Sample	A_T_coord_clusters	G_C_coord_clusters	Non_coord_clusters	clusters	mutations	complex	insertions	deletions	indels	substitutions	bases	A_to_T	A_to_G	A_to_C	A	a	T_to_A	T_to_C	T_to_G	T	t	G_to_C	G_to_T	G_to_A	G	g	C_to_G	C_to_A	C_to_T	C	c	tCw_to_G	tCw_to_A	tCw_to_T	tCw	tcw	tCw_per_mut	tCw_per_C	tcw_per_c	enrich_tCw	freq_tCw	wGa_to_C	wGa_to_T	wGa_to_A	wGa	wga	wGa_per_mut	wGa_per_G	wga_per_g	enrich_wGa	freq_wGa	[tCw_to_G+tCw_to_T]_per_mut	tCw_to_G+tCw_to_T	[(C_to_G)+(C_to_T)]-[(tCw_to_G)+(tCw_to_T)]	tcw+wga	c-tcw	Fisher_p-value_tCw	odds_ratio_tCw	95%_confidence_lower_tCw	95%_confidence_upper_tCw	APOBEC_enrich	tCw_to_G_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_G	odds_ratio_tCw_to_G	tCw_to_T_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_T	odds_ratio_tCw_to_T	p-value_GvT_skew	non-APOBEC_mutations	non-APOBEC_substitutions
TCGA-2J-AAB1-01A-11D-A40W-08	0	0	0	0	147	3	6	21	27	117	4797	2	5	5	12	1067	1	4	1	6	1143	1	5	54	60	1272	4	4	31	39	1315	2	0	2	4	168	0.0272108843537415	0.102564102564103	0.127756653992395	0.802808302808303	0.0238095238095238	1	1	0	2	136	0.0136054421768707	0.0333333333333333	0.106918238993711	0.311764705882353	0.0147058823529412	0.0340136054421769	5	85	304	2283	0.983938247647376	0.44185616895084	0.168862501851963	Inf	0.472770467836257	5.10592105263158	0.0137070097414579	11.2482069322326	0.200232198142415	0.999663698394478	0.181023544362932	1	142	112
TCGA-2J-AAB4-01A-12D-A40W-08	0	0	0	0	101	2	6	24	30	69	2829	1	6	2	9	655	1	4	0	5	677	3	2	28	33	765	2	2	18	22	732	0	0	0	0	96	0	0	0.131147540983607	0	0	0	1	3	4	84	0.0396039603960396	0.121212121212121	0.109803921568627	1.1038961038961	0.0476190476190476	0.0297029702970297	3	48	180	1317	0.952351988293149	0.457464709498688	0.119542537108057	Inf	0.48921568627451	0	1	0	0.542391304347826	0.925111504471466	0.510640646387618	0.142857142857143	98	66
TCGA-2J-AAB6-01A-11D-A40W-08	0	0	0	0	149	1	7	24	31	117	4797	4	6	2	12	1133	3	5	3	11	1055	4	5	35	44	1308	2	5	43	50	1301	1	1	0	2	154	0.0134228187919463	0.04	0.11837048424289	0.337922077922078	0.012987012987013	2	3	2	7	161	0.0469798657718121	0.159090909090909	0.123088685015291	1.29249011857707	0.0434782608695652	0.0335570469798658	5	79	315	2294	0.978518164980827	0.461021762024569	0.175923419796916	Inf	0.493008314436886	4.14126984126984	0.0268903201984457	7.27144322377561	0.212372812372812	0.99943444582882	0.191711026294337	1	144	112
TCGA-2J-AAB8-01A-12D-A40W-08	0	0	0	0	124	1	6	19	25	98	4018	2	4	2	8	922	0	2	2	4	943	3	4	38	45	1061	7	3	31	41	1092	1	0	1	2	137	0.0161290322580645	0.0487804878048781	0.125457875457875	0.388819654619904	0.0145985401459854	2	1	5	8	136	0.0645161290322581	0.177777777777778	0.12818096135721	1.38692810457516	0.0588235294117647	0.0725806451612903	9	70	273	1880	0.684311688869728	0.885472880792806	0.440679127824048	Inf	0.898455974405342	2.36593406593407	0.124860363928092	2.94921281919597	0.685777990125816	0.882952035370327	0.655960304736807	0.369849964277209	115	89
TCGA-2J-AAB9-01A-11D-A40W-08	0	0	0	0	86	0	6	23	29	57	2337	0	6	0	6	509	1	2	1	4	569	0	2	22	24	625	0	1	22	23	634	0	0	0	0	79	0	0	0.124605678233438	0	0	0	0	1	1	49	0.0116279069767442	0.0416666666666667	0.0784	0.531462585034014	0.0204081632653061	0.0116279069767442	1	43	128	1131	0.990616595798065	0.205626739199378	0.0102574158291882	Inf	0.223544034090909	NaN	1	0	0.223544034090909	0.990616595798065	0.205626739199378	1	85	56
TCGA-2J-AABA-01A-21D-A40W-08	0	0	1	1	103	1	7	23	30	72	2952	3	4	2	9	734	1	2	3	6	662	1	4	27	32	734	1	3	21	25	822	0	1	1	2	94	0.0194174757281553	0.08	0.114355231143552	0.699574468085106	0.0212765957446809	0	1	3	4	98	0.0388349514563107	0.125	0.133514986376022	0.936224489795918	0.0408163265306122	0.0388349514563107	4	46	192	1364	0.878233176028036	0.617910602436604	0.201020659673848	Inf	0.648333333333333	0	1	0	0.675347222222222	0.85772849358563	0.645984735215981	0.0606060606060606	99	68
TCGA-2J-AABE-01A-12D-A40W-08	0	0	1	1	103	0	8	29	37	66	2706	4	6	0	10	614	1	6	2	9	625	3	3	17	23	745	5	1	18	24	722	1	0	0	1	81	0.00970873786407767	0.0416666666666667	0.11218836565097	0.371399176954733	0.0123456790123457	0	0	1	1	83	0.00970873786407767	0.0434782608695652	0.111409395973154	0.390256678889471	0.0120481927710843	0.0194174757281553	2	41	164	1303	0.959806134974005	0.387737841413626	0.066162822490894	Inf	0.416052183777652	1.11814024390244	0.613817979917409	1.13489693099914	0.255574912891986	0.983798011154756	0.233812575425271	1	101	64
TCGA-2J-AABF-01A-31D-A40W-08	0	0	0	0	96	0	1	7	8	88	3608	1	2	1	4	797	2	2	1	5	860	0	3	36	39	935	3	6	31	40	1016	3	2	2	7	104	0.0729166666666667	0.175	0.102362204724409	1.70961538461538	0.0673076923076923	0	1	4	5	102	0.0520833333333333	0.128205128205128	0.109090909090909	1.17521367521368	0.0490196078431373	0.09375	9	61	206	1745	0.324512734111302	1.24965071667183	0.616881789584431	Inf	1.21768377253814	9.47087378640777	0.0012080178470617	Inf	0.848137951021591	0.722804296890796	0.833291076755006	0.400323058285099	87	79
TCGA-2J-AABH-01A-21D-A40W-08	0	0	0	0	88	2	3	10	13	73	2993	1	5	0	6	648	2	8	1	11	707	2	5	20	27	830	0	4	25	29	808	0	2	5	7	109	0.0795454545454545	0.241379310344828	0.13490099009901	1.78930718127175	0.0642201834862385	0	0	2	2	78	0.0227272727272727	0.0740740740740741	0.0939759036144578	0.788224121557455	0.0256410256410256	0.0795454545454545	7	40	187	1451	0.292441255470094	1.35760927650992	0.594480950086929	Inf	1.30458527705086	0	1	0	1.36256684491979	0.25570033503372	1.42900564761346	0.00226244343891403	81	66
TCGA-2J-AABK-01A-31D-A40W-08	0	0	0	0	107	1	1	24	25	81	3321	4	6	1	11	735	2	2	1	5	731	2	2	33	37	893	3	6	19	28	962	3	0	2	5	112	0.0467289719626168	0.178571428571429	0.116424116424116	1.53380102040816	0.0446428571428571	1	1	1	3	96	0.0280373831775701	0.0810810810810811	0.107502799552072	0.754222972972973	0.03125	0.0654205607476635	7	50	208	1647	0.463742203324346	1.108461119709	0.491244840936148	Inf	1.09522604588394	7.13461538461539	0.000749048403982856	31.5363365677393	0.514515532544379	0.939535640248513	0.484933611469831	1	100	74
TCGA-2J-AABO-01A-21D-A40W-08	0	1	0	1	167	0	9	21	30	137	5617	0	3	2	5	1253	1	5	3	9	1284	1	5	56	62	1535	3	8	50	61	1545	0	2	1	3	179	0.0179640718562874	0.0491803278688525	0.115857605177994	0.424489422108252	0.0167597765363128	0	1	3	4	170	0.0239520958083832	0.0645161290322581	0.110749185667752	0.582542694497154	0.0235294117647059	0.0239520958083832	4	106	349	2731	0.99886313886386	0.295363317742759	0.0986000557119289	Inf	0.320916905444126	0	1	0	0.333026977347678	0.998360860561106	0.306944838328739	0.06993006993007	163	133
TCGA-2J-AABP-01A-11D-A40W-08	0	0	0	0	253	1	4	30	34	218	8938	7	12	4	23	2044	7	23	5	35	2131	11	17	46	74	2384	9	17	60	86	2379	1	1	3	5	303	0.0197628458498024	0.0581395348837209	0.127364438839849	0.456481694681096	0.0165016501650165	1	3	1	5	285	0.0197628458498024	0.0675675675675676	0.119546979865772	0.565196775723092	0.0175438596491228	0.0237154150197628	6	120	588	4175	0.998749108249496	0.355068040231964	0.151242067587892	Inf	0.385730482669258	0.810034013605442	0.726525869465925	0.78896386460247	0.305673212681299	0.99938022074967	0.278490393622196	0.628482972136223	247	212
TCGA-2J-AABR-01A-11D-A40W-08	0	0	0	0	91	0	3	25	28	63	2583	2	3	0	5	622	2	4	1	7	594	3	3	23	29	627	1	4	17	22	740	0	1	0	1	81	0.010989010989011	0.0454545454545455	0.109459459459459	0.415263748597082	0.0123456790123457	0	0	2	2	74	0.021978021978022	0.0689655172413793	0.118022328548644	0.584342963653309	0.027027027027027	0.021978021978022	2	42	155	1212	0.965723955646657	0.372531214923881	0.063590183625611	Inf	0.400879765395894	0	1	0	0.440967741935484	0.949280206105672	0.41173158002457	0.4	89	61
TCGA-2J-AABT-01A-11D-A40W-08	0	0	0	0	64	0	3	11	14	50	2050	0	3	3	6	443	0	2	1	3	484	3	2	21	26	579	1	2	12	15	544	0	0	2	2	65	0.03125	0.133333333333333	0.119485294117647	1.11589743589744	0.0307692307692308	2	2	1	5	73	0.078125	0.192307692307692	0.126079447322971	1.52528977871444	0.0684931506849315	0.078125	5	32	138	985	0.487833288415829	1.11511809955665	0.407426089892964	Inf	1.0996866431649	4.06884057971014	0.0776485095956529	7.11543592703985	0.739789196310935	0.788472605875066	0.713953131923161	1	59	45
