Sample	A_T_coord_clusters	G_C_coord_clusters	Non_coord_clusters	clusters	mutations	complex	insertions	deletions	indels	substitutions	bases	A_to_T	A_to_G	A_to_C	A	a	T_to_A	T_to_C	T_to_G	T	t	G_to_C	G_to_T	G_to_A	G	g	C_to_G	C_to_A	C_to_T	C	c	tCw_to_G	tCw_to_A	tCw_to_T	tCw	tcw	tCw_per_mut	tCw_per_C	tcw_per_c	enrich_tCw	freq_tCw	wGa_to_C	wGa_to_T	wGa_to_A	wGa	wga	wGa_per_mut	wGa_per_G	wga_per_g	enrich_wGa	freq_wGa	[tCw_to_G+tCw_to_T]_per_mut	tCw_to_G+tCw_to_T	[(C_to_G)+(C_to_T)]-[(tCw_to_G)+(tCw_to_T)]	tcw+wga	c-tcw	Fisher_p-value_tCw	odds_ratio_tCw	95%_confidence_lower_tCw	95%_confidence_upper_tCw	APOBEC_enrich	tCw_to_G_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_G	odds_ratio_tCw_to_G	tCw_to_T_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_T	odds_ratio_tCw_to_T	p-value_GvT_skew	non-APOBEC_mutations	non-APOBEC_substitutions
TCGA-18-3406-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	310	0	1	2	3	304	12464	10	10	4	24	3000	12	15	0	27	3235	22	57	35	114	3086	39	48	52	139	3143	22	5	14	41	481	0.132258064516129	0.294964028776978	0.15303849825008	1.92738449572982	0.0852390852390852	12	9	12	33	454	0.106451612903226	0.289473684210526	0.147116007777058	1.96765592395085	0.0726872246696035	0.193548387096774	60	88	935	5294	1.26536579003802e-13	3.85935659038263	2.86537036444939	Inf	2.70082381847088	3.71326378539493	3.34266548012753e-13	7.12638290180767	1.99095211752413	0.000357245723725533	2.41287750260069	0.241114976360466	250	244
TCGA-18-3407-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	171	0	0	2	2	169	6929	6	8	2	16	1723	3	6	3	12	1662	6	55	22	83	1770	4	42	12	58	1774	0	4	1	5	239	0.0292397660818713	0.0862068965517241	0.134723788049605	0.639878805367191	0.0209205020920502	0	1	1	2	266	0.0116959064327485	0.0240963855421687	0.150282485875706	0.160340610562551	0.0075187969924812	0.0116959064327485	2	42	505	3039	0.990199679594577	0.28662639735898	0.0492239600795505	Inf	0.318991899189919	0	1	0	0.412813046010483	0.963957200329286	0.37618528554741	0.461538461538461	169	167
TCGA-18-3408-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	107	0	2	4	6	100	4100	3	7	2	12	1002	4	12	1	17	981	5	19	19	43	1090	3	14	11	28	1027	0	0	1	1	137	0.00934579439252336	0.0357142857142857	0.133398247322298	0.267726798748697	0.0072992700729927	0	3	2	5	154	0.0467289719626168	0.116279069767442	0.141284403669725	0.823014195107218	0.0324675324675325	0.0280373831775701	3	35	291	1826	0.908775049989986	0.537975415213578	0.139446234121495	Inf	0.57433532284319	0	1	0	0.727491408934708	0.800472407911935	0.697316416007463	0.181818181818182	104	97
TCGA-18-3409-01A-01D-0983-08	0	0	3	3	3667	15	1	6	7	3465	142065	42	60	21	123	34080	41	54	23	118	35079	18	102	1425	1545	35992	15	88	1576	1679	36914	2	9	302	313	5093	0.0853558767384783	0.186420488385944	0.137969334127973	1.35117335721161	0.0614569016296878	1	12	255	268	4679	0.0730842650668121	0.173462783171521	0.13000111135808	1.33431769435977	0.0572771959820474	0.152713389691846	560	2474	9772	63134	1.41539113361311e-14	1.46239485098586	1.34918012963699	Inf	1.37705809800296	0.678245822944963	0.837552828905925	0.646074363843767	1.38474247157074	6.1075287851715e-15	1.47241498500436	2.0652221221762e-298	3107	2905
TCGA-18-3410-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	310	0	0	6	6	300	12300	6	13	1	20	3018	5	18	2	25	3188	33	64	27	124	3094	36	59	36	131	3000	21	5	8	34	468	0.109677419354839	0.259541984732824	0.156	1.66373067136426	0.0726495726495727	18	4	9	31	464	0.1	0.25	0.149967679379444	1.66702586206897	0.0668103448275862	0.180645161290323	56	76	932	5162	1.76536522289641e-13	4.07984751266451	2.98292037208829	Inf	2.77396280400572	3.69574547490203	6.63979571224446e-15	7.19653666409748	1.76439130730976	0.0124468120692026	2.04662907880895	0.000174102918678229	254	244
TCGA-18-3411-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	426	1	1	3	4	417	17097	15	27	7	49	4212	14	24	7	45	4400	26	80	60	166	4249	26	82	49	157	4236	6	7	10	23	623	0.0539906103286385	0.146496815286624	0.147072710103872	0.99608428499862	0.0369181380417336	6	9	6	21	631	0.0492957746478873	0.126506024096386	0.148505530713109	0.851860691577721	0.0332805071315372	0.0657276995305164	28	133	1254	7231	0.205842360065668	1.21391972794618	0.831921300746012	Inf	1.17675611954788	1.56146485093854	0.0746782141910078	1.72976719443361	0.993225348609221	0.553414921754071	0.992060505287247	0.492738621885636	398	389
TCGA-18-3412-01A-01D-0983-08	0	1	0	1	208	0	1	1	2	206	8446	8	6	3	17	2175	7	8	2	17	2080	12	51	21	84	2144	14	51	23	88	2047	4	8	4	16	314	0.0769230769230769	0.181818181818182	0.153395212506106	1.18529241459178	0.0509554140127389	4	4	4	12	316	0.0576923076923077	0.142857142857143	0.147388059701493	0.969258589511754	0.0379746835443038	0.0769230769230769	16	54	630	3561	0.0557030822452533	1.67453538903292	0.98333650162881	Inf	1.52054421768707	2.04688644688645	0.0331300455428811	2.51143413739103	1.20952380952381	0.340686040062945	1.25601089983115	1	192	190
TCGA-18-3414-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	397	1	3	4	7	382	15662	10	18	8	36	3973	16	28	5	49	3886	26	63	54	143	3880	34	54	66	154	3923	12	8	17	37	584	0.0931989924433249	0.24025974025974	0.148865664032628	1.61393657712151	0.0633561643835616	15	9	15	39	564	0.0982367758186398	0.272727272727273	0.145360824742268	1.87620889748549	0.0691489361702128	0.148614609571788	59	121	1148	6655	1.59650645832893e-09	2.82615392361775	2.13092100809953	Inf	2.2279181184669	3.05866724738676	2.31695418343937e-08	4.74178275710192	1.81254355400697	0.000533845316757903	2.10778205247447	0.505739187232621	338	323
TCGA-18-3415-01A-01D-0983-08	0	1	0	1	210	0	0	0	0	208	8528	7	10	2	19	2263	8	13	1	22	2146	17	38	37	92	2082	15	25	35	75	2037	7	3	12	22	308	0.104761904761905	0.293333333333333	0.151202749140893	1.94	0.0714285714285714	12	8	12	32	330	0.152380952380952	0.347826086956522	0.15850144092219	2.19446640316206	0.096969696969697	0.204761904761905	43	61	638	3481	4.54836523676045e-10	3.8443906420563	2.68710396709494	Inf	2.66935435254401	3.83331700626959	2.183737896564e-08	7.96789421213193	2.15203761755486	0.000160907288993563	2.72702872274605	0.431887667001096	167	165
TCGA-18-3416-01A-01D-0983-08	0	0	1	1	512	1	0	3	3	508	20828	24	14	3	41	5178	20	12	4	36	5281	36	154	41	231	5227	30	119	51	200	5142	8	13	8	29	759	0.056640625	0.145	0.147607934655776	0.982332015810277	0.0382081686429512	15	21	7	43	760	0.083984375	0.186147186147186	0.145398890376889	1.28025176577808	0.0565789473684211	0.07421875	38	120	1519	8850	0.00132470149009661	1.84480336533197	1.32151728434406	Inf	1.6417446521279	2.37882777744529	3.84718303482918e-05	3.11586232539355	1.11296762744368	0.370803225320631	1.13492692045577	0.185273590023067	474	470
TCGA-18-3417-01A-01D-1441-08	0	1	0	1	330	0	0	2	2	321	13161	13	20	8	41	3141	20	24	4	48	3210	19	46	33	98	3287	19	59	56	134	3523	5	6	11	22	466	0.0666666666666667	0.164179104477612	0.132273630428612	1.24120812247774	0.0472103004291846	7	5	6	18	464	0.0545454545454545	0.183673469387755	0.141162153939763	1.30115235749472	0.0387931034482759	0.0878787878787879	29	98	930	5880	0.00374867826667858	1.870692122498	1.27397945210756	Inf	1.67208534417069	2.31239388794567	0.00371720526119514	2.91747036112488	1.39869517941283	0.0957572302487581	1.49272715406814	0.352370510885821	301	292
TCGA-18-3419-01A-01D-0983-08	0	1	0	1	449	0	0	6	6	438	17958	10	19	6	35	4333	14	19	5	38	4540	29	99	51	179	4424	40	88	58	186	4661	23	12	18	53	687	0.11804008908686	0.28494623655914	0.14739326324823	1.93323785822729	0.0771470160116448	15	14	11	40	615	0.089086859688196	0.223463687150838	0.139014466546112	1.60748512513058	0.0650406504065041	0.149220489977728	67	111	1302	7783	2.9769394940669e-14	3.60749948177904	2.74411059072254	Inf	2.62644764321096	3.84280593958013	4.72893348100864e-15	7.3263764011791	1.856459363858	0.000632035242678485	2.16669965386989	0.221619260305465	382	371
TCGA-18-3421-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	450	1	0	7	7	439	17999	13	21	14	48	4481	19	22	7	48	4291	37	95	48	180	4568	33	78	52	163	4659	5	5	14	24	647	0.0533333333333333	0.147239263803681	0.138871002361022	1.06025924275325	0.0370942812982998	14	11	12	37	660	0.0822222222222222	0.205555555555556	0.144483362521891	1.4226936026936	0.0560606060606061	0.1	45	125	1307	7920	2.29741672555327e-05	2.18125703832882	1.59894512852703	Inf	1.86873846707773	1.91619849163843	0.00343435519236397	2.2572704245235	1.83551644988523	0.00140419891396047	2.12886885337554	0.260142268834691	405	394
TCGA-18-4083-01A-01D-1352-08	0	0	0	0	347	0	0	1	1	338	13858	17	19	3	39	3520	20	18	5	43	3399	27	50	53	130	3491	28	56	42	126	3448	7	3	6	16	483	0.0461095100864553	0.126984126984127	0.14008120649652	0.906503664267639	0.0331262939958592	11	1	13	25	505	0.0720461095100865	0.192307692307692	0.144657691205958	1.32939832444783	0.0495049504950495	0.106628242074928	37	113	988	5951	0.00057731131875063	1.97205824746376	1.40153864601073	Inf	1.73240890688259	2.29852778800147	0.000442000967706265	2.92961420224922	1.40465587044534	0.0785095568780391	1.50571471656598	1	310	301
TCGA-18-4086-01A-01D-1352-08	0	0	1	1	195	1	0	5	5	185	7585	11	15	3	29	1863	5	12	4	21	1835	26	30	27	83	1905	11	25	16	52	1982	6	0	3	9	240	0.0461538461538462	0.173076923076923	0.12108980827447	1.42932692307692	0.0375	7	3	3	13	263	0.0666666666666667	0.156626506024096	0.138057742782152	1.13449997709469	0.0494296577946768	0.0974358974358974	19	61	503	3384	0.00646017114230563	2.09500586940601	1.28519513118707	Inf	1.83531312127237	2.71511471710279	0.000529152267942306	3.64201036375958	1.07827453881363	0.49004159420663	1.09097238015593	0.0665849696120301	176	166
TCGA-18-4721-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	200	0	0	0	0	196	8036	6	11	5	22	1958	5	14	2	21	2044	12	37	34	83	1976	12	31	27	70	2058	3	5	3	11	293	0.055	0.157142857142857	0.142371234207969	1.1037542662116	0.037542662116041	3	3	3	9	267	0.045	0.108433734939759	0.135121457489879	0.802490862325707	0.0337078651685393	0.06	12	73	560	3474	0.523684224115585	1.01976208731485	0.562107863869982	Inf	1.01697478991597	1.80089285714286	0.106458808617601	2.06741422327806	0.708548009367681	0.866302243615131	0.676810363153802	1	188	184
TCGA-18-5592-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	322	0	0	10	10	306	12546	17	17	6	40	2933	13	10	5	28	3131	20	52	41	113	3271	25	57	43	125	3211	4	5	11	20	463	0.062111801242236	0.16	0.144191840548116	1.10963282937365	0.0431965442764579	5	7	5	17	418	0.0527950310559006	0.150442477876106	0.127789666768572	1.17726637591565	0.0406698564593301	0.077639751552795	25	104	881	5601	0.0435114547134969	1.52813859081993	1.0164516898283	Inf	1.42588144198365	1.47150964812713	0.151116388630121	1.58924555063317	1.40143776012107	0.102434095314824	1.4957833151611	0.139579518059988	297	281
TCGA-18-5595-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	269	1	0	1	1	257	10537	2	4	1	7	2525	5	3	1	9	2424	23	21	82	126	2731	16	14	85	115	2857	11	3	40	54	364	0.200743494423792	0.469565217391304	0.127406370318516	3.68557095078834	0.148351648351648	19	4	36	59	405	0.219330855018587	0.468253968253968	0.148297326986452	3.15753478346071	0.145679012345679	0.394052044609665	106	100	769	4819	8.65170517551884e-36	6.63907277971323	5.17970598120361	Inf	3.73911396719987	5.58967690307092	1.35145023627663e-18	20.8766120402389	3.30694657499046	2.78082469373156e-22	5.23134361966233	1.18826133840219e-09	163	151
TCGA-21-1070-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	543	0	0	1	1	527	21607	24	26	5	55	5279	22	20	7	49	5306	34	117	38	189	5510	42	129	63	234	5512	9	21	7	37	779	0.0681399631675875	0.158119658119658	0.14132801161103	1.11881329339609	0.0474967907573813	5	19	9	33	768	0.0607734806629834	0.174603174603175	0.139382940108893	1.25268683862434	0.04296875	0.0552486187845304	30	147	1547	9475	0.159197452762829	1.24991229389716	0.869828860372569	Inf	1.20758603310946	1.31245534651107	0.174323659641165	1.38296157352002	1.12867447054983	0.342782128388237	1.15285456899238	0.83710147272931	513	497
TCGA-21-1071-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	206	1	0	0	0	202	8282	6	13	5	24	2021	3	11	8	22	2045	12	36	32	80	2155	11	25	40	76	2061	3	2	11	16	284	0.0776699029126214	0.210526315789474	0.13779718583212	1.52779836916234	0.0563380281690141	7	5	10	22	317	0.106796116504854	0.275	0.147099767981439	1.86947949526814	0.0694006309148265	0.150485436893204	31	64	601	3615	6.30230150379735e-06	2.91250559788447	1.95630376503538	Inf	2.28909711883703	3.04998914852058	0.00069713998217623	4.62453648034585	2.04603438713256	0.000936270555598356	2.4760524681482	0.018912358616696	175	171
TCGA-21-1076-01A-02D-1521-08	0	0	0	0	341	0	0	0	0	337	13817	13	18	4	35	3348	16	21	4	41	3444	23	67	40	130	3516	30	59	42	131	3509	10	8	9	27	465	0.0791788856304985	0.206106870229008	0.132516386434882	1.55533119921202	0.0580645161290323	10	13	9	32	513	0.093841642228739	0.246153846153846	0.145904436860068	1.68708951866847	0.0623781676413255	0.111436950146628	38	97	978	6047	1.55116007001298e-05	2.42164846830057	1.71636481142948	Inf	2.02188896462925	2.71057606976116	1.58447794585143e-05	3.74637676035379	1.5767619332635	0.0326621611080885	1.73880940305526	0.843990741820936	303	299
