434	8	2	8	10	416	17056	13	8	2	23	3964	14	3	9	26	4053	37	80	65	182	4505	27	77	81	185	4534	16	17	32	65	599	0.149769585253456	0.351351351351351	0.132112924569916	2.65947750755764	0.108514190317195	19	6	28	53	623	0.122119815668203	0.291208791208791	0.138290788013319	2.10577143562697	0.0850722311396469	0.21889400921659	95	115	1222	7817	5.15757778262722e-28	5.28294349732841	4.13819392420612	Inf	3.34621229833996	4.04517440671031	1.26096187733114e-14	7.71727141515471	3.03981794946528	4.35520398385206e-16	4.4620755549472	0.00138497830779579	339	321
TCGA-05-5429-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	45	0	2	2	4	41	1681	0	0	0	0	380	0	3	2	5	421	2	2	16	20	471	3	3	10	16	409	0	0	1	1	62	0.0222222222222222	0.0625	0.15158924205379	0.412298387096774	0.0161290322580645	0	1	2	3	52	0.0666666666666667	0.15	0.110403397027601	1.35865384615385	0.0576923076923077	0.0666666666666667	3	28	114	766	0.783941099540898	0.720157088057031	0.183042112083336	Inf	0.747028862478778	0	1	0	0.890688259109312	0.674167387793642	0.876574918350297	0.142857142857143	42	38
TCGA-05-5715-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	139	0	4	3	7	132	5412	2	4	0	6	1281	0	2	2	4	1335	13	5	30	48	1386	27	10	37	74	1410	19	2	15	36	216	0.258992805755396	0.486486486486487	0.153191489361702	3.17567567567568	0.166666666666667	11	1	8	20	199	0.143884892086331	0.416666666666667	0.143578643578644	2.90201005025126	0.100502512562814	0.381294964028777	53	54	415	2381	2.08244058305276e-16	5.62601031222908	3.96479399840465	Inf	3.33719175768495	5.05301204819277	5.74212409042522e-17	17.1832818929899	2.31282143499371	7.4638320439242e-05	2.99748401623171	0.256075145532333	86	79
TCGA-17-Z000-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	159	2	2	3	5	152	6232	10	6	3	19	1609	4	3	3	10	1562	16	14	22	52	1519	15	25	31	71	1542	8	6	8	22	215	0.138364779874214	0.309859154929577	0.139429312581064	2.22233868326236	0.102325581395349	7	1	8	16	219	0.10062893081761	0.307692307692308	0.144173798551679	2.13417632595715	0.0730593607305936	0.19496855345912	31	53	434	2627	3.22956062389598e-07	3.53841975653355	2.34086070830528	Inf	2.60289115646259	3.41273970566374	6.87573281578354e-06	5.6696237048133	2.12920615598644	0.00235891263743178	2.61630804326104	1	128	121
TCGA-17-Z001-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	231	2	5	9	14	215	8815	6	14	1	21	2188	11	5	4	20	2104	17	43	30	90	2211	10	42	32	84	2312	0	3	6	9	330	0.038961038961039	0.107142857142857	0.142733564013841	0.750649350649351	0.0272727272727273	2	6	5	13	335	0.0562770562770563	0.144444444444444	0.151515151515152	0.953333333333333	0.0388059701492537	0.0562770562770563	13	76	665	3858	0.556682693999174	0.992363905924338	0.561182682840623	Inf	0.993478077215511	0.503815093288777	0.922562334728088	0.464181629243835	1.20671840892554	0.301146122435221	1.25122436894294	0.00684490502981711	218	202
TCGA-17-Z002-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	37	1	6	1	7	29	1189	0	3	1	4	294	0	1	0	1	311	9	2	4	15	284	4	2	3	9	300	3	1	1	5	48	0.135135135135135	0.555555555555556	0.16	3.47222222222222	0.104166666666667	7	0	1	8	45	0.216216216216216	0.533333333333333	0.158450704225352	3.36592592592593	0.177777777777778	0.324324324324324	12	8	93	491	1.58856846044205e-05	7.87739371111449	3.31734561427359	Inf	3.76774193548387	4.83043837882548	2.88003148403117e-06	17.4727782943129	1.79416282642089	0.313460347268392	2.10850111403763	0.00483241351460493	25	17
TCGA-17-Z003-01A-01W-0746-08	0	1	0	1	329	10	0	4	4	315	12915	20	31	7	58	3136	17	26	7	50	3345	21	35	35	91	3180	26	45	45	116	3254	9	4	4	17	483	0.0516717325227964	0.146551724137931	0.148432698217578	0.987327764689084	0.0351966873706004	6	3	6	15	453	0.0455927051671733	0.164835164835165	0.142452830188679	1.15712102467069	0.033112582781457	0.0759878419452888	25	102	936	5498	0.0714228043998372	1.43959562563768	0.957097261179705	Inf	1.35313614644323	2.19380796508456	0.00211887483646306	2.75291674622615	0.859241452991453	0.743926810756788	0.839154575867172	0.305497198127017	304	290
TCGA-17-Z004-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	38	0	1	0	1	37	1517	1	5	2	8	371	0	9	0	9	375	3	2	4	9	380	2	2	7	11	391	1	0	0	1	47	0.0263157894736842	0.0909090909090909	0.120204603580563	0.756286266924565	0.0212765957446809	1	0	1	2	55	0.0526315789473684	0.222222222222222	0.144736842105263	1.53535353535354	0.0363636363636364	0.0789473684210526	3	13	102	669	0.361985361905837	1.51265085107455	0.362133070776982	Inf	1.41727941176471	3.02352941176471	0.135613499625646	4.35982549658054	0.687165775401069	0.790774488500478	0.656186766058274	1	35	34
TCGA-17-Z005-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	117	2	3	1	4	111	4551	3	6	5	14	1070	6	4	1	11	1056	5	19	15	39	1216	6	23	18	47	1209	0	3	3	6	158	0.0512820512820513	0.127659574468085	0.130686517783292	0.976838136277942	0.0379746835443038	2	2	2	6	153	0.0512820512820513	0.153846153846154	0.125822368421053	1.22272498743087	0.0392156862745098	0.0598290598290598	7	37	311	2114	0.335632188723188	1.28585515246349	0.563481810209935	Inf	1.24049985384391	1.41771411867875	0.42268555604795	1.51023646542828	1.18142843223229	0.421639648373408	1.21371727846854	0.37070938215103	110	104
TCGA-17-Z007-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	87	1	0	2	2	84	3444	4	6	5	15	879	3	4	6	13	835	3	6	23	32	857	3	6	15	24	873	1	1	0	2	118	0.0229885057471264	0.0833333333333333	0.135166093928981	0.616525423728814	0.0169491525423729	0	2	2	4	120	0.0459770114942529	0.125	0.14002333722287	0.892708333333333	0.0333333333333333	0.0344827586206897	3	41	238	1492	0.951247752450081	0.458855618443623	0.119524803496421	Inf	0.495607333842628	1.21148459383753	0.589387653804954	1.25359979960362	0.382574082264485	0.973872620074632	0.348414571448757	1	84	81
TCGA-17-Z009-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	89	2	3	2	5	81	3321	5	4	1	10	834	7	1	2	10	847	3	17	13	33	787	3	14	11	28	853	1	4	2	7	132	0.0786516853932584	0.25	0.154747948417351	1.6155303030303	0.053030303030303	0	2	2	4	121	0.0449438202247191	0.121212121212121	0.153748411689962	0.788379664412722	0.0330578512396694	0.0561797752808989	5	25	253	1387	0.504088414514072	1.09640626905048	0.396896357133913	Inf	1.08036890645586	1.08036890645586	0.634798548638468	1.09640674926185	1.08036890645586	0.520555466274192	1.09640638271647	0.31077694235589	84	76
TCGA-17-Z010-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	336	8	4	6	10	318	13038	16	10	2	28	3151	15	9	5	29	3219	19	85	32	136	3317	15	67	43	125	3351	6	9	13	28	470	0.0833333333333333	0.224	0.140256639809012	1.59707234042553	0.0595744680851064	5	11	8	24	472	0.0714285714285714	0.176470588235294	0.14229725655713	1.24015453639083	0.0508474576271186	0.0952380952380952	32	77	942	5726	3.70639671697664e-05	2.52566551860461	1.72718093289303	Inf	2.07810826077641	2.290121143999	0.00567224134546292	2.90648707887167	1.9819957537155	0.00141074892029059	2.36342085029348	0.0549802290072467	304	286
TCGA-17-Z011-01A-01W-0746-08	0	2	0	2	135	3	5	4	9	123	5043	8	3	1	12	1220	6	4	3	13	1204	7	22	23	52	1294	4	21	21	46	1325	0	2	5	7	195	0.0518518518518519	0.152173913043478	0.147169811320755	1.0340022296544	0.0358974358974359	1	3	5	9	170	0.0666666666666667	0.173076923076923	0.131375579598145	1.31742081447964	0.0529411764705882	0.0814814814814815	11	44	365	2254	0.139963653077864	1.54354096546483	0.806583771902805	Inf	1.43506849315068	0.652303860523039	0.808285509070961	0.617630232740288	1.6307596513076	0.0801869058561745	1.81577922708245	0.00205381180377553	124	112
TCGA-17-Z013-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	75	0	2	6	8	67	2747	3	4	0	7	694	1	4	0	5	688	2	12	17	31	685	1	11	12	24	680	1	0	0	1	98	0.0133333333333333	0.0416666666666667	0.144117647058824	0.289115646258503	0.0102040816326531	1	2	1	4	94	0.0533333333333333	0.129032258064516	0.137226277372263	0.94028826355525	0.0425531914893617	0.04	3	29	192	1173	0.846440462383123	0.632182627604701	0.161931299426424	Inf	0.66650390625	4.73958333333333	0.0544371809543481	12.180097918987	0.245150862068966	0.987338185484829	0.218331321233176	1	72	64
TCGA-17-Z014-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	409	17	3	5	8	384	15744	27	17	8	52	3961	30	19	7	56	3885	26	52	58	136	3861	15	74	51	140	4037	4	11	9	24	589	0.058679706601467	0.171428571428571	0.145900421104781	1.17496968227019	0.0407470288624788	8	7	15	30	581	0.0733496332518337	0.220588235294118	0.15047915047915	1.46590563936418	0.0516351118760757	0.0880195599022005	36	114	1170	6728	0.00223840730353065	1.81575966400051	1.28702275375449	Inf	1.62010256410256	1.97573483427142	0.0136359331308659	2.3789953153976	1.48633262761703	0.0293416544593947	1.6235283593757	0.0240683058799418	373	348
TCGA-17-Z015-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	592	6	11	8	19	567	23247	29	23	11	63	5691	29	19	7	55	5630	34	115	76	225	5971	43	105	76	224	5955	6	11	5	22	776	0.0371621621621622	0.0982142857142857	0.130310663308144	0.7536933910162	0.0283505154639175	7	16	3	26	824	0.0439189189189189	0.115555555555556	0.138000334952269	0.837357065803668	0.0315533980582524	0.035472972972973	21	208	1600	10326	0.979842113452472	0.651601266389872	0.427422972483776	Inf	0.683531659388646	1.25842532467532	0.229288628478303	1.3108835129009	0.392302631578947	0.999679432857844	0.358561989558437	0.323520517496296	571	546
TCGA-17-Z016-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	324	8	4	8	12	304	12464	25	13	3	41	3088	19	14	4	37	3013	12	79	30	121	3176	9	58	38	105	3187	0	9	5	14	452	0.0432098765432099	0.133333333333333	0.141826168810794	0.940117994100295	0.0309734513274336	2	11	0	13	457	0.0401234567901235	0.107438016528926	0.143891687657431	0.746658950756822	0.0284463894967177	0.0216049382716049	7	82	909	5454	0.977115835798156	0.512238846847706	0.233089229990385	Inf	0.550561797752809	0.666666666666667	0.823226349114619	0.631618517470742	0.514705882352941	0.973365903958394	0.476234364153961	0.420286982717615	317	297
TCGA-17-Z017-01A-01W-0746-08	0	0	1	1	239	3	1	3	4	232	9512	13	9	1	23	2347	20	13	2	35	2330	19	45	29	93	2390	14	45	22	81	2445	4	5	3	12	339	0.0502092050209205	0.148148148148148	0.138650306748466	1.06850213044903	0.0353982300884956	2	3	5	10	342	0.0418410041841004	0.10752688172043	0.143096234309623	0.751430547695403	0.0292397660818713	0.0585774058577406	14	70	681	4154	0.29387964678543	1.21990359848384	0.701825470853543	Inf	1.18330885952031	1.29088239220398	0.318760193143385	1.35542633618676	1.11370245601912	0.431849284966117	1.13479436850572	0.746987504951386	225	218
TCGA-17-Z018-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	279	2	1	7	8	269	11029	14	9	1	24	2739	13	13	3	29	2627	16	65	19	100	2916	8	86	22	116	2747	2	12	4	18	374	0.0645161290322581	0.155172413793103	0.136148525664361	1.13972893232528	0.0481283422459893	5	7	0	12	393	0.043010752688172	0.12	0.13477366255144	0.890381679389313	0.0305343511450382	0.039426523297491	11	54	767	4896	0.262482999195237	1.30023725016304	0.689934914359319	Inf	1.24948350215625	2.15346588439809	0.0359226076368986	2.62760743490458	0.720323083282984	0.824139345666289	0.690127606827074	0.506177594327247	268	258
TCGA-17-Z019-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	6	0	2	1	3	3	123	1	0	1	2	23	0	0	0	0	46	0	0	1	1	24	0	0	0	0	30	0	0	0	0	8	0	NaN	0.266666666666667	NaN	0	0	0	0	0	3	0	0	0.125	0	0	0	0	1	11	43	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	6	3
TCGA-17-Z020-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	160	2	3	1	4	154	6314	8	7	3	18	1556	3	3	0	6	1616	12	18	25	55	1522	14	26	35	75	1620	6	6	10	22	246	0.1375	0.293333333333333	0.151851851851852	1.93170731707317	0.0894308943089431	5	4	10	19	239	0.11875	0.345454545454545	0.157030223390276	2.19992392544694	0.0794979079497908	0.19375	31	55	485	2657	3.44398668462721e-06	3.08631832968681	2.04910984249783	Inf	2.33521937185327	2.74084060269627	0.00101675137557046	4.01493903063398	2.15945017182131	0.000531875752192368	2.73784107020576	0.0676668638925778	129	123
TCGA-17-Z021-01A-01W-0746-08	0	0	1	1	223	4	1	3	4	215	8815	15	12	3	30	2174	15	8	4	27	2195	14	46	20	80	2212	12	48	18	78	2234	4	7	3	14	330	0.062780269058296	0.179487179487179	0.147717099373321	1.21507381507382	0.0424242424242424	7	10	3	20	292	0.0896860986547085	0.25	0.132007233273056	1.89383561643836	0.0684931506849315	0.0762331838565022	17	47	622	3824	0.00630167256265468	2.22320350829591	1.31291002576468	Inf	1.898663585209	3.02411575562701	0.000427124447395831	4.50636856169168	1.12861736334405	0.444571259453806	1.1526695392594	0.262434329985059	206	198
TCGA-17-Z022-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	1358	21	5	24	29	1308	53628	49	59	12	120	13145	77	51	9	137	13062	98	278	146	522	13489	99	295	135	529	13932	36	39	53	128	1997	0.0942562592047128	0.241965973534972	0.143339075509618	1.68806707225299	0.0640961442163245	39	28	42	109	1919	0.0802650957290133	0.208812260536398	0.14226406701757	1.46777935506799	0.0568004168837936	0.125184094256259	170	308	3916	23505	1.62279491517237e-30	3.31276473806911	2.80835227981928	Inf	2.49035712301426	2.66584959271607	2.14677415587455e-16	3.68975433605625	2.36732503571442	2.47448555185018e-16	3.06551682651929	0.0686650606557897	1188	1138
TCGA-17-Z023-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	459	12	4	18	22	425	17425	18	21	8	47	4206	24	28	10	62	4520	42	72	38	152	4384	35	76	53	164	4315	14	13	9	36	671	0.0784313725490196	0.219512195121951	0.15550405561993	1.41161717131329	0.0536512667660209	19	7	11	37	613	0.0806100217864924	0.243421052631579	0.139826642335766	1.74087747917919	0.0603588907014682	0.115468409586057	53	115	1284	7415	4.45766386876609e-08	2.66096499252503	1.98080748633573	Inf	2.13732662067942	2.90353805073431	3.40361884721447e-09	4.33039007611702	1.48899387217144	0.0427549528067813	1.62662621304256	0.0384161741180975	406	372
TCGA-17-Z025-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	278	8	4	7	11	259	10619	14	11	4	29	2583	12	19	6	37	2653	17	52	34	103	2708	7	57	26	90	2675	1	8	0	9	375	0.0323741007194245	0.1	0.14018691588785	0.713333333333333	0.024	3	6	4	13	371	0.0467625899280576	0.12621359223301	0.137001477104874	0.921257163792427	0.0350404312668464	0.0287769784172662	8	76	746	4637	0.909341049049356	0.654341339045579	0.314144897735886	Inf	0.68722073279714	1.202636282395	0.431403160430605	1.24310306930068	0.481054512957998	0.973814754480647	0.444035149934493	1	270	251
TCGA-17-Z026-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	1211	14	4	10	14	1183	48503	51	9	15	75	12281	42	20	6	68	12365	141	154	217	512	11915	146	152	230	528	11942	101	23	139	263	1979	0.217175887696119	0.498106060606061	0.165717635236979	3.00575168052429	0.132895401718039	89	29	105	223	1943	0.184145334434352	0.435546875	0.163071758287872	2.6708908984174	0.114770972722594	0.358381502890173	434	300	3922	19935	4.52137826301465e-144	7.35342851345738	6.45994844909787	Inf	3.59668091823251	4.02698438363418	1.81696464258696e-77	9.9543693076463	3.32040106460773	1.32750174161601e-73	6.10880389869552	0.000619623752376295	777	749
TCGA-17-Z027-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	120	1	3	1	4	115	4715	8	11	5	24	1182	3	9	4	16	1143	6	16	15	37	1208	6	12	20	38	1182	1	0	3	4	155	0.0333333333333333	0.105263157894737	0.131133671742809	0.802716468590832	0.0258064516129032	0	0	3	3	159	0.025	0.0810810810810811	0.131622516556291	0.616012238653748	0.0188679245283019	0.0583333333333333	7	40	314	2076	0.426387780184949	1.15691071741733	0.509214484720917	Inf	1.13362244206532	0.634288747346072	0.815674244568206	0.601148594912981	1.30482256596906	0.311607970679498	1.36768908363288	0.0291375291375292	113	108
TCGA-17-Z028-01A-01W-0746-08	0	0	1	1	560	11	1	16	17	532	21812	20	23	6	49	5348	31	19	7	57	5439	30	110	55	195	5407	47	103	81	231	5618	16	18	16	50	795	0.0892857142857143	0.216450216450216	0.141509433962264	1.52958152958153	0.0628930817610063	8	10	13	31	722	0.0553571428571429	0.158974358974359	0.133530608470501	1.19054620356559	0.0429362880886427	0.0946428571428571	53	160	1517	9508	1.33997975063151e-05	2.07600479495616	1.56618592635637	Inf	1.8083782855339	2.26523641157788	7.30541308247863e-05	2.83780100810004	1.54971596417077	0.0107443961656432	1.69860307342097	0.503167765764938	507	479
TCGA-17-Z030-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	676	10	7	16	23	643	26363	45	16	2	63	6494	43	20	7	70	6628	40	141	72	253	6580	27	171	59	257	6661	3	20	12	35	956	0.0517751479289941	0.136186770428016	0.14352199369464	0.948891294791853	0.0366108786610879	6	18	12	36	905	0.0532544378698225	0.142292490118577	0.137537993920973	1.03456860218811	0.0397790055248619	0.0488165680473373	33	165	1861	11380	0.171382572208117	1.22296573726365	0.867492132462265	Inf	1.18583198996955	0.955745185945608	0.61156529736272	0.948874669302073	1.30350997370699	0.104680299578574	1.37154814248974	0.00492187254889706	643	610
TCGA-17-Z031-01A-01W-0746-08	0	1	1	2	2507	68	19	49	68	2371	97211	128	128	82	338	23516	128	118	85	331	23756	104	551	197	852	24945	127	535	188	850	24994	29	76	33	138	3467	0.055045871559633	0.162352941176471	0.138713291189886	1.17042094368754	0.0398038650129795	27	68	18	113	3363	0.0450737933785401	0.132629107981221	0.134816596512327	0.983774337969536	0.0336009515313708	0.0426804946150778	107	509	6830	43109	0.00589375398610837	1.32681356850286	1.1034422919034	Inf	1.27005404917191	1.77253649230223	1.23809143768015e-05	2.01976048192256	0.968564583293719	0.619023350508733	0.963761798357635	0.663013074673142	2400	2264
TCGA-17-Z032-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	163	4	4	5	9	150	6150	6	8	1	15	1437	8	5	3	16	1527	14	8	33	55	1578	11	18	35	64	1608	5	3	8	16	231	0.098159509202454	0.25	0.14365671641791	1.74025974025974	0.0692640692640693	9	1	7	17	207	0.104294478527607	0.309090909090909	0.131178707224335	2.3562582345191	0.0821256038647343	0.177914110429448	29	64	438	2748	1.7559388737791e-05	2.84164814614007	1.88432199899025	Inf	2.26822801590809	4.07342465753425	9.99668477229183e-07	7.97595728141268	1.60455278001612	0.0433359266896028	1.77527114610004	1	134	121
TCGA-17-Z033-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	224	4	6	0	6	214	8774	6	6	1	13	2141	9	8	6	23	2191	18	42	40	100	2235	11	33	34	78	2207	7	6	18	31	349	0.138392857142857	0.397435897435897	0.158133212505664	2.51329806773933	0.0888252148997135	11	3	9	23	323	0.102678571428571	0.23	0.144519015659955	1.59148606811146	0.0712074303405573	0.200892857142857	45	58	672	3770	8.82012002740299e-12	4.35082772499737	3.04668613958449	Inf	2.8879160887656	4.10283251231527	1.29678517401324e-08	9.17269777295365	2.41180019305019	6.71401499486387e-06	3.22166547734788	0.117982055555312	179	169
TCGA-17-Z036-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	91	1	3	3	6	84	3444	6	6	1	13	778	1	3	2	6	860	6	11	12	29	859	5	15	16	36	947	0	1	8	9	130	0.0989010989010989	0.25	0.13727560718057	1.82115384615385	0.0692307692307692	2	1	1	4	103	0.043956043956044	0.137931034482759	0.119906868451688	1.15031804486106	0.0388349514563107	0.120879120879121	11	28	233	1573	0.00956482318352716	2.65029524585171	1.33515704328255	Inf	2.18620006602839	1.40928599297698	0.42623552790112	1.49984519354822	2.49141630901288	0.00738923730536864	3.19495464994231	0.0154193027325347	80	73
TCGA-17-Z037-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	172	1	0	6	6	165	6765	3	10	4	17	1673	11	10	8	29	1720	5	7	43	55	1734	6	6	52	64	1638	2	1	4	7	240	0.0406976744186047	0.109375	0.146520146520147	0.746484375	0.0291666666666667	2	1	4	7	256	0.0406976744186047	0.127272727272727	0.147635524798155	0.862073863636364	0.02734375	0.0697674418604651	12	94	496	2876	0.869120278920162	0.740278623171597	0.411210497137043	Inf	0.769628727936701	2.47214076246334	0.0660270520671196	3.31168590685332	0.572495755517827	0.975610243350206	0.53326578513682	0.251859828599632	160	153
TCGA-17-Z041-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	94	1	16	0	16	77	3157	0	4	2	6	761	1	2	2	5	762	11	14	17	42	834	5	9	10	24	800	2	1	2	5	115	0.0531914893617021	0.208333333333333	0.14375	1.44927536231884	0.0434782608695652	3	4	0	7	103	0.074468085106383	0.166666666666667	0.123501199040767	1.3495145631068	0.0679611650485437	0.074468085106383	7	36	218	1416	0.352817874267402	1.26280549507738	0.550614608768004	Inf	1.22018348623853	2.34231651376147	0.0534857611867913	2.94971412794047	0.555215766224941	0.891457511144388	0.519796055249255	0.37070938215103	87	70
TCGA-17-Z042-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	519	10	4	10	14	495	20295	22	12	7	41	4897	24	22	7	53	5124	28	122	58	208	5003	29	120	44	193	5271	3	17	5	25	789	0.0481695568400771	0.129533678756477	0.149686966420034	0.865363777852203	0.0316856780735108	8	15	8	31	706	0.0597302504816956	0.149038461538462	0.141115330801519	1.05614649161037	0.0439093484419263	0.046242774566474	24	135	1495	8779	0.458104179684265	1.04395717634132	0.69643200893592	Inf	1.0373193664416	1.32622190928827	0.200534428864957	1.40417655474015	0.875873827791986	0.737920094939159	0.85776166540483	0.818274801808065	495	471
TCGA-17-Z043-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	233	6	5	3	8	219	8979	15	9	4	28	2210	10	23	8	41	2208	13	31	25	69	2254	14	35	32	81	2307	5	6	9	20	331	0.0858369098712446	0.246913580246914	0.143476376246207	1.72093543694752	0.0604229607250755	6	6	5	17	321	0.0729613733905579	0.246376811594203	0.142413487133984	1.73001038421599	0.0529595015576324	0.107296137339056	25	59	652	3909	0.00024266024290888	2.53971298775305	1.64138111789982	Inf	2.08196392053754	2.84997727789139	0.000755375154532965	4.12021738530605	1.71816811968572	0.0284900998517602	1.95172646920415	0.623525817550556	208	194
TCGA-17-Z044-01A-01W-0746-08	0	0	1	1	140	0	3	5	8	132	5412	6	9	1	16	1342	7	11	1	19	1310	6	20	20	46	1366	11	25	15	51	1394	1	3	5	9	191	0.0642857142857143	0.176470588235294	0.137015781922525	1.28795811518325	0.0471204188481675	2	4	0	6	202	0.0428571428571429	0.130434782608696	0.14787701317716	0.882049074472665	0.0297029702970297	0.0571428571428571	8	44	393	2367	0.467944274247392	1.09506414564298	0.512520166704094	Inf	1.08044627128597	1.23933542882802	0.445207311210991	1.2904907045701	1.00327153762268	0.571096492803301	1.00381549671299	0.681659170414793	132	124
TCGA-17-Z045-01A-01W-0746-08	0	0	1	1	736	9	13	16	29	698	28618	35	34	12	81	7161	41	37	11	89	7327	43	157	59	259	6955	58	161	50	269	7175	14	17	9	40	1075	0.0543478260869565	0.148698884758364	0.149825783972125	0.992478602922106	0.0372093023255814	9	13	5	27	996	0.0366847826086957	0.104247104247104	0.143206326383896	0.727950411685351	0.0271084337349398	0.0502717391304348	37	173	2071	12059	0.135355581958975	1.24530152829237	0.900130058520258	Inf	1.20211078154101	1.5537048634849	0.0197670281734741	1.7168944973392	0.876321769831531	0.742571877138153	0.85811122597068	0.121522441570454	699	661
TCGA-17-Z047-01A-01W-0747-08	0	1	0	1	44	0	4	3	7	37	1517	2	1	1	4	357	2	2	2	6	375	3	0	11	14	408	4	2	7	13	377	1	0	0	1	54	0.0227272727272727	0.0769230769230769	0.143236074270557	0.537037037037037	0.0185185185185185	1	0	3	4	62	0.0909090909090909	0.285714285714286	0.151960784313725	1.88018433179724	0.0645161290322581	0.113636363636364	5	20	116	669	0.313302918591702	1.44107540459651	0.507591454179219	Inf	1.35344827586207	1.93349753694581	0.280403542891421	2.30372514365399	1.12787356321839	0.513202500118187	1.1532022429206	1	39	32
TCGA-17-Z048-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	66	0	17	1	18	48	1968	1	4	1	6	447	0	5	1	6	510	6	0	11	17	527	4	5	10	19	484	1	1	0	2	71	0.0303030303030303	0.105263157894737	0.146694214876033	0.7175685693106	0.028169014084507	2	0	1	3	63	0.0454545454545455	0.176470588235294	0.119544592030361	1.47619047619048	0.0476190476190476	0.0606060606060606	4	27	134	877	0.60489706059508	0.96962197299314	0.306085967016147	Inf	0.973519499277805	2.2634328358209	0.139583397272246	2.80093696810304	0.359275053304904	0.948964219124019	0.327475354979026	0.523809523809524	62	44
TCGA-17-Z049-01A-01W-0746-08	0	0	0	0	545	11	3	12	15	519	21279	20	22	4	46	5026	29	29	5	63	4991	23	134	45	202	5725	35	112	61	208	5537	10	12	10	32	684	0.0587155963302752	0.153846153846154	0.12353259888026	1.24538911381017	0.0467836257309941	6	18	12	36	720	0.0660550458715596	0.178217821782178	0.125764192139738	1.41707920792079	0.05	0.0697247706422018	38	126	1404	9858	0.000123845829205139	2.11738389719701	1.51923880115473	Inf	1.85860954763394	2.21279104037725	0.0015909965233977	2.67448081347877	1.66481212707628	0.0112607746930536	1.83878811003714	0.339405867999411	507	481
TCGA-17-Z050-01A-01W-0747-08	0	0	0	0	259	3	8	5	13	243	9963	5	20	8	33	2440	11	17	6	34	2501	15	29	47	91	2475	13	27	45	85	2547	5	2	5	12	373	0.0463320463320463	0.141176470588235	0.146446800157048	0.964011985491247	0.032171581769437	8	4	11	23	362	0.0888030888030888	0.252747252747253	0.146262626262626	1.72803715621395	0.0635359116022099	0.111969111969112	29	91	735	4287	0.00439963057254216	1.85842914295733	1.25987414939798	Inf	1.65122448979592	3.17230320699708	6.44018929367608e-05	5.05256915790299	1.18828748890861	0.269885712974996	1.22785736126279	0.627881287139009	230	214
TCGA-17-Z051-01A-01W-0747-08	0	0	0	0	157	3	4	2	6	148	6068	6	12	2	20	1424	4	7	2	13	1485	5	27	23	55	1577	10	24	26	60	1582	1	1	4	6	197	0.0382165605095541	0.1	0.124525916561315	0.803045685279188	0.0304568527918782	2	2	5	9	202	0.0573248407643312	0.163636363636364	0.128091312618897	1.27749774977498	0.0445544554455446	0.0764331210191083	12	52	399	2760	0.106703813349065	1.59601741665879	0.864600095087023	Inf	1.48449248120301	1.58345864661654	0.293741999497256	1.72895574268565	1.4541967162805	0.162155036876488	1.55613383837859	0.0604329414240249	145	136
TCGA-17-Z052-01A-01W-0747-08	0	0	0	0	187	4	3	2	5	178	7298	7	14	1	22	1878	4	11	1	16	1740	9	34	22	65	1802	12	47	16	75	1878	3	6	2	11	237	0.0588235294117647	0.146666666666667	0.126198083067093	1.162194092827	0.0464135021097046	2	2	2	6	255	0.0320855614973262	0.0923076923076923	0.141509433962264	0.652307692307692	0.0235294117647059	0.0481283422459893	9	50	492	3188	0.39277514159115	1.16627041680717	0.575081534267818	Inf	1.14096734187681	1.78087495160666	0.140816968919784	2.02445045459709	0.787334189131365	0.766070810713867	0.762365494345884	1	178	169
TCGA-17-Z053-01A-01W-0747-08	0	0	1	1	326	4	6	15	21	301	12341	12	17	3	32	3113	9	16	5	30	2980	24	39	49	112	3110	20	55	52	127	3138	5	6	11	22	428	0.0674846625766871	0.173228346456693	0.136392606755895	1.27007138126426	0.0514018691588785	10	3	6	19	425	0.0582822085889571	0.169642857142857	0.136655948553055	1.24138655462185	0.0447058823529412	0.098159509202454	32	113	853	5395	0.00426242124781363	1.79087554653178	1.24507824993159	Inf	1.61649351174354	2.49706916764361	0.000511568226199201	3.27053626620082	1.23287639432173	0.214797311134467	1.27995071055555	0.821125954087331	294	269
TCGA-17-Z054-01A-01W-0747-08	0	0	0	0	28	0	4	1	5	23	943	0	2	0	2	249	0	0	0	0	231	0	0	9	9	240	1	2	9	12	223	0	0	1	1	32	0.0357142857142857	0.0833333333333333	0.143497757847534	0.580729166666667	0.03125	0	0	0	0	34	0	0	0.141666666666667	0	0	0.0357142857142857	1	18	66	397	0.945117327885584	0.334695919603647	0.0160524773754363	Inf	0.369218500797448	0	1	0	0.38973063973064	0.936256751905667	0.354365898359667	1	27	22
TCGA-17-Z055-01A-01W-0747-08	0	0	0	0	1048	25	9	19	28	995	40795	61	42	17	120	9821	62	48	17	127	10200	73	191	98	362	10239	70	202	114	386	10535	14	21	13	48	1446	0.0458015267175573	0.124352331606218	0.137256763170384	0.905983273493432	0.033195020746888	21	18	8	47	1375	0.0448473282442748	0.129834254143646	0.134290458052544	0.96681667503767	0.0341818181818182	0.0534351145038168	56	299	2821	17953	0.132633718437993	1.19190373696033	0.921362200445226	Inf	1.16165379373012	1.80239115722987	0.000350847524178713	2.06236319687002	0.72945830797322	0.956004246681746	0.699724027177856	0.0380781089802573	992	939
TCGA-17-Z056-01A-01W-0747-08	0	1	1	2	753	14	11	9	20	719	29479	44	20	7	71	7302	57	29	16	102	7685	65	100	110	275	7217	52	112	107	271	7275	22	7	31	60	1135	0.0796812749003984	0.22140221402214	0.156013745704467	1.41911991807143	0.052863436123348	22	15	36	73	1099	0.0969455511288181	0.265454545454545	0.152279340446169	1.74320787492762	0.0664240218380346	0.147410358565737	111	223	2234	12258	1.38495765335094e-15	2.73078813564061	2.22875276378397	Inf	2.15586552946033	2.4395626257757	5.20177110336886e-09	3.30686486355499	2.00290442223038	1.14090115335142e-08	2.45065951248366	0.00611162800698447	642	608
TCGA-17-Z057-01A-01W-0747-08	0	0	0	0	508	3	13	11	24	481	19721	15	14	5	34	4833	10	16	2	28	4921	63	47	83	193	4906	73	58	95	226	5061	49	17	39	105	770	0.206692913385827	0.464601769911504	0.152143845089903	3.05370072405471	0.136363636363636	41	9	35	85	707	0.167322834645669	0.440414507772021	0.144109253974725	3.05611538207855	0.12022630834512	0.322834645669291	164	150	1477	8490	9.18196960186157e-52	6.28288391995723	5.15412929699997	Inf	3.52450525898167	4.46567963678362	4.91205017175345e-41	11.2419421653502	2.80540573436894	1.47277308621905e-17	4.08934676479632	0.120161730450795	344	317
TCGA-17-Z058-01A-01W-0747-08	0	0	1	1	110	4	8	5	13	93	3813	4	7	3	14	921	3	7	0	10	873	5	14	19	38	1037	1	13	17	31	982	0	2	1	3	108	0.0272727272727273	0.0967741935483871	0.109979633401222	0.879928315412186	0.0277777777777778	0	0	3	3	149	0.0272727272727273	0.0789473684210526	0.143683702989392	0.549452490286118	0.0201342281879195	0.0363636363636364	4	38	257	1762	0.798809322745807	0.721789535007254	0.233596469306928	Inf	0.748193440800445	0	1	0	0.872892347600519	0.689582815289341	0.85708485442259	0.0606060606060606	106	89
TCGA-17-Z059-01A-01W-0747-08	0	0	0	0	190	2	2	3	5	183	7503	5	8	0	13	1786	10	4	2	16	1865	18	34	27	79	1918	16	26	33	75	1934	6	2	8	16	270	0.0842105263157895	0.213333333333333	0.139607032057911	1.5280987654321	0.0592592592592593	8	2	9	19	266	0.1	0.240506329113924	0.138686131386861	1.73417721518987	0.0714285714285714	0.163157894736842	31	63	536	3316	3.10350290184598e-06	3.04298271281983	2.04007791395506	Inf	2.37003810733566	2.95917471466198	9.95078020248761e-05	4.3283903719817	2.03619402985075	0.00295568242917698	2.44510473266473	0.630717557816303	159	152
TCGA-17-Z060-01A-01W-0747-08	0	0	0	0	248	6	7	4	11	231	9471	10	9	2	21	2254	10	14	4	28	2303	17	47	32	96	2361	12	39	35	86	2553	2	4	6	12	351	0.0483870967741935	0.13953488372093	0.137485311398355	1.01490757304711	0.0341880341880342	2	10	2	14	304	0.0564516129032258	0.145833333333333	0.128759000423549	1.13260690789474	0.0460526315789474	0.0483870967741935	12	84	655	4259	0.639526357396953	0.928898495125915	0.515031290140129	Inf	0.937786259541985	1.03479863121874	0.553011723106607	1.04036544798239	0.895795830010254	0.68442117449238	0.881716951900454	0.323837474792719	236	219
TCGA-17-Z061-01A-01W-0747-08	0	0	0	0	215	4	5	12	17	194	7954	16	19	3	38	2030	13	13	4	30	1918	12	23	36	71	2063	9	25	21	55	1943	2	1	3	6	260	0.027906976744186	0.109090909090909	0.13381369016984	0.815244755244755	0.0230769230769231	4	3	6	13	301	0.0604651162790698	0.183098591549296	0.145904023267087	1.25492489822657	0.0431893687707641	0.0697674418604651	15	63	561	3445	0.126946803665144	1.46194151961845	0.851267558470159	Inf	1.37323460852873	2.04023427552839	0.0637915657248543	2.45558980857095	1.1274978891078	0.40651273426355	1.151334942397	0.507678201004119	200	179
TCGA-17-Z062-01A-01W-0747-08	0	0	0	0	542	14	1	25	26	502	20582	25	17	3	45	5027	33	24	5	62	5188	24	118	43	185	5206	32	121	57	210	5161	8	16	10	34	722	0.0627306273062731	0.161904761904762	0.139895369114513	1.15732752934969	0.0470914127423823	9	18	5	32	736	0.0590405904059041	0.172972972972973	0.141375336150595	1.2235017626322	0.0434782608695652	0.0590405904059041	32	124	1458	8909	0.0181020163262783	1.57679927680146	1.10259977900096	Inf	1.45854876719074	2.1585219478738	0.00138017003195038	2.66296953528885	1.06656378600823	0.437646476024762	1.07832393262349	0.839307182564795	510	470
TCGA-35-4122-01A-01D-1105-08	0	0	0	0	381	12	0	8	8	361	14801	13	34	6	53	3660	16	34	6	56	3696	30	48	47	125	3730	22	53	52	127	3715	4	14	9	27	544	0.0708661417322835	0.21259842519685	0.146433378196501	1.45184402501158	0.0496323529411765	12	10	10	32	575	0.083989501312336	0.256	0.154155495978552	1.66066086956522	0.0556521739130435	0.0918635170603675	35	116	1119	6326	0.00580965919996287	1.70557944528107	1.2046077544185	Inf	1.54214678432138	2.04715748951674	0.00324716660120456	2.51214524717647	1.27688863613797	0.156466557120132	1.34259006668239	0.687224870326472	346	326
TCGA-35-4123-01A-01D-1105-08	0	0	0	0	336	7	1	3	4	325	13325	13	12	8	33	3132	12	12	2	26	3211	20	83	34	137	3489	19	72	38	129	3493	2	10	4	16	492	0.0476190476190476	0.124031007751938	0.140853134841111	0.880569735929917	0.032520325203252	5	13	2	20	430	0.0595238095238095	0.145985401459854	0.123244482659788	1.18451875742658	0.0465116279069767	0.0386904761904762	13	98	922	6060	0.719305085108562	0.871924897061639	0.498064537349724	Inf	0.886889058255653	1.35919684075866	0.251633099371194	1.43768187901061	0.631055676066522	0.925824948590656	0.597552370043411	1	323	312
TCGA-35-5375-01A-01D-1625-08	0	0	1	1	473	10	6	13	19	444	18204	26	15	12	53	4545	26	30	13	69	4546	26	84	61	171	4532	38	63	50	151	4581	8	4	6	18	639	0.0380549682875264	0.119205298013245	0.139489194499018	0.854584460404813	0.028169014084507	9	14	11	34	673	0.0718816067653277	0.198830409356725	0.148499558693733	1.33892929450918	0.050520059435364	0.0718816067653277	34	141	1312	7801	0.04270050804888	1.43369328697167	1.01576313097146	Inf	1.34948606271777	1.84500047637195	0.00807231770331439	2.15041948495338	1.06378405844869	0.432982201927112	1.07533034025957	1	439	410
TCGA-38-4625-01A-01D-1553-08	0	0	0	0	640	15	1	12	13	612	25092	19	12	7	38	6077	29	9	6	44	6020	43	155	72	270	6398	34	142	84	260	6597	12	18	24	54	901	0.084375	0.207692307692308	0.136577232075186	1.52069495432426	0.0599334073251942	20	13	27	60	906	0.09375	0.222222222222222	0.141606752110034	1.56929114545009	0.0662251655629139	0.1296875	83	150	1807	11188	1.85103243301156e-16	3.42551952955065	2.69390047483047	Inf	2.5617709859844	2.98866601024874	3.10540914969006e-09	4.40234482182188	2.35105998041803	2.60366734018234e-09	3.00693548177769	0.0130018848565638	557	529
TCGA-38-4626-01A-01D-1553-08	0	0	0	0	352	2	2	11	13	337	13817	16	5	6	27	3318	18	10	4	32	3628	20	92	28	140	3422	18	93	27	138	3449	5	11	4	20	501	0.0568181818181818	0.144927536231884	0.145259495505944	0.997714715496543	0.0399201596806387	7	10	3	20	477	0.0568181818181818	0.142857142857143	0.139392168322618	1.02485774183887	0.0419287211740042	0.0539772727272727	19	74	978	5893	0.0659031500366172	1.54698668901386	0.961538955658878	Inf	1.43532994700618	2.21859864384889	0.00522038302757922	2.78045939233976	0.894162483733036	0.68327338334253	0.878766850664396	0.293305800181552	333	318
TCGA-38-4627-01A-01D-1553-08	0	0	0	0	36	1	0	3	3	32	1312	1	2	0	3	316	2	0	2	4	330	0	2	13	15	342	1	2	7	10	324	1	1	1	3	59	0.0833333333333333	0.3	0.182098765432099	1.64745762711864	0.0508474576271186	0	0	0	0	38	0	0	0.111111111111111	0	0	0.0555555555555556	2	19	97	569	0.831580460829144	0.617841340179401	0.10116165721541	Inf	0.653902798232695	6.8659793814433	0.146926536731634	Inf	0.343298969072165	0.95628854423484	0.309087061530111	1	34	30
TCGA-38-4628-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	161	2	2	9	11	148	6068	8	6	4	18	1427	6	6	4	16	1477	10	18	32	60	1573	12	17	25	54	1591	5	5	4	14	204	0.0869565217391304	0.259259259259259	0.128221244500314	2.02196804647785	0.0686274509803922	3	5	5	13	207	0.0807453416149068	0.216666666666667	0.131595677050223	1.64645732689211	0.0628019323671498	0.105590062111801	17	62	411	2753	0.0257363857123693	1.83617381009077	1.0983900726345	Inf	1.65659552188241	2.79938066799381	0.00497026704503385	3.82542032628535	1.21552055320784	0.322021450718158	1.2558288688485	1	144	131
