# Non-clustered (scattered) mutations all scattered mutation 
Sample	A_T_coord_clusters	G_C_coord_clusters	Non_coord_clusters	clusters	mutations	complex	insertions	deletions	indels	substitutions	bases	A_to_T	A_to_G	A_to_C	A	a	T_to_A	T_to_C	T_to_G	T	t	G_to_C	G_to_T	G_to_A	G	g	C_to_G	C_to_A	C_to_T	C	c	tCw_to_G	tCw_to_A	tCw_to_T	tCw	tcw	tCw_per_mut	tCw_per_C	tcw_per_c	enrich_tCw	freq_tCw	wGa_to_C	wGa_to_T	wGa_to_A	wGa	wga	wGa_per_mut	wGa_per_G	wga_per_g	enrich_wGa	freq_wGa	[tCw_to_G+tCw_to_T]_per_mut	tCw_to_G+tCw_to_T	[(C_to_G)+(C_to_T)]-[(tCw_to_G)+(tCw_to_T)]	tcw+wga	c-tcw	Fisher_p-value_tCw	odds_ratio_tCw	95%_confidence_lower_tCw	95%_confidence_upper_tCw	APOBEC_enrich	tCw_to_G_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_G	odds_ratio_tCw_to_G	tCw_to_T_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_T	odds_ratio_tCw_to_T	p-value_GvT_skew	non-APOBEC_mutations	non-APOBEC_substitutions
TCGA-02-0003-01A-01D-1490-08	0	0	0	0	60	0	0	0	0	60	2460	2	3	0	5	600	1	4	1	6	583	1	4	21	26	620	0	4	19	23	657	0	1	2	3	87	0.05	0.130434782608696	0.132420091324201	0.985007496251874	0.0344827586206897	0	0	0	0	67	0	0	0.108064516129032	0	0	0.0333333333333333	2	39	154	1123	0.964848701415705	0.374154193442444	0.0637112090425796	Inf	0.404497941083307	0	1	0	0.41461038961039	0.960956913079974	0.383996939612475	0.4	58	58
TCGA-02-0033-01A-01D-1490-08	0	0	0	0	49	0	2	1	3	46	1886	1	4	0	5	434	0	1	1	2	438	0	2	17	19	517	0	3	17	20	497	0	0	0	0	65	0	0	0.130784708249497	0	0	0	0	2	2	64	0.0408163265306122	0.105263157894737	0.123791102514507	0.850328947368421	0.03125	0.0408163265306122	2	32	129	885	0.940404934997853	0.42903393747684	0.0723919500334705	Inf	0.462380300957592	NaN	1	0	0.462380300957592	0.940404934997853	0.42903393747684	0.333333333333333	47	44
TCGA-02-0047-01A-01D-1490-08	0	0	0	0	83	0	1	4	5	78	3198	2	3	1	6	758	6	6	3	15	789	3	2	27	32	856	1	2	22	25	795	0	0	4	4	107	0.0481927710843374	0.16	0.134591194968553	1.18878504672897	0.0373831775700935	0	0	1	1	110	0.0120481927710843	0.03125	0.128504672897196	0.243181818181818	0.00909090909090909	0.0602409638554217	5	48	217	1434	0.841250635703014	0.68849739547163	0.257839594035694	Inf	0.717763672724111	0	1	0	0.776356625599549	0.788114341263155	0.751057612232898	0.00793650793650794	78	73
TCGA-02-0055-01A-01D-1490-08	0	0	0	0	77	0	0	0	0	77	3157	4	6	0	10	746	2	5	2	9	741	1	2	28	31	838	2	3	22	27	832	0	0	0	0	99	0	0	0.118990384615385	0	0	0	1	1	2	100	0.025974025974026	0.0645161290322581	0.119331742243437	0.540645161290323	0.02	0.012987012987013	1	52	199	1471	0.998701771420728	0.14223392331531	0.00709216399189491	Inf	0.158338864131981	0	1	0	0.167839195979899	0.998119788561014	0.150941150797638	1	76	76
TCGA-02-2470-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	82	0	0	5	5	77	3157	0	7	2	9	774	2	7	3	12	739	2	4	17	23	839	4	5	24	33	805	0	0	3	3	102	0.0365853658536585	0.0909090909090909	0.126708074534161	0.7174688057041	0.0294117647058824	1	0	1	2	94	0.024390243902439	0.0869565217391304	0.112038140643623	0.776133209990749	0.0212765957446809	0.0609756097560976	5	42	196	1448	0.674481978288209	0.879529178770549	0.327282379963197	Inf	0.892314372557534	1.39795918367347	0.534249367751936	1.47714006093853	0.818317570930811	0.736440829099795	0.798774605653062	0.206349206349206	77	72
TCGA-02-2483-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	71	0	1	1	2	67	2747	3	7	1	11	707	1	12	1	14	657	3	9	12	24	693	1	4	13	18	690	0	3	0	3	69	0.0422535211267606	0.166666666666667	0.1	1.66666666666667	0.0434782608695652	1	1	0	2	99	0.028169014084507	0.0833333333333333	0.142857142857143	0.583333333333333	0.0202020202020202	0.0140845070422535	1	28	168	1215	0.976164167043053	0.258441873222778	0.0127570217618534	Inf	0.283866995073892	2.05803571428571	0.405677510487568	2.4086150423466	0	1	0	1	70	66
TCGA-02-2485-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	74	0	1	5	6	68	2788	0	6	2	8	634	1	3	1	5	624	2	4	26	32	776	1	4	18	23	754	0	1	0	1	81	0.0135135135135135	0.0434782608695652	0.107427055702918	0.404723564143854	0.0123456790123457	0	0	0	0	97	0	0	0.125	0	0	0	0	47	178	1352	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	74	68
TCGA-02-2486-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	71	0	1	2	3	68	2788	0	3	2	5	608	3	1	1	5	681	0	3	27	30	726	1	3	24	28	773	0	1	0	1	106	0.0140845070422535	0.0357142857142857	0.137128072445019	0.26044474393531	0.00943396226415094	0	1	0	1	72	0.0140845070422535	0.0333333333333333	0.0991735537190083	0.336111111111111	0.0138888888888889	0	0	52	178	1321	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	71	68
TCGA-06-0119-01A-08D-1490-08	0	0	0	0	80	0	0	1	1	79	3239	1	2	2	5	695	3	7	1	11	836	1	4	24	29	876	3	6	25	34	832	0	0	0	0	112	0	0	0.134615384615385	0	0	0	0	2	2	111	0.025	0.0689655172413793	0.126712328767123	0.544268406337372	0.018018018018018	0.025	2	51	223	1485	0.994264361401241	0.261268235424201	0.0449534466758137	Inf	0.289026144343853	0	1	0	0.312620115310698	0.990750939836323	0.283499332407013	0.333333333333333	78	77
TCGA-06-0122-01A-01D-1490-08	0	0	0	0	94	0	0	3	3	91	3731	4	3	2	9	887	0	3	1	4	877	7	2	27	36	959	6	3	33	42	1008	1	1	3	5	125	0.0531914893617021	0.119047619047619	0.124007936507937	0.96	0.04	3	0	0	3	126	0.0319148936170213	0.0833333333333333	0.131386861313869	0.634259259259259	0.0238095238095238	0.074468085106383	7	66	251	1716	0.836498687594395	0.725202470539056	0.32544240853358	Inf	0.751459913769579	2.41127796506283	0.0748343439232691	3.0360527559663	0.391832669322709	0.986122307080782	0.359948911899102	1	87	84
TCGA-06-0124-01A-01D-1490-08	0	0	0	0	73	0	1	3	4	68	2788	0	0	0	0	586	1	2	1	4	643	4	2	26	32	749	3	8	21	32	810	0	2	2	4	95	0.0547945205479452	0.125	0.117283950617284	1.06578947368421	0.0421052631578947	1	0	0	1	73	0.0136986301369863	0.03125	0.0974632843791722	0.320633561643836	0.0136986301369863	0.0410958904109589	3	51	168	1391	0.938287577225382	0.487212184695782	0.127482894832921	Inf	0.515542328042328	1.32568027210884	0.551124470785787	1.37963377657225	0.394883485309017	0.967635012004201	0.368147076594839	1	70	65
TCGA-06-0126-01A-01D-1490-08	0	0	0	0	66	0	1	2	3	63	2583	4	4	1	9	677	1	3	3	7	541	0	5	17	22	681	1	6	18	25	684	0	1	0	1	64	0.0151515151515152	0.04	0.0935672514619883	0.4275	0.015625	0	1	1	2	105	0.0303030303030303	0.0909090909090909	0.154185022026432	0.58961038961039	0.019047619047619	0.0151515151515152	1	35	169	1196	0.991086463129037	0.202327965639064	0.0100616602202597	Inf	0.224358974358974	0	1	0	0.230769230769231	0.989855511652137	0.208277675068277	1	65	62
TCGA-06-0128-01A-01D-1490-08	0	0	0	0	80	0	1	3	4	76	3116	2	15	2	19	760	1	8	3	12	727	6	1	18	25	788	3	3	14	20	841	1	1	0	2	99	0.025	0.1	0.117717003567182	0.84949494949495	0.0202020202020202	0	0	1	1	121	0.0125	0.04	0.153553299492386	0.260495867768595	0.00826446280991736	0.025	2	39	220	1409	0.980053742403008	0.328584916186264	0.0560943234126728	Inf	0.36119733924612	0.822727272727273	0.72959834770535	0.800668674098006	0.231392045454545	0.990100962069271	0.206710213546831	1	78	74
TCGA-06-0129-01A-01D-1490-08	0	0	0	0	52	0	1	9	10	42	1722	0	4	1	5	403	0	0	1	1	409	2	2	11	15	451	4	0	17	21	459	2	0	2	4	47	0.0769230769230769	0.19047619047619	0.10239651416122	1.86018237082067	0.0851063829787234	1	1	1	3	70	0.0576923076923077	0.2	0.155210643015521	1.28857142857143	0.0428571428571429	0.115384615384615	6	28	117	793	0.275558875143155	1.45172626168874	0.575870242187438	Inf	1.37254901960784	3.88888888888889	0.0325532788543526	6.75219513458824	0.833333333333333	0.717462135763586	0.813500188891258	1	46	36
TCGA-06-0130-01A-01D-1490-08	0	0	0	0	36	0	0	1	1	35	1435	0	2	1	3	352	2	2	2	6	325	1	3	10	14	392	1	1	10	12	366	0	0	1	1	39	0.0277777777777778	0.0833333333333333	0.10655737704918	0.782051282051282	0.0256410256410256	0	0	1	1	56	0.0277777777777778	0.0714285714285714	0.142857142857143	0.5	0.0178571428571429	0.0555555555555556	2	20	95	663	0.782119005322352	0.698178376992047	0.114684242905506	Inf	0.725358851674641	0	1	0	0.797894736842105	0.735505615190737	0.775670331203372	0.333333333333333	34	33
TCGA-06-0132-01A-02D-1491-08	0	0	0	0	36	0	0	1	1	35	1435	0	2	1	3	324	1	3	0	4	376	0	0	15	15	354	1	1	11	13	381	1	0	0	1	61	0.0277777777777778	0.0769230769230769	0.16010498687664	0.480453972257251	0.0163934426229508	0	0	0	0	44	0	0	0.124293785310734	0	0	0.0277777777777778	1	26	105	630	0.983764679408878	0.231037252896755	0.0113335733296483	Inf	0.259259259259259	7	0.144021739130435	Inf	0	1	0	1	35	34
TCGA-06-0137-01A-01D-1490-08	0	0	0	0	103	0	1	2	3	100	4100	0	4	0	4	983	1	1	1	3	852	2	6	45	53	1155	0	5	35	40	1110	0	0	2	2	119	0.0194174757281553	0.05	0.107207207207207	0.466386554621849	0.0168067226890756	0	1	0	1	155	0.00970873786407767	0.0188679245283019	0.134199134199134	0.140596469872185	0.00645161290322581	0.0194174757281553	2	80	274	1991	0.999642572823257	0.181732747403242	0.0315747410767366	Inf	0.20162008189425	0	1	0	0.206660583941606	0.999551222590795	0.186392090403803	0.4	101	98
TCGA-06-0139-01A-01D-1490-08	0	0	0	0	8	0	0	0	0	8	328	0	0	0	0	78	0	0	0	0	85	0	0	4	4	89	0	3	1	4	76	0	0	0	0	15	0	0	0.197368421052632	0	0	0	0	0	0	14	0	0	0.157303370786517	0	0	0	0	5	29	136	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	8	8
TCGA-06-0140-01A-01D-1490-08	0	0	0	0	53	0	1	1	2	51	2091	1	2	0	3	489	0	2	0	2	480	0	1	24	25	621	2	1	18	21	501	0	0	1	1	67	0.0188679245283019	0.0476190476190476	0.13373253493014	0.356076759061834	0.0149253731343284	0	0	0	0	72	0	0	0.115942028985507	0	0	0.0188679245283019	1	43	139	983	0.996791134257334	0.164599225753663	0.00822174500892766	Inf	0.183453237410072	0	1	0	0.192189105858171	0.995855188383797	0.17262693100784	1	52	50
TCGA-06-0141-01A-01D-1490-08	0	0	0	0	31	0	0	0	0	31	1271	1	9	0	10	345	0	7	1	8	354	1	2	7	10	305	0	2	1	3	267	0	0	0	0	43	0	0	0.161048689138577	0	0	0	0	0	0	52	0	0	0.170491803278689	0	0	0	0	9	95	477	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	31	31
TCGA-06-0142-01A-01D-1490-08	0	0	0	0	56	0	0	1	1	55	2255	0	2	2	4	539	1	2	0	3	517	2	1	24	27	622	1	2	18	21	577	0	0	0	0	77	0	0	0.133448873483536	0	0	0	0	0	0	79	0	0	0.127009646302251	0	0	0	0	45	156	1043	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	56	55
TCGA-06-0145-01A-01W-0224-08	0	0	0	0	108	0	0	2	2	106	4346	3	9	0	12	1029	3	4	0	7	1019	3	5	36	44	1132	1	6	36	43	1166	0	2	0	2	143	0.0185185185185185	0.0465116279069767	0.122641509433962	0.379248658318426	0.013986013986014	0	0	0	0	139	0	0	0.122791519434629	0	0	0	0	76	282	2016	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	108	106
TCGA-06-0151-01A-01D-1491-08	0	0	0	0	29	0	0	2	2	27	1107	1	1	1	3	259	0	1	0	1	241	1	2	11	14	289	1	0	8	9	318	0	0	1	1	37	0.0344827586206897	0.111111111111111	0.116352201257862	0.954954954954955	0.027027027027027	1	1	0	2	45	0.0689655172413793	0.142857142857143	0.155709342560554	0.917460317460317	0.0444444444444444	0.0689655172413793	2	19	82	525	0.796958619001917	0.674311558328318	0.110135935773491	Inf	0.704994192799071	3.70121951219512	0.254196914700545	6.36981632623705	0.389602053915276	0.935767204519519	0.356098131744	1	27	25
TCGA-06-0152-01A-02W-0323-08	0	0	0	0	78	0	1	3	4	74	3034	1	1	4	6	709	0	4	4	8	679	4	7	25	36	833	1	5	18	24	813	0	0	0	0	96	0	0	0.118081180811808	0	0	2	1	0	3	106	0.0384615384615385	0.0833333333333333	0.127250900360144	0.654874213836478	0.0283018867924528	0.0256410256410256	2	46	202	1444	0.985003096210385	0.310945181690897	0.053352358652631	Inf	0.339521452145215	3.25940594059406	0.11807064852442	4.7584459660952	0	1	0	0.4	76	72
TCGA-06-0154-01A-03D-1491-08	0	0	0	0	77	0	0	1	1	76	3116	1	5	0	6	720	0	3	1	4	730	5	1	29	35	856	1	4	26	31	810	1	0	2	3	96	0.038961038961039	0.0967741935483871	0.118518518518519	0.816532258064516	0.03125	1	0	1	2	104	0.025974025974026	0.0571428571428571	0.121495327102804	0.47032967032967	0.0192307692307692	0.0649350649350649	5	56	200	1466	0.868844878798044	0.654603246649873	0.246348152724157	Inf	0.682786885245902	2.77666666666667	0.157130256003531	3.66063242789137	0.454363636363636	0.966952045165212	0.423038520323126	1	72	71
TCGA-06-0155-01B-01D-1492-08	0	0	0	0	88	0	0	3	3	85	3485	1	9	2	12	828	4	3	2	9	867	2	5	29	36	883	3	3	22	28	907	2	1	1	4	129	0.0454545454545455	0.142857142857143	0.142227122381477	1.00442967884828	0.0310077519379845	0	2	0	2	114	0.0227272727272727	0.0555555555555556	0.129105322763307	0.430311890838207	0.0175438596491228	0.0340909090909091	3	53	243	1547	0.985776612321999	0.360492058175045	0.0947150947895966	Inf	0.394620811287478	2.94650205761317	0.140234251949318	4.23921528865364	0.144436375373195	0.999363309831	0.127395154490176	1	85	82
TCGA-06-0157-01A-01D-1491-08	0	0	0	0	63	0	1	3	4	59	2419	4	2	0	6	569	0	3	0	3	543	1	4	21	26	621	2	2	20	24	686	0	0	0	0	79	0	0	0.115160349854227	0	0	0	0	0	0	61	0	0	0.0982286634460548	0	0	0	0	44	140	1167	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	63	59
TCGA-06-0158-01A-01D-1491-08	0	0	0	0	67	1	0	1	1	65	2665	2	2	1	5	645	3	3	2	8	625	4	1	21	26	692	4	0	22	26	703	1	0	1	2	88	0.0298507462686567	0.0769230769230769	0.125177809388336	0.61451048951049	0.0227272727272727	0	0	2	2	86	0.0298507462686567	0.0769230769230769	0.124277456647399	0.618962432915921	0.0232558139534884	0.0597014925373134	4	47	174	1221	0.892320630630997	0.597390702998672	0.194287092359899	Inf	0.628803245436105	1.00215517241379	0.656532485615695	1.00246133096032	0.55934242181235	0.915738773787057	0.526481065286334	0.485714285714286	63	61
TCGA-06-0165-01A-01D-1491-08	0	0	0	0	8	0	0	0	0	8	328	0	0	0	0	72	0	2	0	2	93	0	0	1	1	80	0	1	4	5	83	0	0	0	0	9	0	0	0.108433734939759	0	0	0	0	0	0	17	0	0	0.2125	0	0	0	0	5	26	137	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	8	8
TCGA-06-0166-01A-01D-1491-08	0	0	0	0	56	0	2	1	3	53	2173	0	4	1	5	499	1	0	2	3	532	2	1	17	20	547	2	6	17	25	595	0	0	1	1	72	0.0178571428571429	0.04	0.121008403361345	0.330555555555556	0.0138888888888889	0	0	2	2	72	0.0357142857142857	0.1	0.131627056672761	0.759722222222222	0.0277777777777778	0.0535714285714286	3	35	144	998	0.872613504753196	0.594266766720591	0.153125408653558	Inf	0.62609649122807	0	1	0	0.699754901960784	0.819378461452666	0.670897314331603	0.1	53	50
TCGA-06-0167-01A-01D-1491-08	0	0	0	0	6	0	0	0	0	6	246	0	0	0	0	71	0	0	0	0	59	0	0	3	3	59	0	0	3	3	57	0	0	0	0	10	0	0	0.175438596491228	0	0	0	0	0	0	7	0	0	0.11864406779661	0	0	0	0	6	17	99	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	6	6
TCGA-06-0168-01A-01D-1491-08	0	0	0	0	52	0	0	3	3	48	1968	1	3	1	5	474	0	7	1	8	482	4	3	15	22	498	2	1	10	13	514	0	0	0	0	58	0	0	0.11284046692607	0	0	1	0	0	1	79	0.0192307692307692	0.0454545454545455	0.15863453815261	0.286536248561565	0.0126582278481013	0.0192307692307692	1	30	137	875	0.988541352935421	0.213078979190451	0.0105310180863904	Inf	0.238285848834471	1.23114355231144	0.58370429117048	1.27703588687915	0	1	0	1	51	47
TCGA-06-0169-01A-01D-1490-08	0	0	0	0	69	0	1	3	4	65	2665	0	3	2	5	597	0	11	0	11	591	1	3	14	18	699	2	1	28	31	778	1	0	0	1	71	0.0144927536231884	0.032258064516129	0.0912596401028278	0.353475692866879	0.0140845070422535	0	1	0	1	96	0.0144927536231884	0.0555555555555556	0.137339055793991	0.404513888888889	0.0104166666666667	0.0144927536231884	1	44	167	1310	0.995231442760509	0.178388376958584	0.00892404665609576	Inf	0.196540252827678	2.94810379241517	0.30352826043785	3.91596813357989	0	1	0	1	68	64
TCGA-06-0173-01A-01D-1491-08	0	0	0	0	103	0	1	3	4	99	4059	4	4	0	8	890	4	7	0	11	961	4	8	29	41	1131	1	6	32	39	1077	0	0	1	1	121	0.00970873786407767	0.0256410256410256	0.112349117920149	0.22822631913541	0.00826446280991736	0	1	2	3	151	0.029126213592233	0.0731707317073171	0.133510167992927	0.548053626231627	0.0198675496688742	0.029126213592233	3	63	272	1936	0.990518316642628	0.339044135555574	0.0895655512970935	Inf	0.368983957219251	0	1	0	0.399228543876567	0.984306214201792	0.368266353824822	0.142857142857143	100	96
TCGA-06-0174-01A-01D-1491-08	0	0	0	0	100	0	4	2	6	94	3854	1	4	3	8	883	0	5	1	6	891	4	9	28	41	1015	2	4	33	39	1065	0	0	1	1	130	0.01	0.0256410256410256	0.122065727699531	0.210059171597633	0.00769230769230769	0	0	0	0	122	0	0	0.120197044334975	0	0	0.01	1	66	252	1828	0.999804737194103	0.109961080260392	0.00550507010037569	Inf	0.123193556029377	0	1	0	0.135310954983086	0.999585296222554	0.120956387922895	1	99	93
TCGA-06-0178-01A-01D-1491-08	0	0	0	0	2	0	0	1	1	1	41	0	0	0	0	19	0	1	0	1	4	0	0	0	0	10	0	0	0	0	8	0	0	0	0	0	0	NaN	0	NaN	NaN	0	0	0	0	1	0	NaN	0.1	NaN	0	0	0	0	1	17	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	2	1
TCGA-06-0184-01A-01D-1491-08	0	0	0	0	67	0	0	3	3	64	2624	1	1	2	4	648	2	3	0	5	570	2	2	25	29	719	3	1	22	26	687	0	1	0	1	81	0.0149253731343284	0.0384615384615385	0.117903930131004	0.326210826210826	0.0123456790123457	0	0	0	0	89	0	0	0.123783031988873	0	0	0	0	52	170	1236	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	67	64
TCGA-06-0185-01A-01W-0254-08	0	0	0	0	84	0	0	3	3	81	3321	1	3	1	5	773	4	1	0	5	732	3	3	18	24	873	2	3	42	47	943	0	0	4	4	109	0.0476190476190476	0.0851063829787234	0.11558854718982	0.736287331641616	0.036697247706422	1	0	2	3	96	0.0357142857142857	0.125	0.109965635738832	1.13671875	0.03125	0.0833333333333333	7	58	205	1611	0.612136214246166	0.948464439091813	0.422770330373974	Inf	0.953996247654784	1.77170731707317	0.451712729197444	1.96376172561678	0.885853658536585	0.684173106044057	0.873201163110514	0.0291375291375292	77	74
TCGA-06-0188-01A-01W-0254-08	0	0	0	0	57	0	0	3	3	53	2173	1	6	0	7	496	0	5	1	6	507	0	2	16	18	547	2	1	19	22	623	0	0	1	1	79	0.0175438596491228	0.0454545454545455	0.126805778491172	0.358457997698504	0.0126582278481013	0	1	1	2	60	0.0350877192982456	0.111111111111111	0.109689213893967	1.01296296296296	0.0333333333333333	0.0350877192982456	2	35	139	1031	0.943208018122074	0.424063521903227	0.0718584719385386	Inf	0.454987361462182	0	1	0	0.480986639260021	0.930469759419918	0.449753173332013	0.4	55	51
