# Non-clustered (scattered) mutations all scattered mutation 
Sample	A_T_coord_clusters	G_C_coord_clusters	Non_coord_clusters	clusters	mutations	complex	insertions	deletions	indels	substitutions	bases	A_to_T	A_to_G	A_to_C	A	a	T_to_A	T_to_C	T_to_G	T	t	G_to_C	G_to_T	G_to_A	G	g	C_to_G	C_to_A	C_to_T	C	c	tCw_to_G	tCw_to_A	tCw_to_T	tCw	tcw	tCw_per_mut	tCw_per_C	tcw_per_c	enrich_tCw	freq_tCw	wGa_to_C	wGa_to_T	wGa_to_A	wGa	wga	wGa_per_mut	wGa_per_G	wga_per_g	enrich_wGa	freq_wGa	[tCw_to_G+tCw_to_T]_per_mut	tCw_to_G+tCw_to_T	[(C_to_G)+(C_to_T)]-[(tCw_to_G)+(tCw_to_T)]	tcw+wga	c-tcw	Fisher_p-value_tCw	odds_ratio_tCw	95%_confidence_lower_tCw	95%_confidence_upper_tCw	APOBEC_enrich	tCw_to_G_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_G	odds_ratio_tCw_to_G	tCw_to_T_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_T	odds_ratio_tCw_to_T	p-value_GvT_skew	non-APOBEC_mutations	non-APOBEC_substitutions
TCGA-AF-2687-01A-02D-1733-10	0	0	0	0	187	0	0	3	3	184	7544	3	36	1	40	1739	2	25	0	27	1758	5	12	52	69	2032	0	8	40	48	2015	0	0	3	3	247	0.0160427807486631	0.0625	0.12258064516129	0.509868421052632	0.0121457489878543	1	1	3	5	273	0.0267379679144385	0.072463768115942	0.134350393700787	0.539364017624887	0.0183150183150183	0.0374331550802139	7	90	520	3527	0.971910183171664	0.527608771613157	0.240139497485543	Inf	0.561637589214909	1.55653846153846	0.497676919061715	1.69540021027199	0.507566889632107	0.982522040763797	0.473277769099589	0.0405594405594406	180	177
TCGA-AF-2689-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	63	0	1	0	1	62	2542	4	8	3	15	646	2	7	1	10	641	3	2	17	22	610	3	3	9	15	645	0	1	1	2	95	0.0317460317460317	0.133333333333333	0.147286821705426	0.905263157894737	0.0210526315789474	1	1	2	4	97	0.0634920634920635	0.181818181818182	0.159016393442623	1.14339268978444	0.0412371134020619	0.0634920634920635	4	28	192	1063	0.742858943593363	0.791056608024652	0.251284713013187	Inf	0.817057291666667	1.08940972222222	0.631701070045371	1.10723120871303	0.754206730769231	0.782391245890608	0.722312315998172	0.545454545454546	59	58
TCGA-AF-2691-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	72	0	0	0	0	72	2952	5	2	0	7	716	2	5	1	8	733	1	12	16	29	730	6	10	12	28	773	1	2	1	4	120	0.0555555555555556	0.142857142857143	0.155239327296248	0.920238095238095	0.0333333333333333	0	1	0	1	105	0.0138888888888889	0.0344827586206897	0.143835616438356	0.239737274220033	0.00952380952380952	0.0277777777777778	2	33	225	1278	0.974783575368433	0.344406008915689	0.0584485900576782	Inf	0.381714285714286	0.954285714285714	0.6793360676997	0.946691255705624	0.238571428571429	0.989061082999538	0.210494807104675	1	70	70
TCGA-AF-2692-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	39	0	1	1	2	37	1517	2	4	0	6	352	0	2	0	2	381	1	1	12	14	405	1	2	12	15	379	1	0	0	1	51	0.0256410256410256	0.0666666666666667	0.134564643799472	0.495424836601307	0.0196078431372549	0	1	2	3	47	0.0769230769230769	0.214285714285714	0.116049382716049	1.84650455927052	0.0638297872340425	0.0769230769230769	3	23	98	686	0.649788517365541	0.913123603962913	0.228962991211589	Inf	0.923076923076923	4	0.236184178538435	6.96961280997499	0.666666666666667	0.820074959172692	0.636667426956065	1	36	34
TCGA-AF-2693-01A-02D-1733-10	0	0	0	0	252	1	0	3	3	248	10168	4	53	1	58	2508	6	56	1	63	2541	2	14	43	59	2625	1	12	55	68	2494	0	1	3	4	367	0.0158730158730159	0.0588235294117647	0.147153167602245	0.399743548645616	0.0108991825613079	0	6	4	10	384	0.0396825396825397	0.169491525423729	0.146285714285714	1.15863347457627	0.0260416666666667	0.0277777777777778	7	94	751	4368	0.994317960444746	0.433174487177696	0.197687903714416	Inf	0.472413020263411	0	1	0	0.486874643332699	0.992332504169383	0.447453461692189	0.00579710144927537	245	241
TCGA-AF-3400-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	29	1	0	0	0	28	1148	1	4	0	5	267	0	1	1	2	262	1	1	10	12	328	1	2	6	9	291	0	0	0	0	38	0	0	0.130584192439863	0	0	0	0	0	0	33	0	0	0.100609756097561	0	0	0	0	18	71	548	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	29	28
TCGA-AF-3913-01A-02W-1073-09	0	0	0	0	114	0	1	2	3	110	4510	3	3	4	10	1067	3	8	1	12	1155	10	13	16	39	1206	6	9	34	49	1082	4	2	3	9	160	0.0789473684210526	0.183673469387755	0.147874306839187	1.24209183673469	0.05625	4	0	3	7	165	0.0614035087719298	0.179487179487179	0.13681592039801	1.31188811188811	0.0424242424242424	0.12280701754386	14	52	325	1963	0.0823595980696246	1.62575476059343	0.916942857031148	Inf	1.49333333333333	3.52	0.000781971771616899	6.0323818857151	0.8448	0.731823719315564	0.823700596161857	0.722393472194293	100	96
TCGA-AF-4110-01A-02D-1733-10	0	0	0	0	134	1	5	1	6	127	5207	2	30	1	33	1283	2	17	1	20	1288	2	7	24	33	1261	5	9	27	41	1375	1	2	2	5	195	0.0373134328358209	0.121951219512195	0.141818181818182	0.859912445278299	0.0256410256410256	1	2	1	4	175	0.0298507462686567	0.121212121212121	0.13877874702617	0.873419913419913	0.0228571428571429	0.0373134328358209	5	53	370	2266	0.922739895345679	0.577865232983886	0.21810962137464	Inf	0.614165890027959	2.03552123552124	0.257587762371384	2.44869164634099	0.419077901430843	0.980107370662576	0.382866379212585	1	129	122
TCGA-AF-5654-01A-01D-1657-10	0	0	0	0	175	2	3	0	3	170	6970	4	21	1	26	1703	2	20	0	22	1658	3	8	41	52	1866	6	12	52	70	1743	1	2	3	6	210	0.0342857142857143	0.0857142857142857	0.120481927710843	0.711428571428571	0.0285714285714286	2	3	0	5	247	0.0285714285714286	0.0961538461538462	0.132368703108253	0.726409218312052	0.0202429149797571	0.0342857142857143	6	96	457	3152	0.991593353645053	0.431143247595515	0.182621712577339	Inf	0.464538550650019	2.63238512035011	0.0954677958442057	3.44663156508376	0.254746947130656	0.999609057162411	0.229958950740734	1	169	164
TCGA-AF-6136-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	195	1	1	3	4	190	7790	0	33	1	34	1893	1	35	1	37	1987	4	6	54	64	1953	1	10	44	55	1957	0	0	3	3	296	0.0153846153846154	0.0545454545454545	0.151251916198263	0.360626535626536	0.0101351351351351	3	1	1	5	271	0.0256410256410256	0.078125	0.138760880696365	0.563018911439114	0.018450184501845	0.0358974358974359	7	96	567	3343	0.994646040006969	0.429977877718681	0.196108287521067	Inf	0.468656358623996	4.13756613756614	0.0244307622466114	8.83551971480781	0.281467084188173	0.999785503319856	0.250944231100451	1	188	183
TCGA-AF-6655-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	140	0	0	7	7	133	5453	2	25	1	28	1318	2	23	0	25	1439	2	12	30	44	1329	1	12	23	36	1367	0	2	1	3	217	0.0214285714285714	0.0833333333333333	0.158741770299927	0.524961597542243	0.0138248847926267	1	2	1	4	186	0.0285714285714286	0.0909090909090909	0.139954853273138	0.649560117302053	0.021505376344086	0.0214285714285714	3	53	403	2293	0.99296421443289	0.322153966507965	0.0848803729293759	Inf	0.358383551931939	2.22994210090984	0.38531249968332	2.84339047792582	0.252446275574699	0.997963305666709	0.223202439824267	1	137	130
TCGA-AF-6672-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	146	1	1	2	3	142	5822	3	23	1	27	1415	4	28	1	33	1505	3	10	22	35	1417	7	4	36	47	1485	4	1	2	7	223	0.0479452054794521	0.148936170212766	0.15016835016835	0.991794676080527	0.031390134529148	1	1	2	4	207	0.0273972602739726	0.114285714285714	0.146083274523642	0.782332643202208	0.0193236714975845	0.0616438356164384	9	59	430	2472	0.69399176727999	0.876988225611973	0.435212039549407	Inf	0.893228454172367	3.37441860465116	0.00957305475325146	5.74340527944726	0.465437048917402	0.978982832575531	0.425928993184406	1	137	133
TCGA-AG-3574-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	41	0	1	0	1	40	1640	1	0	0	1	416	1	4	1	6	414	0	4	15	19	391	0	6	8	14	419	0	2	0	2	57	0.0487804878048781	0.142857142857143	0.136038186157518	1.05012531328321	0.0350877192982456	0	2	0	2	61	0.0487804878048781	0.105263157894737	0.156010230179028	0.674719585849871	0.0327868852459016	0	0	23	118	692	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	41	40
TCGA-AG-3575-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	51	0	0	1	1	50	2050	2	4	3	9	508	1	2	0	3	522	1	1	19	21	483	0	6	11	17	537	0	2	0	2	82	0.0392156862745098	0.117647058823529	0.152700186219739	0.770444763271162	0.024390243902439	0	1	0	1	62	0.0196078431372549	0.0476190476190476	0.128364389233954	0.370967741935484	0.0161290322580645	0	0	31	144	876	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	51	50