TCGA-38-4629-01A-02D-1265-08	0	0	0	0	319	4	6	13	19	296	12136	11	7	6	24	2888	19	14	4	37	2976	20	51	47	118	3023	20	48	49	117	3249	5	6	12	23	465	0.0721003134796238	0.196581196581197	0.143120960295476	1.37353184449959	0.0494623655913978	6	12	8	26	419	0.0815047021943574	0.220338983050847	0.1386040357261	1.58970106387282	0.0620525059665871	0.0971786833855799	31	105	884	5388	0.00467201368103827	1.79928092027339	1.24149397538375	Inf	1.61724780409902	1.95113122171946	0.0201384672095013	2.31150140537165	1.47812971342383	0.0469297218413464	1.60380641386928	0.081418609412112	288	265
TCGA-38-4630-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	149	2	3	5	8	139	5699	2	3	3	8	1447	2	2	4	8	1382	12	10	31	53	1365	20	14	36	70	1505	12	3	10	25	220	0.167785234899329	0.357142857142857	0.146179401993355	2.44318181818182	0.113636363636364	7	4	14	25	189	0.167785234899329	0.471698113207547	0.138461538461538	3.40670859538784	0.132275132275132	0.288590604026846	43	56	409	2461	6.6769216456009e-12	4.61688159245439	3.19386932067191	Inf	3.04783779111407	4.1664119804401	6.02133790589056e-09	8.7829222341189	2.51359340218224	1.22346194997332e-05	3.35642636087452	0.419291788688819	106	96
TCGA-38-4631-01A-01D-1753-08	0	0	0	0	865	22	5	20	25	818	33538	51	29	12	92	8084	48	32	9	89	8132	60	221	62	343	8482	42	182	70	294	8840	3	17	8	28	1125	0.0323699421965318	0.0952380952380952	0.127262443438914	0.748359788359788	0.0248888888888889	10	29	7	46	1133	0.0531791907514451	0.134110787172012	0.133576986559774	1.00399620193557	0.0406001765225066	0.0323699421965318	28	206	2258	15064	0.713915476159541	0.906776423544684	0.629484839821676	Inf	0.917944175694397	0.97772625436357	0.579077134896123	0.974472730722408	0.8717489330864	0.752332132869879	0.855335235548321	0.834097357122817	837	790
TCGA-38-4632-01A-01D-1753-08	0	0	0	0	593	14	7	15	22	557	22837	27	38	4	69	5471	48	21	10	79	5692	28	109	80	217	5801	29	116	47	192	5873	7	14	5	26	817	0.0438448566610455	0.135416666666667	0.139111186786991	0.9734419624643	0.0318237454100367	8	14	12	34	766	0.0573355817875211	0.15668202764977	0.132046198931219	1.1865697681414	0.0443864229765013	0.0539629005059022	32	152	1583	10091	0.0846218443210052	1.34198302244198	0.944707932904839	Inf	1.28254003131094	1.94068557369418	0.00787349168592886	2.27643448654791	0.987151874493263	0.562342678038493	0.985166888273055	0.836697440994233	561	525
TCGA-38-6178-01A-11D-1753-08	0	1	2	3	70	1	0	3	3	66	2706	4	0	0	4	604	2	5	2	9	756	4	10	16	30	671	5	6	12	23	675	1	1	2	4	108	0.0571428571428571	0.173913043478261	0.16	1.08695652173913	0.037037037037037	0	1	4	5	86	0.0714285714285714	0.166666666666667	0.128166915052161	1.30038759689922	0.0581395348837209	0.1	7	30	194	1152	0.284850736096498	1.38520104793612	0.596116738176514	Inf	1.31262190025077	0.770904925544101	0.754121953398563	0.742415473370576	1.48674521354934	0.212598362491065	1.61882206913891	0.0497737556561086	63	59
TCGA-38-7271-01A-11D-2036-08	0	0	0	0	121	2	1	5	6	113	4633	2	1	1	4	1026	3	5	0	8	1165	17	20	12	49	1254	18	18	16	52	1188	12	4	7	23	172	0.190082644628099	0.442307692307692	0.144781144781145	3.05500894454383	0.133720930232558	13	2	5	20	163	0.165289256198347	0.408163265306122	0.129984051036683	3.1401026668336	0.122699386503067	0.305785123966942	37	26	335	2107	4.09395840779222e-16	8.93647861502888	5.63233781212489	Inf	4.28116560056859	5.20682302771855	2.4744657836791e-14	15.6925435594934	3.12409381663113	0.000178994592798567	4.71271511563136	0.00854295211900481	84	76
TCGA-38-A44F-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	23	0	0	1	1	22	902	0	1	0	1	222	0	2	1	3	202	0	2	7	9	241	1	2	6	9	237	0	1	1	2	36	0.0869565217391304	0.222222222222222	0.151898734177215	1.46296296296296	0.0555555555555556	0	1	0	1	25	0.0434782608695652	0.111111111111111	0.103734439834025	1.07111111111111	0.04	0.0434782608695652	1	13	61	417	0.852350269394079	0.526398410189581	0.0247243191177167	Inf	0.559718969555035	0	1	0	0.602774274905422	0.831061238469504	0.570206864431321	1	22	21
TCGA-44-2656-01A-02D-0969-08	0	0	0	0	1036	20	5	25	30	986	40426	42	28	14	84	9608	52	31	10	93	9670	51	233	102	386	10501	62	250	111	423	10647	9	39	16	64	1380	0.0617760617760618	0.151300236406619	0.129613975767822	1.16731421523281	0.0463768115942029	10	29	8	47	1351	0.0453667953667954	0.121761658031088	0.128654413865346	0.946424256835275	0.0347890451517395	0.0415057915057915	43	283	2731	18417	0.466385336947422	1.02466048301373	0.765418743788504	Inf	1.02140612328795	1.30203530101781	0.138378493174384	1.36305955208721	0.872527733224687	0.790376907869163	0.856368506380275	0.497255056224347	993	943
TCGA-44-2657-01A-01D-1105-08	0	0	1	1	474	9	1	8	9	456	18696	25	10	5	40	4354	18	17	1	36	4530	32	108	55	195	4808	28	103	54	185	5004	6	11	13	30	664	0.0632911392405063	0.162162162162162	0.132693844924061	1.22207749918593	0.0451807228915663	9	16	10	35	570	0.0738396624472574	0.179487179487179	0.118552412645591	1.51399010346379	0.0614035087719298	0.080168776371308	38	131	1234	8578	0.000286783397991534	2.0162876094814	1.44792534431161	Inf	1.78788372829016	1.98784440842788	0.00657822597142083	2.31682569053909	1.67781362913179	0.00887590444873523	1.85889600224597	0.17667298326983	436	418
TCGA-44-2661-01A-01D-1105-08	0	0	0	0	68	0	1	2	3	65	2665	1	2	0	3	579	3	6	2	11	642	8	3	13	24	720	5	4	18	27	724	0	0	1	1	100	0.0147058823529412	0.037037037037037	0.138121546961326	0.268148148148148	0.01	2	1	3	6	74	0.0882352941176471	0.25	0.102777777777778	2.43243243243243	0.0810810810810811	0.0882352941176471	6	38	174	1270	0.444509919630618	1.15231257977174	0.468602214436633	Inf	1.13166144200627	1.27674624226348	0.478117488940448	1.32677498439729	1.07081942899518	0.525728037758006	1.081277840118	0.592074592074592	62	59
TCGA-44-2665-01A-01D-1040-01	0	0	0	0	56	0	0	2	2	54	2214	0	5	1	6	512	1	5	0	6	506	4	2	14	20	561	2	2	18	22	635	0	0	5	5	77	0.0892857142857143	0.227272727272727	0.121259842519685	1.87426210153483	0.0649350649350649	2	0	4	6	65	0.107142857142857	0.3	0.115864527629234	2.58923076923077	0.0923076923076923	0.196428571428571	11	27	142	1054	0.00448534112066121	3.0201274983811	1.50524608003698	Inf	2.43810229799852	2.8075117370892	0.154836206206415	3.70498437735953	2.36883802816901	0.0116162586073604	2.90088956841295	0.00892219235872487	45	43
TCGA-44-3396-01A-01D-1553-08	0	0	0	0	255	4	6	9	15	236	9676	7	5	4	16	2394	3	9	3	15	2372	19	29	48	96	2460	34	24	51	109	2450	20	3	17	40	346	0.156862745098039	0.36697247706422	0.141224489795918	2.59850453412526	0.115606936416185	9	2	19	30	331	0.117647058823529	0.3125	0.134552845528455	2.32250755287009	0.0906344410876133	0.254901960784314	65	87	677	4233	1.40444145031397e-17	4.66947112799936	3.48129310720674	Inf	3.10143434657545	3.96839552966751	4.26040290730036e-12	7.55000803342204	2.63730361219283	2.46264513578975e-08	3.57164610394607	0.309262401939265	190	171
TCGA-44-3398-01A-01D-1105-08	0	0	0	0	271	5	3	5	8	258	10578	8	10	4	22	2436	13	9	2	24	2664	38	35	32	105	2675	26	35	46	107	2803	15	4	20	39	430	0.143911439114391	0.364485981308411	0.15340706386015	2.37594001304064	0.0906976744186047	23	3	13	39	379	0.143911439114391	0.371428571428571	0.141682242990654	2.62156049754994	0.102902374670185	0.261992619926199	71	71	809	4669	3.30331913396941e-22	5.76855635713374	4.28292696178818	Inf	3.38566131025958	4.02047280593325	5.27378343323743e-16	8.42955174031175	2.86479033945041	5.80154654898307e-09	4.23091340903461	0.520300239821564	200	187
TCGA-44-3918-01A-01D-1105-08	0	0	1	1	1083	32	6	25	31	1020	41820	48	26	6	80	9946	40	33	7	80	10179	66	273	106	445	10871	69	256	90	415	10824	22	32	18	72	1428	0.0664819944598338	0.173493975903614	0.131929046563193	1.31505517869799	0.0504201680672269	25	32	22	79	1473	0.0729455216989843	0.17752808988764	0.135498114248919	1.31018863894673	0.0536320434487441	0.0803324099722992	87	244	2901	18794	4.63157594473353e-10	2.30988595463242	1.85657442994177	Inf	1.96563639374276	2.6036105046791	2.57671963265967e-10	3.45985726132491	1.52621544998558	0.00422082084102465	1.66109022868392	0.445933654743957	996	933
TCGA-44-3919-01A-02D-1458-08	0	0	0	0	105	0	3	5	8	97	3977	0	4	1	5	966	2	3	2	7	1056	15	5	21	41	1015	17	6	21	44	940	10	3	6	19	179	0.180952380952381	0.431818181818182	0.190425531914894	2.26764855256475	0.106145251396648	11	1	11	23	159	0.219047619047619	0.560975609756098	0.156650246305419	3.58107071636754	0.144654088050314	0.361904761904762	38	36	338	1617	7.52329879610062e-11	5.04413019408964	3.3042112476788	Inf	2.97017431632816	3.79576553254438	2.72858135681087e-09	9.11775012521336	2.34115243730628	0.000408270307560763	3.2505333378501	0.511052816727048	67	59
TCGA-44-4112-01A-01D-1105-08	0	0	0	0	489	8	3	20	23	458	18778	34	22	6	62	4530	23	9	3	35	4394	32	103	46	181	4889	27	107	46	180	4965	11	10	6	27	623	0.0552147239263804	0.15	0.125478348439074	1.1954253611557	0.043338683788122	11	12	4	27	659	0.0552147239263804	0.149171270718232	0.134792391082021	1.10667426789292	0.0409711684370258	0.065439672801636	32	119	1282	8572	0.00376337034963512	1.79789960549822	1.25482572909152	Inf	1.62891177898772	2.86612549247733	2.43571033522564e-06	3.97513031807478	0.83548124533677	0.77264818764956	0.815434179433325	0.0196752900541744	457	426
TCGA-44-5643-01A-01D-1625-08	0	0	1	1	154	1	0	6	6	147	6027	3	7	4	14	1404	5	5	1	11	1443	10	19	28	57	1516	9	24	32	65	1664	4	3	7	14	215	0.0909090909090909	0.215384615384615	0.129206730769231	1.66697674418605	0.0651162790697674	5	4	3	12	208	0.0779220779220779	0.210526315789474	0.137203166226913	1.53441295546559	0.0576923076923077	0.123376623376623	19	60	423	2757	0.00763435381688706	2.06338870048413	1.26281675715036	Inf	1.80806176496993	3.56103023516237	0.00036259655828071	5.86059991752544	1.25295508274232	0.275012047159521	1.30342752466333	1	135	128
TCGA-44-5644-01A-21D-2036-08	0	0	1	1	1082	24	7	26	33	1025	42025	53	32	14	99	9878	51	41	13	105	10068	57	256	75	388	11067	55	256	122	433	11012	16	34	20	70	1419	0.0646950092421442	0.161662817551963	0.128859426080639	1.25456726348289	0.0493305144467935	10	19	9	38	1422	0.0351201478743068	0.0979381443298969	0.128490105719707	0.7622232372004	0.0267229254571027	0.0508317929759704	55	254	2841	19238	0.00842427361152292	1.46624874431798	1.12728229908138	Inf	1.38328725584341	1.80411198270227	0.00192299041437657	2.0471616646067	1.14403664971046	0.248042374757501	1.16887608803958	0.754958777276111	1027	970
TCGA-44-5645-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	48	0	2	1	3	45	1845	0	8	2	10	447	2	5	0	7	478	1	5	13	19	474	2	1	6	9	446	1	0	0	1	60	0.0208333333333333	0.111111111111111	0.134529147982063	0.825925925925926	0.0166666666666667	0	1	0	1	69	0.0208333333333333	0.0526315789473684	0.145569620253165	0.361556064073227	0.0144927536231884	0.0208333333333333	1	21	129	791	0.963375056770583	0.29223640503899	0.014233624830298	Inf	0.324171952078929	2.37726098191214	0.366155684024658	3.06059058986694	0	1	0	1	47	44
TCGA-44-6144-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	245	6	0	3	3	236	9676	17	12	4	33	2443	10	12	5	27	2395	17	44	32	93	2417	12	48	23	83	2421	4	9	5	18	349	0.073469387755102	0.216867469879518	0.144155307724081	1.50440156039631	0.0515759312320917	6	6	7	19	367	0.0775510204081633	0.204301075268817	0.151841125362019	1.34549236764232	0.0517711171662125	0.0897959183673469	22	62	716	4122	0.00502193567545329	2.04246897943843	1.2942367982714	Inf	1.76968608672519	2.32999422076671	0.00696369992219927	3.02902480133367	1.47425088877603	0.106578207692712	1.60641075401171	0.799650261166035	223	214
TCGA-44-6145-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	359	7	0	9	9	343	14063	20	16	3	39	3387	16	12	3	31	3523	20	93	21	134	3507	17	93	29	139	3646	2	8	1	11	499	0.0306406685236769	0.079136690647482	0.136862314865606	0.578221190582604	0.0220440881763527	4	8	6	18	500	0.0501392757660167	0.134328358208955	0.142571998859424	0.942179104477612	0.036	0.0362116991643454	13	74	999	6154	0.443653098599422	1.08220140811057	0.61241982984136	Inf	1.06990898944922	1.16110705299894	0.416194378154803	1.19224372801114	1.00242242242242	0.559405564161789	1.00281641984471	1	346	330
TCGA-44-6146-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	50	1	0	3	3	46	1886	1	3	0	4	436	1	4	0	5	416	2	2	17	21	499	0	5	11	16	535	0	1	1	2	63	0.04	0.125	0.117757009345794	1.06150793650794	0.0317460317460317	0	1	1	2	50	0.04	0.0952380952380952	0.100200400801603	0.95047619047619	0.04	0.04	2	28	113	921	0.853956001643654	0.582417162328151	0.0976100977908868	Inf	0.610029498525074	0	1	0	0.653603034134008	0.826058599975526	0.627189202355003	0.428571428571429	48	44
TCGA-44-6147-01A-11D-1753-08	0	0	1	1	236	6	1	5	6	224	9184	10	9	5	24	2277	8	12	4	24	2210	15	40	35	90	2368	13	47	26	86	2329	5	4	5	14	333	0.0593220338983051	0.162790697674419	0.142979819665092	1.13855716181298	0.042042042042042	9	6	6	21	306	0.0889830508474576	0.233333333333333	0.129222972972973	1.80566448801743	0.0686274509803922	0.105932203389831	25	64	639	4058	0.000300134733010812	2.48003649696861	1.61027268803625	Inf	2.06476059854759	3.67527386541471	4.98604328505029e-06	6.34642032656058	1.32550860719875	0.203555568525564	1.39700690418543	0.618346284001778	211	199
TCGA-44-6148-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	12	0	0	1	1	11	451	1	0	1	2	102	0	2	1	3	95	1	0	1	2	128	0	1	3	4	126	0	0	0	0	7	0	0	0.0555555555555556	0	0	0	0	0	0	12	0	0	0.09375	0	0	0	0	5	19	235	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	12	11
TCGA-44-6774-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	355	7	1	9	10	338	13858	20	7	5	32	3400	18	19	1	38	3302	21	86	29	136	3578	14	91	27	132	3578	3	11	4	18	480	0.0507042253521127	0.136363636363636	0.134153158188932	1.01647727272727	0.0375	2	7	3	12	510	0.0338028169014084	0.0882352941176471	0.142537730575741	0.619031141868512	0.0235294117647059	0.0338028169014084	12	79	990	6166	0.617017032210196	0.946067229254808	0.524315817905115	Inf	0.953180153180153	1.03261183261183	0.543259496284102	1.03804816022964	0.903535353535354	0.671885882776517	0.889739332917624	0.748049793024105	343	326
TCGA-44-6775-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	91	0	3	1	4	87	3567	2	6	0	8	853	2	8	2	12	930	1	11	22	34	904	3	10	20	33	880	0	0	6	6	138	0.0659340659340659	0.181818181818182	0.156818181818182	1.15942028985507	0.0434782608695652	0	3	6	9	137	0.0989010989010989	0.264705882352941	0.151548672566372	1.74667239158437	0.0656934306569343	0.131868131868132	12	34	275	1509	0.0455440069239289	1.93592418529942	1.01724177439015	Inf	1.69233201581028	0	1	0	1.85350649350649	0.023567478063268	2.19371845293523	1.05210552618428e-05	79	75
TCGA-44-6776-01A-11D-1855-08	0	0	1	1	233	4	3	7	10	219	8979	10	8	2	20	2174	9	11	4	24	2122	8	56	28	92	2328	13	39	31	83	2355	4	0	4	8	309	0.0343347639484979	0.0963855421686747	0.131210191082803	0.734588840800094	0.0258899676375405	1	5	2	8	290	0.0343347639484979	0.0869565217391304	0.124570446735395	0.698050974512744	0.0275862068965517	0.0472103004291846	11	69	599	4084	0.449775540505123	1.08694001191164	0.582275338923099	Inf	1.07497913188648	1.86143572621035	0.122206273363146	2.13019719349089	0.795053903398319	0.781817691739401	0.771891095374292	1	222	208
TCGA-44-6777-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	447	7	5	10	15	425	17425	18	25	4	47	4095	25	12	7	44	4452	23	72	57	152	4280	38	78	66	182	4598	18	18	25	61	720	0.136465324384787	0.335164835164835	0.156589821661592	2.14039987789988	0.0847222222222222	16	7	15	38	537	0.0850111856823266	0.25	0.125467289719626	1.99255121042831	0.0707635009310987	0.165548098434004	74	110	1257	7621	1.22646599025986e-17	4.07799979852434	3.12688893348445	Inf	2.84049323786794	3.93666940542796	5.4239298881715e-14	7.63155221986153	2.29686115476907	2.47739596230399e-07	2.92136996154408	0.462780019615398	373	351
TCGA-44-6778-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	446	9	4	14	18	419	17179	13	18	6	37	4188	23	27	5	55	4143	20	106	41	167	4603	22	87	51	160	4245	3	15	11	29	602	0.0650224215246637	0.18125	0.141813898704358	1.2780834717608	0.0481727574750831	4	8	3	15	615	0.0336322869955157	0.0898203592814371	0.133608516185097	0.672265225646268	0.024390243902439	0.047085201793722	21	113	1217	7631	0.296565321079415	1.16524067110623	0.752437237286664	Inf	1.13938115503011	1.21172281566694	0.355714424794932	1.25402743083616	1.1063556143046	0.387221480561387	1.12539641953513	0.132383221544331	425	398
TCGA-44-6779-01A-11D-1855-08	0	1	0	1	119	2	3	3	6	111	4551	4	4	2	10	1092	3	6	1	10	1061	4	22	34	60	1165	5	11	15	31	1233	0	0	5	5	164	0.0420168067226891	0.161290322580645	0.133008921330089	1.21262785208497	0.0304878048780488	1	3	3	7	134	0.0588235294117647	0.116666666666667	0.115021459227468	1.01430348258706	0.0522388059701493	0.0756302521008403	9	49	298	2100	0.295366953694145	1.29419266065339	0.635191170685457	Inf	1.24866928951632	0.894108873974646	0.697568519664525	0.880893659658665	1.31379263114642	0.263577987784949	1.37481679417258	0.00942253331538567	110	102
TCGA-44-7659-01A-11D-2063-08	0	0	0	0	169	4	1	8	9	156	6396	9	8	3	20	1503	6	10	0	16	1487	7	30	22	59	1720	7	36	18	61	1686	2	2	3	7	228	0.0414201183431953	0.114754098360656	0.135231316725979	0.848576358930112	0.0307017543859649	2	4	3	9	221	0.0532544378698225	0.152542372881356	0.128488372093023	1.18720760794539	0.0407239819004525	0.0591715976331361	10	44	449	2957	0.170429919947655	1.49655459646856	0.759842919491424	Inf	1.40476779674998	2.1673560292714	0.102958415376017	2.63341150739308	1.13786191536748	0.436784358850901	1.16211745456511	0.704251100256323	159	146
TCGA-44-7660-01A-11D-2063-08	0	0	0	0	439	7	1	13	14	418	17138	25	24	11	60	4111	24	36	7	67	4230	30	65	49	144	4346	49	55	43	147	4451	17	9	5	31	619	0.0706150341685649	0.210884353741497	0.13906987193889	1.51639137076478	0.0500807754442649	9	7	6	22	606	0.0501138952164009	0.152777777777778	0.139438564196963	1.09566373303997	0.0363036303630363	0.0842824601366743	37	134	1225	7572	0.00433554807179921	1.70663029331825	1.22185758417704	Inf	1.55383219954649	2.36344097132524	1.63494676750421e-05	3.03176378281686	0.858624667258208	0.750251503319378	0.839442872633145	0.0040267423588404	402	381
TCGA-44-7661-01A-11D-2063-08	0	0	0	0	329	4	2	10	12	313	12833	17	9	2	28	3035	16	6	1	23	3288	20	64	42	126	3175	38	56	42	136	3335	22	3	15	40	540	0.121580547112462	0.294117647058824	0.16191904047976	1.81644880174292	0.0740740740740741	10	8	10	28	448	0.0851063829787234	0.222222222222222	0.141102362204724	1.57490079365079	0.0625	0.173252279635258	57	85	988	5522	1.20460719483685e-12	3.74692921265938	2.76364485446121	Inf	2.64490790899242	3.63534831774396	3.11149976020726e-12	6.87563208252564	1.96103238866397	0.00057467882498794	2.36785203755867	0.297064705233499	272	256
TCGA-44-7662-01A-11D-2063-08	0	0	0	0	649	13	2	12	14	621	25461	25	26	7	58	6028	35	27	4	66	6229	40	140	65	245	6567	40	136	76	252	6637	10	18	19	47	895	0.0724191063174114	0.186507936507937	0.134850082868766	1.38307617274098	0.0525139664804469	15	10	15	40	878	0.061633281972265	0.163265306122449	0.13369879701538	1.22114267119148	0.0455580865603645	0.0909090909090909	59	162	1773	11431	1.71896785908142e-07	2.34786583770585	1.79393995390523	Inf	1.98818374154295	2.32727016356458	3.2744765064201e-05	2.93023960940862	1.7957942822399	0.000472578040602614	2.04855525441369	0.199961967705128	590	562
TCGA-44-7667-01A-31D-2063-08	0	0	1	1	527	15	3	11	14	498	20418	16	25	14	55	4829	23	20	6	49	4799	23	126	51	200	5360	34	102	58	194	5430	3	9	6	18	721	0.0341555977229602	0.0927835051546392	0.132780847145488	0.698771751719405	0.0249653259361997	5	16	9	30	701	0.0569259962049336	0.15	0.130783582089552	1.14693295292439	0.0427960057061341	0.0436432637571157	23	143	1422	9368	0.433671270164471	1.05960172344188	0.702085050326136	Inf	1.05133614627286	1.06496903299035	0.482923411464157	1.07559103339356	1.04420702202609	0.471687591237393	1.05126779568763	0.150494775799185	504	475
TCGA-44-7669-01A-21D-2063-08	0	0	0	0	518	15	5	16	21	482	19762	21	28	5	54	4715	27	25	8	60	4827	29	105	55	189	5036	31	99	49	179	5184	5	6	2	13	720	0.0250965250965251	0.0726256983240224	0.138888888888889	0.522905027932961	0.0180555555555556	5	15	4	24	608	0.0463320463320463	0.126984126984127	0.120730738681493	1.05179615705931	0.0394736842105263	0.0308880308880309	16	148	1328	8892	0.914684637599937	0.72388901566767	0.442503632991205	Inf	0.750808110490743	1.28263052208835	0.248964323649928	1.33911172180679	0.443987488415199	0.994774880211017	0.409970688170403	0.397540197206348	502	466
TCGA-44-7670-01A-11D-2063-08	1	2	2	5	1211	23	13	35	48	1140	46740	42	26	14	82	11021	54	29	23	106	11412	81	288	119	488	12222	71	267	126	464	12085	25	38	32	95	1661	0.0784475639966969	0.204741379310345	0.137443111294994	1.4896445327908	0.0571944611679711	32	36	31	99	1620	0.0817506193228737	0.202868852459016	0.132547864506627	1.53053278688525	0.0611111111111111	0.0990916597853014	120	277	3281	21026	1.01620698680721e-17	2.77604863023912	2.29559415195246	Inf	2.23931850966983	2.77815452605913	1.47915522662256e-13	3.84430871442392	1.90502024644055	3.06312158950411e-07	2.21820431999822	0.582968365085621	1091	1020
TCGA-44-7671-01A-11D-2063-08	0	0	0	0	259	7	1	13	14	238	9758	15	11	7	33	2298	16	6	4	26	2297	13	40	32	85	2501	14	49	31	94	2662	4	4	3	11	324	0.0424710424710425	0.117021276595745	0.121712997746056	0.961452587339112	0.0339506172839506	4	6	2	12	309	0.0463320463320463	0.141176470588235	0.123550579768093	1.14266133637921	0.0388349514563107	0.0501930501930502	13	77	633	4530	0.310580010116702	1.20817097325963	0.683484610122677	Inf	1.17814639283834	2.41671054941197	0.0134479232231162	3.01229739756479	0.647333182878207	0.898128505571168	0.616979157628847	0.513633088562186	246	225
TCGA-44-7672-01A-11D-2063-08	0	0	0	0	197	4	1	10	11	182	7462	8	9	2	19	1795	14	8	2	24	1882	11	48	23	82	1953	7	35	15	57	1832	0	1	4	5	274	0.0253807106598985	0.087719298245614	0.149563318777293	0.586502753233449	0.0182481751824818	2	5	2	9	262	0.0456852791878173	0.109756097560976	0.134152585765489	0.818143734872463	0.0343511450381679	0.0406091370558376	8	48	536	3249	0.548387995764155	1.01025900830363	0.475749385227861	Inf	1.00879530916844	0.784618573797678	0.746028772606114	0.757746397330288	1.11498428908091	0.456918979536738	1.13647307397608	0.208695652173913	189	174
TCGA-44-8117-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	841	26	6	25	31	784	32144	34	29	8	71	7686	42	38	6	86	7831	35	192	75	302	8290	44	212	69	325	8337	11	26	15	52	1136	0.0618311533888228	0.16	0.136260045579945	1.17422535211268	0.0457746478873239	5	25	8	38	1111	0.0451843043995244	0.125827814569536	0.134016887816647	0.938895214024714	0.0342034203420342	0.0463733650416171	39	184	2247	14380	0.0558624927965458	1.3564163952776	0.989722242624944	Inf	1.2941081382052	1.49866206982024	0.0624509390359433	1.62524257422268	1.18188757849973	0.226705064566894	1.21643738889517	0.277599280856889	802	745
TCGA-44-8119-01A-11D-2238-08	0	0	1	1	705	20	7	16	23	662	27142	36	30	10	76	6499	35	29	12	76	6624	35	135	79	249	6921	36	150	75	261	7098	3	21	10	34	946	0.0482269503546099	0.130268199233716	0.133276979430826	0.977424606935433	0.0359408033826638	7	17	9	33	922	0.0468085106382979	0.132530120481928	0.133217743100708	0.994838355591564	0.0357917570498915	0.0411347517730496	29	196	1868	12151	0.605650513966213	0.962446311687588	0.671204540053987	Inf	0.967287651677373	1.05701661790874	0.477773247160262	1.06637640845029	0.925919102310965	0.675534334635991	0.915481703276765	0.0922461721297609	676	633
TCGA-44-8120-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	700	14	8	24	32	654	26814	30	22	6	58	6380	32	14	13	59	6317	43	161	72	276	6862	37	159	65	261	7255	6	16	11	33	886	0.0471428571428571	0.126436781609195	0.122122674017919	1.03532601645001	0.0372460496613995	6	8	13	27	904	0.0385714285714286	0.0978260869565217	0.131740017487613	0.742569257406695	0.0298672566371681	0.0514285714285714	36	181	1790	12327	0.0572817783561191	1.36967209245823	0.986870485513349	Inf	1.30837473933527	1.18298882681564	0.313527721947318	1.21526042346987	1.38159279044163	0.0636323027920861	1.46258893286417	0.0276921114099865	664	618
TCGA-44-A479-01A-31D-A24D-08	0	0	0	0	342	9	4	10	14	319	13079	12	13	2	27	3157	13	8	2	23	3193	16	90	27	133	3270	17	80	39	136	3459	4	10	6	20	504	0.0584795321637427	0.147058823529412	0.14570685169124	1.00927871148459	0.0396825396825397	3	7	5	15	431	0.043859649122807	0.112781954887218	0.131804281345566	0.855677476754531	0.0348027842227378	0.0526315789473684	18	81	935	5794	0.141686427233303	1.37698999681131	0.848904552867547	Inf	1.3085075352455	1.52659212445309	0.166513414607664	1.66821024005591	1.19946524064171	0.308121078581288	1.23930724733544	0.412540201773484	324	301
TCGA-44-A47A-01A-21D-A24D-08	0	0	0	0	258	3	2	7	9	246	10086	10	6	1	17	2497	9	8	2	19	2493	24	29	41	94	2511	37	28	51	116	2585	28	2	14	44	381	0.170542635658915	0.379310344827586	0.147388781431335	2.57353606661236	0.115485564304462	15	5	10	30	378	0.116279069767442	0.319148936170213	0.150537634408602	2.12006079027356	0.0793650793650794	0.25968992248062	67	86	759	4337	4.75054725073369e-17	4.45003272011263	3.32701668898561	Inf	2.94016034169487	4.73288839931748	5.20849207965242e-22	13.6383121696269	1.75150369479292	0.00401079075700987	2.0164516392565	0.00282334260054313	191	179
TCGA-44-A47B-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	58	0	3	2	5	53	2173	2	1	0	3	523	3	3	1	7	498	0	3	9	12	566	3	10	18	31	586	0	1	3	4	70	0.0689655172413793	0.129032258064516	0.119453924914676	1.08018433179724	0.0571428571428571	0	2	0	2	76	0.0344827586206897	0.166666666666667	0.134275618374558	1.24122807017544	0.0263157894736842	0.0517241379310345	3	27	146	1006	0.751162304535445	0.765758855645919	0.194898257927008	Inf	0.789041095890411	0	1	0	0.876712328767123	0.683936460435485	0.861424806572277	0.181818181818182	55	50
TCGA-44-A47F-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	110	1	1	3	4	105	4305	3	1	2	6	1065	3	7	1	11	1028	6	17	28	51	1118	5	8	24	37	1094	2	1	5	8	135	0.0727272727272727	0.216216216216216	0.123400365630713	1.75215215215215	0.0592592592592593	4	1	7	12	173	0.109090909090909	0.235294117647059	0.15474060822898	1.52057123427406	0.069364161849711	0.163636363636364	18	45	308	1904	0.00223012831943531	2.4714154814427	1.46481443025841	Inf	2.05194805194805	3.91735537190083	0.00187413178874388	7.40636086188174	1.65734265734266	0.0537911541371451	1.85387538243733	0.110969537027476	92	87
TCGA-44-A47G-01A-21D-A24D-08	0	1	1	2	97	0	1	1	2	95	3895	4	2	3	9	864	4	7	3	14	1006	7	11	17	35	944	9	11	17	37	1081	3	1	3	7	162	0.0721649484536082	0.189189189189189	0.149861239592969	1.26242909576243	0.0432098765432099	3	3	3	9	112	0.0927835051546392	0.257142857142857	0.11864406779661	2.16734693877551	0.0803571428571429	0.123711340206186	12	38	274	1751	0.0344095693029645	2.01723810734418	1.06865352630288	Inf	1.77372262773723	2.77144160583942	0.0151691531163888	3.83010825132625	1.30420781451267	0.312257110375886	1.36915940618829	1	85	83
TCGA-44-A4SS-01A-11D-A24P-08	0	0	0	0	539	10	3	14	17	512	20992	27	19	2	48	5052	26	25	13	64	5178	42	96	58	196	5330	46	93	65	204	5432	15	11	14	40	735	0.0742115027829314	0.196078431372549	0.135309278350515	1.44911297852474	0.054421768707483	13	10	13	36	711	0.0667903525046382	0.183673469387755	0.133395872420263	1.37690519245673	0.0506329113924051	0.102040816326531	55	156	1446	9316	1.04567430863731e-06	2.27120782963352	1.71868531763283	Inf	1.94001429011557	2.3681000880171	8.09681900623351e-06	3.00611467538293	1.63374152413723	0.00677980288943871	1.81185798400069	1	484	457
TCGA-44-A4SU-01A-11D-A24P-08	0	0	0	0	170	5	0	4	4	161	6601	8	9	3	20	1617	8	5	0	13	1591	8	34	29	71	1695	7	27	23	57	1698	2	2	3	7	236	0.0411764705882353	0.12280701754386	0.138987043580683	0.883586083853702	0.0296610169491525	1	5	4	10	225	0.0588235294117647	0.140845070422535	0.132743362831858	1.06103286384977	0.0444444444444444	0.0588235294117647	10	57	461	2932	0.429414218413383	1.11573069652593	0.573978973436148	Inf	1.09852041311879	1.47201735357918	0.335093450875429	1.58975809575543	0.990780911062907	0.572505809929023	0.989349561580945	0.258731924360401	160	151
TCGA-49-4486-01A-01D-1265-08	0	1	0	1	307	5	1	5	6	296	12136	2	5	4	11	2955	1	6	3	10	3069	58	18	54	130	2951	57	19	69	145	3161	44	2	32	78	485	0.254071661237785	0.537931034482759	0.153432458082885	3.5059793814433	0.160824742268041	46	1	28	75	468	0.244299674267101	0.576923076923077	0.158590308370044	3.63782051282051	0.16025641025641	0.488599348534202	150	88	953	5159	3.75420358184952e-58	9.22230310745774	7.27984270258051	Inf	4.04207853130759	5.01920708061499	1.03176048886573e-48	19.4640208443719	3.12850305837791	2.20003434428737e-17	5.15371649094467	0.000882852808436233	157	146
TCGA-49-4487-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	440	12	1	12	13	415	17015	19	22	9	50	4090	19	9	8	36	4202	41	79	44	164	4396	45	74	46	165	4327	16	8	12	36	561	0.0818181818181818	0.218181818181818	0.129651028426161	1.68283908604764	0.0641711229946524	16	7	12	35	617	0.0795454545454545	0.213414634146341	0.140354868061874	1.52053603194055	0.0567260940032415	0.127272727272727	56	120	1178	7545	5.75807435472337e-10	2.98844867142467	2.24098711274318	Inf	2.35611205432937	2.75532040904963	3.90932466025285e-08	3.79430043470262	1.97464629315224	0.000742780196205088	2.32861572288654	0.229241216611643	384	359
TCGA-49-4488-01A-01D-1753-08	0	0	0	0	328	3	2	8	10	315	12915	18	13	3	34	3192	17	13	10	40	3101	17	79	31	127	3368	9	75	30	114	3254	1	12	6	19	452	0.0579268292682927	0.166666666666667	0.138905961893055	1.19985250737463	0.0420353982300885	9	7	10	26	467	0.0792682926829268	0.204724409448819	0.138657957244656	1.47647068741675	0.0556745182012848	0.0792682926829268	26	61	919	5703	0.000100665844117592	2.64431565238249	1.72734829403671	Inf	2.15341513138969	2.77140704779443	0.00171599230558831	3.87756499430823	1.89000874079095	0.00812533230306153	2.20612009142982	0.244681181966297	302	289
TCGA-49-4490-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	82	0	1	1	2	80	3280	1	4	0	5	790	1	8	2	11	823	8	5	17	30	800	6	0	28	34	867	3	0	5	8	124	0.0975609756097561	0.235294117647059	0.143021914648212	1.64516129032258	0.0645161290322581	5	0	4	9	113	0.109756097560976	0.3	0.14125	2.12389380530973	0.079646017699115	0.207317073170732	17	42	237	1430	0.00342161169022218	2.44065179135089	1.41714838353348	Inf	2.02667524851606	4.01928872814949	0.000247738357304697	8.02829115764812	1.40675105485232	0.186996612039675	1.50802037705843	1	65	63
TCGA-49-4494-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	221	4	0	5	5	212	8692	10	6	1	17	2033	8	5	4	17	2120	12	51	30	93	2267	13	44	28	85	2272	2	4	3	9	286	0.0407239819004525	0.105882352941176	0.125880281690141	0.841135335252982	0.0314685314685315	6	4	5	15	293	0.0678733031674208	0.161290322580645	0.129245699161888	1.24793570406253	0.0511945392491468	0.0723981900452489	16	67	579	3960	0.0612002748024295	1.63307168584966	0.969204610683284	Inf	1.5112054435358	2.50860103626943	0.0104017988296852	3.2173469298967	1.08129355011613	0.465857911561636	1.094309859681	1	205	196
TCGA-49-4501-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	92	0	1	2	3	89	3649	2	5	0	7	873	2	7	2	11	898	6	3	33	42	937	2	5	22	29	941	1	1	4	6	131	0.0652173913043478	0.206896551724138	0.139213602550478	1.48618057383522	0.0458015267175573	3	0	7	10	132	0.108695652173913	0.238095238095238	0.140875133404482	1.69011544011544	0.0757575757575758	0.16304347826087	15	48	263	1615	0.0281208640128353	1.91826736660243	1.09309928010362	Inf	1.70016295491581	3.57034220532319	0.0172273250804245	6.13101997360803	1.42813688212928	0.144880270955047	1.53477504644994	0.0319523882654032	77	74
TCGA-49-4505-01A-01D-1931-08	0	0	0	0	255	2	3	11	14	239	9799	9	10	3	22	2338	11	12	1	24	2395	11	55	31	97	2521	10	51	35	96	2545	5	6	6	17	329	0.0666666666666667	0.177083333333333	0.129273084479371	1.36983915906788	0.0516717325227964	3	8	6	17	330	0.0666666666666667	0.175257731958763	0.130900436334788	1.3388628553577	0.0515151515151515	0.0784313725490196	20	67	659	4407	0.00800178281341688	1.99595222509556	1.24579302703514	Inf	1.76721957685801	2.92853529879327	0.00354078320494497	4.11394661236169	1.39771002896951	0.146056352852749	1.48595284604426	0.425114228706743	235	219
TCGA-49-4506-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	154	7	3	4	7	140	5740	7	9	5	21	1383	8	9	2	19	1411	6	21	19	46	1490	6	28	20	54	1456	0	2	4	6	197	0.038961038961039	0.111111111111111	0.135302197802198	0.821206993795826	0.0304568527918782	1	2	1	4	187	0.025974025974026	0.0869565217391304	0.125503355704698	0.692862125087189	0.0213903743315508	0.038961038961039	6	45	384	2562	0.66860088820588	0.889589061538494	0.367358517698086	Inf	0.902573529411765	0.639322916666667	0.812998365121329	0.606619980782634	0.983573717948718	0.588141747977406	0.981163404820115	0.140866873065015	148	134
TCGA-49-4507-01A-01D-1265-08	0	1	0	1	241	4	3	4	7	230	9430	10	12	6	28	2292	14	11	2	27	2348	14	35	33	82	2313	24	29	40	93	2477	9	2	9	20	351	0.0829875518672199	0.21505376344086	0.14170367379895	1.51763011978066	0.056980056980057	8	7	7	22	317	0.0912863070539419	0.268292682926829	0.137051448335495	1.95760560129261	0.0694006309148265	0.136929460580913	33	78	668	4122	1.78001077675382e-05	2.60984797075141	1.7902138144465	Inf	2.1318174461887	3.20792625275764	4.89266793687654e-06	4.99279973335888	1.57165121811172	0.0437661532985792	1.731875888608	1	208	197
TCGA-49-4510-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	57	1	0	1	1	55	2255	3	3	1	7	567	1	10	1	12	614	3	8	7	18	507	5	9	4	18	567	2	0	1	3	85	0.0526315789473684	0.166666666666667	0.149911816578483	1.11176470588235	0.0352941176470588	1	3	0	4	82	0.0701754385964912	0.222222222222222	0.161735700197239	1.3739837398374	0.0487804878048781	0.0701754385964912	4	15	167	907	0.345128469869337	1.44774774324544	0.437067927732166	Inf	1.3539237314844	2.41167664670659	0.116722716334417	3.25368225192312	0.584648884050082	0.844305356481349	0.543363364152157	0.559440559440559	53	51
TCGA-49-4512-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	63	0	1	3	4	59	2419	1	7	0	8	578	2	1	2	5	608	2	5	15	22	672	5	5	14	24	561	2	0	2	4	86	0.0634920634920635	0.166666666666667	0.153297682709447	1.08720930232558	0.0465116279069767	1	0	2	3	79	0.0476190476190476	0.136363636363636	0.117559523809524	1.15995397008055	0.0379746835443038	0.111111111111111	7	29	165	1068	0.205434894994777	1.56173995662027	0.669131641509653	Inf	1.4530303030303	3.2025974025974	0.0564783751786748	4.84482614331133	1.0307210031348	0.558164715445429	1.03561284680462	1	56	52
TCGA-49-4514-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	375	6	2	9	11	358	14678	11	7	2	20	3474	12	12	1	25	3557	37	50	56	143	3873	33	66	71	170	3774	15	11	27	53	528	0.141333333333333	0.311764705882353	0.139904610492846	2.22840909090909	0.100378787878788	23	5	19	47	522	0.125333333333333	0.328671328671329	0.134779240898528	2.4385901454867	0.0900383141762452	0.224	84	113	1050	6597	2.06164229523216e-22	4.66921286588502	3.61776380708633	Inf	3.1053807106599	3.95355102040816	2.38045235303994e-15	7.45752247026388	2.63788526434196	2.81910127685258e-10	3.56725780649851	0.315930744141591	291	274
TCGA-49-6742-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	331	4	1	6	7	320	13120	6	12	12	30	3291	3	12	13	28	3193	35	29	68	132	3311	26	29	75	130	3325	14	5	34	53	504	0.16012084592145	0.407692307692308	0.151578947368421	2.68963675213675	0.10515873015873	25	5	28	58	517	0.175226586102719	0.439393939393939	0.156146179401993	2.81399097356544	0.112185686653772	0.305135951661631	101	103	1021	5615	6.99537528577931e-29	5.39079015621451	4.20917667422197	Inf	3.21789479748805	4.15542460782582	2.0687131770393e-17	9.7460937478362	2.81796949377753	3.66900128009866e-15	4.20832310015187	0.00293748020535269	230	219
