Sample	A_T_coord_clusters	G_C_coord_clusters	Non_coord_clusters	clusters	mutations	complex	insertions	deletions	indels	substitutions	bases	A_to_T	A_to_G	A_to_C	A	a	T_to_A	T_to_C	T_to_G	T	t	G_to_C	G_to_T	G_to_A	G	g	C_to_G	C_to_A	C_to_T	C	c	tCw_to_G	tCw_to_A	tCw_to_T	tCw	tcw	tCw_per_mut	tCw_per_C	tcw_per_c	enrich_tCw	freq_tCw	wGa_to_C	wGa_to_T	wGa_to_A	wGa	wga	wGa_per_mut	wGa_per_G	wga_per_g	enrich_wGa	freq_wGa	[tCw_to_G+tCw_to_T]_per_mut	tCw_to_G+tCw_to_T	[(C_to_G)+(C_to_T)]-[(tCw_to_G)+(tCw_to_T)]	tcw+wga	c-tcw	Fisher_p-value_tCw	odds_ratio_tCw	95%_confidence_lower_tCw	95%_confidence_upper_tCw	APOBEC_enrich	tCw_to_G_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_G	odds_ratio_tCw_to_G	tCw_to_T_enrich	Fisher_p-value_tCw_to_T	odds_ratio_tCw_to_T	p-value_GvT_skew	non-APOBEC_mutations	non-APOBEC_substitutions
TCGA-B7-5816-01A-21D-1600-08	0	0	0	0	1581	2	49	224	273	1306	53546	13	153	31	197	12386	11	150	30	191	12479	8	71	365	444	14351	9	95	370	474	14330	0	6	8	14	1798	0.00885515496521189	0.029535864978903	0.125471039776692	0.235399858257886	0.00778642936596218	1	3	10	14	1720	0.00885515496521189	0.0315315315315315	0.11985227510278	0.263086633144773	0.00813953488372093	0.0120177103099304	19	733	3518	25163	1	0.185408497562292	0.120647643753831	Inf	0.205984344949379	0.479567267498244	0.891884333053142	0.447048974653126	0.199656576672738	1	0.179569878258721	1.76309294124923e-06	1562	1287
TCGA-B7-5818-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	421	0	5	7	12	409	16769	15	48	33	96	4273	10	28	51	89	4276	3	10	90	103	4105	4	13	104	121	4115	1	1	20	22	593	0.0522565320665083	0.181818181818182	0.144106925880923	1.2616894067147	0.0370994940978078	1	2	17	20	646	0.0475059382422803	0.194174757281553	0.157369062119367	1.23388139108479	0.0309597523219814	0.0926365795724466	39	162	1239	6981	0.0591671619956512	1.35636942954044	0.984132212304474	Inf	1.28726825918832	1.89553787616742	0.285761973261826	2.25346680187822	1.26532038641072	0.0787844334953132	1.32779760245217	1.08540439943982e-15	382	370
TCGA-B7-A5TI-01A-11D-A31L-08	0	0	0	0	722	2	21	93	114	606	24846	10	39	10	59	5523	6	46	6	58	5609	10	32	219	261	6797	7	37	184	228	6917	4	4	1	9	829	0.0124653739612188	0.0394736842105263	0.119849645800202	0.329360040632341	0.0108564535585042	3	6	4	13	783	0.018005540166205	0.0498084291187739	0.115197881418273	0.432372787637684	0.016602809706258	0.0166204986149584	12	408	1612	12102	0.999999999988435	0.220820740427499	0.126213837780066	Inf	0.243069833392414	3.5030652459495	0.00207904694755272	5.25417642303844	0.10555141648554	1	0.0943215650823679	0.736039848915629	710	594
TCGA-B7-A5TJ-01A-11D-A31L-08	0	0	0	0	294	1	5	18	23	270	11070	8	11	12	31	2477	4	13	18	35	2578	2	14	85	101	2984	4	10	89	103	3031	1	2	4	7	367	0.0238095238095238	0.0679611650485437	0.121082151105246	0.561281447580752	0.0190735694822888	1	4	3	8	361	0.0272108843537415	0.0792079207920792	0.12097855227882	0.65472696854173	0.0221606648199446	0.0306122448979592	9	171	728	5287	0.99958648142874	0.38227072082412	0.195636895110288	Inf	0.413118131868132	2.75412087912088	0.158246241931136	3.63014034528455	0.332393899204244	0.999933629637436	0.304448045236405	0.108645677161419	285	261
TCGA-B7-A5TK-01A-12D-A31L-08	0	0	0	0	66	0	1	2	3	63	2583	1	3	0	4	605	0	4	0	4	589	1	2	14	17	660	3	9	26	38	729	3	1	2	6	99	0.0909090909090909	0.157894736842105	0.135802469135802	1.16267942583732	0.0606060606060606	1	0	2	3	92	0.0454545454545455	0.176470588235294	0.139393939393939	1.26598465473146	0.0326086956521739	0.121212121212121	8	36	191	1198	0.259000941505839	1.39347033865191	0.640320333453306	Inf	1.32222751070919	7.27225130890052	0.00037390614016839	Inf	0.727225130890052	0.817908941313871	0.697073211383301	1	58	55
TCGA-B7-A5TN-01A-21D-A31L-08	1	0	0	1	101	2	4	3	7	92	3772	3	3	5	11	871	2	5	2	9	898	9	9	20	38	935	5	8	21	34	1068	0	1	1	2	131	0.0198019801980198	0.0588235294117647	0.122659176029963	0.479568926807364	0.0152671755725191	0	0	2	2	114	0.0198019801980198	0.0526315789473684	0.12192513368984	0.431671283471837	0.0175438596491228	0.0297029702970297	3	52	245	1758	0.970371794817785	0.414099626234515	0.108748990511522	Inf	0.445936920222634	0	1	0	0.59820806371329	0.891481508179581	0.566616400654725	0.142857142857143	98	89
TCGA-BR-4183-01A-02D-1126-08	0	0	0	0	52	0	1	0	1	51	2091	1	4	1	6	447	0	2	3	5	548	1	0	14	15	512	1	0	24	25	584	0	0	0	0	76	0	0	0.13013698630137	0	0	0	0	1	1	53	0.0192307692307692	0.0666666666666667	0.103515625	0.644025157232704	0.0188679245283019	0.0192307692307692	1	39	129	967	0.992932373295101	0.192363428705893	0.00957592525922229	Inf	0.212403100775194	0	1	0	0.223582211342309	0.990986701514071	0.202759123777676	1	51	50
TCGA-BR-4184-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	4598	6	59	352	411	4179	171339	27	175	33	235	39387	36	182	18	236	39806	13	108	1722	1843	45845	11	111	1743	1865	46301	0	12	17	29	5651	0.00630709003914746	0.0155495978552279	0.1220491998013	0.127404340876819	0.00513183507343833	2	12	16	30	5640	0.00652457590256633	0.0162778079218665	0.123023230450431	0.132314912088293	0.00531914893617021	0.00761200521966072	35	3454	11291	80855	1	0.0725646451234127	0.053558574946435	Inf	0.0818674295993946	0.680084433029256	0.811127138675094	0.65100418096364	0.0777239352033436	1	0.0688566757058314	1.21090268894929e-10	4563	4144
TCGA-BR-4187-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	33	0	0	1	1	32	1312	0	1	1	2	278	0	1	0	1	328	1	2	15	18	339	0	1	10	11	367	0	1	0	1	54	0.0303030303030303	0.0909090909090909	0.147138964577657	0.617845117845118	0.0185185185185185	0	1	1	2	43	0.0606060606060606	0.111111111111111	0.126843657817109	0.875968992248062	0.0465116279069767	0.0303030303030303	1	25	97	609	0.977794531729862	0.251427105600134	0.0123036935951	Inf	0.279936558287074	0	1	0	0.291134020618557	0.974362140735424	0.261898460222659	1	32	31
TCGA-BR-4188-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	84	0	2	0	2	82	3362	0	4	0	4	724	0	4	0	4	814	2	3	39	44	869	2	1	27	30	955	1	0	1	2	117	0.0238095238095238	0.0666666666666667	0.122513089005236	0.544159544159544	0.0170940170940171	0	1	1	2	99	0.0238095238095238	0.0454545454545455	0.113924050632911	0.398989898989899	0.0202020202020202	0.0357142857142857	3	67	216	1608	0.991445676198889	0.333463036498419	0.0880756134262545	Inf	0.361904761904762	2.11111111111111	0.397044689943265	2.47968324356264	0.255892255892256	0.997374619585903	0.232745262119245	1	81	79
TCGA-BR-4191-01A-02D-1126-08	0	1	0	1	224	0	0	14	14	207	8487	9	10	8	27	2045	7	8	4	19	2120	20	19	47	86	2135	24	14	37	75	2187	9	2	7	18	344	0.0803571428571429	0.24	0.157293095564701	1.52581395348837	0.0523255813953488	4	1	6	11	303	0.0491071428571429	0.127906976744186	0.14192037470726	0.901258730524215	0.0363036303630363	0.116071428571429	26	102	647	3675	0.0660092312701406	1.44772047920202	0.967115080792319	Inf	1.35688755795981	1.97365462975973	0.0107264833369512	2.38118546163954	1.03381909177891	0.496210060893399	1.04000808140997	1	198	181
TCGA-BR-4201-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	1761	3	66	307	373	1385	56785	14	111	7	132	12989	15	107	18	140	13168	7	51	501	559	15137	5	47	502	554	15491	1	7	6	14	1897	0.00795002839295855	0.0252707581227437	0.122458201536376	0.206362316330745	0.00738007380073801	1	2	8	11	1818	0.00624645088018171	0.0196779964221825	0.120103058730264	0.163842591772594	0.00605060506050605	0.00908574673480977	16	999	3715	26913	1	0.116030373326437	0.0724470276260138	Inf	0.12996121435533	1.3740690892777	0.43721263881444	1.44885662559431	0.115076573777993	1	0.102553197769977	0.000577202083338867	1745	1369
TCGA-BR-4253-01A-01D-1126-08	0	1	0	1	103	0	1	4	5	98	4018	2	5	9	16	1030	3	4	5	12	981	4	1	26	31	1008	1	4	34	39	999	0	0	5	5	138	0.0485436893203883	0.128205128205128	0.138138138138138	0.92809364548495	0.036231884057971	3	0	2	5	152	0.0485436893203883	0.161290322580645	0.150793650793651	1.06960950764007	0.0328947368421053	0.0970873786407767	10	55	290	1717	0.471308424463301	1.07646830603607	0.550704447700265	Inf	1.06472148541114	4.15241379310345	0.0243661837881785	8.86469235428103	0.807413793103448	0.781210092158731	0.78206414830392	0.178895407997576	93	88
TCGA-BR-4255-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	70	0	0	2	2	68	2788	2	4	1	7	660	1	9	1	11	661	1	2	23	26	704	1	2	21	24	763	0	1	1	2	107	0.0285714285714286	0.0833333333333333	0.140235910878113	0.594236760124611	0.0186915887850467	0	1	1	2	91	0.0285714285714286	0.0769230769230769	0.129261363636364	0.595097210481826	0.021978021978022	0.0285714285714286	2	44	198	1269	0.989083659705889	0.291475591937099	0.0499066385230998	Inf	0.322134387351779	0	1	0	0.336776859504132	0.986057241137124	0.305351868668173	0.428571428571429	68	66
TCGA-BR-4256-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	1239	0	42	151	193	1045	42845	9	105	20	134	10222	16	108	23	147	10011	6	36	328	370	11172	8	55	331	394	11440	1	4	8	13	1432	0.0104923325262308	0.032994923857868	0.125174825174825	0.263590732495817	0.00907821229050279	1	6	16	23	1518	0.0185633575464084	0.0621621621621622	0.135875402792696	0.457493857493858	0.0151515151515152	0.0209846650524617	26	647	2950	19662	1	0.267848663657506	0.186126319616463	Inf	0.296125116478203	1.09501210653753	0.562102876605866	1.11080770919009	0.279153313957974	1	0.2519175377191	5.87413294242966e-08	1213	1019
TCGA-BR-4257-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	1332	0	25	168	193	1139	46699	14	138	22	174	11004	17	116	16	149	10895	5	51	341	397	12261	7	56	356	419	12539	0	10	7	17	1560	0.0127627627627628	0.0405727923627685	0.124411835074567	0.326116822715868	0.0108974358974359	0	4	4	8	1592	0.00600600600600601	0.0201511335012594	0.129842590327053	0.155196638102351	0.0050251256281407	0.00825825825825826	11	698	3152	21648	1	0.108239633318511	0.0603949933443097	Inf	0.122070836883292	0	1	0	0.124172486872674	1	0.110133026812304	0.000238658840758398	1321	1128
TCGA-BR-4267-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	107	1	0	3	3	103	4223	6	4	8	18	1070	4	2	4	10	1017	12	9	14	35	1064	13	9	18	40	1072	3	2	1	6	138	0.0560747663551402	0.15	0.128731343283582	1.16521739130435	0.0434782608695652	3	2	1	6	153	0.0560747663551402	0.171428571428571	0.143796992481203	1.1921568627451	0.0392156862745098	0.0747663551401869	8	49	291	1845	0.524152693459529	1.03512447115529	0.485891373129224	Inf	1.03020437692169	1.76164948453608	0.117370982375515	2.00141283276932	0.458762886597938	0.943677075770495	0.422802375170872	0.193027325346615	99	95
TCGA-BR-4279-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	63	0	2	3	5	58	2378	1	8	1	10	542	2	2	2	6	573	2	4	17	23	655	2	4	13	19	608	1	1	0	2	84	0.0317460317460317	0.105263157894737	0.138157894736842	0.761904761904762	0.0238095238095238	1	2	0	3	77	0.0476190476190476	0.130434782608696	0.117557251908397	1.10954263128176	0.038961038961039	0.0317460317460317	2	32	161	1102	0.941122205432835	0.428000204924877	0.0723771072514757	Inf	0.461454146876142	3.9223602484472	0.0828081723721195	6.82602338791947	0	1	0	0.444444444444444	61	56
TCGA-BR-4280-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	817	2	29	124	153	662	27142	5	91	29	125	6359	7	83	25	115	6161	11	38	154	203	7218	5	47	167	219	7404	1	1	3	5	886	0.00611995104039168	0.0228310502283105	0.119665045921124	0.190791304616717	0.00564334085778781	1	2	4	7	885	0.00856793145654835	0.0344827586206897	0.122610141313383	0.281239041496201	0.00790960451977401	0.011015911872705	9	328	1771	12851	0.999999999895395	0.199119147608401	0.102849606589007	Inf	0.220496056646231	1.03204404291361	0.59398552423632	1.03662622631279	0.180045066676517	0.99999999998409	0.161776049424576	0.0893794588773726	808	653
TCGA-BR-4292-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	1615	3	76	229	305	1307	53587	12	73	17	102	11908	16	76	20	112	11963	8	46	478	532	14909	7	48	506	561	14807	1	2	4	7	1676	0.0043343653250774	0.0124777183600713	0.113189707570744	0.110237217039126	0.00417661097852029	1	7	3	11	1634	0.00681114551083591	0.0206766917293233	0.109598229257495	0.188658994487443	0.00673194614443084	0.00557275541795666	9	990	3310	26406	1	0.0725265463368565	0.0377027343372999	Inf	0.0808796712119975	1.19701913393756	0.510194796826143	1.22731972915127	0.0638653501338639	1	0.0571601624668643	0.121205379714835	1606	1298
TCGA-BR-4294-01A-01D-1126-08	0	0	0	0	34	1	1	0	1	32	1312	1	0	2	3	302	2	1	0	3	355	2	3	9	14	328	1	4	7	12	327	0	0	1	1	49	0.0294117647058824	0.0833333333333333	0.149847094801223	0.556122448979592	0.0204081632653061	0	0	1	1	33	0.0294117647058824	0.0714285714285714	0.100609756097561	0.70995670995671	0.0303030303030303	0.0588235294117647	2	17	82	573	0.708719300227101	0.822317732769894	0.133341918558992	Inf	0.840821566110398	0	1	0	0.998475609756098	0.615985575811922	0.998260424265087	0.333333333333333	32	30
TCGA-BR-4357-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	246	3	3	5	8	234	9594	8	25	16	49	2420	13	10	15	38	2520	13	17	37	67	2350	18	15	47	80	2304	14	3	10	27	368	0.109756097560976	0.3375	0.159722222222222	2.11304347826087	0.0733695652173913	8	3	5	16	357	0.0650406504065041	0.238805970149254	0.151914893617021	1.57197207241105	0.0448179271708683	0.150406504065041	37	78	725	3929	9.90302618447788e-06	2.57001538446933	1.7918516742749	Inf	2.06534332833583	4.55563959955506	1.04425362543802e-11	13.23507448957	1.14630541871921	0.327797768127537	1.17803976792144	0.190996653568062	209	197
TCGA-BR-4361-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	3038	4	76	332	408	2626	107666	49	486	28	563	25330	53	507	24	584	25328	23	76	645	744	28793	11	74	650	735	28215	1	6	28	35	3540	0.0115207373271889	0.0476190476190476	0.125465178096757	0.37953995157385	0.00988700564971751	2	5	21	28	3567	0.00921658986175115	0.0376344086021505	0.123884277428542	0.303786803162804	0.00784973366975049	0.0171165240289664	52	1277	7107	49901	1	0.285917541360994	0.222695842531651	Inf	0.313854133150976	0.707769473344424	0.813788649902052	0.679493464884732	0.303511954335086	1	0.276125506446034	3.38614304289081e-18	2986	2574
TCGA-BR-4362-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	1825	4	74	284	358	1462	59942	22	127	30	179	13576	22	156	54	232	13841	12	59	437	508	16277	11	53	479	543	16248	2	2	11	15	2027	0.00821917808219178	0.0276243093922652	0.124753815854259	0.221430576717082	0.00740009866798224	0	6	2	8	1970	0.00438356164383562	0.015748031496063	0.121029673772808	0.130117110995643	0.00406091370558376	0.00821917808219178	15	924	3997	28528	1	0.115869621573175	0.0710983626190865	Inf	0.129989664772541	0.70759591432705	0.793079316737366	0.679755230030564	0.115486451082854	1	0.102755753658592	0.00120660933196384	1810	1447
TCGA-BR-4363-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	675	1	19	147	166	507	20787	5	38	6	49	4699	6	60	12	78	4541	2	24	162	188	5781	2	15	175	192	5766	0	1	0	1	615	0.00148148148148148	0.00520833333333333	0.106659729448491	0.0488313008130081	0.0016260162601626	0	1	2	3	662	0.00444444444444444	0.0159574468085106	0.114513060024217	0.139350453172205	0.00453172205438067	0.00296296296296296	2	339	1277	10270	1	0.0474441001365476	0.00840122392928	Inf	0.0530339390571285	0	1	0	0.0536634220132962	1	0.0480116461738649	0.428571428571429	673	505
TCGA-BR-4366-01A-01D-1158-08	0	1	0	1	150	1	2	0	2	146	5986	4	12	4	20	1447	2	9	10	21	1408	11	7	37	55	1584	10	11	29	50	1547	2	2	1	5	190	0.0333333333333333	0.1	0.122818358112476	0.81421052631579	0.0263157894736842	5	2	4	11	191	0.0733333333333333	0.2	0.120580808080808	1.6586387434555	0.0575916230366492	0.08	12	75	381	2750	0.372015469806514	1.15478012256136	0.635515538797014	Inf	1.13349624400398	2.73928258967629	0.0100810508139442	3.60693347163771	0.62256422492643	0.915051150616584	0.591707829874866	0.715987167706469	138	134
TCGA-BR-4368-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	1553	5	41	231	272	1276	52316	14	104	9	127	11641	8	89	13	110	11832	10	45	449	504	14249	7	65	463	535	14594	0	7	10	17	1664	0.0109465550547328	0.0317757009345794	0.114019460052076	0.278686646297628	0.0102163461538462	5	4	5	14	1622	0.00901481004507405	0.0277777777777778	0.113832549652607	0.244023153856693	0.00863131935881628	0.0128783000643915	20	909	3286	25557	1	0.171128356201805	0.112761431984664	Inf	0.188967515250464	2.58162973040707	0.036765287829567	3.24027451262889	0.144367452029343	1	0.130063527523778	0.0134283580991749	1533	1256
TCGA-BR-4369-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	191	0	0	2	2	188	7708	5	10	13	28	1872	8	12	27	47	1845	5	6	46	57	1994	7	8	41	56	1997	4	4	3	11	256	0.0575916230366492	0.196428571428571	0.128192288432649	1.53229631696429	0.04296875	2	1	7	10	274	0.0523560209424084	0.175438596491228	0.13741223671013	1.27673197592521	0.0364963503649635	0.0837696335078534	16	83	530	3461	0.241392660537455	1.25875392628483	0.753288956078613	Inf	1.2170001905851	3.76509433962264	0.00253230711743908	6.52500921910319	0.865538928648883	0.733434495817468	0.848115989393848	0.340791997944932	175	172
TCGA-BR-4370-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	1313	2	45	200	245	1066	43706	9	39	9	57	9516	7	64	8	79	9748	3	41	410	454	12210	4	44	428	476	12232	0	4	8	12	1404	0.00913937547600914	0.0252100840336134	0.114780902550687	0.219636572577749	0.00854700854700855	1	4	9	14	1231	0.0106626047220107	0.0308370044052863	0.100819000819001	0.305865007139355	0.0113728675873274	0.0137090632140137	18	827	2635	21807	1	0.180134969282406	0.115726731345625	Inf	0.197593164389253	1.32512876118189	0.550080305133779	1.37929086944157	0.188174609284779	1	0.171370872224102	3.88079391298207e-06	1295	1048
TCGA-BR-4371-01A-01D-1158-08	0	0	1	1	174	0	0	0	0	174	7134	2	7	5	14	1664	1	6	2	9	1629	5	6	52	63	1918	2	13	73	88	1923	1	4	2	7	222	0.0402298850574713	0.0795454545454545	0.115444617784711	0.689035626535627	0.0315315315315315	1	2	8	11	256	0.0632183908045977	0.174603174603175	0.133472367049009	1.30815972222222	0.04296875	0.0689655172413793	12	120	478	3363	0.905365873669209	0.703612222188568	0.393380684028637	Inf	0.730505895777862	2.29587567244471	0.213820447337293	2.81314635929419	0.642845188284519	0.955001300978191	0.611853029853822	0.0116425658138673	162	162
TCGA-BR-6452-01A-12D-1800-08	0	0	1	1	8271	31	198	601	799	7438	304958	351	1154	144	1649	73125	335	1213	138	1686	74710	39	354	1687	2080	78150	61	377	1585	2023	78973	6	42	78	126	10696	0.015233949945593	0.0622837370242214	0.135438694237271	0.459866638370778	0.0117801047120419	10	32	79	121	10394	0.0146294281223552	0.0581730769230769	0.133000639795266	0.437389451754711	0.0116413315374254	0.0209164550840285	173	3199	21090	136033	1	0.348819324515623	0.305159676410078	Inf	0.382227315346813	1.19201896633476	0.263868638048387	1.22858865191558	0.357478181759162	1	0.325095141269103	4.35374842558072e-44	8098	7265
TCGA-BR-6453-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	208	2	0	0	0	206	8446	6	14	30	50	2101	4	20	34	58	2108	2	7	45	54	2099	1	3	40	44	2138	0	0	5	5	306	0.0240384615384615	0.113636363636364	0.143124415341441	0.793969102792632	0.0163398692810458	0	1	3	4	290	0.0192307692307692	0.0740740740740741	0.138161029061458	0.536143039591315	0.0137931034482759	0.0384615384615385	8	80	596	3641	0.938783897911011	0.610966154779469	0.293501379756816	Inf	0.646278218425869	0	1	0	0.669088037899724	0.923171780609476	0.634765882495904	0.000411353352529823	200	198
TCGA-BR-6454-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	161	0	2	3	5	156	6396	4	13	10	27	1525	14	7	7	28	1538	7	9	32	48	1644	9	10	34	53	1689	4	2	3	9	208	0.0559006211180124	0.169811320754717	0.123149792776791	1.37890058055152	0.0432692307692308	3	6	4	13	218	0.0807453416149068	0.270833333333333	0.132603406326034	2.04243119266055	0.0596330275229358	0.0869565217391304	14	68	426	2907	0.162830298298981	1.40476858881733	0.804826528332876	Inf	1.33579525936104	3.42297535211268	0.00230336199683389	5.3031989569363	0.82981220657277	0.754361276563318	0.809667279406556	1	147	142
TCGA-BR-6455-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	110	0	1	1	2	108	4428	2	3	2	7	960	0	6	1	7	1002	2	4	51	57	1173	1	9	27	37	1293	0	1	2	3	156	0.0272727272727273	0.0810810810810811	0.120649651972158	0.672037422037422	0.0192307692307692	1	0	2	3	121	0.0272727272727273	0.0526315789473684	0.103154305200341	0.510221835580687	0.0247933884297521	0.0454545454545455	5	76	277	2189	0.955834995219832	0.520009060056816	0.198080982594942	Inf	0.549538708383474	2.96750902527076	0.301290160520951	3.94731054308478	0.456539850041655	0.979459320474093	0.427267330936934	0.242424242424242	105	103
TCGA-BR-6456-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	48	0	0	3	3	45	1845	2	3	0	5	452	1	4	2	7	430	0	7	12	19	494	1	4	9	14	469	1	0	1	2	68	0.0416666666666667	0.142857142857143	0.14498933901919	0.985294117647059	0.0294117647058824	0	2	1	3	51	0.0625	0.157894736842105	0.103238866396761	1.52941176470588	0.0588235294117647	0.0625	3	19	119	844	0.52590983906586	1.1196919870547	0.277971725977245	Inf	1.1035141329259	8.09243697478992	0.12448132780083	Inf	0.770708283313325	0.75240561790912	0.746772079887091	1	45	42
TCGA-BR-6457-01A-21D-1800-08	0	0	0	0	130	0	0	2	2	128	5248	7	5	8	20	1247	1	7	11	19	1279	3	7	37	47	1335	4	7	31	42	1387	1	1	3	5	177	0.0384615384615385	0.119047619047619	0.12761355443403	0.932875975248857	0.0282485875706215	0	5	1	6	184	0.0461538461538462	0.127659574468085	0.137827715355805	0.92622571692877	0.0326086956521739	0.0384615384615385	5	70	361	2361	0.976245229776292	0.467253536358097	0.177887819693113	Inf	0.502677746999077	1.07716660071231	0.631148906589904	1.09002157376889	0.443539188528597	0.984040199863922	0.40885439962777	0.31077694235589	125	123
TCGA-BR-6458-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	326	1	1	5	6	319	13079	11	22	66	99	3216	9	29	57	95	3307	10	7	53	70	3314	4	10	41	55	3242	2	2	1	5	494	0.0153374233128834	0.0909090909090909	0.152375077112893	0.596613912403386	0.0101214574898785	4	0	6	10	465	0.0306748466257669	0.142857142857143	0.14031382015691	1.01812596006144	0.021505376344086	0.0398773006134969	13	95	959	5597	0.812796119065261	0.798675295334618	0.455843237111535	Inf	0.822886494419341	2.92983762848205	0.0103265188663973	4.37600576598869	0.509085261686597	0.988418828756622	0.469629415722633	1	313	306
TCGA-BR-6563-01A-13D-2053-08	0	0	0	0	88	1	0	1	1	86	3526	2	5	7	14	840	3	5	4	12	837	2	4	25	31	887	0	3	26	29	962	0	1	1	2	113	0.0227272727272727	0.0689655172413793	0.117463617463617	0.58712236801953	0.0176991150442478	0	1	1	2	116	0.0227272727272727	0.0645161290322581	0.130777903043968	0.493325917686318	0.0172413793103448	0.0227272727272727	2	51	229	1620	0.991912735790842	0.277538616606588	0.047790975205371	Inf	0.30468814369284	0	1	0	0.316636698347461	0.98987068110597	0.288864598628079	0.428571428571429	86	84
TCGA-BR-6564-01A-12D-1882-08	0	0	0	0	38	0	2	3	5	33	1353	2	2	0	4	300	1	1	1	3	315	2	2	10	14	355	0	4	8	12	383	0	0	1	1	47	0.0263157894736842	0.0833333333333333	0.122715404699739	0.679078014184397	0.0212765957446809	1	1	1	3	39	0.0789473684210526	0.214285714285714	0.109859154929577	1.95054945054945	0.0769230769230769	0.0789473684210526	3	17	86	652	0.423192259424959	1.33732036423567	0.327389554796827	Inf	1.28720930232558	4.2906976744186	0.221453388435797	7.54342741766875	0.953488372093023	0.63982979375148	0.947735004702367	1	35	30
TCGA-BR-6565-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	162	0	1	1	2	159	6519	3	10	7	20	1555	2	7	4	13	1542	22	10	36	68	1694	11	12	35	58	1728	2	3	1	6	239	0.037037037037037	0.103448275862069	0.138310185185185	0.747944019621988	0.0251046025104603	6	1	2	9	208	0.0555555555555556	0.132352941176471	0.122786304604486	1.0779128959276	0.0432692307692308	0.0679012345679012	11	93	447	2975	0.81174298919287	0.78725696308781	0.425255820564141	Inf	0.80971433488212	1.85587417802183	0.0594856945457357	2.12916012060896	0.323471027507326	0.996557433192028	0.293690028530089	0.128135932033983	151	148
TCGA-BR-6566-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	1090	1	29	153	182	906	37146	9	87	30	126	8219	6	91	19	116	8487	5	51	271	327	10174	11	66	260	337	10266	1	3	5	9	1151	0.00825688073394495	0.0267062314540059	0.11211766997857	0.238198238146677	0.00781928757602085	0	4	2	6	1168	0.0055045871559633	0.018348623853211	0.114802437586004	0.159827824556994	0.00513698630136986	0.0073394495412844	8	539	2319	18121	1	0.115985416942402	0.057378599965119	Inf	0.128908870604725	0.550884001724881	0.854384839541588	0.520956236055818	0.116193989064382	1	0.104392486933191	0.0351824087956022	1082	898
TCGA-BR-6705-01A-12D-1882-08	0	0	0	0	114	0	2	0	2	112	4592	5	9	6	20	1095	3	3	7	13	1146	7	8	26	41	1115	5	3	30	38	1236	2	0	2	4	179	0.0350877192982456	0.105263157894737	0.144822006472492	0.726845045574831	0.0223463687150838	1	2	3	6	144	0.0526315789473684	0.146341463414634	0.12914798206278	1.13313008130081	0.0416666666666667	0.0701754385964912	8	60	323	2028	0.732661720110012	0.837209816954207	0.396769891168427	Inf	0.85631032598798	1.81965944272446	0.223211234615998	2.09206146693696	0.649878372401592	0.897497660464518	0.615658785597277	0.649916646820672	106	104
TCGA-BR-6706-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	226	0	1	4	5	221	9061	4	36	34	74	2255	8	32	37	77	2255	2	5	29	36	2272	1	1	32	34	2279	0	0	4	4	350	0.0176991150442478	0.117647058823529	0.153576129881527	0.766050420168067	0.0114285714285714	0	1	2	3	331	0.0132743362831858	0.0833333333333333	0.14568661971831	0.572004028197382	0.00906344410876133	0.0265486725663717	6	58	681	3870	0.930531554179383	0.587936078979089	0.245922786615153	Inf	0.626514317180617	0	1	0	0.65732649671409	0.909321119064127	0.620000084850084	0.00466200466200466	220	215
TCGA-BR-6707-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	75	0	0	2	2	73	2993	0	2	0	2	721	2	4	0	6	732	1	5	23	29	773	3	6	27	36	767	0	0	1	1	90	0.0133333333333333	0.0277777777777778	0.117340286831812	0.236728395061728	0.0111111111111111	0	4	4	8	95	0.106666666666667	0.275862068965517	0.122897800776197	2.24464609800363	0.0842105263157895	0.0666666666666667	5	49	185	1355	0.791425127679031	0.747503533426871	0.279710719408127	Inf	0.770770770770771	0	1	0	0.832432432432432	0.732694085704632	0.813911974249116	0.0294117647058824	70	68
TCGA-BR-6709-01A-11D-1882-08	0	1	0	1	44	0	1	0	1	42	1722	0	4	2	6	413	1	6	1	8	436	2	2	8	12	444	2	2	12	16	429	1	1	1	3	61	0.0681818181818182	0.1875	0.142191142191142	1.31864754098361	0.0491803278688525	1	0	2	3	65	0.0681818181818182	0.25	0.146396396396396	1.70769230769231	0.0461538461538462	0.113636363636364	5	19	126	747	0.265612653457624	1.55925284664758	0.547541489430245	Inf	1.44345238095238	3.46428571428571	0.103889691515338	5.90925728802685	1.03928571428571	0.569819327457403	1.04617293743023	1	39	37
TCGA-BR-6710-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	5	0	0	1	1	4	164	0	0	0	0	23	0	0	0	0	40	0	0	1	1	47	0	1	2	3	54	0	0	0	0	2	0	0	0.037037037037037	0	0	0	0	0	0	6	0	0	0.127659574468085	0	0	0	0	3	8	93	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	5	4
TCGA-BR-6801-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	54	1	0	1	1	52	2132	0	2	1	3	483	1	1	0	2	481	3	1	19	23	586	2	0	22	24	582	0	0	3	3	73	0.0555555555555556	0.125	0.125429553264605	0.996575342465753	0.0410958904109589	3	0	2	5	65	0.0925925925925926	0.217391304347826	0.110921501706485	1.95986622073579	0.0769230769230769	0.148148148148148	8	38	138	1030	0.178387150268356	1.57062817723837	0.720552969474998	Inf	1.47195967233774	5.07826086956522	0.0141701395139039	11.1555212173821	1.03216684340756	0.544839443927887	1.03660953632425	0.619269619269619	46	44
