Sample	A_T_coord_clusters	G_C_coord_clusters	Non_coord_clusters	clusters	mutations	complex	insertions	deletions	indels	substitutions	bases	A_to_T	A_to_G	A_to_C	A	a	T_to_A	T_to_C	T_to_G	T	t	G_to_C	G_to_T	G_to_A	G	g	C_to_G	C_to_A	C_to_T	C	c	tCw_to_G	tCw_to_A	tCw_to_T	tCw	tcw	tCw_per_mut	tCw_per_C	tcw_per_c	enrich_tCw	freq_tCw	wGa_to_C	wGa_to_T	wGa_to_A	wGa	wga	wGa_per_mut	wGa_per_G	wga_per_g	enrich_wGa	freq_wGa	[tCw_to_G+tCw_to_T]_per_mut	tCw_to_G+tCw_to_T	[(C_to_G)+(C_to_T)]-[(tCw_to_G)+(tCw_to_T)]	tcw+wga	c-tcw	Fisher_p-value_tCw	odds_ratio_tCw	95%_confidence_lower_tCw	95%_confidence_upper_tCw	APOBEC_enrich	tCw_to_G_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_G	odds_ratio_tCw_to_G	tCw_to_T_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_T	odds_ratio_tCw_to_T	p-value_GvT_skew	non-APOBEC_mutations	non-APOBEC_substitutions
TCGA-A6-2671-01A-01D-1408-10	0	0	0	0	124	1	1	8	9	114	4674	0	15	2	17	1097	2	19	1	22	1207	3	10	26	39	1176	2	8	26	36	1194	1	2	1	4	162	0.032258064516129	0.111111111111111	0.135678391959799	0.818930041152263	0.0246913580246914	1	2	0	3	151	0.0241935483870968	0.0769230769230769	0.128401360544218	0.599083036169129	0.0198675496688742	0.0241935483870968	3	54	313	2057	0.9849048451052	0.365209512622115	0.096164469958112	Inf	0.398520262317135	3.02875399361022	0.13355465550007	4.37726748694169	0.145613172769722	0.999326635275236	0.128913791235324	1	121	111
TCGA-A6-2672-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	582	3	2	7	9	570	23370	5	73	14	92	5495	2	65	13	80	5607	1	50	155	206	6257	4	32	156	192	6011	0	3	1	4	796	0.00687285223367698	0.0208333333333333	0.132423889535851	0.157323073701843	0.0050251256281407	0	3	3	6	827	0.0103092783505155	0.029126213592233	0.132171967396516	0.220366044070861	0.00725513905683192	0.00687285223367698	4	312	1623	10645	0.999999999999999	0.0840948299354314	0.0285230661694707	Inf	0.0956815398894062	0	1	0	0.0972198283120655	0.999999999999998	0.0854644400265068	0.086687306501548	578	566
TCGA-A6-2674-01A-02W-0831-10	0	0	0	0	28	0	0	0	0	28	1148	0	0	0	0	284	1	2	0	3	265	0	0	7	7	296	4	0	14	18	303	3	0	0	3	34	0.107142857142857	0.166666666666667	0.112211221122112	1.48529411764706	0.0882352941176471	0	0	0	0	33	0	0	0.111486486486486	0	0	0.107142857142857	3	22	67	532	0.546634680694359	1.08265198033641	0.268706952261279	Inf	1.07283582089552	6.70522388059702	0.00551749244336688	23.5699692570856	0	1	0	0.1	25	25
TCGA-A6-2676-01A-01W-0833-10	0	0	1	1	802	0	32	16	48	754	30914	16	64	18	98	7355	5	53	12	70	7231	6	46	246	298	8212	8	34	246	288	8116	1	4	4	9	1037	0.0112219451371571	0.03125	0.127772301626417	0.244575699132112	0.00867888138862102	1	3	6	10	1070	0.0124688279301746	0.0335570469798658	0.130297126156844	0.257542495138932	0.00934579439252336	0.0149625935162095	12	494	2107	14221	1	0.16396247021813	0.0938810657931556	Inf	0.183780396982766	1.10705810563428	0.55582143121357	1.12486414704905	0.157508267061788	1	0.140037391903471	0.0127669382396857	790	742
TCGA-A6-2677-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	77	0	1	2	3	74	3034	0	1	1	2	728	0	3	2	5	762	4	5	24	33	749	3	4	27	34	795	0	1	0	1	113	0.012987012987013	0.0294117647058824	0.142138364779874	0.206923477355544	0.00884955752212389	2	1	3	6	105	0.0779220779220779	0.181818181818182	0.14018691588785	1.2969696969697	0.0571428571428571	0.0649350649350649	5	53	218	1326	0.924278496418285	0.573994391039808	0.215742804613021	Inf	0.61056627649478	2.02359108781127	0.260568975338972	2.43103909858205	0.416621694549379	0.980450471193074	0.380323691445011	1	72	69
TCGA-A6-2678-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	69	0	0	0	0	69	2829	1	5	1	7	676	2	5	3	10	710	2	13	14	29	722	3	4	16	23	721	1	1	1	3	110	0.0434782608695652	0.130434782608696	0.152565880721221	0.854940711462451	0.0272727272727273	1	2	0	3	94	0.0434782608695652	0.103448275862069	0.130193905817175	0.79457079970653	0.0319148936170213	0.0434782608695652	3	32	204	1239	0.888519167654776	0.569573517067747	0.146669203042023	Inf	0.606302521008403	2.82941176470588	0.15044990491062	4.04337412992329	0.23578431372549	0.989371891937931	0.209560306726525	1	66	66
TCGA-A6-2683-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	101	0	0	2	2	99	4059	3	6	2	11	973	2	7	5	14	1006	6	4	26	36	1041	3	10	25	38	1039	1	2	0	3	147	0.0297029702970297	0.0789473684210526	0.141482194417709	0.558002148227712	0.0204081632653061	3	2	1	6	163	0.0594059405940594	0.166666666666667	0.156580211335255	1.06441717791411	0.0368098159509202	0.0495049504950495	5	55	310	1770	0.954466682939381	0.519191803202788	0.195987468550693	Inf	0.559139784946237	2.9820788530466	0.0338403956556332	4.56291271770602	0.131562302340291	0.999711127193743	0.114249331822488	0.294117647058823	96	94
TCGA-A6-3807-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	88	0	0	1	1	87	3567	3	4	1	8	865	6	3	2	11	921	6	2	24	32	901	6	6	24	36	880	3	0	3	6	123	0.0681818181818182	0.166666666666667	0.139772727272727	1.19241192411924	0.0487804878048781	2	1	3	6	138	0.0681818181818182	0.1875	0.153163152053274	1.2241847826087	0.0434782608695652	0.125	11	49	261	1520	0.264195328350814	1.30716479573123	0.684780842776008	Inf	1.25102171136654	2.84323116219668	0.022468875273109	4.15508315723489	0.852969348659004	0.723778054769966	0.832043959050912	1	77	76
TCGA-A6-3808-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	117	0	1	1	2	114	4674	1	6	3	10	1102	2	6	1	9	1113	3	5	32	40	1238	2	11	42	55	1221	0	1	2	3	160	0.0256410256410256	0.0545454545454545	0.131040131040131	0.41625	0.01875	1	0	2	3	163	0.0256410256410256	0.075	0.131663974151858	0.569631901840491	0.0184049079754601	0.0427350427350427	5	74	323	2136	0.982240541582329	0.446929507316713	0.170281384495539	Inf	0.481835638985774	1.52260061919505	0.50614649025745	1.65284022932254	0.411513680863526	0.990572139798609	0.377987542742404	0.242424242424242	112	109
TCGA-A6-3809-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	871	5	25	134	159	706	28946	11	97	24	132	7284	14	98	23	135	7431	3	42	161	206	7242	8	57	168	233	6989	1	11	3	15	1049	0.0172215843857635	0.0643776824034335	0.150093003290886	0.428918610407623	0.0142993326978074	2	3	4	9	1064	0.0103329506314581	0.0436893203883495	0.146920740127037	0.297366596101905	0.00845864661654135	0.0114810562571757	10	330	2113	12118	0.999999999999923	0.173798366409586	0.0933349918415179	Inf	0.19808746972523	1.83681108290668	0.216819932755541	2.15048041156778	0.143297318524635	0.999999999999999	0.124682077926935	0.28646584223997	861	696
TCGA-A6-3810-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	115	0	0	1	1	114	4674	3	7	5	15	1160	3	6	4	13	1096	3	4	33	40	1255	3	7	36	46	1163	2	1	1	4	165	0.0347826086956522	0.0869565217391304	0.141874462596733	0.612911725955204	0.0242424242424242	2	0	6	8	189	0.0695652173913043	0.2	0.150597609561753	1.32804232804233	0.0423280423280423	0.0956521739130435	11	64	354	2064	0.54885284743336	1.00211781325549	0.533228804346485	Inf	1.00180790960452	4.55367231638418	0.00548859891699508	11.641113658956	0.692950135101941	0.893206087292561	0.658380988418674	0.41364921254543	104	103
TCGA-A6-4105-01A-02D-1771-10	0	0	1	1	266	0	2	2	4	260	10660	6	40	3	49	2520	8	36	3	47	2602	8	15	50	73	2770	6	17	68	91	2768	1	3	5	9	381	0.0338345864661654	0.0989010989010989	0.13764450867052	0.71852556891927	0.0236220472440945	3	2	4	9	367	0.0338345864661654	0.123287671232877	0.132490974729242	0.9305363741555	0.0245231607629428	0.0488721804511278	13	119	748	4790	0.915903045426252	0.699608358646009	0.401420239815743	Inf	0.729156538648517	2.11535523300229	0.109951183102243	2.56082229573052	0.564692286776036	0.982928863450082	0.52879854185038	0.164182424916574	253	247
TCGA-A6-5656-01A-21D-1835-10	0	0	0	0	157	0	3	5	8	149	6109	1	16	1	18	1547	2	26	2	30	1423	3	8	32	43	1586	3	7	48	58	1553	0	2	2	4	188	0.0254777070063694	0.0689655172413793	0.12105602060528	0.569699192956713	0.0212765957446809	0	2	2	4	238	0.0254777070063694	0.0930232558139535	0.150063051702396	0.619894469415673	0.0168067226890756	0.0254777070063694	4	82	426	2713	0.998062181757493	0.31073450441201	0.103326957322649	Inf	0.342723004694836	0	1	0	0.368427230046948	0.996258140607629	0.335262970457769	0.076923076923077	153	145
TCGA-A6-5657-01A-01D-1650-10	0	0	0	0	266	1	2	5	7	258	10578	1	71	4	76	2672	2	58	1	61	2646	1	17	30	48	2616	3	22	48	73	2644	1	4	4	9	426	0.0338345864661654	0.123287671232877	0.161119515885023	0.765193903144897	0.0211267605633803	0	4	5	9	393	0.0338345864661654	0.1875	0.150229357798165	1.24809160305344	0.0229007633587786	0.037593984962406	10	72	819	4441	0.839454147000636	0.753157617200461	0.39213228860474	Inf	0.783227612495905	1.60561660561661	0.492143173257403	1.80724024285577	0.741053817976895	0.874451813034796	0.70732038945178	0.00723025583982201	256	248
TCGA-A6-5659-01A-01D-1650-10	0	0	1	1	315	1	2	6	8	305	12505	3	51	4	58	3071	5	50	2	57	3171	4	15	62	81	3097	2	28	79	109	3166	1	8	7	16	482	0.0507936507936508	0.146788990825688	0.152242577384713	0.964178309033462	0.033195020746888	0	1	1	2	429	0.00634920634920635	0.0246913580246914	0.138521149499516	0.178249733805289	0.00466200466200466	0.0285714285714286	9	138	911	5352	0.99953142295231	0.3831826957101	0.195544805383325	Inf	0.420909966621116	1.14581046469082	0.610808597707287	1.1749205514747	0.390063136916022	0.999711935342209	0.353413858642226	0.0177657714921341	306	296
TCGA-A6-5660-01A-01D-1650-10	0	0	0	0	291	1	4	5	9	281	11521	1	72	2	75	2897	2	66	2	70	2992	5	12	53	70	2845	4	19	43	66	2787	2	4	5	11	467	0.0378006872852234	0.166666666666667	0.167563688554001	0.994646680942184	0.0235546038543897	2	0	3	5	435	0.0171821305841924	0.0714285714285714	0.152899824253076	0.467159277504105	0.0114942528735632	0.0412371134020619	12	93	902	4730	0.925480371383004	0.676675065339533	0.376877143188359	Inf	0.713588850174216	2.77506775067751	0.0424149023442159	4.19361969734648	0.520325203252033	0.990400623565139	0.476769925500688	0.273369766729538	279	269
TCGA-A6-5661-01A-01D-1650-10	0	0	0	0	1476	2	68	189	257	1217	49897	12	136	10	158	11748	15	124	9	148	11627	9	69	368	446	13228	5	91	369	465	13294	0	14	6	20	1655	0.013550135501355	0.043010752688172	0.124492252143824	0.34548939349641	0.0120845921450151	1	3	9	13	1674	0.00880758807588076	0.0291479820627803	0.126549742969459	0.230328259693224	0.00776583034647551	0.010840108401084	16	735	3329	23193	1	0.151667000251613	0.0945783459361602	Inf	0.169735436360211	0.569068360296958	0.847069601838304	0.53593038315253	0.162149736312566	1	0.14474803582155	8.27499972502334e-05	1460	1201
TCGA-A6-5662-01A-01D-1650-10	0	0	1	1	214	0	4	6	10	204	8364	1	67	2	70	2104	4	44	0	48	2205	2	10	31	43	2059	2	8	33	43	1996	0	1	3	4	308	0.0186915887850467	0.0930232558139535	0.154308617234469	0.602839021443673	0.012987012987013	1	0	1	2	306	0.00934579439252336	0.0465116279069767	0.148615832928606	0.31296549627603	0.0065359477124183	0.0233644859813084	5	63	614	3441	0.982576786331444	0.444844203040477	0.169258514529232	Inf	0.485605479977007	1.65105863192182	0.481842658226285	1.86768589468477	0.412764657980456	0.99116342113162	0.373677470272056	0.242424242424242	209	199
TCGA-A6-5664-01A-21D-1835-10	0	0	0	0	96	1	1	6	7	88	3608	0	22	1	23	936	0	20	2	22	950	1	1	12	14	841	2	8	19	29	881	0	3	1	4	154	0.0416666666666667	0.137931034482759	0.174801362088536	0.789072995969548	0.025974025974026	0	1	1	2	148	0.0208333333333333	0.142857142857143	0.175980975029727	0.811776061776062	0.0135135135135135	0.0208333333333333	2	32	302	1420	0.987927194697178	0.294008871402826	0.0499166600094329	Inf	0.335410985586288	0	1	0	0.36787011322367	0.980295554791314	0.324415940847888	0.454545454545454	94	86
TCGA-A6-5665-01A-01D-1650-10	0	0	0	0	2209	5	164	345	509	1693	69413	17	254	33	304	15971	19	239	21	279	15871	7	96	456	559	18815	10	94	447	551	18756	0	10	9	19	2126	0.00860117700316885	0.0344827586206897	0.113350394540414	0.304213838518182	0.00893697083725306	0	12	7	19	2240	0.00860117700316885	0.0339892665474061	0.119053946319426	0.285494665218502	0.00848214285714286	0.00724309642372114	16	904	4366	33205	1	0.13461154752035	0.0840371465625085	Inf	0.149658427771913	0	1	0	0.15247591755278	1	0.137191463407115	4.10708230465479e-06	2193	1677
TCGA-A6-5666-01A-01D-1650-10	0	0	0	0	350	0	3	3	6	342	14022	3	86	3	92	3520	3	88	6	97	3558	0	24	52	76	3457	1	17	59	77	3487	1	5	3	9	520	0.0257142857142857	0.116883116883117	0.1491253226269	0.783791208791209	0.0173076923076923	0	7	4	11	520	0.0314285714285714	0.144736842105263	0.150419438819786	0.962221659919028	0.0211538461538462	0.0228571428571429	8	104	1040	5904	0.996076630512593	0.436722758224148	0.211660684052385	Inf	0.476923076923077	6.67692307692308	0.149892008639309	Inf	0.421067221067221	0.998462398081918	0.382136304669759	0.0435960435960436	342	334
TCGA-A6-6137-01A-11D-1771-10	0	0	0	0	153	0	2	2	4	149	6109	1	18	2	21	1481	3	19	3	25	1515	1	5	46	52	1512	4	7	40	51	1601	1	3	0	4	233	0.0261437908496732	0.0784313725490196	0.145534041224235	0.538921147858285	0.0171673819742489	0	2	3	5	201	0.0326797385620915	0.0961538461538462	0.132936507936508	0.723306544202067	0.0248756218905473	0.0261437908496732	4	87	434	2679	0.999175412962097	0.283878562564022	0.0945707705022864	Inf	0.315288398237707	1.43456221198157	0.528483661077235	1.54294726008259	0.25021433929911	0.999695302026138	0.223175321384828	0.576470588235294	149	145
TCGA-A6-6138-01A-11D-1771-10	0	0	0	0	188	0	2	4	6	182	7462	3	31	1	35	1829	0	28	4	32	1902	4	14	42	60	1879	2	5	48	55	1852	0	0	4	4	269	0.0212765957446809	0.0727272727272727	0.14524838012959	0.50070969922271	0.0148698884758364	1	4	2	7	289	0.0372340425531915	0.116666666666667	0.153805215540181	0.758535178777393	0.0242214532871972	0.0372340425531915	7	89	558	3173	0.992184418408211	0.447312027075886	0.203601509568799	Inf	0.487548536439665	1.11439665471924	0.62201217151461	1.13720290374584	0.445758661887694	0.994749211773362	0.406238069536227	0.0634674922600621	181	175
TCGA-A6-6141-01A-11D-1771-10	0	0	1	1	1146	1	1	2	3	1142	46822	5	63	57	125	12697	0	58	56	114	12752	7	167	257	431	10591	5	190	277	472	10782	0	156	21	177	1827	0.154450261780105	0.375	0.169449081803005	2.21305418719212	0.09688013136289	0	140	21	161	1839	0.140488656195462	0.373549883990719	0.173637994523652	2.15131420410316	0.087547580206634	0.0366492146596859	42	504	3666	17707	0.999999999941025	0.402513283342039	0.302289313711764	Inf	0.448466154685467	0	1	0	0.458544045801995	0.999999999785166	0.412330378890178	1.16956236754891e-13	1104	1100
TCGA-A6-6142-01A-11D-1771-10	1	0	0	1	133	0	1	7	8	125	5125	1	31	3	35	1358	3	25	2	30	1423	0	5	16	21	1155	0	13	26	39	1189	0	1	2	3	209	0.0225563909774436	0.0769230769230769	0.175777964676198	0.437615016562385	0.0143540669856459	0	2	1	3	203	0.0225563909774436	0.142857142857143	0.175757575757576	0.812807881773399	0.0147783251231527	0.0225563909774436	3	39	412	1932	0.984940219297319	0.360823833660249	0.0940953060915229	Inf	0.406380027739251	NaN	1	0	0.406380027739251	0.984940219297319	0.360823833660249	0.181818181818182	130	122
TCGA-A6-6648-01A-11D-1771-10	0	0	0	0	137	0	0	4	4	133	5453	2	27	0	29	1270	4	13	2	19	1375	1	3	35	39	1381	3	5	38	46	1427	1	0	3	4	194	0.0291970802919708	0.0869565217391304	0.135949544498949	0.639623487225459	0.0206185567010309	1	1	3	5	165	0.0364963503649635	0.128205128205128	0.119478638667632	1.07303807303807	0.0303030303030303	0.0583941605839416	8	69	359	2449	0.78244892841813	0.790984372557937	0.377103324053314	Inf	0.81264696306479	3.9108635097493	0.0826463542482448	6.81280143046602	0.642881672835502	0.916302660689261	0.610989628371222	0.153434800493624	129	125
TCGA-A6-6649-01A-11D-1771-10	0	0	1	1	192	1	1	3	4	187	7667	5	24	3	32	1775	3	27	1	31	1833	1	7	53	61	2008	4	10	49	63	2051	1	3	2	6	263	0.03125	0.0952380952380952	0.128230131643101	0.742712294043092	0.0228136882129278	0	0	4	4	239	0.0208333333333333	0.0655737704918033	0.11902390438247	0.550929419027368	0.0167364016736402	0.0364583333333333	7	100	502	3557	0.982367297663084	0.496062025702283	0.226321458229803	Inf	0.528968239192762	1.61713147410359	0.483654608917178	1.77110416485107	0.475626904148113	0.9896218636376	0.442917022470701	0.0572755417956657	185	180
TCGA-A6-6651-01A-21D-1835-10	0	0	1	1	172	1	0	6	6	164	6724	1	37	1	39	1745	4	43	2	49	1796	4	9	25	38	1547	5	5	28	38	1636	2	2	2	6	256	0.0348837209302326	0.157894736842105	0.156479217603912	1.00904605263158	0.0234375	1	2	1	4	236	0.0232558139534884	0.105263157894737	0.152553329023917	0.690008920606601	0.0169491525423729	0.0348837209302326	6	56	492	2691	0.931037570558583	0.586102194229749	0.244500102540646	Inf	0.626081825334382	2.15650406504065	0.151613556904334	2.73343324580833	0.366198803497469	0.991994424799084	0.32824631027964	1	166	158
TCGA-A6-6652-01A-11D-1771-10	0	0	0	0	148	0	0	7	7	141	5781	3	25	0	28	1387	4	21	1	26	1408	2	8	32	42	1442	3	13	29	45	1544	2	2	0	4	213	0.027027027027027	0.0888888888888889	0.137953367875648	0.64434011476265	0.0187793427230047	1	0	4	5	207	0.0337837837837838	0.119047619047619	0.143550624133148	0.829307568438003	0.0241545893719807	0.0472972972972973	7	59	420	2566	0.836747982967727	0.724927930844729	0.325331545274226	Inf	0.754040404040404	4.26571428571429	0.0225188843045921	9.15243546426994	0.466198282591725	0.978357898805149	0.428825233836545	1	141	134
TCGA-A6-6653-01A-11D-1771-10	0	0	0	0	1249	2	37	190	227	1020	41820	4	82	13	99	9287	12	64	13	89	9621	3	49	372	424	11492	6	57	345	408	11420	2	4	2	8	1332	0.00640512409927942	0.0196078431372549	0.116637478108581	0.168109285756345	0.00600600600600601	1	4	9	14	1338	0.011208967173739	0.0330188679245283	0.11642882004873	0.283597033025919	0.0104633781763827	0.011208967173739	14	712	2670	20242	1	0.149076056351835	0.0895949250366126	Inf	0.165479101536303	2.86042446941323	0.0776168990752439	3.79028590017824	0.131651335412325	1	0.118126851979384	0.0216953546230988	1235	1006
TCGA-A6-6654-01A-21D-1835-10	0	0	0	0	270	1	1	3	4	265	10865	2	33	1	36	2520	3	49	3	55	2728	0	6	75	81	2835	5	7	81	93	2782	2	1	6	9	386	0.0333333333333333	0.0967741935483871	0.138749101365924	0.697476182517132	0.0233160621761658	0	1	1	2	354	0.00740740740740741	0.0246913580246914	0.124867724867725	0.19774011299435	0.00564971751412429	0.0333333333333333	9	152	740	4877	0.999419587542441	0.390273694392885	0.199347610955355	Inf	0.42431593083767	3.03621621621622	0.132529795543854	4.39217123964741	0.340601178101178	0.999908617697053	0.309663530995001	0.0804953560371517	261	256
TCGA-A6-6780-01A-11D-1835-10	0	0	0	0	1183	1	51	169	220	962	39442	14	126	25	165	9224	3	116	26	145	9398	5	51	282	338	10447	11	62	241	314	10373	2	4	4	10	1319	0.0084530853761623	0.0318471337579618	0.127157042321411	0.250455131517314	0.00758150113722517	1	2	3	6	1320	0.00507185122569738	0.0177514792899408	0.126352062793146	0.140492200107585	0.00454545454545455	0.0084530853761623	10	529	2639	18181	1	0.130239558061261	0.0702005867210364	Inf	0.146370167482061	1.47925350511557	0.331244680931629	1.58979831370572	0.105593621780079	1	0.0934647776456598	0.252412503425707	1173	952
TCGA-A6-6781-01A-22D-1924-10	0	0	0	0	1982	3	60	245	305	1674	68634	10	86	7	103	15068	11	69	7	87	15127	9	63	641	713	19332	5	70	696	771	19107	1	6	9	16	2139	0.00807265388496468	0.0207522697795071	0.111948500549537	0.185373360765331	0.00748013090229079	0	4	3	7	2076	0.00353178607467205	0.00981767180925666	0.107386716325264	0.0914235218769508	0.00337186897880539	0.0065590312815338	13	1338	4215	34224	1	0.0788918148726812	0.0465355169073246	Inf	0.0877531076229286	0.651398068124047	0.803306478496268	0.624589150245411	0.0818510661517127	1	0.0735377193140824	0.000633645557071536	1969	1661
TCGA-A6-6782-01A-11D-1835-10	0	0	2	2	193	1	1	3	4	186	7626	5	34	8	47	1927	4	22	2	28	1976	8	11	41	60	1814	2	12	37	51	1909	1	3	1	5	306	0.0259067357512953	0.0980392156862745	0.160293347302252	0.611623734461105	0.0163398692810458	2	3	4	9	276	0.0466321243523316	0.15	0.152149944873208	0.985869565217391	0.0326086956521739	0.0414507772020725	8	80	582	3141	0.973006514087617	0.539765001290463	0.259253635761934	Inf	0.58153701968135	1.91907216494845	0.197304547265311	2.31228724834729	0.410058154903516	0.995794434015518	0.369718051775842	0.677616747181965	185	178
TCGA-AA-3489-01A-21D-1835-10	0	0	0	0	126	0	2	4	6	120	4920	3	13	2	18	1255	5	12	2	19	1303	6	8	27	41	1186	3	6	33	42	1176	0	3	5	8	194	0.0634920634920635	0.19047619047619	0.164965986394558	1.15463917525773	0.0412371134020619	2	3	2	7	176	0.0555555555555556	0.170731707317073	0.148397976391231	1.15049889135255	0.0397727272727273	0.0714285714285714	9	60	370	1992	0.771579964604592	0.807634469019873	0.400601136884285	Inf	0.832667450058754	1.41861861861862	0.424441474158181	1.53789815320849	0.744774774774775	0.848079877603983	0.71115682645599	0.108645677161419	117	111
TCGA-AA-3492-01A-01D-1408-10	0	0	0	0	2183	5	57	303	360	1817	74497	28	159	17	204	16348	25	150	31	206	17024	11	98	592	701	20370	14	97	595	706	20755	6	5	9	20	2432	0.00916170407695831	0.028328611898017	0.117176583955673	0.241760008200388	0.00822368421052632	2	11	11	24	2316	0.01099404489235	0.0342368045649073	0.113696612665685	0.301124226678394	0.0103626943005181	0.0128263857077416	28	1184	4748	36377	1	0.181189001810958	0.128145734515454	Inf	0.200101623473215	2.77169334456613	0.00557310773179874	3.60525342080543	0.145940045522648	1	0.131306247588308	0.0111209272230007	2155	1789
TCGA-AA-3496-01A-21D-1835-10	0	0	0	0	360	2	5	5	10	347	14227	2	27	2	31	3588	6	25	1	32	3826	3	81	52	136	3454	1	87	60	148	3359	1	6	6	13	542	0.0361111111111111	0.0878378378378378	0.161357546888955	0.544367707190585	0.0239852398523985	0	9	3	12	522	0.0333333333333333	0.0882352941176471	0.151129125651419	0.583840432724814	0.0229885057471264	0.0277777777777778	10	106	1064	5749	0.990349890071743	0.509777869264723	0.268747392357729	Inf	0.551999611096707	1.60079887218045	0.493205919976808	1.80087463950226	0.514542494629431	0.993927778199988	0.472166553345663	0.010580541940289	350	337
TCGA-AA-3502-01A-01D-1408-10	0	0	0	0	213	0	2	5	7	205	8405	3	20	4	27	2003	2	26	2	30	1971	7	10	60	77	2197	5	9	57	71	2234	1	5	2	8	307	0.0375586854460094	0.112676056338028	0.137421665174575	0.819929348075423	0.0260586319218241	2	0	2	4	273	0.0187793427230047	0.051948051948052	0.124260355029586	0.418058132343847	0.0146520146520147	0.0328638497652582	7	122	580	3851	0.998555312526994	0.381019929603868	0.174669622709943	Inf	0.414554931836407	1.90991379310345	0.20140530028813	2.2126995485895	0.261184792219275	0.999910402629143	0.235076540606266	1	206	198
TCGA-AA-3510-01A-01D-1408-10	0	0	2	2	3003	6	6	3	9	2988	122508	6	103	149	258	33359	15	100	141	256	33460	2	448	799	1249	27844	3	442	780	1225	27845	0	402	55	457	4794	0.152181152181152	0.373061224489796	0.172167355000898	2.16685227282402	0.0953274926992073	1	400	82	483	4901	0.160839160839161	0.386709367493995	0.176016376957334	2.1970078817594	0.0985513160579474	0.045954045954046	138	1446	9695	45994	1	0.452767740853663	0.388226406929721	Inf	0.500432509728539	1.14881897885508	0.615730200428804	1.18598880208499	0.498379354348151	1	0.450733697892588	4.08676029391267e-42	2865	2850
TCGA-AA-3511-01A-21D-1835-10	0	0	0	0	155	0	0	3	3	152	6232	7	17	4	28	1462	4	20	7	31	1616	6	7	25	38	1543	8	8	39	55	1611	3	1	4	8	253	0.0516129032258065	0.145454545454545	0.157045313469894	0.926194753862738	0.0316205533596838	4	1	2	7	200	0.0451612903225806	0.184210526315789	0.129617627997408	1.42118421052632	0.035	0.0838709677419355	13	65	453	2701	0.33016825786494	1.19240392246885	0.668461710840841	Inf	1.16041206769684	3.48123620309051	0.00176905648530493	5.957074478184	0.65273178807947	0.911508367583931	0.616887399345696	1	142	139
TCGA-AA-3514-01A-02W-0831-10	0	0	0	0	72	1	2	0	2	69	2829	3	1	0	4	658	1	5	1	7	705	2	9	17	28	717	3	8	19	30	749	0	1	1	2	107	0.0277777777777778	0.0666666666666667	0.142857142857143	0.466666666666667	0.0186915887850467	1	2	1	4	109	0.0555555555555556	0.142857142857143	0.152022315202232	0.939711664482307	0.036697247706422	0.0416666666666667	3	38	216	1250	0.951526742379915	0.457055636016364	0.118612074140032	Inf	0.496612466124661	1.35740740740741	0.550310977109501	1.44634362697312	0.377057613168724	0.976061753576179	0.340580636737952	1	69	66
TCGA-AA-3516-01A-02W-0833-10	0	0	0	0	911	1	10	8	18	892	36572	14	79	11	104	8483	9	75	19	103	8669	13	64	273	350	9530	10	63	262	335	9890	3	7	6	16	1311	0.017563117453348	0.0477611940298507	0.132558139534884	0.360303744435716	0.0122044241037376	1	4	5	10	1155	0.0109769484083425	0.0285714285714286	0.121196222455404	0.235745207173779	0.00865800865800866	0.0164654226125137	15	543	2466	16954	1	0.189928583493124	0.116171507392568	Inf	0.211696273622339	1.36958284847844	0.333658054258336	1.44735275563772	0.161917972273385	1	0.144331702817513	0.0643797616317861	896	877
TCGA-AA-3517-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	37	0	0	0	0	37	1517	2	0	0	2	370	2	1	0	3	374	0	4	13	17	358	2	1	12	15	415	0	0	0	0	57	0	0	0.137349397590361	0	0	0	0	0	0	51	0	0	0.142458100558659	0	0	0	0	27	108	665	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	37	37
TCGA-AA-3518-01A-02W-0833-10	0	0	0	0	548	2	15	4	19	527	21607	6	41	15	62	5263	6	52	11	69	5211	5	38	163	206	5568	4	35	151	190	5565	0	4	2	6	750	0.0109489051094891	0.0315789473684211	0.134770889487871	0.234315789473684	0.008	1	5	2	8	772	0.0145985401459854	0.0388349514563107	0.138649425287356	0.280094572161578	0.0103626943005181	0.00912408759124088	5	318	1522	9611	0.999999999999999	0.0992971206090454	0.0388191333937305	Inf	0.113230920696655	0.812746386333771	0.733756729612659	0.78935531171113	0.0931811143567381	1	0.0814878824410582	0.325925925925926	543	522
TCGA-AA-3519-01A-02W-0831-10	0	0	0	0	53	0	0	0	0	53	2173	0	2	1	3	544	1	3	5	9	525	1	6	12	19	547	2	5	15	22	557	1	1	1	3	66	0.0566037735849057	0.136363636363636	0.118491921005386	1.15082644628099	0.0454545454545455	0	3	0	3	80	0.0566037735849057	0.157894736842105	0.146252285191956	1.07960526315789	0.0375	0.0377358490566038	2	28	146	958	0.919892350105506	0.468929722692028	0.0787711025087339	Inf	0.504109589041096	2.52054794520548	0.348085976420793	3.27567100256301	0.280060882800609	0.977772131498622	0.252558845124001	1	51	51
TCGA-AA-3520-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	68	0	0	0	0	68	2788	0	5	1	6	697	1	4	2	7	664	0	5	27	32	698	1	4	18	23	729	0	1	1	2	87	0.0294117647058824	0.0869565217391304	0.119341563786008	0.72863568215892	0.0229885057471264	0	1	0	1	100	0.0147058823529412	0.03125	0.143266475644699	0.218125	0.01	0.0147058823529412	1	45	187	1240	0.998315153818008	0.147454381626446	0.0073294835640019	Inf	0.165891653103929	0	1	0	0.169578134284017	0.998068654921343	0.150805170194293	1	67	67
TCGA-AA-3521-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	55	0	2	0	2	53	2173	2	2	0	4	551	3	5	1	9	564	0	4	17	21	506	0	4	15	19	552	0	1	1	2	82	0.0363636363636364	0.105263157894737	0.148550724637681	0.708600770218229	0.024390243902439	0	1	0	1	77	0.0181818181818182	0.0476190476190476	0.152173913043478	0.312925170068027	0.012987012987013	0.0181818181818182	1	31	159	899	0.994257804074256	0.182549259570846	0.00904506771782824	Inf	0.207940251572327	NaN	1	0	0.207940251572327	0.994257804074256	0.182549259570846	1	54	52
TCGA-AA-3522-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	58	0	0	0	0	58	2378	3	1	0	4	576	1	2	1	4	558	0	7	20	27	603	0	8	15	23	641	0	0	2	2	73	0.0344827586206897	0.0869565217391304	0.113884555382215	0.763549731983323	0.0273972602739726	0	1	0	1	89	0.0172413793103448	0.037037037037037	0.14759535655058	0.250936329588015	0.0112359550561798	0.0344827586206897	2	33	162	1082	0.951708515686384	0.404994670342105	0.0685737367003657	Inf	0.438800705467372	NaN	1	0	0.438800705467372	0.951708515686384	0.404994670342105	0.4	56	56
TCGA-AA-3524-01A-02W-0831-10	0	0	0	0	52	0	0	0	0	52	2132	2	3	1	6	543	3	4	0	7	535	1	2	12	15	488	2	1	21	24	566	0	0	1	1	68	0.0192307692307692	0.0416666666666667	0.120141342756184	0.346813725490196	0.0147058823529412	0	1	1	2	69	0.0384615384615385	0.133333333333333	0.141393442622951	0.942995169082126	0.0289855072463768	0.0384615384615385	2	34	137	917	0.956347986282898	0.393972003157634	0.0666749703024123	Inf	0.427412814274128	0	1	0	0.466268524662685	0.938878355933377	0.432080280353627	0.4	50	50
TCGA-AA-3525-01A-02W-0833-10	0	0	0	0	608	2	13	17	30	576	23616	12	45	12	69	5785	14	43	12	69	5886	6	30	180	216	5976	0	36	186	222	5969	0	5	6	11	851	0.0180921052631579	0.0495495495495495	0.142569944714358	0.347545547898074	0.0129259694477086	1	5	6	12	858	0.0197368421052632	0.0555555555555556	0.143574297188755	0.386946386946387	0.013986013986014	0.0213815789473684	13	359	1709	10236	0.999999999998603	0.216904336322096	0.126919353062261	Inf	0.244255585546474	1.16491125414472	0.604143600121112	1.19786052471621	0.229162869667815	0.999999999999422	0.203047698200359	0.000633645557071536	595	563
TCGA-AA-3526-01A-02W-0831-10	0	0	0	0	66	0	0	1	1	65	2665	1	2	0	3	588	3	4	0	7	663	1	5	27	33	676	3	3	16	22	738	1	1	3	5	101	0.0757575757575758	0.227272727272727	0.136856368563686	1.66066606660666	0.0495049504950495	0	1	0	1	68	0.0151515151515152	0.0303030303030303	0.100591715976331	0.301247771836007	0.0147058823529412	0.0606060606060606	4	43	169	1245	0.827545181668518	0.685445067656902	0.222125617092448	Inf	0.712073523857485	2.09171597633136	0.400343344419971	2.45343126932548	0.583734691069217	0.900053598912078	0.552697252535153	0.545454545454546	62	61
TCGA-AA-3527-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	89	0	0	1	1	88	3608	3	5	5	13	913	3	1	2	6	855	2	4	32	38	923	5	4	22	31	917	1	0	0	1	113	0.0112359550561798	0.032258064516129	0.123227917121047	0.261775620896375	0.00884955752212389	1	1	1	3	129	0.0337078651685393	0.0789473684210526	0.1397616468039	0.564871481028152	0.0232558139534884	0.0337078651685393	3	58	242	1598	0.989812290905996	0.341681420311021	0.0899956718904158	Inf	0.373933071399539	2.17237308146399	0.2337342357239	2.63952043317537	0.140801958983777	0.999462313634638	0.124657321861792	1	86	85
TCGA-AA-3529-01A-02W-0831-10	0	0	0	0	62	0	0	1	1	61	2501	0	3	1	4	615	1	1	0	2	608	1	7	25	33	633	1	4	17	22	645	0	0	0	0	92	0	0	0.142635658914729	0	0	0	2	0	2	100	0.032258064516129	0.0606060606060606	0.157977883096367	0.383636363636364	0.02	0	0	44	192	1086	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	62	61
TCGA-AA-3530-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	83	0	0	1	1	81	3321	0	2	0	2	771	2	5	1	8	779	3	6	28	37	898	1	7	26	34	873	0	1	2	3	113	0.036144578313253	0.0882352941176471	0.129438717067583	0.681676210307132	0.0265486725663717	1	1	0	2	111	0.0240963855421687	0.0540540540540541	0.123608017817372	0.437302167031897	0.018018018018018	0.036144578313253	3	55	224	1547	0.981862096048163	0.376845453430845	0.0990546253046661	Inf	0.408943965517241	1.9765625	0.418807555364539	2.30077708820728	0.292824074074074	0.993696913032438	0.265744900284825	1	80	78
TCGA-AA-3531-01A-01W-0831-10	1	0	0	1	72	0	0	0	0	72	2952	2	4	2	8	698	1	4	0	5	638	1	8	25	34	805	1	7	17	25	811	0	1	0	1	89	0.0138888888888889	0.04	0.109741060419236	0.364494382022472	0.0112359550561798	1	2	0	3	94	0.0416666666666667	0.0882352941176471	0.116770186335404	0.755632040050063	0.0319148936170213	0.0138888888888889	1	43	183	1433	0.994708169591212	0.182207917337919	0.00911486447877414	Inf	0.200695479384004	4.41530054644809	0.214571231346792	7.81183133287367	0	1	0	1	71	71
TCGA-AA-3532-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	41	0	0	3	3	38	1558	3	2	2	7	380	0	1	0	1	379	0	3	10	13	393	1	1	15	17	406	0	0	0	0	46	0	0	0.113300492610837	0	0	0	1	1	2	53	0.0487804878048781	0.153846153846154	0.134860050890585	1.14078374455733	0.0377358490566038	0.024390243902439	1	25	99	700	0.96712585719151	0.283103471580522	0.013854772460639	Inf	0.31041181041181	0	1	0	0.322828282828283	0.962591492666201	0.294894267827358	1	40	37
TCGA-AA-3534-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	64	0	0	0	0	64	2624	1	3	0	4	633	0	0	3	3	678	0	5	21	26	666	4	7	20	31	647	2	3	1	6	93	0.09375	0.193548387096774	0.143740340030912	1.34651404786681	0.0645161290322581	0	2	1	3	89	0.046875	0.115384615384615	0.133633633633634	0.863439930855661	0.0337078651685393	0.0625	4	41	182	1131	0.885384175400635	0.606461738913201	0.196260705976449	Inf	0.641269841269841	3.60714285714286	0.0961678223083927	6.20007972223182	0.35191637630662	0.982536901126625	0.318860838934087	1	60	60
TCGA-AA-3538-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	45	1	0	1	1	43	1763	5	1	2	8	473	4	5	1	10	478	2	1	12	15	416	2	1	7	10	396	0	1	0	1	60	0.0222222222222222	0.1	0.151515151515152	0.66	0.0166666666666667	0	0	0	0	53	0	0	0.127403846153846	0	0	0	0	23	113	699	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	45	43
TCGA-AA-3542-01A-02W-0831-10	0	0	0	0	201	2	4	3	7	192	7872	12	14	13	39	1757	16	6	6	28	1698	13	25	24	62	2195	12	25	26	63	2222	3	0	0	3	245	0.0149253731343284	0.0476190476190476	0.11026102610261	0.431875607385811	0.0122448979591837	2	4	3	9	264	0.0447761194029851	0.145161290322581	0.120273348519362	1.20692815249267	0.0340909090909091	0.0398009950248756	8	67	509	3908	0.64571014922342	0.916757688704324	0.437618114176201	Inf	0.925631958087754	1.73555992141454	0.154972554099504	1.91919149115116	0.520667976424361	0.937385170273706	0.49013265712514	0.666846143491722	193	184
TCGA-AA-3543-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	234	0	5	3	8	226	9266	4	18	5	27	2344	3	20	1	24	2365	2	20	58	80	2347	1	11	83	95	2210	0	0	3	3	291	0.0128205128205128	0.0315789473684211	0.131674208144796	0.239826370048833	0.0103092783505155	1	6	1	8	354	0.0341880341880342	0.1	0.150830847890925	0.662994350282486	0.0225988700564972	0.0213675213675214	5	139	645	3912	0.999994640596738	0.21821104632498	0.0844572822771394	Inf	0.2453165374677	2.35503875968992	0.367703526509869	3.03151072633514	0.200428830611908	0.99999867269673	0.177119466567807	0.31077694235589	229	221
