Correlation between gene mutation status and selected clinical features
Stomach and Esophageal carcinoma (Primary solid tumor)
28 January 2016  |  analyses__2016_01_28
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Maintained by TCGA GDAC Team (Broad Institute/MD Anderson Cancer Center/Harvard Medical School)
Cite as Broad Institute TCGA Genome Data Analysis Center (2016): Correlation between gene mutation status and selected clinical features. Broad Institute of MIT and Harvard. doi:10.7908/C1RB7430
Overview
Introduction

This pipeline computes the correlation between significantly recurrent gene mutations and selected clinical features.

Summary

Testing the association between mutation status of 1267 genes and 12 clinical features across 578 patients, 93 significant findings detected with Q value < 0.25.

  • ARID1A mutation correlated to 'GENDER' and 'RADIATION_THERAPY'.

  • RNF43 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH' and 'GENDER'.

  • XYLT2 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH' and 'GENDER'.

  • LARP4B mutation correlated to 'GENDER'.

  • PLEKHA6 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • PGM5 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH' and 'GENDER'.

  • ZBTB20 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH' and 'GENDER'.

  • MBD6 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • DDX17 mutation correlated to 'PATHOLOGY_T_STAGE'.

  • ZBTB7C mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • PRSS36 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • KIAA0406 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • KIAA1967 mutation correlated to 'GENDER'.

  • ZMYM4 mutation correlated to 'PATHOLOGY_T_STAGE'.

  • FHOD3 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • OSBP2 mutation correlated to 'GENDER'.

  • ADAM30 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • NFE2L2 mutation correlated to 'RACE'.

  • GLI1 mutation correlated to 'GENDER'.

  • KLHDC5 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • ERF mutation correlated to 'GENDER'.

  • ASAP2 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • BCORL1 mutation correlated to 'PATHOLOGY_T_STAGE' and 'GENDER'.

  • JARID2 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • TRIP4 mutation correlated to 'PATHOLOGIC_STAGE'.

  • SGOL2 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • CLDN6 mutation correlated to 'GENDER'.

  • PPIG mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • CELSR1 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • WDR7 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • SVIL mutation correlated to 'GENDER'.

  • ATM mutation correlated to 'Time to Death'.

  • TRAM1L1 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • ERBB4 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • HSPG2 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • SRCIN1 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • OBSCN mutation correlated to 'GENDER'.

  • ZC3H18 mutation correlated to 'GENDER'.

  • MBD2 mutation correlated to 'GENDER'.

  • ZC3H4 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • AXIN2 mutation correlated to 'GENDER'.

  • ZFHX3 mutation correlated to 'GENDER'.

  • CREBBP mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • CUBN mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • KIAA0240 mutation correlated to 'PATHOLOGY_T_STAGE'.

  • GTF3C1 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH' and 'GENDER'.

  • KIAA0100 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • GTF3C4 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • MAP7D3 mutation correlated to 'PATHOLOGY_T_STAGE' and 'GENDER'.

  • PRPF4B mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH' and 'GENDER'.

  • ARID1B mutation correlated to 'GENDER'.

  • TNK2 mutation correlated to 'GENDER'.

  • CNNM1 mutation correlated to 'GENDER'.

  • FGF1 mutation correlated to 'PATHOLOGIC_STAGE'.

  • BEND3 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • SIX3 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • HAND2 mutation correlated to 'PATHOLOGY_T_STAGE'.

  • NEK8 mutation correlated to 'GENDER'.

  • PTPLA mutation correlated to 'Time to Death'.

  • SRP14 mutation correlated to 'Time to Death'.

  • CD93 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • SLC25A17 mutation correlated to 'Time to Death'.

  • EPB41 mutation correlated to 'GENDER'.

  • ALDH3A1 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • DNAJA1 mutation correlated to 'PATHOLOGY_T_STAGE'.

  • THSD1 mutation correlated to 'GENDER'.

  • TRIOBP mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • KIAA1609 mutation correlated to 'PATHOLOGY_T_STAGE'.

  • C1RL mutation correlated to 'GENDER'.

  • TMEM116 mutation correlated to 'Time to Death'.

  • CLCA4 mutation correlated to 'GENDER'.

  • SCIN mutation correlated to 'PATHOLOGY_M_STAGE'.

  • TMEM127 mutation correlated to 'GENDER'.

  • OR6C70 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • CHD3 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • CSF3R mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

  • NOS1 mutation correlated to 'PATHOLOGY_T_STAGE'.

  • AFP mutation correlated to 'Time to Death'.

  • COL11A1 mutation correlated to 'Time to Death'.

  • INVS mutation correlated to 'GENDER'.

  • LRRC4 mutation correlated to 'PATHOLOGY_T_STAGE'.

  • ZNF828 mutation correlated to 'PATHOLOGIC_STAGE' and 'PATHOLOGY_T_STAGE'.

  • SETBP1 mutation correlated to 'YEARS_TO_BIRTH'.

Results
Overview of the results

Table 1.  Get Full Table Overview of the association between mutation status of 1267 genes and 12 clinical features. Shown in the table are P values (Q values). Thresholded by Q value < 0.25, 93 significant findings detected.