TCGA-BR-6802-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	576	1	23	68	91	484	19844	7	39	8	54	4467	6	35	7	48	4517	3	24	172	199	5338	3	25	155	183	5522	1	5	3	9	640	0.015625	0.0491803278688525	0.115900036218761	0.424334016393443	0.0140625	1	1	0	2	623	0.00347222222222222	0.0100502512562814	0.116710378418883	0.0861127467191495	0.00321027287319422	0.00868055555555556	5	328	1263	9597	0.999999999999639	0.115842384198851	0.0452864677189037	Inf	0.129107730057849	2.86619160728424	0.14790863883125	3.79854680789906	0.0788860075399333	0.999999999999995	0.0703639069925843	1	571	479
TCGA-BR-6803-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	21	0	1	1	2	19	779	0	1	1	2	206	0	1	0	1	191	1	6	5	12	181	0	1	3	4	201	0	0	0	0	34	0	0	0.169154228855721	0	0	1	1	0	2	23	0.0952380952380952	0.166666666666667	0.12707182320442	1.31159420289855	0.0869565217391304	0.0476190476190476	1	8	57	325	0.768083836865514	0.713270507480246	0.0320403801148929	Inf	0.744639376218324	6.70175438596491	0.151436031331593	Inf	0	1	0	1	20	18
TCGA-BR-6852-01A-11D-1882-08	0	0	1	1	1317	2	43	200	243	1070	43870	12	87	27	126	9517	16	87	28	131	9937	2	67	332	401	12101	10	67	335	412	12315	2	5	3	10	1403	0.00759301442672741	0.0242718446601942	0.11392610637434	0.213049014248248	0.00712758374910905	0	5	6	11	1310	0.00835231586940015	0.027431421446384	0.108255516073052	0.253395138108926	0.0083969465648855	0.00835231586940015	11	668	2713	21703	1	0.131735602103118	0.0734715268290932	Inf	0.145796679599181	1.49993856739157	0.391875690132128	1.59987813980885	0.121434306805315	1	0.109421855526859	0.0324653922214898	1306	1059
TCGA-BR-7196-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	83	0	1	2	3	80	3280	4	3	2	9	803	3	4	3	10	774	5	3	22	30	825	6	11	14	31	878	1	1	2	4	116	0.0481927710843374	0.129032258064516	0.132118451025057	0.976640711902113	0.0344827586206897	2	1	1	4	104	0.0481927710843374	0.133333333333333	0.126060606060606	1.05769230769231	0.0384615384615385	0.072289156626506	6	41	220	1483	0.579472616340177	0.986481603595945	0.403785896002828	Inf	0.988201160541586	2.11115702479339	0.162937861148902	2.52589018277359	0.645075757575758	0.860230384002906	0.612955569536223	1	77	74
TCGA-BR-7197-01A-11D-2201-08	0	0	0	0	225	0	3	2	5	220	9020	5	10	17	32	2067	7	14	29	50	2260	6	5	59	70	2367	8	15	45	68	2326	2	1	4	7	328	0.0311111111111111	0.102941176470588	0.141014617368874	0.730003586800574	0.0213414634146341	2	0	4	6	282	0.0266666666666667	0.0857142857142857	0.119138149556401	0.719452887537994	0.0212765957446809	0.0533333333333333	12	106	610	4083	0.8527401972712	0.757788303845277	0.422948951509801	Inf	0.782383995554321	2.19812646370023	0.0986038530791644	2.67659572965199	0.591803278688525	0.967108734730099	0.557843215627781	0.237743976309059	213	208
TCGA-BR-7703-01A-11D-2053-08	0	1	0	1	848	1	34	104	138	709	29069	3	46	9	58	6450	5	51	7	63	6562	10	40	269	319	8009	6	42	221	269	8048	2	8	5	15	919	0.017688679245283	0.0557620817843866	0.11418986083499	0.488327784766859	0.0163220892274211	4	2	4	10	914	0.0117924528301887	0.0313479623824451	0.114121613185167	0.274689092692564	0.0109409190371991	0.017688679245283	15	491	1833	14224	0.99999999999877	0.237077948067181	0.144854383469844	Inf	0.259682500663074	3.28498363338789	0.00644630258707739	4.65541333481146	0.160897157553693	1	0.14520517845483	0.538025350078065	833	694
TCGA-BR-7704-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	399	0	4	8	12	384	15744	20	23	31	74	3857	24	30	25	79	4057	30	30	51	111	3908	22	32	66	120	3922	5	10	11	26	598	0.0651629072681704	0.216666666666667	0.152473227944926	1.42101449275362	0.0434782608695652	11	5	11	27	567	0.0676691729323308	0.243243243243243	0.145087001023541	1.67653367653368	0.0476190476190476	0.0952380952380952	38	131	1165	6665	0.00601613489264021	1.65940671606132	1.19121435974251	Inf	1.5112375244432	2.06800924397491	0.00292277805579353	2.54226360525785	1.26378342687356	0.146846814309287	1.32481704697109	0.311231083697541	361	346
TCGA-BR-7707-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	1739	4	64	212	276	1458	59778	18	157	31	206	13443	11	142	28	181	13610	7	74	450	531	16191	12	73	455	540	16534	2	2	9	13	1865	0.00747556066705003	0.0240740740740741	0.112797871053587	0.213426670638467	0.00697050938337802	0	6	8	14	1917	0.00805060379528465	0.0263653483992467	0.118399110617009	0.222681980141994	0.00730307772561294	0.0109258194364577	19	905	3782	28943	1	0.160671629263326	0.104667410426407	Inf	0.177926141371408	0.910824125358346	0.662348324126931	0.900322647294814	0.162539332867815	1	0.146511054019085	3.36498956716082e-05	1720	1439
TCGA-BR-7715-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	158	0	0	6	6	152	6232	2	16	10	28	1540	0	10	10	20	1446	5	8	33	46	1661	1	11	46	58	1585	0	1	1	2	210	0.0126582278481013	0.0344827586206897	0.132492113564669	0.260262725779967	0.00952380952380952	2	0	3	5	216	0.0316455696202532	0.108695652173913	0.130042143287176	0.835849436392915	0.0231481481481481	0.0379746835443038	6	79	426	2820	0.972923769872588	0.502846260241921	0.211911755345928	Inf	0.537862468931234	2.53990610328638	0.18109624594812	3.30809473183649	0.385808522018185	0.994394869335561	0.35312697941369	0.592074592074592	152	146
TCGA-BR-7716-01A-21D-2053-08	0	0	0	0	196	2	0	3	3	190	7790	3	10	7	20	2081	8	8	5	21	1878	23	18	43	84	1977	14	15	36	65	1854	11	6	8	25	268	0.127551020408163	0.384615384615385	0.144552319309601	2.66073478760046	0.0932835820895522	15	9	22	46	346	0.23469387755102	0.547619047619048	0.175012645422357	3.12902559867878	0.132947976878613	0.285714285714286	56	60	614	3217	2.2643411953893e-15	4.88737392099013	3.50441499303069	Inf	3.01213074244637	4.38445285676556	4.29295944893438e-13	12.3709451909339	2.36939760029687	2.86202605708229e-06	3.20648750626696	0.606655238059103	140	134
TCGA-BR-7717-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	166	0	0	4	4	160	6560	4	6	8	18	1553	5	11	10	26	1585	10	5	45	60	1659	9	7	40	56	1763	2	0	3	5	245	0.0301204819277108	0.0892857142857143	0.138967668746455	0.642492711370262	0.0204081632653061	3	0	4	7	237	0.0421686746987952	0.116666666666667	0.142857142857143	0.816666666666667	0.029535864978903	0.072289156626506	12	92	482	2940	0.808869579300545	0.795646297507789	0.441603425873583	Inf	0.819182891797	1.86831185848439	0.119367163615858	2.17779190162631	0.584671711008055	0.963056335567604	0.547476917844885	0.684272652909078	154	148
TCGA-BR-7722-01A-31D-2201-08	0	0	0	0	55	0	1	1	2	53	2173	1	2	2	5	467	1	5	1	7	532	1	4	19	24	583	2	1	14	17	591	1	0	1	2	83	0.0363636363636364	0.117647058823529	0.140439932318105	0.837703756201276	0.0240963855421687	0	0	2	2	67	0.0363636363636364	0.0833333333333333	0.114922813036021	0.725124378109453	0.0298507462686567	0.0727272727272727	4	32	150	1024	0.692825235676339	0.853449595427565	0.272445844549156	Inf	0.86962962962963	2.60888888888889	0.337860446515959	3.40808901798674	0.711515151515152	0.810815632147909	0.68285592320911	0.485714285714286	51	49
TCGA-BR-7723-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	191	0	2	3	5	186	7626	11	19	17	47	1913	8	20	13	41	1887	4	7	38	49	1987	4	14	31	49	1839	0	3	5	8	236	0.0418848167539267	0.163265306122449	0.128330614464383	1.27222414389485	0.0338983050847458	1	2	1	4	297	0.0209424083769634	0.0816326530612245	0.149471565173629	0.546141688998832	0.0134680134680135	0.0366492146596859	7	70	533	3293	0.923827615565769	0.617889395205522	0.279301794918528	Inf	0.652566945249872	0.897279549718574	0.699128750562468	0.882662576143099	0.624194469369443	0.93065180215963	0.588471366299451	0.068649885583524	184	179
TCGA-BR-7851-01A-11D-2201-08	0	0	0	0	1778	6	64	250	314	1457	59737	16	114	13	143	13305	17	111	12	140	13328	4	75	528	607	16572	9	66	492	567	16532	2	5	9	16	1847	0.00899887514060742	0.0282186948853616	0.111722719574159	0.252577944691282	0.00866269626421224	0	3	5	8	1903	0.00449943757030371	0.0131795716639209	0.114832247163891	0.114772391810035	0.00420388859695218	0.00899887514060742	16	1017	3750	29354	1	0.123153768885854	0.0769336265510908	Inf	0.136731590835753	1.35811282051282	0.442613734549889	1.42320056389522	0.121164967320261	1	0.108937896514695	0.000508612545638408	1762	1441
TCGA-BR-7901-01A-11D-2201-08	0	1	1	2	215	0	2	2	4	210	8610	10	15	9	34	2139	13	20	20	53	2134	16	7	40	63	2137	8	10	42	60	2200	4	1	6	11	330	0.0511627906976744	0.183333333333333	0.15	1.22222222222222	0.0333333333333333	5	2	5	12	297	0.0558139534883721	0.19047619047619	0.138979878334113	1.37053070386404	0.0404040404040404	0.0930232558139535	20	86	627	3710	0.130013858235422	1.37594957751595	0.86810668383198	Inf	1.30510667749992	2.5938995215311	0.00473570680640022	3.5487641466866	0.927899015832264	0.653125361105321	0.916723566532659	0.76661329679273	195	190
TCGA-BR-7957-01A-11D-2201-08	0	0	0	0	63	0	2	1	3	60	2460	1	2	0	3	597	3	3	0	6	562	2	6	18	26	648	3	4	18	25	653	0	1	1	2	74	0.0317460317460317	0.08	0.113323124042879	0.705945945945946	0.027027027027027	0	0	1	1	92	0.0158730158730159	0.0384615384615385	0.141975308641975	0.270903010033445	0.0108695652173913	0.0317460317460317	2	39	166	1135	0.97312210214974	0.350820854676991	0.0597567138780703	Inf	0.382309726711725	0	1	0	0.435408299866131	0.952984144040976	0.402393509701996	0.4	61	58
TCGA-BR-7958-01A-21D-2340-08	0	0	0	0	193	0	1	3	4	189	7749	4	10	16	30	1784	5	11	17	33	1834	10	15	40	65	2055	14	10	37	61	2076	4	1	5	10	270	0.0518134715025907	0.163934426229508	0.130057803468208	1.26047358834244	0.037037037037037	1	1	6	8	272	0.0414507772020725	0.123076923076923	0.132360097323601	0.929864253393665	0.0294117647058824	0.0829015544041451	16	85	542	3589	0.251466243341955	1.2463720028171	0.746672125874944	Inf	1.20740930181579	1.58786900369004	0.200559373576883	1.74228437471999	1.08882445967317	0.432715970790149	1.1036361647711	0.092215182731215	177	173
TCGA-BR-7959-01A-11D-2340-08	0	1	0	1	113	1	0	1	1	111	4551	3	2	3	8	1116	3	6	5	14	1034	10	4	28	42	1255	7	4	36	47	1146	0	1	3	4	158	0.0353982300884956	0.0851063829787234	0.137870855148342	0.617290600592513	0.0253164556962025	3	0	3	6	157	0.0530973451327434	0.142857142857143	0.125099601593625	1.14194722474977	0.0382165605095541	0.079646017699115	9	72	315	2086	0.750045092080461	0.827837079470414	0.412957474861959	Inf	0.846913580246914	1.34509803921569	0.391154857969097	1.41881067885884	0.714583333333333	0.85919419816912	0.685150305659531	0.369849964277209	104	102
TCGA-BR-8058-01A-31D-2340-08	0	0	1	1	65	1	0	0	0	64	2624	1	6	1	8	651	3	4	3	10	648	8	5	10	23	655	4	7	12	23	670	2	1	1	4	83	0.0615384615384615	0.173913043478261	0.123880597014925	1.40387637506548	0.0481927710843374	3	1	2	6	89	0.0923076923076923	0.260869565217391	0.13587786259542	1.91988275525159	0.0674157303370786	0.123076923076923	8	26	172	1153	0.0696364570406378	2.06123717509298	0.924296312696882	Inf	1.81258549931601	3.20978682170543	0.0139186588387716	4.77938245411294	1.05047568710359	0.559864306993786	1.05841411535113	0.649916646820672	57	56
TCGA-BR-8059-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	884	3	24	80	104	775	31775	15	63	26	104	7215	20	49	35	104	7424	42	55	188	285	8571	40	63	179	282	8565	6	8	3	17	1058	0.0192307692307692	0.0602836879432624	0.123525977816696	0.488024373567148	0.0160680529300567	8	6	3	17	1030	0.0192307692307692	0.0596491228070175	0.120172675300432	0.496361778231988	0.016504854368932	0.0226244343891403	20	429	2088	15048	0.999999993568295	0.335999363285971	0.220260792908862	Inf	0.365563320789494	1.40117746005046	0.121341806142247	1.4837269368561	0.134172695668515	0.999999999999991	0.119789068932361	0.0610356763159465	864	755
TCGA-BR-8060-01A-11D-2340-08	0	0	1	1	238	0	1	4	5	233	9553	10	27	17	54	2413	4	23	21	48	2320	9	10	37	56	2348	10	15	50	75	2472	3	2	8	13	364	0.0546218487394958	0.173333333333333	0.147249190938511	1.17714285714286	0.0357142857142857	1	1	7	9	317	0.0378151260504202	0.160714285714286	0.135008517887564	1.19040108156827	0.028391167192429	0.0798319327731092	19	87	681	4139	0.166024614611987	1.32725582619799	0.829098679043792	Inf	1.26866705455351	1.49006878429554	0.277506731580368	1.6205552721743	1.22031495265583	0.24526314150706	1.26614696537113	0.00194299889429727	219	214
TCGA-BR-8077-01A-11D-2340-08	0	0	1	1	152	0	2	2	4	146	5986	4	5	9	18	1392	4	6	3	13	1365	12	8	36	56	1628	13	13	33	59	1601	3	4	2	9	197	0.0592105263157895	0.152542372881356	0.123048094940662	1.23969715219823	0.0456852791878173	2	0	1	3	180	0.0197368421052632	0.0535714285714286	0.110565110565111	0.48452380952381	0.0166666666666667	0.0526315789473684	8	86	377	2852	0.868981327459284	0.703785668779775	0.337917255127862	Inf	0.728935041480896	1.71299734748011	0.161685251908891	1.89068760462682	0.372390727713067	0.989885669858029	0.343937676521787	0.666846143491722	144	138
TCGA-BR-8078-01A-11D-2340-08	0	0	1	1	1949	2	79	411	490	1456	59696	16	126	17	159	13183	14	139	28	181	13155	16	75	477	568	16589	15	73	460	548	16769	1	6	5	12	1884	0.00615700359158543	0.0218978102189781	0.112350169956467	0.19490678320703	0.00636942675159236	1	6	9	16	1828	0.0082093381221139	0.028169014084507	0.110193501718006	0.255632261842389	0.0087527352297593	0.0082093381221139	16	952	3712	29646	1	0.134231215944943	0.0838030396929828	Inf	0.148537688800228	0.579776140155729	0.873990459806658	0.550803331159969	0.134270461487506	1	0.121142646104303	0.00077998971485745	1933	1440
TCGA-BR-8080-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	207	1	0	2	2	203	8323	7	18	10	35	1950	8	19	16	43	2061	5	14	41	60	2119	10	18	37	65	2193	4	3	2	9	280	0.0434782608695652	0.138461538461538	0.127678978568171	1.08445054945055	0.0321428571428571	1	5	0	6	269	0.0289855072463768	0.1	0.126946672958943	0.787732342007435	0.0223048327137546	0.0338164251207729	7	86	549	3763	0.959082057147211	0.557967546482879	0.253741490046059	Inf	0.591182403979866	2.6180935033394	0.0338284002335312	3.42553428408357	0.201391807949185	0.999677992991375	0.180413856924239	0.389846743295019	200	196
TCGA-BR-8081-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	1176	2	42	153	195	979	40139	10	75	16	101	8894	10	63	13	86	9069	3	72	332	407	11005	10	49	326	385	11171	0	1	5	6	1251	0.00510204081632653	0.0155844155844156	0.111986393339898	0.139163474415273	0.00479616306954436	0	6	5	11	1240	0.00935374149659864	0.027027027027027	0.112676056338028	0.239864864864865	0.00887096774193548	0.00850340136054422	10	661	2491	19685	1	0.119558162903635	0.0645148267876762	Inf	0.132674348967759	0	1	0	0.135295574707244	1	0.12195668967116	0.000296625880608082	1166	969
TCGA-BR-8284-01A-11D-2340-08	0	0	1	1	445	1	10	30	40	403	16523	2	30	5	37	3596	6	17	5	28	3856	5	27	120	152	4541	14	35	137	186	4530	2	5	6	13	529	0.0292134831460674	0.0698924731182796	0.116777041942605	0.59851210439661	0.0245746691871456	1	1	2	4	497	0.00898876404494382	0.0263157894736842	0.109447258313147	0.240442655935614	0.00804828973843058	0.0247191011235955	11	265	1026	8045	0.99999512937894	0.325506418587489	0.17998249276744	Inf	0.352363900895556	1.39596799015082	0.366295643656685	1.47013231850734	0.275210291184078	0.999999519910514	0.251946214055765	0.141070325052528	434	392
TCGA-BR-8285-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	107	0	1	2	3	104	4264	2	8	8	18	1013	1	4	5	10	971	1	4	36	41	1149	1	8	26	35	1131	0	0	1	1	152	0.00934579439252336	0.0285714285714286	0.134394341290893	0.212593984962406	0.00657894736842105	0	0	2	2	154	0.0186915887850467	0.0487804878048781	0.134029590948651	0.363953120050681	0.012987012987013	0.0280373831775701	3	61	306	1974	0.993782569540481	0.317364087337001	0.0838246537559948	Inf	0.349264705882353	0	1	0	0.360531309297913	0.992211399719145	0.328120315171719	0.1	104	101
TCGA-BR-8286-01A-12D-2340-08	0	0	0	0	166	0	5	3	8	158	6478	6	12	9	27	1507	4	14	8	26	1529	5	8	37	50	1729	5	10	40	55	1713	0	2	4	6	221	0.036144578313253	0.109090909090909	0.129013426736719	0.845577951460304	0.0271493212669683	0	1	5	6	238	0.036144578313253	0.12	0.137651821862348	0.871764705882353	0.0252100840336134	0.0542168674698795	9	78	459	2983	0.834420370762353	0.74993016332861	0.376149976776258	Inf	0.775749380211855	0	1	0	0.876496052966641	0.713453403274327	0.860198402948073	0.000336519046978058	157	149
TCGA-BR-8289-01A-11D-2340-08	1	0	0	1	241	0	3	5	8	233	9553	4	14	28	46	2425	6	21	18	45	2309	7	15	51	73	2417	13	16	40	69	2402	4	3	2	9	330	0.037344398340249	0.130434782608696	0.137385512073272	0.949407114624506	0.0272727272727273	2	1	5	8	353	0.033195020746888	0.10958904109589	0.146048820852296	0.750358958438434	0.0226628895184136	0.0539419087136929	13	98	683	4136	0.807063207492476	0.803332285564283	0.45827475055427	Inf	0.826335852690172	2.11669106881406	0.0539913000387695	2.59450089980492	0.542741299695912	0.97940979589529	0.504693615755627	1	228	220
TCGA-BR-8291-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	40	0	0	2	2	38	1558	0	5	1	6	376	1	2	2	5	410	0	3	6	9	374	3	5	10	18	398	0	3	1	4	60	0.1	0.222222222222222	0.150753768844221	1.47407407407407	0.0666666666666667	0	2	0	2	52	0.05	0.222222222222222	0.13903743315508	1.5982905982906	0.0384615384615385	0.025	1	18	112	660	0.948466009620294	0.327692936601393	0.0158205115475024	Inf	0.362781954887218	0	1	0	0.430803571428571	0.918114068912252	0.393191218212308	1	39	37
TCGA-BR-8295-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	82	0	2	4	6	76	3116	2	7	1	10	734	4	6	5	15	720	8	4	15	27	858	10	5	9	24	804	3	1	1	5	104	0.0609756097560976	0.208333333333333	0.129353233830846	1.61057692307692	0.0480769230769231	1	0	0	1	115	0.0121951219512195	0.037037037037037	0.134032634032634	0.276328502415459	0.00869565217391304	0.0609756097560976	5	37	219	1443	0.665324093154756	0.890499452522377	0.329699918133599	Inf	0.903457273320287	1.68645357686454	0.208352276196068	1.88162798092623	0.3162100456621	0.965970404327969	0.286614788672129	0.242424242424242	77	71
TCGA-BR-8297-01A-12D-2340-08	0	0	0	0	269	0	6	5	11	258	10578	7	24	35	66	2630	2	26	31	59	2558	12	8	52	72	2667	7	14	40	61	2723	4	2	2	8	365	0.0297397769516729	0.131147540983607	0.134043334557473	0.978396586570851	0.0219178082191781	5	1	4	10	376	0.0371747211895911	0.138888888888889	0.14098237720285	0.985150709219858	0.0265957446808511	0.0557620817843866	15	96	741	4649	0.570890002761405	0.980307617806741	0.581293305634845	Inf	0.982966772440457	3.44555721287023	0.000453155272773154	5.64365367423704	0.474388311916916	0.990423584679292	0.437765448429132	0.499792039464139	254	243
TCGA-BR-8360-01A-11D-2340-08	0	0	1	1	1150	4	41	170	211	934	38294	13	67	17	97	8406	11	50	21	82	8374	10	56	300	366	10881	19	52	318	389	10633	2	4	0	6	1139	0.00521739130434783	0.0154241645244216	0.107119345434026	0.143990466539223	0.00526777875329236	3	3	9	15	1204	0.0130434782608696	0.040983606557377	0.110651594522562	0.370384238331246	0.0124584717607973	0.0121739130434783	14	633	2343	19171	1	0.180973388639933	0.108675890523885	Inf	0.19868845408171	1.58314568707964	0.203314251324555	1.70457660660698	0.133722014345561	1	0.120925305969704	0.326423631912115	1136	920
TCGA-BR-8361-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	1838	5	57	249	306	1527	62607	17	143	26	186	13989	19	108	20	147	13929	20	65	545	630	17120	14	54	496	564	17569	0	0	12	12	1998	0.00652883569096844	0.0212765957446809	0.113723034891001	0.187091346665815	0.00600600600600601	4	8	6	18	2003	0.00979325353645267	0.0285714285714286	0.116997663551402	0.244205120890093	0.00898652021967049	0.0119695321001088	22	1053	4001	30688	1	0.160252862152048	0.107958529602071	Inf	0.17743424608964	1.02000970345649	0.562451639564677	1.02268003161012	0.149914970825017	1	0.134961159538661	0.000368176733900806	1816	1505
TCGA-BR-8363-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	1515	6	56	247	303	1205	49405	13	131	27	171	11161	22	122	42	186	11204	8	67	339	414	13533	7	62	365	434	13507	0	3	12	15	1570	0.0099009900990099	0.0345622119815668	0.116236025764418	0.297345093780269	0.00955414012738853	1	4	8	13	1637	0.00858085808580858	0.0314009661835749	0.120963570531294	0.25959027206006	0.00794135613927917	0.0138613861386139	21	698	3207	23833	1	0.223592381090679	0.148734855847635	Inf	0.246262413626659	0.56210373142085	0.849489646492952	0.530835666784809	0.239532840094112	1	0.217303724141058	1.30996732944117e-07	1494	1184
TCGA-BR-8364-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	27	0	0	2	2	24	984	0	2	0	2	234	1	2	0	3	240	1	3	8	12	258	3	0	4	7	252	0	0	0	0	31	0	0	0.123015873015873	0	0	1	0	1	2	37	0.0740740740740741	0.166666666666667	0.143410852713178	1.16216216216216	0.0540540540540541	0.0740740740740741	2	14	68	442	0.652391112855425	0.928683732540089	0.147830634911004	Inf	0.9375	1.875	0.439213395044943	2.16243952415762	0.625	0.821090295055416	0.591404144180817	1	25	22
TCGA-BR-8365-01A-21D-2340-08	0	0	0	0	43	0	1	1	2	41	1681	1	1	3	5	358	0	1	2	3	403	2	3	15	20	488	2	3	8	13	432	0	0	1	1	51	0.0232558139534884	0.0769230769230769	0.118055555555556	0.65158371040724	0.0196078431372549	0	1	1	2	52	0.0465116279069767	0.1	0.10655737704918	0.938461538461539	0.0384615384615385	0.0465116279069767	2	25	103	817	0.821261339552826	0.634821338288183	0.105700519648705	Inf	0.6616325062927	0	1	0	0.776699029126214	0.746697656451818	0.755634964638552	0.4	41	39
TCGA-BR-8366-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	222	0	1	0	1	219	8979	6	25	24	55	2218	5	22	27	54	2198	2	14	39	55	2283	2	8	45	55	2280	0	2	2	4	320	0.018018018018018	0.0727272727272727	0.140350877192982	0.518181818181818	0.0125	1	5	4	10	325	0.045045045045045	0.181818181818182	0.142356548401226	1.2772027972028	0.0307692307692308	0.0315315315315315	7	81	645	3918	0.972486730901996	0.525009635952669	0.238505475759477	Inf	0.562737843551797	1.76860465116279	0.456788109095378	2.0244603152009	0.50531561461794	0.983809569248047	0.467323396125838	0.0768115942028986	215	212
TCGA-BR-8367-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	86	1	2	1	3	82	3362	3	4	2	9	726	1	3	5	9	787	4	5	26	35	928	6	3	20	29	921	0	1	0	1	106	0.0116279069767442	0.0344827586206897	0.115092290988056	0.29960962914769	0.00943396226415094	0	0	2	2	92	0.0232558139534884	0.0571428571428571	0.0991379310344828	0.57639751552795	0.0217391304347826	0.0232558139534884	2	54	198	1651	0.985815432580294	0.308952108484721	0.0531682230322931	Inf	0.333513708513709	0	1	0	0.406016688625384	0.963587011968835	0.379151985809331	0.4	84	80
TCGA-BR-8368-01A-11D-2340-08	0	0	1	1	1267	0	50	210	260	1004	41164	8	63	15	86	8861	8	64	13	85	9045	9	34	358	401	11701	14	66	352	432	11557	2	5	5	12	1245	0.00947119179163378	0.0277777777777778	0.107726918750541	0.257853636769299	0.00963855421686747	0	2	7	9	1246	0.00710339384372534	0.0224438902743142	0.10648662507478	0.210767223194021	0.007223113964687	0.0110497237569061	14	719	2491	20767	1	0.162336496502723	0.0975617221274544	Inf	0.178329297887128	0.811896741312202	0.722403246217471	0.794014677932683	0.157805282114203	1	0.143332050807741	0.00250149767228364	1253	990
TCGA-BR-8369-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	234	2	3	6	9	223	9143	5	16	16	37	2141	8	19	17	44	2319	7	15	52	74	2356	5	15	48	68	2327	1	1	0	2	329	0.00854700854700855	0.0294117647058824	0.141383755908896	0.208027892007867	0.0060790273556231	1	5	2	8	306	0.0341880341880342	0.108108108108108	0.129881154499151	0.832361773538244	0.0261437908496732	0.0170940170940171	4	108	635	4048	0.999903719507559	0.236146203853783	0.0790845300531736	Inf	0.263385826771654	1.22913385826772	0.498956102204688	1.2748856407212	0.147496062992126	0.999991158133616	0.130125289994	1	230	219
TCGA-BR-8370-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	147	1	3	3	6	140	5740	1	7	0	8	1342	0	4	3	7	1322	8	15	37	60	1556	3	26	36	65	1520	0	1	2	3	185	0.0204081632653061	0.0461538461538462	0.121710526315789	0.379209979209979	0.0162162162162162	2	4	2	8	202	0.054421768707483	0.133333333333333	0.129820051413882	1.02706270627063	0.0396039603960396	0.0408163265306122	6	78	387	2689	0.9601212549596	0.534572075583453	0.225081960185761	Inf	0.567737172388335	1.4451491660794	0.412433973632863	1.54380977578208	0.435524406215709	0.985710507679356	0.402883941351871	0.635117204776648	141	134
TCGA-BR-8371-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	46	0	0	0	0	46	1886	0	5	1	6	418	1	4	3	8	436	4	4	5	13	482	3	3	13	19	550	0	1	1	2	60	0.0434782608695652	0.105263157894737	0.109090909090909	0.964912280701754	0.0333333333333333	0	0	1	1	56	0.0217391304347826	0.0769230769230769	0.116182572614108	0.662087912087912	0.0178571428571429	0.0434782608695652	2	23	116	916	0.788775402900181	0.686869409135695	0.11405058537024	Inf	0.711724137931035	0	1	0	0.988505747126437	0.61868798131678	0.987080845801945	0.4	44	44
TCGA-BR-8372-01A-11D-2340-08	0	0	1	1	1601	5	54	234	288	1307	53587	25	217	29	271	12070	13	222	20	255	12136	12	68	323	403	14579	7	70	301	378	14802	1	6	2	9	1676	0.00562148657089319	0.0238095238095238	0.113227942169977	0.210279577224685	0.00536992840095465	0	6	3	9	1673	0.00562148657089319	0.0223325062034739	0.114754098360656	0.19461183977313	0.00537955768081291	0.00374765771392879	6	637	3349	26032	1	0.0732182731801153	0.0317546126345715	Inf	0.0818637628650785	0.461740346686364	0.899671906023932	0.431845650606718	0.0702970079089816	1	0.0627895283507502	0.17741935483871	1595	1301
TCGA-BR-8373-01A-11D-2340-08	0	0	1	1	112	0	2	6	8	104	4264	1	7	8	16	966	2	7	4	13	1003	2	8	31	41	1135	5	5	24	34	1160	1	2	2	5	152	0.0446428571428571	0.147058823529412	0.131034482758621	1.12229102167183	0.0328947368421053	0	3	2	5	125	0.0446428571428571	0.121951219512195	0.110132158590308	1.10731707317073	0.04	0.0446428571428571	5	57	277	2018	0.881151704347003	0.63915646295807	0.241403290835171	Inf	0.668161173867474	1.1835997937081	0.594313031517475	1.21408893550315	0.602559894978668	0.910362266796556	0.57149992221281	0.303405572755418	107	99
TCGA-BR-8380-01A-11D-2340-08	0	0	1	1	97	0	3	1	4	93	3813	4	3	4	11	832	1	2	5	8	889	5	8	27	40	1045	4	4	26	34	1047	0	0	0	0	110	0	0	0.105062082139446	0	0	2	1	2	5	122	0.0515463917525773	0.125	0.116746411483254	1.07069672131148	0.040983606557377	0.0412371134020619	4	58	232	1860	0.922162118182722	0.553036111737709	0.181640375263486	Inf	0.581757508342603	2.00383141762452	0.264652143647749	2.28940961913716	0.340273259596617	0.984466350283917	0.314511845866695	1	93	89
TCGA-BR-8381-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	145	0	0	1	1	144	5904	4	8	3	15	1399	3	9	8	20	1366	3	9	47	59	1590	4	6	40	50	1549	0	3	5	8	168	0.0551724137931034	0.16	0.108457069076824	1.4752380952381	0.0476190476190476	1	3	3	7	208	0.0482758620689655	0.11864406779661	0.130817610062893	0.906942633637549	0.0336538461538462	0.0620689655172414	9	85	376	2763	0.805607804256453	0.778121811405418	0.39081444217265	Inf	0.799315301041195	1.19262917933131	0.591159054412133	1.22464808670055	0.767669356810956	0.830687390169471	0.744203849861056	0.0141929035482259	136	135
TCGA-BR-8382-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	1154	3	45	159	204	946	38786	8	80	28	116	8582	11	78	20	109	8516	5	55	311	371	10871	8	49	293	350	10817	2	4	4	10	1204	0.00866551126516464	0.0285714285714286	0.111306277156328	0.256691979117228	0.00830564784053156	0	8	4	12	1232	0.0103986135181976	0.032345013477089	0.113329040566645	0.285407988238177	0.00974025974025974	0.00866551126516464	10	607	2436	19252	1	0.130205411959354	0.0702239078471638	Inf	0.14429691845441	1.36971074902109	0.438144111061567	1.43689648965929	0.117922117465392	1	0.106086980596109	0.0688818317859724	1144	936
