Sample	A_T_coord_clusters	G_C_coord_clusters	Non_coord_clusters	clusters	mutations	complex	insertions	deletions	indels	substitutions	bases	A_to_T	A_to_G	A_to_C	A	a	T_to_A	T_to_C	T_to_G	T	t	G_to_C	G_to_T	G_to_A	G	g	C_to_G	C_to_A	C_to_T	C	c	tCw_to_G	tCw_to_A	tCw_to_T	tCw	tcw	tCw_per_mut	tCw_per_C	tcw_per_c	enrich_tCw	freq_tCw	wGa_to_C	wGa_to_T	wGa_to_A	wGa	wga	wGa_per_mut	wGa_per_G	wga_per_g	enrich_wGa	freq_wGa	[tCw_to_G+tCw_to_T]_per_mut	tCw_to_G+tCw_to_T	[(C_to_G)+(C_to_T)]-[(tCw_to_G)+(tCw_to_T)]	tcw+wga	c-tcw	Fisher_p-value_tCw	odds_ratio_tCw	95%_confidence_lower_tCw	95%_confidence_upper_tCw	APOBEC_enrich	tCw_to_G_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_G	odds_ratio_tCw_to_G	tCw_to_T_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_T	odds_ratio_tCw_to_T	p-value_GvT_skew	non-APOBEC_mutations	non-APOBEC_substitutions
TCGA-AF-2687-01A-02D-1733-10	0	0	1	1	191	0	0	3	3	188	7708	3	36	1	40	1774	3	25	0	28	1790	5	12	52	69	2082	0	9	42	51	2062	0	0	3	3	252	0.0157068062827225	0.0588235294117647	0.122211445198836	0.481325863678805	0.0119047619047619	1	1	3	5	281	0.0261780104712042	0.072463768115942	0.134966378482229	0.536902367321677	0.0177935943060498	0.0366492146596859	7	92	533	3611	0.976240455714102	0.515543235256481	0.234842077691744	Inf	0.549737525347281	1.55497185741088	0.498039444855397	1.69344912333369	0.496267614067303	0.985425147501328	0.461987314843286	0.0405594405594406	184	181
TCGA-AF-2689-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	63	0	1	0	1	62	2542	4	8	3	15	646	2	7	1	10	641	3	2	17	22	610	3	3	9	15	645	0	1	1	2	95	0.0317460317460317	0.133333333333333	0.147286821705426	0.905263157894737	0.0210526315789474	1	1	2	4	97	0.0634920634920635	0.181818181818182	0.159016393442623	1.14339268978444	0.0412371134020619	0.0634920634920635	4	28	192	1063	0.742858943593363	0.791056608024652	0.251284713013187	Inf	0.817057291666667	1.08940972222222	0.631701070045371	1.10723120871303	0.754206730769231	0.782391245890608	0.722312315998172	0.545454545454546	59	58
TCGA-AF-2691-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	72	0	0	0	0	72	2952	5	2	0	7	716	2	5	1	8	733	1	12	16	29	730	6	10	12	28	773	1	2	1	4	120	0.0555555555555556	0.142857142857143	0.155239327296248	0.920238095238095	0.0333333333333333	0	1	0	1	105	0.0138888888888889	0.0344827586206897	0.143835616438356	0.239737274220033	0.00952380952380952	0.0277777777777778	2	33	225	1278	0.974783575368433	0.344406008915689	0.0584485900576782	Inf	0.381714285714286	0.954285714285714	0.6793360676997	0.946691255705624	0.238571428571429	0.989061082999538	0.210494807104675	1	70	70
TCGA-AF-2692-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	39	0	1	1	2	37	1517	2	4	0	6	352	0	2	0	2	381	1	1	12	14	405	1	2	12	15	379	1	0	0	1	51	0.0256410256410256	0.0666666666666667	0.134564643799472	0.495424836601307	0.0196078431372549	0	1	2	3	47	0.0769230769230769	0.214285714285714	0.116049382716049	1.84650455927052	0.0638297872340425	0.0769230769230769	3	23	98	686	0.649788517365541	0.913123603962913	0.228962991211589	Inf	0.923076923076923	4	0.236184178538435	6.96961280997499	0.666666666666667	0.820074959172692	0.636667426956065	1	36	34
TCGA-AF-2693-01A-02D-1733-10	0	0	0	0	252	1	0	3	3	248	10168	4	53	1	58	2508	6	56	1	63	2541	2	14	43	59	2625	1	12	55	68	2494	0	1	3	4	367	0.0158730158730159	0.0588235294117647	0.147153167602245	0.399743548645616	0.0108991825613079	0	6	4	10	384	0.0396825396825397	0.169491525423729	0.146285714285714	1.15863347457627	0.0260416666666667	0.0277777777777778	7	94	751	4368	0.994317960444746	0.433174487177696	0.197687903714416	Inf	0.472413020263411	0	1	0	0.486874643332699	0.992332504169383	0.447453461692189	0.00579710144927537	245	241
TCGA-AF-3400-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	29	1	0	0	0	28	1148	1	4	0	5	267	0	1	1	2	262	1	1	10	12	328	1	2	6	9	291	0	0	0	0	38	0	0	0.130584192439863	0	0	0	0	0	0	33	0	0	0.100609756097561	0	0	0	0	18	71	548	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	29	28
TCGA-AF-3913-01A-02W-1073-09	0	0	0	0	114	0	1	2	3	110	4510	3	3	4	10	1067	3	8	1	12	1155	10	13	16	39	1206	6	9	34	49	1082	4	2	3	9	160	0.0789473684210526	0.183673469387755	0.147874306839187	1.24209183673469	0.05625	4	0	3	7	165	0.0614035087719298	0.179487179487179	0.13681592039801	1.31188811188811	0.0424242424242424	0.12280701754386	14	52	325	1963	0.0823595980696246	1.62575476059343	0.916942857031148	Inf	1.49333333333333	3.52	0.000781971771616899	6.0323818857151	0.8448	0.731823719315564	0.823700596161857	0.722393472194293	100	96
TCGA-AF-4110-01A-02D-1733-10	0	0	0	0	134	1	5	1	6	127	5207	2	30	1	33	1283	2	17	1	20	1288	2	7	24	33	1261	5	9	27	41	1375	1	2	2	5	195	0.0373134328358209	0.121951219512195	0.141818181818182	0.859912445278299	0.0256410256410256	1	2	1	4	175	0.0298507462686567	0.121212121212121	0.13877874702617	0.873419913419913	0.0228571428571429	0.0373134328358209	5	53	370	2266	0.922739895345679	0.577865232983886	0.21810962137464	Inf	0.614165890027959	2.03552123552124	0.257587762371384	2.44869164634099	0.419077901430843	0.980107370662576	0.382866379212585	1	129	122
TCGA-AF-5654-01A-01D-1657-10	0	0	0	0	175	2	3	0	3	170	6970	4	21	1	26	1703	2	20	0	22	1658	3	8	41	52	1866	6	12	52	70	1743	1	2	3	6	210	0.0342857142857143	0.0857142857142857	0.120481927710843	0.711428571428571	0.0285714285714286	2	3	0	5	247	0.0285714285714286	0.0961538461538462	0.132368703108253	0.726409218312052	0.0202429149797571	0.0342857142857143	6	96	457	3152	0.991593353645053	0.431143247595515	0.182621712577339	Inf	0.464538550650019	2.63238512035011	0.0954677958442057	3.44663156508376	0.254746947130656	0.999609057162411	0.229958950740734	1	169	164
TCGA-AF-6136-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	195	1	1	3	4	190	7790	0	33	1	34	1893	1	35	1	37	1987	4	6	54	64	1953	1	10	44	55	1957	0	0	3	3	296	0.0153846153846154	0.0545454545454545	0.151251916198263	0.360626535626536	0.0101351351351351	3	1	1	5	271	0.0256410256410256	0.078125	0.138760880696365	0.563018911439114	0.018450184501845	0.0358974358974359	7	96	567	3343	0.994646040006969	0.429977877718681	0.196108287521067	Inf	0.468656358623996	4.13756613756614	0.0244307622466114	8.83551971480781	0.281467084188173	0.999785503319856	0.250944231100451	1	188	183
TCGA-AF-6655-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	140	0	0	7	7	133	5453	2	25	1	28	1318	2	23	0	25	1439	2	12	30	44	1329	1	12	23	36	1367	0	2	1	3	217	0.0214285714285714	0.0833333333333333	0.158741770299927	0.524961597542243	0.0138248847926267	1	2	1	4	186	0.0285714285714286	0.0909090909090909	0.139954853273138	0.649560117302053	0.021505376344086	0.0214285714285714	3	53	403	2293	0.99296421443289	0.322153966507965	0.0848803729293759	Inf	0.358383551931939	2.22994210090984	0.38531249968332	2.84339047792582	0.252446275574699	0.997963305666709	0.223202439824267	1	137	130
TCGA-AF-6672-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	146	1	1	2	3	142	5822	3	23	1	27	1415	4	28	1	33	1505	3	10	22	35	1417	7	4	36	47	1485	4	1	2	7	223	0.0479452054794521	0.148936170212766	0.15016835016835	0.991794676080527	0.031390134529148	1	1	2	4	207	0.0273972602739726	0.114285714285714	0.146083274523642	0.782332643202208	0.0193236714975845	0.0616438356164384	9	59	430	2472	0.69399176727999	0.876988225611973	0.435212039549407	Inf	0.893228454172367	3.37441860465116	0.00957305475325146	5.74340527944726	0.465437048917402	0.978982832575531	0.425928993184406	1	137	133
TCGA-AG-3574-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	41	0	1	0	1	40	1640	1	0	0	1	416	1	4	1	6	414	0	4	15	19	391	0	6	8	14	419	0	2	0	2	57	0.0487804878048781	0.142857142857143	0.136038186157518	1.05012531328321	0.0350877192982456	0	2	0	2	61	0.0487804878048781	0.105263157894737	0.156010230179028	0.674719585849871	0.0327868852459016	0	0	23	118	692	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	41	40
TCGA-AG-3575-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	51	0	0	1	1	50	2050	2	4	3	9	508	1	2	0	3	522	1	1	19	21	483	0	6	11	17	537	0	2	0	2	82	0.0392156862745098	0.117647058823529	0.152700186219739	0.770444763271162	0.024390243902439	0	1	0	1	62	0.0196078431372549	0.0476190476190476	0.128364389233954	0.370967741935484	0.0161290322580645	0	0	31	144	876	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	51	50