TCGA-49-6743-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	877	18	4	22	26	833	34153	48	47	5	100	8185	36	35	10	81	8524	65	110	131	306	8649	68	135	143	346	8795	36	15	55	106	1244	0.120866590649943	0.30635838150289	0.141444002274019	2.1659340557218	0.0852090032154341	35	13	49	97	1248	0.11060433295325	0.316993464052288	0.144294138050642	2.19685614630468	0.077724358974359	0.199543899657925	175	232	2492	14952	2.61561340838785e-43	4.52550792215393	3.80202402307339	Inf	3.00982800982801	3.73684210526316	8.62366534053375e-26	6.86973113825032	2.65693430656934	9.59410679294582e-22	3.67026078467174	0.00131098707683527	702	658
TCGA-49-6744-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	301	5	2	6	8	288	11808	18	9	4	31	2902	16	11	4	31	2985	21	59	32	112	2980	20	71	23	114	2941	3	9	2	14	422	0.0465116279069767	0.12280701754386	0.143488609316559	0.855865968238131	0.033175355450237	3	8	4	15	436	0.0498338870431894	0.133928571428571	0.146308724832215	0.915383355176933	0.0344036697247706	0.0398671096345515	12	84	858	5063	0.7513162587821	0.843013130284876	0.46795307601363	Inf	0.86261655011655	1.00989254647791	0.557438073715357	1.01158709494537	0.752828989192626	0.826702610067258	0.722598948684643	1	289	276
TCGA-49-6745-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	172	0	1	0	1	171	7011	1	4	2	7	1765	3	3	1	7	1785	15	8	51	74	1754	31	5	47	83	1707	23	1	23	47	273	0.273255813953488	0.566265060240964	0.159929701230228	3.54071229974844	0.172161172161172	11	4	17	32	291	0.186046511627907	0.432432432432432	0.165906499429875	2.60648277143123	0.109965635738832	0.430232558139535	74	70	564	2897	4.41253250874855e-21	5.42636858111677	4.02372890575904	Inf	3.15349192277384	4.53569226025285	1.69491611373869e-17	14.5359864898794	2.50470400926328	1.25863346521271e-08	3.54068443729165	0.425462834990857	98	97
TCGA-49-6761-01A-31D-1945-08	0	0	0	0	216	3	1	3	4	209	8569	7	9	2	18	2094	11	6	3	20	2136	16	18	47	81	2073	22	27	41	90	2266	15	3	21	39	350	0.180555555555556	0.433333333333333	0.154457193292145	2.80552380952381	0.111428571428571	8	1	15	24	318	0.111111111111111	0.296296296296296	0.153400868306802	1.93151642208246	0.0754716981132075	0.273148148148148	59	67	668	3671	3.57186423215665e-16	4.83693725694645	3.51536303066322	Inf	3.04154785666762	3.93149227860069	3.79870124816539e-10	8.41979717818974	2.65725367446924	1.21841674746911e-08	3.80296608935204	0.0317477640279764	157	150
TCGA-49-6767-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	550	7	4	8	12	531	21771	30	12	4	46	5164	27	28	11	66	5335	30	129	67	226	5627	39	110	44	193	5645	12	13	8	33	752	0.06	0.170984455958549	0.133215234720992	1.28352028442289	0.0438829787234043	5	6	12	23	747	0.0418181818181818	0.101769911504425	0.132752799004798	0.766612171399462	0.0307898259705489	0.0672727272727273	37	143	1499	9773	0.00481158523297024	1.68681291170489	1.21128798689106	Inf	1.54571195611889	1.85267473001325	0.0081013688353459	2.13125996870327	1.35489725883322	0.0976075560178317	1.43284095254837	0.688136579144288	513	494
TCGA-50-5044-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	173	2	0	4	4	167	6847	1	6	1	8	1732	2	5	2	9	1701	37	7	42	86	1696	28	2	34	64	1718	22	0	20	42	287	0.242774566473988	0.65625	0.167054714784633	3.92835365853659	0.146341463414634	26	3	24	53	281	0.30635838150289	0.616279069767442	0.165683962264151	3.71960605809815	0.188612099644128	0.531791907514451	92	49	568	2846	8.93491699745937e-36	9.3971921864965	6.86685616254821	Inf	3.9217860353611	4.4385698808234	1.57646468181125e-23	14.1307516067551	3.47979985174203	1.39322227346816e-15	6.88376164802707	0.663315621262426	81	75
TCGA-50-5045-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	359	13	1	7	8	338	13858	16	8	4	28	3340	22	7	5	34	3434	16	91	24	131	3607	19	96	30	145	3477	5	13	8	26	525	0.0724233983286908	0.179310344827586	0.150992234685073	1.18754679802956	0.0495238095238095	3	8	2	13	525	0.0362116991643454	0.099236641221374	0.145550318824508	0.681802980734278	0.0247619047619048	0.0501392757660167	18	71	1050	6034	0.104475393578469	1.45681122200807	0.893383420463879	Inf	1.36449438202247	1.54209523809524	0.137801194858987	1.70255943824578	1.24938271604938	0.274697563897412	1.30600571454236	0.788734217058067	341	320
TCGA-50-5049-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	1016	21	7	21	28	967	39647	61	35	5	101	9543	54	43	9	106	9850	62	240	75	377	10058	61	254	68	383	10196	12	34	7	53	1431	0.0521653543307087	0.138381201044386	0.140349156531973	0.985978145247075	0.037037037037037	8	24	15	47	1391	0.046259842519685	0.124668435013263	0.138297872340426	0.901448683942053	0.0337886412652768	0.0413385826771654	42	224	2822	17432	0.215554262358614	1.15818794125436	0.858364154333611	Inf	1.13323883770376	1.16702102527758	0.263862824032366	1.19942786885569	1.10418143160879	0.343617646345207	1.12308288543881	0.86235110666003	974	925
TCGA-50-5051-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	145	1	2	5	7	137	5617	5	4	5	14	1316	8	6	0	14	1363	5	27	12	44	1432	16	23	26	65	1506	2	2	3	7	177	0.0482758620689655	0.107692307692308	0.117529880478088	0.916297262059974	0.0395480225988701	2	3	0	5	185	0.0344827586206897	0.113636363636364	0.129189944134078	0.87960687960688	0.027027027027027	0.0482758620689655	7	52	362	2576	0.602588398082609	0.957935577939595	0.427352179553017	Inf	0.962917876205637	1.54590897132334	0.256684643613596	1.67400045971879	0.640738586798488	0.86276251936979	0.610029779957782	1	138	130
TCGA-50-5055-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	26	1	0	1	1	24	984	0	0	1	1	264	1	2	1	4	232	2	2	7	11	237	2	1	5	8	251	1	0	1	2	31	0.0769230769230769	0.25	0.123505976095618	2.0241935483871	0.0645161290322581	1	1	1	3	41	0.115384615384615	0.272727272727273	0.172995780590717	1.57649667405765	0.0731707317073171	0.153846153846154	4	12	72	416	0.210245083516912	1.92295940674333	0.558020711360472	Inf	1.69444444444444	3.38888888888889	0.109315829320953	5.74527020273392	1.12962962962963	0.551209001855886	1.15517438538012	1	22	20
TCGA-50-5066-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	332	3	1	7	8	321	13161	17	12	4	33	3217	19	18	6	43	3282	19	60	27	106	3287	30	71	38	139	3375	5	11	8	24	484	0.072289156626506	0.172661870503597	0.143407407407407	1.20399548130091	0.0495867768595041	6	8	5	19	463	0.0572289156626506	0.179245283018868	0.14085792515972	1.2725253677819	0.041036717062635	0.072289156626506	24	90	947	5715	0.0312715320062778	1.60915302100724	1.05673466015169	Inf	1.48102039682099	1.57925134150809	0.0809494886502772	1.74675055229176	1.40696937697994	0.127140106059574	1.50860089626484	0.810383305729776	308	297
TCGA-50-5068-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	119	0	2	5	7	112	4592	5	7	3	15	1146	5	6	5	16	1128	6	13	18	37	1152	3	19	22	44	1166	2	2	2	6	161	0.0504201680672269	0.136363636363636	0.138078902229846	0.987577639751553	0.0372670807453416	1	1	0	2	157	0.0168067226890756	0.0540540540540541	0.136284722222222	0.396625925288346	0.0127388535031847	0.0420168067226891	5	44	318	2000	0.819450919315109	0.714785010392497	0.267576097432445	Inf	0.743806956744962	2.42976939203354	0.115706199977655	3.14242924848994	0.364465408805031	0.979440983849642	0.331120012190572	1	114	107
TCGA-50-5072-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	195	4	2	8	10	181	7421	11	10	1	22	1743	12	8	4	24	1856	8	38	24	70	1863	9	28	28	65	1959	4	3	5	12	274	0.0615384615384615	0.184615384615385	0.139867279224094	1.3199326221224	0.0437956204379562	1	4	8	13	238	0.0666666666666667	0.185714285714286	0.127750939345142	1.45372148859544	0.0546218487394958	0.0923076923076923	18	51	512	3310	0.00398303252162638	2.28107572164337	1.36940411958082	Inf	1.94735054347826	2.19554227941176	0.0674427455874303	2.69271979766451	1.8662109375	0.0184943416377311	2.15440267103141	0.0377584473117958	177	163
TCGA-50-5930-01A-11D-1753-08	0	0	1	1	1232	19	9	18	27	1186	48626	82	23	16	121	11456	82	38	9	129	11750	57	318	82	457	12600	58	317	104	479	12820	6	33	11	50	1663	0.0405844155844156	0.104384133611691	0.129719188767551	0.804693080518267	0.0300661455201443	8	38	6	52	1576	0.0422077922077922	0.113785557986871	0.125079365079365	0.909706872230059	0.032994923857868	0.0251623376623377	31	270	3239	22181	0.914979516911074	0.786270457161305	0.558634734145024	Inf	0.80827621010135	0.955421023665383	0.614348432335058	0.949238473456359	0.717299578059072	0.948306131615402	0.688871481493887	0.696993885710056	1201	1155
TCGA-50-5931-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	347	9	1	11	12	326	13366	14	23	3	40	3220	20	14	3	37	3356	26	61	32	119	3350	19	72	39	130	3440	6	8	4	18	507	0.0518731988472622	0.138461538461538	0.147383720930233	0.939462903959945	0.0355029585798817	7	6	8	21	468	0.0605187319884726	0.176470588235294	0.139701492537313	1.263197586727	0.0448717948717949	0.0720461095100865	25	91	975	5815	0.0243828456171301	1.63834568140881	1.08459022472258	Inf	1.50088417329797	2.01185185185185	0.00916878888074586	2.42245853710962	1.17703141928494	0.319583181692325	1.21298679905171	1	322	301
TCGA-50-5932-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	83	3	0	4	4	76	3116	4	2	0	6	714	3	4	0	7	727	1	20	10	31	831	2	20	10	32	844	0	3	2	5	107	0.0602409638554217	0.15625	0.126777251184834	1.23247663551402	0.0467289719626168	1	0	1	2	104	0.0240963855421687	0.0645161290322581	0.125150421179302	0.515508684863524	0.0192307692307692	0.0481927710843374	4	19	211	1464	0.331035699191088	1.4603351003545	0.451878233477867	Inf	1.38058932618999	2.64612954186414	0.333325815534414	3.46511264377146	1.19075829383886	0.472247470676737	1.22426120157558	0.559440559440559	79	72
TCGA-50-5933-01A-11D-1753-08	0	0	1	1	603	12	5	14	19	572	23452	22	16	7	45	5634	44	23	9	76	5901	32	135	71	238	5978	30	107	76	213	5939	9	17	12	38	895	0.0630182421227197	0.178403755868545	0.150698770836841	1.18384347050647	0.0424581005586592	7	21	11	39	812	0.0646766169154229	0.163865546218487	0.135831381733021	1.20638945233266	0.0480295566502463	0.0646766169154229	39	170	1707	10210	0.0509660671526219	1.37212771197365	0.99821937632336	Inf	1.30272197509271	1.80161384810174	0.012543459678229	2.0803017148893	1.09230499463992	0.359284147975954	1.10945090326205	0.266111163059087	564	533
TCGA-50-5935-01A-11D-1753-08	0	1	0	1	132	0	0	1	1	131	5371	2	5	2	9	1252	2	6	1	9	1445	19	8	30	57	1384	13	6	37	56	1290	13	1	13	27	255	0.204545454545455	0.482142857142857	0.197674418604651	2.4390756302521	0.105882352941176	11	2	11	24	200	0.181818181818182	0.421052631578947	0.144508670520231	2.91368421052632	0.12	0.363636363636364	48	51	455	2219	1.93168695598171e-12	4.58651771963067	3.18987570112899	Inf	2.84941724941725	4.40769230769231	1.40090443922691e-12	14.6107308997422	2.10516647531573	0.000211512174619443	2.72065915448067	1	84	83
TCGA-50-5936-01A-11D-1625-08	0	0	0	0	150	2	3	2	5	143	5863	4	6	6	16	1457	5	4	8	17	1440	17	11	34	62	1493	8	17	23	48	1473	5	4	9	18	216	0.12	0.375	0.146639511201629	2.55729166666667	0.0833333333333333	13	0	13	26	221	0.173333333333333	0.419354838709677	0.148024112525117	2.83301707779886	0.117647058823529	0.266666666666667	40	42	437	2529	9.49993304192022e-13	5.50689208012807	3.69412335005539	Inf	3.31082212423955	4.88677345537757	2.39904111230513e-10	14.8584889730381	2.6196154000562	1.16423799847492e-05	3.63544904136431	0.520977565967919	110	103
TCGA-50-5939-01A-11D-1625-08	1	0	0	1	100	2	3	2	5	93	3813	1	8	2	11	912	3	2	4	9	931	6	5	16	27	936	9	11	26	46	1034	3	0	9	12	147	0.12	0.260869565217391	0.142166344294004	1.83496007098492	0.0816326530612245	3	2	3	8	136	0.08	0.296296296296296	0.145299145299145	2.03921568627451	0.0588235294117647	0.18	18	39	283	1687	0.00092737367022573	2.74947753869081	1.61120296349311	Inf	2.19825181327878	2.78445229681979	0.0142415229282488	3.97013056483414	1.98889449772842	0.0140701993400057	2.38309435754976	0.110969537027476	82	75
TCGA-50-5941-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	460	8	7	17	24	428	17548	25	18	7	50	4314	28	12	7	47	4268	37	98	49	184	4448	32	73	42	147	4518	8	6	6	20	619	0.0434782608695652	0.136054421768707	0.137007525453741	0.993043420922489	0.0323101777059774	8	11	12	31	645	0.0673913043478261	0.168478260869565	0.145008992805755	1.161846983485	0.048062015503876	0.0739130434782609	34	126	1264	7702	0.00949893569784401	1.64412674626762	1.1603674182086	Inf	1.5073378164557	1.64483580994313	0.0292519929566383	1.83933743568382	1.40308109611907	0.0854433378156588	1.50238860225363	0.833842033889162	426	394
TCGA-50-5942-01A-21D-1753-08	0	0	0	0	82	3	1	2	3	76	3116	5	6	5	16	794	3	7	2	12	770	5	8	17	30	784	3	10	5	18	768	1	3	1	5	122	0.0609756097560976	0.277777777777778	0.158854166666667	1.74863387978142	0.040983606557377	0	1	1	2	105	0.024390243902439	0.0666666666666667	0.133928571428571	0.497777777777778	0.019047619047619	0.0365853658536585	3	27	227	1325	0.834817042719262	0.648710314171523	0.165763049323555	Inf	0.683700440528634	0.854625550660793	0.718357580336885	0.833949072229524	0.621545855026031	0.852588419450402	0.58386741317504	1	79	73
TCGA-50-5944-01A-11D-1753-08	0	1	0	1	79	1	0	2	2	76	3116	1	5	0	6	751	2	4	4	10	757	4	9	21	34	783	5	6	15	26	825	3	1	1	5	126	0.0632911392405063	0.192307692307692	0.152727272727273	1.25915750915751	0.0396825396825397	2	2	4	8	115	0.10126582278481	0.235294117647059	0.146871008939974	1.60204603580563	0.0695652173913043	0.126582278481013	10	35	241	1367	0.132160934148899	1.62007123559877	0.806266785594007	Inf	1.48271092669433	3.70677731673582	0.00584279184486365	7.07637775404118	0.926694329183956	0.645144715710953	0.914892287629188	1	69	66
TCGA-50-5946-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	754	15	3	20	23	716	29356	24	32	4	60	6974	37	31	9	77	7507	53	137	84	274	7347	62	142	101	305	7528	27	16	39	82	1091	0.108753315649867	0.268852459016393	0.144925611052072	1.85510660996829	0.075160403299725	29	16	16	61	1019	0.0809018567639257	0.222627737226277	0.138696066421669	1.60514817016826	0.0598626104023552	0.147214854111406	111	189	2110	12765	3.35437177143348e-22	3.55264841083851	2.88255899306283	Inf	2.60841232227488	3.43292808572017	2.12374796138696e-18	5.74110977398304	2.09587549634943	5.28899185101675e-08	2.55925543454202	1	643	605
TCGA-50-6590-01A-12D-1855-08	0	0	1	1	1048	28	5	20	25	995	40795	54	31	13	98	9988	49	41	10	100	10289	90	216	99	405	10328	93	178	121	392	10190	45	28	38	111	1588	0.105916030534351	0.283163265306122	0.155839057899902	1.81702372384722	0.0698992443324937	37	26	30	93	1498	0.0887404580152672	0.22962962962963	0.145042602633617	1.58318745982297	0.0620827770360481	0.143129770992366	150	253	3086	17432	4.29968098389283e-27	3.34878618861386	2.80051736350002	Inf	2.47471571766515	2.97921514047222	1.47833008767773e-21	4.58581901465754	2.05506392505744	2.85411353991494e-09	2.52690838717323	0.181851128144666	898	845
TCGA-50-6591-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	69	2	2	3	5	62	2542	2	4	4	10	609	1	1	2	4	610	5	5	12	22	687	4	5	17	26	636	1	2	1	4	97	0.0579710144927536	0.153846153846154	0.15251572327044	1.00872323552736	0.0412371134020619	1	2	1	4	83	0.0579710144927536	0.181818181818182	0.120815138282387	1.50492880613363	0.0481927710843374	0.0579710144927536	4	34	180	1143	0.778055138157475	0.747204139300724	0.23976046494904	Inf	0.773684210526316	1.63333333333333	0.353966494573326	1.81328828850942	0.506896551724138	0.919027941392126	0.470572696964919	1	65	58
TCGA-50-6592-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	325	7	1	7	8	310	12710	11	18	3	32	3089	20	18	8	46	3177	24	45	39	108	3204	31	42	51	124	3240	10	6	14	30	455	0.0923076923076923	0.241935483870968	0.140432098765432	1.72279333569656	0.0659340659340659	12	5	13	30	423	0.0923076923076923	0.277777777777778	0.132022471910112	2.10401891252955	0.0709219858156028	0.150769230769231	49	96	878	5566	1.00756041587225e-09	3.23492723134245	2.36242800554249	Inf	2.48021365171628	2.93576309794989	1.39218161739767e-06	4.22517076765076	2.20182232346241	5.11330317995004e-05	2.71631675750703	0.457731137157172	276	261
TCGA-50-6593-01A-11D-1753-08	0	1	0	1	357	8	2	5	7	342	14022	18	18	5	41	3376	15	18	7	40	3415	26	71	35	132	3622	17	69	43	129	3609	2	7	7	16	483	0.0448179271708683	0.124031007751938	0.13383208645054	0.926765852953922	0.0331262939958592	6	4	5	15	471	0.0420168067226891	0.113636363636364	0.130038652678078	0.873866049025285	0.0318471337579618	0.0560224089635854	20	101	954	6277	0.172798113184185	1.30285075046499	0.828858216356041	Inf	1.25283711904638	1.41017015260104	0.200922982599034	1.50382004240494	1.16610224157394	0.33216926186242	1.19626044421233	0.415507786081599	337	322
TCGA-50-6594-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	572	11	4	18	22	539	22099	26	20	5	51	5401	28	17	4	49	5478	31	126	61	218	5579	36	133	52	221	5641	14	23	11	48	795	0.0839160839160839	0.217194570135747	0.140932458783904	1.54112524545377	0.060377358490566	5	10	16	31	731	0.0541958041958042	0.142201834862385	0.131027065782398	1.08528595991416	0.0424076607387141	0.0804195804195804	46	134	1526	9694	1.70241803709795e-05	2.18053948824998	1.60800924691771	Inf	1.87898645696811	2.08505310928972	0.00122548389145662	2.51424265713392	1.75680534452963	0.00235073101137202	1.99431218508266	0.220048465463237	526	493
TCGA-50-6595-01A-12D-1855-08	0	0	2	2	124	0	0	2	2	122	5002	1	5	3	9	1215	4	4	0	8	1202	17	8	23	48	1278	12	9	36	57	1307	4	1	6	11	186	0.0887096774193548	0.192982456140351	0.142310635042081	1.35606489341634	0.0591397849462366	6	0	8	14	186	0.112903225806452	0.291666666666667	0.145539906103286	2.00403225806452	0.0752688172043011	0.193548387096774	24	64	372	2213	0.0015016246141753	2.2299929997136	1.4306527679602	Inf	1.89516129032258	2.39618094178717	0.00587632740987609	3.12908074601088	1.64889739383999	0.0402772745176629	1.85020640514074	0.396103959450655	100	98
TCGA-50-6597-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	73	1	0	2	2	70	2870	0	2	2	4	686	0	4	2	6	719	6	3	29	38	709	4	4	14	22	756	1	1	4	6	114	0.0821917808219178	0.272727272727273	0.150793650793651	1.80861244019139	0.0526315789473684	3	0	7	10	114	0.136986301369863	0.263157894736842	0.160789844851904	1.63665743305632	0.087719298245614	0.205479452054795	15	38	228	1237	0.0151138866431558	2.14029140662641	1.19826753885966	Inf	1.81852035749752	2.57017543859649	0.0575008274347696	3.61244157410579	1.6437168502652	0.0652347302662363	1.8639985916679	0.0319523882654032	58	55
TCGA-50-6673-01A-11D-1945-08	0	0	1	1	66	1	3	5	8	57	2337	1	7	2	10	598	0	4	3	7	567	3	4	15	22	603	4	6	8	18	569	3	1	0	4	90	0.0606060606060606	0.222222222222222	0.15817223198594	1.40493827160494	0.0444444444444444	1	0	2	3	85	0.0454545454545455	0.136363636363636	0.140961857379768	0.967379679144385	0.0352941176470588	0.0909090909090909	6	24	175	997	0.29113685038296	1.42381324628957	0.561818822461163	Inf	1.33942857142857	3.8269387755102	0.0123758150906644	7.57606155574319	0.582360248447205	0.877250345097813	0.542812047529402	0.592074592074592	60	51
TCGA-50-7109-01A-11D-2036-08	0	0	0	0	278	6	3	7	10	262	10742	11	11	6	28	2472	12	9	3	24	2545	19	56	27	102	2800	14	51	43	108	2925	6	7	4	17	371	0.0611510791366906	0.157407407407407	0.126837606837607	1.24101527403414	0.045822102425876	1	3	2	6	354	0.0215827338129496	0.0588235294117647	0.126428571428571	0.465270854104354	0.0169491525423729	0.0467625899280576	13	90	725	5000	0.550382280529006	0.996169200509012	0.566986637706721	Inf	0.996652159357215	1.67502612330199	0.116964642235445	1.8564770184379	0.676847290640394	0.891392536650393	0.646593828766958	1	265	249
TCGA-50-8457-01A-11D-2323-08	0	0	1	1	64	2	2	2	4	58	2378	5	3	0	8	594	1	6	0	7	529	4	7	14	25	586	4	10	4	18	669	1	1	0	2	59	0.03125	0.111111111111111	0.0881913303437967	1.25988700564972	0.0338983050847458	1	1	1	3	92	0.046875	0.12	0.156996587030717	0.764347826086957	0.0326086956521739	0.046875	3	23	151	1104	0.622232080977044	0.953672582771009	0.240572975729735	Inf	0.958991339786042	2.07781456953642	0.251408067564328	2.43470524028816	0.461736571008094	0.900266252312745	0.430281620409172	1	61	55
TCGA-50-8459-01A-11D-2323-08	0	0	0	0	100	4	2	3	5	91	3731	3	5	2	10	829	4	7	2	13	902	5	17	8	30	970	6	20	12	38	1030	1	0	2	3	135	0.03	0.0789473684210526	0.131067961165049	0.60233918128655	0.0222222222222222	1	3	1	5	119	0.05	0.166666666666667	0.122680412371134	1.35854341736695	0.0420168067226891	0.05	5	26	254	1746	0.360789763633033	1.32172326244738	0.479962034041344	Inf	1.27000254000508	1.43163922691482	0.417841695227029	1.52717756939042	1.18110236220472	0.477509699737153	1.21293263492285	1	95	86
TCGA-50-8460-01A-11D-2323-08	0	0	0	0	33	0	3	0	3	30	1230	1	3	2	6	301	0	0	2	2	292	2	3	7	12	325	0	3	7	10	312	0	1	2	3	32	0.0909090909090909	0.3	0.102564102564103	2.925	0.09375	1	2	2	5	46	0.151515151515152	0.416666666666667	0.141538461538462	2.94384057971015	0.108695652173913	0.151515151515152	5	11	78	559	0.0412362488662526	3.24902277883369	1.06179276228908	Inf	2.55208333333333	4.08333333333333	0.232146624084458	7.12727608892941	2.33333333333333	0.0871063649032281	2.86010953685635	0.282051282051282	28	25
TCGA-53-7624-01A-11D-2063-08	0	1	0	1	883	18	6	19	25	840	34440	41	34	9	84	8245	46	25	5	76	8251	66	157	116	339	8798	69	161	111	341	9146	27	24	31	82	1161	0.0928652321630804	0.240469208211144	0.126940739120927	1.8943422724368	0.0706287683031869	28	13	34	75	1180	0.0849377123442809	0.221238938053097	0.134121391225278	1.64954252287386	0.0635593220338983	0.135900339750849	120	242	2341	15603	2.48009656933991e-22	3.30473008637544	2.71897360615622	Inf	2.54091725451417	3.12281867514674	1.66617069546521e-15	4.581873842877	2.1948525329926	6.43503995736898e-10	2.67406850762527	0.295901300025469	763	720
TCGA-53-7626-01A-12D-2063-08	0	0	0	0	397	12	2	7	9	376	15416	22	18	4	44	3743	20	12	1	33	4107	22	82	39	143	3708	32	95	29	156	3858	12	15	10	37	596	0.0931989924433249	0.237179487179487	0.154484188698808	1.53529943211151	0.0620805369127517	8	10	5	23	522	0.0579345088161209	0.160839160839161	0.140776699029126	1.14251265975404	0.0440613026819923	0.0881612090680101	35	87	1118	6448	7.05783938153703e-05	2.3199052948991	1.61832196316271	Inf	1.94147922226458	2.50645994832041	5.15489149776414e-05	3.39184173572939	1.49281805745554	0.0706763990384176	1.63216507297262	0.422020556286897	362	341
TCGA-53-7813-01A-11D-2167-08	0	0	0	0	175	5	3	7	10	160	6560	13	8	1	22	1502	6	5	2	13	1601	4	40	20	64	1703	8	29	24	61	1754	1	2	2	5	224	0.0285714285714286	0.0819672131147541	0.127708095781072	0.641832552693208	0.0223214285714286	0	8	1	9	226	0.0514285714285714	0.140625	0.13270698766882	1.05966537610619	0.0398230088495575	0.0228571428571429	4	52	450	3007	0.943700381965012	0.514094746860352	0.168931228266781	Inf	0.548730158730159	0.640185185185185	0.812525790847188	0.607547985281096	0.523787878787879	0.937172726746456	0.48902112724523	0.595555555555556	171	156
TCGA-53-A4EZ-01A-12D-A24P-08	0	0	0	0	582	12	6	11	17	553	22673	25	22	5	52	5432	23	19	7	49	5370	36	131	61	228	5878	32	128	64	224	5993	8	17	10	35	797	0.0601374570446735	0.15625	0.132988486567662	1.17491373902133	0.0439146800501882	5	18	7	30	768	0.0515463917525773	0.131578947368421	0.130656685947601	1.0070586622807	0.0390625	0.0515463917525773	30	163	1565	10306	0.194718214966382	1.21198848606459	0.845906189630158	Inf	1.17906272244202	1.45013155421913	0.107047026514643	1.55645248863603	1.03160127795527	0.485540205946736	1.03657863291307	0.532770225609306	552	523
TCGA-55-1592-01A-01D-0969-08	0	0	0	0	652	10	5	14	19	623	25543	35	44	13	92	6173	32	36	7	75	6336	58	83	79	220	6394	44	94	98	236	6640	12	14	20	46	915	0.0705521472392638	0.194915254237288	0.137801204819277	1.41446698156895	0.0502732240437158	16	10	14	40	875	0.0613496932515337	0.181818181818182	0.136847044103847	1.32862337662338	0.0457142857142857	0.0950920245398773	62	217	1790	11244	9.54242236724462e-05	1.79463476216411	1.39070907224652	Inf	1.61812538795779	1.99886077335962	0.000217624204811559	2.3765993976038	1.39871855569233	0.0271765135431069	1.49346194409921	0.427296518728577	590	561
TCGA-55-1595-01A-01D-0969-08	0	0	0	0	369	6	4	7	11	352	14432	17	15	4	36	3520	23	19	5	47	3494	27	70	37	134	3652	18	85	32	135	3766	3	11	8	22	556	0.0596205962059621	0.162962962962963	0.147636749867233	1.10381028510525	0.039568345323741	2	7	3	12	521	0.032520325203252	0.0895522388059701	0.142661555312158	0.627725098117856	0.0230326295585413	0.043360433604336	16	98	1077	6341	0.598878734436659	0.961249011263996	0.580652171900586	Inf	0.966687843098927	0.765294542453317	0.801484552389675	0.735984128877998	1.09803130004172	0.420279938255346	1.11664418846775	0.151661012836382	353	336
TCGA-55-5899-01A-11D-1625-08	0	0	0	0	496	12	2	10	12	472	19352	22	13	3	38	4636	23	17	2	42	4757	32	94	75	201	4919	40	88	63	191	5040	21	8	21	50	687	0.100806451612903	0.261780104712042	0.136309523809524	1.92048286426301	0.0727802037845706	13	11	23	47	691	0.094758064516129	0.233830845771144	0.140475706444399	1.66456429862266	0.0680173661360347	0.157258064516129	78	132	1378	8581	9.02261682223961e-17	3.67908628419193	2.85931549156794	Inf	2.68436657681941	3.41281648121271	1.33959779062079e-11	5.57015835829719	2.30430575713595	6.25648936879779e-08	2.91440043430758	0.187398439848728	418	394
TCGA-55-6543-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	25	0	0	2	2	23	943	1	3	0	4	208	3	0	0	3	217	1	0	8	9	270	2	2	3	7	248	1	0	0	1	34	0.04	0.142857142857143	0.137096774193548	1.04201680672269	0.0294117647058824	1	0	0	1	31	0.04	0.111111111111111	0.114814814814815	0.967741935483871	0.032258064516129	0.08	2	12	65	453	0.544432293275307	1.16117344967168	0.18216939965017	Inf	1.13846153846154	5.31282051282051	0.0448780818772942	13.8081676807066	0	1	0	0.333333333333333	23	21
TCGA-55-6642-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	143	5	1	6	7	131	5371	9	6	2	17	1226	4	2	1	7	1263	4	32	14	50	1404	7	32	18	57	1478	2	3	2	7	164	0.048951048951049	0.12280701754386	0.110960757780785	1.10676080445015	0.0426829268292683	1	4	2	7	164	0.048951048951049	0.14	0.116809116809117	1.19853658536585	0.0426829268292683	0.048951048951049	7	36	328	2554	0.21571808939257	1.5138008690567	0.662690722681386	Inf	1.43037436188315	2.39634146341463	0.122273647575012	2.918395488552	1.09832317073171	0.503380999936763	1.11229696951377	1	136	124
TCGA-55-6712-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	197	2	1	7	8	187	7667	3	11	3	17	1865	2	3	2	7	1979	25	15	41	81	1893	39	11	32	82	1930	29	1	21	51	282	0.258883248730964	0.621951219512195	0.146113989637306	4.25661650233524	0.180851063829787	17	3	11	31	280	0.157360406091371	0.382716049382716	0.147913365029054	2.58743386243386	0.110714285714286	0.395939086294416	78	59	562	3261	9.80829950210108e-29	7.66443402467607	5.63326655268694	Inf	3.8729511390498	4.88929048042705	4.37808662617464e-24	14.8109722638817	2.9819139082533	3.4813140394474e-09	4.52635270085109	0.0417573866207119	119	109
TCGA-55-6968-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	633	7	1	14	15	611	25051	15	9	1	25	6030	15	15	1	31	6104	111	53	116	280	6501	104	51	120	275	6416	83	11	68	162	984	0.255924170616114	0.589090909090909	0.153366583541147	3.84106430155211	0.164634146341463	71	10	70	151	976	0.238546603475513	0.539285714285714	0.150130749115521	3.59210699648712	0.154713114754098	0.46129541864139	292	159	1960	10957	2.67725875187347e-119	10.2635334869271	8.64826896708751	Inf	4.2668944296122	4.72049833887043	8.08356272935891e-75	14.1082114267004	3.8536535800761	4.61709351819916e-51	7.86999436573845	0.229433463165644	341	319
TCGA-55-6969-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	517	8	6	11	17	492	20172	25	26	15	66	4728	37	30	12	79	4973	43	94	46	183	5163	29	82	53	164	5308	4	8	8	20	713	0.0386847195357834	0.121951219512195	0.134325546345139	0.907878082988404	0.0280504908835905	7	11	5	23	619	0.0444874274661509	0.12568306010929	0.119891535928724	1.04830636404566	0.037156704361874	0.04642166344294	24	147	1332	9139	0.337646441171865	1.12013644534993	0.748797990578763	Inf	1.10331384015595	1.20100308641975	0.306882699616279	1.23722181010841	1.03226711560045	0.496871873357991	1.03714774325147	0.810383305729776	493	468
TCGA-55-6970-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	196	4	2	4	6	186	7626	3	5	0	8	1859	9	10	1	20	1826	12	44	28	84	1962	7	39	28	74	1979	2	6	4	12	283	0.0612244897959184	0.162162162162162	0.14300151591713	1.1339891127877	0.0424028268551237	2	5	5	12	275	0.0612244897959184	0.142857142857143	0.140163098878695	1.01922077922078	0.0436363636363636	0.0663265306122449	13	62	558	3383	0.26214368334535	1.27113294156571	0.71208819526633	Inf	1.2242054958184	1.48688926617619	0.279073117856811	1.61648753371846	1.13508064516129	0.398521614727317	1.1608765894092	0.193019439588996	183	173
TCGA-55-6971-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	101	0	0	4	4	97	3977	3	5	1	9	979	8	8	0	16	1003	4	13	14	31	997	7	16	18	41	998	2	3	4	9	129	0.0891089108910891	0.219512195121951	0.129258517034068	1.69824163357913	0.0697674418604651	0	1	3	4	135	0.0396039603960396	0.129032258064516	0.135406218655968	0.952927120669056	0.0296296296296296	0.0891089108910891	9	34	264	1731	0.111077166100934	1.73505918745855	0.832766802850693	Inf	1.58165961945032	1.37396694214876	0.439544423841502	1.45675314620717	1.65305397727273	0.124821230479479	1.83521245722086	0.0968421052631578	92	88
TCGA-55-6972-01A-11D-1945-08	0	2	0	2	313	3	2	8	10	300	12300	6	7	1	14	3003	9	10	1	20	2950	30	37	70	137	3182	24	30	75	129	3165	13	4	31	48	433	0.153354632587859	0.372093023255814	0.136808846761453	2.71980235243568	0.110854503464203	18	2	37	57	458	0.182108626198083	0.416058394160584	0.143934632306725	2.89060657253052	0.124454148471616	0.31629392971246	99	100	891	5456	1.33868155203422e-31	6.05958124293777	4.71349495178217	Inf	3.54383026242323	4.0893918609968	2.01681111509724e-13	8.24834780165435	3.34065559812686	1.06910375290489e-20	5.40557443606383	5.00000588266382e-07	214	201
TCGA-55-6975-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	93	1	1	4	5	87	3567	7	8	3	18	843	1	5	3	9	899	6	13	16	35	917	7	6	12	25	908	4	0	3	7	119	0.0752688172043011	0.28	0.131057268722467	2.13647058823529	0.0588235294117647	0	1	2	3	120	0.032258064516129	0.0857142857142857	0.130861504907306	0.655	0.025	0.0967741935483871	9	32	239	1586	0.0838255531554788	1.86553330550293	0.890710071264921	Inf	1.67619144810695	2.34953331187641	0.0809502367569303	2.94685218923181	1.36356843992827	0.304805620532183	1.44227633845562	1	84	78
TCGA-55-6978-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	41	0	0	2	2	39	1599	2	3	2	7	374	0	6	3	9	382	2	0	6	8	423	3	1	11	15	420	0	0	0	0	51	0	0	0.121428571428571	0	0	0	0	1	1	49	0.024390243902439	0.125	0.115839243498818	1.07908163265306	0.0204081632653061	0.024390243902439	1	21	100	743	0.937181026716828	0.354099615532554	0.0172028381523032	Inf	0.383181818181818	0	1	0	0.495882352941176	0.882950171960126	0.464687640646038	1	40	38
TCGA-55-6979-01A-11D-1945-08	0	0	1	1	175	2	0	6	6	166	6806	4	4	6	14	1629	6	5	1	12	1691	25	21	17	63	1636	32	26	19	77	1850	17	1	6	24	268	0.137142857142857	0.311688311688312	0.144864864864865	2.15157976352006	0.0895522388059701	12	4	6	22	240	0.125714285714286	0.349206349206349	0.146699266503667	2.38042328042328	0.0916666666666667	0.234285714285714	41	52	508	2978	1.81447636760486e-11	4.61933911842321	3.16820402374903	Inf	3.0252730505461	3.49129714048902	1.98470896497553e-10	6.06667435357313	2.28740157480315	0.00398951920237059	2.92985870907156	0.000698236607206822	134	125
TCGA-55-6980-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	22	0	1	1	2	20	820	0	3	0	3	177	1	0	2	3	200	3	0	3	6	190	0	0	8	8	253	0	0	0	0	35	0	0	0.138339920948617	0	0	0	0	0	0	25	0	0	0.131578947368421	0	0	0	0	14	60	383	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	22	20
TCGA-55-6981-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	69	1	1	2	3	65	2665	1	6	1	8	617	1	5	1	7	654	11	3	15	29	695	2	3	16	21	699	1	0	1	2	95	0.0289855072463768	0.0952380952380952	0.135908440629471	0.700751879699248	0.0210526315789474	4	0	1	5	95	0.072463768115942	0.172413793103448	0.136690647482014	1.26134301270417	0.0526315789473684	0.101449275362319	7	37	190	1204	0.397911806762292	1.19868247649645	0.522593285259794	Inf	1.16722488038278	2.82186234817814	0.0244117080726562	3.95508018789684	0.473344651952462	0.936390011345307	0.437211167823524	0.286130536130536	62	58
TCGA-55-6982-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	282	1	2	9	11	270	11070	1	4	2	7	2753	2	7	2	11	2750	49	11	67	127	2765	45	14	66	125	2802	35	2	39	76	432	0.269503546099291	0.608	0.154175588865096	3.94355555555556	0.175925925925926	34	3	36	73	479	0.25886524822695	0.574803149606299	0.173236889692586	3.31801818092154	0.152400835073069	0.51063829787234	144	83	911	4656	8.81665768381374e-54	8.8640902090581	6.95252367730497	Inf	3.87649724125592	4.48563654623164	1.85954685415161e-33	14.0955808905743	3.44597773247609	6.44592453793423e-25	6.60556764070099	0.562252729655328	138	126
TCGA-55-6983-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	132	3	1	6	7	122	5002	2	8	3	13	1167	11	5	2	18	1193	7	20	20	47	1299	3	19	22	44	1343	0	4	2	6	185	0.0454545454545455	0.136363636363636	0.137751303052867	0.98992628992629	0.0324324324324324	2	3	3	8	155	0.0606060606060606	0.170212765957447	0.119322555812163	1.42649279341112	0.0516129032258065	0.053030303030303	7	45	340	2302	0.512748836821287	1.05319395359134	0.466590840723998	Inf	1.0460407239819	1.55411764705882	0.376486167931522	1.69223607795316	0.925070028011205	0.643687932148726	0.914957479889522	0.384541062801932	125	115
TCGA-55-6984-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	25	0	0	4	4	21	861	2	0	0	2	221	1	1	0	2	207	1	1	6	8	204	1	2	6	9	229	0	0	0	0	28	0	0	0.122270742358079	0	0	0	1	0	1	28	0.04	0.125	0.137254901960784	0.910714285714286	0.0357142857142857	0	0	14	56	377	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	25	21
TCGA-55-6985-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	499	15	3	10	13	471	19311	28	19	7	54	4555	22	21	6	49	4664	33	117	41	191	5019	17	110	50	177	5073	3	15	2	20	678	0.0400801603206413	0.112994350282486	0.13364872856298	0.845457727113644	0.0294985250737463	6	13	2	21	669	0.0420841683366733	0.109947643979058	0.13329348475792	0.824853849224051	0.031390134529148	0.0260521042084168	13	128	1347	8745	0.946434608918611	0.659388501939584	0.379790684875085	Inf	0.690770664518473	1.34859688195991	0.218151506413475	1.42505738195506	0.329327687902298	0.998752615598289	0.298514645870289	0.225786226132783	486	458
TCGA-55-6986-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	27	0	1	2	3	24	984	0	1	0	1	183	0	2	0	2	280	0	1	8	9	268	1	1	10	12	253	1	0	0	1	38	0.037037037037037	0.0833333333333333	0.150197628458498	0.554824561403509	0.0263157894736842	0	0	0	0	21	0	0	0.0783582089552239	0	0	0.037037037037037	1	18	59	462	0.897556986664823	0.435522439477253	0.0208509802007455	Inf	0.464763603925067	8.83050847457627	0.114942528735632	Inf	0	1	0	1	26	23
TCGA-55-6987-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	250	3	1	1	2	245	10045	5	8	2	15	2392	5	11	3	19	2586	29	30	41	100	2491	33	35	43	111	2576	23	5	16	44	391	0.176	0.396396396396396	0.151785714285714	2.61155272919979	0.112531969309463	14	7	11	32	337	0.128	0.32	0.135287033319952	2.3653412462908	0.0949554896142433	0.256	64	82	728	4339	3.74883074790513e-17	4.64994816213347	3.4518223964928	Inf	3.0510311606202	4.15364675646934	4.32543686329351e-16	8.81456461529707	2.23719583987441	3.50230507388496e-05	2.82245414935895	0.138989766835914	186	181
TCGA-55-7227-01A-11D-2036-08	0	0	0	0	183	3	1	3	4	176	7216	9	11	2	22	1666	10	13	3	26	1774	9	39	24	72	1903	7	24	25	56	1873	1	3	6	10	237	0.0546448087431694	0.178571428571429	0.126534970635344	1.41124171187462	0.0421940928270042	2	7	2	11	269	0.0601092896174863	0.152777777777778	0.141355754072517	1.08080338703015	0.0408921933085502	0.0601092896174863	11	54	506	3270	0.252324383485914	1.31631961468006	0.697024482821592	Inf	1.2628762541806	1.39920948616601	0.365770220736907	1.49114820031696	1.21835928047108	0.334244311042432	1.26087697284272	0.158916890624208	172	165