TCGA-AA-3544-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	66	0	0	2	2	64	2624	1	3	0	4	668	0	3	3	6	648	2	4	20	26	656	2	4	22	28	652	1	1	1	3	87	0.0454545454545455	0.107142857142857	0.133435582822086	0.80295566502463	0.0344827586206897	1	0	0	1	99	0.0151515151515152	0.0384615384615385	0.150914634146341	0.254856254856255	0.0101010101010101	0.0454545454545455	3	43	186	1122	0.966754549001659	0.42105255451719	0.109634613924441	Inf	0.458625525946704	3.51612903225806	0.100648977299847	6.01885320053542	0.167434715821813	0.998282954070553	0.147236669318487	1	63	61
TCGA-AA-3548-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	40	0	0	1	1	39	1599	0	0	0	0	407	0	5	2	7	400	0	0	11	11	386	0	1	20	21	406	0	1	1	2	60	0.05	0.0952380952380952	0.147783251231527	0.644444444444444	0.0333333333333333	0	0	1	1	65	0.025	0.0909090909090909	0.16839378238342	0.53986013986014	0.0153846153846154	0.05	2	29	125	667	0.965561946620467	0.368317645022536	0.0618384132855059	Inf	0.408774193548387	NaN	1	0	0.408774193548387	0.965561946620467	0.368317645022536	0.4	38	37
TCGA-AA-3549-01A-02W-0831-10	0	0	0	0	64	0	1	0	1	63	2583	2	1	2	5	628	2	6	1	9	625	4	4	23	31	698	1	5	12	18	632	1	0	1	2	96	0.03125	0.111111111111111	0.151898734177215	0.731481481481481	0.0208333333333333	0	0	3	3	107	0.046875	0.0967741935483871	0.153295128939828	0.63129333735303	0.0280373831775701	0.078125	5	35	203	1127	0.750740979780961	0.793228466319645	0.292543306438651	Inf	0.818965517241379	1.31034482758621	0.564168635409842	1.38754808254281	0.748768472906404	0.802197956841349	0.716509446146481	0.206349206349206	59	58
TCGA-AA-3552-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	61	0	0	0	0	61	2501	0	5	1	6	623	0	2	0	2	618	0	2	21	23	617	3	4	23	30	643	1	1	1	3	91	0.0491803278688525	0.1	0.141524105754277	0.706593406593407	0.032967032967033	0	1	1	2	89	0.0327868852459016	0.0869565217391304	0.144246353322528	0.602833414753298	0.0224719101123595	0.0491803278688525	3	44	180	1080	0.971002595943429	0.409294467959332	0.106623515193237	Inf	0.446808510638298	2.33333333333333	0.371509209532099	2.99631473347787	0.318181818181818	0.989988452872106	0.285891621945921	1	58	58
TCGA-AA-3553-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	34	0	0	1	1	33	1353	1	1	1	3	291	0	1	1	2	353	0	2	14	16	347	2	2	8	12	362	0	2	0	2	60	0.0588235294117647	0.166666666666667	0.165745856353591	1.00555555555556	0.0333333333333333	0	1	0	1	41	0.0294117647058824	0.0625	0.118155619596542	0.528963414634146	0.024390243902439	0	0	24	101	608	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	34	33
TCGA-AA-3554-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	324	0	0	2	2	322	13202	1	11	1	13	3072	0	7	1	8	3270	0	6	145	151	3397	0	9	141	150	3463	0	1	2	3	466	0.00925925925925926	0.02	0.134565405717586	0.14862660944206	0.00643776824034335	0	1	0	1	445	0.00308641975308642	0.00662251655629139	0.130997939358257	0.0505543567229705	0.00224719101123596	0.00617283950617284	2	284	911	5949	1	0.0459945333393745	0.00813372212700099	Inf	0.0526586476092513	NaN	1	0	0.0526586476092513	1	0.0459945333393745	0.428571428571429	322	320
TCGA-AA-3555-01A-01W-0831-10	0	0	1	1	869	1	3	0	3	865	35465	2	27	37	66	9729	4	26	44	74	9762	2	139	224	365	8047	2	126	232	360	7927	0	104	19	123	1388	0.141542002301496	0.341666666666667	0.175097767125016	1.95129082612872	0.0886167146974063	0	125	21	146	1432	0.16800920598389	0.4	0.177954517211383	2.24776536312849	0.10195530726257	0.046029919447641	40	420	2820	13154	0.999999978746427	0.444252522746487	0.330461498110308	Inf	0.492568609312365	0	1	0	0.496889386587035	0.999999967780584	0.448537710725537	3.7982196959898e-13	829	825
TCGA-AA-3556-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	43	0	0	0	0	43	1763	1	0	0	1	415	0	1	0	1	411	1	1	11	13	469	2	5	21	28	468	0	1	1	2	55	0.0465116279069767	0.0714285714285714	0.117521367521368	0.607792207792208	0.0363636363636364	0	0	0	0	64	0	0	0.136460554371002	0	0	0.0232558139534884	1	34	119	818	0.990908266209795	0.202364598910306	0.0100287575570665	Inf	0.224969987995198	0	1	0	0.246060924369748	0.986494338534354	0.221942586154106	1	42	42
TCGA-AA-3558-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	136	0	1	0	1	135	5535	4	10	4	18	1341	3	12	13	28	1357	2	4	37	43	1397	2	12	32	46	1440	0	2	2	4	180	0.0294117647058824	0.0869565217391304	0.125	0.695652173913043	0.0222222222222222	1	0	2	3	207	0.0220588235294118	0.0697674418604651	0.148174659985684	0.470845972362656	0.0144927536231884	0.0367647058823529	5	68	387	2450	0.976700589426103	0.465591595067602	0.177181108267095	Inf	0.50210612013734	1.83268733850129	0.444402795060431	2.10955122867701	0.424970977043778	0.988332360552306	0.389673801749407	0.265734265734266	131	130
TCGA-AA-3560-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	58	0	0	1	1	57	2337	1	5	2	8	565	0	3	0	3	543	1	4	21	26	604	1	4	15	20	625	0	1	0	1	81	0.0172413793103448	0.05	0.1296	0.385802469135803	0.0123456790123457	0	1	2	3	76	0.0517241379310345	0.115384615384615	0.125827814569536	0.917004048582996	0.0394736842105263	0.0344827586206897	2	36	157	1072	0.962508390220123	0.379539018438422	0.0644624113083445	Inf	0.412001340931948	0	1	0	0.434890304317056	0.953162502834556	0.401856356739692	0.428571428571429	56	55
TCGA-AA-3561-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	59	0	1	0	1	58	2378	2	2	1	5	578	0	2	2	4	551	2	2	22	26	627	3	2	18	23	622	1	1	0	2	71	0.0338983050847458	0.0869565217391304	0.114147909967846	0.761788120024495	0.028169014084507	0	0	3	3	82	0.0508474576271186	0.115384615384615	0.130781499202552	0.882270168855535	0.0365853658536585	0.0677966101694915	4	41	153	1096	0.81665914627456	0.699039277864966	0.225816116257212	Inf	0.72563543936093	1.63267973856209	0.481212336362023	1.78981928150457	0.612254901960784	0.881624207190148	0.581018650041217	0.523809523809524	55	54
TCGA-AA-3562-01A-02W-0831-10	0	0	0	0	48	0	1	0	1	47	1927	0	1	0	1	443	1	0	2	3	468	0	2	20	22	499	0	6	15	21	517	0	1	1	2	67	0.0416666666666667	0.0952380952380952	0.129593810444874	0.734896943852168	0.0298507462686567	0	0	3	3	65	0.0625	0.136363636363636	0.130260521042084	1.04685314685315	0.0461538461538462	0.0833333333333333	4	31	132	884	0.684515880402964	0.864251968947421	0.274942114376554	Inf	0.87965367965368	NaN	1	0	0.87965367965368	0.684515880402964	0.864251968947421	0.0476190476190476	44	43
TCGA-AA-3655-01A-02D-1719-10	0	0	0	0	253	0	5	1	6	247	10127	3	39	0	42	2427	8	36	0	44	2533	4	25	48	77	2568	3	29	52	84	2599	1	4	5	10	381	0.0395256916996047	0.119047619047619	0.146594844170835	0.812085989251344	0.026246719160105	1	6	4	11	360	0.0434782608695652	0.142857142857143	0.14018691588785	1.01904761904762	0.0305555555555556	0.0434782608695652	11	96	741	4426	0.913001965292724	0.684451675754479	0.37110585684271	Inf	0.716851438445142	1.99228841334105	0.265546980520831	2.38865144583981	0.627570850202429	0.958462137431477	0.590788090029545	0.0324653922214898	242	236
TCGA-AA-3660-01A-01D-1719-10	0	0	4	4	594	2	2	6	8	582	23862	11	98	4	113	5620	12	104	9	125	5662	10	24	143	177	6266	8	35	124	167	6314	0	7	4	11	867	0.0185185185185185	0.0658682634730539	0.137313905606589	0.479691136757627	0.0126874279123414	2	4	8	14	797	0.0235690235690236	0.0790960451977401	0.127194382381104	0.621851717953626	0.0175658720200753	0.0235690235690236	14	271	1664	10916	0.99999885664312	0.338916596687626	0.202020748791643	Inf	0.37137314439946	0.840010683760684	0.708867185125246	0.820029946252914	0.339779602420052	0.99999939547812	0.308728412493198	0.00361371807528626	580	568
TCGA-AA-3662-01A-01D-1719-10	0	0	2	2	396	0	2	3	5	389	15949	13	82	4	99	3953	19	54	2	75	3962	1	36	68	105	3940	2	29	79	110	4094	1	5	7	13	620	0.0328282828282828	0.118181818181818	0.151441133365901	0.780381231671554	0.0209677419354839	0	6	2	8	580	0.0202020202020202	0.0761904761904762	0.147208121827411	0.517569786535304	0.0137931034482759	0.0252525252525253	10	140	1200	6834	0.99937566629178	0.406816571517887	0.215869065386517	Inf	0.446333333333333	2.23166666666667	0.384687454529448	2.84698725188143	0.409897959183673	0.999702559414613	0.371443410375812	0.00886917960088692	386	379
TCGA-AA-3663-01A-01D-1719-10	0	0	2	2	2366	5	62	326	388	1969	80729	19	265	41	325	18824	31	269	44	344	19177	17	170	449	636	21264	13	150	501	664	21464	1	11	12	24	2685	0.0101437024513948	0.036144578313253	0.125093179276929	0.288941239819614	0.00893854748603352	1	18	12	31	2660	0.0131022823330516	0.0487421383647799	0.125094055680963	0.389643921123564	0.0116541353383459	0.010989010989011	26	954	5345	37383	1	0.190616420251293	0.132834166049175	Inf	0.212086061739944	0.532934206423449	0.903977632195192	0.499579277633001	0.201954015065728	1	0.181274092362546	6.51172244579385e-07	2340	1943
TCGA-AA-3664-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	165	0	1	6	7	158	6478	4	10	2	16	1483	1	10	2	13	1497	2	8	50	60	1789	2	10	57	69	1709	1	1	4	6	229	0.0363636363636364	0.0869565217391304	0.133996489174956	0.648946269223467	0.0262008733624454	0	1	1	2	196	0.0121212121212121	0.0333333333333333	0.109558412520961	0.304251700680272	0.0102040816326531	0.0363636363636364	6	105	425	3073	0.99422351382216	0.41324901584506	0.175299823917858	Inf	0.44489666136725	2.05764705882353	0.404916874546764	2.4093570726413	0.384606926882903	0.997354651760387	0.354510034210794	0.118881118881119	159	152
TCGA-AA-3666-01A-02W-0900-09	0	0	0	0	152	0	1	1	2	149	6109	2	8	14	24	1492	10	6	8	24	1546	7	10	32	49	1517	9	9	34	52	1554	1	0	1	2	211	0.0131578947368421	0.0384615384615385	0.135778635778636	0.283266496536639	0.00947867298578199	1	3	0	4	206	0.0263157894736842	0.0816326530612245	0.135794330916282	0.601149197543095	0.0194174757281553	0.0197368421052632	3	79	417	2654	0.999332487687333	0.241755866845974	0.0643101432116438	Inf	0.269433233900684	0.920563549160672	0.660276482949291	0.909223811785281	0.111583460504324	0.999928434960781	0.0979481890512508	1	149	146
TCGA-AA-3667-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	73	0	2	5	7	66	2706	3	2	3	8	670	0	3	1	4	696	4	4	16	24	674	4	2	24	30	666	0	0	2	2	101	0.0273972602739726	0.0666666666666667	0.151651651651652	0.43960396039604	0.0198019801980198	2	0	1	3	91	0.0410958904109589	0.125	0.135014836795252	0.925824175824176	0.032967032967033	0.0684931506849315	5	43	192	1148	0.834780402436065	0.695414452971745	0.258875013259223	Inf	0.726996527777778	1.74479166666667	0.323536834931674	1.99184170722845	0.5234375	0.937896903482133	0.484997966387233	1	68	61
TCGA-AA-3672-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	1797	0	23	139	162	1633	66953	18	157	21	196	15693	19	132	35	186	15499	9	98	514	621	17834	8	110	512	630	17927	0	12	12	24	2185	0.013355592654424	0.0380952380952381	0.121883192949183	0.31255530129672	0.0109839816933638	0	10	6	16	2220	0.00890372843628269	0.0257648953301127	0.12448132780083	0.206977992485239	0.00720720720720721	0.010016694490818	18	1025	4405	31356	1	0.125007237093777	0.0804245498955954	Inf	0.140104452906409	0	1	0	0.142425871716749	1	0.12711548399423	6.38376840218818e-07	1779	1615
TCGA-AA-3673-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	79	0	2	1	3	76	3116	1	3	2	6	770	1	4	0	5	741	2	3	32	37	803	4	4	20	28	802	1	1	1	3	117	0.0379746835443038	0.107142857142857	0.145885286783042	0.734432234432234	0.0256410256410256	0	1	1	2	112	0.0253164556962025	0.0540540540540541	0.13947696139477	0.387548262548263	0.0178571428571429	0.0379746835443038	3	55	229	1376	0.991971763540277	0.327897516087034	0.0861967500103336	Inf	0.362520704713146	1.16812227074236	0.603800703358941	1.20158690806135	0.269566677863621	0.996530769829166	0.240475228285198	1	76	73
TCGA-AA-3678-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	73	0	1	2	3	70	2870	1	1	2	4	685	2	2	3	7	675	4	3	18	25	764	1	2	31	34	746	0	1	0	1	94	0.0136986301369863	0.0294117647058824	0.126005361930295	0.233416770963705	0.0106382978723404	0	1	0	1	107	0.0136986301369863	0.04	0.140052356020942	0.285607476635514	0.00934579439252336	0	0	54	201	1309	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	73	70
TCGA-AA-3679-01A-02W-0900-09	0	0	0	0	78	0	0	2	2	75	3075	2	1	2	5	677	0	4	1	5	743	4	11	26	41	856	2	3	19	24	799	0	0	2	2	97	0.0256410256410256	0.0833333333333333	0.121401752190238	0.686426116838488	0.0206185567010309	1	1	1	3	90	0.0384615384615385	0.0731707317073171	0.105140186915888	0.695934959349593	0.0333333333333333	0.0512820512820513	4	47	187	1468	0.841279227222767	0.668244627366919	0.2175389288201	Inf	0.694138618014051	1.47504456327986	0.51415588994845	1.56953551093292	0.590017825311943	0.895321340121887	0.560888180058546	0.523809523809524	74	71
TCGA-AA-3680-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	116	0	1	4	5	111	4551	1	7	0	8	1023	0	3	0	3	1053	2	7	53	62	1202	1	9	28	38	1273	0	0	0	0	133	0	0	0.104477611940299	0	0	0	3	0	3	148	0.0258620689655172	0.0483870967741935	0.123128119800333	0.392981691368788	0.0202702702702703	0	0	84	281	2194	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	116	111
TCGA-AA-3681-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	123	0	1	0	1	122	5002	3	6	3	12	1173	2	6	1	9	1232	5	6	38	49	1294	2	10	40	52	1303	0	2	1	3	178	0.024390243902439	0.0576923076923077	0.136607828089025	0.422320656871219	0.0168539325842697	1	3	2	6	163	0.0487804878048781	0.122448979591837	0.12596599690881	0.972079629397771	0.0368098159509202	0.032520325203252	4	81	341	2256	0.996969660717266	0.326798885882925	0.108516884631273	Inf	0.358392271864758	1.08797653958944	0.627238665079783	1.10263255291267	0.292916760658696	0.998484245849582	0.264715173261127	0.576470588235294	119	118
TCGA-AA-3684-01A-02W-0900-09	0	0	0	0	125	0	0	0	0	124	5084	8	3	2	13	1227	3	3	2	8	1235	1	8	43	52	1341	4	3	44	51	1281	0	0	4	4	160	0.032	0.0784313725490196	0.124902419984387	0.627941176470588	0.025	1	3	5	9	205	0.072	0.173076923076923	0.152870991797166	1.13217636022514	0.0439024390243902	0.08	10	82	365	2257	0.838395688665871	0.754164959984379	0.392590698494455	Inf	0.780821917808219	1.43671232876712	0.528008143614234	1.54558631155559	0.743127066603684	0.868795741223703	0.713568209454114	0.0036074841836048	115	114
TCGA-AA-3685-01A-02W-0900-09	0	0	0	0	78	0	2	1	3	74	3034	2	1	0	3	687	0	2	1	3	695	5	8	24	37	869	3	5	23	31	783	1	2	2	5	97	0.0641025641025641	0.161290322580645	0.123882503192848	1.30196208846026	0.0515463917525773	2	0	0	2	92	0.0256410256410256	0.0540540540540541	0.105868814729574	0.510575793184489	0.0217391304347826	0.0641025641025641	5	50	189	1463	0.768121425131744	0.774180171325869	0.290011271310695	Inf	0.794612794612795	3.27777777777778	0.0549469624662025	4.63748479682254	0.371946414499606	0.97580123966293	0.344178518160609	1	73	69
TCGA-AA-3688-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	62	0	0	0	0	62	2542	2	2	3	7	603	1	4	2	7	613	0	5	23	28	677	0	5	15	20	649	0	2	1	3	83	0.0483870967741935	0.15	0.12788906009245	1.17289156626506	0.036144578313253	0	2	0	2	89	0.032258064516129	0.0714285714285714	0.131462333825702	0.543338683788122	0.0224719101123595	0.0161290322580645	1	37	172	1154	0.994647779758941	0.181456836872828	0.00904109815766085	Inf	0.202876376988984	NaN	1	0	0.202876376988984	0.994647779758941	0.181456836872828	1	61	61
TCGA-AA-3692-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	64	0	0	3	3	61	2501	1	2	1	4	571	2	1	1	4	601	2	8	17	27	639	3	4	19	26	690	0	0	0	0	73	0	0	0.105797101449275	0	0	0	2	0	2	99	0.03125	0.0740740740740741	0.154929577464789	0.478114478114478	0.0202020202020202	0	0	41	172	1157	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	64	61
TCGA-AA-3693-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	142	0	1	3	4	135	5535	8	4	4	16	1377	5	7	2	14	1303	7	7	38	52	1401	6	12	35	53	1454	2	2	5	9	174	0.0633802816901408	0.169811320754717	0.119669876203576	1.41899804814574	0.0517241379310345	3	1	3	7	216	0.0492957746478873	0.134615384615385	0.154175588865096	0.873130341880342	0.0324074074074074	0.0915492957746479	13	73	390	2465	0.396650665777323	1.1254875692493	0.633268285906044	Inf	1.10658914728682	2.81558185404339	0.024101942199366	3.9478827311392	0.802247980330172	0.795653266931629	0.77797089947415	0.472547597169157	129	122
TCGA-AA-3695-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	174	0	3	0	3	171	7011	3	2	1	6	1662	3	7	1	11	1675	4	14	65	83	1839	3	12	56	71	1835	2	3	3	8	246	0.0459770114942529	0.112676056338028	0.134059945504087	0.840490095041796	0.032520325203252	0	4	4	8	229	0.0459770114942529	0.0963855421686747	0.12452419793366	0.774030620297785	0.0349344978165939	0.0517241379310345	9	119	475	3199	0.987624028247431	0.509422956516929	0.258413226573684	Inf	0.543848684210526	2.20992481203008	0.22693230323525	2.6928795647353	0.447464114832536	0.996462255091254	0.413605447188327	0.11338524286244	165	162
TCGA-AA-3696-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	96	0	1	3	4	89	3649	0	5	1	6	945	2	4	1	7	819	2	5	28	35	894	1	7	33	41	991	1	4	3	8	127	0.0833333333333333	0.195121951219512	0.128153380423814	1.52256577683887	0.062992125984252	1	2	2	5	122	0.0520833333333333	0.142857142857143	0.136465324384787	1.04683840749415	0.040983606557377	0.0729166666666667	7	57	249	1636	0.756589213877978	0.806959463790413	0.360170758649312	Inf	0.827999497991968	5.04685408299866	0.0481889932506799	13.1082731386021	0.620514846270327	0.917019938668924	0.586767175387464	0.378260869565217	89	82
TCGA-AA-3697-01A-01D-1719-10	0	0	1	1	477	2	5	8	13	456	18696	10	69	2	81	4720	15	81	11	107	4663	5	35	95	135	4671	19	33	81	133	4642	6	6	10	22	661	0.0461215932914046	0.165413533834586	0.14239551917277	1.16164844789735	0.0332829046898638	2	3	9	14	700	0.0293501048218029	0.103703703703704	0.149860843502462	0.692	0.02	0.0566037735849057	27	173	1361	7952	0.70064890218662	0.911858461598809	0.625575937892392	Inf	0.923772961058046	2.28092089150135	0.0173319179468464	2.92091324034835	0.738707334179414	0.941905185482862	0.707109947640749	0.0141918846080063	450	429
TCGA-AA-3710-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	1330	0	4	33	37	1293	53013	10	115	13	138	12466	29	119	16	164	12911	8	100	382	490	13723	7	103	391	501	13913	1	9	8	18	1790	0.0135338345864662	0.0359281437125748	0.128656652052038	0.279256013113438	0.0100558659217877	1	7	11	19	1728	0.0142857142857143	0.0387755102040816	0.125919988340742	0.307937688964475	0.0109953703703704	0.0157894736842105	21	767	3518	24118	1	0.187708211383719	0.124994142106208	Inf	0.20934974013269	1.04741330301308	0.586547558061635	1.05471927159807	0.193087187166059	1	0.172759502693075	1.63367139986927e-05	1309	1272
TCGA-AA-3712-01A-21D-1719-10	0	0	1	1	429	2	2	3	5	419	17179	0	84	5	89	4275	7	67	2	76	4310	12	38	74	124	4264	25	34	71	130	4330	16	10	12	38	670	0.0885780885780886	0.292307692307692	0.15473441108545	1.88909299655568	0.0567164179104478	8	11	14	33	642	0.0769230769230769	0.266129032258065	0.150562851782364	1.76756104914079	0.0514018691588785	0.116550116550117	50	132	1312	7282	2.21469286744915e-05	2.1021867496152	1.56357263382497	Inf	1.79953430715626	4.24884640738299	1.37101963895514e-11	10.2392106092704	1.17453742640875	0.218226539715497	1.21262190133193	0.86064631356251	379	369
TCGA-AA-3713-01A-21D-1719-10	0	0	1	1	1561	7	78	200	278	1274	52234	25	127	9	161	12168	22	115	18	155	11992	8	108	348	464	14029	10	98	386	494	14045	1	17	9	27	1710	0.0172966047405509	0.0546558704453441	0.121751512993948	0.44891327509056	0.0157894736842105	2	12	10	24	1699	0.0153747597693786	0.0517241379310345	0.121106279848884	0.42709707535873	0.0141259564449676	0.0140935297885971	22	730	3409	24665	1	0.218055443607476	0.146643461323523	Inf	0.240925148074871	1.37254326782048	0.376600128732135	1.44702400214862	0.21317429500209	1	0.192271645551712	0.000186419692102629	1539	1252
TCGA-AA-3715-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	1931	0	11	78	89	1841	75481	51	201	41	293	17785	47	188	40	275	18000	12	89	538	639	19828	17	130	487	634	19868	2	16	22	40	2555	0.0207146556188503	0.0630914826498423	0.128598751761627	0.490607270953842	0.0156555772994129	2	13	18	33	2551	0.0170895908855515	0.0516431924882629	0.128656445430704	0.40140384972845	0.0129361034888279	0.0227861211807354	44	1010	5106	34590	1	0.295126885884968	0.224423585965389	Inf	0.324547301199393	1.07232870051461	0.522684141536584	1.08392641612699	0.303390559169987	1	0.275106975469987	3.12940471206435e-11	1887	1797
TCGA-AA-3811-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	1083	0	12	40	52	1031	42271	17	97	12	126	9768	25	91	10	126	9960	4	48	328	380	11113	8	51	340	399	11430	2	4	0	6	1423	0.00554016620498615	0.0150375939849624	0.124496937882765	0.120786858220745	0.00421644413211525	1	3	2	6	1390	0.00554016620498615	0.0157894736842105	0.125078736614775	0.126236274138584	0.00431654676258993	0.00461680517082179	5	675	2813	19730	1	0.0519570218012554	0.020368882200972	Inf	0.0589254720729387	2.00346605047991	0.181492577242316	2.33783287950024	0.023993605394969	1	0.0210774620596326	1	1078	1026
TCGA-AA-3812-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	114	0	0	1	1	113	4633	2	3	0	5	1057	3	8	2	13	1048	5	10	38	53	1269	3	10	29	42	1259	1	2	2	5	132	0.043859649122807	0.119047619047619	0.10484511517077	1.13546176046176	0.0378787878787879	1	2	3	6	144	0.0526315789473684	0.113207547169811	0.113475177304965	0.997641509433962	0.0416666666666667	0.0614035087719298	7	68	276	2252	0.723326412403107	0.840015231546602	0.37770342824976	Inf	0.85487922705314	2.28985507246377	0.215806104549459	2.71826022454635	0.683538827601125	0.867251489705334	0.658109002005781	0.361455108359133	107	106
TCGA-AA-3814-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	107	0	0	1	1	105	4305	0	1	3	4	1008	3	3	0	6	1042	2	4	39	45	1121	3	11	36	50	1134	1	4	2	7	156	0.0654205607476635	0.14	0.137566137566138	1.01769230769231	0.0448717948717949	0	1	2	3	163	0.0280373831775701	0.0666666666666667	0.145405887600357	0.458486707566462	0.0184049079754601	0.0467289719626168	5	75	319	1936	0.991168511917156	0.404710369798364	0.154196669810015	Inf	0.441810344827586	1.41379310344828	0.534254118322481	1.51691279643522	0.377011494252874	0.995441907660015	0.342020800395566	0.303405572755418	102	100
TCGA-AA-3815-01A-01W-0995-10	0	0	1	1	1214	23	39	133	172	1008	41328	16	155	34	205	9617	17	147	21	185	9841	11	55	232	298	10841	16	54	250	320	11029	2	4	8	14	1461	0.0115321252059308	0.04375	0.132468945507299	0.330266084873374	0.00958247775496235	0	6	3	9	1308	0.00741350906095552	0.0302013422818792	0.120653076284476	0.250315559386737	0.00688073394495413	0.0107084019769358	13	496	2769	19101	1	0.180805935050077	0.10613294235111	Inf	0.201721132294751	0.585048754062839	0.872893206497184	0.551865315282394	0.180248423191559	1	0.161110311944414	0.00735642051580793	1201	995
TCGA-AA-3818-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	139	0	1	1	2	137	5617	5	4	1	10	1381	2	7	2	11	1262	4	12	44	60	1524	2	16	38	56	1450	0	3	2	5	184	0.0359712230215827	0.0892857142857143	0.126896551724138	0.703610248447205	0.0271739130434783	1	2	4	7	196	0.0503597122302158	0.116666666666667	0.128608923884514	0.907142857142857	0.0357142857142857	0.0503597122302158	7	81	380	2594	0.941602012498512	0.590014082839904	0.267324113972076	Inf	0.622547846889952	1.30438596491228	0.560236474491647	1.36509989672806	0.572657252888318	0.957939604953941	0.539008444764288	0.068649885583524	132	130
TCGA-AA-3819-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	176	0	1	5	6	166	6806	14	9	4	27	1674	9	4	2	15	1650	7	22	31	60	1709	14	17	33	64	1773	4	2	5	11	268	0.0625	0.171875	0.151156232374506	1.13706856343284	0.041044776119403	0	4	6	10	236	0.0568181818181818	0.166666666666667	0.138092451726156	1.2069209039548	0.0423728813559322	0.0852272727272727	15	70	504	2978	0.247139345800684	1.2660650266564	0.740171116478412	Inf	1.21918767507003	1.31594860166289	0.363240245805081	1.39014013755947	1.18743799603175	0.321214522171031	1.22624859673795	0.0516286315344891	161	151
TCGA-AA-3821-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	811	1	20	79	99	710	29110	11	40	6	57	6484	7	34	6	47	6718	9	37	270	316	7961	4	46	240	290	7947	1	2	1	4	919	0.00493218249075216	0.0137931034482759	0.115641122436139	0.119275074106037	0.0043525571273123	1	6	2	9	916	0.0110974106041924	0.0284810126582278	0.115060921994724	0.247529849096236	0.00982532751091703	0.0061652281134402	5	518	1835	14073	1	0.0740319285100589	0.0290474783700151	Inf	0.0828796348878041	1.33372458604066	0.452434126338677	1.39436352325973	0.0509953518192018	1	0.0453771008939715	1	806	705
TCGA-AA-3831-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	114	0	1	1	2	112	4592	3	6	1	10	1017	1	5	3	9	1139	4	7	39	50	1207	2	10	31	43	1229	1	3	2	6	165	0.0526315789473684	0.13953488372093	0.134255492270138	1.03932346723044	0.0363636363636364	0	1	4	5	144	0.043859649122807	0.1	0.11930405965203	0.838194444444444	0.0347222222222222	0.0614035087719298	7	69	309	2127	0.861067921053425	0.698414266667487	0.314450713558329	Inf	0.726111394992335	1.31391585760518	0.557553532206431	1.37649268958667	0.675728155339806	0.891304751808809	0.645425128941106	0.0634674922600621	107	105
TCGA-AA-3833-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	529	0	4	6	10	519	21279	8	39	6	53	4902	4	22	5	31	4815	3	36	193	232	5806	3	30	170	203	5756	0	2	1	3	682	0.0056710775047259	0.0147783251231527	0.118485059068798	0.124727330511535	0.00439882697947214	1	1	4	6	678	0.0113421550094518	0.0258620689655172	0.11677574922494	0.221467805920049	0.00884955752212389	0.0113421550094518	6	363	1360	10202	0.999999999999959	0.124001651778051	0.0536082795988841	Inf	0.138235294117647	1.41691176470588	0.528193527634795	1.50022517048144	0.117100145843461	0.999999999999992	0.104778161485573	0.131221719457014	523	513
TCGA-AA-3837-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	147	0	2	0	2	145	5945	1	4	0	5	1382	4	6	2	12	1381	4	11	49	64	1609	1	9	54	64	1573	0	2	1	3	193	0.0204081632653061	0.046875	0.12269548633185	0.382043393782383	0.0155440414507772	3	1	2	6	211	0.0408163265306122	0.09375	0.131137352392791	0.714899289099526	0.028436018957346	0.0408163265306122	6	102	404	2778	0.995142573400478	0.404563965711108	0.171454303942748	Inf	0.437568756875688	4.72574257425743	0.0169546042630355	10.2991830179931	0.229404979332885	0.999876311141112	0.206343716429997	1	141	139
TCGA-AA-3842-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	84	0	0	1	1	83	3403	4	4	0	8	787	3	3	0	6	799	0	3	36	39	894	1	5	24	30	923	0	0	2	2	124	0.0238095238095238	0.0666666666666667	0.134344528710726	0.496236559139785	0.0161290322580645	0	1	2	3	100	0.0357142857142857	0.0769230769230769	0.111856823266219	0.687692307692308	0.03	0.0476190476190476	4	57	224	1593	0.950765422444487	0.499205576321122	0.163849070227352	Inf	0.531908665105386	0	1	0	0.540773809523809	0.946367263404861	0.508117129578524	0.0476190476190476	80	79
TCGA-AA-3844-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	112	0	1	1	2	110	4510	4	3	2	9	1071	4	3	2	9	1087	5	15	26	46	1141	3	15	28	46	1211	0	0	2	2	162	0.0178571428571429	0.0434782608695652	0.133773740710157	0.325013419216318	0.0123456790123457	1	0	1	2	167	0.0178571428571429	0.0434782608695652	0.146362839614373	0.297058057797449	0.0119760479041916	0.0357142857142857	4	58	329	2023	0.979601329898216	0.424174320753715	0.139654455637929	Inf	0.461221688400824	0.893617021276596	0.700888759890473	0.87849254674165	0.397163120567376	0.985541970781958	0.361807761645611	0.485714285714286	108	106
TCGA-AA-3845-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	874	0	9	30	39	833	34153	10	65	8	83	8078	2	76	18	96	8310	5	68	236	309	8903	7	60	278	345	8862	2	7	6	15	1159	0.017162471395881	0.0434782608695652	0.130783118934778	0.332445511497918	0.0129421915444349	1	8	4	13	1131	0.0148741418764302	0.0420711974110032	0.127035830618893	0.331175836030205	0.0114942528735632	0.0148741418764302	13	513	2290	15475	1	0.171255084965467	0.100520262019183	Inf	0.191728792734156	1.93941048034935	0.194446350785864	2.25241111637619	0.150926885630299	1	0.134087480207742	0.0550266674313243	861	820
TCGA-AA-3846-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	92	0	0	0	0	92	3772	7	5	2	14	890	4	3	1	8	859	2	5	23	30	976	3	4	33	40	1047	1	0	1	2	119	0.0217391304347826	0.05	0.113658070678128	0.439915966386555	0.0168067226890756	0	0	1	1	135	0.0108695652173913	0.0333333333333333	0.138319672131148	0.240987654320988	0.00740740740740741	0.0326086956521739	3	58	254	1769	0.986085858006756	0.360357750609099	0.094952429916478	Inf	0.391700012908223	1.59291338582677	0.489617896463314	1.74055603047377	0.284448818897638	0.994780863986004	0.2580500843615	1	89	89
TCGA-AA-3848-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	151	0	2	0	2	148	6068	3	7	3	13	1451	2	6	3	11	1408	3	8	50	61	1600	3	8	52	63	1609	2	0	2	4	181	0.0264900662251656	0.0634920634920635	0.112492231199503	0.564412873805139	0.0220994475138122	0	1	3	4	196	0.0264900662251656	0.0655737704918033	0.1225	0.535296085647374	0.0204081632653061	0.0463576158940397	7	101	377	2832	0.974556861387623	0.520711288635268	0.237206479901518	Inf	0.551699577561647	2.83731211317418	0.150944155517081	3.75353911005545	0.417251781349144	0.994216228272745	0.387291047717726	0.314685314685315	144	141
TCGA-AA-3850-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	111	0	2	0	2	108	4428	0	5	3	8	1015	1	4	2	7	990	1	9	40	50	1195	3	3	37	43	1228	0	0	2	2	136	0.018018018018018	0.0465116279069767	0.110749185667752	0.419972640218878	0.0147058823529412	1	1	1	3	142	0.027027027027027	0.06	0.118828451882845	0.504929577464789	0.0211267605633803	0.036036036036036	4	77	278	2145	0.986234614828364	0.400926279440947	0.132877378545729	Inf	0.430411226574296	2.17895683453237	0.386635827910839	2.57053337549723	0.339577688498552	0.994583682164335	0.312898636340425	0.523809523809524	107	104
TCGA-AA-3851-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	96	0	1	3	4	92	3772	1	4	4	9	902	1	8	4	13	895	2	2	32	36	932	3	6	25	34	1043	1	0	0	1	147	0.0104166666666667	0.0294117647058824	0.140939597315436	0.208683473389356	0.00680272108843537	2	0	1	3	133	0.03125	0.0833333333333333	0.142703862660944	0.583959899749373	0.0225563909774436	0.0416666666666667	4	58	280	1695	0.98127265661986	0.417617863431937	0.137345363372005	Inf	0.455069124423963	4.23214285714286	0.0231341234571291	9.06294655826305	0.12374686716792	0.999818115114738	0.108155119352447	0.485714285714286	92	88
TCGA-AA-3852-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	139	0	1	3	4	134	5494	2	3	2	7	1368	5	6	0	11	1320	4	12	44	60	1440	2	14	40	56	1366	1	3	1	5	174	0.0359712230215827	0.0892857142857143	0.127379209370425	0.700944170771757	0.028735632183908	3	3	2	8	185	0.0575539568345324	0.133333333333333	0.128472222222222	1.03783783783784	0.0432432432432432	0.0503597122302158	7	83	359	2447	0.949911841584021	0.574948287396408	0.260565695282842	Inf	0.60792324357784	5.21077065923863	0.00331043506028087	13.6090410940224	0.279148428173498	0.999014590929144	0.252523603159494	1	132	127
TCGA-AA-3854-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	146	0	1	1	2	144	5904	1	8	1	10	1369	6	9	4	19	1408	1	10	48	59	1519	5	13	38	56	1608	1	0	1	2	195	0.0136986301369863	0.0357142857142857	0.121268656716418	0.294505494505494	0.0102564102564103	0	2	2	4	199	0.0273972602739726	0.0677966101694915	0.13100724160632	0.517502768077677	0.0201005025125628	0.0273972602739726	4	88	394	2733	0.997839103906654	0.315371831538677	0.104988770671526	Inf	0.345067314058707	1.32275803722504	0.554817641580736	1.38714207845686	0.276856333372683	0.999088390694843	0.25078413600136	0.545454545454546	142	140
TCGA-AA-3855-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	134	0	0	4	4	130	5330	1	6	3	10	1255	1	5	3	9	1311	2	9	39	50	1305	2	7	52	61	1459	1	4	3	8	197	0.0597014925373134	0.131147540983607	0.135023989033585	0.971290671548639	0.0406091370558376	1	2	5	8	170	0.0597014925373134	0.16	0.130268199233716	1.22823529411765	0.0470588235294118	0.0746268656716418	10	85	367	2397	0.823821888787809	0.768457592902367	0.400521918777933	Inf	0.792772121038291	3.76566757493188	0.0884924860955276	6.52382911049336	0.662095397790221	0.926500012898365	0.629614536271398	0.0538021311924682	124	120
TCGA-AA-3856-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	61	0	1	1	2	58	2378	0	3	4	7	575	1	1	1	3	564	3	3	21	27	589	0	2	19	21	650	0	0	0	0	84	0	0	0.129230769230769	0	0	1	0	1	2	73	0.0327868852459016	0.0740740740740741	0.123938879456706	0.597666159309995	0.0273972602739726	0.0327868852459016	2	41	157	1082	0.97773771120055	0.336374661390342	0.0573645652686189	Inf	0.36705673233595	2.63057324840764	0.33538530874062	3.44053287320629	0.197292993630573	0.995309395386795	0.176840840271415	1	59	56
TCGA-AA-3858-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	61	0	4	2	6	55	2255	0	1	2	3	472	2	0	1	3	519	0	2	22	24	629	2	3	20	25	635	0	0	0	0	71	0	0	0.111811023622047	0	0	0	0	0	0	61	0	0	0.0969793322734499	0	0	0	0	44	132	1132	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	61	55
TCGA-AA-3860-01A-02W-0900-09	0	0	0	0	50	0	3	1	4	46	1886	1	5	1	7	466	4	0	1	5	454	3	4	12	19	460	1	2	12	15	506	0	0	1	1	70	0.02	0.0666666666666667	0.138339920948617	0.481904761904762	0.0142857142857143	2	1	0	3	61	0.06	0.157894736842105	0.132608695652174	1.19068162208801	0.0491803278688525	0.06	3	25	131	835	0.751824455938417	0.765073957602287	0.193602155008974	Inf	0.790076335877863	3.68702290076336	0.0928657438111633	6.35375153154368	0.307251908396947	0.969132640002665	0.277359965092544	1	47	43
TCGA-AA-3861-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	255	2	3	4	7	244	10004	5	53	6	64	2562	6	40	16	62	2535	5	12	42	59	2609	2	14	43	59	2298	0	0	4	4	347	0.0156862745098039	0.0677966101694915	0.151000870322019	0.448981585502857	0.0115273775216138	0	3	5	8	385	0.0313725490196078	0.135593220338983	0.147566117286317	0.918864186660797	0.0207792207792208	0.0352941176470588	9	83	732	4175	0.942687546756687	0.618509735817311	0.31155483289469	Inf	0.655782252316465	0	1	0	0.709787849566056	0.902195726586276	0.675468424639077	0.000336519046978058	246	235
