Lung Adenocarcinoma: Correlation between copy number variation genes and selected clinical features
Maintained by TCGA GDAC Team
(Broad Institute/Dana-Farber Cancer Institute/Harvard Medical School)
Overview
Introduction
Summary
Testing the association between copy number variation of 67 peak regions and 15 clinical features across 223 patients, one significant finding detected with Q value < 0.25.
-
Amp Peak 15(11q13.3) cnvs correlated to 'AGE'.
Results
Overview of the results
Table 1. Get Full Table Overview of the association between significant copy number variation of 67 regions and 15 clinical features. Shown in the table are P values (Q values). Thresholded by Q value < 0.25, one significant finding detected.
|
Clinical Features |
Time to Death |
AGE | GENDER |
KARNOFSKY PERFORMANCE SCORE |
HISTOLOGICAL TYPE |
PATHOLOGY T |
PATHOLOGY N |
PATHOLOGICSPREAD(M) |
TUMOR STAGE |
RADIATIONS RADIATION REGIMENINDICATION |
NEOADJUVANT THERAPY |
NUMBERPACKYEARSSMOKED | STOPPEDSMOKINGYEAR | TOBACCOSMOKINGHISTORYINDICATOR | YEAROFTOBACCOSMOKINGONSET | ||
| nCNV (%) | nWild-Type | logrank test | t-test | Fisher's exact test | t-test | Chi-square test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | t-test | t-test | Fisher's exact test | t-test | |
| Amp Peak 15(11q13 3) | 74 (33%) | 149 |
0.497 (1.00) |
0.000204 (0.204) |
0.567 (1.00) |
0.413 (1.00) |
0.474 (1.00) |
0.955 (1.00) |
0.722 (1.00) |
0.783 (1.00) |
0.488 (1.00) |
0.778 (1.00) |
1 (1.00) |
0.843 (1.00) |
0.139 (1.00) |
0.00845 (1.00) |
0.826 (1.00) |
| Amp Peak 1(1p22 3) | 65 (29%) | 158 |
0.194 (1.00) |
0.000547 (0.546) |
0.883 (1.00) |
0.553 (1.00) |
0.409 (1.00) |
0.665 (1.00) |
0.471 (1.00) |
0.806 (1.00) |
0.664 (1.00) |
0.381 (1.00) |
0.108 (1.00) |
0.733 (1.00) |
0.92 (1.00) |
0.767 (1.00) |
0.925 (1.00) |
| Amp Peak 2(1q21 3) | 167 (75%) | 56 |
0.763 (1.00) |
0.0561 (1.00) |
0.044 (1.00) |
0.344 (1.00) |
0.0757 (1.00) |
0.41 (1.00) |
0.315 (1.00) |
0.564 (1.00) |
0.947 (1.00) |
0.367 (1.00) |
0.293 (1.00) |
0.465 (1.00) |
0.354 (1.00) |
0.104 (1.00) |
0.326 (1.00) |
| Amp Peak 3(3p11 1) | 27 (12%) | 196 |
0.805 (1.00) |
0.825 (1.00) |
0.219 (1.00) |
0.661 (1.00) |
0.0271 (1.00) |
0.189 (1.00) |
1 (1.00) |
0.167 (1.00) |
1 (1.00) |
0.78 (1.00) |
0.0351 (1.00) |
0.271 (1.00) |
0.0777 (1.00) |
0.296 (1.00) |
|
| Amp Peak 4(3q26 2) | 69 (31%) | 154 |
0.445 (1.00) |
0.0922 (1.00) |
0.56 (1.00) |
0.736 (1.00) |