TCGA-AG-3578-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	25	1	0	0	0	24	984	2	0	0	2	246	0	2	1	3	245	0	1	7	8	242	1	3	7	11	251	0	0	0	0	38	0	0	0.151394422310757	0	0	0	0	0	0	36	0	0	0.148760330578512	0	0	0	0	15	74	419	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	25	24
TCGA-AG-3580-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	40	0	0	1	1	39	1599	0	2	0	2	417	0	1	0	1	376	0	4	19	23	406	0	2	11	13	400	0	1	0	1	62	0.025	0.0769230769230769	0.155	0.496277915632754	0.0161290322580645	0	2	2	4	66	0.1	0.173913043478261	0.16256157635468	1.06982872200264	0.0606060606060606	0.05	2	28	128	678	0.961520164501166	0.378663458912945	0.0635199228230906	Inf	0.419791666666667	NaN	1	0	0.419791666666667	0.961520164501166	0.378663458912945	0.444444444444444	38	37
TCGA-AG-3581-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	54	0	1	0	1	53	2173	1	2	0	3	542	1	1	1	3	522	4	2	14	20	551	3	1	23	27	558	0	0	3	3	65	0.0555555555555556	0.111111111111111	0.116487455197133	0.953846153846154	0.0461538461538462	0	0	0	0	84	0	0	0.152450090744102	0	0	0.0555555555555556	3	41	149	960	0.944680137134654	0.471674913973893	0.12233088153457	Inf	0.507474069554606	0	1	0	0.603482677308181	0.889032018883545	0.568727699693672	0.1	51	50
TCGA-AG-3582-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	35	0	0	1	1	34	1394	0	4	1	5	302	0	2	1	3	341	1	5	10	16	379	1	4	5	10	372	0	0	0	0	48	0	0	0.129032258064516	0	0	0	1	0	1	37	0.0285714285714286	0.0625	0.0976253298153034	0.640202702702703	0.027027027027027	0	0	17	85	666	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	35	34
TCGA-AG-3583-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	59	0	0	2	2	57	2337	0	1	0	1	601	0	1	2	3	563	1	1	15	17	565	1	2	33	36	608	1	1	1	3	85	0.0508474576271186	0.0833333333333333	0.139802631578947	0.596078431372549	0.0352941176470588	0	0	2	2	75	0.0338983050847458	0.117647058823529	0.132743362831858	0.886274509803922	0.0266666666666667	0.0677966101694915	4	46	160	1013	0.921450382319253	0.550765051570747	0.178766847320925	Inf	0.5865	3.665625	0.255368443945051	6.31467879708456	0.458203125	0.96631423603853	0.422302465956329	0.523809523809524	55	53
TCGA-AG-3584-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	33	0	1	0	1	32	1312	0	2	1	3	316	0	0	1	1	347	1	3	7	11	307	0	2	15	17	342	0	0	0	0	57	0	0	0.166666666666667	0	0	0	0	0	0	48	0	0	0.156351791530945	0	0	0	0	23	105	544	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	33	32
TCGA-AG-3586-01A-02W-0831-10	0	0	0	0	66	2	1	0	1	63	2583	1	6	3	10	653	5	7	3	15	621	2	6	14	22	650	2	3	11	16	659	0	2	1	3	107	0.0454545454545455	0.1875	0.16236722306525	1.15478971962617	0.0280373831775701	0	2	1	3	101	0.0454545454545455	0.136363636363636	0.155384615384615	0.877587758775878	0.0297029702970297	0.0303030303030303	2	27	208	1101	0.956333194677374	0.392291051585903	0.0659830176529992	Inf	0.434018567639257	0	1	0	0.503461538461539	0.923590462534875	0.460493329250003	0.454545454545454	64	61
TCGA-AG-3587-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	66	1	1	0	1	64	2624	1	4	3	8	667	0	4	0	4	629	0	6	16	22	644	2	4	24	30	684	1	0	0	1	95	0.0151515151515152	0.0333333333333333	0.138888888888889	0.24	0.0105263157894737	0	2	0	2	94	0.0303030303030303	0.0909090909090909	0.145962732919255	0.622823984526112	0.0212765957446809	0.0151515151515152	1	41	189	1139	0.998294509257684	0.147093438296597	0.00729645688180887	Inf	0.167296548248929	3.51322751322751	0.26539825862625	6.01323741558411	0	1	0	1	65	63
TCGA-AG-3593-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	75	1	0	0	0	74	3034	5	4	0	9	780	4	7	1	12	808	7	3	19	29	742	3	6	15	24	704	1	1	0	2	132	0.0266666666666667	0.0833333333333333	0.1875	0.444444444444444	0.0151515151515152	1	2	1	4	107	0.0533333333333333	0.137931034482759	0.144204851752022	0.956493715758943	0.0373831775700935	0.04	3	41	239	1207	0.982699648172881	0.369701831549227	0.0962834793194978	Inf	0.412514263978699	1.21004184100418	0.512072914268421	1.26233371281309	0.177947329559439	0.997735149956762	0.153140190257088	1	72	71
TCGA-AG-3594-01A-02W-0831-10	0	0	0	0	42	0	0	2	2	40	1640	0	2	1	3	440	0	3	0	3	358	0	2	13	15	414	0	4	15	19	428	0	1	0	1	55	0.0238095238095238	0.0526315789473684	0.128504672897196	0.409569377990431	0.0181818181818182	0	0	0	0	65	0	0	0.157004830917874	0	0	0	0	28	120	722	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	42	40
TCGA-AG-3598-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	72	0	0	0	0	72	2952	3	4	5	12	709	1	1	0	2	677	2	6	14	22	771	4	6	26	36	795	1	1	0	2	111	0.0277777777777778	0.0555555555555556	0.139622641509434	0.397897897897898	0.018018018018018	1	1	0	2	92	0.0277777777777778	0.0909090909090909	0.119325551232166	0.761857707509881	0.0217391304347826	0.0277777777777778	2	44	203	1363	0.986189962852864	0.305341467140413	0.0522826323630782	Inf	0.335403726708075	2.57142857142857	0.178267032320271	3.35335730804571	0	1	0	0.428571428571429	70	70
TCGA-AG-3599-01A-02W-0833-10	0	0	0	0	67	0	1	0	1	66	2706	1	2	0	3	634	1	5	0	6	663	3	2	21	26	709	0	7	24	31	700	0	0	0	0	94	0	0	0.134285714285714	0	0	0	0	0	0	93	0	0	0.131170662905501	0	0	0	0	48	187	1222	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	67	66
TCGA-AG-3600-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	95	0	2	1	3	92	3772	0	10	1	11	985	2	6	8	16	968	8	6	26	40	911	4	6	15	25	908	2	0	0	2	151	0.0210526315789474	0.08	0.166299559471366	0.481059602649007	0.0132450331125828	0	1	2	3	135	0.0315789473684211	0.075	0.148188803512623	0.506111111111111	0.0222222222222222	0.0421052631578947	4	49	286	1533	0.974637435920293	0.437705228077665	0.143177954078743	Inf	0.480010555482254	1.06002331002331	0.585176541892246	1.07200298278221	0.310250724884871	0.991894545185102	0.275000778078239	1	91	88
TCGA-AG-3601-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	107	0	0	0	0	107	4387	1	10	9	20	1187	4	5	4	13	1073	6	9	20	35	1078	3	10	26	39	1049	0	2	6	8	151	0.0747663551401869	0.205128205128205	0.143946615824595	1.42502971642044	0.0529801324503311	2	2	1	5	155	0.0467289719626168	0.142857142857143	0.14378478664193	0.993548387096774	0.032258064516129	0.0841121495327103	9	46	306	1821	0.39770693644189	1.16420921784854	0.569642809741127	Inf	1.13743315508021	1.54466230936819	0.380461721883903	1.69976963411769	1.057757885763	0.501639333975813	1.06810760010109	0.0968421052631578	98	98
TCGA-AG-3602-01A-02W-0833-10	0	0	0	0	47	0	0	0	0	47	1927	0	2	0	2	435	1	1	2	4	453	0	2	13	15	538	4	2	20	26	501	2	0	1	3	65	0.0638297872340425	0.115384615384615	0.129740518962076	0.889349112426036	0.0461538461538462	0	1	1	2	55	0.0425531914893617	0.133333333333333	0.102230483271375	1.30424242424242	0.0363636363636364	0.0851063829787234	4	33	120	919	0.634328559473082	0.928333933677251	0.295946229556391	Inf	0.936036036036036	4.32916666666667	0.0695089645240409	7.63081579814389	0.524747474747475	0.906327691656403	0.494338177872082	1	43	43
TCGA-AG-3605-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	60	0	0	0	0	60	2460	1	3	0	4	623	1	2	3	6	604	2	6	14	22	615	2	4	22	28	618	1	1	2	4	86	0.0666666666666667	0.142857142857143	0.13915857605178	1.0265780730897	0.0465116279069767	1	3	0	4	79	0.0666666666666667	0.181818181818182	0.128455284552846	1.41542002301496	0.0506329113924051	0.0666666666666667	4	36	165	1068	0.800300694072482	0.719358839173359	0.23123605119834	Inf	0.747272727272727	3.73636363636364	0.0903759653304243	6.45628235345358	0.415151515151515	0.96177195405825	0.38095329791661	1	56	56
TCGA-AG-3608-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	57	0	0	0	0	57	2337	0	2	0	2	603	0	4	0	4	519	1	4	21	26	595	2	5	18	25	620	0	0	0	0	71	0	0	0.114516129032258	0	0	1	1	0	2	81	0.0350877192982456	0.0769230769230769	0.136134453781513	0.565052231718899	0.0246913580246914	0.0175438596491228	1	41	152	1063	0.99610599631091	0.17070013831812	0.00852160014611592	Inf	0.19031954887218	2.66447368421053	0.331728317230046	3.49102654455274	0	1	0	1	56	56
TCGA-AG-3609-01A-02W-0833-10	0	0	0	0	90	1	0	0	0	89	3649	6	6	3	15	907	5	2	1	8	923	4	4	19	27	850	7	8	24	39	969	2	0	5	7	138	0.0777777777777778	0.179487179487179	0.142414860681115	1.2603121516165	0.0507246376811594	1	1	3	5	123	0.0555555555555556	0.185185185185185	0.144705882352941	1.27973501957242	0.040650406504065	0.122222222222222	11	43	261	1558	0.148846187564772	1.52664282668675	0.794005127752445	Inf	1.41968213424152	1.90073145245559	0.203525136636463	2.23722641967459	1.29662300632629	0.274669159675628	1.36416795898325	0.0995327192661963	79	78