TCGA-AA-3864-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	2718	0	8	35	43	2675	109675	12	97	24	133	24665	13	112	15	140	24847	8	114	1099	1221	30133	11	89	1081	1181	30030	1	4	13	18	3524	0.00662251655629139	0.0152413209144793	0.117349317349317	0.129879928224124	0.00510783200908059	2	8	16	26	3473	0.00956585724797645	0.0212940212940213	0.115255699731192	0.184754605140439	0.00748632306363375	0.0117733627667403	32	2167	6997	53166	1	0.112207072431269	0.0814225260708955	Inf	0.125124501158588	1.35764199694606	0.383235403121797	1.42468424160769	0.114382376195303	1	0.102444077428316	6.36655679575157e-09	2686	2643
TCGA-AA-3866-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	120	0	1	1	2	118	4838	2	2	0	4	1106	1	1	1	3	1136	1	9	51	61	1332	4	12	34	50	1264	1	1	0	2	151	0.0166666666666667	0.04	0.119462025316456	0.334834437086093	0.0132450331125828	0	1	3	4	168	0.0333333333333333	0.0655737704918033	0.126126126126126	0.519906323185012	0.0238095238095238	0.0333333333333333	4	86	319	2277	0.996593077019521	0.332087964886401	0.110374198757225	Inf	0.361685823754789	1.62758620689655	0.48156999180645	1.78398930344619	0.287221095334686	0.998676586908792	0.26122442432087	0.545454545454546	116	114
TCGA-AA-3867-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	88	0	1	2	3	84	3444	3	1	3	7	851	4	5	4	13	815	1	2	23	26	908	0	5	33	38	870	0	3	2	5	134	0.0568181818181818	0.131578947368421	0.154022988505747	0.854281225451689	0.0373134328358209	0	0	0	0	121	0	0	0.133259911894273	0	0	0.0227272727272727	2	55	255	1523	0.998308601979682	0.217290027934684	0.0374947406100638	Inf	0.244650842793258	0	1	0	0.249019607843137	0.998064392196747	0.221313279541256	0.444444444444444	86	82
TCGA-AA-3869-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	77	2	0	1	1	73	2993	1	0	1	2	629	1	4	2	7	749	1	6	27	34	807	0	1	29	30	808	0	0	0	0	108	0	0	0.133663366336634	0	0	1	1	1	3	104	0.038961038961039	0.0882352941176471	0.128872366790582	0.684671945701358	0.0288461538461538	0.025974025974026	2	55	212	1403	0.996579080619693	0.240775836717992	0.0414909778624319	Inf	0.267295597484277	7.61792452830189	0.131806930693069	Inf	0.136034366576819	0.999579428146774	0.120399573144958	1	75	71
TCGA-AA-3870-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	123	0	3	1	4	118	4838	6	2	0	8	1146	2	6	2	10	1125	0	11	36	47	1244	2	11	40	53	1323	0	1	0	1	151	0.00813008130081301	0.0188679245283019	0.114134542705971	0.165313007622142	0.00662251655629139	0	2	2	4	170	0.032520325203252	0.0851063829787234	0.136655948553055	0.622778473091364	0.0235294117647059	0.016260162601626	2	76	321	2246	0.999597148087624	0.184193167730041	0.0320018397460546	Inf	0.205048326543654	0	1	0	0.210444335136908	0.999489555809515	0.189170906293307	0.444444444444444	121	116
TCGA-AA-3872-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	63	1	2	4	6	55	2255	0	1	1	2	516	1	1	2	4	586	3	3	14	20	624	0	3	26	29	529	0	0	0	0	73	0	0	0.137996219281664	0	0	1	1	4	6	90	0.0952380952380952	0.3	0.144230769230769	2.08	0.0666666666666667	0.0793650793650794	5	38	163	990	0.74545661821679	0.799299963981546	0.295274940047134	Inf	0.822513910686261	2.35787321063395	0.368352336346915	3.03266783956707	0.707361963190184	0.834692089386659	0.675042730469978	0.242424242424242	58	50
TCGA-AA-3875-01A-01W-0900-09	0	0	0	0	125	0	1	0	1	124	5084	3	4	0	7	1225	2	1	2	5	1235	1	12	36	49	1330	5	9	49	63	1294	1	1	1	3	175	0.024	0.0476190476190476	0.135239567233385	0.352108843537415	0.0171428571428571	1	2	0	3	186	0.024	0.0612244897959184	0.13984962406015	0.43778801843318	0.0161290322580645	0.024	3	88	361	2263	0.999804384379133	0.213776469973883	0.0569640365488749	Inf	0.239627408602478	2.42289935364728	0.195607929415211	3.13239281314002	0.0855140948346097	0.999995883355194	0.0746574132910921	1	122	121
TCGA-AA-3877-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	1081	0	8	31	39	1041	42681	13	62	9	84	9596	12	72	14	98	9641	7	39	368	414	11718	9	43	393	445	11726	3	2	5	10	1417	0.00925069380203515	0.0224719101123595	0.120842572062084	0.185960210287599	0.00705716302046577	5	3	4	12	1379	0.0111008325624422	0.0289855072463768	0.11768219832736	0.246303244316928	0.00870195794053662	0.0157261794634598	17	760	2796	20648	1	0.165193537336652	0.104599772393397	Inf	0.183451998902643	4.19241773962804	0.00021792886007532	7.3846685190097	0.099163625904474	1	0.0883861753531109	1	1064	1024
TCGA-AA-3930-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	163	0	4	4	8	153	6273	4	8	4	16	1463	7	8	5	20	1546	4	6	39	49	1683	7	10	51	68	1581	2	1	7	10	201	0.0613496932515337	0.147058823529412	0.127134724857685	1.15671641791045	0.0497512437810945	1	3	2	6	205	0.0368098159509202	0.122448979591837	0.121806298276887	1.0052762568442	0.0292682926829268	0.0736196319018405	12	89	406	2858	0.612976311437854	0.94914144704523	0.525663225257404	Inf	0.955177291128128	2.19256605463502	0.149092538444226	2.63868372672834	0.803940886699507	0.801065359875219	0.782209343133188	0.065892860021602	151	141
TCGA-AA-3939-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	120	0	3	2	5	115	4715	2	6	2	10	1124	0	2	4	6	1130	6	1	30	37	1260	2	8	52	62	1201	1	0	5	6	155	0.05	0.0967741935483871	0.129059117402165	0.749843912591051	0.0387096774193548	3	1	2	6	187	0.05	0.162162162162162	0.148412698412698	1.09264344558462	0.0320855614973262	0.0916666666666667	11	79	342	2119	0.720519394224645	0.862769396132394	0.462611614804572	Inf	0.87949967511371	3.59795321637427	0.0166744600573995	6.18837833465256	0.614284695478534	0.947303817630097	0.578389842618274	0.41364921254543	109	104
TCGA-AA-3941-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	111	0	1	6	7	103	4223	1	2	0	3	1016	1	3	3	7	1008	4	5	26	35	1048	3	9	46	58	1151	1	1	1	3	161	0.027027027027027	0.0517241379310345	0.139878366637706	0.369779396016278	0.0186335403726708	1	1	1	3	144	0.027027027027027	0.0857142857142857	0.137404580152672	0.623809523809524	0.0208333333333333	0.036036036036036	4	75	305	1894	0.996495416995265	0.331299563339057	0.109738579010718	Inf	0.365054990661963	2.05995316159251	0.253186590079074	2.4825422281463	0.200273224043716	0.999695645615956	0.177498099832749	1	107	99
TCGA-AA-3947-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	1602	0	28	118	146	1452	59532	19	114	29	162	13652	25	114	32	171	13908	14	107	443	564	15877	10	120	425	555	16095	2	10	5	17	1975	0.0106117353308365	0.0306306306306306	0.122708915812364	0.249620253164557	0.00860759493670886	2	13	8	23	1975	0.0143570536828964	0.0407801418439716	0.124393777161932	0.327831044079361	0.0116455696202532	0.0106117353308365	17	875	3950	28022	1	0.137833836109413	0.0873808512857176	Inf	0.15426122495317	1.34902953586498	0.34425795166647	1.4188126193137	0.121226156448696	1	0.10786803983707	0.0268594409496326	1585	1435
TCGA-AA-3949-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	896	0	3	15	18	878	35998	9	59	13	81	8251	11	52	15	78	8503	5	52	276	333	9820	5	59	322	386	9424	0	8	3	11	1211	0.0122767857142857	0.0284974093264249	0.128501697792869	0.221766792313979	0.00908340214698596	1	6	10	17	1190	0.0189732142857143	0.0510510510510511	0.121181262729124	0.421278421278421	0.0142857142857143	0.015625	14	594	2401	16843	1	0.165344434190948	0.0992671890699351	Inf	0.184555777198097	0.801499375260308	0.736269655272438	0.779453111229008	0.174238994621806	1	0.155896289131677	0.00037503784387916	882	864
TCGA-AA-3950-01A-02W-0995-10	0	0	0	0	1325	25	21	110	131	1159	47519	18	115	38	171	11371	21	118	22	161	11628	14	79	317	410	12202	14	97	306	417	12318	1	12	16	29	1639	0.0218867924528302	0.0695443645083933	0.133057314499107	0.522664723620737	0.0176937156802929	3	7	10	20	1638	0.0150943396226415	0.0487804878048781	0.134240288477299	0.363381875576998	0.0122100122100122	0.0226415094339623	30	621	3277	21243	0.999999999999953	0.313170909234715	0.223360830837717	Inf	0.344813523665148	1.06892192336196	0.525793751892558	1.0804299870388	0.312269325925966	0.999999999999995	0.282326494103407	1.85965436169879e-06	1295	1129
TCGA-AA-3952-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	82	0	3	4	7	74	3034	1	4	1	6	732	3	1	0	4	708	4	6	28	38	848	2	2	22	26	746	0	0	2	2	92	0.024390243902439	0.0769230769230769	0.123324396782842	0.623745819397993	0.0217391304347826	1	1	1	3	98	0.0365853658536585	0.0789473684210526	0.115566037735849	0.683136412459721	0.0306122448979592	0.0487804878048781	4	52	190	1404	0.911761892358683	0.568580993460388	0.185748878920342	Inf	0.599248120300752	1.39824561403509	0.534207183905613	1.47747077654576	0.503368421052632	0.945662390209966	0.47183386304601	0.523809523809524	78	70
TCGA-AA-3955-01A-02W-0995-10	0	0	0	0	124	0	3	2	5	118	4838	5	5	3	13	1191	7	4	8	19	1243	8	9	27	44	1186	11	8	23	42	1218	4	2	3	9	196	0.0725806451612903	0.214285714285714	0.160919540229885	1.33163265306122	0.0459183673469388	4	4	1	9	163	0.0725806451612903	0.204545454545455	0.13743676222597	1.4882877858338	0.0552147239263804	0.0967741935483871	12	57	359	2045	0.335677571587534	1.19911985809411	0.651835218547882	Inf	1.16458762262323	2.81952792845624	0.00418497592193919	4.1393626239804	0.535710306406685	0.95179525199709	0.495451151664419	0.288987764182425	112	106
TCGA-AA-3956-01A-02W-0995-10	0	0	0	0	135	0	5	0	5	129	5289	4	7	4	15	1306	7	6	2	15	1271	5	3	44	52	1386	6	3	38	47	1326	3	1	4	8	178	0.0592592592592593	0.170212765957447	0.134238310708899	1.26798948123356	0.0449438202247191	2	0	3	5	186	0.037037037037037	0.0961538461538462	0.134199134199134	0.716501240694789	0.0268817204301075	0.0888888888888889	12	81	364	2348	0.604882622385288	0.95564559524096	0.527089417249357	Inf	0.961361219425736	3.38661338661339	0.0102034376023876	5.37011070354141	0.636022514071295	0.933804690785702	0.602144396214092	0.695097590523624	123	117
TCGA-AA-3966-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	1146	0	18	82	100	1044	42804	13	101	35	149	10042	23	104	36	163	10424	10	56	289	355	11074	7	78	292	377	11264	2	10	4	16	1488	0.0139616055846422	0.0424403183023873	0.132102272727273	0.321268646073985	0.010752688172043	1	5	5	11	1429	0.00959860383944154	0.0309859154929577	0.129040996929745	0.240124582343607	0.00769769069279216	0.0104712041884817	12	586	2917	19421	1	0.136344461443958	0.078169507412273	Inf	0.153669585396643	1.35138841275283	0.386675975191999	1.42665539611983	0.118624456196892	1	0.10476138177619	0.0993537257872722	1134	1032
TCGA-AA-3968-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	226	7	4	3	7	207	8487	5	29	4	38	2044	2	26	6	34	2074	5	21	49	75	2214	9	13	38	60	2155	1	3	2	6	292	0.0265486725663717	0.1	0.135498839907193	0.738013698630137	0.0205479452054795	1	4	4	9	307	0.0398230088495575	0.12	0.1386630532972	0.865407166123779	0.0293159609120521	0.0353982300884956	8	93	599	3770	0.97327881818277	0.541465731287038	0.261210231041971	Inf	0.577728557496818	1.04197471977105	0.591311134764765	1.0489692025507	0.503022278510161	0.98417422819916	0.466271716742398	0.214759287023155	218	199
TCGA-AA-3971-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	73	0	8	7	15	57	2337	1	3	0	4	583	1	2	0	3	581	1	3	17	21	566	3	7	19	29	607	2	0	2	4	94	0.0547945205479452	0.137931034482759	0.154859967051071	0.89068231841526	0.0425531914893617	1	1	2	4	86	0.0547945205479452	0.19047619047619	0.151943462897526	1.25359911406423	0.0465116279069767	0.0958904109589041	7	33	180	993	0.422416285647295	1.17001071511288	0.50612031138971	Inf	1.14041666666667	4.8875	0.0131216014748697	16.4869196605507	0.724074074074074	0.822978437383508	0.68977255587448	1	66	50
TCGA-AA-3972-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	112	0	5	1	6	106	4346	1	3	3	7	995	2	3	3	8	1066	1	4	30	35	1152	1	3	52	56	1133	0	0	3	3	154	0.0267857142857143	0.0535714285714286	0.135922330097087	0.394132653061224	0.0194805194805195	0	1	4	5	132	0.0446428571428571	0.142857142857143	0.114583333333333	1.24675324675325	0.0378787878787879	0.0625	7	77	286	1999	0.911503598881516	0.635514861836685	0.286886343299991	Inf	0.665792540792541	0	1	0	0.682031383250895	0.898890461362349	0.652456612772334	0.0013986013986014	105	99
TCGA-AA-3973-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	82	0	3	2	5	77	3157	2	2	0	4	760	2	1	1	4	734	2	5	29	36	805	2	4	27	33	858	0	0	5	5	108	0.0609756097560976	0.151515151515152	0.125874125874126	1.2037037037037	0.0462962962962963	1	0	1	2	105	0.024390243902439	0.0555555555555556	0.130434782608696	0.425925925925926	0.019047619047619	0.0853658536585366	7	53	213	1450	0.662448723931037	0.899130775467993	0.399479197402497	Inf	0.910876369327073	1.9518779342723	0.423114678630015	2.2676873470603	0.836519114688129	0.738263441030256	0.816991220540628	0.0291375291375292	75	70
TCGA-AA-3975-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	121	0	1	2	3	116	4756	5	7	5	17	1210	7	4	5	16	1097	2	6	29	37	1188	3	8	35	46	1261	0	0	1	1	155	0.00826446280991736	0.0217391304347826	0.122918318794607	0.176858345021038	0.00645161290322581	1	2	2	5	169	0.0413223140495868	0.135135135135135	0.142255892255892	0.949944026867104	0.029585798816568	0.0330578512396694	4	65	324	2125	0.985234475272267	0.403712799899117	0.133360714197503	Inf	0.438182143496153	1.51172839506173	0.508826416363332	1.6392590805181	0.354311342592593	0.9930897160139	0.322652522929824	0.545454545454546	117	112
TCGA-AA-3976-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	94	0	2	2	4	90	3690	0	2	2	4	906	1	3	1	5	873	3	6	34	43	984	0	6	32	38	927	0	0	1	1	130	0.0106382978723404	0.0263157894736842	0.140237324703344	0.187651821862348	0.00769230769230769	2	2	1	5	115	0.0531914893617021	0.116279069767442	0.116869918699187	0.994944388270981	0.0434782608695652	0.0425531914893617	4	65	245	1666	0.981306687316562	0.4185953387568	0.137983981940858	Inf	0.452173913043478	5.2	0.045531877129415	13.5659396216348	0.236363636363636	0.998623573767183	0.2125963251645	1	90	86
TCGA-AA-3977-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	3644	0	6	4	10	3634	148994	21	153	157	331	39574	8	164	171	343	41320	6	621	803	1430	34020	5	688	837	1530	34080	0	585	61	646	5999	0.177277716794731	0.422222222222222	0.176026995305164	2.39862199255431	0.10768461410235	0	513	37	550	5744	0.150933040614709	0.384615384615385	0.168841857730747	2.27796228840797	0.0957520891364902	0.0268935236004391	98	1553	11743	56357	1	0.302848586623278	0.252785813841982	Inf	0.344228681566187	0	1	0	0.346537532479131	1	0.305008954053569	7.94674470153088e-31	3546	3536
TCGA-AA-3979-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	147	0	8	5	13	134	5494	3	9	7	19	1326	7	3	6	16	1304	12	5	20	37	1450	10	8	44	62	1414	6	2	5	13	195	0.0884353741496599	0.209677419354839	0.137906647807638	1.52043010752688	0.0666666666666667	1	2	0	3	189	0.0204081632653061	0.0810810810810811	0.130344827586207	0.622050622050622	0.0158730158730159	0.0816326530612245	12	74	384	2480	0.490801169956434	1.04728962715494	0.576021542631833	Inf	1.0406976744186	2.37310606060606	0.021800621726282	3.0122470750992	0.582682291666667	0.941084913261367	0.547408800383661	0.715987167706469	135	122
TCGA-AA-3980-01A-02W-0995-10	0	0	0	0	92	0	14	5	19	72	2952	1	3	3	7	714	3	3	2	8	697	5	3	22	30	817	0	4	23	27	724	0	2	0	2	93	0.0217391304347826	0.0740740740740741	0.128453038674033	0.576662684189566	0.021505376344086	2	1	0	3	97	0.0326086956521739	0.1	0.118727050183599	0.842268041237114	0.0309278350515464	0.0217391304347826	2	48	190	1351	0.988263944465335	0.296417954662317	0.0508660488907843	Inf	0.324421052631579	3.24421052631579	0.11910344339792	4.73271830086695	0	1	0	0.444444444444444	90	70
TCGA-AA-3982-01A-02W-0995-10	0	0	0	0	105	0	0	1	1	104	4264	4	3	2	9	1026	4	6	3	13	1078	5	6	24	35	1112	4	8	35	47	1048	1	2	5	8	179	0.0761904761904762	0.170212765957447	0.170801526717557	0.996552953762035	0.0446927374301676	3	2	1	6	141	0.0571428571428571	0.171428571428571	0.126798561151079	1.35197568389058	0.0425531914893617	0.0952380952380952	10	58	320	1840	0.563755410173748	0.991382823846861	0.508858692175547	Inf	0.992647058823529	3	0.0331522412151292	4.59527686631983	0.686440677966102	0.885615648842082	0.651054139261263	0.694584286803966	95	94
TCGA-AA-3984-01A-02W-0995-10	0	0	0	0	4028	0	5	3	8	4019	164779	12	191	237	440	43440	13	208	281	502	45461	10	443	1067	1520	38179	7	456	1094	1557	37699	2	385	98	485	6491	0.120407149950348	0.311496467565832	0.172179633412027	1.80913654764509	0.0747188414728085	0	364	104	468	6366	0.116186693147964	0.307894736842105	0.166740878493413	1.84654620764919	0.0735155513666352	0.0506454816285998	204	1974	12857	63021	1	0.506566852373125	0.446544324750404	Inf	0.552775165515307	0.694316211356597	0.809710805742138	0.653563745389096	0.551661700554964	1	0.505441255899128	1.32685138362014e-62	3824	3815
TCGA-AA-3986-01A-02W-0995-10	0	0	0	0	86	0	2	0	2	84	3444	1	1	0	2	718	0	3	1	4	776	1	6	31	38	963	0	6	34	40	987	0	3	1	4	115	0.0465116279069767	0.1	0.116514690982776	0.858260869565217	0.0347826086956522	0	2	0	2	117	0.0232558139534884	0.0526315789473684	0.121495327102804	0.433198380566802	0.0170940170940171	0.0116279069767442	1	65	232	1718	0.999738303057232	0.113983304319852	0.00570397755722564	Inf	0.127351097178683	0	1	0	0.129310344827586	0.999704104858878	0.115764161776059	1	85	83
TCGA-AA-3989-01A-01W-0995-10	0	0	0	0	120	0	10	4	14	106	4346	2	4	1	7	1040	3	8	0	11	1101	4	8	31	43	1090	1	9	35	45	1115	0	3	1	4	156	0.0333333333333333	0.0888888888888889	0.139910313901345	0.635327635327635	0.0256410256410256	2	1	1	4	150	0.0333333333333333	0.0930232558139535	0.137614678899083	0.675968992248062	0.0266666666666667	0.0333333333333333	4	67	306	1899	0.99165010366288	0.370613309116948	0.122422078871193	Inf	0.405965202982601	2.88235294117647	0.145362061860274	4.13355290058125	0.218360071301248	0.999331277254698	0.194012872223231	1	116	102
TCGA-AA-3994-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	190	0	1	4	5	185	7585	3	6	1	10	1746	4	5	1	10	1749	3	14	69	86	2056	1	26	52	79	2034	0	8	1	9	245	0.0473684210526316	0.113924050632911	0.120452310717797	0.945802118315681	0.036734693877551	0	4	1	5	246	0.0263157894736842	0.0581395348837209	0.119649805447471	0.485914161467196	0.0203252032520325	0.0105263157894737	2	123	491	3599	0.99999750169983	0.119214552910907	0.0208917743520416	Inf	0.133279022403259	0	1	0	0.137684940499234	0.99999601454401	0.123221613620336	0.481481481481482	188	183
TCGA-AA-A004-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	65	0	1	1	2	62	2542	2	1	1	4	669	1	7	2	10	653	4	4	18	26	620	2	2	18	22	600	0	1	1	2	81	0.0307692307692308	0.0909090909090909	0.135	0.673400673400673	0.0246913580246914	4	1	1	6	92	0.0923076923076923	0.230769230769231	0.148387096774194	1.55518394648829	0.0652173913043478	0.0923076923076923	6	36	173	1047	0.56178339926016	1.00866394110285	0.408845912457264	Inf	1.0074318744839	4.70134874759152	0.00497948129553726	12.0617985498679	0.391779062299293	0.970851466117592	0.356204281825017	0.608391608391609	59	56
TCGA-AA-A00A-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	426	1	30	1	31	394	16154	8	71	20	99	4123	8	65	15	88	4105	4	15	95	114	3980	5	8	80	93	3946	1	2	1	4	598	0.00938967136150235	0.043010752688172	0.151545869234668	0.283813428273456	0.00668896321070234	3	3	5	11	625	0.0258215962441315	0.0964912280701754	0.157035175879397	0.614456140350877	0.0176	0.0234741784037559	10	174	1223	6703	0.999992007059142	0.315016566151651	0.16777946592228	Inf	0.35221657364286	2.88034886890161	0.0374526065878962	4.38359100663158	0.222198341315267	0.999999930085794	0.194606258709565	0.699850074962519	416	384
TCGA-AA-A00D-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	77	0	0	0	0	77	3157	2	2	1	5	806	1	0	1	2	747	0	9	27	36	809	3	5	26	34	795	1	0	1	2	109	0.025974025974026	0.0588235294117647	0.137106918238994	0.429033998920669	0.018348623853211	0	2	0	2	115	0.025974025974026	0.0555555555555556	0.142150803461063	0.390821256038647	0.0173913043478261	0.025974025974026	2	54	224	1380	0.997582976830322	0.228296062889529	0.0393396758619235	Inf	0.255739795918367	2.38690476190476	0.364165112324749	3.0772760230263	0.13510781671159	0.99961734089168	0.118549113244244	1	75	75
TCGA-AA-A00E-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	637	0	8	3	11	626	25666	4	62	14	80	6049	10	76	27	113	6229	2	40	172	214	6745	7	40	172	219	6643	1	5	4	10	917	0.0156985871271586	0.045662100456621	0.138040042149631	0.330788804071247	0.0109051254089422	1	2	3	6	906	0.00941915227629513	0.0280373831775701	0.134321719792439	0.208733056879371	0.00662251655629139	0.0141287284144427	9	344	1823	11565	0.999999999999856	0.165986640768896	0.0858008722961123	Inf	0.187239226813816	1.63198634729079	0.35240576423808	1.81245255939849	0.149440610289709	0.999999999999992	0.131782812056828	0.11338524286244	628	617
TCGA-AA-A00F-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	46	0	1	0	1	45	1845	0	3	1	4	432	1	2	0	3	413	0	3	20	23	471	2	1	12	15	529	0	0	0	0	70	0	0	0.132325141776938	0	0	0	0	2	2	48	0.0434782608695652	0.0869565217391304	0.101910828025478	0.853260869565217	0.0416666666666667	0.0434782608695652	2	32	118	882	0.921041515492994	0.467423201685577	0.0787861915436699	Inf	0.498504486540379	0	1	0	0.529661016949153	0.903823833052296	0.498567308581882	0.333333333333333	44	43
TCGA-AA-A00J-01A-02W-A005-10	0	0	0	0	1037	1	26	29	55	981	40221	14	97	14	125	9518	17	82	11	110	9862	4	81	298	383	10301	6	63	294	363	10540	2	5	12	19	1429	0.0183220829315333	0.0523415977961433	0.135578747628084	0.386060490392827	0.013296011196641	0	5	10	15	1310	0.0144648023143684	0.0391644908616188	0.127172119211727	0.307964443027126	0.0114503816793893	0.0231436837029894	24	578	2739	18102	0.999999999999989	0.274431391962201	0.18754500222058	Inf	0.303348094886341	1.52179627601314	0.385972921856223	1.6521904205656	0.282766199934875	0.999999999999998	0.255093161419458	4.22279903001701e-07	1013	957
TCGA-AA-A00K-01A-02W-A005-10	0	0	0	0	146	1	3	5	8	137	5617	4	8	4	16	1341	5	5	4	14	1321	7	9	40	56	1516	9	10	32	51	1439	3	1	2	6	167	0.0410958904109589	0.117647058823529	0.116052814454482	1.01373723141951	0.0359281437125748	1	3	1	5	219	0.0342465753424658	0.0892857142857143	0.144459102902375	0.618069145466406	0.0228310502283105	0.0479452054794521	7	81	386	2569	0.949706931825036	0.575248984350316	0.260654550457314	Inf	0.608955487517664	1.91386010362694	0.148148712323825	2.21769944583283	0.318976683937824	0.996897878267243	0.28944259438989	1	139	130
TCGA-AA-A00L-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	56	0	0	1	1	55	2255	0	2	4	6	570	0	2	1	3	504	1	6	15	22	628	0	7	17	24	553	0	1	0	1	63	0.0178571428571429	0.0416666666666667	0.113924050632911	0.365740740740741	0.0158730158730159	0	0	0	0	87	0	0	0.138535031847134	0	0	0	0	33	150	1031	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	56	55
TCGA-AA-A00N-01A-02W-A00E-09	0	0	1	1	4425	0	2	1	3	4410	180810	8	254	236	498	49454	14	213	233	460	49678	6	435	1286	1727	40676	11	486	1228	1725	41002	0	414	77	491	7135	0.110960451977401	0.28463768115942	0.174015901663333	1.63569925758915	0.0688156972669937	0	371	86	457	7180	0.103276836158192	0.264620729588882	0.176516864981807	1.49912434495228	0.0636490250696379	0.0368361581920904	163	2368	14315	67363	1	0.323918662810142	0.2818301414317	Inf	0.367459264808999	0	1	0	0.369944072884477	1	0.326260872517228	8.3277251255412e-53	4262	4247
TCGA-AA-A00O-01A-02W-A00E-09	0	0	0	0	82	0	0	2	2	79	3239	1	4	4	9	770	2	2	3	7	745	3	7	19	29	828	2	8	24	34	896	0	3	2	5	109	0.0609756097560976	0.147058823529412	0.121651785714286	1.20885051268214	0.0458715596330275	0	0	2	2	117	0.024390243902439	0.0689655172413793	0.141304347826087	0.488063660477454	0.0170940170940171	0.0487804878048781	4	44	226	1498	0.888710434252797	0.60271966481545	0.196032386281059	Inf	0.635693215339233	0	1	0	0.709611031076353	0.831656603273046	0.679957854722567	0.06993006993007	78	75
TCGA-AA-A00Q-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	36	0	0	0	0	36	1476	0	1	0	1	382	1	1	0	2	317	2	4	11	17	385	0	0	16	16	392	0	0	0	0	47	0	0	0.119897959183673	0	0	0	2	1	3	51	0.0833333333333333	0.176470588235294	0.132467532467532	1.33217993079585	0.0588235294117647	0.0277777777777778	1	28	98	679	0.979202153872499	0.247710513922412	0.0121734095031065	Inf	0.273399014778325	0	1	0	0.293650793650794	0.972965075062995	0.266757287552857	1	35	35
TCGA-AA-A00R-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	431	0	4	0	4	427	17507	7	64	4	75	4266	7	52	10	69	4329	3	22	119	144	4475	2	23	114	139	4437	0	3	2	5	591	0.0116009280742459	0.0359712230215827	0.133198106828938	0.270058065222949	0.00846023688663283	0	0	0	0	635	0	0	0.141899441340782	0	0	0.00464037122969838	2	236	1226	7686	0.999999999999969	0.0531350190427704	0.00938756951070179	Inf	0.0610854455974886	0	1	0	0.0623962920695377	0.999999999999938	0.0542851183700291	0.444444444444444	429	425
TCGA-AA-A00U-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	86	0	1	0	1	85	3485	3	9	3	15	888	0	4	2	6	886	2	6	21	29	876	1	8	26	35	835	0	2	2	4	119	0.0465116279069767	0.114285714285714	0.14251497005988	0.801920768307323	0.0336134453781513	2	1	3	6	149	0.0697674418604651	0.206896551724138	0.170091324200913	1.21638509604258	0.0402684563758389	0.0813953488372093	7	43	268	1443	0.685702061827773	0.876581630133826	0.386606192853951	Inf	0.893805970149254	4.25621890547264	0.0664663660397017	10.7427478201891	0.67918386789457	0.877425701363796	0.641133886445469	0.34984520123839	79	78
TCGA-AA-A00W-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	27	0	0	2	2	25	1025	1	2	1	4	245	0	2	0	2	257	0	1	9	10	279	0	0	9	9	244	0	0	0	0	33	0	0	0.135245901639344	0	0	0	0	0	0	35	0	0	0.125448028673835	0	0	0	0	18	68	455	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	27	25
TCGA-AA-A00Z-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	42	0	0	0	0	42	1722	3	1	2	6	451	0	3	3	6	389	2	3	11	16	456	0	3	11	14	426	0	1	0	1	53	0.0238095238095238	0.0714285714285714	0.124413145539906	0.574123989218329	0.0188679245283019	2	1	1	4	73	0.0952380952380952	0.25	0.160087719298246	1.56164383561644	0.0547945205479452	0.0714285714285714	3	21	126	756	0.687896040477408	0.85728143308574	0.214427695718426	Inf	0.875	7	0.0208257534218496	Inf	0.318181818181818	0.965715263414029	0.285969068336007	1	39	39
TCGA-AA-A010-01A-01W-A00E-09	0	0	1	1	7670	0	12	15	27	7637	313117	57	367	362	786	83985	57	355	371	783	84381	13	1316	1695	3024	72174	13	1322	1709	3044	72577	0	968	128	1096	12560	0.142894393741851	0.360052562417871	0.17305758022514	2.08053621199059	0.0872611464968153	0	959	125	1084	12316	0.141329856584094	0.358465608465608	0.170643167899798	2.10067366234141	0.088015589477103	0.0329856584093872	253	3177	24876	119875	1	0.383750868043322	0.343310749129386	Inf	0.429207621991668	0	1	0	0.43248594107856	1	0.386917294253035	5.85852313850198e-80	7417	7384
TCGA-AA-A017-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	61	0	1	2	3	58	2378	0	1	1	2	568	2	1	2	5	569	1	2	24	27	600	6	1	17	24	641	3	0	5	8	93	0.131147540983607	0.333333333333333	0.145085803432137	2.29749103942652	0.0860215053763441	0	0	2	2	68	0.0327868852459016	0.0740740740740741	0.113333333333333	0.65359477124183	0.0294117647058824	0.163934426229508	10	38	161	1080	0.0920528536605948	1.76434315337019	0.877949414341347	Inf	1.60584886128364	3.30346051464064	0.0521978549860732	5.02058183836928	1.31601272534464	0.284714680577701	1.38068330469504	0.178895407997576	51	48
TCGA-AA-A01D-01A-01W-A00E-09	0	1	0	1	160	0	0	0	0	135	5535	1	4	2	7	1247	2	5	2	9	1333	7	16	41	64	1465	7	10	38	55	1490	1	2	12	15	195	0.09375	0.272727272727273	0.130872483221477	2.08391608391608	0.0769230769230769	0	3	6	9	184	0.05625	0.140625	0.125597269624573	1.11965013586957	0.0489130434782609	0.11875	19	74	379	2576	0.0285422121003279	1.7447458864805	1.07776336936197	Inf	1.59290152353392	0.556916698077648	0.853665806604023	0.522923880687389	1.77649377108313	0.011396707752279	2.00508386067975	5.67120279066945e-07	141	116
TCGA-AA-A01F-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	61	0	0	0	0	61	2501	0	2	2	4	573	1	6	2	9	608	1	3	20	24	666	2	4	18	24	654	0	1	0	1	105	0.0163934426229508	0.0416666666666667	0.160550458715596	0.259523809523809	0.00952380952380952	0	0	2	2	77	0.0327868852459016	0.0833333333333333	0.115615615615616	0.720779220779221	0.025974025974026	0.0327868852459016	2	39	182	1138	0.982025405934098	0.320832716032013	0.0546949693847154	Inf	0.3537925489145	0	1	0	0.381723539618276	0.973967175079556	0.34756028382205	0.4	59	59
TCGA-AA-A01G-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	73	0	1	0	1	72	2952	2	1	2	5	682	0	1	1	2	726	0	7	22	29	799	4	8	24	36	745	1	1	1	3	107	0.0410958904109589	0.0833333333333333	0.143624161073826	0.580218068535825	0.0280373831775701	0	1	0	1	96	0.0136986301369863	0.0344827586206897	0.120150187734668	0.286997126436782	0.0104166666666667	0.0273972602739726	2	48	203	1341	0.992106073761795	0.275387098806816	0.0472924903170596	Inf	0.30423645320197	1.90147783251232	0.432119008818856	2.20049922774046	0.165345898479332	0.998361830669115	0.146888838776371	1	71	70
TCGA-AA-A01I-01A-02W-A00E-09	0	0	0	0	98	0	0	2	2	95	3895	3	1	2	6	968	2	2	1	5	927	0	10	30	40	983	1	9	34	44	1017	0	1	1	2	129	0.0204081632653061	0.0454545454545455	0.126843657817109	0.358350951374207	0.0155038759689922	0	3	1	4	153	0.0408163265306122	0.1	0.155645981688708	0.642483660130719	0.0261437908496732	0.0204081632653061	2	63	282	1718	0.999336146657299	0.193490219531802	0.0334719079989588	Inf	0.218221494817239	0	1	0	0.221631205673759	0.99924112198458	0.196610637429717	0.454545454545454	96	93
TCGA-AA-A01K-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	159	0	2	2	4	130	5330	5	9	2	16	1356	9	6	6	21	1320	9	6	28	43	1287	9	10	31	50	1367	2	0	0	2	195	0.0125786163522013	0.04	0.142648134601317	0.280410256410256	0.0102564102564103	4	3	3	10	208	0.0628930817610063	0.232558139534884	0.161616161616162	1.43895348837209	0.0480769230769231	0.0566037735849057	9	68	403	2251	0.843458461693207	0.739346818925897	0.3687445582577	Inf	0.769746382649608	2.19520264681555	0.045125162266037	2.79148641261498	0.334861420700677	0.995783165764604	0.29931572365242	0.400323058285099	150	121
TCGA-AA-A01P-01A-21W-A096-10	0	0	0	0	514	0	5	9	14	500	20500	8	49	9	66	5141	9	39	9	57	5042	4	25	150	179	5109	2	36	160	198	5208	0	4	6	10	733	0.0194552529182879	0.0505050505050505	0.140745007680492	0.358840795402869	0.0136425648021828	0	6	8	14	715	0.0272373540856031	0.0782122905027933	0.139949109414758	0.558862366683596	0.0195804195804196	0.0272373540856031	14	302	1448	8869	0.999999992182555	0.283961378526299	0.169419608951253	Inf	0.315664556962025	0	1	0	0.321774193548387	0.999999985170552	0.289717138217868	8.13258196104165e-06	500	486
TCGA-AA-A01Q-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	771	2	31	3	34	735	30135	13	165	26	204	7308	11	158	25	194	7656	9	28	125	162	7546	8	35	132	175	7625	0	6	3	9	1098	0.0116731517509728	0.0514285714285714	0.144	0.357142857142857	0.00819672131147541	1	1	4	6	1061	0.00778210116731518	0.037037037037037	0.140604293665518	0.263413271895835	0.0056550424128181	0.0103761348897536	8	266	2159	13012	0.999999999939126	0.18126997296973	0.0892533433127519	Inf	0.205163920847378	0.413344958177806	0.926418865901058	0.376695244840018	0.191393190751591	0.999999999914997	0.168762550122125	0.0351824087956022	763	727
TCGA-AA-A01R-01A-21W-A096-10	0	0	0	0	1721	0	4	19	23	1697	69577	24	109	19	152	15719	11	84	16	111	15722	4	78	638	720	18855	5	63	646	714	19281	0	2	2	4	2189	0.00232423009877978	0.00560224089635854	0.113531455837353	0.0493452748847369	0.00182731841023298	0	6	2	8	2259	0.00464846019755956	0.0111111111111111	0.11980906921241	0.0927401505090748	0.00354138999557326	0.00232423009877978	4	1289	4448	33688	1	0.0235193461014149	0.00800087379328689	Inf	0.0265235607337796	0	1	0	0.0267094735426612	1	0.0236847727685219	0.093167701863354	1717	1693
TCGA-AA-A01S-01A-21W-A096-10	0	0	0	0	63	0	1	0	1	62	2542	1	1	0	2	577	0	4	1	5	628	3	4	25	32	696	0	6	17	23	641	0	3	1	4	79	0.0634920634920635	0.173913043478261	0.123244929797192	1.41111722619703	0.0506329113924051	1	1	0	2	92	0.0317460317460317	0.0625	0.132183908045977	0.472826086956522	0.0217391304347826	0.0317460317460317	2	43	171	1166	0.983163575688217	0.317324045869341	0.0542455920051772	Inf	0.347498375568551	2.60623781676413	0.337980532739205	3.40476944383537	0.186159844054581	0.996607542623029	0.166425331773324	1	61	60
TCGA-AA-A01T-01A-21W-A096-10	0	0	0	0	95	0	1	1	2	93	3813	4	2	0	6	929	0	3	6	9	874	7	11	20	38	1037	1	4	35	40	973	0	1	1	2	120	0.0210526315789474	0.05	0.123329907502569	0.405416666666667	0.0166666666666667	0	0	2	2	139	0.0210526315789474	0.0526315789473684	0.13404050144648	0.39265429761454	0.0143884892086331	0.0315789473684211	3	60	259	1751	0.990547076060819	0.338150312745146	0.089188254799392	Inf	0.369553226696084	0	1	0	0.423306423306423	0.978100428549307	0.390161521030784	0.142857142857143	92	90
TCGA-AA-A01V-01A-23W-A096-10	0	0	0	0	132	0	1	3	4	126	5166	5	5	4	14	1244	5	3	1	9	1223	4	12	32	48	1311	0	11	44	55	1388	0	2	2	4	182	0.0303030303030303	0.0727272727272727	0.131123919308357	0.554645354645355	0.021978021978022	0	2	2	4	168	0.0303030303030303	0.0833333333333333	0.128146453089245	0.650297619047619	0.0238095238095238	0.0303030303030303	4	76	350	2349	0.994327849505606	0.353323494479057	0.117177816361768	Inf	0.385571428571429	0	1	0	0.405864661654135	0.991503325108373	0.372949359755417	0.076923076923077	128	122
TCGA-AA-A01X-01A-21W-A096-10	0	0	0	0	65	0	1	1	2	63	2583	1	4	0	5	568	0	0	0	0	603	1	3	29	33	686	0	5	20	25	726	0	2	1	3	89	0.0461538461538462	0.12	0.122589531680441	0.978876404494382	0.0337078651685393	0	0	0	0	95	0	0	0.138483965014577	0	0	0.0153846153846154	1	49	184	1228	0.99898106406251	0.136295579364246	0.00678401816668772	Inf	0.153478260869565	0	1	0	0.156610470275067	0.998833450007353	0.13913471670122	1	64	62
TCGA-AA-A01Z-01A-11W-A096-10	0	0	0	0	106	0	3	3	6	100	4100	1	2	2	5	978	2	2	0	4	978	1	5	32	38	1058	1	6	46	53	1086	0	1	2	3	141	0.0283018867924528	0.0566037735849057	0.129834254143646	0.435969490164593	0.0212765957446809	1	1	0	2	147	0.0188679245283019	0.0526315789473684	0.138941398865784	0.378804153240243	0.0136054421768707	0.0283018867924528	3	77	288	1856	0.999018434386038	0.25117819244417	0.06664446961372	Inf	0.279166666666667	3.72222222222222	0.251256851256851	6.43502174502251	0.190883190883191	0.999803876507041	0.169663878445176	1	103	97