Clinical
Features
Time
to
Death
YEARS
TO
BIRTH
PATHOLOGIC
STAGE
PATHOLOGY
T
STAGE
PATHOLOGY
N
STAGE
PATHOLOGY
M
STAGE
GENDER RADIATION
THERAPY
KARNOFSKY
PERFORMANCE
SCORE
NUMBER
PACK
YEARS
SMOKED
RACE ETHNICITY
nMutated (%) nWild-Type logrank test Wilcoxon-test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Fisher's exact test Wilcoxon-test Wilcoxon-test Fisher's exact test Fisher's exact test
ARID1A 114 (20%) 464 0.402
(1.00)
0.00189
(0.269)
0.471
(1.00)
0.0149
(0.537)
0.378
(1.00)
0.835
(1.00)
0.00015
(0.0999)
0.000705
(0.205)
0.709
(1.00)
0.423
(1.00)
0.455
(1.00)
RNF43 47 (8%) 531 0.361
(1.00)
6.46e-05
(0.0951)
0.117
(0.904)
0.174
(0.975)
0.26
(1.00)
0.352
(1.00)
0.00142
(0.249)
0.272
(1.00)
0.465
(1.00)
0.574
(1.00)
XYLT2 40 (7%) 538 0.0538
(0.753)
8.27e-05
(0.0968)
0.0347
(0.672)
0.00903
(0.474)
0.554
(1.00)
1
(1.00)
0.000561
(0.193)
0.272
(1.00)
0.388
(1.00)
1
(1.00)
PGM5 43 (7%) 535 0.528
(1.00)
1.92e-05
(0.0585)
0.147
(0.939)
0.347
(1.00)
0.725
(1.00)
0.528
(1.00)
8.06e-05
(0.0968)
0.512
(1.00)
0.298
(1.00)
1
(1.00)
ZBTB20 42 (7%) 536 0.501
(1.00)
1.01e-05
(0.0446)
0.756
(1.00)
0.211
(1.00)
0.422
(1.00)
1
(1.00)
0.00145
(0.249)
0.119
(0.906)
1
(1.00)
0.513
(1.00)
BCORL1 27 (5%) 551 0.0757
(0.821)
0.0358
(0.676)
0.17
(0.972)
0.00064
(0.201)
0.0377
(0.692)
0.692
(1.00)
5.35e-05
(0.0928)
0.443
(1.00)
0.129
(0.92)
0.414
(1.00)
GTF3C1 39 (7%) 539 0.819
(1.00)
1.17e-05
(0.0446)
0.749
(1.00)
0.406
(1.00)
0.228
(1.00)
0.503
(1.00)
9.22e-05
(0.0969)
0.0109
(0.474)
0.535
(1.00)
0.288
(1.00)
1
(1.00)
MAP7D3 18 (3%) 560 0.208
(1.00)
0.384
(1.00)
0.593
(1.00)
0.00049
(0.182)
0.039
(0.694)
1
(1.00)
0.00111
(0.249)
0.0819
(0.832)
1
(1.00)
1
(1.00)
PRPF4B 12 (2%) 566 0.333
(1.00)
0.000291
(0.152)
0.626
(1.00)
0.769
(1.00)
0.569
(1.00)
1
(1.00)
0.00142
(0.249)
0.366
(1.00)
0.122
(0.908)
1
(1.00)
ZNF828 12 (2%) 566 0.55
(1.00)
0.322
(1.00)
0.00047
(0.182)
0.00124
(0.249)
0.113
(0.9)
0.0395
(0.694)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.844
(1.00)
0.723
(1.00)
0.0948
(0.857)
LARP4B 34 (6%) 544 0.19
(0.99)
0.00748
(0.444)
0.552
(1.00)
0.199
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.000332
(0.159)
0.325
(1.00)
0.812
(1.00)
0.5
(1.00)
PLEKHA6 28 (5%) 550 0.134
(0.92)
0.00153
(0.25)
0.457
(1.00)
0.0322
(0.656)
0.85
(1.00)
0.416
(1.00)
0.0204
(0.578)
0.195
(0.997)
0.253
(1.00)
0.107
(0.891)
0.399
(1.00)
MBD6 25 (4%) 553 0.333
(1.00)
0.000729
(0.205)
0.852
(1.00)
0.942
(1.00)
0.745
(1.00)
1
(1.00)
0.0228
(0.59)
0.392
(1.00)
0.191
(0.99)
1
(1.00)
DDX17 17 (3%) 561 0.854
(1.00)
0.013
(0.509)
0.301
(1.00)
0.00132
(0.249)
0.24
(1.00)
0.329
(1.00)
0.0131
(0.509)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
ZBTB7C 17 (3%) 561 0.306
(1.00)
0.00091
(0.231)
0.641
(1.00)
0.401
(1.00)
0.448
(1.00)
0.62
(1.00)
0.00262
(0.315)
1
(1.00)
0.278
(1.00)
1
(1.00)
PRSS36 22 (4%) 556 0.49
(1.00)
0.000151
(0.0999)
0.91
(1.00)
0.9
(1.00)
0.798
(1.00)
0.651
(1.00)
0.151
(0.949)
1
(1.00)
0.0693
(0.807)
0.329
(1.00)
1
(1.00)
KIAA0406 26 (4%) 552 0.578
(1.00)
6.88e-05
(0.0951)
0.632
(1.00)
0.488
(1.00)
0.628
(1.00)
0.703
(1.00)
0.38
(1.00)
0.0117
(0.486)
0.797
(1.00)
1
(1.00)
KIAA1967 26 (4%) 552 0.205
(1.00)
0.0485
(0.753)
0.896
(1.00)
0.254
(1.00)
0.362
(1.00)
0.244
(1.00)
0.000209
(0.122)
1
(1.00)
0.823
(1.00)
0.383
(1.00)
ZMYM4 24 (4%) 554 0.782
(1.00)
0.175
(0.975)
0.202
(1.00)
5e-05
(0.0928)
0.605
(1.00)
0.212
(1.00)
0.656
(1.00)
0.147
(0.939)
0.293
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
FHOD3 36 (6%) 542 0.709
(1.00)
0.00113
(0.249)
0.516
(1.00)
0.695
(1.00)
0.554
(1.00)
0.271
(1.00)
0.0588
(0.773)
0.484
(1.00)
0.529
(1.00)
0.454
(1.00)
1
(1.00)
OSBP2 15 (3%) 563 0.341
(1.00)
0.0723
(0.817)
0.523
(1.00)
0.396
(1.00)
0.596
(1.00)
0.301
(1.00)
0.000527
(0.186)
0.48
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
ADAM30 19 (3%) 559 0.104
(0.884)
0.00118
(0.249)
0.369
(1.00)
0.252
(1.00)
0.35
(1.00)
1
(1.00)
0.0387
(0.693)
0.51
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
NFE2L2 18 (3%) 560 0.709
(1.00)
0.00599
(0.415)
0.021
(0.58)
0.213
(1.00)
0.589
(1.00)
0.357
(1.00)
0.298
(1.00)
0.165
(0.959)
0.581
(1.00)
0.137
(0.922)
0.00029
(0.152)
1
(1.00)
GLI1 25 (4%) 553 0.339
(1.00)
0.012
(0.492)
0.272
(1.00)
0.0227
(0.589)
0.555
(1.00)
0.703
(1.00)
0.0014
(0.249)
0.216
(1.00)
0.783
(1.00)
1
(1.00)
KLHDC5 13 (2%) 565 0.399
(1.00)
0.00076
(0.206)
0.146
(0.939)
0.139
(0.924)
0.497
(1.00)
1
(1.00)
0.222
(1.00)
0.701
(1.00)
0.268
(1.00)
1
(1.00)
ERF 18 (3%) 560 0.595
(1.00)
0.00835
(0.467)
0.0443
(0.732)
0.803
(1.00)
0.502
(1.00)
1
(1.00)
0.00111
(0.249)
0.322
(1.00)
0.59
(1.00)
1
(1.00)
ASAP2 21 (4%) 557 0.619
(1.00)
0.000492
(0.182)
0.95
(1.00)
0.312
(1.00)
0.808
(1.00)
0.633
(1.00)
0.223
(1.00)
0.324
(1.00)
0.686
(1.00)
0.611
(1.00)
1
(1.00)
JARID2 44 (8%) 534 0.0592
(0.775)
0.0013
(0.249)
0.318
(1.00)
0.148
(0.944)
0.752
(1.00)
1
(1.00)
0.121
(0.906)
0.2
(1.00)
0.767
(1.00)
0.895
(1.00)
0.172
(0.972)
TRIP4 14 (2%) 564 0.478
(1.00)
0.215
(1.00)
0.0015
(0.249)
0.0181
(0.572)
0.489
(1.00)
0.273
(1.00)
0.373
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
SGOL2 17 (3%) 561 0.36
(1.00)
0.00138
(0.249)
0.275
(1.00)
0.766
(1.00)
0.523
(1.00)
0.329
(1.00)
0.292
(1.00)
1
(1.00)
0.703
(1.00)
1
(1.00)
CLDN6 10 (2%) 568 0.684
(1.00)
0.0599
(0.782)
0.897
(1.00)
0.653
(1.00)
1
(1.00)
0.161
(0.953)
0.000117
(0.0987)
0.216
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
PPIG 20 (3%) 558 0.319
(1.00)
0.0015
(0.249)
0.0972
(0.868)
0.14
(0.925)
0.407
(1.00)
0.642
(1.00)
0.324
(1.00)
1
(1.00)
0.13
(0.92)
1
(1.00)
CELSR1 45 (8%) 533 0.877
(1.00)
5.15e-05
(0.0928)
0.383
(1.00)
0.015
(0.538)
0.258
(1.00)
0.191
(0.99)
0.00593
(0.415)
0.119
(0.906)
0.553
(1.00)
0.603
(1.00)
1
(1.00)
WDR7 29 (5%) 549 0.388
(1.00)
0.000773
(0.206)
0.542
(1.00)
0.074
(0.817)
0.779
(1.00)
0.244
(1.00)
0.404
(1.00)
0.593
(1.00)
0.00934
(0.474)
0.0305
(0.65)
0.366
(1.00)
SVIL 34 (6%) 544 0.144
(0.933)
0.0106
(0.474)
0.811
(1.00)
0.0204
(0.578)
0.908
(1.00)
0.474
(1.00)
0.00148
(0.249)
0.134
(0.92)
0.282
(1.00)
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AFP 4 (1%) 574 0.00121
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COL11A1 61 (11%) 517 0.000702
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(1.00)
0.0566
(0.761)
INVS 23 (4%) 555 0.763
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(1.00)
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(0.58)
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(1.00)
1
(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
0.00173
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(1.00)
0.845
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.0463
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(0.953)
0.752
(1.00)
0.874
(1.00)
0.96
(1.00)
0.989
(1.00)
1
(1.00)
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(0.753)
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(1.00)
0.177
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CIC 54 (9%) 524 0.176
(0.977)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
TENC1 23 (4%) 555 0.575
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
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0.452
(1.00)
0.45
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
0.147
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0.322
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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0.434
(1.00)
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1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
0.312
(1.00)
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(1.00)
0.916
(1.00)
0.444
(1.00)
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(1.00)
0.831
(1.00)
0.336
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(0.544)
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(1.00)
1
(1.00)
0.675
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
0.362
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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1
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1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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0.249
(1.00)
0.467
(1.00)
1
(1.00)
CYP27B1 11 (2%) 567 0.312
(1.00)
0.304
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
CEP57 13 (2%) 565 0.786
(1.00)
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(1.00)
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(0.981)
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1
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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FAHD2B 12 (2%) 566 0.83
(1.00)
0.0605
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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1
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1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
0.753
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
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(1.00)
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(1.00)
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(0.9)
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(1.00)
0.535
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(0.83)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
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1
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1
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
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(1.00)
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(1.00)
0.664
(1.00)
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1
(1.00)
1
(1.00)
0.614
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
0.0145
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0.178
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0.651
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
0.779
(1.00)
1
(1.00)
B3GNT5 12 (2%) 566 0.109
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(1.00)
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(0.568)
0.478
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0.602
(1.00)
0.354
(1.00)
0.701
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
SPTY2D1 21 (4%) 557 0.351
(1.00)
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0.269
(1.00)
0.0517
(0.753)
0.943
(1.00)
0.385
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1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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1
(1.00)
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1
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1
(1.00)
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1
(1.00)
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1
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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1
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
0.933
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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SAMD9L 34 (6%) 544 0.0872
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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0.135
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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1
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
0.156
(0.953)
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(1.00)
0.853
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(0.953)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(0.953)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
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(0.92)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(0.973)
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(1.00)
0.755
(1.00)
0.783
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
0.773
(1.00)
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(1.00)
1
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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0.132
(0.92)
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1
(1.00)
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1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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1
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
1
(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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1
(1.00)
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1
(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
COIL 11 (2%) 567 0.981
(1.00)
0.35
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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NID2 22 (4%) 556 0.911
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KIRREL 24 (4%) 554 0.767
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GLYR1 17 (3%) 561 0.236
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(1.00)
1
(1.00)
CNBD1 22 (4%) 556 0.067
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1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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NT5M 7 (1%) 571 0.542
(1.00)
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0.931
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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1
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(1.00)
1
(1.00)
C11ORF80 9 (2%) 569 0.217
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0.242
(1.00)
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1
(1.00)
0.462
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
0.909
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1
(1.00)
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1
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(1.00)
IPO11 13 (2%) 565 0.519
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1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
CTSO 7 (1%) 571 0.137
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
RIC3 9 (2%) 569 0.571
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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1
(1.00)
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1
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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1
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(1.00)