TCGA-55-7281-01A-11D-2036-08	0	0	0	0	517	7	6	16	22	488	20008	23	17	1	41	4662	34	17	7	58	4801	24	104	57	185	5251	37	105	62	204	5294	11	7	7	25	713	0.0483558994197292	0.122549019607843	0.134680770683793	0.909922173638039	0.0350631136044881	6	12	11	29	664	0.0560928433268859	0.156756756756757	0.126452104361074	1.23965320742429	0.0436746987951807	0.0676982591876209	35	145	1377	9168	0.0107756763359049	1.6070001779259	1.14479037700194	Inf	1.48904623577826	2.13418336369156	0.001708023879313	2.57193265593553	1.15834569121766	0.290471939884757	1.18653300987596	1	482	453
TCGA-55-7283-01A-11D-2036-08	0	0	0	0	260	5	0	6	6	249	10209	10	9	2	21	2393	11	8	1	20	2553	19	26	40	85	2658	16	40	67	123	2605	9	5	12	26	412	0.1	0.211382113821138	0.158157389635317	1.33653011287394	0.0631067961165049	9	4	9	22	364	0.0846153846153846	0.258823529411765	0.136945071482318	1.88998060762767	0.0604395604395604	0.15	39	103	776	4487	8.44960480186595e-05	2.18898440135611	1.55855316366723	Inf	1.86272143168288	3.4879970544919	4.40362704454012e-07	6.11902029747919	1.33108921861451	0.104957712492389	1.41183221200629	0.677962303334474	221	210
TCGA-55-7284-01B-11D-2238-08	0	0	0	0	71	0	0	1	1	70	2870	3	6	1	10	700	2	4	1	7	639	2	4	14	20	803	0	7	26	33	728	0	2	2	4	92	0.0563380281690141	0.121212121212121	0.126373626373626	0.959156785243742	0.0434782608695652	1	0	0	1	101	0.0140845070422535	0.05	0.125778331257783	0.397524752475248	0.0099009900990099	0.0422535211267606	3	39	193	1338	0.911669955778025	0.533451489007148	0.138475222191076	Inf	0.566617320503331	3.96632124352332	0.237155937520757	6.91716398310207	0.396632124352332	0.96828645760703	0.365037904685322	1	68	67
TCGA-55-7570-01A-11D-2036-08	0	0	0	0	426	8	4	13	17	401	16441	19	15	3	37	3980	19	19	11	49	3873	45	62	57	164	4312	37	71	43	151	4276	14	13	16	43	542	0.10093896713615	0.28476821192053	0.126753975678204	2.24662153906307	0.0793357933579336	26	4	14	44	593	0.103286384976526	0.268292682926829	0.13752319109462	1.95089047011887	0.0741989881956155	0.164319248826291	70	112	1135	7453	4.07399784321855e-17	4.10343088899801	3.13261964594661	Inf	2.91019993222636	3.69098527989685	1.38142898189867e-14	6.25162141135397	2.26995594713656	1.08669247968294e-05	2.81375370662888	0.163894382236375	356	331
TCGA-55-7573-01A-11D-2036-08	0	0	1	1	60	2	1	4	5	53	2173	1	3	0	4	537	1	4	1	6	538	3	9	13	25	563	3	9	6	18	535	2	1	0	3	74	0.05	0.166666666666667	0.138317757009346	1.20495495495495	0.0405405405405405	0	4	4	8	93	0.133333333333333	0.32	0.165186500888099	1.93720430107527	0.0860215053763441	0.1	6	19	167	931	0.174485322385717	1.75941766604851	0.679715268275186	Inf	1.57796407185629	2.19161676646707	0.230518632959157	2.78406715984225	1.38417901040025	0.329502349149542	1.48602316799947	0.635117204776648	54	47
TCGA-55-7574-01A-11D-2036-08	0	0	0	0	305	4	2	4	6	295	12095	10	5	5	20	2889	3	6	4	13	2991	40	39	56	135	3068	45	38	44	127	3147	28	9	20	57	490	0.186885245901639	0.448818897637795	0.155703844931681	2.88251647115539	0.116326530612245	23	5	19	47	452	0.154098360655738	0.348148148148148	0.147327249022164	2.36309406751885	0.103982300884956	0.295081967213115	90	95	942	5273	1.01106628550894e-25	5.30103603536601	4.08587990754704	Inf	3.20967464279566	3.95859872611465	1.05140166364905e-20	8.39184090962828	2.57308917197452	8.68658133585524e-09	3.577817271663	0.123480846286912	215	205
TCGA-55-7576-01A-11D-2063-08	0	0	0	0	453	13	3	11	14	426	17466	23	20	7	50	4144	15	19	6	40	4154	21	79	41	141	4481	27	97	71	195	4687	4	7	11	22	565	0.0485651214128035	0.112820512820513	0.12054619159377	0.935911050601316	0.0389380530973451	6	8	6	20	616	0.0441501103752759	0.141843971631206	0.13746931488507	1.03182278714194	0.0324675324675325	0.0596026490066225	27	133	1181	7987	0.0882143460056972	1.37286686508979	0.934731075536822	Inf	1.30999153259949	1.61727349703641	0.0833220947332393	1.77957439259202	1.17829926212653	0.273790720868159	1.21017175853378	0.160403683161573	426	399
TCGA-55-7724-01A-11D-2167-08	0	0	0	0	289	6	5	4	9	274	11234	15	27	5	47	2712	12	22	4	38	2893	19	26	53	98	2782	20	27	44	91	2847	6	6	9	21	433	0.0726643598615917	0.230769230769231	0.152089919213207	1.51732101616628	0.0484988452655889	4	5	11	20	406	0.069204152249135	0.204081632653061	0.145938173975557	1.39841158138132	0.0492610837438424	0.103806228373702	30	106	839	4790	0.0178774776411315	1.61564207661005	1.10905005424106	Inf	1.47996564537615	1.72030194676202	0.056794149787179	1.96847325123062	1.38333558605606	0.0818812248815525	1.48278348710916	0.038228609811757	259	244
TCGA-55-7725-01A-11D-2167-08	0	0	0	0	156	2	4	7	11	143	5863	10	6	1	17	1412	4	13	1	18	1391	5	29	16	50	1532	8	36	14	58	1528	2	5	2	9	188	0.0576923076923077	0.155172413793103	0.12303664921466	1.26118855465884	0.0478723404255319	0	3	3	6	222	0.0384615384615385	0.12	0.14490861618799	0.828108108108108	0.027027027027027	0.0448717948717949	7	36	410	2650	0.354816805305801	1.25666826821731	0.550868826108421	Inf	1.21497447532615	1.14821763602251	0.536726225930571	1.17508588925787	1.24390243902439	0.376833290707524	1.29256378764382	0.389846743295019	149	136
TCGA-55-7726-01A-11D-2167-08	0	1	0	1	132	0	0	4	4	128	5248	4	6	0	10	1279	4	2	4	10	1300	15	8	19	42	1250	29	8	29	66	1419	20	3	9	32	203	0.242424242424242	0.484848484848485	0.143058491895701	3.38916256157635	0.157635467980296	10	3	9	22	174	0.166666666666667	0.523809523809524	0.1392	3.76299945265463	0.126436781609195	0.363636363636364	48	44	377	2292	5.4087710358945e-17	6.62499165273124	4.54102391309445	Inf	3.6936916157306	4.82698336146612	1.11968144802716e-15	13.0066136876512	2.65484084880637	6.27446257339314e-05	3.64527083606665	0.0326601694534836	84	80
TCGA-55-7727-01A-11D-2167-08	0	0	0	0	299	5	0	4	4	290	11890	11	12	3	26	2858	8	12	2	22	2936	22	37	56	115	3042	20	48	59	127	3054	11	6	27	44	465	0.147157190635452	0.346456692913386	0.152259332023576	2.2754381508763	0.0946236559139785	16	3	19	38	438	0.127090301003344	0.330434782608696	0.143984220907298	2.29493746277546	0.0867579908675799	0.244147157190635	73	84	903	5193	1.93940507844204e-20	4.99591615421497	3.76163305552585	Inf	3.13892121802061	4.33981964878975	5.30868331432379e-13	10.3451050266798	2.70033222591362	8.01432807211239e-11	3.83274974868165	0.00452679315311413	226	217
TCGA-55-7728-01A-11D-2184-08	0	0	0	0	119	1	1	3	4	114	4674	4	2	1	7	1084	10	1	0	11	1100	5	17	16	38	1275	3	33	22	58	1215	1	3	2	6	156	0.0504201680672269	0.103448275862069	0.128395061728395	0.805702917771883	0.0384615384615385	2	2	1	5	179	0.0420168067226891	0.131578947368421	0.140392156862745	0.937224345780653	0.0279329608938547	0.0504201680672269	6	40	335	2155	0.598639677189776	0.964935287330522	0.395864313228805	Inf	0.969500324464633	2.78731343283582	0.0816401602001775	3.85606869379872	0.586802827965436	0.900710252228804	0.551491985893259	1	113	108
TCGA-55-7815-01A-11D-2167-08	0	0	0	0	167	3	1	4	5	159	6519	7	8	2	17	1526	8	6	1	15	1547	10	23	26	59	1705	12	37	19	68	1741	1	0	0	1	228	0.00598802395209581	0.0147058823529412	0.130959218839747	0.112293601651187	0.0043859649122807	0	1	5	6	204	0.0359281437125748	0.101694915254237	0.119648093841642	0.849950149551346	0.0294117647058824	0.0359281437125748	6	61	432	3014	0.858977297404801	0.686312465255613	0.287016452237859	Inf	0.714344941956882	0.362584175084175	0.947324839679149	0.332300811717837	0.886316872427984	0.680848762695044	0.872108564887641	0.102564102564103	161	153
TCGA-55-7816-01A-11D-2167-08	0	0	0	0	12	0	1	5	6	6	246	0	1	0	1	44	0	0	0	0	48	1	0	2	3	87	0	0	2	2	67	0	0	0	0	9	0	0	0.134328358208955	0	0	0	0	0	0	5	0	0	0.0574712643678161	0	0	0	0	5	14	140	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	12	6
TCGA-55-7903-01A-11D-2167-08	0	0	0	0	188	3	1	10	11	174	7134	7	8	2	17	1709	8	5	2	15	1720	8	25	44	77	1886	11	27	27	65	1819	4	3	3	10	244	0.0531914893617021	0.153846153846154	0.134139637163277	1.1469104665826	0.040983606557377	4	5	13	22	269	0.117021276595745	0.285714285714286	0.142629904559915	2.00318640467339	0.0817843866171004	0.127659574468085	24	66	513	3192	0.00116072298262949	2.26199558642948	1.45822818542656	Inf	1.92592592592593	3.04093567251462	0.00254030535750741	4.52264614266548	1.62754303599374	0.0332995543714649	1.80975288115298	0.0696786155660074	164	150
TCGA-55-7907-01A-11D-2167-08	0	1	0	1	1281	26	7	22	29	1226	50266	46	32	13	91	11742	58	24	8	90	12128	92	296	127	515	13052	89	302	139	530	13344	37	32	37	106	1751	0.0827478532396565	0.2	0.131220023980815	1.52415762421473	0.0605368360936608	41	39	45	125	1735	0.0975800156128025	0.242718446601942	0.132929819184799	1.82591421616631	0.0720461095100865	0.124902419984387	160	287	3486	22910	5.52539600670882e-33	3.66330467399699	3.0881651789498	Inf	2.71033639190832	3.26307281216421	8.01738108922891e-23	4.97650025960971	2.33422627135826	1.01404269853452e-13	2.92866132284936	0.769311751788768	1121	1066
TCGA-55-7910-01A-11D-2167-08	0	0	0	0	355	4	4	7	11	340	13940	17	8	1	26	3359	19	9	6	34	3187	20	77	34	131	3695	22	84	43	149	3699	4	9	2	15	440	0.0422535211267606	0.100671140939597	0.118951067856177	0.846323978035387	0.0340909090909091	3	12	2	17	449	0.047887323943662	0.129770992366412	0.121515561569689	1.0679372311668	0.0378619153674833	0.0309859154929577	11	108	889	6505	0.85907814467927	0.745297889538626	0.40566004762416	Inf	0.768817763325803	1.3862017247844	0.236875138192974	1.46334953876231	0.432062875257476	0.986598096619771	0.400977401765852	0.509181400291504	344	329
TCGA-55-7911-01A-11D-2167-08	0	0	0	0	277	4	2	5	7	266	10906	9	8	8	25	2560	15	9	5	29	2590	13	56	25	94	2842	21	61	36	118	2914	5	6	8	19	387	0.0685920577617329	0.161016949152542	0.132807137954701	1.21241186002715	0.0490956072351421	5	9	2	16	355	0.0577617328519856	0.170212765957447	0.124912033779029	1.3626610728199	0.0450704225352113	0.0722021660649819	20	75	742	5014	0.0186706882656143	1.80175232097672	1.13140827539021	Inf	1.6331394524046	2.28159188203583	0.00900694090073076	2.81487728108875	1.27170695064292	0.258533891930423	1.32490964516208	1	257	246
TCGA-55-7913-01B-11D-2238-08	0	0	0	0	394	7	2	7	9	378	15498	16	8	2	26	3595	22	13	5	40	3641	24	90	40	154	4111	20	80	58	158	4151	6	12	12	30	549	0.0761421319796954	0.189873417721519	0.132257287400626	1.43563671577782	0.0546448087431694	9	11	6	26	505	0.065989847715736	0.168831168831169	0.122841157869132	1.37438601002957	0.0514851485148515	0.083756345177665	33	109	1054	7208	0.000481820688122218	2.07022506467473	1.44571956195547	Inf	1.8216719672876	2.67228739002933	0.000240742702376469	3.53621499665112	1.43976300197498	0.0717807811549354	1.5386110105855	0.678845512988649	361	345
TCGA-55-7914-01A-11D-2167-08	0	0	0	0	202	4	1	5	6	192	7872	7	5	2	14	1933	8	16	6	30	1910	14	27	31	72	1992	14	36	26	76	2037	5	4	4	13	290	0.0643564356435644	0.171052631578947	0.142366224840452	1.20149727767695	0.0448275862068966	6	4	4	14	260	0.0693069306930693	0.194444444444444	0.130522088353414	1.48974358974359	0.0538461538461538	0.0940594059405941	19	66	550	3479	0.0207426040240555	1.82063378952686	1.12206894664121	Inf	1.63745454545455	2.87785714285714	0.000738061206646413	4.09115161957882	1.02813397129187	0.525504536050888	1.03272387134919	0.569404760261442	183	173
TCGA-55-7994-01A-11D-2184-08	0	0	0	0	1723	37	11	50	61	1625	66625	70	60	14	144	15402	69	53	13	135	15891	91	391	167	649	17634	112	405	180	697	17698	23	44	25	92	2303	0.0533952408589669	0.131994261119082	0.130127698044977	1.01434408740144	0.0399478940512375	20	50	24	94	2174	0.0545560069645966	0.144838212634823	0.123284563910627	1.17482844599929	0.0432382704691812	0.0533952408589669	92	458	4477	30855	0.0037177032990581	1.38437986433448	1.13433306585278	Inf	1.32009828009828	1.6716815337505	0.000496226489398687	1.85212349029383	1.11441701067061	0.230905372133412	1.13320002540252	0.548078553886172	1631	1533
TCGA-55-7995-01A-11D-2184-08	0	0	0	0	760	9	6	23	29	722	29602	32	34	9	75	7179	29	29	11	69	7345	67	145	80	292	7488	51	154	81	286	7590	16	20	24	60	1097	0.0789473684210526	0.20979020979021	0.144532279314888	1.45151111422761	0.0546946216955333	15	15	25	55	1059	0.0723684210526316	0.188356164383562	0.141426282051282	1.33183282238348	0.0519357884796978	0.105263157894737	80	199	2156	12922	6.80668496411699e-10	2.40924101316575	1.90938937167797	Inf	2.00530652143555	1.83727712965001	0.000494172792787122	2.13549366020844	2.12845849802372	1.53759340327818e-07	2.62182864472912	0.0183221928967917	680	642
TCGA-55-8085-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	295	7	0	7	7	281	11521	9	5	2	16	2720	9	7	4	20	2776	25	33	54	112	2993	25	42	66	133	3032	20	6	27	53	413	0.179661016949153	0.398496240601504	0.136213720316623	2.92552203753937	0.128329297820823	16	2	20	38	395	0.128813559322034	0.339285714285714	0.131974607417307	2.57084086799277	0.0962025316455696	0.28135593220339	83	87	808	5217	1.76067169373357e-27	6.1568910905693	4.68852919515492	Inf	3.64061589982528	5.36881188118812	9.56804012222774e-21	16.5885869631694	2.92053424092409	3.99512863756609e-12	4.15591840355714	0.136463492687502	212	198
TCGA-55-8087-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	45	0	2	1	3	42	1722	1	1	0	2	423	0	3	0	3	387	3	4	17	24	475	0	1	12	13	437	0	0	1	1	60	0.0222222222222222	0.0769230769230769	0.137299771167048	0.56025641025641	0.0166666666666667	2	1	2	5	60	0.111111111111111	0.208333333333333	0.126315789473684	1.64930555555556	0.0833333333333333	0.111111111111111	5	27	120	792	0.420860849787018	1.22192983520273	0.440724548575561	Inf	1.1875	5.06666666666667	0.0483140439218581	13.1329427567924	0.786206896551724	0.754169733899348	0.761739446341837	1	40	37
TCGA-55-8089-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	1454	25	8	20	28	1401	57441	51	24	17	92	13408	61	41	7	109	13688	125	259	189	573	14911	128	290	209	627	15434	70	50	75	195	2074	0.134112792297111	0.311004784688995	0.134378644550991	2.31439144015909	0.0940212150433944	57	32	79	168	1939	0.115543328748281	0.293193717277487	0.13003822681242	2.2546732946491	0.0866425992779783	0.193259972489684	281	370	4013	26332	3.41092623778895e-76	4.98302817133829	4.34661222283533	Inf	3.26394861860245	3.79578129970875	1.34025360942165e-44	6.61306253328508	2.92587407508512	2.40402386148068e-36	4.14145866304387	0.0474884995006153	1173	1120
TCGA-55-8090-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	105	0	0	6	6	99	4059	6	11	2	19	961	4	6	2	12	1002	1	19	14	34	1066	5	17	12	34	1030	0	1	2	3	141	0.0285714285714286	0.0882352941176471	0.136893203883495	0.644555694618273	0.0212765957446809	1	3	0	4	118	0.0380952380952381	0.117647058823529	0.110694183864916	1.06281156530409	0.0338983050847458	0.0285714285714286	3	29	259	1837	0.774134963544266	0.73381949432686	0.18843092182815	Inf	0.758687258687259	1.34877734877735	0.547620185432091	1.41825941353107	0.622512622512623	0.848521212502204	0.591176556576843	1	102	96
TCGA-55-8091-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	39	0	0	5	5	34	1394	0	1	0	1	320	1	4	1	6	260	1	3	11	15	419	0	2	10	12	395	0	0	1	1	39	0.0256410256410256	0.0833333333333333	0.0987341772151899	0.844017094017094	0.0256410256410256	0	0	0	0	35	0	0	0.0835322195704057	0	0	0.0256410256410256	1	21	74	740	0.877006999493967	0.47650806847923	0.0230642594350795	Inf	0.5	0	1	0	0.523809523809524	0.864885481704279	0.500317585235242	1	38	33
TCGA-55-8092-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	651	9	2	15	17	625	25625	24	26	9	59	5964	29	17	6	52	6115	32	97	127	256	6684	35	124	99	258	6862	16	13	31	60	862	0.0921658986175115	0.232558139534884	0.125619352958321	1.85129228942967	0.0696055684454756	13	12	43	68	842	0.104454685099846	0.265625	0.125972471573908	2.10859560570071	0.0807600950118765	0.158218125960061	103	190	1704	11842	1.34017840320693e-22	3.76703685515549	3.03814834323562	Inf	2.79454485731225	3.44084156681382	5.23551522060905e-10	5.30256636821756	2.60294362042461	5.87871888162385e-15	3.3829693360724	1.37504938366132e-08	548	522
TCGA-55-8094-01A-11D-2238-08	0	1	0	1	520	7	4	15	19	494	20254	25	21	10	56	4760	28	23	10	61	4996	24	118	52	194	5188	24	114	45	183	5310	3	19	8	30	698	0.0576923076923077	0.163934426229508	0.131450094161959	1.24712292733336	0.0429799426934097	4	16	9	29	712	0.0557692307692308	0.149484536082474	0.137239784117194	1.08922159156724	0.0407303370786517	0.0461538461538462	24	121	1410	9088	0.165193902874687	1.27839105340692	0.849906125562945	Inf	1.23234042553191	1.08578605200946	0.470674883067391	1.10045601843223	1.30486217737808	0.152290754372493	1.3695969796375	0.0381070181124884	496	470
TCGA-55-8096-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	174	5	0	7	7	162	6642	5	7	3	15	1613	11	6	1	18	1630	15	38	27	80	1708	10	22	17	49	1691	4	1	1	6	240	0.0344827586206897	0.122448979591837	0.141927853341218	0.862755102040816	0.025	3	6	4	13	257	0.0747126436781609	0.1625	0.150468384074941	1.07996108949416	0.0505836575875486	0.0689655172413793	12	57	497	2902	0.307963253009091	1.22917479244557	0.66986546168574	Inf	1.18939725308372	1.91492957746479	0.0632113581739384	2.2700291562123	0.777162977867203	0.790222922701936	0.748651729149462	0.728106304302077	162	150
TCGA-55-8097-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	146	0	1	8	9	137	5617	4	7	2	13	1305	4	8	3	15	1356	7	18	31	56	1423	4	24	25	53	1533	3	1	5	9	191	0.0616438356164384	0.169811320754717	0.124592302674494	1.36293588857058	0.0471204188481675	2	2	2	6	180	0.0410958904109589	0.107142857142857	0.126493323963457	0.84702380952381	0.0333333333333333	0.0821917808219178	12	55	371	2585	0.133085561881119	1.51996621537149	0.825248475921656	Inf	1.42704268415336	3.62166135751041	0.00765604919859069	5.8005564937846	0.995956873315364	0.566099206567258	0.995380758657933	0.710381651279623	134	125
TCGA-55-8203-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	481	8	2	8	10	463	18983	32	10	8	50	4510	28	15	0	43	4527	21	121	48	190	4945	28	111	41	180	5001	3	12	2	17	666	0.0353430353430353	0.0944444444444444	0.133173365326935	0.709184184184184	0.0255255255255255	2	10	3	15	598	0.0311850311850312	0.0789473684210526	0.12093023255814	0.652834008097166	0.0250836120401338	0.0207900207900208	10	128	1264	8682	0.985298558888908	0.536642265211309	0.284330029142602	Inf	0.570193542469272	0.802925600619995	0.762744458510412	0.780548646231807	0.442060162139098	0.991222972677527	0.408874997706573	1	471	453
TCGA-55-8204-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	257	3	1	8	9	245	10045	3	12	5	20	2366	8	12	1	21	2446	33	26	48	107	2589	22	32	43	97	2644	11	1	18	30	369	0.116731517509728	0.309278350515464	0.139561270801815	2.21607576900511	0.0813008130081301	19	4	12	35	336	0.136186770428016	0.327102803738318	0.129779837775203	2.52044392523365	0.104166666666667	0.233463035019455	60	86	705	4528	6.37432765994226e-16	4.47926346981423	3.31438724507033	Inf	3.05042261731274	4.04874274661509	1.1097302593131e-12	7.70195567199788	2.44704231938274	2.10894720435854e-06	3.15773431599391	1	197	185
TCGA-55-8205-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	594	13	1	23	24	557	22837	29	19	9	57	5540	20	23	7	50	5539	57	86	81	224	5954	69	92	65	226	5804	38	17	24	79	843	0.132996632996633	0.349557522123894	0.145244658855961	2.40668073357898	0.0937129300118624	32	17	30	79	819	0.132996632996633	0.352678571428571	0.137554585152838	2.56391723356009	0.0964590964590965	0.208754208754209	124	148	1662	10096	1.3445099127989e-34	5.08857333164234	4.11221053521837	Inf	3.22518935371983	3.93033828051879	5.41869806783999e-27	7.59087038309649	2.61663617031799	8.90846869005084e-12	3.56502354000563	0.083774798166779	470	433
TCGA-55-8206-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	37	1	0	4	4	32	1312	1	2	1	4	332	1	2	1	4	304	1	4	7	12	319	2	2	8	12	357	1	1	2	4	51	0.108108108108108	0.333333333333333	0.142857142857143	2.33333333333333	0.0784313725490196	0	1	2	3	49	0.0810810810810811	0.25	0.153605015673981	1.62755102040816	0.0612244897959184	0.135135135135135	5	13	100	576	0.121201761288442	2.21215067130349	0.742781539060051	Inf	1.87777777777778	2.25333333333333	0.383634959366669	2.87378660134677	1.80266666666667	0.176873801890925	2.09174765072607	0.265734265734266	32	27
TCGA-55-8207-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	360	8	8	6	14	338	13858	23	14	3	40	3200	21	14	1	36	3298	18	68	51	137	3639	21	69	35	125	3721	3	13	2	18	457	0.05	0.144	0.122816447191615	1.17248140043764	0.0393873085339169	6	7	4	17	445	0.0472222222222222	0.124087591240876	0.122286342401759	1.01472976297876	0.0382022471910112	0.0416666666666667	15	110	902	6458	0.57591421595196	0.976317117652284	0.581879435556867	Inf	0.979157427937916	1.88299505372676	0.0436579113378751	2.14760739645814	0.569277574382509	0.959880591100618	0.537009748876377	0.561271440912509	345	323
TCGA-55-8208-01A-11D-2238-08	0	1	0	1	528	11	1	10	11	506	20746	6	28	4	38	5170	14	22	8	44	5190	62	54	118	234	5066	61	50	79	190	5320	39	9	35	83	866	0.15719696969697	0.436842105263158	0.162781954887218	2.68360277136259	0.0958429561200924	41	13	47	101	804	0.191287878787879	0.431623931623932	0.158705092775365	2.71966024577965	0.125621890547264	0.306818181818182	162	158	1670	8716	1.84915482445359e-44	5.35013351854185	4.39895961358687	Inf	3.1484505988024	4.04498320432306	1.91231876191094e-33	9.70575186699537	2.58868658621843	3.4683859320761e-17	3.72084756950233	0.916387611002794	366	344
TCGA-55-8299-01A-11D-2284-08	0	0	1	1	364	8	4	9	13	343	14063	11	19	2	32	3325	18	17	4	39	3486	17	73	41	131	3542	19	74	48	141	3710	5	9	10	24	493	0.0659340659340659	0.170212765957447	0.13288409703504	1.28091148418281	0.0486815415821501	1	10	6	17	511	0.0467032967032967	0.129770992366412	0.144268774703557	0.8995085224302	0.0332681017612524	0.0604395604395604	22	103	1004	6248	0.142300364587944	1.32914900780856	0.863074587114119	Inf	1.27126693227092	1.20385126162019	0.381567457465907	1.24457469383627	1.29853619230941	0.165947220410742	1.36390197983076	0.023625010637441	342	321
TCGA-55-8301-01A-11D-2284-08	0	0	0	0	389	14	6	26	32	343	14063	13	23	7	43	3465	11	25	6	42	3401	21	57	40	118	3577	32	65	43	140	3620	16	5	8	29	524	0.0745501285347044	0.207142857142857	0.14475138121547	1.43102508178844	0.0553435114503817	8	10	4	22	499	0.0565552699228792	0.186440677966102	0.139502376292983	1.33646954926803	0.0440881763527054	0.0925449871465296	36	100	1023	6174	0.000153153897742793	2.17238023040483	1.53057655767309	Inf	1.86225633948594	3.18574669396337	6.13562824166072e-08	4.99303926995257	1.01713599265096	0.523008900595094	1.02003128004869	0.0220175508521949	353	307
TCGA-55-8302-01A-11D-2323-08	0	0	0	0	773	15	9	21	30	728	29848	32	22	4	58	7085	44	30	3	77	7145	33	151	90	274	7874	36	209	74	319	7744	8	26	6	40	1059	0.0517464424320828	0.125391849529781	0.136751033057851	0.916935300055355	0.0377714825306893	6	16	7	29	972	0.03751617076326	0.105839416058394	0.123444246888494	0.857386380703493	0.0298353909465021	0.0349288486416559	27	206	2031	13587	0.76600357955834	0.876855007582209	0.604585680741966	Inf	0.891093628162621	1.56025089375549	0.0593732325957439	1.70278515347452	0.609557949346111	0.984522572106118	0.575961123322573	1	746	701
TCGA-55-8505-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	46	0	0	1	1	45	1845	1	3	1	5	405	0	3	0	3	418	4	2	13	19	501	7	2	9	18	521	3	0	2	5	56	0.108695652173913	0.277777777777778	0.107485604606526	2.5843253968254	0.0892857142857143	1	0	2	3	51	0.0652173913043478	0.157894736842105	0.101796407185629	1.55108359133127	0.0588235294117647	0.173913043478261	8	25	107	915	0.0208662309001554	2.73275248479843	1.21150178197489	Inf	2.31549136222033	3.4732370433305	0.0229487612830383	4.87373797857077	1.73661852166525	0.198786113666579	1.89892951440221	1	38	37
TCGA-55-8506-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	2058	34	44	121	165	1859	76219	67	71	20	158	17102	74	69	18	161	17559	65	358	345	768	20555	66	353	353	772	21003	6	43	17	66	2555	0.032069970845481	0.0854922279792746	0.121649288196924	0.702776228668769	0.0258317025440313	9	46	16	71	2376	0.0344995140913508	0.0924479166666667	0.115592313305765	0.799775642711841	0.0298821548821549	0.0233236151603499	48	781	4931	36627	0.999999998570136	0.456522113129445	0.350705774005619	Inf	0.487984854441229	0.965027300409777	0.598601845748064	0.96050333635431	0.398453965584667	0.999999999973355	0.368608385097656	0.00647000888411154	2010	1811
TCGA-55-8507-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	1069	29	2	27	29	1011	41451	41	31	18	90	9686	46	32	11	89	9757	45	252	98	395	10858	82	246	109	437	11150	14	26	13	53	1406	0.0495790458372311	0.121281464530892	0.12609865470852	0.961798242901459	0.0376955903271693	3	35	12	50	1358	0.0467726847521048	0.126582278481013	0.125069073494198	1.0120989541582	0.0368188512518409	0.039289055191768	42	292	2764	19244	0.521691699795285	1.00143721323803	0.746116785854039	Inf	1.00125653179892	1.06582950647812	0.429171910844841	1.07602300367033	0.961639296126177	0.614053331764683	0.956367899556435	0.225813160888008	1027	969
TCGA-55-8508-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	202	8	2	8	10	184	7544	8	6	3	17	1774	10	8	3	21	1855	8	34	32	74	1911	8	40	24	72	2004	1	1	6	8	260	0.0396039603960396	0.111111111111111	0.129740518962076	0.856410256410256	0.0307692307692308	1	6	4	11	230	0.0544554455445545	0.148648648648649	0.120355834641549	1.23507638072855	0.0478260869565217	0.0594059405940594	12	60	490	3425	0.188224812015347	1.39782306055593	0.763664893178403	Inf	1.33163265306122	0.998724489795918	0.613317075688945	0.998542640043525	1.42674927113703	0.159265266072803	1.51932890518612	0.0127669382396857	190	172
TCGA-55-8510-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	357	8	4	9	13	336	13776	11	9	5	25	3236	23	9	5	37	3242	22	70	28	120	3626	22	94	38	154	3672	9	13	5	27	483	0.0756302521008403	0.175324675324675	0.131535947712418	1.332903121723	0.0559006211180124	7	8	5	20	472	0.0560224089635854	0.166666666666667	0.130170987313844	1.28036723163842	0.0423728813559322	0.0728291316526611	26	84	955	6343	0.00197801947530053	2.05559264376867	1.36552895844077	Inf	1.80626368396002	2.77886720609234	8.58079917309635e-05	3.79468814664807	1.15786133587181	0.362559201011469	1.18600959603596	0.248742667402434	331	310
TCGA-55-8511-01A-11D-2393-08	0	0	1	1	665	14	5	15	20	631	25871	30	19	10	59	6257	27	22	9	58	6280	37	125	94	256	6562	33	146	79	258	6772	12	15	17	44	877	0.0661654135338346	0.170542635658915	0.129503839338452	1.31689250704923	0.0501710376282782	9	19	26	54	892	0.081203007518797	0.2109375	0.135934166412679	1.55176219170404	0.0605381165919283	0.0962406015037594	64	179	1769	11565	6.04681169040391e-08	2.3372421903123	1.80667257916809	Inf	1.98520937871481	2.26127755794234	0.000214369315701859	2.80152276448341	1.8735054911661	3.40855539532167e-05	2.1622795991715	0.00128736684172872	601	567
TCGA-55-8512-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	44	2	0	3	3	39	1599	1	5	0	6	387	2	0	0	2	371	2	7	7	16	457	2	6	7	15	384	0	0	2	2	43	0.0454545454545455	0.133333333333333	0.111979166666667	1.1906976744186	0.0465116279069767	2	3	0	5	59	0.113636363636364	0.3125	0.12910284463895	2.42055084745763	0.0847457627118644	0.0909090909090909	4	14	102	739	0.172047361103369	2.06779239378909	0.615740721016428	Inf	1.8322440087146	4.12254901960784	0.0762353196179017	7.2141169918139	1.17787114845938	0.523415704591613	1.20722689843304	1	40	35
TCGA-55-8513-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	11	0	0	0	0	11	451	0	0	0	0	88	0	0	0	0	95	1	0	3	4	134	0	0	7	7	134	0	0	0	0	15	0	0	0.111940298507463	0	0	0	0	0	0	15	0	0	0.111940298507463	0	0	0	0	11	30	238	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	11	11
TCGA-55-8514-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	323	6	2	14	16	301	12341	14	6	5	25	2893	18	12	2	32	2847	18	61	36	115	3225	15	75	39	129	3376	4	6	2	12	412	0.0371517027863777	0.0930232558139535	0.122037914691943	0.762248814630842	0.029126213592233	3	6	3	12	397	0.0371517027863777	0.104347826086957	0.123100775193798	0.847661811411675	0.0302267002518892	0.0371517027863777	12	96	809	5792	0.68449169333746	0.894925194146523	0.49878170215656	Inf	0.906606235407224	1.73079372214106	0.102420118360486	1.92740328889656	0.543963741244335	0.960216319785912	0.511430536985723	0.739967499613171	311	289
TCGA-55-8614-01A-11D-2393-08	0	1	0	1	277	1	6	7	13	263	10783	11	17	1	29	2656	8	24	4	36	2522	28	31	41	100	2833	18	33	47	98	2772	4	2	5	11	383	0.0397111913357401	0.112244897959184	0.138167388167388	0.812383439015293	0.0287206266318538	9	3	6	18	368	0.0649819494584837	0.18	0.129897635015884	1.38570652173913	0.0489130434782609	0.0866425992779783	24	110	751	4854	0.0869090157552658	1.41009415027637	0.93193281192778	Inf	1.33672516246994	2.10921669657847	0.00634282794544933	2.54553543880005	0.932922769640479	0.644691592965589	0.923337909141953	0.79012274822034	253	239
TCGA-55-8615-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	149	1	0	4	4	144	5904	6	7	5	18	1453	15	6	5	26	1389	8	22	18	48	1475	7	22	23	52	1587	1	2	2	5	207	0.0335570469798658	0.0961538461538462	0.130434782608696	0.737179487179487	0.0241545893719807	2	2	2	6	204	0.0402684563758389	0.125	0.138305084745763	0.903799019607843	0.0294117647058824	0.0469798657718121	7	49	411	2651	0.639626472761956	0.92145323047783	0.410337829493969	Inf	0.931265206812652	1.49002433090024	0.328068964717088	1.61222594922461	0.726841137024509	0.818256444183566	0.697382276438823	1	142	137
TCGA-55-8616-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	554	8	9	8	17	529	21689	18	12	4	34	4983	29	12	5	46	5082	19	139	73	231	5687	24	150	44	218	5937	9	6	4	19	765	0.0342960288808664	0.0871559633027523	0.128852956038403	0.676398632847634	0.0248366013071895	2	24	5	31	661	0.055956678700361	0.134199134199134	0.116229998241604	1.15459981269361	0.0468986384266263	0.036101083032491	20	140	1426	10198	0.500983205715755	1.02163957250273	0.657295568505514	Inf	1.01893408134642	2.08526044554617	0.0130052983248862	2.45802010566007	0.627036357751645	0.957515690531531	0.595978370173988	0.803128782293451	534	509
TCGA-55-8619-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	31	0	0	3	3	28	1148	1	1	0	2	273	0	1	1	2	240	0	2	7	9	316	2	1	12	15	319	1	0	0	1	47	0.032258064516129	0.0666666666666667	0.147335423197492	0.452482269503546	0.0212765957446809	0	0	0	0	42	0	0	0.132911392405063	0	0	0.032258064516129	1	20	89	546	0.957189775051906	0.30710708260705	0.0148685059849874	Inf	0.339753879079722	3.56741573033708	0.262803234501348	6.1062555131561	0	1	0	1	30	27
TCGA-55-8620-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	560	10	4	19	23	526	21566	26	16	10	52	4980	19	23	6	48	5057	26	124	72	222	5797	34	102	68	204	5732	5	7	9	21	694	0.0375	0.102941176470588	0.121074668527565	0.850228852347856	0.0302593659942363	6	8	4	18	705	0.0321428571428571	0.0810810810810811	0.121614628255994	0.666705002875216	0.025531914893617	0.0428571428571429	24	176	1399	10130	0.555987359083003	0.987394305652931	0.663070877048013	Inf	0.988906361686919	1.51082916368835	0.106413710550997	1.62541498097038	0.765225160829164	0.879396547810649	0.741210409733537	0.806561154674571	536	502
TCGA-55-8621-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	133	5	0	4	4	124	5084	5	7	1	13	1128	5	10	3	18	1311	6	23	18	47	1273	10	19	17	46	1372	4	1	4	9	211	0.0676691729323308	0.195652173913043	0.153790087463557	1.27220276117865	0.042654028436019	3	2	4	9	152	0.0676691729323308	0.191489361702128	0.119402985074627	1.60372340425532	0.0592105263157895	0.112781954887218	15	36	363	2282	0.00310160448243261	2.61794334857502	1.46829871949244	Inf	2.14308864041484	3.18784435261708	0.00350826012077938	4.88503269011217	1.66548602912239	0.100249753531452	1.8620839055863	1	118	109
TCGA-55-A48X-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	440	17	3	4	7	416	17056	24	11	3	38	3883	24	5	6	35	3982	23	89	43	155	4542	19	119	50	188	4649	7	20	10	37	625	0.0840909090909091	0.196808510638298	0.134437513443751	1.46394042553191	0.0592	6	9	7	22	541	0.05	0.141935483870968	0.119110523998239	1.19162840617733	0.0406654343807763	0.0681818181818182	30	105	1166	8025	0.00160683667871615	1.96631607840877	1.35156325900767	Inf	1.75166761959215	2.43982275586049	0.00160272425940893	3.08472372669915	1.44088788063225	0.0778447627782068	1.53941764428088	0.526364047500119	410	386
TCGA-55-A48Y-01A-11D-A24D-08	0	1	0	1	393	4	2	3	5	384	15744	6	5	1	12	3675	6	5	0	11	3894	63	15	92	170	4036	65	13	113	191	4139	56	4	64	124	612	0.315521628498728	0.649214659685864	0.147861802367722	4.39068541901927	0.202614379084967	45	3	53	101	597	0.256997455470738	0.594117647058824	0.147918731417245	4.01651394226032	0.169179229480737	0.55470737913486	218	115	1209	6966	3.68536029300162e-92	10.9172291567144	8.92070741804548	Inf	4.42663507179636	5.33547223945409	1.86312628994742e-57	21.5303228228023	3.85916601101495	8.45984478005465e-43	7.65679489716334	0.157022107820893	175	166
TCGA-55-A48Z-01A-12D-A24P-08	0	0	0	0	62	0	0	1	1	61	2501	2	1	3	6	575	1	4	1	6	609	3	8	17	28	654	1	7	13	21	663	0	0	3	3	104	0.0483870967741935	0.142857142857143	0.156862745098039	0.910714285714286	0.0288461538461538	2	0	1	3	80	0.0483870967741935	0.107142857142857	0.122324159021407	0.875892857142857	0.0375	0.0967741935483871	6	28	184	1133	0.341563762593526	1.31918884728336	0.526912466856157	Inf	1.2631074168798	3.57880434782609	0.0975259864906699	6.14371216185051	0.954347826086957	0.621244538598524	0.947352874856187	0.567099567099567	56	55
TCGA-55-A490-01A-11D-A24D-08	0	0	1	1	1475	31	11	31	42	1402	57482	75	37	10	122	13367	59	41	17	117	13330	88	372	131	591	15383	83	365	124	572	15402	25	40	23	88	1984	0.0596610169491525	0.153846153846154	0.128814439683158	1.19432382133995	0.0443548387096774	15	48	32	95	1926	0.0644067796610169	0.160744500846024	0.125203146330365	1.28386949974786	0.04932502596054	0.0644067796610169	95	331	3910	26875	3.91893312703847e-08	1.97273709459376	1.61048256348726	Inf	1.75580550652594	1.8417313531057	9.23655547593241e-05	2.09869786527054	1.69818464470187	6.03676644184727e-05	1.89005188334103	0.0947725787027096	1380	1307
TCGA-55-A491-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	423	11	4	7	11	401	16441	17	14	7	38	4011	24	14	9	47	3929	26	80	43	149	4264	29	86	52	167	4237	7	10	8	25	543	0.0591016548463357	0.149700598802395	0.128156714656597	1.16810577739549	0.0460405156537753	6	8	10	24	574	0.0567375886524823	0.161073825503356	0.134615384615385	1.19654841802493	0.0418118466898955	0.0732860520094563	31	119	1117	7384	0.00727775468992393	1.72194535289394	1.19515908405037	Inf	1.57284989555357	1.79886058435745	0.0243166201361024	2.04594049356349	1.44200160203553	0.0703746933726999	1.54522954125342	0.385131748264129	392	370
TCGA-55-A492-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	345	4	2	15	17	324	13284	14	20	6	40	3116	25	13	4	42	3046	14	81	47	142	3516	10	51	39	100	3606	4	7	2	13	420	0.0376811594202899	0.13	0.116472545757072	1.11614285714286	0.030952380952381	4	7	10	21	444	0.0608695652173913	0.147887323943662	0.126279863481229	1.17110772744576	0.0472972972972973	0.0579710144927536	20	90	864	6258	0.043279876987857	1.60943371997806	1.01921033570354	Inf	1.49873737373737	2.74768518518519	0.00581459750141682	3.62072769325097	1.15019379844961	0.35058910602392	1.1745109366224	0.425114228706743	325	304
TCGA-55-A493-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	318	4	1	5	6	308	12628	18	11	5	34	3012	10	10	1	21	3050	23	61	52	136	3334	24	42	51	117	3232	14	2	19	35	468	0.110062893081761	0.299145299145299	0.14480198019802	2.06589232230258	0.0747863247863248	10	7	22	39	487	0.122641509433962	0.286764705882353	0.146070785842831	1.96318999879212	0.080082135523614	0.20440251572327	65	85	955	5611	5.79082319421095e-17	4.49166639399467	3.35259408836538	Inf	2.97933682373473	3.51083881029297	4.98074649390337e-09	6.12816084466777	2.7368067910334	5.24850974404358e-10	3.8842889536044	0.00782109147088091	253	243
TCGA-55-A494-01A-11D-A24P-08	0	1	0	1	261	7	1	6	7	247	10127	7	4	5	16	2364	15	13	6	34	2357	12	49	30	91	2679	14	54	38	106	2727	6	7	2	15	349	0.0574712643678161	0.141509433962264	0.127979464613128	1.10571984646159	0.0429799426934097	2	6	3	11	356	0.0421455938697318	0.120879120879121	0.132885405001866	0.90964933942462	0.0308988764044944	0.0498084291187739	13	81	705	4701	0.457233514414919	1.07019198851406	0.606837165598145	Inf	1.06047985513807	2.35941080196399	0.0150887357151221	2.9627469245247	0.563829787234043	0.95130802492348	0.529262954221468	0.52301713338091	248	234