TCGA-BR-8384-01A-21D-2394-08	0	0	0	0	57	0	1	0	1	55	2255	0	4	6	10	553	3	2	2	7	527	2	1	14	17	576	5	3	13	21	599	1	0	0	1	80	0.0175438596491228	0.0476190476190476	0.13355592654424	0.356547619047619	0.0125	0	0	1	1	75	0.0175438596491228	0.0588235294117647	0.130208333333333	0.451764705882353	0.0133333333333333	0.0350877192982456	2	32	155	1020	0.948662665554314	0.41150938559733	0.0695642124778382	Inf	0.445920303605313	1.08294930875576	0.629719054024779	1.09671814148498	0.280764635603345	0.977575804519168	0.253278652765055	1	55	53
TCGA-BR-8483-01A-31D-2394-08	0	0	0	0	143	0	3	7	10	131	5371	4	7	4	15	1232	5	8	5	18	1281	0	12	39	51	1413	5	11	31	47	1445	1	5	1	7	188	0.048951048951049	0.148936170212766	0.130103806228374	1.1447487550928	0.0372340425531915	0	1	1	2	175	0.013986013986014	0.0392156862745098	0.123849964614296	0.316638655462185	0.0114285714285714	0.020979020979021	3	72	363	2495	0.997155625964964	0.286464129474783	0.0760257637262594	Inf	0.314931129476584	1.57465564738292	0.493588756161263	1.71791980250401	0.224950806768989	0.999105712746397	0.202217533170265	1	140	128
TCGA-BR-8484-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	108	0	0	1	1	107	4387	4	8	5	17	1033	4	10	5	19	1093	1	2	36	39	1139	4	6	22	32	1122	2	0	3	5	147	0.0462962962962963	0.15625	0.131016042780749	1.19260204081633	0.0340136054421769	0	1	4	5	156	0.0462962962962963	0.128205128205128	0.136962247585601	0.936061801446417	0.032051282051282	0.0833333333333333	9	54	303	1958	0.476231558117379	1.07699307249797	0.531024887826768	Inf	1.06600660066007	2.98481848184818	0.136966077784999	4.30401998587984	0.900591783316263	0.67483340563872	0.887018284587521	0.0697785186949274	99	98
TCGA-BR-8485-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	358	2	0	6	6	350	14350	6	37	61	104	3598	18	49	76	143	3848	12	9	30	51	3425	7	6	39	52	3479	1	2	6	9	574	0.0251396648044693	0.173076923076923	0.164989939637827	1.04901500938086	0.0156794425087108	4	1	2	7	482	0.0195530726256983	0.137254901960784	0.140729927007299	0.975307135302254	0.0145228215767635	0.0363128491620112	13	75	1056	5848	0.599730327192958	0.959898398828424	0.543592446551314	Inf	0.965823002754821	1.72049441786284	0.154175927930313	1.97765464174058	0.758014931927975	0.84678257862748	0.726310006925178	0.472547597169157	345	337
TCGA-BR-8486-01A-31D-2394-08	0	0	0	0	70	0	2	1	3	67	2747	1	5	2	8	631	1	5	2	8	609	5	5	22	32	765	0	2	17	19	742	0	0	2	2	82	0.0285714285714286	0.105263157894737	0.110512129380054	0.952503209242619	0.024390243902439	3	0	1	4	95	0.0571428571428571	0.125	0.124183006535948	1.00657894736842	0.0421052631578947	0.0857142857142857	6	38	177	1330	0.419735419226937	1.18629077468895	0.482545650208294	Inf	1.16101694915254	5.10847457627119	0.013836183774519	11.2401798664199	0.654932637983485	0.851252689725785	0.626337396877004	1	64	61
TCGA-BR-8487-01A-11D-2394-08	0	0	2	2	3613	14	116	516	632	2967	121647	28	300	16	344	27023	25	323	22	370	27185	25	157	955	1137	33670	15	173	928	1116	33769	3	11	17	31	3812	0.00858012731801827	0.0277777777777778	0.112884598300216	0.246072344642649	0.00813221406086044	1	5	19	25	3680	0.00691945751453086	0.0219876868953386	0.109296109296109	0.201175385262514	0.00679347826086957	0.0110711320232494	40	1883	7492	59947	1	0.169975020817972	0.127836043562901	Inf	0.187238028763008	0.900146823278163	0.662800196941959	0.889039537882075	0.172093922666032	1	0.155959262121773	1.521515468111e-10	3573	2927
TCGA-BR-8588-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	141	0	0	4	4	136	5576	3	6	6	15	1256	6	13	5	24	1261	0	7	40	47	1523	1	11	38	50	1536	0	2	2	4	179	0.0283687943262411	0.08	0.116536458333333	0.686480446927374	0.0223463687150838	0	1	1	2	178	0.0141843971631206	0.0425531914893617	0.116874589625739	0.364092756394932	0.0112359550561798	0.0212765957446809	3	76	357	2702	0.996167938056713	0.298835232047852	0.0793970375110721	Inf	0.325390915860015	0	1	0	0.329562594268477	0.995770544789729	0.302819234414254	0.181818181818182	138	133
TCGA-BR-8589-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	1229	3	2	8	10	1215	49815	70	158	307	535	12774	77	171	304	552	12900	4	9	45	58	11913	5	3	62	70	12228	1	3	7	11	1967	0.00895036615134255	0.157142857142857	0.160860320575728	0.976890115476796	0.00559227249618709	1	2	7	10	1922	0.0081366965012205	0.172413793103448	0.161336355242172	1.06866051885608	0.00520291363163371	0.0130187144019528	16	100	3889	20252	0.786341434336915	0.833207594342245	0.504890374854192	Inf	0.85620804922815	1.37944630153424	0.438659415497771	1.48782817161	0.812197355108946	0.836830899133235	0.783933918573454	0.000307233628810449	1213	1199
TCGA-BR-8590-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	147	1	2	3	5	140	5740	7	12	14	33	1471	5	14	23	42	1351	2	6	29	37	1426	4	3	21	28	1492	1	0	3	4	180	0.0272108843537415	0.142857142857143	0.120643431635389	1.18412698412698	0.0222222222222222	0	1	1	2	182	0.0136054421768707	0.0540540540540541	0.127629733520337	0.423522423522424	0.010989010989011	0.0340136054421769	5	51	362	2556	0.839066623900145	0.692308102735477	0.260931815575808	Inf	0.719711917916338	1.34346224677716	0.548895615046538	1.41196053643104	0.644861878453039	0.881645800756043	0.614065426703959	0.242424242424242	142	135
TCGA-BR-8591-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	1794	4	85	276	361	1427	58507	16	152	23	191	12869	14	157	25	196	13050	6	80	415	501	16376	16	95	428	539	16212	1	8	9	18	1763	0.0100334448160535	0.0333951762523191	0.108746607451271	0.30709166046659	0.0102098695405559	0	3	8	11	1853	0.00613154960981048	0.0219560878243513	0.113153395212506	0.194038259153576	0.00593631948192121	0.0100334448160535	18	847	3616	28972	1	0.170275106787312	0.109438967474206	Inf	0.187536446877078	0.409644006436042	0.924777481025119	0.381539389379401	0.18174004556	1	0.164903943065692	6.84300078170197e-06	1776	1409
TCGA-BR-8592-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	49	0	1	0	1	48	1968	0	1	2	3	443	0	4	0	4	450	0	3	18	21	496	0	4	16	20	579	0	2	0	2	64	0.0408163265306122	0.1	0.110535405872193	0.9046875	0.03125	0	1	0	1	56	0.0204081632653061	0.0476190476190476	0.112903225806452	0.421768707482993	0.0178571428571429	0	0	34	120	955	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	49	48
TCGA-BR-8676-01A-11D-2394-08	0	1	0	1	112	0	1	5	6	106	4346	2	6	6	14	1018	4	5	4	13	991	3	9	31	43	1164	2	7	27	36	1173	1	3	2	6	157	0.0535714285714286	0.166666666666667	0.13384484228474	1.24522292993631	0.0382165605095541	0	1	4	5	157	0.0446428571428571	0.116279069767442	0.134879725085911	0.862094504517849	0.0318471337579618	0.0625	7	56	314	2023	0.758293575644475	0.805402097061891	0.359980666244548	Inf	0.826963906581741	1.48853503184713	0.514660411333204	1.61027229875923	0.76993191302438	0.807607473676162	0.743469148019555	0.0634674922600621	105	99
TCGA-BR-8677-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	88	1	2	2	4	83	3403	1	5	3	9	823	0	4	0	4	759	2	3	27	32	875	4	8	26	38	946	2	0	2	4	117	0.0454545454545455	0.105263157894737	0.123678646934461	0.851102114260009	0.0341880341880342	0	0	3	3	119	0.0340909090909091	0.09375	0.136	0.689338235294118	0.0252100840336134	0.0795454545454545	7	52	236	1585	0.657365280991543	0.904112226370064	0.401829419486234	Inf	0.915469692617064	2.57203389830508	0.177990807078908	3.35479816164849	0.727934122161816	0.832178705762415	0.699712269705986	0.286130536130536	81	76
TCGA-BR-8678-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	134	0	1	6	7	127	5207	0	4	3	7	1238	5	8	4	17	1346	6	11	32	49	1291	5	12	37	54	1332	2	3	3	8	200	0.0597014925373134	0.148148148148148	0.15015015015015	0.986666666666667	0.04	4	3	4	11	179	0.082089552238806	0.224489795918367	0.138652207591015	1.61908562307605	0.0614525139664804	0.0970149253731343	13	67	379	2244	0.373671491312257	1.14872633659073	0.64387861995006	Inf	1.12463720316623	3.77500599664188	0.00226105860299766	7.09630699696059	0.7021146418875	0.885346797780588	0.668571042665859	1	121	114
TCGA-BR-8679-01A-11D-2394-08	0	0	1	1	183	0	0	7	7	176	7216	5	8	7	20	1692	6	9	11	26	1721	3	10	51	64	1835	4	6	56	66	1968	2	0	6	8	255	0.0437158469945355	0.121212121212121	0.129573170731707	0.935472370766488	0.0313725490196078	1	2	6	9	226	0.0491803278688525	0.140625	0.123160762942779	1.14180033185841	0.0398230088495575	0.0819672131147541	15	99	481	3322	0.47918895490836	1.04642796278012	0.619510615105743	Inf	1.04032169821644	3.38847638847639	0.0481288999795609	5.17620822798387	0.886704101657373	0.713764012558709	0.872445401087018	0.00489579257292174	168	161
TCGA-BR-8680-01A-11D-2394-08	0	0	2	2	6741	15	15	8	23	6698	274618	14	465	553	1032	73251	22	456	536	1014	73752	8	636	1662	2306	63826	8	691	1647	2346	63789	2	589	125	716	10395	0.106215695000742	0.305200341005968	0.162959130884635	1.87286431480805	0.0688792688792689	3	534	123	660	10465	0.0979083222073876	0.28620988725065	0.163961395042773	1.74559314511801	0.0630673674151935	0.0375315235128319	253	3072	20860	106755	1	0.421474852843112	0.377000466724225	Inf	0.465496363151407	1.91177792425695	0.106273330894251	2.32620369388917	0.458503161284472	1	0.414630087941676	8.92685191886618e-72	6488	6445
TCGA-BR-8682-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	91	0	2	3	5	86	3526	3	2	4	9	770	0	1	0	1	820	2	3	32	37	933	1	2	36	39	1003	0	1	2	3	123	0.032967032967033	0.0769230769230769	0.122632103688933	0.627267041901188	0.024390243902439	2	1	1	4	102	0.043956043956044	0.108108108108108	0.109324758842444	0.988871224165342	0.0392156862745098	0.0549450549450549	5	66	225	1711	0.924482137842864	0.576225040815957	0.218243199890357	Inf	0.605946791862285	5.7362962962963	0.0377849542798119	15.1670604131091	0.379607843137255	0.988231826714425	0.351099224027068	1	86	81
TCGA-BR-8683-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	174	0	3	3	6	168	6888	2	11	4	17	1586	9	6	3	18	1659	7	18	34	59	1790	8	14	52	74	1853	1	4	3	8	232	0.0459770114942529	0.108108108108108	0.125202374527793	0.863466915191053	0.0344827586206897	1	3	3	7	222	0.0402298850574713	0.11864406779661	0.124022346368715	0.956634600702397	0.0315315315315315	0.0459770114942529	8	93	454	3189	0.943476563266647	0.604303656156565	0.291114752195362	Inf	0.635582500981376	1.06989720998532	0.574812918529654	1.08065326256824	0.559829935457433	0.963771537879176	0.526890089980795	0.214759287023155	166	160
TCGA-BR-8686-01A-11D-2394-08	0	0	1	1	144	0	1	3	4	140	5740	1	3	2	6	1386	2	5	4	11	1279	1	18	39	58	1491	4	14	47	65	1584	1	2	8	11	190	0.0763888888888889	0.169230769230769	0.119949494949495	1.41085020242915	0.0578947368421053	0	2	9	11	196	0.0763888888888889	0.189655172413793	0.131455399061033	1.44273399014778	0.0561224489795918	0.125	18	73	386	2689	0.0357167588437334	1.71736653047996	1.048067197002	Inf	1.57575585036725	1.59326424870466	0.489230047563113	1.74119272809803	1.57473792023135	0.0404776297958564	1.71598350593539	1.13967072906135e-06	126	122
TCGA-BR-8687-01A-11D-2394-08	0	0	1	1	215	3	0	1	1	211	8651	7	29	19	55	2097	2	26	40	68	2038	2	11	31	44	2255	2	5	37	44	2261	2	1	4	7	274	0.0325581395348837	0.159090909090909	0.121185316231756	1.3127903118779	0.0255474452554745	0	1	4	5	316	0.0232558139534884	0.113636363636364	0.140133037694013	0.810917721518987	0.0158227848101266	0.0465116279069767	10	62	590	3926	0.471261215180972	1.07326758276725	0.554849805468887	Inf	1.06308851224105	3.8271186440678	0.085753483790306	6.64945722302047	0.90049850448654	0.678307155028479	0.887225743213397	0.0360748418360478	205	201
TCGA-BR-8690-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	177	1	3	1	4	171	7011	8	12	8	28	1655	8	6	8	22	1717	7	11	27	45	1802	9	21	46	76	1837	3	5	2	10	244	0.0564971751412429	0.131578947368421	0.132825258573762	0.990616911130285	0.040983606557377	4	3	1	8	236	0.0451977401129944	0.177777777777778	0.130965593784684	1.35743879472693	0.0338983050847458	0.0564971751412429	10	79	480	3159	0.751178664207452	0.833108095183234	0.434073652798394	Inf	0.851825842696629	3.316796875	0.00275713050656868	5.11513539571452	0.311558219178082	0.997485594850121	0.282114239023134	0.264232986146223	167	161
TCGA-BR-A44T-01A-32D-A24D-08	0	0	0	0	24	0	2	0	2	22	902	2	2	0	4	207	0	0	0	0	227	0	0	7	7	226	0	1	10	11	242	0	1	0	1	36	0.0416666666666667	0.0909090909090909	0.148760330578512	0.611111111111111	0.0277777777777778	0	0	1	1	27	0.0416666666666667	0.142857142857143	0.119469026548673	1.1957671957672	0.037037037037037	0.0416666666666667	1	16	63	405	0.913660729559607	0.402333290046454	0.0191576601637267	Inf	0.436974789915966	NaN	1	0	0.436974789915966	0.913660729559607	0.402333290046454	1	23	21
TCGA-BR-A44U-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	125	0	0	4	4	121	4961	1	6	4	11	1110	1	4	4	9	1113	5	5	36	46	1391	12	5	38	55	1347	1	0	1	2	137	0.016	0.0363636363636364	0.101707498144024	0.357531519575315	0.0145985401459854	0	0	2	2	140	0.016	0.0434782608695652	0.100647016534867	0.431987577639752	0.0142857142857143	0.032	4	87	277	2461	0.984790108821249	0.408573679413196	0.135774612467966	Inf	0.434482485024001	0.58143979613506	0.836973379476609	0.555374116661077	0.40072202166065	0.983069829803624	0.37549048957344	0.485714285714286	121	117
TCGA-BR-A452-01A-91D-A25D-08	0	0	0	0	126	1	2	5	7	118	4838	0	5	11	16	1125	2	10	9	21	1191	2	5	27	34	1203	16	6	25	47	1319	9	2	3	14	173	0.111111111111111	0.297872340425532	0.131159969673995	2.27106137006518	0.0809248554913295	1	1	3	5	175	0.0396825396825397	0.147058823529412	0.14546965918537	1.0109243697479	0.0285714285714286	0.126984126984127	16	54	348	2174	0.0294723322394326	1.85041127511154	1.0817410982493	Inf	1.65648604269294	4.02618135376756	4.18408749275148e-05	7.7981529793644	0.836206896551724	0.7403105212779	0.814903215014114	0.324544005242366	110	102
TCGA-BR-A453-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	86	0	0	2	2	84	3444	2	1	0	3	766	4	6	1	11	777	0	8	23	31	949	0	10	29	39	952	0	2	1	3	117	0.0348837209302326	0.0769230769230769	0.122899159663866	0.625904010519395	0.0256410256410256	0	1	0	1	104	0.0116279069767442	0.032258064516129	0.10958904109589	0.294354838709677	0.00961538461538462	0.0116279069767442	1	51	221	1680	0.998276577817317	0.149128743609964	0.00749962178621543	Inf	0.165419422206753	NaN	1	0	0.165419422206753	0.998276577817317	0.149128743609964	1	85	83
TCGA-BR-A4CQ-01A-12D-A25D-08	0	0	0	0	200	0	2	3	5	195	7995	7	11	3	21	1841	3	9	6	18	1802	11	20	53	84	2109	10	12	50	72	2243	2	2	4	8	264	0.04	0.111111111111111	0.117699509585377	0.944023569023569	0.0303030303030303	4	5	0	9	280	0.045	0.107142857142857	0.132764343290659	0.807015306122449	0.0321428571428571	0.05	10	114	544	3808	0.95396027493584	0.614092324934352	0.323493693775243	Inf	0.645161290322581	2.28571428571429	0.0398042227758783	2.7990639453478	0.310679611650485	0.999261832880387	0.28287874411078	0.707985303535915	190	185
TCGA-BR-A4CR-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	84	1	1	4	5	78	3198	4	6	2	12	709	5	2	1	8	751	2	8	25	35	886	2	5	16	23	852	0	1	1	2	107	0.0238095238095238	0.0869565217391304	0.125586854460094	0.692401462819992	0.0186915887850467	0	1	1	2	107	0.0238095238095238	0.0571428571428571	0.120767494356659	0.473164218958611	0.0186915887850467	0.0238095238095238	2	43	214	1524	0.979552790463719	0.331369333575153	0.0567343496867356	Inf	0.360955347871236	0	1	0	0.396170503761112	0.968345280560583	0.365347529931381	0.428571428571429	82	76
TCGA-BR-A4CS-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	181	2	4	8	12	167	6847	1	7	7	15	1562	2	5	7	14	1568	12	15	37	64	1914	11	13	50	74	1803	2	6	3	11	220	0.0607734806629834	0.148648648648649	0.122018857459789	1.21824324324324	0.05	1	3	4	8	231	0.0441988950276243	0.125	0.120689655172414	1.03571428571429	0.0346320346320346	0.0552486187845304	10	100	451	3266	0.870072091696056	0.724223412138176	0.379820373765572	Inf	0.749244104011288	1.07500241010315	0.541441932413472	1.0862576201731	0.663124092055968	0.913879653696666	0.633712547846517	0.269064999877013	171	157
TCGA-BR-A4IU-01A-22D-A25D-08	0	0	0	0	44	0	0	3	3	41	1681	1	4	1	6	381	1	4	0	5	379	0	2	14	16	458	0	3	11	14	463	0	0	0	0	65	0	0	0.140388768898488	0	0	0	0	0	0	48	0	0	0.104803493449782	0	0	0	0	25	113	808	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	44	41
TCGA-BR-A4IV-01A-31D-A25D-08	0	0	0	0	35	0	0	2	2	32	1312	2	0	3	5	329	2	2	1	5	282	1	4	8	13	359	2	2	5	9	342	0	0	0	0	28	0	0	0.0818713450292398	0	0	0	0	1	1	43	0.0285714285714286	0.0769230769230769	0.119777158774373	0.64221824686941	0.0232558139534884	0.0285714285714286	1	15	71	630	0.81952808527313	0.591904041498049	0.028131292120776	Inf	0.617077464788732	0	1	0	0.759479956663055	0.751977379995318	0.739719841480483	1	34	31
TCGA-BR-A4IY-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	163	0	1	5	6	156	6396	5	9	5	19	1400	4	7	3	14	1529	16	7	42	65	1743	12	15	31	58	1724	2	3	4	9	234	0.0552147239263804	0.155172413793103	0.135730858468677	1.14323607427056	0.0384615384615385	4	1	2	7	205	0.0429447852760736	0.107692307692308	0.117613310384395	0.915647279549719	0.0341463414634146	0.0736196319018405	12	89	439	3028	0.638058322231475	0.930004924195889	0.515370709944835	Inf	0.938316155077922	1.69232020826554	0.136453813634306	1.88063689679594	0.649109120978563	0.912006978753876	0.617757578420417	1	151	144
TCGA-BR-A4IZ-01A-32D-A25D-08	0	0	0	0	22	0	1	0	1	21	861	0	0	2	2	177	0	0	0	0	189	0	1	6	7	246	1	2	9	12	249	1	0	0	1	17	0.0454545454545455	0.0833333333333333	0.0682730923694779	1.22058823529412	0.0588235294117647	0	0	0	0	22	0	0	0.0894308943089431	0	0	0.0454545454545455	1	15	39	456	0.734079527442182	0.779801638953246	0.0366282250227773	Inf	0.793269230769231	12.6923076923077	0.0806451612903226	Inf	0	1	0	1	21	20
TCGA-BR-A4J1-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	81	1	0	3	3	77	3157	0	6	6	12	753	1	5	1	7	747	8	4	19	31	861	4	5	18	27	796	0	1	3	4	95	0.0493827160493827	0.148148148148148	0.119346733668342	1.24132553606238	0.0421052631578947	2	0	2	4	116	0.0493827160493827	0.129032258064516	0.13472706155633	0.957730812013348	0.0344827586206897	0.0864197530864197	7	42	211	1446	0.438652700933421	1.14205917383468	0.502040217111423	Inf	1.12186865267434	1.3088467614534	0.465144702230175	1.37032254132397	1.06122710388113	0.519027007295741	1.07076892418379	0.314685314685315	74	70
TCGA-BR-A4J2-01A-21D-A25D-08	0	0	0	0	80	0	2	3	5	74	3034	2	2	3	7	657	0	6	1	7	693	1	3	27	31	870	6	3	20	29	814	0	0	0	0	103	0	0	0.126535626535627	0	0	0	2	1	3	109	0.0375	0.0967741935483871	0.125287356321839	0.77241787511098	0.0275229357798165	0.0125	1	53	212	1472	0.999236488776682	0.131082951866917	0.00653843635472012	Inf	0.147099930118798	0	1	0	0.169008430349257	0.998090103569075	0.151028113882699	1	79	73
TCGA-BR-A4J4-01A-12D-A25D-08	0	0	0	0	94	1	0	0	0	93	3813	0	3	2	5	855	0	4	1	5	903	1	8	30	39	1054	4	9	31	44	1001	1	2	2	5	126	0.0531914893617021	0.113636363636364	0.125874125874126	0.902777777777778	0.0396825396825397	0	1	1	2	108	0.0212765957446809	0.0512820512820513	0.10246679316888	0.500474833808167	0.0185185185185185	0.0425531914893617	4	62	234	1821	0.949848244975348	0.502195528119689	0.165311672358578	Inf	0.532245532245532	1.75641025641026	0.454611030050282	1.94478742691677	0.431904161412358	0.974571623216078	0.402643121608053	0.559440559440559	90	89
TCGA-BR-A4J5-01A-21D-A25D-08	0	0	0	0	100	0	0	1	1	98	4018	3	2	3	8	949	3	8	7	18	958	3	8	25	36	1054	2	5	29	36	1057	0	2	0	2	122	0.02	0.0555555555555556	0.115421002838221	0.481329690346084	0.0163934426229508	0	1	1	2	133	0.02	0.0555555555555556	0.126185958254269	0.440267335004177	0.0150375939849624	0.01	1	58	255	1856	0.999454554438776	0.12554804849951	0.00627658016738267	Inf	0.140312396144899	0	1	0	0.153304284676834	0.998977629067199	0.137391243441451	1	99	97
TCGA-BR-A4J6-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	39	0	2	0	2	37	1517	0	4	1	5	344	3	2	1	6	378	2	5	6	13	386	0	4	9	13	409	0	0	2	2	61	0.0512820512820513	0.153846153846154	0.149144254278729	1.03152585119798	0.0327868852459016	0	2	0	2	39	0.0512820512820513	0.153846153846154	0.101036269430052	1.52268244575937	0.0512820512820513	0.0512820512820513	2	15	100	695	0.65148252094316	0.926738997920719	0.149327286837449	Inf	0.935294117647059	0	1	0	1.06	0.58237838931402	1.06915945592497	0.428571428571429	37	35
TCGA-BR-A4J7-01A-31D-A25D-08	0	0	0	0	71	0	0	0	0	71	2911	0	2	0	2	597	1	7	2	10	725	1	7	27	35	795	0	5	19	24	794	0	1	0	1	100	0.0140845070422535	0.0416666666666667	0.125944584382872	0.330833333333333	0.01	0	0	0	0	75	0	0	0.0943396226415094	0	0	0	0	47	175	1414	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	71	71
TCGA-BR-A4J8-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	111	0	1	1	2	109	4469	3	9	6	18	1041	4	8	2	14	1088	0	6	28	34	1117	4	5	34	43	1223	0	1	3	4	174	0.036036036036036	0.0930232558139535	0.14227309893704	0.653835872761294	0.0229885057471264	0	0	3	3	137	0.027027027027027	0.0882352941176471	0.122649955237243	0.719407471017604	0.0218978102189781	0.0540540540540541	6	60	311	2029	0.885462167527674	0.652512382179631	0.272163567737107	Inf	0.684010523238819	0	1	0	0.728140234415517	0.847202928009499	0.699105113166587	0.00466200466200466	105	103
TCGA-BR-A4PD-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	170	0	1	5	6	164	6724	9	24	16	49	1576	0	16	29	45	1597	4	3	18	25	1788	5	10	30	45	1763	3	2	5	10	238	0.0588235294117647	0.222222222222222	0.134997163925128	1.64612511671335	0.0420168067226891	2	0	6	8	239	0.0470588235294118	0.32	0.133668903803132	2.39397489539749	0.0334728033472803	0.0941176470588235	16	41	477	3074	0.00302236769055671	2.51399707969344	1.44844917837457	Inf	2.08966861598441	4.1358024691358	0.00351297641473955	8.04650496610773	1.70601851851852	0.0521272546654096	1.91559445212405	0.092215182731215	154	148
TCGA-BR-A4PE-01A-31D-A25D-08	0	0	0	0	261	1	4	8	12	246	10086	5	11	14	30	2316	4	8	14	26	2231	6	17	81	104	2848	5	20	61	86	2691	2	1	5	8	324	0.0306513409961686	0.0930232558139535	0.120401337792642	0.772609819121447	0.0246913580246914	1	3	5	9	327	0.0344827586206897	0.0865384615384615	0.114817415730337	0.753705010585745	0.0275229357798165	0.0498084291187739	13	140	651	4888	0.919009533963121	0.69725234149473	0.401333872102054	Inf	0.722940072086182	2.32048596564726	0.130963200120123	2.81491275062574	0.599186516951169	0.975224286840284	0.568868655989428	0.032361238735471	248	233
TCGA-BR-A4PF-01A-11D-A25D-08	0	0	1	1	124	1	2	4	6	117	4797	5	9	2	16	1171	3	5	4	12	1191	5	12	35	52	1203	4	9	24	37	1232	2	3	2	7	179	0.0564516129032258	0.189189189189189	0.145292207792208	1.30212894458705	0.0391061452513966	1	4	3	8	173	0.0645161290322581	0.153846153846154	0.14380714879468	1.06980880391285	0.046242774566474	0.0645161290322581	8	60	352	2083	0.783608836670117	0.789084669707736	0.374183050475253	Inf	0.813836898395722	2.30587121212121	0.130500505319866	2.95696506090687	0.58623844375963	0.940025055833642	0.548036741275102	0.681659170414793	116	109
TCGA-BR-A4QI-01A-12D-A25D-08	0	0	0	0	147	0	1	4	5	142	5822	5	10	4	19	1327	9	7	7	23	1402	4	11	39	54	1521	4	8	34	46	1572	1	1	5	7	200	0.0476190476190476	0.152173913043478	0.127226463104326	1.19608695652174	0.035	1	2	4	7	189	0.0476190476190476	0.12962962962963	0.124260355029586	1.04320987654321	0.037037037037037	0.0748299319727891	11	70	389	2704	0.44471726123882	1.0923226266607	0.583855027767075	Inf	1.07978672760164	1.98778920308483	0.267056610464598	2.31616197557806	0.980279607000739	0.579414565002517	0.977512089316881	0.0183066361556064	136	131
TCGA-BR-A4QL-01A-31D-A25D-08	0	0	0	0	2158	2	88	347	435	1720	70520	22	116	25	163	15488	16	105	18	139	15469	15	66	622	703	19576	9	67	639	715	19987	2	8	6	16	2203	0.00741427247451344	0.0223776223776224	0.110221644068645	0.203023848598066	0.00726282342260554	3	8	10	21	2163	0.00973123262279889	0.0298719772403983	0.110492439722109	0.270353132897844	0.00970873786407767	0.00973123262279889	21	1264	4366	35197	1	0.133938221743365	0.0893857547832321	Inf	0.148088608294372	1.88783592914949	0.117803874039491	2.12142861401643	0.114976843266202	1	0.10360563849238	0.00899632254826935	2137	1699
TCGA-BR-A4QM-01A-12D-A25D-08	0	0	0	0	130	0	2	2	4	126	5166	3	8	6	17	1173	4	14	5	23	1204	1	13	33	47	1349	2	5	32	39	1440	0	0	4	4	165	0.0307692307692308	0.102564102564103	0.114583333333333	0.895104895104895	0.0242424242424242	1	3	0	4	157	0.0307692307692308	0.0851063829787234	0.116382505559674	0.73126439897005	0.0254777070063694	0.0384615384615385	5	63	322	2467	0.904129397905076	0.608143594298985	0.230685348407876	Inf	0.636874314943369	2.8871635610766	0.308557705657515	3.82781972954867	0.533014811275681	0.950013670781323	0.502487554594464	0.282051282051282	125	121
TCGA-CD-5798-01A-11D-1600-08	0	1	0	1	108	0	0	3	3	105	4305	6	4	5	15	1025	3	4	7	14	1057	3	2	25	30	1105	2	11	33	46	1118	2	2	3	7	162	0.0648148148148148	0.152173913043478	0.144901610017889	1.05018786902845	0.0432098765432099	0	1	3	4	134	0.037037037037037	0.133333333333333	0.121266968325792	1.09950248756219	0.0298507462686567	0.0740740740740741	8	55	296	1927	0.614044613495802	0.946942422943751	0.44686113219062	Inf	0.953667953667954	3.00405405405405	0.135488487337141	4.33592386595166	0.776910531220876	0.80043714816371	0.751255217352506	0.18266253869969	100	97
TCGA-CD-5799-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	45	0	1	0	1	44	1804	2	0	1	3	380	3	3	0	6	393	1	7	15	23	544	2	0	10	12	487	0	0	0	0	48	0	0	0.0985626283367557	0	0	0	1	0	1	78	0.0222222222222222	0.0434782608695652	0.143382352941176	0.303232998885173	0.0128205128205128	0	0	28	126	905	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	45	44
TCGA-CD-5800-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	196	0	5	1	6	190	7790	2	8	2	12	1772	2	9	3	14	1979	8	7	64	79	2043	11	9	65	85	1996	2	0	11	13	300	0.0663265306122449	0.152941176470588	0.150300601202405	1.01756862745098	0.0433333333333333	2	1	10	13	257	0.0663265306122449	0.164556962025316	0.125795398923152	1.3081318031818	0.0505836575875486	0.127551020408163	25	123	557	3482	0.170122735938929	1.27051931284599	0.847373194428948	Inf	1.22488961133485	1.52659926296891	0.262771956833049	1.66676907158049	1.18045175566782	0.244608173944012	1.21546125242367	4.28492073358826e-06	171	165
TCGA-CD-5801-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	421	0	2	3	5	416	17056	18	34	70	122	4220	18	45	57	120	4422	3	15	57	75	4149	2	13	84	99	4265	0	4	16	20	667	0.0475059382422803	0.202020202020202	0.156389214536929	1.29177835324762	0.0299850074962519	1	0	9	10	620	0.0237529691211401	0.133333333333333	0.14943359845746	0.892258064516129	0.0161290322580645	0.0617577197149644	26	120	1287	7127	0.232123536754247	1.1997813638562	0.808997522117041	Inf	1.16424519164245	1.30753690753691	0.56413055488159	1.38435890728114	1.15916392512137	0.244462113672967	1.19341635429771	1.23131235128191e-10	395	390
TCGA-CD-5802-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	60	0	1	6	7	52	2132	1	3	0	4	514	0	2	0	2	474	3	1	19	23	551	2	5	16	23	593	1	1	6	8	69	0.133333333333333	0.347826086956522	0.116357504215852	2.9892879647133	0.115942028985507	1	0	3	4	74	0.0666666666666667	0.173913043478261	0.134301270417423	1.29494712103408	0.0540540540540541	0.183333333333333	11	29	143	1001	0.00988719603903467	2.65218117643748	1.3298929720193	Inf	2.2	3.2	0.122372738214265	4.65672308095353	2.05714285714286	0.0280007869662341	2.42063518940695	0.0122781377997423	49	41
TCGA-CD-5803-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	41	0	0	1	1	39	1599	1	2	1	4	399	2	4	0	6	372	1	3	9	13	414	3	3	10	16	414	0	1	1	2	48	0.0487804878048781	0.125	0.115942028985507	1.078125	0.0416666666666667	1	0	1	2	56	0.0487804878048781	0.153846153846154	0.135265700483092	1.13736263736264	0.0357142857142857	0.0731707317073171	3	20	104	724	0.568723844366259	1.04418546427811	0.259642440510034	Inf	1.03846153846154	1.99038461538462	0.417641214933817	2.31732722796733	0.838056680161943	0.710161589767936	0.819184386960653	1	38	36