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(1.00)
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1
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(1.00)
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1
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(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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0.231
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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1
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1
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1
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1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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1
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(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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(0.753)
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(1.00)
1
(1.00)
0.0548
(0.753)
1
(1.00)
0.74
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1
(1.00)
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1
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(1.00)
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(1.00)
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1
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0.0313
(0.653)
CCDC27 12 (2%) 566 0.568
(1.00)
0.653
(1.00)
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0.0912
(0.856)
0.16
(0.953)
0.57
(1.00)
0.757
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
0.0551
(0.753)
0.202
(1.00)
SH3BP2 7 (1%) 571 0.148
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(1.00)
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(1.00)
0.446
(1.00)
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(0.821)
1
(1.00)
0.00343
(0.337)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
TIGD7 12 (2%) 566 0.441
(1.00)
0.481
(1.00)
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(1.00)
0.211
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
0.757
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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1
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(1.00)
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1
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1
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1
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1
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1
(1.00)
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1
(1.00)
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1
(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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ZKSCAN1 12 (2%) 566 0.157
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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TIE1 28 (5%) 550 0.636
(1.00)
0.0353
(0.674)
0.103
(0.882)
0.0198
(0.578)
0.935
(1.00)
0.437
(1.00)
0.29
(1.00)
0.626
(1.00)
0.837
(1.00)
1
(1.00)
MBOAT2 4 (1%) 574 0.713
(1.00)
0.186
(0.99)
0.393
(1.00)
1
(1.00)
0.586
(1.00)
0.483
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
HORMAD1 9 (2%) 569 0.661
(1.00)
0.997
(1.00)
0.915
(1.00)
0.303
(1.00)
0.931
(1.00)
0.457
(1.00)
0.73
(1.00)
0.693
(1.00)
0.741
(1.00)
1
(1.00)
KIAA1549 33 (6%) 545 0.167
(0.968)
0.0161
(0.548)
0.444
(1.00)
0.0826
(0.832)
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(0.817)
0.715
(1.00)
0.434
(1.00)
0.481
(1.00)
0.187
(0.99)
0.879
(1.00)
0.473
(1.00)
COL4A3BP 6 (1%) 572 0.522
(1.00)
0.555
(1.00)
0.117
(0.904)
0.333
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(0.89)
1
(1.00)
HCRTR1 6 (1%) 572 0.181
(0.981)
0.339
(1.00)
0.597
(1.00)
0.21
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
0.369
(1.00)
0.588
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
DHRS9 10 (2%) 568 0.525
(1.00)
0.089
(0.846)
0.69
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
ERI1 4 (1%) 574 0.555
(1.00)
0.388
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
0.0812
(0.83)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
POU5F1B 9 (2%) 569 0.707
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
0.462
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
MYCN 8 (1%) 570 0.35
(1.00)
0.00693
(0.428)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.7
(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
TCN2 12 (2%) 566 0.551
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
0.4
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(0.953)
IFT74 12 (2%) 566 0.716
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
EVI2B 9 (2%) 569 0.201
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(0.892)
1
(1.00)
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1
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(1.00)
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1
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(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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1
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
F13A1 19 (3%) 559 0.778
(1.00)
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1
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(1.00)
1
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(0.658)
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(1.00)
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1
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
NUPL2 9 (2%) 569 0.925
(1.00)
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1
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(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
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(1.00)
1
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(1.00)
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(0.872)
1
(1.00)
1
(1.00)
IKBIP 3 (1%) 575 0.371
(1.00)
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(1.00)
0.159
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0.364
(1.00)
1
(1.00)
0.558
(1.00)
0.1
(0.872)
1
(1.00)
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(1.00)
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1
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(0.904)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
0.491
(1.00)
0.6
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
0.179
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(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
0.197
(1)
0.055
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0.239
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
0.43
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(0.821)
0.41
(1.00)
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0.568
(1.00)
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(1.00)
0.216
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
0.307
(1.00)
1
(1.00)
EFHC1 10 (2%) 568 0.397
(1.00)
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(1.00)
0.223
(1.00)
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0.743
(1.00)
1
(1.00)
0.0724
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0.695
(1.00)
0.1
(0.872)
1
(1.00)
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(1.00)
0.309
(1.00)
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(1.00)
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(0.5)
0.811
(1.00)
0.161
(0.953)
0.74
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
0.116
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(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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MTSS1 15 (3%) 563 0.858
(1.00)
0.0605
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0.911
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
0.778
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(0.953)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
0.323
(1.00)
0.00206
(0.275)
0.502
(1.00)
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(1.00)
SMC5 13 (2%) 565 0.941
(1.00)
0.126
(0.917)
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(0.753)
0.458
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
0.542
(1.00)
0.727
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
BAG4 5 (1%) 573 0.529
(1.00)
0.0219
(0.583)
0.693
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(0.953)
0.483
(1.00)
0.602
(1.00)
1
(1.00)
ZMYND8 21 (4%) 557 0.0768
(0.821)
0.413
(1.00)
0.65
(1.00)
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(0.989)
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(1.00)
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(0.99)
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(0.5)
0.765
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
MPP5 9 (2%) 569 0.89
(1.00)
0.336
(1.00)
0.776
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(0.849)
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(0.846)
0.671
(1.00)
0.501
(1.00)
1
(1.00)
0.7
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
CSNK2A2 9 (2%) 569 0.144
(0.935)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
CCR9 8 (1%) 570 0.787
(1.00)
0.742
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
PODN 15 (3%) 563 0.766
(1.00)
0.116
(0.904)
0.18
(0.981)
0.257
(1.00)
0.902
(1.00)
0.301
(1.00)
0.159
(0.953)
1
(1.00)
0.557
(1.00)
0.373
(1.00)
1
(1.00)
VWA1 8 (1%) 570 0.783
(1.00)
0.0125
(0.501)
0.508
(1.00)
0.953
(1.00)
0.157
(0.953)
1
(1.00)
0.246
(1.00)
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(1.00)
0.74
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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1
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1
(1.00)
SETD6 8 (1%) 570 0.0777
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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OR1L3 8 (1%) 570 0.241
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(1.00)
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(0.703)
0.626
(1.00)
0.458
(1.00)
0.547
(1.00)
0.926
(1.00)
0.461
(1.00)
0.881
(1.00)
1
(1.00)
PSMC4 16 (3%) 562 0.907
(1.00)
0.108
(0.892)
0.228
(1.00)
0.565
(1.00)
0.361
(1.00)
0.613
(1.00)
0.415
(1.00)
0.492
(1.00)
0.082
(0.832)
0.268
(1.00)
0.079
(0.83)
1
(1.00)
ITGB8 15 (3%) 563 0.887
(1.00)
0.191
(0.99)
0.436
(1.00)
0.0382
(0.693)
0.605
(1.00)
0.0748
(0.817)
0.0179
(0.571)
0.48
(1.00)
0.821
(1.00)
1
(1.00)
ARHGEF5 8 (1%) 570 0.117
(0.904)
0.56
(1.00)
0.758
(1.00)
0.574
(1.00)
0.479
(1.00)
1
(1.00)
0.246
(1.00)
0.659
(1.00)
0.207
(1.00)
1
(1.00)
E2F5 5 (1%) 573 0.843
(1.00)
0.632
(1.00)
0.407
(1.00)
0.236
(1.00)
0.158
(0.953)
1
(1.00)
0.159
(0.953)
0.483
(1.00)
0.248
(1.00)
1
(1.00)
MKI67IP 9 (2%) 569 0.104
(0.884)
0.332
(1.00)
0.966
(1.00)
1
(1.00)
0.666
(1.00)
1
(1.00)
0.292
(1.00)
0.629
(1.00)
0.205
(1.00)
1
(1.00)
TMEM63A 15 (3%) 563 0.908
(1.00)
0.0113
(0.48)
0.0556
(0.754)
0.017
(0.568)
0.419
(1.00)
0.613
(1.00)
0.778
(1.00)
1
(1.00)
0.67
(1.00)
1
(1.00)
ZCCHC2 8 (1%) 570 0.938
(1.00)
0.218
(1.00)
0.324
(1.00)
1
(1.00)
0.564
(1.00)
1
(1.00)
0.7
(1.00)
0.366
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
EPHB6 22 (4%) 556 0.185
(0.99)
0.0626
(0.791)
0.525
(1.00)
0.654
(1.00)
0.233
(1.00)
1
(1.00)
0.483
(1.00)
0.554
(1.00)
0.624
(1.00)
1
(1.00)
GPR1 7 (1%) 571 0.503
(1.00)
0.239
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.652
(1.00)
0.414
(1.00)
0.205
(1.00)
0.355
(1.00)
0.511
(1.00)
0.161
(0.953)
PCDHGC3 15 (3%) 563 0.786
(1.00)
0.0986
(0.871)
0.956
(1.00)
0.333
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.0806
(0.83)
0.322
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
CACNA1H 40 (7%) 538 0.714
(1.00)
0.915
(1.00)
0.589
(1.00)
0.78
(1.00)
0.448
(1.00)
0.729
(1.00)
1
(1.00)
0.512
(1.00)
0.692
(1.00)
1
(1.00)
0.538
(1.00)
RPS6KA5 9 (2%) 569 0.816
(1.00)
0.207
(1.00)
0.959
(1.00)
0.953
(1.00)
0.759
(1.00)
1
(1.00)
0.73
(1.00)
1
(1.00)
0.934
(1.00)
0.776
(1.00)
1
(1.00)
NAGPA 9 (2%) 569 0.737
(1.00)
0.533
(1.00)
0.655
(1.00)
1
(1.00)
0.965
(1.00)
0.457
(1.00)
0.462
(1.00)
0.366
(1.00)
0.133
(0.92)
1
(1.00)
KCNJ6 12 (2%) 566 0.154
(0.953)
0.217
(1.00)
0.564
(1.00)
0.281
(1.00)
0.952
(1.00)
0.57
(1.00)
0.354
(1.00)
0.216
(1.00)
0.804
(1.00)
1
(1.00)
PIGZ 10 (2%) 568 0.721
(1.00)
0.0726
(0.817)
0.914
(1.00)
0.204
(1.00)
0.93
(1.00)
0.498
(1.00)
0.0724
(0.817)
0.366
(1.00)
0.611
(1.00)
1
(1.00)
DBF4 9 (2%) 569 0.987
(1.00)
0.606
(1.00)
0.458
(1.00)
0.791
(1.00)
0.564
(1.00)
0.367
(1.00)
0.00381
(0.337)
0.366
(1.00)
0.759
(1.00)
1
(1.00)
DOK7 7 (1%) 571 0.872
(1.00)
0.826
(1.00)
0.721
(1.00)
0.294
(1.00)
0.547
(1.00)
0.367
(1.00)
0.205
(1.00)
1
(1.00)
0.248
(1.00)
1
(1.00)
HECA 19 (3%) 559 0.235
(1.00)
0.341
(1.00)
0.118
(0.904)
0.3
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
0.00989
(0.474)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
IGBP1 6 (1%) 572 0.752
(1.00)
0.275
(1.00)
0.951
(1.00)
0.134
(0.92)
0.26
(1.00)
1
(1.00)
0.369
(1.00)
1
(1.00)
0.332
(1.00)
1
(1.00)
INSM2 13 (2%) 565 0.531
(1.00)
0.00484
(0.375)
0.0872
(0.844)
0.0715
(0.817)
0.49
(1.00)
1
(1.00)
0.0258
(0.606)
1
(1.00)
0.0791
(0.83)
1
(1.00)
SAE1 6 (1%) 572 0.564
(1.00)
0.0415
(0.714)
0.914
(1.00)
0.661
(1.00)
0.682
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.603
(1.00)
0.72
(1.00)
1
(1.00)
SUCLG2 8 (1%) 570 0.797
(1.00)
0.0756
(0.821)
0.116
(0.904)
0.367
(1.00)
0.379
(1.00)
0.414
(1.00)
0.246
(1.00)
0.355
(1.00)
0.152
(0.952)
1
(1.00)
CDC6 13 (2%) 565 0.488
(1.00)
0.169
(0.972)
0.652
(1.00)
0.864
(1.00)
0.379
(1.00)
0.535
(1.00)
1
(1.00)
0.0263
(0.606)
0.788
(1.00)
0.821
(1.00)
1
(1.00)
CUL5 15 (3%) 563 0.692
(1.00)
0.863
(1.00)
0.771
(1.00)
0.85
(1.00)
0.377
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.322
(1.00)
0.493
(1.00)
1
(1.00)
SERPINB8 8 (1%) 570 0.0313
(0.653)
0.0108
(0.474)
0.00843
(0.467)
0.00408
(0.352)
0.544
(1.00)
1
(1.00)
0.7
(1.00)
0.588
(1.00)
0.382
(1.00)
1
(1.00)
HSP90AB1 13 (2%) 565 0.175
(0.976)
0.545
(1.00)
0.33
(1.00)
0.471
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(0.606)
0.48
(1.00)
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(0.606)
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(1.00)
1
(1.00)
SMARCA4 38 (7%) 540 0.0421
(0.718)
0.0568
(0.762)
0.104
(0.884)
0.484
(1.00)
0.196
(0.998)
1
(1.00)
0.0173
(0.571)
0.512
(1.00)
0.926
(1.00)
0.502
(1.00)