TCGA-AG-3578-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	25	1	0	0	0	24	984	2	0	0	2	246	0	2	1	3	245	0	1	7	8	242	1	3	7	11	251	0	0	0	0	38	0	0	0.151394422310757	0	0	0	0	0	0	36	0	0	0.148760330578512	0	0	0	0	15	74	419	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	25	24
TCGA-AG-3580-01A-01W-0831-10	0	1	0	1	42	0	0	1	1	41	1681	0	2	0	2	430	0	1	0	1	402	0	5	20	25	429	0	2	11	13	420	0	1	0	1	66	0.0238095238095238	0.0769230769230769	0.157142857142857	0.48951048951049	0.0151515151515152	0	2	2	4	68	0.0952380952380952	0.16	0.158508158508158	1.00941176470588	0.0588235294117647	0.0476190476190476	2	29	134	715	0.9656513958641	0.368284272407581	0.0618816716354453	Inf	0.408762638420799	NaN	1	0	0.408762638420799	0.9656513958641	0.368284272407581	0.444444444444444	40	39
TCGA-AG-3581-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	54	0	1	0	1	53	2173	1	2	0	3	542	1	1	1	3	522	4	2	14	20	551	3	1	23	27	558	0	0	3	3	65	0.0555555555555556	0.111111111111111	0.116487455197133	0.953846153846154	0.0461538461538462	0	0	0	0	84	0	0	0.152450090744102	0	0	0.0555555555555556	3	41	149	960	0.944680137134654	0.471674913973893	0.12233088153457	Inf	0.507474069554606	0	1	0	0.603482677308181	0.889032018883545	0.568727699693672	0.1	51	50
TCGA-AG-3582-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	35	0	0	1	1	34	1394	0	4	1	5	302	0	2	1	3	341	1	5	10	16	379	1	4	5	10	372	0	0	0	0	48	0	0	0.129032258064516	0	0	0	1	0	1	37	0.0285714285714286	0.0625	0.0976253298153034	0.640202702702703	0.027027027027027	0	0	17	85	666	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	35	34
TCGA-AG-3583-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	59	0	0	2	2	57	2337	0	1	0	1	601	0	1	2	3	563	1	1	15	17	565	1	2	33	36	608	1	1	1	3	85	0.0508474576271186	0.0833333333333333	0.139802631578947	0.596078431372549	0.0352941176470588	0	0	2	2	75	0.0338983050847458	0.117647058823529	0.132743362831858	0.886274509803922	0.0266666666666667	0.0677966101694915	4	46	160	1013	0.921450382319253	0.550765051570747	0.178766847320925	Inf	0.5865	3.665625	0.255368443945051	6.31467879708456	0.458203125	0.96631423603853	0.422302465956329	0.523809523809524	55	53
TCGA-AG-3584-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	33	0	1	0	1	32	1312	0	2	1	3	316	0	0	1	1	347	1	3	7	11	307	0	2	15	17	342	0	0	0	0	57	0	0	0.166666666666667	0	0	0	0	0	0	48	0	0	0.156351791530945	0	0	0	0	23	105	544	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	33	32
TCGA-AG-3586-01A-02W-0831-10	0	0	0	0	66	2	1	0	1	63	2583	1	6	3	10	653	5	7	3	15	621	2	6	14	22	650	2	3	11	16	659	0	2	1	3	107	0.0454545454545455	0.1875	0.16236722306525	1.15478971962617	0.0280373831775701	0	2	1	3	101	0.0454545454545455	0.136363636363636	0.155384615384615	0.877587758775878	0.0297029702970297	0.0303030303030303	2	27	208	1101	0.956333194677374	0.392291051585903	0.0659830176529992	Inf	0.434018567639257	0	1	0	0.503461538461539	0.923590462534875	0.460493329250003	0.454545454545454	64	61
TCGA-AG-3587-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	66	1	1	0	1	64	2624	1	4	3	8	667	0	4	0	4	629	0	6	16	22	644	2	4	24	30	684	1	0	0	1	95	0.0151515151515152	0.0333333333333333	0.138888888888889	0.24	0.0105263157894737	0	2	0	2	94	0.0303030303030303	0.0909090909090909	0.145962732919255	0.622823984526112	0.0212765957446809	0.0151515151515152	1	41	189	1139	0.998294509257684	0.147093438296597	0.00729645688180887	Inf	0.167296548248929	3.51322751322751	0.26539825862625	6.01323741558411	0	1	0	1	65	63
TCGA-AG-3593-01A-01W-0831-10	0	0	0	0	75	1	0	0	0	74	3034	5	4	0	9	780	4	7	1	12	808	7	3	19	29	742	3	6	15	24	704	1	1	0	2	132	0.0266666666666667	0.0833333333333333	0.1875	0.444444444444444	0.0151515151515152	1	2	1	4	107	0.0533333333333333	0.137931034482759	0.144204851752022	0.956493715758943	0.0373831775700935	0.04	3	41	239	1207	0.982699648172881	0.369701831549227	0.0962834793194978	Inf	0.412514263978699	1.21004184100418	0.512072914268421	1.26233371281309	0.177947329559439	0.997735149956762	0.153140190257088	1	72	71
TCGA-AG-3594-01A-02W-0831-10	0	0	0	0	42	0	0	2	2	40	1640	0	2	1	3	440	0	3	0	3	358	0	2	13	15	414	0	4	15	19	428	0	1	0	1	55	0.0238095238095238	0.0526315789473684	0.128504672897196	0.409569377990431	0.0181818181818182	0	0	0	0	65	0	0	0.157004830917874	0	0	0	0	28	120	722	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	42	40
TCGA-AG-3598-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	72	0	0	0	0	72	2952	3	4	5	12	709	1	1	0	2	677	2	6	14	22	771	4	6	26	36	795	1	1	0	2	111	0.0277777777777778	0.0555555555555556	0.139622641509434	0.397897897897898	0.018018018018018	1	1	0	2	92	0.0277777777777778	0.0909090909090909	0.119325551232166	0.761857707509881	0.0217391304347826	0.0277777777777778	2	44	203	1363	0.986189962852864	0.305341467140413	0.0522826323630782	Inf	0.335403726708075	2.57142857142857	0.178267032320271	3.35335730804571	0	1	0	0.428571428571429	70	70
TCGA-AG-3599-01A-02W-0833-10	0	0	0	0	67	0	1	0	1	66	2706	1	2	0	3	634	1	5	0	6	663	3	2	21	26	709	0	7	24	31	700	0	0	0	0	94	0	0	0.134285714285714	0	0	0	0	0	0	93	0	0	0.131170662905501	0	0	0	0	48	187	1222	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	67	66
TCGA-AG-3600-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	95	0	2	1	3	92	3772	0	10	1	11	985	2	6	8	16	968	8	6	26	40	911	4	6	15	25	908	2	0	0	2	151	0.0210526315789474	0.08	0.166299559471366	0.481059602649007	0.0132450331125828	0	1	2	3	135	0.0315789473684211	0.075	0.148188803512623	0.506111111111111	0.0222222222222222	0.0421052631578947	4	49	286	1533	0.974637435920293	0.437705228077665	0.143177954078743	Inf	0.480010555482254	1.06002331002331	0.585176541892246	1.07200298278221	0.310250724884871	0.991894545185102	0.275000778078239	1	91	88
TCGA-AG-3601-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	107	0	0	0	0	107	4387	1	10	9	20	1187	4	5	4	13	1073	6	9	20	35	1078	3	10	26	39	1049	0	2	6	8	151	0.0747663551401869	0.205128205128205	0.143946615824595	1.42502971642044	0.0529801324503311	2	2	1	5	155	0.0467289719626168	0.142857142857143	0.14378478664193	0.993548387096774	0.032258064516129	0.0841121495327103	9	46	306	1821	0.39770693644189	1.16420921784854	0.569642809741127	Inf	1.13743315508021	1.54466230936819	0.380461721883903	1.69976963411769	1.057757885763	0.501639333975813	1.06810760010109	0.0968421052631578	98	98
TCGA-AG-3602-01A-02W-0833-10	0	0	0	0	47	0	0	0	0	47	1927	0	2	0	2	435	1	1	2	4	453	0	2	13	15	538	4	2	20	26	501	2	0	1	3	65	0.0638297872340425	0.115384615384615	0.129740518962076	0.889349112426036	0.0461538461538462	0	1	1	2	55	0.0425531914893617	0.133333333333333	0.102230483271375	1.30424242424242	0.0363636363636364	0.0851063829787234	4	33	120	919	0.634328559473082	0.928333933677251	0.295946229556391	Inf	0.936036036036036	4.32916666666667	0.0695089645240409	7.63081579814389	0.524747474747475	0.906327691656403	0.494338177872082	1	43	43
TCGA-AG-3605-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	60	0	0	0	0	60	2460	1	3	0	4	623	1	2	3	6	604	2	6	14	22	615	2	4	22	28	618	1	1	2	4	86	0.0666666666666667	0.142857142857143	0.13915857605178	1.0265780730897	0.0465116279069767	1	3	0	4	79	0.0666666666666667	0.181818181818182	0.128455284552846	1.41542002301496	0.0506329113924051	0.0666666666666667	4	36	165	1068	0.800300694072482	0.719358839173359	0.23123605119834	Inf	0.747272727272727	3.73636363636364	0.0903759653304243	6.45628235345358	0.415151515151515	0.96177195405825	0.38095329791661	1	56	56
TCGA-AG-3608-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	57	0	0	0	0	57	2337	0	2	0	2	603	0	4	0	4	519	1	4	21	26	595	2	5	18	25	620	0	0	0	0	71	0	0	0.114516129032258	0	0	1	1	0	2	81	0.0350877192982456	0.0769230769230769	0.136134453781513	0.565052231718899	0.0246913580246914	0.0175438596491228	1	41	152	1063	0.99610599631091	0.17070013831812	0.00852160014611592	Inf	0.19031954887218	2.66447368421053	0.331728317230046	3.49102654455274	0	1	0	1	56	56
TCGA-AG-3609-01A-02W-0833-10	0	0	0	0	90	1	0	0	0	89	3649	6	6	3	15	907	5	2	1	8	923	4	4	19	27	850	7	8	24	39	969	2	0	5	7	138	0.0777777777777778	0.179487179487179	0.142414860681115	1.2603121516165	0.0507246376811594	1	1	3	5	123	0.0555555555555556	0.185185185185185	0.144705882352941	1.27973501957242	0.040650406504065	0.122222222222222	11	43	261	1558	0.148846187564772	1.52664282668675	0.794005127752445	Inf	1.41968213424152	1.90073145245559	0.203525136636463	2.23722641967459	1.29662300632629	0.274669159675628	1.36416795898325	0.0995327192661963	79	78