TCGA-21-1077-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	238	0	0	1	1	233	9553	8	10	6	24	2292	11	18	5	34	2344	22	37	35	94	2452	16	27	38	81	2465	7	4	12	23	311	0.0966386554621849	0.283950617283951	0.126166328600406	2.25060537493549	0.0739549839228296	9	6	11	26	318	0.109243697478992	0.276595744680851	0.129690048939641	2.132744547036	0.0817610062893082	0.163865546218487	39	72	629	4288	2.62445584008218e-09	3.69078515074068	2.57751182634269	Inf	2.74657328234435	3.291440046858	7.81848626875697e-06	4.9554610912861	2.46294400766601	2.98907322758044e-05	3.13487336975015	0.215414143584744	199	194
TCGA-21-1078-01A-01D-1521-08	0	1	1	2	87	1	2	2	4	82	3362	2	2	0	4	841	0	3	1	4	791	14	2	18	34	814	10	6	24	40	916	7	3	11	21	143	0.241379310344828	0.525	0.156113537117904	3.36293706293706	0.146853146853147	7	1	8	16	119	0.183908045977011	0.470588235294118	0.146191646191646	3.21898171033119	0.134453781512605	0.379310344827586	33	33	262	1468	1.10680623096517e-10	5.59493279396378	3.56116105190465	Inf	3.30152671755725	3.85178117048346	1.8573286500154e-06	7.82936553206137	2.98709560159942	4.96082934668029e-06	4.62283037670271	0.349677032717578	54	49
TCGA-21-1081-01A-01D-1521-08	0	0	1	1	214	1	0	3	3	209	8569	9	15	5	29	2119	9	17	10	36	2065	10	22	37	69	2203	16	24	35	75	2182	5	6	3	14	285	0.0654205607476635	0.186666666666667	0.130614115490376	1.42914619883041	0.0491228070175439	2	4	3	9	302	0.0420560747663551	0.130434782608696	0.13708579210168	0.951482867837604	0.0298013245033113	0.0607476635514019	13	85	587	3798	0.559728468406678	0.989560046697595	0.561517075882258	Inf	0.99094322567187	2.01120429825711	0.0510223220626265	2.38308850491105	0.6225156161272	0.931226665321303	0.588257915300001	1	201	196
TCGA-21-5782-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	438	1	0	1	1	429	17589	13	22	5	40	4222	17	17	8	42	4329	39	71	57	167	4466	49	68	63	180	4572	28	12	19	59	646	0.134703196347032	0.327777777777778	0.141294838145232	2.31981424148607	0.0913312693498452	20	15	22	57	682	0.13013698630137	0.341317365269461	0.152709359605911	2.2350782306355	0.0835777126099707	0.203196347031963	89	119	1328	7710	6.85060827276741e-22	4.34133445280865	3.39177888883246	Inf	2.9120641218721	3.71221248630887	6.72801462519509e-18	6.9644655617015	2.32528865461847	1.05790303067928e-07	3.01259159572409	0.417966919334386	349	340
TCGA-21-5784-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	238	0	0	0	0	228	9348	16	10	1	27	2300	15	10	3	28	2379	19	37	27	83	2388	12	40	38	90	2281	1	4	11	16	336	0.0672268907563025	0.177777777777778	0.147303814116616	1.20687830687831	0.0476190476190476	4	9	6	19	341	0.0798319327731092	0.228915662650602	0.142797319932998	1.60308094548281	0.0557184750733138	0.092436974789916	22	74	677	3992	0.0194266762147658	1.75279339780975	1.12044318957874	Inf	1.58047144263909	1.11235526754658	0.475156756391008	1.13389797243816	1.80372684922168	0.0104530509883643	2.08799261429604	0.00405185036096857	216	206
TCGA-21-5786-01A-01D-1632-08	0	0	1	1	423	2	0	7	7	408	16728	23	18	5	46	4035	28	16	4	48	4000	32	79	48	159	4338	22	83	50	155	4355	4	7	3	14	574	0.033096926713948	0.0903225806451613	0.131802525832377	0.6852871754524	0.024390243902439	6	9	3	18	555	0.0425531914893617	0.113207547169811	0.127939142461964	0.884854665986742	0.0324324324324324	0.0378250591016548	16	136	1129	7564	0.84621845852465	0.788223801413206	0.480647764033716	Inf	0.810498345065498	1.42587671817078	0.157545270836466	1.5225756484815	0.471412302742177	0.990844075866279	0.436968692304257	0.387032616408581	407	392
TCGA-21-5787-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	464	0	5	9	14	447	18327	22	17	8	47	4611	23	14	6	43	4303	33	103	52	188	4672	27	93	49	169	4741	8	8	9	25	616	0.0538793103448276	0.14792899408284	0.129930394431555	1.13852493660186	0.0405844155844156	14	15	8	37	659	0.0797413793103448	0.196808510638298	0.141053082191781	1.39527975979079	0.0561456752655539	0.084051724137931	39	122	1275	8138	0.000218176721038794	2.04022705345433	1.46665110270751	Inf	1.78836682499087	2.70700653594771	6.54313050429482e-06	3.694665027449	1.2426402640264	0.204582004160297	1.29170652747175	0.439388599735995	425	408
TCGA-22-0944-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	140	3	0	1	1	135	5535	10	7	3	20	1329	7	7	4	18	1400	5	18	28	51	1407	10	17	19	46	1399	3	1	5	9	189	0.0642857142857143	0.195652173913043	0.135096497498213	1.44824016563147	0.0476190476190476	2	1	6	9	205	0.0642857142857143	0.176470588235294	0.145700071073205	1.21119081779053	0.0439024390243902	0.114285714285714	16	46	394	2412	0.0112248230230194	2.12862811030785	1.23397029753753	Inf	1.83789094481742	2.37394247038917	0.0492365013643652	3.05918977044428	1.66681067069878	0.059951200692378	1.8699908110054	0.092215182731215	124	119
TCGA-22-1002-01A-01D-1521-08	0	1	0	1	254	0	0	0	0	251	10291	8	21	4	33	2441	11	17	1	29	2417	10	47	31	88	2727	11	55	35	101	2706	2	4	6	12	367	0.047244094488189	0.118811881188119	0.135624538063562	0.876035287452451	0.0326975476839237	1	8	2	11	358	0.0433070866141732	0.125	0.131279794646131	0.952164804469274	0.0307262569832402	0.0433070866141732	11	76	725	4708	0.623807970874769	0.93989203621704	0.505790584057839	Inf	0.947491082045184	1.07054187192118	0.545361592628843	1.08230797257329	0.90833855799373	0.669050594318421	0.895687834464427	0.165321742179371	243	240
TCGA-22-1011-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	119	1	0	0	0	118	4838	5	1	2	8	1241	3	3	1	7	1177	27	7	18	52	1222	21	6	24	51	1198	10	3	11	24	176	0.201680672268908	0.470588235294118	0.146911519198664	3.20320855614973	0.136363636363636	20	2	9	31	202	0.260504201680672	0.596153846153846	0.165302782324059	3.60643564356436	0.153465346534653	0.420168067226891	50	40	378	2042	2.68668654359527e-17	6.74475258658827	4.59882624295569	Inf	3.55673133450911	4.00132275132275	5.52578153484173e-13	8.99160539410223	3.04862685815067	1.52250927922385e-06	4.90640343783594	0.084353506877441	69	68
TCGA-22-1012-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	307	2	0	2	2	297	12177	9	16	7	32	3021	13	24	10	47	3049	21	51	34	106	3035	31	40	41	112	3072	10	11	10	31	438	0.100977198697068	0.276785714285714	0.142578125	1.9412915851272	0.0707762557077626	8	11	6	25	429	0.0814332247557003	0.235849056603774	0.141350906095552	1.66853586664907	0.0582750582750583	0.110749185667752	34	93	867	5240	0.00018129777625892	2.20921348606811	1.53757427891346	Inf	1.88574957542072	2.43824860260846	0.000196015890084224	3.19881577460377	1.50268358323722	0.0613990511412915	1.63884346217137	0.83739013315881	273	263
TCGA-22-1016-01A-01D-1521-08	0	0	1	1	380	1	0	2	2	368	15088	18	14	8	40	3635	24	17	3	44	3656	24	69	46	139	3925	26	69	50	145	3872	9	11	8	28	511	0.0736842105263158	0.193103448275862	0.131973140495868	1.46320264525272	0.0547945205479452	8	6	4	18	541	0.0473684210526316	0.129496402877698	0.137834394904459	0.939507174297531	0.033271719038817	0.0763157894736842	29	117	1052	6745	0.0215666364964308	1.58908260443636	1.09012777906902	Inf	1.47216651908954	2.51994296577947	0.000198048150503783	3.30223257475472	0.926449619771863	0.656616364887672	0.915934873224913	0.369594801791655	351	339
TCGA-22-4591-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	283	0	1	2	3	275	11275	14	21	7	42	2612	15	20	3	38	2706	16	24	44	84	2964	17	44	50	111	2993	2	3	6	11	388	0.03886925795053	0.0990990990990991	0.129635816906114	0.764442277328875	0.0283505154639175	6	3	3	12	349	0.0424028268551237	0.142857142857143	0.11774628879892	1.21326238231682	0.0343839541547278	0.0600706713780919	17	110	737	5220	0.405845720526114	1.09462430542284	0.672414778687881	Inf	1.08194531992863	1.95945890382797	0.0449939459523648	2.26607313067726	0.77388204047461	0.835629824610761	0.749972560347618	1	266	258
TCGA-22-4593-01A-21D-1817-08	0	0	0	0	216	0	0	6	6	209	8569	9	10	5	24	1942	5	15	1	21	2051	12	28	35	75	2258	9	31	49	89	2318	2	6	10	18	300	0.0833333333333333	0.202247191011236	0.129421915444349	1.56269662921348	0.06	7	4	7	18	278	0.0833333333333333	0.24	0.12311780336581	1.94935251798561	0.0647482014388489	0.12037037037037	26	79	578	3998	0.000612159974203331	2.27593982337553	1.50307424697134	Inf	1.96038886142692	3.39298072170044	0.000599146181788588	5.18472145172578	1.60224089635854	0.0340700044138923	1.75478761308133	0.0849733132129789	190	183
TCGA-22-4595-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	363	3	1	2	3	350	14350	23	11	3	37	3500	13	19	7	39	3517	40	54	44	138	3639	28	59	49	136	3694	7	5	10	22	508	0.0606060606060606	0.161764705882353	0.137520303194369	1.17629689671144	0.0433070866141732	17	7	7	31	508	0.0853994490358127	0.22463768115942	0.139598790876614	1.60916638137624	0.0610236220472441	0.112947658402204	41	120	1016	6317	8.21543478438465e-05	2.12405847459046	1.53447366151406	Inf	1.83800190737027	2.54735988883742	8.37981772358018e-06	3.39058574878495	1.31933155532978	0.141972617242286	1.39068869710164	0.231292487821615	322	309
TCGA-22-4599-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	423	1	4	6	10	405	16605	22	26	6	54	4086	20	22	9	51	4079	26	64	43	133	4184	29	79	59	167	4256	6	11	6	23	572	0.0543735224586288	0.137724550898204	0.134398496240602	1.02474770738244	0.0402097902097902	2	14	3	19	583	0.0449172576832151	0.142857142857143	0.13934034416826	1.02523891203136	0.032590051457976	0.0401891252955083	17	140	1155	7285	0.877434013706357	0.765915752707633	0.474462471274971	Inf	0.79124272754846	1.06288862652499	0.485570074370346	1.07360423006461	0.644766997708174	0.948677090106975	0.610420275551796	1	406	388
TCGA-22-4601-01A-01D-1441-08	0	2	2	4	234	0	0	8	8	223	9143	6	12	7	25	2209	9	14	1	24	2384	14	36	40	90	2274	20	34	30	84	2276	7	8	8	23	342	0.0982905982905983	0.273809523809524	0.150263620386643	1.82219437482595	0.0672514619883041	3	6	11	20	314	0.0854700854700855	0.222222222222222	0.138082673702726	1.60934182590234	0.0636942675159236	0.123931623931624	29	75	656	3894	0.000330213853774021	2.29471341272561	1.54019265210976	Inf	1.93407012195122	2.03999282639885	0.0191241055928453	2.47266785910998	1.88262195121951	0.00435663398471261	2.21095612141651	0.0671374425582784	205	194
TCGA-22-4604-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	294	1	2	4	6	285	11685	12	17	3	32	2801	13	21	7	41	2906	23	31	51	105	2977	14	38	55	107	3001	7	6	9	22	418	0.0748299319727891	0.205607476635514	0.139286904365212	1.4761436301033	0.0526315789473684	6	5	6	17	422	0.0578231292517007	0.161904761904762	0.141753443063487	1.14215752651772	0.0402843601895735	0.0952380952380952	28	115	840	5138	0.0441950656133078	1.48916066410118	1.01376640479527	Inf	1.39347319347319	2.50045045045045	0.00112644763549484	3.31225265557928	1.00707547169811	0.531509228302403	1.00824072509103	0.813676710741718	266	257
TCGA-22-4607-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	100	0	2	0	2	98	4018	2	3	1	6	931	6	4	0	10	982	13	5	18	36	1032	15	13	18	46	1073	9	1	6	16	148	0.16	0.347826086956522	0.137931034482759	2.52173913043478	0.108108108108108	9	1	6	16	157	0.16	0.444444444444444	0.152131782945736	2.92144373673036	0.101910828025478	0.3	30	34	305	1800	1.50145422328572e-09	5.20132821215353	3.28725652881215	Inf	3.23514344262295	4.4367681498829	3.51251287786523e-09	10.603099293512	2.30054644808743	0.00396123247913105	2.94875205935233	0.210129401736766	70	68
TCGA-22-4613-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	714	1	3	5	8	698	28618	40	36	10	86	7082	37	50	15	102	7013	42	120	71	233	7265	51	151	75	277	7258	8	16	8	32	1004	0.0448179271708683	0.115523465703971	0.138330118489942	0.835128798883887	0.0318725099601594	7	14	13	34	1042	0.0476190476190476	0.145922746781116	0.143427391603579	1.01739803777813	0.0326295585412668	0.0504201680672269	36	203	2046	12477	0.361345316819463	1.08147780105102	0.781646950434796	Inf	1.06919103301881	1.14487749503358	0.328782953684833	1.17270528684297	1.02097979351625	0.49567255096525	1.02450546025873	0.328551664255323	678	662
TCGA-22-5471-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	286	1	0	0	0	282	11562	13	17	4	34	2922	12	11	3	26	2787	17	46	60	123	2953	17	43	39	99	2900	10	6	5	21	412	0.0734265734265734	0.212121212121212	0.142068965517241	1.49308620182407	0.0509708737864078	5	3	13	21	425	0.0734265734265734	0.170731707317073	0.143921435827972	1.18628407460545	0.0494117647058823	0.115384615384615	33	100	837	5016	0.0010791282702517	1.97742001748517	1.37428376635613	Inf	1.7350634651144	3.08507273877293	2.83691867257763e-05	4.72944005543796	1.27142391658521	0.170524077829632	1.33166792356058	0.655348339710437	253	249
TCGA-22-5472-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	458	1	0	2	2	451	18491	10	11	4	25	4135	9	9	2	20	4236	22	174	24	220	5097	7	154	25	186	5023	2	15	6	23	604	0.0502183406113537	0.123655913978495	0.120246864423651	1.02835042369864	0.0380794701986755	9	19	1	29	579	0.0633187772925764	0.131818181818182	0.113596233078281	1.16040979745643	0.0500863557858377	0.0393013100436681	18	60	1183	8937	0.00355376135941516	2.2662394286735	1.3788956446158	Inf	1.97412055400221	3.24481884163582	0.000262968924378421	4.61570495603506	1.22207462866804	0.347973115683798	1.25905506616895	0.437542137144354	440	433