TCGA-AA-A022-01A-21W-A096-10	0	0	0	0	1270	0	2	76	78	1192	48872	15	70	9	94	11227	6	81	14	101	11117	4	60	390	454	13188	9	73	461	543	13340	2	4	3	9	1588	0.00708661417322835	0.0165745856353591	0.11904047976012	0.139234869254213	0.00566750629722922	0	7	6	13	1575	0.0102362204724409	0.0286343612334802	0.119426751592357	0.239765051395007	0.00825396825396825	0.00866141732283465	11	853	3163	23365	1	0.0952635469519898	0.0531953359476526	Inf	0.106778609149776	1.29030375252316	0.470350994227427	1.34306612567696	0.0886989066070566	1	0.0789612243073504	0.0338583707840657	1259	1181
TCGA-AA-A024-01A-02W-A00E-09	0	0	0	0	82	0	1	1	2	79	3239	3	1	0	4	798	2	5	1	8	744	4	3	28	35	860	2	6	24	32	837	0	1	1	2	106	0.024390243902439	0.0625	0.126642771804062	0.493514150943396	0.0188679245283019	3	1	3	7	141	0.0853658536585366	0.2	0.163953488372093	1.21985815602837	0.049645390070922	0.0853658536585366	7	51	247	1450	0.757295818344287	0.805840215076204	0.35794365359471	Inf	0.829191679463912	3.43522267206478	0.044427998208117	5.86070119377377	0.528495795702273	0.954437684662843	0.489363137418143	1	75	72
TCGA-AA-A029-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	107	0	2	3	5	94	3854	2	0	3	5	950	3	1	4	8	989	2	9	37	48	968	3	8	22	33	947	1	3	0	4	149	0.0373831775700935	0.121212121212121	0.157338965153115	0.770388448240797	0.0268456375838926	1	1	3	5	139	0.0467289719626168	0.104166666666667	0.143595041322314	0.725419664268585	0.0359712230215827	0.0467289719626168	5	59	288	1627	0.971268002563708	0.478897245467554	0.181083673560553	Inf	0.519476996527778	2.65972222222222	0.166521216012521	3.76242873901148	0.338100282485876	0.995345179935526	0.302761920940016	1	102	89
TCGA-AA-A02F-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	64	0	4	1	5	59	2419	3	4	1	8	595	2	0	1	3	599	2	2	16	20	620	5	2	21	28	605	1	1	1	3	81	0.046875	0.107142857142857	0.133884297520661	0.80026455026455	0.037037037037037	1	0	0	1	78	0.015625	0.05	0.125806451612903	0.397435897435898	0.0128205128205128	0.046875	3	41	159	1066	0.935279728879184	0.490782187045219	0.127387609766906	Inf	0.525300171526587	2.20125786163522	0.229761495182897	2.67877088641832	0.208227095019548	0.993868853042304	0.186370643619948	1	61	56
TCGA-AA-A02H-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	74	0	0	3	3	71	2911	1	3	2	6	725	3	4	1	8	728	2	3	21	26	718	1	7	23	31	740	1	3	2	6	106	0.0810810810810811	0.193548387096774	0.143243243243243	1.3511868533171	0.0566037735849057	0	0	1	1	93	0.0135135135135135	0.0384615384615385	0.129526462395543	0.296939619520265	0.010752688172043	0.0540540540540541	4	43	199	1259	0.897755641737696	0.588698250744307	0.191059114061788	Inf	0.623543248155672	2.44221105527638	0.357233848893949	3.15971617751925	0.499543170397442	0.949109343448377	0.463107683990598	0.559440559440559	70	67
TCGA-AA-A02J-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	134	0	9	3	12	118	4838	4	5	1	10	1184	2	5	3	10	1225	5	4	27	36	1134	14	8	40	62	1295	3	2	4	9	192	0.0671641791044776	0.145161290322581	0.148262548262548	0.979082661290323	0.046875	3	1	3	7	168	0.0522388059701493	0.194444444444444	0.148148148148148	1.3125	0.0416666666666667	0.0970149253731343	13	73	360	2069	0.517776328674393	1.02347061245931	0.575351182554695	Inf	1.01992894056848	2.13070175438596	0.0522663307731066	2.6510349669156	0.704933665008292	0.883347767119852	0.670604754887564	1	121	105
TCGA-AA-A02K-01A-21W-A096-10	0	0	1	1	207	0	2	7	9	196	8036	3	25	8	36	1956	2	30	4	36	1816	6	10	37	53	2084	9	12	50	71	2180	3	2	1	6	261	0.0289855072463768	0.0845070422535211	0.119724770642202	0.705844260968107	0.0229885057471264	2	2	4	8	280	0.0386473429951691	0.150943396226415	0.134357005758157	1.12345013477089	0.0285714285714286	0.0483091787439614	10	92	541	3723	0.846341953860639	0.748056214638547	0.391850109912497	Inf	0.772715740640064	2.62723351817622	0.0333846113419293	3.43919809215082	0.452971296237279	0.989029536274361	0.419676031446255	1	197	186
TCGA-AA-A02O-01A-21W-A096-10	0	0	0	0	163	0	0	3	3	160	6560	1	8	4	13	1526	3	2	4	9	1509	1	11	60	72	1814	7	11	48	66	1711	4	0	2	6	207	0.0368098159509202	0.0909090909090909	0.120981881940386	0.751427316644708	0.0289855072463768	0	2	4	6	217	0.0368098159509202	0.0833333333333333	0.119625137816979	0.696620583717358	0.0276497695852535	0.0613496932515337	10	106	424	3101	0.900822481041248	0.690031987326335	0.36228617664528	Inf	0.716696486662329	4.15683962264151	0.00996692069770782	7.30476903094835	0.46187106918239	0.991818920391513	0.430288980663183	0.680172297752053	153	150
TCGA-AA-A02W-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	113	0	1	1	2	100	4100	6	3	0	9	921	0	3	3	6	925	1	11	31	43	1078	2	8	32	42	1176	0	1	0	1	133	0.00884955752212389	0.0238095238095238	0.113095238095238	0.210526315789474	0.0075187969924812	0	4	1	5	130	0.0442477876106195	0.116279069767442	0.120593692022263	0.964221824686941	0.0384615384615385	0.00884955752212389	1	65	263	1991	0.999694716965266	0.116517475388867	0.00583456385488619	Inf	0.129853669777624	0	1	0	0.136037177862273	0.999561298156279	0.122155039044977	1	112	99
TCGA-AA-A02Y-01A-43W-A096-10	0	0	0	0	124	0	3	2	5	119	4879	1	2	2	5	1198	0	3	4	7	1211	2	21	39	62	1242	4	9	32	45	1228	2	2	0	4	181	0.032258064516129	0.0888888888888889	0.147394136807818	0.603069367710252	0.0220994475138122	1	3	5	9	175	0.0725806451612903	0.145161290322581	0.140901771336554	1.03023041474654	0.0514285714285714	0.0645161290322581	8	69	356	2114	0.880188075221865	0.688577567685577	0.32819546529508	Inf	0.720852181526339	3.46910112359551	0.0430851945965778	5.93133551545366	0.488605792055705	0.98106660845382	0.449968646615791	0.672768878718535	116	111
TCGA-AA-A03F-01A-11W-A096-10	0	0	0	0	133	0	0	2	2	131	5371	3	0	4	7	1261	1	7	5	13	1251	3	12	42	57	1395	1	6	47	54	1464	0	3	0	3	192	0.0225563909774436	0.0555555555555556	0.131147540983607	0.423611111111111	0.015625	1	3	2	6	170	0.0451127819548872	0.105263157894737	0.121863799283154	0.863777089783282	0.0352941176470588	0.0225563909774436	3	90	362	2497	0.999598949907332	0.22999409899273	0.0612972475270463	Inf	0.254767421137052	1.97444751381215	0.418777560676261	2.29847955465866	0.177478428207834	0.999906992290248	0.158621734147919	1	130	128
TCGA-AA-A03J-01A-21W-A096-10	0	0	0	0	90	0	0	0	0	90	3690	1	4	0	5	896	0	10	2	12	901	2	7	33	42	968	2	6	23	31	925	2	1	0	3	122	0.0333333333333333	0.0967741935483871	0.131891891891892	0.733738762559492	0.0245901639344262	0	1	3	4	117	0.0444444444444444	0.0952380952380952	0.120867768595041	0.787952787952788	0.0341880341880342	0.0555555555555556	5	55	239	1654	0.887933279663875	0.629264256601899	0.237070460936813	Inf	0.660041841004184	3.9602510460251	0.08102709770863	6.90798896367374	0.424312612074118	0.977603936453885	0.391860090329046	1	85	85
TCGA-AD-5900-01A-11D-1650-10	0	0	1	1	1648	7	66	266	332	1309	53669	13	125	12	150	12010	13	118	14	145	12146	8	74	433	515	14665	3	93	403	499	14848	0	5	13	18	1789	0.0109223300970874	0.0360721442885772	0.120487607758621	0.29938468328496	0.0100614868641699	1	2	7	10	1740	0.00606796116504854	0.0194174757281553	0.118649846573474	0.16365361008816	0.00574712643678161	0.0127427184466019	21	826	3529	25984	1	0.187200311202885	0.124698414798009	Inf	0.207346917746464	0.760272031737036	0.753641698603846	0.736306238090087	0.20007158729922	1	0.180470947608882	1.30996732944117e-07	1627	1288
TCGA-AD-6548-01A-11D-1835-10	0	0	0	0	145	0	2	3	5	140	5740	2	13	4	19	1395	6	19	3	28	1414	4	11	32	47	1454	3	3	40	46	1477	0	0	3	3	213	0.0206896551724138	0.0652173913043478	0.144211238997969	0.452235150030618	0.0140845070422535	4	3	1	8	213	0.0551724137931034	0.170212765957447	0.146492434662999	1.16192188592548	0.0375586854460094	0.0551724137931034	8	71	426	2505	0.901688960750804	0.662647297087659	0.316558561664574	Inf	0.696737386343377	3.93158953722334	0.0109792358415835	7.83084339138494	0.382237871674491	0.995048834961228	0.345982135044433	1	137	132
TCGA-AD-6888-01A-11D-1924-10	0	0	0	0	132	1	0	5	5	126	5166	2	16	4	22	1233	1	17	1	19	1219	1	5	42	48	1345	3	5	29	37	1369	0	1	1	2	178	0.0151515151515152	0.0540540540540541	0.130021913805698	0.415730337078652	0.0112359550561798	0	0	0	0	180	0	0	0.133828996282528	0	0	0.00757575757575758	1	74	358	2356	0.999972026612175	0.0889663235744015	0.00446212796718037	Inf	0.101080074487896	0	1	0	0.106774726571721	0.999951442962326	0.0940498859816818	1	131	125
TCGA-AD-6889-01A-11D-1924-10	0	0	0	0	2032	6	85	320	405	1619	66379	24	143	20	187	14668	7	149	13	169	15165	11	109	527	647	18285	13	118	485	616	18261	2	10	11	23	2168	0.0113188976377953	0.0373376623376623	0.118722961502656	0.314494027651315	0.0106088560885609	1	7	8	16	2057	0.0078740157480315	0.0247295208655332	0.11249658189773	0.219824642210148	0.00777831793874575	0.0108267716535433	22	1014	4225	32321	1	0.165979169202286	0.111822511938514	Inf	0.183686002147541	1.0812426035503	0.536013295297521	1.09288139336385	0.162400074841546	1	0.146377235386785	9.64624251869409e-05	2010	1597
TCGA-AD-6890-01A-11D-1924-10	0	0	1	1	170	0	2	6	8	162	6642	1	16	1	18	1648	4	25	1	30	1623	2	14	41	57	1652	1	11	45	57	1719	1	5	0	6	217	0.0352941176470588	0.105263157894737	0.126236183827807	0.833858840650012	0.0276497695852535	1	1	4	6	240	0.0352941176470588	0.105263157894737	0.145278450363196	0.724561403508772	0.025	0.0352941176470588	6	83	457	2914	0.985357427036849	0.461022644106137	0.194624483620704	Inf	0.497283209991887	4.91757840991977	0.050409385933742	12.7356978740206	0.343086865808356	0.998051832245817	0.311111105957053	0.64040536122916	164	156
TCGA-AD-6895-01A-11D-1924-10	0	0	0	0	1637	11	36	142	178	1446	59286	65	96	16	177	13320	76	99	11	186	13671	16	53	441	510	16311	17	52	504	573	15984	3	4	27	34	1859	0.0207697006719609	0.0593368237347295	0.116303803803804	0.510188160611036	0.0182894029047875	4	5	29	38	1852	0.0232131948686622	0.0745098039215686	0.113543007786157	0.656225384322195	0.0205183585313175	0.0384850335980452	63	915	3711	28584	0.99999994988917	0.530345491177102	0.421528376858974	Inf	0.560590881362489	1.84598613458759	0.0776614344684667	2.07370604310443	0.515704062995898	0.999999997225987	0.485206339178665	2.58787311447752e-17	1574	1383
TCGA-AD-6899-01A-11D-1924-10	0	0	0	0	198	1	1	5	6	190	7790	5	28	0	33	1963	1	23	1	25	1844	3	8	54	65	2030	5	7	55	67	1953	1	3	3	7	252	0.0353535353535354	0.104477611940299	0.129032258064516	0.809701492537313	0.0277777777777778	3	1	5	9	277	0.0454545454545455	0.138461538461538	0.136453201970443	1.01471813385171	0.0324909747292419	0.0606060606060606	12	105	529	3454	0.864354227026928	0.746254528278159	0.416055170489925	Inf	0.772235955600795	3.76465028355388	0.0141252152249494	6.52410102321976	0.552609215934514	0.981373617714558	0.517240040014071	0.273369766729538	186	178
TCGA-AD-6901-01A-11D-1924-10	0	0	0	0	306	0	2	6	8	297	12177	4	46	3	53	2996	6	32	4	42	2959	10	23	65	98	3115	10	19	75	104	3107	4	4	6	14	416	0.0457516339869281	0.134615384615385	0.133891213389121	1.00540865384615	0.0336538461538462	4	3	5	12	404	0.0392156862745098	0.122448979591837	0.129695024077047	0.944130127298444	0.0297029702970297	0.0620915032679739	19	141	820	5402	0.719823107594782	0.887762797360506	0.563612608334714	Inf	0.901051829268293	3.03512195121951	0.00267509239274235	4.39053058879279	0.596184668989547	0.981528038672769	0.561793627364967	0.565303853216313	287	278
TCGA-AD-6963-01A-11D-1924-10	0	0	0	0	165	0	0	2	2	163	6683	4	35	1	40	1699	5	39	2	46	1762	5	8	22	35	1596	6	4	32	42	1626	4	0	2	6	267	0.0363636363636364	0.142857142857143	0.164206642066421	0.869983948635634	0.0224719101123595	2	1	2	5	268	0.0303030303030303	0.142857142857143	0.167919799498747	0.850746268656716	0.0186567164179104	0.0606060606060606	10	55	535	2687	0.655260381918791	0.913218581076341	0.469321984151659	Inf	0.926527677929547	3.28496176720476	0.00463090384911867	6.0218729004273	0.446105919003115	0.98499771539964	0.401873674336075	0.66992140985949	155	153
TCGA-AD-6964-01A-11D-1924-10	0	0	0	0	1375	4	45	119	164	1206	49446	31	152	14	197	11538	33	166	7	206	11929	6	54	337	397	13009	1	57	348	406	12970	0	6	11	17	1650	0.0123636363636364	0.041871921182266	0.1272166538165	0.32913867741454	0.0103030303030303	0	3	10	13	1650	0.00945454545454546	0.0327455919395466	0.12683526789146	0.258174185176704	0.00787878787878788	0.0152727272727273	21	671	3300	22679	1	0.215090325308386	0.143065372072723	Inf	0.238903047819233	0	1	0	0.241344392833444	1	0.217357817915975	3.58374636253672e-09	1354	1185
TCGA-AD-6965-01A-11D-1924-10	0	0	0	0	162	0	3	3	6	156	6396	3	16	0	19	1493	3	22	2	27	1487	4	8	48	60	1619	4	8	38	50	1797	0	2	1	3	201	0.0185185185185185	0.06	0.111853088480801	0.536417910447761	0.0149253731343284	1	3	4	8	192	0.0493827160493827	0.133333333333333	0.118591723285979	1.12430555555556	0.0416666666666667	0.037037037037037	6	88	393	3023	0.965083468588091	0.524539119037803	0.22156921676388	Inf	0.5548156569758	1.08651399491094	0.624328324572354	1.09880693067585	0.505355346470205	0.974445754545378	0.474899288651851	0.148606811145511	156	150
TCGA-AF-2687-01A-02D-1733-10	0	0	1	1	191	0	0	3	3	188	7708	3	36	1	40	1774	3	25	0	28	1790	5	12	52	69	2082	0	9	42	51	2062	0	0	3	3	252	0.0157068062827225	0.0588235294117647	0.122211445198836	0.481325863678805	0.0119047619047619	1	1	3	5	281	0.0261780104712042	0.072463768115942	0.134966378482229	0.536902367321677	0.0177935943060498	0.0366492146596859	7	92	533	3611	0.976240455714102	0.515543235256481	0.234842077691744	Inf	0.549737525347281	1.55497185741088	0.498039444855397	1.69344912333369	0.496267614067303	0.985425147501328	0.461987314843286	0.0405594405594406	184	181
TCGA-AF-2689-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	63	0	1	0	1	62	2542	4	8	3	15	646	2	7	1	10	641	3	2	17	22	610	3	3	9	15	645	0	1	1	2	95	0.0317460317460317	0.133333333333333	0.147286821705426	0.905263157894737	0.0210526315789474	1	1	2	4	97	0.0634920634920635	0.181818181818182	0.159016393442623	1.14339268978444	0.0412371134020619	0.0634920634920635	4	28	192	1063	0.742858943593363	0.791056608024652	0.251284713013187	Inf	0.817057291666667	1.08940972222222	0.631701070045371	1.10723120871303	0.754206730769231	0.782391245890608	0.722312315998172	0.545454545454546	59	58
TCGA-AF-2691-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	72	0	0	0	0	72	2952	5	2	0	7	716	2	5	1	8	733	1	12	16	29	730	6	10	12	28	773	1	2	1	4	120	0.0555555555555556	0.142857142857143	0.155239327296248	0.920238095238095	0.0333333333333333	0	1	0	1	105	0.0138888888888889	0.0344827586206897	0.143835616438356	0.239737274220033	0.00952380952380952	0.0277777777777778	2	33	225	1278	0.974783575368433	0.344406008915689	0.0584485900576782	Inf	0.381714285714286	0.954285714285714	0.6793360676997	0.946691255705624	0.238571428571429	0.989061082999538	0.210494807104675	1	70	70
TCGA-AF-2692-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	39	0	1	1	2	37	1517	2	4	0	6	352	0	2	0	2	381	1	1	12	14	405	1	2	12	15	379	1	0	0	1	51	0.0256410256410256	0.0666666666666667	0.134564643799472	0.495424836601307	0.0196078431372549	0	1	2	3	47	0.0769230769230769	0.214285714285714	0.116049382716049	1.84650455927052	0.0638297872340425	0.0769230769230769	3	23	98	686	0.649788517365541	0.913123603962913	0.228962991211589	Inf	0.923076923076923	4	0.236184178538435	6.96961280997499	0.666666666666667	0.820074959172692	0.636667426956065	1	36	34
TCGA-AF-2693-01A-02D-1733-10	0	0	0	0	252	1	0	3	3	248	10168	4	53	1	58	2508	6	56	1	63	2541	2	14	43	59	2625	1	12	55	68	2494	0	1	3	4	367	0.0158730158730159	0.0588235294117647	0.147153167602245	0.399743548645616	0.0108991825613079	0	6	4	10	384	0.0396825396825397	0.169491525423729	0.146285714285714	1.15863347457627	0.0260416666666667	0.0277777777777778	7	94	751	4368	0.994317960444746	0.433174487177696	0.197687903714416	Inf	0.472413020263411	0	1	0	0.486874643332699	0.992332504169383	0.447453461692189	0.00579710144927537	245	241
TCGA-AF-3400-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	29	1	0	0	0	28	1148	1	4	0	5	267	0	1	1	2	262	1	1	10	12	328	1	2	6	9	291	0	0	0	0	38	0	0	0.130584192439863	0	0	0	0	0	0	33	0	0	0.100609756097561	0	0	0	0	18	71	548	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	29	28
TCGA-AF-3913-01A-02W-1073-09	0	0	0	0	114	0	1	2	3	110	4510	3	3	4	10	1067	3	8	1	12	1155	10	13	16	39	1206	6	9	34	49	1082	4	2	3	9	160	0.0789473684210526	0.183673469387755	0.147874306839187	1.24209183673469	0.05625	4	0	3	7	165	0.0614035087719298	0.179487179487179	0.13681592039801	1.31188811188811	0.0424242424242424	0.12280701754386	14	52	325	1963	0.0823595980696246	1.62575476059343	0.916942857031148	Inf	1.49333333333333	3.52	0.000781971771616899	6.0323818857151	0.8448	0.731823719315564	0.823700596161857	0.722393472194293	100	96
TCGA-AF-4110-01A-02D-1733-10	0	0	0	0	134	1	5	1	6	127	5207	2	30	1	33	1283	2	17	1	20	1288	2	7	24	33	1261	5	9	27	41	1375	1	2	2	5	195	0.0373134328358209	0.121951219512195	0.141818181818182	0.859912445278299	0.0256410256410256	1	2	1	4	175	0.0298507462686567	0.121212121212121	0.13877874702617	0.873419913419913	0.0228571428571429	0.0373134328358209	5	53	370	2266	0.922739895345679	0.577865232983886	0.21810962137464	Inf	0.614165890027959	2.03552123552124	0.257587762371384	2.44869164634099	0.419077901430843	0.980107370662576	0.382866379212585	1	129	122
TCGA-AF-5654-01A-01D-1657-10	0	0	0	0	175	2	3	0	3	170	6970	4	21	1	26	1703	2	20	0	22	1658	3	8	41	52	1866	6	12	52	70	1743	1	2	3	6	210	0.0342857142857143	0.0857142857142857	0.120481927710843	0.711428571428571	0.0285714285714286	2	3	0	5	247	0.0285714285714286	0.0961538461538462	0.132368703108253	0.726409218312052	0.0202429149797571	0.0342857142857143	6	96	457	3152	0.991593353645053	0.431143247595515	0.182621712577339	Inf	0.464538550650019	2.63238512035011	0.0954677958442057	3.44663156508376	0.254746947130656	0.999609057162411	0.229958950740734	1	169	164
TCGA-AF-6136-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	195	1	1	3	4	190	7790	0	33	1	34	1893	1	35	1	37	1987	4	6	54	64	1953	1	10	44	55	1957	0	0	3	3	296	0.0153846153846154	0.0545454545454545	0.151251916198263	0.360626535626536	0.0101351351351351	3	1	1	5	271	0.0256410256410256	0.078125	0.138760880696365	0.563018911439114	0.018450184501845	0.0358974358974359	7	96	567	3343	0.994646040006969	0.429977877718681	0.196108287521067	Inf	0.468656358623996	4.13756613756614	0.0244307622466114	8.83551971480781	0.281467084188173	0.999785503319856	0.250944231100451	1	188	183
TCGA-AF-6655-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	140	0	0	7	7	133	5453	2	25	1	28	1318	2	23	0	25	1439	2	12	30	44	1329	1	12	23	36	1367	0	2	1	3	217	0.0214285714285714	0.0833333333333333	0.158741770299927	0.524961597542243	0.0138248847926267	1	2	1	4	186	0.0285714285714286	0.0909090909090909	0.139954853273138	0.649560117302053	0.021505376344086	0.0214285714285714	3	53	403	2293	0.99296421443289	0.322153966507965	0.0848803729293759	Inf	0.358383551931939	2.22994210090984	0.38531249968332	2.84339047792582	0.252446275574699	0.997963305666709	0.223202439824267	1	137	130
TCGA-AF-6672-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	146	1	1	2	3	142	5822	3	23	1	27	1415	4	28	1	33	1505	3	10	22	35	1417	7	4	36	47	1485	4	1	2	7	223	0.0479452054794521	0.148936170212766	0.15016835016835	0.991794676080527	0.031390134529148	1	1	2	4	207	0.0273972602739726	0.114285714285714	0.146083274523642	0.782332643202208	0.0193236714975845	0.0616438356164384	9	59	430	2472	0.69399176727999	0.876988225611973	0.435212039549407	Inf	0.893228454172367	3.37441860465116	0.00957305475325146	5.74340527944726	0.465437048917402	0.978982832575531	0.425928993184406	1	137	133
TCGA-AG-3574-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	41	0	1	0	1	40	1640	1	0	0	1	416	1	4	1	6	414	0	4	15	19	391	0	6	8	14	419	0	2	0	2	57	0.0487804878048781	0.142857142857143	0.136038186157518	1.05012531328321	0.0350877192982456	0	2	0	2	61	0.0487804878048781	0.105263157894737	0.156010230179028	0.674719585849871	0.0327868852459016	0	0	23	118	692	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	41	40
TCGA-AG-3575-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	51	0	0	1	1	50	2050	2	4	3	9	508	1	2	0	3	522	1	1	19	21	483	0	6	11	17	537	0	2	0	2	82	0.0392156862745098	0.117647058823529	0.152700186219739	0.770444763271162	0.024390243902439	0	1	0	1	62	0.0196078431372549	0.0476190476190476	0.128364389233954	0.370967741935484	0.0161290322580645	0	0	31	144	876	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	51	50
TCGA-AG-3578-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	25	1	0	0	0	24	984	2	0	0	2	246	0	2	1	3	245	0	1	7	8	242	1	3	7	11	251	0	0	0	0	38	0	0	0.151394422310757	0	0	0	0	0	0	36	0	0	0.148760330578512	0	0	0	0	15	74	419	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	25	24
TCGA-AG-3580-01A-01W-0831-10	0	1	0	1	42	0	0	1	1	41	1681	0	2	0	2	430	0	1	0	1	402	0	5	20	25	429	0	2	11	13	420	0	1	0	1	66	0.0238095238095238	0.0769230769230769	0.157142857142857	0.48951048951049	0.0151515151515152	0	2	2	4	68	0.0952380952380952	0.16	0.158508158508158	1.00941176470588	0.0588235294117647	0.0476190476190476	2	29	134	715	0.9656513958641	0.368284272407581	0.0618816716354453	Inf	0.408762638420799	NaN	1	0	0.408762638420799	0.9656513958641	0.368284272407581	0.444444444444444	40	39
TCGA-AG-3581-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	54	0	1	0	1	53	2173	1	2	0	3	542	1	1	1	3	522	4	2	14	20	551	3	1	23	27	558	0	0	3	3	65	0.0555555555555556	0.111111111111111	0.116487455197133	0.953846153846154	0.0461538461538462	0	0	0	0	84	0	0	0.152450090744102	0	0	0.0555555555555556	3	41	149	960	0.944680137134654	0.471674913973893	0.12233088153457	Inf	0.507474069554606	0	1	0	0.603482677308181	0.889032018883545	0.568727699693672	0.1	51	50
TCGA-AG-3582-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	35	0	0	1	1	34	1394	0	4	1	5	302	0	2	1	3	341	1	5	10	16	379	1	4	5	10	372	0	0	0	0	48	0	0	0.129032258064516	0	0	0	1	0	1	37	0.0285714285714286	0.0625	0.0976253298153034	0.640202702702703	0.027027027027027	0	0	17	85	666	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	35	34
TCGA-AG-3583-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	59	0	0	2	2	57	2337	0	1	0	1	601	0	1	2	3	563	1	1	15	17	565	1	2	33	36	608	1	1	1	3	85	0.0508474576271186	0.0833333333333333	0.139802631578947	0.596078431372549	0.0352941176470588	0	0	2	2	75	0.0338983050847458	0.117647058823529	0.132743362831858	0.886274509803922	0.0266666666666667	0.0677966101694915	4	46	160	1013	0.921450382319253	0.550765051570747	0.178766847320925	Inf	0.5865	3.665625	0.255368443945051	6.31467879708456	0.458203125	0.96631423603853	0.422302465956329	0.523809523809524	55	53
TCGA-AG-3584-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	33	0	1	0	1	32	1312	0	2	1	3	316	0	0	1	1	347	1	3	7	11	307	0	2	15	17	342	0	0	0	0	57	0	0	0.166666666666667	0	0	0	0	0	0	48	0	0	0.156351791530945	0	0	0	0	23	105	544	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	33	32
TCGA-AG-3586-01A-02W-0831-10	0	0	0	0	66	2	1	0	1	63	2583	1	6	3	10	653	5	7	3	15	621	2	6	14	22	650	2	3	11	16	659	0	2	1	3	107	0.0454545454545455	0.1875	0.16236722306525	1.15478971962617	0.0280373831775701	0	2	1	3	101	0.0454545454545455	0.136363636363636	0.155384615384615	0.877587758775878	0.0297029702970297	0.0303030303030303	2	27	208	1101	0.956333194677374	0.392291051585903	0.0659830176529992	Inf	0.434018567639257	0	1	0	0.503461538461539	0.923590462534875	0.460493329250003	0.454545454545454	64	61
TCGA-AG-3587-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	66	1	1	0	1	64	2624	1	4	3	8	667	0	4	0	4	629	0	6	16	22	644	2	4	24	30	684	1	0	0	1	95	0.0151515151515152	0.0333333333333333	0.138888888888889	0.24	0.0105263157894737	0	2	0	2	94	0.0303030303030303	0.0909090909090909	0.145962732919255	0.622823984526112	0.0212765957446809	0.0151515151515152	1	41	189	1139	0.998294509257684	0.147093438296597	0.00729645688180887	Inf	0.167296548248929	3.51322751322751	0.26539825862625	6.01323741558411	0	1	0	1	65	63
TCGA-AG-3593-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	75	1	0	0	0	74	3034	5	4	0	9	780	4	7	1	12	808	7	3	19	29	742	3	6	15	24	704	1	1	0	2	132	0.0266666666666667	0.0833333333333333	0.1875	0.444444444444444	0.0151515151515152	1	2	1	4	107	0.0533333333333333	0.137931034482759	0.144204851752022	0.956493715758943	0.0373831775700935	0.04	3	41	239	1207	0.982699648172881	0.369701831549227	0.0962834793194978	Inf	0.412514263978699	1.21004184100418	0.512072914268421	1.26233371281309	0.177947329559439	0.997735149956762	0.153140190257088	1	72	71
TCGA-AG-3594-01A-02W-0831-10	0	0	0	0	42	0	0	2	2	40	1640	0	2	1	3	440	0	3	0	3	358	0	2	13	15	414	0	4	15	19	428	0	1	0	1	55	0.0238095238095238	0.0526315789473684	0.128504672897196	0.409569377990431	0.0181818181818182	0	0	0	0	65	0	0	0.157004830917874	0	0	0	0	28	120	722	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	42	40
TCGA-AG-3598-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	72	0	0	0	0	72	2952	3	4	5	12	709	1	1	0	2	677	2	6	14	22	771	4	6	26	36	795	1	1	0	2	111	0.0277777777777778	0.0555555555555556	0.139622641509434	0.397897897897898	0.018018018018018	1	1	0	2	92	0.0277777777777778	0.0909090909090909	0.119325551232166	0.761857707509881	0.0217391304347826	0.0277777777777778	2	44	203	1363	0.986189962852864	0.305341467140413	0.0522826323630782	Inf	0.335403726708075	2.57142857142857	0.178267032320271	3.35335730804571	0	1	0	0.428571428571429	70	70
TCGA-AG-3599-01A-02W-0833-10	0	0	0	0	67	0	1	0	1	66	2706	1	2	0	3	634	1	5	0	6	663	3	2	21	26	709	0	7	24	31	700	0	0	0	0	94	0	0	0.134285714285714	0	0	0	0	0	0	93	0	0	0.131170662905501	0	0	0	0	48	187	1222	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	67	66
TCGA-AG-3600-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	95	0	2	1	3	92	3772	0	10	1	11	985	2	6	8	16	968	8	6	26	40	911	4	6	15	25	908	2	0	0	2	151	0.0210526315789474	0.08	0.166299559471366	0.481059602649007	0.0132450331125828	0	1	2	3	135	0.0315789473684211	0.075	0.148188803512623	0.506111111111111	0.0222222222222222	0.0421052631578947	4	49	286	1533	0.974637435920293	0.437705228077665	0.143177954078743	Inf	0.480010555482254	1.06002331002331	0.585176541892246	1.07200298278221	0.310250724884871	0.991894545185102	0.275000778078239	1	91	88
TCGA-AG-3601-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	107	0	0	0	0	107	4387	1	10	9	20	1187	4	5	4	13	1073	6	9	20	35	1078	3	10	26	39	1049	0	2	6	8	151	0.0747663551401869	0.205128205128205	0.143946615824595	1.42502971642044	0.0529801324503311	2	2	1	5	155	0.0467289719626168	0.142857142857143	0.14378478664193	0.993548387096774	0.032258064516129	0.0841121495327103	9	46	306	1821	0.39770693644189	1.16420921784854	0.569642809741127	Inf	1.13743315508021	1.54466230936819	0.380461721883903	1.69976963411769	1.057757885763	0.501639333975813	1.06810760010109	0.0968421052631578	98	98
TCGA-AG-3602-01A-02W-0833-10	0	0	0	0	47	0	0	0	0	47	1927	0	2	0	2	435	1	1	2	4	453	0	2	13	15	538	4	2	20	26	501	2	0	1	3	65	0.0638297872340425	0.115384615384615	0.129740518962076	0.889349112426036	0.0461538461538462	0	1	1	2	55	0.0425531914893617	0.133333333333333	0.102230483271375	1.30424242424242	0.0363636363636364	0.0851063829787234	4	33	120	919	0.634328559473082	0.928333933677251	0.295946229556391	Inf	0.936036036036036	4.32916666666667	0.0695089645240409	7.63081579814389	0.524747474747475	0.906327691656403	0.494338177872082	1	43	43
TCGA-AG-3605-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	60	0	0	0	0	60	2460	1	3	0	4	623	1	2	3	6	604	2	6	14	22	615	2	4	22	28	618	1	1	2	4	86	0.0666666666666667	0.142857142857143	0.13915857605178	1.0265780730897	0.0465116279069767	1	3	0	4	79	0.0666666666666667	0.181818181818182	0.128455284552846	1.41542002301496	0.0506329113924051	0.0666666666666667	4	36	165	1068	0.800300694072482	0.719358839173359	0.23123605119834	Inf	0.747272727272727	3.73636363636364	0.0903759653304243	6.45628235345358	0.415151515151515	0.96177195405825	0.38095329791661	1	56	56
TCGA-AG-3608-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	57	0	0	0	0	57	2337	0	2	0	2	603	0	4	0	4	519	1	4	21	26	595	2	5	18	25	620	0	0	0	0	71	0	0	0.114516129032258	0	0	1	1	0	2	81	0.0350877192982456	0.0769230769230769	0.136134453781513	0.565052231718899	0.0246913580246914	0.0175438596491228	1	41	152	1063	0.99610599631091	0.17070013831812	0.00852160014611592	Inf	0.19031954887218	2.66447368421053	0.331728317230046	3.49102654455274	0	1	0	1	56	56
TCGA-AG-3609-01A-02W-0833-10	0	0	0	0	90	1	0	0	0	89	3649	6	6	3	15	907	5	2	1	8	923	4	4	19	27	850	7	8	24	39	969	2	0	5	7	138	0.0777777777777778	0.179487179487179	0.142414860681115	1.2603121516165	0.0507246376811594	1	1	3	5	123	0.0555555555555556	0.185185185185185	0.144705882352941	1.27973501957242	0.040650406504065	0.122222222222222	11	43	261	1558	0.148846187564772	1.52664282668675	0.794005127752445	Inf	1.41968213424152	1.90073145245559	0.203525136636463	2.23722641967459	1.29662300632629	0.274669159675628	1.36416795898325	0.0995327192661963	79	78
TCGA-AG-3611-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	51	0	0	0	0	51	2091	0	2	3	5	495	1	5	0	6	536	1	3	15	19	548	1	0	20	21	512	0	0	1	1	70	0.0196078431372549	0.0476190476190476	0.13671875	0.348299319727891	0.0142857142857143	0	0	0	0	71	0	0	0.12956204379562	0	0	0.0196078431372549	1	36	141	919	0.994600981207592	0.181203670599672	0.00900962010943809	Inf	0.203181905309565	0	1	0	0.214792299898683	0.992875075370347	0.191860296300339	1	50	50
TCGA-AG-3612-01A-01W-0833-10	0	0	1	1	72	0	0	0	0	72	2952	3	1	3	7	742	5	4	2	11	727	3	6	9	18	705	2	9	25	36	778	2	2	2	6	121	0.0833333333333333	0.166666666666667	0.155526992287918	1.07162534435262	0.0495867768595041	2	0	2	4	101	0.0555555555555556	0.222222222222222	0.143262411347518	1.55115511551155	0.0396039603960396	0.111111111111111	8	31	222	1261	0.22613510257058	1.46543334380954	0.667964915650106	Inf	1.37029337029337	5.34414414414414	0.00228979683609796	22.6379534256919	0.785903550609433	0.769709367899175	0.757484484172543	1	64	64
TCGA-AG-3726-01A-02W-0899-10	0	0	0	0	132	0	0	3	3	109	4469	4	5	2	11	1040	3	4	2	9	1025	5	9	31	45	1184	4	8	32	44	1220	1	3	0	4	137	0.0303030303030303	0.0909090909090909	0.112295081967213	0.809555408095554	0.0291970802919708	0	2	1	3	151	0.0227272727272727	0.0666666666666667	0.127533783783784	0.522737306843267	0.0198675496688742	0.0151515151515152	2	70	288	2116	0.998796732180341	0.209996134250832	0.0364525753915252	Inf	0.231867283950617	0.927469135802469	0.68341459128014	0.918423741415871	0.132495590828924	0.999649626824378	0.118551964757696	1	130	107
TCGA-AG-3727-01A-01W-0899-10	0	0	0	0	81	0	3	0	3	78	3198	0	2	2	4	797	4	2	4	10	729	0	5	20	25	844	1	4	34	39	828	1	2	1	4	122	0.0493827160493827	0.102564102564103	0.147342995169082	0.69609079445145	0.0327868852459016	0	0	2	2	112	0.0246913580246914	0.08	0.132701421800948	0.602857142857143	0.0178571428571429	0.0493827160493827	4	51	234	1438	0.957909295274051	0.482144993627464	0.157717694141611	Inf	0.51965811965812	7.14529914529915	0.140466228332337	Inf	0.39696106362773	0.985377793454174	0.361636315979205	0.545454545454546	77	74
TCGA-AG-3731-01A-11D-1733-10	0	0	0	0	211	0	1	8	9	202	8282	5	40	1	46	1944	1	29	1	31	2197	5	7	52	64	2060	9	7	45	61	2081	7	2	2	11	317	0.0521327014218009	0.180327868852459	0.152330610283518	1.1837927289652	0.0347003154574132	5	0	0	5	299	0.023696682464455	0.078125	0.145145631067961	0.538252508361204	0.0167224080267559	0.0663507109004739	14	97	616	3525	0.784257319643656	0.825949036830192	0.480574143344095	Inf	0.847870597870598	5.76205936920223	8.8005321593423e-09	34.2653481708913	0.138606239121703	0.999996589411097	0.120500918893341	0.000965052278614514	197	188
TCGA-AG-3732-01A-11D-1657-10	0	0	0	0	168	2	4	11	15	151	6191	5	34	1	40	1474	0	39	0	39	1623	2	6	31	39	1572	2	3	28	33	1522	0	2	3	5	221	0.0297619047619048	0.151515151515152	0.145203679369251	1.04346633758398	0.0226244343891403	0	0	2	2	207	0.0119047619047619	0.0512820512820513	0.131679389312977	0.389446302489781	0.00966183574879227	0.0297619047619048	5	58	428	2666	0.946497107853878	0.53706692114953	0.203512575915346	Inf	0.573727933541018	0	1	0	0.612624742594646	0.92366661802561	0.576841017804143	0.020979020979021	163	146
TCGA-AG-3742-01A-11D-1657-10	0	0	0	0	221	0	7	3	10	209	8569	3	29	1	33	1977	2	38	2	42	2156	3	9	53	65	2226	4	9	56	69	2210	2	3	4	9	313	0.0407239819004525	0.130434782608696	0.141628959276018	0.920961244617308	0.0287539936102236	0	3	2	5	303	0.0226244343891403	0.0769230769230769	0.136118598382749	0.565118050266565	0.0165016501650165	0.0361990950226244	8	108	616	3820	0.993479784833926	0.459417375437627	0.222462562259943	Inf	0.496641289744738	2.05751391465677	0.253043500242957	2.47982598541909	0.39640176337424	0.99840788515762	0.361296085989441	0.208695652173913	213	201
TCGA-AG-3878-01A-02W-0899-10	0	0	0	0	80	0	2	1	3	76	3116	2	2	1	5	793	1	3	3	7	766	0	6	20	26	745	2	7	29	38	812	1	1	0	2	113	0.025	0.0526315789473684	0.139162561576355	0.378202142524453	0.0176991150442478	0	1	0	1	119	0.0125	0.0384615384615385	0.159731543624161	0.240788623141564	0.00840336134453781	0.0125	1	50	232	1325	0.999702740037482	0.114298585363166	0.00569394316655243	Inf	0.131592292089249	3.35560344827586	0.276654417062384	5.7011441849014	0	1	0	1	79	75
TCGA-AG-3881-01A-01W-0899-10	0	0	0	0	96	0	0	2	2	93	3813	3	4	2	9	915	4	5	2	11	859	2	8	30	40	1035	4	5	24	33	1004	2	1	3	6	125	0.0625	0.181818181818182	0.124501992031873	1.46036363636364	0.048	0	2	0	2	120	0.0208333333333333	0.05	0.115942028985507	0.43125	0.0166666666666667	0.0520833333333333	5	55	245	1794	0.860388430233658	0.665789278396022	0.250902374460443	Inf	0.693537414965986	2.77414965986395	0.157110172666406	3.6576775613614	0.462358276643991	0.964112215827251	0.430858835512604	1	91	88
TCGA-AG-3882-01A-01W-0899-10	0	0	0	0	61	0	2	0	2	58	2378	0	3	0	3	608	2	1	1	4	534	1	5	23	29	604	1	5	16	22	632	0	1	2	3	79	0.0491803278688525	0.136363636363636	0.125	1.09090909090909	0.0379746835443038	0	0	2	2	84	0.0327868852459016	0.0689655172413793	0.139072847682119	0.495894909688013	0.0238095238095238	0.0655737704918033	4	37	163	1073	0.806321391262339	0.711825653836267	0.229075844562653	Inf	0.739787520574592	0	1	0	0.77772534214252	0.773839251435452	0.752475156564089	0.0476190476190476	57	54