0.888 (1.00) |
0.418 (1.00) |
0.978 (1.00) |
0.657 (1.00) |
0.719 (1.00) |
0.403 (1.00) |
1 (1.00) |
0.2 (1.00) |
0.296 (1.00) |
0.11 (1.00) |
0.226 (1.00) |
| Amp Peak 5(5p15 33) | 145 (65%) | 78 |
0.42 (1.00) |
0.00651 (1.00) |
0.0341 (1.00) |
0.0168 (1.00) |
0.399 (1.00) |
0.055 (1.00) |
0.94 (1.00) |
1 (1.00) |
0.834 (1.00) |
0.269 (1.00) |
0.703 (1.00) |
0.238 (1.00) |
0.142 (1.00) |
0.357 (1.00) |
0.412 (1.00) |
| Amp Peak 6(5p13 2) | 132 (59%) | 91 |
0.0507 (1.00) |
0.0224 (1.00) |
0.0293 (1.00) |
0.488 (1.00) |
0.638 (1.00) |
0.0378 (1.00) |
0.69 (1.00) |
0.459 (1.00) |
0.444 (1.00) |
0.289 (1.00) |
0.582 (1.00) |
0.154 (1.00) |
0.0911 (1.00) |
0.573 (1.00) |
0.678 (1.00) |
| Amp Peak 7(6p21 1) | 78 (35%) | 145 |
0.922 (1.00) |
0.291 (1.00) |
0.397 (1.00) |
0.651 (1.00) |
0.822 (1.00) |
0.0855 (1.00) |
0.558 (1.00) |
0.125 (1.00) |
0.82 (1.00) |
1 (1.00) |
0.445 (1.00) |
0.834 (1.00) |
0.733 (1.00) |
0.0081 (1.00) |
0.289 (1.00) |
| Amp Peak 8(7p21 1) | 124 (56%) | 99 |
0.398 (1.00) |
0.0686 (1.00) |
0.415 (1.00) |
0.967 (1.00) |
0.719 (1.00) |
0.464 (1.00) |
0.00979 (1.00) |
0.899 (1.00) |
0.443 (1.00) |
0.793 (1.00) |
0.199 (1.00) |
0.509 (1.00) |
0.923 (1.00) |
0.114 (1.00) |
0.233 (1.00) |
| Amp Peak 9(7p11 2) | 117 (52%) | 106 |
0.19 (1.00) |
0.0471 (1.00) |
0.589 (1.00) |
0.671 (1.00) |
0.644 (1.00) |
0.301 (1.00) |
0.00192 (1.00) |
0.627 (1.00) |
0.227 (1.00) |
0.79 (1.00) |
0.719 (1.00) |
0.486 (1.00) |
0.979 (1.00) |
0.259 (1.00) |
0.042 (1.00) |
| Amp Peak 10(7q31 2) | 88 (39%) | 135 |
0.661 (1.00) |
0.0298 (1.00) |
0.68 (1.00) |
0.706 (1.00) |
0.296 (1.00) |
0.484 (1.00) |
0.086 (1.00) |
0.298 (1.00) |
0.321 (1.00) |
0.592 (1.00) |
0.853 (1.00) |
0.614 (1.00) |
0.75 (1.00) |
0.455 (1.00) |
0.785 (1.00) |
| Amp Peak 11(8p11 21) | 63 (28%) | 160 |
0.61 (1.00) |
0.108 (1.00) |
0.55 (1.00) |
0.437 (1.00) |
0.407 (1.00) |
0.261 (1.00) |
0.621 (1.00) |
0.253 (1.00) |
0.372 (1.00) |
0.691 (1.00) |
0.689 (1.00) |
0.158 (1.00) |
0.175 (1.00) |
0.995 (1.00) |
|
| Amp Peak 12(8p11 21) | 68 (30%) | 155 |
0.276 (1.00) |
0.0135 (1.00) |
0.56 (1.00) |
0.435 (1.00) |
0.734 (1.00) |
0.265 (1.00) |
1 (1.00) |
0.487 (1.00) |
0.398 (1.00) |
0.323 (1.00) |
0.61 (1.00) |
0.459 (1.00) |
0.0236 (1.00) |
0.673 (1.00) |
|
| Amp Peak 13(8q11 1) | 95 (43%) | 128 |
0.544 (1.00) |
0.0156 (1.00) |
0.892 (1.00) |
0.63 (1.00) |
0.247 (1.00) |
0.39 (1.00) |
0.286 (1.00) |
0.802 (1.00) |
0.431 (1.00) |