TCGA-22-5473-01A-01D-1632-08	0	0	1	1	926	4	2	10	12	901	36941	30	30	14	74	9176	33	29	12	74	9201	108	116	163	387	9112	92	116	158	366	9452	49	15	56	120	1389	0.129589632829374	0.327868852459016	0.146953025814642	2.23111331421355	0.0863930885529158	58	18	63	139	1420	0.150107991360691	0.359173126614987	0.155838454784899	2.30477854205335	0.097887323943662	0.244060475161987	226	295	2809	15755	1.11835333227547e-51	4.29660283138223	3.68428957307607	Inf	2.86675472108092	3.53568529725881	9.36590900720987e-36	6.45208242362905	2.44997554589221	1.57080173537393e-21	3.30387880896512	0.329780187075719	700	675
TCGA-22-5474-01A-01D-1632-08	0	1	0	1	109	0	0	2	2	107	4387	1	4	0	5	1055	1	8	3	12	1142	14	7	26	47	1118	11	11	21	43	1072	9	4	6	19	170	0.174311926605505	0.441860465116279	0.158582089552239	2.78632010943912	0.111764705882353	8	0	8	16	163	0.146788990825688	0.340425531914894	0.145796064400716	2.33494321890093	0.098159509202454	0.284403669724771	31	41	333	1857	2.98965810470782e-08	4.21267852828879	2.72318353588022	Inf	2.83158158158158	4.47207207207207	5.38078323236448e-09	11.8254102119024	1.9589802568526	0.0092239751125899	2.36465344739539	0.630717557816303	78	76
TCGA-22-5477-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	202	1	0	1	1	197	8077	4	3	3	10	1956	5	9	0	14	1951	38	9	47	94	2107	22	20	37	79	2063	14	6	16	36	299	0.178217821782178	0.455696202531646	0.144934561318468	3.14415139071165	0.120401337792642	22	1	23	46	339	0.227722772277228	0.48936170212766	0.160892263882297	3.04154898638047	0.135693215339233	0.371287128712871	75	69	638	3532	1.43507833593451e-23	6.01363272600638	4.46560438838716	Inf	3.40419278996865	3.92163009404389	6.61429200433135e-15	8.2973375687703	3.0345947156292	2.92114879943369e-11	4.79542293210913	0.754024952740554	127	122
TCGA-22-5478-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	212	0	1	3	4	205	8405	13	14	3	30	2012	9	14	2	25	2120	9	38	30	77	2090	15	38	20	73	2183	1	5	2	8	299	0.0377358490566038	0.10958904109589	0.136967475950527	0.800109955559628	0.0267558528428094	2	5	2	9	292	0.0424528301886792	0.116883116883117	0.139712918660287	0.836594911937378	0.0308219178082192	0.0330188679245283	7	67	591	3682	0.900239902112651	0.650964233896713	0.293943351582198	Inf	0.683930123016417	0.903764805414552	0.664382656470702	0.890011805361485	0.578409475465313	0.92815958338952	0.541812448489277	1	205	198
TCGA-22-5480-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	177	1	0	3	3	170	6970	9	13	3	25	1723	10	11	4	25	1736	10	24	24	58	1728	19	21	22	62	1783	7	3	0	10	274	0.0564971751412429	0.161290322580645	0.153673583847448	1.04956439839887	0.0364963503649635	1	2	5	8	242	0.0451977401129944	0.137931034482759	0.140046296296296	0.984895981761185	0.0330578512396694	0.0734463276836158	13	62	516	2995	0.308162953449466	1.21693281526523	0.681371258128748	Inf	1.17940568475452	1.87703822507351	0.0540960832290214	2.21051335914988	0.739593865857769	0.825149208429861	0.707898953140786	0.488676307007786	164	157
TCGA-22-5482-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	186	1	0	4	4	176	7216	7	15	3	25	1783	8	10	6	24	1718	12	23	23	58	1838	7	31	31	69	1877	3	5	6	14	236	0.0752688172043011	0.202898550724638	0.125732551944592	1.61373126995824	0.0593220338983051	3	2	5	10	259	0.0537634408602151	0.172413793103448	0.140914036996736	1.22353880974571	0.0386100386100386	0.0913978494623656	17	56	495	3220	0.0152755945474596	1.97436556492107	1.1764281669179	Inf	1.74775148747751	2.37001594896332	0.0329400216292806	3.00106884360396	1.52880658436214	0.0998568653025556	1.66380892418036	0.227018416057892	169	159
TCGA-22-5485-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	238	0	1	3	4	233	9553	12	16	2	30	2277	17	21	2	40	2382	13	43	39	95	2511	5	43	20	68	2383	1	5	2	8	329	0.0336134453781513	0.117647058823529	0.138061267310113	0.852136599320579	0.0243161094224924	2	2	5	9	333	0.0378151260504202	0.0947368421052632	0.132616487455197	0.714366998577525	0.027027027027027	0.0420168067226891	10	67	662	4232	0.605740082712911	0.95414474427271	0.49508547024575	Inf	0.960097304508181	1.23212487411883	0.44819681706442	1.27847867250772	0.877105842593067	0.701956787242471	0.860604647054776	0.258731924360401	228	223
TCGA-22-5489-01A-01D-1632-08	0	1	0	1	276	0	0	0	0	273	11193	12	22	1	35	2757	15	21	5	41	2833	22	43	44	109	2807	20	44	24	88	2796	8	8	6	22	411	0.0797101449275362	0.25	0.146995708154506	1.7007299270073	0.0535279805352798	9	7	8	24	391	0.0869565217391304	0.220183486238532	0.139294620591379	1.58070344212675	0.061381074168798	0.11231884057971	31	79	802	4801	0.000146056605160115	2.34874388811352	1.59901267815377	Inf	1.96886193606892	2.82778173613585	3.38566186386079e-05	4.06940837012541	1.43835264779228	0.101825932271285	1.55185525465132	0.659490074109026	245	242
TCGA-22-5491-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	394	2	0	5	5	382	15662	12	12	10	34	3678	5	14	4	23	3899	40	34	66	140	4000	49	51	85	185	4085	30	8	37	75	608	0.190355329949239	0.405405405405405	0.148837209302326	2.72381756756757	0.123355263157895	24	6	27	57	555	0.144670050761421	0.407142857142857	0.13875	2.93436293436293	0.102702702702703	0.299492385786802	118	122	1163	6922	7.87300823811555e-36	5.75484185620205	4.58420776562543	Inf	3.41799226139295	4.21797559585342	2.66707060603243e-23	9.17849278899164	2.94647890532022	1.75844344816672e-16	4.37745512056209	0.265199373247527	276	264
TCGA-22-5492-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	250	2	1	0	1	242	9922	12	18	6	36	2468	11	28	6	45	2501	16	34	25	75	2453	18	39	29	86	2500	5	4	5	14	330	0.056	0.162790697674419	0.132	1.23326286116984	0.0424242424242424	5	3	1	9	363	0.036	0.12	0.147982062780269	0.810909090909091	0.0247933884297521	0.064	16	72	693	4260	0.166003685577287	1.36594493269449	0.814043398990021	Inf	1.29948839039748	2.10211357270181	0.0156892927184253	2.56061986042435	0.794131794131794	0.784690904179178	0.768435530276961	0.353412512653542	234	226
TCGA-33-4532-01A-01D-1267-08	0	1	0	1	435	3	1	0	1	417	17097	16	17	4	37	4024	18	31	4	53	4168	31	69	57	157	4462	28	65	77	170	4443	11	10	17	38	598	0.0873563218390805	0.223529411764706	0.134593742966464	1.66077119811135	0.0635451505016722	13	12	9	34	584	0.0781609195402299	0.21656050955414	0.130883012102196	1.65461129046331	0.0582191780821918	0.114942528735632	50	143	1182	7723	2.75399256317673e-06	2.28428813699528	1.70345122281211	Inf	1.95177226620376	3.06461326679859	1.92049848098916e-07	4.47943378566192	1.46179003459858	0.0305375278936349	1.57286375809262	0.861164665319828	385	367
TCGA-33-4533-01A-01D-1267-08	0	0	2	2	326	0	1	8	9	310	12710	13	18	5	36	2964	21	17	5	43	3058	14	51	49	114	3335	16	52	49	117	3353	7	4	14	25	459	0.0766871165644172	0.213675213675214	0.136892335222189	1.56089976351414	0.0544662309368192	3	7	9	19	403	0.0582822085889571	0.166666666666667	0.120839580209895	1.37923904052936	0.0471464019851117	0.101226993865031	33	95	862	5826	7.68744947706997e-05	2.3473617951824	1.62821461667827	Inf	2.00029002320186	2.58623356535189	0.00334167911065403	3.37850624452065	1.82091955111511	0.00315353461714639	2.07240315041103	0.00777060321384472	293	277
TCGA-33-4538-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	221	0	0	4	4	212	8692	7	21	4	32	2153	14	14	3	31	2147	13	28	30	71	2200	14	24	40	78	2192	4	3	7	14	294	0.0633484162895928	0.179487179487179	0.134124087591241	1.33821733821734	0.0476190476190476	4	5	6	15	297	0.0678733031674208	0.211267605633803	0.135	1.56494522691706	0.0505050505050505	0.0950226244343891	21	76	591	3801	0.0190187833914979	1.77683894561206	1.12596354432316	Inf	1.60887539902664	2.2019176536943	0.0227232977978187	2.70714141241378	1.38013052936911	0.143948853348307	1.46667870397594	0.27439462723775	200	191
TCGA-33-4547-01A-01D-1267-08	0	1	0	1	245	0	0	1	1	244	10004	4	6	4	14	2415	5	4	3	12	2429	44	17	57	118	2607	37	22	41	100	2553	27	1	15	43	384	0.175510204081633	0.43	0.150411280846063	2.858828125	0.111979166666667	31	5	22	58	348	0.236734693877551	0.491525423728814	0.133486766398159	3.68220338983051	0.166666666666667	0.387755102040816	95	84	732	4428	1.06868833621445e-32	6.8373822978969	5.23834882307137	Inf	3.74118509020973	5.04756122242461	1.06225449571789e-30	15.240303825423	2.66142522582804	1.03911943363118e-08	3.66791977711134	0.00468912102292458	150	149
TCGA-33-4566-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	1419	5	6	21	27	1364	55924	77	45	8	130	13138	60	39	14	113	13579	75	352	121	548	14704	103	369	101	573	14503	19	38	19	76	1937	0.0535588442565187	0.132635253054101	0.13355857408812	0.993086770802081	0.0392359318533815	14	39	29	82	1862	0.0577871740662438	0.14963503649635	0.126632208922742	1.18165068562961	0.0440386680988185	0.0570824524312896	81	319	3799	25408	3.91290859669579e-05	1.69818467400464	1.36614147471073	Inf	1.55683535140827	1.42531742534257	0.0228142454804518	1.52208234627111	1.66228666149698	0.000276213893808859	1.84491527426745	0.0708815874253105	1338	1283
TCGA-33-4582-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	239	0	0	0	0	237	9717	9	6	6	21	2372	11	12	4	27	2423	16	31	47	94	2406	15	36	44	95	2516	4	4	9	17	373	0.0711297071129707	0.178947368421053	0.148251192368839	1.20705517144067	0.0455764075067024	2	6	10	18	350	0.0753138075313808	0.191489361702128	0.14546965918537	1.31635258358663	0.0514285714285714	0.104602510460251	25	97	723	4199	0.0535687904190926	1.4967014736744	0.991756519919526	Inf	1.39502981656577	1.31762816222728	0.300847808755804	1.39375145092975	1.42139741309866	0.071487164806366	1.53244511141983	0.0024089945773894	214	212
TCGA-33-4583-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	615	2	1	7	8	600	24600	25	29	9	63	5832	34	40	4	78	5889	38	126	67	231	6399	34	123	71	228	6480	8	8	12	28	836	0.0455284552845528	0.12280701754386	0.129012345679012	0.951901284311257	0.0334928229665072	12	16	10	38	815	0.0617886178861789	0.164502164502165	0.127363650570402	1.29159429527528	0.0466257668711656	0.0682926829268293	42	168	1651	11228	0.00243497387769247	1.70009398874957	1.24889825118039	Inf	1.56014536644458	2.16686856450636	0.000577839550738289	2.61551664143387	1.24359413267322	0.167048909664582	1.28976375014443	0.851914527340792	573	558
TCGA-33-4586-01A-01D-1441-08	0	1	0	1	417	1	0	7	7	406	16646	21	21	6	48	3919	19	26	7	52	4114	16	87	49	152	4299	26	73	55	154	4314	6	10	7	23	623	0.0551558752997602	0.149350649350649	0.144413537320352	1.03418732150674	0.0369181380417336	3	12	6	21	559	0.0503597122302158	0.138157894736842	0.130030239590602	1.06250588456831	0.037567084078712	0.052757793764988	22	124	1182	7431	0.355106268126914	1.11534848899848	0.729102502919476	Inf	1.09801126486336	1.56145757795504	0.114270098627012	1.71444903864004	0.910850253807107	0.683607864672046	0.898099258624008	0.46072997099277	395	384
TCGA-33-6737-01A-11D-1817-08	0	1	0	1	512	2	0	2	2	501	20541	20	10	5	35	4899	9	6	4	19	4994	56	74	93	223	5297	68	72	84	224	5351	43	9	32	84	773	0.1640625	0.375	0.144458979629976	2.59589262613195	0.108667529107374	40	11	35	86	768	0.16796875	0.385650224215247	0.144987728903153	2.65988181988042	0.111979166666667	0.29296875	150	151	1541	9107	9.56195432574602e-46	5.86919780388534	4.79566855108147	Inf	3.44342134481428	4.62510728266103	2.12178888117938e-39	11.9591382738766	2.61557356914763	3.09344579376273e-14	3.59902717568578	0.101199996258093	362	351
TCGA-34-2596-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	304	2	4	4	8	292	11972	16	19	5	40	2902	14	22	2	38	2883	29	35	40	104	2992	21	42	47	110	3195	7	5	13	25	426	0.0822368421052632	0.227272727272727	0.133333333333333	1.70454545454545	0.0586854460093897	15	8	11	34	438	0.111842105263158	0.326923076923077	0.146390374331551	2.23322795925536	0.0776255707762557	0.151315789473684	46	91	864	5323	8.53884568995307e-09	3.11350552470224	2.25126191789446	Inf	2.4043829413355	3.15078703703704	2.97453906778393e-07	4.838937360863	1.97541507024266	0.000730594863825674	2.34645777470381	0.850415023784252	258	246
TCGA-34-2600-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	572	2	0	3	3	562	23042	17	15	8	40	5628	14	14	5	33	5809	80	53	112	245	5715	64	68	112	244	5890	40	16	52	108	884	0.188811188811189	0.442622950819672	0.150084889643464	2.94915065647949	0.122171945701357	57	11	48	116	873	0.202797202797203	0.473469387755102	0.152755905511811	3.09951609509783	0.132875143184422	0.344405594405594	197	171	1757	9848	1.3972906752314e-62	6.45567533703857	5.37841340220465	Inf	3.53583337457623	4.44920713969519	2.10292161492003e-44	11.5638777351678	2.94866452557118	3.21424304161956e-25	4.51953523769982	0.849047832143716	375	365
TCGA-34-2608-01A-02D-1522-08	0	0	0	0	181	1	0	0	0	179	7339	6	11	2	19	1757	5	13	1	19	1855	8	27	32	67	1876	12	25	37	74	1851	3	0	7	10	269	0.0552486187845304	0.135135135135135	0.145326850351162	0.929870390836934	0.0371747211895911	5	8	9	22	258	0.121546961325967	0.328358208955224	0.137526652452026	2.38759689922481	0.0852713178294574	0.132596685082873	24	65	527	3200	0.00130863727434963	2.24139787874988	1.44402380787647	Inf	1.90708483465876	2.82884250474383	0.00424050058513151	4.04607379584473	1.63990869840222	0.0309429336118091	1.83271305149586	0.0696786155660074	157	155
TCGA-34-5231-01A-21D-1817-08	0	0	2	2	742	3	2	11	13	720	29520	38	49	10	97	7015	41	46	13	100	7218	58	115	89	262	7653	50	117	94	261	7634	17	13	16	46	1030	0.0619946091644205	0.176245210727969	0.134922714173435	1.30626790164788	0.0446601941747573	21	16	15	52	1004	0.0700808625336927	0.198473282442748	0.131190382856396	1.51286457224537	0.051792828685259	0.0929919137466307	69	222	2034	13253	1.42476102962758e-06	2.02508187307794	1.58799616556112	Inf	1.78208091313647	2.64442441458174	8.07200760125719e-09	3.53677903902126	1.27315687949664	0.0949221984215194	1.3288373283793	0.369607885378369	673	651