TCGA-CD-5804-01A-12D-2053-08	0	0	0	0	90	0	0	6	6	84	3444	1	6	4	11	819	2	6	0	8	822	3	6	24	33	895	2	4	26	32	908	1	1	1	3	131	0.0333333333333333	0.09375	0.144273127753304	0.649809160305343	0.0229007633587786	2	1	3	6	122	0.0666666666666667	0.181818181818182	0.136312849162011	1.33383010432191	0.0491803278688525	0.0777777777777778	7	48	253	1550	0.668367791350103	0.893521783625433	0.395965849903293	Inf	0.90700682716493	4.27588932806324	0.0225238318911172	9.17018273387255	0.570118577075099	0.932390157722722	0.532885140636134	1	83	77
TCGA-CD-5813-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	179	0	5	2	7	171	7011	8	9	7	24	1713	7	15	6	28	1739	8	11	44	63	1730	7	8	41	56	1829	2	3	2	7	260	0.0391061452513966	0.125	0.14215418261345	0.879326923076923	0.0269230769230769	4	3	5	12	242	0.0670391061452514	0.19047619047619	0.139884393063584	1.36166863439591	0.0495867768595041	0.0726256983240224	13	87	502	3057	0.667195050889148	0.909942423496021	0.516226917436442	Inf	0.921653386454183	2.83585657370518	0.0128321232249588	4.05765678902209	0.583852823998125	0.963488599694983	0.546581668119753	1	166	158
TCGA-CD-8524-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	210	0	2	3	5	204	8364	2	7	3	12	1942	4	13	9	26	1928	7	13	59	79	2257	14	21	52	87	2237	2	2	1	5	274	0.0238095238095238	0.0574712643678161	0.122485471613768	0.469208826243812	0.0182481751824818	0	2	4	6	270	0.0285714285714286	0.0759493670886076	0.119627824545857	0.634880450070323	0.0222222222222222	0.0333333333333333	7	125	544	3950	0.997136401051916	0.406673833840286	0.186457199826218	Inf	0.438084893048128	0.786764705882353	0.741084052234316	0.76436018970801	0.372118441971383	0.99813767121297	0.342554796983074	0.361455108359133	203	197
TCGA-CD-8525-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	127	0	0	7	7	120	4920	0	10	5	15	1134	2	8	5	15	1158	12	8	23	43	1292	13	10	24	47	1336	2	0	4	6	148	0.047244094488189	0.127659574468085	0.110778443113772	1.15238642898217	0.0405405405405405	7	1	3	11	152	0.0866141732283465	0.255813953488372	0.117647058823529	2.17441860465116	0.0723684210526316	0.125984251968504	16	56	300	2328	0.00741793327996729	2.21628183546599	1.29645464213966	Inf	1.94666666666667	3.1536	0.00131223864084336	4.36133914606895	1.30468085106383	0.290219207793053	1.35782255140411	0.731857331096761	111	104
TCGA-CD-8526-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	78	0	2	5	7	70	2870	1	2	1	4	623	0	1	0	1	659	9	7	13	29	827	12	8	16	36	761	2	0	0	2	91	0.0256410256410256	0.0555555555555556	0.11957950065703	0.464590964590965	0.021978021978022	0	1	1	2	77	0.0256410256410256	0.0689655172413793	0.0931076178960097	0.740707568293775	0.025974025974026	0.0384615384615385	3	47	168	1420	0.908734730270199	0.539675812714068	0.140858876187659	Inf	0.567142857142857	0.900226757369615	0.668202057230038	0.889771637855424	0.325944170771757	0.960480592843896	0.30201298197918	1	75	67
TCGA-CD-8527-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	300	2	6	14	20	277	11357	8	15	6	29	2539	7	19	9	35	2546	11	21	73	105	3118	6	16	86	108	3154	1	1	4	6	383	0.02	0.0555555555555556	0.12143310082435	0.457499274731651	0.0156657963446475	3	6	2	11	349	0.0366666666666667	0.104761904761905	0.111930724823605	0.935953063173694	0.0315186246418338	0.0333333333333333	10	166	732	5540	0.99743967198371	0.455962768516487	0.242281052097462	Inf	0.486835568802782	2.01607200257152	0.12884924838622	2.3282134853147	0.323332302299206	0.999873374712761	0.296831958949655	0.707985303535915	290	267
TCGA-CD-8528-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	152	1	0	2	2	149	6109	2	6	4	12	1317	3	8	3	14	1390	6	12	32	50	1737	10	7	56	73	1665	0	0	0	0	182	0	0	0.109309309309309	0	0	1	2	0	3	182	0.0197368421052632	0.06	0.104778353483017	0.572637362637363	0.0164835164835165	0.00657894736842105	1	103	364	3038	0.999990965889465	0.0810548190575654	0.00407867212673538	Inf	0.0898668639053254	0.584134615384615	0.836526565560187	0.556486515746669	0	1	0	1	151	148
TCGA-CD-8529-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	512	2	0	17	17	490	20090	21	18	17	56	4755	23	22	16	61	4905	55	40	95	190	5163	66	49	68	183	5267	18	8	12	38	709	0.07421875	0.207650273224044	0.134611733434593	1.54258672647537	0.0535966149506347	17	7	14	38	698	0.07421875	0.2	0.135192717412357	1.47936962750716	0.0544412607449857	0.119140625	61	223	1407	9023	0.00018367212847526	1.7540973501397	1.35651904867835	Inf	1.59221498143087	2.14423749023478	8.14405683887234e-06	2.60941991512939	1.18243140127583	0.210004270325242	1.2170185182669	0.185367176741715	451	429
TCGA-CD-8530-01A-11D-2340-08	0	2	0	2	128	2	0	1	1	124	5084	4	8	9	21	1169	1	7	6	14	1261	9	8	22	39	1334	12	14	24	50	1320	4	3	4	11	178	0.0859375	0.22	0.134848484848485	1.6314606741573	0.0617977528089888	0	0	3	3	156	0.0234375	0.0769230769230769	0.116941529235382	0.657790927021696	0.0192307692307692	0.0859375	11	56	334	2320	0.221997829866083	1.36423745872129	0.721447632513549	Inf	1.30458486013049	1.51354433989165	0.269553944642034	1.63401262432917	1.20919031502213	0.36029966975914	1.24662409181628	0.440071192473938	117	113
TCGA-CD-8531-01A-11D-2340-08	1	0	0	1	299	2	2	10	12	284	11644	13	18	13	44	2720	8	25	11	44	2729	18	14	66	98	3079	15	15	68	98	3116	0	1	5	6	366	0.020066889632107	0.0612244897959184	0.117458279845956	0.52124456339913	0.0163934426229508	2	0	2	4	375	0.0133779264214047	0.0408163265306122	0.12179278986684	0.33512925170068	0.0106666666666667	0.0301003344481605	9	158	741	5454	0.998579915273137	0.419299825275514	0.214321157364437	Inf	0.450556377124294	0.50668629615998	0.917889431456547	0.474903047742346	0.436733337361774	0.997279652097739	0.405727964082193	0.0697785186949274	290	275
TCGA-CD-8532-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	67	1	2	2	4	62	2542	1	1	0	2	591	4	9	2	15	594	4	3	14	21	682	7	4	13	24	675	0	0	4	4	86	0.0597014925373134	0.166666666666667	0.127407407407407	1.30813953488372	0.0465116279069767	0	0	1	1	84	0.0149253731343284	0.0476190476190476	0.12316715542522	0.386621315192744	0.0119047619047619	0.0746268656716418	5	33	170	1187	0.528906574993534	1.05790249026259	0.3882614499245	Inf	1.05030959752322	0	1	0	1.47821350762527	0.249088573346875	1.58626721581161	0.00793650793650794	62	57
TCGA-CD-8533-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	133	0	3	5	8	125	5125	1	8	0	9	1159	3	3	2	8	1225	3	2	47	52	1347	3	8	45	56	1394	2	1	2	5	181	0.037593984962406	0.0892857142857143	0.129842180774749	0.687647987371744	0.0276243093922652	0	0	4	4	162	0.0300751879699248	0.0769230769230769	0.120267260579065	0.63960113960114	0.0246913580246914	0.0601503759398496	8	90	343	2398	0.932255201290406	0.621533994797092	0.298573694618341	Inf	0.652347236270602	2.66375121477162	0.167675118074412	3.4929705923331	0.521168715933578	0.978006140161993	0.487859132830247	0.153434800493624	125	117
TCGA-CD-8534-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	89	1	2	1	3	85	3485	0	5	0	5	778	2	5	4	11	849	4	5	28	37	940	6	2	24	32	918	1	0	2	3	120	0.0337078651685393	0.09375	0.130718954248366	0.7171875	0.025	0	1	8	9	112	0.101123595505618	0.243243243243243	0.119148936170213	2.04150579150579	0.0803571428571429	0.123595505617978	11	51	232	1626	0.151313686612598	1.51128358930263	0.79244537202755	Inf	1.42088431590656	0.800862068965517	0.73702620075558	0.778830788392785	1.54011936339523	0.112533415585603	1.66818072895949	0.000644193604215142	78	74
TCGA-CD-8535-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	329	2	5	6	11	316	12956	13	23	35	71	3187	13	26	33	72	3212	10	11	66	87	3320	6	12	68	86	3237	1	3	9	13	438	0.0395136778115502	0.151162790697674	0.13531047265987	1.11715514495062	0.0296803652968037	2	2	9	13	480	0.0395136778115502	0.149425287356322	0.144578313253012	1.03352490421456	0.0270833333333333	0.0638297872340425	21	129	918	5639	0.53659835818979	1	0.647515934270738	Inf	0.999978213507625	1.33925653594771	0.393138027220922	1.41745769485416	0.959467369037167	0.61274949932765	0.953177538561088	4.46034825367472e-05	308	295
TCGA-CD-8536-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	1068	3	42	169	211	854	35014	8	66	8	82	7546	8	65	5	78	7721	3	47	320	370	9874	12	44	268	324	9873	1	7	1	9	1060	0.00842696629213483	0.0277777777777778	0.107363516661602	0.25872641509434	0.00849056603773585	0	6	2	8	1067	0.00749063670411985	0.0216216216216216	0.108061575855783	0.200086121735606	0.00749765698219306	0.00374531835205993	4	599	2127	17620	1	0.0553215906975755	0.0187955495411605	Inf	0.0615851942294483	0.618931202005955	0.819065861246953	0.591725055003003	0.0473671838269864	1	0.0424646037015966	0.601173020527859	1064	850
TCGA-CD-A486-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	119	0	3	4	7	112	4592	0	7	2	9	1045	3	6	2	11	1097	3	8	36	47	1207	3	9	33	45	1243	0	1	3	4	135	0.0336134453781513	0.0888888888888889	0.108608205953339	0.81843621399177	0.0296296296296296	1	2	1	4	133	0.0336134453781513	0.0851063829787234	0.110190555095278	0.772356422972324	0.0300751879699248	0.0420168067226891	5	70	268	2182	0.921801413641594	0.581659321687504	0.221022051039934	Inf	0.609452736318408	1.52363184079602	0.501809140244315	1.62795906733578	0.529958901146442	0.950764411555568	0.50114032705375	0.282051282051282	114	107
TCGA-CD-A487-01A-21D-A24D-08	0	1	0	1	221	1	6	2	8	212	8692	4	16	21	41	2206	5	11	22	38	2040	11	14	48	73	2212	6	6	48	60	2234	4	2	6	12	306	0.0542986425339367	0.2	0.136974037600716	1.46013071895425	0.0392156862745098	3	2	7	12	326	0.0542986425339367	0.164383561643836	0.147377938517179	1.1153878477183	0.0368098159509202	0.0904977375565611	20	93	632	3814	0.180120124908845	1.29772643720546	0.821295016686417	Inf	1.24509913744819	2.89668652271035	0.00628577852741765	4.22262268988431	0.952630537974684	0.619374466506942	0.945212741572189	0.142453803288567	201	192
TCGA-CD-A489-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	92	0	1	2	3	89	3649	4	7	4	15	908	3	8	4	15	907	1	6	26	33	918	3	5	18	26	916	0	1	2	3	124	0.0326086956521739	0.115384615384615	0.135371179039301	0.852357320099256	0.0241935483870968	0	0	5	5	127	0.0543478260869565	0.151515151515152	0.138344226579521	1.09520400858984	0.0393700787401575	0.0760869565217391	7	41	251	1583	0.493704039305279	1.07674292913749	0.473538865558258	Inf	1.06557104913679	0	1	0	1.16244114451286	0.400945110595587	1.19303607533177	0.0013986013986014	85	82
TCGA-CD-A48A-01A-12D-A24D-08	0	0	1	1	272	1	2	4	6	265	10865	10	25	20	55	2582	8	20	29	57	2665	4	13	55	72	2762	9	14	58	81	2856	2	2	8	12	398	0.0441176470588235	0.148148148148148	0.139355742296919	1.06309324399777	0.0301507537688442	2	3	4	9	371	0.0330882352941176	0.125	0.134322954380883	0.930592991913747	0.0242587601078167	0.0588235294117647	16	110	769	4849	0.66496624623172	0.917170525724658	0.55525547555073	Inf	0.927694181270254	2.24787436230869	0.0910631708825936	2.80176723699181	0.775815045398575	0.861606158828645	0.749213903966861	0.024687945222957	256	249
TCGA-CD-A48C-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	245	0	0	3	3	242	9922	13	13	23	49	2387	8	18	22	48	2451	12	19	48	79	2534	6	12	48	66	2550	3	3	6	12	350	0.0489795918367347	0.181818181818182	0.137254901960784	1.32467532467532	0.0342857142857143	1	3	6	10	322	0.0408163265306122	0.126582278481013	0.12707182320442	0.996147495872317	0.031055900621118	0.0653061224489796	16	98	672	4412	0.441456127395763	1.07191894145421	0.646170576337961	Inf	1.06182121971596	1.68121693121693	0.207998201999271	1.87550378084657	0.945684523809524	0.627643459421182	0.937926447871077	0.0267518008090662	229	226
TCGA-CD-A4MG-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	3278	5	115	425	540	2732	112012	24	267	39	330	24860	18	270	47	335	25032	16	197	825	1038	30829	20	199	810	1029	31291	1	10	12	23	3515	0.00701647345942648	0.0223517978620019	0.112332619603081	0.19897869328589	0.00654338549075391	2	8	12	22	3504	0.00671140939597315	0.0211946050096339	0.113659216971034	0.186475022215184	0.00627853881278539	0.00823672971323978	27	1644	7019	55101	1	0.12892966680445	0.090704009085633	Inf	0.14300246343408	0.73752196419243	0.788981468580775	0.713663911167879	0.129912125802703	1	0.116951751340145	1.65061334890766e-06	3251	2705
TCGA-CD-A4MH-01A-11D-A25D-08	0	1	0	1	105	1	1	5	6	98	4018	3	4	2	9	964	2	6	1	9	916	1	8	31	40	1068	4	5	31	40	1070	1	0	3	4	122	0.0380952380952381	0.1	0.114018691588785	0.877049180327869	0.0327868852459016	0	2	3	5	137	0.0476190476190476	0.125	0.128277153558052	0.974452554744526	0.0364963503649635	0.0666666666666667	7	60	259	1879	0.716472078628627	0.846469387723847	0.378702072410908	Inf	0.862444534086325	1.65096525096525	0.476567720896429	1.8130781276645	0.798854153692863	0.776324890988409	0.777384419241714	0.0497737556561086	98	91
TCGA-CD-A4MI-01A-21D-A25D-08	0	0	0	0	1276	0	46	179	225	1049	43009	8	94	12	114	9570	7	78	13	98	9602	8	79	319	406	11709	4	82	345	431	12128	0	4	2	6	1389	0.00470219435736677	0.0139211136890951	0.114528364116095	0.121551667977931	0.00431965442764579	2	3	4	9	1373	0.00705329153605016	0.0221674876847291	0.117260227175677	0.189045239111794	0.00655498907501821	0.00626959247648903	8	668	2762	21075	1	0.0913851964985408	0.0452660523147041	Inf	0.102134205125349	1.43839005551533	0.413224064644171	1.5260280224187	0.0779850030098671	1	0.0695806060733097	0.214759287023155	1268	1041
TCGA-CD-A4MJ-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	804	3	42	142	184	617	25297	6	55	8	69	5498	4	59	14	77	5643	7	37	192	236	6981	3	37	195	235	7175	0	2	3	5	763	0.00621890547263682	0.0212765957446809	0.106341463414634	0.200078079250439	0.00655307994757536	0	2	2	4	768	0.00497512437810945	0.0169491525423729	0.110012892135797	0.154065148305085	0.00520833333333333	0.00621890547263682	5	392	1531	12625	0.999999999999993	0.105189015270971	0.0411741794683983	Inf	0.116451439354927	0	1	0	0.119460520475209	0.999999999999979	0.107942628476999	0.0294117647058824	799	612
TCGA-CG-4300-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	130	1	1	5	6	123	5043	1	6	8	15	1221	4	11	6	21	1265	5	9	32	46	1277	1	6	34	41	1280	1	1	1	3	164	0.0230769230769231	0.0731707317073171	0.128125	0.571088637715645	0.0182926829268293	1	1	2	4	153	0.0307692307692308	0.0869565217391304	0.119812059514487	0.725774367718102	0.0261437908496732	0.0384615384615385	5	67	317	2240	0.951834563518029	0.527434950989277	0.200407720239225	Inf	0.56015597616544	2.68874868559411	0.165182702712795	3.5301538819452	0.366647548035561	0.991006267184599	0.336581535471841	1	125	118
TCGA-CG-4301-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	63	0	0	1	1	62	2542	1	4	2	7	606	5	2	1	8	599	4	1	20	25	696	5	5	12	22	641	3	2	1	6	73	0.0952380952380952	0.272727272727273	0.113884555382215	2.3947696139477	0.0821917808219178	2	1	1	4	88	0.0634920634920635	0.16	0.126436781609195	1.26545454545455	0.0454545454545455	0.111111111111111	7	34	161	1176	0.224971747098572	1.50331754437365	0.6507910045435	Inf	1.41781548250265	4.61352657004831	0.00223945330298504	9.10242392261021	0.519021739130435	0.910440264535013	0.487154148006094	0.34984520123839	56	55
TCGA-CG-4304-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	94	0	3	5	8	84	3444	1	3	4	8	802	3	3	4	10	789	6	8	18	32	948	6	3	25	34	905	3	0	1	4	106	0.0425531914893617	0.117647058823529	0.117127071823204	1.00443951165372	0.0377358490566038	2	1	4	7	123	0.074468085106383	0.21875	0.129746835443038	1.6859756097561	0.0569105691056911	0.106382978723404	10	45	229	1624	0.141008626050059	1.57548596301197	0.796039594284568	Inf	1.47121873759428	3.37154294032023	0.0111955245031588	5.05830910684666	0.940895704275414	0.628191676653915	0.933141904797077	1	84	74
TCGA-CG-4305-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	1469	3	52	225	277	1189	48749	13	122	19	154	11082	15	92	27	134	11378	9	63	370	442	13128	15	76	368	459	13161	2	8	7	17	1599	0.011572498298162	0.037037037037037	0.121495327102804	0.304843304843305	0.0106316447779862	1	3	8	12	1459	0.00816882232811436	0.0271493212669683	0.111136502132846	0.244288066890171	0.00822481151473612	0.0122532334921715	18	744	3058	23231	1	0.183799629805227	0.118059130756177	Inf	0.203073904512753	1.07459941137999	0.54043191750278	1.08528388907998	0.174731611606502	1	0.157615390079976	0.00138893989677969	1451	1171
TCGA-CG-4306-01A-01D-1158-08	0	0	1	1	1329	5	66	213	279	1044	42804	8	52	11	71	9319	14	78	14	106	9592	4	45	375	424	12016	7	49	387	443	11877	2	2	7	11	1341	0.00827689992475546	0.0248306997742664	0.112907299823188	0.219921119477227	0.00820283370618941	0	5	6	11	1339	0.00827689992475546	0.0259433962264151	0.111434753661784	0.232812433948173	0.0082150858849888	0.0112866817155756	15	758	2680	21213	1	0.15664122643023	0.0959992108867126	Inf	0.173000617867969	1.62096336499322	0.354504892263394	1.75889986762879	0.15209826850002	1	0.137387121825481	0.00106222996091805	1314	1029
TCGA-CG-4436-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	207	0	1	4	5	201	8241	4	13	14	31	2020	8	10	23	41	2109	8	6	54	68	2027	13	8	40	61	2085	5	1	4	10	299	0.0483091787439614	0.163934426229508	0.143405275779377	1.14315477822249	0.0334448160535117	2	0	1	3	299	0.0144927536231884	0.0441176470588235	0.147508633448446	0.29908518591383	0.0100334448160535	0.0579710144927536	12	103	598	3514	0.919837320652579	0.684667565415759	0.381760856898165	Inf	0.717522175367166	2.29208472686734	0.0251144680835255	2.93705706184066	0.365758201095851	0.998608767044414	0.330184641397304	0.695097590523624	195	189
TCGA-CG-4437-01A-01D-1800-08	0	0	0	0	569	2	1	21	22	543	22263	26	18	27	71	5146	30	38	14	82	5454	62	39	107	208	5784	49	45	88	182	5879	12	9	6	27	812	0.0474516695957821	0.148351648351648	0.138118727674775	1.07408785795485	0.0332512315270936	18	4	10	32	764	0.0562390158172232	0.153846153846154	0.132088520055325	1.16472009665727	0.0418848167539267	0.0808435852372583	46	260	1576	10087	0.244282777838769	1.13232984113131	0.850673906692145	Inf	1.11247553166783	2.00010289477295	0.000136108921891611	2.3702782202261	0.607210724977222	0.991619414390781	0.572124465513892	0.0137231201037172	523	497
TCGA-CG-4438-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	151	0	1	3	4	147	6027	4	7	7	18	1402	1	9	8	18	1483	20	8	34	62	1565	9	11	29	49	1577	1	2	5	8	214	0.0529801324503311	0.163265306122449	0.13570069752695	1.20312798016403	0.0373831775700935	9	1	5	15	199	0.0993377483443709	0.241935483870968	0.127156549520767	1.90265845355811	0.0753768844221105	0.132450331125828	20	72	413	2729	0.0169990026168251	1.83502731487469	1.1452521932274	Inf	1.65385830087378	2.6233614427653	0.0030139417991823	3.47581688620135	1.20757907682847	0.315346054530774	1.24664475519108	1	131	127
TCGA-CG-4440-01A-01D-1158-08	0	0	1	1	141	2	2	4	6	132	5412	5	6	7	18	1246	2	6	11	19	1333	6	8	36	50	1436	5	9	31	45	1397	2	1	6	9	196	0.0638297872340425	0.2	0.140300644237652	1.42551020408163	0.0459183673469388	3	3	5	11	197	0.0780141843971631	0.22	0.137186629526462	1.60365482233503	0.0558375634517767	0.113475177304965	16	62	393	2440	0.0717626693369227	1.60192274144605	0.94433149633629	Inf	1.47869772297253	3.27665972704141	0.0117116401735313	5.16919587997887	1.18350993125973	0.326421265073258	1.21945218710572	0.105340267965407	125	116
TCGA-CG-4441-01A-01D-1800-08	0	0	0	0	123	0	3	2	5	118	4838	0	8	9	17	1120	3	4	8	15	1214	4	8	32	44	1236	3	4	35	42	1268	1	0	1	2	177	0.016260162601626	0.0476190476190476	0.139589905362776	0.341135324186172	0.0112994350282486	2	2	1	5	160	0.040650406504065	0.113636363636364	0.129449838187702	0.877840909090909	0.03125	0.040650406504065	5	69	337	2167	0.976490882349501	0.466068847411283	0.177285715585757	Inf	0.502045071778009	3.18440016956337	0.0566548653288374	4.81804557145399	0.221799016785509	0.999227237770295	0.197924790801696	1	118	113
TCGA-CG-4442-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	1635	3	64	272	336	1294	53054	11	154	10	175	12019	13	177	22	212	12063	4	77	407	488	14468	8	56	355	419	14504	1	3	8	12	1695	0.0073394495412844	0.0286396181384248	0.116864313292885	0.245067269309566	0.00707964601769911	0	7	8	15	1627	0.00917431192660551	0.0307377049180328	0.112455073265137	0.273333198988382	0.00921942224953903	0.0103975535168196	17	757	3322	25650	1	0.173402067416767	0.109823330655175	Inf	0.19155205217118	0.726771021473008	0.768124444310829	0.701939716731298	0.183123406985325	1	0.165608470177036	1.52888133281759e-05	1618	1277
TCGA-CG-4443-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	108	0	0	6	6	100	4100	5	9	1	15	920	4	8	1	13	970	10	5	19	34	1071	15	9	14	38	1139	6	1	3	10	143	0.0925925925925926	0.263157894736842	0.125548726953468	2.09606183290394	0.0699300699300699	2	0	2	4	133	0.037037037037037	0.117647058823529	0.124183006535948	0.947368421052632	0.0300751879699248	0.12037037037037	13	45	276	1934	0.0269215824678557	2.0235486202083	1.10816901944114	Inf	1.79472763618191	2.56231884057971	0.00947586943078312	3.29498280566887	1.21321914800176	0.398900805478421	1.25115721102647	0.449481760667654	95	87
TCGA-CG-4444-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	189	1	0	2	2	184	7544	5	12	23	40	1842	8	6	34	48	1896	8	6	34	48	1960	3	13	32	48	1846	1	1	2	4	268	0.0211640211640212	0.0833333333333333	0.145178764897075	0.574004975124378	0.0149253731343284	3	3	3	9	277	0.0476190476190476	0.1875	0.141326530612245	1.32671480144404	0.0324909747292419	0.0476190476190476	9	68	545	3261	0.789786352799951	0.791976366681605	0.395762597920006	Inf	0.816251638269987	2.5394495412844	0.0606819592820268	3.41755026433782	0.529051987767584	0.967773320197933	0.490521903902368	1	180	175
TCGA-CG-4449-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	114	0	4	6	10	104	4264	1	6	1	8	951	4	8	4	16	1062	8	1	33	42	1100	7	8	23	38	1151	2	2	4	8	190	0.0701754385964912	0.210526315789474	0.165073848827107	1.27534626038781	0.0421052631578947	5	0	2	7	137	0.0614035087719298	0.166666666666667	0.124545454545455	1.338199513382	0.0510948905109489	0.114035087719298	13	58	327	1924	0.230928095626048	1.31860763405349	0.733246633852599	Inf	1.26041262867726	3.21243628950051	0.00314458593620435	5.14259737716777	0.737549148099607	0.84044063504871	0.706150782895457	1	101	91
TCGA-CG-4455-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	47	0	1	2	3	44	1804	1	4	1	6	427	3	2	1	6	441	0	2	17	19	449	2	3	8	13	487	0	2	0	2	57	0.0425531914893617	0.153846153846154	0.117043121149897	1.31443994601889	0.0350877192982456	0	0	2	2	60	0.0425531914893617	0.105263157894737	0.133630289532294	0.787719298245614	0.0333333333333333	0.0425531914893617	2	25	117	819	0.867190598269494	0.560274912354085	0.0934229041860484	Inf	0.592592592592593	0	1	0	0.64	0.837284021276136	0.60895954970347	0.428571428571429	45	42
TCGA-CG-4460-01A-01D-1158-08	0	0	1	1	2166	2	53	212	265	1897	77777	13	86	17	116	16981	16	95	21	132	17737	12	59	752	823	21350	13	73	740	826	21709	1	8	8	17	2520	0.00784856879039704	0.0205811138014528	0.116080888110922	0.177299761712595	0.00674603174603175	3	4	2	9	2369	0.00415512465373961	0.0109356014580802	0.11096018735363	0.0985542807640406	0.00379907133811735	0.00646352723915051	14	1503	4889	38170	1	0.0727246402841413	0.0438321190208566	Inf	0.0812804982543919	1.40917160973614	0.31426614117559	1.48708518488675	0.0590303120700462	1	0.0526822839137428	0.116358663763353	2152	1883
TCGA-CG-4462-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	82	0	2	1	3	79	3239	0	4	4	8	770	1	2	4	7	733	3	4	21	28	867	1	2	33	36	869	0	0	1	1	91	0.0121951219512195	0.0277777777777778	0.104718066743383	0.265262515262515	0.010989010989011	1	2	0	3	116	0.0365853658536585	0.107142857142857	0.133794694348328	0.800800492610838	0.0258620689655172	0.024390243902439	2	56	207	1529	0.994015800010907	0.263923699608718	0.0454927626212274	Inf	0.289188738963851	2.09661835748792	0.399332061644713	2.4603421424294	0.155305063517624	0.9988612079978	0.139443974366447	1	80	77
TCGA-CG-4465-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	723	1	23	112	135	587	24067	8	61	14	83	5426	3	50	12	65	5395	10	35	169	214	6589	3	44	178	225	6657	0	3	4	7	747	0.00968188105117566	0.0311111111111111	0.112212708427219	0.277251227130745	0.00937081659973226	0	2	5	7	741	0.00968188105117566	0.0327102803738318	0.112460160874184	0.290861049100105	0.00944669365721997	0.012448132780083	9	351	1488	11758	0.999999999825247	0.202625583696071	0.104684426604126	Inf	0.222547043010753	0	1	0	0.23088454029934	0.999999999404126	0.21041872266631	0.000579710144927536	714	578
TCGA-CG-4466-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	231	0	2	7	9	222	9102	7	13	21	41	2252	3	16	33	52	2348	7	13	43	63	2356	14	14	38	66	2146	5	1	3	9	348	0.038961038961039	0.136363636363636	0.162162162162162	0.840909090909091	0.0258620689655172	2	6	1	9	362	0.038961038961039	0.142857142857143	0.15365025466893	0.929755327545383	0.0248618784530387	0.0476190476190476	11	91	710	3792	0.940167540356392	0.645652088464706	0.349395222967432	Inf	0.683816625241646	2.11361502347418	0.0373410847768546	2.6695899852934	0.313128151625804	0.999324601913095	0.277495583663298	0.470522803114572	220	211
TCGA-CG-4469-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	336	3	4	5	9	322	13202	7	25	43	75	3248	10	20	42	72	3302	10	12	65	87	3291	14	18	56	88	3361	3	7	2	12	472	0.0357142857142857	0.136363636363636	0.140434394525439	0.971013097072419	0.0254237288135593	2	0	6	8	484	0.0238095238095238	0.0919540229885057	0.147067760559101	0.625249358791678	0.0165289256198347	0.0386904761904762	13	132	956	5696	0.980334962839479	0.5868285502944	0.337849831941727	Inf	0.62383494445246	1.44961645746165	0.25710336865699	1.56780803477233	0.460043569971299	0.997343386679547	0.421854602255912	0.50060341606504	323	309
TCGA-CG-4474-01A-02D-1158-08	0	0	0	0	104	0	1	7	8	96	3936	0	5	1	6	823	4	4	4	12	928	3	4	32	39	1076	3	6	30	39	1109	2	1	2	5	137	0.0480769230769231	0.128205128205128	0.123534715960325	1.03780647576268	0.0364963503649635	1	0	2	3	118	0.0288461538461538	0.0769230769230769	0.109665427509294	0.701434159061278	0.0254237288135593	0.0673076923076923	7	61	255	1930	0.693640838781288	0.868610205171282	0.388787456538369	Inf	0.882064590542099	4.2843137254902	0.0246080817898116	7.55579003766512	0.5528146742568	0.939622994214052	0.52209429021154	1	97	89
TCGA-CG-4475-01A-01D-1158-08	0	1	1	2	63	0	0	5	5	57	2337	2	5	2	9	585	2	1	3	6	559	5	2	17	24	611	2	4	12	18	582	0	0	2	2	74	0.0317460317460317	0.111111111111111	0.127147766323024	0.873873873873874	0.027027027027027	2	0	1	3	82	0.0476190476190476	0.125	0.134206219312602	0.93140243902439	0.0365853658536585	0.0793650793650794	5	31	156	1037	0.519377093001232	1.07212371391537	0.39161164731253	Inf	1.06214387464387	2.18498168498168	0.232447479113588	2.6560183906005	0.791114058355438	0.750200436415958	0.76716378797076	1	58	52
TCGA-CG-4476-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	136	0	0	4	4	132	5412	7	4	2	13	1324	1	8	1	10	1331	10	15	25	50	1394	8	14	37	59	1363	2	1	10	13	180	0.0955882352941176	0.220338983050847	0.132061628760088	1.66845574387947	0.0722222222222222	4	3	0	7	182	0.0514705882352941	0.14	0.130559540889527	1.07230769230769	0.0384615384615385	0.117647058823529	16	64	362	2395	0.0585992421696464	1.65365274862304	0.975639419659342	Inf	1.5232044198895	2.53867403314917	0.0239085006106243	3.30594773894754	1.22839066120121	0.296905407758919	1.27219260595052	0.333213079597952	120	116