TCGA-AG-3611-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	51	0	0	0	0	51	2091	0	2	3	5	495	1	5	0	6	536	1	3	15	19	548	1	0	20	21	512	0	0	1	1	70	0.0196078431372549	0.0476190476190476	0.13671875	0.348299319727891	0.0142857142857143	0	0	0	0	71	0	0	0.12956204379562	0	0	0.0196078431372549	1	36	141	919	0.994600981207592	0.181203670599672	0.00900962010943809	Inf	0.203181905309565	0	1	0	0.214792299898683	0.992875075370347	0.191860296300339	1	50	50
TCGA-AG-3612-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	70	0	0	0	0	70	2870	3	1	3	7	715	5	4	2	11	698	2	6	9	17	691	2	8	25	35	766	2	2	2	6	115	0.0857142857142857	0.171428571428571	0.150130548302872	1.14186335403727	0.0521739130434783	1	0	2	3	96	0.0428571428571429	0.176470588235294	0.138929088277858	1.27022058823529	0.03125	0.1	7	31	211	1246	0.312825090464445	1.33315144081974	0.575576317092341	Inf	1.27201297081566	5.17890995260664	0.0110721807668157	17.6565285466814	0.812378031781433	0.745682666763291	0.787478629666264	1	63	63
TCGA-AG-3726-01A-02W-0899-10	0	0	0	0	132	0	0	3	3	109	4469	4	5	2	11	1040	3	4	2	9	1025	5	9	31	45	1184	4	8	32	44	1220	1	3	0	4	137	0.0303030303030303	0.0909090909090909	0.112295081967213	0.809555408095554	0.0291970802919708	0	2	1	3	151	0.0227272727272727	0.0666666666666667	0.127533783783784	0.522737306843267	0.0198675496688742	0.0151515151515152	2	70	288	2116	0.998796732180341	0.209996134250832	0.0364525753915252	Inf	0.231867283950617	0.927469135802469	0.68341459128014	0.918423741415871	0.132495590828924	0.999649626824378	0.118551964757696	1	130	107
TCGA-AG-3727-01A-01W-0899-10	0	0	0	0	81	0	3	0	3	78	3198	0	2	2	4	797	4	2	4	10	729	0	5	20	25	844	1	4	34	39	828	1	2	1	4	122	0.0493827160493827	0.102564102564103	0.147342995169082	0.69609079445145	0.0327868852459016	0	0	2	2	112	0.0246913580246914	0.08	0.132701421800948	0.602857142857143	0.0178571428571429	0.0493827160493827	4	51	234	1438	0.957909295274051	0.482144993627464	0.157717694141611	Inf	0.51965811965812	7.14529914529915	0.140466228332337	Inf	0.39696106362773	0.985377793454174	0.361636315979205	0.545454545454546	77	74
TCGA-AG-3731-01A-11D-1733-10	0	0	0	0	211	0	1	8	9	202	8282	5	40	1	46	1944	1	29	1	31	2197	5	7	52	64	2060	9	7	45	61	2081	7	2	2	11	317	0.0521327014218009	0.180327868852459	0.152330610283518	1.1837927289652	0.0347003154574132	5	0	0	5	299	0.023696682464455	0.078125	0.145145631067961	0.538252508361204	0.0167224080267559	0.0663507109004739	14	97	616	3525	0.784257319643656	0.825949036830192	0.480574143344095	Inf	0.847870597870598	5.76205936920223	8.8005321593423e-09	34.2653481708913	0.138606239121703	0.999996589411097	0.120500918893341	0.000965052278614514	197	188
TCGA-AG-3732-01A-11D-1657-10	0	0	0	0	168	2	4	11	15	151	6191	5	34	1	40	1474	0	39	0	39	1623	2	6	31	39	1572	2	3	28	33	1522	0	2	3	5	221	0.0297619047619048	0.151515151515152	0.145203679369251	1.04346633758398	0.0226244343891403	0	0	2	2	207	0.0119047619047619	0.0512820512820513	0.131679389312977	0.389446302489781	0.00966183574879227	0.0297619047619048	5	58	428	2666	0.946497107853878	0.53706692114953	0.203512575915346	Inf	0.573727933541018	0	1	0	0.612624742594646	0.92366661802561	0.576841017804143	0.020979020979021	163	146
TCGA-AG-3742-01A-11D-1657-10	0	0	0	0	221	0	7	3	10	209	8569	3	29	1	33	1977	2	38	2	42	2156	3	9	53	65	2226	4	9	56	69	2210	2	3	4	9	313	0.0407239819004525	0.130434782608696	0.141628959276018	0.920961244617308	0.0287539936102236	0	3	2	5	303	0.0226244343891403	0.0769230769230769	0.136118598382749	0.565118050266565	0.0165016501650165	0.0361990950226244	8	108	616	3820	0.993479784833926	0.459417375437627	0.222462562259943	Inf	0.496641289744738	2.05751391465677	0.253043500242957	2.47982598541909	0.39640176337424	0.99840788515762	0.361296085989441	0.208695652173913	213	201
TCGA-AG-3878-01A-02W-0899-10	0	0	0	0	80	0	2	1	3	76	3116	2	2	1	5	793	1	3	3	7	766	0	6	20	26	745	2	7	29	38	812	1	1	0	2	113	0.025	0.0526315789473684	0.139162561576355	0.378202142524453	0.0176991150442478	0	1	0	1	119	0.0125	0.0384615384615385	0.159731543624161	0.240788623141564	0.00840336134453781	0.0125	1	50	232	1325	0.999702740037482	0.114298585363166	0.00569394316655243	Inf	0.131592292089249	3.35560344827586	0.276654417062384	5.7011441849014	0	1	0	1	79	75
TCGA-AG-3881-01A-01W-0899-10	0	0	0	0	96	0	0	2	2	93	3813	3	4	2	9	915	4	5	2	11	859	2	8	30	40	1035	4	5	24	33	1004	2	1	3	6	125	0.0625	0.181818181818182	0.124501992031873	1.46036363636364	0.048	0	2	0	2	120	0.0208333333333333	0.05	0.115942028985507	0.43125	0.0166666666666667	0.0520833333333333	5	55	245	1794	0.860388430233658	0.665789278396022	0.250902374460443	Inf	0.693537414965986	2.77414965986395	0.157110172666406	3.6576775613614	0.462358276643991	0.964112215827251	0.430858835512604	1	91	88
TCGA-AG-3882-01A-01W-0899-10	0	0	0	0	61	0	2	0	2	58	2378	0	3	0	3	608	2	1	1	4	534	1	5	23	29	604	1	5	16	22	632	0	1	2	3	79	0.0491803278688525	0.136363636363636	0.125	1.09090909090909	0.0379746835443038	0	0	2	2	84	0.0327868852459016	0.0689655172413793	0.139072847682119	0.495894909688013	0.0238095238095238	0.0655737704918033	4	37	163	1073	0.806321391262339	0.711825653836267	0.229075844562653	Inf	0.739787520574592	0	1	0	0.77772534214252	0.773839251435452	0.752475156564089	0.0476190476190476	57	54
TCGA-AG-3883-01A-02W-0899-10	0	0	0	0	125	0	0	3	3	122	5002	3	3	2	8	1178	2	4	2	8	1241	1	15	37	53	1341	4	7	42	53	1242	3	0	1	4	168	0.032	0.0754716981132075	0.135265700483092	0.557951482479784	0.0238095238095238	0	8	1	9	178	0.072	0.169811320754717	0.132736763609247	1.27930888276447	0.050561797752809	0.04	5	79	346	2237	0.990582326038399	0.409295898162432	0.156299592338998	Inf	0.444364161849711	4.47919075144509	0.0197152577133511	9.68237970611207	0.188995390356333	0.999826326901871	0.16799072207806	1	120	117
TCGA-AG-3885-01A-01W-0899-10	0	0	0	0	184	2	2	5	7	174	7134	1	31	2	34	1654	4	39	6	49	1648	3	5	38	46	1870	3	6	36	45	1962	0	1	5	6	234	0.0326086956521739	0.133333333333333	0.119266055045872	1.11794871794872	0.0256410256410256	0	2	1	3	235	0.016304347826087	0.0652173913043478	0.125668449197861	0.518963922294172	0.0127659574468085	0.0326086956521739	6	74	469	3363	0.935841637238321	0.581464995181953	0.244742602854985	Inf	0.612793176972281	0	1	0	0.662479110240304	0.901646714554492	0.632761250750744	0.0090497737556561	178	168
TCGA-AG-3887-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	76	0	2	2	4	72	2952	2	4	1	7	709	3	5	0	8	703	2	5	26	33	722	2	7	15	24	818	1	0	1	2	113	0.0263157894736842	0.0833333333333333	0.138141809290954	0.603244837758112	0.0176991150442478	1	1	1	3	91	0.0394736842105263	0.0909090909090909	0.126038781163435	0.721278721278721	0.032967032967033	0.0526315789473684	4	41	204	1336	0.862481973734597	0.639084200046394	0.207079308111785	Inf	0.671023965141612	3.77450980392157	0.0885215887369903	6.53551110699707	0.368244858919177	0.977882975604599	0.336003536109525	1	72	68
TCGA-AG-3890-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	77	0	1	1	2	74	3034	1	4	5	10	785	4	4	2	10	807	3	9	19	31	683	7	4	12	23	759	4	0	1	5	125	0.0649350649350649	0.217391304347826	0.164690382081686	1.32	0.04	3	2	2	7	100	0.0909090909090909	0.225806451612903	0.146412884333821	1.54225806451613	0.07	0.12987012987013	10	31	225	1217	0.100425880024363	1.74402368743155	0.85958266399154	Inf	1.56314363143631	4.48622222222222	0.000190548021900623	12.5846913052327	0.620215053763441	0.881365965798569	0.579705042991907	0.213756898640463	67	64
TCGA-AG-3892-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	2177	0	4	1	5	2170	88970	4	86	167	257	25094	9	93	183	285	24962	3	401	436	840	19440	2	375	411	788	19474	1	329	37	367	3617	0.168580615525953	0.465736040609137	0.185734825921742	2.50753211358096	0.101465302737075	1	344	34	379	3639	0.174092788240698	0.451190476190476	0.187191358024691	2.41031680602991	0.104149491618577	0.0335323840146991	73	779	7256	31658	1	0.408858018956454	0.330057561931899	Inf	0.459506718739486	2.145203969129	0.235302409109841	2.90850000882372	0.44955573142904	1	0.39919406125518	1.09380633530124e-19	2104	2097
TCGA-AG-3893-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	115	0	0	1	1	113	4633	4	4	4	12	1101	1	5	2	8	1096	5	8	32	45	1203	5	13	30	48	1233	2	5	3	10	163	0.0869565217391304	0.208333333333333	0.132197891321979	1.57592024539877	0.0613496932515337	1	1	0	2	171	0.0173913043478261	0.0444444444444444	0.14214463840399	0.312670565302144	0.0116959064327485	0.0521739130434783	6	66	334	2102	0.939869994592088	0.572235177669662	0.239518447999442	Inf	0.607784431137725	2.18802395209581	0.148730059187073	2.6957391215535	0.352907089047711	0.993392438207107	0.320100848947872	1	109	107
