		Clinical Features	CN_CNMF		METHLYATION_CNMF		RPPA_CNMF		RPPA_CHIERARCHICAL		MRNASEQ_CNMF		MRNASEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_CNMF		MIRSEQ_CHIERARCHICAL		MIRSEQ_MATURE_CNMF		MIRSEQ_MATURE_CHIERARCHICAL	
	nCNV (%)	nWild-Type	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q	Fisher's exact test_P	Fisher's exact test_Q
amp_1p12	121 (33%)	246	0.13477	0.301	0.96335	0.971	0.25164	0.418	0.92964	0.944	0.02974	0.12	0.64009	0.739	0.50566	0.637	0.56382	0.687	0.64176	0.739	0.70142	0.784
amp_1q21.3	203 (55%)	164	9.9999e-06	0.000245	0.13039	0.293	0.00117	0.0132	0.097869	0.244	0.00049	0.00645	0.35745	0.517	0.0274	0.115	0.01275	0.0678	0.03886	0.145	0.053619	0.169
amp_1q44	201 (55%)	166	2e-05	0.000432	0.066139	0.195	0.00066999	0.00822	0.084619	0.225	0.00149	0.0161	0.072039	0.202	0.00017	0.00255	0.0016	0.0169	0.0050899	0.0357	0.01262	0.0678
amp_3p13	103 (28%)	264	0.1513	0.32	0.79907	0.854	0.28922	0.447	0.76033	0.828	0.7307	0.807	0.42025	0.565	0.93042	0.944	0.1073	0.259	0.79728	0.854	0.85929	0.894
amp_4q12	65 (18%)	302	0.12443	0.284	0.40729	0.558	0.209	0.376	0.38462	0.537	0.48919	0.626	0.072399	0.202	0.00456	0.0333	0.00090999	0.0107	0.061709	0.187	0.30583	0.461
amp_5p15.33	110 (30%)	257	9.9999e-06	0.000245	0.28441	0.445	0.40473	0.556	0.35189	0.515	0.14874	0.32	0.1914	0.362	0.00184	0.0184	0.17901	0.352	0.082659	0.223	0.22003	0.388
amp_5q35.3	59 (16%)	308	9.9999e-06	0.000245	0.03018	0.12	0.46046	0.602	0.051219	0.166	0.18103	0.353	0.092619	0.238	0.39444	0.546	0.1492	0.32	0.052979	0.168	0.58348	0.698
amp_6p24.3	211 (57%)	156	9.9999e-06	0.000245	9.9999e-06	0.000245	0.0268	0.114	0.04997	0.165	0.0067699	0.043	0.00421	0.0316	0.00414	0.0316	8.9999e-05	0.00157	2e-04	0.00292	0.00014	0.00236
amp_6q12	81 (22%)	286	0.38569	0.537	0.46323	0.603	0.61325	0.712	0.01207	0.0665	0.25778	0.423	0.24169	0.409	0.61303	0.712	0.02525	0.11	0.23387	0.404	0.36078	0.521
amp_7p22.1	209 (57%)	158	4e-04	0.00553	0.15832	0.331	0.4847	0.622	0.30039	0.457	0.23413	0.404	0.11529	0.273	0.92555	0.944	0.42606	0.569	0.85896	0.894	0.2408	0.409
amp_7q34	225 (61%)	142	0.00192	0.0185	0.8586	0.894	0.25194	0.418	0.557	0.685	0.19413	0.364	0.15261	0.322	0.62596	0.724	0.20317	0.374	0.47805	0.616	0.00201	0.019
amp_8q24.21	192 (52%)	175	9.9999e-06	0.000245	8.9999e-05	0.00157	0.51528	0.645	0.91671	0.939	5e-05	0.00104	0.054079	0.169	0.92971	0.944	0.12484	0.284	0.37114	0.527	0.27502	0.438