TCGA-AG-3883-01A-02W-0899-10	0	0	0	0	125	0	0	3	3	122	5002	3	3	2	8	1178	2	4	2	8	1241	1	15	37	53	1341	4	7	42	53	1242	3	0	1	4	168	0.032	0.0754716981132075	0.135265700483092	0.557951482479784	0.0238095238095238	0	8	1	9	178	0.072	0.169811320754717	0.132736763609247	1.27930888276447	0.050561797752809	0.04	5	79	346	2237	0.990582326038399	0.409295898162432	0.156299592338998	Inf	0.444364161849711	4.47919075144509	0.0197152577133511	9.68237970611207	0.188995390356333	0.999826326901871	0.16799072207806	1	120	117
TCGA-AG-3885-01A-01W-0899-10	0	0	2	2	193	4	2	6	8	180	7380	1	34	2	37	1730	4	41	6	51	1703	3	5	38	46	1926	3	7	36	46	2021	0	1	5	6	243	0.0310880829015544	0.130434782608696	0.120237506185057	1.08480944712829	0.0246913580246914	0	2	1	3	251	0.0155440414507772	0.0652173913043478	0.130321910695742	0.500433050407067	0.0119521912350598	0.0310880829015544	6	74	494	3453	0.944153041379091	0.566812891751423	0.238633396699569	Inf	0.599240890688259	0	1	0	0.647827989933253	0.91289464632117	0.616816956470634	0.0090497737556561	187	174
TCGA-AG-3887-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	76	0	2	2	4	72	2952	2	4	1	7	709	3	5	0	8	703	2	5	26	33	722	2	7	15	24	818	1	0	1	2	113	0.0263157894736842	0.0833333333333333	0.138141809290954	0.603244837758112	0.0176991150442478	1	1	1	3	91	0.0394736842105263	0.0909090909090909	0.126038781163435	0.721278721278721	0.032967032967033	0.0526315789473684	4	41	204	1336	0.862481973734597	0.639084200046394	0.207079308111785	Inf	0.671023965141612	3.77450980392157	0.0885215887369903	6.53551110699707	0.368244858919177	0.977882975604599	0.336003536109525	1	72	68
TCGA-AG-3890-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	77	0	1	1	2	74	3034	1	4	5	10	785	4	4	2	10	807	3	9	19	31	683	7	4	12	23	759	4	0	1	5	125	0.0649350649350649	0.217391304347826	0.164690382081686	1.32	0.04	3	2	2	7	100	0.0909090909090909	0.225806451612903	0.146412884333821	1.54225806451613	0.07	0.12987012987013	10	31	225	1217	0.100425880024363	1.74402368743155	0.85958266399154	Inf	1.56314363143631	4.48622222222222	0.000190548021900623	12.5846913052327	0.620215053763441	0.881365965798569	0.579705042991907	0.213756898640463	67	64
TCGA-AG-3892-01A-01W-1073-09	0	0	2	2	2187	0	4	1	5	2180	89380	4	86	167	257	25220	9	93	183	285	25066	3	405	438	846	19524	2	378	412	792	19570	1	332	37	370	3635	0.169181527206219	0.467171717171717	0.185743484925907	2.51514456810193	0.101788170563961	1	347	34	382	3661	0.17466849565615	0.451536643026005	0.187512804753124	2.4080309801802	0.104343075662387	0.0333790580704161	73	782	7296	31798	1	0.406847833984546	0.328447535449301	Inf	0.457490445778188	2.14331140350877	0.235632825559681	2.90534939629835	0.447573851909185	1	0.397225499221025	1.10909463699096e-19	2114	2107
TCGA-AG-3893-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	115	0	0	1	1	113	4633	4	4	4	12	1101	1	5	2	8	1096	5	8	32	45	1203	5	13	30	48	1233	2	5	3	10	163	0.0869565217391304	0.208333333333333	0.132197891321979	1.57592024539877	0.0613496932515337	1	1	0	2	171	0.0173913043478261	0.0444444444444444	0.14214463840399	0.312670565302144	0.0116959064327485	0.0521739130434783	6	66	334	2102	0.939869994592088	0.572235177669662	0.239518447999442	Inf	0.607784431137725	2.18802395209581	0.148730059187073	2.6957391215535	0.352907089047711	0.993392438207107	0.320100848947872	1	109	107
TCGA-AG-3894-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	104	0	2	2	4	99	4059	4	2	5	11	938	3	3	2	8	959	3	8	27	38	1073	8	3	31	42	1089	0	1	0	1	133	0.00961538461538462	0.0238095238095238	0.122130394857668	0.194951664876477	0.0075187969924812	0	2	0	2	131	0.0192307692307692	0.0526315789473684	0.122087604846226	0.431096826034552	0.0152671755725191	0	0	69	264	1898	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	104	99
TCGA-AG-3896-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	106	0	1	0	1	105	4305	5	5	3	13	1046	1	4	1	6	992	3	7	36	46	1138	3	2	35	40	1129	1	1	1	3	150	0.0283018867924528	0.075	0.132860938883968	0.5645	0.02	0	3	2	5	157	0.0471698113207547	0.108695652173913	0.137961335676626	0.787870396012185	0.0318471337579618	0.0377358490566038	4	73	307	1960	0.994611801433108	0.349935553004531	0.115846098950399	Inf	0.383603367316722	1.23072747014115	0.583007056697137	1.27672179077969	0.312015414965362	0.997413431830779	0.281760386416265	0.569230769230769	102	101
TCGA-AG-3898-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	110	0	1	0	1	108	4428	5	4	3	12	1117	3	3	2	8	1095	1	7	34	42	1115	3	6	37	46	1101	1	0	2	3	143	0.0272727272727273	0.0652173913043478	0.129881925522253	0.502128306476132	0.020979020979021	0	2	0	2	148	0.0181818181818182	0.0476190476190476	0.132735426008969	0.358751608751609	0.0135135135135135	0.0272727272727273	3	72	291	1925	0.997841788687788	0.275727960161342	0.0730856919143932	Inf	0.304604810996564	1.90378006872852	0.431358896066753	2.20401032433388	0.21451043027927	0.999405685927443	0.191820109372351	1	107	105
TCGA-AG-3901-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	66	0	0	0	0	66	2706	0	2	0	2	629	2	4	2	8	684	2	4	18	24	740	1	2	29	32	653	0	0	0	0	81	0	0	0.124042879019908	0	0	1	1	0	2	85	0.0303030303030303	0.0833333333333333	0.114864864864865	0.725490196078431	0.0235294117647059	0.0151515151515152	1	49	166	1227	0.998095610752257	0.150949872309468	0.00757284256879525	Inf	0.167831325301205	2.79718875502008	0.317861734203103	3.69040186955357	0	1	0	1	65	65
TCGA-AG-3902-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	135	0	0	0	0	134	5494	9	10	7	26	1430	6	6	9	21	1405	7	9	32	48	1321	8	5	26	39	1338	2	2	3	7	207	0.0518518518518519	0.179487179487179	0.154708520179372	1.16016350798959	0.0338164251207729	3	2	2	7	190	0.0518518518518519	0.145833333333333	0.143830431491294	1.01392543859649	0.0368421052631579	0.0740740740740741	10	63	397	2262	0.665574083173541	0.90446081351694	0.466681190490759	Inf	0.917497670887823	2.23257766582704	0.061676061620389	2.84732966602793	0.577390775644923	0.945503596958035	0.537623713907087	1	125	124
TCGA-AG-3909-01A-01W-1073-09	0	0	1	1	85	0	0	2	2	83	3403	1	4	0	5	754	1	5	1	7	846	1	10	24	35	861	3	3	30	36	942	0	0	1	1	118	0.0117647058823529	0.0277777777777778	0.125265392781316	0.221751412429379	0.00847457627118644	1	0	1	2	94	0.0235294117647059	0.0571428571428571	0.10917537746806	0.523404255319149	0.0212765957446809	0.0352941176470588	3	55	212	1591	0.972033984889495	0.40948932360754	0.107595745096317	Inf	0.439899154196487	2.12617924528302	0.394759895025724	2.49967139187237	0.314989517819707	0.989965882545717	0.288765663860446	1	82	80
TCGA-AG-3999-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	97	0	1	0	1	94	3854	1	2	5	8	867	1	2	3	6	896	1	4	32	37	1003	3	4	36	43	1088	1	0	0	1	125	0.0103092783505155	0.0232558139534884	0.114889705882353	0.202418604651163	0.008	1	1	2	4	116	0.0412371134020619	0.108108108108108	0.115653040877368	0.934762348555452	0.0344827586206897	0.0412371134020619	4	68	241	1850	0.971256779825854	0.451673146917497	0.149068319499254	Inf	0.482019363762102	4.33817427385892	0.0686120765748946	7.66247955838648	0.255186721991701	0.997420588776692	0.232709273498493	1	93	90
TCGA-AG-4001-01A-02W-1073-09	0	0	0	0	124	0	1	2	3	120	4920	2	6	1	9	1134	2	3	1	6	1237	4	7	47	58	1238	4	4	39	47	1311	1	1	3	5	164	0.0403225806451613	0.106382978723404	0.12509534706331	0.850415153087701	0.0304878048780488	1	2	1	4	168	0.032258064516129	0.0689655172413793	0.135702746365105	0.508210180623974	0.0238095238095238	0.0483870967741935	6	88	332	2217	0.986575668251517	0.455399346173571	0.192095701750374	Inf	0.490066649577032	1.91942771084337	0.281353547822045	2.22498651323768	0.357102829924349	0.997047419557552	0.325834447082321	0.619909502262444	118	114
TCGA-AG-4005-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	120	0	1	3	4	115	4715	4	7	2	13	1141	5	6	2	13	1090	3	8	38	49	1194	4	6	30	40	1290	2	1	1	4	153	0.0333333333333333	0.1	0.118604651162791	0.843137254901961	0.0261437908496732	1	3	0	4	175	0.0333333333333333	0.0816326530612245	0.146566164154104	0.556967930029155	0.0228571428571429	0.0333333333333333	4	71	328	2156	0.991839768290747	0.370419471020604	0.122597939040604	Inf	0.40390243902439	3.24564459930314	0.0539739029651821	4.92492196787854	0.111370157819225	0.999926630797137	0.0981473102596725	0.569230769230769	116	111
TCGA-AG-4007-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	165	0	4	0	4	161	6601	4	5	4	13	1467	4	8	5	17	1690	3	9	48	60	1754	3	12	56	71	1690	3	5	3	11	215	0.0666666666666667	0.154929577464789	0.127218934911243	1.21781853914183	0.0511627906976744	1	2	3	6	214	0.0363636363636364	0.1	0.122006841505131	0.819626168224299	0.0280373831775701	0.0606060606060606	10	100	429	3015	0.88941835043204	0.702859445545757	0.36848779928913	Inf	0.729815638906548	5.35198135198135	0.00298246158698461	14.0358061386259	0.463152232383002	0.991730003757259	0.430358341580735	0.707985303535915	155	151
TCGA-AG-4008-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	77	0	1	1	2	74	3034	0	3	2	5	739	3	6	2	11	683	0	3	19	22	814	1	8	27	36	798	1	1	1	3	94	0.038961038961039	0.0833333333333333	0.117794486215539	0.707446808510638	0.0319148936170213	0	1	0	1	109	0.012987012987013	0.0454545454545455	0.133906633906634	0.339449541284404	0.00917431192660551	0.025974025974026	2	45	203	1409	0.985495035116152	0.308626764252734	0.0528708002688778	Inf	0.337910072319463	7.94088669950739	0.126472411655301	Inf	0.172627971728422	0.997820905846029	0.154331949988348	1	75	72
TCGA-AG-4015-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	97	0	0	1	1	95	3895	4	4	1	9	961	2	6	4	12	956	0	10	26	36	1012	2	5	31	38	966	0	1	4	5	129	0.0515463917525773	0.131578947368421	0.133540372670807	0.98531211750306	0.0387596899224806	0	3	2	5	141	0.0515463917525773	0.138888888888889	0.139328063241107	0.996847911741529	0.0354609929078014	0.0618556701030928	6	53	270	1708	0.831831786767575	0.716248022952755	0.297012221202784	Inf	0.745009416195857	0	1	0	0.771150097465887	0.80655676136357	0.744324809301847	0.0108359133126935	91	89
TCGA-AG-A002-01A-01W-A00K-09	0	0	0	0	12312	1	25	17	42	12255	502455	47	351	439	837	135838	53	315	474	842	137352	9	2538	2746	5293	114292	16	2518	2749	5283	114973	0	2013	204	2217	20328	0.180068226120858	0.419647927314026	0.176806728536265	2.37348392104858	0.109061393152302	0	2038	202	2240	20300	0.181936322287199	0.423200453429057	0.177615231162286	2.38268109474452	0.110344827586207	0.0329759584145549	406	5114	40628	188637	1	0.368606982833841	0.337793995240377	Inf	0.415048904303878	0	1	0	0.41693720687123	1	0.370417763853851	7.67023552891641e-127	11906	11849
TCGA-AG-A008-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	49	0	0	0	0	49	2009	1	1	0	2	500	1	3	2	6	477	3	1	17	21	514	0	3	17	20	518	0	0	1	1	72	0.0204081632653061	0.05	0.138996138996139	0.359722222222222	0.0138888888888889	2	1	2	5	79	0.102040816326531	0.238095238095238	0.153696498054475	1.54912597950573	0.0632911392405063	0.102040816326531	5	32	151	881	0.648200594436247	0.911737753034835	0.333408948996669	Inf	0.923572579201718	4.55629139072848	0.058839134399482	11.6222008959629	0.603038566419945	0.890952607433482	0.564874917593252	1	44	44
TCGA-AG-A00C-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	69	0	0	0	0	69	2829	1	1	1	3	688	1	4	3	8	724	4	10	21	35	705	3	8	12	23	712	0	2	0	2	95	0.0289855072463768	0.0869565217391304	0.133426966292135	0.651716247139588	0.0210526315789474	1	3	0	4	95	0.0579710144927536	0.114285714285714	0.134751773049645	0.84812030075188	0.0421052631578947	0.0144927536231884	1	39	190	1227	0.996664258744523	0.165696100024196	0.0082743315525203	Inf	0.186447368421053	1.06541353383459	0.63593726546675	1.07628093890234	0	1	0	1	68	68
TCGA-AG-A00H-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	75	0	0	0	0	74	3034	3	4	1	8	762	1	3	0	4	773	3	4	23	30	737	5	7	20	32	762	2	2	0	4	115	0.0533333333333333	0.125	0.150918635170604	0.828260869565217	0.0347826086956522	2	1	2	5	127	0.0666666666666667	0.166666666666667	0.172320217096336	0.967191601049869	0.0393700787401575	0.08	6	45	242	1257	0.850527610233941	0.692710245025032	0.284924693817179	Inf	0.728731161886242	3.09710743801653	0.0281931594133101	5.18576576299563	0.28810301748991	0.994925813579375	0.253517575343961	0.619909502262444	69	68
TCGA-AG-A00Y-01A-02W-A005-10	0	0	1	1	149	5	20	13	33	111	4551	4	11	2	17	1116	3	13	4	20	1087	4	6	30	40	1138	4	8	22	34	1210	0	2	3	5	166	0.0335570469798658	0.147058823529412	0.137190082644628	1.07193479801559	0.0301204819277108	1	1	11	13	166	0.087248322147651	0.325	0.145869947275923	2.22801204819277	0.0783132530120482	0.100671140939597	15	45	332	2016	0.0196371015188657	2.02339574043161	1.15155736752909	Inf	1.76807228915663	0.884036144578313	0.705073895194771	0.86753977305503	1.90407784986098	0.0125185617712838	2.23619220642664	2.0077937570804e-05	134	96
TCGA-AG-A011-01A-01W-A00K-09	0	0	0	0	111	0	0	0	0	111	4551	4	3	1	8	1071	9	5	3	17	1138	3	10	30	43	1174	3	12	28	43	1168	1	3	3	7	161	0.0630630630630631	0.162790697674419	0.137842465753425	1.18099089989889	0.0434782608695652	3	1	2	6	148	0.0540540540540541	0.13953488372093	0.126064735945486	1.1068510370836	0.0405405405405405	0.0810810810810811	9	55	309	2033	0.476301635173483	1.07659772275798	0.531368212099049	Inf	1.06583737864078	5.05285868392664	0.00372960476782158	13.1325706474566	0.653386898783618	0.894119396728624	0.620792848527303	1	102	102
TCGA-AG-A014-01A-02W-A00K-09	0	0	1	1	122	2	5	3	8	100	4100	1	8	1	10	990	1	6	2	9	1035	5	10	29	44	1021	7	5	25	37	1054	0	1	3	4	142	0.0327868852459016	0.108108108108108	0.134724857685009	0.802436239055957	0.028169014084507	1	3	3	7	140	0.0573770491803279	0.159090909090909	0.137120470127326	1.16022727272727	0.05	0.0573770491803279	7	59	282	1793	0.808588633749433	0.754448293886224	0.337549261	Inf	0.780410487857296	0.613179669030733	0.826856620434388	0.578139454353181	0.817572892040977	0.759383872639884	0.794849055758165	0.0634674922600621	115	93
TCGA-AG-A015-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	64	0	0	0	0	64	2624	2	3	2	7	709	2	3	4	9	665	2	5	17	24	615	2	10	12	24	635	1	2	0	3	95	0.046875	0.125	0.149606299212598	0.835526315789474	0.0315789473684211	1	2	1	4	109	0.0625	0.166666666666667	0.177235772357724	0.940366972477064	0.036697247706422	0.046875	3	30	204	1046	0.92179396382206	0.512963438483561	0.131653834559686	Inf	0.557040998217469	3.06372549019608	0.128356884779674	5.11753931610744	0.211291413116971	0.994068999096758	0.183260250863381	1	61	61
TCGA-AG-A016-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	57	0	0	0	0	57	2337	1	2	1	4	577	1	1	1	3	551	1	1	20	22	619	1	4	23	28	590	0	1	2	3	90	0.0526315789473684	0.107142857142857	0.152542372881356	0.702380952380952	0.0333333333333333	1	0	0	1	90	0.0175438596491228	0.0454545454545455	0.145395799676898	0.312626262626263	0.0111111111111111	0.0526315789473684	3	42	180	1029	0.971041905125348	0.40854585018853	0.10624817902621	Inf	0.447777777777778	3.35833333333333	0.27669230401758	5.70367805685392	0.312403100775194	0.991148065195521	0.279044878516805	1	54	54
TCGA-AG-A01L-01A-01W-A00K-09	0	0	0	0	74	0	1	0	1	72	2952	1	0	0	1	606	2	4	1	7	694	0	2	24	26	841	1	3	34	38	811	0	1	3	4	103	0.0540540540540541	0.105263157894737	0.127003699136868	0.828819621870209	0.0388349514563107	0	0	2	2	95	0.027027027027027	0.0769230769230769	0.112960760998811	0.680971659919028	0.0210526315789474	0.0675675675675676	5	54	198	1454	0.848587100037101	0.680081907330402	0.255589806251885	Inf	0.707070707070707	0	1	0	0.719261581330547	0.838069822912248	0.69290790092979	0.0151515151515152	69	67
TCGA-AG-A01W-01A-21W-A096-10	0	0	0	0	127	0	0	2	2	125	5125	1	4	6	11	1218	3	7	6	16	1281	5	9	31	45	1304	3	11	39	53	1322	1	1	3	5	173	0.0393700787401575	0.0943396226415094	0.130862329803328	0.72090740538772	0.0289017341040462	1	0	3	4	167	0.031496062992126	0.0888888888888889	0.128067484662577	0.694078509647372	0.0239520958083832	0.062992125984252	8	70	340	2286	0.805607505023731	0.768472061931825	0.366379549967294	Inf	0.792156862745098	1.93088235294118	0.278885084408864	2.24026917997276	0.662016806722689	0.902449278095902	0.630423534515386	0.153434800493624	119	117
TCGA-AG-A01Y-01A-41W-A096-10	0	0	0	0	92	0	1	2	3	89	3649	1	10	5	16	945	4	7	2	13	902	3	6	22	31	945	4	2	23	29	857	1	0	1	2	133	0.0217391304347826	0.0689655172413793	0.155192532088681	0.44438682914182	0.0150375939849624	0	1	2	3	142	0.0326086956521739	0.0967741935483871	0.15026455026455	0.644025442980463	0.0211267605633803	0.0434782608695652	4	48	275	1527	0.965613787618864	0.462878884360327	0.151269117749728	Inf	0.504055944055944	0.936103896103896	0.686804826548097	0.925475032516152	0.436848484848485	0.975288225159921	0.396765748402455	0.523809523809524	88	85
TCGA-AG-A020-01A-21W-A096-10	0	0	0	0	79	0	1	3	4	74	3034	1	5	3	9	743	2	2	3	7	699	1	6	19	26	767	2	6	24	32	825	0	0	0	0	101	0	0	0.122424242424242	0	0	0	3	2	5	110	0.0632911392405063	0.192307692307692	0.143415906127771	1.34090909090909	0.0454545454545455	0.0253164556962025	2	44	211	1381	0.987875152614071	0.297643767878914	0.0509883881066637	Inf	0.328044508551411	0	1	0	0.350931334729417	0.982632884100271	0.31941729858729	0.444444444444444	77	72
TCGA-AG-A025-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	94	0	1	3	4	87	3567	2	6	2	10	851	2	3	2	7	839	1	5	24	30	888	3	4	33	40	989	0	2	0	2	116	0.0212765957446809	0.05	0.117290192113246	0.426293103448276	0.0172413793103448	0	0	1	1	112	0.0106382978723404	0.0333333333333333	0.126126126126126	0.264285714285714	0.00892857142857143	0.0106382978723404	1	60	228	1649	0.999590283788385	0.120603840424867	0.00602872455671002	Inf	0.134958297382801	0	1	0	0.144429055093875	0.999322186230406	0.129217659961413	1	93	86
TCGA-AG-A026-01A-32W-A096-10	0	0	0	0	218	0	2	2	4	213	8733	7	17	5	29	2173	6	14	7	27	2121	18	14	48	80	2218	19	15	43	77	2221	6	1	4	11	312	0.0504587155963303	0.142857142857143	0.140477262494372	1.01694139194139	0.0352564102564103	9	3	5	17	310	0.0779816513761468	0.2125	0.139765554553652	1.52040322580645	0.0548387096774194	0.110091743119266	24	104	622	3817	0.0860286861104024	1.41602733617186	0.932826181275343	Inf	1.3381229903537	2.89323889806205	7.52762348767196e-05	4.18239107212018	0.705823115790961	0.904206793827041	0.67358771127432	0.176476338697089	194	189
TCGA-AG-A02G-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	51	0	1	1	2	47	1927	0	1	0	1	451	1	2	2	5	435	0	1	20	21	519	2	3	15	20	522	0	0	1	1	65	0.0196078431372549	0.05	0.124521072796935	0.401538461538462	0.0153846153846154	0	0	2	2	64	0.0392156862745098	0.0952380952380952	0.123314065510597	0.772321428571428	0.03125	0.0588235294117647	3	34	129	912	0.85231891310997	0.624035036205587	0.160379895748907	Inf	0.654305468258957	0	1	0	0.691694352159468	0.824972463287447	0.66301040821284	0.1	48	44
TCGA-AG-A02N-01A-11W-A096-10	0	0	0	0	1221	0	13	87	100	1121	45961	6	44	6	56	10157	11	37	8	56	10291	0	43	472	515	12782	3	44	447	494	12731	0	1	1	2	1454	0.00163800163800164	0.00404858299595142	0.114209410101327	0.0354487689968759	0.00137551581843191	0	2	1	3	1376	0.00245700245700246	0.0058252427184466	0.107651384759818	0.0541121020546399	0.00218023255813953	0.00163800163800164	2	920	2830	22683	1	0.0174334410097889	0.00306273851114094	Inf	0.0195557361090884	0	1	0	0.0196195742030245	1	0.0174904878682621	0.444444444444444	1219	1119
TCGA-AG-A02X-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	139	1	1	0	1	132	5412	1	6	2	9	1282	5	7	2	14	1343	4	11	45	60	1389	2	11	36	49	1398	0	2	4	6	206	0.0431654676258993	0.122448979591837	0.147353361945637	0.830988706162077	0.029126213592233	1	3	1	5	218	0.0359712230215827	0.0833333333333333	0.156947444204464	0.530963302752294	0.0229357798165138	0.0431654676258993	6	81	424	2363	0.993779671065217	0.412914547986958	0.174086141404825	Inf	0.453318152244632	1.09551886792453	0.628938956061492	1.11461362852092	0.405747728860936	0.996053597760246	0.366741249227239	0.148606811145511	133	126
TCGA-AG-A032-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	78	0	0	0	0	74	3034	1	2	2	5	722	0	5	1	6	710	4	5	18	27	787	1	13	22	36	815	0	1	1	2	102	0.0256410256410256	0.0555555555555556	0.125153374233129	0.443899782135076	0.0196078431372549	1	0	0	1	97	0.0128205128205128	0.037037037037037	0.123252858958069	0.300496372661321	0.0103092783505155	0.0256410256410256	2	43	199	1403	0.980429451386535	0.32806659910536	0.0561406618408928	Inf	0.357788944723618	1.61005025125628	0.485949033024713	1.76179637510664	0.201256281407035	0.99481712839616	0.180877942644711	1	76	72
TCGA-AG-A036-01A-12W-A096-10	0	0	0	0	150	0	0	1	1	148	6068	8	8	3	19	1456	5	12	4	21	1478	12	6	34	52	1507	7	10	39	56	1627	2	5	3	10	213	0.0666666666666667	0.178571428571429	0.130915795943454	1.3640174379611	0.0469483568075117	3	0	3	6	205	0.04	0.115384615384615	0.136031851360319	0.848217636022514	0.0292682926829268	0.0733333333333333	11	81	418	2716	0.696289951787326	0.882446962369442	0.47434283080238	Inf	0.896453089244851	1.97305464618484	0.0999242064587814	2.31987729725928	0.616241725109786	0.934721505880074	0.581957745458916	1	139	137
TCGA-AH-6544-01A-11D-1826-10	0	0	1	1	186	0	0	2	2	184	7544	5	17	6	28	1773	3	25	10	38	1905	0	18	40	58	1973	8	15	37	60	1893	2	2	3	7	274	0.0376344086021505	0.116666666666667	0.144743792921289	0.806021897810219	0.0255474452554745	0	3	4	7	271	0.0376344086021505	0.120689655172414	0.137354282818044	0.878674131568902	0.025830258302583	0.0483870967741935	9	76	545	3321	0.86182001491213	0.721661998807092	0.3619979802739	Inf	0.751084727468969	1.77339449541284	0.314897347493594	2.03076813548781	0.644870725604671	0.929313262878758	0.609423675628255	0.103188405797102	177	175
TCGA-AH-6547-01A-11D-1826-10	0	0	1	1	43	0	0	2	2	41	1681	0	14	1	15	452	0	13	0	13	482	0	4	2	6	348	0	2	5	7	399	0	0	1	1	74	0.0232558139534884	0.142857142857143	0.18546365914787	0.77027027027027	0.0135135135135135	0	1	0	1	67	0.0232558139534884	0.166666666666667	0.192528735632184	0.865671641791045	0.0149253731343284	0.0232558139534884	1	6	141	606	0.769412438860473	0.716600372585345	0.0314209939073685	Inf	0.756838905775076	NaN	1	0	0.756838905775076	0.769412438860473	0.716600372585345	1	42	40
TCGA-AH-6549-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	138	0	1	4	5	133	5453	3	17	3	23	1327	1	20	0	21	1359	1	15	27	43	1332	5	14	27	46	1435	3	1	2	6	233	0.0434782608695652	0.130434782608696	0.162369337979094	0.803321515208061	0.0257510729613734	0	1	2	3	197	0.0217391304347826	0.0697674418604651	0.147897897897898	0.471727068823043	0.0152284263959391	0.0507246376811594	7	53	430	2337	0.842284184388233	0.717891570697872	0.320810130129775	Inf	0.750736434108527	3.21744186046512	0.0523964252632669	5.42984233486594	0.476658053402239	0.975944942407709	0.434884514846105	1	131	126
TCGA-AH-6643-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	191	0	1	2	3	185	7585	0	25	7	32	1879	3	35	11	49	1908	5	8	41	54	1929	4	9	37	50	1869	0	5	1	6	268	0.031413612565445	0.12	0.143392188336009	0.836865671641791	0.0223880597014925	0	1	2	3	283	0.0157068062827225	0.0555555555555556	0.146708138932089	0.378680800942285	0.0106007067137809	0.0157068062827225	3	84	551	3247	0.999837066108147	0.210510343254701	0.0561364739673025	Inf	0.237686964140434	0	1	0	0.265112383079715	0.999468568945881	0.235769545280703	0.205882352941176	188	182
TCGA-AH-6644-01A-21D-1826-10	0	0	1	1	141	0	3	4	7	134	5494	2	26	2	30	1287	3	14	0	17	1334	1	6	30	37	1333	4	9	37	50	1540	1	1	2	4	213	0.0283687943262411	0.08	0.138311688311688	0.578403755868545	0.0187793427230047	0	1	1	2	183	0.0141843971631206	0.0540540540540541	0.13728432108027	0.393738000295377	0.0109289617486339	0.0283687943262411	4	68	396	2477	0.992193360833284	0.368030737479517	0.121800211118963	Inf	0.403058361391695	1.4510101010101	0.524184993998422	1.56347255486954	0.324853007688829	0.996505682591856	0.293284170454522	0.545454545454546	137	130
TCGA-AU-3779-01A-01D-1719-10	0	0	1	1	389	1	0	2	2	384	15744	13	75	2	90	3985	12	59	2	73	3861	2	33	70	105	3957	1	29	86	116	3941	0	9	3	12	586	0.0308483290488432	0.103448275862069	0.148693225069779	0.695716135106508	0.0204778156996587	0	10	8	18	618	0.0462724935732648	0.171428571428571	0.156178923426839	1.09764216366158	0.029126213592233	0.0282776349614396	11	148	1204	6694	0.999518057773714	0.413259672557833	0.226707752300954	Inf	0.453822687477799	0	1	0	0.462550046852372	0.999346509157843	0.421809296016903	0.000318805252564056	378	373
TCGA-AU-6004-01A-11D-1719-10	0	0	2	2	1432	3	45	201	246	1180	48380	19	135	9	163	11055	15	117	12	144	10977	6	81	343	430	13110	11	65	367	443	13238	0	7	8	15	1591	0.0104748603351955	0.0338600451467269	0.12018431787279	0.28173430399269	0.00942803268384664	3	13	11	27	1567	0.018854748603352	0.0627906976744186	0.11952707856598	0.525326130511569	0.017230376515635	0.0153631284916201	22	705	3158	23190	1	0.229158399995229	0.154037166820016	Inf	0.252478149857178	1.47233915732221	0.333973747434784	1.57351090310642	0.223270210241818	1	0.201919567327533	0.000119417613172744	1410	1158
TCGA-AY-4070-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	123	0	0	0	0	121	4961	5	2	7	14	1136	5	7	3	15	1164	11	15	28	54	1355	4	6	28	38	1306	0	2	1	3	156	0.024390243902439	0.0789473684210526	0.119448698315467	0.660931174089069	0.0192307692307692	0	2	1	3	178	0.024390243902439	0.0555555555555556	0.131365313653137	0.4229088639201	0.0168539325842697	0.016260162601626	2	69	334	2327	0.999112047877164	0.202010675784945	0.0350894521203723	Inf	0.224424390655309	0	1	0	0.284538066723695	0.99483832545388	0.258118061523197	0.454545454545454	121	119
TCGA-AY-4071-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	109	0	1	1	2	106	4346	5	9	2	16	1091	2	14	4	20	1116	5	3	24	32	1056	5	7	26	38	1083	2	1	0	3	138	0.0275229357798165	0.0789473684210526	0.127423822714681	0.619565217391304	0.0217391304347826	0	0	1	1	157	0.00917431192660551	0.03125	0.148674242424242	0.210191082802548	0.00636942675159236	0.0275229357798165	3	57	295	1844	0.991978144409746	0.329103545839406	0.0867520862232366	Inf	0.362542372881356	1.45016949152542	0.41187026365786	1.56232692466146	0.145016949152542	0.999359365136059	0.127627200048821	1	106	103
TCGA-AY-5543-01A-01D-1650-10	0	0	1	1	388	1	0	2	2	385	15785	2	97	3	102	3833	4	88	2	94	4068	5	22	69	96	3983	7	23	63	93	3901	2	5	2	9	584	0.0231958762886598	0.0967741935483871	0.149705203793899	0.646431727794962	0.0154109589041096	1	7	6	14	562	0.0360824742268041	0.145833333333333	0.141099673612855	1.03354833926453	0.0249110320284698	0.0283505154639175	11	133	1146	6738	0.995847568457975	0.4863173364898	0.266210912088787	Inf	0.525523560209424	1.71989528795812	0.248775409815332	1.95974332328171	0.41694431223227	0.99926031705126	0.379359118040755	0.165321742179371	377	374
TCGA-AY-6196-01A-11D-1719-10	0	0	1	1	520	3	2	5	7	505	20705	22	76	7	105	5055	24	73	7	104	5170	14	51	89	154	5183	15	48	79	142	5297	1	6	4	11	736	0.0211538461538462	0.0774647887323944	0.138946573532188	0.557514926515615	0.014945652173913	5	12	6	23	749	0.0442307692307692	0.149350649350649	0.144510901022574	1.03349054150122	0.0307076101468625	0.0307692307692308	16	181	1485	8995	0.996404784043614	0.535473605296357	0.328776168388429	Inf	0.573176776222462	1.46011842563567	0.221140403777095	1.58006313980928	0.420073753407087	0.999756182083807	0.38339296794836	0.391669866658516	504	489
TCGA-AY-6197-01A-11D-1719-10	0	0	1	1	1475	5	45	155	200	1267	51947	21	197	9	227	12203	21	203	15	239	12234	8	89	309	406	13695	7	83	305	395	13815	0	10	5	15	1790	0.0101694915254237	0.0379746835443038	0.129569308722403	0.293083940315395	0.00837988826815642	1	6	7	14	1712	0.00949152542372881	0.0344827586206897	0.125009127418766	0.275841927167258	0.00817757009345794	0.0088135593220339	13	616	3502	24008	1	0.144682983095644	0.0850598710050309	Inf	0.16235555608015	0.523700742432895	0.870286300822108	0.489689819291846	0.153527904947754	1	0.136659475714555	0.000996866028627427	1462	1254
TCGA-AY-6386-01A-21D-1719-10	1	0	1	2	462	0	4	11	15	447	18327	11	71	3	85	4354	13	81	2	96	4544	1	33	87	121	4686	0	44	101	145	4743	0	12	3	15	683	0.0324675324675325	0.103448275862069	0.144001686696184	0.718382390064119	0.0219619326500732	0	1	4	5	629	0.0108225108225108	0.0413223140495868	0.134229620145113	0.307847954906778	0.00794912559618442	0.0151515151515152	7	182	1312	8117	0.999999232954089	0.237972542663252	0.11005171429051	Inf	0.266175474254743	0	1	0	0.267591301245459	0.999999138187816	0.239287263937911	0.00831600831600831	455	440
TCGA-AZ-4315-01A-01D-1408-10	0	0	0	0	6205	22	25	8	33	6148	252068	14	361	330	705	66918	21	394	338	753	67507	10	662	1649	2321	58564	11	686	1672	2369	59079	1	553	114	668	9685	0.107655116841257	0.281975517095821	0.163933038812438	1.72006521161631	0.0689726381001549	0	543	129	672	9398	0.108299758259468	0.289530374838432	0.160474011338023	1.80421971398573	0.0715045754415833	0.0393231265108783	244	3098	19083	98560	1	0.4067815446281	0.363146747494739	Inf	0.450093583126255	0.293562208198272	0.97568360175285	0.258241645592095	0.451083393085149	1	0.40774672891589	1.07736925467216e-76	5961	5904
TCGA-AZ-4323-01A-21D-1835-10	0	0	0	0	80	0	0	1	1	79	3239	2	17	1	20	875	1	11	4	16	823	1	4	14	19	776	2	6	16	24	765	0	2	1	3	117	0.0375	0.125	0.152941176470588	0.817307692307692	0.0256410256410256	0	1	1	2	135	0.025	0.105263157894737	0.173969072164948	0.605068226120858	0.0148148148148148	0.025	2	31	252	1289	0.978873345476092	0.330163044546961	0.0559328740198807	Inf	0.370610870610871	0	1	0	0.407671957671958	0.966990699587906	0.36552700958038	0.444444444444444	78	77
TCGA-AZ-4616-01A-21D-1835-10	0	0	0	0	106	0	1	1	2	104	4264	0	16	3	19	991	2	14	5	21	1232	3	6	24	33	994	2	6	23	31	1047	0	2	2	4	201	0.0377358490566038	0.129032258064516	0.191977077363897	0.672123254694271	0.0199004975124378	0	0	1	1	130	0.00943396226415094	0.0303030303030303	0.130784708249497	0.231701631701632	0.00769230769230769	0.0283018867924528	3	49	331	1710	0.993530656391812	0.316411988574036	0.0830844983068057	Inf	0.355740181268882	0	1	0	0.39358488140387	0.987137352918415	0.352359945552076	0.166666666666667	103	101
TCGA-AZ-4681-01A-01D-1408-10	0	0	0	0	151	1	5	3	8	142	5822	1	25	4	30	1452	2	25	3	30	1466	3	2	26	31	1540	3	7	41	51	1364	1	2	2	5	209	0.033112582781457	0.0980392156862745	0.153225806451613	0.639834881320949	0.0239234449760766	1	0	1	2	221	0.0132450331125828	0.0645161290322581	0.143506493506493	0.449569405926142	0.00904977375565611	0.033112582781457	5	68	430	2474	0.987691337629775	0.423139187307896	0.161107091157945	Inf	0.4625676967187	2.25116279069767	0.219784800977628	2.87529500431032	0.302395001735508	0.998156651246501	0.269769586023439	1	146	137
TCGA-AZ-4682-01B-01D-1408-10	0	0	0	0	123	0	0	2	2	121	4961	3	24	3	30	1173	1	10	1	12	1212	2	4	29	35	1279	1	7	36	44	1297	1	1	2	4	185	0.032520325203252	0.0909090909090909	0.142636854279106	0.637346437346437	0.0216216216216216	2	1	2	5	172	0.040650406504065	0.142857142857143	0.134480062548866	1.06229235880399	0.0290697674418605	0.0569105691056911	7	61	357	2219	0.84723273195039	0.713357477996402	0.32016089693212	Inf	0.742791234140715	7.2156862745098	0.00270041991580118	Inf	0.444042232277526	0.984154890764289	0.407685413055681	1	116	114
TCGA-AZ-5403-01A-01D-1650-10	0	0	1	1	285	1	2	2	4	280	11480	4	84	3	91	2946	4	76	4	84	2948	4	6	37	47	2862	5	9	44	58	2724	0	4	1	5	439	0.0175438596491228	0.0862068965517241	0.161160058737151	0.534914774958762	0.0113895216400911	2	1	2	5	466	0.0175438596491228	0.106382978723404	0.16282320055905	0.653364989498676	0.0107296137339056	0.0175438596491228	5	85	905	4681	0.99939783161071	0.304298613135637	0.116837882927857	Inf	0.342909760589319	1.37163904235727	0.442086333742428	1.47770123987515	0.228606507059546	0.999910676184647	0.19896986624811	1	280	275
TCGA-AZ-5407-01A-01D-1719-10	0	0	1	1	390	4	2	2	4	379	15539	11	56	1	68	3907	14	46	3	63	3815	3	24	89	116	3805	1	39	92	132	4012	0	9	7	16	580	0.041025641025641	0.121212121212121	0.14456630109671	0.838453500522466	0.0275862068965517	0	7	5	12	577	0.0307692307692308	0.103448275862069	0.151642575558476	0.682184904081755	0.0207972270363951	0.0307692307692308	12	173	1157	6660	0.999837275468048	0.399310022480331	0.22581355395834	Inf	0.43824429442407	0	1	0	0.447929251206922	0.99975820132081	0.408760527406564	0.00010896369788381	378	367
TCGA-AZ-6598-01A-11D-1771-10	0	0	2	2	3004	13	99	497	596	2392	98072	30	235	21	286	21813	39	196	18	253	22292	16	157	760	933	27011	5	155	760	920	26956	1	11	19	31	3099	0.0103195739014647	0.033695652173913	0.114965128357323	0.293094546627944	0.0100032268473701	3	18	12	33	3081	0.0109853528628495	0.0353697749196141	0.114064640331717	0.310085358764589	0.0107108081791626	0.0116511318242344	35	1506	6180	47787	1	0.179709676812152	0.132262240814078	Inf	0.198337670028918	1.66333795654184	0.21426841921195	1.81939001596863	0.178097534491569	1	0.160988780055132	7.49609690005353e-08	2969	2357
TCGA-AZ-6599-01A-11D-1771-10	0	0	4	4	778	11	1	7	8	752	30832	14	91	4	109	7329	16	91	2	109	7553	0	95	154	249	7990	4	95	186	285	7960	0	12	33	45	1135	0.057840616966581	0.157894736842105	0.142587939698492	1.10734987247855	0.039647577092511	0	20	30	50	1096	0.06426735218509	0.200803212851406	0.137171464330413	1.46388473602439	0.0456204379562044	0.0809768637532134	63	281	2231	13719	0.0160271848687017	1.37862694346787	1.07756713500858	Inf	1.30931222832602	0	1	0	1.32471590160044	0.0126786041909356	1.3985330872171	2.44353157705486e-26	715	689
TCGA-AZ-6600-01A-11D-1771-10	0	1	2	3	457	1	4	2	6	446	18286	9	87	1	97	4461	11	87	2	100	4557	8	33	84	125	4590	6	37	81	124	4678	1	6	8	15	658	0.0328227571115974	0.120967741935484	0.14065840102608	0.860010785371115	0.0227963525835866	1	4	4	9	646	0.0196936542669584	0.072	0.140740740740741	0.511578947368421	0.0139318885448916	0.0306345733041575	14	165	1304	7964	0.996219813576235	0.51823092612385	0.30642560871764	Inf	0.555883058573534	1.01533742331288	0.606164205896343	1.01789327934733	0.516899051868377	0.997571363384449	0.479039496254098	0.00335136309358198	443	432