0.426 (1.00) |
0.0264 (1.00) |
0.803 (1.00) |
0.326 (1.00) |
0.00248 (1.00) |
0.129 (1.00) |
| Amp Peak 14(8q24 21) | 146 (65%) | 77 |
0.148 (1.00) |
0.0396 (1.00) |
0.572 (1.00) |
0.995 (1.00) |
0.0365 (1.00) |
0.384 (1.00) |
0.513 (1.00) |
0.89 (1.00) |
0.681 (1.00) |
0.0935 (1.00) |
0.569 (1.00) |
0.61 (1.00) |
0.117 (1.00) |
0.0425 (1.00) |
0.825 (1.00) |
| Amp Peak 16(12p12 1) | 74 (33%) | 149 |
0.00824 (1.00) |
0.705 (1.00) |
0.39 (1.00) |
0.56 (1.00) |
0.779 (1.00) |
0.285 (1.00) |
0.421 (1.00) |
0.21 (1.00) |
0.843 (1.00) |
0.778 (1.00) |
1 (1.00) |
0.7 (1.00) |
0.578 (1.00) |
0.576 (1.00) |
0.247 (1.00) |
| Amp Peak 17(12q14 1) | 67 (30%) | 156 |
0.0119 (1.00) |
0.525 (1.00) |
0.465 (1.00) |
0.292 (1.00) |
0.828 (1.00) |
0.123 (1.00) |
0.162 (1.00) |
0.959 (1.00) |
0.243 (1.00) |
1 (1.00) |
0.844 (1.00) |
0.553 (1.00) |
0.0102 (1.00) |
0.155 (1.00) |
0.00431 (1.00) |
| Amp Peak 18(12q15) | 68 (30%) | 155 |
0.188 (1.00) |
0.705 (1.00) |
0.771 (1.00) |
0.199 (1.00) |
0.811 (1.00) |
0.147 (1.00) |
0.209 (1.00) |
1 (1.00) |
0.48 (1.00) |
0.778 (1.00) |
0.696 (1.00) |
0.131 (1.00) |
0.149 (1.00) |
0.0203 (1.00) |
0.00574 (1.00) |
| Amp Peak 19(14q13 3) | 96 (43%) | 127 |
0.589 (1.00) |
0.597 (1.00) |
0.277 (1.00) |
0.689 (1.00) |
0.376 (1.00) |
0.19 (1.00) |
0.981 (1.00) |
0.43 (1.00) |
0.73 (1.00) |
1 (1.00) |
0.587 (1.00) |
0.99 (1.00) |
0.355 (1.00) |
0.724 (1.00) |
0.0701 (1.00) |
| Amp Peak 20(17q12) | 99 (44%) | 124 |
0.971 (1.00) |
0.439 (1.00) |
1 (1.00) |
0.187 (1.00) |
0.468 (1.00) |
0.702 (1.00) |
0.764 (1.00) |
0.0766 (1.00) |
0.526 (1.00) |
0.105 (1.00) |
0.148 (1.00) |
0.303 (1.00) |
0.208 (1.00) |
0.335 (1.00) |
0.979 (1.00) |
| Amp Peak 21(17q25 3) | 110 (49%) | 113 |
0.41 (1.00) |
0.0432 (1.00) |
0.419 (1.00) |
0.619 (1.00) |
0.627 (1.00) |
0.753 (1.00) |
0.658 (1.00) |
0.0245 (1.00) |
0.913 (1.00) |
0.795 (1.00) |
0.277 (1.00) |
0.692 (1.00) |
0.135 (1.00) |
0.334 (1.00) |
0.21 (1.00) |
| Amp Peak 22(18q11 2) | 48 (22%) | 175 |
0.224 (1.00) |
0.688 (1.00) |
0.251 (1.00) |
0.818 (1.00) |
0.288 (1.00) |
1 (1.00) |
0.61 (1.00) |
0.952 (1.00) |
0.941 (1.00) |
0.534 (1.00) |
1 (1.00) |
0.7 (1.00) |
0.615 (1.00) |
0.434 (1.00) |
0.424 (1.00) |
| Amp Peak 23(19q13 11) | 58 (26%) | 165 |
0.491 (1.00) |
0.909 (1.00) |
0.171 (1.00) |
0.551 (1.00) |
0.875 (1.00) |
0.446 (1.00) |
0.797 (1.00) |
0.679 (1.00) |
1 (1.00) |
0.214 (1.00) |
0.324 (1.00) |
0.118 (1.00) |