TCGA-CG-4477-01A-01D-1158-08	0	0	0	0	132	0	44	32	76	56	2296	1	3	1	5	567	3	1	2	6	586	4	4	15	23	607	5	5	12	22	536	2	1	1	4	80	0.0303030303030303	0.181818181818182	0.149253731343284	1.21818181818182	0.05	0	0	1	1	82	0.00757575757575758	0.0434782608695652	0.135090609555189	0.321845174973489	0.0121951219512195	0.0303030303030303	4	32	162	981	0.77000187304337	0.757107833283342	0.241882902124385	Inf	0.783950617283951	1.5679012345679	0.374139402921053	1.72916429470532	0.522633744855967	0.911009304229234	0.484679351329786	1	128	52
TCGA-CG-5716-01A-21D-1800-08	0	0	0	0	15	0	0	0	0	15	615	1	0	0	1	146	0	2	0	2	139	1	2	3	6	166	1	0	5	6	164	0	0	0	0	17	0	0	0.103658536585366	0	0	0	0	0	0	18	0	0	0.108433734939759	0	0	0	0	10	35	295	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	15	15
TCGA-CG-5717-01A-11D-1600-08	0	0	1	1	108	0	1	4	5	102	4182	4	7	2	13	1054	3	8	2	13	996	11	7	21	39	1068	14	4	19	37	1064	6	1	1	8	149	0.0740740740740741	0.216216216216216	0.140037593984962	1.54398693996009	0.0536912751677852	5	1	3	9	174	0.0833333333333333	0.230769230769231	0.162921348314607	1.41644562334218	0.0517241379310345	0.138888888888889	15	50	323	1809	0.0634021778569944	1.67971530067688	0.961720748952178	Inf	1.52321981424149	2.90427244582043	0.000601392552885689	4.39621370698027	0.660061919504644	0.874111327505447	0.622408518988731	0.0366365204494528	93	87
TCGA-CG-5718-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	102	1	2	2	4	97	3977	2	6	1	9	919	3	7	2	12	965	0	4	32	36	1045	5	10	25	40	1048	2	0	2	4	145	0.0392156862745098	0.1	0.138358778625954	0.722758620689655	0.0275862068965517	0	1	6	7	148	0.0686274509803922	0.194444444444444	0.141626794258373	1.37293543543544	0.0472972972972973	0.0980392156862745	10	52	293	1800	0.371352057249926	1.18129261594549	0.602844508274255	Inf	1.15215237256413	2.85733788395904	0.147568462291764	4.09180561846467	1.00257469612598	0.556393983239666	1.00299370166216	0.0299731228523797	92	87
TCGA-CG-5719-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	76	0	2	0	2	74	3034	4	2	0	6	747	0	3	0	3	675	5	1	24	30	802	6	2	27	35	810	3	1	2	6	103	0.0789473684210526	0.171428571428571	0.12716049382716	1.34812760055479	0.058252427184466	1	0	5	6	111	0.0789473684210526	0.2	0.138403990024938	1.44504504504504	0.0540540540540541	0.144736842105263	11	51	214	1398	0.201310996680239	1.40868959264873	0.737746825212339	Inf	1.33644859813084	2.73916737468139	0.0485173076360724	3.72806861091325	1.0339014110317	0.526839463834821	1.03927690968814	0.41364921254543	65	63
TCGA-CG-5720-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	84	0	1	1	2	82	3362	0	5	5	10	847	4	6	1	11	802	3	4	19	26	873	2	8	25	35	840	0	0	1	1	121	0.0119047619047619	0.0285714285714286	0.144047619047619	0.198347107438017	0.00826446280991736	2	0	1	3	112	0.0357142857142857	0.115384615384615	0.128293241695304	0.899381868131868	0.0267857142857143	0.0476190476190476	4	45	233	1480	0.913528421357056	0.564767795190254	0.183879460313778	Inf	0.600157659630376	2.94077253218884	0.140746386917539	4.22945849356754	0.334178696839641	0.986752297432529	0.302607097785432	1	80	78
TCGA-CG-5721-01A-11D-1600-08	0	0	4	4	4829	11	77	448	525	4288	175808	60	1052	42	1154	42041	88	1057	51	1196	42750	22	96	855	973	45577	26	106	833	965	45440	6	6	20	32	6072	0.00662663077241665	0.033160621761658	0.13362676056338	0.248158539665636	0.00527009222661397	0	4	10	14	5736	0.00289915096293228	0.0143884892086331	0.125852952146916	0.114327784634217	0.00244072524407252	0.00745495961896873	36	1700	11808	79209	1	0.142054909308062	0.105086624876046	Inf	0.159844961784871	0.963509908536585	0.603384647110234	0.95829391209973	0.136991930123685	1	0.121377883767878	4.26521857764681e-07	4793	4252
TCGA-CG-5722-01A-21D-1600-08	0	0	0	0	98	0	1	4	5	93	3813	1	4	2	7	819	2	4	2	8	995	4	6	30	40	949	2	6	30	38	1050	1	0	1	2	150	0.0204081632653061	0.0526315789473684	0.142857142857143	0.368421052631579	0.0133333333333333	0	0	4	4	106	0.0408163265306122	0.1	0.111696522655427	0.895283018867925	0.0377358490566038	0.0612244897959184	6	60	256	1743	0.862544190477708	0.680970994652567	0.283537627324194	Inf	0.709872159090909	1.30143229166667	0.561384807176436	1.36148080461833	0.650716145833333	0.895305524518113	0.619085853373471	0.0800865800865801	92	87
TCGA-CG-5723-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	2021	5	36	365	401	1615	66215	14	126	25	165	14786	16	173	38	227	14901	9	54	569	632	18047	8	74	509	591	18481	1	5	8	14	2120	0.00692726373082632	0.0236886632825719	0.114712407337265	0.206504804776043	0.00660377358490566	3	8	11	22	1956	0.0108857001484414	0.0348101265822785	0.108383664875048	0.321175027827392	0.0112474437627812	0.0113805047006432	23	1072	4076	32452	1	0.170824840076295	0.116178714475858	Inf	0.18823719198247	2.10864169023841	0.113263616737007	2.44958214083656	0.157952519932052	1	0.142848627008427	0.000288782575973636	1998	1592
TCGA-CG-5724-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	118	0	2	3	5	113	4633	3	11	10	24	1096	1	6	9	16	1220	5	1	28	34	1113	0	5	34	39	1204	0	2	2	4	184	0.0338983050847458	0.102564102564103	0.152823920265781	0.671125975473801	0.0217391304347826	2	0	2	4	139	0.0338983050847458	0.117647058823529	0.124887690925427	0.94202285230639	0.0287769784172662	0.0508474576271186	6	61	323	1994	0.917839455371904	0.607325832805644	0.253504674909687	Inf	0.642391756388337	2.86934984520124	0.146436771668595	4.11212602386537	0.462798362129232	0.979107188896449	0.425861439282903	0.608391608391609	112	107
TCGA-CG-5725-01A-11D-1600-08	0	1	0	1	104	0	30	33	63	41	1681	0	2	2	4	400	0	0	2	2	378	1	0	13	14	457	1	10	10	21	446	0	1	0	1	49	0.00961538461538462	0.0476190476190476	0.109865470852018	0.433430515063168	0.0204081632653061	0	0	3	3	59	0.0288461538461538	0.214285714285714	0.12910284463895	1.65980629539952	0.0508474576271186	0.0288461538461538	3	22	108	795	0.59171561762388	1.00378386497225	0.251394618576345	Inf	1.00333333333333	0	1	0	1.09057971014493	0.533998442833126	1.10408113231437	0.142857142857143	101	38
TCGA-CG-5726-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	1466	3	43	268	311	1152	47232	20	80	18	118	10491	25	95	12	132	10768	8	48	390	446	12896	9	66	381	456	13077	0	3	9	12	1546	0.00818553888130969	0.0263157894736842	0.11822283398333	0.222594811738272	0.00776196636481242	1	4	5	10	1472	0.00682128240109141	0.0224215246636771	0.114143920595533	0.19643205303178	0.00679347826086957	0.0102319236016371	15	773	3018	22955	1	0.147599695430472	0.0904783502927724	Inf	0.163820377229012	0.50623708728024	0.877523499555931	0.475387585863502	0.156270333038518	1	0.140671465912234	6.26804690625522e-05	1451	1137
TCGA-CG-5727-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	176	0	1	1	2	174	7134	4	9	2	15	1764	4	8	5	17	1697	7	13	57	77	1804	6	14	45	65	1869	3	2	3	8	233	0.0454545454545455	0.123076923076923	0.124665596575709	0.987256520303731	0.0343347639484979	4	3	3	10	260	0.0568181818181818	0.12987012987013	0.144124168514412	0.901098901098901	0.0384615384615385	0.0738636363636364	13	102	493	3180	0.783733067165103	0.822137637610927	0.468651272419864	Inf	0.8422083076109	4.01170229364955	0.000664154424569998	7.51827514264344	0.438253191743229	0.99526398005775	0.403212992991588	1	163	161
TCGA-CG-5728-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	1712	6	74	297	371	1335	54735	15	115	13	143	12430	14	129	24	167	12511	14	74	435	523	14983	11	56	435	502	14811	2	7	6	15	1791	0.00876168224299065	0.0298804780876494	0.120923637836743	0.247102044084967	0.00837520938023451	3	5	5	13	1783	0.00759345794392523	0.0248565965583174	0.119001535073083	0.208876268218323	0.00729108244531688	0.00934579439252336	16	879	3574	26220	1	0.133543632059846	0.0833443692887071	Inf	0.149029145942296	1.66726357022943	0.173445218047365	1.83403092620734	0.105401719957033	1	0.0939490500520106	0.137927660135887	1696	1319
TCGA-CG-5730-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	179	0	4	3	7	172	7052	5	1	1	7	1616	6	6	1	13	1677	4	12	52	68	1813	8	4	72	84	1946	2	1	11	14	285	0.0782122905027933	0.166666666666667	0.146454265159301	1.13801169590643	0.0491228070175439	2	4	8	14	222	0.0782122905027933	0.205882352941176	0.122448979591837	1.68137254901961	0.0630630630630631	0.128491620111732	23	113	507	3252	0.154528049349869	1.30544630500858	0.854192312058057	Inf	1.25387225896276	2.47140039447732	0.0675579798677967	3.20567141992251	1.13604695552586	0.316338456030717	1.16059176531658	9.60182780261739e-05	156	149
TCGA-CG-5732-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	66	0	2	1	3	63	2583	1	3	4	8	608	0	3	1	4	654	1	6	21	28	598	3	6	14	23	723	0	0	1	1	95	0.0151515151515152	0.0434782608695652	0.131396957123098	0.330892448512586	0.0105263157894737	1	2	2	5	70	0.0757575757575758	0.178571428571429	0.117056856187291	1.52551020408163	0.0714285714285714	0.0606060606060606	4	35	165	1156	0.734852138755437	0.800813818473996	0.25709235946629	Inf	0.821134421134421	2.00151515151515	0.414956679026067	2.33334105891225	0.686233766233766	0.829387846034301	0.656993996280533	0.545454545454546	62	59
TCGA-CG-5733-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	1253	0	51	190	241	1011	41451	6	99	12	117	9356	6	85	19	110	9439	3	63	345	411	11253	7	50	316	373	11403	0	8	3	11	1294	0.00877893056664006	0.0294906166219839	0.11347890905902	0.259877512627884	0.00850077279752705	0	2	6	8	1270	0.00638467677573823	0.0194647201946472	0.112858793210699	0.172469682165642	0.0062992125984252	0.00718276137270551	9	662	2564	20092	1	0.106538998791323	0.0552645080857655	Inf	0.118518242965188	0	1	0	0.120311257230925	1	0.108173022659692	0.0011333914559721	1244	1002
TCGA-CG-5734-01A-11D-1600-08	0	0	0	0	95	0	0	2	2	92	3772	4	4	4	12	866	3	7	1	11	886	3	6	20	29	1043	0	6	34	40	977	0	0	2	2	126	0.0210526315789474	0.05	0.128966223132037	0.387698412698413	0.0158730158730159	1	1	0	2	138	0.0210526315789474	0.0689655172413793	0.132310642377756	0.521239380309845	0.0144927536231884	0.0315789473684211	3	54	264	1756	0.983742991693477	0.369651832030026	0.0972260322498088	Inf	0.402711323763955	2.55050505050505	0.343897343375648	3.32287200705413	0.283389450056117	0.994997508291881	0.255930717373049	1	92	89
TCGA-D7-5577-01A-01D-1600-08	0	0	0	0	134	1	1	3	4	129	5289	6	6	7	19	1314	3	3	8	14	1221	2	13	38	53	1422	3	6	34	43	1332	0	1	2	3	169	0.0223880597014925	0.0697674418604651	0.126876876876877	0.5498830328884	0.0177514792899408	1	3	3	7	206	0.0522388059701493	0.132075471698113	0.144866385372714	0.911705440556879	0.0339805825242718	0.0447761194029851	6	71	375	2379	0.958786668434873	0.536209426854541	0.225116397462679	Inf	0.57225974025974	1.4688	0.519588882487831	1.58567873808211	0.51	0.974038978532696	0.473530987275824	0.140866873065015	128	123
TCGA-D7-5578-01A-01D-1600-08	0	0	0	0	249	0	0	4	4	244	10004	7	12	16	35	2428	4	23	19	46	2389	12	10	72	94	2592	9	14	46	69	2595	4	4	6	14	351	0.0562248995983936	0.202898550724638	0.135260115606936	1.50006193484454	0.0398860398860399	6	3	6	15	366	0.0602409638554217	0.159574468085106	0.141203703703704	1.13010115102895	0.040983606557377	0.0883534136546185	22	117	717	4470	0.284373828883396	1.17220275689117	0.7630923409529	Inf	1.14499864543512	3.44490934449093	0.000217014477079988	5.66452291337212	0.735692504077725	0.903128302827736	0.705812862579307	0.787081048919185	227	222
TCGA-D7-5579-01A-01D-1600-08	1	0	0	1	171	0	3	1	4	167	6847	4	12	9	25	1646	7	12	18	37	1778	4	13	33	50	1693	9	11	35	55	1730	4	2	4	10	258	0.0584795321637427	0.181818181818182	0.149132947976879	1.21916842847075	0.0387596899224806	2	1	4	7	251	0.0409356725146199	0.14	0.148257531010041	0.944302788844622	0.0278884462151394	0.0818713450292398	14	67	509	2914	0.318188080381587	1.1961702775466	0.68566839606163	Inf	1.1623371898421	3.10382348496297	0.00738836136621903	4.90375295397601	0.791170692245464	0.810162277962246	0.763381390512003	0.728282095511384	157	153
TCGA-D7-6518-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	94	0	1	4	5	89	3649	2	4	0	6	862	1	3	4	8	870	4	5	28	37	1008	5	6	27	38	909	2	1	2	5	128	0.0531914893617021	0.131578947368421	0.140814081408141	0.934416118421053	0.0390625	0	1	3	4	127	0.0425531914893617	0.108108108108108	0.125992063492063	0.858054905299	0.031496062992126	0.074468085106383	7	57	255	1662	0.763102824804803	0.800496477464629	0.357331403003224	Inf	0.822242647058824	1.67058823529412	0.342637768740856	1.86139823608328	0.683422459893048	0.870588438889744	0.651887589894438	0.334841628959276	87	82
TCGA-D7-6519-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	64	0	0	4	4	60	2460	1	2	0	3	544	1	2	2	5	563	2	8	18	28	671	1	8	15	24	682	1	2	2	5	79	0.078125	0.208333333333333	0.1158357771261	1.79852320675106	0.0632911392405063	0	0	1	1	83	0.015625	0.0357142857142857	0.123695976154993	0.288726333907057	0.0120481927710843	0.0625	4	32	162	1191	0.641193325833306	0.919021758646138	0.29370573934229	Inf	0.92798353909465	2.78395061728395	0.319213693803583	3.67046309867395	0.759259259259259	0.773030678768075	0.7353314125911	0.545454545454546	60	56
TCGA-D7-6520-01A-11D-1800-08	1	0	0	1	73	0	2	0	2	71	2911	0	10	2	12	728	4	1	2	7	642	3	3	16	22	782	6	5	19	30	759	4	2	2	8	105	0.10958904109589	0.266666666666667	0.138339920948617	1.92761904761905	0.0761904761904762	2	0	2	4	106	0.0547945205479452	0.181818181818182	0.135549872122762	1.34133790737564	0.0377358490566038	0.136986301369863	10	34	211	1330	0.0748143420812055	1.85297836345195	0.918976348554533	Inf	1.65984489444205	4.86887835703002	0.000410247996823075	12.5704937285887	0.834664861205146	0.724788864209934	0.813430793232168	0.680172297752053	63	61
TCGA-D7-6521-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	87	0	1	1	2	85	3485	0	3	2	5	814	0	1	3	4	805	3	3	23	29	906	1	6	40	47	960	0	1	8	9	135	0.103448275862069	0.191489361702128	0.140625	1.36170212765957	0.0666666666666667	0	1	3	4	99	0.0459770114942529	0.137931034482759	0.109271523178808	1.26227795193312	0.0404040404040404	0.126436781609195	11	56	234	1632	0.220665960179057	1.36971217936078	0.721540383171053	Inf	1.30922311519326	0	1	0	1.39234839234839	0.166773462260535	1.4750009297692	2.01911428186836e-05	76	74
TCGA-D7-6522-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	46	0	0	0	0	45	1845	0	1	1	2	423	0	2	1	3	458	1	6	17	24	498	1	2	13	16	466	1	1	0	2	63	0.0434782608695652	0.125	0.13519313304721	0.924603174603175	0.0317460317460317	0	2	1	3	71	0.0652173913043478	0.125	0.142570281124498	0.876760563380282	0.0422535211267606	0.0434782608695652	2	30	134	830	0.947457543854201	0.413202951171734	0.0695618070321449	Inf	0.449626865671642	3.59701492537313	0.260097190486918	6.17477627941112	0.239800995024876	0.988313600030162	0.213780970986647	1	44	43
TCGA-D7-6524-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	125	0	1	1	2	123	5043	4	7	2	13	1169	2	4	0	6	1171	3	13	36	52	1318	2	16	34	52	1385	0	2	0	2	154	0.016	0.0384615384615385	0.111191335740072	0.345904095904096	0.012987012987013	0	3	1	4	156	0.032	0.0769230769230769	0.118361153262519	0.649901380670612	0.0256410256410256	0.008	1	74	310	2393	0.999880596753493	0.104353984010131	0.00523566074781595	Inf	0.116258064516129	0	1	0	0.124562211981567	0.999783713754598	0.111915479028429	1	124	122
TCGA-D7-6525-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	190	0	0	5	5	185	7585	3	17	9	29	1875	3	14	14	31	1792	5	16	51	72	1941	7	15	31	53	1977	2	4	5	11	287	0.0578947368421053	0.207547169811321	0.145169448659585	1.42968904082572	0.0383275261324042	1	7	8	16	274	0.0842105263157895	0.222222222222222	0.141164348274086	1.57420924574209	0.0583941605839416	0.0842105263157895	16	78	561	3357	0.270582955620905	1.22739442958508	0.732978424698108	Inf	1.18875867561725	1.74598930481283	0.24189668798501	1.99427841916364	1.10721272988131	0.394547701332035	1.12734087706191	0.00627576510670569	174	169
TCGA-D7-6526-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	243	1	4	5	9	233	9553	9	14	20	43	2397	8	19	15	42	2359	9	18	44	71	2350	6	19	52	77	2447	0	3	9	12	350	0.0493827160493827	0.155844155844156	0.143032284429914	1.089573283859	0.0342857142857143	3	1	8	12	347	0.0493827160493827	0.169014084507042	0.147659574468085	1.14461988066729	0.0345821325648415	0.0823045267489712	20	91	697	4100	0.184131052670915	1.29275001020884	0.818003834693349	Inf	1.24006359300477	1.37647058823529	0.375972121677071	1.47044946463911	1.21875	0.228677148914966	1.26575594115397	8.82777082593548e-05	223	213
TCGA-D7-6527-01A-11D-1800-08	0	1	0	1	239	1	1	7	8	230	9430	5	22	34	61	2461	4	19	33	56	2388	13	10	45	68	2342	5	4	36	45	2239	3	3	5	11	339	0.0460251046025105	0.244444444444444	0.151406878070567	1.61448705342511	0.0324483775811209	5	0	3	8	345	0.0334728033472803	0.117647058823529	0.14730999146029	0.798635976129582	0.0231884057971014	0.0669456066945607	16	83	684	3897	0.409922050030192	1.09829253326195	0.658204095321202	Inf	1.08240297713982	2.9766081871345	0.00271735408679715	4.55584315116593	0.66146848602989	0.929740120956692	0.624424600892534	1	223	214
TCGA-D7-6528-01A-11D-1800-08	0	0	0	0	361	1	5	8	13	347	14227	15	27	39	81	3658	16	22	54	92	3532	21	16	71	108	3645	7	10	49	66	3392	3	1	4	8	471	0.0221606648199446	0.121212121212121	0.138856132075472	0.87293315318793	0.0169851380042463	9	4	9	22	555	0.0609418282548476	0.203703703703704	0.152263374485597	1.33783783783784	0.0396396396396396	0.0692520775623269	25	123	1026	6011	0.246760838076919	1.19073472940499	0.797122389760553	Inf	1.15855987566514	2.93943191311612	0.000294935663193463	4.39288573959087	0.743023066926576	0.904942704256864	0.711832631889416	1	336	322
TCGA-D7-6815-01A-11D-1882-08	0	0	1	1	162	0	7	7	14	147	6027	2	6	2	10	1412	4	4	4	12	1360	6	10	47	63	1621	2	12	48	62	1634	0	1	1	2	173	0.0123456790123457	0.032258064516129	0.105875152998776	0.304680216296849	0.0115606936416185	0	2	4	6	194	0.037037037037037	0.0952380952380952	0.119679210363973	0.795778105056456	0.0309278350515464	0.0308641975308642	5	98	367	2888	0.992299159191991	0.40156767005026	0.154101072037175	Inf	0.430544165498267	0	1	0	0.466800516277069	0.985355903740814	0.437257147440945	0.0256410256410257	157	142
TCGA-D7-6817-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	93	0	1	0	1	91	3731	2	6	3	11	898	4	5	4	13	854	11	6	15	32	1064	4	6	25	35	915	0	0	1	1	117	0.010752688172043	0.0285714285714286	0.127868852459016	0.223443223443223	0.00854700854700855	2	0	0	2	109	0.021505376344086	0.0625	0.102443609022556	0.610091743119266	0.018348623853211	0.032258064516129	3	52	226	1753	0.957287462309018	0.447629007922219	0.117492205504447	Inf	0.477634754625905	1.16755162241888	0.525605387171975	1.19321502750385	0.21891592920354	0.991936668545378	0.198976261232062	1	90	88
TCGA-D7-6818-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	173	0	1	3	4	169	6929	6	20	23	49	1699	4	20	27	51	1812	2	6	19	27	1706	2	9	31	42	1712	0	2	4	6	247	0.0346820809248555	0.142857142857143	0.144275700934579	0.990167727009832	0.0242914979757085	1	0	0	1	257	0.00578034682080925	0.037037037037037	0.150644783118406	0.245856751693328	0.00389105058365759	0.0289017341040462	5	49	504	2914	0.914799929363846	0.590050547484995	0.22240661253305	Inf	0.627939447383892	1.69543650793651	0.472170366194322	1.92668150790473	0.542539682539683	0.948566693757439	0.502841013586068	0.265734265734266	168	164
TCGA-D7-6820-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	104	0	0	2	2	102	4182	3	6	4	13	1026	6	8	2	16	1034	10	6	20	36	1074	5	4	28	37	1048	3	1	3	7	153	0.0673076923076923	0.189189189189189	0.145992366412214	1.29588411941353	0.0457516339869281	3	0	4	7	136	0.0673076923076923	0.194444444444444	0.126629422718808	1.53553921568627	0.0514705882352941	0.125	13	50	289	1833	0.0847930451556707	1.64861519497999	0.908719774587418	Inf	1.5151315428132	2.93702422145329	0.0110278235758181	4.22431802288607	1.07079008073818	0.487975207746236	1.08285861423576	1	91	89
TCGA-D7-6822-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	262	2	2	6	8	251	10291	11	15	32	58	2641	10	30	43	83	2629	10	9	45	64	2487	5	6	35	46	2534	0	3	6	9	362	0.0343511450381679	0.195652173913043	0.142857142857143	1.3695652173913	0.0248618784530387	2	3	8	13	389	0.049618320610687	0.203125	0.156413349416968	1.29864235218509	0.0334190231362468	0.0610687022900763	16	79	751	4270	0.347239960929012	1.15147994733426	0.689133863300301	Inf	1.12602144509076	0.891433644030182	0.680010992184721	0.874770553717575	1.17000665778961	0.307999003364611	1.20600129190562	0.000372885483776326	246	235
TCGA-D7-8570-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	143	0	0	4	4	139	5699	5	7	2	14	1291	8	2	3	13	1277	17	9	29	55	1532	11	5	41	57	1599	3	0	3	6	186	0.041958041958042	0.105263157894737	0.116322701688555	0.904923599320883	0.032258064516129	6	1	1	8	175	0.0559440559440559	0.145454545454545	0.114229765013055	1.27335064935065	0.0457142857142857	0.0909090909090909	13	85	361	2770	0.344048435384935	1.17346223300077	0.663610292322785	Inf	1.15051727062016	2.78779184804116	0.00338738615100461	3.63233682229107	0.495607439651761	0.96660977038976	0.465122729522293	0.128346121057119	130	126
TCGA-D7-8572-01A-11D-2340-08	0	0	1	1	230	1	0	5	5	223	9143	5	13	8	26	2336	10	8	8	26	2180	19	15	45	79	2305	12	27	53	92	2322	3	4	4	11	321	0.0478260869565217	0.119565217391304	0.138242894056848	0.864892320195043	0.0342679127725857	5	2	6	13	340	0.0565217391304348	0.164556962025316	0.147505422993492	1.11559940431869	0.0382352941176471	0.0782608695652174	18	111	661	3966	0.581703420664233	0.972975772573596	0.605451790795861	Inf	0.976744186046512	1.80645161290323	0.0662045591992785	2.08656175019953	0.714285714285714	0.906622284661088	0.681867772562901	0.766127930108728	212	205
TCGA-D7-8573-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	119	0	0	4	4	114	4674	2	7	5	14	1012	2	8	4	14	1086	5	4	31	40	1297	11	8	27	46	1279	1	0	1	2	145	0.0168067226890756	0.0434782608695652	0.113369820172009	0.383508245877061	0.0137931034482759	1	0	1	2	137	0.0168067226890756	0.05	0.105628373168851	0.473357664233577	0.0145985401459854	0.0336134453781513	4	70	282	2294	0.966691050385302	0.46494481975437	0.153753642638038	Inf	0.493770366110792	1.14184397163121	0.536990560447797	1.16202959164122	0.314991440449988	0.989867632825766	0.290612761151705	1	115	110
TCGA-D7-8574-01A-13D-2340-08	0	0	0	0	65	0	1	1	2	62	2542	0	3	0	3	584	0	3	2	5	598	3	6	18	27	700	6	9	12	27	660	0	0	0	0	92	0	0	0.139393939393939	0	0	0	1	0	1	85	0.0153846153846154	0.037037037037037	0.121428571428571	0.305010893246187	0.0117647058823529	0	0	39	177	1183	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	65	62
TCGA-D7-8575-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	66	0	6	2	8	58	2378	1	2	2	5	570	1	3	1	5	533	3	6	12	21	642	3	5	19	27	633	0	1	0	1	74	0.0151515151515152	0.037037037037037	0.116903633491311	0.316816816816817	0.0135135135135135	3	3	0	6	90	0.0909090909090909	0.285714285714286	0.14018691588785	2.03809523809524	0.0666666666666667	0.0454545454545455	3	34	164	1111	0.870194247912005	0.597936759293891	0.154097374970271	Inf	0.630355965721819	3.88719512195122	0.0322679403953039	6.75567750898594	0	1	0	0.192307692307692	63	55
TCGA-D7-8576-01A-11D-2340-08	0	1	0	1	87	0	2	2	4	83	3403	0	3	1	4	795	0	4	2	6	740	4	2	26	32	949	10	12	19	41	919	0	1	1	2	98	0.0229885057471264	0.0487804878048781	0.106637649619151	0.457441513190642	0.0204081632653061	0	0	1	1	115	0.0114942528735632	0.03125	0.12118018967334	0.257880434782609	0.00869565217391304	0.0229885057471264	2	57	213	1655	0.992802369667597	0.272744280793732	0.0470517738385643	Inf	0.297286544123498	0	1	0	0.389775691184142	0.970026181847067	0.361524663176069	0.4	85	81
TCGA-D7-8578-01A-21D-2340-08	0	0	0	0	66	0	4	0	4	62	2542	2	3	3	8	593	2	2	0	4	559	0	7	21	28	671	1	3	18	22	719	0	0	0	0	85	0	0	0.118219749652295	0	0	0	0	0	0	94	0	0	0.140089418777943	0	0	0	0	40	179	1211	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	66	62
TCGA-D7-8579-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	140	0	1	0	1	138	5658	6	14	16	36	1427	1	11	18	30	1385	2	5	33	40	1366	4	3	25	32	1480	2	0	1	3	235	0.0214285714285714	0.09375	0.158783783783784	0.590425531914894	0.0127659574468085	0	3	1	4	211	0.0285714285714286	0.1	0.154465592972182	0.64739336492891	0.018957345971564	0.0285714285714286	4	60	446	2400	0.993271888797296	0.358831524228324	0.118407951644528	Inf	0.398822869955157	2.1270553064275	0.240172729055603	2.6892478865857	0.22004020411319	0.999359209297855	0.19224636168169	1	136	134
TCGA-D7-A4YT-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	327	2	7	11	18	307	12587	14	17	15	46	2968	13	13	11	37	2936	27	29	51	107	3323	33	28	56	117	3360	9	5	5	19	451	0.0581039755351682	0.162393162393162	0.13422619047619	1.2098470635056	0.0421286031042129	8	0	8	16	469	0.0489296636085627	0.149532710280374	0.141137526331628	1.05948229480103	0.0341151385927505	0.0917431192660551	30	137	920	5763	0.0787394660982789	1.37163449275127	0.950438176450693	Inf	1.30493361103879	2.05817028985507	0.00253705071146378	2.47605863609637	0.882557903291345	0.726573220306708	0.866349786507591	0.469050129210538	297	277
TCGA-D7-A4YU-01A-21D-A25D-08	0	0	0	0	220	1	2	4	6	212	8692	7	11	13	31	1920	3	17	16	36	2040	5	12	58	75	2269	13	17	40	70	2463	4	0	1	5	322	0.0227272727272727	0.0714285714285714	0.130734876167276	0.546362023070098	0.015527950310559	2	3	3	8	247	0.0363636363636364	0.106666666666667	0.108858527985897	0.979865047233468	0.0323886639676113	0.0454545454545455	10	106	569	4163	0.901197278508731	0.690267848025398	0.363066607680934	Inf	0.716926246894128	2.77211482132396	0.0158119857697736	3.65668713567195	0.339442631182526	0.99815669976265	0.311382503717267	0.688167990308251	210	202
TCGA-D7-A4YV-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	1097	1	41	160	201	894	36654	10	48	14	72	7994	10	40	13	63	8165	7	45	342	394	10122	11	47	307	365	10373	2	3	2	7	1162	0.00638103919781222	0.0191780821917808	0.112021594524246	0.171199867965011	0.00602409638554217	0	6	4	10	1141	0.00911577028258888	0.0253807106598985	0.112724757952974	0.225156488430756	0.00876424189307625	0.0072926162260711	8	659	2303	18192	1	0.0958986060911378	0.0474862651323708	Inf	0.106737773102159	0.988806870265837	0.616500884661736	0.987408113062358	0.0822736070791297	1	0.0737137690620675	0.224503095470837	1089	886
TCGA-D7-A4YX-01A-11D-A25D-08	0	0	1	1	93	0	1	2	3	89	3649	3	2	0	5	804	1	4	0	5	839	5	3	25	33	1030	3	6	37	46	976	2	0	2	4	105	0.043010752688172	0.0869565217391304	0.107581967213115	0.808281573498965	0.0380952380952381	3	0	1	4	124	0.043010752688172	0.121212121212121	0.120388349514563	1.00684261974585	0.032258064516129	0.0860215053763441	8	62	229	1777	0.556530548324788	1.00126718217815	0.47357312525595	Inf	1.00112289457268	5.47489082969432	0.000846770023748927	12.9008643534257	0.423862515847302	0.977083585331744	0.394692898449299	0.619269619269619	85	81
TCGA-D7-A4YY-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	565	1	34	67	101	463	18983	3	27	19	49	4063	5	32	13	50	4442	3	37	137	177	5254	8	32	147	187	5224	0	3	3	6	639	0.0106194690265487	0.0320855614973262	0.122320061255743	0.262308252366247	0.00938967136150235	0	3	1	4	549	0.00707964601769911	0.0225988700564972	0.104491815759421	0.216274067899519	0.00728597449908925	0.00707964601769911	4	291	1188	9290	0.999999999994491	0.107499697508987	0.0364229434690198	Inf	0.119591394167665	0	1	0	0.124223455209371	0.999999999982084	0.111722843782395	0.086687306501548	561	459