TCGA-2J-AABU-01A-11D-A40W-08	0	0	0	0	88	1	5	23	28	59	2419	4	9	3	16	566	2	4	1	7	607	2	2	20	24	593	1	1	10	12	653	0	0	0	0	72	0	0	0.110260336906585	0	0	0	1	2	3	72	0.0340909090909091	0.125	0.12141652613828	1.02951388888889	0.0416666666666667	0.0227272727272727	2	31	144	1102	0.906719316201056	0.493938523471201	0.0833834813476283	Inf	0.524410774410774	0	1	0	0.576851851851852	0.875704176203279	0.54683467339728	0.4	86	57
TCGA-2J-AABV-01A-12D-A40W-08	0	0	0	0	86	0	6	10	16	70	2870	1	5	0	6	682	2	5	1	8	643	0	3	21	24	772	1	3	28	32	773	1	0	2	3	99	0.0348837209302326	0.09375	0.128072445019405	0.732007575757576	0.0303030303030303	0	1	1	2	99	0.0232558139534884	0.0833333333333333	0.128238341968912	0.64983164983165	0.0202020202020202	0.0465116279069767	4	46	198	1347	0.896181741453773	0.591730883015365	0.192549229344003	Inf	0.624242424242424	7.8030303030303	0.128719275549806	Inf	0.477736549165121	0.958175624760647	0.443843732022836	0.523809523809524	82	66
TCGA-2L-AAQA-01A-21D-A38G-08	0	0	0	0	293	0	6	40	46	247	10127	4	8	2	14	2110	4	10	4	18	2324	3	13	102	118	2846	3	28	66	97	2847	0	4	2	6	347	0.0204778156996587	0.0618556701030928	0.121882683526519	0.507501708309813	0.0172910662824208	0	1	4	5	281	0.0170648464163823	0.0423728813559322	0.0987350667603654	0.429157367754388	0.0177935943060498	0.0204778156996587	6	168	628	5065	0.999918625157457	0.288084405132139	0.123366073556871	Inf	0.312596090489787	0	1	0	0.323760236578708	0.999863294666907	0.298753537402903	0.0123839009287926	287	241
TCGA-2L-AAQE-01A-11D-A397-08	0	0	0	0	106	0	7	23	30	76	3116	3	2	0	5	713	3	3	0	6	696	1	2	37	40	846	1	2	22	25	861	1	0	1	2	89	0.0188679245283019	0.08	0.103368176538908	0.773932584269663	0.0224719101123595	0	0	2	2	90	0.0188679245283019	0.05	0.106382978723404	0.47	0.0222222222222222	0.0377358490566038	4	57	179	1528	0.892234304625436	0.599183700874495	0.196230265601862	Inf	0.625331990108984	4.76815642458101	0.199611370030271	8.51362687272955	0.484897263516712	0.95303304347501	0.457453261241967	0.485714285714286	102	72
TCGA-2L-AAQI-01A-12D-A397-08	0	0	0	0	127	2	9	31	40	85	3485	0	0	1	1	747	1	2	3	6	812	2	1	36	39	912	2	9	28	39	1014	1	2	0	3	136	0.0236220472440945	0.0769230769230769	0.134122287968442	0.573529411764706	0.0220588235294118	0	0	3	3	101	0.0236220472440945	0.0769230769230769	0.110745614035088	0.694592536176695	0.0297029702970297	0.031496062992126	4	64	237	1689	0.973091353309634	0.44554527471904	0.146779457692208	Inf	0.478034251675354	2.03164556962025	0.409551478287151	2.37417850680067	0.380933544303797	0.988218217391051	0.350613659831067	0.545454545454546	123	81
TCGA-2L-AAQJ-01A-12D-A397-08	0	0	0	0	199	1	10	35	45	153	6273	3	6	4	13	1362	5	7	8	20	1439	5	9	55	69	1804	5	6	40	51	1668	2	2	2	6	186	0.0301507537688442	0.117647058823529	0.111510791366906	1.0550284629981	0.032258064516129	0	2	0	2	205	0.0100502512562814	0.0289855072463768	0.113636363636364	0.255072463768116	0.00975609756097561	0.0201005025125628	4	101	391	3081	0.998110741171553	0.31213707154589	0.104183654542951	Inf	0.338277919863598	1.77595907928389	0.313969760969719	1.96951511515774	0.186943060977251	0.999828898809722	0.169502391505587	1	195	149
TCGA-2L-AAQL-01A-11D-A38G-08	0	0	0	0	119	0	5	14	19	100	4100	1	5	0	6	948	0	3	4	7	994	4	3	35	42	1016	3	11	31	45	1142	0	2	2	4	154	0.0336134453781513	0.0888888888888889	0.134851138353765	0.659163059163059	0.025974025974026	0	2	1	3	120	0.0252100840336134	0.0714285714285714	0.118110236220472	0.604761904761905	0.025	0.0252100840336134	3	70	274	1884	0.996385226096003	0.294785970708277	0.0780634860882639	Inf	0.323667633236676	0	1	0	0.35799601857996	0.992376175555146	0.327534015694379	0.192307692307692	116	97
TCGA-2L-AAQM-01A-11D-A397-08	0	0	0	0	107	1	0	16	16	90	3690	5	4	3	12	878	2	4	2	8	862	1	6	30	37	996	4	11	18	33	954	0	4	2	6	150	0.0560747663551402	0.181818181818182	0.157232704402516	1.15636363636364	0.04	0	1	2	3	121	0.0280373831775701	0.0810810810810811	0.1214859437751	0.667411212865758	0.0247933884297521	0.0373831775700935	4	49	271	1679	0.946923100649606	0.505898692146701	0.165401734663529	Inf	0.543062034393929	0	1	0	0.599630996309963	0.914432995386926	0.563367936922283	0.0823529411764706	103	86
TCGA-3A-A9I5-01A-11D-A38G-08	0	0	0	0	77	0	3	9	12	65	2665	2	4	0	6	542	1	3	1	5	622	0	4	24	28	705	3	4	19	26	796	0	1	0	1	77	0.012987012987013	0.0384615384615385	0.0967336683417085	0.397602397602398	0.012987012987013	0	1	0	1	59	0.012987012987013	0.0357142857142857	0.0836879432624113	0.426755447941889	0.0169491525423729	0	0	46	136	1365	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	77	65
TCGA-3A-A9I7-01A-21D-A38G-08	0	0	0	0	79	0	4	23	27	52	2132	0	6	0	6	473	3	0	1	4	483	3	2	17	22	559	3	1	16	20	617	0	0	0	0	72	0	0	0.116693679092382	0	0	0	0	1	1	64	0.0126582278481013	0.0454545454545455	0.114490161001789	0.397017045454545	0.015625	0.0126582278481013	1	38	136	1040	0.991305996362923	0.201387679033474	0.0100215694112079	Inf	0.221719457013575	0	1	0	0.262032085561497	0.982149576946646	0.239138655807008	1	78	51
TCGA-3A-A9I9-01A-11D-A38G-08	0	0	0	0	164	2	8	26	34	128	5248	2	7	3	12	1218	4	4	0	8	1166	15	7	31	53	1396	13	11	31	55	1468	5	2	3	10	173	0.0609756097560976	0.181818181818182	0.117847411444142	1.54282711508145	0.0578034682080925	8	0	1	9	176	0.0548780487804878	0.169811320754717	0.126074498567335	1.34691252144082	0.0511363636363636	0.103658536585366	17	73	349	2515	0.0467818138796838	1.67782407470076	1.00981951383832	Inf	1.55007959248647	3.81006958657388	9.60044992067569e-06	6.23864437862744	0.529438949995379	0.952381990835874	0.497079388572444	0.00813814381546645	147	111
TCGA-3A-A9IB-01A-21D-A397-08	0	0	0	0	129	0	4	37	41	88	3608	2	5	2	9	861	3	4	2	9	834	8	2	29	39	973	3	3	25	31	940	2	0	2	4	106	0.0310077519379845	0.129032258064516	0.112765957446809	1.1442483262325	0.0377358490566038	5	0	0	5	113	0.0387596899224806	0.128205128205128	0.116135662898253	1.10392557295212	0.0442477876106195	0.0697674418604651	9	56	219	1694	0.330878932558226	1.24300014125418	0.611847692880827	Inf	1.20948366701791	5.55873806558738	6.15554558388396e-05	13.5006784058239	0.323524437679689	0.988253266507821	0.297623501523775	0.0566844919786096	120	79
TCGA-3A-A9IC-01A-11D-A38G-08	0	0	0	0	110	0	8	15	23	87	3567	5	3	0	8	842	2	4	1	7	885	0	4	33	37	879	4	3	28	35	961	1	0	1	2	129	0.0181818181818182	0.0571428571428571	0.13423517169615	0.425692137320044	0.0155038759689922	0	1	2	3	97	0.0272727272727273	0.0810810810810811	0.110352673492605	0.734745054332683	0.0309278350515464	0.0363636363636364	4	61	226	1614	0.964459555585742	0.468444851104446	0.154062155505429	Inf	0.501021102791014	2.0353982300885	0.408986002066519	2.37904330286353	0.400406209197737	0.983873225121689	0.369527211790945	0.523809523809524	106	83
TCGA-3A-A9IH-01A-12D-A397-08	0	0	0	0	136	2	7	26	33	101	4141	2	6	0	8	884	2	5	2	9	1010	5	2	40	47	1129	5	5	27	37	1118	1	3	2	6	146	0.0441176470588235	0.162162162162162	0.130590339892665	1.24176231025546	0.0410958904109589	0	0	0	0	110	0	0	0.0974313551815766	0	0	0.0220588235294118	3	74	256	1991	0.994250226380841	0.315400225151573	0.0835931948059498	Inf	0.341974431818182	0.877734375	0.702238628171327	0.864179512403031	0.26201026119403	0.996886778133429	0.239390683431866	1	133	98
TCGA-3A-A9IJ-01A-11D-A397-08	0	0	1	1	141	2	8	39	47	92	3772	2	5	0	7	834	2	10	2	14	887	2	5	40	47	1009	2	5	17	24	1042	0	0	2	2	137	0.0141843971631206	0.0833333333333333	0.13147792706334	0.633819951338199	0.0145985401459854	0	1	0	1	113	0.00709219858156028	0.0212765957446809	0.11199207135778	0.189983054038787	0.00884955752212389	0.0141843971631206	2	59	250	1801	0.996356978667041	0.244301427816961	0.0422113670660122	Inf	0.268983606557377	0	1	0	0.287859649122807	0.994297294934232	0.262066062618923	0.4	139	90
TCGA-3A-A9IL-01A-11D-A38G-08	0	0	1	1	54	1	1	12	13	40	1640	1	1	0	2	370	1	4	0	5	374	0	2	13	15	449	2	2	14	18	447	1	0	0	1	50	0.0185185185185185	0.0555555555555556	0.111856823266219	0.496666666666667	0.02	0	0	0	0	51	0	0	0.11358574610245	0	0	0.0185185185185185	1	28	101	795	0.968060229494469	0.281359977025985	0.0138289812499235	Inf	0.305906452714237	4.43564356435644	0.214382015776419	7.83732339966445	0	1	0	1	53	39
TCGA-3A-A9IO-01A-11D-A38G-08	0	0	0	0	73	0	6	25	31	42	1722	0	2	0	2	410	1	2	1	4	367	0	3	15	18	459	1	2	15	18	486	0	0	1	1	54	0.0136986301369863	0.0555555555555556	0.111111111111111	0.5	0.0185185185185185	0	0	1	1	56	0.0136986301369863	0.0555555555555556	0.122004357298475	0.455357142857143	0.0178571428571429	0.0273972602739726	2	29	110	835	0.889221028981484	0.523786281864111	0.0878949743773898	Inf	0.55425219941349	0	1	0	0.572727272727273	0.87811569011564	0.542481072558979	0.333333333333333	71	40