TCGA-34-5232-01A-21D-1817-08	0	1	0	1	226	0	0	0	0	221	9061	8	11	2	21	2061	8	13	4	25	2261	14	36	36	86	2315	14	24	51	89	2424	2	6	10	18	327	0.079646017699115	0.202247191011236	0.13490099009901	1.49922688382641	0.055045871559633	4	2	1	7	300	0.0309734513274336	0.0813953488372093	0.129589632829374	0.628100775193798	0.0233333333333333	0.0752212389380531	17	98	627	4112	0.354193329559013	1.13758776606603	0.695632842181495	Inf	1.11730115803342	1.61961722488038	0.158127784234572	1.78833378965135	0.95563621697923	0.612122479756893	0.949218367456641	0.232095470796428	209	204
TCGA-34-5234-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	209	1	0	0	0	206	8446	4	15	4	23	2068	15	22	2	39	2105	9	43	23	75	2167	15	32	22	69	2106	3	3	0	6	296	0.0287081339712919	0.0869565217391304	0.140550807217474	0.618683901292597	0.0202702702702703	2	5	3	10	304	0.0478468899521531	0.133333333333333	0.140286109829257	0.950438596491228	0.0328947368421053	0.0382775119617225	8	61	600	3673	0.769766605769337	0.802879471302934	0.382215914736718	Inf	0.825700483091787	1.48368055555556	0.242060339255963	1.61074644880341	0.474777777777778	0.96119785678602	0.437322841137707	0.685082190087752	201	198
TCGA-34-5236-01A-21D-1817-08	0	0	0	0	247	1	0	0	0	241	9881	12	18	0	30	2561	4	14	13	31	2534	21	37	33	91	2444	21	37	31	89	2342	6	7	5	18	343	0.0728744939271255	0.202247191011236	0.146456020495303	1.38094146165689	0.0524781341107872	8	7	7	22	398	0.0890688259109312	0.241758241758242	0.162847790507365	1.48456568557071	0.0552763819095477	0.105263157894737	26	80	741	4045	0.0110998077018374	1.77387191261313	1.17396685307818	Inf	1.58424362793777	2.15294646873594	0.00339251881987019	2.7285057423574	1.21103238866397	0.284208057116705	1.25966675209434	0.811646693938239	221	215
TCGA-34-5239-01A-21D-1817-08	0	0	0	0	272	2	1	3	4	263	10783	15	12	4	31	2593	5	16	4	25	2673	16	44	40	100	2719	16	54	37	107	2798	5	4	5	14	415	0.0514705882352941	0.130841121495327	0.148320228734811	0.882152910708254	0.0337349397590361	3	6	8	17	397	0.0625	0.17	0.146009562339095	1.16430730478589	0.0428211586901763	0.0772058823529412	21	88	812	4705	0.119393148954818	1.38264800765528	0.883306734549094	Inf	1.30900031635558	1.69858374384236	0.0888887819435228	1.93127141428026	1.14709551532212	0.343883779551201	1.17691443189854	0.283069973260209	251	242
TCGA-34-5240-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	195	0	0	6	6	182	7462	6	11	1	18	1750	3	7	4	14	1819	6	35	33	74	1885	12	25	39	76	2008	4	3	12	19	295	0.0974358974358974	0.25	0.14691235059761	1.70169491525424	0.0644067796610169	1	5	7	13	238	0.0666666666666667	0.175675675675676	0.126259946949602	1.39138087667499	0.0546218487394958	0.123076923076923	24	66	533	3360	0.000986316937673958	2.29171921136495	1.47787812515832	Inf	1.94771732332708	2.02887221179904	0.0898217078006496	2.42400795932263	1.92742860120909	0.00349902389331672	2.259298179653	0.000628329265521912	171	158
TCGA-34-5241-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	1	0	0	0	0	1	41	0	0	0	0	12	0	0	0	0	13	0	0	0	0	7	0	1	0	1	9	0	0	0	0	3	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	0	NaN	NaN	0	0	0	3	13	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	1	1
TCGA-34-5927-01A-11D-1817-08	0	1	0	1	318	0	1	5	6	307	12587	10	17	1	28	3036	9	21	4	34	3027	28	50	50	128	3200	24	47	46	117	3324	7	5	11	23	443	0.0723270440251572	0.196581196581197	0.133273164861613	1.4750245991781	0.0519187358916479	9	8	10	27	455	0.0849056603773585	0.2109375	0.1421875	1.48351648351648	0.0593406593406593	0.116352201257862	37	111	898	5626	0.000231156160183918	2.08807060118145	1.48221184937242	Inf	1.8162583518931	2.23539489463766	0.00130809625446986	2.78385666929565	1.58922605790646	0.0208982924057325	1.75402621262972	0.407587685187313	281	270
TCGA-34-5928-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	450	2	1	1	2	439	17999	12	20	3	35	4447	13	9	2	24	4456	75	36	85	196	4580	71	33	80	184	4516	45	6	35	86	740	0.191111111111111	0.467391304347826	0.163861824623561	2.85235017626322	0.116216216216216	46	7	36	89	678	0.197777777777778	0.454081632653061	0.148034934497817	3.06739509963277	0.131268436578171	0.36	162	149	1418	7678	5.54757567237286e-48	5.88544014462936	4.82183548380196	Inf	3.34140290885673	3.99818382054601	1.65047604045431e-36	8.95635243546055	2.76025131427106	1.07300486352946e-16	4.08897428026981	0.0415128350348492	288	277
TCGA-34-5929-01A-11D-1817-08	0	1	0	1	235	1	0	1	1	231	9471	7	6	2	15	2258	10	13	1	24	2252	25	30	31	86	2503	23	48	35	106	2458	10	10	11	31	360	0.131914893617021	0.292452830188679	0.146460537021969	1.99680293501048	0.0861111111111111	13	4	11	28	328	0.119148936170213	0.325581395348837	0.131042748701558	2.48454339194555	0.0853658536585366	0.191489361702128	45	69	688	4273	2.7796634020056e-11	4.04918116847398	2.86997734222828	Inf	2.84635097919217	3.45515382751938	2.07633330124507e-08	5.71071430255131	2.40358527131783	5.65644780409032e-05	3.10438663573689	1	190	186
TCGA-37-3783-01A-01D-1267-08	0	1	0	1	443	0	0	1	1	439	17999	8	18	5	31	4376	7	15	3	25	4569	70	42	77	189	4448	61	39	94	194	4606	37	9	45	91	720	0.205417607223476	0.469072164948454	0.156317846287451	3.00075887743413	0.126388888888889	51	11	32	94	689	0.212189616252822	0.497354497354497	0.154901079136691	3.2107878145614	0.136429608127721	0.372460496613995	165	137	1409	7645	1.37036721955947e-52	6.53275509816701	5.3343287484661	Inf	3.51080330326802	4.31659072808933	3.05907289221863e-39	11.0974159749211	2.89350416495461	2.23016811263876e-19	4.44369274714648	0.295607870092274	278	274
TCGA-37-3789-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	490	0	1	7	8	481	19721	12	13	2	27	4829	9	19	3	31	5110	43	125	51	219	4802	48	108	48	204	4980	30	13	15	58	802	0.118367346938776	0.284313725490196	0.161044176706827	1.76543934281942	0.0723192019950125	24	11	20	55	709	0.112244897959184	0.251141552511416	0.147646813827572	1.70096154465419	0.077574047954866	0.181632653061225	89	101	1511	8271	8.66039579751071e-24	4.82252489799679	3.73746598828064	Inf	3.03249155317148	3.84163024268914	2.8831412058116e-21	7.98614244678996	2.2887378082613	1.08172557420641e-06	2.9930582694608	0.0140488882787214	401	392
TCGA-37-4133-01A-01D-1352-08	0	0	0	0	332	0	1	5	6	326	13366	15	23	5	43	3210	14	22	6	42	3291	19	42	53	114	3371	16	44	67	127	3494	7	11	9	27	508	0.0813253012048193	0.21259842519685	0.145392100744133	1.46224192448385	0.0531496062992126	7	5	6	18	439	0.0542168674698795	0.157894736842105	0.130228418866805	1.21244455101307	0.041002277904328	0.0873493975903614	29	126	947	5918	0.0554861030117287	1.43822198487641	0.988572233958623	Inf	1.35630343699969	2.89968321013728	0.000125685591737126	4.16518054740622	0.906151003167899	0.6980608238276	0.892788184714411	1	303	297
TCGA-37-4135-01A-01D-1352-08	0	1	0	1	335	1	1	10	11	321	13161	14	23	2	39	3128	12	17	5	34	3132	31	50	39	120	3448	24	58	46	128	3453	5	5	5	15	477	0.0447761194029851	0.1171875	0.138140747176368	0.848319575471698	0.0314465408805031	8	2	4	14	427	0.0417910447761194	0.116666666666667	0.123839907192575	0.942076502732241	0.0327868852459016	0.0656716417910448	22	118	904	5997	0.214194954173444	1.23677119921505	0.806354692415745	Inf	1.19960493046776	1.80436444086887	0.0238955736883492	2.05309171175673	0.808289953149401	0.797792569829047	0.78561259486981	0.417274449673559	313	299
TCGA-37-4141-01A-02D-1352-08	0	0	0	0	372	2	0	9	9	358	14678	15	12	5	32	3497	16	17	11	44	3503	27	62	50	139	3839	30	76	37	143	3839	5	11	3	19	498	0.0510752688172043	0.132867132867133	0.129721281583746	1.02425084955205	0.0381526104417671	6	11	5	22	502	0.0591397849462366	0.158273381294964	0.130763219588434	1.21038149560033	0.0438247011952191	0.0510752688172043	19	125	1000	6678	0.513947878974278	1.0150552038842	0.642976735035003	Inf	1.01306944444444	1.48171929824561	0.117345353055488	1.59678990770202	0.706022988505747	0.892855682782906	0.676283340489945	0.601458808712604	353	339
TCGA-37-5819-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	832	3	5	18	23	790	32390	37	28	8	73	7832	35	36	13	84	7826	45	181	97	323	8429	36	189	85	310	8303	5	20	14	39	1141	0.046875	0.125806451612903	0.137420209562809	0.915487263577507	0.0341805433829974	12	25	13	50	1102	0.0600961538461538	0.154798761609907	0.130739114960256	1.18402791434656	0.0453720508166969	0.0528846153846154	44	219	2243	14489	0.0729127970589527	1.29780632182453	0.966836061751903	Inf	1.24800265803709	1.56560602808188	0.0392366562186582	1.71577388391922	1.10665170763254	0.317749729079004	1.12518944828305	0.117291770695331	788	746
TCGA-39-5016-01A-01D-1441-08	0	0	1	1	406	2	0	4	4	394	16154	13	10	7	30	3760	14	28	5	47	3861	24	61	72	157	4339	21	67	72	160	4194	2	6	9	17	512	0.041871921182266	0.10625	0.12207916070577	0.8703369140625	0.033203125	6	5	8	19	517	0.0467980295566502	0.121019108280255	0.119151878312975	1.0156710074043	0.0367504835589942	0.061576354679803	25	164	1029	7504	0.345345499721189	1.11161562931465	0.750225892842232	Inf	1.09689378396861	1.47422524565382	0.169968169614092	1.57665044958446	0.978977702191988	0.575776232282259	0.976165183396676	0.0466149783764657	381	369
TCGA-39-5019-01A-01D-1817-08	0	0	0	0	217	0	0	4	4	210	8610	9	11	1	21	1998	8	18	4	30	2146	11	38	27	76	2233	14	32	37	83	2233	7	5	5	17	303	0.0783410138248848	0.204819277108434	0.135691894312584	1.50944371545588	0.0561056105610561	3	5	4	12	295	0.0552995391705069	0.157894736842105	0.132109270040305	1.19518287243533	0.0406779661016949	0.0875576036866359	19	70	598	3868	0.0269320815205323	1.75539645298874	1.08558797112915	Inf	1.59434068618241	2.98729096989967	0.000924975020823055	4.310287041884	1.05021948160535	0.493389299457189	1.05843746257233	1	198	191
TCGA-39-5021-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	165	0	0	2	2	160	6560	8	9	0	17	1589	2	11	5	18	1636	15	29	21	65	1732	7	25	28	60	1603	2	4	6	12	253	0.0727272727272727	0.2	0.157829070492826	1.26719367588933	0.0474308300395257	4	5	5	14	236	0.0848484848484849	0.215384615384615	0.136258660508083	1.58070404172099	0.0593220338983051	0.103030303030303	17	54	489	2846	0.0275373976263045	1.8318192021105	1.08910084914292	Inf	1.63296753938766	1.86001115448968	0.0929437420108408	2.18187004709865	1.53102958975001	0.09735589350666	1.68443582051747	0.236706211941847	148	143
TCGA-39-5022-01A-21D-1817-08	0	1	0	1	327	1	0	0	0	325	13325	9	13	2	24	3254	2	9	2	13	3414	74	18	65	157	3324	67	23	41	131	3333	52	6	22	80	569	0.244648318042813	0.610687022900763	0.170717071707171	3.57718778089322	0.140597539543058	51	4	33	88	504	0.269113149847095	0.560509554140127	0.151624548736462	3.69669396420989	0.174603174603175	0.483180428134557	158	89	1073	5584	1.08260709301797e-60	9.23618385394693	7.31762786537857	Inf	3.96861499220846	4.53207352620412	3.62464469804473e-49	14.0970469384448	3.21910882906329	5.07088988670034e-17	5.61016997645684	2.32823823614267e-07	169	167
TCGA-39-5024-01A-21D-1817-08	0	0	0	0	254	0	0	0	0	253	10373	10	12	6	28	2576	9	16	6	31	2577	32	17	39	88	2605	30	24	52	106	2615	17	4	16	37	380	0.145669291338583	0.349056603773585	0.145315487571702	2.40206057596822	0.0973684210526316	16	6	15	37	405	0.145669291338583	0.420454545454545	0.155470249520154	2.7044051627385	0.091358024691358	0.251968503937008	64	89	785	4435	4.80350204493482e-15	4.06126894404885	3.03106371535627	Inf	2.78156612963657	3.53934662009451	4.61998737357717e-12	6.42536418127595	2.26527612514874	6.54209952350401e-06	2.91819437720051	0.868299936992599	190	189
TCGA-39-5027-01A-21D-1817-08	0	0	0	0	371	2	0	5	5	359	14719	29	16	2	47	3576	23	22	3	48	3683	13	73	39	125	3749	26	68	45	139	3711	8	11	6	25	514	0.0673854447439353	0.179856115107914	0.138507140932363	1.29853315790947	0.0486381322957198	3	11	8	22	540	0.0592991913746631	0.176	0.144038410242731	1.2218962962963	0.0407407407407407	0.0673854447439353	25	98	1054	6406	0.0388822663667219	1.55035015835328	1.02975232006927	Inf	1.43857700436587	1.99630224298156	0.0169069001754908	2.38733696425938	1.17963314358001	0.296932997362419	1.21551298043371	0.641138038196785	346	334
TCGA-39-5028-01A-01D-1441-08	1	2	1	4	227	0	0	0	0	227	9307	4	9	1	14	2293	5	10	1	16	2320	38	16	40	94	2318	25	29	49	103	2376	20	7	16	43	363	0.18942731277533	0.41747572815534	0.152777777777778	2.73256840247131	0.118457300275482	24	1	18	43	362	0.18942731277533	0.457446808510638	0.156169111302847	2.92917597272834	0.11878453038674	0.343612334801762	78	74	725	3969	9.53057116350272e-24	5.76726556492031	4.32106349004728	Inf	3.32243194192377	4.52186097427477	1.44910020465828e-21	12.6713076724397	2.47339790778768	2.23714382260078e-07	3.38301652465998	0.167876259928872	149	149
TCGA-39-5029-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	170	0	0	0	0	169	6929	0	12	2	14	1722	7	16	2	25	1631	13	22	35	70	1795	10	19	31	60	1781	5	2	5	12	247	0.0705882352941176	0.2	0.138686131386861	1.44210526315789	0.048582995951417	7	8	8	23	251	0.135294117647059	0.328571428571429	0.13983286908078	2.34974388161639	0.0916334661354582	0.147058823529412	25	64	498	3078	0.0004472399689092	2.41344881299585	1.56416508011569	Inf	2.017056992013	3.74646411733892	1.76276318041984e-05	6.73667445815198	1.41438481197517	0.12523610448711	1.51582244308555	1	145	144