0.431 (1.00) |
0.246 (1.00) |
|
| Amp Peak 24(20p11 21) | 82 (37%) | 141 |
0.528 (1.00) |
0.551 (1.00) |
0.405 (1.00) |
0.111 (1.00) |
0.478 (1.00) |
0.235 (1.00) |
0.0565 (1.00) |
0.763 (1.00) |
0.133 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0589 (1.00) |
0.983 (1.00) |
0.986 (1.00) |
0.153 (1.00) |
0.363 (1.00) |
| Amp Peak 25(20q13 2) | 96 (43%) | 127 |
0.96 (1.00) |
0.443 (1.00) |
0.683 (1.00) |
0.0116 (1.00) |
0.198 (1.00) |
0.294 (1.00) |
0.298 (1.00) |
0.218 (1.00) |
0.0797 (1.00) |
0.591 (1.00) |
0.27 (1.00) |
0.547 (1.00) |
0.251 (1.00) |
0.067 (1.00) |
0.904 (1.00) |
| Amp Peak 26(20q13 33) | 104 (47%) | 119 |
0.522 (1.00) |
0.65 (1.00) |
0.686 (1.00) |
0.0718 (1.00) |
0.504 (1.00) |
0.184 (1.00) |
0.228 (1.00) |
0.0167 (1.00) |
0.00395 (1.00) |
0.423 (1.00) |
0.203 (1.00) |
0.755 (1.00) |
0.321 (1.00) |
0.461 (1.00) |
0.665 (1.00) |
| Amp Peak 27(Xq28) | 68 (30%) | 155 |
0.401 (1.00) |
0.0696 (1.00) |
0.145 (1.00) |
0.0899 (1.00) |
0.468 (1.00) |
0.242 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.843 (1.00) |
0.264 (1.00) |
0.778 (1.00) |
0.241 (1.00) |
0.0134 (1.00) |
0.517 (1.00) |
0.0184 (1.00) |
0.78 (1.00) |
| Del Peak 1(1p36 13) | 54 (24%) | 169 |
0.0568 (1.00) |
0.963 (1.00) |
0.0274 (1.00) |
0.553 (1.00) |
0.902 (1.00) |
0.0628 (1.00) |
0.0702 (1.00) |
0.953 (1.00) |
0.292 (1.00) |
0.762 (1.00) |
0.294 (1.00) |
0.574 (1.00) |
0.874 (1.00) |
0.801 (1.00) |
0.959 (1.00) |
| Del Peak 2(1p12) | 65 (29%) | 158 |
0.758 (1.00) |
0.127 (1.00) |
0.659 (1.00) |
0.561 (1.00) |
0.166 (1.00) |
0.862 (1.00) |
1 (1.00) |
0.623 (1.00) |
0.625 (1.00) |
1 (1.00) |
0.843 (1.00) |
0.0412 (1.00) |
0.363 (1.00) |
0.842 (1.00) |
0.246 (1.00) |
| Del Peak 3(2q22 1) | 21 (9%) | 202 |
0.451 (1.00) |
0.519 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0385 (1.00) |
0.268 (1.00) |
0.502 (1.00) |
0.464 (1.00) |
0.474 (1.00) |
0.639 (1.00) |
0.755 (1.00) |
0.737 (1.00) |
0.0952 (1.00) |
0.128 (1.00) |
0.918 (1.00) |
|
| Del Peak 4(2q37 3) | 35 (16%) | 188 |
0.849 (1.00) |
0.822 (1.00) |
0.266 (1.00) |
0.525 (1.00) |
0.169 (1.00) |
0.899 (1.00) |
0.337 (1.00) |
0.33 (1.00) |
0.595 (1.00) |
0.476 (1.00) |
0.616 (1.00) |
0.95 (1.00) |
0.438 (1.00) |
0.293 (1.00) |
0.545 (1.00) |
| Del Peak 5(3q11 1) | 68 (30%) | 155 |
0.514 (1.00) |
0.611 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0609 (1.00) |
0.661 (1.00) |
0.915 (1.00) |
0.802 (1.00) |
0.846 (1.00) |