amp_11q13.3	69 (19%)	298	0.01362	0.0714	0.072879	0.202	0.78745	0.851	0.44876	0.59	0.53025	0.661	0.79518	0.854	0.57333	0.694	0.069909	0.201	0.72631	0.804	0.32901	0.488
amp_12q14.1	58 (16%)	309	0.0221	0.103	0.42045	0.565	0.88149	0.912	0.18267	0.355	0.27589	0.438	0.30073	0.457	0.8429	0.889	0.23468	0.404	0.31773	0.474	0.02508	0.11
amp_12q15	59 (16%)	308	0.20789	0.375	0.49367	0.629	0.11999	0.278	0.13691	0.302	0.21439	0.382	0.063839	0.191	0.46913	0.608	0.32049	0.477	0.56496	0.687	0.098379	0.244
amp_13q31.3	104 (28%)	263	9.9999e-06	0.000245	2e-05	0.000432	0.21395	0.382	0.17992	0.352	5.9999e-05	0.0012	0.01051	0.0607	0.7038	0.784	0.58422	0.698	0.12661	0.286	0.01281	0.0678
amp_15q26.2	120 (33%)	247	0.00265	0.0224	0.17296	0.346	0.81012	0.861	0.49241	0.629	0.4395	0.579	0.11576	0.273	0.28043	0.44	0.56449	0.687	0.17175	0.345	0.36554	0.525
amp_17q25.3	122 (33%)	245	0.00058999	0.00759	0.076049	0.21	0.19738	0.366	0.34155	0.503	0.80217	0.854	0.03457	0.13	0.31471	0.471	0.071379	0.201	0.4839	0.622	0.064049	0.191
amp_20q13.33	188 (51%)	179	9.9999e-06	0.000245	0.01912	0.093	0.017	0.085	0.098389	0.244	0.11779	0.275	0.0437	0.154	0.25078	0.418	0.69457	0.779	0.74817	0.817	0.26444	0.429
amp_22q13.2	152 (41%)	215	0.00217	0.0202	0.04422	0.154	0.22237	0.39	0.27276	0.436	0.27747	0.439	0.53547	0.665	0.41901	0.565	0.091509	0.238	0.57918	0.698	0.0108	0.0614
del_1p36.31	81 (22%)	286	0.0057299	0.0397	0.0063699	0.0418	0.071009	0.201	0.80126	0.854	0.10669	0.259	0.02457	0.109	0.0115	0.0643	0.14694	0.317	0.16885	0.342	0.28992	0.447
del_1p22.1	97 (26%)	270	0.00017	0.00255	0.00404	0.0316	0.30256	0.458	0.054479	0.169	0.01748	0.0866	0.0067199	0.043	0.11316	0.27	0.64576	0.74	0.04196	0.152	0.69421	0.779
del_2q37.3	93 (25%)	274	0.01631	0.0823	0.01056	0.0607	0.17387	0.346	0.02333	0.107	0.04413	0.154	0.0018	0.0183	0.01243	0.0678	0.03433	0.13	0.24051	0.409	0.6472	0.74
del_3p25.1	71 (19%)	296	0.04754	0.162	0.42317	0.567	0.46492	0.603	0.31213	0.469	0.69532	0.779	0.81162	0.861	0.15898	0.331	0.27032	0.434	0.21775	0.386	0.61857	0.717
del_3q13.31	62 (17%)	305	0.12	0.278	0.056759	0.174	0.17449	0.346	0.063039	0.19	0.02447	0.109	0.28605	0.445	0.04946	0.165	0.060669	0.185	0.16499	0.336	0.58959	0.698
del_4p16.3	91 (25%)	276	0.56234	0.687	0.070629	0.201	0.38755	0.538	0.74031	0.813	0.51619	0.645	0.04569	0.158	0.98772	0.991	0.20966	0.376	0.53188	0.662	0.94175	0.954