TCGA-55-A4DF-01A-11D-A24D-08	0	1	0	1	861	16	1	7	8	837	34317	11	13	7	31	8223	14	11	9	34	8447	129	71	162	362	8913	130	77	203	410	8734	92	20	104	216	1272	0.250871080139373	0.526829268292683	0.145637737577284	3.61739530602853	0.169811320754717	85	24	87	196	1276	0.227642276422764	0.541436464088398	0.143161673959385	3.78199310691214	0.153605015673981	0.427409988385598	368	256	2548	15099	4.34400170332194e-138	8.51634280319607	7.39218302757268	Inf	4.08446041138349	4.73309219737791	3.65634157729769e-84	12.7880831861938	3.62419840433539	8.63941806719852e-63	6.50370459738851	0.362324087119776	493	469
TCGA-55-A4DG-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	758	26	4	24	28	704	28864	31	24	6	61	6905	39	21	8	68	6815	59	175	65	299	7553	45	172	59	276	7591	9	20	5	34	971	0.0448548812664908	0.123188405797101	0.127914635752865	0.963051687338617	0.0350154479917611	12	11	3	26	977	0.0343007915567282	0.0869565217391304	0.129352575135708	0.672244225891149	0.0266120777891505	0.0382585751978892	29	199	1948	13196	0.55587114564319	0.9871847937219	0.688764082525352	Inf	0.988814438560467	1.56977570683936	0.0238016355403386	1.71385771465402	0.501556600649136	0.992836896257717	0.467199734931791	0.00975383223976208	729	675
TCGA-62-8394-01A-11D-2323-08	0	0	0	0	174	0	0	6	6	168	6888	3	6	4	13	1637	5	9	7	21	1645	25	14	24	63	1789	20	14	37	71	1817	8	3	6	17	234	0.0977011494252874	0.23943661971831	0.128783709411117	1.8592151197785	0.0726495726495727	15	3	6	24	231	0.137931034482759	0.380952380952381	0.129122414756847	2.95031952174809	0.103896103896104	0.201149425287356	35	71	465	3141	1.31410036396108e-07	3.32833175499604	2.28308292436187	Inf	2.56055995130858	3.96358422939068	1.15357698020742e-09	7.05536123405483	1.52554204124802	0.0903538848412681	1.65396952856087	0.0249261472114262	139	133
TCGA-62-8395-01A-11D-2323-08	0	0	0	0	88	1	0	6	6	81	3321	1	7	2	10	770	2	3	2	7	831	7	2	27	36	849	7	6	15	28	871	3	0	3	6	114	0.0681818181818182	0.214285714285714	0.130884041331803	1.63721804511278	0.0526315789473684	3	1	2	6	124	0.0681818181818182	0.166666666666667	0.14605418138987	1.14112903225806	0.0483870967741935	0.125	11	45	238	1482	0.150107167463512	1.52171151049058	0.79268992450932	Inf	1.41956782713085	3.09723889555822	0.00816524462852505	4.66388450356791	0.860344137655062	0.708278412371168	0.841549583784805	1	77	70
TCGA-62-8397-01A-11D-2323-08	0	0	1	1	36	1	1	5	6	29	1189	0	2	0	2	271	3	0	3	6	300	0	4	4	8	304	1	1	11	13	314	0	0	3	3	45	0.0833333333333333	0.230769230769231	0.143312101910828	1.61025641025641	0.0666666666666667	0	2	0	2	40	0.0555555555555556	0.25	0.131578947368421	1.9	0.05	0.0833333333333333	3	13	85	533	0.387288897706158	1.4461008147977	0.345075301362245	Inf	1.36323529411765	0	1	0	1.45411764705882	0.347509473985941	1.56634904044814	0.166666666666667	33	26
TCGA-62-8398-01A-11D-2323-08	0	1	0	1	104	0	1	4	5	99	4059	3	5	1	9	981	4	4	5	13	989	2	20	18	40	1033	6	10	21	37	1056	2	1	3	6	147	0.0576923076923077	0.162162162162162	0.139204545454545	1.16492002206288	0.0408163265306122	1	1	4	6	142	0.0576923076923077	0.15	0.137463697967086	1.09119718309859	0.0422535211267606	0.0961538461538462	10	37	289	1800	0.110589522364471	1.68285181016982	0.842422201129407	Inf	1.53795185157918	2.7106401384083	0.0875357540009434	3.73363852604682	1.29740040812705	0.293797081015828	1.3622342679594	0.213756898640463	94	89
TCGA-62-8399-01A-21D-2323-08	1	0	0	1	592	9	5	11	16	567	23247	18	19	6	43	5604	9	20	7	36	5561	62	90	92	244	6018	61	94	89	244	6064	35	16	37	88	878	0.148648648648649	0.360655737704918	0.144788918205805	2.49090705403488	0.100227790432802	42	14	39	95	850	0.160472972972973	0.389344262295082	0.141242937853107	2.75655737704918	0.111764705882353	0.258445945945946	153	151	1728	10354	4.04056680442827e-48	6.0698721222462	4.96807932706675	Inf	3.51894873903509	4.37704193014152	4.22010844766601e-34	10.0265660923466	2.93582463679149	3.18689898379807e-19	4.3364937900983	1	439	414
TCGA-62-8402-01A-11D-2323-08	1	0	0	1	72	0	0	2	2	70	2870	2	8	1	11	738	0	1	1	2	659	2	7	18	27	748	6	5	19	30	725	0	1	1	2	91	0.0277777777777778	0.0666666666666667	0.12551724137931	0.531135531135531	0.021978021978022	1	2	4	7	105	0.0972222222222222	0.259259259259259	0.140374331550802	1.84691358024691	0.0666666666666667	0.0833333333333333	6	39	196	1277	0.56609218066965	1.00235326190998	0.408702893335993	Inf	1.00204081632653	0.939413265306122	0.681715593790836	0.930791303926959	1.01558190843905	0.560007911958497	1.01800602399216	0.131221719457014	66	64
TCGA-62-A46O-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	988	26	5	36	41	921	37761	43	38	6	87	8915	42	32	15	89	9030	79	181	111	371	9881	62	193	119	374	9935	24	24	40	88	1372	0.0890688259109312	0.235294117647059	0.138097634625063	1.70382438689762	0.0641399416909621	26	21	25	72	1268	0.0728744939271255	0.194070080862534	0.128327092399555	1.51230794085386	0.056782334384858	0.116396761133603	115	256	2640	17176	2.60086055012618e-18	2.92242757107464	2.40254289506741	Inf	2.3266764681859	2.66172361917043	2.99030871819717e-11	3.57453437263963	2.12127799736495	2.59556148567915e-09	2.5627266643527	0.102673896738235	873	806
TCGA-62-A46P-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	316	6	2	7	9	301	12341	17	7	4	28	2917	14	7	6	27	2793	19	76	34	129	3309	13	79	25	117	3322	4	11	2	17	396	0.0537974683544304	0.145299145299145	0.119205298013245	1.21889838556505	0.0429292929292929	0	15	2	17	396	0.0537974683544304	0.131782945736434	0.119673617407072	1.10118628141884	0.0429292929292929	0.0253164556962025	8	83	792	5839	0.863548848438626	0.710632136643932	0.342166586047874	Inf	0.736041736041736	1.04655934343434	0.542259777499856	1.05321597310065	0.567625406608458	0.932584902788716	0.536220119365781	1	308	293
TCGA-62-A46R-01A-11D-A24D-08	1	0	0	1	202	2	3	8	11	189	7749	12	12	3	27	1813	5	11	1	17	1920	5	33	34	72	2029	13	25	35	73	1987	4	5	9	18	283	0.0891089108910891	0.246575342465753	0.142425767488676	1.73125514303693	0.0636042402826855	2	4	8	14	293	0.0693069306930693	0.194444444444444	0.144406111384919	1.34651118695487	0.0477815699658703	0.113861386138614	23	64	576	3440	0.00254770660146667	2.1457684343759	1.37153010052234	Inf	1.84323116219668	2.32407407407407	0.0350417162136109	2.98497196967559	1.71779388083736	0.0172041411666945	1.95214511145585	0.00846865797844343	179	166
TCGA-62-A46S-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	140	5	1	1	2	133	5453	7	6	2	15	1285	7	5	1	13	1326	6	17	31	54	1400	7	20	24	51	1442	1	2	6	9	188	0.0642857142857143	0.176470588235294	0.130374479889043	1.35356695869837	0.0478723404255319	2	1	3	6	197	0.0428571428571429	0.111111111111111	0.140714285714286	0.789622109419064	0.0304568527918782	0.0857142857142857	12	56	385	2457	0.208774412765249	1.3673663099929	0.743195243338433	Inf	1.30267379679144	1.7034965034965	0.254989140524184	1.91389723582489	1.20793388429752	0.328716228812427	1.24850368031982	0.0604329414240249	128	121
TCGA-62-A46U-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	52	0	0	2	2	50	2050	1	3	2	6	464	2	1	0	3	495	3	4	15	22	570	5	6	8	19	521	1	0	3	4	68	0.0769230769230769	0.210526315789474	0.130518234165067	1.61300309597523	0.0588235294117647	2	0	1	3	66	0.0576923076923077	0.136363636363636	0.115789473684211	1.17768595041322	0.0454545454545455	0.134615384615385	7	24	134	957	0.083023200490143	2.08129129539638	0.87611512749413	Inf	1.83846894559461	3.05317164179104	0.0661972450549777	4.27637553641326	1.41596365996106	0.315689498832456	1.50289350481041	1	45	43
TCGA-62-A46V-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	65	0	1	2	3	62	2542	4	7	4	15	647	1	1	0	2	603	4	3	14	21	626	2	4	18	24	666	0	1	4	5	95	0.0769230769230769	0.208333333333333	0.142642642642643	1.46052631578947	0.0526315789473684	0	2	1	3	81	0.0461538461538462	0.142857142857143	0.129392971246006	1.10405643738977	0.037037037037037	0.0769230769230769	5	33	176	1116	0.606397270082062	0.960767252882057	0.352716848980188	Inf	0.965909090909091	0	1	0	1.14701704545455	0.449709380632089	1.17407020044338	0.0256410256410257	60	57
TCGA-62-A46Y-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	45	0	3	5	8	37	1517	0	3	3	6	400	0	1	4	5	339	0	4	5	9	400	2	4	11	17	378	0	1	1	2	49	0.0444444444444444	0.117647058823529	0.12962962962963	0.907563025210084	0.0408163265306122	0	0	0	0	55	0	0	0.1375	0	0	0.0222222222222222	1	17	104	674	0.9239180808715	0.381547880531119	0.0183494970598599	Inf	0.415598290598291	0	1	0	0.467548076923077	0.899020197439339	0.432387894019712	1	44	36
TCGA-62-A470-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	135	1	1	6	7	127	5207	5	4	1	10	1218	9	7	2	18	1246	5	20	23	48	1405	8	19	24	51	1338	3	4	2	9	197	0.0666666666666667	0.176470588235294	0.147234678624813	1.19856673633921	0.0456852791878173	2	1	0	3	179	0.0222222222222222	0.0625	0.127402135231317	0.490572625698324	0.0167597765363128	0.0518518518518519	7	53	376	2367	0.731759067462431	0.831494764016131	0.371303542180747	Inf	0.851108156028369	2.80585106382979	0.0244557119289447	3.93107385505645	0.310434585785423	0.991458837625494	0.279867851934015	0.37070938215103	128	120
TCGA-62-A471-01A-12D-A24D-08	0	1	0	1	127	0	0	3	3	124	5084	1	7	1	9	1244	0	5	2	7	1232	14	4	33	51	1282	17	8	32	57	1326	11	2	15	28	200	0.220472440944882	0.491228070175439	0.150829562594268	3.25684210526316	0.14	8	2	13	23	188	0.181102362204724	0.450980392156863	0.146645865834633	3.0753024614101	0.122340425531915	0.37007874015748	47	49	388	2220	1.78174328289007e-14	5.48289382237408	3.78641542755507	Inf	3.29080756013746	4.11972065181244	5.9924052757645e-09	9.04675898563325	2.895479777954	7.40382354523267e-08	4.32663935376411	0.11159031830664	80	77
TCGA-62-A472-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	69	2	1	5	6	61	2501	4	6	3	13	598	4	1	1	6	591	2	9	11	22	690	2	8	10	20	622	0	1	1	2	86	0.0289855072463768	0.1	0.138263665594855	0.723255813953488	0.0232558139534884	0	0	2	2	94	0.0289855072463768	0.0909090909090909	0.136231884057971	0.667311411992263	0.0212765957446809	0.0434782608695652	3	22	180	1132	0.68690906801214	0.857679485668222	0.21607987006047	Inf	0.874666666666667	0	1	0	1.04126984126984	0.566802066172807	1.04812011829799	0.142857142857143	66	58
TCGA-64-1676-01A-01D-0969-08	0	0	0	0	672	6	3	13	16	650	26650	26	19	8	53	6338	31	21	10	62	6410	33	177	65	275	6876	37	168	55	260	7026	6	24	6	36	965	0.0535714285714286	0.138461538461538	0.137346996868773	1.00811478676764	0.0373056994818653	4	18	6	28	908	0.0416666666666667	0.101818181818182	0.132053519488074	0.771037244693632	0.0308370044052863	0.0327380952380952	22	168	1873	12029	0.805402394976566	0.841033444214898	0.554897907748069	Inf	0.859426194958833	1.0603310197544	0.473693253401281	1.07040021555382	0.742231713828083	0.897472067462902	0.713606554403233	0.815255608671043	650	628
TCGA-64-1677-01A-01W-0928-08	0	0	0	0	275	5	9	7	16	254	10414	4	5	3	12	2527	14	11	5	30	2621	36	29	45	110	2650	29	29	44	102	2616	13	6	14	33	395	0.12	0.323529411764706	0.150993883792049	2.14266567386448	0.0835443037974684	22	4	15	41	411	0.149090909090909	0.372727272727273	0.155094339622642	2.40322937403229	0.0997566909975669	0.232727272727273	64	90	806	4460	1.54572181987553e-14	3.93356218529583	2.93822905047026	Inf	2.71522026360736	3.51803779347204	1.1418515639591e-12	6.45220324649506	2.12889285415563	4.48832861237403e-05	2.6737723025231	0.406865059758362	211	190
TCGA-64-1679-01A-21D-2063-08	0	0	0	0	579	11	7	8	15	553	22673	19	11	5	35	5435	25	16	5	46	5656	39	155	49	243	5660	37	140	52	229	5922	9	14	14	37	863	0.0639032815198618	0.161572052401747	0.145727794663965	1.10872502239067	0.0428736964078795	11	19	7	37	788	0.0639032815198618	0.152263374485597	0.139222614840989	1.09366840049299	0.0469543147208122	0.0708117443868739	41	136	1651	9931	0.00111784627676494	1.8132748684222	1.3188007236949	Inf	1.62497647376868	1.84609008894131	0.00428394035829025	2.14809484987636	1.45859395146056	0.0472819614190771	1.57889753332046	1	538	512
TCGA-64-1681-01A-11D-2063-08	0	0	1	1	98	1	0	4	4	93	3813	5	5	9	19	973	0	5	3	8	903	8	6	15	29	952	10	3	24	37	985	5	1	8	14	134	0.142857142857143	0.378378378378378	0.136040609137056	2.78136345300524	0.104477611940299	4	1	4	9	127	0.0918367346938776	0.310344827586207	0.133403361344538	2.32636437686668	0.0708661417322835	0.214285714285714	21	36	261	1676	1.22623775954703e-05	3.74237379400654	2.24299821028764	Inf	2.73422060899375	3.71072796934866	0.000249801912885883	6.41128437111988	2.28352490421456	0.0045841798115491	2.8518733076816	0.554443566604302	77	72
TCGA-64-5774-01A-01D-1625-08	0	0	1	1	164	4	3	5	8	152	6232	8	3	1	12	1411	2	9	0	11	1429	6	46	18	70	1681	7	36	16	59	1711	3	3	2	8	208	0.0487804878048781	0.135593220338983	0.12156633547633	1.11538461538462	0.0384615384615385	1	3	3	7	202	0.0426829268292683	0.1	0.120166567519334	0.832178217821782	0.0346534653465347	0.0548780487804878	9	38	410	2982	0.110267011704552	1.72225786287393	0.835737086488918	Inf	1.58422418266736	2.54559099437148	0.0629967286991765	3.23077449684461	1.21664275466284	0.395575752550747	1.25390410143346	1	155	143
TCGA-64-5775-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	532	16	3	25	28	488	20008	26	19	7	52	4781	25	18	4	47	4787	29	115	50	194	5349	18	126	51	195	5091	5	11	6	22	675	0.0413533834586466	0.112820512820513	0.132586918090748	0.850917378917379	0.0325925925925926	2	16	6	24	694	0.0451127819548872	0.123711340206186	0.129743877360254	0.953504263347099	0.0345821325648415	0.0357142857142857	19	129	1369	9071	0.576419059626156	0.97592386070235	0.61939815936154	Inf	0.979014076165281	1.13578788679421	0.42218496905631	1.15951533374353	0.90605992666469	0.686508868440856	0.893378986660424	0.302976742829595	513	469
TCGA-64-5778-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	539	9	3	15	18	512	20992	21	19	8	48	4961	24	20	2	46	5134	28	121	58	207	5412	25	129	57	211	5485	5	15	14	34	718	0.0630797773654917	0.161137440758294	0.130902461257976	1.23097334618279	0.0473537604456825	6	18	17	41	761	0.0760667903525046	0.198067632850242	0.140613451589061	1.40859662153155	0.0538764783180026	0.0779220779220779	42	126	1479	9418	6.24597048125868e-05	2.12243185163928	1.54363393163078	Inf	1.84195402298851	1.52916937757536	0.097756869911134	1.66766202948904	1.98610694652674	0.000122632028899911	2.34974979067433	0.000466303468530965	497	470
TCGA-64-5779-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	401	13	4	9	13	375	15375	11	10	3	24	3655	13	16	5	34	3756	27	87	43	157	3911	27	97	36	160	4053	5	7	4	16	536	0.0399002493765586	0.1	0.132247717739946	0.75615671641791	0.0298507462686567	3	17	7	27	498	0.0673316708229426	0.171974522292994	0.127333162873945	1.35058706162229	0.0542168674698795	0.0473815461346633	19	114	1034	6930	0.366685928505072	1.11697083636258	0.705770434671475	Inf	1.10030395136778	1.14105594956659	0.403814013904798	1.16554757018694	1.07244815513062	0.452242078162423	1.08418278641724	0.60400541709711	382	356
TCGA-64-5781-01A-01D-1625-08	0	0	1	1	1292	19	9	35	44	1229	50389	58	37	15	110	12127	54	35	8	97	12098	82	283	125	490	12849	81	300	151	532	13315	20	39	39	98	1820	0.0758513931888545	0.184210526315789	0.136687945925648	1.34767206477733	0.0538461538461538	19	31	42	92	1828	0.0712074303405573	0.187755102040816	0.142267880768931	1.31972937971688	0.050328227571116	0.0928792569659443	120	319	3648	22516	2.88571773653703e-13	2.32171525047381	1.92743733321811	Inf	1.9604963433641	1.71603567969002	0.000466493757021182	1.9412773868238	2.10486985125858	3.8067599114024e-11	2.56363231234663	5.17501836445501e-06	1172	1109
TCGA-64-5815-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	201	3	0	6	6	192	7872	16	5	2	23	1875	9	2	2	13	1929	6	51	23	80	1995	7	36	33	76	2073	1	7	2	10	273	0.0497512437810945	0.131578947368421	0.131693198263386	0.999132446500867	0.0366300366300366	1	4	1	6	262	0.0298507462686567	0.075	0.131328320802005	0.571087786259542	0.0229007633587786	0.0248756218905473	5	64	535	3533	0.957441622199528	0.515983300659508	0.196345655910627	Inf	0.550995530272247	1.16980589503954	0.525869390774167	1.20061491416086	0.407343124165554	0.982979637758489	0.373858150251042	1	196	187
TCGA-67-3771-01A-01D-1040-01	0	0	0	0	1219	20	5	37	42	1157	47437	45	49	17	111	11087	52	46	13	111	11383	124	180	159	463	12292	123	157	192	472	12675	55	24	70	149	1690	0.122231337161608	0.315677966101695	0.133333333333333	2.36758474576271	0.0881656804733728	61	20	51	132	1642	0.108285479901559	0.285097192224622	0.133582818093069	2.1342354974574	0.0803897685749086	0.19442165709598	237	361	3332	21635	1.2102986728583e-55	4.26271539918996	3.68708442811324	Inf	2.96967231708737	3.51902542393476	7.09113790096467e-37	5.74898290507468	2.58309050115773	1.80932295481254e-23	3.41574168582713	0.732633650400601	982	920
TCGA-67-3772-01A-01W-0928-08	0	0	0	0	87	0	7	6	13	74	3034	3	4	2	9	723	0	4	1	5	714	6	5	14	25	798	4	7	24	35	799	0	0	2	2	114	0.0229885057471264	0.0571428571428571	0.142678347934919	0.400501253132832	0.0175438596491228	2	0	3	5	118	0.0574712643678161	0.2	0.147869674185464	1.35254237288136	0.0423728813559322	0.0804597701149425	7	41	232	1365	0.55991992334189	1.00451794061067	0.441369267773195	Inf	1.00386135057471	1.37672413793103	0.439827669024437	1.47049830858812	0.905739564428312	0.664917576583676	0.891540256079393	0.286130536130536	80	67
TCGA-67-3773-01A-01D-1040-01	0	0	0	0	114	5	4	6	10	99	4059	3	5	1	9	922	5	5	1	11	950	2	24	22	48	1056	1	19	11	31	1131	0	1	1	2	140	0.0175438596491228	0.0645161290322581	0.123784261715296	0.521198156682028	0.0142857142857143	0	2	2	4	132	0.0350877192982456	0.0833333333333333	0.125	0.666666666666667	0.0303030303030303	0.0263157894736842	3	33	272	1915	0.841603113007849	0.640149839792752	0.165451211044647	Inf	0.670036764705882	0	1	0	0.730949197860963	0.795685151202443	0.704142396631291	0.181818181818182	111	96
TCGA-67-4679-01B-01D-1753-08	0	0	0	0	324	5	4	9	13	305	12505	20	6	4	30	2860	21	9	4	34	3086	15	67	32	114	3220	19	68	40	127	3339	5	10	5	20	449	0.0617283950617284	0.15748031496063	0.134471398622342	1.17110639566491	0.044543429844098	2	5	3	10	371	0.0308641975308642	0.087719298245614	0.115217391304348	0.761337305527971	0.0269541778975741	0.0462962962962963	15	91	820	5739	0.347616859772851	1.15359895443115	0.683218142663685	Inf	1.13190289921767	1.64680774748924	0.125405410736778	1.81429349027647	0.888753387533875	0.691940897357249	0.874836019006909	1	309	290
TCGA-67-6215-01A-11D-1753-08	0	0	1	1	136	1	1	1	2	133	5453	5	12	25	42	1416	2	17	30	49	1375	3	4	19	26	1332	2	2	12	16	1330	0	1	3	4	208	0.0294117647058824	0.25	0.156390977443609	1.59855769230769	0.0192307692307692	1	0	5	6	196	0.0441176470588235	0.230769230769231	0.147147147147147	1.56828885400314	0.0306122448979592	0.0661764705882353	9	27	404	2258	0.0872631717639734	1.86246492692643	0.881568481759634	Inf	1.64727722772277	1.31782178217822	0.561412742723189	1.39707825002856	1.7004152028106	0.088879128991374	1.94354457346572	0.00547749464158134	127	124
TCGA-67-6216-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	53	0	1	5	6	47	1927	0	3	0	3	497	4	2	0	6	522	4	3	15	22	459	6	2	8	16	449	2	1	2	5	88	0.0943396226415094	0.3125	0.195991091314031	1.59446022727273	0.0568181818181818	3	1	6	10	79	0.188679245283019	0.454545454545455	0.172113289760349	2.6409666283084	0.126582278481013	0.245283018867925	13	20	167	741	0.00477859073312482	2.87984749753411	1.45809794254821	Inf	2.14189802213754	2.7185628742515	0.0244590396394481	4.42704184125899	1.89117417339235	0.0500765920053672	2.3637283952048	0.462137352376443	40	34
TCGA-67-6217-01A-11D-1753-08	0	0	1	1	210	7	2	4	6	197	8077	11	10	5	26	1933	6	8	4	18	2044	8	41	29	78	1952	10	36	29	75	2148	1	7	4	12	302	0.0571428571428571	0.16	0.140595903165736	1.13801324503311	0.0397350993377483	3	6	2	11	270	0.0523809523809524	0.141025641025641	0.138319672131148	1.01956315289649	0.0407407407407407	0.0476190476190476	10	66	572	3528	0.629344971581825	0.934521963906895	0.484263943702305	Inf	0.943135811556864	1.59285159285159	0.237337430676627	1.76194014037578	0.741499879430914	0.836433509933199	0.711725302839496	0.722238010950433	200	187
TCGA-69-7760-01A-11D-2167-08	0	0	0	0	93	1	0	8	8	84	3444	4	9	3	16	800	3	2	1	6	819	2	9	20	31	851	3	9	19	31	974	0	2	6	8	126	0.0860215053763441	0.258064516129032	0.129363449691992	1.99487967229903	0.0634920634920635	1	2	1	4	101	0.043010752688172	0.129032258064516	0.118683901292597	1.08719259022676	0.0396039603960396	0.0860215053763441	8	36	227	1598	0.179304215167085	1.56392250467233	0.720316841865012	Inf	1.46175410492591	1.6079295154185	0.48628912703986	1.75924140604479	1.44301366768327	0.209679292881767	1.53950195960828	0.0271907389958272	85	76
TCGA-69-7761-01A-11D-2167-08	0	0	0	0	41	0	1	4	5	36	1476	2	5	1	8	367	4	1	1	6	364	2	2	5	9	376	3	5	5	13	369	0	2	0	2	42	0.0487804878048781	0.153846153846154	0.113821138211382	1.35164835164835	0.0476190476190476	0	0	2	2	56	0.0487804878048781	0.222222222222222	0.148936170212766	1.49206349206349	0.0357142857142857	0.0487804878048781	2	13	98	647	0.608136407335278	1.01567888838771	0.161632256411708	Inf	1.01360544217687	0	1	0	1.52040816326531	0.390248573217053	1.64920067873169	0.428571428571429	39	34
TCGA-69-7763-01A-11D-2167-08	0	0	0	0	98	2	3	4	7	89	3649	5	5	1	11	827	4	1	1	6	896	3	14	24	41	972	5	9	17	31	954	2	0	1	3	127	0.0306122448979592	0.0967741935483871	0.133123689727463	0.726949453898908	0.0236220472440945	0	2	1	3	122	0.0306122448979592	0.0731707317073171	0.125514403292181	0.58296681327469	0.0245901639344262	0.0408163265306122	4	45	249	1677	0.891639028471036	0.59879194533433	0.195083077232989	Inf	0.631423653798869	1.93373493975904	0.2786825497436	2.24373924670625	0.377314134587129	0.975107844964013	0.345508031706808	1	94	85
TCGA-69-7764-01A-11D-2167-08	0	1	0	1	117	3	0	5	5	109	4469	4	12	2	18	1061	1	6	0	7	1101	8	14	20	42	1196	2	17	23	42	1111	0	2	6	8	143	0.0683760683760684	0.19047619047619	0.128712871287129	1.47985347985348	0.0559440559440559	2	2	3	7	139	0.0598290598290598	0.166666666666667	0.116220735785953	1.43405275779376	0.0503597122302158	0.094017094017094	11	42	282	2025	0.0562863573599841	1.87998294827651	0.977547006565886	Inf	1.6979124849458	1.63617021276596	0.351791441754913	1.79464973799161	1.71227115289461	0.0756263521018865	1.90005426090465	0.0209395302348826	106	98
TCGA-69-7765-01A-11D-2167-08	0	0	1	1	739	16	5	18	23	700	28700	29	15	4	48	6792	44	26	13	83	6962	35	153	81	269	7461	38	175	87	300	7485	14	21	25	60	999	0.081190798376184	0.2	0.133466933867735	1.4984984984985	0.0600600600600601	14	20	19	53	980	0.0717185385656292	0.197026022304833	0.131349685028817	1.50001138001669	0.0540816326530612	0.0974289580514208	72	169	1979	12967	2.09102564978851e-11	2.79124964342538	2.17898414188995	Inf	2.2562885400439	2.89677227325272	7.69893091365597e-08	4.07680612652069	1.97798310835198	6.45111664015289e-06	2.32472951067075	0.0318665108061207	667	628
TCGA-69-7973-01A-11D-2184-08	0	0	0	0	284	9	3	10	13	262	10742	14	5	1	20	2460	14	7	2	23	2600	9	76	25	110	2812	15	62	32	109	2870	2	5	5	12	376	0.0422535211267606	0.110091743119266	0.131010452961672	0.840327932851845	0.0319148936170213	1	6	5	12	382	0.0422535211267606	0.109090909090909	0.135846372688478	0.803046168491195	0.031413612565445	0.0457746478873239	13	68	758	4924	0.283008513145124	1.2418331467452	0.699637949340842	Inf	1.20306850386006	0.937005277044855	0.638753264778284	0.928006401518984	1.31509512567699	0.225347959052167	1.38204602333213	0.0489914130589479	271	249
TCGA-69-7974-01A-11D-2184-08	0	0	1	1	586	15	6	12	18	553	22673	20	21	8	49	5327	27	16	5	48	5402	37	125	62	224	5999	30	133	69	232	5945	11	12	8	31	753	0.052901023890785	0.133620689655172	0.126661059714045	1.05494687915007	0.0411686586985392	8	9	4	21	784	0.0358361774744027	0.09375	0.130688448074679	0.717354910714286	0.0267857142857143	0.052901023890785	31	167	1537	10407	0.146419252259363	1.25685903438837	0.882482510486554	Inf	1.21666896683162	2.20371143631226	0.000622951276963895	2.67987375834897	0.711845719081983	0.923789140808505	0.682807485439489	0.197979657311723	555	522
TCGA-69-7978-01A-11D-2184-08	0	1	0	1	754	9	2	13	15	730	29930	38	17	5	60	7104	26	28	5	59	7152	65	147	90	302	7755	86	114	109	309	7919	45	13	45	103	1066	0.136604774535809	0.333333333333333	0.134612956181336	2.47623514696685	0.0966228893058161	37	16	27	80	1040	0.106100795755968	0.264900662251656	0.134107027724049	1.97529291900153	0.0769230769230769	0.204244031830239	154	196	2106	13568	6.19754250289012e-43	5.06129007568496	4.19458346260828	Inf	3.27471984805318	4.04164701294944	5.41110637818442e-32	7.65451262854218	2.69278014001632	9.75410686182834e-16	3.65216527182279	0.34064606901188	600	576
TCGA-69-7979-01A-11D-2184-08	0	0	1	1	1610	40	9	26	35	1535	62935	62	30	13	105	14736	68	28	13	109	14821	78	450	153	681	16643	96	404	140	640	16735	27	39	20	86	2204	0.053416149068323	0.134375	0.131700029877502	1.02031108212341	0.0390199637023593	17	50	22	89	2076	0.0552795031055901	0.130690161527166	0.124737126719942	1.04772464272477	0.0428709055876686	0.053416149068323	86	381	4280	29098	0.000401775253317141	1.5345630912477	1.24591432441737	Inf	1.43614440953391	1.97205929745408	6.90936440732281e-06	2.30109351491426	1.11788778667347	0.243870570096413	1.13758427958721	0.901244933386624	1524	1449
TCGA-69-7980-01A-11D-2184-08	0	0	1	1	910	27	8	24	32	851	34891	30	35	14	79	8306	25	40	10	75	8409	76	153	96	325	8935	89	178	105	372	9241	47	21	35	103	1256	0.113186813186813	0.276881720430108	0.135916026404069	2.03715284911992	0.0820063694267516	37	24	26	87	1173	0.0956043956043956	0.267692307692308	0.131281477336318	2.03907141451898	0.0741687979539642	0.159340659340659	145	221	2429	15747	7.87074185793761e-35	4.25330100737633	3.53111266840524	Inf	2.96454274060926	3.80948388787005	2.80145663508907e-30	6.7218469939234	2.27093433614144	4.28236735164638e-10	2.82447552877975	0.0200166476816006	765	706
TCGA-69-8253-01A-11D-2284-08	0	1	0	1	183	1	0	5	5	177	7257	10	6	2	18	1741	10	3	4	17	1734	13	37	18	68	1889	12	34	28	74	1893	4	3	7	14	253	0.0765027322404372	0.189189189189189	0.13365029054411	1.41555389381476	0.0553359683794466	4	4	5	13	270	0.0710382513661202	0.191176470588235	0.142932768660667	1.33752723311547	0.0481481481481481	0.109289617486339	20	51	523	3259	0.00135744320482604	2.44291290636425	1.49914965001137	Inf	2.03700212748768	2.314034416826	0.016627868137218	2.93123630723592	1.88644110067337	0.0208994758183453	2.19871940965238	0.398285093560144	163	157
TCGA-69-8254-01A-11D-2284-08	0	0	0	0	91	1	1	3	4	86	3526	3	6	1	10	878	7	9	2	18	825	3	10	13	26	924	2	12	18	32	899	0	1	1	2	111	0.021978021978022	0.0625	0.123470522803115	0.506193693693694	0.018018018018018	1	0	1	2	145	0.021978021978022	0.0769230769230769	0.156926406926407	0.490185676392573	0.0137931034482759	0.032967032967033	3	33	256	1567	0.897020059474037	0.556607471181875	0.14378263879834	Inf	0.593424479166667	1.42421875	0.531606757249818	1.52985522374705	0.459425403225806	0.943682164231794	0.422287438785791	1	88	83
TCGA-69-8255-01A-11D-2284-08	0	0	0	0	325	8	5	10	15	301	12341	12	22	4	38	3135	10	15	11	36	3034	27	53	48	128	3148	21	37	41	99	3024	5	5	10	20	409	0.0615384615384615	0.202020202020202	0.135251322751323	1.49366525894643	0.0488997555012225	8	9	9	26	479	0.08	0.203125	0.152160101651842	1.33494258872651	0.0542797494780793	0.0984615384615385	32	105	888	5284	0.00381004940766188	1.8132614756051	1.2573010965696	Inf	1.62346287893733	1.88241366366366	0.0162676270081126	2.2098065965461	1.48380402874785	0.0496998998622953	1.61497024279206	0.273666387588394	293	269
TCGA-69-A59K-01A-11D-A25L-08	0	0	0	0	550	9	4	11	15	526	21566	24	11	5	40	5209	29	9	5	43	5167	25	135	61	221	5535	23	134	65	222	5655	4	22	18	44	804	0.08	0.198198198198198	0.142175066312997	1.39404329702837	0.054726368159204	10	16	11	37	764	0.0672727272727273	0.167420814479638	0.13803071364047	1.21292435621047	0.0484293193717278	0.0781818181818182	43	131	1568	9622	0.000140715475130846	2.01415653174626	1.4717082968076	Inf	1.76361277269529	2.08147321428571	0.00506614549585308	2.52647775509523	1.64252308066084	0.00462750264104452	1.83448512557706	0.0122224182624519	507	483
TCGA-71-6725-01A-11D-1855-08	0	0	1	1	72	0	1	0	1	71	2911	0	8	0	8	659	1	3	0	4	698	3	3	27	33	807	1	4	21	26	747	1	0	2	3	111	0.0416666666666667	0.115384615384615	0.14859437751004	0.776507276507277	0.027027027027027	1	0	2	3	88	0.0416666666666667	0.0909090909090909	0.1090458488228	0.833677685950413	0.0340909090909091	0.0833333333333333	6	46	199	1355	0.67018799826429	0.888227599645219	0.365096048079706	Inf	0.901043679938152	3.90452261306533	0.0832852466351117	6.79355100041277	0.650753768844221	0.877144811235283	0.619161624082518	0.567099567099567	66	65
TCGA-71-8520-01A-11D-2393-08	0	0	1	1	110	0	2	4	6	104	4264	3	9	3	15	1028	0	2	5	7	1027	7	11	25	43	1055	5	12	22	39	1154	2	4	2	8	133	0.0727272727272727	0.205128205128205	0.11525129982669	1.77983420088683	0.0601503759398496	5	2	4	11	153	0.1	0.255813953488372	0.145023696682464	1.76394588843289	0.0718954248366013	0.118181818181818	13	46	286	1923	0.0392714350297964	1.89964046490364	1.04197632328884	Inf	1.70184899845917	4.50553613053613	0.000284563881551142	9.39494604627209	0.986013986013986	0.581308163710118	0.983973559299329	1	97	91
TCGA-73-4658-01A-01D-1753-08	0	1	0	1	355	2	0	7	7	343	14063	6	8	3	17	3427	15	6	1	22	3472	39	55	63	157	3567	35	43	69	147	3597	20	8	35	63	524	0.177464788732394	0.428571428571429	0.145676953016403	2.94193020719738	0.120229007633588	18	7	34	59	521	0.166197183098592	0.375796178343949	0.146061115783572	2.5728694206389	0.113243761996161	0.301408450704225	107	99	1045	6119	8.31758685289636e-35	6.326179859582	4.94740482735522	Inf	3.56086774747991	3.52039312039312	1.79215653245179e-13	6.17833214001937	3.58355806872553	1.53180878469657e-23	6.41056726693764	0.000100013578017648	248	236
TCGA-73-4659-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	241	3	1	9	10	228	9348	15	10	1	26	2241	14	11	2	27	2236	13	42	32	87	2395	13	51	24	88	2476	1	8	3	12	341	0.0497925311203319	0.136363636363636	0.137722132471729	0.990135963743002	0.0351906158357771	4	3	3	10	315	0.04149377593361	0.114942528735632	0.131524008350731	0.873928115307426	0.0317460317460317	0.045643153526971	11	71	656	4215	0.555222945478308	0.995470620464223	0.53410728415175	Inf	0.99607748364069	1.42794324577861	0.268667749785057	1.52967441784845	0.795568379790941	0.782379614278605	0.771074007441755	1	230	217
TCGA-73-4662-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	263	3	1	9	10	250	10250	8	12	3	23	2417	13	14	9	36	2513	13	55	37	105	2681	11	48	27	86	2639	4	7	1	12	379	0.0456273764258555	0.13953488372093	0.143615005683971	0.971589863165	0.0316622691292876	5	3	8	16	331	0.0608365019011407	0.152380952380952	0.123461395001865	1.23423967774421	0.0483383685800604	0.0684410646387833	18	70	710	4610	0.0430381895850224	1.6694235388024	1.02138447890237	Inf	1.53265044814341	2.80985915492958	0.00271961895806238	3.89461950649096	1.05369718309859	0.489026974886715	1.06248740235785	1	245	232
TCGA-73-4666-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	414	9	2	12	14	391	16031	15	19	9	43	3880	24	17	8	49	3958	16	75	41	132	4121	31	95	41	167	4072	7	14	7	28	546	0.0676328502415459	0.167664670658683	0.134086444007859	1.25042223245816	0.0512820512820513	6	7	7	20	555	0.0483091787439614	0.151515151515152	0.134676049502548	1.12503412503413	0.036036036036036	0.0652173913043478	27	102	1101	7092	0.0129469081856452	1.70494529076005	1.14999919855643	Inf	1.55750586147899	2.05826424720274	0.00778867084997009	2.46252042775714	1.27048581112514	0.208539474860881	1.3261219779664	1	387	364
TCGA-73-4668-01A-01D-1265-08	0	0	1	1	491	9	2	10	12	470	19270	26	21	1	48	4676	33	17	1	51	4843	34	99	54	187	4833	22	113	49	184	4918	3	20	3	26	710	0.0529531568228106	0.141304347826087	0.144367629117527	0.978781383955909	0.0366197183098592	5	15	3	23	689	0.0468431771894094	0.122994652406417	0.142561555969377	0.862747685167219	0.0333817126269956	0.0285132382892057	14	145	1399	8352	0.986464184600586	0.57643987745384	0.339998535578169	Inf	0.613708803682774	0.995711222301644	0.56344553640465	0.994996856042152	0.406018168317175	0.998043549083252	0.369302210560535	0.773839842992033	477	456
TCGA-73-4670-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	392	6	6	17	23	363	14883	17	20	5	42	3599	16	26	8	50	3640	21	86	49	156	3803	10	59	46	115	3841	1	7	7	15	528	0.038265306122449	0.130434782608696	0.137464202030721	0.948863636363636	0.0284090909090909	5	11	7	23	520	0.0586734693877551	0.147435897435897	0.136734157244281	1.078266765286	0.0442307692307692	0.0510204081632653	20	106	1048	6596	0.277791379898492	1.18748192951591	0.756984480002734	Inf	1.15776081424936	1.41172125092342	0.246213673133689	1.51043509444896	1.07488951386099	0.431009579638114	1.08784746886143	0.0667324931107407	372	343
TCGA-73-4675-01A-01D-1265-08	0	1	0	1	84	0	2	6	8	76	3116	1	6	3	10	703	3	8	2	13	763	5	9	17	31	858	3	6	13	22	792	2	0	1	3	96	0.0357142857142857	0.136363636363636	0.121212121212121	1.125	0.03125	0	3	1	4	110	0.0476190476190476	0.129032258064516	0.128205128205128	1.00645161290323	0.0363636363636364	0.0476190476190476	4	34	206	1444	0.715478007407951	0.824761988518057	0.265031640073185	Inf	0.84312723556464	2.00242718446602	0.265000189696915	2.33495975054788	0.533980582524272	0.902696493496605	0.500854486547475	1	80	72
TCGA-73-4676-01A-01D-1753-08	0	0	0	0	108	3	1	6	7	98	4018	7	11	2	20	937	5	10	3	18	1000	3	12	17	32	1037	5	10	13	28	1044	1	1	2	4	149	0.037037037037037	0.142857142857143	0.14272030651341	1.00095877277085	0.0268456375838926	0	1	1	2	135	0.0185185185185185	0.0625	0.130183220829315	0.480092592592593	0.0148148148148148	0.037037037037037	4	34	284	1797	0.780385262643942	0.744501589832787	0.23984842446748	Inf	0.771312083024463	0.915933098591549	0.69135251973942	0.90394493913514	0.732746478873239	0.796274106680259	0.703155808348786	0.545454545454546	104	94
TCGA-73-4677-01A-01D-1265-08	0	0	0	0	281	4	1	5	6	271	11111	12	16	2	30	2653	11	6	3	20	2713	12	66	26	104	2783	14	56	47	117	2962	5	3	7	15	386	0.0533807829181495	0.128205128205128	0.13031735313977	0.983791683273549	0.038860103626943	1	8	5	14	390	0.0498220640569395	0.134615384615385	0.140136543298599	0.96060157790927	0.0358974358974359	0.0640569395017794	18	81	776	4969	0.117698368696722	1.42286607534662	0.876452599508078	Inf	1.34606373008435	1.7084655035686	0.130034133539548	1.9206214735076	1.21698912582968	0.279908025576365	1.25961464034714	0.154966867766412	263	253
TCGA-73-7498-01A-12D-2184-08	0	0	0	0	138	1	1	9	10	127	5207	2	8	2	12	1141	6	3	3	12	1220	8	23	17	48	1402	6	27	22	55	1444	1	2	0	3	155	0.0217391304347826	0.0545454545454545	0.107340720221607	0.508152492668622	0.0193548387096774	2	2	1	5	166	0.036231884057971	0.104166666666667	0.118402282453638	0.879769076305221	0.0301204819277108	0.0289855072463768	4	49	321	2525	0.861608006705367	0.642209545960885	0.210283713986376	Inf	0.669135367072239	1.89986648865154	0.205690986401659	2.14452953339627	0.227334451633517	0.990420104697335	0.207064222358711	0.569230769230769	134	123
TCGA-73-7499-01A-11D-2184-08	0	0	0	0	91	1	0	3	3	87	3567	3	2	1	6	828	0	6	1	7	926	10	5	20	35	868	13	6	20	39	945	9	2	4	15	159	0.164835164835165	0.384615384615385	0.168253968253968	2.28592162554427	0.0943396226415094	3	1	5	9	124	0.0989010989010989	0.257142857142857	0.142857142857143	1.8	0.0725806451612903	0.230769230769231	21	42	283	1530	0.0005132456820426	2.70117272254519	1.64039920577191	Inf	2.13545347467609	3.34244891688431	6.07308960040945e-05	5.88908135893	1.44143109540636	0.166029232895207	1.56914481514483	0.561214940972018	70	66
TCGA-75-5122-01A-01D-1753-08	0	0	0	0	182	1	1	5	6	175	7175	4	9	2	15	1697	6	8	3	17	1670	18	22	31	71	1921	14	26	32	72	1887	7	2	6	15	242	0.0824175824175824	0.208333333333333	0.128245892951775	1.62448347107438	0.0619834710743802	7	4	6	17	266	0.0934065934065934	0.23943661971831	0.13846954711088	1.72916446044689	0.0639097744360902	0.142857142857143	26	69	508	3300	0.000277011488269243	2.44703479120644	1.60336080072947	Inf	2.05155408205553	3.27952755905512	2.78021503305851e-05	5.04918050977299	1.42782152230971	0.130570579050259	1.52828616297338	0.799406794625546	156	149