TCGA-06-0189-01A-01D-1491-08	0	0	0	0	29	0	0	0	0	29	1189	1	2	3	6	279	0	2	1	3	300	1	1	10	12	300	2	1	5	8	310	0	0	0	0	46	0	0	0.148387096774194	0	0	0	0	0	0	44	0	0	0.146666666666667	0	0	0	0	18	90	520	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	29	29
TCGA-06-0192-01B-01W-0348-08	0	0	0	0	84	0	4	1	5	79	3239	0	5	3	8	811	5	2	2	9	754	4	2	31	37	861	1	2	22	25	813	0	1	2	3	103	0.0357142857142857	0.12	0.126691266912669	0.947184466019417	0.029126213592233	2	0	0	2	106	0.0238095238095238	0.0540540540540541	0.123112659698026	0.439061703212647	0.0188679245283019	0.0476190476190476	4	54	209	1465	0.940343868401552	0.519384452616628	0.170020222773091	Inf	0.552384095033823	3.20382775119617	0.121601893331544	4.66627148831298	0.302247901056243	0.992278392486985	0.275014266299048	1	80	75
TCGA-06-0195-01B-01D-1491-08	0	0	0	0	94	0	3	1	4	90	3690	1	2	3	6	864	1	3	3	7	857	1	2	37	40	999	0	7	30	37	970	0	2	3	5	117	0.0531914893617021	0.135135135135135	0.120618556701031	1.12035112035112	0.0427350427350427	0	0	3	3	102	0.0319148936170213	0.075	0.102102102102102	0.734558823529412	0.0294117647058824	0.0638297872340425	6	62	219	1750	0.780272998484775	0.773398881147898	0.321969212507055	Inf	0.79331184528606	0	1	0	0.805152320588837	0.768229326896584	0.786072339498348	0.00699300699300699	88	84
TCGA-06-0209-01A-01D-1491-08	0	0	0	0	87	0	1	5	6	81	3321	2	7	0	9	826	0	6	0	6	757	4	3	27	34	885	2	2	28	32	853	1	1	2	4	111	0.0459770114942529	0.125	0.130128956623681	0.960585585585586	0.036036036036036	1	0	1	2	115	0.0229885057471264	0.0588235294117647	0.129943502824859	0.452685421994885	0.0173913043478261	0.0574712643678161	5	56	226	1512	0.909917896362289	0.597489460731564	0.225110927073782	Inf	0.630349630059481	2.56342182890855	0.17902397688882	3.34174745832125	0.419469026548673	0.979155600463206	0.386121826590183	1	82	76
TCGA-06-0213-01A-01D-1491-08	0	0	0	0	74	0	0	2	2	72	2952	0	7	0	7	667	0	3	1	4	751	1	6	25	32	757	7	4	18	29	777	3	0	1	4	96	0.0540540540540541	0.137931034482759	0.123552123552124	1.11637931034483	0.0416666666666667	0	1	0	1	99	0.0135135135135135	0.03125	0.130779392338177	0.23895202020202	0.0101010101010101	0.0540540540540541	4	47	195	1339	0.901002955291127	0.584562243486802	0.19033861757894	Inf	0.616993464052288	2.95	0.0715120376666936	4.1144790005941	0.182945736434109	0.996941017244399	0.163591191433231	0.523809523809524	70	68
TCGA-06-0214-01A-02D-1491-08	0	0	0	0	89	1	0	1	1	87	3567	0	5	0	5	832	4	5	0	9	840	3	2	31	36	932	3	3	31	37	963	1	1	2	4	122	0.0449438202247191	0.108108108108108	0.12668743509865	0.853345148427116	0.0327868852459016	0	0	1	1	131	0.0112359550561798	0.0277777777777778	0.140557939914163	0.197625106022053	0.00763358778625954	0.0449438202247191	4	64	253	1642	0.984518058460275	0.405766695553756	0.133748184029198	Inf	0.440595210416182	1.24835309617918	0.577585023755877	1.29782639737247	0.362425092439118	0.991818565774046	0.330131649713751	0.523809523809524	85	83
TCGA-06-0216-01B-01D-1492-08	0	0	0	0	72	0	2	1	3	69	2829	2	3	0	5	649	3	5	1	9	707	4	4	21	29	747	1	2	23	26	726	0	1	1	2	104	0.0277777777777778	0.0769230769230769	0.143250688705234	0.53698224852071	0.0192307692307692	3	0	1	4	102	0.0555555555555556	0.137931034482759	0.136546184738956	1.01014198782961	0.0392156862745098	0.0694444444444444	5	44	206	1267	0.832035877965902	0.699065554424115	0.260704587046156	Inf	0.729641371111551	4.29029126213592	0.0224027398079194	9.20169917228504	0.325022065313327	0.988691990878938	0.293033905985316	1	67	64
TCGA-06-0219-01A-01D-1491-08	0	0	0	0	53	0	0	1	1	52	2132	0	2	2	4	516	0	7	1	8	462	2	4	11	17	545	3	3	17	23	609	0	0	4	4	56	0.0754716981132075	0.173913043478261	0.0919540229885057	1.89130434782609	0.0714285714285714	0	2	0	2	57	0.0377358490566038	0.117647058823529	0.104587155963303	1.12487100103199	0.0350877192982456	0.0754716981132075	4	29	113	1041	0.412499637394734	1.27039280037205	0.4019405680749	Inf	1.2378653794583	0	1	0	1.45891276864728	0.297885689661401	1.53473462570091	0.0606060606060606	49	48
TCGA-06-0237-01A-02D-1491-08	0	0	0	0	57	0	1	3	4	53	2173	1	2	1	4	484	0	4	4	8	519	2	4	18	24	595	1	3	13	17	575	1	1	1	3	63	0.0526315789473684	0.176470588235294	0.109565217391304	1.61064425770308	0.0476190476190476	1	0	0	1	66	0.0175438596491228	0.0416666666666667	0.110924369747899	0.375631313131313	0.0151515151515152	0.0526315789473684	3	31	129	1041	0.739893283362749	0.781091795136838	0.199940872794372	Inf	0.800273597811218	6.04651162790698	0.0344336548538775	16.0620424090177	0.292573143285821	0.972656378962848	0.269173356146845	1	54	50
TCGA-06-0238-01A-02D-1492-08	0	0	0	0	45	0	1	3	4	41	1681	2	6	1	9	407	1	1	0	2	395	0	3	14	17	426	3	4	6	13	453	0	1	0	1	56	0.0222222222222222	0.0769230769230769	0.123620309050773	0.622252747252747	0.0178571428571429	0	0	2	2	53	0.0444444444444444	0.117647058823529	0.124413145539906	0.945615982241953	0.0377358490566038	0.0444444444444444	2	21	109	770	0.797522132616253	0.673039777739839	0.111086650317202	Inf	0.701236537694455	0	1	0	0.806422018348624	0.72973045853894	0.785107319254145	0.4	43	39
TCGA-06-0240-01A-03D-1491-08	0	0	0	0	14	0	0	0	0	14	574	0	1	0	1	127	0	2	0	2	128	0	0	4	4	164	1	0	6	7	155	0	0	0	0	12	0	0	0.0774193548387097	0	0	0	0	0	0	23	0	0	0.140243902439024	0	0	0	0	11	35	284	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	14	14
TCGA-06-0241-01A-02D-1491-08	0	0	0	0	74	1	1	1	2	71	2911	1	10	1	12	683	0	2	1	3	665	2	6	22	30	818	2	2	22	26	745	1	0	2	3	90	0.0405405405405405	0.115384615384615	0.120805369127517	0.955128205128205	0.0333333333333333	0	1	3	4	101	0.0540540540540541	0.133333333333333	0.123471882640587	1.07986798679868	0.0396039603960396	0.0810810810810811	6	42	191	1372	0.544501059954543	1.02616475515384	0.419865332641801	Inf	1.0229057591623	2.04581151832461	0.407481063442818	2.39259342999966	0.929914326511185	0.638710145322063	0.920960460394771	0.102564102564103	68	65
TCGA-06-0644-01A-02D-1492-08	0	0	0	0	76	0	2	3	5	71	2911	2	1	0	3	653	2	8	0	10	703	2	4	28	34	760	1	3	20	24	795	0	1	0	1	94	0.0131578947368421	0.0416666666666667	0.118238993710692	0.352393617021277	0.0106382978723404	0	0	1	1	87	0.0131578947368421	0.0294117647058824	0.114473684210526	0.256930358350237	0.0114942528735632	0.0131578947368421	1	50	181	1374	0.998046056457776	0.15191449013284	0.00762810733776663	Inf	0.168454121980284	0	1	0	0.178982504604052	0.99719635858437	0.161609926222314	1	75	70
TCGA-06-0645-01A-01D-1492-08	0	0	0	0	74	0	0	1	1	73	2993	1	3	2	6	709	1	4	0	5	688	2	4	24	30	783	3	3	26	32	813	1	1	1	3	108	0.0405405405405405	0.09375	0.132841328413284	0.705729166666667	0.0277777777777778	1	1	3	5	107	0.0675675675675676	0.166666666666667	0.136653895274585	1.2196261682243	0.0467289719626168	0.0810810810810811	6	49	215	1381	0.766996500723971	0.786626947839993	0.324470824377036	Inf	0.809809725158562	2.9693023255814	0.138539346847146	4.2764480265442	0.593860465116279	0.917249691515164	0.558706995666483	0.608391608391609	68	67
TCGA-06-0646-01A-01D-1492-08	0	0	0	0	49	0	0	3	3	46	1886	3	4	0	7	438	0	1	1	2	428	2	2	19	23	487	2	0	12	14	533	1	0	0	1	58	0.0204081632653061	0.0714285714285714	0.108818011257036	0.6564039408867	0.0172413793103448	0	0	1	1	46	0.0204081632653061	0.0434782608695652	0.0944558521560575	0.460302457466919	0.0217391304347826	0.0408163265306122	2	33	104	916	0.88354257033666	0.534051281455578	0.0900218853597505	Inf	0.56043956043956	2.45192307692308	0.35170783386169	2.93123585476897	0.316377171215881	0.963594406440367	0.293806441317004	1	47	44
TCGA-06-0648-01A-01W-0323-08	0	0	0	0	88	0	0	3	3	85	3485	2	11	1	14	819	1	0	1	2	814	2	3	29	34	939	2	6	27	35	913	0	0	2	2	109	0.0227272727272727	0.0571428571428571	0.119386637458927	0.478636959370904	0.018348623853211	0	0	2	2	128	0.0227272727272727	0.0588235294117647	0.136315228966986	0.431525735294118	0.015625	0.0454545454545455	4	56	237	1615	0.956379215974709	0.48688257021664	0.159784848444346	Inf	0.520956399437412	0	1	0	0.558167570825799	0.937714628517023	0.524322936192102	0.0285714285714286	84	81
TCGA-06-0649-01B-01W-0348-08	0	0	0	0	121	0	1	4	5	116	4756	7	9	3	19	1170	2	3	6	11	1187	7	9	24	40	1237	1	9	36	46	1162	0	0	1	1	140	0.00826446280991736	0.0217391304347826	0.120481927710843	0.180434782608696	0.00714285714285714	0	1	2	3	169	0.0247933884297521	0.075	0.136620856911884	0.54896449704142	0.0177514792899408	0.0247933884297521	3	65	309	2090	0.994518025580043	0.312269867998181	0.0826141260870621	Inf	0.342518560822387	0	1	0	0.388187702265372	0.987076380850482	0.356089436434631	0.142857142857143	118	113
TCGA-06-0650-01A-02D-1696-08	0	0	0	0	41	0	0	2	2	39	1599	0	1	0	1	351	0	0	0	0	355	4	1	13	18	438	1	3	16	20	455	0	0	1	1	45	0.024390243902439	0.05	0.0989010989010989	0.505555555555556	0.0222222222222222	2	0	0	2	42	0.0487804878048781	0.111111111111111	0.0958904109589041	1.15873015873016	0.0476190476190476	0.0731707317073171	3	31	87	806	0.658844171581718	0.896637639617097	0.228163301844382	Inf	0.905679513184584	4.10574712643678	0.0796751929740653	6.15201566543278	0.353943717796274	0.948001456713363	0.331132067122126	1	38	36
TCGA-06-0686-01A-01W-0348-08	0	0	0	0	79	0	0	1	1	78	3198	3	6	5	14	741	3	3	1	7	780	4	5	21	30	833	4	6	17	27	844	1	0	3	4	102	0.0506329113924051	0.148148148148148	0.12085308056872	1.22585330428468	0.0392156862745098	2	1	2	5	109	0.0632911392405063	0.166666666666667	0.130852340936375	1.2737003058104	0.0458715596330275	0.10126582278481	8	38	211	1466	0.221739465520874	1.4623360490955	0.675119230505113	Inf	1.38223779105708	2.98045023696682	0.0696173402669725	4.1635421460663	1.04577201297082	0.532332282267853	1.05268697589325	0.637186343068696	71	70
TCGA-06-0743-01A-01D-1492-08	0	0	0	0	117	1	0	5	5	111	4551	2	5	2	9	1023	3	4	2	9	1088	6	6	33	45	1206	2	4	42	48	1234	0	1	1	2	149	0.0170940170940171	0.0416666666666667	0.120745542949757	0.345078299776286	0.0134228187919463	2	1	2	5	148	0.0427350427350427	0.111111111111111	0.122719734660033	0.905405405405405	0.0337837837837838	0.0427350427350427	5	78	297	2143	0.977923706486356	0.462639862894172	0.176409550267682	Inf	0.494908928643868	2.05387205387205	0.25463428498194	2.40397771231045	0.328619528619529	0.995883633999548	0.300738085464444	1	112	106
TCGA-06-0744-01A-01W-0348-08	0	0	0	0	96	0	1	1	2	94	3854	3	5	1	9	893	3	5	1	9	934	4	1	41	46	1038	1	7	22	30	989	0	2	1	3	146	0.03125	0.1	0.147623862487361	0.677397260273973	0.0205479452054795	0	0	1	1	137	0.0104166666666667	0.0217391304347826	0.131984585741811	0.164709615994922	0.0072992700729927	0.0208333333333333	2	66	283	1744	0.999511390924542	0.186827423216373	0.0323553289189908	Inf	0.210663063812097	0	1	0	0.227382354590835	0.99905271154809	0.202139200128724	0.428571428571429	94	92
TCGA-06-0745-01A-01W-0348-08	0	0	0	0	56	0	0	2	2	54	2214	3	3	0	6	512	3	3	1	7	593	5	3	12	20	550	4	3	14	21	559	1	2	3	6	86	0.107142857142857	0.285714285714286	0.153846153846154	1.85714285714286	0.0697674418604651	2	1	1	4	72	0.0714285714285714	0.2	0.130909090909091	1.52777777777778	0.0555555555555556	0.125	7	28	158	951	0.230542042746258	1.5041294554504	0.642283579684079	Inf	1.40379746835443	2.33966244725738	0.127498694765237	3.00531896901259	1.07984420642648	0.521063512307326	1.09429868362363	1	49	47
TCGA-06-0747-01A-01W-0348-08	0	0	0	0	91	0	1	3	4	86	3526	3	9	1	13	812	1	2	2	5	818	6	4	27	37	917	2	4	25	31	979	0	1	2	3	118	0.032967032967033	0.0967741935483871	0.120531154239019	0.80289775833789	0.0254237288135593	2	0	0	2	98	0.021978021978022	0.0540540540540541	0.106870229007634	0.505791505791506	0.0204081632653061	0.043956043956044	4	56	216	1680	0.920276950954989	0.555691048556211	0.182200228273355	Inf	0.585185185185185	2.19444444444444	0.23077551815515	2.59076407421364	0.337606837606838	0.98516797878114	0.311232250176444	1	87	82
TCGA-06-0749-01A-01W-0348-08	0	0	0	0	69	0	1	5	6	63	2583	0	2	1	3	567	3	5	1	9	594	0	2	19	21	678	2	3	25	30	744	0	1	0	1	87	0.0144927536231884	0.0333333333333333	0.116935483870968	0.285057471264368	0.0114942528735632	0	0	0	0	73	0	0	0.107669616519174	0	0	0	0	46	160	1262	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	69	63
TCGA-06-0750-01A-01W-0348-08	0	0	0	0	47	0	1	0	1	45	1845	0	4	1	5	446	2	1	0	3	424	1	6	10	17	504	2	3	15	20	471	0	1	1	2	71	0.0425531914893617	0.1	0.150743099787686	0.663380281690141	0.028169014084507	0	2	0	2	68	0.0425531914893617	0.117647058823529	0.134920634920635	0.8719723183391	0.0294117647058824	0.0212765957446809	1	27	139	836	0.986043137773219	0.222952905825569	0.0109801514711002	Inf	0.250513874614594	0	1	0	0.280575539568345	0.978078548324439	0.250813017050299	1	46	44
TCGA-06-0875-01A-01W-0424-08	0	0	0	0	78	0	0	2	2	76	3116	2	4	1	7	747	2	5	1	8	732	2	2	24	28	826	4	4	25	33	811	1	1	1	3	112	0.0384615384615385	0.0909090909090909	0.13810110974106	0.658279220779221	0.0267857142857143	1	0	0	1	89	0.0128205128205128	0.0357142857142857	0.10774818401937	0.331460674157303	0.0112359550561798	0.0384615384615385	3	52	201	1436	0.97079426983604	0.412325859427236	0.108114807830961	Inf	0.444233378561737	2.71475953565506	0.163097945916958	3.56826961993484	0.166209767489085	0.998253606851779	0.148925039181863	1	75	73
TCGA-06-0876-01A-01W-0424-08	0	0	0	0	86	1	1	4	5	80	3280	0	2	1	3	779	2	3	1	6	738	1	2	31	34	949	2	6	29	37	814	0	0	0	0	92	0	0	0.113022113022113	0	0	0	0	5	5	128	0.0581395348837209	0.147058823529412	0.134878819810327	1.09030330882353	0.0390625	0.0581395348837209	5	58	220	1543	0.905265152772735	0.604764472719277	0.228070747354662	Inf	0.636002886002886	0	1	0	0.66780303030303	0.881598432115923	0.637738519380104	0.00793650793650794	81	75
TCGA-06-0877-01A-01W-0424-08	0	0	0	0	86	0	0	2	2	84	3444	5	2	1	8	845	1	2	3	6	775	1	5	26	32	895	8	5	25	38	929	1	1	0	2	111	0.0232558139534884	0.0526315789473684	0.119483315392896	0.440493124703651	0.018018018018018	0	0	2	2	126	0.0232558139534884	0.0625	0.140782122905028	0.443948412698413	0.0158730158730159	0.0348837209302326	3	57	237	1587	0.987658486231926	0.352565549839962	0.0928068716104437	Inf	0.384810126582278	0.855133614627286	0.714827912239085	0.837116437701246	0.301811863986101	0.992506592386537	0.273433127701513	1	83	81
TCGA-06-0878-01A-01W-0424-08	0	0	0	0	57	0	0	5	5	52	2132	2	3	5	10	523	1	3	0	4	521	2	3	16	21	525	0	2	15	17	563	0	0	3	3	72	0.0526315789473684	0.176470588235294	0.127886323268206	1.37990196078431	0.0416666666666667	0	1	1	2	66	0.0350877192982456	0.0952380952380952	0.125714285714286	0.757575757575757	0.0303030303030303	0.0701754385964912	4	29	138	950	0.619018079475368	0.949561394375344	0.301177822521407	Inf	0.955643390425999	0	1	0	1.01729780271155	0.56857118782669	1.01984433425468	0.0476190476190476	53	48
TCGA-06-0879-01A-01W-0424-08	0	0	0	0	69	1	1	1	2	66	2706	0	8	0	8	635	1	2	1	4	624	1	3	20	24	710	1	6	23	30	737	0	3	0	3	71	0.0434782608695652	0.1	0.096336499321574	1.03802816901408	0.0422535211267606	1	1	0	2	85	0.0289855072463768	0.0833333333333333	0.119718309859155	0.696078431372549	0.0235294117647059	0.0144927536231884	1	44	156	1291	0.993799320645159	0.188197548438002	0.00940895959899997	Inf	0.206125356125356	4.63782051282051	0.205028043726098	8.25157944775314	0	1	0	1	68	65
TCGA-06-0881-01A-02W-0424-08	0	0	0	0	33	0	1	0	1	31	1271	1	3	0	4	337	0	2	2	4	306	2	1	8	11	319	0	0	12	12	309	0	0	0	0	44	0	0	0.142394822006472	0	0	0	0	0	0	53	0	0	0.166144200626959	0	0	0	0	22	97	531	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	33	31
TCGA-06-0882-01A-01W-0424-08	0	0	0	0	48	1	0	1	1	46	1886	1	3	1	5	444	0	4	0	4	415	2	3	11	16	477	1	4	16	21	550	0	0	1	1	51	0.0208333333333333	0.0476190476190476	0.0927272727272727	0.513538748832866	0.0196078431372549	1	1	0	2	64	0.0416666666666667	0.125	0.134171907756813	0.931640625	0.03125	0.0416666666666667	2	28	115	912	0.863575556905399	0.566707238046887	0.0949941998490212	Inf	0.59536231884058	2.9768115942029	0.301500503383812	3.95625858127399	0.330756843800322	0.958831068640175	0.305238209741511	1	46	44
TCGA-06-0939-01A-01D-1353-08	0	0	0	0	111	0	0	1	1	110	4510	1	8	1	10	1120	1	9	1	11	1029	2	8	28	38	1178	6	5	40	51	1183	0	1	1	2	161	0.018018018018018	0.0392156862745098	0.136094674556213	0.288150042625746	0.0124223602484472	1	2	0	3	155	0.027027027027027	0.0789473684210526	0.131578947368421	0.6	0.0193548387096774	0.018018018018018	2	74	316	2045	0.99973998659161	0.174974023903764	0.0303727330698886	Inf	0.19661892071952	0.933939873417722	0.683696801367544	0.924520009810857	0.109875279225614	0.99993577020085	0.0966317142656021	1	109	108
TCGA-06-1804-01A-01D-1696-08	0	0	0	0	100	0	0	1	1	99	4059	4	5	1	10	904	3	4	0	7	954	4	7	26	37	1135	3	9	33	45	1066	0	1	3	4	116	0.04	0.0888888888888889	0.108818011257036	0.816858237547893	0.0344827586206897	2	2	1	5	160	0.05	0.135135135135135	0.140969162995595	0.958614864864865	0.03125	0.06	6	60	276	1925	0.848804138142879	0.697561977077672	0.290654619881089	Inf	0.724967061923584	2.27846790890269	0.216899761144553	2.78801412836599	0.540653402112503	0.946915415358741	0.507366946037628	0.619909502262444	94	93
TCGA-06-1806-01A-02D-1845-08	0	0	0	0	36	0	0	1	1	34	1394	2	4	1	7	318	2	7	2	11	324	1	0	7	8	365	1	0	7	8	387	1	0	0	1	56	0.0277777777777778	0.125	0.144702842377261	0.863839285714286	0.0178571428571429	0	0	0	0	53	0	0	0.145205479452055	0	0	0.0277777777777778	1	15	109	643	0.917903906218866	0.393615139568833	0.0188012778652806	Inf	0.431192660550459	3.44954128440367	0.27065918465836	5.87680821045298	0	1	0	1	35	33