TCGA-AG-3611-01A-01W-0833-10	0	0	0	0	51	0	0	0	0	51	2091	0	2	3	5	495	1	5	0	6	536	1	3	15	19	548	1	0	20	21	512	0	0	1	1	70	0.0196078431372549	0.0476190476190476	0.13671875	0.348299319727891	0.0142857142857143	0	0	0	0	71	0	0	0.12956204379562	0	0	0.0196078431372549	1	36	141	919	0.994600981207592	0.181203670599672	0.00900962010943809	Inf	0.203181905309565	0	1	0	0.214792299898683	0.992875075370347	0.191860296300339	1	50	50
TCGA-AG-3612-01A-01W-0833-10	0	0	1	1	72	0	0	0	0	72	2952	3	1	3	7	742	5	4	2	11	727	3	6	9	18	705	2	9	25	36	778	2	2	2	6	121	0.0833333333333333	0.166666666666667	0.155526992287918	1.07162534435262	0.0495867768595041	2	0	2	4	101	0.0555555555555556	0.222222222222222	0.143262411347518	1.55115511551155	0.0396039603960396	0.111111111111111	8	31	222	1261	0.22613510257058	1.46543334380954	0.667964915650106	Inf	1.37029337029337	5.34414414414414	0.00228979683609796	22.6379534256919	0.785903550609433	0.769709367899175	0.757484484172543	1	64	64
TCGA-AG-3726-01A-02W-0899-10	0	0	0	0	132	0	0	3	3	109	4469	4	5	2	11	1040	3	4	2	9	1025	5	9	31	45	1184	4	8	32	44	1220	1	3	0	4	137	0.0303030303030303	0.0909090909090909	0.112295081967213	0.809555408095554	0.0291970802919708	0	2	1	3	151	0.0227272727272727	0.0666666666666667	0.127533783783784	0.522737306843267	0.0198675496688742	0.0151515151515152	2	70	288	2116	0.998796732180341	0.209996134250832	0.0364525753915252	Inf	0.231867283950617	0.927469135802469	0.68341459128014	0.918423741415871	0.132495590828924	0.999649626824378	0.118551964757696	1	130	107
TCGA-AG-3727-01A-01W-0899-10	0	0	0	0	81	0	3	0	3	78	3198	0	2	2	4	797	4	2	4	10	729	0	5	20	25	844	1	4	34	39	828	1	2	1	4	122	0.0493827160493827	0.102564102564103	0.147342995169082	0.69609079445145	0.0327868852459016	0	0	2	2	112	0.0246913580246914	0.08	0.132701421800948	0.602857142857143	0.0178571428571429	0.0493827160493827	4	51	234	1438	0.957909295274051	0.482144993627464	0.157717694141611	Inf	0.51965811965812	7.14529914529915	0.140466228332337	Inf	0.39696106362773	0.985377793454174	0.361636315979205	0.545454545454546	77	74
TCGA-AG-3731-01A-11D-1733-10	0	0	0	0	211	0	1	8	9	202	8282	5	40	1	46	1944	1	29	1	31	2197	5	7	52	64	2060	9	7	45	61	2081	7	2	2	11	317	0.0521327014218009	0.180327868852459	0.152330610283518	1.1837927289652	0.0347003154574132	5	0	0	5	299	0.023696682464455	0.078125	0.145145631067961	0.538252508361204	0.0167224080267559	0.0663507109004739	14	97	616	3525	0.784257319643656	0.825949036830192	0.480574143344095	Inf	0.847870597870598	5.76205936920223	8.8005321593423e-09	34.2653481708913	0.138606239121703	0.999996589411097	0.120500918893341	0.000965052278614514	197	188
TCGA-AG-3732-01A-11D-1657-10	0	0	0	0	168	2	4	11	15	151	6191	5	34	1	40	1474	0	39	0	39	1623	2	6	31	39	1572	2	3	28	33	1522	0	2	3	5	221	0.0297619047619048	0.151515151515152	0.145203679369251	1.04346633758398	0.0226244343891403	0	0	2	2	207	0.0119047619047619	0.0512820512820513	0.131679389312977	0.389446302489781	0.00966183574879227	0.0297619047619048	5	58	428	2666	0.946497107853878	0.53706692114953	0.203512575915346	Inf	0.573727933541018	0	1	0	0.612624742594646	0.92366661802561	0.576841017804143	0.020979020979021	163	146
TCGA-AG-3742-01A-11D-1657-10	0	0	0	0	221	0	7	3	10	209	8569	3	29	1	33	1977	2	38	2	42	2156	3	9	53	65	2226	4	9	56	69	2210	2	3	4	9	313	0.0407239819004525	0.130434782608696	0.141628959276018	0.920961244617308	0.0287539936102236	0	3	2	5	303	0.0226244343891403	0.0769230769230769	0.136118598382749	0.565118050266565	0.0165016501650165	0.0361990950226244	8	108	616	3820	0.993479784833926	0.459417375437627	0.222462562259943	Inf	0.496641289744738	2.05751391465677	0.253043500242957	2.47982598541909	0.39640176337424	0.99840788515762	0.361296085989441	0.208695652173913	213	201
TCGA-AG-3878-01A-02W-0899-10	0	0	0	0	80	0	2	1	3	76	3116	2	2	1	5	793	1	3	3	7	766	0	6	20	26	745	2	7	29	38	812	1	1	0	2	113	0.025	0.0526315789473684	0.139162561576355	0.378202142524453	0.0176991150442478	0	1	0	1	119	0.0125	0.0384615384615385	0.159731543624161	0.240788623141564	0.00840336134453781	0.0125	1	50	232	1325	0.999702740037482	0.114298585363166	0.00569394316655243	Inf	0.131592292089249	3.35560344827586	0.276654417062384	5.7011441849014	0	1	0	1	79	75
TCGA-AG-3881-01A-01W-0899-10	0	0	0	0	96	0	0	2	2	93	3813	3	4	2	9	915	4	5	2	11	859	2	8	30	40	1035	4	5	24	33	1004	2	1	3	6	125	0.0625	0.181818181818182	0.124501992031873	1.46036363636364	0.048	0	2	0	2	120	0.0208333333333333	0.05	0.115942028985507	0.43125	0.0166666666666667	0.0520833333333333	5	55	245	1794	0.860388430233658	0.665789278396022	0.250902374460443	Inf	0.693537414965986	2.77414965986395	0.157110172666406	3.6576775613614	0.462358276643991	0.964112215827251	0.430858835512604	1	91	88
TCGA-AG-3882-01A-01W-0899-10	0	0	0	0	61	0	2	0	2	58	2378	0	3	0	3	608	2	1	1	4	534	1	5	23	29	604	1	5	16	22	632	0	1	2	3	79	0.0491803278688525	0.136363636363636	0.125	1.09090909090909	0.0379746835443038	0	0	2	2	84	0.0327868852459016	0.0689655172413793	0.139072847682119	0.495894909688013	0.0238095238095238	0.0655737704918033	4	37	163	1073	0.806321391262339	0.711825653836267	0.229075844562653	Inf	0.739787520574592	0	1	0	0.77772534214252	0.773839251435452	0.752475156564089	0.0476190476190476	57	54
TCGA-AG-3883-01A-02W-0899-10	0	0	0	0	125	0	0	3	3	122	5002	3	3	2	8	1178	2	4	2	8	1241	1	15	37	53	1341	4	7	42	53	1242	3	0	1	4	168	0.032	0.0754716981132075	0.135265700483092	0.557951482479784	0.0238095238095238	0	8	1	9	178	0.072	0.169811320754717	0.132736763609247	1.27930888276447	0.050561797752809	0.04	5	79	346	2237	0.990582326038399	0.409295898162432	0.156299592338998	Inf	0.444364161849711	4.47919075144509	0.0197152577133511	9.68237970611207	0.188995390356333	0.999826326901871	0.16799072207806	1	120	117
TCGA-AG-3885-01A-01W-0899-10	0	0	2	2	193	4	2	6	8	180	7380	1	34	2	37	1730	4	41	6	51	1703	3	5	38	46	1926	3	7	36	46	2021	0	1	5	6	243	0.0310880829015544	0.130434782608696	0.120237506185057	1.08480944712829	0.0246913580246914	0	2	1	3	251	0.0155440414507772	0.0652173913043478	0.130321910695742	0.500433050407067	0.0119521912350598	0.0310880829015544	6	74	494	3453	0.944153041379091	0.566812891751423	0.238633396699569	Inf	0.599240890688259	0	1	0	0.647827989933253	0.91289464632117	0.616816956470634	0.0090497737556561	187	174
TCGA-AG-3887-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	76	0	2	2	4	72	2952	2	4	1	7	709	3	5	0	8	703	2	5	26	33	722	2	7	15	24	818	1	0	1	2	113	0.0263157894736842	0.0833333333333333	0.138141809290954	0.603244837758112	0.0176991150442478	1	1	1	3	91	0.0394736842105263	0.0909090909090909	0.126038781163435	0.721278721278721	0.032967032967033	0.0526315789473684	4	41	204	1336	0.862481973734597	0.639084200046394	0.207079308111785	Inf	0.671023965141612	3.77450980392157	0.0885215887369903	6.53551110699707	0.368244858919177	0.977882975604599	0.336003536109525	1	72	68
TCGA-AG-3890-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	77	0	1	1	2	74	3034	1	4	5	10	785	4	4	2	10	807	3	9	19	31	683	7	4	12	23	759	4	0	1	5	125	0.0649350649350649	0.217391304347826	0.164690382081686	1.32	0.04	3	2	2	7	100	0.0909090909090909	0.225806451612903	0.146412884333821	1.54225806451613	0.07	0.12987012987013	10	31	225	1217	0.100425880024363	1.74402368743155	0.85958266399154	Inf	1.56314363143631	4.48622222222222	0.000190548021900623	12.5846913052327	0.620215053763441	0.881365965798569	0.579705042991907	0.213756898640463	67	64
TCGA-AG-3892-01A-01W-1073-09	0	0	2	2	2187	0	4	1	5	2180	89380	4	86	167	257	25220	9	93	183	285	25066	3	405	438	846	19524	2	378	412	792	19570	1	332	37	370	3635	0.169181527206219	0.467171717171717	0.185743484925907	2.51514456810193	0.101788170563961	1	347	34	382	3661	0.17466849565615	0.451536643026005	0.187512804753124	2.4080309801802	0.104343075662387	0.0333790580704161	73	782	7296	31798	1	0.406847833984546	0.328447535449301	Inf	0.457490445778188	2.14331140350877	0.235632825559681	2.90534939629835	0.447573851909185	1	0.397225499221025	1.10909463699096e-19	2114	2107
TCGA-AG-3893-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	115	0	0	1	1	113	4633	4	4	4	12	1101	1	5	2	8	1096	5	8	32	45	1203	5	13	30	48	1233	2	5	3	10	163	0.0869565217391304	0.208333333333333	0.132197891321979	1.57592024539877	0.0613496932515337	1	1	0	2	171	0.0173913043478261	0.0444444444444444	0.14214463840399	0.312670565302144	0.0116959064327485	0.0521739130434783	6	66	334	2102	0.939869994592088	0.572235177669662	0.239518447999442	Inf	0.607784431137725	2.18802395209581	0.148730059187073	2.6957391215535	0.352907089047711	0.993392438207107	0.320100848947872	1	109	107
