Chromosome Arm	TCGA-AF-2691-01A-01D-1167-02	TCGA-AF-2692-01A-01D-1167-02	TCGA-AF-3913-01A-02D-1115-02	TCGA-AG-3574-01A-01D-1167-02	TCGA-AG-3727-01A-01D-1167-02	TCGA-AG-3728-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3878-01A-02D-1167-02	TCGA-AG-3881-01A-01D-0957-02	TCGA-AG-3882-01A-01D-0957-02	TCGA-AG-3885-01A-01D-0957-02	TCGA-AG-3887-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3890-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3892-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3893-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3894-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3896-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3898-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3901-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3902-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3909-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-3999-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-4001-01A-02D-1115-02	TCGA-AG-4005-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-4007-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-4008-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-4015-01A-01D-1115-02	TCGA-AG-A002-01A-01D-A077-02	TCGA-AG-A008-01A-01D-A077-02	TCGA-AG-A00Y-01A-02D-A077-02	TCGA-AG-A011-01A-01D-A077-02	TCGA-AG-A01N-01A-01D-A077-02	TCGA-AG-A01W-01A-21D-A079-02	TCGA-AG-A01Y-01A-41D-A079-02	TCGA-AG-A020-01A-21D-A079-02	TCGA-AG-A032-01A-01D-A077-02
1p	0.000	-0.418	0.000	0.000	0.000	-0.349	0.000	-0.395	0.451	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.320	0.000	0.000	0.000	-0.517	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.401	0.000	0.000	-0.607	0.000	0.000	-0.066	0.000	0.000	-0.516
1q	0.000	0.729	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.130	0.451	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.462	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.401	0.000	0.000	0.425	0.000	0.821	0.384	0.000	0.000	0.438
2p	0.000	0.000	0.000	0.794	0.000	0.000	0.000	-0.429	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.463	0.802	0.000	0.461	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.422	0.000	0.000	0.000	0.301
2q	0.000	0.000	0.330	0.794	0.000	0.000	0.000	-0.429	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.380	0.335	0.000	0.000	0.000	0.501	0.802	0.000	0.461	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.422	0.436	0.000	0.000	0.301
3p	0.000	0.000	1.018	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.419	0.000	0.208	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.576	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.539	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
3q	0.000	0.000	1.018	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.419	0.000	0.532	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.576	0.000	0.000	0.000	0.000	0.335	0.000	0.539	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
4p	0.000	-0.398	0.000	0.000	0.000	-0.410	0.000	-0.454	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.771	0.000	0.000	-0.369	0.000	0.063	-0.337	-0.529	-0.322	-0.545	0.000	0.000	-0.578	0.000	-0.459	-0.660	0.720	0.000	-0.480	-0.789	0.000	0.000
4q	0.000	-0.398	0.000	0.000	0.000	-0.410	0.000	-0.454	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.546	0.000	0.000	-0.369	0.000	0.509	-0.337	-0.529	-0.322	-0.545	0.000	0.000	-0.578	0.000	-0.459	-0.660	0.000	0.000	-0.480	-0.789	0.000	0.000
5p	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.423	-0.451	0.946	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.401	0.000	0.000	0.000	-0.557	0.000	0.000	0.444	0.000	-0.556	0.000	0.000	0.000	0.000	0.411	-0.468	0.000	0.000	0.802
5q	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.430	0.000	-0.423	-0.451	0.946	0.000	-0.337	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.401	0.000	0.000	0.000	-0.557	0.000	0.000	0.444	0.000	-0.556	0.000	0.000	0.000	0.000	0.411	-0.468	-0.757	0.000	0.802
6p	0.000	-0.409	0.523	0.000	0.000	0.730	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.508	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.517	0.473	0.000	0.000	0.000	-0.398	0.000	-0.553	0.411	0.000	0.000	0.000	0.000
6q	0.000	-0.409	0.523	0.000	0.000	0.730	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.508	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.014	0.473	0.000	0.000	0.000	-0.398	0.000	-0.553	0.411	0.000	0.000	0.000	0.000
7p	0.000	0.000	1.131	0.000	0.000	0.454	-0.368	0.000	0.508	1.449	0.000	0.324	0.000	0.484	0.000	0.581	0.550	0.000	0.000	0.744	0.000	1.390	0.000	1.433	0.393	1.335	0.000	-0.352	0.000	0.000	0.796	0.472	0.000	0.000	0.393
7q	0.000	0.000	1.131	0.000	0.000	0.454	-0.368	0.000	0.508	1.449	0.000	0.324	0.000	0.484	0.000	0.581	0.550	0.000	0.000	0.744	0.561	1.390	0.000	0.477	0.000	0.000	0.000	-0.352	0.000	0.000	0.796	0.472	0.000	0.000	0.393
8p	0.077	-0.382	-0.113	0.800	-0.881	-0.328	0.000	0.218	0.000	-1.046	0.809	-0.354	0.000	-0.626	0.000	-0.106	0.307	0.000	0.269	0.000	-0.535	-0.988	0.083	-0.079	-0.362	0.131	0.000	0.000	-0.747	-0.433	-0.819	0.336	0.788	-0.336	0.407
8q	0.486	0.000	0.694	0.800	0.000	0.000	0.000	0.613	0.000	0.000	0.809	0.000	0.000	0.000	0.000	0.578	0.307	0.000	0.812	0.000	1.559	0.000	0.532	0.953	1.065	0.564	0.000	0.000	0.557	1.255	0.946	0.336	1.566	-0.336	0.407
9p	0.000	0.000	1.251	0.000	0.000	0.000	-0.367	2.732	-0.368	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.564	0.000	0.000	0.467	0.000	0.000	1.026	0.000	0.000	0.000	1.127	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.898	0.000	0.902	0.372