TCGA-06-2557-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	70	0	1	2	3	67	2747	3	4	0	7	602	1	5	5	11	704	1	1	20	22	707	0	4	23	27	734	0	2	1	3	102	0.0428571428571429	0.111111111111111	0.138964577656676	0.799564270152505	0.0294117647058824	0	0	1	1	78	0.0142857142857143	0.0454545454545455	0.11032531824611	0.412004662004662	0.0128205128205128	0.0285714285714286	2	42	180	1261	0.978682537609465	0.333763534725292	0.0570298741510682	Inf	0.363888888888889	0	1	0	0.372351421188631	0.976182057046121	0.34190183134548	0.428571428571429	68	65
TCGA-06-2558-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	97	0	0	0	0	97	3977	5	10	1	16	913	4	8	1	13	979	4	7	21	32	1041	4	3	29	36	1044	1	0	0	1	151	0.0103092783505155	0.0277777777777778	0.14463601532567	0.19205298013245	0.00662251655629139	1	1	2	4	125	0.0412371134020619	0.125	0.120076849183477	1.041	0.032	0.0412371134020619	4	54	276	1809	0.956920926372772	0.485635667905165	0.159376711912158	Inf	0.520989505247376	1.88858695652174	0.288312873480984	2.18372009762475	0.302173913043478	0.992558026975097	0.273201949604578	1	93	93
TCGA-06-2559-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	87	0	0	4	4	83	3403	1	6	0	7	766	2	4	1	7	827	3	6	25	34	969	1	5	29	35	841	0	2	3	5	111	0.0574712643678161	0.142857142857143	0.131985731272295	1.08236808236808	0.045045045045045	1	1	1	3	130	0.0344827586206897	0.0882352941176471	0.134158926728586	0.657692307692308	0.0230769230769231	0.0574712643678161	5	53	241	1569	0.898267542370616	0.614322806374947	0.231142512038293	Inf	0.647445986550293	1.87759336099585	0.436310958053227	2.16892075687298	0.556323958813585	0.939261753885539	0.520976493291759	0.282051282051282	82	78
TCGA-06-2561-01A-02D-1494-08	0	0	0	0	44	0	0	4	4	40	1640	0	2	3	5	392	1	1	0	2	404	3	4	12	19	436	0	1	13	14	408	0	1	4	5	59	0.113636363636364	0.357142857142857	0.144607843137255	2.46973365617433	0.0847457627118644	0	0	2	2	54	0.0454545454545455	0.105263157894737	0.123853211009174	0.84990253411306	0.037037037037037	0.136363636363636	6	22	113	731	0.170735988110821	1.76289492430996	0.686023725837346	Inf	1.60050568900126	0	1	0	1.79256637168142	0.113930571214178	2.04076414108583	0.00466200466200466	38	34
TCGA-06-2562-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	84	1	0	3	3	80	3280	1	7	1	9	714	2	8	3	13	742	3	1	22	26	896	2	3	27	32	928	1	0	1	2	111	0.0238095238095238	0.0625	0.119612068965517	0.522522522522523	0.018018018018018	0	0	0	0	89	0	0	0.0993303571428571	0	0	0.0238095238095238	2	52	200	1624	0.984927135460429	0.312433402290116	0.0537695045676062	Inf	0.337777777777778	1.824	0.441645785273198	2.02900160859335	0.186122448979592	0.996445050799893	0.169250946593717	1	82	78
TCGA-06-2563-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	88	0	0	2	2	86	3526	5	4	2	11	808	1	5	1	7	815	3	4	23	30	919	4	8	26	38	984	1	0	1	2	109	0.0227272727272727	0.0526315789473684	0.110772357723577	0.475132786093674	0.018348623853211	0	1	0	1	107	0.0113636363636364	0.0333333333333333	0.116430903155604	0.286292834890966	0.00934579439252336	0.0227272727272727	2	54	216	1687	0.989927311035856	0.289382202723781	0.0498533640509448	Inf	0.314649470899471	1.25859788359788	0.570709157783601	1.30149633487034	0.179799697656841	0.997123584766209	0.162790862558495	1	86	84
TCGA-06-2564-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	76	0	1	1	2	74	3034	0	4	1	5	682	1	0	1	2	688	1	2	28	31	840	3	0	33	36	824	1	0	3	4	98	0.0526315789473684	0.111111111111111	0.118932038834951	0.934240362811791	0.0408163265306122	1	0	6	7	104	0.0921052631578947	0.225806451612903	0.123809523809524	1.82382133995037	0.0673076923076923	0.144736842105263	11	54	202	1462	0.167304329903051	1.47394816733528	0.773607452628094	Inf	1.39405940594059	4.11881188118812	0.0755680968470065	7.22150834867662	1.21538711248174	0.325814331900016	1.25248127805979	0.00892219235872487	65	63
TCGA-06-2565-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	74	0	1	3	4	70	2870	0	6	0	6	726	0	3	3	6	662	1	2	20	23	756	2	3	30	35	726	0	0	1	1	97	0.0135135135135135	0.0285714285714286	0.133608815426997	0.213843888070692	0.0103092783505155	1	0	2	3	112	0.0405405405405405	0.130434782608696	0.148148148148148	0.880434782608696	0.0267857142857143	0.0540540540540541	4	49	209	1273	0.950635226747269	0.497397863645931	0.162320194416657	Inf	0.53516295025729	2.36363636363636	0.367287359787264	3.04220735381571	0.425454545454545	0.977895741644115	0.388952453203809	0.485714285714286	70	66
TCGA-06-2567-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	76	0	0	5	5	71	2911	2	4	0	6	672	1	2	2	5	688	2	4	23	29	796	2	1	28	31	755	0	0	1	1	102	0.0131578947368421	0.032258064516129	0.135099337748344	0.238772928526249	0.00980392156862745	2	0	0	2	103	0.0263157894736842	0.0689655172413793	0.129396984924623	0.532976230331436	0.0194174757281553	0.0394736842105263	3	52	205	1346	0.981045044327505	0.378960677254084	0.0993746106174514	Inf	0.412682926829268	3.78292682926829	0.0881619861618997	6.55236959905382	0.148350071736011	0.999207166391534	0.131399664003786	1	73	68
TCGA-06-2569-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	38	0	1	4	5	33	1353	0	4	0	4	287	1	2	1	4	286	1	5	10	16	397	3	3	3	9	383	1	0	0	1	34	0.0263157894736842	0.111111111111111	0.0887728459530026	1.2516339869281	0.0294117647058824	0	0	1	1	37	0.0263157894736842	0.0625	0.0931989924433249	0.670608108108108	0.027027027027027	0.0526315789473684	2	15	71	709	0.47160292581616	1.33091663207591	0.213419665135349	Inf	1.29246064623032	2.74647887323944	0.320297970626168	3.32053315380073	0.845070422535211	0.712727850340864	0.83231821400691	1	36	31
TCGA-06-2570-01A-01D-1495-08	0	0	0	0	47	0	0	1	1	45	1845	2	2	0	4	467	0	7	0	7	402	3	0	11	14	475	0	5	15	20	501	0	1	1	2	57	0.0425531914893617	0.1	0.11377245508982	0.878947368421053	0.0350877192982456	1	0	0	1	71	0.0212765957446809	0.0714285714285714	0.149473684210526	0.477867203219316	0.0140845070422535	0.0425531914893617	2	27	128	848	0.90768206525762	0.491012424060917	0.0822254871760988	Inf	0.525862068965517	2.54166666666667	0.345806299354789	3.306552925595	0.293269230769231	0.973538928417947	0.265218609405877	1	45	43
TCGA-06-5408-01A-01D-1696-08	0	0	0	0	61	0	1	1	2	59	2419	1	5	0	6	569	2	4	0	6	548	1	3	22	26	628	2	1	18	21	674	0	0	0	0	80	0	0	0.118694362017804	0	0	1	1	1	3	90	0.0491803278688525	0.115384615384615	0.143312101910828	0.805128205128205	0.0333333333333333	0.0327868852459016	2	41	170	1132	0.981017927960475	0.325002283822495	0.0554650546488461	Inf	0.356224350205198	2.55294117647059	0.344070939448939	3.32490919892344	0.191470588235294	0.996068852889319	0.170860123385691	1	59	57
TCGA-06-5410-01A-01D-1696-08	0	0	0	0	38	0	0	0	0	38	1558	0	2	1	3	345	0	0	1	1	389	2	1	14	17	437	2	2	13	17	387	0	0	0	0	46	0	0	0.118863049095607	0	0	0	0	0	0	56	0	0	0.128146453089245	0	0	0	0	31	102	722	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	38	38
TCGA-06-5411-01A-01D-1696-08	0	0	0	0	47	0	0	3	3	44	1804	0	4	0	4	446	3	4	0	7	427	1	3	11	15	512	2	0	16	18	419	1	0	1	2	60	0.0425531914893617	0.111111111111111	0.143198090692124	0.775925925925926	0.0333333333333333	0	2	0	2	72	0.0425531914893617	0.133333333333333	0.140625	0.948148148148148	0.0277777777777778	0.0425531914893617	2	28	132	799	0.938091268890945	0.432639211163772	0.072601047172159	Inf	0.47020202020202	2.3510101010101	0.369587450389287	3.02143189226786	0.261223344556678	0.983357721781642	0.23302194006826	1	45	42
TCGA-06-5412-01A-01D-1696-08	0	0	0	0	71	0	1	4	5	66	2706	3	0	0	3	623	1	4	2	7	619	4	3	25	32	736	2	3	19	24	728	0	0	2	2	88	0.028169014084507	0.0833333333333333	0.120879120879121	0.689393939393939	0.0227272727272727	0	0	2	2	91	0.028169014084507	0.0625	0.123641304347826	0.505494505494505	0.021978021978022	0.0563380281690141	4	46	179	1285	0.873529022084117	0.624406146588431	0.202987001692863	Inf	0.654301675977654	0	1	0	0.743524631792788	0.80174200594356	0.718017728731194	0.0285714285714286	67	62
TCGA-06-5413-01A-01D-1696-08	0	0	0	0	64	0	2	3	5	59	2419	3	2	2	7	557	1	4	1	6	579	3	2	20	25	637	2	4	15	21	646	1	0	0	1	85	0.015625	0.0476190476190476	0.131578947368421	0.361904761904762	0.0117647058823529	0	0	1	1	78	0.015625	0.04	0.122448979591837	0.326666666666667	0.0128205128205128	0.03125	2	38	163	1120	0.969281560623371	0.361832696340311	0.0615632974393952	Inf	0.393558282208589	1.57423312883436	0.494455919226069	1.71691075054059	0.224890446976337	0.991051109086497	0.202231889621629	1	62	57
TCGA-06-5414-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	51	0	0	3	3	47	1927	0	2	0	2	434	0	4	1	5	480	0	4	18	22	528	1	2	15	18	485	0	0	0	0	73	0	0	0.150515463917526	0	0	0	2	1	3	65	0.0588235294117647	0.136363636363636	0.123106060606061	1.10769230769231	0.0461538461538462	0.0196078431372549	1	33	138	875	0.992751152448653	0.192309386298581	0.00953529019774365	Inf	0.215899403239557	0	1	0	0.222441809398331	0.991641472041564	0.198317577494391	1	50	46
TCGA-06-5415-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	72	0	0	3	3	69	2829	0	5	1	6	627	1	1	0	2	640	4	2	25	31	794	2	1	27	30	768	0	1	1	2	91	0.0277777777777778	0.0666666666666667	0.118489583333333	0.562637362637363	0.021978021978022	0	1	0	1	91	0.0138888888888889	0.032258064516129	0.114609571788413	0.281460475008862	0.010989010989011	0.0138888888888889	1	57	182	1380	0.999162998250914	0.133106474866164	0.00664288946213799	Inf	0.147972716938234	0	1	0	0.165046491969569	0.998279759451783	0.14876422727983	1	71	68
TCGA-06-5417-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	71	0	1	5	6	65	2665	4	9	2	15	675	0	9	1	10	661	3	6	15	24	652	4	3	9	16	677	2	0	1	3	110	0.0422535211267606	0.1875	0.162481536189069	1.15397727272727	0.0272727272727273	1	1	1	3	105	0.0422535211267606	0.125	0.161042944785276	0.776190476190476	0.0285714285714286	0.0704225352112676	5	26	215	1114	0.579778424542687	0.996424739129301	0.361129679664983	Inf	0.996999249812453	2.64916943521595	0.0903986234669136	3.88037386376328	0.515116279069767	0.917760078634042	0.47124277768426	1	66	60
TCGA-06-5418-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	57	0	2	3	5	52	2132	0	2	0	2	514	2	4	0	6	496	1	1	18	20	555	2	0	22	24	567	0	0	1	1	69	0.0175438596491228	0.0416666666666667	0.121693121693122	0.342391304347826	0.0144927536231884	0	1	0	1	67	0.0175438596491228	0.05	0.120720720720721	0.414179104477612	0.0149253731343284	0.0175438596491228	1	42	136	986	0.995854004668504	0.172759299028683	0.00862181131467987	Inf	0.191860465116279	0	1	0	0.20625	0.993963620853553	0.186045777297158	1	56	51
TCGA-06-5856-01A-01D-1696-08	0	0	0	0	70	0	0	2	2	68	2788	5	3	5	13	636	0	4	4	8	643	3	4	12	19	766	4	11	13	28	743	1	3	1	5	91	0.0714285714285714	0.178571428571429	0.122476446837147	1.45800627943485	0.0549450549450549	2	2	1	5	85	0.0714285714285714	0.263157894736842	0.110966057441253	2.37151702786378	0.0588235294117647	0.0714285714285714	5	27	176	1333	0.32004897854565	1.40221494837665	0.508669890672348	Inf	1.33966619318182	3.67451298701299	0.0395346752616605	5.66914502739131	0.685909090909091	0.806288746450616	0.658750687402298	1	65	63
TCGA-06-5858-01A-01D-1696-08	0	0	0	0	261	0	2	0	2	259	10619	0	7	3	10	2248	0	6	0	6	2289	2	4	116	122	3057	0	2	119	121	3025	0	0	2	2	310	0.00766283524904215	0.0165289256198347	0.102479338842975	0.161290322580645	0.00645161290322581	0	0	0	0	296	0	0	0.0968269545305855	0	0	0.00766283524904215	2	235	606	5476	0.999999999349243	0.0769175176843874	0.013544200409445	Inf	0.0846945454039075	0	1	0	0.0854153500456429	0.999999999209771	0.0775777436924329	0.333333333333333	259	257
TCGA-06-5859-01A-01D-1696-08	0	0	0	0	53	0	0	3	3	50	2050	1	0	0	1	471	1	1	0	2	457	1	4	18	23	594	1	1	22	24	528	1	0	2	3	64	0.0566037735849057	0.125	0.121212121212121	1.03125	0.046875	1	1	0	2	86	0.0377358490566038	0.0869565217391304	0.144781144781145	0.600606673407482	0.0232558139534884	0.0754716981132075	4	38	150	972	0.829301069897265	0.682302932638848	0.219602225933052	Inf	0.712380952380952	7.48	0.018183373842941	Inf	0.374	0.975974676221183	0.341268099470648	1	49	46
TCGA-06-6388-01A-12D-1845-08	0	0	0	0	63	0	2	1	3	60	2460	1	2	0	3	562	3	4	0	7	622	2	4	21	27	659	3	2	18	23	617	0	0	0	0	74	0	0	0.119935170178282	0	0	1	0	0	1	84	0.0158730158730159	0.037037037037037	0.127465857359636	0.290564373897707	0.0119047619047619	0.0158730158730159	1	43	158	1118	0.996810580225902	0.164676222695767	0.00823316857316903	Inf	0.183544303797468	1.61518987341772	0.485083288112933	1.76801622426027	0	1	0	1	62	59
TCGA-06-6389-01A-11D-1696-08	0	0	0	0	50	0	0	1	1	49	2009	2	3	2	7	457	1	4	1	6	489	4	1	13	18	496	2	1	15	18	567	0	0	0	0	75	0	0	0.132275132275132	0	0	1	1	0	2	61	0.04	0.111111111111111	0.122983870967742	0.903460837887067	0.0327868852459016	0.02	1	33	136	927	0.990050691393077	0.206720839599582	0.0102467476829706	Inf	0.229887543252595	1.30269607843137	0.561741701290073	1.3627899754062	0	1	0	1	49	48
TCGA-06-6390-01A-11D-1696-08	0	0	0	0	53	0	0	2	2	51	2091	0	3	1	4	504	2	10	1	13	556	1	2	17	20	490	3	2	9	14	541	0	0	0	0	78	0	0	0.144177449168207	0	0	1	0	2	3	85	0.0566037735849057	0.15	0.173469387755102	0.864705882352941	0.0352941176470588	0.0566037735849057	3	27	163	868	0.872942376196194	0.591932853908131	0.150777740343383	Inf	0.632515337423313	1.58128834355828	0.499001988768079	1.77386617588466	0.486550259556395	0.931958960606512	0.444018551450167	1	50	48
TCGA-06-6391-01A-11D-1696-08	0	0	0	0	72	0	0	0	0	72	2952	4	4	0	8	690	3	7	0	10	712	4	1	22	27	794	6	3	18	27	756	2	2	1	5	102	0.0694444444444444	0.185185185185185	0.134920634920635	1.37254901960784	0.0490196078431373	1	0	3	4	108	0.0555555555555556	0.148148148148148	0.136020151133501	1.08916323731139	0.037037037037037	0.0972222222222222	7	43	210	1340	0.527678810990134	1.03874087531469	0.457051282556444	Inf	1.03333333333333	2.21428571428571	0.145526589174794	2.73224482752647	0.738095238095238	0.808545475402339	0.709131485804132	1	65	65
TCGA-06-6693-01A-11D-1845-08	0	0	0	0	61	0	0	2	2	59	2419	0	4	1	5	534	4	4	1	9	572	5	2	13	20	621	5	1	19	25	692	1	1	2	4	84	0.0655737704918033	0.16	0.121387283236994	1.31809523809524	0.0476190476190476	2	0	1	3	75	0.0491803278688525	0.15	0.120772946859903	1.242	0.04	0.0983606557377049	6	36	159	1154	0.405173052690229	1.20945266555818	0.489811281750687	Inf	1.17969451931716	2.47735849056604	0.113186469314745	3.10661499971324	0.774174528301887	0.761731075539892	0.750957773366496	1	55	53
TCGA-06-6694-01A-12D-1845-08	0	0	0	0	114	0	1	2	3	111	4551	2	7	1	10	1034	2	4	0	6	1089	2	9	40	51	1174	4	5	35	44	1254	0	0	5	5	152	0.043859649122807	0.113636363636364	0.121212121212121	0.9375	0.0328947368421053	1	2	0	3	130	0.0263157894736842	0.0588235294117647	0.110732538330494	0.531221719457014	0.0230769230769231	0.0526315789473684	6	75	282	2146	0.918075260364346	0.608895769190927	0.255562183228343	Inf	0.637772524297347	1.43498817966903	0.524044527997567	1.5216702622999	0.573995271867612	0.943729839159018	0.543673314607296	0.118881118881119	108	105
TCGA-06-6695-01A-11D-1845-08	0	0	0	0	70	0	3	1	4	66	2706	1	3	2	6	602	1	4	0	5	644	2	2	27	31	705	3	2	19	24	755	0	0	1	1	92	0.0142857142857143	0.0416666666666667	0.121854304635762	0.341938405797101	0.0108695652173913	0	0	1	1	84	0.0142857142857143	0.032258064516129	0.119148936170213	0.27073732718894	0.0119047619047619	0.0285714285714286	2	49	176	1284	0.987952560747819	0.297927772199995	0.0511220991431775	Inf	0.325311942959002	0	1	0	0.360671936758893	0.979372570967153	0.331774140018755	0.333333333333333	68	64
TCGA-06-6697-01A-11D-1845-08	0	0	0	0	78	1	0	3	3	74	3034	2	3	3	8	750	3	4	0	7	784	5	5	26	36	738	2	6	15	23	762	1	1	1	3	119	0.0384615384615385	0.130434782608696	0.156167979002625	0.835221044939715	0.0252100840336134	3	1	2	6	104	0.0769230769230769	0.166666666666667	0.140921409214092	1.18269230769231	0.0576923076923077	0.0897435897435897	7	41	223	1277	0.585636974268763	0.977699816109609	0.42937515957802	Inf	0.980941704035874	3.84368994234465	0.0120833592907152	7.6200249305268	0.492179809690474	0.953684989891511	0.452263287113697	1	71	67
TCGA-06-6698-01A-11D-1845-08	0	0	0	0	52	0	1	2	3	49	2009	1	3	2	6	451	1	2	1	4	451	0	1	14	15	538	4	2	18	24	569	1	0	1	2	62	0.0384615384615385	0.0833333333333333	0.10896309314587	0.764784946236559	0.032258064516129	0	0	1	1	59	0.0192307692307692	0.0666666666666667	0.109665427509294	0.607909604519774	0.0169491525423729	0.0576923076923077	3	33	121	986	0.768922391618365	0.740970797072923	0.190062005275734	Inf	0.762396694214876	2.28719008264463	0.372463545722141	2.71273455694586	0.571797520661157	0.877791010509674	0.543483323966257	1	49	46
TCGA-06-6699-01A-11D-1845-08	0	0	0	0	76	0	1	1	2	74	3034	0	4	1	5	628	1	5	0	6	653	0	4	20	24	839	1	6	32	39	914	1	0	0	1	88	0.0131578947368421	0.0256410256410256	0.0962800875273523	0.266317016317016	0.0113636363636364	0	2	2	4	89	0.0526315789473684	0.166666666666667	0.106078665077473	1.57116104868914	0.0449438202247191	0.0394736842105263	3	50	177	1576	0.912233593251566	0.534384197627444	0.139826081565562	Inf	0.560601215222258	9.90395480225989	0.101482326111744	Inf	0.380921338548457	0.972133782947975	0.356296149595094	1	73	71
TCGA-06-6700-01A-12D-1845-08	0	0	0	0	63	0	2	0	2	61	2501	2	5	0	7	609	1	3	0	4	685	1	3	24	28	587	2	2	18	22	620	1	1	1	3	88	0.0476190476190476	0.136363636363636	0.141935483870968	0.960743801652893	0.0340909090909091	0	0	0	0	83	0	0	0.141396933560477	0	0	0.0317460317460317	2	43	171	1036	0.990714896036792	0.281973200709553	0.0481650935901393	Inf	0.3137102014295	2.35282651072125	0.36895946103963	3.02530521395662	0.168059036480089	0.998228057471844	0.14788557942453	1	61	59
TCGA-06-6701-01A-11D-1845-08	0	0	0	0	48	0	1	4	5	42	1722	2	1	0	3	392	1	6	2	9	409	2	0	11	13	458	1	1	15	17	463	1	0	2	3	52	0.0625	0.176470588235294	0.11231101511879	1.57126696832579	0.0576923076923077	0	0	0	0	54	0	0	0.117903930131004	0	0	0.0625	3	26	106	815	0.666060587873294	0.887237807646914	0.224421585334417	Inf	0.898828887443071	2.89622641509434	0.309020392091487	3.83515099483512	0.668359941944848	0.817410778826709	0.640979638640765	1	45	39