TCGA-AG-3894-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	104	0	2	2	4	99	4059	4	2	5	11	938	3	3	2	8	959	3	8	27	38	1073	8	3	31	42	1089	0	1	0	1	133	0.00961538461538462	0.0238095238095238	0.122130394857668	0.194951664876477	0.0075187969924812	0	2	0	2	131	0.0192307692307692	0.0526315789473684	0.122087604846226	0.431096826034552	0.0152671755725191	0	0	69	264	1898	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	104	99
TCGA-AG-3896-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	106	0	1	0	1	105	4305	5	5	3	13	1046	1	4	1	6	992	3	7	36	46	1138	3	2	35	40	1129	1	1	1	3	150	0.0283018867924528	0.075	0.132860938883968	0.5645	0.02	0	3	2	5	157	0.0471698113207547	0.108695652173913	0.137961335676626	0.787870396012185	0.0318471337579618	0.0377358490566038	4	73	307	1960	0.994611801433108	0.349935553004531	0.115846098950399	Inf	0.383603367316722	1.23072747014115	0.583007056697137	1.27672179077969	0.312015414965362	0.997413431830779	0.281760386416265	0.569230769230769	102	101
TCGA-AG-3898-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	110	0	1	0	1	108	4428	5	4	3	12	1117	3	3	2	8	1095	1	7	34	42	1115	3	6	37	46	1101	1	0	2	3	143	0.0272727272727273	0.0652173913043478	0.129881925522253	0.502128306476132	0.020979020979021	0	2	0	2	148	0.0181818181818182	0.0476190476190476	0.132735426008969	0.358751608751609	0.0135135135135135	0.0272727272727273	3	72	291	1925	0.997841788687788	0.275727960161342	0.0730856919143932	Inf	0.304604810996564	1.90378006872852	0.431358896066753	2.20401032433388	0.21451043027927	0.999405685927443	0.191820109372351	1	107	105
TCGA-AG-3901-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	66	0	0	0	0	66	2706	0	2	0	2	629	2	4	2	8	684	2	4	18	24	740	1	2	29	32	653	0	0	0	0	81	0	0	0.124042879019908	0	0	1	1	0	2	85	0.0303030303030303	0.0833333333333333	0.114864864864865	0.725490196078431	0.0235294117647059	0.0151515151515152	1	49	166	1227	0.998095610752257	0.150949872309468	0.00757284256879525	Inf	0.167831325301205	2.79718875502008	0.317861734203103	3.69040186955357	0	1	0	1	65	65
TCGA-AG-3902-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	135	0	0	0	0	134	5494	9	10	7	26	1430	6	6	9	21	1405	7	9	32	48	1321	8	5	26	39	1338	2	2	3	7	207	0.0518518518518519	0.179487179487179	0.154708520179372	1.16016350798959	0.0338164251207729	3	2	2	7	190	0.0518518518518519	0.145833333333333	0.143830431491294	1.01392543859649	0.0368421052631579	0.0740740740740741	10	63	397	2262	0.665574083173541	0.90446081351694	0.466681190490759	Inf	0.917497670887823	2.23257766582704	0.061676061620389	2.84732966602793	0.577390775644923	0.945503596958035	0.537623713907087	1	125	124
TCGA-AG-3909-01A-01W-1073-09	0	0	1	1	85	0	0	2	2	83	3403	1	4	0	5	754	1	5	1	7	846	1	10	24	35	861	3	3	30	36	942	0	0	1	1	118	0.0117647058823529	0.0277777777777778	0.125265392781316	0.221751412429379	0.00847457627118644	1	0	1	2	94	0.0235294117647059	0.0571428571428571	0.10917537746806	0.523404255319149	0.0212765957446809	0.0352941176470588	3	55	212	1591	0.972033984889495	0.40948932360754	0.107595745096317	Inf	0.439899154196487	2.12617924528302	0.394759895025724	2.49967139187237	0.314989517819707	0.989965882545717	0.288765663860446	1	82	80
TCGA-AG-3999-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	97	0	1	0	1	94	3854	1	2	5	8	867	1	2	3	6	896	1	4	32	37	1003	3	4	36	43	1088	1	0	0	1	125	0.0103092783505155	0.0232558139534884	0.114889705882353	0.202418604651163	0.008	1	1	2	4	116	0.0412371134020619	0.108108108108108	0.115653040877368	0.934762348555452	0.0344827586206897	0.0412371134020619	4	68	241	1850	0.971256779825854	0.451673146917497	0.149068319499254	Inf	0.482019363762102	4.33817427385892	0.0686120765748946	7.66247955838648	0.255186721991701	0.997420588776692	0.232709273498493	1	93	90
TCGA-AG-4001-01A-02W-1073-09	0	0	0	0	124	0	1	2	3	120	4920	2	6	1	9	1134	2	3	1	6	1237	4	7	47	58	1238	4	4	39	47	1311	1	1	3	5	164	0.0403225806451613	0.106382978723404	0.12509534706331	0.850415153087701	0.0304878048780488	1	2	1	4	168	0.032258064516129	0.0689655172413793	0.135702746365105	0.508210180623974	0.0238095238095238	0.0483870967741935	6	88	332	2217	0.986575668251517	0.455399346173571	0.192095701750374	Inf	0.490066649577032	1.91942771084337	0.281353547822045	2.22498651323768	0.357102829924349	0.997047419557552	0.325834447082321	0.619909502262444	118	114
TCGA-AG-4005-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	120	0	1	3	4	115	4715	4	7	2	13	1141	5	6	2	13	1090	3	8	38	49	1194	4	6	30	40	1290	2	1	1	4	153	0.0333333333333333	0.1	0.118604651162791	0.843137254901961	0.0261437908496732	1	3	0	4	175	0.0333333333333333	0.0816326530612245	0.146566164154104	0.556967930029155	0.0228571428571429	0.0333333333333333	4	71	328	2156	0.991839768290747	0.370419471020604	0.122597939040604	Inf	0.40390243902439	3.24564459930314	0.0539739029651821	4.92492196787854	0.111370157819225	0.999926630797137	0.0981473102596725	0.569230769230769	116	111
TCGA-AG-4007-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	165	0	4	0	4	161	6601	4	5	4	13	1467	4	8	5	17	1690	3	9	48	60	1754	3	12	56	71	1690	3	5	3	11	215	0.0666666666666667	0.154929577464789	0.127218934911243	1.21781853914183	0.0511627906976744	1	2	3	6	214	0.0363636363636364	0.1	0.122006841505131	0.819626168224299	0.0280373831775701	0.0606060606060606	10	100	429	3015	0.88941835043204	0.702859445545757	0.36848779928913	Inf	0.729815638906548	5.35198135198135	0.00298246158698461	14.0358061386259	0.463152232383002	0.991730003757259	0.430358341580735	0.707985303535915	155	151
TCGA-AG-4008-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	77	0	1	1	2	74	3034	0	3	2	5	739	3	6	2	11	683	0	3	19	22	814	1	8	27	36	798	1	1	1	3	94	0.038961038961039	0.0833333333333333	0.117794486215539	0.707446808510638	0.0319148936170213	0	1	0	1	109	0.012987012987013	0.0454545454545455	0.133906633906634	0.339449541284404	0.00917431192660551	0.025974025974026	2	45	203	1409	0.985495035116152	0.308626764252734	0.0528708002688778	Inf	0.337910072319463	7.94088669950739	0.126472411655301	Inf	0.172627971728422	0.997820905846029	0.154331949988348	1	75	72
TCGA-AG-4015-01A-01W-1073-09	0	0	0	0	97	0	0	1	1	95	3895	4	4	1	9	961	2	6	4	12	956	0	10	26	36	1012	2	5	31	38	966	0	1	4	5	129	0.0515463917525773	0.131578947368421	0.133540372670807	0.98531211750306	0.0387596899224806	0	3	2	5	141	0.0515463917525773	0.138888888888889	0.139328063241107	0.996847911741529	0.0354609929078014	0.0618556701030928	6	53	270	1708	0.831831786767575	0.716248022952755	0.297012221202784	Inf	0.745009416195857	0	1	0	0.771150097465887	0.80655676136357	0.744324809301847	0.0108359133126935	91	89
TCGA-AG-A002-01A-01W-A00K-09	0	0	0	0	12312	1	25	17	42	12255	502455	47	351	439	837	135838	53	315	474	842	137352	9	2538	2746	5293	114292	16	2518	2749	5283	114973	0	2013	204	2217	20328	0.180068226120858	0.419647927314026	0.176806728536265	2.37348392104858	0.109061393152302	0	2038	202	2240	20300	0.181936322287199	0.423200453429057	0.177615231162286	2.38268109474452	0.110344827586207	0.0329759584145549	406	5114	40628	188637	1	0.368606982833841	0.337793995240377	Inf	0.415048904303878	0	1	0	0.41693720687123	1	0.370417763853851	7.67023552891641e-127	11906	11849
TCGA-AG-A008-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	49	0	0	0	0	49	2009	1	1	0	2	500	1	3	2	6	477	3	1	17	21	514	0	3	17	20	518	0	0	1	1	72	0.0204081632653061	0.05	0.138996138996139	0.359722222222222	0.0138888888888889	2	1	2	5	79	0.102040816326531	0.238095238095238	0.153696498054475	1.54912597950573	0.0632911392405063	0.102040816326531	5	32	151	881	0.648200594436247	0.911737753034835	0.333408948996669	Inf	0.923572579201718	4.55629139072848	0.058839134399482	11.6222008959629	0.603038566419945	0.890952607433482	0.564874917593252	1	44	44
TCGA-AG-A00C-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	69	0	0	0	0	69	2829	1	1	1	3	688	1	4	3	8	724	4	10	21	35	705	3	8	12	23	712	0	2	0	2	95	0.0289855072463768	0.0869565217391304	0.133426966292135	0.651716247139588	0.0210526315789474	1	3	0	4	95	0.0579710144927536	0.114285714285714	0.134751773049645	0.84812030075188	0.0421052631578947	0.0144927536231884	1	39	190	1227	0.996664258744523	0.165696100024196	0.0082743315525203	Inf	0.186447368421053	1.06541353383459	0.63593726546675	1.07628093890234	0	1	0	1	68	68