TCGA-75-5125-01A-01D-1753-08	0	0	0	0	203	5	4	11	15	183	7503	8	11	2	21	1785	7	9	1	17	1877	20	26	31	77	1906	14	22	32	68	1935	7	2	8	17	271	0.083743842364532	0.25	0.140051679586563	1.78505535055351	0.0627306273062731	8	6	8	22	271	0.108374384236453	0.285714285714286	0.142182581322141	2.00948866631523	0.0811808118081181	0.152709359605911	31	66	542	3299	8.49731729171973e-06	2.85786380195505	1.92157610281023	Inf	2.26482672043215	3.12649229433471	2.52055853648037e-05	4.80243907996153	1.79980085515141	0.0133554953683772	2.07161005719025	1	172	152
TCGA-75-5126-01A-01D-1753-08	0	0	1	1	743	13	3	13	16	714	29274	27	25	7	59	7101	33	27	8	68	7248	62	132	107	301	7430	66	133	87	286	7495	35	18	29	82	963	0.110363391655451	0.286713286713287	0.128485657104737	2.23148087634069	0.0851505711318795	32	17	41	90	1074	0.121130551816958	0.299003322259136	0.144549125168237	2.06852391469775	0.0837988826815642	0.184387617765814	137	185	2037	12888	7.75230147758231e-36	4.68481349530581	3.84804584243526	Inf	3.11736752074205	3.83520112297496	7.11034549826361e-25	6.94864649389828	2.64374535019662	6.24182076858204e-15	3.57130402388214	0.82570499414722	606	577
TCGA-75-5146-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	225	0	3	7	10	215	8815	8	8	4	20	2020	6	12	4	22	2136	13	57	14	84	2331	10	59	20	89	2328	1	7	4	12	306	0.0533333333333333	0.134831460674157	0.131443298969072	1.02577660277594	0.0392156862745098	2	3	5	10	287	0.0444444444444444	0.119047619047619	0.123123123123123	0.966898954703833	0.0348432055749129	0.0533333333333333	12	45	593	4066	0.0543532720033431	1.82814736285947	0.985003710402775	Inf	1.65403390432236	1.02478187550407	0.575474306067565	1.02849708986558	2.07970439440532	0.0239404431015043	2.46772100561478	0.088339310120365	213	203
TCGA-75-5147-01A-01D-1625-08	0	0	0	0	57	0	3	1	4	53	2173	1	2	2	5	516	2	3	2	7	536	2	3	13	18	562	8	6	9	23	559	5	0	2	7	81	0.12280701754386	0.304347826086957	0.144901610017889	2.1003757380569	0.0864197530864197	1	1	2	4	72	0.0701754385964912	0.222222222222222	0.128113879003559	1.73456790123457	0.0555555555555556	0.175438596491228	10	22	153	968	0.00946191243335352	2.87217718591643	1.36605463505722	Inf	2.28962418300654	4.39607843137255	0.000911025141184193	9.45707509550002	1.3321449792038	0.357362077516324	1.40548095933398	0.66992140985949	47	43
TCGA-75-6203-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	23	0	0	3	3	20	820	1	1	0	2	176	1	0	0	1	181	0	1	11	12	243	0	0	5	5	220	0	0	0	0	29	0	0	0.131818181818182	0	0	0	0	0	0	21	0	0	0.0864197530864197	0	0	0	0	16	50	413	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	23	20
TCGA-75-6205-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	57	0	1	0	1	56	2296	2	8	3	13	606	3	2	1	6	608	5	5	11	21	542	7	1	8	16	540	1	0	2	3	89	0.0526315789473684	0.1875	0.164814814814815	1.1376404494382	0.0337078651685393	0	1	1	2	88	0.0350877192982456	0.0952380952380952	0.162361623616236	0.586580086580087	0.0227272727272727	0.0701754385964912	4	27	177	905	0.769373847823153	0.757654877037782	0.239926130615481	Inf	0.788773464552579	0.509416195856874	0.882670572384946	0.46507163294758	0.965209634255129	0.623546452524181	0.958714516822927	0.523809523809524	53	52
TCGA-75-6206-01A-11D-1753-08	0	1	0	1	102	3	2	1	3	96	3936	4	6	1	11	999	5	2	0	7	919	10	18	12	40	1023	8	13	17	38	995	2	0	2	4	115	0.0392156862745098	0.105263157894737	0.115577889447236	0.910755148741419	0.0347826086956522	4	4	1	9	149	0.0882352941176471	0.225	0.145650048875855	1.54479865771812	0.0604026845637584	0.0882352941176471	9	38	264	1754	0.158621621532405	1.57315265051362	0.760510522489906	Inf	1.4637330754352	2.5479797979798	0.0237600493204668	3.31912798286415	0.790752351097179	0.750418226261846	0.766699150615536	0.410983981693364	93	87
TCGA-75-6207-01A-11D-1753-08	0	2	0	2	87	0	1	2	3	84	3444	3	7	1	11	823	2	5	1	8	847	8	8	14	30	854	4	8	23	35	920	3	2	4	9	114	0.103448275862069	0.257142857142857	0.123913043478261	2.07518796992481	0.0789473684210526	4	3	1	8	119	0.0919540229885057	0.266666666666667	0.139344262295082	1.91372549019608	0.0672268907563025	0.137931034482759	12	37	233	1541	0.0245914897527482	2.1438490330734	1.13150350560727	Inf	1.86458789524393	4.44134477825465	0.000316519485416916	9.23773503070769	1.02888296021343	0.547528478528012	1.03338205316401	0.720681594686528	75	72
TCGA-75-6211-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	398	8	2	5	7	383	15703	17	14	5	36	3805	21	19	1	41	3885	13	95	44	152	3974	25	86	43	154	4039	8	13	4	25	560	0.0628140703517588	0.162337662337662	0.138648180242634	1.17086038961039	0.0446428571428571	3	17	3	23	566	0.0577889447236181	0.151315789473684	0.142425767488676	1.06241863492654	0.0406360424028269	0.0452261306532663	18	107	1126	6887	0.495322617255499	1.02891724544298	0.641137925445688	Inf	1.02475310834813	2.05999345610919	0.0133357358141844	2.49145199637896	0.572579163349054	0.968903474460411	0.53521437718783	0.433468614771957	380	365
TCGA-75-6212-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	28	0	0	3	3	25	1025	0	2	2	4	240	0	1	0	1	240	0	0	8	8	268	1	2	9	12	277	0	0	0	0	37	0	0	0.133574007220217	0	0	0	0	2	2	42	0.0714285714285714	0.25	0.156716417910448	1.5952380952381	0.0476190476190476	0.0714285714285714	2	16	79	466	0.759047732660761	0.737702850498739	0.118975393057733	Inf	0.766526019690577	0	1	0	0.811615785554728	0.730410659957008	0.786808424613849	0.333333333333333	26	23
TCGA-75-6214-01A-41D-1945-08	0	0	0	0	836	14	4	16	20	802	32882	21	25	7	53	7897	34	24	7	65	7886	86	144	117	347	8363	66	146	125	337	8736	31	13	33	77	1251	0.0921052631578947	0.228486646884273	0.143200549450549	1.59557102092806	0.061550759392486	43	21	42	106	1119	0.126794258373206	0.305475504322767	0.133803658974052	2.28301308547926	0.0947274352100089	0.17822966507177	149	245	2370	14729	2.52262251924284e-31	3.77932093684191	3.1529871247725	Inf	2.72842746685515	3.51245280923829	2.29116407180678e-24	5.89509825068319	2.23598179725913	9.7325301644931e-12	2.79083517113485	1	687	653
TCGA-75-7025-01A-12D-1945-08	0	0	0	0	49	0	1	2	3	46	1886	1	5	1	7	446	0	4	2	6	458	1	1	14	16	484	2	1	14	17	498	0	0	4	4	65	0.0816326530612245	0.235294117647059	0.130522088353414	1.8027149321267	0.0615384615384615	1	1	3	5	76	0.102040816326531	0.3125	0.15702479338843	1.99013157894737	0.0657894736842105	0.163265306122449	8	23	141	841	0.0718118032995464	2.07277174849754	0.916486308616134	Inf	1.79730038892702	2.32151300236407	0.373457096756032	2.9776122002922	1.74113475177305	0.101718963316585	1.98655958135521	0.0152200740436034	41	38
TCGA-75-7027-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	260	7	3	6	9	244	10004	12	10	2	24	2318	17	14	2	33	2394	15	47	30	92	2725	10	64	21	95	2567	0	6	4	10	314	0.0384615384615385	0.105263157894737	0.122321776392676	0.86054307743882	0.0318471337579618	3	2	3	8	334	0.0307692307692308	0.0869565217391304	0.12256880733945	0.709450663889612	0.0239520958083832	0.0384615384615385	10	66	648	4644	0.456951492897256	1.08586963147843	0.563075354468606	Inf	1.07456140350877	0.98	0.606098733776231	0.977275946551305	1.12091503267974	0.436728933685065	1.14010013153378	0.264232986146223	250	234
TCGA-75-7030-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	23	0	0	0	0	23	943	1	2	2	5	214	0	1	0	1	253	1	2	6	9	231	1	1	6	8	245	0	0	0	0	39	0	0	0.159183673469388	0	0	0	1	0	1	33	0.0434782608695652	0.111111111111111	0.142857142857143	0.777777777777778	0.0303030303030303	0	0	14	72	404	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	23	23
TCGA-75-7031-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	242	5	3	10	13	224	9184	6	12	5	23	2283	14	11	7	32	2215	17	36	35	88	2291	16	32	33	81	2395	6	10	5	21	324	0.0867768595041322	0.259259259259259	0.135281837160752	1.91643804298125	0.0648148148148148	7	5	4	16	328	0.0661157024793388	0.181818181818182	0.14316892186818	1.269955654102	0.0487804878048781	0.0909090909090909	22	79	652	4034	0.0219898050403919	1.72275639900614	1.10434872880111	Inf	1.56551053878394	2.83128834355828	0.000290138988737502	4.02030940501725	0.951236015878744	0.617529727352068	0.943799562336677	0.445946401249281	220	202
TCGA-78-7143-01A-11D-2036-08	0	0	0	0	48	0	1	3	4	43	1763	1	1	0	2	405	0	4	0	4	426	7	3	7	17	462	3	3	14	20	470	2	1	2	5	66	0.104166666666667	0.25	0.140425531914894	1.78030303030303	0.0757575757575758	4	0	3	7	64	0.145833333333333	0.411764705882353	0.138528138528139	2.97242647058824	0.109375	0.229166666666667	11	20	130	802	0.00276121618700711	3.38696134403404	1.63475089395158	Inf	2.5439205955335	4.30153846153846	0.00104235421579806	9.21630327143748	1.70695970695971	0.164445465409075	1.9263391519127	1	37	32
TCGA-78-7145-01A-11D-2036-08	0	0	0	0	215	4	0	7	7	204	8364	12	9	1	22	2035	4	7	3	14	2105	12	37	31	80	2093	15	50	23	88	2131	7	5	3	15	296	0.0697674418604651	0.170454545454545	0.138901923979352	1.22715755528256	0.0506756756756757	3	7	4	14	298	0.0651162790697674	0.175	0.142379359770664	1.22911073825503	0.0469798657718121	0.0790697674418605	17	64	594	3630	0.059166961632222	1.62304266882274	0.97502834783082	Inf	1.49245541838134	2.63374485596708	0.00267906069599636	3.59323486807233	0.921810699588477	0.651145732826953	0.910162593824913	0.564807498286014	198	187
TCGA-78-7146-01A-11D-2036-08	0	1	0	1	400	8	2	6	8	384	15744	19	10	6	35	3740	17	12	2	31	3903	36	72	60	168	4041	32	63	55	150	4060	12	9	20	41	563	0.1025	0.273333333333333	0.138669950738916	1.97110716400237	0.0728241563055062	15	9	19	43	528	0.1075	0.255952380952381	0.130660727542687	1.95890827922078	0.0814393939393939	0.165	66	117	1091	7010	2.88352959557542e-14	3.62381523090601	2.75687203883987	Inf	2.67797628886117	2.94828004529034	8.6173621854824e-08	4.23048255391595	2.51814450245088	2.69114119233759e-08	3.29652031865823	0.0819024967745901	334	318
TCGA-78-7147-01A-11D-2036-08	0	0	0	0	388	5	3	11	14	369	15129	18	12	5	35	3623	18	20	3	41	3529	29	60	52	141	4007	33	57	62	152	3970	9	14	18	41	524	0.105670103092784	0.269736842105263	0.131989924433249	2.04361691442346	0.0782442748091603	6	5	11	22	541	0.0567010309278351	0.156028368794326	0.135013725979536	1.15564819548774	0.0406654343807763	0.11340206185567	44	132	1065	6912	3.07791905980279e-05	2.16312144395788	1.58297894727919	Inf	1.87253521126761	1.81213084961381	0.0152407077434414	2.07110581781314	1.90538670620213	0.000443852611793035	2.21400161362449	0.0146623549466332	344	325
TCGA-78-7148-01A-11D-2036-08	0	0	0	0	262	3	1	9	10	249	10209	12	18	0	30	2404	8	16	4	28	2432	21	48	36	105	2633	11	49	26	86	2740	2	4	3	9	349	0.0343511450381679	0.104651162790698	0.127372262773723	0.821616578929833	0.0257879656160458	2	6	5	13	350	0.049618320610687	0.123809523809524	0.132928218761869	0.931401360544218	0.0371428571428571	0.0458015267175573	12	82	699	4674	0.574701687042271	0.978543414472967	0.542265393005305	Inf	0.981280248379143	0.960836909871245	0.61339294925574	0.955245741417386	0.991831648899349	0.567265925473892	0.990623015119982	0.310154563132442	250	237
TCGA-78-7149-01A-11D-2036-08	0	0	0	0	185	2	2	1	3	180	7380	3	5	1	9	1744	7	7	0	14	1788	17	12	41	70	1884	25	24	38	87	1964	18	5	17	40	282	0.216216216216216	0.459770114942529	0.143584521384929	3.2020868998125	0.141843971631206	9	3	18	30	248	0.162162162162162	0.428571428571429	0.131634819532909	3.25576036866359	0.120967741935484	0.335135135135135	62	59	530	3318	1.28326215635305e-21	6.57364625201454	4.74521157733806	Inf	3.7201933572431	4.66738544474394	1.09658650927716e-13	11.2565590115657	3.21662288034392	8.32471532291341e-11	4.97678006028098	0.233538024902598	123	118
TCGA-78-7150-01A-21D-2036-08	0	0	0	0	464	8	1	15	16	440	18040	16	19	7	42	4355	14	17	9	40	4373	46	47	98	191	4616	42	49	76	167	4696	25	8	25	58	675	0.125	0.347305389221557	0.143739352640545	2.41621645597694	0.0859259259259259	23	7	37	67	642	0.144396551724138	0.350785340314136	0.139081455805893	2.52215752475086	0.104361370716511	0.237068965517241	110	152	1317	7995	4.99333654950162e-27	4.39243886926127	3.52247374033084	Inf	2.96857883113947	3.85669910954649	1.40476033469117e-18	7.28075076457525	2.51941455240489	2.24004628204645e-12	3.35991926350241	0.0974466985406115	354	330
TCGA-78-7152-01A-11D-2036-08	0	0	0	0	233	2	5	5	10	221	9061	6	5	1	12	2177	9	8	4	21	2191	19	31	41	91	2325	28	27	42	97	2368	23	4	19	46	349	0.197424892703863	0.474226804123711	0.147381756756757	3.2176764245414	0.131805157593123	15	3	17	35	345	0.150214592274678	0.384615384615385	0.148387096774194	2.59197324414716	0.101449275362319	0.317596566523605	74	56	694	3999	1.77750590616521e-27	7.60838361180607	5.5588292013129	Inf	3.8492795389049	5.46734931632841	2.1841647111287e-23	24.2976269087481	2.93302315891809	6.03459976710138e-10	4.41183393840191	0.874740796706631	159	147
TCGA-78-7153-01A-11D-2036-08	0	1	0	1	146	1	0	5	5	140	5740	7	10	4	21	1407	6	7	2	15	1314	9	11	28	48	1483	13	11	32	56	1536	6	0	6	12	184	0.0821917808219178	0.214285714285714	0.119791666666667	1.7888198757764	0.0652173913043478	6	1	6	13	210	0.089041095890411	0.270833333333333	0.141604855023601	1.91259920634921	0.0619047619047619	0.164383561643836	24	58	394	2625	0.000116184823200865	2.75562721667886	1.75930825194684	Inf	2.24266435557757	4.17951084448546	5.02215726863796e-06	7.98356760218534	1.53248730964467	0.0882404135124286	1.66527476047921	1	122	116
TCGA-78-7154-01A-11D-2036-08	0	0	1	1	294	1	3	5	8	285	11685	4	13	4	21	2840	2	17	2	21	2903	23	21	73	117	2902	32	32	62	126	3040	24	5	18	47	457	0.159863945578231	0.373015873015873	0.150328947368421	2.48133097148414	0.102844638949672	13	2	28	43	401	0.146258503401361	0.367521367521368	0.138180565127498	2.65971822580301	0.107231920199501	0.282312925170068	83	107	858	5084	1.94767781269098e-21	4.5948229438925	3.54186742518178	Inf	3.02530977794136	4.65891078618351	1.35549849944272e-18	12.1714470929159	2.35976862643529	1.44321134988503e-08	3.06178538152487	0.231534485731615	211	202
TCGA-78-7155-01A-11D-2036-08	0	0	1	1	1664	37	5	65	70	1557	63837	89	64	17	170	15333	97	50	21	168	15405	89	375	141	605	16340	107	371	136	614	16759	23	38	30	91	2301	0.0546875	0.148208469055375	0.137299361537085	1.07945490347632	0.0395480225988701	20	57	32	109	2238	0.0655048076923077	0.180165289256198	0.136964504283966	1.3154159188768	0.048704200178731	0.0631009615384615	105	368	4539	28560	4.54853571899492e-07	1.79526974869108	1.48123837652999	Inf	1.61876143193102	1.59980509057556	0.00117102487685112	1.76833776001434	1.63217458321502	6.56514924572789e-05	1.8144342774062	0.0405169669513542	1559	1452
TCGA-78-7156-01A-11D-2036-08	0	0	0	0	374	4	2	9	11	359	14719	13	10	1	24	3507	9	1	2	12	3579	34	44	68	146	3821	43	56	78	177	3812	31	11	36	78	554	0.20855614973262	0.440677966101695	0.145330535152151	3.03224622162394	0.140794223826715	22	8	27	57	561	0.152406417112299	0.39041095890411	0.146820204135043	2.65910922276756	0.101604278074866	0.310160427807487	116	107	1115	6518	1.36852248667383e-37	6.33509480655932	5.00319320211676	Inf	3.56101268877315	4.71200279541087	1.76837063101363e-26	12.897499157297	2.95398365992997	2.2713181531586e-16	4.43609940818348	0.268496662382269	258	243
TCGA-78-7158-01A-11D-2036-08	0	0	0	0	269	4	0	9	9	256	10496	8	10	1	19	2515	11	11	4	26	2438	13	62	35	110	2686	18	47	36	101	2857	7	6	12	25	362	0.0929368029739777	0.247524752475248	0.126706335316766	1.95353098845796	0.069060773480663	5	7	10	22	358	0.0817843866171004	0.2	0.133283693224125	1.50055865921788	0.0614525139664804	0.12639405204461	34	68	720	4823	1.48415191478809e-07	3.34830481355493	2.2902542781239	Inf	2.5662037037037	2.98010752688172	0.00031101027718873	4.22934416898844	2.38548513302034	7.16529608701919e-05	3.00670059011045	0.0526074267285581	235	222
TCGA-78-7159-01A-11D-2036-08	0	0	0	0	335	13	3	10	13	309	12669	19	12	3	34	3102	18	14	4	36	3089	18	74	34	126	3227	13	64	36	113	3251	1	6	8	15	472	0.0447761194029851	0.132743362831858	0.145186096585666	0.914298035098245	0.0317796610169492	4	13	2	19	429	0.0567164179104478	0.150793650793651	0.132940811899597	1.13429163429163	0.0442890442890443	0.0447761194029851	15	86	901	5577	0.436414730832412	1.07962338905652	0.638328652948035	Inf	1.06779046384106	1.15964340696717	0.43692764760871	1.19029589152729	1.02711273188521	0.516561581591903	1.03163106086106	0.241664333019683	320	294
TCGA-78-7160-01A-11D-2036-08	0	0	0	0	53	0	0	2	2	51	2091	0	5	0	5	477	4	6	0	10	541	4	4	7	15	533	6	6	9	21	540	2	0	1	3	76	0.0566037735849057	0.142857142857143	0.140740740740741	1.01503759398496	0.0394736842105263	2	1	0	3	59	0.0566037735849057	0.2	0.110694183864916	1.80677966101695	0.0508474576271186	0.0943396226415094	5	21	135	938	0.228559445332308	1.65341374083313	0.586517553076564	Inf	1.52849002849003	3.17925925925926	0.0293350126700679	4.62177179535905	0.496759259259259	0.883549680354271	0.463457460359316	0.242424242424242	48	46
TCGA-78-7161-01A-11D-2036-08	0	0	0	0	211	6	0	8	8	197	8077	9	9	3	21	1900	9	11	9	29	1922	9	40	26	75	2141	11	34	27	72	2114	3	4	2	9	252	0.042654028436019	0.125	0.119205298013245	1.04861111111111	0.0357142857142857	3	7	4	14	272	0.0663507109004739	0.186666666666667	0.12704343764596	1.4693137254902	0.0514705882352941	0.0568720379146919	12	61	524	3731	0.186060283388131	1.40057368228521	0.766070216457339	Inf	1.3348321656384	2.43606870229008	0.0297312400599788	3.05037600206737	0.91927120841135	0.649796904055341	0.908969276884041	1	199	185
TCGA-78-7162-01A-21D-2063-08	0	0	0	0	102	2	1	2	3	97	3977	5	5	2	12	979	2	5	2	9	976	9	9	18	36	976	6	14	20	40	1046	2	1	5	8	132	0.0784313725490196	0.2	0.126195028680688	1.58484848484849	0.0606060606060606	4	1	4	9	127	0.0882352941176471	0.25	0.130122950819672	1.92125984251969	0.0708661417322835	0.147058823529412	15	38	259	1763	0.00249738228776046	2.68519471208204	1.50665941595095	Inf	2.20951409630655	3.12277992277992	0.00822844675276494	4.53283657970897	1.8490144279618	0.0496135768844585	2.11152497664893	0.490528929083845	87	82
TCGA-78-7163-01A-12D-2063-08	0	0	0	0	28	0	1	1	2	26	1066	0	1	1	2	268	0	1	2	3	257	2	1	7	10	275	2	4	5	11	266	0	0	0	0	30	0	0	0.112781954887218	0	0	0	0	0	0	29	0	0	0.105454545454545	0	0	0	0	16	59	482	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	28	26
TCGA-78-7166-01A-12D-2063-08	0	0	0	0	249	5	2	6	8	236	9676	22	9	6	37	2422	10	11	3	24	2271	9	54	21	84	2440	8	61	22	91	2543	1	3	3	7	346	0.0281124497991968	0.0769230769230769	0.136059771922926	0.565362383281458	0.0202312138728324	0	9	5	14	327	0.0562248995983936	0.166666666666667	0.134016393442623	1.24362895005097	0.0428134556574924	0.036144578313253	9	51	673	4310	0.424329765373875	1.13008632753069	0.558627356562163	Inf	1.11062407132244	0.435538851498995	0.915055386231086	0.400311672724313	1.37751822799682	0.219666246810627	1.46367655117513	0.0204857765833376	240	227
TCGA-78-7167-01A-11D-2063-08	0	0	0	0	114	2	2	4	6	106	4346	2	3	2	7	1061	5	6	0	11	1037	10	10	23	43	1153	6	14	25	45	1095	3	1	9	13	151	0.114035087719298	0.288888888888889	0.137899543378995	2.09492273730684	0.0860927152317881	7	0	6	13	160	0.114035087719298	0.302325581395349	0.138768430182134	2.17863372093023	0.08125	0.219298245614035	25	39	311	1937	8.70595572420104e-07	3.98924972102338	2.48565881293993	Inf	2.82355305466238	4.51768488745981	1.04350364564077e-05	10.3616763362929	2.2588424437299	0.00177777603957387	2.82927246522677	0.266831211274679	89	81
TCGA-78-7220-01A-11D-2036-08	0	0	0	0	920	17	4	27	31	872	35752	49	27	12	88	8322	42	29	12	83	8535	46	212	106	364	9327	61	165	111	337	9568	18	22	24	64	1293	0.0695652173913043	0.189910979228487	0.135137959866221	1.40531187104266	0.0494972931167827	14	28	36	78	1209	0.0847826086956522	0.214285714285714	0.129623673206819	1.65313718539525	0.0645161290322581	0.1	92	232	2502	16393	1.00343765105968e-12	2.59783245462675	2.09408568478911	Inf	2.14438325882504	2.25852962489821	5.80304239163544e-06	2.79529016777843	2.08809910596868	1.96378279781484e-08	2.50373092491205	0.000579758874078923	828	780
TCGA-78-7535-01A-11D-2063-08	0	1	0	1	195	6	2	3	5	184	7544	8	13	6	27	1775	11	7	8	26	1791	10	39	23	72	1991	6	34	19	59	1987	1	2	4	7	264	0.0358974358974359	0.11864406779661	0.13286361348767	0.892976373908577	0.0265151515151515	2	4	2	8	251	0.041025641025641	0.111111111111111	0.126067302862883	0.881363435148296	0.0318725099601594	0.0461538461538462	9	49	515	3463	0.336658828155629	1.23499560612184	0.608530374181898	Inf	1.19859390693003	1.44830097087379	0.344654608995972	1.55154857934904	1.10346740638003	0.466862772856763	1.1206468301239	0.426986506746627	186	175
TCGA-78-7536-01A-11D-2063-08	0	0	1	1	666	13	2	17	19	634	25994	32	32	10	74	6018	38	23	7	68	6432	31	144	78	253	6788	45	138	56	239	6756	4	15	11	30	932	0.045045045045045	0.125523012552301	0.137951450562463	0.909907159660244	0.0321888412017167	1	12	15	28	840	0.042042042042042	0.110671936758893	0.123747790218032	0.89433465085639	0.0333333333333333	0.0465465465465465	31	179	1772	11772	0.265167337416788	1.15048685173423	0.809586305050084	Inf	1.12830269805439	0.502851372222882	0.97684214243784	0.467861591973755	1.48303628583943	0.0257304835979229	1.59924929584133	1.55083547537508e-05	635	603
TCGA-78-7537-01A-11D-2063-08	0	0	1	1	160	0	2	11	13	147	6027	15	2	0	17	1484	8	5	2	15	1375	10	26	19	55	1528	9	32	19	60	1640	1	3	4	8	194	0.05	0.133333333333333	0.118292682926829	1.12714776632302	0.0412371134020619	3	1	6	10	207	0.0625	0.181818181818182	0.135471204188482	1.34211682037769	0.0483091787439614	0.0875	14	43	401	2767	0.0110833042136689	2.24585195005419	1.25512881579373	Inf	1.9404121275758	1.66321039506497	0.21482435907375	1.83961479678368	2.07901299383121	0.0181905015292649	2.46340359271017	0.0858022601602424	146	133
TCGA-78-7539-01A-11D-2063-08	0	0	0	0	551	10	2	11	13	528	21648	12	19	3	34	5191	15	14	3	32	5411	73	47	95	215	5433	89	57	101	247	5613	68	8	42	118	819	0.214156079854809	0.477732793522267	0.145911277391769	3.27413207575151	0.144078144078144	52	10	42	104	794	0.188747731397459	0.483720930232558	0.146143935210749	3.30989397223361	0.130982367758186	0.370235934664247	204	154	1613	9433	2.37094546600462e-73	7.74448313087645	6.42639489518996	Inf	3.90227446688394	5.07267341737274	2.68022762741406e-63	16.7016450595862	2.93490390576565	4.11587035825407e-21	4.38548013625308	0.000839077101414039	347	324
TCGA-78-7540-01A-11D-2063-08	0	1	0	1	36	0	1	0	1	35	1435	0	0	0	0	323	1	1	0	2	352	1	2	14	17	360	1	3	12	16	400	0	1	1	2	47	0.0555555555555556	0.125	0.1175	1.06382978723404	0.0425531914893617	1	1	1	3	36	0.0833333333333333	0.176470588235294	0.1	1.76470588235294	0.0833333333333333	0.0833333333333333	3	25	83	677	0.606646152320255	0.978820637801162	0.245997830543474	Inf	0.981067125645439	4.57831325301205	0.208449305203472	8.11334899201292	0.704355885078777	0.793107502032702	0.680009001220669	1	33	32
TCGA-78-7542-01A-21D-2063-08	0	1	0	1	420	12	3	12	15	393	16113	23	12	4	39	3826	18	10	3	31	3807	11	90	50	151	4233	20	92	60	172	4247	5	11	19	35	528	0.0833333333333333	0.203488372093023	0.124323051565811	1.63677105355884	0.0662878787878788	3	17	11	31	549	0.0738095238095238	0.205298013245033	0.129695251594614	1.58292621141389	0.0564663023679417	0.0904761904761905	38	103	1077	7403	5.45380502072656e-06	2.53544710347897	1.8026805882312	Inf	2.121996351831	2.03192859496211	0.036459466069337	2.39060979519256	2.14737908331223	3.80258508527975e-05	2.57745466840903	3.80227116621351e-05	382	355
TCGA-78-7633-01A-11D-2063-08	0	0	0	0	116	4	2	5	7	105	4305	5	2	2	9	1014	2	9	0	11	1039	7	25	17	49	1137	8	18	10	36	1115	2	5	1	8	160	0.0689655172413793	0.222222222222222	0.143497757847534	1.54861111111111	0.05	2	3	1	6	146	0.0517241379310345	0.122448979591837	0.128408091468777	0.953592395862454	0.0410958904109589	0.0517241379310345	6	36	306	1946	0.516783764484971	1.05989935278407	0.432152558855766	Inf	1.05135387488329	1.96252723311547	0.137828288439576	2.31140606037857	0.545146453643186	0.89786568353732	0.508877636464718	0.648309178743961	110	99
TCGA-78-8640-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	819	11	5	16	21	787	32267	38	24	11	73	7837	43	46	13	102	7848	61	143	95	299	8126	73	139	101	313	8456	25	17	33	75	1169	0.0915750915750916	0.23961661341853	0.138245033112583	1.73327466472805	0.0641573994867408	18	19	21	58	1130	0.0708180708180708	0.193979933110368	0.139059808023628	1.39493888181845	0.0513274336283186	0.118437118437118	97	233	2299	14283	4.36014490097961e-13	2.58611145634952	2.09292707655439	Inf	2.12009701187605	2.31452351119565	6.78462090601765e-08	2.9354065940227	1.98717277254529	4.79829009965738e-07	2.36239071383327	0.202612377892737	722	690
TCGA-78-8648-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	16	1	0	0	0	15	615	1	1	1	3	134	0	0	1	1	128	2	2	4	8	186	0	1	2	3	167	0	0	0	0	15	0	0	0.0898203592814371	0	0	0	0	0	0	22	0	0	0.118279569892473	0	0	0	0	8	37	316	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	16	15
TCGA-78-8655-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	124	2	0	9	9	113	4633	4	6	2	12	1069	6	8	2	16	1098	4	22	16	42	1213	3	22	18	43	1253	2	2	1	5	157	0.0403225806451613	0.116279069767442	0.125299281723863	0.928010665086654	0.0318471337579618	1	2	2	5	138	0.0403225806451613	0.119047619047619	0.113767518549052	1.04641131815045	0.036231884057971	0.0483870967741935	6	35	295	2171	0.369015999895103	1.26146999951611	0.513470954486883	Inf	1.22331541959487	3.58256658595642	0.0418590172561743	5.51299678619145	0.737587238285145	0.789828445527259	0.712278009323802	1	118	107
TCGA-78-8660-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	286	8	2	6	8	270	11070	19	12	2	33	2665	8	13	8	29	2704	16	46	40	102	2803	24	42	40	106	2898	8	7	11	26	407	0.0909090909090909	0.245283018867925	0.140441683919945	1.74651152009643	0.0638820638820639	5	11	13	29	401	0.101398601398601	0.284313725490196	0.14306100606493	1.98736003129431	0.0723192019950125	0.129370629370629	37	83	808	4893	3.2014477428496e-06	2.69905326619881	1.88945177496684	Inf	2.1755053630363	2.29310024752475	0.00272446164921893	2.91494369717789	2.11670792079208	0.000237862163176349	2.5946376760313	0.0428637187290326	249	233
TCGA-78-8662-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	1274	29	5	21	26	1219	49979	83	51	18	152	11833	75	62	12	149	11993	79	250	124	453	13187	66	279	120	465	12966	19	36	25	80	1736	0.0627943485086342	0.172043010752688	0.133888631806263	1.28497101233834	0.0460829493087558	17	27	17	61	1664	0.0478806907378336	0.134657836644592	0.126184879047547	1.06714717057225	0.0366586538461538	0.0612244897959184	78	311	3400	22753	7.44654200579901e-05	1.67834943096198	1.34449662340714	Inf	1.5423665507334	1.90975253549696	8.96560903099351e-05	2.21013535043387	1.32404291224687	0.0358144900159918	1.39139489424769	0.505795696949158	1196	1141
TCGA-80-5607-01A-31D-1945-08	0	0	0	0	150	2	3	1	4	144	5904	2	6	3	11	1469	1	2	1	4	1468	19	7	30	56	1430	22	8	43	73	1537	18	3	23	44	219	0.293333333333333	0.602739726027397	0.142485361093038	4.2301870269594	0.200913242009132	18	6	21	45	259	0.3	0.803571428571429	0.181118881118881	4.43670711527854	0.173745173745174	0.533333333333333	80	34	478	2489	1.09366446836894e-35	12.2319919597946	8.51449735331772	Inf	4.35586875137635	5.45014797428309	2.67919558770607e-23	37.4505926016905	3.74127357138763	6.20414004762522e-17	7.89311203097113	0.291522277953472	70	64
TCGA-80-5608-01A-31D-1945-08	0	0	1	1	191	1	2	3	5	185	7585	8	6	1	15	1833	15	8	1	24	1845	11	44	25	80	1953	12	39	15	66	1954	2	7	1	10	260	0.0523560209424084	0.151515151515152	0.133060388945752	1.13869463869464	0.0384615384615385	2	5	4	11	267	0.0575916230366492	0.1375	0.136712749615975	1.00575842696629	0.0411985018726592	0.0471204188481675	9	54	527	3380	0.483124206761124	1.06894324667319	0.529153003352952	Inf	1.05909460558417	1.28933256331986	0.378280068216013	1.35012728530461	0.926707779886148	0.642683744914889	0.916240295151602	1	182	176
TCGA-80-5611-01A-01D-1625-08	0	0	1	1	238	2	2	10	12	224	9184	11	18	3	32	2157	14	14	8	36	2296	15	25	31	71	2358	14	34	37	85	2373	4	6	3	13	332	0.0546218487394958	0.152941176470588	0.139907290349768	1.09316087880936	0.0391566265060241	1	4	4	9	296	0.0378151260504202	0.126760563380282	0.125530110262935	1.0098020555767	0.0304054054054054	0.0504201680672269	12	85	628	4103	0.648118758875138	0.922367121470454	0.511507434015665	Inf	0.931971895725261	1.29886887766308	0.340565799464386	1.36103185609378	0.775501124016486	0.814105023444354	0.749779971072929	0.736039848915629	226	212
TCGA-83-5908-01A-21D-2284-08	0	0	0	0	283	3	0	8	8	272	11152	6	10	5	21	2659	10	8	3	21	2566	32	42	37	111	2958	37	47	35	119	2969	16	8	16	40	380	0.141342756183746	0.336134453781513	0.127989221960256	2.62627156125608	0.105263157894737	21	3	8	32	382	0.113074204946996	0.288288288288288	0.129141311697093	2.23234753077685	0.0837696335078534	0.215547703180212	61	80	762	5165	1.89398970368841e-18	5.1662107615558	3.81497336945978	Inf	3.36504346531152	4.17092700368976	1.31453313904559e-15	7.83442321610459	2.59273840769904	7.36916288147542e-06	3.38815840320118	0.0425892636563898	222	211
TCGA-86-6562-01A-11D-1753-08	0	0	0	0	66	1	1	0	1	64	2624	2	2	0	4	639	1	5	1	7	678	7	5	14	26	650	8	6	13	27	657	4	2	3	9	115	0.136363636363636	0.333333333333333	0.175038051750381	1.90434782608696	0.0782608695652174	4	1	3	8	88	0.121212121212121	0.307692307692308	0.135384615384615	2.27272727272727	0.0909090909090909	0.212121212121212	14	28	203	1104	0.00399060642337275	2.71639626028785	1.45629130338706	Inf	2.14614121510673	3.43382594417077	0.000864630918451459	6.20197270529418	1.43076081007115	0.238461620276607	1.55324140821303	0.728282095511384	52	50
TCGA-86-6851-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	1044	20	8	24	32	992	40672	56	38	8	102	9712	45	45	9	99	10074	82	213	92	387	10464	97	220	87	404	10422	49	24	17	90	1541	0.0862068965517241	0.222772277227723	0.147860295528689	1.50664028115985	0.0584036340038936	40	30	24	94	1448	0.0900383141762452	0.242894056847545	0.138379204892966	1.75527859865519	0.0649171270718232	0.124521072796935	130	228	2989	17897	1.33054423032163e-24	3.41373011800531	2.82036251028686	Inf	2.53740437469978	3.4742921438197	7.87669665728304e-29	5.92031560643058	1.60051660557986	0.00144989553024023	1.77886919493085	2.36558548531559e-07	914	862
TCGA-86-7701-01A-11D-2167-08	0	0	0	0	231	6	2	8	10	215	8815	10	13	7	30	2113	12	11	3	26	2097	9	44	26	79	2284	12	39	29	80	2321	2	5	3	10	302	0.0432900432900433	0.125	0.130116329168462	0.96067880794702	0.033112582781457	1	7	2	10	289	0.0432900432900433	0.126582278481013	0.126532399299475	1.00039420086724	0.0346020761245675	0.0346320346320346	8	68	591	4014	0.774317335331813	0.799080041102953	0.381909826632537	Inf	0.820197702377772	1.11312545322698	0.517610922499358	1.1319216310128	0.708352561144439	0.849946953223814	0.679237339501136	0.694764694764695	223	207
TCGA-86-7711-01A-11D-2063-08	0	0	0	0	270	4	2	10	12	254	10414	8	15	3	26	2411	17	10	3	30	2491	25	36	31	92	2787	22	43	41	106	2725	7	9	11	27	342	0.1	0.254716981132075	0.125504587155963	2.02954319761668	0.0789473684210526	10	2	7	19	345	0.0703703703703704	0.206521739130435	0.123789020452099	1.66833648393195	0.0550724637681159	0.12962962962963	35	84	687	4825	1.06391983224645e-06	2.92558193881945	2.03189489714509	Inf	2.35979107800325	2.90204094273592	3.11156739769703e-05	3.97878483722683	2.00582241630277	0.00291721940563453	2.34059919348479	1	235	219
TCGA-86-7713-01A-11D-2063-08	0	1	2	3	177	3	0	9	9	165	6765	6	10	6	22	1598	8	5	4	17	1637	9	30	23	62	1718	7	35	22	64	1812	2	7	2	11	236	0.0621468926553672	0.171875	0.130242825607064	1.31965042372881	0.0466101694915254	2	3	2	7	223	0.0395480225988701	0.112903225806452	0.129802095459837	0.869810501952842	0.031390134529148	0.0451977401129944	8	53	459	3071	0.547893168139847	1.0099044221259	0.477363631781061	Inf	1.00860745026608	1.92265795206972	0.1461124605085	2.22954654998827	0.683611716291455	0.853031796116556	0.652811962705146	1	169	157
TCGA-86-7714-01A-12D-2167-08	0	0	0	0	97	1	1	6	7	89	3649	7	7	2	16	883	7	5	1	13	852	1	15	18	34	903	5	8	13	26	1011	1	1	1	3	121	0.0309278350515464	0.115384615384615	0.119683481701286	0.964081373172282	0.0247933884297521	0	1	3	4	126	0.0412371134020619	0.117647058823529	0.13953488372093	0.843137254901961	0.0317460317460317	0.0515463917525773	5	32	247	1667	0.531032066663333	1.05451259355626	0.387839679599046	Inf	1.04716052084473	1.2914979757085	0.564381841530384	1.34955946079596	0.999869400548518	0.581681501323138	0.999871481814677	0.265734265734266	92	84
TCGA-86-7953-01A-11D-2184-08	0	0	0	0	66	1	1	2	3	62	2542	4	4	2	10	625	2	3	2	7	642	4	6	15	25	612	3	10	7	20	663	1	1	2	4	97	0.0606060606060606	0.2	0.14630467571644	1.36701030927835	0.0412371134020619	0	0	3	3	93	0.0454545454545455	0.12	0.151960784313725	0.789677419354839	0.032258064516129	0.0909090909090909	6	23	190	1085	0.262040044421525	1.48918094470978	0.586204036393037	Inf	1.38838475499093	0.958646616541353	0.677665317877062	0.951782988864876	1.52511961722488	0.22622689081531	1.67876795097215	0.102564102564103	60	56
TCGA-86-7954-01A-11D-2184-08	0	0	0	0	269	4	2	3	5	260	10660	12	13	4	29	2557	7	15	3	25	2604	17	39	43	99	2696	15	41	51	107	2803	9	8	12	29	394	0.107806691449814	0.271028037383178	0.140563681769533	1.92815124057118	0.0736040609137056	8	7	7	22	351	0.0817843866171004	0.222222222222222	0.130192878338279	1.70686926242482	0.0626780626780627	0.133828996282528	36	90	745	4754	1.04520671002704e-05	2.55183540158425	1.78614810376987	Inf	2.10891658676894	3.92126677852349	1.45738702329299e-07	7.22716937714145	1.49194630872483	0.0485462666362764	1.61640197258742	0.836046451350002	233	224
TCGA-86-7955-01A-11D-2184-08	0	0	0	0	342	10	4	12	16	316	12956	15	19	4	38	3115	20	15	4	39	3199	22	59	42	123	3342	25	48	43	116	3300	6	8	8	22	467	0.064327485380117	0.189655172413793	0.141515151515152	1.34017573654286	0.0471092077087794	5	7	9	21	451	0.0614035087719298	0.170731707317073	0.134949132256134	1.26515602184847	0.0465631929046563	0.0818713450292398	28	104	918	5724	0.0139842161428566	1.67857542777014	1.13910054986393	Inf	1.53475935828877	1.69336670838548	0.0533310796148394	1.90490563217198	1.44705882352941	0.0744204825464787	1.55869848901628	0.249724728492636	314	288
TCGA-86-8054-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	258	5	3	8	11	242	9922	13	9	4	26	2340	9	11	4	24	2390	13	50	26	89	2628	19	56	28	103	2564	5	10	7	22	370	0.0852713178294574	0.213592233009709	0.144305772230889	1.48013644712674	0.0594594594594595	0	4	5	9	339	0.0348837209302326	0.101123595505618	0.128995433789954	0.783931589937357	0.0265486725663717	0.0658914728682171	17	69	709	4483	0.0749505081989587	1.55768070818247	0.940085628694411	Inf	1.44756781579034	1.14421720733427	0.449059727386151	1.17086869958503	1.62733113931986	0.0590745599086951	1.8063173610918	0.0860130139090089	241	225
TCGA-86-8055-01A-11D-2238-08	0	1	0	1	69	2	2	0	2	65	2665	2	3	3	8	631	2	3	5	10	602	3	3	24	30	728	5	1	11	17	704	2	0	1	3	79	0.0434782608695652	0.176470588235294	0.112215909090909	1.57259865971705	0.0379746835443038	0	2	1	3	90	0.0434782608695652	0.1	0.123626373626374	0.808888888888889	0.0333333333333333	0.0579710144927536	4	39	169	1263	0.762561922545958	0.766625583187468	0.247434808010491	Inf	0.788220723820008	2.11834319526627	0.243955650738964	2.48882940692555	0.484192730346577	0.928946955477362	0.453113520856241	1	65	61
TCGA-86-8056-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	347	3	3	4	7	337	13817	6	10	4	20	3253	10	8	2	20	3420	28	44	66	138	3565	43	34	82	159	3579	30	5	34	69	516	0.198847262247839	0.433962264150943	0.1441743503772	3.0099824484423	0.133720930232558	21	7	32	60	510	0.172910662824208	0.434782608695652	0.143057503506311	3.03921568627451	0.117647058823529	0.337175792507205	117	102	1026	6118	5.82190026092652e-40	6.83700781313971	5.38485506428074	Inf	3.71993911719939	5.00156494522692	2.91547302212422e-27	15.195362674058	3.10510510510511	2.74883248049169e-18	4.79804051476164	0.0797749151375281	230	220