TCGA-08-0386-01A-01D-1492-08	0	0	0	0	17	0	0	1	1	16	656	0	0	0	0	138	0	1	0	1	147	1	0	6	7	188	1	0	7	8	183	1	0	0	1	23	0.0588235294117647	0.125	0.12568306010929	0.994565217391304	0.0434782608695652	0	0	0	0	15	0	0	0.0797872340425532	0	0	0.0588235294117647	1	14	38	333	0.8038930870676	0.626579263382531	0.0292932524070715	Inf	0.650877192982456	4.88157894736842	0.198434662284874	8.66515965210017	0	1	0	1	16	15
TCGA-12-0615-01A-01D-1492-08	0	0	0	0	76	0	2	0	2	74	3034	2	5	1	8	700	0	4	1	5	682	4	3	23	30	772	5	3	23	31	880	2	0	0	2	106	0.0263157894736842	0.0645161290322581	0.120454545454545	0.535605599513086	0.0188679245283019	1	1	0	2	84	0.0263157894736842	0.0666666666666667	0.10880829015544	0.612698412698413	0.0238095238095238	0.0394736842105263	3	52	190	1462	0.958585878315411	0.44408319693635	0.116392599754788	Inf	0.474258373205742	2.89824561403509	0.0764431301133538	3.84210275261831	0	1	0	0.142857142857143	73	71
TCGA-12-0616-01A-01D-1492-08	0	0	0	0	53	0	2	0	2	51	2091	0	6	0	6	456	0	1	1	2	489	2	2	22	26	564	3	0	14	17	582	1	0	1	2	75	0.0377358490566038	0.117647058823529	0.128865979381443	0.912941176470588	0.0266666666666667	0	0	4	4	65	0.0754716981132075	0.153846153846154	0.115248226950355	1.33491124260355	0.0615384615384615	0.113207547169811	6	35	140	1006	0.391559230599567	1.23159555122725	0.497046665788736	Inf	1.19790940766551	1.63714285714286	0.480360657283769	1.79529561730402	1.13690476190476	0.45798550087745	1.15881285744544	0.0800865800865801	47	45
TCGA-12-0618-01A-01D-1492-08	0	0	0	0	66	0	4	2	6	60	2460	2	3	0	5	548	1	4	2	7	597	0	2	27	29	649	1	4	14	19	666	1	0	0	1	85	0.0151515151515152	0.0526315789473684	0.127627627627628	0.412383900928793	0.0117647058823529	0	1	0	1	70	0.0151515151515152	0.0344827586206897	0.107858243451464	0.319704433497537	0.0142857142857143	0.0151515151515152	1	41	155	1160	0.994556680844676	0.182658045090309	0.00911776460342525	Inf	0.201996927803379	8.48387096774194	0.11854103343465	Inf	0	1	0	1	65	59
TCGA-12-0619-01A-01D-1492-08	0	0	0	0	66	0	2	1	3	63	2583	1	4	0	5	616	0	4	0	4	565	3	3	28	34	737	2	3	15	20	665	0	0	0	0	74	0	0	0.111278195488722	0	0	0	0	1	1	72	0.0151515151515152	0.0294117647058824	0.0976933514246947	0.301062091503268	0.0138888888888889	0.0151515151515152	1	47	146	1256	0.994596815649935	0.183152679372509	0.00916620819333147	Inf	0.200057077625571	0	1	0	0.223319528512265	0.990772026065198	0.204952798234409	1	65	62
TCGA-12-0688-01A-02D-1492-08	0	0	0	0	70	0	0	5	5	65	2665	1	5	2	8	609	1	8	1	10	579	0	1	19	20	729	2	5	20	27	748	0	0	2	2	77	0.0285714285714286	0.0740740740740741	0.102941176470588	0.71957671957672	0.025974025974026	0	1	0	1	95	0.0142857142857143	0.05	0.130315500685871	0.383684210526316	0.0105263157894737	0.0285714285714286	2	39	172	1305	0.959052314006426	0.389258159968575	0.0663412489144511	Inf	0.418888258650028	0	1	0	0.440369707811568	0.949913528700898	0.410292459170862	0.4	68	63
TCGA-12-0692-01A-01W-0348-08	0	0	0	0	85	1	2	3	5	79	3239	3	3	1	7	706	1	3	4	8	784	4	4	24	32	910	1	2	29	32	839	0	0	2	2	97	0.0235294117647059	0.0625	0.115613825983313	0.540592783505155	0.0206185567010309	1	0	0	1	101	0.0117647058823529	0.03125	0.110989010989011	0.281559405940594	0.0099009900990099	0.0352941176470588	3	55	198	1551	0.965522146758167	0.427419167659387	0.112246739547521	Inf	0.456896551724138	1.76666666666667	0.45274898395535	1.95743898980292	0.333333333333333	0.986067904816393	0.307319837943899	1	82	76
TCGA-12-0821-01A-01W-0424-08	0	0	0	0	102	1	6	4	10	91	3731	1	5	8	14	939	5	5	3	13	863	3	9	25	37	942	5	1	21	27	987	2	0	1	3	131	0.0294117647058824	0.111111111111111	0.132725430597771	0.837150127226463	0.0229007633587786	0	1	4	5	140	0.0490196078431373	0.135135135135135	0.148619957537155	0.909266409266409	0.0357142857142857	0.0686274509803922	7	47	271	1658	0.650389978193947	0.911219313136903	0.403712343990224	Inf	0.922714227142271	1.77952029520295	0.314071956657006	2.03845024072074	0.773704476175197	0.792213247515089	0.746208143878399	0.314685314685315	95	84
TCGA-12-1597-01B-01D-1495-08	0	0	0	0	89	0	1	4	5	84	3444	1	5	2	8	776	2	4	1	7	826	2	3	31	36	880	4	7	22	33	962	1	2	2	5	139	0.0561797752808989	0.151515151515152	0.144490644490644	1.0486156529322	0.0359712230215827	0	0	2	2	104	0.0224719101123595	0.0555555555555556	0.118181818181818	0.47008547008547	0.0192307692307692	0.0561797752808989	5	54	243	1599	0.901791771900925	0.609417033473787	0.229468425120744	Inf	0.642393806235614	1.26337448559671	0.572951702393773	1.31583133576058	0.572094106685302	0.93029679578342	0.5373060212798	0.265734265734266	84	79
TCGA-12-3649-01A-01D-1495-08	0	0	0	0	99	0	0	2	2	97	3977	7	8	0	15	963	5	2	1	8	941	3	6	28	37	978	7	5	25	37	1095	4	2	0	6	151	0.0606060606060606	0.162162162162162	0.137899543378995	1.17594415607661	0.0397350993377483	0	1	1	2	135	0.0202020202020202	0.0540540540540541	0.138036809815951	0.391591591591592	0.0148148148148148	0.0505050505050505	5	58	286	1787	0.945131907195146	0.538770277618567	0.203631902563331	Inf	0.575258075258075	2.8993006993007	0.0388557557584261	4.16148592422692	0.136759466948146	0.999585759716848	0.120216471044175	0.282051282051282	94	92
TCGA-12-3650-01A-01D-1495-08	0	0	0	0	67	0	0	1	1	66	2706	1	1	2	4	601	0	1	1	2	648	1	5	21	27	733	3	4	26	33	724	1	1	0	2	88	0.0298507462686567	0.0606060606060606	0.121546961325967	0.49862258953168	0.0227272727272727	1	0	3	4	81	0.0597014925373134	0.148148148148148	0.110504774897681	1.34064929126658	0.0493827160493827	0.0746268656716418	5	46	169	1288	0.719697144213342	0.828505340646337	0.308929141603656	Inf	0.845225664230189	4.31065088757396	0.0696867051969489	7.60179760501489	0.550295857988166	0.920012674609401	0.519813393693816	1	62	61
TCGA-12-3652-01A-01D-1495-08	0	0	0	0	74	0	0	2	2	72	2952	0	8	0	8	704	3	5	0	8	706	4	7	24	35	775	1	1	19	21	767	1	0	0	1	120	0.0135135135135135	0.0476190476190476	0.15645371577575	0.304365079365079	0.00833333333333333	1	1	0	2	88	0.027027027027027	0.0571428571428571	0.113548387096774	0.503246753246753	0.0227272727272727	0.027027027027027	2	46	208	1334	0.991453489310283	0.278988552113719	0.0478770506429361	Inf	0.308894230769231	2.96538461538462	0.138892257912356	4.26973015236909	0	1	0	0.4	72	70
TCGA-12-3653-01A-01D-1495-08	0	0	0	0	45	0	1	2	3	42	1722	0	3	0	3	438	0	5	2	7	413	0	1	13	14	442	1	3	14	18	429	0	0	1	1	66	0.0222222222222222	0.0555555555555556	0.153846153846154	0.361111111111111	0.0151515151515152	0	0	0	0	60	0	0	0.135746606334842	0	0	0.0222222222222222	1	27	126	745	0.986899348299967	0.219207885423868	0.0107874629841083	Inf	0.2468820861678	0	1	0	0.256025867136978	0.984744189276775	0.22763617320951	1	44	41
TCGA-12-5295-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	92	1	0	4	4	87	3567	4	4	2	10	859	0	4	1	5	885	4	6	28	38	930	0	8	26	34	893	0	0	1	1	135	0.0108695652173913	0.0294117647058824	0.151175811870101	0.194553376906318	0.00740740740740741	1	0	4	5	131	0.0543478260869565	0.131578947368421	0.140860215053763	0.934110084371233	0.0381679389312977	0.0652173913043478	6	52	266	1557	0.865976283577588	0.675515484979298	0.279836493953117	Inf	0.708970702618616	1.71334586466165	0.468749005432252	1.95033576565528	0.634572542467279	0.909247879391445	0.597423862217459	0.0800865800865801	86	81
TCGA-12-5299-01A-02D-1486-08	0	0	0	0	51	0	0	0	0	51	2091	1	2	0	3	460	1	3	0	4	425	4	2	19	25	617	2	2	15	19	589	2	0	0	2	52	0.0392156862745098	0.105263157894737	0.0882852292020374	1.19230769230769	0.0384615384615385	2	0	1	3	68	0.0588235294117647	0.12	0.110210696920583	1.08882352941176	0.0441176470588235	0.0980392156862745	5	35	120	1086	0.373315750161677	1.29256168325827	0.473680039884019	Inf	1.25625	6.7	0.00133318388223141	18.0065084466307	0.295588235294118	0.971011396078031	0.274418609444527	0.206349206349206	46	46
TCGA-12-5301-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	88	0	3	0	3	85	3485	0	7	2	9	835	2	2	1	5	782	4	2	30	36	896	4	0	31	35	972	1	0	2	3	114	0.0340909090909091	0.0857142857142857	0.117283950617284	0.730827067669173	0.0263157894736842	0	0	0	0	120	0	0	0.133928571428571	0	0	0.0340909090909091	3	66	234	1634	0.993779870508267	0.31752923899178	0.0838846345614437	Inf	0.347082868821999	0.997863247863248	0.657961448804583	0.997559284249789	0.26173462239036	0.997007884021451	0.236814382427471	1	85	82
TCGA-14-0740-01B-01D-1845-08	0	0	0	0	59	0	1	0	1	58	2378	2	2	0	4	526	3	4	1	8	593	1	1	18	20	585	3	3	20	26	674	1	0	1	2	96	0.0338983050847458	0.0769230769230769	0.142433234421365	0.540064102564103	0.0208333333333333	0	0	3	3	79	0.0508474576271186	0.15	0.135042735042735	1.11075949367089	0.0379746835443038	0.0847457627118644	5	37	175	1084	0.712192908244776	0.83717363379221	0.309150954926646	Inf	0.856462585034014	1.79857142857143	0.45176084103695	2.06328062064815	0.757293233082707	0.792622885369722	0.728899830205889	0.206349206349206	54	53
TCGA-14-0781-01B-01D-1696-08	0	0	0	0	40	0	0	3	3	37	1517	0	0	0	0	358	0	1	2	3	369	1	2	11	14	411	3	1	16	20	379	0	0	0	0	49	0	0	0.129287598944591	0	0	0	0	1	1	59	0.025	0.0714285714285714	0.143552311435523	0.497578692493947	0.0169491525423729	0.025	1	30	108	682	0.988945217430371	0.210726936122426	0.010393176726908	Inf	0.235961768219833	0	1	0	0.270919067215364	0.980434531945203	0.243134088973717	1	39	36
TCGA-14-0786-01B-01D-1492-08	0	0	0	0	51	0	0	1	1	50	2050	1	3	2	6	426	1	4	1	6	496	2	2	15	19	593	3	3	13	19	535	1	1	1	3	68	0.0588235294117647	0.157894736842105	0.127102803738318	1.2422600619195	0.0441176470588235	0	0	2	2	78	0.0392156862745098	0.105263157894737	0.131534569983137	0.800269905533063	0.0256410256410256	0.0784313725490196	4	29	146	982	0.635404289957608	0.927772069024158	0.294494250234936	Inf	0.936488169364882	1.54520547945205	0.501503719222069	1.68057308343586	0.827788649706458	0.721704288970416	0.807262193184442	0.523809523809524	47	46
TCGA-14-0787-01A-01W-0424-08	0	0	0	0	47	0	0	2	2	45	1845	2	2	0	4	456	1	2	1	4	432	1	4	12	17	502	1	2	17	20	455	0	0	2	2	72	0.0425531914893617	0.1	0.158241758241758	0.631944444444445	0.0277777777777778	1	1	0	2	69	0.0425531914893617	0.117647058823529	0.137450199203187	0.855924978687127	0.0289855072463768	0.0638297872340425	3	28	141	816	0.85412312110351	0.620318233192154	0.158074514958348	Inf	0.656829100892244	3.3936170212766	0.274348497151478	5.77040076456842	0.468085106382979	0.939732388572974	0.428956774911819	1	44	42
TCGA-14-0789-01A-01W-0424-08	0	0	0	0	86	0	2	3	5	81	3321	2	3	0	5	739	2	1	2	5	796	2	3	26	31	892	1	5	34	40	894	0	0	2	2	114	0.0232558139534884	0.05	0.12751677852349	0.392105263157895	0.0175438596491228	1	0	3	4	118	0.0465116279069767	0.129032258064516	0.132286995515695	0.975396391470749	0.0338983050847458	0.0697674418604651	6	57	232	1554	0.841645041685789	0.705200517753293	0.292819282437912	Inf	0.733169129720854	2.56609195402299	0.342207991494694	3.34582635013101	0.641522988505747	0.902075016290394	0.609073017245494	0.0800865800865801	80	75
TCGA-14-0790-01B-01D-1494-08	0	0	0	0	79	1	3	1	4	74	3034	3	4	2	9	739	0	2	0	2	770	2	3	20	25	739	1	4	33	38	786	0	1	0	1	96	0.0126582278481013	0.0263157894736842	0.122137404580153	0.215460526315789	0.0104166666666667	1	0	0	1	99	0.0126582278481013	0.04	0.133964817320704	0.298585858585859	0.0101010101010101	0.0126582278481013	1	55	195	1330	0.999475684299384	0.124089050302611	0.00618951499533973	Inf	0.139652014652015	2.60683760683761	0.337757579572309	3.40624150080962	0	1	0	1	78	73
TCGA-14-0813-01A-01W-0424-08	0	0	0	0	113	0	0	5	5	107	4387	2	5	3	10	1067	9	7	2	18	995	4	7	22	33	1168	2	5	39	46	1157	0	0	3	3	153	0.0265486725663717	0.0652173913043478	0.132238547968885	0.493179880647911	0.0196078431372549	1	0	1	2	148	0.0176991150442478	0.0606060606060606	0.126712328767123	0.478296478296478	0.0135135135135135	0.0442477876106195	5	62	301	2024	0.94376279900172	0.542391524293791	0.205528613979086	Inf	0.576436753111519	1.28737541528239	0.565467793966219	1.34465728582097	0.506508360111105	0.96304998630758	0.471992401592411	0.206349206349206	108	102
TCGA-14-0817-01A-01W-0424-08	0	0	0	0	87	0	0	4	4	83	3403	2	3	0	5	787	0	2	2	4	838	1	4	40	45	890	0	4	25	29	888	0	0	2	2	125	0.0229885057471264	0.0689655172413793	0.140765765765766	0.489931034482759	0.016	0	0	0	0	105	0	0	0.117977528089888	0	0	0.0229885057471264	2	64	230	1548	0.998715876377732	0.210428913495234	0.0364158386491011	Inf	0.234255599472991	0	1	0	0.237859531772575	0.998551278849743	0.213768558240735	0.333333333333333	85	81
TCGA-14-0862-01B-01D-1845-08	0	0	0	0	51	0	0	3	3	48	1968	4	4	1	9	474	0	3	2	5	472	1	2	9	12	491	2	3	17	22	531	2	0	2	4	72	0.0784313725490196	0.181818181818182	0.135593220338983	1.34090909090909	0.0555555555555556	0	0	0	0	67	0	0	0.136456211812627	0	0	0.0784313725490196	4	25	139	883	0.572059528338906	1.01638831123671	0.319488713467126	Inf	1.01414041180848	4.90167865707434	0.0513106515091911	12.6494323088148	0.565578306585501	0.885333274230517	0.529634855719674	1	47	44
TCGA-14-0871-01A-01W-0424-08	0	0	0	0	66	0	2	0	2	63	2583	3	6	1	10	634	6	6	1	13	626	5	4	12	21	613	5	3	11	19	710	1	0	2	3	102	0.0454545454545455	0.157894736842105	0.143661971830986	1.09907120743034	0.0294117647058824	1	1	4	6	99	0.0909090909090909	0.285714285714286	0.161500815660685	1.76911976911977	0.0606060606060606	0.121212121212121	8	25	201	1122	0.121928347601889	1.7853508017384	0.799396794767194	Inf	1.59565807327001	1.31641791044776	0.464600199926356	1.39512990105905	1.71706683971447	0.128300734951931	1.96900143679423	0.153434800493624	58	55
TCGA-14-1043-01B-11D-1845-08	0	0	0	0	28	0	1	2	3	25	1025	0	1	3	4	253	0	1	2	3	249	0	2	8	10	280	2	1	5	8	243	1	0	0	1	28	0.0357142857142857	0.125	0.11522633744856	1.08482142857143	0.0357142857142857	0	0	0	0	43	0	0	0.153571428571429	0	0	0.0357142857142857	1	14	71	452	0.887617290134179	0.455230991225723	0.0215387930693763	Inf	0.491079812206573	3.6830985915493	0.255703380588877	6.32882874871847	0	1	0	1	27	24
TCGA-14-1395-01B-11D-1845-08	0	0	0	0	65	0	1	5	6	59	2419	4	0	0	4	537	1	3	1	5	588	1	3	23	27	627	1	1	21	23	667	1	0	2	3	85	0.0461538461538462	0.130434782608696	0.12743628185907	1.02352941176471	0.0352941176470588	1	1	0	2	82	0.0307692307692308	0.0740740740740741	0.130781499202552	0.56639566395664	0.024390243902439	0.0615384615384615	4	42	167	1127	0.859553987265986	0.642897373494796	0.20808434851863	Inf	0.67378286904452	7.74850299401198	0.0169169169169169	Inf	0.352204681545999	0.981996530167924	0.321538898540323	1	61	55
TCGA-14-1450-01B-01D-1845-08	0	0	0	0	72	0	1	2	3	69	2829	2	1	0	3	662	3	4	2	9	680	1	2	24	27	785	1	4	25	30	702	0	1	0	1	94	0.0138888888888889	0.0333333333333333	0.133903133903134	0.248936170212766	0.0106382978723404	0	0	0	0	96	0	0	0.122292993630573	0	0	0	0	51	190	1297	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	72	69
TCGA-14-1456-01B-01D-1494-08	0	0	0	0	30	0	0	0	0	30	1230	0	3	1	4	293	1	2	1	4	297	0	0	4	4	323	3	2	13	18	317	0	0	0	0	41	0	0	0.129337539432177	0	0	0	0	0	0	44	0	0	0.136222910216718	0	0	0	0	20	85	555	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	30	30
TCGA-14-1823-01A-01W-0643-08	0	0	0	0	66	0	0	0	0	66	2706	5	1	2	8	622	2	4	0	6	638	4	4	19	27	727	5	5	15	25	719	1	2	1	4	80	0.0606060606060606	0.16	0.111265646731572	1.438	0.05	1	1	0	2	90	0.0303030303030303	0.0740740740740741	0.123796423658872	0.598353909465021	0.0222222222222222	0.0454545454545455	3	40	170	1276	0.893573345167624	0.563118275214251	0.146154996266415	Inf	0.59343365253078	1.89019607843137	0.28874209632943	2.14306149273791	0.250173010380623	0.985371747637209	0.227583661550711	1	63	63
TCGA-14-1825-01A-01W-0643-08	0	0	0	0	61	0	0	1	1	60	2460	1	3	1	5	530	1	0	0	1	565	1	6	22	29	666	2	4	19	25	699	0	0	1	1	82	0.0163934426229508	0.04	0.117310443490701	0.340975609756098	0.0121951219512195	0	1	0	1	60	0.0163934426229508	0.0344827586206897	0.0900900900900901	0.382758620689655	0.0166666666666667	0.0163934426229508	1	43	142	1223	0.991656860779016	0.200421752432307	0.0100065032106638	Inf	0.218469910371319	0	1	0	0.23445551356922	0.988495548147121	0.215450586356702	1	60	59
TCGA-14-1829-01A-01W-0643-08	0	0	0	0	60	0	1	0	1	59	2419	0	3	0	3	519	1	3	1	5	592	2	1	17	20	632	5	5	21	31	676	2	2	0	4	84	0.0666666666666667	0.129032258064516	0.124260355029586	1.0384024577573	0.0476190476190476	2	0	0	2	62	0.0333333333333333	0.1	0.0981012658227848	1.01935483870968	0.032258064516129	0.0666666666666667	4	41	146	1162	0.754450792022749	0.776611088715581	0.250753416546348	Inf	0.79634703196347	5.11937377690802	0.00432585761786545	10.5748219116968	0	1	0	0.0606060606060606	56	55
TCGA-14-2554-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	83	0	1	0	1	82	3362	5	6	1	12	817	0	2	2	4	758	0	6	24	30	903	1	8	27	36	884	0	0	0	0	100	0	0	0.113122171945701	0	0	0	0	0	0	121	0	0	0.133997785160576	0	0	0	0	52	221	1566	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	83	82
TCGA-14-3476-01B-01D-1353-08	0	0	0	0	99	0	0	1	1	98	4018	2	5	1	8	932	2	7	1	10	932	3	6	31	40	1108	4	16	20	40	1046	1	2	1	4	146	0.0404040404040404	0.1	0.139579349904398	0.716438356164384	0.0273972602739726	1	1	1	3	130	0.0303030303030303	0.075	0.117328519855596	0.639230769230769	0.0230769230769231	0.0404040404040404	4	54	276	1878	0.948379311502263	0.504149329452266	0.165463730302938	Inf	0.538230884557721	2.22981366459627	0.224316643382582	2.71996781529126	0.306052855924979	0.991863406656187	0.277829949955423	1	95	94