TCGA-AZ-6601-01A-11D-1771-10	0	0	2	2	2274	7	15	40	55	2212	90692	18	145	13	176	19893	20	147	16	183	20038	4	127	804	935	24997	9	151	758	918	25764	0	12	11	23	2919	0.0101143359718558	0.0250544662309368	0.113297624592455	0.221138495366172	0.0078794107571086	0	10	11	21	2745	0.00923482849604222	0.0224598930481283	0.10981317758131	0.204528213669969	0.00765027322404372	0.00967458223394899	22	1553	5664	45097	1	0.112793475662508	0.076119877425811	Inf	0.125184064209488	0	1	0	0.12622592902045	1	0.113745625609617	1.38814127000832e-08	2252	2190
TCGA-AZ-6603-01A-11D-1835-10	0	0	0	0	222	0	2	5	7	215	8815	2	50	3	55	2224	4	51	0	55	2280	3	11	48	62	2201	2	10	31	43	2110	0	3	1	4	341	0.018018018018018	0.0930232558139535	0.161611374407583	0.575598445065812	0.0117302052785924	0	0	4	4	323	0.018018018018018	0.0645161290322581	0.146751476601545	0.439628482972136	0.0123839009287926	0.0225225225225225	5	79	664	3647	0.997632314960321	0.347681211319678	0.133145756911422	Inf	0.386456540447504	0	1	0	0.410915815159372	0.995703967222092	0.371170601958871	0.0256410256410257	217	210
TCGA-AZ-6605-01A-11D-1835-10	0	0	0	0	193	0	0	4	4	188	7708	2	40	3	45	1938	1	31	1	33	2029	5	8	42	55	1841	4	10	41	55	1900	3	2	2	7	278	0.0362694300518135	0.127272727272727	0.146315789473684	0.869849574885546	0.0251798561151079	2	4	2	8	304	0.0414507772020725	0.145454545454545	0.165127648017382	0.880861244019139	0.0263157894736842	0.0466321243523316	9	83	582	3159	0.958557692176894	0.588631474521225	0.296169950733891	Inf	0.628809950694756	3.57101947308133	0.00672670421236969	6.77930867456685	0.309775183207055	0.999384647425319	0.274885826656722	1	184	179
TCGA-AZ-6606-01A-11D-1835-10	0	0	1	1	190	1	2	6	8	181	7421	2	31	0	33	1862	1	37	2	40	1839	4	7	36	47	1850	3	5	53	61	1870	2	0	4	6	257	0.0315789473684211	0.0983606557377049	0.137433155080214	0.715698156535051	0.0233463035019455	2	3	5	10	272	0.0526315789473684	0.212765957446809	0.147027027027027	1.44712140175219	0.0367647058823529	0.068421052631579	13	83	529	3191	0.619991554983208	0.944795583765722	0.535303148825269	Inf	0.95226843100189	4.01836348906292	0.0101154959238772	8.03525966568885	0.71111488710945	0.899681409529449	0.678676981799735	0.148883622704777	177	168
TCGA-AZ-6607-01A-11D-1835-10	0	0	0	0	142	0	0	0	0	142	5822	3	27	5	35	1477	4	35	0	39	1612	0	8	29	37	1391	0	5	26	31	1342	0	1	1	2	253	0.0140845070422535	0.0645161290322581	0.188524590163934	0.342215988779804	0.00790513833992095	0	2	4	6	213	0.0422535211267606	0.162162162162162	0.153127246585191	1.05900266463647	0.028169014084507	0.0352112676056338	5	50	466	2267	0.967941081382586	0.486584960375017	0.183454548021732	Inf	0.533164260632072	NaN	1	0	0.533164260632072	0.967941081382586	0.486584960375017	0.0256410256410257	137	137
TCGA-AZ-6608-01A-11D-1835-10	0	0	1	1	364	1	5	3	8	353	14473	27	67	5	99	3766	26	75	10	111	3722	7	15	51	73	3438	7	10	53	70	3547	2	4	2	8	555	0.021978021978022	0.114285714285714	0.156470256554835	0.73039897039897	0.0144144144144144	1	2	2	5	547	0.0137362637362637	0.0684931506849315	0.159104130308319	0.430492599734542	0.00914076782449726	0.0192307692307692	7	111	1102	5883	0.999667780795151	0.336694640115327	0.154378302275768	Inf	0.376011258420745	1.35824474980555	0.384518397375982	1.45585614671151	0.243787519195868	0.999973143562378	0.213566002855304	1	357	346
TCGA-CA-5254-01A-21D-1835-10	0	0	0	0	201	1	3	3	6	194	7954	6	19	4	29	1953	7	18	4	29	1897	7	11	41	59	2038	1	19	57	77	2066	0	1	2	3	289	0.0149253731343284	0.038961038961039	0.139883833494676	0.278524243922168	0.0103806228373702	3	3	3	9	279	0.0447761194029851	0.152542372881356	0.136898920510304	1.11427009294697	0.032258064516129	0.0398009950248756	8	98	568	3536	0.98374251421487	0.508258501754431	0.245467594872618	Inf	0.545309593409514	2.70950704225352	0.0871299229774071	3.73355133111775	0.368640413912044	0.99843455319078	0.33475467290003	0.666846143491722	193	186
TCGA-CA-5255-01A-11D-1835-10	0	0	0	0	77	2	1	1	2	73	2993	1	18	2	21	769	0	11	0	11	733	0	3	13	16	742	2	10	13	25	749	0	2	0	2	112	0.025974025974026	0.08	0.149532710280374	0.535	0.0178571428571429	0	1	1	2	108	0.025974025974026	0.125	0.1455525606469	0.858796296296296	0.0185185185185185	0.012987012987013	1	27	220	1271	0.988266479167255	0.214099744802615	0.0105754411408333	Inf	0.242045454545455	0	1	0	0.260664335664336	0.983928987990528	0.231224315882334	1	76	72
TCGA-CA-5796-01A-01D-1650-10	0	0	0	0	123	0	3	2	5	118	4838	1	24	0	25	1202	1	30	2	33	1266	1	3	22	26	1131	0	8	26	34	1239	0	1	0	1	183	0.00813008130081301	0.0294117647058824	0.147699757869249	0.199132111861138	0.00546448087431694	0	0	1	1	177	0.00813008130081301	0.0384615384615385	0.156498673740053	0.245762711864407	0.00564971751412429	0.00813008130081301	1	48	360	2010	0.999666510071242	0.116369339308721	0.00580275298969946	Inf	0.134353741496599	0	1	0	0.137152777777778	0.999608011594915	0.118845116000683	1	122	117
TCGA-CA-5797-01A-01D-1650-10	0	0	1	1	150	1	5	2	7	142	5822	2	44	0	46	1546	0	41	5	46	1554	2	6	21	29	1389	3	2	16	21	1333	0	1	3	4	218	0.0266666666666667	0.19047619047619	0.163540885221305	1.16470074268239	0.018348623853211	0	0	1	1	211	0.00666666666666667	0.0344827586206897	0.15190784737221	0.226997875469848	0.004739336492891	0.0266666666666667	4	38	429	2293	0.91419739703851	0.562729342851392	0.182632021170814	Inf	0.604284604284604	0	1	0	0.685944685944686	0.855298098025824	0.647967267598145	0.0476190476190476	146	138
TCGA-CA-6715-01A-21D-1835-10	0	0	1	1	172	0	1	7	8	164	6724	1	31	0	32	1709	6	31	0	37	1686	3	11	35	49	1671	4	10	32	46	1658	0	2	2	4	230	0.0232558139534884	0.0869565217391304	0.138721351025332	0.626843100189036	0.0173913043478261	1	1	0	2	266	0.0116279069767442	0.0408163265306122	0.159186116098145	0.256406321927267	0.0075187969924812	0.0174418604651163	3	71	496	2833	0.999317722901885	0.241400293175207	0.0641153723021182	Inf	0.272095684394072	0.958813364055299	0.677079079854165	0.951955533726877	0.200349061145883	0.999722630072062	0.175793641425861	1	169	161
TCGA-CA-6716-01A-11D-1835-10	0	0	0	0	283	1	8	1	9	272	11152	2	45	3	50	2810	0	42	5	47	2697	3	15	55	73	2814	5	18	79	102	2831	2	5	4	11	364	0.03886925795053	0.107843137254902	0.128576474743907	0.838747037276449	0.0302197802197802	0	4	3	7	413	0.0247349823321555	0.0958904109589041	0.146766169154229	0.653355003482703	0.0169491525423729	0.0318021201413428	9	133	777	4868	0.998261618651129	0.424000500309199	0.216052477762353	Inf	0.460465495676763	1.81628056628057	0.304125881681777	2.08804801863603	0.379521312357133	0.999565037089481	0.345364370551156	0.121205379714835	274	263
TCGA-CA-6717-01A-11D-1835-10	0	0	1	1	8268	34	13	2	15	8211	336651	56	646	770	1472	92625	65	645	795	1505	93293	20	1191	1382	2593	74929	16	1221	1404	2641	75804	1	943	141	1085	13679	0.131228834059023	0.410829231351761	0.18045221888027	2.27666489168718	0.0793186636450033	2	939	107	1048	13471	0.126753749395259	0.404165059776321	0.179783528406892	2.24806501105931	0.0777967485710044	0.0303580067731011	251	2571	27150	123583	1	0.444382357115042	0.397045102399396	Inf	0.493804702071203	0.462655003069368	0.9691186344096	0.413803903514854	0.494207210744594	1	0.44477999568594	8.47941361105025e-73	8017	7960
TCGA-CA-6718-01A-11D-1835-10	0	0	0	0	3081	5	8	3	11	3065	125665	15	194	259	468	35226	16	185	265	466	35309	10	522	509	1041	27646	10	550	530	1090	27484	2	484	49	535	5242	0.173644920480364	0.490825688073394	0.190729151506331	2.5734172474264	0.102060282334987	2	451	34	487	5078	0.158065563128854	0.467819404418828	0.183679374954786	2.54693486698758	0.0959038991729027	0.0282375851996105	87	972	10320	44810	1	0.388640236626705	0.319894601510595	Inf	0.438865647715045	1.06841085271318	0.531045770036405	1.08552939393043	0.426747356954734	1	0.376977438282386	6.24155201452489e-21	2994	2978
TCGA-CA-6719-01A-11D-1835-10	0	0	0	0	187	0	5	2	7	180	7380	0	28	1	29	1800	2	36	1	39	1922	0	13	42	55	1837	1	8	48	57	1821	0	3	2	5	281	0.0267379679144385	0.087719298245614	0.154310818231741	0.568458512830118	0.0177935943060498	0	3	4	7	272	0.0374331550802139	0.127272727272727	0.148067501360915	0.859558823529412	0.0257352941176471	0.0320855614973262	6	85	553	3105	0.995783395013923	0.396409864094184	0.167569142767348	Inf	0.436142519325159	0	1	0	0.440988547317661	0.995296128718962	0.401128392832563	0.0137299771167048	181	174
TCGA-CI-6619-01B-11D-1826-10	1	0	0	1	145	0	0	4	4	141	5781	3	31	3	37	1474	3	27	2	32	1533	5	7	21	33	1381	4	7	28	39	1393	1	1	0	2	222	0.0137931034482759	0.0512820512820513	0.159368269921034	0.321783321783322	0.00900900900900901	1	1	1	3	203	0.0206896551724138	0.0909090909090909	0.146994931209269	0.618450515002239	0.0147783251231527	0.0206896551724138	3	55	425	2349	0.995542142090796	0.301559286845353	0.079553519115038	Inf	0.337606490872211	1.45045751633987	0.412509323251637	1.57885350064223	0.133205282112845	0.999693563239158	0.115189395703216	1	142	138
TCGA-CI-6620-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	126	0	2	4	6	120	4920	2	27	0	29	1161	1	28	1	30	1247	3	0	21	24	1178	0	6	31	37	1334	0	1	2	3	194	0.0238095238095238	0.0810810810810811	0.145427286356822	0.557536918361661	0.0154639175257732	2	0	0	2	171	0.0158730158730159	0.0833333333333333	0.145161290322581	0.574074074074074	0.0116959064327485	0.0317460317460317	4	51	365	2147	0.966763240918584	0.461456937057537	0.151405394125478	Inf	0.50052303860523	4.58812785388128	0.0575618485503324	11.7448492495186	0.264699683877766	0.997057786345984	0.235367400263858	1	122	116
TCGA-CI-6621-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	117	0	1	1	2	114	4674	2	9	3	14	1131	2	11	1	14	1182	4	10	27	41	1126	4	9	32	45	1235	1	2	1	4	185	0.0341880341880342	0.0888888888888889	0.149797570850202	0.593393393393393	0.0216216216216216	1	1	1	3	156	0.0256410256410256	0.0731707317073171	0.13854351687389	0.528142589118199	0.0192307692307692	0.0341880341880342	4	63	341	2020	0.990647444929587	0.376217592426122	0.12414769382131	Inf	0.413358427802337	1.73093841642229	0.326297302830718	1.9739542670859	0.234703514091158	0.998813283328735	0.207928974144698	1	113	110
TCGA-CI-6622-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	175	0	3	2	5	170	6970	0	24	2	26	1751	4	21	1	26	1750	4	15	34	53	1753	2	12	51	65	1716	1	1	3	5	255	0.0285714285714286	0.0769230769230769	0.148601398601399	0.517647058823529	0.0196078431372549	1	5	1	7	250	0.04	0.132075471698113	0.142612664004564	0.92611320754717	0.028	0.0342857142857143	6	85	505	2964	0.993766185211254	0.414377539587089	0.175086713551927	Inf	0.452921336089653	2.28976897689769	0.213832136443327	2.93338096322543	0.32326150262085	0.998973123527889	0.289907162495759	0.64040536122916	169	164
TCGA-CI-6624-01C-11D-1826-10	0	0	1	1	304	1	3	2	5	296	12136	11	34	11	56	3064	18	44	15	77	3203	21	21	38	80	2935	14	26	43	83	2934	7	2	6	15	454	0.0493421052631579	0.180722891566265	0.154737559645535	1.16793163844807	0.0330396475770925	6	4	5	15	421	0.0493421052631579	0.1875	0.143441226575809	1.30715558194774	0.0356294536817102	0.0789473684210526	24	92	875	4994	0.0597443752335574	1.48877801829653	0.978139433431172	Inf	1.38774384236453	2.4913306122449	0.00108545982243474	3.37158398540877	0.910885361552028	0.678104630176258	0.896924180376571	0.792494242590731	280	272
TCGA-CK-4947-01B-11D-1650-10	0	0	1	1	239	1	3	4	7	231	9471	4	62	1	67	2346	4	53	2	59	2485	1	10	35	46	2338	5	9	45	59	2302	2	2	1	5	369	0.0209205020920502	0.0847457627118644	0.160295395308427	0.528684947866428	0.013550135501355	0	1	2	3	333	0.0125523012552301	0.0652173913043478	0.142429426860565	0.45789267528398	0.00900900900900901	0.0209205020920502	5	81	702	3938	0.997745951000996	0.346329376359127	0.132734488495941	Inf	0.384284105214338	2.20322886989554	0.227049248006545	2.80409637345436	0.247863247863248	0.999752101474311	0.218600438998357	1	234	226
TCGA-CK-4948-01B-11D-1650-10	0	0	1	1	259	1	5	2	7	250	10250	3	57	3	63	2697	2	49	2	53	2514	6	15	46	67	2451	3	17	47	67	2588	0	3	2	5	351	0.0193050193050193	0.0746268656716418	0.135625965996909	0.550240251732789	0.0142450142450142	3	4	3	10	385	0.0386100386100386	0.149253731343284	0.157078743370053	0.950184144213995	0.025974025974026	0.0308880308880309	8	94	736	4303	0.986330020619294	0.497627049673658	0.240299704954423	Inf	0.536977834612106	2.28215579710145	0.133059901455983	2.92236583109213	0.368089644693782	0.998534668389546	0.332233099076633	0.681659170414793	251	242
TCGA-CK-4950-01A-01D-1719-10	0	0	1	1	450	1	5	2	7	439	17999	6	70	2	78	4375	11	68	10	89	4510	10	39	93	142	4597	11	40	79	130	4517	2	10	8	20	650	0.0444444444444444	0.153846153846154	0.14390081912774	1.0691124260355	0.0307692307692308	0	3	6	9	652	0.02	0.0633802816901408	0.141831629323472	0.446869869523892	0.0138036809815951	0.0355555555555556	16	177	1302	7812	0.99566003121063	0.542403746060078	0.332731822042644	Inf	0.580310880829015	0.666666666666667	0.823237036427678	0.631606888253327	0.569767441860465	0.994714507568859	0.53167655059865	0.000845568965218306	434	423
TCGA-CK-4952-01A-01D-1719-10	0	0	4	4	659	7	2	5	7	642	26322	20	119	4	143	6271	16	112	4	132	6245	4	47	145	196	6862	3	40	128	171	6944	1	7	17	25	950	0.0379362670713202	0.146198830409357	0.136808755760369	1.06863650353955	0.0263157894736842	0	8	5	13	912	0.0197268588770865	0.0663265306122449	0.132905858350335	0.499048961689939	0.0142543859649123	0.0349013657056146	23	257	1862	11944	0.997531397895783	0.574089977078461	0.385277053281734	Inf	0.609057081479208	1.05922970692036	0.637376216329759	1.06911512789834	0.597514193647384	0.997914997132628	0.562256748172502	1.00883426309219e-07	636	619
TCGA-CK-5912-01A-11D-1650-10	0	0	2	2	172	1	3	2	5	165	6765	1	47	0	48	1704	3	39	0	42	1807	5	7	18	30	1554	3	5	37	45	1700	1	1	0	2	278	0.0116279069767442	0.0444444444444444	0.163529411764706	0.271782573940847	0.00719424460431655	0	0	2	2	211	0.0116279069767442	0.0666666666666667	0.135778635778636	0.490995260663507	0.00947867298578199	0.0174418604651163	3	60	489	2765	0.997300689014672	0.282788485499099	0.0748168277307647	Inf	0.316876034667446	0.831799591002045	0.728472332342053	0.807820344298879	0.241978062836959	0.998550265302302	0.213431403506607	1	169	162
TCGA-CK-5913-01A-11D-1650-10	0	0	0	0	984	4	45	145	190	790	32390	12	101	2	115	7415	8	97	6	111	7515	5	57	235	297	8692	2	55	210	267	8768	0	5	3	8	1071	0.00813008130081301	0.0299625468164794	0.122148722627737	0.245295621369646	0.00746965452847806	0	5	3	8	1056	0.00813008130081301	0.0269360269360269	0.121491026231017	0.221712070196919	0.00757575757575758	0.00609756097560976	6	446	2127	15333	1	0.0969842382461568	0.0419758012811579	Inf	0.108965637754784	0	1	0	0.110679703966657	1	0.0985306727326483	0.0176739587195649	978	784
TCGA-CK-5914-01A-11D-1650-10	0	0	2	2	279	1	2	5	7	270	11070	4	64	2	70	2880	5	60	2	67	2774	5	13	47	65	2729	2	13	53	68	2687	1	3	2	6	415	0.021505376344086	0.0882352941176471	0.154447339039821	0.571296952515946	0.0144578313253012	3	1	2	6	401	0.021505376344086	0.0923076923076923	0.146940271161598	0.628198733934395	0.0149625935162095	0.028673835125448	8	99	816	4600	0.993886821372815	0.455587962040396	0.220377557281559	Inf	0.496243357155946	3.79271708683473	0.0124000552534942	7.51191388800405	0.265490196078431	0.999904759741903	0.234922510852689	1	271	262
TCGA-CK-5915-01A-11D-1650-10	0	0	2	2	272	3	7	4	11	258	10578	1	73	1	75	2645	5	60	2	67	2623	1	10	39	50	2587	1	7	58	66	2723	0	3	1	4	415	0.0147058823529412	0.0606060606060606	0.152405435181785	0.397663380795911	0.00963855421686747	0	1	1	2	395	0.00735294117647059	0.04	0.152686509470429	0.261974683544304	0.00506329113924051	0.00735294117647059	2	97	810	4500	0.999998369208435	0.114569520717753	0.0200426286128415	Inf	0.132435465768799	0	1	0	0.135166093928981	0.999997785332838	0.11698143812514	0.454545454545454	270	256
TCGA-CK-5916-01A-11D-1650-10	0	0	1	1	915	1	63	271	334	580	23780	5	81	9	95	5856	6	56	2	64	5571	3	26	181	210	6150	3	32	176	211	6203	1	5	2	8	776	0.0087431693989071	0.037914691943128	0.125100757697888	0.303073239849514	0.0103092783505155	0	3	4	7	820	0.00765027322404372	0.0333333333333333	0.133333333333333	0.25	0.00853658536585366	0.00765027322404372	7	356	1596	10757	0.99999999999999	0.132537990236205	0.061692404845737	Inf	0.149255715045189	1.28999582289056	0.564107205136186	1.34795565943903	0.130083612392325	0.999999999999998	0.115222502867436	0.0800766283524905	908	573
TCGA-CK-6746-01A-11D-1835-10	0	0	1	1	1400	7	43	245	288	1105	45305	7	136	12	155	10617	14	141	18	173	10482	6	65	307	378	11988	12	68	319	399	12218	1	4	4	9	1519	0.00642857142857143	0.0225563909774436	0.1243247667376	0.181431194840294	0.00592495062541146	1	8	8	17	1451	0.0121428571428571	0.044973544973545	0.121037704371038	0.371566407403761	0.0117160578911096	0.01	14	630	2970	21236	1	0.158898704369006	0.0954554473962094	Inf	0.177177572829747	0.905574261129817	0.666699611491076	0.893757531520483	0.156233259108658	1	0.13974820018813	0.00386533730326349	1386	1091
TCGA-CK-6747-01A-11D-1835-10	0	0	1	1	260	2	2	62	64	194	7954	1	34	1	36	1992	2	28	1	31	1934	2	10	44	56	1970	2	12	57	71	2058	0	2	6	8	309	0.0307692307692308	0.112676056338028	0.150145772594752	0.750444414057159	0.0258899676375405	0	1	0	1	275	0.00384615384615385	0.0178571428571429	0.139593908629442	0.127922077922078	0.00363636363636364	0.0230769230769231	6	99	584	3444	0.998541466626285	0.357470527391665	0.151677566676567	Inf	0.39412915851272	0	1	0	0.409738234097382	0.997752808379606	0.372520196574265	0.0090497737556561	254	188
TCGA-CK-6748-01A-11D-1835-10	0	0	1	1	130	0	1	4	5	125	5125	1	22	0	23	1301	2	27	3	32	1354	1	12	23	36	1262	2	8	24	34	1208	0	1	1	2	180	0.0153846153846154	0.0588235294117647	0.149006622516556	0.394771241830065	0.0111111111111111	0	2	0	2	187	0.0153846153846154	0.0555555555555556	0.148177496038035	0.374925727866904	0.0106951871657754	0.00769230769230769	1	49	367	2103	0.999656866396411	0.116991716646756	0.00583667192912772	Inf	0.134604904632153	0	1	0	0.143196707055481	0.999448904901978	0.124621098572586	1	129	124
TCGA-CK-6751-01A-11D-1835-10	0	0	0	0	283	0	2	5	7	274	11234	2	37	2	41	2790	3	44	1	48	2694	1	4	88	93	2891	2	11	79	92	2859	1	2	5	8	363	0.0282685512367491	0.0869565217391304	0.126967471143757	0.684872439813151	0.0220385674931129	0	2	4	6	397	0.0212014134275618	0.0645161290322581	0.13732272570045	0.469813927033396	0.0151133501259446	0.0353356890459364	10	160	760	4990	0.999317669202491	0.410405506321832	0.217958323694622	Inf	0.445046439628483	2.5219298245614	0.346709905637149	3.28192285163095	0.407737157264419	0.999683368943384	0.374043433786919	0.00442410373760488	273	264
TCGA-CL-5917-01A-11D-1657-10	0	0	1	1	205	0	1	5	6	199	8159	7	45	4	56	1893	1	44	1	46	1956	4	3	36	43	2176	3	10	41	54	2134	1	2	2	5	276	0.024390243902439	0.0925925925925926	0.12933458294283	0.715915190552872	0.0181159420289855	0	0	3	3	268	0.0146341463414634	0.0697674418604651	0.123161764705882	0.566469975702881	0.0111940298507463	0.0292682926829268	6	78	544	3766	0.96135466476981	0.532584429883246	0.22464728343126	Inf	0.565913865546218	1.13182773109244	0.611472399934286	1.15374184978362	0.514467150496562	0.972166973937546	0.480812111696725	0.118881118881119	199	193
TCGA-CL-5918-01A-11D-1657-10	0	0	0	0	228	2	0	2	2	224	9184	5	35	3	43	1944	3	40	8	51	2110	7	12	41	60	2540	4	8	58	70	2590	0	2	0	2	280	0.0087719298245614	0.0285714285714286	0.108108108108108	0.264285714285714	0.00714285714285714	0	1	1	2	269	0.0087719298245614	0.0333333333333333	0.105905511811024	0.314745972738538	0.00743494423791822	0.0043859649122807	1	109	549	4581	0.999995600239979	0.0765681241560648	0.00385748199593674	Inf	0.0849478390461997	0	1	0	0.0943864878291108	0.999985082116733	0.0851623299850121	1	227	223
TCGA-CM-4743-01A-01D-1719-10	0	0	1	1	1497	2	39	218	257	1235	50635	9	174	17	200	11804	18	143	13	174	11413	8	87	340	435	13672	5	99	322	426	13746	0	8	7	15	1614	0.0100200400801603	0.0352112676056338	0.117415975556526	0.299884810723074	0.00929368029739777	2	7	12	21	1665	0.0140280561122244	0.0482758620689655	0.121781743709772	0.396412964688827	0.0126126126126126	0.0140280561122244	21	654	3279	24139	1	0.236391759586752	0.157250591790324	Inf	0.260141642099556	1.28641471367912	0.472004443035899	1.33847094051073	0.239988243412948	1	0.217537351094436	1.47149641729541e-05	1476	1214
TCGA-CM-4744-01A-01D-1408-10	0	0	0	0	197	0	5	6	11	185	7585	0	25	4	29	1806	6	30	3	39	1905	3	14	39	56	1974	0	14	47	61	1900	0	3	2	5	275	0.0253807106598985	0.0819672131147541	0.144736842105263	0.566318926974665	0.0181818181818182	0	2	1	3	254	0.0152284263959391	0.0535714285714286	0.128672745694022	0.416338582677165	0.0118110236220472	0.0152284263959391	3	86	529	3345	0.999738160379962	0.220627661903552	0.0588182095461682	Inf	0.246851171385485	0	1	0	0.255462258759397	0.999621461726445	0.228601557473276	0.2	194	182
TCGA-CM-4746-01A-01D-1408-10	0	0	0	0	847	1	28	92	120	724	29684	4	30	5	39	6549	2	48	4	54	6478	4	29	252	285	8193	3	33	310	346	8464	0	2	3	5	936	0.00590318772136954	0.0144508670520231	0.110586011342155	0.130675361889235	0.00534188034188034	1	7	4	12	924	0.0141676505312869	0.0421052631578947	0.112779201757598	0.373342447026658	0.012987012987013	0.00944510035419126	8	561	1860	14797	1	0.113452309387495	0.0561188510193443	Inf	0.12591038796606	1.27933947772657	0.563559995864196	1.32586763086183	0.111543833467264	1	0.100344071831506	0.0390969389857042	839	716
TCGA-CM-4747-01A-01D-1408-10	0	0	1	1	118	0	0	4	4	114	4674	0	19	2	21	1167	1	17	2	20	1073	1	3	32	36	1201	1	4	32	37	1233	1	2	4	7	178	0.0593220338983051	0.189189189189189	0.144363341443633	1.31050713634983	0.0393258426966292	0	1	0	1	163	0.00847457627118644	0.0277777777777778	0.135720233139051	0.2046693933197	0.00613496932515337	0.0423728813559322	5	61	341	2093	0.962283363890345	0.503211806162866	0.190737226951132	Inf	0.540744690304808	3.56891495601173	0.261127239255116	6.13033015063676	0.446114369501466	0.983677545699202	0.409293989519087	0.282051282051282	113	109
TCGA-CM-4752-01A-01D-1408-10	0	0	0	0	399	3	2	2	4	391	16031	14	52	2	68	3757	13	35	1	49	3826	2	26	119	147	4200	2	19	106	127	4248	0	5	2	7	523	0.0175438596491228	0.0551181102362205	0.123116760828625	0.447689736679665	0.0133843212237094	0	8	2	10	538	0.025062656641604	0.0680272108843537	0.128095238095238	0.531067445565587	0.0185873605947955	0.0100250626566416	4	225	1061	7387	0.999999999599946	0.123788558306618	0.0418571601632985	Inf	0.139079471043631	0	1	0	0.141551994973296	0.999999999358321	0.126029032427071	0.102639296187683	395	387
TCGA-CM-5341-01A-01D-1408-10	0	0	0	0	168	1	0	1	1	166	6806	4	23	3	30	1591	4	22	1	27	1647	11	6	36	53	1813	3	4	49	56	1755	1	0	5	6	235	0.0357142857142857	0.107142857142857	0.133903133903134	0.800151975683891	0.025531914893617	3	0	0	3	216	0.0178571428571429	0.0566037735849057	0.119139547710976	0.475104821802935	0.0138888888888889	0.0535714285714286	9	90	451	3117	0.890128783655133	0.691192592912657	0.348155518638128	Inf	0.719209836726466	2.26037377256889	0.0911469189675028	2.76341402618976	0.465371070823008	0.986333120702442	0.432028942882718	1	159	157
TCGA-CM-5344-01A-21D-1719-10	0	0	1	1	323	2	1	5	6	315	12915	10	62	0	72	3250	10	67	1	78	3118	1	21	47	69	3213	6	35	55	96	3334	0	4	1	5	447	0.0154798761609907	0.0520833333333333	0.134073185362927	0.388469425801641	0.0111856823266219	0	4	4	8	470	0.0247678018575851	0.115942028985507	0.146280734516029	0.792599444958372	0.0170212765957447	0.0154798761609907	5	104	917	5630	0.99961541253378	0.295206894344509	0.113833048258873	Inf	0.327503926845617	0	1	0	0.349979686531101	0.999150131771421	0.316509168920768	0.0391304347826087	318	310
TCGA-CM-5348-01A-21D-1719-10	0	0	1	1	487	1	1	5	6	476	19516	8	71	3	82	4695	8	82	4	94	4856	11	66	66	143	4987	5	66	86	157	4978	2	5	9	16	728	0.0328542094455852	0.101910828025478	0.146243471273604	0.696857282844544	0.021978021978022	3	3	4	10	680	0.0205338809034908	0.0699300699300699	0.136354521756567	0.512854792266557	0.0147058823529412	0.0369609856262834	18	150	1408	8557	0.919519780848834	0.72931087763026	0.45894345428017	Inf	0.758294439935065	2.21169211647727	0.0642002815191244	2.76207127920493	0.605305210825359	0.98601841728812	0.5684189141976	0.0398590019038723	469	458
TCGA-CM-5349-01A-21D-1719-10	0	0	4	4	449	1	3	7	10	437	17917	9	97	3	109	4276	11	95	2	108	4543	1	31	74	106	4520	2	29	83	114	4578	1	6	5	12	708	0.0267260579064588	0.105263157894737	0.154652686762779	0.68064228367529	0.0169491525423729	0	6	10	16	615	0.0356347438752784	0.150943396226415	0.136061946902655	1.10937260315999	0.0260162601626016	0.0356347438752784	16	144	1323	7775	0.963745907007177	0.653004598812433	0.398894700798304	Inf	0.687679516250945	2.29226505416982	0.376057488308498	2.93790991862685	0.657018646099629	0.974899681229439	0.620816951665218	5.18045322791073e-05	433	421
TCGA-CM-5860-01A-01D-1650-10	0	0	2	2	388	2	0	0	0	386	15826	3	89	0	92	3952	5	78	1	84	4051	3	22	73	98	3840	2	35	75	112	3983	0	5	6	11	572	0.0283505154639175	0.0982142857142857	0.143610343961838	0.683894230769231	0.0192307692307692	1	4	6	11	603	0.0283505154639175	0.112244897959184	0.15703125	0.714793380038583	0.0182421227197347	0.0335051546391753	13	140	1175	6648	0.994005794185452	0.525410441401408	0.30311717585826	Inf	0.565701571408705	1.33157446808511	0.556994625532283	1.41439443683698	0.53982748706153	0.995751434647224	0.499260921728838	0.000567214974475328	375	373
TCGA-CM-5861-01A-01D-1650-10	0	0	1	1	1670	4	54	197	251	1415	58015	13	239	22	274	13421	17	218	28	263	13569	5	76	332	413	15526	16	92	357	465	15499	2	5	10	17	1883	0.0101796407185629	0.0365591397849462	0.121491709142525	0.300918803784855	0.00902814657461498	0	7	11	18	1928	0.0107784431137725	0.0435835351089588	0.124178796856885	0.350974048807933	0.00933609958506224	0.0137724550898204	23	687	3811	27214	1	0.23907594606092	0.162224509566821	Inf	0.263719551631489	0.775324561732329	0.74867156950491	0.751680934180563	0.248126365547139	1	0.224495643205293	1.59954845965831e-06	1647	1392
TCGA-CM-5862-01A-01D-1650-10	0	0	0	0	276	1	3	8	11	264	10824	1	93	2	96	2774	1	71	2	74	2646	1	9	34	44	2829	4	7	39	50	2575	2	1	3	6	382	0.0217391304347826	0.12	0.148349514563107	0.808900523560209	0.0157068062827225	1	1	4	6	451	0.0217391304347826	0.136363636363636	0.159420289855072	0.855371900826446	0.0133037694013304	0.036231884057971	10	68	833	4571	0.780826503296151	0.806999704437458	0.41931999217083	Inf	0.831717302305538	3.89243697478992	0.0288247548808302	8.22622570661976	0.622078968573731	0.945370881535608	0.582046464198558	0.213756898640463	266	254
TCGA-CM-5863-01A-21D-1835-10	0	0	0	0	106	0	0	3	3	103	4223	0	16	3	19	986	1	13	0	14	1094	1	7	25	33	1043	1	6	30	37	1100	0	2	3	5	160	0.0471698113207547	0.135135135135135	0.145454545454545	0.929054054054054	0.03125	0	1	1	2	129	0.0188679245283019	0.0606060606060606	0.123681687440077	0.490016443504816	0.0155038759689922	0.0377358490566038	4	53	289	1854	0.957455699355024	0.484293276794273	0.158888741475207	Inf	0.520366660596127	0	1	0	0.539289084617804	0.948516741522263	0.503279969062465	0.06993006993007	102	99
TCGA-CM-5864-01A-01D-1650-10	0	0	0	0	371	1	0	4	4	364	14924	8	85	10	103	3583	4	58	8	70	3757	9	19	62	90	3823	11	33	57	101	3761	1	4	7	12	518	0.032345013477089	0.118811881188119	0.137729327306567	0.862647654726863	0.0231660231660232	0	2	4	6	532	0.0161725067385445	0.0666666666666667	0.139157729531781	0.479072681704261	0.0112781954887218	0.032345013477089	12	127	1050	6534	0.976554307078429	0.588021485360088	0.33039500073615	Inf	0.623556012332991	0.361142857142857	0.949158595759898	0.327550323442252	0.66765906362545	0.949312565463314	0.633842613212468	0.000944965305365749	359	352
TCGA-CM-5868-01A-01D-1650-10	0	0	1	1	336	1	3	4	7	327	13407	3	101	5	109	3242	6	95	2	103	3426	3	11	45	59	3365	0	10	46	56	3374	0	3	7	10	518	0.0297619047619048	0.178571428571429	0.153526970954357	1.16312741312741	0.0193050193050193	1	2	3	6	465	0.0178571428571429	0.101694915254237	0.138187221396731	0.735921268452706	0.0129032258064516	0.0327380952380952	11	83	983	5756	0.824262412083912	0.776062897237993	0.419329025731355	Inf	0.802244540161468	2.28518141742964	0.377103768519007	2.9271193310897	0.75335651124054	0.870463645003648	0.722938229247299	0.00205381180377553	325	316
TCGA-CM-6161-01A-11D-1650-10	0	0	2	2	316	1	4	3	7	307	12587	5	87	2	94	3271	1	74	1	76	3144	2	25	38	65	3091	1	11	60	72	3081	0	1	5	6	463	0.0189873417721519	0.0833333333333333	0.1502758844531	0.554535637149028	0.0129589632829374	1	4	2	7	471	0.0221518987341772	0.107692307692308	0.152377871239081	0.706745059611302	0.0148619957537155	0.0253164556962025	8	93	934	5238	0.989552213813574	0.482466571599531	0.233116207837868	Inf	0.52341679564102	2.20271234832263	0.388994224403963	2.80353645799971	0.472009788926277	0.994510737108607	0.431436246892515	0.0302059496567506	308	299
TCGA-CM-6162-01A-11D-1650-10	0	0	0	0	1263	3	33	97	130	1130	46330	3	63	3	69	10280	2	70	5	77	10504	5	36	472	513	12775	2	31	438	471	12771	1	5	4	10	1501	0.00791765637371338	0.0212314225053079	0.117531908229583	0.18064390194223	0.00666222518321119	0	5	4	9	1486	0.00712589073634204	0.0175438596491228	0.116320939334638	0.150822884937782	0.00605652759084791	0.00712589073634204	9	908	2987	22559	1	0.0748615540956452	0.0389025439891484	Inf	0.083938433320105	1.22177052943708	0.581296269520631	1.25871899368803	0.0751858787345898	1	0.0669862717638742	0.0187524768169929	1254	1121
TCGA-CM-6163-01A-11D-1650-10	0	0	0	0	226	2	1	3	4	220	9020	1	57	2	60	2159	1	55	0	56	2312	6	12	33	51	2283	2	9	42	53	2266	1	3	3	7	328	0.0309734513274336	0.132075471698113	0.144748455428067	0.912448228255867	0.0213414634146341	3	2	1	6	306	0.0265486725663717	0.117647058823529	0.134034165571616	0.877739331026528	0.0196078431372549	0.0353982300884956	8	75	634	3915	0.905751424288382	0.658727462612971	0.31592579959399	Inf	0.691573866443693	3.58753943217666	0.0166974183283946	6.17102745580552	0.38267087276551	0.994994010743109	0.347945426729254	1	218	212
TCGA-CM-6164-01A-11D-1650-10	0	0	1	1	245	1	0	1	1	243	9963	3	58	1	62	2716	6	81	0	87	2656	2	10	24	36	2299	0	18	40	58	2292	0	6	3	9	401	0.036734693877551	0.155172413793103	0.174956369982548	0.886920629460831	0.0224438902743142	1	2	2	5	422	0.0204081632653061	0.138888888888889	0.183558068725533	0.756648235913639	0.0118483412322275	0.0244897959183673	6	60	823	3768	0.985085061805316	0.457902775961171	0.191826381753273	Inf	0.50712471004087	2.78918590522479	0.326653345380146	4.57622135452838	0.435810297691373	0.993359438117356	0.388051580713135	0.164734299516908	239	237
TCGA-CM-6165-01A-11D-1650-10	0	0	0	0	180	0	5	4	9	170	6970	1	46	0	47	1730	2	24	0	26	1748	4	22	26	52	1785	0	14	31	45	1707	0	3	1	4	266	0.0222222222222222	0.0888888888888889	0.155828939660223	0.570426065162907	0.0150375939849624	2	1	3	6	275	0.0333333333333333	0.115384615384615	0.15406162464986	0.748951048951049	0.0218181818181818	0.0333333333333333	6	55	541	2951	0.925451869756378	0.595134914135685	0.248214542524512	Inf	0.634889851822672	3.22735674676525	0.116414676775679	5.45069634556785	0.452962350423193	0.982847873808635	0.4117500921682	0.628482972136223	174	164
TCGA-CM-6166-01A-11D-1650-10	0	0	1	1	193	1	5	3	8	184	7544	0	39	2	41	1841	3	47	1	51	1886	0	10	32	42	1948	5	14	31	50	1869	3	2	2	7	286	0.0362694300518135	0.14	0.153023006955591	0.914895104895105	0.0244755244755245	0	3	1	4	290	0.0207253886010363	0.0952380952380952	0.148870636550308	0.639737274220033	0.0137931034482759	0.0310880829015544	6	62	576	3241	0.9544229752092	0.544594379528801	0.228166446105632	Inf	0.584712009803922	3.97604166666667	0.0272547286195351	8.43233402788118	0.315558862433862	0.997418479073871	0.281395194164473	1	187	178
TCGA-CM-6167-01A-11D-1650-10	1	0	1	2	184	1	2	4	6	177	7257	3	51	0	54	1872	3	41	0	44	1947	2	12	20	34	1688	1	10	34	45	1750	0	1	2	3	279	0.016304347826087	0.0666666666666667	0.159428571428571	0.41816009557945	0.010752688172043	0	4	1	5	285	0.0271739130434783	0.147058823529412	0.168838862559242	0.871001031991744	0.0175438596491228	0.016304347826087	3	54	564	2874	0.997179365572015	0.283162352641732	0.0747365101056568	Inf	0.320828667413214	0	1	0	0.338652482269504	0.995654622324398	0.299817011663688	0.2	181	174
TCGA-CM-6168-01A-11D-1650-10	0	0	1	1	365	1	1	4	5	359	14719	0	76	1	77	3749	2	68	1	71	3658	7	23	60	90	3523	7	24	90	121	3789	4	3	7	14	528	0.0383561643835616	0.115702479338843	0.139350752177356	0.830296769346356	0.0265151515151515	2	5	6	13	534	0.0356164383561644	0.144444444444444	0.151575361907465	0.952954640033292	0.0243445692883895	0.0520547945205479	19	145	1062	6250	0.881426349745	0.771179166754541	0.490504183024299	Inf	0.797666620734004	2.95076674737692	0.009962275051618	4.41275482525354	0.596710608913999	0.988162991407922	0.558480009469715	0.0860667543156722	346	340
TCGA-CM-6169-01A-11D-1650-10	0	0	1	1	234	0	2	5	7	227	9307	2	55	2	59	2282	2	41	3	46	2403	0	14	46	60	2336	2	12	48	62	2286	1	2	2	5	336	0.0213675213675214	0.0806451612903226	0.146981627296588	0.548675115207373	0.0148809523809524	0	1	0	1	326	0.00427350427350427	0.0166666666666667	0.139554794520548	0.119427402862986	0.00306748466257669	0.0128205128205128	3	93	662	3960	0.999942569995647	0.193001374778453	0.0516008987300155	Inf	0.218183534743202	3.49093655589124	0.2662327747452	5.97814235974544	0.148550491740053	0.999990827471747	0.130068539667091	1	231	224
TCGA-CM-6170-01A-11D-1650-10	0	0	0	0	213	0	2	4	6	207	8487	1	47	2	50	2062	3	40	1	44	2037	2	10	40	52	2237	6	10	45	61	2151	1	1	3	5	288	0.0234741784037559	0.0819672131147541	0.133891213389121	0.61219262295082	0.0173611111111111	1	1	2	4	332	0.0187793427230047	0.0769230769230769	0.148413053196245	0.518303985171455	0.0120481927710843	0.0328638497652582	7	86	620	3768	0.982282506619143	0.494736402931979	0.225093134834795	Inf	0.532708983697537	1.76935483870968	0.315833053000875	2.02544381705711	0.416318785578748	0.994917012473482	0.379895853653761	0.334841628959276	206	200