TCGA-AG-A00H-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	75	0	0	0	0	74	3034	3	4	1	8	762	1	3	0	4	773	3	4	23	30	737	5	7	20	32	762	2	2	0	4	115	0.0533333333333333	0.125	0.150918635170604	0.828260869565217	0.0347826086956522	2	1	2	5	127	0.0666666666666667	0.166666666666667	0.172320217096336	0.967191601049869	0.0393700787401575	0.08	6	45	242	1257	0.850527610233941	0.692710245025032	0.284924693817179	Inf	0.728731161886242	3.09710743801653	0.0281931594133101	5.18576576299563	0.28810301748991	0.994925813579375	0.253517575343961	0.619909502262444	69	68
TCGA-AG-A00Y-01A-02W-A005-10	0	0	1	1	149	5	20	13	33	111	4551	4	11	2	17	1116	3	13	4	20	1087	4	6	30	40	1138	4	8	22	34	1210	0	2	3	5	166	0.0335570469798658	0.147058823529412	0.137190082644628	1.07193479801559	0.0301204819277108	1	1	11	13	166	0.087248322147651	0.325	0.145869947275923	2.22801204819277	0.0783132530120482	0.100671140939597	15	45	332	2016	0.0196371015188657	2.02339574043161	1.15155736752909	Inf	1.76807228915663	0.884036144578313	0.705073895194771	0.86753977305503	1.90407784986098	0.0125185617712838	2.23619220642664	2.0077937570804e-05	134	96
TCGA-AG-A011-01A-01W-A00K-09	0	0	0	0	111	0	0	0	0	111	4551	4	3	1	8	1071	9	5	3	17	1138	3	10	30	43	1174	3	12	28	43	1168	1	3	3	7	161	0.0630630630630631	0.162790697674419	0.137842465753425	1.18099089989889	0.0434782608695652	3	1	2	6	148	0.0540540540540541	0.13953488372093	0.126064735945486	1.1068510370836	0.0405405405405405	0.0810810810810811	9	55	309	2033	0.476301635173483	1.07659772275798	0.531368212099049	Inf	1.06583737864078	5.05285868392664	0.00372960476782158	13.1325706474566	0.653386898783618	0.894119396728624	0.620792848527303	1	102	102
TCGA-AG-A014-01A-02W-A00K-09	0	0	1	1	122	2	5	3	8	100	4100	1	8	1	10	990	1	6	2	9	1035	5	10	29	44	1021	7	5	25	37	1054	0	1	3	4	142	0.0327868852459016	0.108108108108108	0.134724857685009	0.802436239055957	0.028169014084507	1	3	3	7	140	0.0573770491803279	0.159090909090909	0.137120470127326	1.16022727272727	0.05	0.0573770491803279	7	59	282	1793	0.808588633749433	0.754448293886224	0.337549261	Inf	0.780410487857296	0.613179669030733	0.826856620434388	0.578139454353181	0.817572892040977	0.759383872639884	0.794849055758165	0.0634674922600621	115	93
TCGA-AG-A015-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	64	0	0	0	0	64	2624	2	3	2	7	709	2	3	4	9	665	2	5	17	24	615	2	10	12	24	635	1	2	0	3	95	0.046875	0.125	0.149606299212598	0.835526315789474	0.0315789473684211	1	2	1	4	109	0.0625	0.166666666666667	0.177235772357724	0.940366972477064	0.036697247706422	0.046875	3	30	204	1046	0.92179396382206	0.512963438483561	0.131653834559686	Inf	0.557040998217469	3.06372549019608	0.128356884779674	5.11753931610744	0.211291413116971	0.994068999096758	0.183260250863381	1	61	61
TCGA-AG-A016-01A-01W-A005-10	0	0	0	0	57	0	0	0	0	57	2337	1	2	1	4	577	1	1	1	3	551	1	1	20	22	619	1	4	23	28	590	0	1	2	3	90	0.0526315789473684	0.107142857142857	0.152542372881356	0.702380952380952	0.0333333333333333	1	0	0	1	90	0.0175438596491228	0.0454545454545455	0.145395799676898	0.312626262626263	0.0111111111111111	0.0526315789473684	3	42	180	1029	0.971041905125348	0.40854585018853	0.10624817902621	Inf	0.447777777777778	3.35833333333333	0.27669230401758	5.70367805685392	0.312403100775194	0.991148065195521	0.279044878516805	1	54	54
TCGA-AG-A01L-01A-01W-A00K-09	0	0	0	0	74	0	1	0	1	72	2952	1	0	0	1	606	2	4	1	7	694	0	2	24	26	841	1	3	34	38	811	0	1	3	4	103	0.0540540540540541	0.105263157894737	0.127003699136868	0.828819621870209	0.0388349514563107	0	0	2	2	95	0.027027027027027	0.0769230769230769	0.112960760998811	0.680971659919028	0.0210526315789474	0.0675675675675676	5	54	198	1454	0.848587100037101	0.680081907330402	0.255589806251885	Inf	0.707070707070707	0	1	0	0.719261581330547	0.838069822912248	0.69290790092979	0.0151515151515152	69	67
TCGA-AG-A01W-01A-21W-A096-10	0	0	0	0	127	0	0	2	2	125	5125	1	4	6	11	1218	3	7	6	16	1281	5	9	31	45	1304	3	11	39	53	1322	1	1	3	5	173	0.0393700787401575	0.0943396226415094	0.130862329803328	0.72090740538772	0.0289017341040462	1	0	3	4	167	0.031496062992126	0.0888888888888889	0.128067484662577	0.694078509647372	0.0239520958083832	0.062992125984252	8	70	340	2286	0.805607505023731	0.768472061931825	0.366379549967294	Inf	0.792156862745098	1.93088235294118	0.278885084408864	2.24026917997276	0.662016806722689	0.902449278095902	0.630423534515386	0.153434800493624	119	117
TCGA-AG-A01Y-01A-41W-A096-10	0	0	0	0	92	0	1	2	3	89	3649	1	10	5	16	945	4	7	2	13	902	3	6	22	31	945	4	2	23	29	857	1	0	1	2	133	0.0217391304347826	0.0689655172413793	0.155192532088681	0.44438682914182	0.0150375939849624	0	1	2	3	142	0.0326086956521739	0.0967741935483871	0.15026455026455	0.644025442980463	0.0211267605633803	0.0434782608695652	4	48	275	1527	0.965613787618864	0.462878884360327	0.151269117749728	Inf	0.504055944055944	0.936103896103896	0.686804826548097	0.925475032516152	0.436848484848485	0.975288225159921	0.396765748402455	0.523809523809524	88	85
TCGA-AG-A020-01A-21W-A096-10	0	0	0	0	79	0	1	3	4	74	3034	1	5	3	9	743	2	2	3	7	699	1	6	19	26	767	2	6	24	32	825	0	0	0	0	101	0	0	0.122424242424242	0	0	0	3	2	5	110	0.0632911392405063	0.192307692307692	0.143415906127771	1.34090909090909	0.0454545454545455	0.0253164556962025	2	44	211	1381	0.987875152614071	0.297643767878914	0.0509883881066637	Inf	0.328044508551411	0	1	0	0.350931334729417	0.982632884100271	0.31941729858729	0.444444444444444	77	72
TCGA-AG-A025-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	94	0	1	3	4	87	3567	2	6	2	10	851	2	3	2	7	839	1	5	24	30	888	3	4	33	40	989	0	2	0	2	116	0.0212765957446809	0.05	0.117290192113246	0.426293103448276	0.0172413793103448	0	0	1	1	112	0.0106382978723404	0.0333333333333333	0.126126126126126	0.264285714285714	0.00892857142857143	0.0106382978723404	1	60	228	1649	0.999590283788385	0.120603840424867	0.00602872455671002	Inf	0.134958297382801	0	1	0	0.144429055093875	0.999322186230406	0.129217659961413	1	93	86
TCGA-AG-A026-01A-32W-A096-10	0	0	0	0	218	0	2	2	4	213	8733	7	17	5	29	2173	6	14	7	27	2121	18	14	48	80	2218	19	15	43	77	2221	6	1	4	11	312	0.0504587155963303	0.142857142857143	0.140477262494372	1.01694139194139	0.0352564102564103	9	3	5	17	310	0.0779816513761468	0.2125	0.139765554553652	1.52040322580645	0.0548387096774194	0.110091743119266	24	104	622	3817	0.0860286861104024	1.41602733617186	0.932826181275343	Inf	1.3381229903537	2.89323889806205	7.52762348767196e-05	4.18239107212018	0.705823115790961	0.904206793827041	0.67358771127432	0.176476338697089	194	189
TCGA-AG-A02G-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	51	0	1	1	2	47	1927	0	1	0	1	451	1	2	2	5	435	0	1	20	21	519	2	3	15	20	522	0	0	1	1	65	0.0196078431372549	0.05	0.124521072796935	0.401538461538462	0.0153846153846154	0	0	2	2	64	0.0392156862745098	0.0952380952380952	0.123314065510597	0.772321428571428	0.03125	0.0588235294117647	3	34	129	912	0.85231891310997	0.624035036205587	0.160379895748907	Inf	0.654305468258957	0	1	0	0.691694352159468	0.824972463287447	0.66301040821284	0.1	48	44
TCGA-AG-A02N-01A-11W-A096-10	0	0	0	0	1221	0	13	87	100	1121	45961	6	44	6	56	10157	11	37	8	56	10291	0	43	472	515	12782	3	44	447	494	12731	0	1	1	2	1454	0.00163800163800164	0.00404858299595142	0.114209410101327	0.0354487689968759	0.00137551581843191	0	2	1	3	1376	0.00245700245700246	0.0058252427184466	0.107651384759818	0.0541121020546399	0.00218023255813953	0.00163800163800164	2	920	2830	22683	1	0.0174334410097889	0.00306273851114094	Inf	0.0195557361090884	0	1	0	0.0196195742030245	1	0.0174904878682621	0.444444444444444	1219	1119
TCGA-AG-A02X-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	139	1	1	0	1	132	5412	1	6	2	9	1282	5	7	2	14	1343	4	11	45	60	1389	2	11	36	49	1398	0	2	4	6	206	0.0431654676258993	0.122448979591837	0.147353361945637	0.830988706162077	0.029126213592233	1	3	1	5	218	0.0359712230215827	0.0833333333333333	0.156947444204464	0.530963302752294	0.0229357798165138	0.0431654676258993	6	81	424	2363	0.993779671065217	0.412914547986958	0.174086141404825	Inf	0.453318152244632	1.09551886792453	0.628938956061492	1.11461362852092	0.405747728860936	0.996053597760246	0.366741249227239	0.148606811145511	133	126