del_4q34.3	110 (30%)	257	0.0068499	0.043	0.37118	0.527	0.74767	0.817	0.72211	0.801	0.03137	0.123	0.00476	0.0338	0.58932	0.698	0.00313	0.026	0.1704	0.343	0.04888	0.164
del_5p15.31	79 (22%)	288	9.9999e-06	0.000245	0.5924	0.698	0.094539	0.24	0.79635	0.854	0.43943	0.579	0.28	0.44	0.99095	0.993	0.43035	0.572	0.19012	0.361	0.66947	0.759
del_5q12.1	97 (26%)	270	9.9999e-06	0.000245	0.16505	0.336	0.00265	0.0224	0.16349	0.336	0.33927	0.501	0.1076	0.259	0.84636	0.889	0.59028	0.698	0.60788	0.712	0.94432	0.955
del_5q31.3	131 (36%)	236	9.9999e-06	0.000245	0.02996	0.12	0.02601	0.111	0.65095	0.743	0.24362	0.411	0.37046	0.527	0.84462	0.889	0.60946	0.712	0.58852	0.698	0.78822	0.851
del_6q21	214 (58%)	153	9.9999e-06	0.000245	0.0017	0.0177	0.64324	0.739	0.43203	0.572	0.00192	0.0185	0.1317	0.295	0.50097	0.636	0.15518	0.326	0.099299	0.245	0.41043	0.558
del_6q26	221 (60%)	146	9.9999e-06	0.000245	0.00417	0.0316	0.20415	0.374	0.20359	0.374	0.0063399	0.0418	0.050859	0.165	0.39851	0.549	0.18917	0.361	0.31484	0.471	0.27786	0.439
del_8p23.3	89 (24%)	278	0.00028	0.00398	0.082109	0.223	0.03231	0.126	0.0217	0.102	0.070849	0.201	0.95095	0.96	0.29011	0.447	0.43251	0.572	0.26617	0.43	0.80211	0.854
del_9p23	249 (68%)	118	0.00017	0.00255	0.03137	0.123	0.04224	0.152	0.25236	0.418	0.04431	0.154	0.16005	0.331	0.091629	0.238	0.089259	0.235	0.70417	0.784	0.00127	0.014
del_9p21.3	278 (76%)	89	9.9999e-06	0.000245	0.00060999	0.00766	0.0082099	0.051	0.20632	0.375	0.00253	0.0224	0.00333	0.0272	0.02978	0.12	0.50288	0.636	0.12618	0.286	0.00262	0.0224
del_10p15.3	199 (54%)	168	9.9999e-06	0.000245	0.00462	0.0333	0.73908	0.813	0.58526	0.698	0.00457	0.0333	0.00102	0.0117	0.90048	0.926	0.19485	0.364	0.29987	0.457	0.11141	0.267
del_10q21.1	217 (59%)	150	9.9999e-06	0.000245	0.01421	0.0724	0.88528	0.912	0.91274	0.937	0.093699	0.239	0.0346	0.13	0.50246	0.636	0.13643	0.302	0.15026	0.32	0.65279	0.744
del_10q23.31	230 (63%)	137	9.9999e-06	0.000245	0.00227	0.0208	0.86302	0.896	0.68063	0.769	0.03416	0.13	0.01987	0.095	0.69333	0.779	0.26126	0.426	0.30176	0.458	0.37175	0.527
del_10q26.3	236 (64%)	131	9.9999e-06	0.000245	0.00366	0.0295	0.98178	0.987	1	1	0.0064199	0.0418	0.0062699	0.0418	0.6701	0.759	0.18962	0.361	0.11713	0.275	0.22516	0.393
del_11p15.5	114 (31%)	253	0.00041	0.00553	0.19285	0.363	0.7667	0.833	0.85512	0.894	0.88492	0.912	0.3527	0.515	0.45461	0.596	0.082699	0.223	0.20773	0.375	0.40827	0.558