TCGA-39-5030-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	325	0	0	0	0	324	13284	4	10	1	15	3036	2	15	2	19	3315	24	32	95	151	3401	24	29	86	139	3532	14	4	7	25	520	0.0769230769230769	0.179856115107914	0.14722536806342	1.22163807415606	0.0480769230769231	16	7	14	37	436	0.113846153846154	0.245033112582781	0.128197588944428	1.91137067865605	0.0848623853211009	0.156923076923077	51	178	956	5977	0.000422443401104881	1.79115184586749	1.34659337033221	Inf	1.61509473607279	4.53255753138075	1.20230345124039e-14	10.4138122538621	0.841402945051897	0.829345239362905	0.820608701424933	0.143959362630222	274	273
TCGA-39-5031-01A-01D-1441-08	0	0	2	2	741	2	0	3	3	731	29971	8	12	5	25	7397	17	9	5	31	7467	124	58	148	330	7538	111	69	165	345	7569	77	24	86	187	1204	0.252361673414305	0.542028985507246	0.159069890342185	3.40748952766142	0.15531561461794	86	9	86	181	1133	0.244264507422402	0.548484848484848	0.150305120721677	3.64914279600952	0.159752868490733	0.452091767881242	335	213	2337	12770	1.07784492674278e-123	8.59210454181791	7.37739480807916	Inf	3.95169816565626	4.48372800189368	1.06682971909322e-74	12.3626964117072	3.55225084451954	1.64190406468937e-56	6.66436177823617	0.553778368055531	406	396
TCGA-39-5035-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	181	1	0	0	0	177	7257	3	8	6	17	1765	4	6	6	16	1803	21	14	32	67	1770	24	11	42	77	1919	12	0	10	22	279	0.121546961325967	0.285714285714286	0.14538822303283	1.96518177163338	0.0788530465949821	11	3	10	24	274	0.132596685082873	0.358208955223881	0.154802259887006	2.31397755746813	0.0875912408759124	0.237569060773481	43	76	553	3136	2.1805793015572e-08	3.20716713649305	2.27027077767339	Inf	2.41048824593128	3.40956399437412	2.03797134959254e-08	5.92424142003639	1.80294218268902	0.00585061282513394	2.09982836576257	0.676261718124988	138	134
TCGA-39-5036-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	334	0	2	3	5	326	13366	20	27	10	57	3325	17	18	7	42	3460	22	45	47	114	3349	23	38	52	113	3232	8	2	9	19	479	0.0568862275449102	0.168141592920354	0.148205445544554	1.13451696934986	0.0396659707724426	11	8	8	27	467	0.0808383233532934	0.236842105263158	0.139444610331442	1.69846726022766	0.0578158458244111	0.107784431137725	36	108	946	5635	0.000623614802968812	1.98536336335202	1.40270734351298	Inf	1.73916490486258	2.93725628376791	6.00997994563593e-06	4.35176346176609	1.19457791445106	0.254078663338659	1.2348615595845	0.831028064785003	298	290
TCGA-39-5037-01A-01D-1441-08	0	0	1	1	280	1	1	4	5	273	11193	16	16	4	36	2662	10	22	5	37	2803	16	39	47	102	2899	13	40	45	98	2829	4	7	9	20	397	0.0714285714285714	0.204081632653061	0.140332272887946	1.4542744049761	0.0503778337531486	3	6	9	18	380	0.0642857142857143	0.176470588235294	0.131079682649189	1.34628482972136	0.0473684210526316	0.0892857142857143	25	96	777	4951	0.0214035052469273	1.6591843080712	1.09949162908199	Inf	1.52312879585607	1.77943460702081	0.089389052634939	2.02716374153666	1.44233674668457	0.0704042596139867	1.54979126087987	0.0137944750894916	255	248
TCGA-39-5039-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	193	0	1	0	1	187	7667	7	12	1	20	1867	10	12	2	24	1850	7	37	29	73	1997	15	23	32	70	1953	3	3	3	9	260	0.0466321243523316	0.128571428571429	0.133128520225294	0.965769230769231	0.0346153846153846	1	2	1	4	254	0.0207253886010363	0.0547945205479452	0.127190786179269	0.430805738323805	0.015748031496063	0.0414507772020725	8	75	514	3436	0.860055150446155	0.713101596200156	0.341658566846792	Inf	0.74070601472036	1.39724089140432	0.320793714541176	1.48534044589279	0.503922944440901	0.964598877367981	0.469178932283571	1	185	179
TCGA-43-2578-01A-01D-1522-08	0	0	1	1	351	0	0	1	1	347	14227	25	19	7	51	3359	20	16	5	41	3343	28	73	43	144	3797	16	56	39	111	3728	4	8	6	18	474	0.0512820512820513	0.162162162162162	0.127145922746781	1.27540198426274	0.0379746835443038	6	8	7	21	493	0.0598290598290598	0.145833333333333	0.129839346852779	1.12318289384719	0.0425963488843813	0.0655270655270655	23	103	967	6558	0.0534381466035885	1.51428174843673	0.991793507437749	Inf	1.42048718832586	1.7685907680737	0.0500832308920912	1.99447060583793	1.2336999016319	0.252934357440803	1.27768394467742	0.620030839539336	328	324
TCGA-43-3394-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	175	0	3	6	9	165	6765	9	18	3	30	1735	8	10	1	19	1630	5	35	23	63	1639	10	27	16	53	1761	5	2	3	10	229	0.0571428571428571	0.188679245283019	0.130039750141965	1.45093515695806	0.0436681222707424	1	5	3	9	231	0.0514285714285714	0.142857142857143	0.140939597315436	1.01360544217687	0.038961038961039	0.0685714285714286	12	42	460	2940	0.0564689680163183	1.82569035240007	0.978007463581395	Inf	1.64251207729469	2.95652173913043	0.010524687245039	4.25840329183637	1.1371237458194	0.437466948777626	1.16198067793167	1	163	153
TCGA-43-3920-01A-01D-0983-08	0	1	0	1	350	0	2	3	5	344	14104	14	15	3	32	3466	12	16	5	33	3677	37	61	49	147	3475	31	62	39	132	3486	16	13	15	44	536	0.125714285714286	0.333333333333333	0.153757888697648	2.16791044776119	0.082089552238806	13	6	14	33	512	0.0942857142857143	0.224489795918367	0.147338129496403	1.52363679846939	0.064453125	0.165714285714286	58	98	1048	5913	2.14176308558612e-11	3.33845565945584	2.48655104042158	Inf	2.46952681542376	2.83269252357432	5.35928646392014e-08	4.19436377441828	2.18889876821652	2.49566107854422e-05	2.77288459475074	1	292	286
TCGA-43-5668-01A-01D-1632-08	0	0	0	0	708	4	1	6	7	688	28208	30	34	13	77	6702	42	20	6	68	7044	38	124	86	248	7246	40	178	77	295	7216	7	19	11	37	975	0.0522598870056497	0.125423728813559	0.135116407982262	0.928264232942199	0.037948717948718	5	19	14	38	990	0.0536723163841808	0.153225806451613	0.13662710460944	1.12148908439231	0.0383838383838384	0.0522598870056497	37	204	1965	12497	0.239086714562654	1.15345563710218	0.83708748316586	Inf	1.12992725391446	1.13227637502447	0.369824168852275	1.15629284293103	1.12880313461028	0.290298789983546	1.15210105608598	0.0222660649853544	671	651
TCGA-43-6143-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	365	2	1	13	14	342	14022	14	19	3	36	3429	17	30	6	53	3401	28	61	54	143	3642	24	45	41	110	3550	6	6	9	21	510	0.0575342465753425	0.190909090909091	0.143661971830986	1.32887700534759	0.0411764705882353	10	4	9	23	500	0.063013698630137	0.160839160839161	0.13728720483251	1.17155244755245	0.046	0.0931506849315069	34	113	1010	6182	0.00231991204398252	1.84143458045801	1.29320588262625	Inf	1.6469859230821	2.19101294744859	0.00160972526771467	2.71991137672228	1.34920270974466	0.114443216644893	1.43075137192339	0.826908622506718	331	308
TCGA-43-6647-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	195	0	0	0	0	190	7790	7	14	3	24	1915	9	15	4	28	1967	12	32	35	79	1918	19	20	20	59	1990	6	6	2	14	282	0.0717948717948718	0.23728813559322	0.141708542713568	1.67448010578194	0.049645390070922	5	6	5	16	278	0.0820512820512821	0.20253164556962	0.144942648592284	1.39732264821055	0.0575539568345324	0.0923076923076923	18	68	560	3348	0.0636023836351452	1.58234400547496	0.965340528406331	Inf	1.46063122923588	2.47626728110599	0.00289031281487221	3.28679503452095	0.888181818181818	0.690320611270175	0.871919504935571	0.398508976829821	177	172
TCGA-43-6770-01A-11D-1817-08	0	0	1	1	254	1	0	3	3	244	10004	10	19	4	33	2322	9	19	5	33	2462	23	37	31	91	2565	25	31	31	87	2655	8	4	6	18	346	0.0708661417322835	0.206896551724138	0.130320150659134	1.58760215268089	0.0520231213872832	5	2	6	13	301	0.0511811023622047	0.142857142857143	0.117348927875244	1.21737066919791	0.0431893687707641	0.0984251968503937	25	85	647	4573	0.00208259010267267	2.07847412216755	1.36891227964742	Inf	1.83363776872278	2.18508500772798	0.00487649782033382	2.62459039834317	1.56154958368649	0.0784357634530219	1.6961113689152	1	229	219
TCGA-43-6771-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	214	2	0	0	0	206	8446	15	13	2	30	2043	7	5	2	14	1989	12	52	17	81	2175	7	38	36	81	2239	1	5	2	8	297	0.0373831775700935	0.0987654320987654	0.132648503796338	0.744564991478572	0.0269360269360269	4	5	4	13	291	0.0607476635514019	0.160493827160494	0.133793103448276	1.19956726485936	0.0446735395189003	0.0514018691588785	11	61	588	3826	0.364433431893767	1.17329521429498	0.625317289016837	Inf	1.14687263794407	1.97547440028643	0.0991365098274741	2.32342732466121	0.849826723142087	0.725295620583408	0.83069105251931	1	203	195
TCGA-46-3765-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	375	0	1	1	2	368	15088	10	11	4	25	3702	11	13	4	28	3832	20	111	45	176	3873	17	76	46	139	3681	4	7	13	24	546	0.064	0.172661870503597	0.148329258353708	1.16404458850502	0.043956043956044	9	13	15	37	566	0.0986666666666667	0.210227272727273	0.146139943196489	1.43853397044651	0.0653710247349823	0.109333333333333	41	87	1112	6442	8.15033302056323e-07	2.72981558974903	1.94464146346254	Inf	2.17593581384892	2.38678786700369	0.0017204583812705	3.13729727883914	2.09020475926951	8.80911502332877e-05	2.5742791891655	0.00691925076705544	334	327
TCGA-46-3766-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	1	0	0	1	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	NaN	NaN	0	0	0	0	0	1	0	0	Inf	NaN	NaN	1	0	NaN	1	0	1	1	0
TCGA-46-3767-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	237	1	0	2	2	231	9471	15	9	3	27	2488	8	9	4	21	2243	16	66	13	95	2425	14	51	23	88	2315	3	7	3	13	312	0.0548523206751055	0.147727272727273	0.134773218142549	1.09611742424242	0.0416666666666667	6	6	3	15	391	0.0632911392405063	0.157894736842105	0.161237113402062	0.979270426706152	0.0383631713554987	0.0632911392405063	15	51	703	4037	0.0589380144841905	1.68875682289726	0.973740081168313	Inf	1.5323936376568	2.02275960170697	0.0265792273202671	2.4603399541058	1.12375533428165	0.448988320772106	1.14844185113553	0.547152630062323	222	216
TCGA-46-3768-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	401	1	2	13	15	378	15498	18	26	5	49	3833	26	15	3	44	3950	26	91	36	153	3913	22	75	35	132	3802	9	11	7	27	596	0.0673316708229426	0.204545454545455	0.156759600210416	1.30483526540574	0.0453020134228188	7	12	6	25	564	0.0623441396508728	0.163398692810458	0.144134934832609	1.13365085987114	0.0443262411347518	0.0723192019950125	29	90	1160	6555	0.00545185803782546	1.82066279196993	1.23655541698387	Inf	1.62079831932773	2.21695402298851	0.00128861924715298	2.8249243555804	1.21776347741622	0.265894371966959	1.26653004618671	0.662311513260241	372	349
TCGA-46-3769-01A-01D-0983-08	0	1	0	1	1000	5	3	5	8	972	39852	42	33	12	87	9760	45	31	7	83	9790	112	167	122	401	10168	95	184	122	401	10134	47	37	45	129	1488	0.129	0.321695760598504	0.146832445233866	2.19090378891481	0.0866935483870968	59	20	42	121	1460	0.121	0.301745635910224	0.143587726199843	2.10147234653093	0.0828767123287671	0.193	193	258	2948	17354	2.91221158478906e-46	4.40340312355078	3.73355320334013	Inf	2.94708126370767	3.52652416442163	7.76463961591738e-35	6.17725958925651	2.45550470449541	3.44089881832497e-16	3.26179713421706	0.0981071225514733	807	779
TCGA-46-6025-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	217	0	0	3	3	211	8651	7	21	4	32	2075	8	8	8	24	2042	18	11	34	63	2241	33	23	36	92	2293	14	5	6	25	301	0.115207373271889	0.271739130434783	0.131269079808112	2.07009244547162	0.0830564784053156	6	1	10	17	291	0.0783410138248848	0.26984126984127	0.129852744310576	2.0780559646539	0.0584192439862543	0.165898617511521	36	85	592	3942	1.7793536189859e-06	2.81931946390609	1.96451931702461	Inf	2.27864641501005	3.00344462109168	3.22949548455424e-06	4.29417869275691	1.75057915057915	0.0178810480480604	1.972670730141	0.50862847882284	181	175
TCGA-46-6026-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	238	1	2	4	6	230	9430	5	12	1	18	2208	7	11	2	20	2301	13	33	50	96	2439	14	35	47	96	2482	5	4	14	23	327	0.0966386554621849	0.239583333333333	0.131748589846898	1.81848878695209	0.0703363914373089	9	3	12	24	327	0.100840336134454	0.25	0.134071340713407	1.86467889908257	0.073394495412844	0.168067226890756	40	84	654	4267	7.26861489777223e-08	3.1059034076287	2.19481022372141	Inf	2.42724671993687	3.90157435723185	2.1492358460468e-06	7.02081444403212	2.01686686213311	0.000354524410582855	2.38857414495088	0.0212085990021263	198	190
TCGA-51-4079-01A-01D-1458-08	0	0	1	1	422	3	2	4	6	407	16687	28	18	6	52	4061	32	17	10	59	4051	24	53	57	134	4311	19	78	65	162	4264	9	11	20	40	598	0.0947867298578199	0.246913580246914	0.140243902439024	1.76060118089104	0.0668896321070234	8	6	16	30	615	0.0710900473933649	0.223880597014925	0.142658315935978	1.56934838005096	0.0487804878048781	0.125592417061611	53	112	1213	7362	5.47206866058696e-09	2.87157685095546	2.13446878108738	Inf	2.27072872167678	2.79481968596024	4.02571524090339e-05	3.96762759470788	2.08600813590475	1.11510391081636e-05	2.54021764122569	0.00158969451516888	369	354
TCGA-51-4080-01A-01D-1458-08	0	0	0	0	316	0	2	7	9	301	12341	16	12	6	34	2986	17	17	2	36	3038	24	49	48	121	3152	13	63	34	110	3165	1	6	6	13	454	0.0411392405063291	0.118181818181818	0.143443917851501	0.82388866639968	0.0286343612334802	3	7	4	14	413	0.0443037974683544	0.115702479338843	0.131027918781726	0.883036839893542	0.0338983050847458	0.0443037974683544	14	105	867	5450	0.769437520609396	0.838160993605465	0.489666530376669	Inf	0.85718162697605	0.787680413977992	0.766401250132946	0.761974643243051	0.888541930402003	0.703527966988979	0.873101396001205	0.118849833020996	302	287