TCGA-AG-3894-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	104	0	2	2	4	99	4059	4	2	5	11	938	3	3	2	8	959	3	8	27	38	1073	8	3	31	42	1089	0	1	0	1	133	0.00961538461538462	0.0238095238095238	0.122130394857668	0.194951664876477	0.0075187969924812	0	2	0	2	131	0.0192307692307692	0.0526315789473684	0.122087604846226	0.431096826034552	0.0152671755725191	0	0	69	264	1898	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	104	99
TCGA-AG-3896-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	106	0	1	0	1	105	4305	5	5	3	13	1046	1	4	1	6	992	3	7	36	46	1138	3	2	35	40	1129	1	1	1	3	150	0.0283018867924528	0.075	0.132860938883968	0.5645	0.02	0	3	2	5	157	0.0471698113207547	0.108695652173913	0.137961335676626	0.787870396012185	0.0318471337579618	0.0377358490566038	4	73	307	1960	0.994611801433108	0.349935553004531	0.115846098950399	Inf	0.383603367316722	1.23072747014115	0.583007056697137	1.27672179077969	0.312015414965362	0.997413431830779	0.281760386416265	0.569230769230769	102	101
TCGA-AG-3898-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	110	0	1	0	1	108	4428	5	4	3	12	1117	3	3	2	8	1095	1	7	34	42	1115	3	6	37	46	1101	1	0	2	3	143	0.0272727272727273	0.0652173913043478	0.129881925522253	0.502128306476132	0.020979020979021	0	2	0	2	148	0.0181818181818182	0.0476190476190476	0.132735426008969	0.358751608751609	0.0135135135135135	0.0272727272727273	3	72	291	1925	0.997841788687788	0.275727960161342	0.0730856919143932	Inf	0.304604810996564	1.90378006872852	0.431358896066753	2.20401032433388	0.21451043027927	0.999405685927443	0.191820109372351	1	107	105
TCGA-AG-3901-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	66	0	0	0	0	66	2706	0	2	0	2	629	2	4	2	8	684	2	4	18	24	740	1	2	29	32	653	0	0	0	0	81	0	0	0.124042879019908	0	0	1	1	0	2	85	0.0303030303030303	0.0833333333333333	0.114864864864865	0.725490196078431	0.0235294117647059	0.0151515151515152	1	49	166	1227	0.998095610752257	0.150949872309468	0.00757284256879525	Inf	0.167831325301205	2.79718875502008	0.317861734203103	3.69040186955357	0	1	0	1	65	65
TCGA-AG-3902-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	135	0	0	0	0	134	5494	9	10	7	26	1430	6	6	9	21	1405	7	9	32	48	1321	8	5	26	39	1338	2	2	3	7	207	0.0518518518518519	0.179487179487179	0.154708520179372	1.16016350798959	0.0338164251207729	3	2	2	7	190	0.0518518518518519	0.145833333333333	0.143830431491294	1.01392543859649	0.0368421052631579	0.0740740740740741	10	63	397	2262	0.665574083173541	0.90446081351694	0.466681190490759	Inf	0.917497670887823	2.23257766582704	0.061676061620389	2.84732966602793	0.577390775644923	0.945503596958035	0.537623713907087	1	125	124
TCGA-AG-3909-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	82	0	0	0	0	82	3362	1	4	0	5	738	1	5	1	7	836	1	10	23	34	850	3	3	30	36	938	0	0	1	1	116	0.0121951219512195	0.0277777777777778	0.123667377398721	0.224616858237548	0.00862068965517241	1	0	0	1	89	0.0121951219512195	0.0294117647058824	0.104705882352941	0.280898876404494	0.0112359550561798	0.024390243902439	2	55	205	1583	0.991432612403225	0.280919762524089	0.0483808741110761	Inf	0.306033376123235	2.18048780487805	0.386701956931292	2.57207256397546	0.164565117349287	0.998314276983332	0.14857698160351	1	80	80
TCGA-AG-3999-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	97	0	1	0	1	94	3854	1	2	5	8	867	1	2	3	6	896	1	4	32	37	1003	3	4	36	43	1088	1	0	0	1	125	0.0103092783505155	0.0232558139534884	0.114889705882353	0.202418604651163	0.008	1	1	2	4	116	0.0412371134020619	0.108108108108108	0.115653040877368	0.934762348555452	0.0344827586206897	0.0412371134020619	4	68	241	1850	0.971256779825854	0.451673146917497	0.149068319499254	Inf	0.482019363762102	4.33817427385892	0.0686120765748946	7.66247955838648	0.255186721991701	0.997420588776692	0.232709273498493	1	93	90
TCGA-AG-4001-01A-02W-1073-09	0	0	0	0	124	0	1	2	3	120	4920	2	6	1	9	1134	2	3	1	6	1237	4	7	47	58	1238	4	4	39	47	1311	1	1	3	5	164	0.0403225806451613	0.106382978723404	0.12509534706331	0.850415153087701	0.0304878048780488	1	2	1	4	168	0.032258064516129	0.0689655172413793	0.135702746365105	0.508210180623974	0.0238095238095238	0.0483870967741935	6	88	332	2217	0.986575668251517	0.455399346173571	0.192095701750374	Inf	0.490066649577032	1.91942771084337	0.281353547822045	2.22498651323768	0.357102829924349	0.997047419557552	0.325834447082321	0.619909502262444	118	114
TCGA-AG-4005-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	120	0	1	3	4	115	4715	4	7	2	13	1141	5	6	2	13	1090	3	8	38	49	1194	4	6	30	40	1290	2	1	1	4	153	0.0333333333333333	0.1	0.118604651162791	0.843137254901961	0.0261437908496732	1	3	0	4	175	0.0333333333333333	0.0816326530612245	0.146566164154104	0.556967930029155	0.0228571428571429	0.0333333333333333	4	71	328	2156	0.991839768290747	0.370419471020604	0.122597939040604	Inf	0.40390243902439	3.24564459930314	0.0539739029651821	4.92492196787854	0.111370157819225	0.999926630797137	0.0981473102596725	0.569230769230769	116	111
TCGA-AG-4007-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	165	0	4	0	4	161	6601	4	5	4	13	1467	4	8	5	17	1690	3	9	48	60	1754	3	12	56	71	1690	3	5	3	11	215	0.0666666666666667	0.154929577464789	0.127218934911243	1.21781853914183	0.0511627906976744	1	2	3	6	214	0.0363636363636364	0.1	0.122006841505131	0.819626168224299	0.0280373831775701	0.0606060606060606	10	100	429	3015	0.88941835043204	0.702859445545757	0.36848779928913	Inf	0.729815638906548	5.35198135198135	0.00298246158698461	14.0358061386259	0.463152232383002	0.991730003757259	0.430358341580735	0.707985303535915	155	151
TCGA-AG-4008-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	77	0	1	1	2	74	3034	0	3	2	5	739	3	6	2	11	683	0	3	19	22	814	1	8	27	36	798	1	1	1	3	94	0.038961038961039	0.0833333333333333	0.117794486215539	0.707446808510638	0.0319148936170213	0	1	0	1	109	0.012987012987013	0.0454545454545455	0.133906633906634	0.339449541284404	0.00917431192660551	0.025974025974026	2	45	203	1409	0.985495035116152	0.308626764252734	0.0528708002688778	Inf	0.337910072319463	7.94088669950739	0.126472411655301	Inf	0.172627971728422	0.997820905846029	0.154331949988348	1	75	72
TCGA-AG-4015-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	97	0	0	1	1	95	3895	4	4	1	9	961	2	6	4	12	956	0	10	26	36	1012	2	5	31	38	966	0	1	4	5	129	0.0515463917525773	0.131578947368421	0.133540372670807	0.98531211750306	0.0387596899224806	0	3	2	5	141	0.0515463917525773	0.138888888888889	0.139328063241107	0.996847911741529	0.0354609929078014	0.0618556701030928	6	53	270	1708	0.831831786767575	0.716248022952755	0.297012221202784	Inf	0.745009416195857	0	1	0	0.771150097465887	0.80655676136357	0.744324809301847	0.0108359133126935	91	89
TCGA-AG-A002-01A-01W-A00K-09	0	0	0	0	12312	1	25	17	42	12255	502455	47	351	439	837	135838	53	315	474	842	137352	9	2538	2746	5293	114292	16	2518	2749	5283	114973	0	2013	204	2217	20328	0.180068226120858	0.419647927314026	0.176806728536265	2.37348392104858	0.109061393152302	0	2038	202	2240	20300	0.181936322287199	0.423200453429057	0.177615231162286	2.38268109474452	0.110344827586207	0.0329759584145549	406	5114	40628	188637	1	0.368606982833841	0.337793995240377	Inf	0.415048904303878	0	1	0	0.41693720687123	1	0.370417763853851	7.67023552891641e-127	11906	11849
TCGA-AG-A008-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	49	0	0	0	0	49	2009	1	1	0	2	500	1	3	2	6	477	3	1	17	21	514	0	3	17	20	518	0	0	1	1	72	0.0204081632653061	0.05	0.138996138996139	0.359722222222222	0.0138888888888889	2	1	2	5	79	0.102040816326531	0.238095238095238	0.153696498054475	1.54912597950573	0.0632911392405063	0.102040816326531	5	32	151	881	0.648200594436247	0.911737753034835	0.333408948996669	Inf	0.923572579201718	4.55629139072848	0.058839134399482	11.6222008959629	0.603038566419945	0.890952607433482	0.564874917593252	1	44	44
TCGA-AG-A00C-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	69	0	0	0	0	69	2829	1	1	1	3	688	1	4	3	8	724	4	10	21	35	705	3	8	12	23	712	0	2	0	2	95	0.0289855072463768	0.0869565217391304	0.133426966292135	0.651716247139588	0.0210526315789474	1	3	0	4	95	0.0579710144927536	0.114285714285714	0.134751773049645	0.84812030075188	0.0421052631578947	0.0144927536231884	1	39	190	1227	0.996664258744523	0.165696100024196	0.0082743315525203	Inf	0.186447368421053	1.06541353383459	0.63593726546675	1.07628093890234	0	1	0	1	68	68