TCGA-14-4157-01A-01D-1353-08	0	0	0	0	70	0	0	6	6	64	2624	1	9	2	12	627	2	6	2	10	646	3	1	12	16	714	3	6	17	26	637	2	1	0	3	91	0.0428571428571429	0.115384615384615	0.142857142857143	0.807692307692308	0.032967032967033	1	0	0	1	111	0.0142857142857143	0.0625	0.15546218487395	0.402027027027027	0.00900900900900901	0.0428571428571429	3	32	202	1149	0.910548116882144	0.533458992345445	0.137345565740125	Inf	0.573267326732673	3.34405940594059	0.0478441018800112	5.67668416662633	0	1	0	0.142857142857143	67	61
TCGA-15-0742-01A-01W-0348-08	0	0	0	0	83	0	1	2	3	80	3280	2	2	1	5	819	3	6	1	10	779	4	4	27	35	858	4	4	22	30	824	1	2	0	3	103	0.036144578313253	0.1	0.125	0.8	0.029126213592233	0	1	0	1	96	0.0120481927710843	0.0285714285714286	0.111888111888112	0.255357142857143	0.0104166666666667	0.0120481927710843	1	56	199	1483	0.999163432726324	0.133152070716457	0.00664647094208121	Inf	0.14828528607952	1.05653266331658	0.63572646249906	1.06458754971722	0	1	0	1	82	79
TCGA-15-1444-01A-02D-1696-08	0	0	0	0	23	0	0	5	5	18	738	1	2	0	3	170	0	0	1	1	177	1	0	10	11	179	1	0	2	3	212	0	0	1	1	25	0.0434782608695652	0.333333333333333	0.117924528301887	2.82666666666667	0.04	0	0	1	1	25	0.0434782608695652	0.0909090909090909	0.139664804469274	0.650909090909091	0.04	0.0869565217391304	2	12	50	341	0.556554019396556	1.13626042237819	0.177162352904278	Inf	1.11714285714286	0	1	0	1.30333333333333	0.472933366680374	1.36282881624708	0.333333333333333	21	16
TCGA-16-0846-01A-01W-0424-08	0	0	0	0	87	0	1	0	1	86	3526	5	6	2	13	816	2	3	0	5	777	4	10	29	43	969	2	3	20	25	964	1	0	2	3	108	0.0344827586206897	0.12	0.112033195020747	1.07111111111111	0.0277777777777778	0	0	1	1	123	0.0114942528735632	0.0232558139534884	0.126934984520124	0.18321043675553	0.00813008130081301	0.0459770114942529	4	51	231	1702	0.905990575461233	0.578011165235451	0.189054808085398	Inf	0.60857929948839	1.39466089466089	0.534974540213712	1.47324601871921	0.512324410283594	0.941484282731279	0.48065636058395	0.485714285714286	83	82
TCGA-16-0861-01A-01W-0424-08	0	0	0	0	74	0	0	2	2	71	2911	5	6	2	13	657	2	4	3	9	733	5	4	16	25	766	1	4	19	24	755	0	1	1	2	102	0.027027027027027	0.0833333333333333	0.135099337748344	0.616830065359477	0.0196078431372549	2	1	1	4	80	0.0540540540540541	0.16	0.10443864229765	1.532	0.05	0.0540540540540541	4	37	182	1339	0.739129805826226	0.795474316393484	0.256337311937496	Inf	0.815331010452962	2.78571428571429	0.156421690910219	3.67372926633776	0.477551020408163	0.932571960944882	0.446058574963959	1	70	67
TCGA-16-1045-01B-01W-0611-08	0	0	0	0	118	0	1	3	4	114	4674	3	6	1	10	1085	4	9	3	16	1097	2	6	40	48	1220	2	7	31	40	1272	1	1	1	3	152	0.0254237288135593	0.075	0.119496855345912	0.627631578947368	0.0197368421052632	1	3	2	6	166	0.0508474576271186	0.125	0.136065573770492	0.918674698795181	0.036144578313253	0.0423728813559322	5	70	318	2174	0.968801883318639	0.488426991700236	0.185801863934267	Inf	0.522431865828092	3.91823899371069	0.0824274520724595	6.82661440105324	0.331118788200904	0.995741820837983	0.301700675775379	1	113	109
TCGA-16-1048-01B-01D-1353-08	0	0	0	0	103	0	1	2	3	100	4100	2	3	1	6	972	2	7	2	11	936	3	10	37	50	1102	4	5	24	33	1090	1	1	0	2	151	0.0194174757281553	0.0606060606060606	0.138532110091743	0.437487457355007	0.0132450331125828	0	2	1	3	141	0.029126213592233	0.06	0.127949183303085	0.468936170212766	0.0212765957446809	0.0194174757281553	2	66	292	1900	0.999242910063981	0.197257329278514	0.0341575942192345	Inf	0.220789685737309	1.07240704500978	0.633018011623085	1.08446015883578	0.123063103525713	0.999819940042135	0.108497329235144	1	101	98
TCGA-19-1390-01A-01D-1495-08	0	0	0	0	139	0	0	1	1	138	5658	3	9	2	14	1421	6	12	2	20	1353	4	6	34	44	1468	2	10	48	60	1416	1	3	6	10	195	0.0719424460431655	0.166666666666667	0.13771186440678	1.21025641025641	0.0512820512820513	0	1	4	5	220	0.0359712230215827	0.113636363636364	0.149863760217984	0.758264462809917	0.0227272727272727	0.079136690647482	11	77	415	2469	0.73635005744611	0.849958227433915	0.456060569752204	Inf	0.868674698795181	1.15823293172691	0.606783652294683	1.18978729809592	0.847487511019689	0.758404385391358	0.826355410568506	0.0016991504247876	128	127
TCGA-19-1790-01B-01D-1353-08	0	0	0	0	189	0	1	8	9	180	7380	5	8	2	15	1706	7	13	0	20	1727	14	18	37	69	2015	15	19	42	76	1932	4	2	2	8	260	0.0423280423280423	0.105263157894737	0.134575569358178	0.782186234817814	0.0307692307692308	3	3	0	6	251	0.0317460317460317	0.0869565217391304	0.124565756823821	0.698077256192621	0.0239043824701195	0.0476190476190476	9	99	511	3436	0.947769328103152	0.611342637979412	0.30892987922654	Inf	0.643672537508154	1.86443079829948	0.0736653902759494	2.13895291745316	0.195546087344249	0.999759300373855	0.174691818769747	0.103188405797102	180	171
TCGA-19-2619-01A-01D-1495-08	0	0	0	0	63	0	0	2	2	61	2501	1	0	0	1	561	0	1	0	1	582	3	2	25	30	681	3	3	23	29	677	2	0	5	7	89	0.111111111111111	0.241379310344828	0.131462333825702	1.83611003487021	0.0786516853932584	1	1	3	5	78	0.0793650793650794	0.166666666666667	0.114537444933921	1.45512820512821	0.0641025641025641	0.174603174603175	11	43	167	1191	0.0675940599167913	1.82341268030673	0.942630679572646	Inf	1.65646484808161	4.06586826347305	0.0285909791456557	7.11335879938394	1.35528942115768	0.23975934412777	1.42593638331371	0.0995327192661963	52	50
TCGA-19-2620-01A-01D-1495-08	0	0	0	0	88	1	0	2	2	85	3485	1	4	2	7	837	4	1	0	5	825	3	5	31	39	870	4	3	27	34	953	0	3	0	3	116	0.0340909090909091	0.0882352941176471	0.121720881427072	0.724898580121704	0.0258620689655172	1	1	1	3	109	0.0340909090909091	0.0769230769230769	0.125287356321839	0.613973182780522	0.0275229357798165	0.0227272727272727	2	63	225	1598	0.997876079745984	0.225572049758066	0.0390089525486103	Inf	0.249299145299145	1.15746031746032	0.603202487056721	1.18358090322655	0.139693486590038	0.999472219153904	0.124667113519605	1	86	83
TCGA-19-2623-01A-01D-1495-08	0	0	0	0	113	0	1	3	4	109	4469	0	3	2	5	1042	3	11	1	15	1074	7	3	39	49	1145	5	5	30	40	1208	4	0	2	6	163	0.0530973451327434	0.15	0.134933774834437	1.11165644171779	0.0368098159509202	0	0	3	3	149	0.0265486725663717	0.0612244897959184	0.130131004366812	0.470483495411588	0.0201342281879195	0.079646017699115	9	72	312	2041	0.761251646335812	0.81777172888531	0.407894665553061	Inf	0.837962962962963	2.51388888888889	0.0645064684352539	3.26845588142984	0.546497584541063	0.959040885394738	0.511181227030378	1	104	100
TCGA-19-2624-01A-01D-1495-08	0	0	0	0	56	0	1	1	2	53	2173	3	4	1	8	479	0	2	0	2	519	4	0	19	23	595	2	6	12	20	580	0	0	0	0	74	0	0	0.127586206896552	0	0	0	0	0	0	83	0	0	0.139495798319328	0	0	0	0	37	157	1018	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	56	53
TCGA-19-2625-01A-01D-1495-08	0	0	0	0	68	0	1	5	6	62	2542	1	4	0	5	630	3	10	1	14	578	2	2	16	20	652	4	3	16	23	682	0	0	0	0	82	0	0	0.120234604105572	0	0	1	0	1	2	97	0.0294117647058824	0.1	0.148773006134969	0.672164948453608	0.0206185567010309	0.0294117647058824	2	36	179	1155	0.970261969531335	0.358658364183768	0.0609579768103467	Inf	0.392237577183181	1.24208566108007	0.579890461771344	1.29023219135628	0.232891061452514	0.989720997809919	0.208282823764559	1	66	60
TCGA-19-2629-01A-01D-1495-08	0	0	0	0	121	0	1	30	31	90	3690	2	14	2	18	837	4	9	1	14	907	5	5	19	29	994	2	6	21	29	952	0	0	3	3	129	0.0247933884297521	0.103448275862069	0.135504201680672	0.763432237369687	0.0232558139534884	1	2	0	3	126	0.0247933884297521	0.103448275862069	0.126760563380282	0.816091954022989	0.0238095238095238	0.0330578512396694	4	43	255	1691	0.878843016188425	0.616998864386418	0.20069759907122	Inf	0.649478514810179	1.09019607843137	0.626620007515914	1.10513290368335	0.572352941176471	0.909083231976784	0.537814524149624	0.545454545454546	117	86
TCGA-19-2631-01A-01D-1353-08	0	0	0	0	123	0	0	5	5	118	4838	3	11	1	15	1118	1	9	2	12	1140	4	4	31	39	1293	9	7	36	52	1287	3	2	1	6	147	0.0487804878048781	0.115384615384615	0.114219114219114	1.01020408163265	0.0408163265306122	0	0	4	4	128	0.032520325203252	0.102564102564103	0.0989945862335654	1.03605769230769	0.03125	0.0650406504065041	8	72	275	2305	0.62985955980717	0.931329246152221	0.443706496022367	Inf	0.938181818181818	2.16503496503497	0.155685547555768	2.5132865278046	0.700135685210312	0.85306530743815	0.676039776110353	0.649916646820672	115	110
TCGA-19-4068-01A-01D-1353-08	0	0	0	0	85	0	1	4	5	80	3280	2	6	0	8	760	1	2	1	4	744	2	4	31	37	906	3	5	23	31	870	1	0	1	2	97	0.0235294117647059	0.0645161290322581	0.111494252873563	0.578649817093449	0.0206185567010309	0	1	0	1	94	0.0117647058823529	0.027027027027027	0.103752759381898	0.260494537090282	0.0106382978723404	0.0235294117647059	2	57	191	1585	0.989600559192591	0.291297117003022	0.0502059569556055	Inf	0.315200993877008	1.85968586387435	0.435056888826591	2.07349958752167	0.172193135543921	0.997709429458644	0.156655417383535	1	83	78
TCGA-19-5947-01A-11D-1696-08	0	0	0	0	30	0	4	2	6	24	984	0	0	1	1	205	1	3	0	4	255	1	0	8	9	247	0	2	8	10	277	0	0	0	0	39	0	0	0.140794223826715	0	0	1	0	0	1	26	0.0333333333333333	0.111111111111111	0.105263157894737	1.05555555555556	0.0384615384615385	0.0333333333333333	1	16	65	459	0.894335276278339	0.441842343151896	0.021050409895163	Inf	0.47420814479638	8.06153846153846	0.125714285714286	Inf	0	1	0	1	29	23
TCGA-19-5950-01A-11D-1696-08	0	0	0	0	66	0	0	2	2	64	2624	2	4	0	6	602	1	5	1	7	632	0	0	12	12	696	1	5	33	39	694	0	2	1	3	93	0.0454545454545455	0.0769230769230769	0.134005763688761	0.574028122415219	0.032258064516129	0	0	2	2	74	0.0303030303030303	0.166666666666667	0.10632183908046	1.56756756756757	0.027027027027027	0.0454545454545455	3	43	167	1223	0.924744068877297	0.511120363119374	0.13297783076369	Inf	0.542827388700859	0	1	0	0.554890219560878	0.917779391271362	0.523284762351706	0.166666666666667	63	61
TCGA-19-5951-01A-11D-1696-08	0	0	0	0	90	0	1	3	4	86	3526	1	6	0	7	785	1	7	2	10	798	1	5	25	31	933	2	2	34	38	1010	0	0	0	0	109	0	0	0.107920792079208	0	0	0	1	0	1	105	0.0111111111111111	0.032258064516129	0.112540192926045	0.286635944700461	0.00952380952380952	0	0	62	214	1729	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	90	86
TCGA-19-5952-01A-11D-1696-08	0	0	0	0	52	0	0	2	2	50	2050	2	4	0	6	459	0	1	0	1	499	1	1	18	20	516	1	1	21	23	576	0	0	1	1	92	0.0192307692307692	0.0434782608695652	0.159722222222222	0.272211720226843	0.0108695652173913	1	0	1	2	57	0.0384615384615385	0.1	0.11046511627907	0.905263157894737	0.0350877192982456	0.0576923076923077	3	38	149	943	0.929978247234658	0.499889874491147	0.129272488458585	Inf	0.536257980029465	3.66442953020134	0.255531711690314	6.31107850279681	0.375838926174497	0.975550797408864	0.342322505936661	1	49	47
TCGA-19-5953-01B-12D-1845-08	0	0	0	0	72	0	0	2	2	70	2870	1	4	0	5	643	0	4	1	5	695	2	2	23	27	789	5	1	27	33	743	1	0	1	2	89	0.0277777777777778	0.0606060606060606	0.11978465679677	0.505958461014641	0.0224719101123595	0	1	0	1	94	0.0138888888888889	0.037037037037037	0.119138149556401	0.310874704491726	0.0106382978723404	0.0277777777777778	2	55	183	1349	0.993355043399309	0.268195980318135	0.0461673316233558	Inf	0.293739814015914	1.19594067135051	0.590647372640473	1.22841914956339	0.167431693989071	0.998138924826407	0.150532749547287	1	70	68
TCGA-19-5954-01A-11D-1696-08	0	0	0	0	88	0	1	2	3	85	3485	3	11	0	14	810	2	5	0	7	834	0	5	26	31	896	3	4	26	33	945	1	1	2	4	124	0.0454545454545455	0.121212121212121	0.131216931216931	0.92375366568915	0.032258064516129	0	1	1	2	135	0.0227272727272727	0.0645161290322581	0.150669642857143	0.428195937873357	0.0148148148148148	0.0454545454545455	4	51	259	1582	0.959293087316506	0.479213733876438	0.156886865602114	Inf	0.516953316953317	2.36936936936937	0.366324824943147	3.05142125006028	0.41008316008316	0.982301070679819	0.374102129512431	0.545454545454546	84	81
TCGA-19-5955-01A-11D-1696-08	0	0	0	0	97	1	0	3	3	93	3813	1	3	5	9	894	1	12	0	13	891	1	2	36	39	1039	1	5	26	32	989	1	0	1	2	116	0.0206185567010309	0.0625	0.117290192113246	0.532866379310345	0.0172413793103448	0	0	1	1	143	0.0103092783505155	0.0256410256410256	0.137632338787295	0.186300878608571	0.00699300699300699	0.0309278350515464	3	61	259	1769	0.990942612504746	0.336025301648102	0.0886655309840434	Inf	0.36703667953668	3.91505791505792	0.239808491163839	6.81807587180787	0.25258438161664	0.997722377499543	0.227765681597862	1	94	90
TCGA-19-5958-01A-11D-1696-08	0	0	0	0	52	0	0	1	1	51	2091	4	3	0	7	493	3	1	0	4	494	1	4	17	22	558	0	3	15	18	546	0	0	0	0	69	0	0	0.126373626373626	0	0	0	0	0	0	62	0	0	0.111111111111111	0	0	0	0	33	131	973	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	52	51
TCGA-19-5959-01A-11D-1696-08	0	0	0	0	104	0	0	5	5	99	4059	3	9	0	12	875	0	3	0	3	993	2	4	35	41	1054	1	3	39	43	1137	0	0	0	0	152	0	0	0.133685136323659	0	0	0	0	0	0	112	0	0	0.106261859582543	0	0	0	0	77	264	1927	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	104	99
TCGA-19-5960-01A-11D-1696-08	0	0	0	0	51	0	0	2	2	49	2009	1	2	0	3	460	0	2	0	2	500	2	6	18	26	512	3	2	13	18	537	2	1	0	3	82	0.0588235294117647	0.166666666666667	0.152700186219739	1.09146341463415	0.0365853658536585	0	1	1	2	66	0.0392156862745098	0.0769230769230769	0.12890625	0.596736596736597	0.0303030303030303	0.0588235294117647	3	33	148	901	0.898220900736123	0.553688483338543	0.142319264007408	Inf	0.590653153153153	2.83513513513514	0.150438708331917	4.0506767654966	0.228639930252833	0.990651223208579	0.203100112564036	1	48	46
TCGA-26-1439-01A-01D-1353-08	0	0	0	0	59	0	2	0	2	57	2337	0	3	1	4	489	1	4	1	6	489	2	2	21	25	666	5	2	15	22	693	0	1	0	1	72	0.0169491525423729	0.0454545454545455	0.103896103896104	0.4375	0.0138888888888889	1	0	0	1	64	0.0169491525423729	0.04	0.0960960960960961	0.41625	0.015625	0.0169491525423729	1	42	136	1223	0.988811472454952	0.214243906835473	0.0106855135804814	Inf	0.232387140902873	1.42752100840336	0.5236112158586	1.49824446346031	0	1	0	1	58	56
TCGA-26-1442-01A-01D-1696-08	0	0	0	0	60	0	1	0	1	59	2419	3	7	0	10	577	1	9	0	10	566	6	4	16	26	649	3	2	8	13	627	1	1	0	2	89	0.0333333333333333	0.153846153846154	0.141945773524721	1.0838375108038	0.0224719101123595	3	0	1	4	94	0.0666666666666667	0.153846153846154	0.144838212634823	1.06219312602291	0.0425531914893617	0.0833333333333333	5	28	183	1093	0.524766765765347	1.06651117753334	0.387845732560424	Inf	1.05646630236794	3.0989678202793	0.0301541595730664	4.76929304279284	0.290528233151184	0.975231663272992	0.259848745737016	0.242424242424242	55	54
TCGA-26-5132-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	57	0	1	3	4	53	2173	3	6	0	9	494	2	6	0	8	559	1	3	13	17	553	0	0	19	19	567	0	0	2	2	71	0.0350877192982456	0.105263157894737	0.125220458553792	0.840622683469237	0.028169014084507	0	0	1	1	65	0.0175438596491228	0.0588235294117647	0.11754068716094	0.500452488687783	0.0153846153846154	0.0526315789473684	3	30	136	984	0.781430375872796	0.723710637096203	0.185056176532311	Inf	0.748663101604278	0	1	0	0.772058823529412	0.76342277182684	0.748648661870644	0.1	54	50
TCGA-26-5133-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	66	0	0	4	4	62	2542	2	5	2	9	607	2	8	1	11	591	2	0	18	20	644	0	5	17	22	700	0	0	1	1	108	0.0151515151515152	0.0454545454545455	0.154285714285714	0.294612794612795	0.00925925925925926	2	0	2	4	87	0.0606060606060606	0.2	0.135093167701863	1.48045977011494	0.0459770114942529	0.0757575757575758	5	32	195	1149	0.640192498723571	0.920704162305059	0.337800243075327	Inf	0.931392931392931	6.89230769230769	0.0213282367692792	Inf	0.590769230769231	0.899045682759966	0.5525998499136	1	61	57
TCGA-26-5134-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	60	0	0	2	2	58	2378	1	6	1	8	575	1	6	0	7	596	2	5	9	16	564	5	7	15	27	643	4	1	0	5	83	0.0833333333333333	0.185185185185185	0.129082426127527	1.43462739848282	0.0602409638554217	0	0	1	1	62	0.0166666666666667	0.0625	0.109929078014184	0.568548387096774	0.0161290322580645	0.0833333333333333	5	26	145	1062	0.319216986707635	1.40804400061283	0.508178893966575	Inf	1.34260289210234	4.75665024630542	0.00567124544734883	9.73261977006685	0.34683908045977	0.953136245877241	0.318634842078385	0.242424242424242	55	53
TCGA-26-5135-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	78	0	0	1	1	77	3157	0	2	3	5	663	1	3	1	5	737	3	4	28	35	839	1	2	29	32	918	0	0	0	0	103	0	0	0.112200435729847	0	0	0	0	0	0	98	0	0	0.116805721096544	0	0	0	0	61	201	1556	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	78	77
TCGA-26-5136-01B-01D-1486-08	0	0	0	0	66	0	0	4	4	62	2542	2	1	0	3	577	0	7	0	7	557	3	3	18	24	747	4	3	21	28	661	1	2	1	4	84	0.0606060606060606	0.142857142857143	0.127080181543116	1.12414965986395	0.0476190476190476	1	0	0	1	82	0.0151515151515152	0.0416666666666667	0.109772423025435	0.379573170731707	0.0121951219512195	0.0454545454545455	3	43	166	1242	0.918523926037744	0.522180412978039	0.135850728366924	Inf	0.553169198533264	2.42340791738382	0.197576248711097	2.98938848851588	0.217485325919061	0.992177605632234	0.197015981070046	1	63	59
TCGA-26-5139-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	61	0	1	2	3	58	2378	2	3	0	5	537	0	3	0	3	575	1	3	24	28	644	2	4	16	22	622	0	0	1	1	78	0.0163934426229508	0.0454545454545455	0.12540192926045	0.362470862470862	0.0128205128205128	1	1	1	3	71	0.0491803278688525	0.107142857142857	0.110248447204969	0.971830985915493	0.0422535211267606	0.0491803278688525	3	40	149	1117	0.893821693167636	0.562450165308967	0.145774926641467	Inf	0.592789136881536	2.83221476510067	0.31456295477037	3.74220561301745	0.424832214765101	0.956558814166026	0.394759759079217	1	58	55
TCGA-26-6173-01A-11D-1845-08	0	0	0	0	46	0	0	1	1	45	1845	1	5	2	8	447	1	2	1	4	408	1	2	15	18	473	1	3	11	15	517	1	0	2	3	48	0.0652173913043478	0.2	0.0928433268858801	2.15416666666667	0.0625	0	0	0	0	63	0	0	0.133192389006343	0	0	0.0652173913043478	3	25	111	879	0.624167358503236	0.950312231721888	0.240015219120999	Inf	0.955598455598456	4.45945945945946	0.213160378893916	7.88771554892689	0.686070686070686	0.805437585660064	0.66014178271806	1	43	42