TCGA-D7-A4Z0-01A-22D-A25D-08	0	0	0	0	335	1	2	5	7	326	13366	15	37	69	121	3389	12	35	78	125	3504	4	3	34	41	3242	4	5	30	39	3231	2	1	0	3	513	0.00895522388059702	0.0769230769230769	0.158774373259053	0.484480431848853	0.00584795321637427	1	1	3	5	523	0.0149253731343284	0.121951219512195	0.161320172732881	0.755957655178846	0.00956022944550669	0.017910447761194	6	66	1036	5437	0.980679386753828	0.47714222765881	0.20070068767211	Inf	0.520672458172458	2.34302606177606	0.123042599631773	3.14806620345992	0.292878257722008	0.998735156629506	0.25813462407864	1	329	320
TCGA-D7-A6ET-01A-32D-A32N-08	0	0	0	0	42	0	0	5	5	37	1517	3	0	0	3	343	1	1	1	3	356	0	2	16	18	397	1	1	11	13	421	0	0	1	1	57	0.0238095238095238	0.0769230769230769	0.135391923990499	0.568151147098516	0.0175438596491228	0	0	1	1	58	0.0238095238095238	0.0555555555555556	0.146095717884131	0.380268199233716	0.0172413793103448	0.0476190476190476	2	26	115	703	0.918447703575375	0.470559877728037	0.0785602779201916	Inf	0.508074534161491	0	1	0	0.526892109500805	0.908142620367035	0.48936922908491	0.333333333333333	40	35
TCGA-D7-A6EV-01A-11D-A31L-08	0	0	0	0	211	0	2	8	10	201	8241	7	10	8	25	1885	2	14	9	25	1929	13	12	49	74	2216	13	9	55	77	2211	3	2	1	6	298	0.028436018957346	0.0779220779220779	0.134780642243329	0.578139980824545	0.0201342281879195	5	1	2	8	273	0.037914691943128	0.108108108108108	0.123194945848375	0.877536877536878	0.0293040293040293	0.0521327014218009	11	119	571	3856	0.954663253132222	0.624288705713657	0.33992212921308	Inf	0.65602855988145	2.38555839956891	0.0142412881396609	3.0003002761709	0.223646099959585	0.999913562984337	0.20062610565084	0.120111873887617	200	190
TCGA-D7-A6EX-01A-11D-A31L-08	0	1	0	1	145	0	2	3	5	137	5617	6	7	6	19	1342	8	4	5	17	1377	8	12	30	50	1456	4	14	33	51	1442	0	1	4	5	192	0.0344827586206897	0.0980392156862745	0.133148404993065	0.736315359477124	0.0260416666666667	3	1	1	5	204	0.0344827586206897	0.1	0.14010989010989	0.713725490196078	0.0245098039215686	0.0551724137931034	8	67	396	2502	0.81952538295751	0.75447522075513	0.359550576320734	Inf	0.780606060606061	1.82954545454545	0.220479367258101	2.10538453758768	0.580808080808081	0.942414970981278	0.544762598277961	0.649916646820672	137	129
TCGA-D7-A6EY-01A-21D-A31L-08	0	0	0	0	1751	4	60	238	298	1449	59409	53	193	53	299	13156	49	172	53	274	13383	8	56	365	429	16247	9	77	361	447	16623	1	7	6	14	1926	0.00799543118218161	0.0313199105145414	0.115863562533839	0.270317171590458	0.00726895119418484	1	2	7	10	1897	0.00571102227298686	0.0233100233100233	0.116760017233951	0.199640457943041	0.00527148128624143	0.0085665334094803	15	728	3823	29047	1	0.156555770130782	0.0959692760633853	Inf	0.173579267513446	1.01152467264698	0.604402035215368	1.0130619435926	0.153957956373955	1	0.138536223928806	0.00134883438246903	1736	1434
TCGA-D7-A6EZ-01A-11D-A31L-08	0	0	0	0	294	7	1	16	17	270	11070	9	19	7	35	2641	16	19	13	48	2531	30	20	47	97	2901	29	18	43	90	2997	12	1	5	18	370	0.0612244897959184	0.2	0.123456790123457	1.62	0.0486486486486487	10	2	6	18	418	0.0612244897959184	0.185567010309278	0.144088245432609	1.28787056676368	0.0430622009569378	0.112244897959184	33	116	788	5110	0.00255569206608463	1.84453303551539	1.28908386174809	Inf	1.65770108677137	2.79093177320829	4.02452129295461e-06	3.85491244812162	0.914805414551607	0.670531689036114	0.902934864007376	0.0173929095052304	261	237
TCGA-D7-A6F0-01A-11D-A31L-08	0	0	0	0	157	0	4	5	9	148	6068	2	8	6	16	1500	2	5	10	17	1465	8	7	35	50	1497	10	17	38	65	1606	3	4	6	13	228	0.0828025477707006	0.2	0.141967621419676	1.40877192982456	0.0570175438596491	1	3	4	8	206	0.0509554140127389	0.16	0.137608550434202	1.16271844660194	0.0388349514563107	0.089171974522293	14	77	434	2669	0.398122241974183	1.11813650497452	0.643848230044198	Inf	1.09996455157745	1.58883768561188	0.239137988567977	1.75668915745916	0.97942049113061	0.580358175755801	0.976159318540474	0.100121866895246	143	134
TCGA-D7-A6F2-01A-12D-A31L-08	0	0	1	1	86	0	1	1	2	83	3403	2	2	3	7	822	3	6	3	12	807	2	7	26	35	875	4	5	20	29	899	0	0	0	0	126	0	0	0.140155728587319	0	0	1	3	3	7	128	0.0813953488372093	0.2	0.146285714285714	1.3671875	0.0546875	0.0465116279069767	4	48	254	1520	0.950104434076521	0.498839646589707	0.162946325117357	Inf	0.53725015142338	1.16404199475066	0.605101290234149	1.19670702765171	0.455494693598083	0.968312411528987	0.417651790900257	0.559440559440559	82	79
TCGA-D7-A747-01A-22D-A33T-08	0	0	0	0	117	1	0	2	2	114	4674	0	7	11	18	1048	5	3	20	28	1182	4	6	29	39	1211	3	4	22	29	1233	2	1	4	7	183	0.0598290598290598	0.241379310344828	0.148418491484185	1.62634256642171	0.0382513661202186	1	0	2	3	155	0.0256410256410256	0.0769230769230769	0.127993393889348	0.600992555831266	0.0193548387096774	0.0769230769230769	9	49	338	2106	0.413634022064426	1.1443323384538	0.562199441522542	Inf	1.12201591511936	3.0989010989011	0.0607239740010897	4.66866782686696	0.850678733031674	0.725043607997529	0.830827336104135	0.369849964277209	108	105
TCGA-D7-A748-01A-12D-A32N-08	0	0	0	0	54	0	1	3	4	50	2050	0	3	4	7	487	1	4	2	7	466	2	6	19	27	520	0	1	8	9	577	0	0	1	1	68	0.0185185185185185	0.111111111111111	0.117850953206239	0.94281045751634	0.0147058823529412	0	1	1	2	74	0.037037037037037	0.0740740740740741	0.142307692307692	0.520520520520521	0.027027027027027	0.037037037037037	2	27	142	955	0.903661127698087	0.498415908459261	0.0836164107108657	Inf	0.532782904322487	0	1	0	0.572248304642671	0.880430780005757	0.538267025457983	0.4	52	48
TCGA-D7-A74A-01A-11D-A32N-08	0	1	0	1	169	1	3	6	9	159	6519	3	2	4	9	1508	2	4	1	7	1489	27	6	40	73	1792	15	7	48	70	1730	11	1	7	19	207	0.112426035502959	0.271428571428571	0.119653179190751	2.26846100759144	0.0917874396135266	20	2	9	31	244	0.183431952662722	0.424657534246575	0.136160714285714	3.1187963170896	0.127049180327869	0.27810650887574	47	83	451	3071	3.44067663026969e-11	3.85404943198915	2.7641161067891	Inf	2.82336687702541	5.76401647133354	4.93789634242064e-19	19.1602530389005	1.41987502519653	0.096529131146985	1.5129751013676	0.00477742718365635	122	112
TCGA-D7-A74B-01A-12D-A33T-08	0	0	0	0	39	1	0	2	2	36	1476	0	7	0	7	342	2	4	0	6	338	0	0	14	14	406	1	2	6	9	390	0	0	1	1	42	0.0256410256410256	0.111111111111111	0.107692307692308	1.03174603174603	0.0238095238095238	0	0	1	1	44	0.0256410256410256	0.0714285714285714	0.108374384236453	0.659090909090909	0.0227272727272727	0.0512820512820513	2	19	86	710	0.680860719531823	0.869149556879236	0.142146198586461	Inf	0.881506090808416	0	1	0	0.925581395348837	0.654645474243579	0.917395838364536	0.333333333333333	37	34
TCGA-EQ-5647-01A-01D-1600-08	0	0	1	1	92	3	0	0	0	88	3608	3	3	3	9	847	2	7	3	12	858	2	8	33	43	939	1	9	14	24	964	0	1	1	2	130	0.0217391304347826	0.0833333333333333	0.134854771784232	0.617948717948718	0.0153846153846154	1	0	9	10	125	0.108695652173913	0.232558139534884	0.133120340788072	1.74697674418605	0.08	0.119565217391304	11	39	255	1648	0.0678670667332882	1.8221266910124	0.941891167765482	Inf	1.64180392156863	2.48758169934641	0.351399936497969	3.22848188271031	1.58781810596579	0.0946590841102596	1.74608317891459	0.000644193604215142	81	77
TCGA-EQ-8122-01A-11D-2340-08	0	0	1	1	217	1	3	6	9	207	8487	5	10	5	20	1990	3	13	7	23	1988	6	10	67	83	2280	7	11	63	81	2229	2	3	13	18	275	0.0829493087557604	0.222222222222222	0.123373710183939	1.80121212121212	0.0654545454545455	3	2	3	8	291	0.0368663594470046	0.0963855421686747	0.127631578947368	0.755185691218482	0.0274914089347079	0.0967741935483871	21	122	566	3943	0.259050876093865	1.1990764754578	0.77310399745203	Inf	1.16989547554919	3.06401195977168	0.0170199504010342	4.35207538818698	0.980483827126937	0.574030734846903	0.977748062430599	0.00417100806910248	196	186
TCGA-EQ-A4SO-01A-11D-A25D-08	0	0	2	2	205	3	2	19	21	180	7380	6	18	5	29	1700	5	6	3	14	1747	27	17	19	63	1941	17	21	36	74	1992	7	3	2	12	224	0.0585365853658537	0.162162162162162	0.112449799196787	1.44208494208494	0.0535714285714286	14	3	3	20	252	0.0975609756097561	0.317460317460317	0.129829984544049	2.44520030234316	0.0793650793650794	0.126829268292683	26	73	476	3457	0.00012129671211557	2.58589621668795	1.69856934713154	Inf	2.16997708174179	3.94351604278075	9.02691378656838e-09	6.62538151039995	0.751145912910619	0.810535569931423	0.726312576398245	9.45769103516266e-05	179	154
TCGA-F1-6177-01A-11D-1800-08	0	0	1	1	1584	7	77	225	302	1275	52275	5	83	10	98	11476	6	87	12	105	11299	10	59	474	543	14679	12	49	468	529	14821	0	3	7	10	1510	0.00631313131313131	0.0189035916824197	0.10188246407125	0.18554313399016	0.00662251655629139	0	0	8	8	1585	0.00505050505050505	0.0147329650092081	0.107977382655494	0.136444916952786	0.00504731861198738	0.00946969696969697	15	949	3095	26405	1	0.134854190280946	0.0827334032387351	Inf	0.148311759698081	0	1	0	0.151775516294002	1	0.138054594738514	2.93108577675973e-07	1569	1260
TCGA-F1-6874-01A-11D-1882-08	0	0	0	0	1086	1	52	168	220	864	35424	9	66	9	84	7838	12	54	9	75	8003	7	57	303	367	9568	7	58	273	338	10015	1	6	5	12	1149	0.0110497237569061	0.0355029585798817	0.114727908137793	0.309453551068333	0.010443864229765	2	6	8	16	1111	0.0147329650092081	0.0435967302452316	0.116116220735786	0.375457709258664	0.0144014401440144	0.0147329650092081	16	574	2260	17323	0.999999999999999	0.213669019234319	0.132983371943301	Inf	0.234984250787461	1.85679519595449	0.21421330857933	2.09037534867302	0.195565234759095	1	0.17699847245786	0.00667019874726893	1070	848
TCGA-F1-6875-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	99	0	0	1	1	98	4018	3	3	5	11	909	1	9	1	11	868	4	7	31	42	1090	1	3	30	34	1151	0	1	6	7	142	0.0707070707070707	0.205882352941176	0.123370981754996	1.66880695940348	0.0492957746478873	1	0	1	2	125	0.0202020202020202	0.0476190476190476	0.114678899082569	0.415238095238095	0.016	0.0808080808080808	8	58	267	1974	0.537875576395486	1.01975310433781	0.481856805124568	Inf	1.0173646578141	1.67865168539326	0.470555655646941	1.84765720401378	0.963160803094493	0.602220834270286	0.958398847430369	0.0152200740436034	91	90
TCGA-F1-A448-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	776	4	13	108	121	650	26650	7	58	15	80	5879	5	57	10	72	6109	1	26	225	252	7317	4	30	212	246	7345	0	2	2	4	835	0.00515463917525773	0.016260162601626	0.113682777399592	0.143031011148435	0.00479041916167665	0	1	1	2	816	0.00257731958762887	0.00793650793650794	0.111521115211152	0.0711659663865546	0.00245098039215686	0.0038659793814433	3	439	1651	13011	1	0.0538581752177184	0.0146068302310488	Inf	0.0602760975796926	0	1	0	0.0609657554467371	1	0.0544786582114042	0.181818181818182	773	647
TCGA-F1-A72C-01A-21D-A33T-08	0	0	0	0	67	0	1	5	6	61	2501	3	7	3	13	582	3	3	3	9	607	1	6	17	24	645	1	1	13	15	667	0	0	0	0	93	0	0	0.139430284857571	0	0	1	2	1	4	82	0.0597014925373134	0.166666666666667	0.127131782945736	1.3109756097561	0.0487804878048781	0.0298507462686567	2	30	175	1137	0.938355302066468	0.433341494678811	0.0731370591084975	Inf	0.468571428571429	3.74857142857143	0.250032168654168	6.48150981446399	0.249904761904762	0.98597860443918	0.224186068952744	1	65	59
TCGA-FP-7735-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	78	0	1	2	3	74	3034	2	1	2	5	722	0	2	1	3	728	2	7	28	37	785	4	3	22	29	799	1	1	3	5	93	0.0641025641025641	0.172413793103448	0.11639549436796	1.48127549128661	0.0537634408602151	0	1	8	9	102	0.115384615384615	0.243243243243243	0.129936305732484	1.87201907790143	0.0882352941176471	0.153846153846154	12	44	195	1389	0.0415526720345781	1.94174381796482	1.03380087469503	Inf	1.74065934065934	1.35384615384615	0.546459154302901	1.42424901595897	1.78707692307692	0.041799106153864	2.00802405540401	0.000341005967604433	66	62
TCGA-FP-7829-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	287	0	2	8	10	277	11357	3	12	11	26	2576	10	8	7	25	2608	7	33	74	114	3058	3	29	80	112	3115	2	10	2	14	392	0.0487804878048781	0.125	0.125842696629213	0.993303571428571	0.0357142857142857	1	7	7	15	362	0.0522648083623693	0.131578947368421	0.118378024852845	1.11151497528351	0.0414364640883978	0.0418118466898955	12	152	754	5419	0.983621080110953	0.56743733055145	0.319655815559306	Inf	0.599048974574626	2.45610079575597	0.113732113286397	3.07933759274923	0.478461193978435	0.996989845277273	0.446131233889568	0.1026743601157	275	265
TCGA-FP-7916-01A-11D-2201-08	0	0	0	0	124	2	0	4	4	118	4838	2	5	2	9	1142	5	3	4	12	1092	4	14	36	54	1280	3	9	31	43	1324	1	0	2	3	152	0.0241935483870968	0.0697674418604651	0.114803625377644	0.607711138310894	0.0197368421052632	2	2	0	4	149	0.032258064516129	0.0740740740740741	0.11640625	0.636341039025603	0.0268456375838926	0.0403225806451613	5	69	301	2303	0.937874634180828	0.554531308849357	0.210808834693242	Inf	0.584538026398492	3.70764119601329	0.0382557400081492	5.73167923708671	0.25824366539396	0.997235255979766	0.235495535363428	1	119	113
TCGA-FP-7998-01A-11D-2201-08	0	0	0	0	77	0	0	1	1	76	3116	2	3	1	6	711	1	2	2	5	736	4	7	19	30	840	2	7	26	35	829	0	3	1	4	108	0.051948051948052	0.114285714285714	0.130277442702051	0.877248677248677	0.037037037037037	2	0	4	6	116	0.0779220779220779	0.2	0.138095238095238	1.44827586206897	0.0517241379310345	0.0909090909090909	7	44	224	1445	0.538758065976559	1.02626587683395	0.452416865068662	Inf	1.02267156862745	2.48363095238095	0.188470615533735	3.22217385290328	0.827876984126984	0.739287190536378	0.806455858931766	0.34984520123839	70	69
TCGA-FP-8099-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	177	1	1	2	3	173	7093	3	6	1	10	1583	0	10	4	14	1679	7	14	58	79	1917	6	11	53	70	1914	1	1	1	3	239	0.0169491525423729	0.0428571428571429	0.124869383490073	0.343215780035864	0.0125523012552301	1	3	6	10	223	0.0564971751412429	0.126582278481013	0.116327595200835	1.08815348810808	0.0448430493273543	0.0508474576271186	9	115	462	3369	0.968398378320565	0.5707618014138	0.289294831565716	Inf	0.60185379136992	1.27572427572428	0.47727125324116	1.32574505922986	0.522932022932023	0.983796338475276	0.490891315011121	0.0968421052631578	168	164
TCGA-FP-8209-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	20	0	0	0	0	19	779	0	0	0	0	129	0	1	1	2	159	4	2	2	8	263	7	2	0	9	228	0	0	0	0	14	0	0	0.0614035087719298	0	0	0	0	0	0	9	0	0	0.0342205323193916	0	0	0	0	13	23	468	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	20	19
TCGA-FP-8210-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	10	0	0	0	0	10	410	0	2	1	3	94	1	0	0	1	99	0	1	3	4	90	0	1	1	2	127	0	0	0	0	16	0	0	0.125984251968504	0	0	0	0	0	0	12	0	0	0.133333333333333	0	0	0	0	4	28	189	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	10	10
TCGA-FP-8211-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	146	2	2	7	9	133	5453	2	10	5	17	1187	6	7	6	19	1285	20	11	17	48	1467	16	16	17	49	1514	2	3	0	5	169	0.0342465753424658	0.102040816326531	0.111624834874505	0.914140804250694	0.029585798816568	6	3	4	13	166	0.089041095890411	0.270833333333333	0.113156100886162	2.39344879518072	0.0783132530120482	0.0821917808219178	12	58	335	2646	0.0935224877928161	1.63385244221166	0.88865190913857	Inf	1.52545842217484	1.97744610281924	0.044844759488005	2.25576583138473	1.0468832309043	0.54208911759518	1.05312990187362	0.288987764182425	134	121
TCGA-FP-8631-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	121	2	3	5	8	110	4510	3	6	5	14	1046	3	7	2	12	1176	6	11	24	41	1140	8	11	24	43	1148	4	3	3	10	156	0.0826446280991736	0.232558139534884	0.13588850174216	1.71138938580799	0.0641025641025641	0	2	5	7	173	0.0578512396694215	0.170731707317073	0.151754385964912	1.1250528690258	0.0404624277456647	0.0991735537190083	12	50	329	1959	0.17797317940381	1.42881068534286	0.77100382402864	Inf	1.34601431512893	1.98697351280938	0.131989799427915	2.38053242507497	1.15906788247214	0.388474746477474	1.19076597445782	0.281752672051071	109	98
TCGA-FP-A4BE-01A-12D-A24D-08	0	0	1	1	1812	8	77	220	297	1507	61787	9	137	21	167	13455	11	98	13	122	13728	2	64	543	609	17136	4	84	521	609	17468	0	8	2	10	1875	0.00551876379690949	0.0164203612479475	0.10733913441722	0.152976464148878	0.00533333333333333	0	2	3	5	1885	0.00275938189845475	0.00821018062397373	0.11000233426704	0.0746364218421293	0.0026525198938992	0.00275938189845475	5	1065	3760	30844	1	0.038488212482837	0.0151419684689504	Inf	0.0430055677072977	0	1	0	0.0432480803071509	1	0.0387067202053307	0.0421455938697318	1807	1502
TCGA-FP-A4BF-01A-12D-A24D-08	0	1	0	1	130	0	1	6	7	123	5043	3	11	5	19	1149	4	6	4	14	1141	1	9	37	47	1420	4	6	33	43	1333	0	1	0	1	159	0.00769230769230769	0.0232558139534884	0.119279819954989	0.194968553459119	0.00628930817610063	0	3	4	7	169	0.0538461538461538	0.148936170212766	0.119014084507042	1.25141634143271	0.0414201183431953	0.0307692307692308	4	71	328	2425	0.982364025039659	0.416616380960977	0.13793391057185	Inf	0.447642276422764	0	1	0	0.479616724738676	0.972656900217037	0.448172375103996	0.076923076923077	126	119
TCGA-FP-A8CX-01A-11D-A364-08	0	0	0	0	87	1	0	6	6	80	3280	2	4	2	8	800	4	6	4	14	823	5	8	18	31	825	2	10	15	27	832	1	1	1	3	118	0.0344827586206897	0.111111111111111	0.141826923076923	0.783427495291902	0.0254237288135593	1	0	1	2	102	0.0229885057471264	0.0645161290322581	0.123636363636364	0.521821631878558	0.0196078431372549	0.0459770114942529	4	36	220	1437	0.795312825197298	0.72588062106137	0.234029205316016	Inf	0.753181818181818	2.15194805194805	0.237299297538119	2.61045118727987	0.456473829201102	0.944237677038193	0.421564357637722	1	83	76
TCGA-FP-A9TM-01A-11D-A397-08	0	0	0	0	171	1	1	6	7	163	6683	3	6	0	9	1470	2	7	3	12	1550	2	21	43	66	1839	7	14	55	76	1824	1	1	6	8	229	0.0467836257309941	0.105263157894737	0.125548245614035	0.838427947598253	0.0349344978165939	0	0	3	3	211	0.0175438596491228	0.0454545454545455	0.1147362697118	0.396165445928479	0.014218009478673	0.0584795321637427	10	97	440	3223	0.839091189108205	0.755205855235611	0.395689059284353	Inf	0.77803738317757	0.925	0.684262284094808	0.915635270619235	0.764540816326531	0.844465123096598	0.740783758708245	0.00190521552750655	161	153
TCGA-HF-7131-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	103	1	0	1	1	101	4141	2	7	8	17	1046	2	4	4	10	1003	7	5	21	33	1061	9	9	23	41	1031	4	3	9	16	137	0.155339805825243	0.390243902439024	0.132880698351115	2.93679900302653	0.116788321167883	6	1	9	16	176	0.155339805825243	0.484848484848485	0.165881244109331	2.9228650137741	0.0909090909090909	0.271844660194175	28	32	313	1779	1.13218052838739e-08	4.96776967501428	3.09181146032295	Inf	3.11906283280085	4.17731629392971	2.11917784303171e-05	9.45613449136892	2.73424339239036	3.64911964391887e-05	3.93127519347295	0.0769246704921621	75	73
TCGA-HF-7132-01A-11D-2053-08	0	0	1	1	1566	5	74	211	285	1275	52275	6	104	18	128	11813	7	76	10	93	11623	8	73	451	532	14267	12	73	437	522	14572	0	5	5	10	1634	0.00638569604086846	0.0191570881226054	0.112132857534999	0.170842771188865	0.00611995104039168	2	8	6	16	1664	0.0102171136653895	0.0300751879699248	0.116632788953529	0.257862203585888	0.00961538461538462	0.00830140485312899	13	895	3298	25541	1	0.112492178068604	0.0662444575487923	Inf	0.1251950187405	0.874439053972104	0.684301685113844	0.860469225356809	0.10832015308213	1	0.0971393989765175	0.00873210582068963	1553	1262
TCGA-HF-7133-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	100	1	1	5	6	93	3813	2	5	2	9	848	1	9	3	13	899	2	3	32	37	1011	4	8	22	34	1055	4	1	2	7	123	0.07	0.205882352941176	0.116587677725118	1.76590148254424	0.0569105691056911	2	0	0	2	112	0.02	0.0540540540540541	0.110781404549951	0.487934362934363	0.0178571428571429	0.08	8	52	235	1831	0.378029558082467	1.19857540071844	0.563066156290099	Inf	1.17219858156028	8.79148936170213	2.34245789942275e-06	Inf	0.325610717100079	0.987839688963676	0.299781768324336	0.153434800493624	92	85
TCGA-HF-7134-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	308	0	2	1	3	301	12341	4	17	34	55	3047	5	23	28	56	2943	6	12	69	87	3134	6	27	70	103	3217	3	7	10	20	446	0.0649350649350649	0.194174757281553	0.13863848305875	1.40058339501067	0.0448430493273543	0	2	7	9	451	0.0292207792207792	0.103448275862069	0.143905552010211	0.718862298340852	0.0199556541019956	0.0649350649350649	20	131	897	5454	0.656232651736682	0.928278725258985	0.595106450026901	Inf	0.937783782586547	1.77006688963211	0.235011646559564	2.0265197193572	0.865932003561031	0.772155559652207	0.847271048418438	0.000221155494148479	288	281
TCGA-HF-7136-01A-11D-2053-08	0	0	1	1	113	0	2	7	9	103	4223	6	4	3	13	1023	5	3	4	12	962	0	7	25	32	1106	7	16	23	46	1132	3	1	1	5	167	0.0442477876106195	0.108695652173913	0.147526501766784	0.736787294975267	0.029940119760479	0	1	3	4	145	0.0353982300884956	0.125	0.131103074141049	0.953448275862069	0.0275862068965517	0.0619469026548673	7	48	312	1926	0.661385599927879	0.900250174272838	0.399733098841396	Inf	0.912937062937063	3.07417582417582	0.0620282875521479	4.62508643042827	0.59775641025641	0.915852604640081	0.561306233061986	1	106	96
TCGA-HF-A5NB-01A-11D-A31L-08	0	0	0	0	1686	7	75	276	351	1328	54448	18	122	24	164	12101	12	133	25	170	12124	10	52	416	478	15027	9	57	450	516	15196	0	4	6	10	1729	0.00593119810201661	0.0193798449612403	0.113779942090024	0.170327428589362	0.00578368999421631	1	4	3	8	1695	0.00474495848161329	0.0167364016736402	0.112796965462168	0.148376346873033	0.00471976401179941	0.00593119810201661	10	875	3424	26799	1	0.089452256153768	0.0483064667700325	Inf	0.0997379745498706	0.464568986719134	0.898168953318871	0.434831201432156	0.0917335989941939	1	0.0821979863189835	0.00723025583982201	1676	1318
TCGA-HJ-7597-01A-21D-2201-08	0	0	0	0	984	1	25	134	159	824	33784	12	68	7	87	7398	6	61	8	75	7465	6	35	312	353	9398	3	32	274	309	9523	1	1	3	5	1069	0.00508130081300813	0.0161812297734628	0.112254541636039	0.144147662425338	0.00467726847521048	0	4	2	6	998	0.00609756097560976	0.0169971671388102	0.106192806980209	0.160059495762062	0.00601202404809619	0.00609756097560976	6	589	2067	16854	1	0.0830657069222498	0.0360044351060862	Inf	0.0923076923076923	1.01709401709402	0.647040468550034	1.01923206933694	0.078104489367288	1	0.0701746193543051	0.148606811145511	978	818
TCGA-HU-8238-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	181	0	3	3	6	175	7175	5	9	14	28	1715	11	8	11	30	1758	7	8	39	54	1828	12	10	41	63	1874	2	2	6	10	268	0.0552486187845304	0.158730158730159	0.143009605122732	1.10992655768775	0.0373134328358209	3	1	5	9	254	0.0497237569060773	0.166666666666667	0.138949671772429	1.1994750656168	0.0354330708661417	0.0883977900552486	16	83	522	3180	0.322358774268856	1.17427575074689	0.702626660424607	Inf	1.1461743875537	1.86630369026013	0.11968674908126	2.17511674317485	0.97514367816092	0.585348540480528	0.971185693560943	0.0991480719971313	165	159
TCGA-HU-8243-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	176	1	4	6	10	165	6765	3	7	1	11	1511	4	9	2	15	1563	10	12	42	64	1900	14	8	53	75	1791	4	1	5	10	211	0.0568181818181818	0.133333333333333	0.117811278615299	1.13175355450237	0.0473933649289099	2	2	0	4	231	0.0227272727272727	0.0625	0.121578947368421	0.514069264069264	0.0173160173160173	0.0625	11	108	442	3249	0.854450215197944	0.748731936633492	0.406074427557246	Inf	0.771911479523936	2.08766968325792	0.0602816472988168	2.44937138317629	0.439509407001667	0.991148297995979	0.408439891843943	1	165	154
TCGA-HU-8244-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	138	0	1	1	2	136	5576	1	6	4	11	1220	2	9	1	12	1175	2	7	47	56	1559	3	8	46	57	1622	1	0	3	4	173	0.0289855072463768	0.0701754385964912	0.106658446362515	0.657945441638779	0.023121387283237	1	1	0	2	182	0.0144927536231884	0.0357142857142857	0.116741500962155	0.305926216640502	0.010989010989011	0.036231884057971	5	93	355	2826	0.987445666514124	0.428067567449245	0.164090029616631	Inf	0.45717160103478	3.58422535211268	0.0995778646760956	5.30223972304215	0.28905043162199	0.99854772949452	0.265418073527164	1	133	131
TCGA-HU-8249-01A-11D-2340-08	0	0	0	0	171	0	2	3	5	166	6806	3	9	1	13	1550	7	7	7	21	1678	3	18	54	75	1718	7	7	43	57	1860	4	1	4	9	260	0.0526315789473684	0.157894736842105	0.139784946236559	1.12955465587045	0.0346153846153846	2	6	3	11	211	0.064327485380117	0.146666666666667	0.122817229336438	1.19418641390205	0.0521327014218009	0.0760233918128655	13	94	471	3107	0.664058463095328	0.912296494471604	0.518654853050455	Inf	0.922951763001766	4.55796178343949	0.000700489646378238	9.88283223934232	0.548208461925712	0.976812046014193	0.513144279516838	1	158	153
TCGA-HU-8602-01A-11D-2394-08	0	0	1	1	2013	5	63	342	405	1602	65682	8	140	22	170	14493	13	165	12	190	14630	17	81	561	659	18297	9	81	493	583	18262	0	2	4	6	1987	0.0029806259314456	0.0102915951972556	0.108805169203811	0.0945873736750283	0.00301962757926522	0	3	4	7	1975	0.00347739692001987	0.0106221547799697	0.107941192545226	0.0984068688653695	0.00354430379746835	0.00397416790859414	8	1072	3962	32597	1	0.0614003350274173	0.0304683372062537	Inf	0.068351188139174	0	1	0	0.0700372705790398	1	0.0629265350930936	0.00164759725400458	2005	1594
TCGA-HU-8604-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	257	0	2	6	8	248	10168	3	12	12	27	2348	3	17	18	38	2524	7	17	64	88	2529	5	23	67	95	2767	1	7	1	9	344	0.0350194552529183	0.0947368421052632	0.124322370798699	0.76202570379437	0.0261627906976744	2	4	3	9	301	0.0350194552529183	0.102272727272727	0.119019375247133	0.859294774992449	0.0299003322259136	0.0272373540856031	7	136	645	4651	0.998981500442068	0.371193331322222	0.170568584958235	Inf	0.401929853092644	2.05271317829457	0.172833336871809	2.40306702270192	0.250713059944375	0.999946255060488	0.227149660467642	1	250	241
TCGA-HU-8608-01A-11D-2394-08	0	0	0	0	107	0	3	4	7	100	4100	1	14	1	16	953	5	6	3	14	992	3	5	22	30	1077	4	8	28	40	1078	2	0	0	2	136	0.0186915887850467	0.05	0.126159554730983	0.396323529411765	0.0147058823529412	2	1	5	8	129	0.0747663551401869	0.266666666666667	0.119777158774373	2.22635658914729	0.062015503875969	0.0841121495327103	9	48	265	1890	0.268273320759519	1.33706707890224	0.65485563746979	Inf	1.28401191658391	4.64690026954178	0.00603950446492494	9.49343694362638	0.813207547169811	0.751812577545047	0.792529921979204	1	98	91
TCGA-HU-8610-01A-22D-2394-08	0	0	0	0	94	1	0	1	1	92	3772	2	3	4	9	823	2	5	3	10	849	1	6	29	36	1054	8	7	22	37	1046	1	2	4	7	130	0.074468085106383	0.189189189189189	0.124282982791587	1.52224532224532	0.0538461538461538	0	1	0	1	104	0.0106382978723404	0.0277777777777778	0.0986717267552182	0.281517094017094	0.00961538461538462	0.0531914893617021	5	55	234	1866	0.811493931388691	0.725037932498231	0.273131346194737	Inf	0.747863247863248	0.997150997150997	0.655408332366004	0.996796372268271	0.703871292106586	0.833402038977025	0.678775113840224	0.282051282051282	89	87
TCGA-HU-A4G2-01A-11D-A25D-08	0	0	1	1	75	0	1	3	4	71	2911	0	3	0	3	639	0	9	1	10	655	1	7	20	28	801	2	4	24	30	816	0	2	2	4	97	0.0533333333333333	0.133333333333333	0.118872549019608	1.12164948453608	0.0412371134020619	0	2	1	3	90	0.04	0.107142857142857	0.112359550561798	0.953571428571429	0.0333333333333333	0.04	3	44	187	1430	0.919157599554197	0.521552006451716	0.13595602454235	Inf	0.551939924906133	0	1	0	0.589572192513369	0.895950776736532	0.559699697663885	0.192307692307692	72	68
TCGA-HU-A4G3-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	133	0	3	6	9	124	5084	2	9	2	13	1144	2	5	7	14	1185	2	7	43	52	1369	1	7	37	45	1386	0	1	3	4	172	0.0300751879699248	0.0888888888888889	0.124098124098124	0.716279069767442	0.0232558139534884	0	0	1	1	160	0.0075187969924812	0.0192307692307692	0.116873630387144	0.164543269230769	0.00625	0.0300751879699248	4	79	332	2423	0.992177301127011	0.369618402496713	0.122657107971256	Inf	0.39991290463057	0	1	0	0.414909638554217	0.989677759514502	0.384206239203949	0.0476190476190476	129	120