TCGA-CM-6171-01A-11D-1650-10	0	0	0	0	1501	1	40	218	258	1242	50922	8	139	13	160	11642	10	113	11	134	11596	12	70	380	462	13783	9	80	397	486	13901	1	8	12	21	1677	0.0139906728847435	0.0432098765432099	0.120638802963816	0.358175607529613	0.0125223613595707	1	9	7	17	1679	0.011325782811459	0.0367965367965368	0.121816730755278	0.302064721064126	0.0101250744490768	0.0139906728847435	21	777	3356	24328	1	0.195927944595327	0.13045198242949	Inf	0.217081738912239	0.785629150349055	0.741711573536459	0.7630707001962	0.20171559265719	1	0.181711672158747	1.79945894195468e-05	1480	1221
TCGA-CM-6172-01A-11D-1650-10	0	0	0	0	258	0	3	5	8	249	10209	2	40	3	45	2619	3	57	2	62	2510	0	17	50	67	2609	2	13	60	75	2471	1	3	4	8	351	0.0310077519379845	0.106666666666667	0.142047753945771	0.750921177587844	0.0227920227920228	0	2	2	4	369	0.0155038759689922	0.0597014925373134	0.141433499425067	0.422117056991465	0.010840108401084	0.0271317829457364	7	105	720	4360	0.997217571527061	0.403753442780364	0.184679027345824	Inf	0.440972222222222	3.52777777777778	0.263642490280053	6.05207025742737	0.384848484848485	0.998896583370129	0.349406787960065	0.068649885583524	251	242
TCGA-CM-6674-01A-11D-1835-10	0	0	0	0	1007	2	28	113	141	864	35424	8	72	6	86	7855	10	88	9	107	8084	6	38	299	343	9756	2	34	292	328	9729	0	0	5	5	1135	0.00496524329692155	0.0152439024390244	0.116661527392332	0.130667776942087	0.00440528634361234	1	6	7	14	1135	0.0139026812313803	0.0408163265306122	0.116338663386634	0.350840600557404	0.0123348017621145	0.012909632571996	13	586	2270	17215	1	0.168246936349166	0.0988302977505903	Inf	0.186290660645864	1.07296255506608	0.628843617896489	1.08341105923137	0.17428833381784	1	0.157182591420096	0.00036362439032072	994	851
TCGA-CM-6675-01A-11D-1835-10	0	0	0	0	159	0	2	5	7	152	6232	5	33	1	39	1530	0	36	2	38	1578	0	10	28	38	1584	2	4	31	37	1540	0	0	1	1	231	0.00628930817610063	0.027027027027027	0.15	0.18018018018018	0.00432900432900433	0	1	0	1	233	0.00628930817610063	0.0263157894736842	0.14709595959596	0.178902191100068	0.00429184549356223	0.00628930817610063	1	60	464	2660	0.999940327676914	0.0955778357002513	0.00478415714920996	Inf	0.110373092142453	0	1	0	0.114114552893045	0.999918176636184	0.0988734831438365	1	158	151
TCGA-CM-6676-01A-11D-1835-10	0	0	1	1	231	0	1	1	2	229	9389	3	40	2	45	2390	4	47	1	52	2327	0	14	35	49	2356	2	17	64	83	2316	1	1	5	7	345	0.0303030303030303	0.0843373493975904	0.148963730569948	0.566160293347302	0.0202898550724638	0	4	1	5	401	0.0216450216450216	0.102040816326531	0.170203735144312	0.599521604152883	0.0124688279301746	0.0303030303030303	7	94	746	3926	0.997846818767374	0.391959211384265	0.178841699408373	Inf	0.434050911793592	3.1313672922252	0.294126776964437	5.25999788424171	0.379559671784873	0.999143778702427	0.339582725355652	0.068649885583524	224	222
TCGA-CM-6677-01A-11D-1835-10	0	0	0	0	215	0	3	5	8	207	8487	2	30	1	33	2104	4	36	3	43	2140	2	10	48	60	2076	2	14	55	71	2167	0	7	2	9	338	0.0418604651162791	0.126760563380282	0.15597600369174	0.8126927243937	0.0266272189349112	0	3	3	6	305	0.027906976744186	0.1	0.146917148362235	0.680655737704918	0.019672131147541	0.0232558139534884	5	102	643	3600	0.999829311801579	0.274500288347502	0.105692605988805	Inf	0.308353076263426	0	1	0	0.320327953011521	0.999718518936273	0.285703393978755	0.0421455938697318	210	202
TCGA-CM-6678-01A-11D-1835-10	0	0	0	0	245	2	3	1	4	239	9799	4	41	3	48	2445	0	43	1	44	2400	3	5	53	61	2473	0	10	76	86	2481	0	2	5	7	359	0.0285714285714286	0.0813953488372093	0.144699717855703	0.562512146142385	0.0194986072423398	0	1	2	3	345	0.0122448979591837	0.0491803278688525	0.139506672058229	0.352530292230934	0.00869565217391304	0.0285714285714286	7	125	704	4250	0.999660913127535	0.338116418725812	0.155180472125074	Inf	0.373170626721763	0	1	0	0.381849013389711	0.999533317213295	0.346430030499574	0.00309597523219814	238	232
TCGA-CM-6679-01A-11D-1835-10	0	0	0	0	111	0	1	3	4	107	4387	0	25	0	25	1082	4	21	1	26	1145	0	4	25	29	1108	1	4	22	27	1052	0	0	0	0	164	0	0	0.155893536121673	0	0	0	0	3	3	159	0.027027027027027	0.103448275862069	0.143501805054152	0.720884840598569	0.0188679245283019	0.027027027027027	3	45	323	1837	0.980770631124407	0.379271025211015	0.0993052096237355	Inf	0.417956656346749	0	1	0	0.426849351162638	0.97826977839617	0.387888930515259	0.1	108	104
TCGA-CM-6680-01A-11D-1835-10	0	0	1	1	204	0	2	7	9	195	7995	0	44	1	45	1946	4	47	3	54	2086	2	8	32	42	2026	0	7	47	54	1937	0	1	4	5	293	0.0245098039215686	0.0925925925925926	0.15126484254001	0.612122361269119	0.0170648464163823	1	2	2	5	289	0.0245098039215686	0.119047619047619	0.142645607107601	0.834569121766354	0.0173010380622837	0.0343137254901961	7	74	582	3381	0.961978635254058	0.549594692510434	0.248924721004475	Inf	0.58845615374825	3.40463917525773	0.272485026015985	5.80519657543158	0.517160381051807	0.980768476787882	0.477544881571686	0.0572755417956657	197	188
TCGA-D5-5537-01A-21D-1924-10	0	0	1	1	169	0	3	3	6	162	6642	1	18	4	23	1558	0	18	3	21	1663	1	21	36	58	1697	2	12	46	60	1724	0	3	1	4	244	0.0236686390532544	0.0666666666666667	0.1415313225058	0.47103825136612	0.0163934426229508	0	3	2	5	220	0.029585798816568	0.0862068965517241	0.129640542133176	0.664968652037618	0.0227272727272727	0.0177514792899408	3	82	464	2957	0.999534027727145	0.233210495945952	0.0621136569282885	Inf	0.260218052738337	0	1	0	0.269738225399495	0.999330639585172	0.242065801024928	0.205882352941176	166	159
TCGA-D5-5538-01A-01D-1650-10	0	0	1	1	298	1	2	3	5	291	11931	6	67	2	75	3112	4	61	2	67	3052	4	21	41	66	2802	2	22	59	83	2965	0	3	3	6	466	0.0201342281879195	0.072289156626506	0.15716694772344	0.459951393557061	0.0128755364806867	0	4	1	5	435	0.0167785234899329	0.0757575757575758	0.15524625267666	0.487983281086729	0.0114942528735632	0.0134228187919463	4	102	901	4866	0.99997590025118	0.211823311729084	0.0709251224609399	Inf	0.241534563273512	0	1	0	0.256026637069922	0.999944291608494	0.225061558925756	0.0902255639097742	294	287
TCGA-D5-5539-01A-01D-1650-10	0	0	2	2	322	0	2	1	3	319	13079	2	76	1	79	3285	3	76	4	83	3330	7	19	54	80	3283	1	11	65	77	3181	0	4	5	9	483	0.0279503105590062	0.116883116883117	0.151839044325684	0.769783012019037	0.0186335403726708	2	1	6	9	448	0.0279503105590062	0.1125	0.136460554371002	0.8244140625	0.0200892857142857	0.0403726708074534	13	114	931	5533	0.932631615886938	0.677754932028835	0.388792223640018	Inf	0.710708153961958	1.73576799140709	0.324300445613361	1.98083807108718	0.641796568251361	0.964112957991488	0.605353319814269	0.00451083214153292	309	306
TCGA-D5-5540-01A-01D-1650-10	0	0	0	0	275	2	2	4	6	265	10865	4	76	4	84	2712	3	54	0	57	2681	3	9	48	60	2660	1	9	54	64	2812	0	3	2	5	401	0.0181818181818182	0.078125	0.142603129445235	0.547849127182045	0.0124688279301746	1	2	6	9	393	0.0327272727272727	0.15	0.147744360902256	1.01526717557252	0.0229007633587786	0.0327272727272727	9	97	794	4678	0.977013509026926	0.546701485370941	0.276660759837303	Inf	0.585143291668647	1.72292191435768	0.466149132630594	1.96368228615071	0.54052452215143	0.985471101229345	0.501471214605856	0.0127536231884058	266	256
TCGA-D5-5541-01A-01D-1650-10	0	0	1	1	218	1	1	4	5	211	8651	3	63	0	66	2131	3	59	3	65	2186	0	8	31	39	2085	0	5	36	41	2249	0	1	4	5	353	0.0229357798165138	0.121951219512195	0.156958648288128	0.776964001934637	0.0141643059490085	0	2	1	3	299	0.0137614678899083	0.0769230769230769	0.143405275779377	0.536403395935169	0.0100334448160535	0.0229357798165138	5	62	652	3682	0.979640215480912	0.455482155039185	0.173259703960198	Inf	0.49606263162714	NaN	1	0	0.49606263162714	0.979640215480912	0.455482155039185	0.0256410256410257	213	206
TCGA-D5-6529-01A-11D-1771-10	0	0	0	0	240	0	1	3	4	235	9635	0	41	0	41	2307	3	47	1	51	2403	3	11	48	62	2396	3	14	64	81	2529	0	3	4	7	382	0.0291666666666667	0.0864197530864197	0.151047844998023	0.572134962187318	0.0183246073298429	0	1	3	4	322	0.0166666666666667	0.0645161290322581	0.134390651085142	0.480064115407734	0.0124223602484472	0.0291666666666667	7	111	704	4221	0.998636224926563	0.378160095548289	0.173161414115375	Inf	0.415001444530046	0	1	0	0.437233664772727	0.997480472355007	0.399767095097164	0.00386996904024769	233	228
TCGA-D5-6532-01A-11D-1719-10	0	0	1	1	374	5	0	6	6	362	14842	10	71	4	85	3764	12	64	4	80	3783	4	30	57	91	3586	7	21	78	106	3709	4	3	11	18	560	0.0481283422459893	0.169811320754717	0.150984092747371	1.12469676549865	0.0321428571428571	2	7	7	16	546	0.0427807486631016	0.175824175824176	0.152258784160625	1.15477196795878	0.0293040293040293	0.0641711229946524	24	122	1106	6189	0.369694952403288	1.10083453095631	0.731310772089593	Inf	1.08424781391662	3.59773138254151	0.00284543547969108	6.71220774791589	0.879445449065702	0.756357452681819	0.86091531273503	0.00472307429540234	350	338
TCGA-D5-6533-01A-11D-1719-10	0	0	2	2	465	4	1	8	9	450	18450	14	72	5	91	4628	26	76	4	106	4402	8	27	80	115	4716	7	44	87	138	4704	6	8	3	17	637	0.0365591397849462	0.123188405797101	0.135416666666667	0.909698996655518	0.0266875981161695	4	8	7	19	667	0.0408602150537634	0.165217391304348	0.141433418150975	1.16816374421485	0.0284857571214393	0.043010752688172	20	162	1304	8116	0.890482461188409	0.768405714315414	0.495936699805546	Inf	0.793838063776714	4.8159509202454	4.09323550504863e-06	12.4420826822612	0.432570441938209	0.999595799445498	0.396454783318982	1	445	430
TCGA-D5-6534-01A-21D-1924-10	0	0	0	0	196	0	1	4	5	189	7749	3	28	6	37	1906	2	25	10	37	1968	5	10	38	53	1891	7	17	38	62	1984	2	3	3	8	312	0.0408163265306122	0.129032258064516	0.157258064516129	0.82051282051282	0.0256410256410256	0	1	2	3	273	0.0153061224489796	0.0566037735849057	0.144368059227922	0.392079618494713	0.010989010989011	0.0357142857142857	7	81	585	3290	0.984234191327831	0.486090820772167	0.220737094959949	Inf	0.526903651903652	1.1039886039886	0.560821761345802	1.12471428330685	0.435784975258659	0.992618411402299	0.396116989152697	0.361455108359133	189	182
TCGA-D5-6535-01A-11D-1719-10	0	0	1	1	439	3	2	2	4	429	17589	10	73	4	87	4395	16	63	6	85	4291	10	37	88	135	4485	4	34	84	122	4418	1	7	10	18	653	0.041002277904328	0.147540983606557	0.14780443639656	0.998217558305927	0.0275650842266462	5	7	8	20	654	0.0455580865603645	0.148148148148148	0.145819397993311	1.01597009853891	0.0305810397553517	0.0546697038724374	24	162	1307	7596	0.780567431429072	0.861018997187622	0.576916332307467	Inf	0.878939704321643	2.91933544649689	0.0104748728559008	4.35803612680094	0.712860981121332	0.956554383814291	0.67932596590266	0.00600782067430335	415	405
TCGA-D5-6536-01A-11D-1719-10	0	1	1	2	431	2	3	4	7	418	17138	6	67	1	74	4124	13	73	2	88	4312	3	54	84	141	4333	5	46	64	115	4369	2	3	5	10	668	0.0232018561484919	0.0869565217391304	0.152895399404898	0.568732101015361	0.0149700598802395	1	3	6	10	585	0.0232018561484919	0.0709219858156028	0.135010385414263	0.52530763169061	0.0170940170940171	0.0324825986078886	14	142	1253	7449	0.98375075752002	0.586151190717252	0.345467597550369	Inf	0.623263142816215	2.60434956105347	0.0956093906741066	3.56623209187349	0.516177390479066	0.996705174725571	0.477363170196992	0.0187011260426166	417	404
TCGA-D5-6537-01A-11D-1719-10	0	0	1	1	326	2	1	3	4	317	12997	2	43	1	46	3005	10	60	1	71	3173	2	29	60	91	3394	2	37	70	109	3425	0	6	3	9	468	0.0276073619631902	0.0825688073394495	0.136642335766423	0.604269583627382	0.0192307692307692	0	5	1	6	417	0.0184049079754601	0.0659340659340659	0.12286387743076	0.536643212902206	0.0143884892086331	0.0122699386503067	4	130	885	5934	0.999986119929347	0.206336806704363	0.0693601630227171	Inf	0.23000252972426	0	1	0	0.237079530638853	0.999977998181714	0.212886921549166	0.0996168582375479	322	313
TCGA-D5-6538-01A-11D-1719-10	0	0	3	3	303	1	2	5	7	294	12054	7	49	4	60	2955	9	38	2	49	2931	4	13	72	89	2972	1	20	75	96	3196	0	5	4	9	454	0.0297029702970297	0.09375	0.142052565707134	0.659966960352423	0.0198237885462555	0	2	7	9	406	0.0297029702970297	0.101123595505618	0.136608344549125	0.74024464493275	0.0221674876847291	0.0363036303630363	11	141	860	5308	0.996312501467441	0.481556022707791	0.263665662673451	Inf	0.519033047735618	0	1	0	0.536687233032748	0.994394040093193	0.499258504953778	0.000105937814502887	292	283
TCGA-D5-6539-01A-11D-1719-10	0	0	2	2	329	1	0	0	0	326	13366	10	66	4	80	3306	11	64	3	78	3418	6	19	48	73	3224	3	27	65	95	3418	1	9	6	16	512	0.0486322188449848	0.168421052631579	0.14979520187244	1.12434210526316	0.03125	1	2	6	9	466	0.027355623100304	0.123287671232877	0.14454094292804	0.852960197542477	0.01931330472103	0.0425531914893617	14	108	978	5664	0.873960933735379	0.75076810064178	0.439157334279397	Inf	0.779342250829729	1.50920245398773	0.391361160213713	1.6545340653173	0.721211792171128	0.917686970579505	0.688123138231523	0.00361371807528626	315	312
TCGA-D5-6540-01A-11D-1719-10	0	0	1	1	1554	5	43	211	254	1293	53013	20	91	24	135	11847	21	96	16	133	11905	6	99	395	500	14709	12	103	410	525	14552	3	12	6	21	1672	0.0135135135135135	0.04	0.114898295766905	0.348133971291866	0.0125598086124402	1	10	7	18	1730	0.0115830115830116	0.036	0.117615065606092	0.30608323699422	0.0104046242774566	0.0109395109395109	17	806	3402	25859	1	0.16032635450245	0.101592511620749	Inf	0.177665843049939	1.91135933111242	0.148995716144537	2.17167321817953	0.138900025925561	1	0.124769929383749	0.0263401246431802	1537	1276
TCGA-D5-6541-01A-11D-1719-10	0	0	2	2	305	0	3	6	9	296	12136	8	79	2	89	3098	7	63	2	72	3029	0	13	44	57	2996	4	18	56	78	3013	2	3	1	6	451	0.019672131147541	0.0769230769230769	0.149684699634915	0.513900733412929	0.0133037694013304	0	6	4	10	431	0.0327868852459016	0.175438596491228	0.143858477970628	1.21952212317336	0.0232018561484919	0.0229508196721311	7	97	882	5127	0.995863734602653	0.419531658232738	0.191665918674892	Inf	0.458562271062271	3.40646258503401	0.105601964414624	5.81024464178195	0.340646258503401	0.999398480790652	0.305981773756207	0.39438882709183	298	289
TCGA-D5-6898-01A-11D-1924-10	0	0	1	1	132	0	4	1	5	127	5207	2	30	1	33	1348	2	16	0	18	1332	3	11	23	37	1294	2	5	32	39	1233	2	2	1	5	190	0.0378787878787879	0.128205128205128	0.154095701540957	0.831983805668016	0.0263157894736842	0	3	1	4	198	0.0303030303030303	0.108108108108108	0.153013910355487	0.706524706524707	0.0202020202020202	0.0303030303030303	4	56	388	2139	0.987025396233156	0.393878461839499	0.129674505485682	Inf	0.434192439862543	2.60515463917526	0.172116337659513	3.67253452207345	0.236832239925023	0.998780485036387	0.208106918095411	1	128	123
TCGA-D5-6920-01A-11D-1924-10	0	0	0	0	158	0	3	4	7	150	6150	2	31	1	34	1604	4	20	0	24	1549	1	5	35	41	1488	5	6	40	51	1509	3	3	1	7	253	0.0443037974683544	0.137254901960784	0.167660702451955	0.818646826319461	0.0276679841897233	0	1	2	3	244	0.0189873417721519	0.0731707317073171	0.163978494623656	0.446221511395442	0.0122950819672131	0.0379746835443038	6	75	497	2500	0.994905814330349	0.402498830044306	0.169473719643466	Inf	0.446680080482897	3.01509054325956	0.0619377559923509	5.0262911354138	0.241207243460765	0.999826369296338	0.209653509937095	1	152	144
TCGA-D5-6922-01A-11D-1924-10	0	0	1	1	200	2	4	1	5	191	7831	1	25	3	29	1956	3	32	1	36	1982	4	17	44	65	1920	7	6	48	61	1973	3	2	0	5	274	0.025	0.0819672131147541	0.13887480993411	0.590223764508795	0.0182481751824818	2	1	3	6	273	0.03	0.0923076923076923	0.1421875	0.649196956889265	0.021978021978022	0.04	8	95	547	3346	0.981720083788155	0.515186015616862	0.248565183032594	Inf	0.552776841021636	3.23500083097889	0.0122809880211026	5.09424102495459	0.232076146570225	0.999873349989637	0.206237890007917	0.659442724458204	192	183
TCGA-D5-6923-01A-11D-1924-10	0	0	0	0	329	2	3	1	4	321	13161	5	67	6	78	3349	7	63	7	77	3243	9	16	54	79	3312	11	22	54	87	3257	2	10	1	13	456	0.0395136778115502	0.149425287356322	0.140006140620203	1.0672766686832	0.0285087719298246	5	4	4	13	505	0.0395136778115502	0.164556962025316	0.152475845410628	1.0792329865898	0.0257425742574257	0.0364741641337386	12	116	961	5608	0.969836841936487	0.603721589651396	0.33838130843308	Inf	0.640836368366285	2.39245577523413	0.0195455914548247	3.14146627951395	0.316462404131499	0.999760737129374	0.283314704294603	0.74316307182049	317	309
TCGA-D5-6924-01A-11D-1924-10	0	0	1	1	222	1	2	4	6	214	8774	3	27	2	32	2061	9	32	6	47	2179	6	13	44	63	2179	9	13	50	72	2355	2	2	2	6	294	0.027027027027027	0.0833333333333333	0.12484076433121	0.667517006802721	0.0204081632653061	1	2	5	8	295	0.036036036036036	0.126984126984127	0.135383203304268	0.937960721011568	0.0271186440677966	0.045045045045045	10	99	589	3945	0.911701611392709	0.676595118090328	0.355298928344652	Inf	0.706219529290821	1.53955857385399	0.308883615267354	1.67421389204396	0.573239894520103	0.967469932597284	0.538961773776904	0.236460717009916	212	204
TCGA-D5-6926-01A-11D-1924-10	0	0	0	0	143	0	1	2	3	140	5740	3	24	1	28	1430	3	26	5	34	1493	1	7	33	41	1360	4	4	29	37	1457	2	2	2	6	238	0.041958041958042	0.162162162162162	0.163349347975292	0.992732228026346	0.0252100840336134	0	0	1	1	200	0.00699300699300699	0.024390243902439	0.147058823529412	0.165853658536585	0.005	0.034965034965035	5	62	438	2379	0.984015313313282	0.438116438945817	0.166365154251493	Inf	0.47996319771008	2.57260273972603	0.175666268437504	3.61863494963087	0.311201944321697	0.997711612134477	0.276256809437177	1	138	135
TCGA-D5-6927-01A-21D-1924-10	0	0	0	0	780	1	32	100	132	647	26527	10	92	8	110	6078	4	91	5	100	6124	3	41	182	226	7147	3	34	174	211	7178	0	1	5	6	826	0.00769230769230769	0.028436018957346	0.115073836723321	0.247111070309721	0.00726392251815981	0	5	3	8	878	0.0102564102564103	0.0353982300884956	0.122848747726319	0.288144818271615	0.00911161731207289	0.0102564102564103	8	354	1704	12621	0.999999999997322	0.167393520895297	0.0825788606609056	Inf	0.185783207532488	0	1	0	0.18891438518753	0.999999999994979	0.170279572599467	0.00193236714975846	772	639
TCGA-D5-6928-01A-11D-1924-10	0	0	0	0	1528	1	25	116	141	1386	56826	13	86	14	113	12652	19	89	13	121	12891	3	113	503	619	15670	3	88	442	533	15613	0	9	9	18	1792	0.0117801047120419	0.0337711069418387	0.114776148081727	0.294234538327526	0.0100446428571429	2	10	12	24	1768	0.0157068062827225	0.0387722132471729	0.11282705807275	0.343642862886425	0.0135746606334842	0.0150523560209424	23	928	3560	27723	1	0.193011045493627	0.131141666288314	Inf	0.212522891338508	2.92911985018727	0.142479909660464	3.89305169629293	0.195274656679151	1	0.176990491698712	3.8441825468754e-06	1505	1363
TCGA-D5-6929-01A-31D-1924-10	0	0	1	1	252	0	2	7	9	242	9922	1	50	5	56	2531	2	59	3	64	2637	5	13	37	55	2348	6	21	40	67	2406	3	2	1	6	399	0.0238095238095238	0.0895522388059701	0.165835411471322	0.540006733251038	0.0150375939849624	1	3	4	8	374	0.0317460317460317	0.145454545454545	0.159284497444634	0.91317452600875	0.0213903743315508	0.0357142857142857	9	79	773	3981	0.959368885609627	0.586773564513786	0.295151368047281	Inf	0.628983888039515	2.23638715747383	0.0892941169458584	2.94201912737438	0.399354849548899	0.996852852513444	0.357695028364729	1	243	233
TCGA-D5-6930-01A-11D-1924-10	0	0	2	2	1347	1	33	148	181	1165	47765	9	51	8	68	10585	15	71	17	103	10905	6	63	422	491	12899	8	62	433	503	13376	0	8	15	23	1535	0.0170749814402376	0.0457256461232604	0.114757775119617	0.398453578205037	0.0149837133550489	0	8	8	16	1508	0.0118782479584261	0.0325865580448065	0.116908287464145	0.278736082373978	0.0106100795755968	0.0170749814402376	23	846	3043	23232	1	0.207565983775344	0.140960527870866	Inf	0.228532953254976	0	1	0	0.232275013308273	1	0.211058644322878	2.18607745613878e-09	1324	1142
TCGA-D5-6931-01A-11D-1924-10	0	0	0	0	393	1	4	4	8	384	15744	10	47	31	88	3902	7	48	32	87	3908	2	18	81	101	3982	6	19	83	108	3952	2	4	6	12	589	0.0305343511450382	0.111111111111111	0.149038461538462	0.745519713261649	0.0203735144312394	1	7	4	12	576	0.0305343511450382	0.118811881188119	0.144650929181316	0.821369636963696	0.0208333333333333	0.0330788804071247	13	159	1165	6769	0.998397081139549	0.47509228220718	0.274761743933406	Inf	0.514732009182553	2.55386266094421	0.10024600332631	3.48540174979739	0.415262221291741	0.999801035814041	0.377323067789133	0.0489914130589479	380	371
TCGA-D5-6932-01A-11D-1924-10	0	0	1	1	186	0	0	6	6	179	7339	5	33	4	42	1899	9	30	6	45	1880	5	12	27	44	1777	8	11	29	48	1783	2	1	1	4	273	0.021505376344086	0.0833333333333333	0.153112731351655	0.544261294261294	0.0146520146520147	1	4	2	7	279	0.0376344086021505	0.159090909090909	0.157006190208216	1.0132779406973	0.025089605734767	0.032258064516129	6	63	552	3008	0.965765410693005	0.519056623451572	0.217538442310724	Inf	0.560806553245117	1.48829431438127	0.328301431106906	1.63451218284209	0.345496894409938	0.994776752848745	0.308515257180426	1	180	173
TCGA-D5-7000-01A-11D-1924-10	0	0	0	0	173	2	3	3	6	164	6724	1	27	0	28	1588	2	25	0	27	1640	3	10	34	47	1726	3	8	51	62	1770	2	1	1	4	237	0.023121387283237	0.0645161290322581	0.133898305084746	0.481829318089016	0.0168776371308017	0	0	0	0	207	0	0	0.119930475086906	0	0	0.0173410404624277	3	88	444	3052	0.999524606141362	0.234392827198596	0.0624998374717852	Inf	0.25957825957826	2.62462462462462	0.171606968159272	3.43495906192573	0.0926338102808691	0.999989057793825	0.0818560939097346	1	170	161
TCGA-DC-5337-01A-01D-1657-10	0	0	0	0	283	1	6	3	9	271	11111	0	61	0	61	2589	2	57	1	60	2508	0	13	58	71	2938	4	14	61	79	3076	0	0	1	1	334	0.00353356890459364	0.0126582278481013	0.108582574772432	0.116576972637004	0.0029940119760479	0	4	4	8	330	0.0282685512367491	0.112676056338028	0.112321307011573	1.00315834400341	0.0242424242424242	0.0176678445229682	5	118	664	5350	0.998282291927292	0.341447719262921	0.131849080497412	Inf	0.368180037222059	0	1	0	0.380555836792548	0.997591054356404	0.353427519812912	0.0294117647058824	278	266
TCGA-DC-5869-01A-01D-1657-10	0	0	1	1	187	2	4	10	14	171	7011	1	38	0	39	1463	2	37	1	40	1505	5	5	31	41	1986	4	7	40	51	2057	1	1	3	5	221	0.0267379679144385	0.0980392156862745	0.107438016528926	0.912518853695324	0.0226244343891403	0	1	2	3	198	0.0160427807486631	0.0731707317073171	0.0996978851963746	0.733924611973392	0.0151515151515152	0.0320855614973262	6	74	419	3624	0.847368081933119	0.701336557330302	0.295050045476196	Inf	0.723687350835322	1.07212940864492	0.626886660414595	1.0811555033373	0.679518639281993	0.870249495840999	0.655297278784581	0.118881118881119	181	165
TCGA-DC-6155-01A-11D-1657-10	0	1	2	3	144	1	3	1	4	139	5699	4	23	1	28	1172	0	30	0	30	1302	2	7	23	32	1629	4	4	41	49	1596	2	0	3	5	175	0.0347222222222222	0.102040816326531	0.109649122807018	0.930612244897959	0.0285714285714286	0	0	1	1	176	0.00694444444444444	0.03125	0.108041743400859	0.289240056818182	0.00568181818181818	0.0416666666666667	6	64	351	2874	0.786209445290686	0.767684161657587	0.321214434675218	Inf	0.787545787545788	3.06267806267806	0.132783892000509	4.0915466773146	0.574252136752137	0.926997818057207	0.545949412502487	0.567099567099567	138	133
TCGA-DC-6157-01A-11D-1657-10	1	0	2	3	183	2	1	4	5	176	7216	5	40	1	46	1736	1	39	2	42	1731	5	5	32	42	1830	6	10	30	46	1919	0	2	2	4	219	0.0218579234972678	0.0869565217391304	0.11412193850964	0.761961485010919	0.0182648401826484	3	1	2	6	225	0.0327868852459016	0.142857142857143	0.122950819672131	1.16190476190476	0.0266666666666667	0.0382513661202186	7	66	444	3305	0.775186912096074	0.789527613208872	0.355894722169754	Inf	0.809669258299395	2.30282555282555	0.133520838666228	2.79029249250898	0.544754431851206	0.944654424983543	0.513429021143428	1	176	169
TCGA-DC-6158-01A-11D-1657-10	0	2	0	2	154	1	1	3	4	147	6027	1	30	1	32	1566	1	28	0	29	1559	2	2	29	33	1401	13	2	38	53	1501	7	0	11	18	225	0.116883116883117	0.339622641509434	0.149900066622252	2.26566037735849	0.08	0	1	1	2	219	0.012987012987013	0.0606060606060606	0.156316916488223	0.387712743877128	0.0091324200913242	0.123376623376623	19	63	444	2458	0.0420160871482153	1.66925737034893	1.02447329759102	Inf	1.51444737420347	3.05015015015015	0.00419221857018053	4.84021178254385	1.17063331988705	0.327959658547205	1.20775715646662	0.204927155190733	135	128
TCGA-DC-6160-01A-11D-1657-10	0	0	0	0	187	3	2	5	7	176	7216	4	42	2	48	1627	1	39	2	42	1650	1	6	38	45	1968	1	4	36	41	1971	1	1	3	5	227	0.0267379679144385	0.121951219512195	0.115169964485033	1.05888041259267	0.0220264317180617	0	3	2	5	217	0.0267379679144385	0.111111111111111	0.110264227642276	1.00768049155146	0.0230414746543779	0.0320855614973262	6	70	444	3495	0.869439623082091	0.6747678751772	0.283482915494687	Inf	0.700391180654339	4.43581081081081	0.213106519126661	7.86366738625615	0.599433893352812	0.929179956503928	0.570472581372878	0.140866873065015	181	170
TCGA-DC-6681-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	178	0	4	0	4	174	7134	0	30	7	37	1721	1	30	3	34	1638	6	4	33	43	1904	6	7	47	60	1871	2	0	2	4	246	0.0224719101123595	0.0666666666666667	0.13148049171566	0.507046070460705	0.016260162601626	2	0	3	5	232	0.0280898876404494	0.116279069767442	0.121848739495798	0.954290296712109	0.021551724137931	0.050561797752809	9	83	478	3297	0.836931099261373	0.747971634471384	0.375998679530109	Inf	0.772580498453702	2.63249651324965	0.0555974721592623	3.44687906552164	0.49359309623431	0.97898940059717	0.459901378254905	1	169	165
TCGA-DC-6682-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	203	2	4	4	8	193	7913	2	22	1	25	1867	1	39	5	45	2061	4	8	42	54	1913	5	13	51	69	2072	2	1	2	5	308	0.0246305418719212	0.072463768115942	0.148648648648649	0.487483530961792	0.0162337662337662	2	2	3	7	243	0.0344827586206897	0.12962962962963	0.127025614218505	1.0204999237921	0.0288065843621399	0.0443349753694581	9	93	551	3434	0.951910455360714	0.603190445130785	0.304422244354086	Inf	0.638144550016014	3.21435773341399	0.0260855153439905	4.98278807124634	0.388833596783951	0.997290287159551	0.354169650291552	1	194	184
TCGA-DC-6683-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	118	3	0	0	0	115	4715	4	21	1	26	1256	4	19	0	23	1221	2	5	19	26	1114	3	8	29	40	1124	1	1	1	3	180	0.0254237288135593	0.075	0.160142348754448	0.468333333333333	0.0166666666666667	2	2	2	6	165	0.0508474576271186	0.230769230769231	0.148114901256732	1.55804195804196	0.0363636363636364	0.0508474576271186	6	47	345	1893	0.844811437633864	0.700560713318969	0.289597718119499	Inf	0.734372436423298	3.89217391304348	0.0290358662102221	8.21818828604096	0.405434782608696	0.984200809811059	0.365909160177365	1	112	109
TCGA-DM-A0X9-01A-11D-A152-10	0	0	1	1	245	0	3	3	6	238	9758	4	37	3	44	2521	6	28	3	37	2331	4	20	43	67	2456	5	11	74	90	2450	2	2	4	8	342	0.0326530612244898	0.0888888888888889	0.139591836734694	0.636777128005198	0.0233918128654971	0	5	4	9	341	0.036734693877551	0.134328358208955	0.138843648208469	0.967479318947783	0.0263929618768328	0.0408163265306122	10	116	683	4223	0.985484941462581	0.533074153145266	0.281187065791112	Inf	0.570080643287085	1.59622580120384	0.363486322037737	1.76632393630081	0.491146400370412	0.994245565974679	0.45385153082332	0.0570263255469039	235	228
TCGA-DM-A0XD-01A-12D-A152-10	0	0	1	1	270	0	2	7	9	260	10660	1	52	2	55	2618	4	40	2	46	2563	6	10	66	82	2722	7	13	57	77	2757	2	3	3	8	359	0.0296296296296296	0.103896103896104	0.130214000725426	0.797887349419383	0.0222841225626741	4	4	6	14	369	0.0518518518518519	0.170731707317073	0.135562086700955	1.25943552118448	0.037940379403794	0.0555555555555556	15	121	728	4751	0.813336830655266	0.809049172869322	0.482969289805408	Inf	0.830084437621202	3.47358410819949	0.00415514355670619	5.59094271333851	0.550690163495042	0.986480023619537	0.515268025149366	0.525601571783849	255	245
TCGA-DM-A0XF-01A-11D-A152-10	0	0	2	2	213	0	1	4	5	208	8528	5	32	1	38	2202	7	41	2	50	2218	5	19	28	52	2054	5	16	47	68	2054	1	1	3	5	330	0.0234741784037559	0.0735294117647059	0.160662122687439	0.457664884135472	0.0151515151515152	2	3	2	7	308	0.0328638497652582	0.134615384615385	0.149951314508277	0.897727272727273	0.0227272727272727	0.0375586854460094	8	77	638	3470	0.96258718269626	0.565143817586053	0.271233993769471	Inf	0.606011432786281	1.93166144200627	0.194507376075553	2.33032201064122	0.429258098223615	0.99363915601957	0.388552221816171	0.666846143491722	205	200
TCGA-DM-A1D0-01A-11D-A152-10	0	0	0	0	168	1	1	3	4	163	6683	5	31	4	40	1662	6	29	1	36	1664	5	10	21	36	1673	7	6	38	51	1684	3	1	1	5	241	0.0297619047619048	0.0980392156862745	0.143111638954869	0.685054104629404	0.020746887966805	3	2	0	5	259	0.0297619047619048	0.138888888888889	0.154811715481172	0.897147147147147	0.0193050193050193	0.0416666666666667	7	64	500	2857	0.918195534454742	0.62504361596556	0.281538700378372	Inf	0.661943661971831	3.357	0.00459327212718833	5.7093747602252	0.113796610169492	0.999920883974175	0.0985477113545622	0.0572755417956657	161	156
TCGA-DM-A1D4-01A-21D-A152-10	0	0	0	0	331	3	4	4	8	318	13038	6	59	4	69	3201	4	44	3	51	3358	2	22	66	90	3180	4	36	68	108	3299	1	9	1	11	477	0.0332326283987915	0.101851851851852	0.144589269475599	0.704421927168258	0.0230607966457023	0	6	4	10	444	0.0302114803625378	0.111111111111111	0.139622641509434	0.795795795795796	0.0225225225225225	0.0181268882175227	6	134	921	5558	0.999964494147358	0.270245662877907	0.115482559299958	Inf	0.301489064681247	1.17245747376041	0.601683877646684	1.20689990424568	0.262490479200091	0.999984120456468	0.233935371311757	0.18361137873333	325	312
TCGA-DM-A1D6-01A-21D-A152-10	0	0	2	2	279	1	2	2	4	274	11234	3	51	3	57	2767	5	42	2	49	2902	6	29	41	76	2768	4	26	62	92	2797	3	2	5	10	411	0.03584229390681	0.108695652173913	0.14694315337862	0.739712260657992	0.024330900243309	2	4	4	10	408	0.03584229390681	0.131578947368421	0.147398843930636	0.892672858617131	0.0245098039215686	0.0501792114695341	14	99	819	4746	0.79305935941965	0.819504049479198	0.477798100122804	Inf	0.841842523258452	3.3974358974359	0.00920160614115084	5.79200082543798	0.593726661687827	0.974023548890004	0.554877319871317	0.320265760755193	265	260
TCGA-DM-A1D7-01A-11D-A152-10	0	0	0	0	215	0	2	1	3	212	8692	8	42	3	53	2209	3	33	2	38	2249	7	13	40	60	2115	1	21	39	61	2119	0	1	2	3	314	0.013953488372093	0.0491803278688525	0.14818310523832	0.331888900490759	0.00955414012738853	2	1	4	7	310	0.0325581395348837	0.116666666666667	0.146572104018913	0.795967741935484	0.0225806451612903	0.0372093023255814	8	79	624	3610	0.952755762257983	0.585911116196442	0.281423003567747	Inf	0.623931623931624	1.6963141025641	0.335133630509959	1.92793778786072	0.515335929892892	0.98135781561876	0.475566194670771	0.169802333889021	207	204
TCGA-DM-A1D8-01A-11D-A152-10	0	0	1	1	211	3	3	1	4	204	8364	4	32	7	43	2168	8	26	2	36	2035	6	15	44	65	2105	4	16	40	60	2056	2	2	0	4	284	0.018957345971564	0.0666666666666667	0.138132295719844	0.482629107981221	0.0140845070422535	3	2	2	7	290	0.033175355450237	0.107692307692308	0.137767220902613	0.781697612732096	0.0241379310344828	0.033175355450237	7	87	574	3587	0.979991316078837	0.502869089397734	0.228788074470358	Inf	0.539828749351323	3.62456445993031	0.00698721485091378	6.24459097673481	0.172598307615729	0.999939098302132	0.152452734313306	0.361455108359133	204	197
TCGA-DM-A1D9-01A-11D-A152-10	0	0	0	0	218	0	5	8	13	204	8364	9	39	1	49	2020	8	28	4	40	2168	9	18	32	59	2073	9	12	35	56	2103	2	4	3	9	301	0.0412844036697248	0.160714285714286	0.143128863528293	1.12286426198386	0.0299003322259136	2	1	2	5	284	0.0229357798165138	0.0847457627118644	0.136999517607332	0.618584387682024	0.0176056338028169	0.0412844036697248	9	76	585	3591	0.856929058311138	0.726972541663486	0.364809024970422	Inf	0.755837104072398	1.58632478632479	0.239645833296318	1.75355799723938	0.532721010332951	0.966136245041051	0.49510285214968	1	209	195
TCGA-DM-A1DA-01A-11D-A152-10	0	0	1	1	396	4	1	5	6	386	15826	11	50	7	68	3775	2	46	6	54	3686	16	44	76	136	4257	11	45	72	128	4108	1	6	4	11	475	0.0277777777777778	0.0859375	0.115628042843233	0.743223684210526	0.0231578947368421	1	7	5	13	583	0.0328282828282828	0.0955882352941176	0.136950904392765	0.697974472807991	0.0222984562607204	0.0277777777777778	11	164	1058	7307	0.997850574503154	0.463268769030889	0.254530748233357	Inf	0.496975425330813	0.585661275642372	0.872433789101396	0.552546159519118	0.480796249936137	0.996925652480098	0.447209281221696	0.0363296085288338	385	375
TCGA-DM-A1DB-01A-11D-A152-10	0	0	1	1	308	2	0	2	2	301	12341	1	57	1	59	3096	4	62	2	68	3179	6	45	40	91	3125	3	39	41	83	2941	2	5	1	8	431	0.025974025974026	0.0963855421686747	0.146548792927576	0.657702736700864	0.0185614849187935	3	7	4	14	468	0.0454545454545455	0.153846153846154	0.14976	1.02728468113083	0.0299145299145299	0.0324675324675325	10	80	899	5167	0.87441297247968	0.718472563374038	0.375561554353812	Inf	0.74972191323693	3.74860956618465	0.00539510858172813	7.1805634108022	0.416512174020517	0.995089008876556	0.378165976656816	1	298	291
TCGA-DM-A1HA-01A-11D-A152-10	0	1	1	2	249	2	2	1	3	244	10004	4	37	0	41	2312	6	34	2	42	2510	11	26	54	91	2619	3	19	48	70	2563	1	3	3	7	330	0.0281124497991968	0.1	0.128755364806867	0.776666666666667	0.0212121212121212	2	4	3	9	343	0.036144578313253	0.0989010989010989	0.130966017563956	0.755166116682152	0.0262390670553936	0.036144578313253	9	107	673	4509	0.971320592861893	0.563589833843205	0.285744315824014	Inf	0.597402264692319	1.64996815962641	0.271055866120167	1.82696783198932	0.452932435975876	0.993530103496167	0.418790046155016	0.433147942157953	240	235
TCGA-DM-A1HB-01A-21D-A183-10	0	0	0	0	1453	4	45	191	236	1210	49610	15	142	22	179	11511	10	182	25	217	11528	11	117	303	431	13309	6	102	275	383	13262	1	11	13	25	1580	0.0172057811424639	0.0652741514360313	0.119137385009802	0.547889744521929	0.0158227848101266	2	3	5	10	1625	0.00688231245698555	0.0232018561484919	0.12209782853708	0.190026771372479	0.00615384615384615	0.0144528561596696	21	574	3205	23366	0.999999999999935	0.266732804597068	0.177296323273741	Inf	0.292605304212168	1.46302652106084	0.337714911090344	1.56220752739572	0.258181150775443	0.999999999999995	0.234344221260013	0.000167237832367287	1432	1189
TCGA-DM-A282-01A-12D-A16V-10	0	0	0	0	173	0	2	6	8	165	6765	2	19	1	22	1663	5	23	0	28	1718	6	16	39	61	1772	2	14	38	54	1612	1	5	1	7	237	0.0404624277456647	0.12962962962963	0.147022332506203	0.88170026566651	0.029535864978903	2	4	4	10	248	0.0578034682080925	0.163934426229508	0.139954853273138	1.17133791644632	0.0403225806451613	0.046242774566474	8	77	485	2899	0.931910024112142	0.621094344490649	0.29769948616103	Inf	0.65668890236507	2.61649484536082	0.0949310342466426	3.58444706946997	0.453072700495381	0.989473796249344	0.415167392432407	0.68801848668367	165	157