TCGA-26-6174-01A-21D-1845-08	0	0	0	0	102	0	1	0	1	101	4141	3	8	3	14	1034	3	10	1	14	1030	9	3	28	40	1023	4	7	22	33	1054	1	1	2	4	145	0.0392156862745098	0.121212121212121	0.137571157495256	0.881086729362591	0.0275862068965517	2	0	1	3	149	0.0294117647058824	0.075	0.145650048875855	0.51493288590604	0.0201342281879195	0.0588235294117647	6	57	294	1783	0.895450580742755	0.638498150674246	0.26565189533012	Inf	0.672821509556203	1.63029827315542	0.277982192003918	1.81874836671129	0.423877551020408	0.978665533626605	0.387226086963912	1	96	95
TCGA-27-1830-01A-01W-0643-08	0	0	0	0	61	0	0	0	0	61	2501	1	4	1	6	637	2	1	1	4	614	3	2	19	24	624	1	3	23	27	626	1	0	2	3	79	0.0491803278688525	0.111111111111111	0.126198083067093	0.880450070323488	0.0379746835443038	2	0	1	3	106	0.0491803278688525	0.125	0.169871794871795	0.735849056603774	0.0283018867924528	0.0983606557377049	6	40	185	1065	0.693859743204524	0.863606928868412	0.352245141577763	Inf	0.881316098707403	5.06756756756757	0.0118212815110313	17.2047316503758	0.482625482625483	0.95757311275161	0.443035979327998	1	55	55
TCGA-27-1831-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	70	0	2	1	3	67	2747	0	2	0	2	644	1	2	0	3	689	4	4	24	32	711	0	5	25	30	703	0	2	1	3	84	0.0428571428571429	0.1	0.119487908961593	0.836904761904762	0.0357142857142857	0	0	2	2	95	0.0285714285714286	0.0625	0.133614627285513	0.467763157894737	0.0210526315789474	0.0428571428571429	3	50	179	1235	0.969869371459819	0.414147156479521	0.108346375464535	Inf	0.447138189100875	0	1	0	0.483639265762171	0.955364257327043	0.450146881392783	0.166666666666667	67	64
TCGA-27-1832-01A-01W-0643-08	0	0	0	0	45	0	1	1	2	43	1763	1	3	1	5	416	1	3	1	5	449	2	2	14	18	443	1	2	12	15	455	0	0	0	0	54	0	0	0.118681318681319	0	0	1	0	1	2	55	0.0444444444444444	0.111111111111111	0.124153498871332	0.894949494949495	0.0363636363636364	0.0444444444444444	2	27	109	789	0.881548458271038	0.536476726491899	0.0897172785650242	Inf	0.568174628282189	2.74617737003058	0.323677889314267	3.61155058565579	0.316866619618913	0.964705579030235	0.28978914850516	1	43	41
TCGA-27-1833-01A-01W-0643-08	0	0	0	0	70	0	1	3	4	66	2706	2	4	0	6	594	1	3	1	5	577	0	3	26	29	786	0	2	24	26	749	0	0	0	0	75	0	0	0.100133511348465	0	0	0	0	1	1	64	0.0142857142857143	0.0344827586206897	0.0814249363867685	0.423491379310345	0.015625	0.0142857142857143	1	49	139	1396	0.990907544560667	0.205076039917441	0.0102649567313107	Inf	0.220863309352518	NaN	1	0	0.220863309352518	0.990907544560667	0.205076039917441	1	69	65
TCGA-27-1834-01A-01W-0643-08	0	0	0	0	69	0	1	0	1	68	2788	4	4	0	8	619	5	1	2	8	710	2	2	19	23	721	0	2	27	29	738	0	0	2	2	98	0.0289855072463768	0.0689655172413793	0.132791327913279	0.519352568613652	0.0204081632653061	0	1	1	2	92	0.0289855072463768	0.0869565217391304	0.127600554785021	0.681474480151229	0.0217391304347826	0.0434782608695652	3	45	190	1269	0.957346086184113	0.445441001040418	0.116203315666959	Inf	0.479934210526316	0	1	0	0.500800915331808	0.947894374261131	0.466155184184813	0.142857142857143	66	65
TCGA-27-1835-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	76	0	1	5	6	70	2870	2	4	1	7	654	2	3	1	6	709	3	6	17	26	726	3	7	21	31	781	1	0	2	3	101	0.0394736842105263	0.0967741935483871	0.12932138284251	0.748323219418716	0.0297029702970297	1	2	0	3	92	0.0394736842105263	0.115384615384615	0.126721763085399	0.910535117056856	0.0326086956521739	0.0526315789473684	4	40	193	1314	0.830835744044522	0.680977079281029	0.220318908477318	Inf	0.709844559585492	2.60276338514681	0.174851337647229	3.40010932665139	0.410962639760022	0.963123216341056	0.378405179327368	1	72	66
TCGA-27-1836-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	53	0	0	3	3	50	2050	2	4	1	7	487	1	0	0	1	455	2	0	16	18	527	0	1	23	24	581	0	0	1	1	68	0.0188679245283019	0.0416666666666667	0.117039586919105	0.356004901960784	0.0147058823529412	0	0	1	1	72	0.0188679245283019	0.0555555555555556	0.136622390891841	0.406635802469136	0.0138888888888889	0.0377358490566038	2	39	140	968	0.971645023300559	0.354799294410275	0.0603355312723902	Inf	0.386062717770035	0	1	0	0.405860805860806	0.96462428287947	0.373970085520349	0.333333333333333	51	48
TCGA-27-1837-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	42	0	0	1	1	41	1681	0	3	1	4	393	0	2	2	4	390	0	0	10	10	438	2	3	18	23	460	0	1	3	4	57	0.0952380952380952	0.173913043478261	0.123913043478261	1.40350877192982	0.0701754385964912	0	0	0	0	38	0	0	0.0867579908675799	0	0	0.0714285714285714	3	27	95	803	0.63108668683851	0.939236813721836	0.23767528753831	Inf	0.945263157894737	0	1	0	1.01278195488722	0.583953597909824	1.01430134354712	0.142857142857143	39	38
TCGA-27-1838-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	118	0	1	4	5	112	4592	3	8	2	13	1183	3	8	1	12	1099	7	8	31	46	1162	6	11	24	41	1148	2	2	1	5	172	0.0423728813559322	0.121951219512195	0.149825783972125	0.813953488372093	0.0290697674418605	2	2	2	6	165	0.0508474576271186	0.130434782608696	0.141996557659208	0.918577075098814	0.0363636363636364	0.0593220338983051	7	61	337	1973	0.882311824665507	0.67193909284649	0.301420878947002	Inf	0.705620527142608	2.10910750970098	0.110361588038276	2.6005380248061	0.373887240356083	0.990390791128496	0.337870353479849	1	111	105
TCGA-27-2518-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	62	0	0	1	1	61	2501	1	0	2	3	566	2	1	0	3	571	3	4	19	26	686	2	4	23	29	678	1	1	0	2	79	0.032258064516129	0.0689655172413793	0.116519174041298	0.591881274552597	0.0253164556962025	0	1	1	2	69	0.032258064516129	0.0769230769230769	0.100583090379009	0.764771460423634	0.0289855072463768	0.032258064516129	2	45	148	1216	0.968523864385674	0.365344616318405	0.0624345990973408	Inf	0.392179413456009	1.84324324324324	0.438443359845123	2.05265636665327	0.219433719433719	0.991595721825805	0.200523142402993	1	60	59
TCGA-27-2519-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	55	0	0	3	3	52	2132	0	2	2	4	452	3	1	1	5	563	2	3	17	22	511	1	4	16	21	606	0	1	0	1	84	0.0181818181818182	0.0476190476190476	0.138613861386139	0.343537414965986	0.0119047619047619	0	0	0	0	51	0	0	0.0998043052837573	0	0	0	0	36	135	982	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	55	52
TCGA-27-2521-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	81	0	2	2	4	76	3116	5	6	0	11	751	1	7	2	10	758	3	8	21	32	800	5	2	16	23	807	4	0	1	5	104	0.0617283950617284	0.217391304347826	0.128872366790582	1.686872909699	0.0480769230769231	1	2	1	4	122	0.0493827160493827	0.125	0.1525	0.819672131147541	0.0327868852459016	0.0864197530864197	7	38	226	1381	0.453777328360103	1.1255195646481	0.492407801491211	Inf	1.10609636184857	4.44413716814159	0.00222658084768439	10.1590849065854	0.38435780913657	0.973439358901587	0.34933140661117	0.334841628959276	74	69
TCGA-27-2523-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	63	0	0	1	1	62	2542	0	1	1	2	553	2	5	0	7	583	3	3	20	26	716	2	2	23	27	690	2	0	2	4	89	0.0634920634920635	0.148148148148148	0.128985507246377	1.14856429463171	0.0449438202247191	0	1	0	1	75	0.0158730158730159	0.0384615384615385	0.104748603351955	0.367179487179487	0.0133333333333333	0.0634920634920635	4	44	164	1242	0.825130743654239	0.688625110870913	0.223286928819819	Inf	0.714430894308943	3.42926829268293	0.108320702819689	5.03907694862599	0.398752127056154	0.966775227997916	0.36959888557905	1	59	58
TCGA-27-2524-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	74	0	0	1	1	73	2993	2	5	0	7	684	3	8	0	11	766	5	4	18	27	768	3	6	19	28	775	2	1	0	3	119	0.0405405405405405	0.107142857142857	0.153548387096774	0.697779111644658	0.0252100840336134	1	0	3	4	89	0.0540540540540541	0.148148148148148	0.115885416666667	1.27840199750312	0.0449438202247191	0.0810810810810811	6	39	208	1335	0.579214099485753	0.987433340879224	0.402899335117388	Inf	0.989102564102564	2.78185096153846	0.0825403564792649	3.84545461963479	0.601481288981289	0.89082907253561	0.566485980001269	1	68	67
TCGA-27-2526-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	53	0	1	2	3	50	2050	0	5	0	5	494	1	4	0	5	489	1	2	14	17	529	2	1	20	23	538	0	0	0	0	64	0	0	0.118959107806691	0	0	0	1	1	2	56	0.0377358490566038	0.117647058823529	0.10586011342155	1.11134453781513	0.0357142857142857	0.0188679245283019	1	36	120	947	0.987364278265847	0.219387106125603	0.0108882989334754	Inf	0.240315315315315	0	1	0	0.261519607843137	0.982094262203699	0.239326071551153	1	52	49
TCGA-27-2527-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	80	1	0	3	3	76	3116	2	3	1	6	736	1	5	2	8	736	2	2	23	27	792	5	6	24	35	852	1	1	0	2	101	0.025	0.0571428571428571	0.118544600938967	0.482036775106082	0.0198019801980198	0	0	0	0	81	0	0	0.102272727272727	0	0	0.0125	1	53	182	1462	0.998092666682874	0.151651193609578	0.00762357605219855	Inf	0.167277167277167	1.29042386185243	0.561305361136397	1.33855954379403	0	1	0	1	79	75
TCGA-27-2528-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	57	0	1	3	4	53	2173	2	5	2	9	550	1	2	2	5	479	1	2	18	21	589	1	2	15	18	555	0	0	1	1	67	0.0175438596491228	0.0555555555555556	0.120720720720721	0.460199004975124	0.0149253731343284	0	0	0	0	88	0	0	0.149405772495756	0	0	0.0175438596491228	1	34	155	989	0.993565379373264	0.18781454407506	0.00932902315057924	Inf	0.210875576036866	0	1	0	0.223655913978495	0.991452177153561	0.19955038065443	1	56	52
TCGA-28-1747-01C-01D-1494-08	0	0	0	0	52	0	0	3	3	49	2009	2	3	0	5	475	0	2	1	3	459	1	2	19	22	567	0	2	17	19	508	0	1	1	2	70	0.0384615384615385	0.105263157894737	0.137795275590551	0.76390977443609	0.0285714285714286	0	0	1	1	62	0.0192307692307692	0.0454545454545455	0.109347442680776	0.415689149560117	0.0161290322580645	0.0384615384615385	2	35	132	943	0.950230048411495	0.408462503791746	0.0691766932776855	Inf	0.44021294021294	0	1	0	0.452441077441077	0.944696097633433	0.420470740190781	0.4	50	47
TCGA-28-1753-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	65	0	0	1	1	64	2624	0	5	0	5	678	2	2	0	4	573	0	3	17	20	689	2	1	32	35	684	0	0	1	1	80	0.0153846153846154	0.0285714285714286	0.116959064327485	0.244285714285714	0.0125	0	0	0	0	95	0	0	0.137880986937591	0	0	0.0153846153846154	1	50	175	1198	0.998948843119395	0.137010327745455	0.00682041688153539	Inf	0.153837535014006	0	1	0	0.160116618075802	0.998631321680155	0.142718346022623	1	64	63
TCGA-28-2499-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	35	0	0	1	1	34	1394	0	3	0	3	340	1	0	0	1	354	0	2	11	13	331	0	2	15	17	369	0	0	2	2	47	0.0571428571428571	0.117647058823529	0.127371273712737	0.923654568210263	0.0425531914893617	0	0	0	0	53	0	0	0.16012084592145	0	0	0.0571428571428571	2	24	100	600	0.901728132777207	0.500379630789226	0.0830420551626624	Inf	0.538461538461538	NaN	1	0	0.538461538461538	0.901728132777207	0.500379630789226	0.333333333333333	33	32
TCGA-28-2501-01A-01D-1696-08	0	0	0	0	59	0	0	0	0	59	2419	0	4	0	4	529	0	3	0	3	579	0	2	20	22	648	1	2	27	30	663	0	0	1	1	101	0.0169491525423729	0.0333333333333333	0.152337858220211	0.218811881188119	0.0099009900990099	0	0	2	2	71	0.0338983050847458	0.0909090909090909	0.109567901234568	0.829705505761844	0.028169014084507	0.0508474576271186	3	45	172	1139	0.958796057897099	0.44167031065442	0.11510797828432	Inf	0.476380813953488	0	1	0	0.486516575952499	0.954411751050537	0.451704329095978	0.1	56	56
TCGA-28-2502-01B-01D-1494-08	0	0	0	0	68	0	0	3	3	65	2665	1	1	0	2	595	2	7	1	10	646	2	1	23	26	687	4	2	21	27	737	2	0	1	3	102	0.0441176470588235	0.111111111111111	0.138398914518318	0.802832244008715	0.0294117647058824	0	0	0	0	89	0	0	0.129548762736536	0	0	0.0441176470588235	3	47	191	1233	0.970351869934224	0.412232998931663	0.107694914497269	Inf	0.447329842931937	2.48516579406632	0.188522600919665	3.22390907713246	0.169443122322703	0.998101304405729	0.150228311191325	1	65	62
TCGA-28-2509-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	72	0	1	6	7	65	2665	0	3	0	3	596	1	0	1	2	643	2	2	28	32	730	4	1	23	28	696	1	0	2	3	87	0.0416666666666667	0.107142857142857	0.125	0.857142857142857	0.0344827586206897	1	0	0	1	92	0.0138888888888889	0.03125	0.126027397260274	0.247961956521739	0.0108695652173913	0.0555555555555556	4	53	179	1247	0.936499488242634	0.525955570706532	0.171796718618433	Inf	0.5590512594335	2.65549348230912	0.169315231186372	3.47844163325458	0.312410997918721	0.990548576134868	0.284500563067784	1	68	61
TCGA-28-2510-01A-01D-1696-08	0	0	0	0	33	0	0	0	0	33	1353	0	3	1	4	314	1	4	0	5	317	1	0	12	13	383	1	1	9	11	339	1	0	0	1	40	0.0303030303030303	0.0909090909090909	0.117994100294985	0.770454545454546	0.025	0	0	1	1	46	0.0303030303030303	0.0769230769230769	0.120104438642298	0.640468227424749	0.0217391304347826	0.0606060606060606	2	21	86	636	0.778096357571178	0.704611477589685	0.115910863457516	Inf	0.730030333670374	4.19767441860465	0.226037917516792	7.35973822883022	0.399778516057586	0.929593957670857	0.370111478545852	1	31	31
TCGA-28-2513-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	95	0	0	2	2	93	3813	1	2	2	5	942	5	3	1	9	966	4	8	30	42	930	4	8	25	37	975	0	1	0	1	148	0.0105263157894737	0.027027027027027	0.151794871794872	0.178049671292915	0.00675675675675676	1	0	2	3	129	0.0315789473684211	0.0714285714285714	0.138709677419355	0.514950166112957	0.0232558139534884	0.0315789473684211	3	60	277	1628	0.996286213096357	0.293981808918295	0.0775617511654202	Inf	0.327488396080454	0.859657039711191	0.715986882937841	0.839680352225878	0.250082047915983	0.99802870516017	0.221884229683441	1	92	90
TCGA-28-2514-01A-02D-1494-08	0	0	0	0	57	0	1	2	3	54	2214	1	1	2	4	547	1	2	0	3	487	2	3	12	17	577	0	0	30	30	603	0	0	1	1	75	0.0175438596491228	0.0333333333333333	0.124378109452736	0.268	0.0133333333333333	1	0	1	2	74	0.0350877192982456	0.117647058823529	0.128249566724437	0.917329093799682	0.027027027027027	0.0526315789473684	3	41	149	1031	0.926837805176256	0.50652517052648	0.131384291401948	Inf	0.539963392312386	3.95973154362416	0.237796412744942	6.89945386428196	0.377117289868968	0.974607944464309	0.346178347330864	1	54	51
TCGA-28-5204-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	50	0	0	3	3	47	1927	1	2	1	4	470	1	5	0	6	464	0	3	14	17	494	2	1	17	20	499	1	1	0	2	71	0.04	0.1	0.142284569138277	0.702816901408451	0.028169014084507	0	1	1	2	59	0.04	0.117647058823529	0.119433198380567	0.985044865403789	0.0338983050847458	0.04	2	31	130	863	0.940501699740436	0.428548523216456	0.0722222850405214	Inf	0.462937062937063	3.81923076923077	0.246097691677704	6.61690655355262	0.246401985111663	0.986586744673195	0.221473417441275	1	48	45
TCGA-28-5207-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	70	0	1	2	3	67	2747	1	8	0	9	659	0	6	1	7	641	6	4	19	29	717	2	6	14	22	730	0	2	1	3	102	0.0428571428571429	0.136363636363636	0.13972602739726	0.975935828877005	0.0294117647058824	4	0	0	4	101	0.0571428571428571	0.137931034482759	0.140864714086471	0.97917377944691	0.0396039603960396	0.0714285714285714	5	36	203	1244	0.699861098702462	0.851209528015283	0.314416418944578	Inf	0.869277904601706	3.564039408867	0.017459691073052	6.11561995415741	0.216002388416182	0.992932491426404	0.19162232674698	0.265734265734266	65	62
TCGA-28-5208-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	74	0	0	1	1	73	2993	0	5	2	7	692	0	0	3	3	663	0	4	27	31	816	2	0	30	32	822	0	0	2	2	97	0.027027027027027	0.0625	0.118004866180049	0.529639175257732	0.0206185567010309	0	0	0	0	96	0	0	0.117647058823529	0	0	0.027027027027027	2	57	193	1445	0.99415630801457	0.26283115764991	0.0453001006540803	Inf	0.287696496004215	0	1	0	0.2977911098991	0.992764588903775	0.272386764486024	0.333333333333333	72	71
TCGA-28-5209-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	115	1	1	5	6	107	4387	4	4	0	8	1046	2	5	3	10	986	3	3	32	38	1200	1	7	43	51	1155	0	1	2	3	140	0.0260869565217391	0.0588235294117647	0.121212121212121	0.485294117647059	0.0214285714285714	0	1	0	1	132	0.00869565217391304	0.0263157894736842	0.11	0.239234449760766	0.00757575757575758	0.0173913043478261	2	77	272	2083	0.999227444866176	0.198985247205572	0.0346022711356247	Inf	0.219192107222636	0	1	0	0.230882352941176	0.998811512777487	0.209887373520318	0.428571428571429	113	105
TCGA-28-5211-01C-11D-1845-08	0	0	0	0	44	0	0	1	1	42	1722	0	4	0	4	362	0	1	1	2	385	3	3	12	18	469	3	3	12	18	506	1	2	0	3	55	0.0681818181818182	0.166666666666667	0.108695652173913	1.53333333333333	0.0545454545454545	1	2	0	3	53	0.0681818181818182	0.166666666666667	0.113006396588486	1.4748427672956	0.0566037735849057	0.0454545454545455	2	28	108	867	0.859292997422422	0.573671781751841	0.0960874828682295	Inf	0.601851851851852	3.00925925925926	0.138432061313847	4.0042333275149	0	1	0	0.454545454545454	42	40
TCGA-28-5213-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	65	0	1	0	1	64	2624	0	7	2	9	555	0	3	0	3	596	0	3	25	28	700	0	3	21	24	773	0	0	0	0	72	0	0	0.093143596377749	0	0	0	0	1	1	69	0.0153846153846154	0.0357142857142857	0.0985714285714286	0.36231884057971	0.0144927536231884	0.0153846153846154	1	45	141	1332	0.989810995285253	0.21004991699129	0.0104958445994331	Inf	0.227104532839963	NaN	1	0	0.227104532839963	0.989810995285253	0.21004991699129	1	64	63
TCGA-28-5214-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	60	0	0	1	1	59	2419	1	6	3	10	538	1	5	0	6	574	3	0	14	17	639	2	2	22	26	668	1	1	0	2	80	0.0333333333333333	0.0769230769230769	0.119760479041916	0.642307692307692	0.025	1	0	0	1	78	0.0166666666666667	0.0588235294117647	0.122065727699531	0.481900452488688	0.0128205128205128	0.0333333333333333	2	39	158	1149	0.965260115750797	0.373121126077853	0.063549863232437	Inf	0.403519604816301	3.30886075949367	0.115333847541818	4.83859312997277	0	1	0	0.4	58	57