TCGA-86-8073-01A-11D-2238-08	0	1	1	2	1772	54	11	27	38	1680	68880	107	60	14	181	16281	81	64	14	159	16452	76	418	163	657	18091	98	429	156	683	18056	28	49	30	107	2394	0.0603837471783296	0.156661786237189	0.132587505538325	1.18157277038374	0.0446950710108605	16	48	39	103	2435	0.0581264108352144	0.156773211567732	0.134597313581339	1.16475735953669	0.042299794661191	0.0637697516930023	113	380	4829	31318	7.28933835713534e-09	1.92860858377385	1.60131156664668	Inf	1.71572064819673	1.89285994815804	1.92165405121505e-05	2.1949997286261	1.61909921185419	3.65320839648888e-05	1.78993303281429	0.00811217783673269	1659	1567
TCGA-86-8074-01A-11D-2238-08	0	1	0	1	82	0	0	4	4	78	3198	2	6	3	11	744	1	7	5	13	774	4	9	14	27	831	8	7	12	27	849	3	2	3	8	134	0.0975609756097561	0.296296296296296	0.157832744405183	1.87728026533997	0.0597014925373134	0	0	2	2	98	0.024390243902439	0.0740740740740741	0.117930204572804	0.6281179138322	0.0204081632653061	0.0975609756097561	8	30	232	1448	0.149666102639226	1.66377808937419	0.75710633503277	Inf	1.52450090744102	1.81034482758621	0.226156550607937	2.07933347331774	1.39257294429708	0.288853105287948	1.48564323151247	0.649916646820672	74	70
TCGA-86-8075-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	62	1	0	6	6	55	2255	2	1	0	3	526	2	2	3	7	528	4	4	19	27	616	3	1	14	18	585	2	0	1	3	67	0.0483870967741935	0.166666666666667	0.114529914529915	1.45522388059701	0.0447761194029851	0	1	2	3	76	0.0483870967741935	0.111111111111111	0.123376623376623	0.900584795321637	0.0394736842105263	0.0806451612903226	5	35	143	1058	0.529396334550831	1.05690870982563	0.388252237241024	Inf	1.04982517482517	2.3996003996004	0.201002779927069	2.95557939083945	0.763509218054673	0.769635698256665	0.74002243106856	1	57	50
TCGA-86-8076-01A-31D-2238-08	0	0	0	0	89	0	0	5	5	84	3444	4	3	0	7	765	1	4	2	7	844	10	7	16	33	875	7	10	20	37	960	4	2	5	11	124	0.123595505617978	0.297297297297297	0.129166666666667	2.30165649520488	0.0887096774193548	6	1	2	9	114	0.101123595505618	0.272727272727273	0.130285714285714	2.0933014354067	0.0789473684210526	0.191011235955056	17	36	238	1597	0.000332766315492235	3.16589810182776	1.81772638149768	Inf	2.47304582210243	4.53534354918438	1.28427191866056e-05	9.56367290906009	1.49918300653595	0.18243933587137	1.61917522559993	0.523107089291739	72	67
TCGA-86-8278-01A-11D-2284-08	0	0	1	1	128	1	0	0	0	127	5207	3	4	0	7	1327	1	2	1	4	1303	20	1	31	52	1292	22	4	38	64	1285	17	3	21	41	211	0.3203125	0.640625	0.16420233463035	3.90143661137441	0.194312796208531	18	0	15	33	222	0.2578125	0.634615384615385	0.171826625386997	3.69334719334719	0.148648648648649	0.5546875	71	40	433	2144	6.72473182482626e-27	8.77689542883098	6.16535342054238	Inf	3.80681605392922	4.95958429561201	1.76495642301919e-20	24.7111874536702	3.10513103725274	4.42435355686245e-11	5.39666946485762	1	57	56
TCGA-86-8279-01A-11D-2284-08	0	0	0	0	568	17	4	8	12	539	22099	42	27	8	77	5213	30	26	4	60	5314	21	126	41	188	5752	28	133	53	214	5820	8	20	11	39	760	0.0686619718309859	0.182242990654206	0.130584192439863	1.39559763895721	0.0513157894736842	2	16	5	23	711	0.0404929577464789	0.122340425531915	0.123609179415855	0.989735763234282	0.0323488045007032	0.0457746478873239	26	117	1471	10101	0.0389530324867104	1.52587595968132	1.02857382715082	Inf	1.43031951053705	1.60546067509261	0.0867428755404664	1.76059856240304	1.33902252050277	0.138237643826325	1.40851449445916	0.269879361841515	542	513
TCGA-86-8280-01A-11D-2284-08	0	1	0	1	64	1	1	3	4	59	2419	2	4	1	7	516	0	4	2	6	539	4	5	18	27	706	2	3	14	19	658	0	1	1	2	67	0.03125	0.105263157894737	0.101823708206687	1.03377847604085	0.0298507462686567	1	0	1	2	72	0.03125	0.0740740740740741	0.101983002832861	0.726337448559671	0.0277777777777778	0.046875	3	35	139	1225	0.758265174236922	0.755531793256665	0.194663083978271	Inf	0.774706550549034	1.63549160671463	0.476924348344681	1.7616779663162	0.613309352517986	0.850900281944406	0.587713116213556	1	61	56
TCGA-86-8281-01A-11D-2284-08	0	0	0	0	312	8	3	8	11	293	12013	12	12	2	26	2818	11	11	1	23	2803	20	63	35	118	3214	22	61	43	126	3178	10	12	8	30	395	0.0961538461538462	0.238095238095238	0.124292007551919	1.91561181434599	0.0759493670886076	10	11	4	25	398	0.0801282051282051	0.211864406779661	0.123833229620411	1.71088493314028	0.0628140703517588	0.102564102564103	32	88	793	5599	2.33434140253736e-05	2.56712997567705	1.76556253763857	Inf	2.1494745691467	3.83834744490482	2.87710469729225e-08	6.41559421546743	1.24008148220002	0.25928318329413	1.2836767784427	0.141078321059635	280	261
TCGA-86-8358-01A-11D-2323-08	0	0	0	0	1209	25	10	18	28	1156	47396	68	38	16	122	11060	78	47	10	135	11256	74	258	107	439	12286	62	270	128	460	12794	14	27	12	53	1616	0.04383788254756	0.115217391304348	0.126309207440988	0.912185213086526	0.0327970297029703	9	24	15	48	1601	0.0397022332506203	0.109339407744875	0.130310923001791	0.839065561245179	0.0299812617114304	0.0413564929693962	50	321	3217	21863	0.37807260748303	1.05859197583293	0.808566728774769	Inf	1.05068508186378	1.31845526522701	0.101279620179948	1.38324983401307	0.895720209789747	0.756981357766534	0.882161169957344	0.62504904017833	1159	1106
TCGA-86-8359-01A-11D-2323-08	0	0	0	0	191	3	4	8	12	176	7216	10	7	2	19	1752	15	6	3	24	1670	9	37	23	69	1836	6	40	18	64	1958	1	3	2	6	252	0.031413612565445	0.09375	0.128702757916241	0.728422619047619	0.0238095238095238	3	2	5	10	248	0.0523560209424084	0.144927536231884	0.135076252723312	1.07293127629734	0.0403225806451613	0.0575916230366492	11	45	500	3294	0.11481297533237	1.61015706713924	0.844432521609235	Inf	1.4905	2.02346666666667	0.126086395846604	2.39475813154948	1.29551219512195	0.293938130267015	1.35623005982825	0.45779368380326	180	165
TCGA-86-8585-01A-11D-2393-08	0	1	0	1	639	6	8	22	30	603	24723	37	20	9	66	5960	22	24	7	53	6059	57	106	62	225	6323	57	127	75	259	6381	21	21	23	65	914	0.101721439749609	0.250965250965251	0.143237737031813	1.75208891292042	0.0711159737417943	26	14	14	54	868	0.0845070422535211	0.24	0.137276609204492	1.74829493087558	0.0622119815668203	0.131455399061033	84	167	1782	10922	1.25607032445358e-14	3.08251019013934	2.43639977662453	Inf	2.38582370853287	2.93917734853407	1.55210382033107e-12	4.29905890235721	1.92536885480924	5.61572482544056e-05	2.26756715344735	0.222073296706693	555	519
TCGA-86-8668-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	44	0	0	1	1	43	1763	4	1	2	7	386	2	2	1	5	427	3	3	11	17	468	1	3	10	14	482	0	0	2	2	58	0.0454545454545455	0.142857142857143	0.120331950207469	1.1871921182266	0.0344827586206897	2	0	2	4	56	0.0909090909090909	0.235294117647059	0.11965811965812	1.96638655462185	0.0714285714285714	0.136363636363636	6	19	114	836	0.0756434644579183	2.31313527628929	0.888697343198533	Inf	2	4.16666666666667	0.0746070970533778	7.30433615420952	1.58730158730159	0.245348944879004	1.72431204660803	0.567099567099567	38	37
TCGA-86-8669-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	156	1	2	9	11	144	5904	12	11	3	26	1458	9	5	2	16	1327	5	23	29	57	1614	6	21	18	45	1505	0	4	0	4	154	0.0256410256410256	0.0888888888888889	0.102325581395349	0.868686868686869	0.025974025974026	3	4	3	10	186	0.0641025641025641	0.175438596491228	0.115241635687732	1.52235427277872	0.0537634408602151	0.0384615384615385	6	52	340	2779	0.617106470752716	0.943111533182099	0.391629889623365	Inf	0.948985801217039	2.50187165775401	0.110704058776406	3.06335391062951	0.585544430538173	0.898262777017712	0.557368922566018	1	150	138
TCGA-86-8671-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	71	0	1	1	2	69	2829	0	4	2	6	705	2	5	1	8	662	8	3	15	26	671	7	5	17	29	791	2	3	2	7	120	0.0985915492957746	0.241379310344828	0.151706700379267	1.59109195402299	0.0583333333333333	7	1	4	12	96	0.169014084507042	0.461538461538462	0.143070044709389	3.22596153846154	0.125	0.211267605633803	15	32	216	1246	0.00287530409899355	2.70140387585936	1.49124565484741	Inf	2.16016548463357	4.06111111111111	8.23514160411124e-05	8.63185625548092	1.26909722222222	0.336355661793915	1.33091491846714	0.507678201004119	56	54
TCGA-86-8672-01A-21D-2393-08	0	0	0	0	354	8	4	9	13	333	13653	9	17	6	32	3277	9	8	5	22	3225	24	58	56	138	3540	31	68	42	141	3611	6	15	12	33	479	0.0932203389830508	0.234042553191489	0.132650235391858	1.76435837071914	0.0688935281837161	6	9	15	30	475	0.0847457627118644	0.217391304347826	0.134180790960452	1.62013729977117	0.0631578947368421	0.110169491525424	39	114	954	6197	5.24267612428049e-05	2.22193549511046	1.59091529719367	Inf	1.91069593455831	1.63544882790166	0.0571841205439393	1.81259739150307	2.06517135155949	0.000171906290974939	2.46980575732919	0.00657973074295078	315	294
TCGA-86-8673-01A-11D-2393-08	0	1	1	2	559	13	1	24	25	521	21361	38	21	6	65	5068	31	18	9	58	5135	31	95	56	182	5425	41	105	70	216	5733	12	11	12	35	763	0.0626118067978533	0.162037037037037	0.133089133089133	1.21750764525994	0.0458715596330275	10	16	13	39	756	0.0697674418604651	0.214285714285714	0.139354838709677	1.53769841269841	0.0515873015873016	0.0840787119856887	47	151	1519	9639	0.000101590708686894	1.97504460873749	1.46634155914552	Inf	1.74365777591584	2.24449564772145	0.000168188013092835	2.79171760422894	1.45746470631263	0.0338386340272036	1.57061945267049	0.724204234943032	512	474
TCGA-86-8674-01A-21D-2393-08	0	1	0	1	338	15	4	12	16	307	12587	5	6	5	16	2993	21	12	3	36	3053	20	70	31	121	3240	17	73	44	134	3301	6	9	17	32	453	0.0946745562130177	0.238805970149254	0.137231142078158	1.74017330565714	0.0706401766004415	4	8	11	23	430	0.0680473372781065	0.190082644628099	0.132716049382716	1.43225062463963	0.0534883720930233	0.112426035502959	38	74	883	5658	4.48760992115745e-08	3.28961023410428	2.29828602097021	Inf	2.51332713153211	2.00208135655474	0.0223018392886751	2.37280349412602	2.76554171385428	2.54688033159016e-07	3.81581860680873	0.000559852847074928	300	269
TCGA-86-A456-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	424	8	3	5	8	408	16728	24	12	4	40	4025	21	21	0	42	3996	19	98	48	165	4271	21	85	55	161	4436	5	9	14	28	563	0.0660377358490566	0.173913043478261	0.126916140667268	1.3702988647772	0.0497335701598579	4	13	9	26	563	0.0613207547169811	0.157575757575758	0.131819246078202	1.1953926476129	0.0461811722912966	0.0754716981132075	32	111	1126	7581	0.00140950149503977	1.94085533535975	1.35033691568587	Inf	1.73039039113639	1.73985346358792	0.0666130070281174	1.95454279389051	1.72671541154357	0.00615613374790276	1.93555547481676	0.00568380152179431	392	376
TCGA-86-A4JF-01A-11D-A24P-08	0	0	3	3	1627	24	36	110	146	1457	59737	50	125	27	202	14151	42	142	14	198	13900	57	130	360	547	15731	57	129	324	510	15955	27	13	37	77	2037	0.0473263675476337	0.150980392156863	0.127671576308367	1.18256856007008	0.0378006872852234	30	17	42	89	1973	0.0547019053472649	0.162705667276051	0.125421142966118	1.2972746335122	0.0451089711099848	0.0835894283958205	136	662	4010	27676	0.000249493096413655	1.41786014883228	1.20374712433216	Inf	1.34666341664635	3.95087281795511	7.09335497557357e-22	6.90081684102811	0.912628516428228	0.820540274710823	0.901200456163472	0.0189431116196881	1491	1321
TCGA-86-A4P7-01A-11D-A24P-08	0	0	0	0	93	0	0	5	5	88	3608	2	2	1	5	813	3	2	1	6	879	9	3	25	37	953	11	8	21	40	963	6	3	5	14	127	0.150537634408602	0.35	0.131879543094496	2.65393700787402	0.110236220472441	6	1	4	11	118	0.118279569892473	0.297297297297297	0.123819517313746	2.40105359596885	0.0932203389830508	0.225806451612903	21	45	245	1671	6.87020032795046e-05	3.18022020320229	1.93778960139722	Inf	2.48831168831169	4.69224489795918	1.10740934357923e-06	10.2070219842874	1.53007985803017	0.13073987004213	1.65850335939128	0.567184805720698	72	67
TCGA-86-A4P8-01A-11D-A24P-08	0	0	0	0	2	0	1	0	1	1	41	0	0	0	0	13	0	0	0	0	8	0	0	1	1	15	0	0	0	0	5	0	0	0	0	0	0	NaN	0	NaN	NaN	0	0	0	0	2	0	0	0.133333333333333	0	0	0	0	1	2	18	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	2	1
TCGA-91-6828-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	359	2	4	13	17	340	13940	14	15	5	34	3371	14	12	10	36	3302	27	67	47	141	3635	22	79	28	129	3632	7	5	7	19	493	0.052924791086351	0.147286821705426	0.135737885462555	1.08508262968379	0.0385395537525355	9	8	7	24	451	0.0668523676880223	0.170212765957447	0.124071526822558	1.37189224890315	0.0532150776053215	0.0835654596100279	30	94	944	6323	0.000566105312901524	2.13741283985483	1.46113429752362	Inf	1.86244190814653	2.51366309235559	0.000330516018170255	3.24682075286214	1.43697740112994	0.103862468070433	1.53715639928422	0.821252515491856	329	310
TCGA-91-6829-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	720	22	6	15	21	677	27757	43	35	12	90	6489	40	35	12	87	6950	57	115	72	244	7146	51	122	83	256	7172	12	20	14	46	966	0.0638888888888889	0.1796875	0.134690462911322	1.33407738095238	0.0476190476190476	18	14	14	46	943	0.0638888888888889	0.188524590163934	0.131961936747831	1.42862854858057	0.0487804878048781	0.0805555555555556	58	205	1909	12409	8.57157969962421e-05	1.83897559034762	1.4131174740203	Inf	1.6540501566524	2.0834060881206	6.09944522453212e-05	2.49985340740929	1.35488602375843	0.058785625882367	1.43308392675191	0.87401866036495	662	619
TCGA-91-6830-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	352	4	3	5	8	340	13940	5	8	3	16	3326	8	3	2	13	3592	69	14	71	154	3450	62	15	80	157	3572	48	3	51	102	588	0.289772727272727	0.64968152866242	0.16461366181411	3.94670479656831	0.173469387755102	52	6	39	97	540	0.275568181818182	0.62987012987013	0.156521739130435	4.02417027417027	0.17962962962963	0.539772727272727	190	92	1128	5894	5.0165512776249e-78	10.7857017266113	8.63533452564834	Inf	4.19426839696192	4.75204374424774	4.90317688659776e-51	16.849554165096	3.71037057911794	9.44616167548927e-33	7.70662547628171	0.366449492742608	162	150
TCGA-91-6831-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	337	3	4	12	16	318	13038	18	20	5	43	3038	10	20	4	34	3245	23	52	36	111	3380	28	54	48	130	3375	5	8	6	19	496	0.056379821958457	0.146153846153846	0.146962962962963	0.994494416873449	0.0383064516129032	5	7	1	13	407	0.0385756676557863	0.117117117117117	0.120414201183432	0.972618810456648	0.0319410319410319	0.0504451038575668	17	118	903	5852	0.642020659837574	0.933645809071907	0.575238937220337	Inf	0.942004019523399	1.46678826569387	0.137509468999236	1.5805048286986	0.623385012919897	0.94265174106709	0.589185995493163	0.572231300449338	320	301
TCGA-91-6835-01A-11D-1855-08	0	0	0	0	113	4	1	1	2	107	4387	3	15	2	20	1085	5	5	4	14	1126	5	14	19	38	1072	11	8	16	35	1104	4	1	4	9	165	0.079646017699115	0.257142857142857	0.14945652173913	1.72051948051948	0.0545454545454545	3	3	5	11	155	0.0973451327433628	0.289473684210526	0.144589552238806	2.00203735144312	0.0709677419354839	0.141592920353982	16	35	320	1856	0.00231207779844746	2.64975653599083	1.50310404493329	Inf	2.13333333333333	2.975	0.00523896559763226	4.50663305573603	1.74857142857143	0.0644984414913624	2.006957966307	0.747527282566215	97	91
TCGA-91-6836-01A-21D-1855-08	0	0	0	0	493	8	4	9	13	472	19352	22	12	4	38	4407	25	13	6	44	4785	31	107	54	192	4978	24	114	60	198	5182	6	14	12	32	725	0.0649087221095335	0.161616161616162	0.139907371671169	1.15516544757924	0.0441379310344828	5	20	3	28	626	0.0567951318458418	0.145833333333333	0.12575331458417	1.15967784877529	0.0447284345047923	0.0527383367139959	26	143	1351	8809	0.2443839760657	1.18548285462675	0.803797968323978	Inf	1.15697773728862	1.5040710584752	0.107575142590646	1.6299884867722	0.989520433207371	0.559443786067215	0.98793339878491	0.50675163133872	467	446
TCGA-91-6840-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	134	0	1	5	6	128	5248	2	1	2	5	1261	0	8	1	9	1397	23	12	25	60	1314	19	7	28	54	1276	13	4	11	28	229	0.208955223880597	0.518518518518518	0.179467084639498	2.88921235646126	0.122270742358079	17	5	11	33	204	0.246268656716418	0.55	0.155251141552511	3.54264705882353	0.161764705882353	0.388059701492537	52	43	433	2157	2.26693278517309e-16	6.01824926561733	4.15318749760343	Inf	3.27409748389449	4.27251732101617	1.38544467193043e-14	12.4352007446766	2.4828968582509	2.2685279524639e-05	3.53293248040714	0.199813053007916	82	76
TCGA-91-6847-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	106	1	3	4	7	98	4018	0	5	5	10	964	4	7	2	13	982	8	8	25	41	1042	10	6	18	34	1030	2	2	1	5	150	0.0471698113207547	0.147058823529412	0.145631067961165	1.00980392156863	0.0333333333333333	4	0	4	8	139	0.0754716981132075	0.195121951219512	0.133397312859885	1.46271275662397	0.0575539568345324	0.10377358490566	11	50	289	1783	0.230132404037772	1.35708377529541	0.712557532575717	Inf	1.29286970332974	2.38985005767013	0.0315073162155047	3.08241228413709	0.833668624768649	0.734519126388288	0.811857666347246	1	95	87
TCGA-91-6848-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	665	18	1	14	15	632	25912	18	37	10	65	6155	26	41	12	79	6331	67	100	76	243	6659	61	107	77	245	6767	21	13	23	57	902	0.0857142857142857	0.23265306122449	0.133293926407566	1.74541381962985	0.0631929046563193	22	15	16	53	875	0.0796992481203008	0.218106995884774	0.13140111127797	1.65985655496767	0.0605714285714286	0.123308270676692	82	199	1777	11649	3.91342628201675e-12	2.70096351993526	2.14363543802478	Inf	2.20478754828903	2.53815243387732	3.95673479825471e-09	3.31587975335646	1.92589404923478	3.97653741765929e-05	2.24247298938034	0.675856166944483	583	550
TCGA-91-6849-01A-11D-1945-08	0	0	0	0	127	5	3	5	8	114	4674	6	4	0	10	1112	7	3	0	10	1089	5	21	11	37	1222	15	23	19	57	1251	1	2	6	9	153	0.0708661417322835	0.157894736842105	0.122302158273381	1.29102167182663	0.0588235294117647	0	5	3	8	165	0.062992125984252	0.216216216216216	0.135024549918167	1.6013104013104	0.0484848484848485	0.078740157480315	10	40	318	2155	0.105261090192269	1.69375321503826	0.852923247173495	Inf	1.55534591194969	0.388836477987421	0.936046972762969	0.356770329330235	2.33301886792453	0.0114860565571817	2.90255819527543	0.00659992584352986	117	104
TCGA-91-7771-01A-11D-2167-08	0	0	1	1	263	4	1	9	10	249	10209	13	12	6	31	2488	10	13	5	28	2556	16	42	34	92	2553	20	39	39	98	2612	4	3	9	16	373	0.0608365019011407	0.163265306122449	0.142802450229709	1.14329485145265	0.0428954423592493	6	4	7	17	389	0.064638783269962	0.184782608695652	0.152369761065413	1.21272493573265	0.0437017994858612	0.0988593155893536	26	83	762	4403	0.00875781301716354	1.80979533677472	1.19996710839529	Inf	1.61682197982133	1.88283756197142	0.0324484574118956	2.2219534429257	1.48563621328156	0.0664994122449986	1.62177304679182	0.207493089215497	237	223
TCGA-91-8496-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	50	0	5	1	6	44	1804	0	1	0	1	406	2	1	0	3	421	3	3	12	18	500	2	1	19	22	477	1	0	1	2	55	0.04	0.0909090909090909	0.115303983228512	0.788429752066116	0.0363636363636364	1	1	1	3	53	0.06	0.166666666666667	0.106	1.57232704402516	0.0566037735849057	0.08	4	32	108	869	0.577277427056304	1.00578148992343	0.319623089631373	Inf	1.00514403292181	3.61851851851852	0.0992136792517009	5.34827513242649	0.58363201911589	0.87060080013708	0.555178614214673	1	46	40
TCGA-91-8497-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	63	0	1	4	5	58	2378	2	4	1	7	522	1	4	1	6	569	2	6	14	22	629	1	7	15	23	658	0	0	0	0	73	0	0	0.110942249240122	0	0	0	1	2	3	83	0.0476190476190476	0.136363636363636	0.131955484896661	1.03340635268346	0.036144578313253	0.0317460317460317	2	30	156	1131	0.912397094819405	0.483538666326796	0.0815202655517648	Inf	0.515625	0	1	0	0.568965517241379	0.881349621525818	0.537239965633639	0.4	61	56
TCGA-91-8499-01A-11D-2393-08	0	1	0	1	348	6	3	11	14	328	13448	11	15	6	32	3125	9	17	2	28	3422	29	64	46	139	3360	28	40	61	129	3541	16	7	20	43	474	0.123563218390805	0.333333333333333	0.133860491386614	2.4901547116737	0.0907172995780591	11	11	16	38	433	0.109195402298851	0.273381294964029	0.128869047619048	2.12138833967468	0.0877598152424942	0.181034482758621	63	101	907	5994	1.34775630144279e-15	4.12128906380155	3.09609586496841	Inf	2.92281576895152	3.60407357975976	5.02173682600621e-10	5.94521522931667	2.55990272954899	6.3122993699586e-08	3.35003608365641	0.197115300679922	285	265
TCGA-91-A4BC-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	525	12	3	10	13	500	20500	28	12	5	45	4847	28	13	4	45	4997	22	120	48	190	5476	34	126	60	220	5180	12	20	9	41	700	0.0780952380952381	0.186363636363636	0.135135135135135	1.37909090909091	0.0585714285714286	2	15	5	22	722	0.0419047619047619	0.115789473684211	0.131848064280497	0.878203819798804	0.0304709141274238	0.0533333333333333	28	136	1422	9234	0.10358596942089	1.33689027993076	0.917255263864153	Inf	1.27940722445199	1.87341772151899	0.0139073148230481	2.16435984281995	0.971401781528364	0.589278915910865	0.967142695855888	1	497	472
TCGA-91-A4BD-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	25	0	1	1	2	23	943	3	3	0	6	232	0	1	0	1	200	0	0	7	7	254	0	1	8	9	257	0	0	2	2	32	0.08	0.222222222222222	0.124513618677043	1.78472222222222	0.0625	0	0	1	1	29	0.04	0.142857142857143	0.114173228346457	1.2512315270936	0.0344827586206897	0.12	3	12	61	450	0.271301485699837	1.84156518798607	0.432699761724329	Inf	1.67540983606557	NaN	1	0	1.67540983606557	0.271301485699837	1.84156518798607	0.1	22	20
TCGA-93-7347-01A-11D-2184-08	0	0	0	0	143	1	3	3	6	136	5576	8	9	0	17	1242	6	2	6	14	1370	8	24	20	52	1480	8	27	18	53	1484	2	2	3	7	187	0.048951048951049	0.132075471698113	0.126010781671159	1.04812834224599	0.0374331550802139	4	2	6	12	187	0.0839160839160839	0.230769230769231	0.126351351351351	1.82640888523241	0.0641711229946524	0.104895104895105	15	39	374	2590	0.00250022789521266	2.66231730977778	1.50258892307936	Inf	2.20142602495544	2.97192513368984	0.0107694640088888	4.15234912504137	1.87700534759358	0.0450467709340061	2.14847196864413	0.507678201004119	128	121
TCGA-93-7348-01A-21D-2036-08	0	0	0	0	125	1	2	0	2	122	5002	10	6	1	17	1160	4	5	2	11	1183	1	20	21	42	1324	12	17	23	52	1335	4	4	4	12	168	0.096	0.230769230769231	0.125842696629213	1.83379120879121	0.0714285714285714	0	4	5	9	175	0.072	0.214285714285714	0.132175226586103	1.62122448979592	0.0514285714285714	0.104	13	44	343	2316	0.029315638259793	1.99437279627887	1.09310137881376	Inf	1.76804255536801	2.38528818120655	0.0769175439807098	2.99919819746521	1.58567452955208	0.109251061828353	1.735844015631	0.180943925829842	112	109
TCGA-93-8067-01A-11D-2284-08	0	1	0	1	606	5	2	6	8	593	24313	5	10	3	18	5774	3	8	2	13	5887	90	39	146	275	6223	96	38	153	287	6429	66	13	88	167	992	0.275577557755776	0.581881533101045	0.154300824389485	3.77108505676071	0.168346774193548	64	4	84	152	979	0.250825082508251	0.552727272727273	0.157319620761691	3.5134032872133	0.155260469867211	0.498349834983498	302	183	1971	10681	1.54729788634923e-113	8.94055379213063	7.59517219251164	Inf	3.99703327109061	4.4864513946853	2.98183762206487e-60	12.5804850617717	3.69257918751665	1.06158618993058e-59	7.33745123055871	0.00113327865179877	304	291
TCGA-93-A4JN-01A-11D-A24P-08	0	1	0	1	95	1	1	3	4	90	3690	1	4	2	7	834	2	6	1	9	950	4	7	22	33	890	8	8	25	41	1016	2	1	3	6	135	0.0631578947368421	0.146341463414634	0.132874015748032	1.10135501355014	0.0444444444444444	0	2	5	7	115	0.0736842105263158	0.212121212121212	0.129213483146067	1.64163372859025	0.0608695652173913	0.105263157894737	10	49	250	1656	0.246330949795526	1.3516046715847	0.686631762979627	Inf	1.29220338983051	1.27066666666667	0.481198159582901	1.32458283476318	1.29770212765957	0.275054155869615	1.35852964084298	0.0414053035401803	85	80
TCGA-93-A4JO-01A-21D-A24P-08	0	1	0	1	64	0	0	4	4	60	2460	2	1	3	6	568	2	6	0	8	641	8	3	16	27	584	5	5	9	19	667	2	0	2	4	90	0.0625	0.210526315789474	0.134932533733133	1.56023391812865	0.0444444444444444	4	0	1	5	90	0.078125	0.185185185185185	0.154109589041096	1.20164609053498	0.0555555555555556	0.140625	9	29	180	1071	0.0914951023293449	1.84543810080212	0.871261181920914	Inf	1.64605263157895	3.20769230769231	0.00654874774439945	5.08983532718031	0.834	0.719135732232361	0.811487664533695	0.346935417523653	55	51
TCGA-93-A4JP-01A-11D-A24P-08	0	1	0	1	79	0	1	2	3	76	3116	5	2	2	9	763	5	1	0	6	771	4	7	18	29	835	7	7	18	32	747	4	2	9	15	114	0.189873417721519	0.46875	0.152610441767068	3.07154605263158	0.131578947368421	1	6	6	13	128	0.164556962025316	0.448275862068966	0.153293413173653	2.92429956896552	0.1015625	0.253164556962025	20	27	242	1340	1.06725917587962e-05	4.09656483012751	2.36497261272674	Inf	2.78178301389133	2.97145003756574	0.0178563075910043	4.60785383648442	2.72382920110193	0.000165179889791586	3.95032641960642	0.0111459566887651	59	56
TCGA-93-A4JQ-01A-11D-A24P-08	0	0	0	0	138	2	0	1	1	135	5535	3	9	2	14	1330	3	11	6	20	1422	16	5	28	49	1352	24	9	19	52	1431	12	4	6	22	254	0.159420289855072	0.423076923076923	0.177498252969951	2.383555420957	0.0866141732283465	12	1	8	21	197	0.152173913043478	0.428571428571429	0.145710059171598	2.94126178390138	0.106598984771574	0.27536231884058	38	49	451	2332	2.97979878363651e-09	4.00723111777294	2.70758435418634	Inf	2.69526212503504	3.70243902439024	6.91702469467013e-10	7.74567411387064	1.83809029579658	0.0153921771857532	2.19288481968455	0.0500177474752383	100	97
TCGA-95-7039-01A-11D-1945-08	0	0	1	1	1424	28	19	38	57	1338	54858	85	54	14	153	13238	83	49	19	151	13368	69	285	126	480	13851	73	341	140	554	14401	20	40	19	79	1929	0.0554775280898876	0.142599277978339	0.13394903131727	1.0645786429062	0.0409538621047175	15	41	24	80	1866	0.0561797752808989	0.166666666666667	0.134719514836474	1.23713826366559	0.0428724544480171	0.0547752808988764	78	330	3795	24457	0.000899216810010848	1.52322188229603	1.22200248155125	Inf	1.42321940633961	1.83491992800015	0.000243958177044314	2.10796886024647	1.20343942861105	0.114840754771599	1.24265176196693	0.361646474531253	1346	1260
TCGA-95-7043-01A-11D-1945-08	0	0	2	2	1225	24	15	39	54	1147	47027	38	33	7	78	11308	56	29	10	95	11023	59	314	125	498	12412	66	298	112	476	12284	15	37	16	68	1633	0.0555102040816327	0.142857142857143	0.132937154021491	1.07462164290088	0.0416411512553582	14	38	13	65	1645	0.0530612244897959	0.130522088353414	0.132533032549146	0.984826845375423	0.0395136778115502	0.0473469387755102	58	304	3278	21418	0.0760404218716042	1.2465738501589	0.968119095761549	Inf	1.20708287966992	1.74785600976205	0.00178857814440423	1.97377384868338	0.921864984051714	0.708374137732003	0.910956539725125	1	1167	1089
TCGA-95-7562-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	455	6	3	42	45	404	16564	16	8	0	24	3859	15	14	1	30	3874	24	127	39	190	4448	25	98	37	160	4383	4	10	1	15	527	0.032967032967033	0.09375	0.120237280401551	0.77970825426945	0.0284629981024668	3	12	6	21	532	0.0461538461538462	0.110526315789474	0.119604316546763	0.92409972299169	0.0394736842105263	0.0307692307692308	14	111	1059	7772	0.648056822296151	0.925637103796872	0.542076125524554	Inf	0.933967894239849	1.19128557938756	0.37320008394151	1.22313583036615	0.768065702499876	0.820160385664467	0.74455845781222	1	441	390
TCGA-95-7567-01A-11D-2063-08	0	0	0	0	1074	15	46	12	58	1001	41041	56	124	17	197	9899	38	128	29	195	10220	21	117	150	288	10476	31	126	164	321	10446	10	20	10	40	1474	0.037243947858473	0.124610591900312	0.141106643691365	0.883095144498409	0.0271370420624152	2	15	14	31	1419	0.0288640595903166	0.107638888888889	0.13545246277205	0.794661733615222	0.02184637068358	0.0335195530726257	36	330	2893	18029	0.990906102512053	0.679859646251962	0.496244574568109	Inf	0.711338278376862	1.66890903773033	0.0488791558003721	1.86946558894599	0.552759681286479	0.99974952025147	0.515760992516211	0.0329997184877954	1038	965
TCGA-95-7944-01A-11D-2184-08	0	1	0	1	300	2	0	9	9	289	11849	2	8	2	12	2783	3	4	4	11	2875	41	15	60	116	3048	57	21	72	150	3143	43	11	33	87	473	0.29	0.58	0.150493159401845	3.85399577167019	0.183932346723044	30	3	35	68	439	0.226666666666667	0.586206896551724	0.144028871391076	4.07006519519284	0.154897494305239	0.47	141	89	912	5279	1.07105107888092e-55	9.16500365947535	7.21880147723545	Inf	4.16157036613272	5.05664831722163	4.48193102096008e-39	16.889230860736	3.4970427963849	1.93083381285232e-22	6.14737845031654	0.64829582331268	159	148
TCGA-95-7947-01A-11D-2184-08	0	0	0	0	594	15	6	7	13	566	23206	14	35	4	53	5496	20	20	6	46	5738	62	76	101	239	6028	59	65	104	228	5944	31	12	48	91	841	0.153198653198653	0.399122807017544	0.141487213997308	2.82091077873042	0.10820451843044	31	14	43	88	865	0.148148148148148	0.368200836820084	0.14349701393497	2.56591288364331	0.101734104046243	0.257575757575758	153	173	1706	10266	1.64900410924662e-43	5.32085627235867	4.38198550242962	Inf	3.29352915369069	3.5957873523684	1.72797414308513e-21	6.32200743428232	3.11512309495897	8.80710288901635e-25	4.80272414860779	0.00272222352869827	441	413
TCGA-95-7948-01A-11D-2184-08	0	0	0	0	177	3	0	6	6	168	6888	1	3	1	5	1670	1	1	0	2	1701	29	7	42	78	1740	33	5	45	83	1777	22	3	23	48	274	0.271186440677966	0.578313253012048	0.1541924592009	3.75059361533726	0.175182481751825	25	4	25	54	270	0.305084745762712	0.692307692307692	0.155172413793103	4.46153846153846	0.2	0.536723163841808	95	54	544	2973	4.02017383706713e-38	9.60503568776623	7.09156012082053	Inf	4.12202674694039	4.90094283681214	2.85554622253603e-25	17.1030137861282	3.56693711967546	6.18257216709234e-17	6.72070605830038	1	82	73
TCGA-95-8039-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	125	0	0	9	9	115	4715	3	6	6	15	1115	6	6	8	20	1171	5	9	24	38	1220	8	13	21	42	1209	4	0	5	9	174	0.072	0.214285714285714	0.143920595533499	1.48891625615764	0.0517241379310345	3	1	6	10	156	0.08	0.263157894736842	0.127868852459016	2.05802968960864	0.0641025641025641	0.144	18	40	330	2099	0.000582829520901646	2.86059523888794	1.68276856541076	Inf	2.28432601880878	3.96340326340326	0.000729312607872886	7.41025433608407	1.79925925925926	0.0373786896202282	2.05710952558274	0.329980270793735	107	97
TCGA-95-8494-01A-11D-2323-08	0	1	0	1	125	1	0	2	2	122	5002	4	3	2	9	1236	1	1	2	4	1244	9	5	36	50	1249	11	10	38	59	1273	8	3	18	29	192	0.232	0.491525423728814	0.15082482325216	3.25891596045198	0.151041666666667	7	3	12	22	184	0.176	0.44	0.147317854283427	2.98673913043478	0.119565217391304	0.36	45	49	376	2146	1.85761209860969e-13	5.23658974313383	3.59869251823741	Inf	3.21101177003169	5.03058510638298	3.70942880705796e-09	17.09051063648	2.71923519263945	1.4454248756721e-07	3.88856946547909	0.00497686604742774	80	77
TCGA-95-A4VK-01A-11D-A25L-08	0	0	0	0	274	8	0	7	7	259	10619	8	10	4	22	2513	12	8	4	24	2447	21	72	33	126	2906	11	50	26	87	2753	0	6	3	9	347	0.0328467153284672	0.103448275862069	0.126044315292408	0.820729404750074	0.0259365994236311	2	14	3	19	367	0.0693430656934307	0.150793650793651	0.126290433585685	1.19402274988106	0.0517711171662125	0.0291970802919708	8	83	714	4945	0.899911183222783	0.667585249367782	0.321295363762083	Inf	0.696771016098747	0.495360644257703	0.924713842983671	0.461764293709362	0.806010539809144	0.770341779241806	0.784080196678381	0.251558873978408	266	251
TCGA-95-A4VN-01A-11D-A25L-08	0	0	0	0	538	14	6	9	15	509	20869	32	11	3	46	4848	26	11	8	45	5151	29	132	62	223	5537	39	109	47	195	5333	11	12	9	32	707	0.0594795539033457	0.164102564102564	0.132570785674105	1.23784862002684	0.0452616690240453	4	19	13	36	727	0.0669144981412639	0.161434977578475	0.131298537113961	1.22952609470704	0.0495185694635488	0.0687732342007435	37	140	1434	9436	0.00317083879203748	1.73894271213361	1.24763242449206	Inf	1.58456059065945	1.67210189515137	0.030381478413388	1.86214346821103	1.52994766675623	0.0275792341664105	1.66385901143427	0.247466386702219	501	472
TCGA-95-A4VP-01A-21D-A25L-08	0	0	1	1	144	2	1	4	5	137	5617	12	7	3	22	1311	8	8	2	18	1324	6	31	15	52	1467	5	23	17	45	1515	1	1	0	2	180	0.0138888888888889	0.0444444444444444	0.118811881188119	0.374074074074074	0.0111111111111111	2	2	0	4	160	0.0277777777777778	0.0769230769230769	0.10906612133606	0.705288461538462	0.025	0.0208333333333333	3	40	340	2642	0.88146784100728	0.582879486365391	0.152051677670244	Inf	0.611901504787962	2.39197860962567	0.122743917685715	2.91245606535336	0	1	0	0.181818181818182	141	134
TCGA-97-7546-01A-11D-2036-08	0	0	0	0	314	15	1	6	7	292	11972	9	14	5	28	2868	15	9	3	27	2863	17	73	34	124	3125	12	71	30	113	3116	4	4	0	8	382	0.0254777070063694	0.0707964601769911	0.122593068035944	0.577491544270954	0.0209424083769634	7	8	4	19	413	0.0605095541401274	0.153225806451613	0.13216	1.15939623525736	0.0460048426150121	0.0477707006369427	15	78	795	5446	0.203596902433431	1.3173028033642	0.775681888123849	Inf	1.26617975248529	2.9777054868792	0.000565927654903134	4.18518005446836	0.49064465408805	0.969762734843469	0.456729286945605	0.0663858084550456	299	277
TCGA-97-7547-01A-11D-2036-08	0	1	2	3	206	6	0	6	6	194	7954	12	3	5	20	1918	9	7	2	18	1827	23	22	25	70	2114	15	32	39	86	2095	11	5	12	28	261	0.135922330097087	0.325581395348837	0.124582338902148	2.61338323086519	0.10727969348659	11	3	7	21	297	0.101941747572816	0.3	0.140491958372753	2.13535353535354	0.0707070707070707	0.199029126213592	41	61	558	3651	2.84155735314357e-11	4.39569384507958	3.05231836560312	Inf	3.0319945182374	4.36700622524052	1.71913996607642e-10	8.98739982961086	2.2393313172043	0.000523038143123404	2.76169224667138	0.682388938340186	165	153
TCGA-97-7552-01A-11D-2036-08	0	0	0	0	45	0	0	2	2	43	1763	1	5	2	8	393	1	3	2	6	399	3	3	8	14	448	1	2	12	15	523	0	1	1	2	71	0.0444444444444444	0.133333333333333	0.135755258126195	0.982159624413146	0.028169014084507	0	1	0	1	35	0.0222222222222222	0.0714285714285714	0.078125	0.914285714285714	0.0285714285714286	0.0222222222222222	1	23	106	865	0.936992178884825	0.355049764637125	0.0173266419345321	Inf	0.381682389937107	0	1	0	0.458018867924528	0.900608036767502	0.429759523805848	1	44	42
TCGA-97-7553-01A-21D-2036-08	0	0	0	0	69	0	3	14	17	52	2132	1	3	1	5	481	0	3	0	3	485	2	6	19	27	577	1	6	10	17	589	1	1	2	4	84	0.0579710144927536	0.235294117647059	0.142614601018676	1.64985994397759	0.0476190476190476	0	1	2	3	77	0.0434782608695652	0.111111111111111	0.133448873483536	0.832611832611832	0.038961038961039	0.072463768115942	5	27	161	1005	0.462247266629651	1.15579518141365	0.418670911208994	Inf	1.13159937888199	2.41407867494824	0.361052311939239	3.11675428058194	0.998929106875134	0.584242323165399	0.998758797098903	0.265734265734266	64	47
TCGA-97-7554-01A-11D-2036-08	0	0	1	1	510	12	7	15	22	476	19516	27	18	4	49	4513	21	25	6	52	4725	26	107	57	190	5090	16	119	50	185	5188	3	8	9	20	668	0.0392156862745098	0.108108108108108	0.12875867386276	0.839618061174947	0.029940119760479	7	10	6	23	694	0.0450980392156863	0.121052631578947	0.136345776031434	0.887835583194297	0.0331412103746398	0.0490196078431373	25	124	1362	8916	0.12906358041903	1.31976887045682	0.884738669310963	Inf	1.26615025278657	1.79672750157332	0.0449111592478328	2.04555749579363	1.05788628597307	0.450766331916248	1.0673353521312	0.342332207373192	485	451
TCGA-97-7937-01A-11D-2167-08	0	0	0	0	530	14	4	23	27	489	20049	18	11	9	38	4682	15	26	4	45	4730	20	126	60	206	5423	30	119	51	200	5214	10	15	4	29	677	0.0547169811320755	0.145	0.129842731108554	1.11673559822747	0.0428360413589365	3	10	8	21	653	0.039622641509434	0.101941747572816	0.120413055504333	0.846600454957701	0.0321592649310873	0.0471698113207547	25	136	1330	9307	0.151602644534747	1.28631561968485	0.864669730173696	Inf	1.24188577032644	2.07941353383459	0.00740358436261802	2.45835390952467	0.864621011989433	0.74585984828658	0.84824532437668	1	505	464
TCGA-97-7938-01A-11D-2167-08	0	0	0	0	451	12	3	9	12	427	17507	20	20	2	42	4112	19	15	5	39	4161	27	86	51	164	4575	36	105	41	182	4659	16	8	11	35	617	0.0776053215077605	0.192307692307692	0.132431852328826	1.45212567011595	0.0567260940032415	8	11	8	27	558	0.0598669623059867	0.164634146341463	0.121967213114754	1.34982297403619	0.0483870967741935	0.0953436807095344	43	112	1175	8059	6.30521684754421e-07	2.63291875166039	1.90990747562572	Inf	2.18016197666438	2.99379939209726	3.70293080759958e-07	4.22008626154924	1.62299722479186	0.0224615198621903	1.78500844870032	0.450620520743349	408	384