TCGA-51-4081-01A-01D-1458-08	0	0	0	0	227	1	1	3	4	218	8938	7	16	2	25	2091	12	13	6	31	2157	11	33	37	81	2271	17	36	28	81	2419	6	3	1	10	304	0.0440528634361234	0.123456790123457	0.125671765192228	0.982374918778427	0.0328947368421053	4	6	6	16	306	0.0704845814977974	0.197530864197531	0.134742404227213	1.46598886468168	0.0522875816993464	0.0748898678414097	17	76	610	4080	0.0943834651082371	1.49596732016782	0.905939972011004	Inf	1.405429226159	2.74590163934426	0.00202494279489772	3.71387694753316	0.827994955863808	0.75691056512457	0.807269586338439	0.555135522297396	210	201
TCGA-56-1622-01A-01D-1521-08	0	0	0	0	244	0	1	2	3	234	9594	9	18	6	33	2329	6	16	4	26	2353	15	38	26	79	2299	14	43	39	96	2613	2	3	5	10	374	0.040983606557377	0.104166666666667	0.143130501339457	0.727774064171123	0.0267379679144385	3	5	3	11	336	0.0450819672131148	0.139240506329114	0.146150500217486	0.952720012055455	0.0327380952380952	0.0532786885245902	13	81	710	4202	0.613123541100205	0.949853196148095	0.538591931730005	Inf	0.956787533712916	1.19281204468188	0.412255276499295	1.23291366614414	0.85148429035753	0.739928642280159	0.83066926815388	0.505475577859527	231	221
TCGA-56-5897-01A-11D-1632-08	0	0	0	0	126	1	0	0	0	125	5125	3	9	1	13	1203	4	8	3	15	1346	14	20	21	55	1285	13	12	17	42	1291	9	1	6	16	204	0.126984126984127	0.380952380952381	0.158017041053447	2.41083099906629	0.0784313725490196	11	2	7	20	182	0.158730158730159	0.363636363636364	0.141634241245136	2.56743256743257	0.10989010989011	0.261904761904762	33	32	386	2190	3.42430706504163e-11	5.8448337309204	3.72756483721892	Inf	3.38812275807094	4.94338898483976	1.47220389824344e-11	16.1813851730401	2.2830651758931	0.00282679905217562	2.94857510004544	0.155401359597851	93	92
TCGA-56-5898-01A-11D-1632-08	0	0	0	0	169	0	0	2	2	164	6724	4	16	3	23	1725	4	13	3	20	1640	14	28	14	56	1673	9	26	30	65	1686	2	5	4	11	215	0.0650887573964497	0.169230769230769	0.127520759193357	1.32708407871199	0.0511627906976744	6	1	3	10	232	0.0591715976331361	0.178571428571429	0.138673042438733	1.28771551724138	0.0431034482758621	0.0887573964497041	15	52	447	2912	0.03001033130076	1.87868738751878	1.0815245365292	Inf	1.68236001202043	2.6137535259216	0.00778536999733087	3.47259547097197	1.19549522066301	0.370720053078961	1.23239232297428	1	154	149
TCGA-56-6545-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	322	1	0	0	0	312	12792	12	14	5	31	3020	13	15	3	31	3182	35	47	43	125	3322	26	62	37	125	3268	12	8	12	32	463	0.0993788819875776	0.256	0.141676866585067	1.80692872570194	0.0691144708423326	14	8	15	37	452	0.114906832298137	0.296	0.136062612883805	2.17546902654867	0.081858407079646	0.164596273291925	53	88	915	5675	4.57848281724893e-12	3.73445456676563	2.73844866150737	Inf	2.70720458861373	3.06978410821464	5.10799211448571e-08	4.60591536039559	2.43073770491803	6.64780333661783e-06	3.15883130441902	1	269	259
TCGA-56-6546-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	367	1	0	0	0	358	14678	24	20	8	52	3524	23	19	2	44	3442	17	67	52	136	3890	27	61	38	126	3822	5	8	4	17	491	0.0463215258855586	0.134920634920635	0.128466771323914	1.05023761031908	0.0346232179226069	2	11	3	16	515	0.0435967302452316	0.117647058823529	0.132390745501285	0.888635065676756	0.0310679611650485	0.0381471389645777	14	120	1006	6706	0.845711735999706	0.777723572411514	0.456309072825049	Inf	0.800925788552268	1.21959154165914	0.349705104403808	1.26109396277585	0.596244753700022	0.957324236608303	0.56222773512986	1	353	344
TCGA-60-2698-01A-01D-1522-08	0	2	0	2	1375	2	0	7	7	1355	55555	29	38	10	77	13721	28	26	12	66	13844	237	125	247	609	14232	236	116	251	603	13758	164	25	117	306	2152	0.222545454545455	0.507462686567164	0.156418084023841	3.24427120901071	0.142193308550186	175	28	122	325	2167	0.236363636363636	0.533661740558292	0.152262507026419	3.50487950697998	0.149976926626673	0.420363636363636	578	393	4319	23671	4.43365113613244e-205	8.05962141841842	7.1994299704028	Inf	3.85769868439909	4.64470624170598	1.87808810681309e-160	13.862881037836	3.11019953860359	1.22793382074277e-63	5.05714417800433	2.08286037844285e-08	797	777
TCGA-60-2707-01A-01D-1522-08	0	0	1	1	141	1	0	1	1	136	5576	3	8	0	11	1419	4	13	0	17	1413	17	19	20	56	1384	13	16	23	52	1360	10	4	11	25	204	0.177304964539007	0.480769230769231	0.15	3.20512820512821	0.122549019607843	11	3	4	18	203	0.127659574468085	0.321428571428571	0.146676300578035	2.19141449683322	0.0886699507389163	0.25531914893617	36	37	407	2337	1.00777059181803e-11	5.58160119277316	3.65300293688289	Inf	3.32482918784289	4.71941031941032	2.14999411549395e-11	13.3765136421255	2.35186560767956	0.000999875745954267	3.07435017252715	0.274378037544243	105	100
TCGA-60-2708-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	231	1	0	4	4	225	9225	17	14	5	36	2279	9	13	3	25	2145	21	21	36	78	2428	20	30	36	86	2373	10	0	7	17	318	0.0735930735930736	0.197674418604651	0.134007585335019	1.47509872751207	0.0534591194968553	7	4	5	16	323	0.0692640692640693	0.205128205128205	0.133031301482702	1.5419544335953	0.0495356037151703	0.125541125541126	29	84	641	4160	0.000408890027544092	2.24006930516193	1.51177646246462	Inf	1.92217635608079	3.10555153913474	9.43077069119589e-06	4.59492657947194	1.2483099323973	0.25158739572288	1.2978942360624	0.321257069400288	202	196
TCGA-60-2709-01A-21D-1817-08	0	0	0	0	218	0	0	0	0	213	8733	9	13	2	24	2207	9	20	2	31	2207	15	38	29	82	2162	18	27	31	76	2157	2	8	6	16	307	0.073394495412844	0.210526315789474	0.142327306444135	1.47917023829933	0.0521172638436482	7	7	6	20	365	0.0917431192660551	0.24390243902439	0.168825161887142	1.4447043100568	0.0547945205479452	0.0963302752293578	21	72	672	3647	0.0495786776735509	1.58270509913618	1.00109876280447	Inf	1.45127688172043	1.75284090909091	0.061384817298571	2.03479244712126	1.28541666666667	0.217948646245742	1.35666461586132	0.604715380138393	197	192
TCGA-60-2710-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	228	0	1	2	3	222	9102	11	16	9	36	2191	11	13	2	26	2242	11	33	43	87	2311	8	33	32	73	2358	1	8	5	14	322	0.0614035087719298	0.191780821917808	0.136556403731976	1.40440738534842	0.0434782608695652	1	8	5	14	295	0.0614035087719298	0.160919540229885	0.127650367806145	1.26062731346191	0.0474576271186441	0.0526315789473684	12	82	617	4052	0.597449062007149	0.96106630513487	0.532282535501864	Inf	0.9660333114935	0.796553783161307	0.736664453557862	0.772657877944608	1.00896812533766	0.54015272653201	1.01034619153356	0.0200300915227592	216	210
TCGA-60-2711-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	148	0	1	0	1	145	5945	10	10	1	21	1379	5	8	1	14	1453	14	14	23	51	1521	13	25	21	59	1592	3	3	1	7	229	0.0472972972972973	0.11864406779661	0.143844221105528	0.824809414551107	0.0305676855895196	5	1	4	10	193	0.0675675675675676	0.196078431372549	0.126890203813281	1.54526059128315	0.0518134715025907	0.0878378378378378	13	58	422	2691	0.16295453173619	1.42909304211263	0.796591322666104	Inf	1.35067752486483	2.18571177812884	0.0238896628217834	2.68386497458935	0.838270142180095	0.729470169183062	0.817584328953735	0.481265818703551	135	132
TCGA-60-2712-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	98	1	2	3	5	92	3772	2	5	2	9	946	1	3	3	7	861	9	10	19	38	1004	6	11	21	38	961	0	0	4	4	131	0.0408163265306122	0.105263157894737	0.136316337148803	0.772197669746886	0.0305343511450382	5	1	5	11	154	0.112244897959184	0.289473684210526	0.153386454183267	1.88721804511278	0.0714285714285714	0.142857142857143	14	41	285	1680	0.025068593039546	2.01201681891574	1.1169040275517	Inf	1.75502392344498	2.29824561403509	0.0558535712321033	2.94512256792216	1.55131578947368	0.119803907640471	1.71082530813035	0.2723034767446	84	78
TCGA-60-2713-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	283	0	0	4	4	273	11193	10	19	6	35	2808	12	18	9	39	2805	29	30	40	99	2768	28	32	40	100	2812	9	2	7	18	426	0.0636042402826855	0.18	0.15149359886202	1.18816901408451	0.0422535211267606	8	5	6	19	415	0.0671378091872792	0.191919191919192	0.14992774566474	1.2800778873068	0.0457831325301205	0.106007067137809	30	107	841	4739	0.0225580211057505	1.5797446871685	1.08479891027528	Inf	1.4529105947907	1.97884723699856	0.0036899122722893	2.39427827120131	1.0781807372176	0.432479293477429	1.09335808538637	0.477849621897703	253	243
TCGA-60-2715-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	190	1	0	0	0	188	7708	11	11	5	27	1825	10	14	4	28	1919	9	20	29	58	1891	10	31	34	75	2073	2	10	5	17	277	0.0894736842105263	0.226666666666667	0.133622768933912	1.69631768953069	0.0613718411552347	2	2	2	6	237	0.0315789473684211	0.103448275862069	0.125330512956108	0.825403753819293	0.0253164556962025	0.0578947368421053	11	71	514	3450	0.502663787739509	1.03989390170993	0.557210891487084	Inf	1.03454493688906	1.62359205406512	0.22737451655375	1.7895592453855	0.856895806312149	0.724218439261107	0.83905146455538	0.49076968674246	179	177
TCGA-60-2719-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	222	0	1	3	4	215	8815	7	19	5	31	2165	12	19	1	32	2106	10	26	35	71	2353	14	33	34	81	2191	3	4	9	16	314	0.0720720720720721	0.197530864197531	0.143313555454131	1.37831249508532	0.0509554140127389	3	2	4	9	313	0.0405405405405405	0.126760563380282	0.133021674458139	0.952931647392341	0.0287539936102236	0.0855855855855856	19	74	627	3917	0.0519571559957872	1.60381430367337	0.994657306791921	Inf	1.48061257738677	1.81180223285486	0.103965881913763	2.08199934227619	1.36541617548483	0.152065710536759	1.45010816525926	0.0792068906018774	203	196
TCGA-60-2720-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	456	0	0	0	0	448	18368	17	17	5	39	4483	14	30	4	48	4635	61	54	50	165	4489	59	64	73	196	4761	36	1	27	64	700	0.140350877192982	0.326530612244898	0.147027935307708	2.22087463556851	0.0914285714285714	25	6	11	42	647	0.0921052631578947	0.254545454545455	0.144130095789708	1.76608121399466	0.0649149922720247	0.217105263157895	99	144	1347	7903	1.71170797634504e-22	4.03294483260805	3.20409578944393	Inf	2.79771233743023	3.49078198465726	2.17055238256785e-20	6.06415612299493	2.12154682794044	3.85301461223713e-06	2.62249367108623	0.00237705491878434	357	349
TCGA-60-2721-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	95	0	0	0	0	95	3895	2	5	1	8	1022	1	10	0	11	891	11	5	15	31	945	14	11	20	45	1037	7	2	6	15	135	0.157894736842105	0.333333333333333	0.130183220829315	2.56049382716049	0.111111111111111	3	2	4	9	146	0.0947368421052632	0.290322580645161	0.154497354497354	1.8791427308882	0.0616438356164384	0.210526315789474	20	40	281	1701	0.000192417186833382	3.02441423037709	1.81336937865604	Inf	2.35112692763938	2.82135231316726	0.00152772146978082	4.03163576252064	2.01525165226233	0.021797647589007	2.41986274044842	1	75	75
TCGA-60-2722-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	355	0	1	6	7	341	13981	13	13	4	30	3460	17	27	7	51	3503	22	48	49	119	3479	27	58	56	141	3539	10	14	10	34	541	0.0957746478873239	0.24113475177305	0.152868041819723	1.57740459616418	0.0628465804066543	9	4	13	26	498	0.0732394366197183	0.218487394957983	0.143144581776373	1.52634065674463	0.0522088353413655	0.11830985915493	42	112	1039	5979	5.74493709300819e-05	2.15767993949156	1.55938096744661	Inf	1.84215591915303	2.61911964015635	3.88743913322329e-05	3.64362482784885	1.47957284935148	0.0340717046552731	1.61395356050728	0.566129834184731	313	299
TCGA-60-2723-01A-01D-1522-08	0	1	1	2	306	0	0	3	3	298	12218	19	22	3	44	2909	12	15	4	31	3010	20	57	40	117	3135	22	55	29	106	3164	6	8	2	16	432	0.0522875816993464	0.150943396226415	0.13653603034134	1.10552061495458	0.037037037037037	2	5	6	13	425	0.042483660130719	0.111111111111111	0.135566188197767	0.819607843137255	0.0305882352941176	0.0522875816993464	16	95	857	5442	0.444653834537837	1.06948991339465	0.644804449534855	Inf	1.0594678692695	1.40001111296327	0.206230668191242	1.49401727686737	0.852180677455905	0.737897824588665	0.832818408484524	1	290	282
TCGA-60-2724-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	350	1	1	1	2	342	14022	20	22	4	46	3419	15	19	6	40	3505	28	69	34	131	3567	25	55	45	125	3531	5	7	3	15	486	0.0428571428571429	0.12	0.137638062871708	0.871851851851852	0.0308641975308642	9	5	3	17	519	0.0485714285714286	0.129770992366412	0.145500420521447	0.891894277015399	0.0327552986512524	0.0571428571428571	20	112	1005	6093	0.410683981694081	1.08263291269332	0.691221147231782	Inf	1.07010402532791	1.86561531962827	0.014100756130424	2.17605003938785	0.53640657472133	0.974634223487267	0.498342364917646	0.0576766630978577	330	322
TCGA-60-2725-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	185	0	0	1	1	180	7380	4	9	4	17	1815	11	15	5	31	1799	16	24	22	62	1910	16	32	22	70	1856	8	6	0	14	261	0.0756756756756757	0.2	0.140625	1.42222222222222	0.053639846743295	6	4	2	12	256	0.0648648648648649	0.193548387096774	0.134031413612565	1.44405241935484	0.046875	0.0864864864864865	16	60	517	3249	0.0539592012449643	1.67554930005243	0.988327733105902	Inf	1.53354372391326	3.18689555125725	3.84161102270895e-05	4.88473858471721	0.331106031299455	0.987716006127848	0.299314846007788	0.000645543108221572	169	164
TCGA-60-2726-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	326	1	0	1	1	318	13038	26	24	5	55	3246	13	14	9	36	3140	14	44	53	111	3261	19	49	48	116	3391	9	4	10	23	491	0.0705521472392638	0.198275862068966	0.14479504570923	1.3693552918042	0.0468431771894094	7	5	13	25	449	0.0766871165644172	0.225225225225225	0.137687825820301	1.63576717028833	0.0556792873051225	0.119631901840491	39	95	940	5712	7.41525793252156e-06	2.49414304926362	1.7715397837372	Inf	2.05960622419816	3.43107672469375	2.8764094059115e-06	5.71678144638731	1.61150200126396	0.013649256225484	1.79162661458385	0.212230106240872	287	279