TCGA-AG-A00H-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	75	0	0	0	0	74	3034	3	4	1	8	762	1	3	0	4	773	3	4	23	30	737	5	7	20	32	762	2	2	0	4	115	0.0533333333333333	0.125	0.150918635170604	0.828260869565217	0.0347826086956522	2	1	2	5	127	0.0666666666666667	0.166666666666667	0.172320217096336	0.967191601049869	0.0393700787401575	0.08	6	45	242	1257	0.850527610233941	0.692710245025032	0.284924693817179	Inf	0.728731161886242	3.09710743801653	0.0281931594133101	5.18576576299563	0.28810301748991	0.994925813579375	0.253517575343961	0.619909502262444	69	68
TCGA-AG-A00Y-01A-02W-A005-10	0	0	0	0	145	4	20	13	33	108	4428	4	11	2	17	1088	3	13	4	20	1060	4	6	27	37	1102	4	8	22	34	1178	0	2	3	5	162	0.0344827586206897	0.147058823529412	0.137521222410866	1.06935366739288	0.0308641975308642	1	1	8	10	161	0.0689655172413793	0.27027027027027	0.146098003629764	1.84992445862011	0.062111801242236	0.0827586206896552	12	45	323	1957	0.104869680617433	1.61529174778211	0.866350311664679	Inf	1.48606811145511	0.882352941176471	0.705825618772142	0.86561690764422	1.58463385354142	0.0816376874633311	1.75335869327173	0.000483968542044767	133	96
TCGA-AG-A011-01A-01W-A00K-09	0	0	0	0	111	0	0	0	0	111	4551	4	3	1	8	1071	9	5	3	17	1138	3	10	30	43	1174	3	12	28	43	1168	1	3	3	7	161	0.0630630630630631	0.162790697674419	0.137842465753425	1.18099089989889	0.0434782608695652	3	1	2	6	148	0.0540540540540541	0.13953488372093	0.126064735945486	1.1068510370836	0.0405405405405405	0.0810810810810811	9	55	309	2033	0.476301635173483	1.07659772275798	0.531368212099049	Inf	1.06583737864078	5.05285868392664	0.00372960476782158	13.1325706474566	0.653386898783618	0.894119396728624	0.620792848527303	1	102	102
TCGA-AG-A014-01A-02W-A00K-09	0	0	0	0	120	2	5	1	6	100	4100	1	8	1	10	990	1	6	2	9	1035	5	10	29	44	1021	7	5	25	37	1054	0	1	3	4	142	0.0333333333333333	0.108108108108108	0.134724857685009	0.802436239055957	0.028169014084507	1	3	3	7	140	0.0583333333333333	0.159090909090909	0.137120470127326	1.16022727272727	0.05	0.0583333333333333	7	59	282	1793	0.808588633749433	0.754448293886224	0.337549261	Inf	0.780410487857296	0.613179669030733	0.826856620434388	0.578139454353181	0.817572892040977	0.759383872639884	0.794849055758165	0.0634674922600621	113	93
TCGA-AG-A015-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	64	0	0	0	0	64	2624	2	3	2	7	709	2	3	4	9	665	2	5	17	24	615	2	10	12	24	635	1	2	0	3	95	0.046875	0.125	0.149606299212598	0.835526315789474	0.0315789473684211	1	2	1	4	109	0.0625	0.166666666666667	0.177235772357724	0.940366972477064	0.036697247706422	0.046875	3	30	204	1046	0.92179396382206	0.512963438483561	0.131653834559686	Inf	0.557040998217469	3.06372549019608	0.128356884779674	5.11753931610744	0.211291413116971	0.994068999096758	0.183260250863381	1	61	61
TCGA-AG-A016-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	57	0	0	0	0	57	2337	1	2	1	4	577	1	1	1	3	551	1	1	20	22	619	1	4	23	28	590	0	1	2	3	90	0.0526315789473684	0.107142857142857	0.152542372881356	0.702380952380952	0.0333333333333333	1	0	0	1	90	0.0175438596491228	0.0454545454545455	0.145395799676898	0.312626262626263	0.0111111111111111	0.0526315789473684	3	42	180	1029	0.971041905125348	0.40854585018853	0.10624817902621	Inf	0.447777777777778	3.35833333333333	0.27669230401758	5.70367805685392	0.312403100775194	0.991148065195521	0.279044878516805	1	54	54
TCGA-AG-A01L-01A-01W-A00K-09	0	0	0	0	74	0	1	0	1	72	2952	1	0	0	1	606	2	4	1	7	694	0	2	24	26	841	1	3	34	38	811	0	1	3	4	103	0.0540540540540541	0.105263157894737	0.127003699136868	0.828819621870209	0.0388349514563107	0	0	2	2	95	0.027027027027027	0.0769230769230769	0.112960760998811	0.680971659919028	0.0210526315789474	0.0675675675675676	5	54	198	1454	0.848587100037101	0.680081907330402	0.255589806251885	Inf	0.707070707070707	0	1	0	0.719261581330547	0.838069822912248	0.69290790092979	0.0151515151515152	69	67
TCGA-AG-A01W-01A-21W-A096-10	0	0	0	0	127	0	0	2	2	125	5125	1	4	6	11	1218	3	7	6	16	1281	5	9	31	45	1304	3	11	39	53	1322	1	1	3	5	173	0.0393700787401575	0.0943396226415094	0.130862329803328	0.72090740538772	0.0289017341040462	1	0	3	4	167	0.031496062992126	0.0888888888888889	0.128067484662577	0.694078509647372	0.0239520958083832	0.062992125984252	8	70	340	2286	0.805607505023731	0.768472061931825	0.366379549967294	Inf	0.792156862745098	1.93088235294118	0.278885084408864	2.24026917997276	0.662016806722689	0.902449278095902	0.630423534515386	0.153434800493624	119	117
TCGA-AG-A01Y-01A-41W-A096-10	0	0	0	0	92	0	1	2	3	89	3649	1	10	5	16	945	4	7	2	13	902	3	6	22	31	945	4	2	23	29	857	1	0	1	2	133	0.0217391304347826	0.0689655172413793	0.155192532088681	0.44438682914182	0.0150375939849624	0	1	2	3	142	0.0326086956521739	0.0967741935483871	0.15026455026455	0.644025442980463	0.0211267605633803	0.0434782608695652	4	48	275	1527	0.965613787618864	0.462878884360327	0.151269117749728	Inf	0.504055944055944	0.936103896103896	0.686804826548097	0.925475032516152	0.436848484848485	0.975288225159921	0.396765748402455	0.523809523809524	88	85
TCGA-AG-A020-01A-21W-A096-10	0	0	0	0	79	0	1	3	4	74	3034	1	5	3	9	743	2	2	3	7	699	1	6	19	26	767	2	6	24	32	825	0	0	0	0	101	0	0	0.122424242424242	0	0	0	3	2	5	110	0.0632911392405063	0.192307692307692	0.143415906127771	1.34090909090909	0.0454545454545455	0.0253164556962025	2	44	211	1381	0.987875152614071	0.297643767878914	0.0509883881066637	Inf	0.328044508551411	0	1	0	0.350931334729417	0.982632884100271	0.31941729858729	0.444444444444444	77	72
TCGA-AG-A025-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	94	0	1	3	4	87	3567	2	6	2	10	851	2	3	2	7	839	1	5	24	30	888	3	4	33	40	989	0	2	0	2	116	0.0212765957446809	0.05	0.117290192113246	0.426293103448276	0.0172413793103448	0	0	1	1	112	0.0106382978723404	0.0333333333333333	0.126126126126126	0.264285714285714	0.00892857142857143	0.0106382978723404	1	60	228	1649	0.999590283788385	0.120603840424867	0.00602872455671002	Inf	0.134958297382801	0	1	0	0.144429055093875	0.999322186230406	0.129217659961413	1	93	86
TCGA-AG-A026-01A-32W-A096-10	0	0	0	0	218	0	2	2	4	213	8733	7	17	5	29	2173	6	14	7	27	2121	18	14	48	80	2218	19	15	43	77	2221	6	1	4	11	312	0.0504587155963303	0.142857142857143	0.140477262494372	1.01694139194139	0.0352564102564103	9	3	5	17	310	0.0779816513761468	0.2125	0.139765554553652	1.52040322580645	0.0548387096774194	0.110091743119266	24	104	622	3817	0.0860286861104024	1.41602733617186	0.932826181275343	Inf	1.3381229903537	2.89323889806205	7.52762348767196e-05	4.18239107212018	0.705823115790961	0.904206793827041	0.67358771127432	0.176476338697089	194	189
TCGA-AG-A02G-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	51	0	1	1	2	47	1927	0	1	0	1	451	1	2	2	5	435	0	1	20	21	519	2	3	15	20	522	0	0	1	1	65	0.0196078431372549	0.05	0.124521072796935	0.401538461538462	0.0153846153846154	0	0	2	2	64	0.0392156862745098	0.0952380952380952	0.123314065510597	0.772321428571428	0.03125	0.0588235294117647	3	34	129	912	0.85231891310997	0.624035036205587	0.160379895748907	Inf	0.654305468258957	0	1	0	0.691694352159468	0.824972463287447	0.66301040821284	0.1	48	44
TCGA-AG-A02N-01A-11W-A096-10	0	0	0	0	1221	0	13	87	100	1121	45961	6	44	6	56	10157	11	37	8	56	10291	0	43	472	515	12782	3	44	447	494	12731	0	1	1	2	1454	0.00163800163800164	0.00404858299595142	0.114209410101327	0.0354487689968759	0.00137551581843191	0	2	1	3	1376	0.00245700245700246	0.0058252427184466	0.107651384759818	0.0541121020546399	0.00218023255813953	0.00163800163800164	2	920	2830	22683	1	0.0174334410097889	0.00306273851114094	Inf	0.0195557361090884	0	1	0	0.0196195742030245	1	0.0174904878682621	0.444444444444444	1219	1119
TCGA-AG-A02X-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	139	1	1	0	1	132	5412	1	6	2	9	1282	5	7	2	14	1343	4	11	45	60	1389	2	11	36	49	1398	0	2	4	6	206	0.0431654676258993	0.122448979591837	0.147353361945637	0.830988706162077	0.029126213592233	1	3	1	5	218	0.0359712230215827	0.0833333333333333	0.156947444204464	0.530963302752294	0.0229357798165138	0.0431654676258993	6	81	424	2363	0.993779671065217	0.412914547986958	0.174086141404825	Inf	0.453318152244632	1.09551886792453	0.628938956061492	1.11461362852092	0.405747728860936	0.996053597760246	0.366741249227239	0.148606811145511	133	126