TCGA-3A-A9IR-01A-11D-A38G-08	0	0	0	0	68	0	1	23	24	44	1804	1	6	0	7	399	0	3	1	4	385	1	0	16	17	486	0	4	12	16	534	0	0	0	0	63	0	0	0.117977528089888	0	0	0	0	0	0	56	0	0	0.11522633744856	0	0	0	0	29	119	901	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	68	44
TCGA-3A-A9IS-01A-21D-A397-08	0	0	0	0	110	1	7	27	34	75	3075	1	2	1	4	624	3	2	3	8	720	2	1	26	29	920	2	7	25	34	811	1	0	2	3	107	0.0272727272727273	0.0882352941176471	0.13193588162762	0.668774051676746	0.0280373831775701	1	0	0	1	93	0.00909090909090909	0.0344827586206897	0.101086956521739	0.341119762699296	0.010752688172043	0.0363636363636364	4	51	200	1531	0.89090026650882	0.600535373561037	0.196176308725867	Inf	0.629454545454545	4.3275	0.0690516318210819	7.63838978189266	0.339411764705882	0.984758003158224	0.312581994190767	1	106	71
TCGA-3A-A9IU-01A-11D-A397-08	0	0	0	0	134	2	11	37	48	84	3444	1	5	0	6	774	1	3	4	8	722	0	3	35	38	990	2	4	26	32	958	0	0	2	2	103	0.0149253731343284	0.0625	0.107515657620042	0.581310679611651	0.0194174757281553	0	0	0	0	96	0	0	0.096969696969697	0	0	0.0149253731343284	2	61	199	1749	0.990293673013338	0.28827428664854	0.0497733561803121	Inf	0.31076014995613	0	1	0	0.320949007331741	0.988351797257619	0.298044574935428	0.333333333333333	132	82
TCGA-3A-A9IV-01A-11D-A40W-08	0	0	0	0	148	2	12	40	52	94	3854	0	5	2	7	880	2	7	0	9	959	4	7	31	42	1059	3	6	27	36	956	1	0	4	5	122	0.0337837837837838	0.138888888888889	0.127615062761506	1.08834244080146	0.040983606557377	0	2	2	4	123	0.027027027027027	0.0952380952380952	0.11614730878187	0.819976771196283	0.032520325203252	0.0472972972972973	7	58	245	1770	0.690157613244496	0.872000916849685	0.389406588053586	Inf	0.885714285714286	1.17492711370262	0.597276962366191	1.20396241259737	0.850809289232935	0.72236140090523	0.833670554635624	0.0497737556561086	141	87
TCGA-3A-A9IX-01A-11D-A40W-08	1	0	0	1	87	0	4	14	18	69	2829	1	2	0	3	683	2	4	0	6	639	3	2	28	33	734	1	5	21	27	773	1	1	0	2	89	0.0229885057471264	0.0740740740740741	0.115135834411384	0.643362463587183	0.0224719101123595	0	2	0	2	83	0.0229885057471264	0.0606060606060606	0.113079019073569	0.535962029937934	0.0240963855421687	0.0114942528735632	1	52	172	1335	0.998240346833507	0.149354766632788	0.00750342677260139	Inf	0.165313734093901	2.19040697674419	0.385469769986107	2.58491421016631	0	1	0	1	86	68
TCGA-3A-A9IZ-01A-12D-A40W-08	0	0	0	0	128	2	9	19	28	98	4018	6	7	1	14	911	1	4	4	9	1010	10	1	29	40	999	11	8	16	35	1098	2	2	3	7	168	0.0546875	0.2	0.153005464480874	1.30714285714286	0.0416666666666667	1	0	1	2	107	0.015625	0.05	0.107107107107107	0.466822429906542	0.0186915887850467	0.0546875	7	59	275	1822	0.777638333826903	0.786151728852627	0.351672533560623	Inf	0.808760330578512	1.08935064935065	0.533769485916647	1.10422479465747	0.677818181818182	0.857362715424283	0.646499394528496	1	121	91
TCGA-3A-A9J0-01A-11D-A40W-08	0	0	0	0	163	0	12	22	34	129	5289	3	8	1	12	1232	1	5	3	9	1183	3	6	45	54	1446	3	4	47	54	1428	2	1	1	4	157	0.0245398773006135	0.0740740740740741	0.109943977591036	0.673743807501769	0.0254777070063694	1	3	2	6	175	0.0368098159509202	0.111111111111111	0.121023513139696	0.918095238095238	0.0342857142857143	0.0368098159509202	6	92	332	2542	0.974510496760034	0.499436963173462	0.210951923947663	Inf	0.529997541185149	4.32831325301205	0.0238423320865463	7.64657118926031	0.282281299109481	0.998839688036724	0.258160473466865	1	157	123
TCGA-3E-AAAY-01A-11D-A38G-08	0	0	0	0	79	0	3	9	12	67	2747	1	3	2	6	556	0	4	1	5	668	1	2	28	31	724	1	1	23	25	799	0	0	3	3	93	0.0379746835443038	0.12	0.11639549436796	1.03096774193548	0.032258064516129	1	0	0	1	65	0.0126582278481013	0.032258064516129	0.0897790055248619	0.359305210918114	0.0153846153846154	0.0506329113924051	4	49	158	1365	0.812279556410807	0.705381706566271	0.229562993506115	Inf	0.727489849534273	4.81962025316456	0.197715244610817	8.61299208016836	0.567014147431124	0.908478061786674	0.540121148773843	0.485714285714286	75	63
TCGA-3E-AAAZ-01A-11D-A38G-08	0	0	0	0	107	0	1	24	25	82	3362	3	4	1	8	777	0	8	0	8	803	2	5	28	35	841	3	5	23	31	941	0	0	1	1	112	0.00934579439252336	0.032258064516129	0.119022316684378	0.27102534562212	0.00892857142857143	1	2	1	4	105	0.0373831775700935	0.114285714285714	0.124851367419738	0.915374149659864	0.0380952380952381	0.0280373831775701	3	53	217	1565	0.972295488324094	0.408368381388062	0.107205470425538	Inf	0.439927583936801	1.64239631336406	0.478620828891173	1.8022558858085	0.322038492816481	0.98876231879758	0.294492474366049	1	104	79
TCGA-F2-7273-01A-11D-2154-08	0	0	0	0	46	0	9	35	44	2	82	0	0	0	0	23	0	0	0	0	9	2	0	0	2	31	0	0	0	0	19	0	0	0	0	1	0	NaN	0.0526315789473684	NaN	0	0	0	0	0	2	0	0	0.0645161290322581	0	0	0	0	2	3	47	1	0	0	Inf	0	0	1	0	NaN	1	0	1	46	2
TCGA-F2-A44G-01A-11D-A26I-08	0	0	0	0	89	3	2	34	36	50	2050	0	3	1	4	440	2	0	0	2	465	1	5	15	21	585	2	4	17	23	560	2	1	1	4	68	0.0449438202247191	0.173913043478261	0.121428571428571	1.43222506393862	0.0588235294117647	0	0	1	1	60	0.0112359550561798	0.0476190476190476	0.102564102564103	0.464285714285714	0.0166666666666667	0.0449438202247191	4	31	128	1017	0.563244457654289	1.02518317904892	0.326118306151055	Inf	1.02232142857143	5.96354166666667	0.0353625288128771	15.8138191411883	0.55908203125	0.885874295126239	0.529914236582741	1	85	46
TCGA-F2-A7TX-01A-33D-A38G-08	0	0	0	0	99	1	8	15	23	75	3075	3	4	0	7	652	0	2	1	3	702	2	2	28	32	848	2	7	24	33	873	1	0	1	2	79	0.0202020202020202	0.0606060606060606	0.0904925544100802	0.669735327963176	0.0253164556962025	2	0	1	3	85	0.0303030303030303	0.09375	0.100235849056604	0.935294117647059	0.0352941176470588	0.0505050505050505	5	51	164	1557	0.628937147067682	0.93080487690396	0.348444875527017	Inf	0.936955574912892	7.87042682926829	0.00331567666641076	28.3553705592568	0.403611632270169	0.963541406610701	0.379899437999515	1	94	70
TCGA-F2-A8YN-01A-11D-A377-08	0	0	0	0	175	3	4	30	34	138	5658	2	6	0	8	1289	5	7	1	13	1335	2	5	57	64	1460	6	2	45	53	1574	0	1	2	3	194	0.0171428571428571	0.0566037735849057	0.123252858958069	0.459249173312585	0.0154639175257732	1	0	1	2	152	0.0114285714285714	0.03125	0.104109589041096	0.300164473684211	0.0131578947368421	0.0228571428571429	4	106	346	2688	0.998937016403222	0.293234763715057	0.0978832874281203	Inf	0.318864950078823	1.09609826589595	0.620963636616741	1.10975738335334	0.25790547432846	0.999514466006901	0.235481981952278	0.523809523809524	171	134
TCGA-FB-A5VM-01A-11D-A32N-08	0	0	0	0	165	1	7	26	33	131	5371	2	6	2	10	1177	1	10	2	13	1271	4	8	63	75	1428	1	5	27	33	1495	0	2	2	4	185	0.0242424242424242	0.121212121212121	0.123745819397993	0.97952497952498	0.0216216216216216	3	2	6	11	165	0.0666666666666667	0.146666666666667	0.115546218487395	1.26933333333333	0.0666666666666667	0.0666666666666667	11	84	350	2573	0.595253106384547	0.962695581300319	0.517453333517535	Inf	0.967007518796992	5.01085714285714	0.014419622082305	11.0067975893419	0.742349206349206	0.856319905914345	0.717283260234565	0.128135932033983	154	120
TCGA-FB-A78T-01A-12D-A32N-08	0	0	0	0	178	0	7	18	25	153	6273	3	3	3	9	1439	3	9	0	12	1413	8	9	74	91	1760	2	9	30	41	1661	1	3	0	4	171	0.0224719101123595	0.0975609756097561	0.102950030102348	0.947653687063186	0.0233918128654971	2	2	1	5	186	0.0280898876404494	0.0549450549450549	0.105681818181818	0.519910197329552	0.0268817204301075	0.0224719101123595	4	110	357	3064	0.998142599168636	0.312162297085687	0.104296068911144	Inf	0.336232738709519	2.87478991596639	0.0786441503944453	3.67603171803759	0.0921407024348201	0.999987791086351	0.0833511453782837	0.576470588235294	174	149
TCGA-FB-AAPP-01A-12D-A40W-08	0	0	0	0	298	1	13	20	33	264	10824	1	4	2	7	2337	4	9	0	13	2465	1	8	119	128	3043	5	11	100	116	2979	1	5	0	6	332	0.0201342281879195	0.0517241379310345	0.11144679422625	0.46411508101371	0.0180722891566265	0	2	3	5	338	0.0167785234899329	0.0390625	0.11107459743674	0.351678069526627	0.014792899408284	0.0134228187919463	4	221	670	5352	0.999999982405929	0.144602783487837	0.0488624787131362	Inf	0.159787728026534	1.49800995024876	0.507558137954599	1.59745210120308	0.123124105499898	0.999999996454042	0.110963349330612	0.586466165413534	294	260