0.363
(1.00)
1
(1.00)
SETD2 24 (4%) 554 0.682
(1.00)
0.0615
(0.789)
0.262
(1.00)
0.164
(0.959)
0.915
(1.00)
1
(1.00)
0.494
(1.00)
0.783
(1.00)
0.877
(1.00)
0.405
(1.00)
0.176
(0.979)
0.35
(1.00)
ZC3H8 5 (1%) 573 0.0722
(0.817)
0.285
(1.00)
0.297
(1.00)
0.338
(1.00)
0.691
(1.00)
0.262
(1.00)
1
(1.00)
0.256
(1.00)
0.118
(0.905)
1
(1.00)
NARG2 14 (2%) 564 0.357
(1.00)
0.0344
(0.672)
0.743
(1.00)
0.271
(1.00)
0.553
(1.00)
0.613
(1.00)
0.035
(0.672)
0.48
(1.00)
0.836
(1.00)
1
(1.00)
C3ORF33 8 (1%) 570 0.436
(1.00)
0.0955
(0.862)
0.347
(1.00)
0.685
(1.00)
0.585
(1.00)
1
(1.00)
0.7
(1.00)
1
(1.00)
0.0109
(0.474)
1
(1.00)
ZNF2 9 (2%) 569 0.274
(1.00)
0.107
(0.892)
0.583
(1.00)
0.588
(1.00)
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(0.99)
0.498
(1.00)
0.462
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
ETV1 9 (2%) 569 0.142
(0.929)
0.478
(1.00)
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(1.00)
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0.9
(1.00)
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(1.00)
0.73
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
TAF6 15 (3%) 563 0.895
(1.00)
0.326
(1.00)
0.518
(1.00)
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(0.287)
0.784
(1.00)
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(1.00)
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(0.953)
1
(1.00)
0.702
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
0.107
(0.892)
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(1.00)
1
(1.00)
0.87
(1.00)
1
(1.00)
0.159
(0.953)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
SPTLC3 15 (3%) 563 0.0528
(0.753)
0.0853
(0.842)
0.636
(1.00)
0.928
(1.00)
0.742
(1.00)
1
(1.00)
0.159
(0.953)
0.136
(0.92)
0.811
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
0.411
(1.00)
0.542
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(0.583)
0.392
(1.00)
0.383
(1.00)
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(1.00)
KCNT2 41 (7%) 537 0.00667
(0.424)
0.0326
(0.658)
0.696
(1.00)
0.351
(1.00)
0.205
(1.00)
0.515
(1.00)
1
(1.00)
0.512
(1.00)
0.533
(1.00)
0.94
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
0.997
(1.00)
0.848
(1.00)
0.764
(1.00)
0.0889
(0.846)
1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(0.753)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(0.674)
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(0.571)
0.0744
(0.817)
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(0.99)
0.498
(1.00)
0.00952
(0.474)
0.216
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
BZW1 9 (2%) 569 0.738
(1.00)
0.983
(1.00)
0.466
(1.00)
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(1.00)
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(0.92)
0.135
(0.92)
1
(1.00)
0.513
(1.00)
1
(1.00)
CEP110 19 (3%) 559 0.823
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
UACA 17 (3%) 561 0.688
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(0.98)
1
(1.00)
PAPOLB 15 (3%) 563 0.508
(1.00)
0.805
(1.00)
0.923
(1.00)
0.778
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
0.397
(1.00)
0.701
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
TBC1D22B 9 (2%) 569 0.534
(1.00)
0.877
(1.00)
0.735
(1.00)
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(0.99)
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(1.00)
1
(1.00)
0.73
(1.00)
1
(1.00)
0.571
(1.00)
1
(1.00)
HTR1E 17 (3%) 561 0.633
(1.00)
0.831
(1.00)
0.219
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.823
(1.00)
0.222
(1.00)
SALL2 16 (3%) 562 0.912
(1.00)
0.578
(1.00)
0.00954
(0.474)
0.0103
(0.474)
0.0715
(0.817)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.533
(1.00)
0.724
(1.00)
1
(1.00)
BTAF1 25 (4%) 553 0.106
(0.89)
0.951
(1.00)
0.266
(1.00)
0.153
(0.953)
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(1.00)
0.407
(1.00)
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(0.59)
0.593
(1.00)
0.352
(1.00)
0.0803
(0.83)
0.315
(1.00)
ARV1 7 (1%) 571 0.321
(1.00)
0.414
(1.00)
0.935
(1.00)
0.941
(1.00)
0.947
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.463
(1.00)
1
(1.00)
DOPEY2 35 (6%) 543 0.98
(1.00)
0.125
(0.917)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(0.845)
1
(1.00)
0.804
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(0.5)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(0.92)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
SRPK3 13 (2%) 565 0.113
(0.9)
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(1.00)
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0.306
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(0.606)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
CIB3 5 (1%) 573 0.997
(1.00)
0.294
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(0.884)
1
(1.00)
PDK3 8 (1%) 570 0.499
(1.00)
0.914
(1.00)
0.533
(1.00)
0.656
(1.00)
0.884
(1.00)
1
(1.00)
0.7
(1.00)
0.603
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
NRIP3 7 (1%) 571 0.846
(1.00)
0.196
(0.998)
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(0.753)
0.00643
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0.208
(1.00)
0.414
(1.00)
0.43
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
0.907
(1.00)
0.803
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
0.542
(1.00)
0.265
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
ZNF167 15 (3%) 563 0.111
(0.896)
0.0542
(0.753)
0.434
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(0.83)
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(1.00)
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(1.00)
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(0.981)
ABCA5 23 (4%) 555 0.0981
(0.87)
0.00434
(0.36)
0.184
(0.989)
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(1.00)
0.429
(1.00)
1
(1.00)
0.163
(0.957)
1
(1.00)
0.899
(1.00)
1
(1.00)
PPM1D 10 (2%) 568 0.465
(1.00)
0.364
(1.00)
0.495
(1.00)
0.652
(1.00)
0.662
(1.00)
0.498
(1.00)
0.494
(1.00)
0.216
(1.00)
0.756
(1.00)
1
(1.00)
CSNK1G1 7 (1%) 571 0.541
(1.00)
0.315
(1.00)
0.775
(1.00)
0.754
(1.00)
0.397
(1.00)
0.367
(1.00)
0.205
(1.00)
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(1.00)
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(0.817)
1
(1.00)
TMC2 19 (3%) 559 0.969
(1.00)
0.806
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(0.846)
0.804
(1.00)
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(1.00)
0.527
(1.00)
1
(1.00)
XRCC5 13 (2%) 565 0.796
(1.00)
0.0146
(0.535)
0.519
(1.00)
0.366
(1.00)
0.977
(1.00)
0.189
(0.99)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.25
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
0.303
(1.00)
0.852
(1.00)
0.669
(1.00)
0.901
(1.00)
1
(1.00)
0.205
(1.00)
1
(1.00)
0.0501
(0.753)
1
(1.00)
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(1.00)
0.343
(1.00)
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(0.92)
0.482
(1.00)
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(0.901)
0.66
(1.00)
0.0538
(0.753)
0.143
(0.932)
0.453
(1.00)
1
(1.00)
ZNF98 18 (3%) 560 0.975
(1.00)
0.214
(1.00)
0.695
(1.00)
0.751
(1.00)
0.767
(1.00)
1
(1.00)
0.434
(1.00)
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(1.00)
0.885
(1.00)
0.0416
(0.714)
1
(1.00)
RGS22 23 (4%) 555 0.0926
(0.857)
0.052
(0.753)
0.787
(1.00)
0.877
(1.00)
0.532
(1.00)
1
(1.00)
0.353
(1.00)
0.0191
(0.578)
1
(1.00)
1
(1.00)
ATOH1 6 (1%) 572 0.905
(1.00)
0.218
(1.00)
0.517
(1.00)
0.479
(1.00)
0.845
(1.00)
1
(1.00)
0.0675
(0.798)
0.588
(1.00)
0.626
(1.00)
1
(1.00)
RBM33 21 (4%) 557 0.308
(1.00)
0.0952
(0.86)
0.956
(1.00)
0.673
(1.00)
0.193
(0.994)
1
(1.00)
0.0873
(0.844)
0.776
(1.00)
0.362
(1.00)
0.383
(1.00)
SLC22A16 12 (2%) 566 0.168
(0.969)
0.577
(1.00)
0.942
(1.00)
0.243
(1.00)
0.524
(1.00)
0.535
(1.00)
0.757
(1.00)
1
(1.00)
0.822
(1.00)
1
(1.00)
SMAD2 11 (2%) 567 0.975
(1.00)
0.134
(0.92)
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(1.00)
0.737
(1.00)
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(0.912)
0.535
(1.00)
0.0933
(0.857)
0.0521
(0.753)
0.246
(1.00)
0.181
(0.981)
FIGNL1 12 (2%) 566 0.551
(1.00)
0.624
(1.00)
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0.243
(1.00)
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(1.00)
0.57
(1.00)
0.197
(0.999)
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(0.92)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
0.357
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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1
(1.00)
0.00224
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1
(1.00)
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(0.904)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
0.324
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(0.606)
0.116
(0.904)
0.412
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(0.69)
1
(1.00)
0.247
(1.00)
0.817
(1.00)
0.458
(1.00)
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(1.00)
0.949
(1.00)
0.798
(1.00)
0.702
(1.00)
0.563
(1.00)
0.262
(1.00)
0.637
(1.00)
1
(1.00)
0.248
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
0.244
(1.00)
0.742
(1.00)
0.356
(1.00)
0.973
(1.00)
0.535
(1.00)
0.74
(1.00)
0.695
(1.00)
0.811
(1.00)
1
(1.00)
PELI2 11 (2%) 567 0.892
(1.00)
0.288
(1.00)
0.449
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.389
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
UNC93B1 9 (2%) 569 0.741
(1.00)
0.251
(1.00)
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(0.99)
0.552
(1.00)
0.692
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.19
(0.99)
0.305
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
0.491
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(0.99)
1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
0.0259
(0.606)
0.279
(1.00)
0.902
(1.00)
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(1.00)
0.602
(1.00)
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(1.00)
0.476
(1.00)
0.0671
(0.798)
0.222
(1.00)
GLTPD1 4 (1%) 574 0.425
(1.00)
0.672
(1.00)
0.731
(1.00)
0.0321
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0.401
(1.00)
1
(1.00)
0.586
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(0.921)
0.0133
(0.514)
0.0269
(0.61)
0.749
(1.00)
1
(1.00)
0.172
(0.972)
0.421
(1.00)
0.57
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
0.478
(1.00)
0.106
(0.891)
0.0106
(0.474)
0.0884
(0.846)
0.602
(1.00)
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(1.00)
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(0.832)
0.306
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
0.629
(1.00)
0.301
(1.00)
0.198
(1.00)
0.548
(1.00)
0.414
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.391
(1.00)
0.0107
(0.474)
ABCD1 10 (2%) 568 0.0839
(0.833)
0.802
(1.00)
0.95
(1.00)
0.462
(1.00)
0.404
(1.00)
0.535
(1.00)
0.172
(0.972)
1
(1.00)
0.804
(1.00)
1
(1.00)
MCTP1 10 (2%) 568 0.887
(1.00)
0.226
(1.00)
0.987
(1.00)
0.867
(1.00)
0.788
(1.00)
1
(1.00)
0.494
(1.00)
1
(1.00)
0.758
(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
0.725
(1.00)
0.578
(1.00)
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(0.959)
0.835
(1.00)
0.189
(0.99)
0.354
(1.00)
0.695
(1.00)
0.482
(1.00)
0.202
(1.00)
WEE1 7 (1%) 571 0.0768
(0.821)
0.917
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
IGSF21 5 (1%) 573 0.133
(0.92)
0.584
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
IBTK 23 (4%) 555 0.937
(1.00)
0.387
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(0.957)
1
(1.00)
0.984
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
EEA1 16 (3%) 562 0.36
(1.00)
0.61
(1.00)
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(0.957)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(0.857)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
PBX2 11 (2%) 567 0.0193
(0.578)
0.00669
(0.424)
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(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
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(0.578)
1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
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(1.00)
0.0492
(0.753)
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(1.00)
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1
(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
ZNF740 3 (1%) 575 0.195
(0.997)
0.0321
(0.656)
0.772
(1.00)
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(1.00)
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(1.00)
1
(1.00)
0.213
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
SLA 9 (2%) 569 0.558
(1.00)
0.0904
(0.854)
0.833
(1.00)
0.607
(1.00)
0.0895
(0.848)
0.414
(1.00)
0.0234
(0.59)
0.355
(1.00)
0.755
(1.00)
1
(1.00)
CC2D2A 17 (3%) 561 0.0996
(0.872)
0.0247
(0.605)
0.172
(0.972)
0.746
(1.00)
0.25
(1.00)
0.329
(1.00)
1
(1.00)
0.545
(1.00)
0.848
(1.00)
0.242
(1.00)
GZF1 21 (4%) 557 0.98
(1.00)
0.0605
(0.784)
0.413
(1.00)
0.593
(1.00)
0.703
(1.00)
0.626
(1.00)
0.223
(1.00)
0.755
(1.00)
0.359
(1.00)
0.872
(1.00)
1
(1.00)
AGXT2L1 10 (2%) 568 0.374
(1.00)
0.694
(1.00)
0.749
(1.00)
0.578
(1.00)
0.594
(1.00)
0.498
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.111
(0.897)
1
(1.00)
EPN1 12 (2%) 566 0.803
(1.00)
0.0968
(0.866)
0.0649
(0.798)
0.0658
(0.798)
0.481
(1.00)
0.189
(0.99)
0.0492
(0.753)
0.701
(1.00)
0.627
(1.00)
0.586
(1.00)
1
(1.00)
CCT6A 9 (2%) 569 0.762
(1.00)
0.0405
(0.704)
0.499
(1.00)
0.789
(1.00)
0.322
(1.00)
1
(1.00)
0.135
(0.92)
1
(1.00)
0.571
(1.00)
1
(1.00)
PJA1 13 (2%) 565 0.911
(1.00)
0.172
(0.972)
0.43
(1.00)
0.807
(1.00)
0.325
(1.00)
1
(1.00)
0.00343
(0.337)
1
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
GALK1 4 (1%) 574 0.558
(1.00)
0.853
(1.00)
0.709
(1.00)
0.216
(1.00)
1
(1.00)
0.586
(1.00)
0.355
(1.00)
0.12
(0.906)
1
(1.00)
PEG3 43 (7%) 535 0.0992
(0.872)
0.333
(1.00)
0.188
(0.99)
0.0905
(0.854)
0.931
(1.00)
0.521
(1.00)
0.299
(1.00)
0.673
(1.00)
0.0874
(0.844)
0.652
(1.00)
0.513
(1.00)
GPR120 7 (1%) 571 0.496
(1.00)
0.597
(1.00)
0.0639
(0.796)
0.0439
(0.732)
0.949
(1.00)
0.414
(1.00)
0.68
(1.00)
0.603
(1.00)
0.668
(1.00)
1
(1.00)
RRP7A 5 (1%) 573 0.644
(1.00)
0.882
(1.00)
0.242
(1.00)
0.292
(1.00)
0.703
(1.00)
1
(1.00)
1
(1.00)
0.588
(1.00)
0.0425
(0.718)
1
(1.00)
ARID5B 18 (3%) 560 0.511
(1.00)
0.541
(1.00)
0.157
(0.953)
0.0234
(0.59)
0.952
(1.00)
0.62
(1.00)
0.192
(0.99)
0.217
(1.00)
0.409
(1.00)
0.0506
(0.753)
1
(1.00)
'ARID1A MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.00015 (Fisher's exact test), Q value = 0.1