TCGA-AG-A032-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	78	0	0	0	0	74	3034	1	2	2	5	722	0	5	1	6	710	4	5	18	27	787	1	13	22	36	815	0	1	1	2	102	0.0256410256410256	0.0555555555555556	0.125153374233129	0.443899782135076	0.0196078431372549	1	0	0	1	97	0.0128205128205128	0.037037037037037	0.123252858958069	0.300496372661321	0.0103092783505155	0.0256410256410256	2	43	199	1403	0.980429451386535	0.32806659910536	0.0561406618408928	Inf	0.357788944723618	1.61005025125628	0.485949033024713	1.76179637510664	0.201256281407035	0.99481712839616	0.180877942644711	1	76	72
TCGA-AG-A036-01A-12W-A096-10	0	0	0	0	150	0	0	1	1	148	6068	8	8	3	19	1456	5	12	4	21	1478	12	6	34	52	1507	7	10	39	56	1627	2	5	3	10	213	0.0666666666666667	0.178571428571429	0.130915795943454	1.3640174379611	0.0469483568075117	3	0	3	6	205	0.04	0.115384615384615	0.136031851360319	0.848217636022514	0.0292682926829268	0.0733333333333333	11	81	418	2716	0.696289951787326	0.882446962369442	0.47434283080238	Inf	0.896453089244851	1.97305464618484	0.0999242064587814	2.31987729725928	0.616241725109786	0.934721505880074	0.581957745458916	1	139	137
TCGA-AH-6544-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	183	0	0	2	2	181	7421	5	16	6	27	1723	3	25	10	38	1885	0	18	40	58	1946	8	15	35	58	1867	2	2	3	7	269	0.0382513661202186	0.120689655172414	0.144081414033208	0.837649019356493	0.0260223048327138	0	3	4	7	266	0.0382513661202186	0.120689655172414	0.136690647482014	0.882940108892922	0.0263157894736842	0.0491803278688525	9	74	535	3278	0.838876849314833	0.745239670117117	0.373474742532977	Inf	0.772818376308974	1.78177570093458	0.312806149116074	2.04192361243406	0.665196261682243	0.914854632010099	0.630796136252917	0.103188405797102	174	172
TCGA-AH-6547-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	40	0	0	2	2	38	1558	0	13	0	13	404	0	13	0	13	462	0	4	2	6	327	0	2	4	6	365	0	0	1	1	69	0.025	0.166666666666667	0.189041095890411	0.881642512077295	0.0144927536231884	0	1	0	1	63	0.025	0.166666666666667	0.192660550458716	0.865079365079365	0.0158730158730159	0.025	1	5	132	560	0.720135250269381	0.848675374441485	0.036155723533324	Inf	0.873737373737374	NaN	1	0	0.873737373737374	0.720135250269381	0.848675374441485	1	39	37
TCGA-AH-6549-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	138	0	1	4	5	133	5453	3	17	3	23	1327	1	20	0	21	1359	1	15	27	43	1332	5	14	27	46	1435	3	1	2	6	233	0.0434782608695652	0.130434782608696	0.162369337979094	0.803321515208061	0.0257510729613734	0	1	2	3	197	0.0217391304347826	0.0697674418604651	0.147897897897898	0.471727068823043	0.0152284263959391	0.0507246376811594	7	53	430	2337	0.842284184388233	0.717891570697872	0.320810130129775	Inf	0.750736434108527	3.21744186046512	0.0523964252632669	5.42984233486594	0.476658053402239	0.975944942407709	0.434884514846105	1	131	126
TCGA-AH-6643-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	191	0	1	2	3	185	7585	0	25	7	32	1879	3	35	11	49	1908	5	8	41	54	1929	4	9	37	50	1869	0	5	1	6	268	0.031413612565445	0.12	0.143392188336009	0.836865671641791	0.0223880597014925	0	1	2	3	283	0.0157068062827225	0.0555555555555556	0.146708138932089	0.378680800942285	0.0106007067137809	0.0157068062827225	3	84	551	3247	0.999837066108147	0.210510343254701	0.0561364739673025	Inf	0.237686964140434	0	1	0	0.265112383079715	0.999468568945881	0.235769545280703	0.205882352941176	188	182
TCGA-AH-6644-01A-21D-1826-10	0	0	0	0	139	0	3	4	7	132	5412	2	26	2	30	1275	3	14	0	17	1318	1	6	29	36	1312	4	9	36	49	1507	1	1	2	4	211	0.0287769784172662	0.0816326530612245	0.140013271400133	0.583035109778508	0.018957345971564	0	1	1	2	183	0.0143884892086331	0.0555555555555556	0.139481707317073	0.398299939283546	0.0109289617486339	0.0287769784172662	4	66	394	2425	0.991337519782157	0.373108244800251	0.123379532949788	Inf	0.408846990572879	1.43096446700508	0.529495546448512	1.53842713859736	0.330222569308864	0.996050031458562	0.297894911214391	0.545454545454546	135	128
TCGA-CI-6619-01B-11D-1826-10	0	0	0	0	141	0	0	4	4	137	5617	3	27	3	33	1419	3	27	2	32	1487	5	7	21	33	1345	4	7	28	39	1366	1	1	0	2	216	0.0141843971631206	0.0512820512820513	0.158125915080527	0.324311490978158	0.00925925925925926	1	1	1	3	190	0.0212765957446809	0.0909090909090909	0.141263940520446	0.643540669856459	0.0157894736842105	0.0212765957446809	3	55	406	2305	0.994631514239918	0.309759346681812	0.0817022863910695	Inf	0.34537965007644	1.48385331143952	0.400648240953382	1.62175106080608	0.136272242887303	0.999626312704555	0.118322073043069	1	138	134
TCGA-CI-6620-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	126	0	2	4	6	120	4920	2	27	0	29	1161	1	28	1	30	1247	3	0	21	24	1178	0	6	31	37	1334	0	1	2	3	194	0.0238095238095238	0.0810810810810811	0.145427286356822	0.557536918361661	0.0154639175257732	2	0	0	2	171	0.0158730158730159	0.0833333333333333	0.145161290322581	0.574074074074074	0.0116959064327485	0.0317460317460317	4	51	365	2147	0.966763240918584	0.461456937057537	0.151405394125478	Inf	0.50052303860523	4.58812785388128	0.0575618485503324	11.7448492495186	0.264699683877766	0.997057786345984	0.235367400263858	1	122	116
TCGA-CI-6621-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	117	0	1	1	2	114	4674	2	9	3	14	1131	2	11	1	14	1182	4	10	27	41	1126	4	9	32	45	1235	1	2	1	4	185	0.0341880341880342	0.0888888888888889	0.149797570850202	0.593393393393393	0.0216216216216216	1	1	1	3	156	0.0256410256410256	0.0731707317073171	0.13854351687389	0.528142589118199	0.0192307692307692	0.0341880341880342	4	63	341	2020	0.990647444929587	0.376217592426122	0.12414769382131	Inf	0.413358427802337	1.73093841642229	0.326297302830718	1.9739542670859	0.234703514091158	0.998813283328735	0.207928974144698	1	113	110
TCGA-CI-6622-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	175	0	3	2	5	170	6970	0	24	2	26	1751	4	21	1	26	1750	4	15	34	53	1753	2	12	51	65	1716	1	1	3	5	255	0.0285714285714286	0.0769230769230769	0.148601398601399	0.517647058823529	0.0196078431372549	1	5	1	7	250	0.04	0.132075471698113	0.142612664004564	0.92611320754717	0.028	0.0342857142857143	6	85	505	2964	0.993766185211254	0.414377539587089	0.175086713551927	Inf	0.452921336089653	2.28976897689769	0.213832136443327	2.93338096322543	0.32326150262085	0.998973123527889	0.289907162495759	0.64040536122916	169	164
TCGA-CI-6624-01C-11D-1826-10	0	0	0	0	300	1	3	2	5	292	11972	11	34	10	55	3017	18	43	15	76	3158	21	20	38	79	2892	14	26	42	82	2905	7	2	6	15	446	0.05	0.182926829268293	0.153528399311532	1.19148528929235	0.0336322869955157	6	3	5	14	409	0.0466666666666667	0.177215189873418	0.141424619640387	1.253071709325	0.0342298288508557	0.08	24	91	855	4942	0.0496250027117542	1.52429759724634	1.00089930405841	Inf	1.41498093058734	2.51832915622389	0.000980638341985642	3.41449899515469	0.932266081871345	0.647185197051215	0.92146027332981	0.79012274822034	276	268
TCGA-CL-5917-01A-11D-1657-10	0	0	0	0	200	0	1	4	5	195	7995	7	44	4	55	1837	1	42	1	44	1917	4	3	36	43	2143	3	10	40	53	2098	1	2	2	5	269	0.025	0.0943396226415094	0.128217349857007	0.735778915620397	0.0185873605947955	0	0	3	3	259	0.015	0.0697674418604651	0.120858609426038	0.57726497261381	0.0115830115830116	0.03	6	77	528	3713	0.954120219855458	0.548025590613006	0.231050654589269	Inf	0.580640744797371	1.14745670995671	0.606100007728402	1.17197634500152	0.528434011164274	0.966707911335914	0.495288468955353	0.118881118881119	194	189
TCGA-CL-5918-01A-11D-1657-10	0	0	0	0	228	2	0	2	2	224	9184	5	35	3	43	1944	3	40	8	51	2110	7	12	41	60	2540	4	8	58	70	2590	0	2	0	2	280	0.0087719298245614	0.0285714285714286	0.108108108108108	0.264285714285714	0.00714285714285714	0	1	1	2	269	0.0087719298245614	0.0333333333333333	0.105905511811024	0.314745972738538	0.00743494423791822	0.0043859649122807	1	109	549	4581	0.999995600239979	0.0765681241560648	0.00385748199593674	Inf	0.0849478390461997	0	1	0	0.0943864878291108	0.999985082116733	0.0851623299850121	1	227	223
TCGA-DC-5337-01A-01D-1657-10	0	0	0	0	283	1	6	3	9	271	11111	0	61	0	61	2589	2	57	1	60	2508	0	13	58	71	2938	4	14	61	79	3076	0	0	1	1	334	0.00353356890459364	0.0126582278481013	0.108582574772432	0.116576972637004	0.0029940119760479	0	4	4	8	330	0.0282685512367491	0.112676056338028	0.112321307011573	1.00315834400341	0.0242424242424242	0.0176678445229682	5	118	664	5350	0.998282291927292	0.341447719262921	0.131849080497412	Inf	0.368180037222059	0	1	0	0.380555836792548	0.997591054356404	0.353427519812912	0.0294117647058824	278	266