TCGA-FB-AAPQ-01A-11D-A40W-08	0	0	1	1	89	1	6	12	18	70	2870	0	8	3	11	638	1	5	1	7	699	3	4	22	29	721	3	3	17	23	812	0	2	2	4	108	0.0449438202247191	0.173913043478261	0.133004926108374	1.30756843800322	0.037037037037037	1	2	1	4	94	0.0449438202247191	0.137931034482759	0.130374479889043	1.05796038151137	0.0425531914893617	0.0449438202247191	4	41	202	1331	0.859610445379394	0.642995114373958	0.20832859803068	Inf	0.674587458745875	1.26485148514851	0.57267115870648	1.31755863444583	0.583777608530084	0.901806698052349	0.549263002231297	0.569230769230769	85	66
TCGA-FB-AAPS-01A-12D-A397-08	0	0	0	0	105	1	3	23	26	78	3198	2	2	0	4	729	1	1	3	5	671	0	5	39	44	895	0	3	22	25	903	0	1	1	2	86	0.019047619047619	0.08	0.0952380952380952	0.84	0.0232558139534884	0	2	3	5	83	0.0476190476190476	0.113636363636364	0.0927374301675978	1.22535596933187	0.0602409638554217	0.0380952380952381	4	57	169	1629	0.835510725285838	0.676547639947876	0.221463208778352	Inf	0.697642836356582	NaN	1	0	0.697642836356582	0.835510725285838	0.676547639947876	0.06993006993007	101	74
TCGA-FB-AAPU-01A-31D-A40W-08	0	0	1	1	168	1	5	21	26	141	5781	3	9	6	18	1289	8	6	1	15	1407	15	10	29	54	1553	14	12	28	54	1532	6	1	4	11	204	0.0654761904761905	0.203703703703704	0.133159268929504	1.52977487291213	0.053921568627451	2	1	5	8	204	0.0476190476190476	0.148148148148148	0.131358660656793	1.1278140885984	0.0392156862745098	0.101190476190476	17	69	408	2677	0.0605140681774645	1.61625144656457	0.971702411528877	Inf	1.49467054263566	2.08586883029074	0.031663649158049	2.49850063069378	1.19388544891641	0.341523701181195	1.23014314112994	1	151	124
TCGA-FB-AAPZ-01A-11D-A40W-08	0	0	0	0	109	0	3	28	31	78	3198	1	4	1	6	789	1	5	1	7	745	0	4	37	41	839	2	3	19	24	825	0	1	1	2	106	0.018348623853211	0.0833333333333333	0.128484848484848	0.648584905660377	0.0188679245283019	0	0	2	2	105	0.018348623853211	0.0487804878048781	0.125148986889154	0.389779326364692	0.019047619047619	0.0275229357798165	3	55	211	1453	0.982093716347718	0.375763679588556	0.0987225454390761	Inf	0.407909789181239	0	1	0	0.422477995937712	0.978060767140607	0.38993957520323	0.142857142857143	106	75
TCGA-FB-AAQ0-01A-31D-A40W-08	0	0	0	0	116	0	4	22	26	90	3690	2	2	4	8	895	2	2	4	8	858	2	5	29	36	991	4	5	29	38	946	0	0	3	3	118	0.0258620689655172	0.0789473684210526	0.124735729386892	0.632917038358608	0.0254237288135593	1	0	1	2	108	0.0172413793103448	0.0555555555555556	0.108980827447023	0.50977366255144	0.0185185185185185	0.0431034482758621	5	59	226	1711	0.879142249571775	0.641714837483604	0.242224331652868	Inf	0.669593473451327	1.42846607669617	0.525951818360639	1.51377384967458	0.591089411046689	0.916973024346114	0.560932295664034	0.206349206349206	111	85
TCGA-FB-AAQ1-01A-12D-A40W-08	0	0	1	1	103	0	10	18	28	75	3075	0	5	1	6	699	1	5	0	6	711	1	4	33	38	805	1	3	21	25	860	0	1	0	1	113	0.00970873786407767	0.04	0.131395348837209	0.304424778761062	0.00884955752212389	0	2	1	3	93	0.029126213592233	0.0789473684210526	0.115527950310559	0.683361629881154	0.032258064516129	0.00970873786407767	1	55	206	1459	0.999325574698209	0.128848253420925	0.00642987066135731	Inf	0.144330790568655	0	1	0	0.149676375404531	0.999128477971042	0.133709963064185	1	102	74
TCGA-FB-AAQ2-01A-31D-A40W-08	0	0	1	1	107	1	8	18	26	80	3280	1	5	0	6	783	1	5	1	7	697	1	3	27	31	921	3	3	30	36	879	0	0	3	3	89	0.0280373831775701	0.0833333333333333	0.101251422070535	0.823033707865168	0.0337078651685393	0	0	0	0	122	0	0	0.132464712269273	0	0	0.0280373831775701	3	58	211	1589	0.97844386554015	0.389663815636308	0.102529925265378	Inf	0.419547820682154	0	1	0	0.448989773010726	0.968810058180616	0.41852014990986	0.1	104	77
TCGA-FB-AAQ3-01A-11D-A40W-08	0	0	0	0	107	1	7	17	24	82	3362	2	2	1	5	772	5	1	0	6	817	3	3	36	42	869	3	6	20	29	904	2	2	0	4	107	0.0373831775700935	0.137931034482759	0.118362831858407	1.16532388011602	0.0373831775700935	1	0	4	5	100	0.0467289719626168	0.119047619047619	0.115074798619102	1.03452380952381	0.05	0.0654205607476635	7	55	207	1566	0.598034193695679	0.962862129156062	0.428340812904927	Inf	0.967040673211781	4.28260869565217	0.0247303967937361	7.5494523951876	0.611801242236025	0.903317767351025	0.582082164459617	1	100	75
TCGA-FB-AAQ6-01A-11D-A40W-08	0	1	0	1	126	3	8	8	16	107	4387	3	8	2	13	1018	1	3	2	6	985	7	4	38	49	1187	5	7	27	39	1197	1	1	0	2	154	0.0158730158730159	0.0512820512820513	0.128654970760234	0.398601398601399	0.012987012987013	3	1	3	7	150	0.0555555555555556	0.142857142857143	0.12636899747262	1.13047619047619	0.0466666666666667	0.0555555555555556	7	70	304	2080	0.873136818352795	0.684303688205791	0.308194846660979	Inf	0.712918660287081	2.6140350877193	0.0571847860089217	3.41829115648032	0.361943319838057	0.991834179789987	0.33116946794113	1	119	100
TCGA-FZ-5919-01A-11D-1609-08	0	0	0	0	68	1	4	4	8	59	2419	1	1	2	4	539	1	1	2	4	564	1	5	23	29	654	1	1	20	22	662	0	0	0	0	78	0	0	0.117824773413897	0	0	1	0	1	2	56	0.0294117647058824	0.0689655172413793	0.0856269113149847	0.805418719211823	0.0357142857142857	0.0294117647058824	2	43	134	1182	0.950141399822648	0.41046628278835	0.0700102556180991	Inf	0.436484245439469	4.91044776119403	0.194434170638885	8.79334862149434	0.228392919125304	0.989681449889809	0.210157257527208	1	66	57
TCGA-FZ-5920-01A-11D-1609-08	0	0	0	0	118	1	4	18	22	95	3895	3	5	1	9	857	1	4	1	6	886	2	3	29	34	1067	3	6	37	46	1085	2	2	1	5	122	0.0423728813559322	0.108695652173913	0.112442396313364	0.966678545972915	0.040983606557377	0	1	0	1	103	0.00847457627118644	0.0294117647058824	0.0965323336457357	0.304683038263849	0.00970873786407767	0.0254237288135593	3	68	225	1927	0.982179604399972	0.37795791129542	0.0998980844077829	Inf	0.404131455399061	3.82577777777778	0.0890265798405449	5.70131276261914	0.144915824915825	0.99925703484074	0.131818853414915	1	115	92
TCGA-FZ-5921-01A-11D-1609-08	0	1	0	1	123	2	7	4	11	110	4510	0	3	1	4	946	1	1	3	5	1012	4	5	41	50	1282	4	4	43	51	1270	3	0	5	8	141	0.0650406504065041	0.156862745098039	0.111023622047244	1.41287720762064	0.0567375886524823	1	1	2	4	128	0.032520325203252	0.08	0.0998439937597504	0.80125	0.03125	0.0894308943089431	11	81	269	2283	0.381975048682807	1.15247211063673	0.617203671078832	Inf	1.13431388395022	4.74349442379182	0.00625588345913173	8.47161939244565	0.790582403965304	0.793225499710079	0.771613594245049	0.41364921254543	112	99
TCGA-FZ-5922-01A-11D-1609-08	0	0	0	0	100	0	5	21	26	74	3034	2	2	0	4	723	1	5	3	9	626	2	2	24	28	859	5	5	23	33	826	2	0	1	3	87	0.03	0.0909090909090909	0.105326876513317	0.863113897596656	0.0344827586206897	0	0	2	2	97	0.02	0.0714285714285714	0.112922002328289	0.632547864506627	0.0206185567010309	0.05	5	49	184	1501	0.716091348785053	0.832508735455468	0.311531741735364	Inf	0.847926731078905	2.61645962732919	0.174567377673374	3.25928427227978	0.584528214616096	0.898355538403182	0.556352658831004	1	95	69
TCGA-FZ-5923-01A-12D-1609-08	0	0	0	0	123	0	3	6	9	114	4674	1	2	1	4	1010	1	4	0	5	1069	3	6	49	58	1331	2	1	44	47	1264	0	0	4	4	154	0.032520325203252	0.0851063829787234	0.121835443037975	0.698535507046145	0.025974025974026	0	2	4	6	144	0.0487804878048781	0.103448275862069	0.108189331329827	0.95617816091954	0.0416666666666667	0.0650406504065041	8	90	298	2297	0.884787323114508	0.685244926907863	0.32881740576595	Inf	0.710861525818381	0	1	0	0.74907988742152	0.848599353955795	0.725541488100234	0.000714455822814955	115	106
TCGA-FZ-5924-01A-13D-1609-08	0	0	0	0	57	0	1	7	8	49	2009	0	6	0	6	449	0	2	1	3	389	2	2	16	20	606	1	3	16	20	565	0	0	1	1	52	0.0175438596491228	0.05	0.0920353982300885	0.543269230769231	0.0192307692307692	1	0	1	2	64	0.0350877192982456	0.1	0.105610561056106	0.946875	0.03125	0.0526315789473684	3	32	116	1055	0.688635837710144	0.852719804127264	0.218332823379256	Inf	0.865270935960591	3.36494252873563	0.270378464013187	4.53747116889615	0.630926724137931	0.839114035837333	0.606530609494055	1	54	46
TCGA-FZ-5926-01A-11D-1609-08	0	0	0	0	68	1	5	3	8	59	2419	2	1	0	3	571	0	2	1	3	534	2	2	20	24	618	0	5	24	29	696	0	0	4	4	73	0.0588235294117647	0.137931034482759	0.104885057471264	1.31506849315068	0.0547945205479452	1	0	0	1	73	0.0147058823529412	0.0416666666666667	0.118122977346278	0.352739726027397	0.0136986301369863	0.0735294117647059	5	41	146	1168	0.592513939920797	0.975626019606179	0.361322634314745	Inf	0.978260869565217	4.5	0.211002346088504	7.97580151052767	0.818181818181818	0.735325119163668	0.800121339510164	0.206349206349206	63	54