TCGA-97-7941-01A-11D-2184-08	0	0	0	0	119	1	0	6	6	112	4592	2	6	0	8	1058	3	2	0	5	1141	7	24	24	55	1206	6	20	18	44	1187	1	4	4	9	179	0.0756302521008403	0.204545454545455	0.150800336983993	1.35639918740477	0.0502793296089385	4	4	6	14	169	0.117647058823529	0.254545454545455	0.140132669983416	1.81646046261431	0.0828402366863905	0.126050420168067	15	40	348	2045	0.0112941801362092	2.20275779752096	1.24436986982593	Inf	1.87539184952978	2.644783377542	0.0309415902005664	3.66990322783459	1.63724685276409	0.0778183067632555	1.83580766801454	0.207811470006592	104	97
TCGA-97-8171-01A-11D-2284-08	0	0	0	0	78	0	0	3	3	75	3075	6	5	3	14	685	2	5	0	7	735	1	6	26	33	860	1	5	15	21	795	1	1	1	3	91	0.0384615384615385	0.142857142857143	0.114465408805031	1.24803767660911	0.032967032967033	1	0	0	1	109	0.0128205128205128	0.0303030303030303	0.126744186046512	0.239088128996386	0.00917431192660551	0.0384615384615385	3	40	200	1455	0.904479571623692	0.545782096038867	0.14186435214029	Inf	0.577325581395349	8.275	0.0147966903693597	Inf	0.201829268292683	0.994689822251833	0.181974153608691	1	75	72
TCGA-97-8172-01A-11D-2284-08	0	0	0	0	306	8	4	14	18	280	11480	20	8	4	32	2786	12	15	1	28	2700	12	67	42	121	2986	8	55	36	99	3008	1	7	2	10	394	0.0326797385620915	0.101010101010101	0.130984042553191	0.771163410757319	0.0253807106598985	1	8	3	12	398	0.0392156862745098	0.0991735537190083	0.133288680509042	0.744050832675776	0.0301507537688442	0.0228758169934641	7	91	792	5202	0.979673482177577	0.505290310816832	0.230446114617812	Inf	0.540584415584416	0.756818181818182	0.762395827851319	0.729832408908446	0.48513986013986	0.981933003967759	0.449918648488431	0.412059862995768	299	273
TCGA-97-8174-01A-11D-2284-08	0	0	0	0	205	4	1	6	7	194	7954	5	5	2	12	1878	11	10	1	22	1877	15	35	30	80	2079	16	39	25	80	2120	9	5	4	18	280	0.0878048780487805	0.225	0.132075471698113	1.70357142857143	0.0642857142857143	3	7	3	13	266	0.0634146341463415	0.1625	0.127946127946128	1.27006578947368	0.0488721804511278	0.0926829268292683	19	67	546	3653	0.014635503461679	1.8968444098724	1.16996157120517	Inf	1.69905869324474	2.97695852534562	0.000319868686413599	4.22366915172166	0.978787878787879	0.585166029613172	0.975698575620383	0.270402008555555	186	175
TCGA-97-8175-01A-11D-2284-08	0	0	0	0	53	1	1	1	2	50	2050	0	4	0	4	522	2	3	2	7	461	1	5	15	21	516	1	5	12	18	551	0	1	1	2	77	0.0377358490566038	0.111111111111111	0.139745916515427	0.795093795093795	0.025974025974026	1	0	3	4	72	0.0754716981132075	0.19047619047619	0.13953488372093	1.36507936507937	0.0555555555555556	0.0943396226415094	5	24	149	918	0.386363505053523	1.28323810016965	0.460540044087493	Inf	1.23466790094885	3.58053691275168	0.26105990056863	6.1438615008349	1.0608998260005	0.535442419925004	1.07143957410575	0.242424242424242	48	45
TCGA-97-8176-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	181	4	1	6	7	170	6970	5	10	3	18	1682	3	4	4	11	1642	8	18	29	55	1825	16	26	44	86	1821	11	2	12	25	232	0.138121546961326	0.290697674418605	0.127402526084569	2.28172614274258	0.107758620689655	4	2	10	16	236	0.0883977900552486	0.290909090909091	0.129315068493151	2.24961479198767	0.0677966101694915	0.204419889502762	37	60	468	3178	6.20160176827262e-10	4.18540457939596	2.86223328804549	Inf	2.97167151290863	4.86912393162393	2.10634774138999e-08	11.3031985052292	2.34785153963236	0.000102145750513032	2.92808293885464	0.182695739345778	144	133
TCGA-97-8177-01A-11D-2284-08	0	0	0	0	80	1	1	4	5	74	3034	1	1	2	4	682	5	3	2	10	730	4	7	15	26	808	6	8	20	34	814	3	1	6	10	109	0.125	0.294117647058824	0.133906633906634	2.19643820831085	0.0917431192660551	3	0	0	3	103	0.0375	0.115384615384615	0.127475247524752	0.905153099327857	0.029126213592233	0.15	12	33	212	1410	0.0124525688480401	2.41681738623901	1.26338582906019	Inf	2.04025157232704	4.59056603773585	0.000700370158024983	9.9504073797512	1.31159029649596	0.30871335042731	1.37575817037866	1	68	62
TCGA-97-8179-01A-11D-2284-08	0	0	0	0	195	3	7	8	15	177	7257	10	4	1	15	1568	9	10	4	23	1689	9	35	7	51	1947	14	50	24	88	2053	4	4	2	10	232	0.0512820512820513	0.113636363636364	0.113005358012664	1.00558385579937	0.0431034482758621	2	3	1	6	212	0.0307692307692308	0.117647058823529	0.108885464817668	1.08046614872364	0.0283018867924528	0.0461538461538462	9	45	444	3556	0.142359892426396	1.60157019528466	0.785174788135344	Inf	1.5015015015015	2.35017626321974	0.0364650125997014	2.82565289233414	0.871839581517001	0.684513961705475	0.858114979857242	0.433147942157953	186	168
TCGA-97-8547-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	82	1	3	3	6	75	3075	1	1	2	4	706	0	3	2	5	736	3	5	25	33	782	4	5	24	33	851	3	2	7	12	101	0.146341463414634	0.363636363636364	0.118683901292597	3.06390639063906	0.118811881188119	2	2	4	8	103	0.0975609756097561	0.242424242424242	0.131713554987212	1.84054133568697	0.0776699029126214	0.195121951219512	16	40	204	1429	0.00133855373745166	2.79959023577933	1.59502684888419	Inf	2.28711484593838	5.71778711484594	0.000543541414606747	17.4539451278805	1.79701880752301	0.0400008231111126	2.02668477652281	0.105340267965407	66	59
TCGA-97-8552-01A-11D-2393-08	0	0	0	0	33	0	1	3	4	29	1189	1	1	1	3	302	1	3	0	4	264	3	1	7	11	296	2	2	7	11	327	0	0	0	0	39	0	0	0.119266055045872	0	0	1	0	2	3	47	0.0909090909090909	0.272727272727273	0.158783783783784	1.71760154738878	0.0638297872340425	0.0909090909090909	3	16	86	537	0.503848454066666	1.17045712830743	0.284928529773205	Inf	1.1438188494492	1.44883720930233	0.526772224921314	1.55975021284868	1.03488372093023	0.597950983726816	1.04063848727012	1	30	26
TCGA-97-A4LX-01A-11D-A24P-08	0	0	0	0	204	3	2	3	5	196	8036	13	11	1	25	2002	13	13	2	28	1979	8	44	13	65	2067	8	50	20	78	1988	2	7	4	13	298	0.0637254901960784	0.166666666666667	0.14989939637827	1.11185682326622	0.0436241610738255	3	5	1	9	290	0.0441176470588235	0.138461538461538	0.140299951620706	0.986896551724138	0.0310344827586207	0.0490196078431373	10	39	588	3467	0.166616584485366	1.51168180821842	0.763153492594324	Inf	1.40739969457171	2.15508078231292	0.0708796111632047	2.67905422465042	1.04488765203051	0.533182239038904	1.05290067917458	1	194	186
TCGA-97-A4M0-01A-11D-A24P-08	0	0	1	1	441	4	2	14	16	421	17261	27	8	3	38	4209	27	24	4	55	4327	35	100	49	184	4397	19	81	44	144	4328	8	13	17	38	662	0.0861678004535147	0.263888888888889	0.152957486136784	1.72524337025848	0.0574018126888218	16	17	12	45	637	0.102040816326531	0.244565217391304	0.144871503297703	1.68815268582349	0.0706436420722135	0.120181405895692	53	94	1299	7426	3.15290411643875e-10	3.22265338591489	2.37588668848213	Inf	2.42166920655868	2.98520229236165	2.22952023339972e-07	4.57239208291293	2.09445644706019	6.16804753025534e-05	2.58996930268745	0.505654431321465	388	368
TCGA-97-A4M1-01A-11D-A24P-08	0	0	0	0	55	0	1	3	4	51	2091	2	1	1	4	478	2	2	2	6	555	4	5	13	22	529	5	2	12	19	529	2	0	3	5	72	0.0909090909090909	0.263157894736842	0.136105860113422	1.93347953216374	0.0694444444444444	1	0	2	3	66	0.0545454545454545	0.136363636363636	0.12476370510397	1.09297520661157	0.0454545454545455	0.145454545454545	8	26	138	920	0.0722435339966113	2.04960092458916	0.915721632187693	Inf	1.80392156862745	2.55555555555556	0.104089693644082	3.3278351569611	1.53333333333333	0.226039134437857	1.665726216635	0.619269619269619	47	43
TCGA-97-A4M2-01A-12D-A24P-08	0	0	0	0	39	0	0	4	4	35	1435	3	0	1	4	326	2	2	0	4	374	1	2	6	9	307	6	7	5	18	428	4	0	0	4	66	0.102564102564103	0.222222222222222	0.154205607476636	1.44107744107744	0.0606060606060606	0	1	2	3	43	0.0769230769230769	0.333333333333333	0.140065146579805	2.37984496124031	0.0697674418604651	0.153846153846154	6	12	109	626	0.0432241174123451	2.86607631102549	1.04169906491092	Inf	2.24770642201835	3.85321100917431	0.012358039921072	7.62157431294809	1.22602168473728	0.50445767384013	1.27579497754762	0.592074592074592	33	29
TCGA-97-A4M3-01A-11D-A24P-08	0	1	0	1	223	6	1	5	6	210	8610	7	7	3	17	2064	11	11	0	22	2123	10	49	24	83	2231	17	43	28	88	2192	6	7	10	23	286	0.103139013452915	0.261363636363636	0.130474452554745	2.00317863954228	0.0804195804195804	5	7	4	16	286	0.0717488789237668	0.192771084337349	0.128193635141192	1.50374926278541	0.0559440559440559	0.112107623318386	25	54	572	3851	1.58134601434671e-05	3.11578525298228	2.00091557695714	Inf	2.44699920332832	3.1502849002849	0.00031769373816673	4.62627369141914	2.08183162990855	0.00558177433193119	2.47968604600133	0.628002220528021	198	185
TCGA-97-A4M5-01A-11D-A24P-08	0	2	0	2	178	3	0	3	3	172	7052	2	2	2	6	1803	0	4	2	6	1795	23	11	44	78	1697	25	6	51	82	1757	19	1	31	51	276	0.286516853932584	0.621951219512195	0.1570859419465	3.95930540827147	0.184782608695652	17	3	21	41	279	0.230337078651685	0.525641025641026	0.164407778432528	3.19717856814631	0.146953405017921	0.49438202247191	88	55	555	2899	1.18922197795656e-32	8.34984781419377	6.1465129767601	Inf	3.82979902979903	4.66756756756757	5.58849525549523e-19	15.6507787918231	3.40650545282124	2.86381317928958e-17	6.31173111780526	0.026577784475657	90	84
TCGA-97-A4M6-01A-11D-A24P-08	0	0	2	2	42	0	1	4	5	37	1517	1	3	2	6	385	3	4	1	8	406	0	3	8	11	355	2	2	8	12	371	1	0	1	2	62	0.0476190476190476	0.166666666666667	0.16711590296496	0.997311827956989	0.032258064516129	0	0	3	3	50	0.0714285714285714	0.272727272727273	0.140845070422535	1.93636363636364	0.06	0.119047619047619	5	13	112	614	0.137797210835396	2.10589051047061	0.708510775671331	Inf	1.80059523809524	3.24107142857143	0.286526746980667	5.46236182914847	1.62053571428571	0.23101385127931	1.82557843920457	0.206349206349206	37	32
TCGA-97-A4M7-01A-11D-A24P-08	0	0	0	0	355	6	4	12	16	332	13612	14	12	5	31	3233	18	8	11	37	3305	12	84	31	127	3497	14	85	38	137	3577	3	5	5	13	442	0.0366197183098592	0.0948905109489051	0.123567235113223	0.767926148561614	0.0294117647058824	3	11	6	20	455	0.0563380281690141	0.15748031496063	0.130111524163569	1.2103487064117	0.043956043956044	0.047887323943662	17	78	897	6177	0.0911048143375427	1.50075356050337	0.91163264127514	Inf	1.41123041718007	1.81991252894263	0.103245464592352	2.06563746263415	1.25723425912462	0.256327422737162	1.30596430635579	0.260001661059441	338	315
TCGA-99-7458-01A-11D-2036-08	0	0	1	1	545	7	5	22	27	511	20951	30	23	1	54	4950	20	26	5	51	5147	24	136	55	215	5338	25	108	58	191	5516	10	7	7	24	743	0.0440366972477064	0.12565445026178	0.13469905728789	0.932853226977091	0.0323014804845222	3	15	7	25	743	0.0458715596330275	0.116279069767442	0.139190708130386	0.835393909042537	0.0336473755047106	0.0495412844036697	27	135	1486	9368	0.163673958991723	1.26079704920058	0.859506607660241	Inf	1.21736204576043	1.93784162386354	0.0129344785281557	2.27628080439232	0.904941697733417	0.696428726651403	0.891479708594525	1	518	484
TCGA-99-8025-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	560	8	3	11	14	538	22058	23	16	7	46	5115	16	16	4	36	5200	50	78	102	230	5868	50	85	91	226	5875	30	10	27	67	743	0.119642857142857	0.29646017699115	0.126468085106383	2.34415012089234	0.0901749663526245	27	15	36	78	765	0.139285714285714	0.339130434782609	0.130368098159509	2.60132992327366	0.101960784313725	0.214285714285714	120	173	1508	10235	4.86113057758178e-32	4.70704825901699	3.81988195224091	Inf	3.18927042123464	4.43866710875332	3.80010944625758e-25	8.9919283984153	2.54191462459285	1.61302186368706e-12	3.28871018316012	0.55116265027988	440	418
TCGA-99-8028-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	622	8	2	7	9	605	24805	28	23	4	55	5888	29	25	10	64	5958	32	169	60	261	6454	38	146	41	225	6505	5	9	3	17	837	0.0273311897106109	0.0755555555555556	0.128670253651038	0.587202973582902	0.020310633213859	4	24	12	40	847	0.0643086816720257	0.153256704980843	0.131236442516269	1.16779076026725	0.0472255017709563	0.0385852090032154	24	147	1684	11275	0.377371638746909	1.0931439663414	0.731205710394825	Inf	1.08005167312581	0.98940447913132	0.567316926166626	0.987841789219868	1.14287646104278	0.332162722622352	1.16776609775127	0.250437435227578	598	581
TCGA-99-8032-01A-11D-2238-08	0	0	1	1	492	15	5	17	22	455	18655	30	17	6	53	4331	23	12	6	41	4377	29	85	51	165	4936	34	108	54	196	5011	4	11	10	25	613	0.0508130081300813	0.127551020408163	0.122330872081421	1.04267237074275	0.0407830342577488	7	13	5	25	603	0.0508130081300813	0.151515151515152	0.122163695299838	1.24026332981557	0.0414593698175788	0.0528455284552846	26	142	1216	8731	0.125589248784576	1.31462449340152	0.890904678930343	Inf	1.26596765350877	1.42827119883041	0.142796973638185	1.51878616911397	1.16858552631579	0.30190099479039	1.19665509231137	0.494501159503202	466	429
TCGA-99-8033-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	216	6	2	7	9	201	8241	5	7	2	14	1932	9	14	3	26	2005	13	33	27	73	2108	9	42	37	88	2196	1	8	6	15	298	0.0694444444444444	0.170454545454545	0.135701275045537	1.25610128126907	0.0503355704697987	2	2	5	9	274	0.0416666666666667	0.123287671232877	0.129981024667932	0.948505149485051	0.0328467153284672	0.0648148148148148	14	72	572	3732	0.251817800627728	1.26857222637041	0.730008031075874	Inf	1.22491462026346	1.02606484424666	0.575306263024673	1.03017761988432	1.29326923076923	0.22776954665502	1.35402932144857	0.0243008942252253	202	187
TCGA-J2-8192-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	95	0	1	5	6	89	3649	3	6	0	9	826	1	3	3	7	890	5	7	21	33	916	8	7	25	40	1017	3	4	5	12	143	0.126315789473684	0.3	0.140609636184857	2.13356643356643	0.0839160839160839	1	2	1	4	117	0.0421052631578947	0.121212121212121	0.127729257641921	0.948976948976949	0.0341880341880342	0.105263157894737	10	49	260	1673	0.271127348790736	1.31298832895122	0.66728359559435	Inf	1.26010430247718	2.28757396449704	0.0874879728959596	2.85765590666676	0.969732441471572	0.598692257633362	0.965205712433934	0.704251100256323	85	79
TCGA-J2-8194-01A-11D-2238-08	0	0	0	0	193	2	0	6	6	185	7585	11	5	4	20	1801	11	15	0	26	1728	2	39	37	78	2041	11	21	29	61	2015	2	4	4	10	247	0.0518134715025907	0.163934426229508	0.12258064516129	1.33735979292494	0.0404858299595142	0	3	3	6	241	0.0310880829015544	0.0769230769230769	0.118079372856443	0.651452282157676	0.024896265560166	0.0466321243523316	9	70	488	3568	0.62126169051238	0.940053237986542	0.470032496301242	Inf	0.946876945424362	1.27868852459016	0.475950876177969	1.32925278931318	0.881520119225037	0.694792120535911	0.867461435843811	0.11338524286244	184	176
TCGA-J2-A4AD-01A-11D-A24D-08	0	1	0	1	374	11	2	9	11	352	14432	12	18	10	40	3503	4	18	6	28	3555	51	45	49	145	3700	53	35	51	139	3674	30	9	22	61	530	0.163101604278075	0.438848920863309	0.144256940664126	3.04213384009773	0.115094339622642	28	6	21	55	529	0.147058823529412	0.379310344827586	0.142972972972973	2.65302131542924	0.103969754253308	0.270053475935829	101	103	1059	6315	2.33477494643434e-31	5.84526468549478	4.56607619822606	Inf	3.44745320224407	3.88330791022009	2.65912396554404e-22	7.51469873685035	2.99416430594901	6.42194921475402e-12	4.49739867157464	0.0635139322560666	273	251
TCGA-J2-A4AE-01A-21D-A24D-08	0	0	0	0	63	0	0	3	3	60	2460	1	4	0	5	582	0	3	1	4	608	2	4	18	24	644	9	5	13	27	626	7	0	2	9	113	0.142857142857143	0.333333333333333	0.180511182108626	1.84660766961652	0.079646017699115	0	0	4	4	63	0.0634920634920635	0.166666666666667	0.0978260869565217	1.7037037037037	0.0634920634920635	0.206349206349206	13	29	176	1094	0.00418240433017611	2.78347702434662	1.46645804505028	Inf	2.23349567099567	4.59194214876033	0.000216903456256454	10.8425946888704	1.3966275659824	0.258696120543185	1.49128983353043	1	50	47
TCGA-J2-A4AG-01A-11D-A24D-08	0	0	1	1	107	3	0	6	6	98	4018	2	1	2	5	923	6	9	0	15	983	5	22	17	44	1026	3	16	15	34	1086	1	1	1	3	139	0.0280373831775701	0.0882352941176471	0.127992633517495	0.689377909437156	0.0215827338129496	1	3	3	7	127	0.0654205607476635	0.159090909090909	0.123781676413255	1.28525411596278	0.0551181102362205	0.0560747663551402	6	34	266	1846	0.394113474273119	1.22454982116698	0.497189792814705	Inf	1.19097744360902	1.98496240601504	0.268058301555966	2.3119852829116	0.992481203007519	0.587269275788421	0.991410891912163	0.628482972136223	101	92
TCGA-L4-A4E5-01A-11D-A24P-08	0	0	1	1	371	6	1	6	7	358	14678	19	13	3	35	3501	21	10	5	36	3494	14	85	43	142	3841	17	94	34	145	3842	3	9	5	17	516	0.045822102425876	0.117241379310345	0.13430504945341	0.872948409516172	0.0329457364341085	1	11	8	20	476	0.0539083557951483	0.140845070422535	0.123926060921635	1.13652503254823	0.0420168067226891	0.045822102425876	17	91	992	6691	0.229069271743041	1.260003364246	0.770265610343008	Inf	1.21911402329749	0.999349635796046	0.581017931454705	0.999253381022529	1.30759059488898	0.191054112932053	1.37000447122003	0.0252282036529381	354	341
TCGA-L4-A4E6-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	21	0	0	2	2	19	779	0	0	0	0	145	1	1	0	2	188	2	4	3	9	219	4	3	1	8	227	0	1	0	1	35	0.0476190476190476	0.125	0.154185022026432	0.810714285714286	0.0285714285714286	2	0	1	3	18	0.142857142857143	0.333333333333333	0.0821917808219178	4.05555555555556	0.166666666666667	0.142857142857143	3	7	53	393	0.112533871279378	3.1661564950367	0.687090838123156	Inf	2.52452830188679	2.80503144654088	0.158315383780894	3.69106364264254	2.10377358490566	0.40140006982599	2.46480513040589	1	18	16
TCGA-L9-A443-01A-12D-A24D-08	0	0	0	0	269	13	2	7	9	247	10127	15	7	5	27	2433	15	18	4	37	2514	13	48	21	82	2560	15	59	27	101	2620	1	6	3	10	378	0.0371747211895911	0.099009900990099	0.144274809160305	0.686259102100686	0.0264550264550265	4	4	7	15	359	0.0557620817843866	0.182926829268293	0.140234375	1.30443644269312	0.0417827298050139	0.0557620817843866	15	61	737	4443	0.118072138866711	1.48228552343566	0.86310263250126	Inf	1.38720274226951	1.2550881953867	0.368421109645522	1.31046573890674	1.46426956128449	0.137881070707762	1.58627366795855	0.216534219430637	254	232
TCGA-L9-A444-01A-21D-A24D-08	0	0	1	1	624	26	5	18	23	575	23575	35	15	6	56	5429	24	14	6	44	5662	31	135	58	224	6245	31	156	64	251	6239	3	17	7	27	774	0.0432692307692308	0.107569721115538	0.124058342683122	0.867089780413231	0.0348837209302326	5	12	10	27	762	0.0432692307692308	0.120535714285714	0.122017614091273	0.987855033745782	0.0354330708661417	0.0400641025641026	25	159	1536	10948	0.331635282976426	1.12065135688313	0.756851027635997	Inf	1.10429404438406	1.04872311827957	0.500531001325895	1.05595113686465	1.1325350068306	0.331719309104956	1.15396177847252	0.0666886969762868	599	550
TCGA-MN-A4N1-01A-11D-A24P-08	0	0	0	0	509	13	2	13	15	481	19721	22	19	11	52	4468	21	18	5	44	4786	25	100	63	188	5330	31	116	50	197	5137	9	13	4	26	666	0.0510805500982318	0.131979695431472	0.129647654272922	1.01798753067789	0.039039039039039	6	13	9	28	663	0.0550098231827112	0.148936170212766	0.124390243902439	1.19732999582812	0.0422322775263952	0.0550098231827112	28	141	1329	9138	0.0870742012418514	1.36536856344089	0.937598625700175	Inf	1.30487397651836	2.10960174137375	0.00358469887708289	2.51517105934047	0.906070836413033	0.689667850274522	0.893847107059412	0.82650007721565	481	453
TCGA-MN-A4N4-01A-12D-A24P-08	0	0	0	0	1698	33	6	35	41	1624	66584	58	38	9	105	15920	66	45	16	127	16093	113	345	217	675	17162	148	351	218	717	17409	79	48	84	211	2444	0.124263839811543	0.294281729428173	0.1403871560687	2.09621547774757	0.0863338788870704	56	46	77	179	2317	0.105418138987044	0.265185185185185	0.135007574874723	1.96422449207948	0.0772550712127751	0.17432273262662	296	400	4761	29810	1.53205863671287e-74	4.63324513971718	4.06005139546142	Inf	3.08813467662304	3.75583947156856	2.73395706799142e-47	6.70791568404738	2.68751179965573	3.28169116231565e-33	3.67899157174081	0.0649997422234827	1402	1328
TCGA-MN-A4N5-01A-11D-A24P-08	0	0	1	1	486	14	3	11	14	458	18778	19	26	4	49	4598	19	23	5	47	4560	27	117	45	189	4735	28	101	44	173	4885	7	17	11	35	681	0.0720164609053498	0.202312138728324	0.139406345957011	1.45124052523915	0.0513950073421439	6	11	15	32	662	0.065843621399177	0.169312169312169	0.139809926082365	1.21101680014067	0.0483383685800604	0.0802469135802469	39	105	1343	8277	3.1651055186505e-05	2.28888596700785	1.63583225598451	Inf	1.93999751799454	1.69308874297705	0.0375256876178629	1.90736229992003	2.09258159244355	0.000160512319436127	2.54311746948771	0.0218257586670147	447	419
TCGA-MP-A4SV-01A-11D-A24P-08	0	0	0	0	399	5	5	7	12	382	15662	13	10	7	30	3749	16	17	4	37	3953	45	55	62	162	3934	39	55	59	153	4026	22	8	14	44	600	0.110275689223058	0.287581699346405	0.14903129657228	1.92967320261438	0.0733333333333333	26	8	27	61	564	0.152882205513784	0.376543209876543	0.143365531265887	2.62645565186936	0.108156028368794	0.223057644110276	89	116	1164	6796	1.83661467843278e-22	4.47852865958976	3.49189042286957	Inf	2.96890453440617	3.90770741286205	4.41849287707015e-19	7.78092086667775	2.31717361051944	1.24152190118983e-07	2.99166124116658	0.40217563756848	310	293
TCGA-MP-A4SW-01A-21D-A24P-08	0	0	0	0	86	0	0	5	5	81	3321	2	4	1	7	799	4	2	1	7	718	3	5	25	33	890	5	8	21	34	914	2	1	1	4	90	0.0465116279069767	0.117647058823529	0.0984682713347921	1.19477124183007	0.0444444444444444	1	1	5	7	117	0.0813953488372093	0.212121212121212	0.131460674157303	1.61357161357161	0.0598290598290598	0.104651162790698	9	45	207	1597	0.167261977063428	1.54256870446484	0.75095031553055	Inf	1.4524959742351	3.26811594202899	0.05526484185566	4.62267546955033	1.13673597983617	0.43932928252966	1.15713344135483	0.386996904024768	77	72
TCGA-MP-A4SY-01A-21D-A24P-08	0	0	0	0	186	2	0	2	2	182	7462	10	10	2	22	1783	7	10	4	21	1816	15	26	26	67	1879	9	31	32	72	1984	3	6	6	15	277	0.0806451612903226	0.208333333333333	0.139616935483871	1.49217809867629	0.0541516245487365	8	5	1	14	248	0.0752688172043011	0.208955223880597	0.131985098456626	1.58317284545017	0.0564516129032258	0.0967741935483871	18	64	525	3338	0.0272257735500137	1.78789228639357	1.08707531480661	Inf	1.61519163763066	3.37246031746032	0.000140966895428048	5.37622181394291	0.888045977011494	0.689452809615566	0.872730727340503	0.394976278104946	168	164
TCGA-MP-A4T2-01A-11D-A24P-08	0	0	0	0	87	1	0	2	2	84	3444	5	7	1	13	782	4	4	0	8	892	2	11	13	26	892	11	5	21	37	878	6	0	7	13	121	0.149425287356322	0.351351351351351	0.137813211845103	2.54947509492964	0.107438016528926	2	2	1	5	124	0.0574712643678161	0.192307692307692	0.139013452914798	1.3833746898263	0.0403225806451613	0.183908045977011	16	31	245	1525	0.000474952165295291	3.20972147930193	1.79652080202664	Inf	2.45940078158923	4.4458398744113	0.000100037228519295	9.93674400264447	1.69987995198079	0.0920776141483905	1.9144819052143	1	71	68
TCGA-MP-A4T4-01A-11D-A25L-08	0	0	1	1	456	6	3	11	14	436	17876	17	20	2	39	4185	20	16	3	39	4166	26	123	52	201	4792	21	88	48	157	4733	6	11	8	25	613	0.0548245614035088	0.159235668789809	0.129516163110078	1.22946561236895	0.0407830342577488	8	13	10	31	607	0.0679824561403509	0.154228855721393	0.126669449081803	1.21756948371815	0.0510708401976936	0.0701754385964912	32	115	1220	8305	0.00191301067317177	1.89397468864466	1.32004872687838	Inf	1.69956507193041	2.32560167422393	0.00178274230483019	2.8875230612343	1.40532786885246	0.0860714614403693	1.4942245757566	0.530729918092061	424	404
TCGA-MP-A4T6-01A-32D-A25L-08	0	0	0	0	88	1	1	1	2	85	3485	1	5	1	7	736	2	9	2	13	837	7	7	22	36	977	5	4	20	29	935	4	1	1	6	113	0.0681818181818182	0.206896551724138	0.120855614973262	1.71193164479707	0.0530973451327434	4	3	5	12	115	0.136363636363636	0.333333333333333	0.117707267144319	2.83188405797101	0.104347826086957	0.159090909090909	14	40	228	1684	0.00427799938902323	2.58339178530335	1.42820930586708	Inf	2.17413905133203	5.5906432748538	1.46087454760769e-05	14.7323141791939	1.19799498746867	0.38916447525261	1.23085115939216	0.733222421047541	74	71
TCGA-MP-A4T7-01A-11D-A24P-08	0	0	0	0	153	0	0	4	4	149	6109	8	4	2	14	1384	5	2	3	10	1399	11	36	11	58	1612	5	36	26	67	1714	0	2	3	5	188	0.0326797385620915	0.0746268656716418	0.109684947491249	0.680374722134011	0.0265957446808511	1	3	2	6	184	0.0392156862745098	0.103448275862069	0.114143920595533	0.906296851574213	0.0326086956521739	0.0392156862745098	6	47	372	2954	0.552970078520432	1.01372385112432	0.419406213358228	Inf	1.01217285453439	0.55880376344086	0.850136985020019	0.529469935624544	1.20822435338564	0.401590877297744	1.24067221860863	0.148606811145511	147	143
TCGA-MP-A4T8-01A-11D-A24P-08	0	0	0	0	130	3	3	5	8	119	4879	9	6	4	19	1210	1	11	2	14	1146	3	20	18	41	1214	2	25	18	45	1309	0	1	3	4	148	0.0307692307692308	0.0888888888888889	0.113063407181054	0.786186186186186	0.027027027027027	0	3	5	8	150	0.0615384615384615	0.195121951219512	0.123558484349259	1.57918699186992	0.0533333333333333	0.0615384615384615	8	33	298	2225	0.107060894225206	1.80952703573732	0.83113469203564	Inf	1.65198886888198	0	1	0	1.88143176733781	0.0575368525263422	2.13244886358579	0.00134607618791224	122	111
TCGA-MP-A4T9-01A-11D-A24P-08	0	0	0	0	46	0	0	2	2	44	1804	0	3	0	3	407	3	1	1	5	456	4	8	5	17	461	1	6	12	19	480	1	0	1	2	65	0.0434782608695652	0.105263157894737	0.135416666666667	0.777327935222672	0.0307692307692308	2	1	1	4	60	0.0869565217391304	0.235294117647059	0.130151843817787	1.8078431372549	0.0666666666666667	0.108695652173913	5	17	125	816	0.164254688690166	1.91848427228455	0.666640243619427	Inf	1.71090909090909	4.5168	0.0196992876075405	9.74966686386397	0.885647058823529	0.68183923105712	0.870542411901993	1	41	39
TCGA-MP-A4TA-01A-21D-A24P-08	0	0	0	0	410	6	1	12	13	391	16031	31	22	3	56	3979	20	23	5	48	4015	27	88	49	164	4052	18	64	41	123	3985	6	12	7	25	618	0.0609756097560976	0.203252032520325	0.155081555834379	1.31061383429368	0.040453074433657	7	6	5	18	601	0.0439024390243902	0.109756097560976	0.148321816386969	0.739986201858691	0.0299500831946755	0.0609756097560976	25	110	1219	6818	0.16918672654323	1.27111992428091	0.848341284956373	Inf	1.22094613070823	1.90467596390484	0.0141799654999263	2.27190335398133	0.879081214109926	0.728882193801464	0.860494274008052	1	385	366
TCGA-MP-A4TC-01A-11D-A24P-08	0	0	0	0	286	6	1	9	10	270	11070	12	4	2	18	2504	12	12	2	26	2744	19	57	37	113	2897	15	69	29	113	2925	4	6	8	18	395	0.0629370629370629	0.15929203539823	0.135042735042735	1.17956760389829	0.0455696202531646	3	4	9	16	340	0.0559440559440559	0.141592920353982	0.117362789092164	1.20645497136908	0.0470588235294118	0.0839160839160839	24	76	735	5087	0.00146343865770776	2.18523252174557	1.42255333888319	Inf	1.9010612244898	1.63081232492997	0.130391276259397	1.79413301308446	2.04028035456607	0.00305450072376068	2.40070819524376	0.0214207475547899	262	246
TCGA-MP-A4TD-01A-32D-A25L-08	0	0	0	0	95	3	0	6	6	86	3526	3	4	3	10	798	4	3	0	7	841	4	14	14	32	930	3	16	18	37	957	1	3	2	6	124	0.0631578947368421	0.162162162162162	0.12957157784744	1.25152571926765	0.0483870967741935	1	0	1	2	115	0.0210526315789474	0.0625	0.123655913978495	0.505434782608696	0.0173913043478261	0.0526315789473684	5	34	239	1648	0.562031914111667	1.01402269959104	0.374111247577906	Inf	1.01223044737689	2.25582785415421	0.220495959019049	2.75607229496665	0.740193514644351	0.788914091310522	0.713428507744606	1	90	81
TCGA-MP-A4TE-01A-22D-A25L-08	0	0	0	0	158	2	3	5	8	148	6068	8	3	4	15	1450	7	4	1	12	1397	6	23	17	46	1600	12	25	38	75	1621	0	4	1	5	216	0.0316455696202532	0.0666666666666667	0.133251079580506	0.500308641975309	0.0231481481481481	0	4	2	6	211	0.0379746835443038	0.130434782608696	0.131875	0.989078920255512	0.028436018957346	0.0189873417721519	3	70	427	2794	0.99757905373732	0.280496547433207	0.0744486693937517	Inf	0.30999967918899	0	1	0	0.411454119650841	0.981876889418888	0.377577669851965	0.214285714285714	155	145
TCGA-MP-A4TF-01A-11D-A25L-08	0	0	0	0	479	11	1	13	14	454	18614	17	20	5	42	4352	22	14	9	45	4393	22	110	51	183	4915	25	109	50	184	4954	4	9	7	20	647	0.0417536534446764	0.108695652173913	0.130601534113847	0.832269336738122	0.0309119010819165	8	16	7	31	628	0.0647181628392484	0.169398907103825	0.127772126144456	1.32578921722182	0.0493630573248408	0.0542797494780793	26	122	1275	8594	0.0652297945636963	1.43641354542782	0.96910786253553	Inf	1.35979862215156	1.9762703379224	0.0146358945056748	2.31057314538545	1.07292564550573	0.433578976089265	1.08467833401057	0.820606101577243	453	428
TCGA-MP-A4TH-01A-31D-A25L-08	0	0	1	1	129	3	1	5	6	120	4920	5	9	4	18	1160	8	8	2	18	1206	10	14	16	40	1327	5	22	17	44	1227	0	3	2	5	160	0.0387596899224806	0.113636363636364	0.13039934800326	0.871448863636364	0.03125	0	3	2	5	174	0.0387596899224806	0.125	0.13112283345893	0.953304597701149	0.028735632183908	0.0310077519379845	4	44	334	2220	0.888035626444365	0.604344663217043	0.197119241907464	Inf	0.637225548902196	0	1	0	0.926873525675921	0.642902466712008	0.916801248915061	0.086687306501548	125	116
TCGA-MP-A4TI-01A-21D-A24P-08	0	0	0	0	291	3	1	2	3	285	11685	8	9	6	23	2815	4	4	2	10	2904	25	30	78	133	2979	29	32	58	119	2987	21	10	34	65	454	0.223367697594502	0.546218487394958	0.151991965182457	3.59373264724392	0.143171806167401	16	5	46	67	439	0.230240549828179	0.503759398496241	0.147364887546156	3.41844931234693	0.152619589977221	0.402061855670103	117	73	893	5073	1.917896415441e-46	9.09952384232746	6.99897315158615	Inf	4.11399776035834	4.57762017336485	1.71985311066505e-18	12.3516528997469	3.92991239048811	9.47030627602098e-31	8.11087503084106	1.51646422421212e-07	174	168
TCGA-MP-A4TK-01A-11D-A24P-08	0	0	0	0	399	7	1	11	12	380	15580	19	10	7	36	3682	20	10	2	32	3854	20	77	46	143	4031	20	99	50	169	4013	10	13	16	39	546	0.0977443609022556	0.230769230769231	0.13605781211064	1.69611158072697	0.0714285714285714	12	8	15	35	559	0.087719298245614	0.244755244755245	0.138675266683205	1.76495240001501	0.0626118067978533	0.132832080200501	53	83	1105	6939	5.11959208467517e-13	4.00928885483995	2.93321792025567	Inf	2.83691775352675	4.00380090497738	1.13558508684882e-09	7.67181969080704	2.35071644042232	3.23797443806318e-06	2.99433567890648	0.169922235092706	346	327
TCGA-MP-A5C7-01A-11D-A25L-08	0	0	0	0	87	1	3	2	5	81	3321	1	8	2	11	816	2	7	1	10	782	4	14	13	31	887	1	9	19	29	836	1	0	3	4	103	0.0459770114942529	0.137931034482759	0.123205741626794	1.11951791094744	0.0388349514563107	0	1	0	1	110	0.0114942528735632	0.032258064516129	0.124013528748591	0.260117302052786	0.00909090909090909	0.0459770114942529	4	33	213	1510	0.687720882692405	0.859389854330539	0.275835163510668	Inf	0.874508311128029	1.61784037558685	0.484112769659124	1.77157511030818	0.758362676056338	0.774377932891937	0.733481798435976	0.523809523809524	83	77
TCGA-NJ-A4YF-01A-12D-A25L-08	0	0	0	0	665	17	4	19	23	625	25625	29	12	8	49	6152	34	26	2	62	6315	41	161	57	259	6536	36	162	57	255	6622	7	24	6	37	937	0.0556390977443609	0.145098039215686	0.141498036846874	1.0254420658338	0.0394877267876201	8	17	7	32	867	0.0481203007518797	0.123552123552124	0.13264993880049	0.931414855290288	0.0369088811995386	0.0421052631578947	28	163	1804	11354	0.383777584354943	1.08115864931868	0.746045317080823	Inf	1.06924693235509	1.42086848849598	0.100373529249436	1.52262998496221	0.831748161979227	0.799972987532167	0.810104148102833	0.832687965832813	637	597
TCGA-NJ-A4YG-01A-22D-A25L-08	0	0	0	0	167	3	2	2	4	160	6560	4	6	1	11	1552	4	8	2	14	1665	11	26	25	62	1634	12	24	37	73	1709	7	6	9	22	254	0.131736526946108	0.301369863013699	0.148624926857812	2.02772084996225	0.0866141732283465	4	4	6	14	226	0.0838323353293413	0.225806451612903	0.138310893512852	1.63260062803311	0.0619469026548673	0.155688622754491	26	59	480	2863	0.000130055461049169	2.62735059720371	1.70535608414884	Inf	2.1303431372549	3.33088768115942	0.000145823012576685	5.46321609784153	1.68497983870968	0.0286439229997495	1.90304663868409	0.462075597471318	141	134
TCGA-NJ-A4YI-01A-11D-A25L-08	0	0	0	0	491	17	5	16	21	453	18573	22	18	5	45	4140	15	14	7	36	4444	19	118	54	191	4953	25	105	51	181	5036	6	11	8	25	597	0.0509164969450102	0.138121546961326	0.118546465448769	1.1651258132282	0.0418760469011725	4	10	9	23	572	0.0468431771894094	0.120418848167539	0.115485564304462	1.04271775345074	0.0402097902097902	0.054989816700611	27	122	1169	8820	0.0147921324526877	1.66966719632372	1.13377732252059	Inf	1.54840654261946	1.94202504082744	0.0286856207226171	2.21885633589562	1.38346164813231	0.105557071616966	1.45747074995308	0.172623729259697	464	426
TCGA-NJ-A4YP-01A-11D-A25L-08	0	0	0	0	626	7	2	7	9	610	25010	11	9	2	22	6120	14	10	5	29	6330	69	64	143	276	6343	69	73	141	283	6217	49	17	80	146	969	0.233226837060703	0.515901060070671	0.155862956409844	3.30996583122741	0.150670794633643	54	23	93	170	992	0.271565495207668	0.615942028985507	0.156392874034369	3.93842771154745	0.171370967741935	0.440894568690096	276	146	1961	10599	9.30577959643291e-112	10.2163110015556	8.55238457866048	Inf	4.18898376154926	4.78046545314798	1.16925751744807e-52	15.9001714773065	3.90157364380059	4.60748208616892e-65	8.4215961040082	2.73908853635417e-08	350	334
TCGA-NJ-A4YQ-01A-11D-A25L-08	0	0	2	2	1272	23	4	38	42	1207	49487	62	48	18	128	11545	78	44	17	139	11934	52	316	105	473	12848	57	318	92	467	13160	6	38	8	52	1752	0.0408805031446541	0.11134903640257	0.133130699088146	0.836388880740762	0.0296803652968037	9	40	17	66	1601	0.0518867924528302	0.13953488372093	0.124610834371108	1.1197652629897	0.0412242348532167	0.0314465408805031	40	266	3353	22655	0.488728449580862	1.01603619881649	0.750814285783684	Inf	1.01393932660051	1.0674269516276	0.43578732100368	1.07820748665493	0.984344650824097	0.565737622470292	0.982069102482403	0.117650166704544	1232	1167
TCGA-NJ-A55A-01A-11D-A25L-08	0	0	0	0	144	0	1	2	3	141	5781	8	2	2	12	1285	5	6	3	14	1405	10	27	16	53	1553	5	40	17	62	1538	0	3	3	6	215	0.0416666666666667	0.0967741935483871	0.139791937581274	0.692273068267067	0.027906976744186	4	3	3	10	180	0.0694444444444444	0.188679245283019	0.115904700579523	1.62788259958071	0.0555555555555556	0.0694444444444444	10	38	395	2696	0.0815484987340802	1.79572310108487	0.902965655705891	Inf	1.63027426160338	2.08675105485232	0.115952287198963	2.48090396924083	1.42278481012658	0.242710670933546	1.51649638568892	0.704251100256323	134	131
TCGA-NJ-A55O-01A-11D-A25L-08	0	0	0	0	161	4	2	4	6	151	6191	12	1	1	14	1508	7	8	0	15	1394	10	31	16	57	1627	5	47	13	65	1662	1	6	1	8	212	0.0496894409937888	0.123076923076923	0.127557160048135	0.964876632801161	0.0377358490566038	3	2	3	8	231	0.0496894409937888	0.140350877192982	0.141979102642901	0.988531935900357	0.0346320346320346	0.0496894409937888	8	36	443	2846	0.237551809310575	1.42746329210743	0.66110158212218	Inf	1.34988713318284	1.9798344620015	0.134035514913827	2.33522425759631	1.02405230793181	0.56204341937094	1.02789579166391	1	153	143
TCGA-NJ-A55R-01A-11D-A25L-08	0	0	0	0	297	8	2	8	10	279	11439	13	12	2	27	2684	17	11	6	34	2832	10	66	36	112	2981	17	60	29	106	2942	5	5	5	15	406	0.0505050505050505	0.141509433962264	0.138001359619307	1.02542057812064	0.0369458128078818	2	7	5	14	420	0.0471380471380471	0.125	0.140892318014089	0.887202380952381	0.0333333333333333	0.0572390572390572	17	75	826	5097	0.138434825480884	1.39860191173485	0.847830500491419	Inf	1.32502105484788	1.85907093534212	0.0729367695128258	2.15939274192134	1.10318495064258	0.422920118986109	1.12188837284888	0.564807498286014	280	262
TCGA-O1-A52J-01A-11D-A25L-08	0	0	0	0	199	3	2	6	8	188	7708	7	6	4	17	1866	7	11	3	21	1819	13	36	17	66	1951	5	52	27	84	2072	1	6	2	9	260	0.0452261306532663	0.107142857142857	0.125482625482625	0.853846153846154	0.0346153846153846	3	2	2	7	250	0.0351758793969849	0.106060606060606	0.128139415684264	0.82769696969697	0.028	0.0402010050251256	8	54	510	3513	0.536808214457487	1.02047636332999	0.483042440393269	Inf	1.01783681214421	1.75294117647059	0.187632031769123	1.96771991396076	0.717112299465241	0.825327022018305	0.688879073417076	1	191	180
Totals	5	64	94	163	183898	3510	1559	4838	6397	173975	7132975	7790	6929	2311	17030	1702799	8086	7087	2365	17538	1733992	12088	33949	23200	69237	1836290	12584	34029	23557	70170	1859894	4762	4277	5629	14668	254682	0.0797616069777812	0.209035200228018	0.13693361019499	1.52654414011547	0.0575933909738419	4465	4262	5311	14038	247041	0.0763357948427933	0.202752863353409	0.134532671854663	1.50709014069418	0.0568245756777215	0.10966405289889	20167	51262	501723	3194461	0	2.50480537242014	2.47021583739738	Inf	2.07996630967761	2.75515309716129	0	3.80335920862478	1.72369434139912	0	1.94482849439039	1.08126074367158e-50	163731	153808