TCGA-HU-A4G6-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	105	0	3	4	7	98	4018	2	4	5	11	943	3	4	4	11	942	5	4	32	41	1040	3	11	21	35	1093	0	2	3	5	144	0.0476190476190476	0.142857142857143	0.131747483989021	1.0843253968254	0.0347222222222222	0	0	1	1	121	0.00952380952380952	0.024390243902439	0.116346153846154	0.209635154202782	0.00826446280991736	0.0380952380952381	4	57	265	1868	0.953048254043725	0.494795090861896	0.162620935963314	Inf	0.527806990411383	0	1	0	0.60747597009612	0.907499005641492	0.575553313767985	0.0606060606060606	101	94
TCGA-HU-A4G8-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	1862	3	68	298	366	1493	61213	14	130	10	154	13401	9	138	20	167	13625	17	54	541	612	16762	8	62	490	560	17425	1	5	3	9	1939	0.00483351235230934	0.0160714285714286	0.111276901004304	0.144427355779857	0.00464156781846313	3	4	10	17	1859	0.00912996777658432	0.0277777777777778	0.110905619854433	0.250463212001674	0.00914470145239376	0.00912996777658432	17	1039	3798	30389	1	0.130920279096764	0.0830448853688613	Inf	0.144907557007675	1.44021063717746	0.29993468209132	1.52402928083175	0.113498655936633	1	0.102180874112396	0.0167005066052869	1845	1476
TCGA-HU-A4G9-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	957	2	35	160	195	760	31160	6	81	8	95	6781	5	63	13	81	6866	5	29	248	282	8689	5	28	269	302	8824	0	0	4	4	970	0.00417972831765935	0.0132450331125828	0.109927470534905	0.120488837304567	0.00412371134020619	0	5	4	9	912	0.00940438871473354	0.0319148936170213	0.104960294625388	0.304066349384099	0.00986842105263158	0.00835945663531871	8	519	1882	15631	1	0.128030509319141	0.0633088779493151	Inf	0.141260357284733	0	1	0	0.143992665936275	1	0.130545820331816	0.00164759725400458	949	752
TCGA-HU-A4GC-01A-12D-A25D-08	0	0	0	0	175	0	2	3	5	170	6970	2	8	4	14	1628	3	17	6	26	1658	4	9	47	60	1818	2	7	61	70	1866	1	0	2	3	230	0.0171428571428571	0.0428571428571429	0.123258306538049	0.347701863354037	0.0130434782608696	1	2	3	6	230	0.0342857142857143	0.1	0.126512651265127	0.790434782608696	0.0260869565217391	0.04	7	107	460	3224	0.99072643526023	0.458582583695383	0.209435694033078	Inf	0.491762013729977	2.6695652173913	0.166858247271553	3.50227909703455	0.370772946859903	0.998209823495403	0.34029292975582	0.334841628959276	168	163
TCGA-HU-A4GD-01A-11D-A25D-08	0	1	0	1	113	0	2	2	4	109	4469	6	8	4	18	1034	1	7	3	11	1021	10	3	28	41	1232	7	6	26	39	1182	0	3	3	6	140	0.0530973451327434	0.153846153846154	0.11844331641286	1.2989010989011	0.0428571428571429	1	0	5	6	158	0.0530973451327434	0.146341463414634	0.128246753246753	1.14109292991664	0.0379746835443038	0.079646017699115	9	62	298	2116	0.522114880018272	1.03073439077355	0.511154295443584	Inf	1.02684563758389	0.476510067114094	0.893435114449338	0.443900745284303	1.20009942828735	0.351919696595843	1.23478123773056	0.00942253331538567	104	100
TCGA-HU-A4GF-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	179	1	2	10	12	166	6806	4	16	11	31	1639	6	13	7	26	1617	3	8	38	49	1784	5	11	44	60	1766	1	2	3	6	232	0.0335195530726257	0.1	0.131370328425821	0.761206896551724	0.0258620689655172	0	2	4	6	236	0.0335195530726257	0.122448979591837	0.132286995515695	0.925631269456935	0.0254237288135593	0.0446927374301676	8	82	468	3082	0.91795404089927	0.64255274676964	0.308519792083279	Inf	0.674264007597341	0.948183760683761	0.677614113140884	0.940789768501055	0.647540129247446	0.926286414684837	0.614714301528322	0.0271907389958272	171	158
TCGA-HU-A4GH-01A-11D-A24D-08	0	0	0	0	849	0	4	6	10	835	34235	40	99	196	335	8666	29	113	208	350	8613	14	10	41	65	8370	13	15	57	85	8586	2	3	5	10	1266	0.0117785630153121	0.117647058823529	0.147449336128581	0.797881237803178	0.00789889415481832	4	4	7	15	1350	0.0176678445229682	0.230769230769231	0.161290322580645	1.43076923076923	0.0111111111111111	0.0212014134275618	18	107	2616	14340	0.662036557462385	0.922130086981453	0.575762725759852	Inf	0.933357798165138	1.44036697247706	0.22938657775157	1.56613354293308	0.793671597079199	0.844431802806778	0.764893230244065	0.139785384641228	831	817
TCGA-HU-A4GJ-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	4	0	0	1	1	3	123	0	0	0	0	22	0	1	0	1	22	0	1	0	1	28	0	0	1	1	51	0	0	0	0	0	0	0	0	NaN	NaN	0	1	0	1	4	0.25	1	0.142857142857143	7	0.25	0	0	1	4	75	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	4	3
TCGA-HU-A4GN-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	1504	1	52	220	272	1231	50471	10	86	12	108	11096	7	87	18	112	11368	9	62	441	512	13983	9	74	416	499	14024	1	4	7	12	1596	0.00797872340425532	0.0240480961923848	0.113804905875642	0.211309837720554	0.0075187969924812	2	2	8	12	1600	0.00797872340425532	0.0234375	0.11442465851391	0.2048291015625	0.0075	0.011968085106383	18	857	3196	24811	1	0.163058454443433	0.104813707103642	Inf	0.180270337922403	1.46052357113058	0.338712475364437	1.55259064801541	0.153380538391776	1	0.138302913992797	0.000781910508693529	1486	1213
TCGA-HU-A4GP-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	263	1	5	5	10	251	10291	6	12	6	24	2387	13	12	7	32	2450	9	27	50	86	2795	15	24	70	109	2659	4	5	4	13	353	0.0494296577946768	0.119266055045872	0.132756675441895	0.898380850897939	0.0368271954674221	1	3	4	8	346	0.0304182509505703	0.0930232558139535	0.123792486583184	0.751445086705202	0.023121387283237	0.0494296577946768	13	131	699	4755	0.935327627409377	0.675106756866052	0.388134683897776	Inf	0.704399141630901	1.6255364806867	0.187161400096517	1.78991458157291	0.520171673819742	0.989328999755731	0.485948030217666	0.505475577859527	250	238
TCGA-HU-A4GQ-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	2199	2	82	293	375	1821	74661	17	135	12	164	15830	21	117	27	165	16513	8	79	685	772	20859	5	92	623	720	21459	1	7	9	17	2367	0.00773078672123693	0.0236111111111111	0.110303369215714	0.214056118856499	0.00718208702999578	0	6	6	12	2266	0.00545702592087312	0.0155440414507772	0.108634162711539	0.143086125605367	0.00529567519858782	0.00727603456116417	16	1305	4633	37685	1	0.0997300123687415	0.062317618265912	Inf	0.110631805238822	0.702618340002324	0.778522808648131	0.677842080589924	0.104748147018695	1	0.0943646232092334	5.79555442177159e-05	2183	1805
TCGA-HU-A4GT-01A-21D-A25D-08	0	0	0	0	1913	3	107	250	357	1553	63673	11	218	41	270	14191	21	186	24	231	14353	4	101	422	527	17641	12	71	442	525	17488	4	4	3	11	2013	0.00575013068478829	0.020952380952381	0.115107502287283	0.182024460057247	0.00546448087431694	1	8	8	17	1988	0.00888656560376372	0.032258064516129	0.112692024261663	0.286249756604141	0.0085513078470825	0.00836382645060115	16	864	4001	31128	1	0.144078941089847	0.0899268139596272	Inf	0.159637363386426	2.7437671832042	0.0285245593901381	3.5361884016495	0.111783107463875	1	0.100331810096237	0.137927660135887	1897	1537
TCGA-HU-A4GU-01A-11D-A25D-08	0	0	1	1	1815	6	40	194	234	1575	64575	17	84	44	145	14095	14	89	49	152	14578	6	116	513	635	17842	11	125	507	643	18060	2	12	17	31	2020	0.0170798898071625	0.0482115085536547	0.111849390919158	0.431039526969804	0.0153465346534653	3	15	8	26	2045	0.0143250688705234	0.0409448818897638	0.114617195381684	0.35723158077123	0.0127139364303178	0.0165289256198347	30	1007	4065	31837	1	0.23333140608248	0.166962652317076	Inf	0.25550569874069	2.59764127053035	0.0358972048524951	3.26295698145714	0.216470105877529	1	0.19678816041622	3.23769204761885e-05	1785	1545
TCGA-HU-A4GX-01A-12D-A25D-08	0	0	0	0	1556	1	48	263	311	1243	50963	7	79	13	99	10847	10	88	8	106	11105	3	65	455	523	14458	5	60	450	515	14553	0	4	4	8	1546	0.0051413881748072	0.0155339805825243	0.106232391946678	0.146226403245456	0.00517464424320828	0	3	3	6	1505	0.0038560411311054	0.011472275334608	0.104094618896113	0.110210070955324	0.00398671096345515	0.0044987146529563	7	906	3051	25960	1	0.0657427377428634	0.0307505692570337	Inf	0.0729033951125859	0	1	0	0.0735478450141336	1	0.0663284174886269	0.00579710144927537	1549	1236
TCGA-HU-A4GY-01A-21D-A24D-08	0	0	0	0	93	0	0	1	1	91	3731	3	1	0	4	809	4	3	3	10	841	2	2	24	28	1070	5	12	32	49	1011	0	2	1	3	116	0.032258064516129	0.0612244897959184	0.114737883283877	0.533603096410978	0.0258620689655172	0	1	1	2	119	0.021505376344086	0.0714285714285714	0.111214953271028	0.642256902761104	0.0168067226890756	0.021505376344086	2	61	235	1846	0.994948503333034	0.257650638261662	0.0445342445055655	Inf	0.28112124282337	0	1	0	0.316261398176292	0.989652255904468	0.291044279968443	0.444444444444444	91	89
TCGA-HU-A4H0-01A-11D-A25D-08	0	0	1	1	202	0	3	2	5	197	8077	8	20	2	30	1851	4	15	4	23	1939	8	11	64	83	2046	4	11	46	61	2241	0	3	3	6	284	0.0297029702970297	0.0983606557377049	0.126729138777332	0.776148695451397	0.0211267605633803	2	2	4	8	258	0.0396039603960396	0.0963855421686747	0.126099706744868	0.764359764639955	0.0310077519379845	0.0445544554455446	9	113	542	3745	0.976199765730951	0.550383193846873	0.279097447771607	Inf	0.583494646421874	1.31826568265683	0.460164631605463	1.38179786091197	0.503337806105334	0.988678663544296	0.469646908979833	0.103188405797102	193	188
TCGA-HU-A4H2-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	200	0	2	3	5	195	7995	8	12	12	32	1908	6	14	8	28	1931	4	16	41	61	2038	3	14	57	74	2118	0	0	5	5	276	0.025	0.0675675675675676	0.130311614730878	0.518507638072855	0.0181159420289855	0	0	2	2	229	0.01	0.0327868852459016	0.112365063788027	0.291788961271387	0.00873362445414847	0.035	7	98	505	3651	0.976167435922917	0.516471403123528	0.235507743758442	Inf	0.548646864686469	0	1	0	0.587835926449788	0.960143661202703	0.556193887289775	0.000582750582750584	193	188
TCGA-HU-A4H3-01A-21D-A25D-08	0	0	0	0	1084	1	41	191	232	851	34891	12	62	12	86	7832	3	72	20	95	7938	6	50	277	333	9661	7	58	272	337	9460	1	3	2	6	1107	0.00553505535055351	0.0178041543026706	0.117019027484144	0.152147515540437	0.00542005420054201	0	8	6	14	1143	0.0129151291512915	0.042042042042042	0.11831073387848	0.35535272805614	0.0122484689413823	0.00830258302583026	9	553	2250	16871	1	0.122038753390815	0.0632807476682881	Inf	0.136092526690391	0.653709401709402	0.803603427627375	0.624865042618934	0.123835660797409	1	0.110885164833502	0.0196560196560197	1075	842
TCGA-HU-A4H4-01A-21D-A25D-08	0	0	0	0	809	0	18	69	87	722	29602	9	122	28	159	6977	19	114	31	164	6994	3	49	149	201	7829	4	45	149	198	7802	1	4	5	10	992	0.0123609394313968	0.0505050505050505	0.127146885413996	0.397218149234278	0.0100806451612903	0	3	4	7	979	0.00865265760197775	0.0348258706467662	0.125047898837655	0.27850024646939	0.00715015321756895	0.0123609394313968	10	295	1971	13660	0.999999996629453	0.23494442117632	0.126091256938886	Inf	0.260016135605626	1.13292744799594	0.610831866363679	1.15505472036033	0.239511507462229	0.999999998525415	0.215840301468575	0.00659992584352986	799	712
TCGA-HU-A4H5-01A-21D-A25D-08	0	0	0	0	307	2	0	14	14	291	11931	16	14	14	44	2751	17	15	9	41	2907	35	26	54	115	3077	18	31	42	91	3196	4	4	3	11	422	0.0358306188925081	0.120879120879121	0.132040050062578	0.915473152439977	0.0260663507109005	5	3	5	13	383	0.0423452768729642	0.11304347826087	0.124471888202795	0.908184810988761	0.0339425587467363	0.0553745928338762	17	132	805	5468	0.732433233799542	0.874840169612866	0.540340279620776	Inf	0.889082496144066	1.32326262744638	0.236164111620402	1.38929946985957	0.649378881987578	0.935816044582	0.61754430344092	1	290	274
TCGA-HU-A4H6-01A-11D-A25D-08	0	0	0	0	145	0	1	0	1	144	5904	2	6	5	13	1362	3	6	3	12	1358	4	8	48	60	1574	2	7	50	59	1610	1	2	2	5	179	0.0344827586206897	0.0847457627118644	0.111180124223602	0.762238424391629	0.0279329608938547	0	2	1	3	177	0.0206896551724138	0.05	0.112452350698856	0.444632768361582	0.0169491525423729	0.0275862068965517	4	100	356	2828	0.997763597991957	0.317825277730479	0.106012223358005	Inf	0.343993085566119	1.49063670411985	0.50968216087306	1.588477395199	0.273790415042421	0.999119864100728	0.250921146592094	0.569230769230769	141	140
TCGA-HU-A4H8-01A-11D-A25D-08	0	0	1	1	1461	3	60	203	263	1195	48995	14	61	10	85	10518	7	50	9	66	10418	15	65	470	550	13979	5	54	435	494	14080	0	2	10	12	1442	0.0082135523613963	0.0242914979757085	0.102414772727273	0.23718744209291	0.00832177531206657	1	4	2	7	1506	0.00479123887748118	0.0127272727272727	0.107733028113599	0.118137148376192	0.00464807436918991	0.00889801505817933	13	912	2948	25111	1	0.12142270695815	0.0714808772843965	Inf	0.133766181378122	0.475898914518318	0.891389450983188	0.44832378297352	0.126205236999333	1	0.114467270276599	0.00036362439032072	1448	1182
TCGA-HU-A4HB-01A-12D-A25D-08	0	0	0	0	16	0	0	0	0	16	656	1	0	3	4	107	0	2	2	4	182	0	0	4	4	175	0	1	3	4	192	0	0	0	0	30	0	0	0.15625	0	0	0	0	0	0	16	0	0	0.0914285714285714	0	0	0	0	7	46	321	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	16	16
TCGA-HU-A4HD-01A-11D-A25D-08	1	0	0	1	222	0	5	1	6	216	8856	4	18	8	30	2185	10	9	9	28	2098	12	22	44	78	2211	11	13	56	80	2362	5	3	7	15	300	0.0675675675675676	0.1875	0.12701100762066	1.47625	0.05	2	5	9	16	319	0.0720720720720721	0.205128205128205	0.144278606965174	1.42175066312997	0.0501567398119122	0.103603603603604	23	100	619	3954	0.0695035196894793	1.46903504548492	0.958640132650206	Inf	1.38144397599065	2.24843717075227	0.0287520581909497	2.79375431521282	1.18203554119548	0.278591585896834	1.21664131771334	0.0343651784962589	199	193
TCGA-IN-7806-01A-11D-2053-08	0	0	0	0	89	0	2	2	4	85	3485	2	4	2	8	810	4	8	1	13	777	0	5	38	43	942	2	6	13	21	956	0	2	5	7	102	0.0786516853932584	0.333333333333333	0.106694560669456	3.12418300653595	0.0686274509803922	0	0	4	4	118	0.0449438202247191	0.0930232558139535	0.125265392781316	0.742609381158849	0.0338983050847458	0.101123595505618	9	44	220	1678	0.160782065792541	1.55970105610311	0.758944788389564	Inf	1.46500857632933	0	1	0	1.52245989304813	0.1358075795011	1.63391830397622	0.000221141088014153	80	76
TCGA-IN-7808-01A-11D-2201-08	0	0	0	0	135	0	5	3	8	127	5207	2	8	2	12	1205	4	7	6	17	1259	3	10	31	44	1330	6	11	37	54	1413	1	3	1	5	175	0.037037037037037	0.0925925925925926	0.123849964614296	0.747619047619048	0.0285714285714286	0	1	2	3	160	0.0222222222222222	0.0681818181818182	0.120300751879699	0.566761363636364	0.01875	0.0296296296296296	4	73	335	2408	0.987702638984306	0.393958276910783	0.130559719037664	Inf	0.425353750726885	0.909784411276949	0.690796314657008	0.898524671848257	0.361237928007024	0.991854059412963	0.331843283447033	0.569230769230769	131	123
TCGA-IN-8462-01A-11D-2340-08	1	0	0	1	160	0	5	6	11	149	6109	3	5	2	10	1361	3	9	8	20	1467	2	20	33	55	1552	5	18	41	64	1729	0	2	4	6	226	0.0375	0.09375	0.130711393869289	0.717228982300885	0.0265486725663717	1	2	2	5	202	0.03125	0.0909090909090909	0.130154639175258	0.698469846984698	0.0247524752475248	0.04375	7	74	428	2853	0.9153628684399	0.630631433986233	0.28518122196957	Inf	0.662484135225568	1.09512683578104	0.624543504208701	1.11090980241394	0.621558474362213	0.931113301497214	0.588244714014402	0.0634674922600621	153	142
TCGA-IN-8663-01A-11D-2394-08	0	0	1	1	198	0	4	3	7	191	7831	4	12	15	31	1773	5	20	21	46	1958	6	9	45	60	2048	7	10	37	54	2052	3	2	3	8	274	0.0404040404040404	0.148148148148148	0.133528265107212	1.10948905109489	0.0291970802919708	0	0	3	3	279	0.0151515151515152	0.05	0.13623046875	0.367025089605735	0.010752688172043	0.0454545454545455	9	86	553	3547	0.90626470401525	0.671299964868826	0.338071489917083	Inf	0.702388883601409	1.71094728056753	0.252411202437574	1.92395963872593	0.54249547920434	0.971675506795199	0.506442897783831	0.386996904024768	189	182
TCGA-IN-A6RI-01A-11D-A32N-08	0	0	0	0	113	0	0	1	1	112	4592	2	10	10	22	1154	2	14	7	23	1120	1	5	26	32	1113	5	3	27	35	1205	0	1	1	2	152	0.0176991150442478	0.0571428571428571	0.126141078838174	0.453007518796992	0.0131578947368421	1	1	2	4	181	0.0353982300884956	0.125	0.162623539982031	0.768646408839779	0.0220994475138122	0.0353982300884956	4	55	333	1985	0.976597152548118	0.433636288208278	0.142547045488445	Inf	0.471929556675319	1.16016016016016	0.606241049283842	1.19208061481254	0.394016658167602	0.986386812225576	0.357764575587807	0.545454545454546	109	108
TCGA-IN-A6RJ-01A-21D-A33T-08	0	0	0	0	161	1	1	7	8	152	6232	3	15	18	36	1391	10	14	11	35	1670	7	6	32	45	1497	6	5	25	36	1674	4	1	1	6	231	0.0372670807453416	0.166666666666667	0.137992831541219	1.20779220779221	0.025974025974026	3	1	1	5	204	0.031055900621118	0.111111111111111	0.13627254509018	0.815359477124183	0.0245098039215686	0.0559006211180124	9	61	435	2736	0.635588349495509	0.927987479696983	0.461230982379255	Inf	0.937241379310345	3.92519893899204	0.000763829147097541	7.32967607630422	0.255777374470659	0.997657424750976	0.228776400602574	0.0804953560371517	152	143
TCGA-IN-A6RL-01A-11D-A32N-08	0	0	0	0	524	4	6	9	15	505	20705	18	57	29	104	5248	12	49	38	99	5240	18	65	79	162	5193	24	65	51	140	5024	5	32	9	46	730	0.0877862595419847	0.328571428571429	0.145302547770701	2.2612915851272	0.063013698630137	5	29	7	41	749	0.0782442748091603	0.253086419753086	0.14423262083574	1.75470998368195	0.054739652870494	0.049618320610687	26	146	1479	8738	0.439590154373023	1.0521228355146	0.713995919796243	Inf	1.0442395081529	1.6447728516694	0.073836068221907	1.84611175003691	0.850221043324492	0.792475144369255	0.829213763064431	0.287603727957323	498	479
TCGA-IN-A6RN-01A-12D-A33T-08	0	0	0	0	132	1	1	1	2	129	5289	5	9	3	17	1339	7	4	2	13	1272	9	9	37	55	1327	11	11	22	44	1351	4	3	4	11	189	0.0833333333333333	0.25	0.139896373056995	1.78703703703704	0.0582010582010582	2	0	7	9	194	0.0681818181818182	0.163636363636364	0.14619442351168	1.11930646672915	0.0463917525773196	0.128787878787879	17	62	383	2295	0.0564670160850268	1.64266098282212	0.981839761830989	Inf	1.50464355355785	2.0976501305483	0.0565737828823886	2.56681552097624	1.30362437491702	0.220246987590216	1.37302574840905	0.200287272812301	115	112
TCGA-IN-A6RO-01A-12D-A33T-08	0	0	0	0	328	2	3	11	14	312	12792	14	11	8	33	2926	11	10	12	33	3179	24	21	72	117	3298	21	40	68	129	3389	8	11	11	30	467	0.0914634146341463	0.232558139534884	0.137798760696371	1.68766495692446	0.0642398286937901	12	5	7	24	419	0.0731707317073171	0.205128205128205	0.127046694966646	1.61458907043633	0.0572792362768496	0.115853658536585	38	147	886	5801	0.00435159124388945	1.69236728704736	1.21788542105861	Inf	1.55027759136111	3.35440180586907	3.52114820922871e-07	5.23590924455736	0.970380522412125	0.592274337055666	0.966012006954225	0.840482421692892	290	274
TCGA-IN-A6RP-01A-21D-A33T-08	0	0	0	0	203	1	4	13	17	185	7585	5	7	2	14	1847	1	4	6	11	1771	6	10	66	82	1974	10	14	54	78	1993	5	3	7	15	264	0.0738916256157636	0.192307692307692	0.132463622679378	1.45177738927739	0.0568181818181818	4	1	6	11	285	0.0541871921182266	0.134146341463415	0.144376899696049	0.929139922978177	0.0385964912280702	0.108374384236453	22	114	549	3418	0.253115348027936	1.20140534361897	0.780033590292816	Inf	1.16888996035573	4.06454918032787	8.91278862873795e-05	7.99736341250856	0.782802064359441	0.860695069833728	0.756461195030981	0.400105410870232	181	163
TCGA-IN-A6RR-01A-12D-A32N-08	0	0	0	0	188	1	2	6	8	179	7339	2	10	10	22	1758	1	9	10	20	1651	2	8	58	68	1984	4	17	48	69	1946	1	2	5	8	197	0.0425531914893617	0.115942028985507	0.101233299075026	1.14529537261826	0.0406091370558376	0	1	8	9	247	0.0478723404255319	0.132352941176471	0.124495967741935	1.06311026434865	0.0364372469635627	0.074468085106383	14	98	444	3486	0.39006376179321	1.12155904390642	0.651511069414324	Inf	1.10641891891892	1.47522522522523	0.513416508689581	1.5700440145158	1.08554309026007	0.424012320835862	1.09750948116591	5.91102298313207e-05	174	165
TCGA-IN-A6RS-01A-12D-A34U-08	0	0	0	0	114	0	2	3	5	109	4469	0	0	3	3	988	0	2	1	3	1053	5	9	36	50	1178	5	11	37	53	1250	1	2	3	6	171	0.0526315789473684	0.113207547169811	0.1368	0.827540549486925	0.0350877192982456	1	0	3	4	119	0.0350877192982456	0.08	0.101018675721562	0.791932773109244	0.0336134453781513	0.0701754385964912	8	75	290	2138	0.787315311521629	0.786460168311946	0.375322563731349	Inf	0.806979642708766	1.67448275862069	0.340894657697146	1.84250665553472	0.68814359943316	0.880111956939981	0.66031119520092	0.169802333889021	106	101
TCGA-IN-A7NR-01A-11D-A34U-08	0	0	0	0	89	0	1	1	2	87	3567	4	7	7	18	907	2	5	14	21	935	2	2	15	19	814	4	2	23	29	911	0	0	2	2	154	0.0224719101123595	0.0689655172413793	0.169045005488474	0.407971339005822	0.012987012987013	1	1	1	3	126	0.0337078651685393	0.157894736842105	0.154791154791155	1.02005012531328	0.0238095238095238	0.0449438202247191	4	40	280	1445	0.940381469544733	0.516230566344053	0.167472275752945	Inf	0.560064935064935	1.02678571428571	0.655098892140911	1.03212773476275	0.486372180451128	0.957591942354289	0.442498871667395	0.523809523809524	85	83
TCGA-IN-A7NT-01A-21D-A34U-08	0	0	0	0	126	2	4	6	10	114	4674	2	4	5	11	1129	3	14	9	26	1157	4	5	32	41	1206	3	11	22	36	1182	1	2	4	7	166	0.0555555555555556	0.194444444444444	0.140439932318105	1.38453815261044	0.0421686746987952	3	1	3	7	156	0.0555555555555556	0.170731707317073	0.129353233830846	1.31988742964353	0.0448717948717949	0.0873015873015873	11	50	322	2066	0.198019918232966	1.41132624421945	0.741863018463881	Inf	1.33733835658283	4.23779946761313	0.00841406892395412	8.54078288230215	0.961352657004831	0.605687041511125	0.955608329846559	0.440071192473938	115	103
TCGA-IN-A7NU-01A-22D-A34U-08	0	1	0	1	99	0	1	4	5	93	3813	3	7	8	18	944	5	8	4	17	962	3	5	18	26	938	2	5	25	32	969	1	0	1	2	120	0.0202020202020202	0.0625	0.123839009287926	0.5046875	0.0166666666666667	0	1	2	3	125	0.0303030303030303	0.115384615384615	0.133262260127932	0.865846153846154	0.024	0.0404040404040404	4	44	245	1662	0.879057208954684	0.616826893867984	0.200763679491967	Inf	0.648639455782313	1.55673469387755	0.498120352221684	1.69534671068694	0.543046986236355	0.926021563082744	0.508914959395337	0.523809523809524	95	89
TCGA-IN-AB1V-01A-21D-A410-08	0	1	1	2	66	1	1	4	5	60	2460	2	1	1	4	544	3	3	1	7	605	2	6	18	26	656	1	4	18	23	655	0	0	2	2	87	0.0303030303030303	0.0869565217391304	0.132824427480916	0.654672663668166	0.0229885057471264	0	1	2	3	67	0.0454545454545455	0.115384615384615	0.102134146341463	1.12973593570608	0.0447761194029851	0.0606060606060606	4	35	154	1157	0.688246317120263	0.858742098645682	0.275492964422997	Inf	0.873126873126873	0	1	0	0.945887445887446	0.625816361275898	0.939158338133602	0.0476190476190476	62	56
TCGA-IN-AB1X-01A-11D-A397-08	0	0	0	0	125	1	2	4	6	118	4838	6	9	8	23	1183	2	6	5	13	1164	3	11	28	42	1219	1	10	29	40	1272	1	2	0	3	174	0.024	0.075	0.136792452830189	0.548275862068966	0.0172413793103448	2	2	4	8	167	0.064	0.19047619047619	0.136997538966366	1.3903621328771	0.0479041916167665	0.056	7	54	341	2150	0.746128729833177	0.817373441544932	0.365023655004364	Inf	0.838277005913177	5.47873900293255	0.00933730828639264	18.8755838122261	0.512630549981993	0.961165906582225	0.475956382841931	1	118	111
TCGA-IP-7968-01A-11D-2201-08	0	0	0	0	121	0	4	0	4	116	4756	6	5	3	14	1038	1	2	2	5	1038	1	8	33	42	1300	2	7	46	55	1380	0	0	1	1	147	0.00826446280991736	0.0181818181818182	0.106521739130435	0.170686456400742	0.00680272108843537	1	4	2	7	164	0.0578512396694215	0.166666666666667	0.126153846153846	1.32113821138211	0.0426829268292683	0.0330578512396694	4	78	311	2369	0.988466776381858	0.390727620249336	0.129634843572197	Inf	0.420359187514705	2.87245444801715	0.309968843560313	3.80567661424286	0.327241645976637	0.995951053438994	0.300769573857792	0.569230769230769	117	112
TCGA-KB-A6F5-01A-12D-A33T-08	0	0	0	0	75	1	2	4	6	67	2747	1	4	2	7	646	1	6	2	9	593	0	1	22	23	785	2	4	22	28	723	1	0	1	2	92	0.0266666666666667	0.0714285714285714	0.127247579529737	0.561335403726708	0.0217391304347826	0	1	3	4	83	0.0533333333333333	0.173913043478261	0.105732484076433	1.64484023048717	0.0481927710843374	0.0666666666666667	5	41	175	1333	0.631647172801377	0.928952143535519	0.344844306741374	Inf	0.936645962732919	4.30857142857143	0.219595451573122	7.59825446216023	0.783376623376623	0.766481232342906	0.761835550282796	0.242424242424242	70	62
TCGA-KB-A6F7-01A-12D-A32N-08	0	0	0	0	124	1	2	8	10	113	4633	6	12	6	24	1147	3	3	4	10	1126	5	17	22	44	1179	6	11	18	35	1181	3	0	0	3	165	0.0241935483870968	0.0857142857142857	0.139712108382726	0.613506493506494	0.0181818181818182	1	3	1	5	160	0.0403225806451613	0.113636363636364	0.135708227311281	0.837357954545455	0.03125	0.0403225806451613	5	46	325	2035	0.847780877349007	0.680697886901689	0.255325496100978	Inf	0.711915535444947	2.64055944055944	0.0540312467724307	3.57524001706207	0.181538461538462	0.997236570248566	0.160616548895819	0.282051282051282	119	108
TCGA-KB-A93G-01A-11D-A397-08	0	0	0	0	91	0	0	2	2	89	3649	2	1	1	4	812	2	0	1	3	874	4	8	30	42	970	3	11	26	40	993	1	2	2	5	127	0.0549450549450549	0.125	0.127895266868077	0.977362204724409	0.0393700787401575	2	0	2	4	123	0.043956043956044	0.0952380952380952	0.12680412371134	0.751064653503678	0.032520325203252	0.0769230769230769	7	56	250	1713	0.706017948094746	0.856573694167651	0.382067414075534	Inf	0.872444444444444	3.36514285714286	0.0493571956142739	5.13205532025816	0.560857142857143	0.936245420306042	0.527211278344217	1	84	82
TCGA-KB-A93J-01A-11D-A397-08	0	1	0	1	151	8	55	45	100	42	1722	2	4	3	9	439	0	4	0	4	460	0	3	9	12	412	3	7	7	17	411	1	1	0	2	67	0.0132450331125828	0.117647058823529	0.16301703163017	0.721685689201054	0.0298507462686567	0	1	1	2	63	0.0132450331125828	0.166666666666667	0.152912621359223	1.08994708994709	0.0317460317460317	0.0132450331125828	2	17	130	693	0.825675796694444	0.627449054039256	0.102334202896109	Inf	0.666396761133603	2.11025641025641	0.404726838900774	2.66109713477818	0.395673076923077	0.935628963791596	0.355690197552008	1	149	40
TCGA-MX-A5UG-01A-21D-A31L-08	0	0	0	0	50	0	0	1	1	49	2009	2	4	0	6	499	1	1	3	5	479	0	2	20	22	507	3	0	13	16	524	0	0	4	4	72	0.08	0.25	0.137404580152672	1.81944444444444	0.0555555555555556	0	0	2	2	85	0.04	0.0909090909090909	0.167652859960552	0.542245989304813	0.0235294117647059	0.12	6	30	157	874	0.479132045998652	1.11329110650355	0.445655464536532	Inf	1.09447983014862	0	1	0	1.19397799652577	0.393905090542022	1.23681896261246	0.00216450216450216	44	43
TCGA-MX-A5UJ-01A-11D-A31L-08	0	0	0	0	1765	3	90	269	359	1402	57482	9	88	18	115	12272	6	107	14	127	12635	12	53	517	582	16223	8	67	503	578	16352	1	3	8	12	1726	0.00679886685552408	0.0207612456747405	0.105552837573386	0.196690549984563	0.00695249130938586	0	5	6	11	1723	0.00623229461756374	0.0189003436426117	0.106207236639339	0.17795721120957	0.00638421358096344	0.0084985835694051	15	1025	3449	29126	1	0.123585585542478	0.0758562933215689	Inf	0.13622259517809	0.47223832995071	0.893349796164297	0.444469229456337	0.129634051359019	1	0.117525089011056	7.53731610226221e-05	1750	1387
TCGA-MX-A663-01A-11D-A31L-08	0	0	0	0	94	1	1	3	4	88	3608	0	1	1	2	813	1	4	2	7	867	5	9	21	35	967	5	8	31	44	961	0	0	3	3	113	0.0319148936170213	0.0681818181818182	0.117585848074922	0.579847144006436	0.0265486725663717	2	1	4	7	124	0.074468085106383	0.2	0.1282316442606	1.55967741935484	0.0564516129032258	0.0957446808510638	9	53	237	1691	0.356236371124215	1.21147226323953	0.595392929312302	Inf	1.18089015924867	1.62700421940928	0.354723306907177	1.78309601257898	1.09509899383317	0.463768775392696	1.1097949120488	0.0697785186949274	85	79
TCGA-MX-A666-01A-11D-A31L-08	0	1	1	2	131	1	4	6	10	120	4920	1	4	7	12	1152	3	6	4	13	1163	4	11	30	45	1264	7	11	32	50	1341	3	2	6	11	186	0.083969465648855	0.22	0.138702460850112	1.58612903225806	0.0591397849462366	2	4	4	10	164	0.0763358778625954	0.222222222222222	0.129746835443038	1.71273712737127	0.0609756097560976	0.114503816793893	15	58	350	2255	0.0632561302485983	1.66587467115951	0.962508093346723	Inf	1.5293542074364	3.38311688311688	0.0102586653443719	5.36349521246004	1.20046082949309	0.32248586173309	1.23889284645537	0.197108337616762	116	105