TCGA-H8-A6C1-01A-11D-A32N-08	0	0	0	0	140	0	2	26	28	112	4592	1	4	1	6	989	2	2	2	6	1040	0	5	56	61	1289	1	6	32	39	1274	1	2	2	5	146	0.0357142857142857	0.128205128205128	0.114599686028257	1.11872146118721	0.0342465753424658	0	0	0	0	121	0	0	0.0938712179984484	0	0	0.0214285714285714	3	86	267	2296	0.996095549563219	0.300060953010175	0.0797864923687066	Inf	0.323570256280773	9.59925093632959	0.104524180967239	Inf	0.218164794007491	0.999220265375581	0.200050061599505	1	137	109
TCGA-HV-A7OL-01A-11D-A33T-08	0	0	0	0	219	1	16	47	63	155	6355	2	6	3	11	1470	1	10	2	13	1346	3	3	64	70	1729	1	7	53	61	1810	1	1	1	3	193	0.0136986301369863	0.0491803278688525	0.106629834254144	0.461224836490274	0.0155440414507772	1	0	1	2	208	0.0091324200913242	0.0285714285714286	0.120300751879699	0.2375	0.00961538461538462	0.0182648401826484	4	117	401	3138	0.999597657568532	0.267595782891649	0.0895850644226572	Inf	0.291749963933142	4.41271820448878	0.0662573965093358	7.81676355153275	0.150862160837223	0.999985267220166	0.136131146813546	1	215	151
TCGA-HV-A7OP-01A-11D-A33T-08	0	0	1	1	299	1	20	73	93	205	8405	5	6	3	14	1978	5	7	2	14	1894	4	13	95	112	2240	5	6	54	65	2293	1	3	5	9	262	0.0301003344481605	0.138461538461538	0.114260793720017	1.21180270111568	0.0343511450381679	0	1	8	9	280	0.0301003344481605	0.0803571428571429	0.125	0.642857142857143	0.0321428571428571	0.0468227424749164	14	144	542	3991	0.909031872610386	0.715938641736086	0.420600891180306	Inf	0.741066841048157	0.929274292742927	0.682407348406531	0.92044019480424	0.729698605710889	0.912904710374571	0.703908128961679	8.28617949089971e-05	285	191
TCGA-HV-AA8V-01A-11D-A40W-08	0	0	0	0	86	1	9	13	22	63	2583	1	2	0	3	617	5	4	1	10	612	1	3	20	24	640	0	7	19	26	714	0	1	0	1	94	0.0116279069767442	0.0384615384615385	0.131652661064426	0.292144026186579	0.0106382978723404	0	0	2	2	80	0.0232558139534884	0.0833333333333333	0.125	0.666666666666667	0.025	0.0232558139534884	2	38	174	1180	0.970970217880175	0.357108486620344	0.0607959866026774	Inf	0.389080459770115	0	1	0	0.399056881815503	0.967486902229614	0.366756991368726	0.4	84	61
TCGA-HV-AA8X-01A-11D-A397-08	0	1	0	1	146	0	11	36	47	99	4059	3	1	1	5	828	3	5	1	9	921	0	5	41	46	1125	3	4	32	39	1185	2	2	0	4	119	0.0273972602739726	0.102564102564103	0.10042194092827	1.0213316095669	0.0336134453781513	0	1	1	2	109	0.0136986301369863	0.0434782608695652	0.0968888888888889	0.448743518149182	0.018348623853211	0.0205479452054795	3	73	228	2082	0.983026512775243	0.375376708793927	0.0993841276774906	Inf	0.399930747922438	6.75438596491228	0.0276041136896833	18.2129682994707	0.138788752703677	0.99944429033316	0.126879687296775	1	143	96
TCGA-HZ-7918-01A-11D-2154-08	0	0	0	0	158	3	3	18	21	134	5494	3	8	6	17	1256	5	5	2	12	1363	19	15	26	60	1477	15	8	22	45	1398	6	1	5	12	209	0.0759493670886076	0.266666666666667	0.149499284692418	1.78373205741627	0.0574162679425837	7	2	9	18	188	0.113924050632911	0.3	0.127285037237644	2.35691489361702	0.0957446808510638	0.170886075949367	27	55	397	2478	1.24005448399405e-05	3.06254033040943	1.98757519331612	Inf	2.38449960066351	2.76892873018225	0.000396702515162135	3.86150566584109	2.11219563392107	0.00475259084997337	2.56896159170875	1	131	107
TCGA-HZ-7925-01A-11D-2154-08	0	0	0	0	64	0	6	30	36	28	1148	0	1	0	1	221	0	2	1	3	268	1	3	8	12	319	0	1	11	12	340	0	0	0	0	34	0	0	0.1	0	0	0	0	0	0	25	0	0	0.0783699059561129	0	0	0	0	20	59	600	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	64	28
TCGA-HZ-8637-01A-11D-2396-08	0	0	0	0	199	1	10	79	89	109	4469	0	6	2	8	946	2	9	0	11	1027	5	6	40	51	1213	2	4	33	39	1283	0	1	1	2	147	0.0100502512562814	0.0512820512820513	0.114575214341387	0.447584161869876	0.0136054421768707	2	2	5	9	140	0.0452261306532663	0.176470588235294	0.115416323165705	1.52899159663866	0.0642857142857143	0.0402010050251256	8	72	287	2209	0.71339494809701	0.855278547270784	0.407588102922922	Inf	0.869686411149826	2.48481831757093	0.189067282354925	3.07663937977779	0.714810748890268	0.856504973509314	0.689359053511477	0.18266253869969	191	101
TCGA-HZ-A49I-01A-12D-A26I-08	0	0	0	0	92	0	4	33	37	55	2255	1	3	2	6	515	2	1	2	5	551	1	5	14	20	584	4	2	18	24	605	2	1	1	4	75	0.0434782608695652	0.166666666666667	0.12396694214876	1.34444444444444	0.0533333333333333	0	0	0	0	67	0	0	0.11472602739726	0	0	0.0326086956521739	3	34	142	1047	0.833842059720399	0.650775983024193	0.167465580226473	Inf	0.678911305671869	3.34929577464789	0.113081523972037	4.90469886738111	0.261663732394366	0.982418414117123	0.238012709367917	1	89	52
TCGA-HZ-A77O-01A-11D-A33T-08	1	0	0	1	192	0	11	43	54	138	5658	2	7	1	10	1293	2	8	3	13	1198	2	3	71	76	1551	2	4	33	39	1616	0	0	0	0	162	0	0	0.100247524752475	0	0	0	0	0	0	179	0	0	0.115409413281754	0	0	0	0	108	341	2826	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	192	138
TCGA-HZ-A77P-01A-11D-A33T-08	0	0	2	2	209	1	12	54	66	142	5822	2	4	0	6	1287	1	5	1	7	1356	2	7	73	82	1573	2	10	35	47	1606	1	3	0	4	193	0.0191387559808612	0.0851063829787234	0.120174346201743	0.708190938154558	0.0207253886010363	1	2	0	3	182	0.0143540669856459	0.0365853658536585	0.115702479338843	0.316202090592334	0.0164835164835165	0.00956937799043062	2	110	375	2804	0.99998489197314	0.135992386890095	0.0237731301243369	Inf	0.151380952380952	4.23866666666667	0.0713566322400776	7.46869792460366	0	1	0	0.461538461538461	207	140
TCGA-HZ-A77Q-01A-11D-A36O-08	0	0	0	0	478	2	8	30	38	438	17958	3	3	2	8	4697	1	6	2	9	5138	4	156	28	188	4037	3	201	29	233	4086	1	47	1	49	668	0.102510460251046	0.210300429184549	0.163485070974058	1.28635861324561	0.0733532934131736	1	40	0	41	647	0.0857740585774059	0.218085106382979	0.160267525390141	1.36075668387648	0.0633693972179289	0.00627615062761506	3	61	1315	6808	0.998879013471823	0.254641625268347	0.0675272366864496	Inf	0.289555608365019	1.76491037479631	0.317052508987891	2.07068497839012	0.108371689680475	0.99995618346248	0.092461835051526	1	475	435
TCGA-HZ-A8P0-01A-11D-A36O-08	0	0	0	0	141	1	6	33	39	101	4141	2	4	2	8	963	1	2	2	5	1025	1	16	25	42	1061	0	16	30	46	1092	0	9	1	10	130	0.0709219858156028	0.217391304347826	0.119047619047619	1.82608695652174	0.0769230769230769	0	4	1	5	120	0.0354609929078014	0.119047619047619	0.113100848256362	1.05257936507937	0.0416666666666667	0.0141843971631206	2	54	250	1903	0.991295993518114	0.282027379424455	0.048616090714246	Inf	0.307571428571429	0	1	0	0.313163636363636	0.990329796911862	0.287347808860803	0.482758620689655	139	99
TCGA-HZ-A8P1-01A-11D-A377-08	0	0	0	0	127	1	4	15	19	107	4387	1	9	2	12	1084	2	7	2	11	1143	2	1	29	32	1094	8	6	38	52	1066	3	3	4	10	161	0.078740157480315	0.192307692307692	0.151031894934334	1.27329192546584	0.062111801242236	2	0	2	4	154	0.031496062992126	0.125	0.140767824497258	0.887987012987013	0.025974025974026	0.0866141732283465	11	66	315	1845	0.580020150718003	0.976198459146651	0.519521825307295	Inf	0.979591836734694	3.42857142857143	0.00901053846358592	5.84954701409056	0.61407249466951	0.936916969850823	0.576233158603302	1	116	96
TCGA-HZ-A9TJ-01A-11D-A40W-08	0	0	0	0	170	2	10	32	42	126	5166	4	7	0	11	1182	7	7	1	15	1202	4	3	40	47	1383	4	8	41	53	1399	1	2	2	5	172	0.0294117647058824	0.0943396226415094	0.122944960686204	0.767332163229487	0.0290697674418605	0	0	3	3	150	0.0176470588235294	0.0638297872340425	0.108459869848156	0.588510638297872	0.02	0.0352941176470588	6	83	322	2460	0.951816849886595	0.552364158732524	0.232675918847652	Inf	0.582455160862586	1.07996894409938	0.626794680336222	1.09139199392144	0.533317997086113	0.963593081372635	0.502710062694178	0.118881118881119	164	120
TCGA-IB-7651-01A-11D-2154-08	0	0	1	1	21516	142	67	77	144	21230	870430	98	1092	623	1813	204465	99	1068	621	1788	206135	17	2257	6382	8656	228178	16	2408	6549	8973	231652	2	556	381	939	29882	0.0436419408812047	0.10464727515881	0.128995216963376	0.811249266618319	0.0314235994913326	4	520	404	928	28974	0.0431306934374419	0.10720887245841	0.126979814004856	0.844298546966769	0.0320287154000138	0.0367633389105782	791	12173	58856	400974	1	0.44269397052525	0.416159331036546	Inf	0.476698757534221	1.42050860652193	0.241471851715554	1.51394670135721	0.474290148376647	1	0.44031262444654	2.92230688091647e-269	20725	20439