Table S1.  Gene #2: 'ARID1A MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
ARID1A MUTATED 51 63
ARID1A WILD-TYPE 121 343

Figure S1.  Get High-res Image Gene #2: 'ARID1A MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'ARID1A MUTATION STATUS' versus 'RADIATION_THERAPY'

P value = 0.000705 (Fisher's exact test), Q value = 0.21

Table S2.  Gene #2: 'ARID1A MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #8: 'RADIATION_THERAPY'

nPatients NO YES
ALL 416 102
ARID1A MUTATED 91 8
ARID1A WILD-TYPE 325 94

Figure S2.  Get High-res Image Gene #2: 'ARID1A MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #8: 'RADIATION_THERAPY'

'RNF43 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 6.46e-05 (Wilcoxon-test), Q value = 0.095

Table S3.  Gene #4: 'RNF43 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
RNF43 MUTATED 47 71.1 (9.7)
RNF43 WILD-TYPE 524 64.0 (11.2)

Figure S3.  Get High-res Image Gene #4: 'RNF43 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'RNF43 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.00142 (Fisher's exact test), Q value = 0.25

Table S4.  Gene #4: 'RNF43 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
RNF43 MUTATED 24 23
RNF43 WILD-TYPE 148 383

Figure S4.  Get High-res Image Gene #4: 'RNF43 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'XYLT2 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 8.27e-05 (Wilcoxon-test), Q value = 0.097

Table S5.  Gene #7: 'XYLT2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
XYLT2 MUTATED 39 71.7 (9.6)
XYLT2 WILD-TYPE 532 64.1 (11.2)

Figure S5.  Get High-res Image Gene #7: 'XYLT2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'XYLT2 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.000561 (Fisher's exact test), Q value = 0.19

Table S6.  Gene #7: 'XYLT2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
XYLT2 MUTATED 22 18
XYLT2 WILD-TYPE 150 388

Figure S6.  Get High-res Image Gene #7: 'XYLT2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'LARP4B MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.000332 (Fisher's exact test), Q value = 0.16

Table S7.  Gene #9: 'LARP4B MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
LARP4B MUTATED 20 14
LARP4B WILD-TYPE 152 392

Figure S7.  Get High-res Image Gene #9: 'LARP4B MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'PLEKHA6 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.00153 (Wilcoxon-test), Q value = 0.25

Table S8.  Gene #16: 'PLEKHA6 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
PLEKHA6 MUTATED 28 71.1 (10.0)
PLEKHA6 WILD-TYPE 543 64.3 (11.2)

Figure S8.  Get High-res Image Gene #16: 'PLEKHA6 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'PGM5 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 1.92e-05 (Wilcoxon-test), Q value = 0.058

Table S9.  Gene #17: 'PGM5 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
PGM5 MUTATED 43 71.9 (9.6)
PGM5 WILD-TYPE 528 64.0 (11.1)

Figure S9.  Get High-res Image Gene #17: 'PGM5 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'PGM5 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 8.06e-05 (Fisher's exact test), Q value = 0.097

Table S10.  Gene #17: 'PGM5 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
PGM5 MUTATED 25 18
PGM5 WILD-TYPE 147 388

Figure S10.  Get High-res Image Gene #17: 'PGM5 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'ZBTB20 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 1.01e-05 (Wilcoxon-test), Q value = 0.045

Table S11.  Gene #20: 'ZBTB20 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
ZBTB20 MUTATED 42 72.1 (10.1)
ZBTB20 WILD-TYPE 529 64.0 (11.1)

Figure S11.  Get High-res Image Gene #20: 'ZBTB20 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'ZBTB20 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.00145 (Fisher's exact test), Q value = 0.25

Table S12.  Gene #20: 'ZBTB20 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
ZBTB20 MUTATED 22 20
ZBTB20 WILD-TYPE 150 386

Figure S12.  Get High-res Image Gene #20: 'ZBTB20 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'MBD6 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.000729 (Wilcoxon-test), Q value = 0.21

Table S13.  Gene #21: 'MBD6 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
MBD6 MUTATED 25 72.2 (9.7)
MBD6 WILD-TYPE 546 64.3 (11.2)

Figure S13.  Get High-res Image Gene #21: 'MBD6 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'DDX17 MUTATION STATUS' versus 'PATHOLOGY_T_STAGE'

P value = 0.00132 (Fisher's exact test), Q value = 0.25

Table S14.  Gene #27: 'DDX17 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

nPatients T0+T1 T2 T3 T4
ALL 54 135 261 102
DDX17 MUTATED 3 2 3 9
DDX17 WILD-TYPE 51 133 258 93

Figure S14.  Get High-res Image Gene #27: 'DDX17 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

'ZBTB7C MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.00091 (Wilcoxon-test), Q value = 0.23

Table S15.  Gene #34: 'ZBTB7C MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
ZBTB7C MUTATED 17 73.9 (9.5)
ZBTB7C WILD-TYPE 554 64.3 (11.2)

Figure S15.  Get High-res Image Gene #34: 'ZBTB7C MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'PRSS36 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.000151 (Wilcoxon-test), Q value = 0.1

Table S16.  Gene #37: 'PRSS36 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
PRSS36 MUTATED 22 74.0 (9.1)
PRSS36 WILD-TYPE 549 64.2 (11.1)

Figure S16.  Get High-res Image Gene #37: 'PRSS36 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'KIAA0406 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 6.88e-05 (Wilcoxon-test), Q value = 0.095