TCGA-28-5215-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	46	0	0	0	0	46	1886	1	5	0	6	400	0	4	1	5	438	3	3	12	18	482	1	0	16	17	566	0	0	0	0	70	0	0	0.123674911660777	0	0	1	1	0	2	58	0.0434782608695652	0.111111111111111	0.120331950207469	0.923371647509578	0.0344827586206897	0.0217391304347826	1	31	128	920	0.983982825871171	0.232040587903543	0.0114715824296202	Inf	0.255859375	2.046875	0.407897579443019	2.39312047027808	0	1	0	1	45	45
TCGA-28-5216-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	60	1	0	1	1	58	2378	4	8	1	13	544	0	1	3	4	573	3	1	11	15	615	4	4	18	26	646	2	0	1	3	87	0.05	0.115384615384615	0.134674922600619	0.856763925729443	0.0344827586206897	0	0	0	0	86	0	0	0.139837398373984	0	0	0.05	3	33	173	1088	0.887019736994324	0.571933315732674	0.147265884001647	Inf	0.607418111753372	2.08257638315442	0.249917946420769	2.51310146186796	0.251345425553119	0.985760182295499	0.224761082333576	1	57	55
TCGA-28-5218-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	32	0	1	2	3	29	1189	1	0	0	1	291	1	2	2	5	260	0	1	11	12	322	3	0	8	11	316	1	0	0	1	35	0.03125	0.0909090909090909	0.110759493670886	0.820779220779221	0.0285714285714286	0	1	1	2	39	0.0625	0.166666666666667	0.12111801242236	1.37606837606838	0.0512820512820513	0.0625	2	20	74	564	0.743176851879277	0.762446813485576	0.124747281538244	Inf	0.783783783783784	2.87387387387387	0.311973570492115	3.79828833171985	0.453769559032717	0.903410375073589	0.423826915474496	1	30	27
TCGA-28-5219-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	64	0	2	2	4	60	2460	3	5	0	8	518	2	4	1	7	589	2	2	17	21	674	2	4	18	24	679	0	1	0	1	72	0.015625	0.0416666666666667	0.106038291605302	0.392939814814815	0.0138888888888889	0	0	0	0	73	0	0	0.108308605341246	0	0	0	0	39	145	1208	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	64	60
TCGA-28-5220-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	49	0	2	1	3	46	1886	0	4	0	4	491	1	3	1	5	383	0	2	17	19	538	4	2	12	18	474	1	0	0	1	50	0.0204081632653061	0.0555555555555556	0.105485232067511	0.526666666666667	0.02	0	0	0	0	75	0	0	0.139405204460967	0	0	0.0204081632653061	1	32	125	887	0.986578372639143	0.221936834413507	0.0109815710255094	Inf	0.245333333333333	2.024	0.411669717866874	2.36249019703269	0	1	0	1	48	45
TCGA-28-6450-01A-11D-1696-08	0	0	0	0	64	0	0	5	5	57	2337	0	4	0	4	533	2	6	2	10	549	3	1	18	22	650	3	4	14	21	605	0	0	1	1	84	0.015625	0.0476190476190476	0.138842975206612	0.34297052154195	0.0119047619047619	0	0	0	0	81	0	0	0.124615384615385	0	0	0.015625	1	37	165	1090	0.995024394885754	0.178672198500517	0.00890044189305575	Inf	0.200159489633174	0	1	0	0.237689393939394	0.988633207721145	0.213246588337501	1	63	56
TCGA-32-1970-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	98	0	1	0	1	97	3977	3	4	0	7	876	2	2	0	4	946	4	7	31	42	1030	5	5	34	44	1125	1	0	0	1	124	0.0102040816326531	0.0227272727272727	0.110222222222222	0.206195014662757	0.00806451612903226	0	0	0	0	121	0	0	0.11747572815534	0	0	0.0102040816326531	1	73	245	1910	0.999850415804638	0.106842436116554	0.00535521787998131	Inf	0.118863761720905	0.977324263038549	0.663183873785082	0.974500351638667	0	1	0	1	97	96
TCGA-32-1977-01A-01D-1353-08	0	0	0	0	116	0	1	4	5	111	4551	5	4	3	12	1110	3	3	1	7	1036	3	5	37	45	1212	8	7	32	47	1193	1	0	2	3	141	0.0258620689655172	0.0638297872340425	0.118189438390612	0.540063377093708	0.0212765957446809	2	2	0	4	166	0.0344827586206897	0.0888888888888889	0.136963696369637	0.648995983935743	0.0240963855421687	0.0431034482758621	5	75	307	2098	0.979844787742544	0.455699132780091	0.173626068620141	Inf	0.489617263843648	2.13651169677228	0.158195902136981	2.56117264921495	0.22706887598546	0.999022760871427	0.20407077180804	1	111	106
TCGA-32-1979-01A-01D-1696-08	0	0	0	0	97	0	0	2	2	95	3895	3	5	2	10	842	0	3	1	4	933	5	2	38	45	1038	3	2	31	36	1082	1	0	0	1	133	0.0103092783505155	0.0277777777777778	0.122920517560074	0.225981620718463	0.0075187969924812	2	0	2	4	104	0.0412371134020619	0.0888888888888889	0.10019267822736	0.887179487179487	0.0384615384615385	0.0515463917525773	5	72	237	1883	0.939200711931906	0.551867513077773	0.209637551721797	Inf	0.580853745410707	3.35443037974684	0.0516062578350417	4.76132197429101	0.259279642878982	0.997071473931924	0.237260885332315	1	92	90
TCGA-32-1980-01A-01D-1696-08	0	0	0	0	19	0	0	0	0	19	779	0	2	0	2	187	1	3	0	4	197	1	0	5	6	199	2	0	5	7	196	0	0	0	0	27	0	0	0.137755102040816	0	0	0	0	0	0	34	0	0	0.170854271356784	0	0	0	0	13	61	334	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	19	19
TCGA-32-1982-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	96	0	0	4	4	92	3772	1	4	0	5	963	1	7	1	9	919	1	8	40	49	995	3	3	23	29	895	2	1	1	4	128	0.0416666666666667	0.137931034482759	0.143016759776536	0.964439655172414	0.03125	1	1	6	8	155	0.0833333333333333	0.163265306122449	0.155778894472362	1.04805793285056	0.0516129032258065	0.104166666666667	10	57	283	1607	0.558602374053601	0.996220319702056	0.510312741137549	Inf	0.996782870101788	5.00883392226148	0.0121180293672907	16.9935474308153	0.742049469964664	0.849202489027417	0.709918354822249	0.213756898640463	86	82
TCGA-32-1986-01A-01D-1494-08	0	0	0	0	63	0	0	3	3	60	2460	1	3	1	5	539	0	4	2	6	599	2	1	19	22	686	3	4	20	27	636	0	0	1	1	95	0.0158730158730159	0.037037037037037	0.14937106918239	0.247953216374269	0.0105263157894737	0	0	0	0	87	0	0	0.126822157434402	0	0	0.0158730158730159	1	43	182	1140	0.998400883300018	0.145774236120875	0.0072371548022188	Inf	0.165084915084915	0	1	0	0.186249647788109	0.996713732498535	0.164951998032393	1	62	59
TCGA-32-1991-01A-01D-1353-08	0	0	0	0	81	0	0	2	2	79	3239	4	4	1	9	745	2	3	2	7	725	2	5	24	31	938	4	13	15	32	831	2	3	0	5	100	0.0617283950617284	0.15625	0.120336943441637	1.2984375	0.05	0	2	1	3	118	0.037037037037037	0.0967741935483871	0.125799573560768	0.769272826681247	0.0254237288135593	0.037037037037037	3	42	218	1551	0.926482301081317	0.508340796522991	0.132459370014198	Inf	0.540978593272171	2.70489296636086	0.163969692869418	3.55308286090461	0.208068689720066	0.993859791378943	0.187323429392299	1	78	76
TCGA-32-2491-01A-01D-1353-08	0	0	0	0	128	0	1	1	2	126	5166	4	12	0	16	1198	3	6	1	10	1137	6	4	43	53	1382	13	10	24	47	1449	0	3	0	3	157	0.0234375	0.0638297872340425	0.108350586611456	0.589104214663233	0.0191082802547771	3	0	1	4	164	0.03125	0.0754716981132075	0.118668596237337	0.635987114588127	0.024390243902439	0.03125	4	82	321	2510	0.990300490293548	0.381517856884915	0.126687191701257	Inf	0.410200681011374	1.39252336448598	0.36895935240841	1.46588717889682	0.131631561817083	0.999660626718752	0.118515300123812	0.559440559440559	124	122
TCGA-32-2494-01A-01D-1353-08	0	0	0	0	93	0	1	3	4	88	3608	1	5	2	8	884	1	4	2	7	805	2	7	31	40	966	6	6	21	33	953	1	1	2	4	102	0.043010752688172	0.121212121212121	0.107030430220357	1.13250148544266	0.0392156862745098	1	0	0	1	129	0.010752688172043	0.025	0.133540372670807	0.187209302325581	0.00775193798449612	0.043010752688172	4	56	231	1688	0.939291158424763	0.522090969366258	0.171263616166633	Inf	0.553823953823954	2.07683982683983	0.250763823242938	2.43421629011121	0.31951381951382	0.98923958492021	0.292410773665305	1	89	84
TCGA-32-2495-01A-01D-1353-08	0	0	0	0	117	0	1	8	9	105	4305	1	7	3	11	999	3	10	1	14	1094	5	6	29	40	1112	5	5	30	40	1100	3	1	1	5	155	0.0427350427350427	0.125	0.140909090909091	0.887096774193548	0.032258064516129	0	0	0	0	147	0	0	0.132194244604317	0	0	0.0341880341880342	4	65	302	1910	0.988264226924478	0.389314365155678	0.128546333961579	Inf	0.424608887609176	2.19735099337748	0.147452647234572	2.70882988862969	0.124144123919632	0.999809742949259	0.109092954606469	0.523809523809524	113	101
TCGA-32-2615-01A-01D-1495-08	0	0	0	0	52	0	2	0	2	50	2050	0	2	1	3	436	2	5	1	8	488	1	0	14	15	540	2	3	19	24	586	0	2	0	2	68	0.0384615384615385	0.0833333333333333	0.116040955631399	0.718137254901961	0.0294117647058824	0	0	2	2	58	0.0384615384615385	0.133333333333333	0.107407407407407	1.24137931034483	0.0344827586206897	0.0384615384615385	2	34	126	1000	0.921532516798696	0.467085543997322	0.0789758797769853	Inf	0.49647266313933	0	1	0	0.541606541606542	0.896229246013379	0.51226447978167	0.428571428571429	50	48
TCGA-32-2632-01A-01D-1495-08	0	0	0	0	117	1	2	2	4	112	4592	2	5	1	8	1082	4	5	1	10	1115	8	4	43	55	1201	3	3	33	39	1194	1	0	3	4	156	0.0341880341880342	0.102564102564103	0.130653266331658	0.785009861932939	0.0256410256410256	4	0	1	5	152	0.0427350427350427	0.0909090909090909	0.126561199000833	0.718301435406699	0.0328947368421053	0.0769230769230769	9	78	308	2087	0.800680730306621	0.781914774256313	0.391006294448572	Inf	0.804411106135244	3.53453364817001	0.00854345833690032	5.6398886741963	0.409261790840738	0.990853085439434	0.376547065443229	1	108	103
TCGA-32-2634-01A-01D-1495-08	0	0	0	0	55	1	0	4	4	50	2050	5	1	1	7	535	3	6	1	10	478	1	3	14	18	546	1	0	14	15	491	0	0	0	0	68	0	0	0.138492871690428	0	0	1	2	0	3	83	0.0545454545454545	0.166666666666667	0.152014652014652	1.09638554216867	0.036144578313253	0.0181818181818182	1	29	151	886	0.990717027297201	0.202503810377658	0.0100058878809953	Inf	0.228918322295806	3.43377483443709	0.2713072633572	5.85155516190753	0	1	0	1	54	49
TCGA-32-2638-01A-01D-1495-08	0	0	0	0	74	0	2	3	5	69	2829	0	4	0	4	698	2	2	0	4	590	3	3	18	24	752	5	6	26	37	789	1	1	4	6	88	0.0810810810810811	0.162162162162162	0.111533586818758	1.4539312039312	0.0681818181818182	1	2	0	3	102	0.0405405405405405	0.125	0.13563829787234	0.92156862745098	0.0294117647058824	0.0810810810810811	6	46	190	1351	0.633069003486881	0.927489220114621	0.381046475263131	Inf	0.93582995951417	2.02763157894737	0.260266300802868	2.36853787319141	0.737320574162679	0.807205872127905	0.71118855207587	0.619909502262444	68	63
TCGA-32-4208-01A-01D-1353-08	0	0	0	0	80	0	0	3	3	76	3116	1	11	1	13	747	0	8	1	9	739	11	4	15	30	776	5	4	15	24	854	2	0	0	2	111	0.025	0.0833333333333333	0.129976580796253	0.641141141141141	0.018018018018018	2	0	0	2	97	0.025	0.0666666666666667	0.125	0.533333333333333	0.0206185567010309	0.05	4	42	208	1422	0.85368580106948	0.651242903676855	0.21127856028738	Inf	0.681438127090301	1.95913461538462	0.140270886028614	2.27733440593561	0	1	0	0.0285714285714286	76	72
TCGA-32-4209-01A-01D-1353-08	0	0	0	0	48	0	0	2	2	46	1886	1	4	1	6	467	0	5	1	6	446	2	2	11	15	500	4	4	11	19	473	1	0	0	1	47	0.0208333333333333	0.0526315789473684	0.0993657505285412	0.529675251959686	0.0212765957446809	1	1	2	4	81	0.0833333333333333	0.266666666666667	0.162	1.64609053497942	0.0493827160493827	0.0833333333333333	4	24	128	845	0.51628069742346	1.10018334587994	0.344485942548341	Inf	1.0859375	2.53385416666667	0.183473001695082	3.29489565158666	0.691051136363636	0.80538191467788	0.660394703328033	1	44	42
TCGA-32-4210-01A-01D-1353-08	0	0	0	0	120	0	0	0	0	119	4879	3	9	1	13	1178	7	13	6	26	1145	6	6	31	43	1295	5	9	23	37	1261	0	1	1	2	172	0.0166666666666667	0.0540540540540541	0.136399682791435	0.396291640477687	0.0116279069767442	1	3	0	4	180	0.0333333333333333	0.0930232558139535	0.138996138996139	0.669250645994832	0.0222222222222222	0.0166666666666667	2	63	352	2204	0.99919125313794	0.198842862464048	0.0344884217093895	Inf	0.223426573426573	0.660123966942149	0.804214177857678	0.626233544459049	0.134469696969697	0.999641641795849	0.118185155421528	1	118	117
TCGA-32-4211-01A-01D-1353-08	0	0	0	0	109	1	1	1	2	106	4346	0	7	0	7	1011	2	3	5	10	973	3	4	35	42	1202	4	4	39	47	1160	1	0	4	5	151	0.0458715596330275	0.106382978723404	0.130172413793103	0.817246723967874	0.033112582781457	2	0	1	3	133	0.0275229357798165	0.0714285714285714	0.110648918469218	0.645542427497315	0.0225563909774436	0.073394495412844	8	73	284	2078	0.770954064330891	0.801919462871807	0.382300694955305	Inf	0.821422361328465	3.56438631790744	0.0424397761098607	5.48098208419139	0.561952797868291	0.950446005597367	0.530321210228314	0.619269619269619	101	98
TCGA-32-4213-01A-01D-1353-08	0	0	0	0	90	0	1	6	7	83	3403	1	11	2	14	800	1	3	1	5	787	1	6	22	29	897	0	9	26	35	919	0	3	3	6	121	0.0666666666666667	0.171428571428571	0.131664853101197	1.30200708382527	0.0495867768595041	0	0	0	0	113	0	0	0.125975473801561	0	0	0.0333333333333333	3	46	234	1582	0.959516396959579	0.441057172052232	0.115343885368174	Inf	0.475143903715332	0	1	0	0.485042735042735	0.955260678646592	0.450855653702006	0.181818181818182	87	80
TCGA-32-4719-01A-01D-1353-08	0	0	0	0	56	0	2	0	2	54	2214	2	3	1	6	487	0	0	1	1	524	0	5	22	27	583	3	2	15	20	620	1	1	1	3	69	0.0535714285714286	0.15	0.111290322580645	1.34782608695652	0.0434782608695652	0	0	1	1	65	0.0178571428571429	0.037037037037037	0.111492281303602	0.332193732193732	0.0153846153846154	0.0535714285714286	3	37	134	1069	0.836682169660453	0.64702722459003	0.166992117781111	Inf	0.673320895522388	2.99253731343284	0.299851581617148	3.98096736404283	0.485276321097217	0.927445520623962	0.45607883134538	1	53	51
TCGA-32-5222-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	100	0	0	1	1	99	4059	2	5	1	8	974	1	10	1	12	889	0	2	38	40	1090	4	3	32	39	1106	0	1	1	2	132	0.02	0.0512820512820513	0.119349005424955	0.42968142968143	0.0151515151515152	0	0	1	1	142	0.01	0.025	0.130275229357798	0.191901408450704	0.00704225352112676	0.02	2	72	274	1922	0.999329838475154	0.194928608780116	0.0338024617986809	Inf	0.216610771355297	0	1	0	0.228988529718457	0.998929624974986	0.206393668973366	0.4	98	97
TCGA-41-2571-01A-01D-1495-08	0	0	0	0	65	0	0	2	2	63	2583	1	1	1	3	611	4	4	0	8	582	1	6	17	24	666	3	2	23	28	724	2	0	1	3	78	0.0461538461538462	0.107142857142857	0.107734806629834	0.994505494505494	0.0384615384615385	0	0	0	0	75	0	0	0.112612612612613	0	0	0.0461538461538462	3	41	153	1237	0.875042698163403	0.591762057422142	0.153573496568429	Inf	0.619429590017825	4.54248366013072	0.063388756117946	8.0615324977089	0.227124183006536	0.990195516121288	0.207435383372903	1	62	60
TCGA-41-2572-01A-01D-1353-08	0	0	0	0	79	0	1	0	1	78	3198	0	6	2	8	760	0	4	3	7	695	2	3	25	30	839	3	5	25	33	904	0	0	0	0	107	0	0	0.118362831858407	0	0	1	0	0	1	98	0.0126582278481013	0.0333333333333333	0.116805721096544	0.285374149659864	0.0102040816326531	0.0126582278481013	1	54	205	1538	0.998888271727673	0.13900998503059	0.00693670263358301	Inf	0.154589800443459	1.70048780487805	0.466195532655702	1.87469476357514	0	1	0	1	78	77
TCGA-41-2573-01A-01D-1495-08	0	0	0	0	56	0	0	0	0	56	2296	3	4	0	7	558	3	4	0	7	538	2	0	17	19	596	2	3	18	23	604	1	1	0	2	77	0.0357142857142857	0.0869565217391304	0.127483443708609	0.682100508187465	0.025974025974026	1	0	4	5	73	0.0892857142857143	0.263157894736842	0.12248322147651	2.14852198990627	0.0684931506849315	0.107142857142857	6	33	150	1050	0.366298287151048	1.27245677942498	0.512298224717078	Inf	1.23076923076923	4	0.0799939696808856	6.98017575983794	0.914285714285714	0.653727226189333	0.903275260974827	0.592074592074592	50	50
TCGA-41-2575-01A-01D-1495-08	0	0	0	0	79	0	0	1	1	78	3198	6	6	2	14	787	1	6	5	12	771	5	5	17	27	813	4	8	13	25	827	0	0	0	0	108	0	0	0.130592503022975	0	0	1	1	0	2	116	0.0253164556962025	0.0740740740740741	0.142681426814268	0.519157088122605	0.0172413793103448	0.0126582278481013	1	38	224	1416	0.996589036670604	0.166448243323902	0.00831352820014373	Inf	0.187728937728938	0.813492063492063	0.733866017947827	0.790282456466281	0	1	0	1	78	77
TCGA-41-3392-01A-01D-1495-08	0	0	0	0	87	0	1	5	6	81	3321	3	5	2	10	738	3	2	1	6	794	2	4	24	30	914	6	3	26	35	875	1	0	1	2	111	0.0229885057471264	0.0571428571428571	0.126857142857143	0.45045045045045	0.018018018018018	0	0	1	1	115	0.0114942528735632	0.0333333333333333	0.12582056892779	0.264927536231884	0.00869565217391304	0.0344827586206897	3	55	226	1563	0.981731424116873	0.377372063807101	0.099200017660152	Inf	0.409444613976198	0.989491150442478	0.661287468772668	0.987996200148435	0.316637168141593	0.989932199908762	0.288288089575204	1	84	78
TCGA-41-3393-01A-01D-1353-08	0	0	0	0	92	0	0	1	1	91	3731	3	4	0	7	806	4	6	1	11	944	2	3	35	40	964	2	3	28	33	1017	0	0	0	0	126	0	0	0.123893805309735	0	0	1	0	2	3	109	0.0326086956521739	0.075	0.113070539419087	0.663302752293578	0.0275229357798165	0.0326086956521739	3	64	235	1746	0.988757429346599	0.348393154355372	0.0919807297112121	Inf	0.377453159733249	2.10744680851064	0.397523878403782	2.47494943837463	0.267612293144208	0.996429514019601	0.243700615178946	1	89	88
TCGA-41-3915-01A-01D-1353-08	0	0	0	0	67	1	2	0	2	64	2624	1	9	0	10	643	3	4	0	7	574	5	3	16	24	737	1	4	18	23	670	0	0	0	0	86	0	0	0.128358208955224	0	0	2	1	2	5	94	0.0746268656716418	0.208333333333333	0.127544097693351	1.6334219858156	0.0531914893617021	0.0597014925373134	4	36	180	1227	0.769842969857487	0.757539660708588	0.243768861700448	Inf	0.781666666666667	2.60555555555556	0.174656423637882	3.40399780960356	0.459803921568627	0.942056318508876	0.426225956184547	1	63	60
TCGA-41-4097-01A-01D-1353-08	0	0	0	0	84	0	0	1	1	83	3403	0	6	1	7	829	1	5	1	7	775	8	7	20	35	928	9	3	22	34	871	2	1	1	4	110	0.0476190476190476	0.117647058823529	0.126291618828932	0.931550802139038	0.0363636363636364	2	0	1	3	118	0.0357142857142857	0.0857142857142857	0.127155172413793	0.67409200968523	0.0254237288135593	0.0714285714285714	6	53	228	1571	0.773422269378384	0.780135671932067	0.323036440932972	Inf	0.802408563782337	1.85655314757482	0.162498121989617	2.11897952120947	0.375730994152047	0.97540989985183	0.34465255412177	0.592074592074592	78	77
TCGA-41-5651-01A-01D-1696-08	0	0	0	0	111	0	1	1	2	109	4469	3	6	2	11	1056	1	4	2	7	1054	3	4	35	42	1195	5	9	35	49	1164	3	1	1	5	150	0.045045045045045	0.102040816326531	0.128865979381443	0.791836734693878	0.0333333333333333	0	1	0	1	150	0.00900900900900901	0.0238095238095238	0.125523012552301	0.18968253968254	0.00666666666666667	0.036036036036036	4	74	300	2059	0.991775198693008	0.371096021703573	0.122878196655069	Inf	0.403247863247863	2.94875	0.0711382346784785	4.11454633934268	0.112333333333333	0.999917636456482	0.099511309027609	0.545454545454546	107	105