TCGA-IB-7652-01A-11D-2154-08	0	0	0	0	139	1	3	30	33	105	4305	7	4	1	12	1008	5	5	3	13	1000	5	7	26	38	1126	8	7	27	42	1171	2	1	2	5	138	0.0359712230215827	0.119047619047619	0.117847993168232	1.01017943409248	0.036231884057971	1	1	1	3	126	0.0215827338129496	0.0789473684210526	0.11190053285968	0.705513784461153	0.0238095238095238	0.0431654676258993	6	60	264	2033	0.7834004612615	0.7701534096716	0.320835987323929	Inf	0.790977961432507	2.00786713286713	0.183030097443516	2.30907503559179	0.492495711835334	0.950844334359221	0.462158675376646	1	133	99
TCGA-IB-7885-01A-11D-2154-08	0	1	0	1	115	0	9	44	53	62	2542	2	4	0	6	625	3	3	2	8	587	3	3	23	29	624	2	2	15	19	706	1	1	1	3	100	0.0260869565217391	0.157894736842105	0.141643059490085	1.11473684210526	0.03	0	0	2	2	80	0.0173913043478261	0.0689655172413793	0.128205128205128	0.537931034482759	0.025	0.0347826086956522	4	39	180	1150	0.849982848336692	0.655446172455379	0.211653301311935	Inf	0.68733850129199	1.47777777777778	0.517928747123311	1.59655305301476	0.583333333333333	0.902397382719338	0.547815893831154	0.523809523809524	111	58
TCGA-IB-8126-01A-11D-2396-08	0	0	0	0	179	0	21	72	93	86	3526	0	10	3	13	804	4	7	2	13	766	3	7	28	38	934	2	2	18	22	1022	0	2	0	2	106	0.0111731843575419	0.0909090909090909	0.103718199608611	0.876500857632933	0.0188679245283019	0	1	3	4	102	0.0223463687150838	0.105263157894737	0.109207708779443	0.963880288957688	0.0392156862745098	0.0167597765363128	3	48	208	1748	0.917513998328183	0.525373268544763	0.137483672726054	Inf	0.55316742081448	0	1	0	0.613294314381271	0.879079467648774	0.586443141285415	0.181818181818182	176	83
TCGA-IB-A5SO-01A-11D-A32N-08	0	0	0	0	138	0	7	25	32	106	4346	1	4	0	5	1021	1	5	1	7	988	6	2	54	62	1117	2	3	27	32	1220	0	1	3	4	144	0.0289855072463768	0.125	0.118032786885246	1.05902777777778	0.0277777777777778	0	0	4	4	140	0.0289855072463768	0.0645161290322581	0.125335720680394	0.514746543778802	0.0285714285714286	0.0507246376811594	7	82	284	2053	0.924451987589619	0.617203525921872	0.279143867417049	Inf	0.647214749169172	0	1	0	0.71113719353156	0.873748470398357	0.683906955615794	0.0013986013986014	131	99
TCGA-IB-A5SP-01A-11D-A32N-08	0	0	0	0	185	1	7	35	42	142	5822	2	6	2	10	1224	2	6	2	10	1314	5	6	59	70	1627	3	11	38	52	1657	2	2	1	5	177	0.027027027027027	0.0961538461538462	0.106819553409777	0.900152107779226	0.0282485875706215	2	1	0	3	179	0.0162162162162162	0.0428571428571429	0.110018438844499	0.389545091779729	0.0167597765363128	0.027027027027027	5	100	356	2928	0.990772418953742	0.411312958397009	0.157934410907024	Inf	0.439272338148743	4.6123595505618	0.00687918593173256	8.21386344916572	0.0951001969188	0.99998313484292	0.085700549519116	0.282051282051282	180	137
TCGA-IB-A5SQ-01A-11D-A32N-08	0	0	1	1	167	1	9	44	53	113	4633	0	8	0	8	1027	1	5	4	10	1034	1	4	56	61	1312	4	3	27	34	1260	1	0	3	4	141	0.0239520958083832	0.117647058823529	0.111904761904762	1.05131414267835	0.0283687943262411	0	0	1	1	145	0.00598802395209581	0.0163934426229508	0.110518292682927	0.148332391181458	0.00689655172413793	0.029940119760479	5	83	286	2286	0.971911931906065	0.481608581250532	0.183880888007266	Inf	0.510966306420852	1.7986013986014	0.446147849404576	1.99759859639015	0.433397927373831	0.985449543077139	0.40480740982553	0.206349206349206	162	108
TCGA-IB-A5SS-01A-11D-A32N-08	0	0	0	0	118	1	4	11	15	102	4182	2	1	1	4	925	2	3	1	6	904	4	4	39	47	1163	6	13	26	45	1190	2	3	1	6	139	0.0508474576271186	0.133333333333333	0.116806722689076	1.14148681055156	0.0431654676258993	1	0	0	1	129	0.00847457627118644	0.0212765957446809	0.110920034393809	0.191819231403596	0.00775193798449612	0.0338983050847458	4	71	268	2085	0.975942755076292	0.438410647604107	0.14496457405958	Inf	0.468258706467662	2.6339552238806	0.0972707703124686	3.33135327210027	0.135074626865672	0.999580201087007	0.121610373367468	0.559440559440559	114	98
TCGA-IB-A5ST-01A-11D-A32N-08	0	1	1	2	138	1	8	26	34	103	4223	1	2	0	3	931	2	7	2	11	905	2	3	53	58	1167	1	3	27	31	1220	0	1	0	1	107	0.0072463768115942	0.032258064516129	0.0877049180327869	0.367802230931565	0.00934579439252336	2	0	1	3	115	0.0217391304347826	0.0517241379310345	0.0985432733504713	0.524887556221889	0.0260869565217391	0.0217391304347826	3	80	222	2165	0.985510417664474	0.365811016720827	0.0970233590986362	Inf	0.388635623575383	7.16816816816817	0.0246191912042915	19.4492460456139	0.134403153153153	0.99955152836424	0.123495338807875	1	135	100
TCGA-IB-A6UF-01A-23D-A33T-08	0	0	0	0	202	0	8	43	51	151	6191	6	7	0	13	1369	1	3	2	6	1402	3	2	78	83	1660	4	5	40	49	1760	1	0	0	1	193	0.00495049504950495	0.0204081632653061	0.109659090909091	0.18610553029502	0.00518134715025907	1	0	1	2	174	0.0099009900990099	0.0240963855421687	0.104819277108434	0.229885057471264	0.0114942528735632	0.0148514851485149	3	122	367	3053	0.999896314380426	0.204612153889407	0.0547943076998432	Inf	0.223651226158038	2.6625145971195	0.168903471492566	3.32590605637739	0.0789728905925276	0.999998134331435	0.0711222472299259	1	199	148
TCGA-IB-A6UG-01A-32D-A33T-08	0	0	0	0	220	1	6	39	45	174	7134	3	7	0	10	1545	2	5	2	9	1526	2	8	79	89	2044	3	5	58	66	2019	0	1	1	2	198	0.00909090909090909	0.0303030303030303	0.0980683506686478	0.308999081726354	0.0101010101010101	1	0	0	1	207	0.00454545454545455	0.0112359550561798	0.101272015655577	0.110948271182761	0.00483091787439614	0.00909090909090909	2	140	405	3658	0.999993177446078	0.129060096883435	0.0226346698111734	Inf	0.141297165710311	2.00641975308642	0.40902579552798	2.25739389643294	0.0732269982878255	0.999999299059252	0.0664292702455792	1	218	172
TCGA-IB-A7LX-01A-12D-A36O-08	0	0	0	0	112	2	6	22	28	82	3362	2	3	4	9	841	4	7	4	15	869	2	10	16	28	832	1	14	15	30	820	0	6	1	7	107	0.0625	0.233333333333333	0.130487804878049	1.78816199376947	0.0654205607476635	1	5	3	9	123	0.0803571428571429	0.321428571428571	0.147836538461538	2.17421602787456	0.0731707317073171	0.0446428571428571	5	29	230	1422	0.524034221379	1.06594156845727	0.389452050657293	Inf	1.05626598465473	2.39420289855072	0.363192559801148	3.08828801113949	0.926788218793829	0.644433183660133	0.915967987618613	0.332591768631813	107	77
TCGA-IB-A7M4-01A-11D-A36O-08	0	0	0	0	162	0	11	35	46	116	4756	1	7	3	11	1164	1	4	2	7	1115	4	5	42	51	1259	7	9	31	47	1218	3	5	2	10	154	0.0617283950617284	0.212765957446809	0.126436781609195	1.68278529980658	0.0649350649350649	3	0	1	4	174	0.0246913580246914	0.0784313725490196	0.138204924543288	0.567500563443768	0.0229885057471264	0.0555555555555556	9	75	328	2149	0.795877436452503	0.786287920763546	0.392903739881148	Inf	0.80912456445993	4.11917960088692	0.00142987636494206	7.85017388265136	0.310349148012028	0.997510892162403	0.280881402641397	0.419710144927536	153	107
TCGA-IB-AAUM-01A-11D-A377-08	0	0	0	0	92	0	4	22	26	66	2706	1	2	0	3	620	4	2	1	7	639	2	3	27	32	697	3	1	20	24	750	1	0	0	1	92	0.0108695652173913	0.0416666666666667	0.122666666666667	0.339673913043478	0.0108695652173913	0	0	2	2	87	0.0217391304347826	0.0625	0.124820659971306	0.500718390804598	0.0229885057471264	0.0326086956521739	3	49	179	1268	0.962406658596232	0.433879970154592	0.113442061614392	Inf	0.466373012462398	1.61675977653631	0.484559808021463	1.77008940643791	0.343991441816237	0.983895182107642	0.314995892805369	1	89	63
TCGA-IB-AAUN-01A-12D-A38G-08	0	0	0	0	83	1	4	8	12	70	2870	0	2	1	3	657	0	4	1	5	632	1	1	25	27	768	2	5	28	35	813	0	1	0	1	90	0.0120481927710843	0.0285714285714286	0.11070110701107	0.258095238095238	0.0111111111111111	0	1	0	1	73	0.0120481927710843	0.037037037037037	0.0950520833333333	0.389649923896499	0.0136986301369863	0	0	56	163	1418	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	83	70
TCGA-IB-AAUO-01A-12D-A38G-08	0	0	0	0	112	0	4	14	18	94	3854	1	4	1	6	891	0	3	2	5	921	1	8	38	47	1052	2	3	31	36	990	1	0	0	1	125	0.00892857142857143	0.0277777777777778	0.126262626262626	0.22	0.008	0	2	2	4	134	0.0357142857142857	0.0851063829787234	0.127376425855513	0.668148618609082	0.0298507462686567	0.0267857142857143	3	69	259	1783	0.995922879086073	0.299422480735689	0.0792368456360917	Inf	0.328507078507078	2.62805662805663	0.335122183238881	3.43879215688811	0.228526663309272	0.99895043225994	0.205585598612482	1	109	91