Table S17.  Gene #40: 'KIAA0406 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
KIAA0406 MUTATED 26 72.9 (10.8)
KIAA0406 WILD-TYPE 545 64.2 (11.1)

Figure S17.  Get High-res Image Gene #40: 'KIAA0406 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'KIAA1967 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.000209 (Fisher's exact test), Q value = 0.12

Table S18.  Gene #41: 'KIAA1967 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
KIAA1967 MUTATED 17 9
KIAA1967 WILD-TYPE 155 397

Figure S18.  Get High-res Image Gene #41: 'KIAA1967 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'ZMYM4 MUTATION STATUS' versus 'PATHOLOGY_T_STAGE'

P value = 5e-05 (Fisher's exact test), Q value = 0.093

Table S19.  Gene #42: 'ZMYM4 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

nPatients T0+T1 T2 T3 T4
ALL 54 135 261 102
ZMYM4 MUTATED 0 4 6 14
ZMYM4 WILD-TYPE 54 131 255 88

Figure S19.  Get High-res Image Gene #42: 'ZMYM4 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

'FHOD3 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.00113 (Wilcoxon-test), Q value = 0.25

Table S20.  Gene #60: 'FHOD3 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
FHOD3 MUTATED 36 70.1 (10.9)
FHOD3 WILD-TYPE 535 64.3 (11.2)

Figure S20.  Get High-res Image Gene #60: 'FHOD3 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'OSBP2 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.000527 (Fisher's exact test), Q value = 0.19

Table S21.  Gene #61: 'OSBP2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
OSBP2 MUTATED 11 4
OSBP2 WILD-TYPE 161 402

Figure S21.  Get High-res Image Gene #61: 'OSBP2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'ADAM30 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.00118 (Wilcoxon-test), Q value = 0.25

Table S22.  Gene #69: 'ADAM30 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
ADAM30 MUTATED 19 72.9 (8.6)
ADAM30 WILD-TYPE 552 64.3 (11.2)

Figure S22.  Get High-res Image Gene #69: 'ADAM30 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'NFE2L2 MUTATION STATUS' versus 'RACE'

P value = 0.00029 (Fisher's exact test), Q value = 0.15

Table S23.  Gene #76: 'NFE2L2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #11: 'RACE'

nPatients ASIAN BLACK OR AFRICAN AMERICAN NATIVE HAWAIIAN OR OTHER PACIFIC ISLANDER WHITE
ALL 133 14 1 357
NFE2L2 MUTATED 12 0 0 4
NFE2L2 WILD-TYPE 121 14 1 353

Figure S23.  Get High-res Image Gene #76: 'NFE2L2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #11: 'RACE'

'GLI1 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.0014 (Fisher's exact test), Q value = 0.25

Table S24.  Gene #78: 'GLI1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
GLI1 MUTATED 15 10
GLI1 WILD-TYPE 157 396

Figure S24.  Get High-res Image Gene #78: 'GLI1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'KLHDC5 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.00076 (Wilcoxon-test), Q value = 0.21

Table S25.  Gene #102: 'KLHDC5 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
KLHDC5 MUTATED 13 75.5 (9.6)
KLHDC5 WILD-TYPE 558 64.4 (11.1)

Figure S25.  Get High-res Image Gene #102: 'KLHDC5 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'ERF MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.00111 (Fisher's exact test), Q value = 0.25

Table S26.  Gene #111: 'ERF MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
ERF MUTATED 12 6
ERF WILD-TYPE 160 400

Figure S26.  Get High-res Image Gene #111: 'ERF MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'ASAP2 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.000492 (Wilcoxon-test), Q value = 0.18

Table S27.  Gene #133: 'ASAP2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
ASAP2 MUTATED 21 73.1 (10.8)
ASAP2 WILD-TYPE 550 64.3 (11.1)

Figure S27.  Get High-res Image Gene #133: 'ASAP2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'BCORL1 MUTATION STATUS' versus 'PATHOLOGY_T_STAGE'

P value = 0.00064 (Fisher's exact test), Q value = 0.2

Table S28.  Gene #134: 'BCORL1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

nPatients T0+T1 T2 T3 T4
ALL 54 135 261 102
BCORL1 MUTATED 0 8 6 12
BCORL1 WILD-TYPE 54 127 255 90

Figure S28.  Get High-res Image Gene #134: 'BCORL1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

'BCORL1 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 5.35e-05 (Fisher's exact test), Q value = 0.093

Table S29.  Gene #134: 'BCORL1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
BCORL1 MUTATED 18 9
BCORL1 WILD-TYPE 154 397

Figure S29.  Get High-res Image Gene #134: 'BCORL1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'JARID2 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.0013 (Wilcoxon-test), Q value = 0.25

Table S30.  Gene #137: 'JARID2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
JARID2 MUTATED 44 69.8 (11.3)
JARID2 WILD-TYPE 527 64.2 (11.1)

Figure S30.  Get High-res Image Gene #137: 'JARID2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'TRIP4 MUTATION STATUS' versus 'PATHOLOGIC_STAGE'

P value = 0.0015 (Fisher's exact test), Q value = 0.25

Table S31.  Gene #147: 'TRIP4 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #3: 'PATHOLOGIC_STAGE'

nPatients STAGE I STAGE IA STAGE IB STAGE II STAGE IIA STAGE IIB STAGE III STAGE IIIA STAGE IIIB STAGE IIIC STAGE IV STAGE IVA
ALL 10 20 46 31 84 83 29 84 62 39 43 4
TRIP4 MUTATED 0 0 0 5 1 1 1 0 0 3 2 0
TRIP4 WILD-TYPE 10 20 46 26 83 82 28 84 62 36 41 4

Figure S31.  Get High-res Image Gene #147: 'TRIP4 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #3: 'PATHOLOGIC_STAGE'

'SGOL2 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.00138 (Wilcoxon-test), Q value = 0.25

Table S32.  Gene #148: 'SGOL2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
SGOL2 MUTATED 16 73.7 (13.9)
SGOL2 WILD-TYPE 555 64.4 (11.0)

Figure S32.  Get High-res Image Gene #148: 'SGOL2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'CLDN6 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.000117 (Fisher's exact test), Q value = 0.099

Table S33.  Gene #161: 'CLDN6 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
CLDN6 MUTATED 9 1
CLDN6 WILD-TYPE 163 405

Figure S33.  Get High-res Image Gene #161: 'CLDN6 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'PPIG MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.0015 (Wilcoxon-test), Q value = 0.25

Table S34.  Gene #168: 'PPIG MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
PPIG MUTATED 20 73.4 (12.4)
PPIG WILD-TYPE 551 64.3 (11.1)

Figure S34.  Get High-res Image Gene #168: 'PPIG MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'CELSR1 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 5.15e-05 (Wilcoxon-test), Q value = 0.093

Table S35.  Gene #174: 'CELSR1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
CELSR1 MUTATED 44 71.7 (10.2)
CELSR1 WILD-TYPE 527 64.0 (11.1)

Figure S35.  Get High-res Image Gene #174: 'CELSR1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'WDR7 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.000773 (Wilcoxon-test), Q value = 0.21

Table S36.  Gene #186: 'WDR7 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
WDR7 MUTATED 29 71.8 (11.6)
WDR7 WILD-TYPE 542 64.2 (11.1)

Figure S36.  Get High-res Image Gene #186: 'WDR7 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'SVIL MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.00148 (Fisher's exact test), Q value = 0.25

Table S37.  Gene #191: 'SVIL MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
SVIL MUTATED 19 15
SVIL WILD-TYPE 153 391

Figure S37.  Get High-res Image Gene #191: 'SVIL MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'ATM MUTATION STATUS' versus 'Time to Death'

P value = 0.000747 (logrank test), Q value = 0.21

Table S38.  Gene #193: 'ATM MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #1: 'Time to Death'

nPatients nDeath Duration Range (Median), Month
ALL 554 216 0.0 - 122.3 (13.6)
ATM MUTATED 54 10 0.3 - 122.3 (18.9)
ATM WILD-TYPE 500 206 0.0 - 122.1 (13.5)

Figure S38.  Get High-res Image Gene #193: 'ATM MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #1: 'Time to Death'

'TRAM1L1 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.000127 (Wilcoxon-test), Q value = 0.099

Table S39.  Gene #241: 'TRAM1L1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
TRAM1L1 MUTATED 21 73.8 (11.1)
TRAM1L1 WILD-TYPE 550 64.3 (11.1)

Figure S39.  Get High-res Image Gene #241: 'TRAM1L1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'ERBB4 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.000928 (Wilcoxon-test), Q value = 0.23

Table S40.  Gene #248: 'ERBB4 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
ERBB4 MUTATED 64 68.7 (11.1)
ERBB4 WILD-TYPE 507 64.1 (11.1)

Figure S40.  Get High-res Image Gene #248: 'ERBB4 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'HSPG2 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.00112 (Wilcoxon-test), Q value = 0.25

Table S41.  Gene #266: 'HSPG2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
HSPG2 MUTATED 74 68.7 (10.4)
HSPG2 WILD-TYPE 497 64.0 (11.2)

Figure S41.  Get High-res Image Gene #266: 'HSPG2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'SRCIN1 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.00096 (Wilcoxon-test), Q value = 0.24

Table S42.  Gene #269: 'SRCIN1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
SRCIN1 MUTATED 18 73.5 (8.5)
SRCIN1 WILD-TYPE 553 64.3 (11.2)

Figure S42.  Get High-res Image Gene #269: 'SRCIN1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'OBSCN MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.000862 (Fisher's exact test), Q value = 0.23

Table S43.  Gene #278: 'OBSCN MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
OBSCN MUTATED 49 65
OBSCN WILD-TYPE 123 341

Figure S43.  Get High-res Image Gene #278: 'OBSCN MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'ZC3H18 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.0014 (Fisher's exact test), Q value = 0.25

Table S44.  Gene #284: 'ZC3H18 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
ZC3H18 MUTATED 15 10
ZC3H18 WILD-TYPE 157 396

Figure S44.  Get High-res Image Gene #284: 'ZC3H18 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'MBD2 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.00142 (Fisher's exact test), Q value = 0.25

Table S45.  Gene #375: 'MBD2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
MBD2 MUTATED 9 3
MBD2 WILD-TYPE 163 403

Figure S45.  Get High-res Image Gene #375: 'MBD2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'ZC3H4 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.000469 (Wilcoxon-test), Q value = 0.18

Table S46.  Gene #402: 'ZC3H4 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
ZC3H4 MUTATED 22 72.7 (8.3)
ZC3H4 WILD-TYPE 549 64.3 (11.2)