TCGA-41-6646-01A-11D-1845-08	0	0	0	0	57	0	0	4	4	53	2173	1	2	1	4	528	2	5	0	7	512	1	0	19	20	576	2	2	18	22	557	1	0	1	2	64	0.0350877192982456	0.0909090909090909	0.114901256732496	0.791193181818182	0.03125	0	0	1	1	67	0.0175438596491228	0.05	0.116319444444444	0.429850746268657	0.0149253731343284	0.0526315789473684	3	37	131	1002	0.85515348727479	0.620390706485687	0.160060960311035	Inf	0.648664122137405	2.88295165394402	0.309895085966936	3.81728345864713	0.467505673612544	0.936824970361147	0.437305088303858	1	54	50
TCGA-74-6573-01A-12D-1845-08	0	0	0	0	55	0	1	3	4	51	2091	0	2	1	3	447	0	3	1	4	505	1	3	19	23	596	2	2	17	21	543	0	1	0	1	65	0.0181818181818182	0.0476190476190476	0.119705340699816	0.397802197802198	0.0153846153846154	0	0	1	1	66	0.0181818181818182	0.0434782608695652	0.110738255033557	0.39262187088274	0.0151515151515152	0.0181818181818182	1	38	131	1008	0.991050994341759	0.202645658645913	0.0100810198879438	Inf	0.222939909962811	0	1	0	0.241518235793045	0.987213391031837	0.220011258613137	1	54	50
TCGA-74-6575-01A-11D-1845-08	0	0	0	0	125	0	3	5	8	117	4797	1	7	4	12	1172	8	10	1	19	1204	7	7	36	50	1237	8	2	26	36	1184	5	0	0	5	166	0.04	0.138888888888889	0.140202702702703	0.990629183400268	0.0301204819277108	3	0	1	4	169	0.032	0.08	0.136620856911884	0.585562130177515	0.0236686390532544	0.072	9	68	335	2086	0.753914411527351	0.824204051896512	0.410515571450649	Inf	0.844698584997092	3.85432835820896	0.000372265582902508	7.10813268242903	0.11656234954261	0.999892272091632	0.102122832391222	0.00337309749074455	116	108
TCGA-74-6577-01A-11D-1845-08	0	0	0	0	49	0	2	2	4	43	1763	1	1	0	2	393	0	5	0	5	415	0	1	15	16	475	2	3	15	20	480	1	0	1	2	55	0.0408163265306122	0.1	0.114583333333333	0.872727272727273	0.0363636363636364	0	0	0	0	58	0	0	0.122105263157895	0	0	0.0408163265306122	2	30	113	842	0.904640357451969	0.49702962711305	0.0835648549291972	Inf	0.52820796460177	4.22566371681416	0.224164163638987	7.4234215502444	0.281710914454277	0.976459933243696	0.257159187161247	1	47	41
TCGA-74-6578-01A-11D-1845-08	0	0	0	0	91	0	0	3	3	88	3608	1	4	2	7	865	2	5	1	8	902	0	2	42	44	897	6	5	18	29	944	3	1	0	4	135	0.043956043956044	0.137931034482759	0.143008474576271	0.964495530012771	0.0296296296296296	0	0	1	1	118	0.010989010989011	0.0227272727272727	0.131549609810479	0.172765793528505	0.00847457627118644	0.043956043956044	4	62	253	1588	0.984575385398577	0.405085432409047	0.13340254929096	Inf	0.441010899508923	3.63833992094862	0.0381556732280605	6.26634011096772	0.121277997364954	0.999841915420251	0.106442984573437	0.523809523809524	87	84
TCGA-74-6584-01A-11D-1845-08	0	0	0	0	47	0	0	1	1	46	1886	2	4	3	9	471	1	4	0	5	444	0	4	12	16	453	2	2	12	16	518	0	0	0	0	61	0	0	0.117760617760618	0	0	0	1	1	2	68	0.0425531914893617	0.125	0.150110375275938	0.832720588235294	0.0294117647058824	0.0212765957446809	1	25	129	842	0.974834954619693	0.261303343952956	0.0128211144780772	Inf	0.289505068574836	0	1	0	0.313630490956072	0.966717554835647	0.284017271656042	1	46	45
TCGA-76-4925-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	77	0	2	4	6	71	2911	1	4	1	6	722	2	6	1	9	639	2	2	19	23	767	6	3	24	33	783	1	1	1	3	89	0.038961038961039	0.0909090909090909	0.113665389527458	0.799795709908069	0.0337078651685393	0	0	2	2	94	0.025974025974026	0.0869565217391304	0.122555410691004	0.709528214616096	0.0212765957446809	0.051948051948052	4	47	183	1367	0.865407537635671	0.635893537724887	0.206945631675611	Inf	0.664309439622844	1.05874316939891	0.634989442148294	1.06710988305902	0.590926420129623	0.895359722765603	0.560411684345089	0.523809523809524	73	67
TCGA-76-4926-01B-01D-1486-08	0	0	0	0	69	0	1	3	4	64	2624	1	5	2	8	576	0	2	1	3	557	2	0	26	28	725	3	1	21	25	766	1	0	1	2	80	0.0289855072463768	0.08	0.10443864229765	0.766	0.025	2	0	3	5	83	0.072463768115942	0.178571428571429	0.11448275862069	1.55981067125645	0.0602409638554217	0.101449275362319	7	45	163	1328	0.346362046568867	1.2671355899281	0.55714958516445	Inf	1.23135913166588	5.48834355828221	0.011337556866126	12.1799787797929	0.778488447983292	0.769647680093704	0.758006306857649	1	62	57
TCGA-76-4927-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	69	0	1	1	2	67	2747	0	1	3	4	646	3	3	0	6	603	4	0	19	23	756	1	2	31	34	742	0	0	1	1	82	0.0144927536231884	0.0294117647058824	0.110512129380054	0.266140602582496	0.0121951219512195	2	0	2	4	76	0.0579710144927536	0.173913043478261	0.100529100529101	1.72997711670481	0.0526315789473684	0.072463768115942	5	50	158	1340	0.70206703437009	0.848210784909948	0.317049591809009	Inf	0.861910241657077	3.79240506329114	0.0907770447157337	5.64233764892845	0.568860759493671	0.907546818859513	0.541512734586542	1	64	62
TCGA-76-4928-01B-01D-1486-08	0	0	0	0	96	0	1	3	4	92	3772	4	5	0	9	932	1	9	2	12	874	3	2	33	38	1002	2	5	26	33	964	0	0	3	3	114	0.03125	0.0909090909090909	0.118257261410788	0.768740031897927	0.0263157894736842	0	1	1	2	140	0.0208333333333333	0.0526315789473684	0.139720558882236	0.376691729323308	0.0142857142857143	0.0416666666666667	4	60	254	1712	0.971554788521465	0.449475518902706	0.147883684586039	Inf	0.483759842519685	0	1	0	0.524756439343387	0.954835020440403	0.490328814998916	0.0476190476190476	92	88
TCGA-76-4929-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	77	0	0	4	4	73	2993	2	2	0	4	664	1	4	1	6	680	2	2	22	26	838	1	2	34	37	811	0	0	1	1	101	0.012987012987013	0.027027027027027	0.124537607891492	0.217018999197217	0.0099009900990099	0	0	2	2	99	0.025974025974026	0.0769230769230769	0.118138424821002	0.651126651126651	0.0202020202020202	0.038961038961039	3	56	200	1449	0.978680176513428	0.388277158814121	0.102019289186269	Inf	0.419237288135593	0	1	0	0.441696428571429	0.97157587981236	0.410248840754163	0.1	74	70
TCGA-76-4931-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	55	0	0	0	0	55	2255	0	3	2	5	479	0	0	0	0	467	2	3	23	28	667	2	1	19	22	642	1	1	0	2	56	0.0363636363636364	0.0909090909090909	0.0872274143302181	1.04220779220779	0.0357142857142857	1	0	2	3	67	0.0545454545454545	0.107142857142857	0.100449775112444	1.06663113006397	0.0447761194029851	0.0727272727272727	4	42	123	1186	0.640448000341659	0.918359120855898	0.296191346466626	Inf	0.925415341109933	5.32113821138211	0.0474688097892624	9.60753063546911	0.506775067750677	0.913888100419861	0.482311414643558	1	51	51
TCGA-76-4932-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	80	0	0	2	2	78	3198	1	7	0	8	755	1	5	0	6	756	3	2	30	35	860	2	2	25	29	827	1	0	1	2	95	0.025	0.0689655172413793	0.114873035066505	0.600362976406534	0.0210526315789474	1	0	0	1	104	0.0125	0.0285714285714286	0.12093023255814	0.236263736263736	0.00961538461538462	0.0375	3	57	199	1488	0.977139076009136	0.393695782095142	0.10349108640926	Inf	0.423869346733668	3.39095477386935	0.110231931365313	4.97707455271004	0.154134307903152	0.998908861419282	0.138548375950962	1	77	75
TCGA-76-4934-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	67	0	0	3	3	64	2624	0	4	0	4	598	1	4	1	6	617	3	7	20	30	705	3	5	16	24	704	2	2	2	6	75	0.0895522388059701	0.25	0.106534090909091	2.34666666666667	0.08	1	0	1	2	74	0.0298507462686567	0.0666666666666667	0.104964539007092	0.635135135135135	0.027027027027027	0.0895522388059701	6	36	149	1260	0.287837702545378	1.40901295611063	0.570195851790507	Inf	1.35091083413231	4.72818791946309	0.0190438369223747	8.43023906152007	0.788031319910515	0.748578057895869	0.76888897606266	1	61	58
TCGA-76-4935-01A-01D-1486-08	0	0	0	0	69	2	0	1	1	66	2706	1	4	0	5	614	0	5	0	5	638	4	4	17	25	701	5	7	19	31	753	1	2	2	5	97	0.072463768115942	0.161290322580645	0.128818061088977	1.25207848353841	0.0515463917525773	1	0	1	2	99	0.0289855072463768	0.08	0.141226818830243	0.566464646464646	0.0202020202020202	0.072463768115942	5	40	196	1258	0.742834092737042	0.802405545709764	0.297838636934122	Inf	0.824263038548753	1.64852607709751	0.349373869451418	1.83287995144471	0.618197278911565	0.879605455687271	0.583663760275448	1	64	61
TCGA-76-6191-01A-12D-1696-08	0	0	0	0	68	0	0	4	4	64	2624	2	3	0	5	616	3	4	2	9	601	2	6	19	27	712	2	3	18	23	695	0	0	2	2	96	0.0294117647058824	0.0869565217391304	0.138129496402878	0.629528985507246	0.0208333333333333	1	0	0	1	77	0.0147058823529412	0.037037037037037	0.10814606741573	0.342472342472342	0.012987012987013	0.0441176470588235	3	38	173	1234	0.893218658083534	0.563310129667448	0.145933542005725	Inf	0.595093754405752	2.03323699421965	0.409648714378731	2.37574349792766	0.439618809561006	0.950802640273395	0.407779002345944	1	65	61
TCGA-76-6192-01A-11D-1696-08	0	0	0	0	68	0	0	0	0	68	2788	3	4	3	10	658	1	4	1	6	700	1	2	27	30	698	1	2	19	22	732	0	0	0	0	94	0	0	0.128415300546448	0	0	1	1	0	2	102	0.0294117647058824	0.0666666666666667	0.146131805157593	0.456209150326797	0.0196078431372549	0.0147058823529412	1	47	196	1234	0.99907571618787	0.134047180006862	0.00666836645524052	Inf	0.151998299319728	3.64795918367347	0.256297116131626	6.28247101875522	0	1	0	1	67	67
TCGA-76-6193-01A-11D-1696-08	0	0	0	0	54	1	0	2	2	51	2091	1	4	0	5	483	2	2	2	6	516	3	4	11	18	491	2	1	19	22	601	1	1	1	3	83	0.0555555555555556	0.136363636363636	0.138103161397671	0.987404162102957	0.036144578313253	1	0	0	1	59	0.0185185185185185	0.0555555555555556	0.120162932790224	0.462335216572505	0.0169491525423729	0.0555555555555556	3	32	142	950	0.849859657420966	0.627422190541554	0.160992908778034	Inf	0.659154929577465	3.07605633802817	0.13099650507322	4.45073101826821	0.256338028169014	0.984201052208231	0.23087347364849	1	51	48
TCGA-76-6280-01A-21D-1845-08	0	0	0	0	67	1	1	2	3	63	2583	0	2	1	3	557	0	7	1	8	601	1	1	25	27	761	3	4	18	25	664	0	1	0	1	81	0.0149253731343284	0.04	0.121987951807229	0.327901234567901	0.0123456790123457	1	0	1	2	76	0.0298507462686567	0.0740740740740741	0.0998685939553219	0.741715399610136	0.0263157894736842	0.0298507462686567	2	45	157	1268	0.970758275948709	0.359123526212026	0.0614091931396823	Inf	0.386231196639111	2.26910828025478	0.374501586798697	2.68946586112876	0.2110798400237	0.99307292480145	0.192414776818565	1	65	61
TCGA-76-6282-01A-11D-1696-08	0	0	0	0	59	0	0	3	3	56	2296	3	2	0	5	531	1	6	1	8	555	2	3	15	20	569	4	3	16	23	641	1	1	2	4	75	0.0677966101694915	0.173913043478261	0.117004680187207	1.4863768115942	0.0533333333333333	1	0	0	1	72	0.0169491525423729	0.05	0.126537785588752	0.395138888888889	0.0138888888888889	0.0677966101694915	4	33	147	1063	0.674323122656016	0.876636906760859	0.280239487949557	Inf	0.889869461298033	2.7437641723356	0.160774113752689	3.61002280146227	0.531051130129471	0.903688866251809	0.49892784753324	1	55	52
TCGA-76-6283-01A-11D-1845-08	0	0	0	0	112	0	1	9	10	102	4182	5	8	1	14	1035	1	7	2	10	976	1	5	28	34	1047	2	4	38	44	1124	1	0	1	2	136	0.0178571428571429	0.0454545454545455	0.120996441281139	0.375668449197861	0.0147058823529412	1	2	1	4	140	0.0357142857142857	0.117647058823529	0.133715377268386	0.879831932773109	0.0285714285714286	0.0357142857142857	4	65	276	1895	0.980317495198111	0.422637688582791	0.139445725290064	Inf	0.455996639361479	5.243961352657	0.0447592821587343	13.7013223096765	0.238361879666227	0.998538394058152	0.214646057561714	1	108	98
TCGA-76-6285-01A-11D-1696-08	0	0	0	0	65	0	0	1	1	64	2624	1	3	1	5	647	1	4	1	6	586	2	2	20	24	664	2	4	23	29	727	1	0	0	1	81	0.0153846153846154	0.0344827586206897	0.111416781292985	0.309493401447424	0.0123456790123457	0	1	0	1	84	0.0153846153846154	0.0416666666666667	0.126506024096386	0.329365079365079	0.0119047619047619	0.0153846153846154	1	46	165	1226	0.997164589085605	0.161635671286121	0.00809593847494105	Inf	0.179368149580916	2.10757575757576	0.397914803204072	2.47446145384153	0	1	0	1	64	63
TCGA-76-6286-01A-11D-1845-08	0	0	0	0	82	0	0	2	2	80	3280	0	8	2	10	782	1	4	1	6	744	3	4	24	31	895	5	3	25	33	859	0	0	1	1	83	0.0121951219512195	0.0303030303030303	0.0966239813736903	0.313618108798832	0.0120481927710843	0	2	0	2	120	0.024390243902439	0.0645161290322581	0.134078212290503	0.481182795698925	0.0166666666666667	0.0121951219512195	1	56	203	1551	0.999018557378054	0.136509809066854	0.00681550674930407	Inf	0.151585861204736	0	1	0	0.176334573238162	0.997441765192795	0.159258910667087	1	81	79
TCGA-76-6656-01A-11D-1845-08	0	0	0	0	113	0	0	5	5	108	4428	0	6	2	8	1036	1	11	1	13	1042	2	1	37	40	1144	4	7	36	47	1206	1	0	2	3	145	0.0265486725663717	0.0638297872340425	0.120232172470978	0.530887747615554	0.0206896551724138	0	1	1	2	153	0.0176991150442478	0.05	0.133741258741259	0.373856209150327	0.0130718954248366	0.0353982300884956	4	75	298	2052	0.992364649371611	0.367353352145573	0.121672483159349	Inf	0.399286381785745	1.31431767337808	0.557461108664144	1.37696713529989	0.324078330421991	0.9963703808485	0.295205922207736	0.523809523809524	109	104
TCGA-76-6657-01A-11D-1845-08	0	0	0	0	69	0	2	5	7	62	2542	2	1	2	5	607	3	3	1	7	584	0	2	24	26	638	5	2	17	24	713	1	1	1	3	79	0.0434782608695652	0.125	0.110799438990182	1.12816455696203	0.0379746835443038	0	0	0	0	90	0	0	0.141065830721003	0	0	0.0289855072463768	2	44	169	1182	0.983024087167867	0.318085496023115	0.0544030876523849	Inf	0.347568819140726	1.59881656804734	0.4887129115162	1.74763573980147	0.194977630249675	0.995590756993972	0.174970295690094	1	67	60
TCGA-76-6660-01A-11D-1845-08	0	0	0	0	99	0	0	5	5	94	3854	3	5	1	9	940	1	9	2	12	954	4	5	30	39	1050	3	4	27	34	910	1	1	2	4	139	0.0404040404040404	0.117647058823529	0.152747252747253	0.770207363520948	0.0287769784172662	1	0	1	2	126	0.0202020202020202	0.0512820512820513	0.12	0.427350427350427	0.0158730158730159	0.0505050505050505	5	59	265	1695	0.943353624610448	0.542187537856856	0.20491586831981	Inf	0.577830188679245	2.11320754716981	0.243716904022068	2.5567459339467	0.389275074478649	0.986978740584981	0.355471354964369	1	94	89
TCGA-76-6661-01B-11D-1845-08	0	0	0	0	64	0	0	1	1	63	2583	3	4	4	11	618	1	3	1	5	571	3	1	18	22	659	1	4	20	25	735	0	0	1	1	74	0.015625	0.04	0.100680272108844	0.397297297297297	0.0135135135135135	0	1	1	2	92	0.03125	0.0909090909090909	0.139605462822458	0.651185770750988	0.0217391304347826	0.03125	2	40	166	1228	0.966531256363517	0.370057310144682	0.0631072015901482	Inf	0.399885255306942	0	1	0	0.441978440076094	0.949385488040692	0.411160847218986	0.4	62	61
TCGA-76-6662-01A-11D-1845-08	0	0	0	0	48	0	1	6	7	41	1681	0	2	1	3	384	1	2	1	4	399	1	2	12	15	457	1	3	15	19	441	0	0	1	1	48	0.0208333333333333	0.0526315789473684	0.108843537414966	0.483552631578947	0.0208333333333333	0	0	0	0	66	0	0	0.144420131291028	0	0	0.0208333333333333	1	28	114	784	0.97985033302766	0.245839754629617	0.0120999382738581	Inf	0.271627344222626	0	1	0	0.291747888239116	0.97373473965063	0.264743758366309	1	47	40
TCGA-76-6663-01A-11D-1845-08	0	0	0	0	73	0	0	3	3	70	2870	0	4	2	6	620	2	2	0	4	692	1	2	28	31	763	1	8	20	29	795	0	1	0	1	103	0.0136986301369863	0.0344827586206897	0.129559748427673	0.26615333110144	0.00970873786407767	0	1	1	2	87	0.0273972602739726	0.0645161290322581	0.114023591087811	0.565813867259918	0.0229885057471264	0.0136986301369863	1	49	190	1368	0.998383437760886	0.147028005743324	0.00738289151368438	Inf	0.164	0	1	0	0.170833333333333	0.997918093373167	0.153283753294834	1	72	69
TCGA-76-6664-01A-11D-1845-08	0	0	0	0	63	0	0	1	1	62	2542	2	2	2	6	539	3	2	1	6	635	1	4	21	26	663	4	3	17	24	705	1	1	1	3	95	0.0476190476190476	0.125	0.134751773049645	0.927631578947368	0.0315789473684211	1	0	1	2	84	0.0317460317460317	0.0769230769230769	0.126696832579186	0.607142857142857	0.0238095238095238	0.0634920634920635	4	39	179	1189	0.830287095424742	0.681440656915427	0.22004799851085	Inf	0.710926334935689	3.05698324022346	0.132039537525476	4.42100194629709	0.402234636871508	0.966514235502579	0.369207819823953	1	59	58
TCGA-81-5910-01A-11D-1696-08	0	0	0	0	60	0	2	0	2	58	2378	0	2	1	3	551	1	6	4	11	579	1	1	18	20	598	0	2	22	24	650	0	0	1	1	82	0.0166666666666667	0.0416666666666667	0.126153846153846	0.330284552845528	0.0121951219512195	1	0	0	1	81	0.0166666666666667	0.05	0.135451505016722	0.369135802469136	0.0123456790123457	0.0333333333333333	2	39	163	1085	0.976047995967883	0.341549630449545	0.0581709205760559	Inf	0.373484961843483	7.65644171779141	0.131305044035228	Inf	0.191411042944785	0.996066488317314	0.170804224579998	1	58	56
TCGA-81-5911-01A-12D-1845-08	0	0	0	0	36	0	1	1	2	34	1394	1	0	0	1	342	2	2	0	4	350	1	0	8	9	336	1	3	16	20	366	0	0	0	0	46	0	0	0.12568306010929	0	0	0	0	0	0	49	0	0	0.145833333333333	0	0	0	0	26	95	607	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	36	34
TCGA-87-5896-01A-01D-1696-08	0	0	0	0	67	0	0	0	0	67	2747	2	2	5	9	603	3	4	1	8	699	0	5	23	28	753	1	2	19	22	692	1	0	0	1	95	0.0149253731343284	0.0454545454545455	0.13728323699422	0.3311004784689	0.0105263157894737	0	1	0	1	72	0.0149253731343284	0.0357142857142857	0.0956175298804781	0.373511904761905	0.0138888888888889	0.0149253731343284	1	42	167	1278	0.994648018909936	0.182320086240527	0.00911053494813409	Inf	0.201225456064615	8.65269461077844	0.116182572614108	Inf	0	1	0	1	66	66
Totals	0	0	0	0	20106	26	187	641	828	19221	788061	448	1177	301	1926	183845	427	1151	301	1879	185412	666	919	6109	7694	208674	710	992	6020	7722	210130	183	150	279	612	26204	0.0304386750223814	0.0792540792540792	0.124703754818446	0.635538836576846	0.0233552129445886	166	128	239	533	26072	0.0265094996518452	0.0692747595528984	0.124941295992793	0.554458467894351	0.0204433875421909	0.043121456281707	867	12638	52276	366528	1	0.48100274492122	0.453338250037783	Inf	0.514319488260541	2.031961451918	2.11860961829286e-38	2.38271211574101	0.342147393117276	1	0.312798751012507	4.01437158982844e-13	19239	18354