TCGA-IB-AAUP-01A-11D-A377-08	0	0	0	0	142	1	8	29	37	104	4264	1	2	3	6	910	2	2	0	4	1015	3	3	41	47	1127	4	1	42	47	1212	3	0	1	4	140	0.028169014084507	0.0851063829787234	0.115511551155116	0.73677811550152	0.0285714285714286	1	1	1	3	129	0.0211267605633803	0.0638297872340425	0.114463176574978	0.557644730331519	0.0232558139534884	0.0422535211267606	6	84	269	2070	0.952866036782042	0.549765047198476	0.231315952577454	Inf	0.579677819083024	4.96866702071163	0.00471916631934668	10.240716276758	0.209522103283021	0.999477100470917	0.190076010870433	0.592074592074592	136	98
TCGA-IB-AAUQ-01A-22D-A40W-08	0	0	0	0	127	0	11	18	29	98	4018	1	1	2	4	913	2	7	2	11	903	5	1	36	42	1085	2	5	34	41	1117	1	0	3	4	118	0.031496062992126	0.0975609756097561	0.105640107430618	0.923522116577098	0.0338983050847458	2	0	1	3	131	0.0236220472440945	0.0714285714285714	0.12073732718894	0.591603053435114	0.0229007633587786	0.0551181102362205	7	70	249	1953	0.779994255541632	0.784414150321424	0.352677273145428	Inf	0.8039430449069	3.79001721170396	0.0362113584338541	5.87419841944857	0.505335628227194	0.962115880680737	0.47547535771198	1	120	91
TCGA-IB-AAUR-01A-21D-A38G-08	0	0	1	1	98	0	1	15	16	82	3362	0	4	1	5	773	0	3	1	4	795	0	2	41	43	841	2	5	23	30	953	1	0	0	1	114	0.0102040816326531	0.0333333333333333	0.119622245540399	0.278654970760234	0.0087719298245614	0	1	0	1	94	0.0102040816326531	0.0232558139534884	0.111771700356718	0.208065314200891	0.0106382978723404	0.0102040816326531	1	65	208	1586	0.999670069306618	0.117371631715231	0.00587118611693775	Inf	0.130681818181818	4.3125	0.219254797104057	7.60906382279552	0	1	0	1	97	81
TCGA-IB-AAUS-01A-12D-A38G-08	0	0	0	0	81	0	4	14	18	63	2583	1	3	0	4	592	1	2	3	6	609	0	0	28	28	679	1	4	20	25	703	1	0	0	1	86	0.0123456790123457	0.04	0.122332859174964	0.326976744186047	0.0116279069767442	0	0	2	2	78	0.0246913580246914	0.0714285714285714	0.114874815905744	0.621794871794872	0.0256410256410256	0.037037037037037	3	46	164	1218	0.939107690502226	0.484548613202642	0.126330851978775	Inf	0.515928322548532	8.42682926829268	0.119305856832972	Inf	0.351117886178862	0.981826552011438	0.323074892873529	1	78	60
TCGA-IB-AAUU-01A-11D-A377-08	0	0	0	0	157	1	19	34	53	103	4223	1	3	1	5	969	2	2	0	4	950	1	4	43	48	1177	4	2	40	46	1127	1	0	2	3	118	0.0191082802547771	0.0652173913043478	0.104702750665484	0.622881355932203	0.0254237288135593	1	0	2	3	154	0.0191082802547771	0.0625	0.130841121495327	0.477678571428571	0.0194805194805195	0.0382165605095541	6	82	272	2032	0.954224746359668	0.546740796859595	0.229919789549645	Inf	0.577540106951872	3.38823529411765	0.110091178802558	4.97467228464606	0.40822111977321	0.99067135681171	0.378365290384249	0.567099567099567	151	97
TCGA-IB-AAUV-01A-11D-A38G-08	0	0	0	0	45	0	5	8	13	32	1312	1	1	0	2	283	0	1	0	1	280	0	0	11	11	402	0	3	15	18	347	0	0	0	0	32	0	0	0.0922190201729107	0	0	0	0	0	0	38	0	0	0.0945273631840796	0	0	0	0	26	70	679	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	45	32
TCGA-IB-AAUW-01A-12D-A38G-08	0	0	0	0	56	0	5	16	21	35	1435	0	1	0	1	308	0	3	0	3	359	0	1	18	19	375	0	3	9	12	393	0	0	0	0	50	0	0	0.127226463104326	0	0	0	1	2	3	38	0.0535714285714286	0.157894736842105	0.101333333333333	1.55817174515235	0.0789473684210526	0.0357142857142857	2	25	88	680	0.83139439786726	0.618496628880028	0.102741362971223	Inf	0.646464646464647	NaN	1	0	0.646464646464647	0.83139439786726	0.618496628880028	0.4	54	33
TCGA-LB-A7SX-01A-11D-A33T-08	0	0	1	1	356	0	10	56	66	290	11890	1	9	5	15	2688	3	12	3	18	2736	12	14	129	155	3229	13	10	79	102	3237	6	3	18	27	381	0.0758426966292135	0.264705882352941	0.117701575532901	2.24895785085688	0.0708661417322835	8	4	26	38	400	0.106741573033708	0.245161290322581	0.123877361412202	1.97906451612903	0.095	0.162921348314607	58	175	781	5685	1.10673789625595e-07	2.41206956083351	1.83597221319293	Inf	2.06089914437856	4.63631241997439	1.85755035227812e-07	9.25799018130663	1.75135427952329	0.000195518954868909	1.95275257245904	1.88019309542012e-07	298	232
TCGA-LB-A8F3-01A-11D-A36O-08	0	0	0	0	148	1	8	29	37	110	4510	3	9	0	12	1053	4	5	1	10	1042	1	3	39	43	1161	6	0	39	45	1254	0	0	0	0	161	0	0	0.128389154704944	0	0	0	1	4	5	137	0.0337837837837838	0.116279069767442	0.118001722652885	0.985401459854015	0.0364963503649635	0.027027027027027	4	81	298	2117	0.994644083677274	0.350916414931475	0.116433579508697	Inf	0.381365969206475	0	1	0	0.415591120289107	0.989573892065319	0.384105049262365	0.0476190476190476	144	106
TCGA-LB-A9Q5-01A-11D-A397-08	0	0	0	0	130	0	1	29	30	100	4100	1	1	1	3	965	0	4	2	6	917	0	3	50	53	1119	1	2	35	38	1099	1	0	2	3	135	0.0230769230769231	0.0789473684210526	0.122838944494995	0.642690058479532	0.0222222222222222	0	0	2	2	120	0.0153846153846154	0.0377358490566038	0.107238605898123	0.35188679245283	0.0166666666666667	0.0384615384615385	5	81	255	1963	0.973840909884093	0.475306128677448	0.181195982130378	Inf	0.505699954400365	8.69803921568627	0.115367282559712	Inf	0.409319492502884	0.990355045253717	0.380261823191392	0.206349206349206	125	95
TCGA-OE-A75W-01A-12D-A32N-08	0	0	1	1	255	3	2	34	36	216	8856	6	10	1	17	2073	5	4	2	11	1993	8	10	84	102	2358	11	6	69	86	2432	8	2	11	21	308	0.0823529411764706	0.244186046511628	0.126644736842105	1.92811839323467	0.0681818181818182	4	3	10	17	295	0.0666666666666667	0.166666666666667	0.125106022052587	1.33220338983051	0.0576271186440678	0.129411764705882	33	139	603	4187	0.0101680279346914	1.6482821986411	1.15680291254929	Inf	1.52406571792202	5.01702016234616	3.70695664366087e-07	11.8920842261168	1.09030013332033	0.374716486211442	1.10467751026563	0.0633693846139903	222	183
TCGA-Q3-A5QY-01A-12D-A32N-08	0	0	0	0	140	1	6	32	38	101	4141	2	3	0	5	883	1	6	0	7	976	1	5	59	65	1054	0	7	17	24	1228	0	2	0	2	160	0.0142857142857143	0.0833333333333333	0.130293159609121	0.639583333333333	0.0125	0	2	1	3	115	0.0214285714285714	0.0461538461538462	0.109108159392789	0.423010033444816	0.0260869565217391	0.00714285714285714	1	76	275	2007	0.999941661219072	0.096071216276587	0.00481768022122258	Inf	0.107768595041322	0	1	0	0.109186602870813	0.999933931260581	0.0973520971745154	1	139	100
TCGA-Q3-AA2A-01A-11D-A377-08	0	1	0	1	109	0	8	24	32	77	3157	0	5	0	5	746	1	4	1	6	721	3	4	34	41	828	2	3	20	25	862	0	1	1	2	117	0.018348623853211	0.08	0.135730858468677	0.589401709401709	0.0170940170940171	2	0	1	3	112	0.0275229357798165	0.0731707317073171	0.135265700483092	0.540940766550523	0.0267857142857143	0.036697247706422	4	55	229	1461	0.965643627741444	0.464151825334575	0.152177366285707	Inf	0.500333061949523	2.95196506550218	0.139857015169446	4.24797946719253	0.27333009865761	0.996092666134255	0.245501743782944	1	105	73
TCGA-RB-A7B8-01A-12D-A33T-08	1	1	0	2	228	0	8	44	52	176	7216	4	8	3	15	1649	1	8	1	10	1580	2	3	92	97	1934	3	5	46	54	2053	1	1	0	2	230	0.0087719298245614	0.037037037037037	0.112031173891866	0.330595813204509	0.00869565217391304	0	0	3	3	218	0.0131578947368421	0.0309278350515464	0.112719751809721	0.274378132980233	0.0137614678899083	0.0175438596491228	4	139	448	3539	0.999945449392167	0.227372914243951	0.0763234144316647	Inf	0.248938561438561	1.77991071428571	0.449490118842751	1.97451155298527	0.193468555900621	0.999985179805184	0.175585289204391	0.523809523809524	224	172
TCGA-RB-AA9M-01A-11D-A397-08	0	0	0	0	138	1	13	43	56	81	3321	2	3	0	5	732	2	4	1	7	829	2	2	34	38	811	2	5	24	31	949	0	1	0	1	133	0.0072463768115942	0.032258064516129	0.140147523709168	0.230172204705312	0.0075187969924812	1	0	0	1	83	0.0072463768115942	0.0263157894736842	0.102342786683107	0.2571337983513	0.0120481927710843	0.0072463768115942	1	61	216	1544	0.999666568244758	0.117248316524337	0.00586027771597198	Inf	0.13142174432497	2.03703703703704	0.408765960663425	2.3811260431156	0	1	0	1	137	80
TCGA-RL-AAAS-01A-32D-A397-08	0	0	0	0	100	1	4	30	34	65	2665	1	5	0	6	597	0	2	1	3	606	1	1	29	31	668	1	3	21	25	794	0	1	2	3	84	0.03	0.12	0.105793450881612	1.13428571428571	0.0357142857142857	0	0	0	0	79	0	0	0.118263473053892	0	0	0.02	2	50	163	1299	0.983103539374566	0.318931264580683	0.0547236789882669	Inf	0.344974044360547	0	1	0	0.358773006134969	0.979426788518358	0.332216577077565	0.4	98	63
TCGA-S4-A8RO-01A-12D-A377-08	0	0	0	0	143	0	10	23	33	110	4510	1	2	2	5	1020	2	5	0	7	1089	4	3	52	59	1199	3	4	32	39	1202	2	0	3	5	149	0.034965034965035	0.128205128205128	0.12396006655574	1.0342453966615	0.0335570469798658	0	0	1	1	136	0.00699300699300699	0.0169491525423729	0.113427856547123	0.149426719840479	0.00735294117647059	0.041958041958042	6	85	285	2116	0.964614383581546	0.524195791969316	0.22072451972591	Inf	0.555465587044534	2.40701754385965	0.198904843152693	2.96787136887641	0.401169590643275	0.991862667058822	0.371330816560727	0.567099567099567	137	104