del_11q23.3	204 (56%)	163	9.9999e-06	0.000245	0.56319	0.687	0.38312	0.537	0.16136	0.333	0.16901	0.342	0.20635	0.375	0.28499	0.445	0.070919	0.201	0.0487	0.164	0.12044	0.278
del_12q23.3	92 (25%)	275	0.02748	0.115	0.01005	0.059	0.26144	0.426	0.14553	0.316	0.50496	0.637	0.7322	0.807	0.58772	0.698	0.10668	0.259	0.66165	0.752	0.37602	0.53
del_13q34	85 (23%)	282	0.78243	0.848	0.46449	0.603	0.61248	0.712	0.4708	0.608	0.17651	0.348	0.41854	0.565	0.58638	0.698	0.37439	0.529	0.37997	0.534	0.14525	0.316
del_14q23.3	120 (33%)	247	8.9999e-05	0.00157	0.25314	0.418	0.7199	0.8	0.01381	0.0717	0.0060199	0.0411	0.03024	0.12	0.054779	0.169	0.5553	0.685	0.18878	0.361	0.33056	0.489
del_14q32.31	117 (32%)	250	7.9999e-05	0.00154	0.065369	0.194	0.60672	0.712	0.0294	0.12	0.01155	0.0643	0.02157	0.102	0.18961	0.361	0.60574	0.712	0.41011	0.558	0.23788	0.406
del_15q13.3	84 (23%)	283	0.084589	0.225	0.052699	0.168	0.0224	0.103	0.20276	0.374	0.29024	0.447	0.04235	0.152	0.92122	0.942	0.82707	0.876	0.0083199	0.0511	0.59144	0.698
del_15q21.1	91 (25%)	276	0.04777	0.162	0.2356	0.404	0.083909	0.225	0.02425	0.109	0.42772	0.57	0.11342	0.27	0.87672	0.909	0.39667	0.548	0.090609	0.238	0.8534	0.894
del_16p13.3	62 (17%)	305	0.0096599	0.0573	0.0090899	0.0552	0.19158	0.362	0.04784	0.162	0.2565	0.422	0.56734	0.688	0.17541	0.347	0.36627	0.525	0.050639	0.165	0.4185	0.565
del_16q12.1	117 (32%)	250	9.9999e-06	0.000245	0.066549	0.195	0.092269	0.238	0.538	0.666	0.050719	0.165	0.19701	0.366	0.15998	0.331	0.054509	0.169	0.35037	0.514	0.12395	0.284
del_16q23.1	120 (33%)	247	9.9999e-06	0.000245	0.04122	0.152	0.052759	0.168	0.27015	0.434	0.0178	0.0874	0.067869	0.198	0.27283	0.436	0.081629	0.223	0.13599	0.302	0.092819	0.238
del_16q24.3	133 (36%)	234	9.9999e-06	0.000245	0.096049	0.241	0.04187	0.152	0.51339	0.645	0.02537	0.11	0.02464	0.109	0.24591	0.414	0.10273	0.252	0.069019	0.2	0.18872	0.361
del_17p13.3	134 (37%)	233	0.74907	0.817	0.26174	0.426	0.089159	0.235	0.03287	0.127	0.21632	0.384	0.38572	0.537	0.84667	0.889	0.35537	0.516	0.35399	0.515	0.22587	0.393
del_19p13.3	104 (28%)	263	0.014	0.072	0.29191	0.448	0.15038	0.32	0.22165	0.39	0.00015	0.00245	0.13845	0.304	0.36291	0.523	0.095769	0.241	0.54553	0.674	0.23288	0.404
del_xp21.1	86 (23%)	281	0.03006	0.12	2e-05	0.000432	0.14095	0.308	0.24921	0.418	0.0093099	0.0559	0.0042	0.0316	0.00237	0.0213	0.01978	0.095	0.04373	0.154	0.00072999	0.00876