TCGA-DC-5869-01A-01D-1657-10	0	0	0	0	184	2	4	9	13	169	6929	1	38	0	39	1454	2	35	1	38	1491	5	5	31	41	1970	4	7	40	51	2014	1	1	3	5	219	0.0271739130434783	0.0980392156862745	0.108738828202582	0.901602650192497	0.0228310502283105	0	1	2	3	198	0.016304347826087	0.0731707317073171	0.100507614213198	0.728011825572801	0.0151515151515152	0.0326086956521739	6	74	417	3567	0.853988682153908	0.693618644763059	0.29179193959214	Inf	0.716546762589928	1.06155075939249	0.630740121853512	1.06925032549762	0.672813861586787	0.875789911637468	0.648086063513979	0.118881118881119	178	163
TCGA-DC-6155-01A-11D-1657-10	0	0	0	0	137	1	3	1	4	132	5412	3	23	1	27	1114	0	29	0	29	1261	2	6	21	29	1537	4	4	39	47	1500	2	0	3	5	165	0.0364963503649635	0.106382978723404	0.11	0.967117988394584	0.0303030303030303	0	0	1	1	166	0.0072992700729927	0.0344827586206897	0.108002602472349	0.319277108433735	0.00602409638554217	0.0437956204379562	6	60	331	2706	0.738165477091215	0.817590188323202	0.341199524374302	Inf	0.83411150782752	3.05840886203424	0.133141230064547	4.08497703211991	0.611681772406848	0.903054418637445	0.584028022009583	0.567099567099567	131	126
TCGA-DC-6157-01A-11D-1657-10	0	0	0	0	175	1	1	3	4	170	6970	5	36	1	42	1657	1	39	2	42	1668	5	5	32	42	1780	6	10	28	44	1865	0	2	2	4	210	0.0228571428571429	0.0909090909090909	0.112600536193029	0.807359307359307	0.019047619047619	3	1	2	6	212	0.0342857142857143	0.142857142857143	0.119101123595506	1.19946091644205	0.0283018867924528	0.04	7	64	422	3223	0.728165844850616	0.835402856644386	0.376030769187158	Inf	0.85157866631066	2.35566566135287	0.126879923545258	2.86284746720798	0.575829383886256	0.926980138733232	0.545603245177373	1	168	163
TCGA-DC-6158-01A-11D-1657-10	0	0	0	0	133	1	1	3	4	126	5166	1	30	1	32	1237	1	28	0	29	1329	2	2	29	33	1295	3	1	28	32	1305	0	0	4	4	197	0.0300751879699248	0.125	0.15095785440613	0.828045685279188	0.0203045685279188	0	1	1	2	185	0.0150375939849624	0.0606060606060606	0.142857142857143	0.424242424242424	0.0108108108108108	0.037593984962406	5	57	382	2218	0.959337798510792	0.509427867536334	0.192802946368108	Inf	0.548893767944604	0	1	0	0.597042344080095	0.934113630376844	0.558398796756492	0.0151515151515152	128	121
TCGA-DC-6160-01A-11D-1657-10	0	0	0	0	187	3	2	5	7	176	7216	4	42	2	48	1627	1	39	2	42	1650	1	6	38	45	1968	1	4	36	41	1971	1	1	3	5	227	0.0267379679144385	0.121951219512195	0.115169964485033	1.05888041259267	0.0220264317180617	0	3	2	5	217	0.0267379679144385	0.111111111111111	0.110264227642276	1.00768049155146	0.0230414746543779	0.0320855614973262	6	70	444	3495	0.869439623082091	0.6747678751772	0.283482915494687	Inf	0.700391180654339	4.43581081081081	0.213106519126661	7.86366738625615	0.599433893352812	0.929179956503928	0.570472581372878	0.140866873065015	181	170
TCGA-DC-6681-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	178	0	4	0	4	174	7134	0	30	7	37	1721	1	30	3	34	1638	6	4	33	43	1904	6	7	47	60	1871	2	0	2	4	246	0.0224719101123595	0.0666666666666667	0.13148049171566	0.507046070460705	0.016260162601626	2	0	3	5	232	0.0280898876404494	0.116279069767442	0.121848739495798	0.954290296712109	0.021551724137931	0.050561797752809	9	83	478	3297	0.836931099261373	0.747971634471384	0.375998679530109	Inf	0.772580498453702	2.63249651324965	0.0555974721592623	3.44687906552164	0.49359309623431	0.97898940059717	0.459901378254905	1	169	165
TCGA-DC-6682-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	203	2	4	4	8	193	7913	2	22	1	25	1867	1	39	5	45	2061	4	8	42	54	1913	5	13	51	69	2072	2	1	2	5	308	0.0246305418719212	0.072463768115942	0.148648648648649	0.487483530961792	0.0162337662337662	2	2	3	7	243	0.0344827586206897	0.12962962962963	0.127025614218505	1.0204999237921	0.0288065843621399	0.0443349753694581	9	93	551	3434	0.951910455360714	0.603190445130785	0.304422244354086	Inf	0.638144550016014	3.21435773341399	0.0260855153439905	4.98278807124634	0.388833596783951	0.997290287159551	0.354169650291552	1	194	184
TCGA-DC-6683-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	118	3	0	0	0	115	4715	4	21	1	26	1256	4	19	0	23	1221	2	5	19	26	1114	3	8	29	40	1124	1	1	1	3	180	0.0254237288135593	0.075	0.160142348754448	0.468333333333333	0.0166666666666667	2	2	2	6	165	0.0508474576271186	0.230769230769231	0.148114901256732	1.55804195804196	0.0363636363636364	0.0508474576271186	6	47	345	1893	0.844811437633864	0.700560713318969	0.289597718119499	Inf	0.734372436423298	3.89217391304348	0.0290358662102221	8.21818828604096	0.405434782608696	0.984200809811059	0.365909160177365	1	112	109
TCGA-DT-5265-01A-21D-1826-10	0	0	0	0	118	0	2	2	4	114	4674	2	19	0	21	1121	0	20	1	21	1228	2	7	26	35	1169	2	4	31	37	1156	0	1	4	5	190	0.0423728813559322	0.135135135135135	0.164359861591695	0.822190611664296	0.0263157894736842	0	1	2	3	156	0.0254237288135593	0.0857142857142857	0.133447390932421	0.642307692307692	0.0192307692307692	0.0508474576271186	6	55	346	1979	0.905740658151056	0.624069353990326	0.259601972529533	Inf	0.660949493035156	0	1	0	0.707331913599026	0.868253018757733	0.672999792400662	0.00699300699300699	112	108
TCGA-DY-A0XA-01A-11D-A152-10	0	0	0	0	326	0	1	1	2	323	13243	9	72	5	86	3334	5	65	3	73	3390	14	25	40	79	3269	10	22	53	85	3250	3	2	6	11	476	0.0337423312883436	0.129411764705882	0.146461538461538	0.883588729609491	0.023109243697479	5	4	5	14	478	0.0429447852760736	0.177215189873418	0.146222086264913	1.21195911233515	0.0292887029288703	0.0582822085889571	19	98	954	5565	0.351741510222528	1.13089483564969	0.710765830357272	Inf	1.10968660968661	2.27777777777778	0.0175512109382931	2.91600166484741	0.808243727598566	0.816954579442117	0.782547501541979	0.560744103424875	307	304
TCGA-DY-A1DC-01A-31D-A152-10	0	0	0	0	207	1	1	1	2	204	8364	7	47	2	56	2171	4	32	7	43	2071	7	13	26	46	2088	14	14	31	59	2034	4	4	3	11	292	0.0531400966183575	0.186440677966102	0.143559488692232	1.29869979103785	0.0376712328767123	1	3	1	5	302	0.0241545893719807	0.108695652173913	0.14463601532567	0.751511661387849	0.0165562913907285	0.0434782608695652	9	69	594	3528	0.80830324617445	0.774747236295677	0.387525128604201	Inf	0.800699300699301	1.65223665223665	0.176710373698206	1.85568924562904	0.486975013290803	0.972011431124029	0.448319221478611	1	198	195
TCGA-DY-A1DD-01A-21D-A152-10	0	0	0	0	231	1	4	6	10	219	8979	5	51	2	58	2259	7	31	1	39	2306	4	15	43	62	2248	1	13	46	60	2166	0	5	4	9	330	0.038961038961039	0.15	0.152354570637119	0.984545454545455	0.0272727272727273	0	1	3	4	309	0.0173160173160173	0.0645161290322581	0.137455516014235	0.469360058461217	0.0129449838187702	0.0303030303030303	7	87	639	3775	0.987045881440764	0.475392476408257	0.216381564550529	Inf	0.514400825758332	0	1	0	0.543299748553744	0.97934941129306	0.504375754911938	0.00521739130434783	224	212
TCGA-DY-A1DF-01A-11D-A152-10	0	0	0	0	186	1	2	3	5	179	7339	5	25	7	37	1862	3	26	2	31	1831	7	9	39	55	1789	7	8	41	56	1857	4	3	0	7	270	0.0376344086021505	0.125	0.145395799676898	0.859722222222222	0.0259259259259259	2	2	2	6	274	0.032258064516129	0.109090909090909	0.153158188932364	0.71227604512276	0.0218978102189781	0.043010752688172	8	86	544	3102	0.97656018175553	0.530512992278408	0.255261682570314	Inf	0.570400500625782	2.87237394957983	0.0114745356740415	4.2743390070296	0.167555147058824	0.999959348660736	0.146249392799634	0.201556064073226	178	171
TCGA-DY-A1DG-01A-11D-A152-10	0	0	0	0	335	1	2	6	8	324	13284	7	62	2	71	3258	8	50	0	58	3222	3	21	64	88	3372	8	28	71	107	3432	2	6	7	15	494	0.0447761194029851	0.14018691588785	0.143939393939394	0.973930152484014	0.0303643724696356	0	4	9	13	479	0.0388059701492537	0.147727272727273	0.142052194543298	1.0399506547732	0.0271398747390397	0.0537313432835821	18	128	973	5831	0.783375112576838	0.842758114327533	0.527576239264084	Inf	0.862126736966591	1.27141922825376	0.481090433914812	1.33167070308118	0.828776978417266	0.823033963834145	0.805779070994293	0.000114104820121922	317	306
TCGA-DY-A1H8-01A-21D-A152-10	0	0	0	0	168	0	2	1	3	164	6724	1	28	2	31	1717	1	30	2	33	1636	3	11	39	53	1682	2	7	38	47	1689	0	2	1	3	234	0.0178571428571429	0.0638297872340425	0.13854351687389	0.460720130932897	0.0128205128205128	1	3	1	5	254	0.0297619047619048	0.0943396226415094	0.151010701545779	0.624721438122122	0.0196850393700787	0.0178571428571429	3	79	488	2883	0.999673760921469	0.224403755423351	0.0597366747009237	Inf	0.252723910435826	1.38155737704918	0.542907994008082	1.47674714951558	0.179423035980413	0.999908568813859	0.15758551739842	1	165	161