TCGA-63-5128-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	341	2	1	11	12	323	13243	14	24	7	45	3224	21	18	6	45	3316	19	65	41	125	3282	17	55	36	108	3421	4	5	5	14	504	0.0410557184750733	0.12962962962963	0.147325343466823	0.87988683127572	0.0277777777777778	3	6	7	16	435	0.0469208211143695	0.128	0.13254113345521	0.965737931034483	0.0367816091954023	0.0557184750733138	19	94	939	5764	0.232676544967237	1.24069539254564	0.778588372414451	Inf	1.20026953923869	1.38803100224825	0.233968907102525	1.48158984090673	1.11248495913033	0.39457619858727	1.13319784452048	0.266835660720813	322	304
TCGA-63-5131-01A-01D-1441-08	0	0	0	0	313	1	1	3	4	306	12546	14	23	8	45	3029	13	12	5	30	3174	25	45	46	116	3113	30	44	41	115	3230	14	4	13	31	507	0.0990415335463259	0.269565217391304	0.156965944272446	1.71734842637853	0.0611439842209073	5	3	9	17	439	0.0543130990415335	0.146551724137931	0.141021522646964	1.03921530123321	0.0387243735763098	0.130990415335463	41	101	946	5397	2.02806909793118e-05	2.31553377417919	1.66002559579042	Inf	1.93597206920168	2.3162982894484	0.000259844888004231	3.01028871261646	1.69553595295376	0.00833475516585855	1.9308097617202	0.680114602059056	272	265
TCGA-63-6202-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	384	0	0	3	3	373	15293	18	18	0	36	3665	20	13	8	41	3641	24	79	43	146	3993	20	81	49	150	3994	5	9	3	17	491	0.0442708333333333	0.113333333333333	0.122934401602404	0.921900882552614	0.0346232179226069	4	7	11	22	554	0.0572916666666667	0.150684931506849	0.138742799899825	1.08607388358637	0.0397111913357401	0.0598958333333333	23	113	1045	6942	0.120458735672886	1.35206926938538	0.888644676054533	Inf	1.29257669575007	1.56335363201392	0.114543591834868	1.70807342651399	1.16307468275432	0.3166215336198	1.1923054665973	0.320691739653879	361	350
TCGA-66-2727-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	266	0	0	3	3	262	10742	12	15	2	29	2794	12	15	4	31	2766	15	60	36	111	2542	19	46	26	91	2640	5	7	6	18	426	0.0676691729323308	0.197802197802198	0.161363636363636	1.22581643708404	0.0422535211267606	7	8	6	21	381	0.0789473684210526	0.189189189189189	0.149881982690795	1.26225438036462	0.0551181102362205	0.0902255639097744	24	72	807	4375	0.0119680152394445	1.80685893259438	1.17348699448102	Inf	1.60532837670384	2.26634594358189	0.00399093217554896	2.95623404573077	1.24283487228684	0.25378207830212	1.30104290793227	1	242	238
TCGA-66-2734-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	325	1	0	0	0	317	12997	8	8	6	22	3135	9	15	4	28	3200	15	121	23	159	3370	11	78	19	108	3292	1	8	1	10	477	0.0307692307692308	0.0925925925925926	0.144896719319563	0.639024769003805	0.0209643605870021	1	13	3	17	497	0.0523076923076923	0.106918238993711	0.147477744807122	0.724978803639447	0.03420523138833	0.0184615384615385	6	62	974	5688	0.944306917806339	0.565186273472971	0.237210976482568	Inf	0.603514917260539	0.526141209919444	0.910353276679274	0.486695115254699	0.651412926566931	0.880452878443918	0.61475842907439	0.66873541869578	319	311
TCGA-66-2742-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	247	1	0	4	4	236	9676	15	27	3	45	2326	12	14	4	30	2252	11	32	29	72	2531	18	40	31	89	2567	3	5	4	12	336	0.048582995951417	0.134831460674157	0.130892091936112	1.0300963081862	0.0357142857142857	4	2	5	11	319	0.0445344129554656	0.152777777777778	0.126037139470565	1.21216475095785	0.0344827586206897	0.0647773279352227	16	73	655	4443	0.105217898493348	1.48659424750308	0.886260611666559	Inf	1.39922806415645	1.87870492234799	0.0709939934020595	2.15787525482486	1.16748091603053	0.365660903280039	1.19698271475367	0.757529692245078	231	220
TCGA-66-2744-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	286	1	1	5	6	275	11275	11	13	6	30	2808	8	10	2	20	2889	15	65	34	114	2795	20	75	16	111	2783	7	8	2	17	402	0.0594405594405594	0.153153153153153	0.144448436938556	1.0602617542916	0.0422885572139304	6	3	5	14	390	0.048951048951049	0.12280701754386	0.13953488372093	0.880116959064327	0.0358974358974359	0.0699300699300699	20	65	792	4786	0.0152589911305879	1.85906530196724	1.15969382135017	Inf	1.65715983363042	2.61594516594517	0.000682996617944011	3.56967915544825	0.986010101010101	0.578007387119522	0.983734712598104	0.173664823538192	266	255
TCGA-66-2754-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	347	0	0	6	6	337	13817	13	14	9	36	3387	17	19	6	42	3338	29	42	42	113	3601	29	52	65	146	3491	5	2	11	18	499	0.0518731988472622	0.123287671232877	0.142938985963907	0.86251955966728	0.0360721442885772	12	2	8	22	500	0.0634005763688761	0.194690265486726	0.138850319355735	1.4021592920354	0.044	0.103746397694524	36	129	999	6093	0.00515040388654326	1.70192154095302	1.21095163075371	Inf	1.54889434889435	2.08077042559801	0.00217621386644588	2.52842652059472	1.26058769049423	0.171909585211676	1.31679396165922	0.822384163766055	311	301
TCGA-66-2755-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	228	0	1	0	1	217	8897	7	18	4	29	2260	17	15	7	39	2223	10	44	21	75	2185	18	27	29	74	2229	2	3	3	8	340	0.0350877192982456	0.108108108108108	0.152534768954688	0.708744038155803	0.0235294117647059	3	6	3	12	332	0.0526315789473684	0.16	0.151945080091533	1.05301204819277	0.036144578313253	0.0482456140350877	11	67	672	3742	0.656310450760015	0.914214256885001	0.489419500337239	Inf	0.926320207570208	1.17293792517007	0.427386019821288	1.21045923478667	0.788214285714286	0.792653070769302	0.759377757829213	1	217	206
TCGA-66-2756-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	538	0	1	5	6	522	21402	32	23	9	64	5084	24	28	11	63	5085	36	105	60	201	5688	27	113	54	194	5545	6	7	4	17	692	0.0315985130111524	0.0876288659793814	0.124797114517583	0.70217060961802	0.0245664739884393	7	14	12	33	717	0.0613382899628253	0.164179104477612	0.126054852320675	1.30244176606507	0.0460251046025105	0.0539033457249071	29	148	1409	9824	0.0822023853728889	1.36615301472992	0.945294842889877	Inf	1.30619945227011	1.64508206878682	0.0476576907796069	1.81268310894552	1.11892221682667	0.356894825290943	1.13830039198585	0.65982489317682	509	493
TCGA-66-2757-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	284	0	1	6	7	273	11193	8	18	1	27	2650	9	13	5	27	2720	27	47	37	111	2877	17	59	32	108	2946	3	7	4	14	399	0.0492957746478873	0.12962962962963	0.135437881873727	0.957115009746589	0.0350877192982456	6	5	5	16	380	0.0563380281690141	0.144144144144144	0.132082029892249	1.09132290184922	0.0421052631578947	0.0633802816901408	18	95	779	5044	0.252241374837181	1.22678047238741	0.76026351043789	Inf	1.19070285253388	1.52897070836737	0.127241879531885	1.66481268260579	0.974995814031367	0.586317532004848	0.971247774393592	1	266	255
TCGA-66-2758-01A-02D-1522-08	0	1	0	1	383	0	2	3	5	373	15293	17	17	11	45	3693	14	21	3	38	3785	52	42	51	145	3898	50	45	50	145	3917	27	5	10	42	563	0.109660574412533	0.289655172413793	0.143732448302272	2.01523856189135	0.0746003552397869	20	9	11	40	538	0.10443864229765	0.275862068965517	0.13801949717804	1.99871811306243	0.0743494423791822	0.177545691906005	68	135	1101	6714	5.36781715134719e-12	3.07103276027439	2.35782362740351	Inf	2.37768620555429	3.27068974728856	1.48819826353481e-14	5.20947662138428	1.47584104459492	0.0429422259162793	1.60063008453106	6.41212716169862e-05	315	305
TCGA-66-2759-01A-01D-1522-08	0	1	1	2	497	1	2	4	6	487	19967	13	30	9	52	4800	16	23	9	48	5014	39	63	74	176	5026	45	77	89	211	5127	25	11	19	55	764	0.110663983903421	0.260663507109005	0.149015018529354	1.74924319495794	0.0719895287958115	22	13	13	48	691	0.096579476861167	0.272727272727273	0.137485077596498	1.98368635705828	0.0694645441389291	0.158953722334004	79	168	1455	8698	3.49550960098484e-12	2.81070503086969	2.20858223032238	Inf	2.23183215771387	3.90436098838161	1.26906531404143e-18	7.59060554154595	1.36991545970105	0.0400174025346464	1.46021181987523	0.0445280976784953	418	408
TCGA-66-2763-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	443	2	1	6	7	428	17548	23	25	8	56	4256	29	23	6	58	4408	28	79	56	163	4435	32	77	42	151	4449	14	9	7	30	639	0.0677200902934537	0.198675496688742	0.143627781523938	1.38326648633523	0.0469483568075117	10	7	6	23	577	0.0519187358916479	0.141104294478528	0.130101465614431	1.08457113693634	0.0398613518197574	0.0835214446952596	37	121	1216	7668	0.000751648286022678	1.92818038799561	1.37535805690724	Inf	1.71088024650233	2.92236842105263	4.9253715985197e-07	4.20326050865307	0.969152792696026	0.59304288280387	0.96443534795405	0.0408808358183998	406	391
TCGA-66-2765-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	112	0	0	1	1	110	4510	4	6	1	11	1050	5	5	1	11	1154	8	16	21	45	1130	13	12	18	43	1176	2	1	4	7	172	0.0625	0.162790697674419	0.146258503401361	1.11303407247161	0.0406976744186047	2	1	0	3	154	0.0267857142857143	0.0666666666666667	0.136283185840708	0.489177489177489	0.0194805194805195	0.0714285714285714	8	52	326	1980	0.62762305752515	0.934414700408799	0.440223980660399	Inf	0.943149284253579	1.34735612036226	0.346846748096671	1.42883544084895	0.72549944942583	0.82038002660906	0.694223961042806	1	104	102
TCGA-66-2766-01A-01D-1522-08	0	0	1	1	432	2	4	3	7	419	17179	12	21	6	39	4126	21	26	7	54	4257	39	62	62	163	4335	28	56	79	163	4461	10	8	33	51	644	0.118055555555556	0.312883435582822	0.144362250616454	2.16734938840834	0.0791925465838509	22	5	19	46	591	0.106481481481481	0.282208588957055	0.136332179930796	2.07000716265454	0.077834179357022	0.194444444444444	84	124	1235	7561	4.35972600701996e-20	4.14668876725497	3.23048426934167	Inf	2.87630021800062	3.40167985981026	5.41506910470216e-11	5.59580103844645	2.62665173572228	2.10258433250383e-11	3.57636550015202	0.00575327010154435	348	335
TCGA-66-2767-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	387	0	2	2	4	383	15703	18	19	7	44	3758	10	18	6	34	3834	27	57	68	152	4008	29	64	60	153	4103	8	8	11	27	518	0.0697674418604651	0.176470588235294	0.126249086034609	1.39779695662049	0.0521235521235521	8	6	8	22	535	0.0568475452196382	0.144736842105263	0.133483033932136	1.08430890309887	0.0411214953271028	0.0904392764857881	35	149	1053	7058	0.0139690415141976	1.57436298465442	1.12118931193279	Inf	1.46519777860358	2.20078686745353	0.00165025335605745	2.68065118774315	1.14337755223172	0.304134280999933	1.1683286939242	0.673609287557202	352	348
TCGA-66-2768-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	292	0	2	3	5	285	11685	9	14	5	28	2758	8	17	3	28	2928	34	30	53	117	2914	34	29	49	112	3085	22	3	14	39	457	0.133561643835616	0.348214285714286	0.148136142625608	2.35063691778681	0.0853391684901532	18	5	15	38	418	0.13013698630137	0.324786324786325	0.143445435827042	2.26418026418026	0.0909090909090909	0.236301369863014	69	101	875	5124	5.36956177520553e-16	3.99947112853016	3.02818391771319	Inf	2.78272941176471	4.03294117647059	9.08021964941011e-17	8.36069772184784	1.94925490196078	0.000268662312107713	2.32593695739412	0.104831096973288	223	216
TCGA-66-2770-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	266	2	2	0	2	260	10660	13	15	3	31	2543	15	11	5	31	2536	5	45	45	95	2780	17	41	45	103	2801	2	7	10	19	363	0.0714285714285714	0.184466019417476	0.129596572652624	1.42338655754366	0.0523415977961433	1	6	3	10	356	0.037593984962406	0.105263157894737	0.128057553956835	0.821998817267889	0.0280898876404494	0.0601503759398496	16	96	719	4862	0.371950528956131	1.12697224015453	0.679191651292368	Inf	1.10888138287304	1.05847768365154	0.552817911714267	1.0677173391186	1.12120228712718	0.376519770642927	1.14161140687225	0.00704802465559796	250	244
TCGA-66-2771-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	296	1	0	3	3	290	11890	12	16	4	32	2971	11	16	8	35	3046	28	34	40	102	2968	32	41	48	121	2905	17	5	20	42	442	0.141891891891892	0.347107438016529	0.152151462994836	2.28132829737108	0.0950226244343891	15	6	16	37	431	0.125	0.362745098039216	0.145215633423181	2.49797552431645	0.08584686774942	0.22972972972973	68	80	873	5000	9.55489887687104e-19	4.86648393869859	3.63088426805194	Inf	3.09095693631776	3.58793432607866	6.25852089313793e-12	6.54226216650337	2.75210871602624	4.29100304859631e-09	3.96386636564839	0.629943440688087	228	222
TCGA-66-2773-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	670	5	0	1	1	659	27019	5	14	3	22	6798	10	9	1	20	6634	94	59	148	301	6790	91	57	168	316	6797	66	11	71	148	1043	0.22089552238806	0.468354430379747	0.153450051493306	3.0521620932801	0.14189837008629	71	12	77	160	1059	0.238805970149254	0.53156146179402	0.155964653902798	3.40821749346685	0.151085930122757	0.425373134328358	285	216	2102	11485	3.8277988377985e-95	7.20766840355806	6.15832756366724	Inf	3.67703698217267	4.78673849872708	5.2188197673336e-69	15.5895645520062	3.02736995507594	3.62602212358604e-38	4.81273978403813	0.419068092033799	385	374
TCGA-66-2777-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	221	0	0	0	0	220	9020	14	10	2	26	2156	10	12	5	27	2228	10	31	47	88	2393	13	28	38	79	2243	3	3	7	13	317	0.0588235294117647	0.164556962025316	0.141328577797593	1.16435730543465	0.0410094637223975	4	2	7	13	324	0.0588235294117647	0.147727272727273	0.135394901796908	1.09108445566779	0.0401234567901235	0.0950226244343891	21	87	641	3995	0.0680822580174431	1.50423141535491	0.959254938054445	Inf	1.40630958571676	2.20118022112189	0.031883514534319	2.7258840202664	1.19122694319537	0.28560125709309	1.2288638718353	0.0888790871291686	200	199