Figure S46.  Get High-res Image Gene #402: 'ZC3H4 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'AXIN2 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.00118 (Fisher's exact test), Q value = 0.25

Table S47.  Gene #412: 'AXIN2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
AXIN2 MUTATED 14 8
AXIN2 WILD-TYPE 158 398

Figure S47.  Get High-res Image Gene #412: 'AXIN2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'ZFHX3 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.00114 (Fisher's exact test), Q value = 0.25

Table S48.  Gene #430: 'ZFHX3 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
ZFHX3 MUTATED 24 22
ZFHX3 WILD-TYPE 148 384

Figure S48.  Get High-res Image Gene #430: 'ZFHX3 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'CREBBP MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.00151 (Wilcoxon-test), Q value = 0.25

Table S49.  Gene #465: 'CREBBP MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
CREBBP MUTATED 47 69.3 (10.4)
CREBBP WILD-TYPE 524 64.2 (11.2)

Figure S49.  Get High-res Image Gene #465: 'CREBBP MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'CUBN MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 9.56e-05 (Wilcoxon-test), Q value = 0.097

Table S50.  Gene #478: 'CUBN MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
CUBN MUTATED 72 69.1 (11.3)
CUBN WILD-TYPE 499 64.0 (11.1)

Figure S50.  Get High-res Image Gene #478: 'CUBN MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'KIAA0240 MUTATION STATUS' versus 'PATHOLOGY_T_STAGE'

P value = 0.00052 (Fisher's exact test), Q value = 0.19

Table S51.  Gene #484: 'KIAA0240 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

nPatients T0+T1 T2 T3 T4
ALL 54 135 261 102
KIAA0240 MUTATED 4 1 2 7
KIAA0240 WILD-TYPE 50 134 259 95

Figure S51.  Get High-res Image Gene #484: 'KIAA0240 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

'GTF3C1 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 1.17e-05 (Wilcoxon-test), Q value = 0.045

Table S52.  Gene #487: 'GTF3C1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
GTF3C1 MUTATED 38 72.3 (8.3)
GTF3C1 WILD-TYPE 533 64.1 (11.2)

Figure S52.  Get High-res Image Gene #487: 'GTF3C1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'GTF3C1 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 9.22e-05 (Fisher's exact test), Q value = 0.097

Table S53.  Gene #487: 'GTF3C1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
GTF3C1 MUTATED 23 16
GTF3C1 WILD-TYPE 149 390

Figure S53.  Get High-res Image Gene #487: 'GTF3C1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'KIAA0100 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.000585 (Wilcoxon-test), Q value = 0.19

Table S54.  Gene #488: 'KIAA0100 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
KIAA0100 MUTATED 29 71.3 (10.5)
KIAA0100 WILD-TYPE 542 64.3 (11.2)

Figure S54.  Get High-res Image Gene #488: 'KIAA0100 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'GTF3C4 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.000399 (Wilcoxon-test), Q value = 0.17

Table S55.  Gene #523: 'GTF3C4 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
GTF3C4 MUTATED 14 74.9 (8.8)
GTF3C4 WILD-TYPE 557 64.4 (11.2)

Figure S55.  Get High-res Image Gene #523: 'GTF3C4 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'MAP7D3 MUTATION STATUS' versus 'PATHOLOGY_T_STAGE'

P value = 0.00049 (Fisher's exact test), Q value = 0.18

Table S56.  Gene #528: 'MAP7D3 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

nPatients T0+T1 T2 T3 T4
ALL 54 135 261 102
MAP7D3 MUTATED 0 4 3 10
MAP7D3 WILD-TYPE 54 131 258 92

Figure S56.  Get High-res Image Gene #528: 'MAP7D3 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

'MAP7D3 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.00111 (Fisher's exact test), Q value = 0.25

Table S57.  Gene #528: 'MAP7D3 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
MAP7D3 MUTATED 12 6
MAP7D3 WILD-TYPE 160 400

Figure S57.  Get High-res Image Gene #528: 'MAP7D3 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'PRPF4B MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.000291 (Wilcoxon-test), Q value = 0.15

Table S58.  Gene #530: 'PRPF4B MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
PRPF4B MUTATED 12 76.2 (7.6)
PRPF4B WILD-TYPE 559 64.4 (11.2)

Figure S58.  Get High-res Image Gene #530: 'PRPF4B MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'PRPF4B MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.00142 (Fisher's exact test), Q value = 0.25

Table S59.  Gene #530: 'PRPF4B MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
PRPF4B MUTATED 9 3
PRPF4B WILD-TYPE 163 403

Figure S59.  Get High-res Image Gene #530: 'PRPF4B MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'ARID1B MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.00142 (Fisher's exact test), Q value = 0.25

Table S60.  Gene #537: 'ARID1B MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
ARID1B MUTATED 20 17
ARID1B WILD-TYPE 152 389

Figure S60.  Get High-res Image Gene #537: 'ARID1B MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'TNK2 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.00118 (Fisher's exact test), Q value = 0.25

Table S61.  Gene #538: 'TNK2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
TNK2 MUTATED 14 8
TNK2 WILD-TYPE 158 398

Figure S61.  Get High-res Image Gene #538: 'TNK2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'CNNM1 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 5.49e-05 (Fisher's exact test), Q value = 0.093

Table S62.  Gene #554: 'CNNM1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
CNNM1 MUTATED 11 2
CNNM1 WILD-TYPE 161 404

Figure S62.  Get High-res Image Gene #554: 'CNNM1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'FGF1 MUTATION STATUS' versus 'PATHOLOGIC_STAGE'

P value = 0.00018 (Fisher's exact test), Q value = 0.11

Table S63.  Gene #562: 'FGF1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #3: 'PATHOLOGIC_STAGE'

nPatients STAGE I STAGE IA STAGE IB STAGE II STAGE IIA STAGE IIB STAGE III STAGE IIIA STAGE IIIB STAGE IIIC STAGE IV STAGE IVA
ALL 10 20 46 31 84 83 29 84 62 39 43 4
FGF1 MUTATED 0 0 0 3 0 0 1 0 0 0 0 1
FGF1 WILD-TYPE 10 20 46 28 84 83 28 84 62 39 43 3

Figure S63.  Get High-res Image Gene #562: 'FGF1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #3: 'PATHOLOGIC_STAGE'

'BEND3 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.000116 (Wilcoxon-test), Q value = 0.099

Table S64.  Gene #568: 'BEND3 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
BEND3 MUTATED 14 75.8 (7.4)
BEND3 WILD-TYPE 557 64.3 (11.2)

Figure S64.  Get High-res Image Gene #568: 'BEND3 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'SIX3 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.000471 (Wilcoxon-test), Q value = 0.18

Table S65.  Gene #582: 'SIX3 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
SIX3 MUTATED 12 76.0 (8.5)
SIX3 WILD-TYPE 559 64.4 (11.1)

Figure S65.  Get High-res Image Gene #582: 'SIX3 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'HAND2 MUTATION STATUS' versus 'PATHOLOGY_T_STAGE'

P value = 0.00039 (Fisher's exact test), Q value = 0.17

Table S66.  Gene #595: 'HAND2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

nPatients T0+T1 T2 T3 T4
ALL 54 135 261 102
HAND2 MUTATED 0 1 0 6
HAND2 WILD-TYPE 54 134 261 96

Figure S66.  Get High-res Image Gene #595: 'HAND2 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

'NEK8 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.00136 (Fisher's exact test), Q value = 0.25

Table S67.  Gene #602: 'NEK8 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
NEK8 MUTATED 10 4
NEK8 WILD-TYPE 162 402

Figure S67.  Get High-res Image Gene #602: 'NEK8 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'PTPLA MUTATION STATUS' versus 'Time to Death'

P value = 0.000334 (logrank test), Q value = 0.16

Table S68.  Gene #609: 'PTPLA MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #1: 'Time to Death'

nPatients nDeath Duration Range (Median), Month
ALL 554 216 0.0 - 122.3 (13.6)
PTPLA MUTATED 7 5 0.1 - 16.1 (6.6)
PTPLA WILD-TYPE 547 211 0.0 - 122.3 (13.8)

Figure S68.  Get High-res Image Gene #609: 'PTPLA MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #1: 'Time to Death'

'SRP14 MUTATION STATUS' versus 'Time to Death'

P value = 4.28e-10 (logrank test), Q value = 6.5e-06

Table S69.  Gene #672: 'SRP14 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #1: 'Time to Death'

nPatients nDeath Duration Range (Median), Month
ALL 554 216 0.0 - 122.3 (13.6)
SRP14 MUTATED 3 2 0.1 - 4.3 (1.1)
SRP14 WILD-TYPE 551 214 0.0 - 122.3 (13.7)

Figure S69.  Get High-res Image Gene #672: 'SRP14 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #1: 'Time to Death'

'CD93 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.000574 (Wilcoxon-test), Q value = 0.19

Table S70.  Gene #699: 'CD93 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
CD93 MUTATED 24 71.8 (6.4)
CD93 WILD-TYPE 547 64.3 (11.3)

Figure S70.  Get High-res Image Gene #699: 'CD93 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'SLC25A17 MUTATION STATUS' versus 'Time to Death'

P value = 9.88e-06 (logrank test), Q value = 0.045

Table S71.  Gene #732: 'SLC25A17 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #1: 'Time to Death'

nPatients nDeath Duration Range (Median), Month
ALL 554 216 0.0 - 122.3 (13.6)
SLC25A17 MUTATED 3 3 1.0 - 9.7 (6.6)
SLC25A17 WILD-TYPE 551 213 0.0 - 122.3 (13.7)

Figure S71.  Get High-res Image Gene #732: 'SLC25A17 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #1: 'Time to Death'

'EPB41 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.00136 (Fisher's exact test), Q value = 0.25

Table S72.  Gene #734: 'EPB41 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
EPB41 MUTATED 10 4
EPB41 WILD-TYPE 162 402

Figure S72.  Get High-res Image Gene #734: 'EPB41 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'ALDH3A1 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.000886 (Wilcoxon-test), Q value = 0.23

Table S73.  Gene #737: 'ALDH3A1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
ALDH3A1 MUTATED 14 74.1 (6.4)
ALDH3A1 WILD-TYPE 557 64.4 (11.2)

Figure S73.  Get High-res Image Gene #737: 'ALDH3A1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'DNAJA1 MUTATION STATUS' versus 'PATHOLOGY_T_STAGE'

P value = 0.00131 (Fisher's exact test), Q value = 0.25

Table S74.  Gene #784: 'DNAJA1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

nPatients T0+T1 T2 T3 T4
ALL 54 135 261 102
DNAJA1 MUTATED 4 0 3 5
DNAJA1 WILD-TYPE 50 135 258 97

Figure S74.  Get High-res Image Gene #784: 'DNAJA1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