TCGA-EF-5830-01A-01D-1657-10	0	0	0	0	291	1	0	0	0	289	11849	3	86	7	96	2639	3	84	6	93	2758	4	12	38	54	3158	1	19	26	46	3294	1	1	4	6	405	0.0206185567010309	0.130434782608696	0.122950819672131	1.06086956521739	0.0148148148148148	0	1	5	6	352	0.0206185567010309	0.111111111111111	0.111462951234959	0.996843434343434	0.0170454545454545	0.0343642611683849	10	59	757	5695	0.289786626728036	1.27505179318407	0.658609083845956	Inf	1.23523443034097	1.70462351387054	0.464511868671228	1.88047625248825	1.19856340819022	0.336434970991654	1.23101238080216	0.00275945618522009	281	279
TCGA-EI-6506-01A-11D-1733-10	0	0	0	0	262	0	3	5	8	253	10373	5	20	1	26	2561	9	28	4	41	2606	6	25	60	91	2613	8	20	67	95	2593	3	7	4	14	383	0.0534351145038168	0.147368421052632	0.147705360586194	0.997718840181393	0.0365535248041775	0	9	4	13	389	0.049618320610687	0.142857142857143	0.148871029468044	0.959603378626515	0.0334190231362468	0.0419847328244275	11	130	772	4434	0.995732049642114	0.486044666046226	0.26556068393598	Inf	0.526090471465844	1.44504071058475	0.34576191742961	1.56625377865222	0.424788870303129	0.999032488573613	0.386166978449447	0.175080710726683	251	242
TCGA-EI-6507-01A-11D-1733-10	0	0	0	0	1086	0	41	147	188	898	36818	10	68	4	82	8320	14	63	6	83	8347	4	51	306	361	9960	5	74	293	372	10191	1	8	6	15	1206	0.0138121546961326	0.0403225806451613	0.118339711510156	0.340735836944311	0.0124378109452736	0	8	8	16	1142	0.0147329650092081	0.0443213296398892	0.114658634538153	0.386550300537037	0.0140105078809107	0.0138121546961326	15	593	2348	17803	1	0.191800869325677	0.117371070098972	Inf	0.211731849054066	0.953577512776831	0.672148124721192	0.947773202559119	0.200585586994793	1	0.181462328522869	0.000183147697995668	1071	883
TCGA-EI-6508-01A-11D-1733-10	0	0	0	0	172	2	0	2	2	168	6888	3	19	4	26	1643	5	27	5	37	1727	1	12	36	49	1685	5	9	42	56	1833	2	1	4	7	239	0.0406976744186047	0.125	0.130387343153301	0.958682008368201	0.0292887029288703	0	0	1	1	255	0.00581395348837209	0.0204081632653061	0.1513353115727	0.134853941576631	0.00392156862745098	0.0406976744186047	7	77	494	3024	0.958915141219299	0.556571831606112	0.252187319679026	Inf	0.593454790823212	2.37381916329285	0.201899848422637	3.05934514373963	0.456503685248625	0.988733022336785	0.419350906745947	0.314685314685315	165	161
TCGA-EI-6510-01A-11D-1733-10	0	0	0	0	262	1	0	8	8	251	10291	2	39	2	43	2471	6	54	1	61	2753	3	10	58	71	2478	0	18	58	76	2589	0	3	5	8	413	0.0305343511450382	0.105263157894737	0.159521050598687	0.659870014018096	0.0193704600484262	1	0	2	3	340	0.0114503816793893	0.0422535211267606	0.137207425343019	0.307953603976802	0.00882352941176471	0.0305343511450382	8	111	753	4314	0.99784061396208	0.412956713309271	0.200238600643806	Inf	0.452375372459741	2.24302788844621	0.383155750982504	2.86371749698161	0.406065393598022	0.998991786025446	0.367971415109717	0.0237358101135191	254	243
TCGA-F5-6464-01A-11D-1733-10	0	0	0	0	143	0	2	3	5	137	5617	1	25	9	35	1384	3	15	7	25	1523	3	12	21	36	1297	5	10	26	41	1413	1	4	3	8	241	0.0559440559440559	0.195121951219512	0.170559094125973	1.14401376378909	0.033195020746888	0	1	0	1	221	0.00699300699300699	0.0277777777777778	0.170393215111796	0.163021618903972	0.00452488687782805	0.027972027972028	4	51	462	2248	0.989199035833843	0.381724714068997	0.125392487613223	Inf	0.426603699330972	0.733225108225108	0.775995738216824	0.695198592009811	0.374412821221332	0.991086692264722	0.331848727177191	0.576470588235294	139	133
TCGA-F5-6465-01A-11D-1733-10	0	0	0	0	213	1	0	4	4	207	8487	5	34	2	41	2189	5	39	3	47	2205	6	13	46	65	2018	5	9	40	54	2075	1	2	2	5	311	0.0234741784037559	0.0925925925925926	0.149879518072289	0.617780159580803	0.0160771704180064	3	2	2	7	308	0.0328638497652582	0.107692307692308	0.152626362735382	0.705594405594406	0.0227272727272727	0.0375586854460094	8	89	619	3474	0.984352479478795	0.504542616751072	0.243104133367732	Inf	0.545342504538414	2.40446467910119	0.0717836252878831	3.20572819771285	0.307547807792013	0.99942231160725	0.273823119060672	1	205	199
TCGA-F5-6571-01A-12D-1826-10	0	0	0	0	144	0	0	4	4	140	5740	0	23	0	23	1390	4	23	0	27	1476	1	15	25	41	1457	2	7	40	49	1417	1	1	3	5	210	0.0347222222222222	0.102040816326531	0.148200423429781	0.688532555879495	0.0238095238095238	1	4	5	10	214	0.0694444444444444	0.24390243902439	0.146877144818119	1.66058810120811	0.0467289719626168	0.0694444444444444	10	58	424	2450	0.557761275671209	0.996260156696943	0.512543876290743	Inf	0.99680910099889	4.5188679245283	0.0591894133438443	11.5401143048383	0.834252539912917	0.760570191449664	0.811044024196145	0.0501749125437281	134	130
TCGA-F5-6702-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	89	0	0	2	2	87	3567	0	14	2	16	841	2	15	1	18	933	0	4	17	21	857	0	8	24	32	936	0	1	2	3	140	0.0337078651685393	0.09375	0.14957264957265	0.626785714285714	0.0214285714285714	0	0	1	1	104	0.0112359550561798	0.0476190476190476	0.121353558926488	0.392399267399267	0.00961538461538462	0.0337078651685393	3	38	244	1549	0.929829337711361	0.501335828562096	0.130238763560332	Inf	0.537684926029588	NaN	1	0	0.537684926029588	0.929829337711361	0.501335828562096	0.142857142857143	86	84
TCGA-F5-6811-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	178	0	3	2	5	173	7093	3	37	1	41	1733	0	27	2	29	1741	0	5	34	39	1771	4	4	56	64	1848	0	1	1	2	259	0.0112359550561798	0.03125	0.140151515151515	0.222972972972973	0.00772200772200772	0	0	3	3	254	0.0168539325842697	0.0769230769230769	0.143421795595709	0.536341611144761	0.0118110236220472	0.0224719101123595	4	90	513	3106	0.999530380705661	0.269152040026943	0.0897851662774882	Inf	0.300194931773879	0	1	0	0.313536928741607	0.999242963052923	0.281669504909933	0.0476190476190476	174	169
TCGA-F5-6812-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	134	0	0	4	4	129	5289	3	23	3	29	1332	3	18	4	25	1391	2	13	21	36	1291	3	5	31	39	1275	1	1	1	3	213	0.0223880597014925	0.0769230769230769	0.167058823529412	0.460455037919827	0.0140845070422535	2	2	1	5	192	0.0373134328358209	0.138888888888889	0.148721920991479	0.933883101851852	0.0260416666666667	0.0373134328358209	5	52	405	2161	0.957131741331985	0.513165639799979	0.193649819015607	Inf	0.555772146415421	3.80148148148148	0.0309131617183179	7.99511865974443	0.243684710351377	0.998498720417781	0.213505979501876	1	129	124
TCGA-F5-6813-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	189	0	3	2	5	184	7544	2	25	5	32	1848	2	27	1	30	1905	8	12	42	62	1964	6	10	44	60	1827	3	3	5	11	259	0.0582010582010582	0.183333333333333	0.14176245210728	1.29324324324324	0.0424710424710425	3	2	4	9	266	0.0476190476190476	0.145161290322581	0.135437881873727	1.07179238418627	0.0338345864661654	0.0793650793650794	15	85	525	3266	0.415059913011344	1.09781695091772	0.646943827626889	Inf	1.08314285714286	3.09469387755102	0.0079763534670219	4.66296435900392	0.755681063122924	0.856700117031116	0.727178560535809	0.514475543396567	174	169
TCGA-G5-6235-01A-11D-1733-10	0	0	0	0	260	1	0	0	0	259	10619	4	26	4	34	2570	7	26	3	36	2781	1	24	55	80	2595	3	31	75	109	2673	0	8	6	14	405	0.0538461538461538	0.128440366972477	0.151515151515152	0.847706422018349	0.0345679012345679	0	6	1	7	352	0.0269230769230769	0.0875	0.135645472061657	0.645063920454545	0.0198863636363636	0.0269230769230769	7	127	757	4511	0.999771232961631	0.328496357590379	0.150848165840051	Inf	0.363532404030048	0	1	0	0.374718016461742	0.999646474168248	0.339178296898973	0.00862025252269155	253	252
TCGA-G5-6641-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	121	2	1	3	4	115	4715	1	16	2	19	1166	5	20	1	26	1240	2	9	31	42	1132	3	3	22	28	1177	2	0	0	2	187	0.0165289256198347	0.0714285714285714	0.158878504672897	0.449579831932773	0.0106951871657754	0	3	0	3	161	0.0247933884297521	0.0714285714285714	0.142226148409894	0.502218278615794	0.0186335403726708	0.0165289256198347	2	56	348	1961	0.9990642955839	0.201330394473694	0.0348241646547092	Inf	0.228795085216013	2.65402298850575	0.16694524647525	3.75359405005221	0	1	0	0.444444444444444	119	113
Totals	0	0	0	0	31952	54	239	479	718	31071	1273911	368	2466	879	3713	324390	396	2430	938	3764	329325	391	3951	7319	11661	308484	443	3927	7563	11933	311712	131	2522	478	3131	48087	0.0979907361041562	0.262381630771809	0.154267400677549	1.70082356751601	0.0651111527023936	108	2579	437	3124	47129	0.0977716574862293	0.267901552182489	0.152776156948172	1.75355603605981	0.0662861507776528	0.0361166750125188	1154	14562	95216	524980	1	0.436933399167735	0.415072514756255	Inf	0.478280656454624	1.86659835297616	1.51860875191021e-22	2.21469648670492	0.400478146113341	1	0.36120117092757	2.60041888117485e-102	30798	29917