0.804 (1.00) |
1 (1.00) |
0.844 (1.00) |
0.0675 (1.00) |
0.502 (1.00) |
0.683 (1.00) |
0.0271 (1.00) |
| Del Peak 6(3q28) | 67 (30%) | 156 |
0.435 (1.00) |
0.0519 (1.00) |
0.307 (1.00) |
0.21 (1.00) |
0.876 (1.00) |
0.884 (1.00) |
0.314 (1.00) |
0.295 (1.00) |
0.158 (1.00) |
0.562 (1.00) |
0.429 (1.00) |
0.76 (1.00) |
0.869 (1.00) |
0.877 (1.00) |
0.361 (1.00) |
| Del Peak 7(4p15 31) | 45 (20%) | 178 |
0.629 (1.00) |
0.09 (1.00) |
0.403 (1.00) |
0.612 (1.00) |
0.266 (1.00) |
0.817 (1.00) |
0.784 (1.00) |
0.949 (1.00) |
0.619 (1.00) |
0.192 (1.00) |
0.656 (1.00) |
0.19 (1.00) |
0.00277 (1.00) |
0.0989 (1.00) |
0.14 (1.00) |
| Del Peak 8(4q35 2) | 76 (34%) | 147 |
0.241 (1.00) |
0.603 (1.00) |
0.322 (1.00) |
0.174 (1.00) |
0.438 (1.00) |
0.272 (1.00) |
0.474 (1.00) |
0.133 (1.00) |
0.483 (1.00) |
0.397 (1.00) |
0.252 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.167 (1.00) |
0.276 (1.00) |
0.441 (1.00) |
| Del Peak 9(5q11 1) | 58 (26%) | 165 |
0.627 (1.00) |
0.0705 (1.00) |
0.759 (1.00) |
0.229 (1.00) |
0.256 (1.00) |
0.613 (1.00) |
0.496 (1.00) |
1 (1.00) |
0.482 (1.00) |
0.364 (1.00) |
0.836 (1.00) |
0.147 (1.00) |
0.00427 (1.00) |
0.132 (1.00) |
0.902 (1.00) |
| Del Peak 10(5q11 2) | 76 (34%) | 147 |
0.742 (1.00) |
0.0358 (1.00) |
1 (1.00) |
0.338 (1.00) |
0.672 (1.00) |
0.719 (1.00) |
0.106 (1.00) |
0.673 (1.00) |
0.427 (1.00) |
0.779 (1.00) |
0.566 (1.00) |
0.183 (1.00) |
0.00332 (1.00) |
0.147 (1.00) |
0.272 (1.00) |
| Del Peak 11(5q31 1) | 89 (40%) | 134 |
0.51 (1.00) |
0.00218 (1.00) |
0.68 (1.00) |
0.338 (1.00) |
0.4 (1.00) |
0.64 (1.00) |
0.0623 (1.00) |
0.862 (1.00) |
0.0615 (1.00) |
0.414 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0843 (1.00) |
0.00567 (1.00) |
0.00297 (1.00) |
0.122 (1.00) |
| Del Peak 12(6q11 1) | 62 (28%) | 161 |
0.0619 (1.00) |
0.491 (1.00) |
0.23 (1.00) |
0.265 (1.00) |
0.457 (1.00) |
0.931 (1.00) |
0.097 (1.00) |
0.137 (1.00) |
0.0189 (1.00) |
0.567 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0911 (1.00) |
0.527 (1.00) |
0.0371 (1.00) |
0.116 (1.00) |
| Del Peak 13(6q22 31) | 117 (52%) | 106 |
0.955 (1.00) |
0.478 (1.00) |
0.893 (1.00) |
0.137 (1.00) |
0.697 (1.00) |
0.696 (1.00) |
0.811 (1.00) |
0.898 (1.00) |
0.413 (1.00) |
1 (1.00) |
0.856 (1.00) |
0.73 (1.00) |
0.0286 (1.00) |
0.138 (1.00) |
0.357 (1.00) |
| Del Peak 14(6q26) | 116 (52%) | 107 |
0.963 (1.00) |
0.425 (1.00) |
0.18 (1.00) |
0.187 (1.00) |
0.394 (1.00) |