TCGA-R5-A7O7-01A-11D-A33T-08	0	0	0	0	153	1	2	6	8	144	5904	1	6	6	13	1465	1	9	5	15	1337	6	11	37	54	1546	6	13	43	62	1556	3	2	3	8	198	0.0522875816993464	0.129032258064516	0.127249357326478	1.01401107852721	0.0404040404040404	1	0	4	5	212	0.0326797385620915	0.0925925925925926	0.137128072445019	0.675227113906359	0.0235849056603774	0.0718954248366013	11	81	410	2692	0.684644890878252	0.891718803585078	0.479270741889329	Inf	0.904612937433722	2.5219512195122	0.0636291274602629	3.28111265829443	0.662012195121951	0.915848226320426	0.62968130601476	0.428307982231794	142	133
TCGA-R5-A7ZE-01B-11D-A34U-08	0	0	0	0	152	4	2	4	6	142	5822	3	8	10	21	1381	2	9	10	21	1379	5	9	43	57	1539	3	7	33	43	1523	0	0	3	3	201	0.0197368421052632	0.0697674418604651	0.131976362442548	0.528635890315863	0.0149253731343284	1	3	2	6	222	0.0394736842105263	0.105263157894737	0.144249512670565	0.72972972972973	0.027027027027027	0.0394736842105263	6	78	423	2639	0.980132946385326	0.479994163796151	0.20220305644381	Inf	0.517055048969943	0.904846335697399	0.695928385933452	0.891258410035533	0.476234913524947	0.984188047565269	0.439434470516726	0.131221719457014	146	136
TCGA-R5-A7ZF-01A-11D-A34U-08	0	0	0	0	60	0	0	4	4	56	2296	0	2	0	2	564	0	7	1	8	528	3	3	23	29	619	0	5	12	17	585	0	1	0	1	64	0.0166666666666667	0.0588235294117647	0.109401709401709	0.537683823529412	0.015625	0	0	0	0	67	0	0	0.108239095315024	0	0	0	0	38	131	1073	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	60	56
TCGA-R5-A7ZI-01A-11D-A34U-08	0	0	0	0	923	0	39	135	174	748	30668	9	66	10	85	7079	14	62	16	92	7065	6	43	240	289	8155	6	44	232	282	8369	1	4	7	12	1002	0.0130010834236186	0.0425531914893617	0.119727566017445	0.355416825922623	0.0119760479041916	1	5	5	11	1000	0.0119176598049837	0.0380622837370242	0.122624156958921	0.310397923875433	0.011	0.0151679306608884	14	470	2002	14522	0.99999999999989	0.216080133330751	0.129522163068079	Inf	0.238744726348032	1.37562437562438	0.436697340090257	1.45070556716573	0.209841006451176	0.999999999999986	0.189238300609461	0.00307829099661205	909	734
TCGA-R5-A7ZR-01A-11D-A34U-08	0	0	0	0	80	0	5	1	6	74	3034	1	5	1	7	730	3	5	2	10	672	1	5	22	28	766	3	4	22	29	866	0	2	3	5	113	0.0625	0.172413793103448	0.130484988452656	1.32133048519988	0.0442477876106195	1	1	1	3	103	0.0375	0.107142857142857	0.134464751958225	0.796809986130374	0.029126213592233	0.0625	5	43	216	1416	0.778181782757727	0.762386438519352	0.284199859312891	Inf	0.787037037037037	1.88888888888889	0.434343949819555	2.18382305321709	0.686868686868687	0.85014775700584	0.655698902941279	0.282051282051282	75	69
TCGA-R5-A804-01A-11D-A364-08	0	0	0	0	87	1	2	4	6	80	3280	2	5	3	10	750	2	1	4	7	830	0	14	24	38	825	2	7	16	25	875	1	1	2	4	104	0.0459770114942529	0.16	0.118857142857143	1.34615384615385	0.0384615384615385	0	1	1	2	112	0.0229885057471264	0.0526315789473684	0.135757575757576	0.387687969924812	0.0178571428571429	0.0459770114942529	4	38	216	1484	0.79749750755215	0.723317222154728	0.233753606611045	Inf	0.749559082892416	3.93518518518519	0.238804021412717	6.85631595665074	0.590277777777778	0.897133254278601	0.557209858391052	0.545454545454546	83	76
TCGA-R5-A805-01A-11D-A364-08	0	0	0	0	135	0	0	2	2	133	5453	4	12	28	44	1363	2	7	22	31	1335	2	4	26	32	1428	5	3	18	26	1327	2	0	1	3	185	0.0222222222222222	0.115384615384615	0.139412207987943	0.827650727650728	0.0162162162162162	0	0	5	5	196	0.037037037037037	0.15625	0.137254901960784	1.13839285714286	0.0255102040816327	0.0592592592592593	8	43	381	2374	0.412177926980813	1.15916129414321	0.541791413375425	Inf	1.13426998095826	2.06599175103112	0.251829858784872	2.49126094101264	0.986041517537581	0.581816574445565	0.983842437570612	0.131934731934732	127	125
TCGA-RD-A7BS-01A-11D-A32N-08	0	0	0	0	68	0	0	3	3	65	2665	1	3	1	5	594	0	2	2	4	621	1	3	25	29	707	2	5	20	27	743	2	2	4	8	95	0.117647058823529	0.296296296296296	0.1278600269179	2.31734892787524	0.0842105263157895	0	2	2	4	78	0.0588235294117647	0.137931034482759	0.11032531824611	1.25022104332449	0.0512820512820513	0.117647058823529	8	40	173	1277	0.215219866495696	1.47585581686253	0.681586218118581	Inf	1.39691714836224	5.58766859344894	0.039857219309237	14.710382232663	1.11753371868979	0.456733648238057	1.13548770309151	0.193027325346615	60	57
TCGA-RD-A7BT-01A-11D-A33T-08	0	0	0	0	281	1	4	8	12	268	10988	7	20	43	70	2852	7	18	51	76	2660	16	8	30	54	2743	13	16	39	68	2733	2	2	4	8	390	0.0284697508896797	0.117647058823529	0.142700329308452	0.824434389140271	0.0205128205128205	7	1	4	12	396	0.0427046263345196	0.222222222222222	0.144367480860372	1.53928170594837	0.0303030303030303	0.0604982206405694	17	81	786	4690	0.239246340724157	1.252248491979	0.761315473486538	Inf	1.20854754115387	2.16214793366675	0.0174733265372743	2.68424521062038	0.80775897038758	0.791115017655821	0.782579240177542	1	264	251
TCGA-RD-A7BW-01A-11D-A32N-08	0	0	0	0	89	0	0	2	2	87	3567	1	6	2	9	874	2	7	2	11	845	5	6	25	36	947	4	7	20	31	901	1	2	2	5	123	0.0561797752808989	0.161290322580645	0.136514983351831	1.18148439548912	0.040650406504065	1	2	2	5	135	0.0561797752808989	0.138888888888889	0.142555438225977	0.974279835390947	0.037037037037037	0.0674157303370786	6	48	258	1590	0.782203786514999	0.770446080791074	0.318102496643281	Inf	0.795865633074935	1.59173126614987	0.365809108501447	1.76014326219537	0.636692506459948	0.889323181645713	0.601384755602607	0.628482972136223	83	81
TCGA-RD-A7C1-01A-11D-A32N-08	0	0	0	0	317	2	2	6	8	306	12546	5	18	18	41	2855	3	22	16	41	3004	16	10	76	102	3348	12	16	94	122	3339	5	2	2	9	393	0.028391167192429	0.0737704918032787	0.11769991015274	0.626767613565261	0.0229007633587786	4	1	5	10	378	0.0315457413249211	0.0980392156862745	0.112903225806452	0.868347338935574	0.0264550264550265	0.0504731861198738	16	182	771	5916	0.95257795915797	0.674596786183572	0.41328078911095	Inf	0.700860747553355	2.78779877709839	0.00327746606480791	3.63355973051846	0.357129777981231	0.999793085762664	0.329556949349241	0.743136452697801	301	290
TCGA-RD-A8MV-01A-11D-A364-08	0	0	0	0	77	0	2	7	9	68	2788	1	4	4	9	675	1	4	4	9	666	2	4	17	23	725	4	7	16	27	722	2	1	0	3	101	0.038961038961039	0.111111111111111	0.1398891966759	0.794279427942794	0.0297029702970297	1	2	0	3	98	0.038961038961039	0.130434782608696	0.135172413793103	0.964951197870453	0.0306122448979592	0.038961038961039	3	36	199	1248	0.917421346372247	0.522796722144313	0.135296751900178	Inf	0.559335137224584	3.6356783919598	0.0383935987147219	6.25824959980638	0	1	0	0.181818181818182	74	65
TCGA-RD-A8MW-01A-11D-A364-08	0	0	0	0	87	1	2	7	9	77	3157	4	2	2	8	725	2	6	3	11	809	5	4	18	27	807	8	8	15	31	816	4	2	1	7	118	0.0804597701149425	0.225806451612903	0.144607843137255	1.56150902132313	0.0593220338983051	1	1	4	6	90	0.0689655172413793	0.222222222222222	0.111524163568773	1.99259259259259	0.0666666666666667	0.114942528735632	10	36	208	1415	0.0673109490975519	1.88869750586746	0.940337429939421	Inf	1.69627926421405	3.00110946745562	0.018999506611008	4.24624306251309	1.18225524475524	0.422156199956225	1.21463934190276	1	77	67
TCGA-RD-A8N0-01A-12D-A364-08	0	0	0	0	8	0	0	1	1	7	287	1	1	0	2	77	0	0	0	0	75	0	1	1	2	68	0	2	1	3	67	0	0	0	0	12	0	0	0.17910447761194	0	0	0	0	0	0	11	0	0	0.161764705882353	0	0	0	0	2	23	112	1	0	0	Inf	0	NaN	1	0	0	1	0	1	8	7
TCGA-RD-A8N1-01A-12D-A364-08	0	0	0	0	111	0	1	5	6	104	4264	7	9	8	24	1037	2	8	3	13	1026	8	7	21	36	1072	6	12	13	31	1129	3	2	3	8	154	0.0720720720720721	0.258064516129032	0.136403897254207	1.89191453707583	0.051948051948052	5	1	2	8	158	0.0720720720720721	0.222222222222222	0.147388059701493	1.50773558368495	0.0506329113924051	0.117117117117117	13	35	312	1889	0.0153177263199056	2.24776375890075	1.2116506615953	Inf	1.91059027777778	4.03113553113553	0.000236811425413668	8.05981413700414	1.0374245852187	0.540301364329646	1.04386458043652	0.472547597169157	98	91
TCGA-RD-A8N2-01A-12D-A364-08	0	0	0	0	6	0	1	1	2	4	164	0	0	0	0	34	1	1	0	2	37	0	0	1	1	49	0	0	1	1	44	0	0	1	1	3	0.166666666666667	1	0.0681818181818182	14.6666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	7	0	0	0.142857142857143	0	0	0.166666666666667	1	1	10	83	0.219260918253079	7.96089445390821	0.19627125264728	Inf	4.65	NaN	1	0	4.65	0.219260918253079	7.96089445390821	1	5	3
TCGA-RD-A8N4-01A-21D-A364-08	0	0	0	0	5	0	1	1	2	3	123	0	0	0	0	42	0	0	0	0	21	0	0	1	1	26	0	0	2	2	34	0	0	2	2	5	0.4	1	0.147058823529412	6.8	0.4	0	0	0	0	8	0	0	0.307692307692308	0	0	0.4	2	1	13	47	0.138374757623832	6.93858507623907	0.508524872944078	Inf	3.07692307692308	NaN	1	0	3.07692307692308	0.138374757623832	6.93858507623907	0.333333333333333	3	1
TCGA-RD-A8N5-01A-12D-A364-08	0	0	0	0	38	0	0	2	2	36	1476	1	2	1	4	349	2	3	0	5	359	0	2	10	12	389	1	3	11	15	379	0	0	0	0	50	0	0	0.131926121372032	0	0	0	0	0	0	42	0	0	0.107969151670951	0	0	0	0	22	92	676	1	0	0	Inf	0	0	1	0	0	1	0	1	38	36
TCGA-RD-A8N6-01A-11D-A364-08	0	0	0	0	163	1	3	7	10	152	6232	5	11	0	16	1452	4	14	4	22	1503	4	7	46	57	1587	14	6	37	57	1690	3	0	4	7	222	0.0429447852760736	0.12280701754386	0.131360946745562	0.934882250671724	0.0315315315315315	1	2	4	7	219	0.0429447852760736	0.12280701754386	0.137996219281664	0.889930305215092	0.0319634703196347	0.0736196319018405	12	89	441	2836	0.720311428511703	0.867126114574064	0.480476387364612	Inf	0.882871960665454	1.65129755605946	0.217889298033088	1.83695607590126	0.716225446001694	0.883457969715235	0.686024527341306	0.251859828599632	151	140
TCGA-RD-A8N9-01A-12D-A397-08	0	0	0	0	144	2	0	6	6	136	5576	2	6	5	13	1313	2	5	7	14	1366	2	13	44	59	1449	3	10	37	50	1448	0	1	1	2	176	0.0138888888888889	0.04	0.121546961325967	0.329090909090909	0.0113636363636364	0	2	3	5	199	0.0347222222222222	0.0847457627118644	0.137336093857833	0.617068392811515	0.0251256281407035	0.0277777777777778	4	82	375	2522	0.996901741561352	0.328146728752027	0.109053473349407	Inf	0.359317829457364	0	1	0	0.381497942386831	0.994820125838555	0.349451879417158	0.06993006993007	140	132
TCGA-SW-A7EA-01A-12D-A34U-08	0	0	0	0	682	1	43	98	141	540	22140	5	54	15	74	5022	5	48	13	66	5178	2	37	165	204	5938	9	25	162	196	6002	6	2	3	11	752	0.0161290322580645	0.0561224489795918	0.125291569476841	0.447934759009987	0.0146276595744681	1	1	4	6	700	0.00879765395894428	0.0294117647058824	0.117884809700236	0.249495798319328	0.00857142857142857	0.0205278592375367	14	324	1452	10488	0.99999988778308	0.312129990706097	0.186366438003329	Inf	0.340603452491564	5.23290758827949	8.40956800887771e-05	12.6354643728634	0.176030530492582	0.999999999992324	0.158018497477415	1	668	526
TCGA-SW-A7EB-01A-11D-A34U-08	0	0	0	0	142	0	3	2	5	135	5535	2	5	5	12	1291	3	6	3	12	1342	18	13	25	56	1446	18	13	24	55	1456	5	4	5	14	209	0.0985915492957746	0.254545454545455	0.143543956043956	1.77329273597216	0.0669856459330144	7	0	3	10	200	0.0704225352112676	0.178571428571429	0.138312586445367	1.29107142857143	0.05	0.140845070422535	20	65	409	2493	0.0149010202172721	1.87492986591762	1.16413232482526	Inf	1.66949518193585	2.36511817440913	0.00306219373947213	3.04604780468374	1.15842522828202	0.388495091518529	1.18924446911501	0.38012904359539	122	115
TCGA-VQ-A8DL-01A-11D-A364-08	0	0	0	0	151	6	63	29	92	53	2173	1	2	3	6	534	1	3	2	6	514	1	4	14	19	544	3	8	11	22	581	1	1	2	4	75	0.0264900662251656	0.181818181818182	0.129087779690189	1.40848484848485	0.0533333333333333	0	1	0	1	71	0.00662251655629139	0.0526315789473684	0.130514705882353	0.403261675315048	0.0140845070422535	0.0198675496688742	3	26	146	979	0.745414087948411	0.773866609753823	0.196543974879379	Inf	0.797118564005668	1.9263698630137	0.428094972274181	2.23305858595496	0.616438356164384	0.853115954488433	0.583311581025063	1	148	50
TCGA-VQ-A8DT-01A-11D-A364-08	0	0	0	0	186	1	4	8	12	171	7011	2	14	16	32	1672	4	7	11	22	1658	4	10	46	60	1855	0	15	42	57	1826	0	1	3	4	240	0.021505376344086	0.0701754385964912	0.131434830230011	0.533918128654971	0.0166666666666667	0	2	3	5	224	0.0268817204301075	0.0833333333333333	0.120754716981132	0.690104166666667	0.0223214285714286	0.032258064516129	6	86	464	3217	0.979511478693384	0.483783851210434	0.204425211497151	Inf	0.517381934032983	0	1	0	0.540899294670846	0.971566771263141	0.50737928105669	0.0090497737556561	180	165
TCGA-VQ-A8DU-01A-11D-A364-08	0	0	0	0	158	1	1	5	6	151	6191	8	14	20	42	1524	4	12	10	26	1599	7	4	33	44	1551	3	6	30	39	1517	1	0	4	5	232	0.0316455696202532	0.128205128205128	0.152933421226104	0.838306808134394	0.021551724137931	1	1	3	5	193	0.0316455696202532	0.113636363636364	0.124435847840103	0.913212435233161	0.0259067357512953	0.0569620253164557	9	64	425	2643	0.696847728858854	0.874574476896436	0.435412439498505	Inf	0.889991941982272	1.44376470588235	0.413784815563013	1.5544401814651	0.802091503267974	0.786446836553651	0.777410670980234	0.0697785186949274	149	142
TCGA-VQ-A8DV-01A-12D-A364-08	0	0	0	0	74	2	3	4	7	65	2665	4	2	4	10	670	1	6	3	10	631	1	4	15	20	673	1	5	19	25	691	1	1	1	3	101	0.0405405405405405	0.12	0.14616497829233	0.820990099009901	0.0297029702970297	0	0	0	0	94	0	0	0.139673105497771	0	0	0.027027027027027	2	34	195	1169	0.972081674640197	0.352820674467204	0.0598822642303533	Inf	0.388603988603989	3.4974358974359	0.266471449487555	5.98214319387216	0.205731523378582	0.994497127635943	0.181785344226543	1	72	63
TCGA-VQ-A8DZ-01A-11D-A364-08	0	0	1	1	85	1	1	5	6	76	3116	1	9	5	15	692	3	2	4	9	814	4	7	17	28	799	0	10	14	24	811	0	0	2	2	129	0.0235294117647059	0.0833333333333333	0.159062885326757	0.52390180878553	0.0155038759689922	0	3	2	5	99	0.0588235294117647	0.178571428571429	0.123904881101377	1.44119769119769	0.0505050505050505	0.0470588235294118	4	31	228	1382	0.749899783568535	0.782224386028184	0.25035441184631	Inf	0.807017543859649	0	1	0	0.911148839841539	0.658303153347769	0.898072789490978	0.06993006993007	81	72
TCGA-VQ-A8E2-01A-11D-A364-08	0	0	0	0	120	0	3	3	6	113	4633	1	9	10	20	1150	4	10	8	22	1100	7	2	29	38	1192	8	3	22	33	1191	4	0	2	6	155	0.05	0.181818181818182	0.130142737195634	1.39706744868035	0.0387096774193548	2	0	1	3	169	0.025	0.0789473684210526	0.141778523489933	0.556835876673933	0.0177514792899408	0.075	9	57	324	2059	0.552083740112684	1.00340996716816	0.496189428786504	Inf	1.00294612794613	2.94197530864198	0.0108920484095406	4.23302834262394	0.432643427741467	0.975803838463671	0.397290856865246	0.346935417523653	111	104
TCGA-VQ-A8E7-01B-11D-A410-08	0	0	0	0	109	0	3	2	5	104	4264	2	5	1	8	998	1	2	5	8	1004	5	8	31	44	1128	2	8	34	44	1134	0	2	1	3	131	0.0275229357798165	0.0681818181818182	0.115520282186949	0.590215128383067	0.0229007633587786	2	3	2	7	148	0.0642201834862385	0.159090909090909	0.131205673758865	1.21253071253071	0.0472972972972973	0.0458715596330275	5	67	279	1983	0.950148682421125	0.53052855946449	0.201393234657947	Inf	0.563022700119474	2.31643625192012	0.211344450567501	2.84113632748474	0.374193548387097	0.989609836919957	0.344019262219173	1	104	99
TCGA-VQ-A8P2-01A-11D-A364-08	0	0	1	1	8109	27	185	243	428	7648	313568	31	349	70	450	73408	47	343	65	455	74208	12	700	2698	3410	82702	15	674	2644	3333	83250	0	184	104	288	10670	0.0355160932297447	0.0864086408640864	0.128168168168168	0.674181757444723	0.026991565135895	1	142	113	256	10438	0.031569860648662	0.0750733137829912	0.126212183502213	0.594818279026723	0.0245257712205403	0.0268837094586262	218	5151	21108	144844	1	0.290415407089107	0.258049336345319	Inf	0.319226175519717	0.291186771383853	0.974599064823727	0.263925871838083	0.319367894709471	1	0.290549796401375	2.04507201076691e-75	7891	7430
TCGA-VQ-A8P3-01A-11D-A364-08	0	0	1	1	298	4	3	13	16	277	11357	8	38	68	114	2942	10	29	56	95	2948	5	3	18	26	2677	4	9	29	42	2790	1	1	3	5	442	0.0167785234899329	0.119047619047619	0.1584229390681	0.751454427925016	0.0113122171945701	1	0	0	1	461	0.00335570469798658	0.0384615384615385	0.172207695181173	0.223343901218088	0.00216919739696312	0.0167785234899329	5	51	903	4564	0.964980151470153	0.495569278170598	0.187433877704362	Inf	0.540559246954596	1.34539190353144	0.452743594093143	1.44396350429529	0.386442355269668	0.988962568862734	0.344653430870255	1	293	272
TCGA-VQ-A8PE-01A-11D-A410-08	0	0	0	0	143	0	3	8	11	132	5412	5	9	4	18	1316	2	8	3	13	1342	8	5	44	57	1352	9	9	26	44	1402	3	2	2	7	188	0.048951048951049	0.159090909090909	0.134094151212553	1.18641199226306	0.0372340425531915	5	2	7	14	205	0.0979020979020979	0.245614035087719	0.151627218934911	1.61985451433462	0.0682926829268293	0.118881118881119	17	70	393	2361	0.113265257957097	1.45877405403559	0.87718569804888	Inf	1.36930771255594	3.29770992366412	0.00131522738589516	5.33507404139557	0.900981461286805	0.683222780238496	0.886428650752013	1	126	115
TCGA-VQ-A8PK-01A-12D-A410-08	0	0	0	0	96	0	0	7	7	89	3649	3	6	13	22	909	1	8	13	22	948	5	4	12	21	906	5	3	16	24	886	3	0	1	4	145	0.0416666666666667	0.166666666666667	0.163656884875847	1.0183908045977	0.0275862068965517	3	2	4	9	134	0.09375	0.428571428571429	0.147902869757174	2.89765458422175	0.0671641791044776	0.114583333333333	11	27	279	1513	0.0285397513485535	2.20813692489264	1.11078626925058	Inf	1.85927183550274	3.85376344086022	0.00177933736275404	8.11986575546514	1.14695340501792	0.449103564671014	1.17875985681363	1	85	78
TCGA-VQ-A8PM-01A-21D-A410-08	0	0	0	0	61	0	3	4	7	54	2214	2	4	4	10	561	2	6	6	14	528	0	5	13	18	591	1	0	11	12	534	1	0	1	2	66	0.0327868852459016	0.166666666666667	0.123595505617978	1.34848484848485	0.0303030303030303	0	0	3	3	88	0.0491803278688525	0.166666666666667	0.148900169204738	1.11931818181818	0.0340909090909091	0.0819672131147541	5	20	154	971	0.256607225471936	1.57556710117587	0.55756117131931	Inf	1.46103896103896	7.30519480519481	0.137655417406749	Inf	1.21753246753247	0.424843517663893	1.2607624473099	0.206349206349206	56	49
TCGA-VQ-A8PQ-01A-11D-A410-08	0	0	0	0	22	0	2	1	3	19	779	0	2	0	2	186	0	1	0	1	173	0	2	7	9	204	1	0	6	7	216	0	0	1	1	21	0.0454545454545455	0.142857142857143	0.0972222222222222	1.46938775510204	0.0476190476190476	0	0	1	1	30	0.0454545454545455	0.111111111111111	0.147058823529412	0.755555555555556	0.0333333333333333	0.0909090909090909	2	12	51	369	0.52727011004623	1.20531688105339	0.188059902235405	Inf	1.17647058823529	0	1	0	1.26696832579186	0.487221479138321	1.31458897657125	0.333333333333333	20	17
TCGA-VQ-A91Q-01A-12D-A410-08	0	0	0	0	109	1	3	0	3	104	4264	6	6	1	13	1118	9	2	4	15	1065	11	10	18	39	1025	6	9	22	37	1056	1	5	4	10	148	0.0917431192660551	0.27027027027027	0.140151515151515	1.92841490138787	0.0675675675675676	2	1	1	4	164	0.036697247706422	0.102564102564103	0.16	0.641025641025641	0.024390243902439	0.073394495412844	8	49	312	1769	0.637217190647313	0.925704168722967	0.434751644964222	Inf	0.936122357174989	1.17703619909502	0.48137054430591	1.21483507502394	0.833733974358974	0.736084746876592	0.810057051837901	0.677616747181965	101	96
TCGA-VQ-A91U-01A-11D-A410-08	0	0	0	0	159	0	0	4	4	154	6314	3	7	3	13	1498	2	10	4	16	1502	9	10	46	65	1682	7	9	44	60	1632	3	3	4	10	221	0.0628930817610063	0.166666666666667	0.135416666666667	1.23076923076923	0.0452488687782805	1	2	2	5	227	0.0314465408805031	0.0769230769230769	0.134958382877527	0.569976279227381	0.0220264317180617	0.0628930817610063	10	96	448	2866	0.918657214375213	0.666457629978734	0.349105462837985	Inf	0.69786051212938	1.84933035714286	0.162079414388621	2.13182469084119	0.493154761904762	0.986295520657097	0.457029459391511	0.699850074962519	149	144
TCGA-VQ-A91V-01A-11D-A410-08	0	0	1	1	257	2	1	10	11	243	9963	1	16	54	71	2568	10	22	53	85	2571	3	7	29	39	2467	3	6	39	48	2357	2	4	5	11	373	0.0428015564202335	0.229166666666667	0.158252015273653	1.44811215370867	0.0294906166219839	2	1	3	6	380	0.0233463035019455	0.153846153846154	0.15403323875152	0.998785425101215	0.0157894736842105	0.0466926070038911	12	62	753	4071	0.492948720549963	1.04639294030363	0.573699439253378	Inf	1.03887154086357	4.27091633466135	0.00689170863613206	10.8023427267698	0.753691117881416	0.851398967478449	0.720894325138532	0.281752672051071	245	231
TCGA-VQ-A92D-01A-11D-A410-08	0	0	0	0	146	0	3	10	13	133	5453	5	6	4	15	1279	2	7	4	13	1274	7	11	39	57	1477	7	12	29	48	1423	1	2	5	8	186	0.0547945205479452	0.166666666666667	0.130709768095573	1.27508960573477	0.043010752688172	1	1	4	6	192	0.0410958904109589	0.105263157894737	0.129993229519296	0.809758771929824	0.03125	0.0753424657534247	11	71	378	2522	0.510469267777332	1.03367703459087	0.552670009525019	Inf	1.0291650535553	1.09599395313681	0.562279495638039	1.11191627088221	1.01540616246499	0.536014575650523	1.0177517365698	0.0183066361556064	135	122
TCGA-VQ-A94T-01A-11D-A410-08	0	0	0	0	88	0	1	5	6	82	3362	3	2	0	5	824	1	7	3	11	833	3	13	21	37	833	0	4	25	29	872	0	1	2	3	128	0.0340909090909091	0.103448275862069	0.146788990825688	0.704741379310345	0.0234375	0	4	2	6	123	0.0681818181818182	0.162162162162162	0.14765906362545	1.0982201713909	0.0487804878048781	0.0454545454545455	4	45	251	1454	0.941680625614213	0.515076178285255	0.167771926797716	Inf	0.554516627368079	0	1	0	0.59068075523991	0.920927646838772	0.551853354615595	0.0823529411764706	84	78
TCGA-VQ-AA64-01A-11D-A410-08	0	0	0	0	280	5	3	22	25	249	10209	8	15	6	29	2484	11	10	14	35	2451	24	30	37	91	2667	29	30	35	94	2607	13	5	6	24	371	0.0857142857142857	0.25531914893617	0.142309167625623	1.79411596031427	0.0646900269541779	15	4	11	30	394	0.107142857142857	0.32967032967033	0.147731533558305	2.23155017571261	0.0761421319796954	0.160714285714286	45	80	765	4509	3.61654980747765e-09	3.31440667541774	2.37196605873754	Inf	2.48188235294118	3.64217536071032	9.69340716514521e-11	6.59762682160765	1.62777777777778	0.0278215565752712	1.82156759017701	0.0504088361956751	235	204
TCGA-VQ-AA68-01A-11D-A410-08	0	0	0	0	177	1	3	7	10	166	6806	5	8	13	26	1641	2	22	16	40	1651	5	9	38	52	1760	8	9	31	48	1754	4	3	2	9	231	0.0508474576271186	0.1875	0.13169897377423	1.4237012987013	0.038961038961039	1	0	3	4	259	0.0225988700564972	0.0769230769230769	0.147159090909091	0.522720522720523	0.0154440154440154	0.0564971751412429	10	72	490	3024	0.7223526688298	0.857182415627751	0.445230359379855	Inf	0.874564459930314	2.75824175824176	0.0260487093761183	3.85511074811769	0.519668737060041	0.971024696931138	0.482220540448681	1	167	156
TCGA-VQ-AA69-01A-11D-A410-08	0	0	0	0	71	0	0	6	6	65	2665	2	1	1	4	613	1	2	0	3	628	2	5	24	31	749	3	9	15	27	675	1	1	1	3	100	0.0422535211267606	0.111111111111111	0.148148148148148	0.75	0.03	0	1	2	3	98	0.0422535211267606	0.0967741935483871	0.130841121495327	0.73963133640553	0.0306122448979592	0.0563380281690141	4	40	198	1226	0.876407016174398	0.61936493494852	0.200406598524545	Inf	0.653810835629017	1.43838383838384	0.528076510067556	1.54742319676307	0.553224553224553	0.921154445430982	0.516180499822973	0.545454545454546	67	61
TCGA-VQ-AA6A-01A-11D-A410-08	0	0	0	0	105	0	3	3	6	98	4018	5	6	6	17	1026	4	8	8	20	1018	4	1	23	28	949	2	5	26	33	1025	1	0	1	2	170	0.019047619047619	0.0606060606060606	0.165853658536585	0.36541889483066	0.0117647058823529	0	0	3	3	136	0.0285714285714286	0.107142857142857	0.143308746048472	0.747636554621849	0.0220588235294118	0.0476190476190476	5	50	306	1668	0.940767332907135	0.545234385215254	0.205074154557478	Inf	0.586452762923351	1.07516339869281	0.636604506876731	1.09017171588147	0.526610644257703	0.956362542912732	0.484670783832272	0.206349206349206	100	93
TCGA-VQ-AA6B-01A-11D-A410-08	0	0	0	0	88	0	1	7	8	79	3239	1	2	4	7	747	3	4	4	11	838	5	3	21	29	832	6	5	21	32	822	3	0	1	4	116	0.0454545454545455	0.125	0.141119221411192	0.885775862068966	0.0344827586206897	0	1	0	1	94	0.0113636363636364	0.0344827586206897	0.112980769230769	0.30520909757887	0.0106382978723404	0.0454545454545455	4	49	210	1444	0.915941732504085	0.561477714820295	0.183221543803882	Inf	0.594429469901168	2.14805194805195	0.156970531753343	2.57634528505726	0.187528344671202	0.996494578998805	0.167805760797046	0.523809523809524	84	75
TCGA-VQ-AA6F-01A-31D-A410-08	0	0	0	0	53	1	1	4	5	47	1927	2	4	1	7	465	1	3	1	5	453	1	6	13	20	507	2	3	10	15	502	1	2	1	4	56	0.0754716981132075	0.266666666666667	0.111553784860558	2.39047619047619	0.0714285714285714	0	1	3	4	56	0.0754716981132075	0.2	0.110453648915187	1.81071428571429	0.0714285714285714	0.0943396226415094	5	21	112	897	0.161143597555133	1.90548448322338	0.674005186868346	Inf	1.73248626373626	3.00297619047619	0.299230115889927	3.9951228058512	1.5667701863354	0.253605166083839	1.68505367528582	0.282051282051282	48	42
TCGA-VQ-AA6G-01A-11D-A410-08	0	0	0	0	136	0	2	6	8	128	5248	2	6	6	14	1232	3	10	9	22	1213	1	9	34	44	1381	2	12	34	48	1422	0	1	1	2	161	0.0147058823529412	0.0416666666666667	0.113220815752461	0.368012422360248	0.0124223602484472	0	3	2	5	183	0.0367647058823529	0.113636363636364	0.132512671976828	0.857550919026329	0.0273224043715847	0.0220588235294118	3	68	344	2459	0.994229995481211	0.315447101108294	0.0835934963647946	Inf	0.344292499181133	0	1	0	0.359481874145007	0.992148133256128	0.330004158373582	0.192307692307692	133	125
TCGA-VQ-AA6I-01A-11D-A410-08	0	0	0	0	112	2	5	10	15	94	3854	1	4	3	8	818	1	2	2	5	989	6	9	28	43	976	3	7	28	38	1071	0	2	5	7	134	0.0625	0.184210526315789	0.125116713352007	1.47230950510605	0.0522388059701493	3	1	0	4	114	0.0357142857142857	0.0930232558139535	0.116803278688525	0.79640962872297	0.0350877192982456	0.0714285714285714	8	57	248	1799	0.539882996095026	1.01810276301219	0.480365118846596	Inf	1.01588089330025	2.75134408602151	0.0863735831388941	3.62371389937479	0.736967165898618	0.822904453290104	0.711282046948667	0.659442724458204	104	86
TCGA-VQ-AA6J-01A-11D-A410-08	0	0	0	0	146	1	1	9	10	135	5535	6	8	18	32	1365	2	9	10	21	1353	4	7	32	43	1349	3	12	24	39	1468	0	4	1	5	205	0.0342465753424658	0.128205128205128	0.139645776566758	0.918073796122576	0.024390243902439	1	0	5	6	201	0.0410958904109589	0.13953488372093	0.148999258710156	0.936480388753905	0.0298507462686567	0.0479452054794521	7	56	406	2411	0.820159107754035	0.742373097829607	0.33238080340374	Inf	0.770935960591133	0.991203377902885	0.66400023170946	0.989740559115884	0.743402533427164	0.83503370107152	0.712686552221629	0.0634674922600621	139	128
TCGA-VQ-AA6K-01A-11D-A410-08	0	0	0	0	84	0	6	7	13	71	2911	3	1	0	4	695	3	7	3	13	724	4	9	17	30	759	1	6	17	24	733	0	1	0	1	110	0.0119047619047619	0.0416666666666667	0.150068212824011	0.277651515151515	0.00909090909090909	1	2	2	5	103	0.0595238095238095	0.166666666666667	0.13570487483531	1.22815533980583	0.0485436893203883	0.0357142857142857	3	36	213	1279	0.9297701286723	0.500571436297982	0.129612615531775	Inf	0.53882267966775	1.40093896713615	0.53810917692867	1.50070030204586	0.412040872687103	0.963826307108012	0.375462896644569	1	81	68
TCGA-ZA-A8F6-01A-23D-A364-08	0	0	0	0	45	1	0	3	3	41	1681	1	3	2	6	393	0	1	1	2	423	3	2	11	16	438	4	2	11	17	427	1	0	1	2	64	0.0444444444444444	0.117647058823529	0.149882903981265	0.784926470588235	0.03125	1	1	3	5	58	0.111111111111111	0.3125	0.132420091324201	2.35991379310345	0.0862068965517241	0.133333333333333	6	23	122	743	0.224919722330885	1.58777658728587	0.620971465403248	Inf	1.46693046919163	2.02576112412178	0.261459116577849	2.43260070478861	1.28912071535022	0.382527217924507	1.35285703828041	0.592074592074592	39	35
Totals	7	25	56	88	178005	474	4835	17432	22267	155086	6358526	2622	13369	5087	21078	1469253	2706	13443	5317	21466	1488194	2578	8597	45367	56542	1692946	2624	9021	44355	56000	1708133	642	1675	1666	3983	211549	0.0223757759613494	0.071125	0.123848084429023	0.574292289847742	0.0188277893064964	669	1513	1701	3883	208350	0.0218139939889329	0.0686746135616002	0.12306948951709	0.558014937992113	0.0186369090472762	0.0262801606696441	4678	90246	419899	2981180	1	0.368022905322098	0.358931281885224	Inf	0.399168320069967	2.04128772159586	2.15627194747935e-140	2.39212529594567	0.303959729905484	1	0.276820720426827	1.06663876925855e-288	173327	150408