TCGA-AG-A032-01A-01W-A00E-09	0	0	0	0	78	0	0	0	0	74	3034	1	2	2	5	722	0	5	1	6	710	4	5	18	27	787	1	13	22	36	815	0	1	1	2	102	0.0256410256410256	0.0555555555555556	0.125153374233129	0.443899782135076	0.0196078431372549	1	0	0	1	97	0.0128205128205128	0.037037037037037	0.123252858958069	0.300496372661321	0.0103092783505155	0.0256410256410256	2	43	199	1403	0.980429451386535	0.32806659910536	0.0561406618408928	Inf	0.357788944723618	1.61005025125628	0.485949033024713	1.76179637510664	0.201256281407035	0.99481712839616	0.180877942644711	1	76	72
TCGA-AG-A036-01A-12W-A096-10	0	0	0	0	150	0	0	1	1	148	6068	8	8	3	19	1456	5	12	4	21	1478	12	6	34	52	1507	7	10	39	56	1627	2	5	3	10	213	0.0666666666666667	0.178571428571429	0.130915795943454	1.3640174379611	0.0469483568075117	3	0	3	6	205	0.04	0.115384615384615	0.136031851360319	0.848217636022514	0.0292682926829268	0.0733333333333333	11	81	418	2716	0.696289951787326	0.882446962369442	0.47434283080238	Inf	0.896453089244851	1.97305464618484	0.0999242064587814	2.31987729725928	0.616241725109786	0.934721505880074	0.581957745458916	1	139	137
TCGA-AH-6544-01A-11D-1826-10	0	0	1	1	186	0	0	2	2	184	7544	5	17	6	28	1773	3	25	10	38	1905	0	18	40	58	1973	8	15	37	60	1893	2	2	3	7	274	0.0376344086021505	0.116666666666667	0.144743792921289	0.806021897810219	0.0255474452554745	0	3	4	7	271	0.0376344086021505	0.120689655172414	0.137354282818044	0.878674131568902	0.025830258302583	0.0483870967741935	9	76	545	3321	0.86182001491213	0.721661998807092	0.3619979802739	Inf	0.751084727468969	1.77339449541284	0.314897347493594	2.03076813548781	0.644870725604671	0.929313262878758	0.609423675628255	0.103188405797102	177	175
TCGA-AH-6547-01A-11D-1826-10	0	0	1	1	43	0	0	2	2	41	1681	0	14	1	15	452	0	13	0	13	482	0	4	2	6	348	0	2	5	7	399	0	0	1	1	74	0.0232558139534884	0.142857142857143	0.18546365914787	0.77027027027027	0.0135135135135135	0	1	0	1	67	0.0232558139534884	0.166666666666667	0.192528735632184	0.865671641791045	0.0149253731343284	0.0232558139534884	1	6	141	606	0.769412438860473	0.716600372585345	0.0314209939073685	Inf	0.756838905775076	NaN	1	0	0.756838905775076	0.769412438860473	0.716600372585345	1	42	40
TCGA-AH-6549-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	138	0	1	4	5	133	5453	3	17	3	23	1327	1	20	0	21	1359	1	15	27	43	1332	5	14	27	46	1435	3	1	2	6	233	0.0434782608695652	0.130434782608696	0.162369337979094	0.803321515208061	0.0257510729613734	0	1	2	3	197	0.0217391304347826	0.0697674418604651	0.147897897897898	0.471727068823043	0.0152284263959391	0.0507246376811594	7	53	430	2337	0.842284184388233	0.717891570697872	0.320810130129775	Inf	0.750736434108527	3.21744186046512	0.0523964252632669	5.42984233486594	0.476658053402239	0.975944942407709	0.434884514846105	1	131	126
TCGA-AH-6643-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	191	0	1	2	3	185	7585	0	25	7	32	1879	3	35	11	49	1908	5	8	41	54	1929	4	9	37	50	1869	0	5	1	6	268	0.031413612565445	0.12	0.143392188336009	0.836865671641791	0.0223880597014925	0	1	2	3	283	0.0157068062827225	0.0555555555555556	0.146708138932089	0.378680800942285	0.0106007067137809	0.0157068062827225	3	84	551	3247	0.999837066108147	0.210510343254701	0.0561364739673025	Inf	0.237686964140434	0	1	0	0.265112383079715	0.999468568945881	0.235769545280703	0.205882352941176	188	182
TCGA-AH-6644-01A-21D-1826-10	0	0	1	1	141	0	3	4	7	134	5494	2	26	2	30	1287	3	14	0	17	1334	1	6	30	37	1333	4	9	37	50	1540	1	1	2	4	213	0.0283687943262411	0.08	0.138311688311688	0.578403755868545	0.0187793427230047	0	1	1	2	183	0.0141843971631206	0.0540540540540541	0.13728432108027	0.393738000295377	0.0109289617486339	0.0283687943262411	4	68	396	2477	0.992193360833284	0.368030737479517	0.121800211118963	Inf	0.403058361391695	1.4510101010101	0.524184993998422	1.56347255486954	0.324853007688829	0.996505682591856	0.293284170454522	0.545454545454546	137	130
TCGA-CI-6619-01B-11D-1826-10	1	0	0	1	145	0	0	4	4	141	5781	3	31	3	37	1474	3	27	2	32	1533	5	7	21	33	1381	4	7	28	39	1393	1	1	0	2	222	0.0137931034482759	0.0512820512820513	0.159368269921034	0.321783321783322	0.00900900900900901	1	1	1	3	203	0.0206896551724138	0.0909090909090909	0.146994931209269	0.618450515002239	0.0147783251231527	0.0206896551724138	3	55	425	2349	0.995542142090796	0.301559286845353	0.079553519115038	Inf	0.337606490872211	1.45045751633987	0.412509323251637	1.57885350064223	0.133205282112845	0.999693563239158	0.115189395703216	1	142	138
TCGA-CI-6620-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	126	0	2	4	6	120	4920	2	27	0	29	1161	1	28	1	30	1247	3	0	21	24	1178	0	6	31	37	1334	0	1	2	3	194	0.0238095238095238	0.0810810810810811	0.145427286356822	0.557536918361661	0.0154639175257732	2	0	0	2	171	0.0158730158730159	0.0833333333333333	0.145161290322581	0.574074074074074	0.0116959064327485	0.0317460317460317	4	51	365	2147	0.966763240918584	0.461456937057537	0.151405394125478	Inf	0.50052303860523	4.58812785388128	0.0575618485503324	11.7448492495186	0.264699683877766	0.997057786345984	0.235367400263858	1	122	116
TCGA-CI-6621-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	117	0	1	1	2	114	4674	2	9	3	14	1131	2	11	1	14	1182	4	10	27	41	1126	4	9	32	45	1235	1	2	1	4	185	0.0341880341880342	0.0888888888888889	0.149797570850202	0.593393393393393	0.0216216216216216	1	1	1	3	156	0.0256410256410256	0.0731707317073171	0.13854351687389	0.528142589118199	0.0192307692307692	0.0341880341880342	4	63	341	2020	0.990647444929587	0.376217592426122	0.12414769382131	Inf	0.413358427802337	1.73093841642229	0.326297302830718	1.9739542670859	0.234703514091158	0.998813283328735	0.207928974144698	1	113	110
TCGA-CI-6622-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	175	0	3	2	5	170	6970	0	24	2	26	1751	4	21	1	26	1750	4	15	34	53	1753	2	12	51	65	1716	1	1	3	5	255	0.0285714285714286	0.0769230769230769	0.148601398601399	0.517647058823529	0.0196078431372549	1	5	1	7	250	0.04	0.132075471698113	0.142612664004564	0.92611320754717	0.028	0.0342857142857143	6	85	505	2964	0.993766185211254	0.414377539587089	0.175086713551927	Inf	0.452921336089653	2.28976897689769	0.213832136443327	2.93338096322543	0.32326150262085	0.998973123527889	0.289907162495759	0.64040536122916	169	164
TCGA-CI-6624-01C-11D-1826-10	0	0	1	1	304	1	3	2	5	296	12136	11	34	11	56	3064	18	44	15	77	3203	21	21	38	80	2935	14	26	43	83	2934	7	2	6	15	454	0.0493421052631579	0.180722891566265	0.154737559645535	1.16793163844807	0.0330396475770925	6	4	5	15	421	0.0493421052631579	0.1875	0.143441226575809	1.30715558194774	0.0356294536817102	0.0789473684210526	24	92	875	4994	0.0597443752335574	1.48877801829653	0.978139433431172	Inf	1.38774384236453	2.4913306122449	0.00108545982243474	3.37158398540877	0.910885361552028	0.678104630176258	0.896924180376571	0.792494242590731	280	272
TCGA-CL-5917-01A-11D-1657-10	0	0	1	1	205	0	1	5	6	199	8159	7	45	4	56	1893	1	44	1	46	1956	4	3	36	43	2176	3	10	41	54	2134	1	2	2	5	276	0.024390243902439	0.0925925925925926	0.12933458294283	0.715915190552872	0.0181159420289855	0	0	3	3	268	0.0146341463414634	0.0697674418604651	0.123161764705882	0.566469975702881	0.0111940298507463	0.0292682926829268	6	78	544	3766	0.96135466476981	0.532584429883246	0.22464728343126	Inf	0.565913865546218	1.13182773109244	0.611472399934286	1.15374184978362	0.514467150496562	0.972166973937546	0.480812111696725	0.118881118881119	199	193
TCGA-CL-5918-01A-11D-1657-10	0	0	0	0	228	2	0	2	2	224	9184	5	35	3	43	1944	3	40	8	51	2110	7	12	41	60	2540	4	8	58	70	2590	0	2	0	2	280	0.0087719298245614	0.0285714285714286	0.108108108108108	0.264285714285714	0.00714285714285714	0	1	1	2	269	0.0087719298245614	0.0333333333333333	0.105905511811024	0.314745972738538	0.00743494423791822	0.0043859649122807	1	109	549	4581	0.999995600239979	0.0765681241560648	0.00385748199593674	Inf	0.0849478390461997	0	1	0	0.0943864878291108	0.999985082116733	0.0851623299850121	1	227	223
TCGA-DC-5337-01A-01D-1657-10	0	0	0	0	283	1	6	3	9	271	11111	0	61	0	61	2589	2	57	1	60	2508	0	13	58	71	2938	4	14	61	79	3076	0	0	1	1	334	0.00353356890459364	0.0126582278481013	0.108582574772432	0.116576972637004	0.0029940119760479	0	4	4	8	330	0.0282685512367491	0.112676056338028	0.112321307011573	1.00315834400341	0.0242424242424242	0.0176678445229682	5	118	664	5350	0.998282291927292	0.341447719262921	0.131849080497412	Inf	0.368180037222059	0	1	0	0.380555836792548	0.997591054356404	0.353427519812912	0.0294117647058824	278	266