0.854 (1.00) |
0.543 (1.00) |
0.837 (1.00) |
0.428 (1.00) |
1 (1.00) |
0.365 (1.00) |
0.351 (1.00) |
0.141 (1.00) |
0.239 (1.00) |
0.441 (1.00) |
| Del Peak 15(8p23 2) | 104 (47%) | 119 |
0.241 (1.00) |
0.493 (1.00) |
0.0795 (1.00) |
0.0277 (1.00) |
0.0704 (1.00) |
0.403 (1.00) |
0.632 (1.00) |
0.724 (1.00) |
0.851 (1.00) |
0.605 (1.00) |
0.364 (1.00) |
0.398 (1.00) |
0.691 (1.00) |
0.221 (1.00) |
0.45 (1.00) |
| Del Peak 16(8p21 3) | 112 (50%) | 111 |
0.0557 (1.00) |
0.948 (1.00) |
0.0311 (1.00) |
0.033 (1.00) |
0.0503 (1.00) |
0.58 (1.00) |
0.294 (1.00) |
0.263 (1.00) |
0.767 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.856 (1.00) |
0.0209 (1.00) |
0.184 (1.00) |
0.796 (1.00) |
0.663 (1.00) |
| Del Peak 17(8p11 21) | 46 (21%) | 177 |
0.837 (1.00) |
0.766 (1.00) |
0.0194 (1.00) |
0.104 (1.00) |
0.814 (1.00) |
0.267 (1.00) |
0.639 (1.00) |
0.802 (1.00) |
0.702 (1.00) |
0.0902 (1.00) |
0.264 (1.00) |
0.632 (1.00) |
0.983 (1.00) |
0.798 (1.00) |
0.505 (1.00) |
| Del Peak 18(9p23) | 128 (57%) | 95 |
0.0946 (1.00) |
0.0978 (1.00) |
0.892 (1.00) |
0.786 (1.00) |
0.418 (1.00) |
0.812 (1.00) |
0.0114 (1.00) |
0.108 (1.00) |
0.115 (1.00) |
1 (1.00) |
0.583 (1.00) |
0.877 (1.00) |
0.042 (1.00) |
0.0773 (1.00) |
0.0374 (1.00) |
| Del Peak 19(9p21 3) | 134 (60%) | 89 |
0.229 (1.00) |
0.0596 (1.00) |
0.171 (1.00) |
0.671 (1.00) |
0.825 (1.00) |
0.906 (1.00) |
0.00583 (1.00) |
0.165 (1.00) |
0.0605 (1.00) |
1 (1.00) |
0.854 (1.00) |
0.842 (1.00) |
0.00814 (1.00) |
0.167 (1.00) |
0.109 (1.00) |
| Del Peak 20(9q21 11) | 112 (50%) | 111 |
0.181 (1.00) |
0.487 (1.00) |
0.788 (1.00) |
0.967 (1.00) |
0.107 (1.00) |
0.491 (1.00) |
0.187 (1.00) |
0.93 (1.00) |
0.148 (1.00) |
0.437 (1.00) |
0.071 (1.00) |
0.2 (1.00) |
0.945 (1.00) |
0.769 (1.00) |
0.897 (1.00) |
| Del Peak 21(10p15 3) | 54 (24%) | 169 |
0.156 (1.00) |
0.694 (1.00) |
0.000855 (0.853) |
0.638 (1.00) |
0.16 (1.00) |
0.137 (1.00) |
0.791 (1.00) |
0.701 (1.00) |
0.978 (1.00) |
0.532 (1.00) |
0.835 (1.00) |
0.321 (1.00) |
0.901 (1.00) |
0.0065 (1.00) |
0.295 (1.00) |
| Del Peak 22(10q26 3) | 62 (28%) | 161 |
0.827 (1.00) |
0.929 (1.00) |
0.0711 (1.00) |
0.0718 (1.00) |
0.827 (1.00) |
0.215 (1.00) |
0.263 (1.00) |
0.706 (1.00) |
0.0667 (1.00) |
0.0734 (1.00) |
0.543 (1.00) |
0.0594 (1.00) |
0.557 (1.00) |
0.157 (1.00) |
0.0436 (1.00) |
| Del Peak 23(11q25) | 50 (22%) | 173 |
0.218 (1.00) |
0.955 (1.00) |
0.749 (1.00) |
0.722 (1.00) |