TCGA-US-A776-01A-13D-A33T-08	0	0	0	0	262	2	9	56	65	195	7995	4	6	3	13	1768	6	7	2	15	1853	5	6	76	87	2178	3	14	63	80	2196	0	2	3	5	246	0.0190839694656489	0.0625	0.112021857923497	0.557926829268293	0.0203252032520325	1	1	5	7	257	0.0267175572519084	0.0804597701149425	0.117998163452709	0.681873071246478	0.0272373540856031	0.0343511450381679	9	138	503	3871	0.989605107242079	0.501962262919155	0.2554872504738	Inf	0.532397452022559	1.08697813121272	0.624056692761314	1.09934441535883	0.500479139551182	0.992266307175477	0.470034777362357	0.00942253331538567	253	186
TCGA-US-A779-01A-11D-A32N-08	0	1	0	1	137	0	4	30	34	103	4223	3	2	1	6	909	0	5	0	5	951	5	3	45	53	1194	3	5	31	39	1169	2	0	1	3	131	0.0218978102189781	0.0769230769230769	0.112061591103507	0.686435701702877	0.0229007633587786	0	1	1	2	129	0.0145985401459854	0.0377358490566038	0.108040201005025	0.349275998244844	0.0155038759689922	0.0291970802919708	4	80	260	2103	0.985470697530846	0.404529723450222	0.134123836555197	Inf	0.432783882783883	2.27211538461538	0.218495726781874	2.69453469639136	0.23917004048583	0.99839022401216	0.218685394170443	1	133	99
TCGA-US-A77E-01A-11D-A32N-08	0	0	0	0	176	0	2	30	32	144	5904	5	5	4	14	1247	1	3	2	6	1349	2	7	71	80	1681	3	2	39	44	1627	0	1	2	3	182	0.0170454545454545	0.0681818181818182	0.111862323294407	0.609515484515484	0.0164835164835165	0	0	2	2	168	0.0113636363636364	0.025	0.099940511600238	0.25014880952381	0.0119047619047619	0.0227272727272727	4	111	350	2958	0.998510401020582	0.304623991308354	0.101777926627984	Inf	0.328745341614907	0	1	0	0.343688311688312	0.997727255399298	0.318991446960489	0.0476190476190476	172	140
TCGA-US-A77G-01A-11D-A32N-08	0	0	1	1	157	0	8	33	41	116	4756	2	6	1	9	1087	1	1	2	4	1055	2	4	54	60	1250	4	5	34	43	1364	0	1	2	3	146	0.0191082802547771	0.0697674418604651	0.107038123167155	0.651799936285441	0.0205479452054795	0	0	1	1	129	0.00636942675159236	0.0166666666666667	0.1032	0.161498708010336	0.00775193798449612	0.0191082802547771	3	91	275	2339	0.997689105729439	0.280481930248795	0.0746667092076476	Inf	0.303365570599613	0	1	0	0.32404958677686	0.996073170072318	0.300278019492121	0.142857142857143	154	113
TCGA-US-A77J-01A-11D-A32N-08	0	0	0	0	128	0	7	32	39	89	3649	1	8	0	9	811	3	5	1	9	831	0	0	47	47	966	2	1	21	24	1041	0	0	0	0	115	0	0	0.110470701248799	0	0	0	0	0	0	117	0	0	0.12111801242236	0	0	0	0	70	232	1775	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	128	89
TCGA-XD-AAUG-01A-61D-A40W-08	0	0	0	0	91	1	5	15	20	70	2870	1	7	2	10	664	2	2	0	4	667	1	9	26	36	740	1	6	13	20	799	0	1	0	1	101	0.010989010989011	0.05	0.126408010012516	0.395544554455446	0.0099009900990099	0	2	1	3	71	0.032967032967033	0.0833333333333333	0.095945945945946	0.868544600938967	0.0422535211267606	0.010989010989011	1	40	172	1367	0.991929682498174	0.198804702191876	0.0099220542067329	Inf	0.218235961429382	0	1	0	0.229427549194991	0.989822281849285	0.209266401376907	1	90	69
TCGA-XD-AAUH-01A-42D-A40W-08	1	0	0	1	74	1	5	16	21	52	2132	2	2	0	4	470	2	3	2	7	499	1	4	18	23	600	0	1	17	18	563	0	0	0	0	70	0	0	0.124333925399645	0	0	0	0	0	0	70	0	0	0.116666666666667	0	0	0	0	36	140	1023	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	74	52
TCGA-XD-AAUI-01A-42D-A40W-08	0	0	0	0	97	1	4	16	20	76	3116	1	6	1	8	706	3	1	0	4	719	1	2	32	35	840	4	5	20	29	851	0	1	1	2	110	0.0206185567010309	0.0689655172413793	0.129259694477086	0.533542319749216	0.0181818181818182	0	0	2	2	86	0.0206185567010309	0.0571428571428571	0.102380952380952	0.558139534883721	0.0232558139534884	0.0309278350515464	3	54	196	1495	0.966759870733314	0.423904203851599	0.111253923211525	Inf	0.454081632653061	0	1	0	0.497743328100471	0.948120292014386	0.467148381963717	0.142857142857143	94	73
TCGA-XD-AAUL-01A-21D-A397-08	0	1	0	1	122	0	4	28	32	90	3690	1	4	1	6	857	1	2	5	8	852	2	8	31	41	978	3	6	26	35	1003	1	1	1	3	127	0.0245901639344262	0.0857142857142857	0.126620139581256	0.676940382452193	0.0236220472440945	0	1	1	2	116	0.0163934426229508	0.0487804878048781	0.118609406952965	0.411269974768713	0.0172413793103448	0.0245901639344262	3	59	243	1738	0.985326238631847	0.363798708413994	0.0958742609142154	Inf	0.394464356829948	1.63045267489712	0.481154879492165	1.78741675944583	0.286044328929319	0.994527546064268	0.260187921425846	1	119	87
TCGA-XN-A8T3-01A-11D-A36O-08	0	0	0	0	213	0	11	41	52	161	6601	0	4	0	4	1683	1	8	2	11	1788	0	47	24	71	1565	0	56	19	75	1565	0	20	1	21	235	0.0985915492957746	0.28	0.150159744408946	1.86468085106383	0.0893617021276596	0	19	0	19	245	0.0892018779342723	0.267605633802817	0.156549520766773	1.70939925265881	0.0775510204081633	0.00469483568075117	1	42	480	2650	0.99919143789739	0.131490337411938	0.00654638770631603	Inf	0.151647286821705	NaN	1	0	0.151647286821705	0.99919143789739	0.131490337411938	1	212	160
TCGA-XN-A8T5-01A-12D-A36O-08	0	0	0	0	113	2	5	22	27	84	3444	7	3	1	11	825	2	5	0	7	819	3	4	31	38	877	2	7	19	28	923	1	2	0	3	120	0.0265486725663717	0.107142857142857	0.130010834236186	0.824107142857143	0.025	0	0	1	1	109	0.00884955752212389	0.0263157894736842	0.124287343215507	0.211733462095606	0.00917431192660551	0.0176991150442478	2	53	229	1571	0.994611388414675	0.258994048452505	0.044613147583807	Inf	0.285827709408495	1.57205240174672	0.494565631312525	1.71443845108624	0.157205240174672	0.998810022312496	0.140080051412335	1	111	82
TCGA-YB-A89D-01A-12D-A36O-08	0	1	0	1	383	2	10	73	83	298	12218	0	6	4	10	3236	1	7	2	10	3638	2	86	23	111	2621	5	135	27	167	2723	3	64	1	68	488	0.177545691906005	0.407185628742515	0.179214102093279	2.27206243251202	0.139344262295082	0	47	1	48	462	0.12532637075718	0.432432432432432	0.17626859977108	2.45325845325845	0.103896103896104	0.0130548302872063	5	52	950	4394	0.981880113551419	0.444783348834724	0.168362353057096	Inf	0.493444136657433	2.41082706766917	0.112373548836632	3.4678368601666	0.225010526315789	0.999315644435343	0.192752779578904	1	378	293
TCGA-YH-A8SY-01A-11D-A377-08	0	0	1	1	163	2	7	37	44	117	4797	1	3	0	4	1025	3	2	1	6	1144	1	6	52	59	1244	1	4	43	48	1384	0	0	3	3	153	0.0184049079754601	0.0625	0.110549132947977	0.565359477124183	0.0196078431372549	0	1	1	2	120	0.0122699386503067	0.0338983050847458	0.0964630225080386	0.351412429378531	0.0166666666666667	0.0245398773006135	4	93	273	2355	0.992131130986764	0.37111992017089	0.123423350129336	Inf	0.396963860881387	0	1	0	0.405320994794679	0.990789551019318	0.379275074414963	0.0476190476190476	159	113
TCGA-YY-A8LH-01A-11D-A36O-08	0	0	0	0	206	1	5	28	33	172	7052	5	8	2	15	1575	1	10	1	12	1772	3	13	55	71	1733	7	30	37	74	1972	1	8	5	14	277	0.0679611650485437	0.189189189189189	0.140466531440162	1.34686310859596	0.0505415162454874	2	5	3	10	232	0.0485436893203883	0.140845070422535	0.133871898442008	1.05208839242351	0.0431034482758621	0.0533980582524272	11	91	509	3196	0.842537186438696	0.759047999620389	0.410066361945735	Inf	0.78498786548018	2.18369351669941	0.148965132973107	2.69009916234203	0.632954642521568	0.946445102251399	0.598067135099529	0.168091511920334	195	161
TCGA-Z5-AAPL-01A-12D-A40W-08	0	0	0	0	87	1	6	20	26	60	2460	3	5	1	9	602	1	3	1	5	597	0	1	27	28	632	2	5	11	18	629	1	0	0	1	90	0.0114942528735632	0.0555555555555556	0.14308426073132	0.388271604938272	0.0111111111111111	0	0	0	0	75	0	0	0.118670886075949	0	0	0.0114942528735632	1	39	165	1096	0.996111221889071	0.17044333574001	0.00850323865457752	Inf	0.191060606060606	3.82121212121212	0.245681991284304	6.6254079852899	0	1	0	1	86	59
Totals	4	11	19	34	38788	240	885	3382	4267	34281	1405521	338	1661	785	2784	326578	337	1629	817	2783	331644	363	3096	11235	14694	370209	403	3459	10158	14020	377090	124	825	575	1524	47540	0.0392905022171806	0.108701854493581	0.126070699302554	0.862229329217171	0.0320572149768616	99	726	630	1455	45523	0.0375116015262452	0.0990200081665986	0.122965676145096	0.805265430734976	0.0319618654306614	0.0368155099515314	1428	20731	93063	654236	1	0.484247044424631	0.462493095952942	Inf	0.517482184269196	2.33772513350329	1.83365507621304e-34	2.88710050977105	0.452306374466302	1	0.419614434739175	1.30263136749755e-209	37360	32853