TCGA-DC-5869-01A-01D-1657-10	0	0	1	1	187	2	4	10	14	171	7011	1	38	0	39	1463	2	37	1	40	1505	5	5	31	41	1986	4	7	40	51	2057	1	1	3	5	221	0.0267379679144385	0.0980392156862745	0.107438016528926	0.912518853695324	0.0226244343891403	0	1	2	3	198	0.0160427807486631	0.0731707317073171	0.0996978851963746	0.733924611973392	0.0151515151515152	0.0320855614973262	6	74	419	3624	0.847368081933119	0.701336557330302	0.295050045476196	Inf	0.723687350835322	1.07212940864492	0.626886660414595	1.0811555033373	0.679518639281993	0.870249495840999	0.655297278784581	0.118881118881119	181	165
TCGA-DC-6155-01A-11D-1657-10	0	1	2	3	144	1	3	1	4	139	5699	4	23	1	28	1172	0	30	0	30	1302	2	7	23	32	1629	4	4	41	49	1596	2	0	3	5	175	0.0347222222222222	0.102040816326531	0.109649122807018	0.930612244897959	0.0285714285714286	0	0	1	1	176	0.00694444444444444	0.03125	0.108041743400859	0.289240056818182	0.00568181818181818	0.0416666666666667	6	64	351	2874	0.786209445290686	0.767684161657587	0.321214434675218	Inf	0.787545787545788	3.06267806267806	0.132783892000509	4.0915466773146	0.574252136752137	0.926997818057207	0.545949412502487	0.567099567099567	138	133
TCGA-DC-6157-01A-11D-1657-10	1	0	2	3	183	2	1	4	5	176	7216	5	40	1	46	1736	1	39	2	42	1731	5	5	32	42	1830	6	10	30	46	1919	0	2	2	4	219	0.0218579234972678	0.0869565217391304	0.11412193850964	0.761961485010919	0.0182648401826484	3	1	2	6	225	0.0327868852459016	0.142857142857143	0.122950819672131	1.16190476190476	0.0266666666666667	0.0382513661202186	7	66	444	3305	0.775186912096074	0.789527613208872	0.355894722169754	Inf	0.809669258299395	2.30282555282555	0.133520838666228	2.79029249250898	0.544754431851206	0.944654424983543	0.513429021143428	1	176	169
TCGA-DC-6158-01A-11D-1657-10	0	2	0	2	154	1	1	3	4	147	6027	1	30	1	32	1566	1	28	0	29	1559	2	2	29	33	1401	13	2	38	53	1501	7	0	11	18	225	0.116883116883117	0.339622641509434	0.149900066622252	2.26566037735849	0.08	0	1	1	2	219	0.012987012987013	0.0606060606060606	0.156316916488223	0.387712743877128	0.0091324200913242	0.123376623376623	19	63	444	2458	0.0420160871482153	1.66925737034893	1.02447329759102	Inf	1.51444737420347	3.05015015015015	0.00419221857018053	4.84021178254385	1.17063331988705	0.327959658547205	1.20775715646662	0.204927155190733	135	128
TCGA-DC-6160-01A-11D-1657-10	0	0	0	0	187	3	2	5	7	176	7216	4	42	2	48	1627	1	39	2	42	1650	1	6	38	45	1968	1	4	36	41	1971	1	1	3	5	227	0.0267379679144385	0.121951219512195	0.115169964485033	1.05888041259267	0.0220264317180617	0	3	2	5	217	0.0267379679144385	0.111111111111111	0.110264227642276	1.00768049155146	0.0230414746543779	0.0320855614973262	6	70	444	3495	0.869439623082091	0.6747678751772	0.283482915494687	Inf	0.700391180654339	4.43581081081081	0.213106519126661	7.86366738625615	0.599433893352812	0.929179956503928	0.570472581372878	0.140866873065015	181	170
TCGA-DC-6681-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	178	0	4	0	4	174	7134	0	30	7	37	1721	1	30	3	34	1638	6	4	33	43	1904	6	7	47	60	1871	2	0	2	4	246	0.0224719101123595	0.0666666666666667	0.13148049171566	0.507046070460705	0.016260162601626	2	0	3	5	232	0.0280898876404494	0.116279069767442	0.121848739495798	0.954290296712109	0.021551724137931	0.050561797752809	9	83	478	3297	0.836931099261373	0.747971634471384	0.375998679530109	Inf	0.772580498453702	2.63249651324965	0.0555974721592623	3.44687906552164	0.49359309623431	0.97898940059717	0.459901378254905	1	169	165
TCGA-DC-6682-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	203	2	4	4	8	193	7913	2	22	1	25	1867	1	39	5	45	2061	4	8	42	54	1913	5	13	51	69	2072	2	1	2	5	308	0.0246305418719212	0.072463768115942	0.148648648648649	0.487483530961792	0.0162337662337662	2	2	3	7	243	0.0344827586206897	0.12962962962963	0.127025614218505	1.0204999237921	0.0288065843621399	0.0443349753694581	9	93	551	3434	0.951910455360714	0.603190445130785	0.304422244354086	Inf	0.638144550016014	3.21435773341399	0.0260855153439905	4.98278807124634	0.388833596783951	0.997290287159551	0.354169650291552	1	194	184
TCGA-DC-6683-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	118	3	0	0	0	115	4715	4	21	1	26	1256	4	19	0	23	1221	2	5	19	26	1114	3	8	29	40	1124	1	1	1	3	180	0.0254237288135593	0.075	0.160142348754448	0.468333333333333	0.0166666666666667	2	2	2	6	165	0.0508474576271186	0.230769230769231	0.148114901256732	1.55804195804196	0.0363636363636364	0.0508474576271186	6	47	345	1893	0.844811437633864	0.700560713318969	0.289597718119499	Inf	0.734372436423298	3.89217391304348	0.0290358662102221	8.21818828604096	0.405434782608696	0.984200809811059	0.365909160177365	1	112	109
TCGA-DT-5265-01A-21D-1826-10	0	0	0	0	118	0	2	2	4	114	4674	2	19	0	21	1121	0	20	1	21	1228	2	7	26	35	1169	2	4	31	37	1156	0	1	4	5	190	0.0423728813559322	0.135135135135135	0.164359861591695	0.822190611664296	0.0263157894736842	0	1	2	3	156	0.0254237288135593	0.0857142857142857	0.133447390932421	0.642307692307692	0.0192307692307692	0.0508474576271186	6	55	346	1979	0.905740658151056	0.624069353990326	0.259601972529533	Inf	0.660949493035156	0	1	0	0.707331913599026	0.868253018757733	0.672999792400662	0.00699300699300699	112	108
TCGA-DY-A0XA-01A-11D-A152-10	0	0	1	1	330	0	1	1	2	327	13407	10	72	5	87	3385	5	66	3	74	3435	14	26	40	80	3304	10	23	53	86	3283	3	3	6	12	484	0.0363636363636364	0.13953488372093	0.147426134632958	0.94647318854507	0.0247933884297521	5	5	5	15	487	0.0454545454545455	0.1875	0.147397094430993	1.27207392197125	0.0308008213552361	0.0575757575757576	19	98	971	5616	0.363980122951567	1.12135313882886	0.704771874289049	Inf	1.10163106146628	2.261242705115	0.0182865543050491	2.89121899345088	0.802376443750484	0.824325427341121	0.775893539782003	0.569404760261442	311	308
TCGA-DY-A1DC-01A-31D-A152-10	0	0	1	1	210	1	1	1	2	207	8487	7	48	2	57	2219	4	32	7	43	2101	7	13	26	46	2108	14	14	33	61	2059	4	4	4	12	300	0.0571428571428571	0.19672131147541	0.14570179698883	1.35016393442623	0.04	1	3	1	5	309	0.0238095238095238	0.108695652173913	0.146584440227704	0.741522442662164	0.0161812297734628	0.0476190476190476	10	70	609	3558	0.748954534829262	0.834657184793601	0.43359845136105	Inf	0.855295566502463	1.62913441238564	0.184203428349453	1.82541644510344	0.579861401018619	0.94425722169027	0.541025003465652	1	200	197
TCGA-DY-A1DD-01A-21D-A152-10	0	0	0	0	231	1	4	6	10	219	8979	5	51	2	58	2259	7	31	1	39	2306	4	15	43	62	2248	1	13	46	60	2166	0	5	4	9	330	0.038961038961039	0.15	0.152354570637119	0.984545454545455	0.0272727272727273	0	1	3	4	309	0.0173160173160173	0.0645161290322581	0.137455516014235	0.469360058461217	0.0129449838187702	0.0303030303030303	7	87	639	3775	0.987045881440764	0.475392476408257	0.216381564550529	Inf	0.514400825758332	0	1	0	0.543299748553744	0.97934941129306	0.504375754911938	0.00521739130434783	224	212
TCGA-DY-A1DF-01A-11D-A152-10	0	0	0	0	186	1	2	3	5	179	7339	5	25	7	37	1862	3	26	2	31	1831	7	9	39	55	1789	7	8	41	56	1857	4	3	0	7	270	0.0376344086021505	0.125	0.145395799676898	0.859722222222222	0.0259259259259259	2	2	2	6	274	0.032258064516129	0.109090909090909	0.153158188932364	0.71227604512276	0.0218978102189781	0.043010752688172	8	86	544	3102	0.97656018175553	0.530512992278408	0.255261682570314	Inf	0.570400500625782	2.87237394957983	0.0114745356740415	4.2743390070296	0.167555147058824	0.999959348660736	0.146249392799634	0.201556064073226	178	171
TCGA-DY-A1DG-01A-11D-A152-10	0	0	0	0	335	1	2	6	8	324	13284	7	62	2	71	3258	8	50	0	58	3222	3	21	64	88	3372	8	28	71	107	3432	2	6	7	15	494	0.0447761194029851	0.14018691588785	0.143939393939394	0.973930152484014	0.0303643724696356	0	4	9	13	479	0.0388059701492537	0.147727272727273	0.142052194543298	1.0399506547732	0.0271398747390397	0.0537313432835821	18	128	973	5831	0.783375112576838	0.842758114327533	0.527576239264084	Inf	0.862126736966591	1.27141922825376	0.481090433914812	1.33167070308118	0.828776978417266	0.823033963834145	0.805779070994293	0.000114104820121922	317	306
TCGA-DY-A1H8-01A-21D-A152-10	0	0	1	1	171	0	2	1	3	167	6847	1	29	2	32	1761	1	31	2	34	1665	3	11	39	53	1707	2	7	39	48	1714	0	2	1	3	241	0.0175438596491228	0.0625	0.140606767794632	0.444502074688797	0.012448132780083	1	3	1	5	261	0.0292397660818713	0.0943396226415094	0.152899824253076	0.617002819345045	0.0191570881226054	0.0175438596491228	3	80	502	2919	0.999756429999091	0.218108387629532	0.0581056893724938	Inf	0.246315941055057	1.36294820717131	0.548155567328886	1.45350086442545	0.174736949637348	0.999932684542012	0.153062471841843	1	168	164