0.748 (1.00) |
0.759 (1.00) |
0.722 (1.00) |
0.483 (1.00) |
0.856 (1.00) |
0.53 (1.00) |
0.274 (1.00) |
0.81 (1.00) |
0.925 (1.00) |
0.292 (1.00) |
0.126 (1.00) |
| Del Peak 24(12p12 3) | 60 (27%) | 163 |
0.57 (1.00) |
0.557 (1.00) |
0.0676 (1.00) |
0.94 (1.00) |
0.509 (1.00) |
0.454 (1.00) |
0.0807 (1.00) |
0.25 (1.00) |
0.318 (1.00) |
0.126 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0104 (1.00) |
0.472 (1.00) |
0.172 (1.00) |
0.315 (1.00) |
| Del Peak 25(12q24 33) | 62 (28%) | 161 |
0.79 (1.00) |
0.817 (1.00) |
0.549 (1.00) |
0.849 (1.00) |
0.014 (1.00) |
0.168 (1.00) |
0.977 (1.00) |
0.305 (1.00) |
0.88 (1.00) |
0.245 (1.00) |
1 (1.00) |
0.282 (1.00) |
0.879 (1.00) |
0.149 (1.00) |
0.694 (1.00) |
| Del Peak 26(13q12 11) | 115 (52%) | 108 |
0.76 (1.00) |
0.0977 (1.00) |
0.418 (1.00) |
0.0246 (1.00) |
0.135 (1.00) |
0.399 (1.00) |
0.892 (1.00) |
0.214 (1.00) |
0.476 (1.00) |
0.427 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0631 (1.00) |
0.139 (1.00) |
0.246 (1.00) |
0.101 (1.00) |
| Del Peak 27(14q32 33) | 64 (29%) | 159 |
0.25 (1.00) |
0.98 (1.00) |
0.655 (1.00) |
0.89 (1.00) |
0.356 (1.00) |
0.574 (1.00) |
0.11 (1.00) |
0.838 (1.00) |
0.257 (1.00) |
0.768 (1.00) |
0.16 (1.00) |
0.595 (1.00) |
0.895 (1.00) |
0.435 (1.00) |
0.333 (1.00) |
| Del Peak 28(15q11 2) | 122 (55%) | 101 |
0.609 (1.00) |
0.175 (1.00) |
0.0795 (1.00) |
0.125 (1.00) |
0.0283 (1.00) |
0.574 (1.00) |
0.842 (1.00) |
0.605 (1.00) |
0.952 (1.00) |
0.791 (1.00) |
0.466 (1.00) |
0.582 (1.00) |
0.333 (1.00) |
0.116 (1.00) |
0.175 (1.00) |
| Del Peak 29(15q15 2) | 122 (55%) | 101 |
0.941 (1.00) |
0.285 (1.00) |
0.0795 (1.00) |
0.125 (1.00) |
0.00769 (1.00) |
0.631 (1.00) |
0.751 (1.00) |
0.9 (1.00) |
1 (1.00) |
0.425 (1.00) |
0.716 (1.00) |
0.649 (1.00) |
0.715 (1.00) |
0.212 (1.00) |
0.342 (1.00) |
| Del Peak 30(16q23 1) | 73 (33%) | 150 |
0.768 (1.00) |
0.61 (1.00) |
0.472 (1.00) |
0.484 (1.00) |
0.723 (1.00) |
0.847 (1.00) |
0.677 (1.00) |
0.852 (1.00) |
0.756 (1.00) |
0.574 (1.00) |
0.564 (1.00) |
0.494 (1.00) |
0.299 (1.00) |
0.147 (1.00) |
0.751 (1.00) |
| Del Peak 31(17p13 3) | 129 (58%) | 94 |
0.128 (1.00) |
0.0457 (1.00) |
0.0765 (1.00) |
0.585 (1.00) |
0.144 (1.00) |
0.743 (1.00) |
0.981 (1.00) |
0.535 (1.00) |
0.959 (1.00) |
0.422 (1.00) |
0.143 (1.00) |
0.385 (1.00) |
0.344 (1.00) |
0.308 (1.00) |
0.0105 (1.00) |
| Del Peak 32(17p11 2) | 107 (48%) | 116 |
0.0869 (1.00) |
0.00715 (1.00) |