TCGA-DM-A285-01A-11D-A16V-10	0	0	0	0	216	2	1	2	3	211	8651	2	34	8	44	2173	9	29	3	41	2303	10	19	41	70	2050	4	19	33	56	2125	3	3	1	7	322	0.0324074074074074	0.125	0.151529411764706	0.824922360248447	0.0217391304347826	3	4	4	11	335	0.0509259259259259	0.157142857142857	0.163414634146341	0.961620469083156	0.0328358208955224	0.0509259259259259	11	77	657	3518	0.835043673147954	0.764993884293851	0.411583994079916	Inf	0.794330289193303	2.72341813437704	0.0147710182230296	4.01408120267405	0.429367723888272	0.993676286127288	0.388077919289216	1	205	200
TCGA-DM-A28C-01A-11D-A16V-10	0	0	1	1	182	0	2	7	9	171	7011	1	23	1	25	1769	0	20	0	20	1831	6	24	29	59	1761	4	20	43	67	1650	1	5	3	9	252	0.0494505494505494	0.134328358208955	0.152727272727273	0.87953091684435	0.0357142857142857	2	3	2	7	263	0.0384615384615385	0.11864406779661	0.149346961953436	0.794419024295933	0.026615969581749	0.043956043956044	8	74	515	2896	0.939717067907245	0.607999915888133	0.291148095575893	Inf	0.646175704475491	1.98699029126214	0.183253856145354	2.40912232273745	0.45995145631068	0.988418111053533	0.41972461458548	0.685082190087752	174	163
TCGA-DM-A28E-01A-11D-A16V-10	0	0	2	2	167	0	0	7	7	160	6560	7	31	2	40	1753	2	26	1	29	1729	2	15	21	38	1594	2	7	44	53	1484	1	2	5	8	242	0.0479041916167665	0.150943396226415	0.163072776280323	0.925619834710744	0.0330578512396694	1	5	2	8	259	0.0479041916167665	0.210526315789474	0.162484316185696	1.29567161146109	0.0308880308880309	0.0538922155688623	9	60	501	2577	0.81023259135943	0.771616423517397	0.38351269528881	Inf	0.801353814110909	3.07185628742515	0.127054069277836	5.13972239890212	0.661630584983878	0.92008557839217	0.620876319888865	0.11338524286244	158	151
TCGA-DM-A28F-01A-11D-A16V-10	0	0	1	1	417	3	9	6	15	398	16318	13	55	14	82	4238	11	50	13	74	4163	12	32	77	121	4056	12	43	66	121	3861	5	7	4	16	618	0.0383693045563549	0.132231404958678	0.16006216006216	0.8261253309797	0.0258899676375405	5	3	8	16	651	0.0383693045563549	0.132231404958678	0.160502958579882	0.823856495410748	0.0245775729646697	0.052757793764988	22	145	1269	6648	0.866481267343938	0.794869701119241	0.521945718620692	Inf	0.821873982531391	2.599487785658	0.00253301059957994	3.7410997599374	0.523533204384268	0.997322684998458	0.479925166392471	0.792808399497203	395	376
TCGA-DM-A28G-01A-11D-A16V-10	0	0	0	0	253	0	4	1	5	248	10168	5	33	1	39	2670	5	39	4	48	2721	2	25	42	69	2390	2	33	57	92	2387	2	2	5	9	362	0.0355731225296443	0.0978260869565217	0.151654796816087	0.645057650732645	0.0248618784530387	0	6	2	8	384	0.0316205533596838	0.115942028985507	0.160669456066946	0.721618357487923	0.0208333333333333	0.0355731225296443	9	94	746	4031	0.985238996413491	0.517414172240621	0.261544638493057	Inf	0.559527837788594	3.20174262734584	0.11795132383758	5.40063607511386	0.45277168467517	0.996488568071574	0.411187579300022	0.117538005190953	244	239
TCGA-DM-A28H-01A-11D-A16V-10	0	0	0	0	311	2	6	5	11	298	12218	3	34	3	40	3128	14	41	3	58	3267	8	32	59	99	2899	5	42	54	101	2924	3	2	2	7	460	0.022508038585209	0.0693069306930693	0.157318741450068	0.440551011622901	0.0152173913043478	4	6	7	17	463	0.0546623794212219	0.171717171717172	0.159710244912039	1.07517944019024	0.0367170626349892	0.0514469453376206	16	110	923	4900	0.862174751270334	0.772217348559074	0.467823366603475	Inf	0.801114378579167	3.39703308609051	0.00180639891914101	6.19058747785518	0.502468863555739	0.995375407728775	0.459463086113718	0.760109163604173	295	282
TCGA-DM-A28K-01A-21D-A16V-10	0	0	1	1	250	0	3	3	6	244	10004	3	30	1	34	2427	1	40	1	42	2535	4	27	46	77	2521	4	34	53	91	2521	0	8	5	13	371	0.052	0.142857142857143	0.147163823879413	0.970735463996919	0.0350404312668464	0	3	1	4	355	0.016	0.051948051948052	0.14081713605712	0.368904335101518	0.0112676056338028	0.024	6	101	726	4316	0.998745692386656	0.353210966122176	0.150058443626666	Inf	0.389433845678536	0	1	0	0.420903247349528	0.997037106859617	0.383591829290216	0.0184042875922742	244	238
TCGA-DT-5265-01A-21D-1826-10	0	0	0	0	118	0	2	2	4	114	4674	2	19	0	21	1121	0	20	1	21	1228	2	7	26	35	1169	2	4	31	37	1156	0	1	4	5	190	0.0423728813559322	0.135135135135135	0.164359861591695	0.822190611664296	0.0263157894736842	0	1	2	3	156	0.0254237288135593	0.0857142857142857	0.133447390932421	0.642307692307692	0.0192307692307692	0.0508474576271186	6	55	346	1979	0.905740658151056	0.624069353990326	0.259601972529533	Inf	0.660949493035156	0	1	0	0.707331913599026	0.868253018757733	0.672999792400662	0.00699300699300699	112	108
TCGA-DY-A0XA-01A-11D-A152-10	0	0	1	1	330	0	1	1	2	327	13407	10	72	5	87	3385	5	66	3	74	3435	14	26	40	80	3304	10	23	53	86	3283	3	3	6	12	484	0.0363636363636364	0.13953488372093	0.147426134632958	0.94647318854507	0.0247933884297521	5	5	5	15	487	0.0454545454545455	0.1875	0.147397094430993	1.27207392197125	0.0308008213552361	0.0575757575757576	19	98	971	5616	0.363980122951567	1.12135313882886	0.704771874289049	Inf	1.10163106146628	2.261242705115	0.0182865543050491	2.89121899345088	0.802376443750484	0.824325427341121	0.775893539782003	0.569404760261442	311	308
TCGA-DY-A1DC-01A-31D-A152-10	0	0	1	1	210	1	1	1	2	207	8487	7	48	2	57	2219	4	32	7	43	2101	7	13	26	46	2108	14	14	33	61	2059	4	4	4	12	300	0.0571428571428571	0.19672131147541	0.14570179698883	1.35016393442623	0.04	1	3	1	5	309	0.0238095238095238	0.108695652173913	0.146584440227704	0.741522442662164	0.0161812297734628	0.0476190476190476	10	70	609	3558	0.748954534829262	0.834657184793601	0.43359845136105	Inf	0.855295566502463	1.62913441238564	0.184203428349453	1.82541644510344	0.579861401018619	0.94425722169027	0.541025003465652	1	200	197
TCGA-DY-A1DD-01A-21D-A152-10	0	0	0	0	231	1	4	6	10	219	8979	5	51	2	58	2259	7	31	1	39	2306	4	15	43	62	2248	1	13	46	60	2166	0	5	4	9	330	0.038961038961039	0.15	0.152354570637119	0.984545454545455	0.0272727272727273	0	1	3	4	309	0.0173160173160173	0.0645161290322581	0.137455516014235	0.469360058461217	0.0129449838187702	0.0303030303030303	7	87	639	3775	0.987045881440764	0.475392476408257	0.216381564550529	Inf	0.514400825758332	0	1	0	0.543299748553744	0.97934941129306	0.504375754911938	0.00521739130434783	224	212
TCGA-DY-A1DF-01A-11D-A152-10	0	0	0	0	186	1	2	3	5	179	7339	5	25	7	37	1862	3	26	2	31	1831	7	9	39	55	1789	7	8	41	56	1857	4	3	0	7	270	0.0376344086021505	0.125	0.145395799676898	0.859722222222222	0.0259259259259259	2	2	2	6	274	0.032258064516129	0.109090909090909	0.153158188932364	0.71227604512276	0.0218978102189781	0.043010752688172	8	86	544	3102	0.97656018175553	0.530512992278408	0.255261682570314	Inf	0.570400500625782	2.87237394957983	0.0114745356740415	4.2743390070296	0.167555147058824	0.999959348660736	0.146249392799634	0.201556064073226	178	171
TCGA-DY-A1DG-01A-11D-A152-10	0	0	0	0	335	1	2	6	8	324	13284	7	62	2	71	3258	8	50	0	58	3222	3	21	64	88	3372	8	28	71	107	3432	2	6	7	15	494	0.0447761194029851	0.14018691588785	0.143939393939394	0.973930152484014	0.0303643724696356	0	4	9	13	479	0.0388059701492537	0.147727272727273	0.142052194543298	1.0399506547732	0.0271398747390397	0.0537313432835821	18	128	973	5831	0.783375112576838	0.842758114327533	0.527576239264084	Inf	0.862126736966591	1.27141922825376	0.481090433914812	1.33167070308118	0.828776978417266	0.823033963834145	0.805779070994293	0.000114104820121922	317	306
TCGA-DY-A1H8-01A-21D-A152-10	0	0	1	1	171	0	2	1	3	167	6847	1	29	2	32	1761	1	31	2	34	1665	3	11	39	53	1707	2	7	39	48	1714	0	2	1	3	241	0.0175438596491228	0.0625	0.140606767794632	0.444502074688797	0.012448132780083	1	3	1	5	261	0.0292397660818713	0.0943396226415094	0.152899824253076	0.617002819345045	0.0191570881226054	0.0175438596491228	3	80	502	2919	0.999756429999091	0.218108387629532	0.0581056893724938	Inf	0.246315941055057	1.36294820717131	0.548155567328886	1.45350086442545	0.174736949637348	0.999932684542012	0.153062471841843	1	168	164
TCGA-EF-5830-01A-01D-1657-10	0	0	4	4	304	2	0	1	1	300	12300	3	91	7	101	2760	3	87	7	97	2867	4	12	38	54	3299	1	20	27	48	3374	1	2	4	7	411	0.0230263157894737	0.145833333333333	0.121813870776526	1.19718167072182	0.0170316301703163	0	1	5	6	373	0.0197368421052632	0.111111111111111	0.113064565019703	0.982722669049747	0.0160857908847185	0.0328947368421053	10	60	784	5889	0.306872923983042	1.25186708627159	0.647184878974969	Inf	1.21592565597668	1.70229591836735	0.464988077983078	1.87757958408977	1.1785125588697	0.355053447850572	1.20716517987164	0.0036074841836048	294	290
TCGA-EI-6506-01A-11D-1733-10	0	0	0	0	262	0	3	5	8	253	10373	5	20	1	26	2561	9	28	4	41	2606	6	25	60	91	2613	8	20	67	95	2593	3	7	4	14	383	0.0534351145038168	0.147368421052632	0.147705360586194	0.997718840181393	0.0365535248041775	0	9	4	13	389	0.049618320610687	0.142857142857143	0.148871029468044	0.959603378626515	0.0334190231362468	0.0419847328244275	11	130	772	4434	0.995732049642114	0.486044666046226	0.26556068393598	Inf	0.526090471465844	1.44504071058475	0.34576191742961	1.56625377865222	0.424788870303129	0.999032488573613	0.386166978449447	0.175080710726683	251	242
TCGA-EI-6507-01A-11D-1733-10	0	0	0	0	1086	0	41	147	188	898	36818	10	68	4	82	8320	14	63	6	83	8347	4	51	306	361	9960	5	74	293	372	10191	1	8	6	15	1206	0.0138121546961326	0.0403225806451613	0.118339711510156	0.340735836944311	0.0124378109452736	0	8	8	16	1142	0.0147329650092081	0.0443213296398892	0.114658634538153	0.386550300537037	0.0140105078809107	0.0138121546961326	15	593	2348	17803	1	0.191800869325677	0.117371070098972	Inf	0.211731849054066	0.953577512776831	0.672148124721192	0.947773202559119	0.200585586994793	1	0.181462328522869	0.000183147697995668	1071	883
TCGA-EI-6508-01A-11D-1733-10	0	1	1	2	179	2	0	2	2	175	7175	3	21	4	28	1755	5	27	5	37	1807	1	13	36	50	1738	5	11	44	60	1875	2	2	4	8	253	0.0446927374301676	0.133333333333333	0.134933333333333	0.988142292490119	0.0316205533596838	0	1	1	2	270	0.0111731843575419	0.04	0.155350978135788	0.257481481481481	0.00740740740740741	0.0391061452513966	7	79	523	3090	0.972686364289351	0.523588876719305	0.237457731680528	Inf	0.56229712303793	2.30274059910771	0.211899399030622	2.95286984075204	0.431763862332696	0.993009895742022	0.39395158503607	0.34984520123839	172	168
TCGA-EI-6510-01A-11D-1733-10	0	0	0	0	262	1	0	8	8	251	10291	2	39	2	43	2471	6	54	1	61	2753	3	10	58	71	2478	0	18	58	76	2589	0	3	5	8	413	0.0305343511450382	0.105263157894737	0.159521050598687	0.659870014018096	0.0193704600484262	1	0	2	3	340	0.0114503816793893	0.0422535211267606	0.137207425343019	0.307953603976802	0.00882352941176471	0.0305343511450382	8	111	753	4314	0.99784061396208	0.412956713309271	0.200238600643806	Inf	0.452375372459741	2.24302788844621	0.383155750982504	2.86371749698161	0.406065393598022	0.998991786025446	0.367971415109717	0.0237358101135191	254	243
TCGA-F4-6459-01A-11D-1771-10	0	0	0	0	192	1	2	5	7	181	7421	4	46	3	53	1827	4	28	1	33	2003	5	8	30	43	1755	7	10	35	52	1836	3	2	2	7	300	0.0364583333333333	0.134615384615385	0.163398692810458	0.823846153846154	0.0233333333333333	1	2	3	6	279	0.03125	0.13953488372093	0.158974358974359	0.877719429857464	0.021505376344086	0.046875	9	68	579	3012	0.890065869355919	0.688573583438201	0.34416723201548	Inf	0.724917569477155	2.06735751295337	0.1146898009189	2.60010955738195	0.477082502989239	0.985111293949776	0.433577614907222	1	183	172
TCGA-F4-6460-01A-11D-1771-10	0	0	1	1	299	2	1	3	4	291	11931	8	54	3	65	2865	8	55	2	65	3075	8	25	39	72	2973	8	19	62	89	3018	1	5	5	11	462	0.0367892976588629	0.123595505617978	0.153081510934394	0.807383627608347	0.0238095238095238	3	6	2	11	438	0.0367892976588629	0.152777777777778	0.147325933400605	1.03700532724505	0.0251141552511416	0.0367892976588629	11	106	900	5091	0.971830080617498	0.587057475469872	0.319378857374977	Inf	0.625840455840456	1.66416666666667	0.211610922366919	1.88524793685686	0.461353135313531	0.995648500135913	0.421283412896296	0.487606765542103	288	280
TCGA-F4-6569-01A-11D-1771-10	0	0	0	0	194	0	0	5	5	188	7708	1	28	9	38	1930	3	35	7	45	2089	8	12	33	53	1889	4	9	39	52	1800	1	4	1	6	312	0.0309278350515464	0.115384615384615	0.173333333333333	0.665680473372781	0.0192307692307692	4	4	5	13	280	0.0670103092783505	0.245283018867925	0.148226574907358	1.65478436657682	0.0464285714285714	0.0567010309278351	11	73	592	3097	0.808889855142102	0.788342854546596	0.423119506999122	Inf	0.816019144144144	2.59642454954955	0.0317338147244209	3.73482853268273	0.51928490990991	0.980836205079267	0.475660415392001	1	183	177
TCGA-F4-6570-01A-11D-1771-10	0	0	0	0	1747	4	43	232	275	1467	60147	29	130	35	194	14123	21	92	17	130	14044	10	92	469	571	15988	12	107	453	572	15992	1	10	9	20	1996	0.0114481969089868	0.034965034965035	0.124812406203102	0.280140700982384	0.0100200400801603	3	8	18	29	1965	0.0165998855180309	0.0507880910683012	0.122904678508882	0.41323155216285	0.0147582697201018	0.0177447052089296	31	913	3961	28019	1	0.240187051416129	0.172765521680429	Inf	0.26513271344764	1.4679488650708	0.287061693599609	1.57190360372217	0.236432111131252	1	0.213402722927449	7.17943074355837e-07	1716	1436
TCGA-F4-6703-01A-11D-1835-10	0	0	1	1	492	2	3	14	17	472	19352	5	77	13	95	4489	5	70	7	82	4540	3	24	112	139	5218	6	27	123	156	5105	1	2	0	3	644	0.00609756097560976	0.0192307692307692	0.12615083251714	0.152442666029623	0.0046583850931677	0	5	1	6	643	0.0121951219512195	0.0431654676258993	0.123227290149483	0.350291462009242	0.00933125972006221	0.0040650406504065	2	242	1287	9036	0.999999999999605	0.0580306075710755	0.0102520409955205	Inf	0.0657457296801559	0.891219891219891	0.698442750358233	0.877609287415624	0.0341318256211873	0.999999999999963	0.0300323945706068	1	490	470
TCGA-F4-6704-01A-11D-1835-10	0	0	0	0	75	0	1	1	2	73	2993	2	15	1	18	748	2	16	0	18	760	1	7	11	19	734	1	2	15	18	751	1	0	2	3	122	0.04	0.166666666666667	0.162450066577896	1.02595628415301	0.0245901639344262	0	0	0	0	96	0	0	0.130790190735695	0	0	0.04	3	25	218	1267	0.800110459177896	0.697578994028215	0.177421883848202	Inf	0.729849279161206	3.40596330275229	0.272946967029645	5.80097463066807	0.523994354269584	0.911103303155556	0.484509734981971	1	72	70
TCGA-F4-6805-01A-11D-1835-10	1	0	0	1	80	0	0	1	1	79	3239	1	11	0	12	823	2	17	2	21	891	3	5	22	30	725	0	2	14	16	800	0	1	0	1	143	0.0125	0.0625	0.17875	0.34965034965035	0.00699300699300699	0	0	0	0	117	0	0	0.161379310344828	0	0	0	0	39	260	1265	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	80	79
TCGA-F4-6806-01A-11D-1835-10	0	0	0	0	138	0	2	3	5	133	5453	3	20	3	26	1405	1	13	1	15	1396	3	9	37	49	1335	1	8	34	43	1317	0	2	2	4	198	0.0289855072463768	0.0930232558139535	0.150341685649203	0.618745595489782	0.0202020202020202	1	2	3	6	211	0.0434782608695652	0.122448979591837	0.158052434456929	0.774736434858303	0.028436018957346	0.0434782608695652	6	69	409	2243	0.980410356725463	0.476983443222176	0.200177170576119	Inf	0.518728606356968	1.62102689486553	0.488851066710463	1.82752884196217	0.456627294328317	0.989056828829775	0.415559363981046	0.140866873065015	132	127
TCGA-F4-6807-01A-11D-1835-10	0	0	0	0	197	0	1	3	4	193	7913	3	22	1	26	1935	6	23	0	29	1894	2	30	39	71	2021	6	24	37	67	2063	0	1	3	4	277	0.0203045685279188	0.0597014925373134	0.134270479883665	0.444636025647934	0.0144404332129964	0	6	4	10	282	0.050761421319797	0.140845070422535	0.13953488372093	1.0093896713615	0.0354609929078014	0.0355329949238579	7	77	559	3525	0.950832931659119	0.573328298055011	0.259943029239026	Inf	0.608825283243888	0	1	0	0.672912155164297	0.908658595098829	0.639789105730594	0.00579710144927537	190	186
TCGA-F4-6808-01A-11D-1835-10	0	0	0	0	199	0	0	0	0	199	8159	4	40	2	46	2009	1	32	2	35	2123	4	14	38	56	2009	4	16	42	62	2018	0	3	3	6	300	0.0301507537688442	0.0967741935483871	0.148662041625372	0.650967741935484	0.02	1	3	0	4	285	0.0201005025125628	0.0714285714285714	0.14186162269786	0.503508771929825	0.0140350877192982	0.0201005025125628	4	84	585	3442	0.999279207668635	0.280233954658282	0.0933999086528467	Inf	0.312898212898213	0.860470085470086	0.715367482641872	0.840572074620397	0.258141025641026	0.999598600685998	0.229286229091965	0.582043343653251	195	195
TCGA-F4-6809-01A-11D-1835-10	1	0	0	1	185	3	3	1	4	176	7216	2	33	1	36	1886	6	39	5	50	1905	5	16	19	40	1753	8	13	29	50	1672	3	2	2	7	292	0.0378378378378378	0.14	0.174641148325359	0.801643835616438	0.023972602739726	4	3	2	9	278	0.0486486486486487	0.225	0.158585282373075	1.41879496402878	0.0323741007194245	0.0594594594594595	11	50	570	2855	0.439446631356616	1.10192372303971	0.581507280883279	Inf	1.08354903652574	3.23549257759784	0.00244854062930549	5.83908590185102	0.500730994152047	0.968452566130872	0.455426089278427	0.45779368380326	174	165
TCGA-F4-6854-01A-11D-1924-10	0	0	0	0	116	0	3	3	6	109	4469	3	16	6	25	1119	1	8	1	10	1058	0	7	27	34	1162	2	8	30	40	1130	1	0	1	2	156	0.0172413793103448	0.05	0.138053097345133	0.362179487179487	0.0128205128205128	0	0	4	4	168	0.0344827586206897	0.117647058823529	0.144578313253012	0.813725490196078	0.0238095238095238	0.0517241379310345	6	53	324	1968	0.856431734764355	0.687728460951483	0.285588346366508	Inf	0.71939736346516	3.53703703703704	0.263329393008782	6.06628333542072	0.62053281351527	0.918523053714407	0.58415833416397	0.0800865800865801	110	103
TCGA-F4-6855-01A-11D-1924-10	0	0	0	0	136	0	2	3	5	130	5330	0	15	0	15	1252	1	18	1	20	1313	3	3	33	39	1399	4	16	36	56	1366	3	3	2	8	191	0.0588235294117647	0.142857142857143	0.139824304538799	1.02169035153328	0.0418848167539267	0	2	3	5	210	0.0367647058823529	0.128205128205128	0.150107219442459	0.854090354090354	0.0238095238095238	0.0588235294117647	8	68	401	2364	0.875981232210357	0.693640422676826	0.330740063850582	Inf	0.725817036356477	2.95511221945137	0.0683706372620022	4.41809271852319	0.499656655462792	0.977965352163121	0.460666163133342	0.672768878718535	128	122
TCGA-F4-6856-01A-11D-1924-10	0	0	0	0	1153	3	46	154	200	949	38909	14	75	7	96	8785	12	72	10	94	8688	7	35	345	387	10596	3	40	329	372	10840	0	3	7	10	1216	0.00867302688638335	0.0268817204301075	0.112177121771218	0.239636389360498	0.00822368421052632	3	3	4	10	1183	0.00867302688638335	0.0258397932816537	0.11164590411476	0.231444167043451	0.0084530853761623	0.0121422376409367	14	670	2399	19037	1	0.165821141334688	0.0996082294137089	Inf	0.182888094210794	2.68061692371822	0.092295419407658	3.40079389064373	0.145829802971812	1	0.131663908190531	0.0187011260426166	1139	935
TCGA-F5-6464-01A-11D-1733-10	0	0	0	0	143	0	2	3	5	137	5617	1	25	9	35	1384	3	15	7	25	1523	3	12	21	36	1297	5	10	26	41	1413	1	4	3	8	241	0.0559440559440559	0.195121951219512	0.170559094125973	1.14401376378909	0.033195020746888	0	1	0	1	221	0.00699300699300699	0.0277777777777778	0.170393215111796	0.163021618903972	0.00452488687782805	0.027972027972028	4	51	462	2248	0.989199035833843	0.381724714068997	0.125392487613223	Inf	0.426603699330972	0.733225108225108	0.775995738216824	0.695198592009811	0.374412821221332	0.991086692264722	0.331848727177191	0.576470588235294	139	133
TCGA-F5-6465-01A-11D-1733-10	1	0	0	1	215	1	0	4	4	209	8569	5	36	2	43	2225	5	39	3	47	2225	6	13	46	65	2036	5	9	40	54	2083	1	2	2	5	316	0.0232558139534884	0.0925925925925926	0.151704272683629	0.610349273323957	0.0158227848101266	3	2	2	7	314	0.0325581395348837	0.107692307692308	0.154223968565815	0.69828515433611	0.0222929936305732	0.0372093023255814	8	89	630	3489	0.98597237854465	0.497874437652989	0.239916656311464	Inf	0.539224349533628	2.37748917748918	0.0742983948927533	3.16338396324615	0.304097452934662	0.999495561196537	0.270203768826766	1	207	201
TCGA-F5-6571-01A-12D-1826-10	0	0	2	2	149	0	0	6	6	143	5863	0	24	0	24	1424	4	23	0	27	1500	1	15	25	41	1471	2	7	42	51	1468	1	1	3	5	217	0.0335570469798658	0.0980392156862745	0.147820163487738	0.663233035149544	0.0230414746543779	1	4	5	10	216	0.0671140939597315	0.24390243902439	0.146838885112169	1.66102077687444	0.0462962962962963	0.0671140939597315	10	60	433	2506	0.594220175420142	0.964594714960608	0.497034712056613	Inf	0.969646981194325	4.52501924557352	0.0590309197322355	11.5588830611061	0.810451208162421	0.788141138283091	0.784808558213666	0.0501749125437281	139	133
TCGA-F5-6702-01A-11D-1826-10	0	1	0	1	91	0	0	2	2	89	3649	0	14	2	16	879	2	15	1	18	953	1	5	17	23	873	0	8	24	32	944	0	1	2	3	142	0.032967032967033	0.09375	0.150423728813559	0.623239436619718	0.0211267605633803	1	1	1	3	110	0.032967032967033	0.130434782608696	0.126002290950745	1.03517786561265	0.0272727272727273	0.043956043956044	4	38	252	1565	0.851404543319639	0.653847654318509	0.211551355255117	Inf	0.686696900982615	7.21031746031746	0.139163916391639	Inf	0.527584204413473	0.935582770202652	0.490436347955139	0.545454545454546	87	85
TCGA-F5-6811-01A-11D-1826-10	0	0	1	1	181	0	4	2	6	175	7175	3	39	1	43	1763	0	27	2	29	1758	0	5	34	39	1793	4	4	56	64	1861	0	1	1	2	262	0.0110497237569061	0.03125	0.140784524449221	0.221970419847328	0.00763358778625954	0	0	3	3	258	0.0165745856353591	0.0769230769230769	0.143892916899052	0.53458556946929	0.0116279069767442	0.0220994475138122	4	90	520	3134	0.999552611907361	0.267922101112489	0.0893790365521972	Inf	0.299018003273322	0	1	0	0.312307692307692	0.999276927933921	0.280382379827925	0.0476190476190476	177	171
TCGA-F5-6812-01A-11D-1826-10	0	0	1	1	137	0	0	4	4	132	5412	3	23	4	30	1359	3	19	4	26	1414	2	14	21	37	1324	3	5	31	39	1315	1	1	1	3	216	0.0218978102189781	0.0769230769230769	0.16425855513308	0.468304843304843	0.0138888888888889	2	2	1	5	196	0.0364963503649635	0.135135135135135	0.148036253776435	0.912851627137342	0.0255102040816327	0.0364963503649635	5	52	412	2227	0.954097412364777	0.519848511372896	0.196188213586269	Inf	0.561871912791688	3.84320388349515	0.0299998265929088	8.09884689914492	0.246359223300971	0.998355183028467	0.216285971676966	1	132	127
TCGA-F5-6813-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	189	0	3	2	5	184	7544	2	25	5	32	1848	2	27	1	30	1905	8	12	42	62	1964	6	10	44	60	1827	3	3	5	11	259	0.0582010582010582	0.183333333333333	0.14176245210728	1.29324324324324	0.0424710424710425	3	2	4	9	266	0.0476190476190476	0.145161290322581	0.135437881873727	1.07179238418627	0.0338345864661654	0.0793650793650794	15	85	525	3266	0.415059913011344	1.09781695091772	0.646943827626889	Inf	1.08314285714286	3.09469387755102	0.0079763534670219	4.66296435900392	0.755681063122924	0.856700117031116	0.727178560535809	0.514475543396567	174	169
TCGA-G4-6293-01A-11D-1719-10	0	0	3	3	493	4	5	4	9	478	19598	11	96	4	111	4883	11	89	0	100	4652	4	29	90	123	5048	3	43	98	144	5015	0	10	8	18	685	0.0365111561866126	0.125	0.136590229312064	0.91514598540146	0.0262773722627737	1	5	6	12	657	0.0243407707910751	0.0975609756097561	0.130150554675119	0.749600920666741	0.0182648401826484	0.0304259634888438	15	180	1342	8721	0.994860682473262	0.541569897014844	0.326850928086818	Inf	0.576808437464175	1.07121566957633	0.632963632437508	1.08310209737938	0.558399657545106	0.995860691103981	0.522896252470037	0.000169860893891131	478	463
TCGA-G4-6299-01A-11D-1771-10	0	0	0	0	297	2	2	9	11	284	11644	8	43	6	57	2831	7	44	3	54	2767	10	25	49	84	2984	8	26	55	89	3062	1	3	1	5	416	0.0168350168350168	0.0561797752808989	0.135858915741346	0.413515557476232	0.0120192307692308	2	2	5	9	401	0.0303030303030303	0.107142857142857	0.134383378016086	0.797292483078019	0.0224438902743142	0.0303030303030303	9	113	817	5229	0.987731874192642	0.509799412670131	0.258973071770619	Inf	0.545919698216185	1.23337413300694	0.447363905470533	1.27999064357504	0.426937199887016	0.996469592700966	0.391893361417147	0.419710144927536	288	275
TCGA-G4-6303-01A-11D-1771-10	0	0	2	2	411	0	3	0	3	406	16646	8	95	5	108	4215	6	80	7	93	4274	2	20	81	103	4118	7	24	71	102	4039	1	8	4	13	651	0.0316301703163017	0.127450980392157	0.161178509532062	0.790744254691124	0.0199692780337942	1	4	5	10	611	0.024330900243309	0.0970873786407767	0.148372996600291	0.654346686158295	0.016366612111293	0.0267639902676399	11	150	1262	6895	0.999698688962487	0.400690337387289	0.219890486866216	Inf	0.441609000797315	1.43634442683571	0.417083180849892	1.56091108936038	0.38271019267662	0.99990818768008	0.34388889925456	0.0351425643541355	400	395
TCGA-G4-6304-01A-11D-1924-10	0	0	0	0	909	0	4	28	32	876	35916	13	83	8	104	8101	8	99	11	118	8435	7	41	265	313	9769	5	44	292	341	9611	1	3	1	5	1167	0.0055005500550055	0.0146627565982405	0.12142336905629	0.120757286774369	0.00428449014567267	3	6	5	14	1215	0.0154015401540154	0.0447284345047923	0.124373016685434	0.359631338829067	0.011522633744856	0.011001100110011	10	559	2382	16998	1	0.127663270917273	0.0688490571369406	Inf	0.142988051865264	2.7120067170445	0.0501896869111591	3.56800894399479	0.0876411506405763	1	0.0777103635876758	0.713981956473614	899	866
TCGA-G4-6306-01A-11D-1771-10	0	0	1	1	311	3	0	7	7	300	12300	5	77	1	83	2974	3	71	1	75	3180	2	10	52	64	3009	1	20	57	78	3137	1	5	6	12	506	0.0385852090032154	0.153846153846154	0.161300605674211	0.953785345089693	0.0237154150197628	0	1	1	2	449	0.00643086816720257	0.03125	0.149219009637753	0.209423719376392	0.0044543429844098	0.0257234726688103	8	104	955	5191	0.997491252630245	0.418164055066375	0.202620709137012	Inf	0.459685863874346	2.14520069808028	0.397714413186381	2.71708313152217	0.413295547336568	0.998801790222115	0.373071583402315	0.0328502415458937	303	292
TCGA-G4-6307-01A-11D-1719-10	0	0	2	2	358	1	3	2	5	349	14309	8	85	2	95	3575	20	51	2	73	3607	4	29	56	89	3643	1	27	64	92	3484	1	5	2	8	490	0.0223463687150838	0.0869565217391304	0.140642939150402	0.618278615794144	0.0163265306122449	2	5	1	8	551	0.0223463687150838	0.0898876404494382	0.151248970628603	0.5943024939334	0.014519056261343	0.0167597765363128	6	119	1041	6086	0.999870152226129	0.29480314319743	0.125765475887264	Inf	0.328622478386167	4.10778097982709	0.0248361348394707	8.76488111087769	0.171157540826129	0.999998468654974	0.149925444110346	1	352	343
TCGA-G4-6309-01A-21D-1835-10	0	0	0	0	1004	1	42	125	167	835	34235	6	92	7	105	7787	5	92	8	105	7932	7	30	279	316	9286	5	24	280	309	9230	0	0	5	5	1160	0.0049800796812749	0.0161812297734628	0.125677139761647	0.128752371387122	0.00431034482758621	0	5	4	9	1127	0.00896414342629482	0.0284810126582278	0.121365496446263	0.234671413970101	0.00798580301685892	0.00896414342629482	9	562	2287	16229	1	0.113646211836257	0.0589345977773403	Inf	0.127610793359558	0	1	0	0.130350202161552	1	0.116125745348206	0.000579710144927536	995	826
TCGA-G4-6310-01A-11D-1719-10	0	0	2	2	315	1	1	3	4	310	12710	3	60	1	64	3065	5	56	1	62	3070	4	20	59	83	3327	4	20	77	101	3248	1	3	8	12	470	0.0380952380952381	0.118811881188119	0.144704433497537	0.821065936380872	0.025531914893617	0	2	2	4	436	0.0126984126984127	0.0481927710843374	0.131048993086865	0.367746214214657	0.00917431192660551	0.0349206349206349	11	133	906	5669	0.991749035307339	0.517552696101182	0.283101781583211	Inf	0.554367488349276	0.907146799116998	0.694751995422097	0.893871772617594	0.533615764186469	0.992914998979065	0.496643378699983	0.00205381180377553	304	299
TCGA-G4-6315-01A-11D-1719-10	0	0	1	1	383	1	3	5	8	374	15334	5	66	3	74	3883	11	49	2	62	3769	8	37	75	120	3898	5	28	85	118	3784	4	3	4	11	525	0.0287206266318538	0.0932203389830508	0.138742071881607	0.671896690879742	0.020952380952381	4	8	5	17	574	0.0443864229765013	0.141666666666667	0.147255002565418	0.962049941927991	0.029616724738676	0.0443864229765013	17	156	1099	6583	0.967500122955713	0.652787475088122	0.405253142045523	Inf	0.686877718577582	4.30153286204242	0.00011738979567172	9.57906735591984	0.393186988171065	0.99984114113471	0.357050822267779	1	366	357
TCGA-G4-6317-01A-11D-1719-10	0	0	1	1	284	3	0	4	4	276	11316	9	41	3	53	2884	11	41	0	52	2855	2	17	51	70	2738	2	18	81	101	2839	1	7	5	13	425	0.0457746478873239	0.128712871287129	0.149700598802395	0.85980198019802	0.0305882352941176	0	3	4	7	408	0.0246478873239437	0.1	0.149013878743608	0.671078431372549	0.017156862745098	0.0352112676056338	10	126	833	4744	0.997441307366374	0.452035511030281	0.239063738326083	Inf	0.492285149353859	1.67376950780312	0.476704777353527	1.89801458184506	0.456482593037215	0.998537467681424	0.416758078510991	0.0083617341681858	274	266
TCGA-G4-6321-01A-11D-1719-10	0	0	0	0	309	1	0	3	3	304	12464	4	62	1	67	3058	5	77	0	82	3090	1	16	63	80	3095	1	19	55	75	3221	1	4	3	8	460	0.0258899676375405	0.106666666666667	0.142812791058677	0.746898550724638	0.0173913043478261	0	2	4	6	447	0.0194174757281553	0.075	0.144426494345719	0.519295302013423	0.0134228187919463	0.0258899676375405	8	112	907	5409	0.997033011132334	0.426012736655611	0.206735020095826	Inf	0.464241087835355	3.48180815876516	0.266797819116958	5.96091141999911	0.413095883243324	0.998738283514122	0.376123146728536	0.0328502415458937	301	296
TCGA-G4-6323-01A-11D-1719-10	0	0	1	1	269	1	2	1	3	263	10783	5	50	0	55	2773	10	39	1	50	2784	4	20	55	79	2700	4	17	58	79	2526	1	3	2	6	394	0.0223048327137546	0.0759493670886076	0.155977830562154	0.486924114887875	0.0152284263959391	1	5	6	12	404	0.0446096654275093	0.151898734177215	0.14962962962963	1.01516480762	0.0297029702970297	0.0371747211895911	10	111	798	4428	0.99204162246276	0.499952711269097	0.263614731165456	Inf	0.541229105822407	1.63721804511278	0.351851143392803	1.84934118871913	0.463636968527513	0.997161231274668	0.422819529399531	0.0599078341013823	259	253
TCGA-G4-6586-01A-11D-1771-10	0	0	1	1	1486	8	35	232	267	1211	49651	11	148	16	175	11359	7	147	16	170	11409	10	75	337	422	13363	6	65	373	444	13520	2	8	6	16	1623	0.0107671601615074	0.036036036036036	0.120044378698225	0.300189283553424	0.00985828712261245	1	6	9	16	1591	0.0107671601615074	0.037914691943128	0.119060091296864	0.318450049299823	0.0100565681961031	0.0121130551816958	18	708	3214	23669	1	0.187235224687628	0.120242190650764	Inf	0.207380417285944	1.56831440572495	0.297996019533411	1.69941715535361	0.176711482335206	1	0.158948121484975	0.0017340171838652	1468	1193
TCGA-G4-6588-01A-11D-1771-10	0	0	0	0	2546	4	72	353	425	2114	86674	27	261	25	313	19980	35	288	15	338	20186	10	127	613	750	23185	16	125	572	713	23323	1	10	24	35	2887	0.0137470542026709	0.0490883590462833	0.123783389786906	0.396566608256483	0.0121233113959127	1	8	16	25	2786	0.00981932443047918	0.0333333333333333	0.120163899072676	0.277398899258196	0.00897343862167983	0.016496465043205	42	1169	5673	40835	1	0.258619760194316	0.195540842406617	Inf	0.284328260118664	0.63062550000678	0.843306246534426	0.599850202764477	0.276730177218165	1	0.251467313485051	3.58822246086648e-14	2504	2072
TCGA-G4-6625-01A-21D-1771-10	0	0	0	0	234	0	3	2	5	229	9389	2	45	2	49	2341	5	50	0	55	2448	6	14	43	63	2379	7	17	38	62	2221	2	3	1	6	339	0.0256410256410256	0.0967741935483871	0.152633948671769	0.634027976020554	0.0176991150442478	3	1	2	6	356	0.0256410256410256	0.0952380952380952	0.149642707019756	0.636436597110754	0.0168539325842697	0.0341880341880342	8	86	695	3905	0.979228178779528	0.522730771634615	0.251801367237177	Inf	0.563294045614572	2.54565578306585	0.0355209440651599	3.51032289050497	0.24513722355449	0.999780432798036	0.21614529970278	0.666846143491722	226	221
TCGA-G4-6626-01A-11D-1771-10	0	0	2	2	444	0	0	4	4	439	17999	6	69	0	75	4514	8	98	0	106	4499	4	36	84	124	4495	6	39	89	134	4491	1	8	6	15	646	0.0337837837837838	0.111940298507463	0.143843242039635	0.778210341481447	0.0232198142414861	0	8	5	13	629	0.0292792792792793	0.104838709677419	0.139933259176863	0.749205087440382	0.0206677265500795	0.027027027027027	12	171	1275	7711	0.999572904718991	0.424437751218148	0.240026242208847	Inf	0.462153648344584	0.70478431372549	0.783569137352014	0.672009077039087	0.44812875439193	0.99958620502118	0.410683686990821	0.00226259913841089	432	427
TCGA-G4-6628-01A-11D-1835-10	0	0	0	0	2082	2	111	218	329	1751	71791	15	146	16	177	16472	14	134	12	160	16952	13	104	608	725	19019	16	124	549	689	19348	1	15	17	33	2425	0.015850144092219	0.0478955007256894	0.125335952036386	0.382136968264181	0.0136082474226804	1	11	9	21	2310	0.0100864553314121	0.0289655172413793	0.121457489878543	0.23848275862069	0.00909090909090909	0.0134486071085495	28	1158	4735	33632	1	0.171748267336711	0.121460822756021	Inf	0.191298339835925	0.558817317845829	0.888503454308643	0.526144630533454	0.182086541769989	1	0.163287817609061	9.20367304938498e-08	2054	1723
TCGA-G5-6235-01A-11D-1733-10	0	0	2	2	268	1	0	0	0	267	10947	5	28	4	37	2667	7	28	3	38	2865	1	25	55	81	2660	3	32	76	111	2755	0	8	6	14	426	0.0522388059701493	0.126126126126126	0.154627949183303	0.815674829759337	0.0328638497652582	0	7	1	8	366	0.0298507462686567	0.0987654320987654	0.137593984962406	0.717803413613978	0.0218579234972678	0.0261194029850746	7	128	792	4623	0.999845922329928	0.319260678853998	0.146642842808331	Inf	0.354517396184063	0	1	0	0.365342354846172	0.999758821225047	0.329558607799809	0.00890091190715127	261	260
TCGA-G5-6641-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	121	2	1	3	4	115	4715	1	16	2	19	1166	5	20	1	26	1240	2	9	31	42	1132	3	3	22	28	1177	2	0	0	2	187	0.0165289256198347	0.0714285714285714	0.158878504672897	0.449579831932773	0.0106951871657754	0	3	0	3	161	0.0247933884297521	0.0714285714285714	0.142226148409894	0.502218278615794	0.0186335403726708	0.0165289256198347	2	56	348	1961	0.9990642955839	0.201330394473694	0.0348241646547092	Inf	0.228795085216013	2.65402298850575	0.16694524647525	3.75359405005221	0	1	0	0.444444444444444	119	113
Totals	9	10	183	202	217412	522	3188	10085	13273	203135	8328535	2563	20568	5232	28363	2051164	2809	19887	5393	28089	2075853	1968	18117	52357	72442	2095405	2045	18563	53633	74241	2106113	512	8673	2502	11687	299615	0.0537550825161445	0.157419754583047	0.142259698316282	1.10656606506405	0.0390067252974651	487	8492	2416	11395	295481	0.0524120103766121	0.157298252395019	0.14101378969698	1.11548134925693	0.0385642393250327	0.0272156090740162	5917	104086	595096	3606422	1	0.344506509933148	0.336901147081345	Inf	0.379766137259937	1.75758171537433	4.68277598988608e-72	2.00874315788173	0.327599197784769	1	0.294880607944002	0	211495	197218