TCGA-EF-5830-01A-01D-1657-10	0	0	4	4	304	2	0	1	1	300	12300	3	91	7	101	2760	3	87	7	97	2867	4	12	38	54	3299	1	20	27	48	3374	1	2	4	7	411	0.0230263157894737	0.145833333333333	0.121813870776526	1.19718167072182	0.0170316301703163	0	1	5	6	373	0.0197368421052632	0.111111111111111	0.113064565019703	0.982722669049747	0.0160857908847185	0.0328947368421053	10	60	784	5889	0.306872923983042	1.25186708627159	0.647184878974969	Inf	1.21592565597668	1.70229591836735	0.464988077983078	1.87757958408977	1.1785125588697	0.355053447850572	1.20716517987164	0.0036074841836048	294	290
TCGA-EI-6506-01A-11D-1733-10	0	0	0	0	262	0	3	5	8	253	10373	5	20	1	26	2561	9	28	4	41	2606	6	25	60	91	2613	8	20	67	95	2593	3	7	4	14	383	0.0534351145038168	0.147368421052632	0.147705360586194	0.997718840181393	0.0365535248041775	0	9	4	13	389	0.049618320610687	0.142857142857143	0.148871029468044	0.959603378626515	0.0334190231362468	0.0419847328244275	11	130	772	4434	0.995732049642114	0.486044666046226	0.26556068393598	Inf	0.526090471465844	1.44504071058475	0.34576191742961	1.56625377865222	0.424788870303129	0.999032488573613	0.386166978449447	0.175080710726683	251	242
TCGA-EI-6507-01A-11D-1733-10	0	0	0	0	1086	0	41	147	188	898	36818	10	68	4	82	8320	14	63	6	83	8347	4	51	306	361	9960	5	74	293	372	10191	1	8	6	15	1206	0.0138121546961326	0.0403225806451613	0.118339711510156	0.340735836944311	0.0124378109452736	0	8	8	16	1142	0.0147329650092081	0.0443213296398892	0.114658634538153	0.386550300537037	0.0140105078809107	0.0138121546961326	15	593	2348	17803	1	0.191800869325677	0.117371070098972	Inf	0.211731849054066	0.953577512776831	0.672148124721192	0.947773202559119	0.200585586994793	1	0.181462328522869	0.000183147697995668	1071	883
TCGA-EI-6508-01A-11D-1733-10	0	1	1	2	179	2	0	2	2	175	7175	3	21	4	28	1755	5	27	5	37	1807	1	13	36	50	1738	5	11	44	60	1875	2	2	4	8	253	0.0446927374301676	0.133333333333333	0.134933333333333	0.988142292490119	0.0316205533596838	0	1	1	2	270	0.0111731843575419	0.04	0.155350978135788	0.257481481481481	0.00740740740740741	0.0391061452513966	7	79	523	3090	0.972686364289351	0.523588876719305	0.237457731680528	Inf	0.56229712303793	2.30274059910771	0.211899399030622	2.95286984075204	0.431763862332696	0.993009895742022	0.39395158503607	0.34984520123839	172	168
TCGA-EI-6510-01A-11D-1733-10	0	0	0	0	262	1	0	8	8	251	10291	2	39	2	43	2471	6	54	1	61	2753	3	10	58	71	2478	0	18	58	76	2589	0	3	5	8	413	0.0305343511450382	0.105263157894737	0.159521050598687	0.659870014018096	0.0193704600484262	1	0	2	3	340	0.0114503816793893	0.0422535211267606	0.137207425343019	0.307953603976802	0.00882352941176471	0.0305343511450382	8	111	753	4314	0.99784061396208	0.412956713309271	0.200238600643806	Inf	0.452375372459741	2.24302788844621	0.383155750982504	2.86371749698161	0.406065393598022	0.998991786025446	0.367971415109717	0.0237358101135191	254	243
TCGA-F5-6464-01A-11D-1733-10	0	0	0	0	143	0	2	3	5	137	5617	1	25	9	35	1384	3	15	7	25	1523	3	12	21	36	1297	5	10	26	41	1413	1	4	3	8	241	0.0559440559440559	0.195121951219512	0.170559094125973	1.14401376378909	0.033195020746888	0	1	0	1	221	0.00699300699300699	0.0277777777777778	0.170393215111796	0.163021618903972	0.00452488687782805	0.027972027972028	4	51	462	2248	0.989199035833843	0.381724714068997	0.125392487613223	Inf	0.426603699330972	0.733225108225108	0.775995738216824	0.695198592009811	0.374412821221332	0.991086692264722	0.331848727177191	0.576470588235294	139	133
TCGA-F5-6465-01A-11D-1733-10	1	0	0	1	215	1	0	4	4	209	8569	5	36	2	43	2225	5	39	3	47	2225	6	13	46	65	2036	5	9	40	54	2083	1	2	2	5	316	0.0232558139534884	0.0925925925925926	0.151704272683629	0.610349273323957	0.0158227848101266	3	2	2	7	314	0.0325581395348837	0.107692307692308	0.154223968565815	0.69828515433611	0.0222929936305732	0.0372093023255814	8	89	630	3489	0.98597237854465	0.497874437652989	0.239916656311464	Inf	0.539224349533628	2.37748917748918	0.0742983948927533	3.16338396324615	0.304097452934662	0.999495561196537	0.270203768826766	1	207	201
TCGA-F5-6571-01A-12D-1826-10	0	0	2	2	149	0	0	6	6	143	5863	0	24	0	24	1424	4	23	0	27	1500	1	15	25	41	1471	2	7	42	51	1468	1	1	3	5	217	0.0335570469798658	0.0980392156862745	0.147820163487738	0.663233035149544	0.0230414746543779	1	4	5	10	216	0.0671140939597315	0.24390243902439	0.146838885112169	1.66102077687444	0.0462962962962963	0.0671140939597315	10	60	433	2506	0.594220175420142	0.964594714960608	0.497034712056613	Inf	0.969646981194325	4.52501924557352	0.0590309197322355	11.5588830611061	0.810451208162421	0.788141138283091	0.784808558213666	0.0501749125437281	139	133
TCGA-F5-6702-01A-11D-1826-10	0	1	0	1	91	0	0	2	2	89	3649	0	14	2	16	879	2	15	1	18	953	1	5	17	23	873	0	8	24	32	944	0	1	2	3	142	0.032967032967033	0.09375	0.150423728813559	0.623239436619718	0.0211267605633803	1	1	1	3	110	0.032967032967033	0.130434782608696	0.126002290950745	1.03517786561265	0.0272727272727273	0.043956043956044	4	38	252	1565	0.851404543319639	0.653847654318509	0.211551355255117	Inf	0.686696900982615	7.21031746031746	0.139163916391639	Inf	0.527584204413473	0.935582770202652	0.490436347955139	0.545454545454546	87	85
TCGA-F5-6811-01A-11D-1826-10	0	0	1	1	181	0	4	2	6	175	7175	3	39	1	43	1763	0	27	2	29	1758	0	5	34	39	1793	4	4	56	64	1861	0	1	1	2	262	0.0110497237569061	0.03125	0.140784524449221	0.221970419847328	0.00763358778625954	0	0	3	3	258	0.0165745856353591	0.0769230769230769	0.143892916899052	0.53458556946929	0.0116279069767442	0.0220994475138122	4	90	520	3134	0.999552611907361	0.267922101112489	0.0893790365521972	Inf	0.299018003273322	0	1	0	0.312307692307692	0.999276927933921	0.280382379827925	0.0476190476190476	177	171
TCGA-F5-6812-01A-11D-1826-10	0	0	1	1	137	0	0	4	4	132	5412	3	23	4	30	1359	3	19	4	26	1414	2	14	21	37	1324	3	5	31	39	1315	1	1	1	3	216	0.0218978102189781	0.0769230769230769	0.16425855513308	0.468304843304843	0.0138888888888889	2	2	1	5	196	0.0364963503649635	0.135135135135135	0.148036253776435	0.912851627137342	0.0255102040816327	0.0364963503649635	5	52	412	2227	0.954097412364777	0.519848511372896	0.196188213586269	Inf	0.561871912791688	3.84320388349515	0.0299998265929088	8.09884689914492	0.246359223300971	0.998355183028467	0.216285971676966	1	132	127
TCGA-F5-6813-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	189	0	3	2	5	184	7544	2	25	5	32	1848	2	27	1	30	1905	8	12	42	62	1964	6	10	44	60	1827	3	3	5	11	259	0.0582010582010582	0.183333333333333	0.14176245210728	1.29324324324324	0.0424710424710425	3	2	4	9	266	0.0476190476190476	0.145161290322581	0.135437881873727	1.07179238418627	0.0338345864661654	0.0793650793650794	15	85	525	3266	0.415059913011344	1.09781695091772	0.646943827626889	Inf	1.08314285714286	3.09469387755102	0.0079763534670219	4.66296435900392	0.755681063122924	0.856700117031116	0.727178560535809	0.514475543396567	174	169
TCGA-G5-6235-01A-11D-1733-10	0	0	2	2	268	1	0	0	0	267	10947	5	28	4	37	2667	7	28	3	38	2865	1	25	55	81	2660	3	32	76	111	2755	0	8	6	14	426	0.0522388059701493	0.126126126126126	0.154627949183303	0.815674829759337	0.0328638497652582	0	7	1	8	366	0.0298507462686567	0.0987654320987654	0.137593984962406	0.717803413613978	0.0218579234972678	0.0261194029850746	7	128	792	4623	0.999845922329928	0.319260678853998	0.146642842808331	Inf	0.354517396184063	0	1	0	0.365342354846172	0.999758821225047	0.329558607799809	0.00890091190715127	261	260
TCGA-G5-6641-01A-11D-1826-10	0	0	0	0	121	2	1	3	4	115	4715	1	16	2	19	1166	5	20	1	26	1240	2	9	31	42	1132	3	3	22	28	1177	2	0	0	2	187	0.0165289256198347	0.0714285714285714	0.158878504672897	0.449579831932773	0.0106951871657754	0	3	0	3	161	0.0247933884297521	0.0714285714285714	0.142226148409894	0.502218278615794	0.0186335403726708	0.0165289256198347	2	56	348	1961	0.9990642955839	0.201330394473694	0.0348241646547092	Inf	0.228795085216013	2.65402298850575	0.16694524647525	3.75359405005221	0	1	0	0.444444444444444	119	113
Totals	3	6	33	42	32101	59	240	490	730	31203	1279323	371	2496	882	3749	326092	397	2446	939	3782	330623	393	3963	7329	11685	309645	453	3939	7595	11987	312963	138	2528	486	3152	48301	0.0981900875362138	0.262951530825061	0.154334537948575	1.70377631812185	0.065257448085961	110	2587	441	3138	47387	0.0977539640509641	0.268549422336329	0.153036541846308	1.75480587248259	0.0662206934391289	0.0366032210834553	1175	14595	95688	526920	1	0.443321248947165	0.421331522810524	Inf	0.484800872334135	1.90738576496545	9.513703710102e-25	2.28369046848693	0.404158496351416	1	0.36469540773217	2.45194414382054e-101	30926	30028