TCGA-66-2778-01A-02D-1522-08	0	0	0	0	169	0	0	0	0	169	6929	1	8	1	10	1654	5	7	1	13	1731	24	11	43	78	1757	23	19	26	68	1787	11	3	13	27	239	0.159763313609467	0.397058823529412	0.133743704532736	2.96880383952744	0.112970711297071	15	2	9	26	240	0.153846153846154	0.333333333333333	0.136596471257826	2.44027777777778	0.108333333333333	0.284023668639053	48	68	479	3065	4.77107290977847e-13	4.51413315633542	3.20863847549367	Inf	3.06155064430207	4.09292408830454	2.75057443048612e-11	7.91386970720981	2.35902090708299	8.64599923305092e-05	2.99387904198136	0.558523904562372	121	121
TCGA-66-2780-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	142	1	1	1	2	137	5617	5	5	1	11	1382	8	12	4	24	1368	10	15	23	48	1418	23	14	17	54	1449	8	1	1	10	177	0.0704225352112676	0.185185185185185	0.122153209109731	1.51600753295669	0.0564971751412429	4	2	5	11	203	0.0774647887323944	0.229166666666667	0.143159379407616	1.60077996715928	0.0541871921182266	0.126760563380282	18	55	380	2487	0.00688796468619507	2.14120901040888	1.28794892953576	Inf	1.86034607065609	2.74354066985646	0.000764592388751062	3.73694441878331	1.13171052631579	0.442439551587836	1.15487079292077	0.117971798543708	124	119
TCGA-66-2781-01A-01D-1522-08	0	0	0	0	165	1	1	1	2	161	6601	1	14	2	17	1648	8	5	4	17	1665	9	27	31	67	1623	14	24	22	60	1665	5	2	6	13	250	0.0787878787878788	0.216666666666667	0.15015015015015	1.443	0.052	2	2	5	9	227	0.0545454545454545	0.134328358208955	0.139864448552064	0.960418173449931	0.039647577092511	0.109090909090909	18	58	477	2811	0.024128701717056	1.8284704799833	1.10516739649481	Inf	1.63257199602781	2.09789444900191	0.0404203586023296	2.57718569794094	1.43063961077489	0.140512899296925	1.5431901252758	0.357976754661922	147	143
TCGA-66-2782-01A-01D-1522-08	0	1	0	1	387	2	0	0	0	369	15129	20	19	1	40	3746	16	20	3	39	3788	37	59	51	147	3770	35	60	48	143	3825	14	11	8	33	536	0.0852713178294574	0.230769230769231	0.140130718954248	1.64681400688863	0.0615671641791045	23	7	14	44	530	0.113695090439276	0.299319727891156	0.140583554376658	2.12912334745219	0.0830188679245283	0.152454780361757	59	112	1066	6529	2.7178815847752e-11	3.22575571032573	2.4229724085591	Inf	2.45825241653226	3.66133781530123	1.06625340138451e-13	6.47216942697679	1.58328121742756	0.0188798970780962	1.74977617688515	0.0199420163025206	328	310
TCGA-66-2783-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	271	0	0	1	1	270	11070	17	18	4	39	2572	14	16	3	33	2711	22	42	34	98	2856	16	31	53	100	2931	5	3	8	16	369	0.0590405904059041	0.16	0.12589559877175	1.27089430894309	0.043360433604336	7	5	5	17	360	0.0627306273062731	0.173469387755102	0.126050420168067	1.37619047619048	0.0472222222222222	0.0922509225092251	25	100	729	5058	0.0136557151443581	1.73436886191165	1.15082960433676	Inf	1.58765432098765	2.50682261208577	0.00189368964783322	3.20136770408894	1.18617851568043	0.301323285383267	1.21883646829457	1	246	245
TCGA-66-2785-01A-01D-1522-08	0	0	1	1	1311	7	0	7	7	1287	52767	28	31	16	75	13177	24	48	5	77	13389	291	87	183	561	13112	305	97	172	574	13089	215	21	89	325	2064	0.24790236460717	0.566202090592335	0.157689663075865	3.59061005996273	0.157461240310078	211	21	85	317	2135	0.241800152555301	0.5650623885918	0.162827943868212	3.47030353124856	0.14847775175644	0.45766590389016	600	351	4199	22002	2.10644345916161e-222	8.95690166669675	7.97511637118329	Inf	3.93679432462138	4.46000485893893	1.44193481293742e-192	13.1280886870141	3.05839015996431	2.00683142254574e-46	5.03685394371644	5.74829838467272e-46	711	687
TCGA-66-2786-01A-01D-1522-08	0	1	0	1	265	0	0	3	3	260	10660	14	23	2	39	2586	6	15	4	25	2642	32	24	42	98	2677	23	35	40	98	2755	10	2	14	26	379	0.0981132075471698	0.26530612244898	0.137568058076225	1.92854450487319	0.0686015831134565	17	4	11	32	403	0.120754716981132	0.326530612244898	0.15054165110198	2.16903833493695	0.0794044665012407	0.19622641509434	52	85	782	4650	2.03056419273437e-11	3.6365614057544	2.6535451593217	Inf	2.6365486213527	3.40999767495931	1.46701226947222e-09	5.73105467270925	2.11777181710436	0.000174193292452105	2.60733049575696	0.852011098744621	213	208
TCGA-66-2787-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	579	0	1	4	5	570	23370	35	25	7	67	5775	31	27	10	68	5827	30	125	54	209	5838	40	136	50	226	5930	9	11	10	30	821	0.0518134715025907	0.132743362831858	0.138448566610455	0.958791889881754	0.0365408038976857	5	21	7	33	818	0.0569948186528497	0.157894736842105	0.140116478245975	1.12688199716896	0.0403422982885086	0.0535405872193437	31	143	1639	10129	0.0901641017221083	1.33967926692399	0.936710773595726	Inf	1.27919322827909	1.43599755948749	0.102375453909204	1.54492545682652	1.1736518515042	0.277843485710566	1.20755090616826	0.679533172104555	548	539
TCGA-66-2788-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	221	0	0	3	3	216	8856	13	9	5	27	2200	8	15	4	27	2224	22	30	25	77	2140	15	34	36	85	2292	6	5	10	21	337	0.0950226244343891	0.247058823529412	0.147033158813264	1.6802932448944	0.0623145400593472	10	5	5	20	320	0.0904977375565611	0.25974025974026	0.149532710280374	1.73701298701299	0.0625	0.14027149321267	31	67	657	3775	2.69642563291984e-05	2.65762556391824	1.79109436220603	Inf	2.13388003603268	2.91710888971163	3.395694635871e-05	4.3758561449147	1.65880679691594	0.0317145567765282	1.87325325990672	1	190	185
TCGA-66-2789-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	394	1	1	4	5	381	15621	15	22	4	41	3823	15	30	4	49	3831	29	57	49	135	3954	37	70	49	156	4013	14	12	4	30	596	0.0761421319796954	0.192307692307692	0.148517318714179	1.29485028394424	0.0503355704697987	8	6	9	23	544	0.0583756345177665	0.17037037037037	0.137582195245321	1.23831699346405	0.0422794117647059	0.0888324873096447	35	129	1140	6827	0.0101362247288774	1.62469285584063	1.15199201692952	Inf	1.49146876337184	2.32953216374269	8.57214660881e-05	2.99372473274908	0.927058718224132	0.659228800995089	0.915892037805299	0.0978017014118169	359	346
TCGA-66-2791-01A-01D-0983-08	0	0	0	0	382	1	0	6	6	373	15293	7	26	3	36	3795	8	19	7	34	3884	31	60	54	145	3718	32	66	60	158	3896	17	11	12	40	592	0.104712041884817	0.253164556962025	0.151950718685832	1.66609647622306	0.0675675675675676	15	7	16	38	575	0.0994764397905759	0.262068965517241	0.154653039268424	1.69456071964018	0.0660869565217391	0.157068062827225	60	117	1167	6447	1.32264193380527e-09	2.83257419964019	2.13617265381013	Inf	2.21166833689164	3.31399192067573	7.07977945612186e-11	5.70067211848743	1.60248951427412	0.00721063284061027	1.79848212507666	0.621694325475763	322	313
TCGA-66-2792-01A-01D-0983-08	0	0	1	1	193	0	0	5	5	187	7667	8	5	3	16	1784	5	10	4	19	1916	12	33	32	77	1987	9	36	30	75	1980	2	4	4	10	255	0.0518134715025907	0.133333333333333	0.128787878787879	1.03529411764706	0.0392156862745098	2	4	3	9	292	0.0466321243523316	0.116883116883117	0.146955208857574	0.795365593310799	0.0308219178082192	0.0569948186528497	11	72	547	3420	0.604894864861463	0.955214680519874	0.512275802874778	Inf	0.961146230259245	1.38138765561069	0.32842229117786	1.47095820326325	0.818806392640208	0.76824930586758	0.795787353134006	0.475633586868292	182	176
TCGA-66-2793-01A-01D-1267-08	0	0	2	2	348	1	1	9	10	332	13612	22	31	10	63	3225	17	24	13	54	3124	28	34	39	101	3639	25	50	39	114	3624	7	4	3	14	436	0.0402298850574713	0.12280701754386	0.120309050772627	1.02076291646548	0.0321100917431193	4	5	5	14	459	0.0402298850574713	0.138613861386139	0.126133553173949	1.09894518863651	0.0305010893246187	0.0545977011494253	19	112	895	6368	0.261814526016712	1.20698396546625	0.761774555324522	Inf	1.17699688686085	1.6842626752398	0.0568481272684298	1.8632249464138	0.83231628706489	0.759630813464309	0.81318117901339	0.573113236010386	329	313
TCGA-66-2794-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	175	1	0	1	1	173	7093	3	3	1	7	1647	6	6	2	14	1666	22	16	38	76	1940	18	22	36	76	1840	9	1	10	20	224	0.114285714285714	0.263157894736842	0.121739130434783	2.16165413533835	0.0892857142857143	14	0	4	18	246	0.102857142857143	0.236842105263158	0.12680412371134	1.86777920410783	0.0731707317073171	0.211428571428571	37	77	470	3310	3.87274607084476e-08	3.38262627703285	2.34876771548031	Inf	2.61030235162374	4.62446808510638	2.32427498876273e-11	9.52035654605495	1.5215641173088	0.0735310009726018	1.64300363734205	0.0656753010422444	138	136
TCGA-66-2795-01A-02D-0983-08	0	0	0	0	415	0	0	6	6	408	16728	17	11	2	30	4231	19	16	4	39	4135	17	106	52	175	4137	24	92	48	164	4225	8	11	8	27	588	0.0650602409638554	0.164634146341463	0.139171597633136	1.18295793927327	0.0459183673469388	2	12	7	21	579	0.0506024096385542	0.12	0.139956490210297	0.85740932642487	0.0362694300518135	0.0602409638554217	25	116	1167	7195	0.12496955192335	1.32869515883777	0.888277279676987	Inf	1.27045768078421	1.74765398039585	0.0524268819685941	1.98869449657301	1.07480719794344	0.425626114089918	1.08802319885757	0.352448989171022	390	383
TCGA-66-2800-01A-01D-1267-08	0	0	0	0	266	0	1	1	2	261	10701	11	9	7	27	2562	4	15	3	22	2587	19	37	59	115	2743	9	50	38	97	2809	2	8	4	14	361	0.0526315789473684	0.144329896907216	0.128515485938056	1.12305451637776	0.038781163434903	3	5	9	17	342	0.0639097744360902	0.147826086956522	0.124681006197594	1.18563437579456	0.0497076023391813	0.0676691729323308	18	107	703	4849	0.3202420931065	1.16028838897198	0.721541847829138	Inf	1.13725177809388	1.41028246291404	0.27795040187282	1.49934196217184	1.05843879690868	0.460041914682684	1.06748861155322	0.0485513975824021	248	243
TCGA-70-6722-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	311	2	0	4	4	301	12341	13	9	2	24	2849	12	8	4	24	2907	19	69	30	118	3223	17	81	37	135	3362	6	5	7	18	441	0.0578778135048231	0.133333333333333	0.131171921475312	1.01647770219199	0.0408163265306122	4	8	8	20	411	0.0643086816720257	0.169491525423729	0.127520943220602	1.32912697430822	0.048661800486618	0.0803858520900322	25	78	852	5733	0.00139307862228324	2.15637380852047	1.4169588704018	Inf	1.87594010665937	2.14690923317684	0.0139892082414782	2.58732253671041	1.73034475509775	0.0233052769510758	1.94086652294835	0.328892249805994	286	276
TCGA-70-6723-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	130	1	0	4	4	125	5125	6	8	1	15	1223	12	7	4	23	1275	11	13	20	44	1290	5	22	16	43	1337	0	3	0	3	186	0.0230769230769231	0.0697674418604651	0.139117427075542	0.501500375093773	0.0161290322580645	2	1	1	4	175	0.0307692307692308	0.0909090909090909	0.135658914728682	0.67012987012987	0.0228571428571429	0.0230769230769231	3	49	361	2266	0.979743709519023	0.384403078219843	0.100991991501365	Inf	0.419827402514383	0.909626038781163	0.667174172390832	0.896726202620957	0.202139119729147	0.994996017823888	0.179405954222696	1	127	122
TCGA-85-6175-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	62	1	0	1	1	60	2460	0	3	1	4	559	1	2	0	3	598	1	7	11	19	626	2	12	20	34	677	0	2	4	6	86	0.0967741935483871	0.176470588235294	0.127031019202363	1.38919288645691	0.0697674418604651	0	1	0	1	76	0.0161290322580645	0.0526315789473684	0.121405750798722	0.433518005540166	0.0131578947368421	0.0645161290322581	4	30	162	1141	0.626295698340858	0.939128872307221	0.299065982753423	Inf	0.946259985475672	0	1	0	1.03783353245719	0.55165718415764	1.04341328584292	0.06993006993007	58	56
TCGA-85-6560-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	486	0	2	5	7	476	19516	24	31	11	66	4616	21	37	10	68	4817	35	71	67	173	5113	36	72	61	169	4970	13	9	8	30	698	0.0617283950617284	0.177514792899408	0.140442655935614	1.2639663620488	0.0429799426934097	12	6	4	22	721	0.0452674897119342	0.127167630057803	0.141013103852924	0.901814275292024	0.0305131761442441	0.0761316872427984	37	162	1419	8664	0.0475090626143057	1.39446030898026	1.00487831031898	Inf	1.32116183454269	2.50200994550814	7.34537780452136e-06	3.31776665979948	0.666160147991543	0.956763267264587	0.631650340894638	0.0134466918800927	449	439
TCGA-85-6561-01A-11D-1817-08	0	0	0	0	967	2	0	2	2	959	39319	17	12	11	40	10154	13	15	3	31	10680	34	343	40	417	9081	25	409	37	471	9404	9	72	15	96	1581	0.0992761116856256	0.203821656050955	0.16811994895789	1.21235854111523	0.0607210626185958	11	57	10	78	1502	0.0806618407445708	0.18705035971223	0.16540028631208	1.13089501767428	0.051930758988016	0.046535677352637	45	91	3083	15402	2.50281196822363e-06	2.47023824153751	1.78971351106852	Inf	1.98389889527008	2.03246892472113	0.00100373746398968	2.56195440682746	1.94668289867771	0.000530459887708237	2.40167238140635	0.523172098723381	922	914
Totals	1	31	32	64	62667	168	121	572	693	60888	2496408	2356	2852	814	6022	606463	2329	2934	826	6089	616315	4978	9621	9619	24218	634510	4904	9780	9875	24559	639120	2134	1287	2367	5788	90603	0.0923612108446232	0.235677348426239	0.141762110401802	1.6624847623829	0.0638830943787733	2251	1289	2247	5787	88744	0.0923452534826942	0.23895449665538	0.139862255914012	1.7084988018661	0.0652100423690616	0.143600299998404	8999	20377	179347	1094283	0	2.69471117019855	2.6376681279167	Inf	2.17545826507706	3.15118508240164	0	4.86735770657332	1.68083774549147	1.04024729548507e-273	1.89186421522546	0.00211050346831513	53668	51889
