Arm # Genes Amp frequency Amp frequency score Amp z-score Amp q-value Del frequency Del frequency score Del z-score Del q-value 1p 3092 0.29 0.34 2.53 0.0344 0.15 0.21 -0.534 1 1q 2863 0.58 0.61 9.05 0 0.05 0.11 -2.02 1 2p 1500 0.20 0.22 -1.03 1 0.07 0.09 -3.63 1 2q 2495 0.19 0.21 -0.744 1 0.09 0.11 -2.85 1 3p 1531 0.08 0.12 -2.71 1 0.33 0.36 2.21 0.0384 3q 1708 0.16 0.22 -0.831 1 0.25 0.29 0.807 0.503 4p 693 0.07 0.09 -4.01 1 0.17 0.19 -2.02 1 4q 1467 0.06 0.08 -4 1 0.17 0.18 -1.77 1 5p 456 0.51 0.54 5.86 3.7e-08 0.05 0.11 -2.77 1 5q 2185 0.24 0.29 0.84 0.601 0.17 0.23 -0.457 1 6p 1664 0.16 0.19 -1.57 1 0.13 0.15 -2.31 1 6q 1304 0.09 0.12 -2.88 1 0.26 0.29 0.582 0.641 7p 926 0.53 0.56 6.56 6.31e-10 0.05 0.12 -2.53 1 7q 1717 0.44 0.48 5.03 2.54e-06 0.08 0.15 -2.01 1 8p 795 0.18 0.26 -0.28 1 0.30 0.37 1.97 0.0614 8q 1249 0.30 0.34 1.67 0.207 0.12 0.17 -1.92 1 9p 621 0.06 0.12 -2.6 1 0.48 0.51 5.38 3.56e-07 9q 1610 0.05 0.09 -2.95 1 0.48 0.50 5.76 4.99e-08 10p 767 0.12 0.15 -2.46 1 0.24 0.27 -0.142 0.9 10q 1968 0.06 0.08 -3.52 1 0.25 0.26 0.242 0.829 11p 1162 0.19 0.25 -0.416 1 0.23 0.28 0.296 0.829 11q 2133 0.21 0.26 0.213 1 0.19 0.24 -0.158 0.9 12p 804 0.21 0.27 -0.132 1 0.22 0.28 0.0436 0.841 12q 2055 0.19 0.24 -0.189 1 0.21 0.26 0.18 0.829 13p 0 0.05 0.10 -3.23 1 0.45 0.48 4.32 4.25e-05 13q 1092 0.04 0.06 -3.62 1 0.44 0.45 4.29 4.35e-05 14p 0 0.24 0.34 1.02 0.526 0.31 0.40 2.34 0.0307 14q 1829 0.25 0.27 0.358 1 0.09 0.12 -2.8 1 15p 0 0.08 0.17 -1.91 1 0.52 0.56 6.11 8.17e-09 15q 2082 0.02 0.03 -3.83 1 0.46 0.47 5.34 3.63e-07 16p 1378 0.32 0.36 2.19 0.0761 0.12 0.17 -1.76 1 16q 1070 0.25 0.31 0.875 0.601 0.21 0.28 0.172 0.829 17p 937 0.20 0.26 -0.322 1 0.22 0.27 0.0308 0.841 17q 2298 0.27 0.33 1.79 0.175 0.16 0.23 -0.427 1 18p 212 0.06 0.10 -3.48 1 0.35 0.38 2.11 0.0469 18q 644 0.06 0.11 -2.99 1 0.42 0.45 3.85 0.000256 19p 1331 0.12 0.20 -1.17 1 0.41 0.46 4.47 2.33e-05 19q 2402 0.13 0.18 -1.26 1 0.30 0.34 2.29 0.0334 20p 583 0.22 0.28 0.0232 1 0.22 0.28 0.0232 0.841 20q 1092 0.26 0.32 1.08 0.514 0.17 0.23 -0.686 1 21p 92 0.04 0.06 -4.16 1 0.38 0.40 2.48 0.0242 21q 750 0.12 0.18 -1.85 1 0.34 0.38 2.35 0.0307 22p 2 0.04 0.06 -3.95 1 0.43 0.44 3.51 0.0009 22q 1258 0.03 0.05 -3.82 1 0.45 0.46 4.52 2.16e-05 Xp 945 0.41 0.46 4.27 7.76e-05 0.12 0.20 -1.29 1 Xq 1533 0.44 0.48 5.02 2.54e-06 0.09 0.16 -1.77 1 Yp 113 0.22 0.51 3.39 0.00237 0.57 0.73 9.14 0 Yq 245 0.15 0.37 1.28 0.4 0.58 0.69 8.63 0