9q	0.000	-0.372	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.367	0.000	-0.368	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.564	0.000	0.000	0.467	0.000	0.000	0.436	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.898	0.000	0.902	0.372
10p	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.324	-0.323	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.078	0.000	-0.350	0.000	-0.427	0.000	0.539	0.000	-0.752	0.000
10q	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.414	0.000	-0.397	0.000	0.000	-0.847	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.344	0.000	-0.323	0.483	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.541	0.000	-0.350	0.000	-0.427	0.000	0.539	0.000	-0.752	0.000
11p	0.000	0.685	0.571	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.416	0.000	-0.560	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.356	0.000	0.472	0.000	0.000	0.000	-0.358	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.728	0.000
11q	0.000	-0.436	0.571	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.416	0.000	-0.560	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.356	0.000	0.472	0.000	0.000	0.000	-0.358	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.728	0.000
12p	0.000	0.000	-0.584	0.838	0.000	-0.382	0.000	0.000	0.000	0.000	0.819	0.000	0.000	0.000	0.000	0.418	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.428	0.000	0.000	0.000	-1.044	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.430	0.000	0.000	0.000
12q	0.000	0.000	0.000	0.838	0.000	-0.382	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.418	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.318	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
13q	0.720	0.941	1.004	0.000	0.868	1.274	0.000	0.000	1.460	2.510	0.741	0.359	0.000	1.600	0.713	2.329	0.000	0.000	0.452	0.711	1.896	0.924	3.417	0.951	0.645	1.134	0.000	0.000	2.613	0.000	0.000	0.000	0.770	0.000	1.879
14q	0.000	-0.437	0.000	0.000	-0.869	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.436	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.602	-0.491	0.000	0.000	-0.528	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.431	0.817	0.000	-0.518
15q	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.445	0.000	-0.362	-0.439	0.000	0.000	-0.387	0.000	-0.606	0.000	0.000	0.000	0.450	0.000	-0.677	-0.478	0.000	-0.483	0.000	-0.470	-0.511	0.000	-0.351	-0.674	-0.539	0.000	0.566	0.000	0.000	-0.496
16p	0.000	0.000	0.472	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.346	0.000	0.477	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.814	0.000	0.000	-0.504	0.311	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.698	0.000	0.000	0.000	0.444
16q	0.000	0.000	0.472	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.346	0.000	0.477	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.814	0.000	0.000	-0.504	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.698	0.307	0.000	0.000	0.444
17p	-0.436	-0.379	0.000	0.000	-0.883	0.000	0.000	-0.302	0.317	-0.509	0.000	-0.346	0.000	-0.586	0.000	0.000	-0.565	0.000	-0.529	-0.622	-0.456	-0.610	-0.510	0.514	-0.549	-0.476	0.000	-0.397	-0.457	-0.463	-0.615	-0.474	-0.041	0.000	0.000
17q	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.317	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.529	0.000	-0.456	0.000	0.000	1.035	0.000	-0.476	0.000	-0.397	0.000	0.000	0.000	0.000	0.721	0.000	0.000
18p	0.000	-0.458	-0.795	-0.857	0.000	-0.862	0.000	0.000	-0.525	0.000	-0.857	-0.463	0.000	-0.750	0.000	-0.706	-0.742	0.603	-0.390	-1.072	-1.085	-0.640	0.000	-0.536	-0.600	-0.585	0.000	-0.880	-0.147	-0.618	-0.461	-0.468	-0.050	-0.835	-0.540
18q	0.000	-0.458	-0.795	-0.857	-0.867	-0.862	0.000	-0.986	-0.525	-1.067	-0.857	-0.463	0.000	-0.750	0.000	-0.706	-0.742	0.603	-0.390	-1.072	-1.085	-0.640	-0.552	-0.536	-0.600	-0.585	0.000	-0.880	-0.694	-0.618	-0.461	-0.943	-0.797	-0.835	-0.540
19p	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.426	-0.325	0.592	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.593	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.430	0.000	1.025	0.000	-0.453	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.476
19q	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.426	-0.325	0.592	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.593	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.430	0.000	0.500	0.000	0.086	0.000	0.000	0.000	-0.418	0.000	0.000	0.000	0.000	0.476
20p	0.000	0.000	0.962	1.546	-0.846	1.527	-0.359	0.000	0.000	0.000	0.875	1.151	0.000	1.681	0.838	1.045	0.384	0.000	0.341	1.600	0.754	2.072	0.526	2.476	1.346	0.000	0.000	-0.318	1.671	0.693	-0.454	0.522	-0.790	-0.459	2.163
20q	1.118	0.000	2.320	2.398	0.817	1.527	-0.359	0.000	2.389	0.440	0.875	1.151	0.000	1.681	0.838	1.045	0.384	0.000	0.869	1.600	0.754	2.072	0.526	2.476	1.346	2.819	0.000	0.805	1.339	0.693	2.575	0.983	-0.057	1.224	2.163
21q	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.400	0.000	-0.471	-0.593	0.476	0.000	-0.801	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.487	0.000	0.000	-0.368	0.000	-0.316	0.000	0.000	-0.338	-0.519	0.000	0.000	0.000	0.469	-0.468	0.000	-0.824	-0.941	0.000
22q	0.000	-0.539	0.000	0.000	0.000	-0.395	0.000	0.000	0.000	-0.566	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.457	0.000	-0.513	0.000	0.000	-0.453	0.000	0.000	-0.317	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.837	0.000
Xq	0.000	1.015	1.215	0.892	-0.841	1.313	-0.590	0.605	0.971	0.000	0.000	0.625	0.000	2.323	0.000	0.000	1.905	0.000	0.992	-0.328	0.000	0.394	0.490	2.402	1.965	0.509	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.801	0.000	0.374