'THSD1 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.000662 (Fisher's exact test), Q value = 0.2

Table S75.  Gene #809: 'THSD1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
THSD1 MUTATED 16 10
THSD1 WILD-TYPE 156 396

Figure S75.  Get High-res Image Gene #809: 'THSD1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'TRIOBP MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.00139 (Wilcoxon-test), Q value = 0.25

Table S76.  Gene #838: 'TRIOBP MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
TRIOBP MUTATED 37 70.2 (9.6)
TRIOBP WILD-TYPE 534 64.2 (11.2)

Figure S76.  Get High-res Image Gene #838: 'TRIOBP MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'KIAA1609 MUTATION STATUS' versus 'PATHOLOGY_T_STAGE'

P value = 0.00013 (Fisher's exact test), Q value = 0.099

Table S77.  Gene #845: 'KIAA1609 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

nPatients T0+T1 T2 T3 T4
ALL 54 135 261 102
KIAA1609 MUTATED 1 0 0 6
KIAA1609 WILD-TYPE 53 135 261 96

Figure S77.  Get High-res Image Gene #845: 'KIAA1609 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

'C1RL MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.00113 (Fisher's exact test), Q value = 0.25

Table S78.  Gene #877: 'C1RL MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
C1RL MUTATED 7 1
C1RL WILD-TYPE 165 405

Figure S78.  Get High-res Image Gene #877: 'C1RL MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'TMEM116 MUTATION STATUS' versus 'Time to Death'

P value = 0.000722 (logrank test), Q value = 0.21

Table S79.  Gene #889: 'TMEM116 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #1: 'Time to Death'

nPatients nDeath Duration Range (Median), Month
ALL 554 216 0.0 - 122.3 (13.6)
TMEM116 MUTATED 3 3 1.7 - 16.1 (7.0)
TMEM116 WILD-TYPE 551 213 0.0 - 122.3 (13.6)

Figure S79.  Get High-res Image Gene #889: 'TMEM116 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #1: 'Time to Death'

'CLCA4 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.000456 (Fisher's exact test), Q value = 0.18

Table S80.  Gene #896: 'CLCA4 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
CLCA4 MUTATED 13 6
CLCA4 WILD-TYPE 159 400

Figure S80.  Get High-res Image Gene #896: 'CLCA4 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'SCIN MUTATION STATUS' versus 'PATHOLOGY_M_STAGE'

P value = 0.00134 (Fisher's exact test), Q value = 0.25

Table S81.  Gene #915: 'SCIN MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #6: 'PATHOLOGY_M_STAGE'

nPatients 0 1
ALL 482 38
SCIN MUTATED 8 5
SCIN WILD-TYPE 474 33

Figure S81.  Get High-res Image Gene #915: 'SCIN MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #6: 'PATHOLOGY_M_STAGE'

'TMEM127 MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.000653 (Fisher's exact test), Q value = 0.2

Table S82.  Gene #920: 'TMEM127 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
TMEM127 MUTATED 6 0
TMEM127 WILD-TYPE 166 406

Figure S82.  Get High-res Image Gene #920: 'TMEM127 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'OR6C70 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.000145 (Wilcoxon-test), Q value = 0.1

Table S83.  Gene #968: 'OR6C70 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
OR6C70 MUTATED 6 82.8 (4.2)
OR6C70 WILD-TYPE 565 64.4 (11.1)

Figure S83.  Get High-res Image Gene #968: 'OR6C70 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'CHD3 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.000189 (Wilcoxon-test), Q value = 0.11

Table S84.  Gene #1005: 'CHD3 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
CHD3 MUTATED 37 71.0 (14.0)
CHD3 WILD-TYPE 534 64.2 (10.9)

Figure S84.  Get High-res Image Gene #1005: 'CHD3 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'CSF3R MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.000322 (Wilcoxon-test), Q value = 0.16

Table S85.  Gene #1072: 'CSF3R MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
CSF3R MUTATED 16 74.2 (7.8)
CSF3R WILD-TYPE 555 64.3 (11.2)

Figure S85.  Get High-res Image Gene #1072: 'CSF3R MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

'NOS1 MUTATION STATUS' versus 'PATHOLOGY_T_STAGE'

P value = 0.00037 (Fisher's exact test), Q value = 0.17

Table S86.  Gene #1144: 'NOS1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

nPatients T0+T1 T2 T3 T4
ALL 54 135 261 102
NOS1 MUTATED 5 6 9 16
NOS1 WILD-TYPE 49 129 252 86

Figure S86.  Get High-res Image Gene #1144: 'NOS1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

'AFP MUTATION STATUS' versus 'Time to Death'

P value = 0.00121 (logrank test), Q value = 0.25

Table S87.  Gene #1150: 'AFP MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #1: 'Time to Death'

nPatients nDeath Duration Range (Median), Month
ALL 554 216 0.0 - 122.3 (13.6)
AFP MUTATED 3 3 7.0 - 11.8 (8.5)
AFP WILD-TYPE 551 213 0.0 - 122.3 (13.7)

Figure S87.  Get High-res Image Gene #1150: 'AFP MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #1: 'Time to Death'

'COL11A1 MUTATION STATUS' versus 'Time to Death'

P value = 0.000702 (logrank test), Q value = 0.21

Table S88.  Gene #1151: 'COL11A1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #1: 'Time to Death'

nPatients nDeath Duration Range (Median), Month
ALL 554 216 0.0 - 122.3 (13.6)
COL11A1 MUTATED 59 14 1.1 - 105.1 (20.2)
COL11A1 WILD-TYPE 495 202 0.0 - 122.3 (13.3)

Figure S88.  Get High-res Image Gene #1151: 'COL11A1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #1: 'Time to Death'

'INVS MUTATION STATUS' versus 'GENDER'

P value = 0.000598 (Fisher's exact test), Q value = 0.19

Table S89.  Gene #1160: 'INVS MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

nPatients FEMALE MALE
ALL 172 406
INVS MUTATED 15 8
INVS WILD-TYPE 157 398

Figure S89.  Get High-res Image Gene #1160: 'INVS MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #7: 'GENDER'

'LRRC4 MUTATION STATUS' versus 'PATHOLOGY_T_STAGE'

P value = 0.00023 (Fisher's exact test), Q value = 0.13

Table S90.  Gene #1198: 'LRRC4 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

nPatients T0+T1 T2 T3 T4
ALL 54 135 261 102
LRRC4 MUTATED 1 0 9 11
LRRC4 WILD-TYPE 53 135 252 91

Figure S90.  Get High-res Image Gene #1198: 'LRRC4 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

'ZNF828 MUTATION STATUS' versus 'PATHOLOGIC_STAGE'

P value = 0.00047 (Fisher's exact test), Q value = 0.18

Table S91.  Gene #1222: 'ZNF828 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #3: 'PATHOLOGIC_STAGE'

nPatients STAGE I STAGE IA STAGE IB STAGE II STAGE IIA STAGE IIB STAGE III STAGE IIIA STAGE IIIB STAGE IIIC STAGE IV STAGE IVA
ALL 10 20 46 31 84 83 29 84 62 39 43 4
ZNF828 MUTATED 1 1 0 1 0 1 1 1 0 2 1 2
ZNF828 WILD-TYPE 9 19 46 30 84 82 28 83 62 37 42 2

Figure S91.  Get High-res Image Gene #1222: 'ZNF828 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #3: 'PATHOLOGIC_STAGE'

'ZNF828 MUTATION STATUS' versus 'PATHOLOGY_T_STAGE'

P value = 0.00124 (Fisher's exact test), Q value = 0.25

Table S92.  Gene #1222: 'ZNF828 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

nPatients T0+T1 T2 T3 T4
ALL 54 135 261 102
ZNF828 MUTATED 5 1 2 4
ZNF828 WILD-TYPE 49 134 259 98

Figure S92.  Get High-res Image Gene #1222: 'ZNF828 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #4: 'PATHOLOGY_T_STAGE'

'SETBP1 MUTATION STATUS' versus 'YEARS_TO_BIRTH'

P value = 0.000109 (Wilcoxon-test), Q value = 0.099

Table S93.  Gene #1248: 'SETBP1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

nPatients Mean (Std.Dev)
ALL 571 64.6 (11.2)
SETBP1 MUTATED 45 70.4 (10.5)
SETBP1 WILD-TYPE 526 64.1 (11.1)

Figure S93.  Get High-res Image Gene #1248: 'SETBP1 MUTATION STATUS' versus Clinical Feature #2: 'YEARS_TO_BIRTH'

Methods & Data
Input
  • Mutation data file = sample_sig_gene_table.txt from Mutsig_2CV pipeline

  • Processed Mutation data file = /xchip/cga/gdac-prod/tcga-gdac/jobResults/GDAC_Correlate_Genomic_Events_Preprocess/STES-TP/22815585/transformed.cor.cli.txt

  • Clinical data file = /xchip/cga/gdac-prod/tcga-gdac/jobResults/Append_Data/STES-TP/22507048/STES-TP.merged_data.txt

  • Number of patients = 578

  • Number of significantly mutated genes = 1267

  • Number of selected clinical features = 12

  • Exclude genes that fewer than K tumors have mutations, K = 3

Survival analysis

For survival clinical features, the Kaplan-Meier survival curves of tumors with and without gene mutations were plotted and the statistical significance P values were estimated by logrank test (Bland and Altman 2004) using the 'survdiff' function in R

Fisher's exact test

For binary or multi-class clinical features (nominal or ordinal), two-tailed Fisher's exact tests (Fisher 1922) were used to estimate the P values using the 'fisher.test' function in R

Q value calculation

For multiple hypothesis correction, Q value is the False Discovery Rate (FDR) analogue of the P value (Benjamini and Hochberg 1995), defined as the minimum FDR at which the test may be called significant. We used the 'Benjamini and Hochberg' method of 'p.adjust' function in R to convert P values into Q values.

Download Results

In addition to the links below, the full results of the analysis summarized in this report can also be downloaded programmatically using firehose_get, or interactively from either the Broad GDAC website or TCGA Data Coordination Center Portal.

References
[1] Bland and Altman, Statistics notes: The logrank test, BMJ 328(7447):1073 (2004)
[2] Fisher, R.A., On the interpretation of chi-square from contingency tables, and the calculation of P, Journal of the Royal Statistical Society 85(1):87-94 (1922)
[3] Benjamini and Hochberg, Controlling the false discovery rate: a practical and powerful approach to multiple testing, Journal of the Royal Statistical Society Series B 59:289-300 (1995)