0.18 (1.00) |
0.254 (1.00) |
0.349 (1.00) |
0.14 (1.00) |
0.495 (1.00) |
0.328 (1.00) |
0.877 (1.00) |
0.111 (1.00) |
0.365 (1.00) |
0.857 (1.00) |
0.506 (1.00) |
0.65 (1.00) |
0.0665 (1.00) |
| Del Peak 33(18q21 1) | 113 (51%) | 110 |
0.358 (1.00) |
0.206 (1.00) |
0.226 (1.00) |
0.506 (1.00) |
0.139 (1.00) |
0.234 (1.00) |
0.752 (1.00) |
0.318 (1.00) |
0.551 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.766 (1.00) |
0.776 (1.00) |
0.461 (1.00) |
0.281 (1.00) |
| Del Peak 34(18q21 32) | 115 (52%) | 108 |
0.151 (1.00) |
0.168 (1.00) |
0.14 (1.00) |
0.506 (1.00) |
0.253 (1.00) |
0.224 (1.00) |
0.598 (1.00) |
0.652 (1.00) |
0.791 (1.00) |
0.597 (1.00) |
1 (1.00) |
0.742 (1.00) |
0.783 (1.00) |
0.293 (1.00) |
0.325 (1.00) |
| Del Peak 35(19p13 3) | 117 (52%) | 106 |
0.251 (1.00) |
0.678 (1.00) |
0.000269 (0.269) |
0.585 (1.00) |
0.39 (1.00) |
0.118 (1.00) |
0.385 (1.00) |
0.165 (1.00) |
0.217 (1.00) |
0.602 (1.00) |
0.1 (1.00) |
0.795 (1.00) |
0.844 (1.00) |
0.206 (1.00) |
0.562 (1.00) |
| Del Peak 36(19q13 33) | 80 (36%) | 143 |
0.255 (1.00) |
0.246 (1.00) |
0.122 (1.00) |
0.641 (1.00) |
0.56 (1.00) |
0.289 (1.00) |
0.468 (1.00) |
0.17 (1.00) |
0.266 (1.00) |
0.409 (1.00) |
0.132 (1.00) |
0.769 (1.00) |
0.545 (1.00) |
0.504 (1.00) |
0.385 (1.00) |
| Del Peak 37(21q11 2) | 75 (34%) | 148 |
0.873 (1.00) |
0.435 (1.00) |
0.157 (1.00) |
0.269 (1.00) |
0.55 (1.00) |
0.481 (1.00) |
0.776 (1.00) |
0.925 (1.00) |
0.266 (1.00) |
0.582 (1.00) |
0.0551 (1.00) |
0.00341 (1.00) |
0.0915 (1.00) |
0.168 (1.00) |
0.683 (1.00) |
| Del Peak 38(21q21 3) | 72 (32%) | 151 |
0.928 (1.00) |
0.653 (1.00) |
0.0432 (1.00) |
0.71 (1.00) |
0.803 (1.00) |
0.368 (1.00) |
0.677 (1.00) |
0.888 (1.00) |
0.388 (1.00) |
0.57 (1.00) |
0.0816 (1.00) |
0.00732 (1.00) |
0.0497 (1.00) |
0.0291 (1.00) |
0.859 (1.00) |
| Del Peak 39(22q13 32) | 107 (48%) | 116 |
0.358 (1.00) |
0.391 (1.00) |
0.345 (1.00) |
0.268 (1.00) |
0.704 (1.00) |
0.798 (1.00) |
0.358 (1.00) |
0.868 (1.00) |
0.24 (1.00) |
1 (1.00) |
0.717 (1.00) |
0.974 (1.00) |
0.88 (1.00) |
0.0789 (1.00) |
0.209 (1.00) |
| Del Peak 40(Xp22 2) | 58 (26%) | 165 |
0.302 (1.00) |
0.224 (1.00) |
0.0938 (1.00) |
0.419 (1.00) |
0.567 (1.00) |
0.764 (1.00) |
0.601 (1.00) |
0.867 (1.00) |
0.476 (1.00) |
0.765 (1.00) |
0.535 (1.00) |
0.549 (1.00) |
0.549 (1.00) |
0.662 (1.00) |
0.514 (1.00) |
Methods & Data
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